miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Pap-MIR156a PmiREN016631 MIR156 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000005.1 1472037 1472161 + TATGATGGATGAGAGTCTGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGATGAAGATGGCATCGAGGAATGCCGTTCGCGTTGCGTGCTCACTACTCTTCCTGTCAGCCACCGCTCTCTCTGTCTTTT ...((((((.((((((..((((((((((((((((((((((.(((((.(((..(((((((......))))))))))))))).))))))))).))))).))))))))....)))))))))))).... 1472057 1472141 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGATGAAGATGGCATCGAGGAATGCCGTTCGCGTTGCGTGCTCACTACTCTTCCTGTCAGC ((((((((((((((((((((.(((((.(((..(((((((......))))))))))))))).))))))))).))))).)))))).. 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Pap-miR157 332426 332446 CTGACAGAAGATAGAGAGCAC Pap-miR157* 332489 332509 CTCTCTATACTTCTGTCATCA 3 Pap-MIR159a PmiREN016638 MIR159 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000105.1 179150 179407 + GGCTGCGGTAGAGCTCCTTACTCTCCAAAAATGGGTTTTTGAGGGTTATTTGAGCTGCTTGGTTATGGATTCCACTCACTTATTCCATACCAGGTCTGCAAAGAAATGAAATAGACTAAAGTCAAAACTTTGGTGTATATAAATATATGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTGGAGTGGCCTTCTATCTGGTCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCAACTCATCCTAAGTTTTT ...((..((((((((((((.(..((((((((.(((((...(((((((((((.((((.((.(((((((.(..((((...(((((((((((.((..(((....)))..))..(((.((((((((....)))))))).))).......)))))))))))...))))..).))))))).)).)))).))))))))))).....))))).))))))))..).))))))))))))..))................. .-97.90 179170 179387 GAGCTCCTTACTCTCCAAAAATGGGTTTTTGAGGGTTATTTGAGCTGCTTGGTTATGGATTCCACTCACTTATTCCATACCAGGTCTGCAAAGAAATGAAATAGACTAAAGTCAAAACTTTGGTGTATATAAATATATGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTGGAGTGGCCTTCTATCTGGTCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((.(..((((((((.(((((...(((((((((((.((((.((.(((((((.(..((((...(((((((((((.((..(((....)))..))..(((.((((((((....)))))))).))).......)))))))))))...))))..).))))))).)).)))).))))))))))).....))))).))))))))..).))))))))))) Pap-miR159a 179367 179387 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Pap-miR159a* 179170 179190 GAGCTCCTTACTCTCCAAAAA 3 Pap-MIR159b PmiREN016639 MIR159 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000075.1 1109872 1110106 - GGTAGTTTTGGTTCAGTGGTAGAGCTCTCTTTGGTTCAAATGAGGGCCTTGAAGGATTTTTAATTGAGCTGCTTGGTTATGGATTCCACTGTCCTATTCCATGTAGAGCAACGGTTTAATTAGTCTATATTTTGTTGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTTTATTGATCTTCCATGAACCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATATCACTAGCTTCCTAGCT (((.....((((...(((((((((((((((((((((((((.(((((..((.(.(((...(((((.(((((.((.(((((((.(..((((...(((((((((((((((..((........))..))))))......)))))))))...))))..).))))))).)).))))).)))))...))).).))))))))))))))))))))))))))))).))).)))))))........ 1109892 1110086 AGAGCTCTCTTTGGTTCAAATGAGGGCCTTGAAGGATTTTTAATTGAGCTGCTTGGTTATGGATTCCACTGTCCTATTCCATGTAGAGCAACGGTTTAATTAGTCTATATTTTGTTGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTTTATTGATCTTCCATGAACCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGC ((((((((((((((((((((.(((((..((.(.(((...(((((.(((((.((.(((((((.(..((((...(((((((((((((((..((........))..))))))......)))))))))...))))..).))))))).)).))))).)))))...))).).))))))))))))))))))))))))))).. Pap-miR159b 1109892 1109912 TTGGATTGAAGGGAGCTCTGC Pap-miR159b* 1110066 1110086 AGAGCTCTCTTTGGTTCAAAT 3 Pap-MIR159c PmiREN016640 MIR159 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000201.1 313129 313343 - GATGATTTGGTTTTGATGGTAGAGCTGCCTTTGATTCAAATGAGGGGTTTTTTAGGGTTTTGGATTGAGCTGCATGGTTATGGTTTCCACTATCCTATTCCATGGAAGAATAATTGGGATTGGCTTGTGGTTAGCATAACTTTAGGAGCTTCATTAGCTCTCAATGATCCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATATGATCTCTCTCTCTCTC ((.((...((((......((((((((.(((((((((((((.((((((((.((.((((((...(((.(((((.(..(((((((.(..((((...((.((((((............)))))).))...))))..).)))))))...).))))).))))))))).)).))))))))))))))))))))).))))))))....))))..))))...... 313149 313323 AGAGCTGCCTTTGATTCAAATGAGGGGTTTTTTAGGGTTTTGGATTGAGCTGCATGGTTATGGTTTCCACTATCCTATTCCATGGAAGAATAATTGGGATTGGCTTGTGGTTAGCATAACTTTAGGAGCTTCATTAGCTCTCAATGATCCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGC ((((((.(((((((((((((.((((((((.((.((((((...(((.(((((.(..(((((((.(..((((...((.((((((............)))))).))...))))..).)))))))...).))))).))))))))).)).))))))))))))))))))))).)))))).. 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Pap-miR166d 1751713 1751733 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Pap-miR166d* 1751618 1751638 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Pap-MIR167a PmiREN016654 MIR167 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000004.1 3580217 3580361 + TCCCTTTGCTGGTGTGAAGGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCCGTTGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATGCAGTGGCTAACCAGATCATGTTGCAGCTTCAATCACTCATGGCCACCAACA ..........(((.(((..((((((((((((.((((((((((((((((((............................................)))))))....)))))))))))))))))))))))..)))..)))....... 3580237 3580341 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCCGTTGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATGCAGTGGCTAACCAGATCATGTTGCAGCTTCAAT (((((((((.((((((((((((((((((............................................)))))))....)))))))))))))))))))))) Pap-miR167a 3580237 3580256 TGAAGCTGCCAGCATGATCT Pap-miR167a* 3580321 3580341 AGATCATGTTGCAGCTTCAAT 3 Pap-MIR167b PmiREN016655 MIR167 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000035.1 1144336 1144452 - TTCTGTGCTCCACAAGCAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAATTCTCCATTCTTTCTCTAAATCATCAAAAGCTCAGATCATGTTGCAGTTTCATCTGCTGATAGGAGCACATGGG (((((((((((...(((((.(((((((((.((((((((((((................................))))))))))))))))))))).)))))....)))))))).))) 1144356 1144432 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAATTCTCCATTCTTTCTCTAAATCATCAAAAGCTCAGATCATGTTGCAGTTTCATC (((((((((.((((((((((((................................))))))))))))))))))))).. Pap-miR167b 1144411 1144432 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pap-miR167b* 1144356 1144376 AGATCATGTTGCAGTTTCATC 3 Pap-MIR167c PmiREN016656 MIR167 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000104.1 1146402 1146551 - TACTGTGCACCATCAGCTGCTGAAGCTGCCAGCTTGATCTGAAACTCTGATATTATATCCTCTCTCAGAAGAAATTAATGGAGGAAAAAAATATATATACACAGATCAGATCATGCTGCGCGGTTTCATTTGCTGATGGCAGCACAAAAA ...(((((.((((((((...(((((((((((((.((((((((...((((....((((((((((................))))))........))))....)))))))))))).)))).)))))))))...))))))))..))))).... 1146422 1146531 TGAAGCTGCCAGCTTGATCTGAAACTCTGATATTATATCCTCTCTCAGAAGAAATTAATGGAGGAAAAAAATATATATACACAGATCAGATCATGCTGCGCGGTTTCATT (((((((((((((.((((((((...((((....((((((((((................))))))........))))....)))))))))))).)))).))))))))).. Pap-miR167c 1146511 1146531 TGAAGCTGCCAGCTTGATCTG Pap-miR167c* 1146422 1146442 ATCATGCTGCGCGGTTTCATT 3 Pap-MIR167d PmiREN016657 MIR167 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000111.1 568577 568684 - TTCTGTGCACCAAAAGTTGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATTTGCTCATCCTTACTGTATAGATCAGATCATGTGGTAGTTTCATCTACTAATGGGAGCACATATC ...(((((.(((..(((.(.(((((((((((.((((((((((((((..((.......))..))))))))))))))))))))))))).).)))..)))..))))).... 568597 568664 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATTTGCTCATCCTTACTGTATAGATCAGATCATGTGGTAGTTTCATC (((((((((((.((((((((((((((..((.......))..))))))))))))))))))))))))).. Pap-miR167d 568643 568664 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pap-miR167d* 568597 568617 AGATCATGTGGTAGTTTCATC 3 Pap-MIR167e PmiREN016658 MIR167 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01003098.1 17437 17581 + TCCCTTTGCTGGTGTGAAGGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCCGTTGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATGCAGTGGCTAACCAGATCATGTTGCAGCTTCAATCACTCATGGCCACCAACA ..........(((.(((..((((((((((((.((((((((((((((((((............................................)))))))....)))))))))))))))))))))))..)))..)))....... 17457 17561 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCCGTTGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATGCAGTGGCTAACCAGATCATGTTGCAGCTTCAAT (((((((((.((((((((((((((((((............................................)))))))....)))))))))))))))))))))) Pap-miR167e 17457 17476 TGAAGCTGCCAGCATGATCT Pap-miR167e* 17541 17561 AGATCATGTTGCAGCTTCAAT 3 Pap-MIR167f PmiREN016659 MIR167 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000045.1 885617 885769 - TTGGTGCTCTGTGGAATGAATGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCATTGATTGATATATATGAGTGAGTTTATGAGAAAATATTCATGGATTTGCTGAGTCAGTCTTTGCTAGGTCATGCTTTGGCAGCCTCATTTCTTCCTATTTTTGGGCATA ...((((((...((((.((((((.((((((((((((((((((((..(((((((.....(.(((((((((((((........))))))))))))).))))))))..)))))))))))))..))))))).)))))).)))).......)))))). 885637 885749 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCATTGATTGATATATATGAGTGAGTTTATGAGAAAATATTCATGGATTTGCTGAGTCAGTCTTTGCTAGGTCATGCTTTGGCAGCCTCATT (((.((((((((((((((((((((..(((((((.....(.(((((((((((((........))))))))))))).))))))))..)))))))))))))..))))))).))).. Pap-miR167f 885729 885749 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Pap-miR167f* 885637 885657 TCATGCTTTGGCAGCCTCATT 3 Pap-MIR168a PmiREN016660 MIR168 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000069.1 191068 191160 - ATGTCGCCGCCGCCGCTGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGATCGGGGCTGGATCCTGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGAGGAGAGCGACGAT ..((((((.((.((.((((((((.((((((((((.(((((((.......))))))).)))))))))).)))))))).)).)).).)))))... 191088 191140 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGATCGGGGCTGGATCCTGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((((.......))))))).)))))))))).))).. Pap-miR168a 191120 191140 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAT Pap-miR168a* 191088 191108 CCTGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Pap-MIR168b PmiREN016661 MIR168 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000010.1 482314 482427 + TTGTCGCTGCCGCCGCTGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGACCAGGGCCGAATCCTTGCGGATTGGAACTGGATCCTGCCTTGCATCAACTGAATCGGCGGCGGAGAGCGACGAT ((((((((.((((((((((((((.((((((((((.(((((((((..((.(((((....)))))))..)))).))))).)))))))))).))))))))))))))..)))))))). 482334 482407 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGACCAGGGCCGAATCCTTGCGGATTGGAACTGGATCCTGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((((((..((.(((((....)))))))..)))).))))).)))))))))).))).. Pap-miR168b 482334 482354 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAC Pap-miR168b* 482387 482407 CCTGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Pap-MIR168c PmiREN016662 MIR168 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000166.1 121474 121596 - ATCTCGTCGCGCTCTCGAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAATCGATCTCGTTTTTGCGTTCGGAGTTAACGGATTGTCTGTTCCCTACTTGCATCAAGTGAATTCGAGAAAAAACGGCGTAGA ............(((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((...((.......)).)))))))))...)))))).))))))))))))))))))))))).............. 121494 121576 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAATCGATCTCGTTTTTGCGTTCGGAGTTAACGGATTGTCTGTTCCCTACTTGCATCAAGTGAAT (((((((((((((((.(((((((((((.((((...((.......)).)))))))))...)))))).))))))))))))))).. Pap-miR168c 121556 121576 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Pap-miR168c* 121494 121514 CCCTACTTGCATCAAGTGAAT 3 Pap-MIR169a PmiREN016663 MIR169 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000005.1 3500508 3500622 - AAGAAGCAGGGAGTGAAATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCATTAATACAACAATGATTTATTGATATTTGCCGGCAGGTTGTTCTTGGCTACATCTGGCTCTCTTCTTCTCAC (.((((.(((((((.(.(((.((((((((((((((((((((((..((((...(((((...))))).)))))))))))))))))))))))))).))).).))))))).)))))... 3500528 3500602 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCATTAATACAACAATGATTTATTGATATTTGCCGGCAGGTTGTTCTTGGCTACA .((((((((((((((((((((((..((((...(((((...))))).))))))))))))))))))))))))))... Pap-miR169a 3500582 3500602 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Pap-miR169a* 3500528 3500548 GGCAGGTTGTTCTTGGCTACA 3 Pap-MIR169b PmiREN016664 MIR169 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000080.1 1390211 1390371 + GTGGGAAGGAGGCTATACCGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCATGTTTTGTTGGCTTTTTTTAAAATGCACTCATTTTATGTGATTCATGTCATGTGTGCATGATGCACGAAATTAAACCGGCAAGTTATTGTTGGCTATATAGTTGCCTGCTTTTCTC ..((((((.((((...((.(((.((((((.(((((((((((((...(((((((..((..........((((((.(((..((((.....))))..))).))))))...)))))))))....))))))))))))).)))))).))).)).)))).)))))).. 1390231 1390351 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCATGTTTTGTTGGCTTTTTTTAAAATGCACTCATTTTATGTGATTCATGTCATGTGTGCATGATGCACGAAATTAAACCGGCAAGTTATTGTTGGCTATA .((((((.(((((((((((((...(((((((..((..........((((((.(((..((((.....))))..))).))))))...)))))))))....))))))))))))).)))))).)) Pap-miR169b 1390231 1390251 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Pap-miR169b* 1390331 1390351 GGCAAGTTATTGTTGGCTATA 3 Pap-MIR169c PmiREN016665 MIR169 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000725.1 273202 273313 - AGACGGAGAGTACATGCATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGAAACATACGCCATGCATGGCGGGTTGCCGGCAAGTTATTCATGGTTACATTCTGCTCTCTTCTTCTCAT (((.((((((((...(.(((.(((((.(((((((((((((((((......(((((....)))))..))))))))))))))))).))))).))).))))))))))))...... 273222 273293 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGAAACATACGCCATGCATGGCGGGTTGCCGGCAAGTTATTCATGGTTACA .(((((.(((((((((((((((((......(((((....)))))..))))))))))))))))).)))))... Pap-miR169c 273273 273293 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Pap-miR169c* 273222 273242 GGCAAGTTATTCATGGTTACA 3 Pap-MIR169d PmiREN016666 MIR169 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000064.1 2164647 2164797 - GAGGTTCAGAAAGCATGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACCCCTCACTTTATTTGCTCTTCATATGTTGTTTCGTTTCACTAAGAGAAACAATTCGGAGGAGAAAGTGGGCAAGTTGTTTTTGGCTATGTTTTGCTTTCTCATCCTCAT ((((...((((((((.((((.((((((((((((((((((.......((((((.....((((((....((((((((.(((....))).))))))))...)))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))))...)))).. 2164667 2164777 CAGCCAAGGATGACTTGCCGACCCCTCACTTTATTTGCTCTTCATATGTTGTTTCGTTTCACTAAGAGAAACAATTCGGAGGAGAAAGTGGGCAAGTTGTTTTTGGCTATG .((((((((((((((((((.......((((((.....((((((....((((((((.(((....))).))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))... Pap-miR169d 2164757 2164777 CAGCCAAGGATGACTTGCCGA Pap-miR169d* 2164667 2164687 GGCAAGTTGTTTTTGGCTATG 3 Pap-MIR169e PmiREN016667 MIR169 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000098.1 1570342 1570516 - GAGCCACAGGAAGTGTGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACCTTCGAAAAAATTTCTTATTCATGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCCACCTTGAGAGGAAGTATAAAGGAGAATAGGCCATTACGAAGAAGTGGGCAAGTTGTCTTTGGCTACATGTTACTTCCTTCTCCCCAT (((....((((((((..(((.((((((((((((((((((.(((((((....(((..(((((((.(....(((.((((((..............)))))).)))......).)))))))..))).)))))..)).)))))))))))))))))).)))..)))))))).)))..... 1570362 1570496 CAGCCAAGGATGACTTGCCGACCTTCGAAAAAATTTCTTATTCATGAAGACTCTCTCTCTCTCTCTCCACCTTGAGAGGAAGTATAAAGGAGAATAGGCCATTACGAAGAAGTGGGCAAGTTGTCTTTGGCTACA .((((((((((((((((((.(((((((....(((..(((((((.(....(((.((((((..............)))))).)))......).)))))))..))).)))))..)).))))))))))))))))))... Pap-miR169e 1570476 1570496 CAGCCAAGGATGACTTGCCGA Pap-miR169e* 1570362 1570382 GGCAAGTTGTCTTTGGCTACA 3 Pap-MIR169f PmiREN016668 MIR169 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000219.1 888219 888347 + AAGAGCTAGCCATTCTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTCATATGAGTTATCTGAAATGAGAGAACTCTGCTGTGGTTCAAAGGCAGTCTCCTTGGCTATTCAAAGTTGCTCTTTTCTTCA ((((((........((((((((((((((((.((((.((((.((.((.((...(((((.(((......))).)))))...)).))..)).)))))))))))))))))).))))))..))))))....... 888239 888327 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTCATATGAGTTATCTGAAATGAGAGAACTCTGCTGTGGTTCAAAGGCAGTCTCCTTGGCTATT ((((((((((.((((.((((.((.((.((...(((((.(((......))).)))))...)).))..)).)))))))))))))))))).. Pap-miR169f 888239 888258 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Pap-miR169f* 888307 888327 AAGGCAGTCTCCTTGGCTATT 3 Pap-MIR169g PmiREN016669 MIR169 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000579.1 204626 204755 - GAGAGGCAAAGAGTAGAACATAGCCAAGGATGACTTGCCTTCATTAGTTTACTTGAGAAGTATAATATAGCTCTAAGTATAAAAGGACAGCAAGTTATTCTTGGCATAAGTCCTGCTCTTTTCTTCTCAC ((((((.(((((((((.((.((((((((((((((((((..((.......((((((((..(((...)))..))).)))))......))..)))))))))))))))).)).)).))))))))).)))))).. 204646 204735 TAGCCAAGGATGACTTGCCTTCATTAGTTTACTTGAGAAGTATAATATAGCTCTAAGTATAAAAGGACAGCAAGTTATTCTTGGCATAAG ((((((((((((((((((..((.......((((((((..(((...)))..))).)))))......))..)))))))))))))))).)).. Pap-miR169g 204716 204735 TAGCCAAGGATGACTTGCCT Pap-miR169g* 204646 204666 GCAAGTTATTCTTGGCATAAG 3 Pap-MIR170 PmiREN016670 MIR170 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000177.1 1045005 1045127 + TGAAGAGAACTACAAGGAGGAGGTATTGGCGTGTCTCAATCTAAAGCCATGGCTGAGCTATTTCCACATCCATGTTCTTGGCTTGAGCCGCGTCAATATCTCCTTCCATACACAGTCTCATGC ...............((((((((((((((((((.(((((.((((...(((((.((...........)).)))))...)))).))))).))))))))))))))))))................. 1045025 1045107 AGGTATTGGCGTGTCTCAATCTAAAGCCATGGCTGAGCTATTTCCACATCCATGTTCTTGGCTTGAGCCGCGTCAATATCTCC (((((((((((((.(((((.((((...(((((.((...........)).)))))...)))).))))).))))))))))))).. Pap-miR170 1045087 1045107 TTGAGCCGCGTCAATATCTCC Pap-miR170* 1045025 1045045 AGGTATTGGCGTGTCTCAATC 3 Pap-MIR171a PmiREN016671 MIR171 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000010.1 154546 154679 + CGGTGAAAGAGGTATTGTGATGTTGGCTCGGTTCATTCAGAAAAGAATTACTGGCCCTCCTTGTTGTACATTCAATCATCTGAATCTCCTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCAGAACTTTTTTCATTTAC .((((((((((((.(((.(((((((((.(((((((.(((((((.((......((....)).........(((((......))))).)).))))))).))))))).))))))))).))).))))))))))))... 154566 154659 TGTTGGCTCGGTTCATTCAGAAAAGAATTACTGGCCCTCCTTGTTGTACATTCAATCATCTGAATCTCCTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.(((((((.((......((....)).........(((((......))))).)).))))))).))))))).))))))).. Pap-miR171a 154639 154659 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Pap-miR171a* 154566 154586 TGTTGGCTCGGTTCATTCAGA 3 Pap-MIR171b PmiREN016672 MIR171 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000069.1 775978 776103 - TGTTGAAAGAGCTACTGAGATGTTGGCCCGGTTCACTCAAACAAGGCATCGCTAGCCATCGAACCGACCGCTCCGGTCTGTTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGCACTCTTTCATATCTT ...((((((((...(((((((((((((.(((((((.(((((...(((.......)))...((((.(((((...))))).))))))))).))))))).)))))))))))))..))))))))...... 775998 776083 TGTTGGCCCGGTTCACTCAAACAAGGCATCGCTAGCCATCGAACCGACCGCTCCGGTCTGTTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.(((((...(((.......)))...((((.(((((...))))).))))))))).))))))).))))))).. Pap-miR171b 775998 776018 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Pap-miR171b* 776063 776083 TGTTGGCCCGGTTCACTCAAA 3 Pap-MIR171c PmiREN016673 MIR171 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000321.1 281317 281433 - TGAGCGTAATTTGAACGGGATATTGGTGCGGTTCAATTAGAGCGTAGTGCTTCAATGAATTGAAAGCTCTGTTCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCGCGTGCCTTCACCAGCTTCT ................(.((((((((((((((((((((((((..(((.(((((((....))).)))).)))..)))))))))))))))))))))))).).................. 281337 281413 TATTGGTGCGGTTCAATTAGAGCGTAGTGCTTCAATGAATTGAAAGCTCTGTTCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC ((((((((((((((((((((((..(((.(((((((....))).)))).)))..)))))))))))))))))))))).. 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Pap-miR172b 3252837 3252857 AGAATCATGATGATGCTGCAA Pap-miR172b* 3252798 3252818 GTGGCATCATCAAGATTCACA 3 Pap-MIR172c PmiREN016677 MIR172 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000082.1 804498 804608 + GAAAGCTGGTGACTGCAGGTGCTGCATCATCAAGATTCACGCAAAGCAAGGGATGAAAATCCCTATCGCGCGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAGTAAGCAGCTATGTA ...(((((.(.(((((.(((((.(((((((((((((((.(((......((((((....))))))...))).))))))))))))))).))))).))))).).)))))..... 804518 804588 GCTGCATCATCAAGATTCACGCAAAGCAAGGGATGAAAATCCCTATCGCGCGAATCTTGATGATGCTGCAT ((.(((((((((((((((.(((......((((((....))))))...))).))))))))))))))).)).. Pap-miR172c 804568 804588 CGAATCTTGATGATGCTGCAT Pap-miR172c* 804518 804538 GCTGCATCATCAAGATTCACG 3 Pap-MIR172d PmiREN016678 MIR172 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000034.1 2844302 2844389 - CCCTGATCACGTTGGAGTTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCAGCAGCGACTCACATATTTAGGCTTCGTTTGAAAGAGCATTT .............((((((..((((..((.(((((((((........))))))..))))).)))).))))))................ 2844322 2844369 AGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCAGCAGCGACTCACATATTTAGG .((((..((.(((((((((........))))))..))))).))))... 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Pap-miR172e 452711 452731 AGAATCTTGATGATGCTGCCT Pap-miR172e* 452877 452897 GTGGCATCATCAAGATTCACA 3 Pap-MIR172f PmiREN016680 MIR172 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000029.1 2847853 2847971 + AACAGTCATTGTTTGCTGGCGCCGTATCATCAAGATTCACGAACCTTGCTATCTTCACTGATGGCTTTCAAGGGATTGAGAATCTTGATGATGCTGCTTCGGCAATAAATGACTTCATC ...(((((((..(((((((.((.(((((((((((((((.(((.((((((((((......)))))).....)))).))).))))))))))))))).)).)))))))..)))))))..... 2847873 2847951 GCCGTATCATCAAGATTCACGAACCTTGCTATCTTCACTGATGGCTTTCAAGGGATTGAGAATCTTGATGATGCTGCTT ((.(((((((((((((((.(((.((((((((((......)))))).....)))).))).))))))))))))))).)).. 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Pap-miR172h 5711 5731 TGAATCTTGATGATGCTGCTT Pap-miR172h* 5772 5792 GCAGCATAATAGAGATTCATA 3 Pap-MIR319a PmiREN016683 MIR319 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000014.1 3331467 3331674 - AGAGCTGAAATTTGGTAAAGAGAGCTTCCTTCAGTTCACTCATGGCTGGCTTTAAGGTTAGATTAGCTGCTGAGTCATTCATGCAGATGCGAAGCAAAGATAGGATTTTTGGCTTTGTAAATGAGTGGATGAAGCAGGAGGTAAATCAGATCTTGACCCATCTTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTCTTCAATATCTCATGCAGT ...(((((...((((..(((.(((((((((((((((((..((.((.(((..((((((((.(((((.((.(((..((((((((.((..((((((((.((((......)))).))))))))..)).))))))))..))).)).).)))).)))))))).))).)).))..))))))))))))))))).)))..))))....))).))... 3331487 3331654 AGAGCTTCCTTCAGTTCACTCATGGCTGGCTTTAAGGTTAGATTAGCTGCTGAGTCATTCATGCAGATGCGAAGCAAAGATAGGATTTTTGGCTTTGTAAATGAGTGGATGAAGCAGGAGGTAAATCAGATCTTGACCCATCTTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT .(((((((((((((((((..((.((.(((..((((((((.(((((.((.(((..((((((((.((..((((((((.((((......)))).))))))))..)).))))))))..))).)).).)))).)))))))).))).)).))..)))))))))))))))))... 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Pap-miR390a 2442972 2442992 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Pap-miR390a* 2442873 2442893 CGCTATCTATCCTGAGTTTTA 3 Pap-MIR390b PmiREN016687 MIR390 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000202.1 1100464 1100601 - AAAGCATCGAAAAATCCTTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCACTGTTCATCAGAGCTCTCTAGAATTTACTGTATTTTTCGCTCGCTTGATATGTGGCGCTATCTATCCTGAGTTTTATGGTTTTTTCCTGCTCGCTC ..((((..((((((.((.((((((((((((.((((((((((((...(((...((((.....(((((.......)))))..))))...)))...)))))))))))).)))))))))))).)).)))))).))))..... 1100484 1100581 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCACTGTTCATCAGAGCTCTCTAGAATTTACTGTATTTTTCGCTCGCTTGATATGTGGCGCTATCTATCCTGAGTTTTA ((((((((((.((((((((((((...(((...((((.....(((((.......)))))..))))...)))...)))))))))))).)))))))))).. Pap-miR390b 1100561 1100581 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Pap-miR390b* 1100484 1100504 CGCTATCTATCCTGAGTTTTA 3 Pap-MIR390c PmiREN016688 MIR390 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000202.1 953014 953151 - AAAGCAGGGAGAAATCCTTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGTTCATCAGTTTTCTCGGAGATTTACTCAACTTTTCCTTCTCTTGATCTGTGACGCTATCTATCCTGAGTTTTATTGGTTATTCCTGCTCTCTC ..((((((((..((((..((((((((((((.((((((((.(((((.(((..((.......(((((...........)))))..))..))).))))).)))))))).))))))))))))..)))).))))))))..... 953034 953131 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGTTCATCAGTTTTCTCGGAGATTTACTCAACTTTTCCTTCTCTTGATCTGTGACGCTATCTATCCTGAGTTTTA ((((((((((.((((((((.(((((.(((..((.......(((((...........)))))..))..))).))))).)))))))).)))))))))).. 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Pap-miR394a 333139 333158 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Pap-miR394a* 333200 333220 GAGGTGGGCATCCTGCCAACA 3 Pap-MIR394b PmiREN016694 MIR394 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01002045.1 12301 12422 + AGGGTTGCTTGCAGAGGTTATTGGCATTCTGTCCACCTCCGACTCTTTGCATCTCCAAAATCCAGAGATCTAACTATTATGGAGGTGGGCATCCTGCCAACAGATCTCCGTTGTCATCCCTT ((((.((...((.((((((.((((((...((((((((((((.....(((.(((((.........))))).)))......))))))))))))...))))))..)))))).))...)).)))). 12321 12402 TTGGCATTCTGTCCACCTCCGACTCTTTGCATCTCCAAAATCCAGAGATCTAACTATTATGGAGGTGGGCATCCTGCCAACA ((((((...((((((((((((.....(((.(((((.........))))).)))......))))))))))))...)))))).. 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Pap-miR396b 345631 345651 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Pap-miR396b* 345569 345589 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA 3 Pap-MIR396c PmiREN016697 MIR396 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000026.1 411439 411543 + CTGTTCACCTCTTCATTCCCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCTTCGGCGGAGTTGGAGACGACAGTTCAGGAAAGCTGTGGGAAGATATGAAGAGCGTGCGAGGT .....(((((((((((..(.((((((((((((((((((((((((((((...)))))))....))))))))))))))))))))).)..)))))))).)))...... 411459 411523 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCTTCGGCGGAGTTGGAGACGACAGTTCAGGAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((((((((((((((((((...)))))))....))))))))))))))))))))).. Pap-miR396c 411459 411479 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Pap-miR396c* 411503 411523 GTTCAGGAAAGCTGTGGGAAG 3 Pap-MIR396d PmiREN016698 MIR396 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000034.1 586335 586467 - AGATGGTCTACCTTGTTGTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCATAATTCTACGAAGGAGGAGGGTGCAAACTGCAAACTGCAAACTGCAGTTCAAGACAGCTGTGGGAAACCACAGGGAGAGGCCAATTC ...((((((.((((((.((.((((((((((.((((((((((((......((((....))))(.((..((((...))))..)).)....)))))))))))).)))))))))).)).))))))..)))))).... 586355 586447 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCATAATTCTACGAAGGAGGAGGGTGCAAACTGCAAACTGCAAACTGCAGTTCAAGACAGCTGTGGGAAA ((((((((((.((((((((((((......((((....))))(.((..((((...))))..)).)....)))))))))))).)))))))))).. Pap-miR396d 586427 586447 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Pap-miR396d* 586355 586375 GTTCAAGACAGCTGTGGGAAA 3 Pap-MIR397 PmiREN016699 MIR397 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000222.1 967814 967960 - AAAACAGACCAAAGGCATGTTTGAGGGCAGCGTTGATGAAATCATCCACAGCTCTTTCTCCTTCTCTTCCACTTTAAGAGAAAATGGGGAAAGGAATCAGGAGGTCTTGTCAGCGCTGCAATCAATCATGACTCTGTTTTGTTAGGC ..((((((.((.((.((((.((((..(((((((((((((.(((.(((.....((((((((((((((((.......)))))))...))))))))).....)))))).)))))))))))))..)))).)))).)).)).)))))).... 967834 967940 TTGAGGGCAGCGTTGATGAAATCATCCACAGCTCTTTCTCCTTCTCTTCCACTTTAAGAGAAAATGGGGAAAGGAATCAGGAGGTCTTGTCAGCGCTGCAATCAATC ((((..(((((((((((((.(((.(((.....((((((((((((((((.......)))))))...))))))))).....)))))).)))))))))))))..)))).. 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Pap-miR529 255383 255403 AGAAGAGAGAGAGTACAGCCT Pap-miR529* 255305 255325 GTTGTGCTCTCTCTCTTCCTC 3 Pap-MIR535a PmiREN016703 MIR535 Phalaenopsis aphrodite Pap-NEWO01000759.1 68264 68385 - TTTGCTTGGATTTGTTGGGCTGACAAAGAGAGAGAGCACGCTAGTTGGCGTCCATGAACAAGACCATGGCCGTACACTTGCGTGCTCTCTCTTGTTGTCATCCATTTAGCTGTGCAAAATGT (((((..((......((((.((((((.((((((((((((((.(((..(((.(((((........))))).)))..))).)))))))))))))).)))))))))).....))..))))).... 68284 68365 TGACAAAGAGAGAGAGCACGCTAGTTGGCGTCCATGAACAAGACCATGGCCGTACACTTGCGTGCTCTCTCTTGTTGTCATC ((((((.((((((((((((((.(((..(((.(((((........))))).)))..))).)))))))))))))).)))))).. 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