miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Pvi-MIR156a PmiREN016276 MIR156 Panicum virgatum Pvi-Chr01K 8672750 8672877 - GCGGAGAGGCTCTTGGGAGATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGAACAACATAACATGTATGTTGTTCTCACCGCGTGCTCACTCCTCTTACTGTCATTCTCTCTTTTTGAAGGGCTTTA ......((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((..(((.((((((((((.....)))))))))))))))).))))))))).))))).)))))).))))))......)))))))).. 8672770 8672857 TTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGAACAACATAACATGTATGTTGTTCTCACCGCGTGCTCACTCCTCTTACTGTCATTC .((((((((((((((((((((.(((..(((.((((((((((.....)))))))))))))))).))))))))).))))).))))))... 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Pvi-miR156j 6746580 6746600 TTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Pvi-miR156j* 6746514 6746534 GCTCACTCTCTATCTGTCAGC 3 Pvi-MIR156k PmiREN016286 MIR156 Panicum virgatum Pvi-Chr06K 56725145 56725305 + GTGGTTTTTTCCATGGCTAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCCAGACTGCATCGATCCGCACCTTTGCAATCGAGACGGCGCACGAACGAACGATGCAGCTGCTGCTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCGGTCCTCTCTCCGGCCTCACCCTG ...................((((((((((((((((((((((.(((((((.((.((((((((.((.((.(((((.......))).)).))......)).))))))))))))))))).)))))))).))))).)))))))))...........(........) 56725165 56725285 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCCAGACTGCATCGATCCGCACCTTTGCAATCGAGACGGCGCACGAACGAACGATGCAGCTGCTGCTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCGGTC (((((((((((((((((((((.(((((((.((.((((((((.((.((.(((((.......))).)).))......)).))))))))))))))))).)))))))).))))).)))))))).. 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Pvi-miR159c 16044208 16044227 TTGCATGACCGAGGAGCTGC Pvi-miR159c* 16044303 16044323 AGCTGCTCGTTCATGGTTCCC 3 Pvi-MIR159d PmiREN016300 MIR159 Panicum virgatum Pvi-Chr05N 16099819 16100060 - CGTCCCCTCGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCGTCTCGATCCCATCAGGCCCTCCTGCTTCCGTTTGTGAGCCCTACTAATTAATGGCCGCTACTTAGGTTTACATGCTTAATCACAGCTCGTACTATTCGTTTGATGTGCTAATCCGTGTAGTCTATGTGGAGAGCTGGTTGGGATTAGTATAGCTTGTTACTGTTTCTTTCAACTATTTTCATCGTTATCGCATAACATT .((..((.....))..))....(((.(((((((((((...((..((.(((((((...(((.((((.((..(((((....((.....))....)))))..)).((.(((..(((((((......((((..(((.((.....)).)))))))......))))))).))).)))))).)))...)))))))))....))........))))))))))))))................(......) 16099839 16100040 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCGTCTCGATCCCATCAGGCCCTCCTGCTTCCGTTTGTGAGCCCTACTAATTAATGGCCGCTACTTAGGTTTACATGCTTAATCACAGCTCGTACTATTCGTTTGATGTGCTAATCCGTGTAGTCTATGTGGAGAGCTGGTTGGGATTAGTATAGCTTGTTACTGTTTCTTTCAACTATTTT ..(((.(((((((((((...((..((.(((((((...(((.((((.((..(((((....((.....))....)))))..)).((.(((..(((((((......((((..(((.((.....)).)))))))......))))))).))).)))))).)))...)))))))))....))........)))))))))))))).... Pvi-miR159d 16100020 16100040 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG Pvi-miR159d* 16099839 16099859 ACTGTTTCTTTCAACTATTTT 3 Pvi-MIR159e PmiREN016301 MIR159 Panicum virgatum Pvi-Chr05K 15266418 15266682 - GGATGGTTGGATTGGAAGCGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAAGGCCCTTTCGCTGGGTTGGTACAGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTAGTCCTATCTCATCACCTGGAGGGTTTATCTGAAAGAGAGGGTGAGATGAGTCATGAGTGGCCTGGTGTTTGGCTTGAGATAGGCTTTGTGGCTTGCATGACCGAGGAGCTGCACCGTCCCCTTGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCGTC .(((......)))....(((((((((((.(((.(((((.((..((((.....((.(((.((((.(((((.((((.(((((....((((.((.(((((((((.((((..((...(((((((........))))))).....))..).)))(((........))).)))))))))))..))))....))))).)))).))))).))))..)))..)).))))..)).))))).))).)))))))))))... 15266438 15266662 GAGCTCCTATCATTCCAATGAAAGGCCCTTTCGCTGGGTTGGTACAGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTAGTCCTATCTCATCACCTGGAGGGTTTATCTGAAAGAGAGGGTGAGATGAGTCATGAGTGGCCTGGTGTTTGGCTTGAGATAGGCTTTGTGGCTTGCATGACCGAGGAGCTGCACCGTCCCCTTGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTG ((((((((.(((.(((((.((..((((.....((.(((.((((.(((((.((((.(((((....((((.((.(((((((((.((((..((...(((((((........))))))).....))..).)))(((........))).)))))))))))..))))....))))).)))).))))).))))..)))..)).))))..)).))))).))).)))))))).. Pvi-miR159e 15266438 15266458 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG Pvi-miR159e* 15266642 15266662 GAGCTCCTATCATTCCAATGA 3 Pvi-MIR159f PmiREN016302 MIR159 Panicum virgatum Pvi-Chr05N 16087674 16087932 - GGATGGTTGGATTGGAAGCGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAGGGTCCTTTCGCTGGGTTGGTACAGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCTCATCTCCTGGAGGGTTTATCTCAGAGAGAGAGGGAGAGATGAGTGGCCTGGTGTTTGGCTTGAGATAGGCTTTGTGGCTTGCATGACCGAGGAGCTGCACCGTTCCCTTGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCGTCTTGATC .........(((((((.(((((((((((.(((.(((((.((..((((.....((.(((.((((.(((((.((((.(((((....((((...(((((((((((((((..........((((.....)))))))))).......((((........)))))))))))))....))))....))))).)))).))))).))))..)))..)).))))..)).))))).))).))))))))))).)).))))) 16087694 16087912 GAGCTCCTATCATTCCAATGAAGGGTCCTTTCGCTGGGTTGGTACAGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCTCATCTCCTGGAGGGTTTATCTCAGAGAGAGAGGGAGAGATGAGTGGCCTGGTGTTTGGCTTGAGATAGGCTTTGTGGCTTGCATGACCGAGGAGCTGCACCGTTCCCTTGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTG ((((((((.(((.(((((.((..((((.....((.(((.((((.(((((.((((.(((((....((((...(((((((((((((((..........((((.....)))))))))).......((((........)))))))))))))....))))....))))).)))).))))).))))..)))..)).))))..)).))))).))).)))))))).. Pvi-miR159f 16087694 16087714 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG Pvi-miR159f* 16087892 16087912 GAGCTCCTATCATTCCAATGA 3 Pvi-MIR160a PmiREN016303 MIR160 Panicum virgatum Pvi-Chr01K 6815559 6815682 - GATCAAATTGAGATTGTGTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCAACCCGTGGCGTGGTTGCCTGCTGTGGGTGGCATGCAAGGGGCCAAGCATGCATTTTTGTTTCGATCTTCT ......((((((((.((((((((.(((((((.((((((((((.(((((((..(((((((...)).))))).)))).))).)))))))))).))))))).))))))))....))))))))..... 6815579 6815662 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCAACCCGTGGCGTGGTTGCCTGCTGTGGGTGGCATGCAAGGGGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((.(((((((..(((((((...)).))))).)))).))).)))))))))).))))))).))).. 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Pvi-miR160b 6098750 6098770 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Pvi-miR160b* 6098687 6098707 GCGTGCAAGGGGCCAAGCATG 3 Pvi-MIR160c PmiREN016305 MIR160 Panicum virgatum Pvi-Chr02K 6186910 6187055 - GTGAAAAGTTCTAGGGAATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCACGGCTACCACCTGGATCGGAGATTTTGTTGATCGATCGATCGGTGGCCGCTGCGGCTGGCGTGCGAGGTGCCAAGCATGGCCCTCATCTCTCTCTCTCT ((((.........(((..(((((.((((.((.(((((((((.(((((((((((((.....((((((.((((.....))))..)))))))))))))).))))).))))))))).)).)))).))))).)))))))............ 6186930 6187035 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCACGGCTACCACCTGGATCGGAGATTTTGTTGATCGATCGATCGGTGGCCGCTGCGGCTGGCGTGCGAGGTGCCAAGCATG (((.((((.((.(((((((((.(((((((((((((.....((((((.((((.....))))..)))))))))))))).))))).))))))))).)).)))).))).. 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Pvi-miR160d 5309768 5309788 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Pvi-miR160d* 5309682 5309702 GCGTGCGAGGTGCCAAGCATG 3 Pvi-MIR160e PmiREN016307 MIR160 Panicum virgatum Pvi-Chr04K 59783531 59783654 + GATCGGCTATAGCTCGTGTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCAACCCGTGGCGCGATTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATGCAGAACAGGCCGTGATCATC ((((((((...(.((.(((((((.(((((((.((((((((((.((((((..((((..(((...))).)))).))).))).)))))))))).))))))).))))))))).).))))..))))... 59783551 59783634 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCAACCCGTGGCGCGATTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((.((((((..((((..(((...))).)))).))).))).)))))))))).))))))).))).. 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Pvi-miR166c 95538389 95538409 TCGGACCAGGCTTCATTCCTC Pvi-miR166c* 95538307 95538327 GGAATGTTGGCTGGCTCGAGG 3 Pvi-MIR166d PmiREN016327 MIR166 Panicum virgatum Pvi-Chr01N 94476118 94476260 - TTGGTCATGGGGGCTTGTGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCATCCGCGCGTCCTAGCTAAGCTTGCAGATCACTGCCTGCTGCCGTGCAGATCGAGAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCGCAAGCCAGTGTATCCATGG ....((((((((((((((((((((((..(.((((.((((.(((((.(((((.....((..(((..((((....))))..)))))))))).)))......)).)))).)))).)..)))))))))))))))......))))))) 94476138 94476240 GGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCATCCGCGCGTCCTAGCTAAGCTTGCAGATCACTGCCTGCTGCCGTGCAGATCGAGAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTC ((((((..(.((((.((((.(((((.(((((.....((..(((..((((....))))..)))))))))).)))......)).)))).)))).)..)))))).. 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Pvi-miR166t 25007468 25007488 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Pvi-miR166t* 25007552 25007572 GGAATGTTGTCTGGTTCAAGG 3 Pvi-MIR166u PmiREN016344 MIR166 Panicum virgatum Pvi-Chr09N 57556388 57556512 - ATCATCTTATCTTGTTGAGGGGAATGTCGTCTGGAGCGAGACCGGCCGGACAACGGGCGGCGTGGGCCGTCGCCTCGGACGGTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACGGCTCCATCTGTCGC ((.........((((((.((((((((..((((((..((((((((.(((......((((((((.....))))))))))).))))))))..))))))..)))))))).))))))........))... 57556408 57556492 GGAATGTCGTCTGGAGCGAGACCGGCCGGACAACGGGCGGCGTGGGCCGTCGCCTCGGACGGTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((..((((((((.(((......((((((((.....))))))))))).))))))))..))))))..)))))).. Pvi-miR166u 57556408 57556428 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Pvi-miR166u* 57556472 57556492 GGAATGTCGTCTGGAGCGAGA 3 Pvi-MIR166v PmiREN016345 MIR166 Panicum virgatum Pvi-scaffold_3563 4229 4417 - GAGCCTTTTCGTCTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGGGGGCGCCGCTCTTTCTCTGACCTGCCCCTTTCTCCTCCATCTCGCTCTTCCTTTCTCTCTTGGAGATCAAGAGGAGACGGGCAGGGGTGAGAGGAGATGGGTGTAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAAAAGGATGGGCTCCCCA ((((((.(((...((((.((((((((..((((((.(((((((((((..((((((((...(((((((...(((((((.(((((...................)))))...))))))).)))))))...)))).))))..)))))...)))))).))))))..)))))))).)))).))).)))))).... 4249 4397 GGAATGTTGTCTGGCTCGGGGGCGCCGCTCTTTCTCTGACCTGCCCCTTTCTCCTCCATCTCGCTCTTCCTTTCTCTCTTGGAGATCAAGAGGAGACGGGCAGGGGTGAGAGGAGATGGGTGTAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.(((((((((((..((((((((...(((((((...(((((((.(((((...................)))))...))))))).)))))))...)))).))))..)))))...)))))).))))))..)))))).. Pvi-miR166v 4249 4269 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Pvi-miR166v* 4377 4397 GGAATGTTGTCTGGCTCGGGG 3 Pvi-MIR167a PmiREN016346 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr01K 7103042 7103293 - TGGTGGTGTGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAGGACCCAAACAACCATCGGTTTTCAGGGTCTAGTCATACCGCAATGCGAGAGGGTTAGTGATAGTTTGGTGATATATATGGCCGGTTGAGTATGTTAAGTGGAGGAGGGATTCTTGGGTCTTCTGATATGGTTTCTGAATTTGTGAGCATGCATGCTTGGTCAGTCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCACCGCCACCAAAGGATC (((((((((((((((.(((((((((.(((((((((((.((((((....((((...))))....)))))).((((((((............)))..)))))......(((((.....((((((((...(((((((.....(((...(((..((...(((....)))..))..)))...)))...)))))))..)).))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))))))....... . 7103062 7103273 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAGGACCCAAACAACCATCGGTTTTCAGGGTCTAGTCATACCGCAATGCGAGAGGGTTAGTGATAGTTTGGTGATATATATGGCCGGTTGAGTATGTTAAGTGGAGGAGGGATTCTTGGGTCTTCTGATATGGTTTCTGAATTTGTGAGCATGCATGCTTGGTCAGTCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACT (((((((((.(((((((((((.((((((....((((...))))....)))))).((((((((............)))..)))))......(((((.....((((((((...(((((((.....(((...(((..((...(((....)))..))..)))...)))...)))))))..)).))))))))))))))))))))))))))))))).. Pvi-miR167a 7103252 7103273 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167a* 7103062 7103082 AGATCATGTTGCAGCTTCACT 3 Pvi-MIR167b PmiREN016347 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr01K 5372279 5372365 + TGATATGGTTTCTGAATTTGTGAGCATGCATGCTTGGTCAGTCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCACCGCCACCAAAGGA (....((((...(((....((((((.((((.((.(((((........))))).)))))))).))))....)))..))))....)... 5372299 5372345 TGAGCATGCATGCTTGGTCAGTCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACT (((((.((((.((.(((((........))))).)))))))).))).. Pvi-miR167b 5372325 5372345 AGATCATGTTGCAGCTTCACT Pvi-miR167b* 5372299 5372319 TGAGCATGCATGCTTGGTCAG 3 Pvi-MIR167c PmiREN016348 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr01N 6499255 6499520 - GTTTTGGTGGTGTGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAGGGCCCAAACAACCATCGGTTTTCAGGGTTTAGTCATACCGCAATGCGAGGGGAAGATGCTGGCTCTTAAGGATTAGTGATAGTTTGGTGACATATGGGGTTGAGTGGTTAACTGGAGGAGGAATTCTTGGGTCTTCTGATATGGCTTCTGAATTTGTGAACATGCATGCTTGGTCAGTCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCT ..............((((..(((((((((.((((((((((((((((((......((((..(((.(((((.(...(((((.((.....((.((.(.....).)).))......))....)))))).))))).)))..))))((((((....)))))).(((((....)))))))))))))....((((((.((((...(((......)))...))))..)))))).))))))))))))))))))))))) 6499275 6499500 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAGGGCCCAAACAACCATCGGTTTTCAGGGTTTAGTCATACCGCAATGCGAGGGGAAGATGCTGGCTCTTAAGGATTAGTGATAGTTTGGTGACATATGGGGTTGAGTGGTTAACTGGAGGAGGAATTCTTGGGTCTTCTGATATGGCTTCTGAATTTGTGAACATGCATGCTTGGTCAGTCATCAGATCATGTTGCAGCTTCACT (((((((((.((((((((((((((((((......((((..(((.(((((.(...(((((.((.....((.((.(.....).)).))......))....)))))).))))).)))..))))((((((....)))))).(((((....)))))))))))))....((((((.((((...(((......)))...))))..)))))).))))))))))))))))))).. Pvi-miR167c 6499479 6499500 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167c* 6499275 6499295 AGATCATGTTGCAGCTTCACT 3 Pvi-MIR167d PmiREN016349 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr02K 10591843 10591977 - TTGGTGCATCCTCTAGGAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGACGAGTGTTTAATTAGCAAGTTGACCCCAGAAATGATGAATGCTAACGATCAGATCATGCTTTGCAGTTTCATCTGCTCGTGGGTGCACAGCAG ...........((((.(((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((.....(((....)))...)))))))))))..)).))))))))))))..)))))))))...)))).)))).......... 10591863 10591957 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGACGAGTGTTTAATTAGCAAGTTGACCCCAGAAATGATGAATGCTAACGATCAGATCATGCTTTGCAGTTTCATC (((((((((.((((((((((((((((((((((.(((.....(((....)))...)))))))))))..)).))))))))))))..))))))))).. 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Pvi-miR167e 7676625 7676646 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167e* 7676556 7676576 ATCATGCTTTGCAGTTTCATC 3 Pvi-MIR167f PmiREN016351 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr03K 68715377 68715540 + AGCGGTGCTCCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTATTTTACCTCTCTCCCTGATTGCCAAGGACGAATTCAGAGATTCGGGGAGAGAGGAATAGGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGTGCACAACGA ....(((((((((.(((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((......))))....(((((((((((((.......................)))))))))))))....).))))))))))))))))))))))))).))).))))).))))..... 68715397 68715520 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTATTTTACCTCTCTCCCTGATTGCCAAGGACGAATTCAGAGATTCGGGGAGAGAGGAATAGGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATC (((((((((.((((((((((((((.(((((......))))....(((((((((((((.......................)))))))))))))....).))))))))))))))))))))))).. Pvi-miR167f 68715397 68715418 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167f* 68715500 68715520 AGGTCATGCTGTAGTTTCATC 3 Pvi-MIR167g PmiREN016352 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr03N 51687126 51687290 - AGCGGTGCTCCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTTACCTCGATCTCCTCCTGATCGCCGAGGACGAATTCAGGATAGGGGAAAGAGGAATAATAAGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGTGCACAACGA ....(((((((((.(((.(((((((((((.((((((((((((((.(....(((....((.((((..(((((((((((((((....).)))..))))))..)))))..))))))..)))).))))))))))))))))))))))))).))).))))).))))..... 51687146 51687270 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTATGATATGCTTTTACCTCGATCTCCTCCTGATCGCCGAGGACGAATTCAGGATAGGGGAAAGAGGAATAATAAGCGTCAGGTCATGCTGTAGTTTCATC (((((((((.((((((((((((((.(....(((....((.((((..(((((((((((((((....).)))..))))))..)))))..))))))..)))).))))))))))))))))))))))).. Pvi-miR167g 51687249 51687270 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167g* 51687146 51687166 AGGTCATGCTGTAGTTTCATC 3 Pvi-MIR167h PmiREN016353 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr04N 48286602 48286734 + TGTTTGCTGGTGTGAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCTGCTCAATCGCCGGGCCCTGAACTATGAAGTGTCTGGAGATGCTTCACCAGATCATGTTGTAGCTTCACCCTCTCGCAACCAGCAAGTTG ..(((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((((.((....(((.((((((.((.........)).)))))).)))....))))))))))))))))))))))).)))))))).)))))))))... 48286622 48286714 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCTGCTCAATCGCCGGGCCCTGAACTATGAAGTGTCTGGAGATGCTTCACCAGATCATGTTGTAGCTTCACC (((((((((.((((((((((((.((....(((.((((((.((.........)).)))))).)))....))))))))))))))))))))))).. Pvi-miR167h 48286622 48286642 TGAAGCTGCCAGCATGATCTG Pvi-miR167h* 48286694 48286714 AGATCATGTTGTAGCTTCACC 3 Pvi-MIR167i PmiREN016354 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr05K 96370252 96370410 - GTGTGTGCACATTAAGCAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTCTTCTTCTAGTTATTAAGTTCCTTCTTCTGGTGATGAAGGTCTGGCAATTTTGGATGATGCCTAGATTCAGATCTTGCTGTGCAGTTTCACCTGCTCATTGGAGCACAGAAA ....((((.((...(((((.((((((((((((((.((((((((((....((.(((((......((..(((((.((....)).))))).)).......))))).)).....))).))))))).))))).))))))))).)))))...))..))))..... 96370272 96370390 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTCTTCTTCTAGTTATTAAGTTCCTTCTTCTGGTGATGAAGGTCTGGCAATTTTGGATGATGCCTAGATTCAGATCTTGCTGTGCAGTTTCACC ((((((((((((((.((((((((((....((.(((((......((..(((((.((....)).))))).)).......))))).)).....))).))))))).))))).))))))))).. Pvi-miR167i 96370369 96370390 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167i* 96370272 96370292 ATCTTGCTGTGCAGTTTCACC 3 Pvi-MIR167j PmiREN016355 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr05N 88814160 88814329 - ATGTGTGCACATTAAGCAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTCTTCTTCTACTTAAGTTCCTATTCCTTCTTCTGGTGATGAAGGTCTGGCAACTTTAATTTGGATGATGCCTAGACGACTCAGATCTTGCTGCGCAGTTTCACCTGCTCATTGGAGCACAGAAA .(.(((((.((...(((((.((((((((((((((.((((((((((....((.((((...(((((.(((..(((((.((....)).)))))..))).))))).....)))).)).....)))....))))))).))))).))))))))).)))))...))..))))).).. 88814180 88814309 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTCTTCTTCTACTTAAGTTCCTATTCCTTCTTCTGGTGATGAAGGTCTGGCAACTTTAATTTGGATGATGCCTAGACGACTCAGATCTTGCTGCGCAGTTTCACC ((((((((((((((.((((((((((....((.((((...(((((.(((..(((((.((....)).)))))..))).))))).....)))).)).....)))....))))))).))))).))))))))).. Pvi-miR167j 88814288 88814309 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167j* 88814180 88814200 ATCTTGCTGCGCAGTTTCACC 3 Pvi-MIR167k PmiREN016356 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr05N 88625950 88626119 - ATGTGTGCACATTAAGCAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTCTTCTTCTACTTAAGTTCCTATTCCTTCTTCTGGTGATGAAGGTCTGGCAACTTTAATTTGGATGATGCCTAGACGACTCAGATCTTGCTGCGCAGTTTCACCTGCTCATTGGAGCACAGAAA .(.(((((.((...(((((.((((((((((((((.((((((((((....((.((((...(((((.(((..(((((.((....)).)))))..))).))))).....)))).)).....)))....))))))).))))).))))))))).)))))...))..))))).).. 88625970 88626099 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTCTTCTTCTACTTAAGTTCCTATTCCTTCTTCTGGTGATGAAGGTCTGGCAACTTTAATTTGGATGATGCCTAGACGACTCAGATCTTGCTGCGCAGTTTCACC ((((((((((((((.((((((((((....((.((((...(((((.(((..(((((.((....)).)))))..))).))))).....)))).)).....)))....))))))).))))).))))))))).. Pvi-miR167k 88626078 88626099 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167k* 88625970 88625990 ATCTTGCTGCGCAGTTTCACC 3 Pvi-MIR167l PmiREN016357 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr09K 83695709 83695853 - GTCTGTGCAGCACAAGAAGATGAAGCTGCCAGCATGATCTGAAAGCCGACGCGTTCGTCCTGATCGTGTCTGGAGAGGGACTGCACGGGAAACAGCAGGCGACCAGATCATCTAGCAGTTTCATTCTCTTGTGGCGGCACACACA ((.(((((.((((((((.(((((((((((.((.((((((((...(((...((.....(((((..((.((((......))))))..)))))....)).)))...)))))))))).))))))))))).)))))).)).))))).)). 83695729 83695833 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAAAGCCGACGCGTTCGTCCTGATCGTGTCTGGAGAGGGACTGCACGGGAAACAGCAGGCGACCAGATCATCTAGCAGTTTCATT (((((((((.((.((((((((...(((...((.....(((((..((.((((......))))))..)))))....)).)))...)))))))))).))))))))).. Pvi-miR167l 83695812 83695833 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167l* 83695729 83695749 AGATCATCTAGCAGTTTCATT 3 Pvi-MIR167m PmiREN016358 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr09N 118515341 118515496 - GTCTGTGCAGCACAAGAAGATGAAGCTGCCAGCATGATCTGAAAGCCGGCCGACGCGTTCTTCGTGATCGTGTCTGCAGAGGGACTGCACGCACGGGAAACAGCAGGCGACCTGCAGATCATCTAGCAGTTTCATTCTCTTGTGGCGGCACACACC ((.(((((.((((((((.(((((((((((.((.(((((((((((((((.....)).))).)))((..((((((.(((((.....))))).))))))...)).(((((...)))))))))))))).))))))))))).)))))).)).))))).)). 118515361 118515476 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAAAGCCGGCCGACGCGTTCTTCGTGATCGTGTCTGCAGAGGGACTGCACGCACGGGAAACAGCAGGCGACCTGCAGATCATCTAGCAGTTTCATT (((((((((.((.(((((((((((((((.....)).))).)))((..((((((.(((((.....))))).))))))...)).(((((...)))))))))))))).))))))))).. Pvi-miR167m 118515455 118515476 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Pvi-miR167m* 118515361 118515381 AGATCATCTAGCAGTTTCATT 3 Pvi-MIR167n PmiREN016359 MIR167 Panicum virgatum Pvi-scaffold_621 133 288 + GTCTGTGCAGCACAAGAAGATGAAGCTGCCAGCATGATCTGAAAGCCGGCCGACGCGTTCTTCGTGATCGTGTCTGCAGAGGGACTGCACGCACGGGAAACAGCAGGCGACCTGCAGATCATCTAGCAGTTTCATTCTCTTGTGGCGGCACACACC ((.(((((.((((((((.(((((((((((.((.(((((((((((((((.....)).))).)))((..((((((.(((((.....))))).))))))...)).(((((...)))))))))))))).))))))))))).)))))).)).))))).)). 153 268 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAAAGCCGGCCGACGCGTTCTTCGTGATCGTGTCTGCAGAGGGACTGCACGCACGGGAAACAGCAGGCGACCTGCAGATCATCTAGCAGTTTCATT (((((((((.((.(((((((((((((((.....)).))).)))((..((((((.(((((.....))))).))))))...)).(((((...)))))))))))))).))))))))).. 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Pvi-miR167p 68713627 68713647 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Pvi-miR167p* 68713722 68713742 ATCATGCATGACAGCCTCATT 3 Pvi-MIR167q PmiREN016362 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr03N 51699091 51699248 - CAAATGCTCGTGTGAATGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGTTGGCATCATTGGCACACAAACACAGTCACCAGATCGGTTGGCCTGGTGGACCTGCAAATCATTGTTAGATCATGCATGACAGCCTCATTTCTTCACAATGTTCAGCATG ...(((((((((((((.((((((.((((.((((((((((((((..(((((.(((.....((..(((.....((((((((.....)).))).))))))..))))).)))))..)))))))))))).)).)))).)))))).))))).)))...))))). 51699111 51699228 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGTTGGCATCATTGGCACACAAACACAGTCACCAGATCGGTTGGCCTGGTGGACCTGCAAATCATTGTTAGATCATGCATGACAGCCTCATT (((.((((.((((((((((((((..(((((.(((.....((..(((.....((((((((.....)).))).))))))..))))).)))))..)))))))))))).)).)))).))).. 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Pvi-miR167s 108054819 108054839 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Pvi-miR167s* 108054738 108054758 TCATGCTGCGGCAGCCTCACT 3 Pvi-MIR167t PmiREN016365 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr09N 10240548 10240712 + TGAGTGCCCAAGGGAAAGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTCGTGTGGGGGCGCAAGCGATGCCATGGCATGGCATGGCGAGGTCGCTGCGCTGAGGCTTATTTTGGGCGGTGGTGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACTCTTTCCCTCTGGGCACGTCG ...((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((.(..((.(((((((...))))))).))..)))).))))))....(((((...)))))....).)))))))))))))).).)))))))))))))))))).))))))).... 10240568 10240692 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTCGTGTGGGGGCGCAAGCGATGCCATGGCATGGCATGGCGAGGTCGCTGCGCTGAGGCTTATTTTGGGCGGTGGTGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACT (((((((((((((((((((((((.(((((((.(((.(..((.(((((((...))))))).))..)))).))))))....(((((...)))))....).)))))))))))))).).)))))))).. Pvi-miR167t 10240568 10240588 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Pvi-miR167t* 10240672 10240692 TCATGCTGTGACAGTTTCACT 3 Pvi-MIR167u PmiREN016366 MIR167 Panicum virgatum Pvi-Chr09N 8913833 8914009 + TGAGTGCCCAAGAGATAGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTCGTGTGGGGGGCGCAAACTAAAGCGATGCCGTGGCATGGCATGGCGAGGTTGCTGCGCTAGCTGAGGCTTATTTTTGGGCGGTGGTGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACTCTTTCCCTCTGGGCACGTCG ...(((((((((.((.(((((((((((((((((((((((((((..........((((((((((...((.(((((((...))))))).))..))))..)))))).(((...(((((....)))))...))))))))))))))))).).)))))))))))).)).)).))))))).... 8913853 8913989 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTCGTGTGGGGGGCGCAAACTAAAGCGATGCCGTGGCATGGCATGGCGAGGTTGCTGCGCTAGCTGAGGCTTATTTTTGGGCGGTGGTGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACT (((((((((((((((((((((((..........((((((((((...((.(((((((...))))))).))..))))..)))))).(((...(((((....)))))...))))))))))))))))).).)))))))).. Pvi-miR167u 8913853 8913873 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Pvi-miR167u* 8913969 8913989 TCATGCTGTGACAGTTTCACT 3 Pvi-MIR167v PmiREN016367 MIR167 Panicum virgatum Pvi-scaffold_20695 828 992 - TGAGTGCCCAAGGGAAAGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTCGTGTGGGGGCGCAAGCGATGCCATGGCATGGCATGGCGAGGTCGCTGCGCTGAGGCTTATTTTGGGCGGTGGTGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACTCTTTCCCTCTGGGCACGTCG (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((.(..((.(((((((...))))))).))..)))).))))))....(((((...)))))....).)))))))))))))).).)))))))))))))))))).))))))).))) 848 972 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAACTCGTGTGGGGGCGCAAGCGATGCCATGGCATGGCATGGCGAGGTCGCTGCGCTGAGGCTTATTTTGGGCGGTGGTGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACT (((((((((((((((((((((((.(((((((.(((.(..((.(((((((...))))))).))..)))).))))))....(((((...)))))....).)))))))))))))).).)))))))).. Pvi-miR167v 952 972 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Pvi-miR167v* 848 868 TCATGCTGTGACAGTTTCACT 3 Pvi-MIR167w PmiREN016368 MIR167 Panicum virgatum Pvi-scaffold_22 84560 84701 + GAACTGCCCAAGGGAACGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGAGTGATCACCGAGAGGAACGGAAGTTCGAGCTCTCATGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACTTCTTCCCGTCGTTGGGCACA ....((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((.....(((((((..(((((((((....))))...))))).))))))).....)))))))))))))..)))))).)))))).)))))....))))))).. 84580 84681 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGAGTGATCACCGAGAGGAACGGAAGTTCGAGCTCTCATGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACT (((.(((((((((((((((((((.....(((((((..(((((((((....))))...))))).))))))).....)))))))))))))..)))))).))).. Pvi-miR167w 84580 84600 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Pvi-miR167w* 84661 84681 TCATGCTGCGGCAGCCTCACT 3 Pvi-MIR168a PmiREN016369 MIR168 Panicum virgatum Pvi-Chr01K 3562224 3562331 - GACGCCGCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGACGCCCGCGCCGCCGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCACAGCGATAA ..(((.(.((((.(((.((.(((((((((((((..(((((.(((...((((......)))).))).)))))..))))))))))))).)).))).)))).).))).... 3562244 3562311 TCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGACGCCCGCGCCGCCGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAAT (((((((((((((..(((((.(((...((((......)))).))).)))))..))))))))))))).. Pvi-miR168a 3562291 3562311 TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC Pvi-miR168a* 3562244 3562264 CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT 3 Pvi-MIR168b PmiREN016370 MIR168 Panicum virgatum Pvi-Chr01N 3202850 3202957 - GCCGCCGCGCCGCCTCGGACTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGACGCCCGCGCCGCCGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCACAGCGATAA ..(((.(.((((.(((.((.(((((((((((((..(((((.(((...((((......)))).))).)))))..))))))))))))).)).))).)))).).))).... 3202870 3202937 TCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGACGCCCGCGCCGCCGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAAT (((((((((((((..(((((.(((...((((......)))).))).)))))..))))))))))))).. Pvi-miR168b 3202917 3202937 TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC Pvi-miR168b* 3202870 3202890 CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT 3 Pvi-MIR169a PmiREN016371 MIR169 Panicum virgatum Pvi-Chr01K 75510196 75510380 - GGAGGCCGTGTTTTCTTGTGTAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGTTGTCTCTGGCAGCCAACGCGCGCTTGCCTGCGGCATTGCACGCACGCGTTCGTTCGTGCGCGCGCATGTACACTGCATGCGAGAAATCAACCGGCCGGCAGGTTCTTCGCTTTGGCTACACGATGGCCTCGTCTTCTCAT .((((((((.......(((((((((((((..((((((((((((((((((((..((((...((((((((.((((...))))..(((((.(((....))).)))))))))))..))...))))....))))...))).))))))))))))).....))))))))))))))))))))).......... 75510216 75510360 TAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGTTGTCTCTGGCAGCCAACGCGCGCTTGCCTGCGGCATTGCACGCACGCGTTCGTTCGTGCGCGCGCATGTACACTGCATGCGAGAAATCAACCGGCCGGCAGGTTCTTCGCTTTGGCTACA (((((((((..((((((((((((((((((((..((((...((((((((.((((...))))..(((((.(((....))).)))))))))))..))...))))....))))...))).))))))))))))).....))))))))).. Pvi-miR169a 75510340 75510360 TAGCCAAGGATGACTTGCCGG Pvi-miR169a* 75510216 75510236 AGGTTCTTCGCTTTGGCTACA 3 Pvi-MIR169b PmiREN016372 MIR169 Panicum virgatum Pvi-Chr01N 88487275 88487465 - GGAGGCTATGTTTTCTTGTGTAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGTTGTCTCTGCTGGCAGCGAACGCGCTTGCCTGCGGCATTGCACGCATGCGTTCGTTCGTGCGCGCGGCATGTGCTGCGGCTGCATGCGAGACATCAACCGGCCGGCAGGTTCTTCGCTTTGGCTACACGATGGCCTCGTCTTCTCAT .(((((((.......((((((((((((((..(((((((((((((.((((((.((..(((((((((((((.(((.((((....)))).))).)))..))))).....((((((....)))))))))))..)))))))).....))))))))))))).....))))))))))))))))))))).......... 88487295 88487445 TAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGTTGTCTCTGCTGGCAGCGAACGCGCTTGCCTGCGGCATTGCACGCATGCGTTCGTTCGTGCGCGCGGCATGTGCTGCGGCTGCATGCGAGACATCAACCGGCCGGCAGGTTCTTCGCTTTGGCTACA (((((((((..(((((((((((((.((((((.((..(((((((((((((.(((.((((....)))).))).)))..))))).....((((((....)))))))))))..)))))))).....))))))))))))).....))))))))).. Pvi-miR169b 88487425 88487445 TAGCCAAGGATGACTTGCCGG Pvi-miR169b* 88487295 88487315 AGGTTCTTCGCTTTGGCTACA 3 Pvi-MIR169c PmiREN016373 MIR169 Panicum virgatum Pvi-Chr02K 65424440 65424574 - TTCTGCAGCTGCGCATCGCGTAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGGCAGCTCTTGGATCGGAGAACTGCAAGTCTGGAGATGGAGAGAGGGGAGCCGGCAAGTCATCTGTGGCTACGCGTTTGCCCCCTCCTCTCAT ............(((.((((((((((.(((((((((((((((..(..(((((.(.(((((..........)))))...).)))))..)...))))))))))))))).))))))))))..)))............. 65424460 65424554 TAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGGCAGCTCTTGGATCGGAGAACTGCAAGTCTGGAGATGGAGAGAGGGGAGCCGGCAAGTCATCTGTGGCTACG ((((((.(((((((((((((((..(..(((((.(.(((((..........)))))...).)))))..)...))))))))))))))).)))))).. Pvi-miR169c 65424534 65424554 TAGCCAAGGATGACTTGCCGG Pvi-miR169c* 65424460 65424480 GGCAAGTCATCTGTGGCTACG 3 Pvi-MIR169d PmiREN016374 MIR169 Panicum virgatum Pvi-Chr06K 13299781 13299930 + GGGGTAGAGAGTGGGAGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGCCACCACACCAGGCGTCAACAAACGCCGGCATAATATGCATGATTATGGCCAAGGATCCCGGCCGGCAAGTTTGTCCTTGGCTACACCTTACTCTCTGCCTATCAT .....((((((((((.(.((.(((((((((((((((((((((.....((......(((((......)))))((((((((.......))))).)))..))......))))))))).)))))))))))).)))))))))))))......... 13299801 13299910 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGCCACCACACCAGGCGTCAACAAACGCCGGCATAATATGCATGATTATGGCCAAGGATCCCGGCCGGCAAGTTTGTCCTTGGCTACA .(((((((((((((((((((((.....((......(((((......)))))((((((((.......))))).)))..))......))))))))).))))))))))))... Pvi-miR169d 13299801 13299821 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Pvi-miR169d* 13299890 13299910 GCAAGTTTGTCCTTGGCTACA 3 Pvi-MIR171a PmiREN016375 MIR171 Panicum virgatum Pvi-Chr06K 11316813 11316933 + GCAGTGCGCGGGCGACGCGGTGTTGGCGCGGTTCAATCCGAGAGCCTGCGCCCCGGGCGGCCATCGGGGGCCCTCCTCTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTCGCCCTTCACCCAATT .........((((((((.((((((((((((((((((((.(((((...((.((((((.......))))))))....))))).)))))))))))))))))))).))))))))........... 11316833 11316913 TGTTGGCGCGGTTCAATCCGAGAGCCTGCGCCCCGGGCGGCCATCGGGGGCCCTCCTCTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC ((((((((((((((((((.(((((...((.((((((.......))))))))....))))).)))))))))))))))))).. 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Pvi-miR171c 85289509 85289529 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Pvi-miR171c* 85289568 85289588 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGA 3 Pvi-MIR171d PmiREN016378 MIR171 Panicum virgatum Pvi-Chr09K 85285334 85285453 - TGATGAAATAGTAGCTATGATGTTGGCTCGGCTCACTCAGATGACCACGCGGGATGCCATGCCCGCGATATGGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTACTCTTTCATACGAG ....((((.((((.(((.(((((((((.(((((((.(((((..((((((((((........))))))...))))...))))).))))))).))))))))).))))))).))))....... 85285354 85285433 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGATGACCACGCGGGATGCCATGCCCGCGATATGGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.(((((..((((((((((........))))))...))))...))))).))))))).))))))).. Pvi-miR171d 85285354 85285374 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Pvi-miR171d* 85285413 85285433 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGA 3 Pvi-MIR171e PmiREN016379 MIR171 Panicum virgatum Pvi-Chr09K 51459123 51459272 - AAATGGAAGTGTAGCTATGGTGTTGGCTCGGCTCACTCAGAAGCTGAAGGAGCCATGGCCCATGTGGATCTAGCTACGCACAGATTGCAGTGCTAGCTCCTGGGGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGCACCCTTTCATGTTTG ..(((((((.((.((((.(((((((((.(((((((.(((((((((..((((((..((((...((((.((((.((...))..))))))))..))))))))))..))))))))).))))))).))))))))).)))))).)))))))..... 51459143 51459252 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGAAGCTGAAGGAGCCATGGCCCATGTGGATCTAGCTACGCACAGATTGCAGTGCTAGCTCCTGGGGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.(((((((((..((((((..((((...((((.((((.((...))..))))))))..))))))))))..))))))))).))))))).))))))).. 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Pvi-miR171f 51290775 51290795 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Pvi-miR171f* 51290864 51290884 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGA 3 Pvi-MIR171g PmiREN016381 MIR171 Panicum virgatum Pvi-Chr09N 81578472 81578626 - AAATGGAAGTGTAGCTATGGTGTTGGCTCGGCTCACTCAGAAGCTGAAGGAGCCATATGGCCCATGGATCTAGCTTAGCTACGCACATATTGAAGTGCTAGCTCCTGGCGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGCACCCTTTCATGTTTG ..(((((((.((.((((.(((((((((.(((((((.((((((((....((.(((....))))).........(((.(((((.((((........)))))))))...))))))))))).))))))).))))))))).)))))).)))))))..... 81578492 81578606 TGTTGGCTCGGCTCACTCAGAAGCTGAAGGAGCCATATGGCCCATGGATCTAGCTTAGCTACGCACATATTGAAGTGCTAGCTCCTGGCGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.((((((((....((.(((....))))).........(((.(((((.((((........)))))))))...))))))))))).))))))).))))))).. 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Pvi-miR171j 52140591 52140611 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Pvi-miR171j* 52140517 52140537 TGTTGGCATGGTTCAATCAAA 3 Pvi-MIR171k PmiREN016385 MIR171 Panicum virgatum Pvi-Chr07K 63636808 63636919 + AAGGAAGAAGACGACATGGCGTGGTATTGTTCCGGCTCATGTCCTTCTTGAGTCTGTTGGCGGATGTGATGTGAGCCGAACCAATATCACTCATGTATTCTTCATTCAGGGG ..(((.(((((..((((((.(((((((((...((((((((((((.(((...(((....)))))).).)))))))))))...)))))))))))))))..))))).)))..... 63636828 63636899 GTGGTATTGTTCCGGCTCATGTCCTTCTTGAGTCTGTTGGCGGATGTGATGTGAGCCGAACCAATATCACTC (((((((((...((((((((((((.(((...(((....)))))).).)))))))))))...))))))))).. 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Pvi-miR394c 80821247 80821266 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Pvi-miR394c* 80821310 80821330 GAGGTGGGCATACTGCCAATG 3 Pvi-MIR395a PmiREN016413 MIR395 Panicum virgatum Pvi-Chr03K 7038482 7038592 - ATTTGGTGTTACTACCAGGAGTTCCCTACAAGCACTTCTCATTAGGCCTTGCATTGGCTTCAGGGCTCTTGTGAAGTGCTTGGGGGAACTCTCGGTGTCACCAAGTACTTA ((((((((..((.(((.((((((((((.((((((((((.((..((.(((.((....))...))).))..)).)))))))))))))))))))).)))))))))))))..... 7038502 7038572 GTTCCCTACAAGCACTTCTCATTAGGCCTTGCATTGGCTTCAGGGCTCTTGTGAAGTGCTTGGGGGAACTC (((((((.((((((((((.((..((.(((.((....))...))).))..)).))))))))))))))))).. 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Pvi-miR395e 69327470 69327489 TGAAGTGTTTGGGGGAACTC Pvi-miR395e* 69327420 69327440 GTTCCCTAGAAGCACTTCACA 3 Pvi-MIR395f PmiREN016418 MIR395 Panicum virgatum Pvi-Chr07N 66000467 66000571 - TAGGTTTGGTGTCCCCAGGAGTTCCCTGCAAGCACTTCACAAGGCACTTTTTTTAGAGCTTTATGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTCACTAAGCATTTG ...((((((((.(.(((((((((((((.(((((((((((((((((.((......)).))))..)))))))))))))))))))))))))).).))))))))..... 66000487 66000551 GTTCCCTGCAAGCACTTCACAAGGCACTTTTTTTAGAGCTTTATGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC (((((((.(((((((((((((((((.((......)).))))..)))))))))))))))))))).. Pvi-miR395f 66000487 66000506 TGAAGTGTTTGGGGGAACTC Pvi-miR395f* 66000531 66000551 GTTCCCTGCAAGCACTTCACA 3 Pvi-MIR396a PmiREN016419 MIR396 Panicum virgatum Pvi-Chr01K 77558753 77558903 + ACATGGCCCTCTTTGCGATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCTGCGTGAATTCGAAGTGGCGGTTCTTTGAGAACAGATTGCTTGGCTTCGGTCGGAGATCTATCGAGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTGCAGAGAGAGACCAACTG ...((((.(((((((((((.((((((((((((.((((((((((.(((((..((((((((((((((((...)))))....))))..)))))))))).........)))))))))))).)))))))))))).))))))))))).).))).... 77558773 77558883 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCTGCGTGAATTCGAAGTGGCGGTTCTTTGAGAACAGATTGCTTGGCTTCGGTCGGAGATCTATCGAGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAA ((((((((((((.((((((((((.(((((..((((((((((((((((...)))))....))))..)))))))))).........)))))))))))).)))))))))))).. 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Pvi-miR408b 39047287 39047307 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT Pvi-miR408b* 39047150 39047170 ACAGGGATGAGGCAGAGCATG 3 Pvi-MIR408c PmiREN016435 MIR408 Panicum virgatum Pvi-Chr05N 44233936 44234169 + GAAGGTGGTCTGGATTGGAGACAGGGATGAGGCAGAGCATGGGATGGGGCCATCAACAAAAAAAAAAAACGTTTCTTCCACTGCGAAAACATGCTTGTTCGCTTGCCTGCGAAATAGGGGAGGCAGTTGTGAGAGGTTCTTCATCAGGCACAGAAAAGGTTGAGAGCTCCGCTGGTGTTGTTGCTCCCTCCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCCCCCCATCACGTCCGGCCC ......((.((((((.((((.((((((.(((((((.(((.((((.(((((...(((((........................((((..(((....)))))))((((((.(........).))))))..(((.(((.(((((.(((............))).)))))))))))...)))))..))))).)))).))).))))))).)))))).)))).........)))))).)) 44233956 44234149 ACAGGGATGAGGCAGAGCATGGGATGGGGCCATCAACAAAAAAAAAAAACGTTTCTTCCACTGCGAAAACATGCTTGTTCGCTTGCCTGCGAAATAGGGGAGGCAGTTGTGAGAGGTTCTTCATCAGGCACAGAAAAGGTTGAGAGCTCCGCTGGTGTTGTTGCTCCCTCCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGCT .((((((.(((((((.(((.((((.(((((...(((((........................((((..(((....)))))))((((((.(........).))))))..(((.(((.(((((.(((............))).)))))))))))...)))))..))))).)))).))).))))))).))))))... 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Pvi-miR528a 69192334 69192354 TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG Pvi-miR528a* 69192405 69192425 CCTGTGCCTGCCTCTTCCATT 3 Pvi-MIR528b PmiREN016437 MIR528 Panicum virgatum Pvi-Chr09K 87418444 87418571 - TCTGGCTGTAGCAGCAGCAGTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGAGGTTTGGTTGGAAGCCGACCTGCGCTACCCTCGGTTGCTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCATTCCTGCTGTTACGCTATTTTT ..((((.((((((((((.(((((((((((((.(((.(((((((((.(((((......)))))..)))))((.(((...))).))..)))).))).))))))))))))).))))))))))))))..... 87418464 87418551 TGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGAGGTTTGGTTGGAAGCCGACCTGCGCTACCCTCGGTTGCTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCATT (((((((((((.(((.(((((((((.(((((......)))))..)))))((.(((...))).))..)))).))).))))))))))).. Pvi-miR528b 87418531 87418551 TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG Pvi-miR528b* 87418464 87418484 CCTGTGCCTGCCTCTTCCATT 3 Pvi-MIR528c PmiREN016438 MIR528 Panicum virgatum Pvi-Chr09N 120070864 120070991 - TCTGGCTGTAGCAGCAGCAGTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGAGGTTTGGTTGGAAGCCGACTTGTGCTACCCTCGCTCGCTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCATTCCTGCTGTTACGCTATGTTT ......(((((((((((.(((((((((((((.(((.(((((.(((((....(((....(((........))))))....))).))))))).))).))))))))))))).)))))))))))........ 120070884 120070971 TGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGAGGTTTGGTTGGAAGCCGACTTGTGCTACCCTCGCTCGCTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCATT (((((((((((.(((.(((((.(((((....(((....(((........))))))....))).))))))).))).))))))))))).. Pvi-miR528c 120070951 120070971 TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG Pvi-miR528c* 120070884 120070904 CCTGTGCCTGCCTCTTCCATT 3 Pvi-MIR529a PmiREN016439 MIR529 Panicum virgatum Pvi-Chr01K 36013115 36013263 - AATTCATCGAGGCTAAAGGGAGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTACCATGTACACACTTCAGATCTCATCAGTCTCTGACCTTATGAAGTTATGTGTGAGTGTCATGAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTCTCTTAGCCTTTTGATGCAAT ........((((((((.((((((((((((((.((((((((((..((((.((((((((((.......((((...)))).....)))))).........)))))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))).......... 36013135 36013243 AGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTACCATGTACACACTTCAGATCTCATCAGTCTCTGACCTTATGAAGTTATGTGTGAGTGTCATGAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTC (((((((((((.((((((((((..((((.((((((((((.......((((...)))).....)))))).........)))))))))))))))))).))))))))))).. 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