miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Spo-MIR156a PmiREN020137 MIR156 Spirodela polyrhiza Spo-pseudo0 7609960 7610083 + GGGGGAGGGGGATGGGGCGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACCGGAGGAGGTATTAAAGGATGCCATCGCCGCCGTGCGTGCTCACTCCTCTCCCTGTCGGCCCCCGGTTGCCCCCAACCCA .............((((.((((((((.(((((((((((((.((((((.((.((((((....)))))).)).)))..))).))))))))).))))..))))))))))))(((((....))))).. 7609980 7610063 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACACCGGAGGAGGTATTAAAGGATGCCATCGCCGCCGTGCGTGCTCACTCCTCTCCCTGTCGGC ((((((.(((((((((((((.((((((.((.((((((....)))))).)).)))..))).))))))))).))))..)))))).. 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Spo-miRN3301 2341555 2341576 TAGAACAAGAACACTGAGGGTA Spo-miRN3301* 2341717 2341737 CCCTTATTGATTTTTAGTTTT 3 Spo-MIRN3302 PmiREN020188 MIRN3302 Spirodela polyrhiza Spo-pseudo19 2108792 2108901 + TGTGGGCTTCATTCTTCGCCACATTCTTCCACGTCTTCTCGGGACGGTGCCGATCGGGGCCTCTCCAAGAGAGGACATGGAGGAATGCGGTCAAGACAATAAGGCCGATG (((.(((((.((((((.(((.((((((((((.((((((((.(((.((.(((......))))).)))..)))))))).)))))))))).))).))))..)).))))).))) 2108812 2108881 ACATTCTTCCACGTCTTCTCGGGACGGTGCCGATCGGGGCCTCTCCAAGAGAGGACATGGAGGAATGCGG .((((((((((.((((((((.(((.((.(((......))))).)))..)))))))).))))))))))... Spo-miRN3302 2108861 2108881 AGAGGACATGGAGGAATGCGG Spo-miRN3302* 2108812 2108832 ACATTCTTCCACGTCTTCTCG 3 Spo-MIRN3303 PmiREN020189 MIRN3303 Spirodela polyrhiza Spo-pseudo1 2159149 2159271 - ATGAGGTTTCTGATATCATACTGAGACAACACATGTGGACGCCCAGTCTTTGAAAAATATCATTATTTCGAAAAGCTGTGCGTCCACATGTGTTGTCTCATTATGATATCAGAAACCTCATTC ((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((.((((...(((((....)))))...))))))).))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).. 2159169 2159251 CTGAGACAACACATGTGGACGCCCAGTCTTTGAAAAATATCATTATTTCGAAAAGCTGTGCGTCCACATGTGTTGTCTCATTA .(((((((((((((((((((((.(((.((((...(((((....)))))...))))))).)))))))))))))))))))))... Spo-miRN3303 2159231 2159251 CTGAGACAACACATGTGGACG Spo-miRN3303* 2159169 2159189 TCCACATGTGTTGTCTCATTA 3 Spo-MIRN3304 PmiREN020190 MIRN3304 Spirodela polyrhiza Spo-pseudo22 2770845 2771010 + GAACTCAAACCCCCATAGGACGTCGGTAGTAGATACAGGCCTGAGGCGATGGCAGTGAGAGAACCAGTACCCATATACGGCGCCGTGTATGACGAAAACCAGTACCCATATACGGCCTGAGGCGATGGCAGTTATTTCTCTCACTGCCATCGCCTCAGGCCTGTAT ........(((((....)).....))).....(((((((((((((((((((((((((((((((.......((((...(((.((((((((((((........))...))))))))))))).....)))).......))))))))))))))))))))))))))))))) 2770865 2770990 GGCCTGAGGCGATGGCAGTGAGAGAACCAGTACCCATATACGGCGCCGTGTATGACGAAAACCAGTACCCATATACGGCCTGAGGCGATGGCAGTTATTTCTCTCACTGCCATCGCCTCAGGCCTG ((((((((((((((((((((((((((.......((((...(((.((((((((((((........))...))))))))))))).....)))).......)))))))))))))))))))))))))))) Spo-miRN3304 2770970 2770990 ACTGCCATCGCCTCAGGCCTG Spo-miRN3304* 2770865 2770885 GGCCTGAGGCGATGGCAGTGA 3 Spo-MIRN3305 PmiREN020191 MIRN3305 Spirodela polyrhiza Spo-pseudo2 6743562 6743761 - GTGGGCTGTCAGCCTGATATGTGAATGCCTACTACGTATGAGTTGCCAGGAAATAATCATCTTTGGAGTGGGCCCACGTGAAGAATACTAGTTTTTGTTTGTTTGTTGCTTGCGAGTGGAATGCTAGAAAAAGCAATGCATCATTATTCCTGGCAATTCATACGTAGTAGGCATTCACATATCAGGCTGACAGCCCGCAC ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((..((((((..(((....))).))))))..........((((..((.....))..))))(((.(.((((......)))).).))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. 6743582 6743741 GTGAATGCCTACTACGTATGAGTTGCCAGGAAATAATCATCTTTGGAGTGGGCCCACGTGAAGAATACTAGTTTTTGTTTGTTTGTTGCTTGCGAGTGGAATGCTAGAAAAAGCAATGCATCATTATTCCTGGCAATTCATACGTAGTAGGCATTCACAT ((((((((((((((((((((((((((((((((.((((..((((((..(((....))).))))))..........((((..((.....))..))))(((.(.((((......)))).).))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).. Spo-miRN3305 6743582 6743602 ATACGTAGTAGGCATTCACAT Spo-miRN3305* 6743721 6743741 GTGAATGCCTACTACGTATGA 3