miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Nnu-MIR156a PmiREN012256 MIR156 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729092.1 3537546 3537750 + TCTGGAGCCCCATGGTTGAGTTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGCTGGAGTCTGAGACTCCTGCAAAACATTCACCCGGATGCATACCGGAACTGGAAAAGACCGTCCCACCCACTGAACCTTGCAGATATGGGTGGGAGCTGTGAGAGAACGCAGTGCCTGTAGGGTTCTCTGAGCTTCCTGGCCATAGATGTGGGAGAAATTTT .....((((((((...((.((((...((((..(((((((...((.((((((...)))))).))...........((((.......))))...(((......)))((((((((((((.......)))...)))))))))((((((......)))))).((....)))))))))...)))).))))))...))).))).......)) 3537566 3537730 TTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGCTGGAGTCTGAGACTCCTGCAAAACATTCACCCGGATGCATACCGGAACTGGAAAAGACCGTCCCACCCACTGAACCTTGCAGATATGGGTGGGAGCTGTGAGAGAACGCAGTGCCTGTAGGGTTCTCTGAGCTTCCTGGCC (((...((((..(((((((...((.((((((...)))))).))...........((((.......))))...(((......)))((((((((((((.......)))...)))))))))((((((......)))))).((....)))))))))...)))).))).. 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Nnu-miR157a 487808 487828 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Nnu-miR157a* 487870 487890 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Nnu-MIR157b PmiREN012264 MIR157 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729079.1 3121856 3121980 - AGCTGTTGCTGTTGCTTTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAAGTGAACATCCGCAGGAAGGCTTGCGTTTGAGCACTGTTGTGCTCTCTCTTCTTCTGTTAACAGAAATATACATGGCTTTGAA (((....))).....((((((((((((((((.((((((((((((((..((..((((((....))))))..))..))))..))))))))))..))))))))))))))))................. 3121876 3121960 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAAGTGAACATCCGCAGGAAGGCTTGCGTTTGAGCACTGTTGTGCTCTCTCTTCTTCTGTTAACA (((((((((((.((((((((((((((..((..((((((....))))))..))..))))..))))))))))..))))))))))).. 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Nnu-miR157d 976373 976393 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Nnu-miR157d* 976436 976456 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Nnu-MIR159 PmiREN012267 MIR159 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729260.1 482142 482227 + AGGGGGTGGAAGAACTTAGATTTGGCATTTTGGGGTTATGGGGTGGAGCTCCTTCAAGTCCAATATTGGTTCTTTCTGGTTAGATA .......(((((((((.....((((.((((.((((((.........))))))...))))))))....))))))))).......... 482162 482207 TTTGGCATTTTGGGGTTATGGGGTGGAGCTCCTTCAAGTCCAATAT .((((.((((.((((((.........))))))...))))))))... 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Nnu-miR164e 1602298 1602318 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCT Nnu-miR164e* 1602351 1602371 CACGTGCCCTTACTCTCCAGC 3 Nnu-MIR165 PmiREN012277 MIR165 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729161.1 243894 244057 + TTCGTTTAGGTTGGGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCACGTAGGTGATTTTGTAGATTTTCCTATAGTTTTTCTTTAGAGTTCTATGGAAAGTTTGGATTCAATCCCTAAGTGACCTCGGACCAGGCTTCATCCCCGTCAACCAACATATGCTATCT ...((.((.(((((.(((((((((.((..((((((.((((((((((.((((.((((.(.((((((((((.((((...(((....)))..)))))))))))))).)...)))))))).)))))))))).))))))..))))))).))))))))).)).))..... 243914 244037 GGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCACGTAGGTGATTTTGTAGATTTTCCTATAGTTTTTCTTTAGAGTTCTATGGAAAGTTTGGATTCAATCCCTAAGTGACCTCGGACCAGGCTTCATCCCCG ((((.((..((((((.((((((((((.((((.((((.(.((((((((((.((((...(((....)))..)))))))))))))).)...)))))))).)))))))))).))))))..)))))).. 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Nnu-miR166c 994625 994645 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Nnu-miR166c* 994734 994754 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Nnu-MIR166d PmiREN012281 MIR166 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729150.1 48122 48243 + TGTTGTCTGTGTTGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTCAGGTTAGCTCTGGTATGAGGAGAGAAGTGAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACCATGTTAACGTTGGT ...............(((((((((((..(.((((.((((.(((((((..((..((((.......))))..)).))))))).)))).)))).)..)))))))))))................. 48142 48223 GGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTCAGGTTAGCTCTGGTATGAGGAGAGAAGTGAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(.((((.((((.(((((((..((..((((.......))))..)).))))))).)))).)))).)..)))))).. Nnu-miR166d 48203 48223 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Nnu-miR166d* 48142 48162 GGAATGTTGGCTGGCTCGAGG 3 Nnu-MIR166e PmiREN012282 MIR166 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729150.1 48314 48474 + TCGTTTAGGTTAGGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCACGTAGGTGATTTTGTAGATTTTCCTGTTTTACGTTTAGAGTTGTAAGGAAAGTTTGGATTCAACGCCTAAGTGACCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACCAACATATGCTCTCT ............((((((((((((((..((((((.((((((((((.((((((....(.(((((((((((....((((........))))))))))))))).).....)))))).)))))))))).))))))..)))))))))))))).............. 48334 48454 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCACGTAGGTGATTTTGTAGATTTTCCTGTTTTACGTTTAGAGTTGTAAGGAAAGTTTGGATTCAACGCCTAAGTGACCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((((((((.((((((....(.(((((((((((....((((........))))))))))))))).).....)))))).)))))))))).))))))..)))))).. Nnu-miR166e 48434 48454 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Nnu-miR166e* 48334 48354 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Nnu-MIR166f PmiREN012283 MIR166 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729160.1 328892 329014 + CTCTCTCTCTCAGGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGTTCGAGACCATTCATGCATGCGGAGAAAACAGCATCATCTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACATAGATGAATTCCAT ..................((((((((..(((((((((((((.((((((((.((((..........))))))..)))))).)))))))))))))..)))))))).................... 328912 328994 GGAATGTTGTCTGGTTCGAGACCATTCATGCATGCGGAGAAAACAGCATCATCTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(((((((((((((.((((((((.((((..........))))))..)))))).)))))))))))))..)))))).. Nnu-miR166f 328974 328994 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Nnu-miR166f* 328912 328932 GGAATGTTGTCTGGTTCGAGA 3 Nnu-MIR166g PmiREN012284 MIR166 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729161.1 243687 243810 + TGTTGTTGCTGCTGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTCAGTTTCAGGGGTAGCTCTCTGAAGAGAGGTGAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACCATGATTATGTGTTG .............(((((((((((((..(.((((.((((.(((((((.(((((((((....))))))))....).))))))).)))).)))).)..)))))))))))))......((.....)) 243707 243790 GGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTCAGTTTCAGGGGTAGCTCTCTGAAGAGAGGTGAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(.((((.((((.(((((((.(((((((((....))))))))....).))))))).)))).)))).)..)))))).. 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Nnu-miR167c 484201 484221 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Nnu-miR167c* 484283 484303 TCATGCTCTGACAGCCTCACT 3 Nnu-MIR167d PmiREN012290 MIR167 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729209.1 503833 503938 + AGTCGTGCACCACTACCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTTCCTTAAAAAGGGAAGATCAGATCATGCGGCAGTTTCACCTGTTGGTGGGAGCACGAGAA ..((((((.((((((.(((.((((((((((.(((((((((...((((((((...))))))))...))))))))))))))))))).))).))))))..))))))... 503853 503918 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTTCCTTAAAAAGGGAAGATCAGATCATGCGGCAGTTTCACC ((((((((((.(((((((((...((((((((...))))))))...))))))))))))))))))).. Nnu-miR167d 503853 503874 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAA Nnu-miR167d* 503898 503918 AGATCATGCGGCAGTTTCACC 3 Nnu-MIR168a PmiREN012291 MIR168 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729074.1 2375797 2375910 + CAATCGTTGTTGGCTTGAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGTGCTTTAATTTCGCTTGGCGTGGTGAATCTAAGCGCCCACCTGCACCAACTGAGTTCAGTCCCTCGGCGAAGCAG ....(((((..((.(((((((((.(((((((((((.((((((((....((((((......))))))...))))))))))))))))))).))))))))).))..)))))...... 2375817 2375890 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGTGCTTTAATTTCGCTTGGCGTGGTGAATCTAAGCGCCCACCTGCACCAACTGAGT (((.(((((((((((.((((((((....((((((......))))))...))))))))))))))))))).))).. 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Nnu-miR169a 161690 161709 CAGCCAAGAATGACTTGCCA Nnu-miR169a* 161621 161641 GGCAGGTTGTTCTTGACTACA 3 Nnu-MIR169b PmiREN012295 MIR169 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729187.1 91048 91174 + AAGAGGTAGAAAGTGGAACAGAGCCAAGGATGACTTGCCGACATCTATCAAGAAAAGGGTGTATATGACCTGAATTGTAAGTTGTCGGTAGGTCATTCTTGGCTACATTCGACTTTATTCTTCTCAT .(((((...(((((.(((...((((((((((((((((((((((.((..(((.....((((.......))))...)))..)).))))))))))))))))))))))...))).)))))...)))))... 91068 91154 GAGCCAAGGATGACTTGCCGACATCTATCAAGAAAAGGGTGTATATGACCTGAATTGTAAGTTGTCGGTAGGTCATTCTTGGCTACA .((((((((((((((((((((((.((..(((.....((((.......))))...)))..)).))))))))))))))))))))))... 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Nnu-miR169d 345757 345777 TAGCCAAGGATGACTTGCCTA Nnu-miR169d* 345667 345687 AGGCAAGTTCCTTGGCTAGCT 3 Nnu-MIR169e PmiREN012298 MIR169 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729081.1 2399186 2399337 - AAGATGAGAGTCTTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTATGTCCTCCTAATTAGGGTCTCTCATCATGTAATATTGGAATTCAATCCAGCCCTGGTTTTGTGCCATTCATAGGCAAGCTCCTTGGCTAGCTTGACAACCTCTTGCCCCTC .....(((((..(((((.(.((((((((((.(.((((((((((..(.(..(((((((((.................((((......)))))))))))))..).).....))))))))))))))))))))).)..))))).)))))....... 2399206 2399317 TAGCCAAGGATGACTTGCCTATGTCCTCCTAATTAGGGTCTCTCATCATGTAATATTGGAATTCAATCCAGCCCTGGTTTTGTGCCATTCATAGGCAAGCTCCTTGGCTAGC ((((((((((.(.((((((((((..(.(..(((((((((.................((((......)))))))))))))..).).....))))))))))))))))))))).. 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Nnu-miR169l 90782 90802 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Nnu-miR169l* 90845 90865 GGCGGGTTGTCCTTGGCTACA 3 Nnu-MIR169m PmiREN012306 MIR169 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729187.1 119058 119179 + GAAAGATAGAGAGTGGAGTGCAGCCAAGAATGACTTGCCGTCGTAGAGCAACAGATGGGTTTTCCTGAATGACCTGTCGCCGGCAGGTTGTTCTTGGCTACATTTTGCTCTCTTCTTCACAT ..((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((..((.(((..........)))..))..))).)).))))))))))))))))))).)))))))))))))))))..... 119078 119159 CAGCCAAGAATGACTTGCCGTCGTAGAGCAACAGATGGGTTTTCCTGAATGACCTGTCGCCGGCAGGTTGTTCTTGGCTACA .(((((((((((((((((((.(((((..((.(((..........)))..))..))).)).)))))))))))))))))))... 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Nnu-miR169o 135013 135033 CAGCCAAGAATGACTTGCCGG Nnu-miR169o* 134873 134893 GGCAGGTTGTTCTTGGCTACA 3 Nnu-MIR169p PmiREN012309 MIR169 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729187.1 91324 91448 + AAGAGGTAGAGAGTGTAGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGCATCAAGTAGGAGGGAGAATTGCCTGAAATGGGAGTAGTCGGCAGGTTGTCCTTGGCTACATTGTGCTCTCTTCTTCTCAT .(((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((.((..((...(((........)))...))..)))).))))))))))))))))))))).))))))))))))).)))))... 91344 91428 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGCATCAAGTAGGAGGGAGAATTGCCTGAAATGGGAGTAGTCGGCAGGTTGTCCTTGGCTACA .(((((((((((((((((((((.((.((..((...(((........)))...))..)))).)))))))))))))))))))))... 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Nnu-miR319c 3817053 3817072 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Nnu-miR319c* 3816907 3816927 GAGCTTCCTTCAGTCCACTCA 3 Nnu-MIR319d PmiREN012328 MIR319 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729101.1 2403254 2403460 - TGGAATGCAATCTGGGAAGAGAGCTTCCTTCAGTCCACTCATGGGGAGTGGTAAGATTTAATTAACTGCCGACTCATTCACCCAAATACCAAGTAAAAGAAGGGAGCCATCGCTTGGTAGATGAGCGAATGATGCGGGAGATAAGTTGGATCTTATGCTTCCCGTCCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTACCGTCATGCTATCCCA ......(((...(((((((.(((((((((((((((((...((((((((((.((((((((((((..((.(((..((((((.(.((..((((((((....((.((...)).))))))))))..)).).))))))..))).))...))))))))))))))))))))))...))))))))))))))))).)))).)))...)))....... 2403274 2403440 GAGCTTCCTTCAGTCCACTCATGGGGAGTGGTAAGATTTAATTAACTGCCGACTCATTCACCCAAATACCAAGTAAAAGAAGGGAGCCATCGCTTGGTAGATGAGCGAATGATGCGGGAGATAAGTTGGATCTTATGCTTCCCGTCCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((...((((((((((.((((((((((((..((.(((..((((((.(.((..((((((((....((.((...)).))))))))))..)).).))))))..))).))...))))))))))))))))))))))...))))))))))))))))).. Nnu-miR319d 2403274 2403293 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Nnu-miR319d* 2403420 2403440 GAGCTTCCTTCAGTCCACTCA 3 Nnu-MIR319e PmiREN012329 MIR319 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729204.1 1305903 1306114 - GCACTGAGAAACGGCTTGAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGATGGGCTAAGGTGTTGAATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACTCAGTAGAAAGGGGATATTTTTTACTACTGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGATAATTGCCATTCTTCCTCCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTTCTGTTTCTTTCATTCC .....(((((((((...(((.(((((((((((((((((..((((((.(((..((((.....(((((.((.(((..((((((((.((..(((..(((((((((......)))))))))...)))..)).))))))))..))).)).))))).....))))..)))))))))..))))))))))))))))).)))...)))))))))....... 1305923 1306094 AGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGATGGGCTAAGGTGTTGAATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACTCAGTAGAAAGGGGATATTTTTTACTACTGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGATAATTGCCATTCTTCCTCCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT .(((((((((((((((((..((((((.(((..((((.....(((((.((.(((..((((((((.((..(((..(((((((((......)))))))))...)))..)).))))))))..))).)).))))).....))))..)))))))))..)))))))))))))))))... Nnu-miR319e 1305923 1305943 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Nnu-miR319e* 1306074 1306094 AGAGCTTTCTTCAGTCCACTC 3 Nnu-MIR319f PmiREN012396 MIR319 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729080.1 6548786 6548893 + CGAGAAAATTGCAGAAATGGAAGCTCCTTCCAGCCCAAAACAGTGTATCCTTACTTTGATCCCTTGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAATTCTTCTCTTTTCTCTCT .....................((((((((.(((.(((((((((.(.(((........))).).))))))))).))).))))))))....................... 6548806 6548873 AAGCTCCTTCCAGCCCAAAACAGTGTATCCTTACTTTGATCCCTTGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT .((((((((.(((.(((((((((.(.(((........))).).))))))))).))).))))))))... 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Nnu-miR390b 1636468 1636488 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Nnu-miR390b* 1636404 1636424 CGCTATCCATCCTGAGTTTTA 3 Nnu-MIR393a PmiREN012334 MIR393 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729091.1 2116375 2116498 - TACTGCGACTGGAGTAGGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCCGACTTTCAGCCGAAGCAACGTTAGGTTTTGATGAATCTGGATCATGCAATCCCTTTAGAATCCTACTCTAGTTGCTCCTGA ....((((((((((((((..((.((((((((.((((.(((((.((..((((..((((((........)))))).)))))).))))))))).)))))))).))..))))))))))))))...... 2116395 2116478 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCCGACTTTCAGCCGAAGCAACGTTAGGTTTTGATGAATCTGGATCATGCAATCCCTTTAGAAT ((.((((((((.((((.(((((.((..((((..((((((........)))))).)))))).))))))))).)))))))).)).. 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Nnu-miR393b 3071214 3071235 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Nnu-miR393b* 3071277 3071297 ATCATGCAATCCCTTTGGAAT 3 Nnu-MIR393c PmiREN012336 MIR393 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729088.1 2974424 2974571 + GGTGATGGGTGCAGGTGGAGAATTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGATTCCCTCCCCCATACCAAAGTGGGCGGTTTTGATTCTCCGTCTTCTTTTCTTTGATTTATCGGATCATGCGATCTCTTCGGAATTTTCCATCTGTGGCTTT .........(((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((.........((....((((.((((((..........)))))).))))....))....)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))..... 2974444 2974551 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCGATTCCCTCCCCCATACCAAAGTGGGCGGTTTTGATTCTCCGTCTTCTTTTCTTTGATTTATCGGATCATGCGATCTCTTCGGAAT (((.((((((((((((.((((((((.........((....((((.((((((..........)))))).))))....))....)))))))))))))))))))).))))) Nnu-miR393c 2974444 2974464 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Nnu-miR393c* 2974531 2974551 ATCATGCGATCTCTTCGGAAT 3 Nnu-MIR393d PmiREN012337 MIR393 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729152.1 167568 167709 + CAGCCGTGCAGGTGGAGAATTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGATTCTCTCCCTGTCACAACATATTGATTTCGATCTTTTCTTCGTTGATTATTAATCGGATCATGCGATCTCTTCGGAATTTTCCATCTGTGGCTCTAAA .((((..((((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((.......(((....)))...(((((.(((........)))..)))))..))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))..... 167588 167689 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCGATTCTCTCCCTGTCACAACATATTGATTTCGATCTTTTCTTCGTTGATTATTAATCGGATCATGCGATCTCTTCGGAAT (((.((((((((((((.(((((((((.......(((....)))...(((((.(((........)))..)))))..))))))))))))))))))))).))).. Nnu-miR393d 167588 167608 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Nnu-miR393d* 167669 167689 ATCATGCGATCTCTTCGGAAT 3 Nnu-MIR394a PmiREN012338 MIR394 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729117.1 1500330 1500458 + AAAGGGTTTCTTACAGAGTTTATTGGCATTCTGTCCACCTCCACCAAAGGAAATCCATCTCTCTCTCTCGTTTTCTCTTCTTTTTTAATGGAGGTGGGCATCCTGCCAACAAAGCTCTGTTGGCTTCTC ...(((...((.(((((((((.((((((...((((((((((((..(((((((.........................)))))))....))))))))))))...))))))..))))))))).))...))) 1500350 1500438 TTGGCATTCTGTCCACCTCCACCAAAGGAAATCCATCTCTCTCTCTCGTTTTCTCTTCTTTTTTAATGGAGGTGGGCATCCTGCCAACA ((((((...((((((((((((..(((((((.........................)))))))....))))))))))))...)))))).. 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Nnu-miR394d 337016 337035 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Nnu-miR394d* 336962 336982 GAGGTGGCCAGCATGTCAAAA 3 Nnu-MIR395a PmiREN012342 MIR395 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729075.1 3425859 3425968 - TACGTCAGGTGTCTCCCAGAGTTCCCTCAACCTCTTCAGTGGGACTTGGGACTCATTAGTCATTCTCTGCTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCAGGTGCCACTCGATATTAC ...(((.((((.(.((..((((((((((((.(.(((((((((((.....((((....))))..)).))))))))).).))))))))))))..)).).)))).)))..... 3425879 3425948 GTTCCCTCAACCTCTTCAGTGGGACTTGGGACTCATTAGTCATTCTCTGCTGAAGTGTTTGGGGGAACTC ((((((((((.(.(((((((((((.....((((....))))..)).))))))))).).)))))))))).. 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Nnu-miR396h 577781 577801 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Nnu-miR396h* 577695 577715 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Nnu-MIR397 PmiREN012353 MIR397 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729128.1 2750620 2750765 - CACCCAAGATCGGAAAAGCATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAATTCCAATTTCCAATCACCACTGTTGTAATTTTGCTCTTGTAAAGAAATGTGAGTTGATTTCGTCCGCGCTGCACTCAATTATGTTTTTAATCTTTCTGGGGCA ..((((((((...((((((((.((((((((((((((.((((((.((.(((((.((.((...((....(((....)))....))...))..)).))))))).)))))).)))))))))))))).)))))))).))))...))))... 2750640 2750745 TCATTGAGTGCAGCGTTGATGAATTCCAATTTCCAATCACCACTGTTGTAATTTTGCTCTTGTAAAGAAATGTGAGTTGATTTCGTCCGCGCTGCACTCAATTATG (.((((((((((((((.((((((.((.(((((.((.((...((....(((....)))....))...))..)).))))))).)))))).)))))))))))))).).. Nnu-miR397 2750725 2750745 TCATTGAGTGCAGCGTTGATG Nnu-miR397* 2750640 2750660 TCCGCGCTGCACTCAATTATG 3 Nnu-MIR399a PmiREN012354 MIR399 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729088.1 6506940 6507078 + TCATAAGCGATCCAGTTGCAGGGTGTCTCTCCTTTGGCAGGTGGTGGGTGTCTGTGTGAGAGTGATGCAATATCTACATTAATTTGCTTCCAATTACCCGCCAAAGGAGAGTTGCCCTTTGACTGTTTCAGCTTAATTA ...(((((((..((((((.(((((..((((((((((((.(((((((((.((..((((.(((...........)))))))......)).))).)))))).))))))))))))..))))).))))))..)).))))).... 6506960 6507058 GGGTGTCTCTCCTTTGGCAGGTGGTGGGTGTCTGTGTGAGAGTGATGCAATATCTACATTAATTTGCTTCCAATTACCCGCCAAAGGAGAGTTGCCCTT ((((..((((((((((((.(((((((((.((..((((.(((...........)))))))......)).))).)))))).))))))))))))..)))).. Nnu-miR399a 6507038 6507058 CGCCAAAGGAGAGTTGCCCTT Nnu-miR399a* 6506960 6506980 GGGTGTCTCTCCTTTGGCAGG 3 Nnu-MIR399b PmiREN012355 MIR399 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729149.1 61374 61511 + TTATAGGCGAACCAGTTGTAGGGTGTCCCTCCTTTGGCAGGCTATGGCGATGGGAGAGTCTGATGCTTTATCTGCATTTGCTGCTTCCAGCTTTACCCGCCAAAGGAGAGTTGCCCTCTGACTGTTTCAGCTTAAATG ....................((((..(.((((((((((.((.((.(((..(((((((((..(((((.......))))).))).))))))))).)))).)))))))))).)..))))...................... 61394 61491 GGGTGTCCCTCCTTTGGCAGGCTATGGCGATGGGAGAGTCTGATGCTTTATCTGCATTTGCTGCTTCCAGCTTTACCCGCCAAAGGAGAGTTGCCCTC ((((..(.((((((((((.((.((.(((..(((((((((..(((((.......))))).))).))))))))).)))).)))))))))).)..)))).. Nnu-miR399b 61471 61491 CGCCAAAGGAGAGTTGCCCTC Nnu-miR399b* 61394 61414 GGGTGTCCCTCCTTTGGCAGG 3 Nnu-MIR399c PmiREN012356 MIR399 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729162.1 1016910 1017034 - GAGGGTAGAGAAGAATAACAGTGCAGTTTTCCTTTGGCAGAAAACCTAGCTACTGCTGCCTTGCAATTTGGGCTGCTTAATTTCCGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCACCCACACAGTTCC (.((((......((((..(((.((((((((((((((((.((((...(((((..(((......))).....))))).....)))).)))))))))))))))).)))..)))))))).)........ 1016930 1017014 GTGCAGTTTTCCTTTGGCAGAAAACCTAGCTACTGCTGCCTTGCAATTTGGGCTGCTTAATTTCCGCCAAAGGAGAATTGCCCTG (.((((((((((((((((.((((...(((((..(((......))).....))))).....)))).)))))))))))))))).).. Nnu-miR399c 1016930 1016950 CGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Nnu-miR399c* 1016994 1017014 GTGCAGTTTTCCTTTGGCAGA 3 Nnu-MIR399d PmiREN012357 MIR399 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010731635.1 1111 1218 - GAGGGTAAAGAAGAATAACAGTGCACTTCTCCTTTGGCAGAGACCTTACTTCTCAAGTTTCTGTTTCCGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCACCCCCACACTCCT (.((((......((((..(((.(((.((((((((((((.(((((...((((...))))....))))).)))))))))))).))).)))..)))))))).)........ 1131 1198 GTGCACTTCTCCTTTGGCAGAGACCTTACTTCTCAAGTTTCTGTTTCCGCCAAAGGAGAATTGCCCTG (.(((.((((((((((((.(((((...((((...))))....))))).)))))))))))).))).).. Nnu-miR399d 1131 1151 CGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Nnu-miR399d* 1178 1198 GTGCACTTCTCCTTTGGCAGA 3 Nnu-MIR408a PmiREN012358 MIR408 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729077.1 5253709 5253836 - GGAGACAGAGAGAGAGATAGGCAGGGATAAGGCAGAGCATGGGATGGAGCAATCAACAGAGGGGTGGAGCTGTTGTTGCTCTTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTCTCTTTCTCCCCTTCCCC ((((...((((((((((.((.((((((..((((((.((((((((.(((((((.((((((..........))))))))))))))))))))).))))))..)))))).)).))))))))))...)))).. 5253729 5253816 GCAGGGATAAGGCAGAGCATGGGATGGAGCAATCAACAGAGGGGTGGAGCTGTTGTTGCTCTTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT .((((((..((((((.((((((((.(((((((.((((((..........))))))))))))))))))))).))))))..))))))... Nnu-miR408a 5253729 5253749 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT Nnu-miR408a* 5253796 5253816 GCAGGGATAAGGCAGAGCATG 3 Nnu-MIR408b PmiREN012397 MIR408 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729089.1 4866968 4867095 + GGCAAGAGACAGATAGACAGACAGGGATAAGACAGAGCATGGGATGGACCATTCAACAGAGGCATGGAGCTGTTGTTGCTCTTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTCTCTCTCTTCCCTCCTCT .....................((((((..((.(((.((((((((.(((.((..((((((..........)))))).)).))))))))))).))).))..))))))....................... 4866988 4867075 ACAGGGATAAGACAGAGCATGGGATGGACCATTCAACAGAGGCATGGAGCTGTTGTTGCTCTTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT .((((((..((.(((.((((((((.(((.((..((((((..........)))))).)).))))))))))).))).))..))))))... Nnu-miR408b 4867055 4867075 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT Nnu-miR408b* 4866988 4867008 ACAGGGATAAGACAGAGCATG 3 Nnu-MIR482a PmiREN012359 MIR482 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729093.1 2209268 2209423 + TGGAATTCTCGGGAGTAGTGGGAATGGAGGGCTGGGACAATTCTCCTTTCCTATGCTCCTATCCTTCACTCTTTCTTTCCTGGAGGAGGGCCAAGGCCTAGGAGATCGACGAATTTTCCCACACCGCCCATTCCTACTACCTCCGAGATCCTCTC .(((..(((((((.(((((((((((((.((..(((((.(((((((.(((((((.(((.....(((((.((((.........)))))))))....))).)))))))..)).))))).)))))..))..))))))))))))).)))))))))).... 2209288 2209403 GGAATGGAGGGCTGGGACAATTCTCCTTTCCTATGCTCCTATCCTTCACTCTTTCTTTCCTGGAGGAGGGCCAAGGCCTAGGAGATCGACGAATTTTCCCACACCGCCCATTCCTA (((((((.((..(((((.(((((((.(((((((.(((.....(((((.((((.........)))))))))....))).)))))))..)).))))).)))))..))..))))))).. Nnu-miR482a 2209382 2209403 TTTCCCACACCGCCCATTCCTA Nnu-miR482a* 2209288 2209308 GGAATGGAGGGCTGGGACAAT 3 Nnu-MIR482b PmiREN012360 MIR482 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729210.1 888197 888342 + GACAGAGCCGCCGGAACTTATTGGACTGGGTGCCTTGGGAAGTTCTATTACAACTGAGAGTTTAGAGACAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTATAAGTGCTGAACCTTCCCAAGGCCTCCCATGCCGATGATTTCCTGTGGTTCCT ....(((((((.((((.(((((((..((((.((((((((((((((.........((((((...(((((.(((....))).)))))))))))..........))).)))))))))))..))))..))))))).)))).))))))).. 888217 888322 GGACTGGGTGCCTTGGGAAGTTCTATTACAACTGAGAGTTTAGAGACAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTATAAGTGCTGAACCTTCCCAAGGCCTCCCATGCCGA ((..((((.((((((((((((((.........((((((...(((((.(((....))).)))))))))))..........))).)))))))))))..))))..)))) Nnu-miR482b 888301 888322 TTCCCAAGGCCTCCCATGCCGA Nnu-miR482b* 888217 888237 GGACTGGGTGCCTTGGGAAGT 3 Nnu-MIR482c PmiREN012398 MIR482 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729074.1 463874 464026 + TGGAGCTGCTGGAAGTTTTTGGGATGGGAGCCTTGGGAAGCAGAGGCGAGTGAGAGACCGAGATAAATTCATTTTCTCTCGTTCTCTTTCTCTTCTTCTGCTATGCTTTTCTTCCCAAGGCCTCCCATGCCGATGATTTCCCGTGGTTCCTCC ....................((.(((((((((((((((((((((((.(((.((((((.(((((.(((.....))).))))).)))))).)))..))))))))..........)))))))).))))))).))...................... 463894 464006 GGGATGGGAGCCTTGGGAAGCAGAGGCGAGTGAGAGACCGAGATAAATTCATTTTCTCTCGTTCTCTTTCTCTTCTTCTGCTATGCTTTTCTTCCCAAGGCCTCCCATGCCGA ((.(((((((((((((((((((((((.(((.((((((.(((((.(((.....))).))))).)))))).)))..))))))))..........)))))))).))))))).)).. Nnu-miR482c 463985 464006 TTCCCAAGGCCTCCCATGCCGA Nnu-miR482c* 463894 463914 GGGATGGGAGCCTTGGGAAGC 3 Nnu-MIR529 PmiREN012364 MIR529 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729267.1 266502 266610 + TAATCTCATTAAGACTAATAGCAGAAGAGAGAGAGTACAGCTTCGACTTCTCCATAATGGGGGGAAAGAAGCTGTACCCTCTCTCTTCTTCTGTTTGTCTTCGATGAAA .....((((((((((.(((((.(((((((((((.((((((((((...((((((......))))))..)))))))))).))))))))))).))))).))))).))))).. 266522 266590 AGAAGAGAGAGAGTACAGCTTCGACTTCTCCATAATGGGGGGAAAGAAGCTGTACCCTCTCTCTTCTTC (((((((((((.((((((((((...((((((......))))))..)))))))))).))))))))))).) Nnu-miR529 266522 266542 AGAAGAGAGAGAGTACAGCTT Nnu-miR529* 266570 266590 GCTGTACCCTCTCTCTTCTTC 3 Nnu-MIR530 PmiREN012365 MIR530 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729230.1 459435 459583 + CAGTCGACATGTCGCATATGTCTGCATTTGCACCTGCACTGCACCAAGGAATTCTCTGCGTCCGTCCCCAAAAAGACCTGTTACAGAGAAGGAGATCGATCGGTGTCGGTGCAGGTGCAGGTCCAGACAAATGCCATCTTGCCTCGCAT ((.......))..((((.((((((.((((((((((((((((((((..((..(((((((.....(((........)))......))))))).....))....)))).)))))))))))))))).)))))).))))............... 459455 459563 TCTGCATTTGCACCTGCACTGCACCAAGGAATTCTCTGCGTCCGTCCCCAAAAAGACCTGTTACAGAGAAGGAGATCGATCGGTGTCGGTGCAGGTGCAGGTCCAGACA ((((.((((((((((((((((((((..((..(((((((.....(((........)))......))))))).....))....)))).)))))))))))))))).)))).. Nnu-miR530 459455 459475 TCTGCATTTGCACCTGCACTG Nnu-miR530* 459543 459563 GTGCAGGTGCAGGTCCAGACA 3 Nnu-MIR827 PmiREN012366 MIR827 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729194.1 774772 774896 - TTTTTGCAGCAATGAATATGTTTGTTGATGACCATCTAGTCATGCTCTTTCTTTATGTTGCATATATATAGTTCATGAATATGGTTAGATGATCATCAACAAACACATTCATAGTAATGCATCTC ....((((((.((((((.(((((((((((((.((((((((((((.((...((.(((((.....))))).)).....)).)))))))))))).))))))))))))).)))))).))..)))).... 774792 774876 TTTGTTGATGACCATCTAGTCATGCTCTTTCTTTATGTTGCATATATATAGTTCATGAATATGGTTAGATGATCATCAACAAACA (((((((((((.((((((((((((.((...((.(((((.....))))).)).....)).)))))))))))).))))))))))).. Nnu-miR827 774792 774812 TTAGATGATCATCAACAAACA Nnu-miR827* 774856 774876 TTTGTTGATGACCATCTAGTC 3 Nnu-MIR2950 PmiREN012324 MIR2950 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729087.1 7617487 7617588 - TCACATGGGTTTATGATATATTCCATCTCTTGCACACTGGAGCAGCTTTCTGTCCCTGGGCTGGTGTGCAAGAGATGGAATGCATCATTAATGCGTGCCTTT ...((((.(((.(((((.((((((((((((((((((((((..(((..........)))..)))))))))))))))))))))).))))).))).))))..... 7617507 7617568 TTCCATCTCTTGCACACTGGAGCAGCTTTCTGTCCCTGGGCTGGTGTGCAAGAGATGGAATG ((((((((((((((((((((..(((..........)))..)))))))))))))))))))).. Nnu-miR2950 7617548 7617568 TTCCATCTCTTGCACACTGGA Nnu-miR2950* 7617507 7617527 TGGTGTGCAAGAGATGGAATG 3 Nnu-MIR3627a PmiREN012330 MIR3627 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729075.1 2119103 2119215 + AGCAAGAGTTTGGGGTACTATTTGTCGCAGGAGAGATGGCACTGCTCCCTTTCGGGGTACGTGAAGCATGTTCTATCTCCCCTGCGGCAATAAGACCCTGCAAATTCTTTTAT ....((((((((((((.((..((((((((((.(((((((.((((((((((...)))).......)))).)).))))))).))))))))))..))))))..))))))))..... 2119123 2119195 TTTGTCGCAGGAGAGATGGCACTGCTCCCTTTCGGGGTACGTGAAGCATGTTCTATCTCCCCTGCGGCAATAA .((((((((((.(((((((.((((((((((...)))).......)))).)).))))))).))))))))))... Nnu-miR3627a 2119123 2119144 TTTGTCGCAGGAGAGATGGCAC Nnu-miR3627a* 2119175 2119195 CTATCTCCCCTGCGGCAATAA 3 Nnu-MIR3627b PmiREN012331 MIR3627 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729075.1 2113249 2113362 + ATGAAGAATTTGGGGTCATCTTGTCGCAGGAGAGATGGCACGCAGGATCCTGCTCACTTTGCATGGCTCGTGTGCCATCTCTTCTGTGACGAGAAGTCCCTGCAATCGGATTCA ...........((((.(.(((((((((((((((((((((((((..((.(((((.......))).)).))))))))))))))))))))))))))).).))))............. 2113269 2113342 TTGTCGCAGGAGAGATGGCACGCAGGATCCTGCTCACTTTGCATGGCTCGTGTGCCATCTCTTCTGTGACGAGA (((((((((((((((((((((((..((.(((((.......))).)).))))))))))))))))))))))))).. Nnu-miR3627b 2113269 2113289 TTGTCGCAGGAGAGATGGCAC Nnu-miR3627b* 2113322 2113342 GCCATCTCTTCTGTGACGAGA 3 Nnu-MIR5179a PmiREN012361 MIR5179 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729222.1 151789 152017 + GGGAGTAGTTTGTTGAGAGATCTTGCTCAAGACCGCGCAGCTGATTCATGTGTAACACCGCATCGGGGTAGGTGTCTATCGCTGCTCAAAAACTAGTGTGGTGATCACGATGAAGCCTGCCGGACACCGATGACTCCTTCAACAACTGATGATAGCCCTCTACCTCGATGCGCTGTTCATGTGCAGGCTGTGTGGTCTTGCCCAAGATCTTGCAGAGGGATGGAGAACA ................(((((((((..(((((((((((((((....((((((.((((.((((((((((((((.(.((((((((((.(........).))))).((((.(.(((((.....(((...))).......))))).)...))))))))).).)))))))))))))).))))))))))..)))))))))))))))..))))))))).........((.....)) 151809 151997 TCTTGCTCAAGACCGCGCAGCTGATTCATGTGTAACACCGCATCGGGGTAGGTGTCTATCGCTGCTCAAAAACTAGTGTGGTGATCACGATGAAGCCTGCCGGACACCGATGACTCCTTCAACAACTGATGATAGCCCTCTACCTCGATGCGCTGTTCATGTGCAGGCTGTGTGGTCTTGCCCAAGATC (((((..(((((((((((((((....((((((.((((.((((((((((((((.(.((((((((((.(........).))))).((((.(.(((((.....(((...))).......))))).)...))))))))).).)))))))))))))).))))))))))..)))))))))))))))..))))).. 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Nnu-miRN687 2122581 2122601 ATGTCGCAGGAGAGATGGCGC Nnu-miRN687* 2122642 2122662 GCCATCTCTTCTCTGACACGA 3 Nnu-MIRN958 PmiREN012391 MIRN958 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729144.1 593791 593918 - GGAGGTGGTGCAGCTCAACAGGGTCGTCCTGAGATCACATGTGACACCCAATTGGCTCCCTTGTTAAGGTGTGTTACTGTGCGTTTATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGCCGAACTTCCCACCACCGCA ..................(((((.((.(((((((.((((((((((((((..(((((......))))))).))))))).........))))).))))))).)).))))).................... 593811 593898 GGGTCGTCCTGAGATCACATGTGACACCCAATTGGCTCCCTTGTTAAGGTGTGTTACTGTGCGTTTATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG (((.((.(((((((.((((((((((((((..(((((......))))))).))))))).........))))).))))))).)).))).. Nnu-miRN958 593878 593898 GGGTCGTCCTGAGATCACATG Nnu-miRN958* 593811 593831 TGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG 3 Nnu-MIRN2011a PmiREN012368 MIRN2011 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729084.1 7850312 7850437 - TACTAGTGGTGCAATTGATCTGCCTGGCTCCCTGAGTGCCATCTAAGGAGAATGTGTCAATAGTGTTTGACACTCTTCCTAGTTGGCATCAGGGGAGTCATGCAGATTGCAGACCCAGTAATTAAT ...((.(((((((....((((((.(((((((((..((((((.(((.(((((..(((((((......)))))))))))).))).))))))..))))))))).))))))))))...))).))...... 7850332 7850417 TGCCTGGCTCCCTGAGTGCCATCTAAGGAGAATGTGTCAATAGTGTTTGACACTCTTCCTAGTTGGCATCAGGGGAGTCATGCAGA (((.(((((((((..((((((.(((.(((((..(((((((......)))))))))))).))).))))))..))))))))).))).. 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Nnu-miRN2011b 490676 490696 GCATCAGGGGAGTCATGCAGA Nnu-miRN2011b* 490738 490758 TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA 3 Nnu-MIRN2013 PmiREN012370 MIRN2013 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729075.1 4931749 4931967 + GCATCAATCTAATGTTTTCCATCTGGGACAGTGACGGAAGGGAGGTTTTTGTTGAGTTTCTCAAAAGTTCAGGGGATATATTTGTTAAAATGAAACTATAAGGGAGGTTTTTATGATTGTCAGAAACTTTAGGGGAGGTTTTTGTATTTTACCCTTTTAAAAAATTCAACAAAAATCTTCCATCCCTCATTAATCCCAACGGAAAACGTTAAAGGTTAA .........(((((((((((...(((((.(((((.(((.((((((((((((((((((((......((((((...((((....))))....)).)))).((((((.(((....(((.....((((((((((....)))))))))))))...)))))))))..)))))))))))))))))))).))).)))))..)))))..)))))))))))........ 4931769 4931947 CTGGGACAGTGACGGAAGGGAGGTTTTTGTTGAGTTTCTCAAAAGTTCAGGGGATATATTTGTTAAAATGAAACTATAAGGGAGGTTTTTATGATTGTCAGAAACTTTAGGGGAGGTTTTTGTATTTTACCCTTTTAAAAAATTCAACAAAAATCTTCCATCCCTCATTAATCCCAACG .(((((.(((((.(((.((((((((((((((((((((......((((((...((((....))))....)).)))).((((((.(((....(((.....((((((((((....)))))))))))))...)))))))))..)))))))))))))))))))).))).)))))..)))))..) 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Nnu-miRN2015 3206532 3206552 TGTGGCTGCAGTGCACGGTGG Nnu-miRN2015* 3206576 3206596 ACCTTGAATTGCAGCCACACA 3 Nnu-MIRN2016a PmiREN012373 MIRN2016 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729086.1 7462036 7462212 - TTTTCAGAGAGTGAATCTGTCTCCCATAATGTCCCACAGCACATCTCTGCTGTGTATTGAAAACATCTTCCGATGATGATATCATCATTTCGGATATTATTATCGGGAGATGTTTCCAATACACGGCGGGGATGTACTGTGGGACGTTGTAGGGGACTGTCTTGTGGGAGGCTGATT (((((...(((.......((((((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.........))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))...)))...)))))...... 7462056 7462192 CTCCCATAATGTCCCACAGCACATCTCTGCTGTGTATTGAAAACATCTTCCGATGATGATATCATCATTTCGGATATTATTATCGGGAGATGTTTCCAATACACGGCGGGGATGTACTGTGGGACGTTGTAGGGGAC ((((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.........))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))))).)))).. Nnu-miRN2016a 7462056 7462076 CTGTGGGACGTTGTAGGGGAC Nnu-miRN2016a* 7462172 7462192 CTCCCATAATGTCCCACAGCA 3 Nnu-MIRN2016b PmiREN012375 MIRN2016 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729098.1 2290792 2290956 - TCAATTCGAGTTCAAATCAGCCCCCACAACGCCCCACAGCACATCCCCGCCATGTATTGTGAACATCTCCGGATAATGACATCATCATTTCTGGGAGATATTCTTAATACACGGCTTGAATGTGCTGTGGGACGTTGTAGGGGACAATCTTGTGCGGGATTTATT ((.....))...........((((.((((((.((((((((((((.(..(((.(((((((.(((.(((((((((.(((((.....)))))))).)))))).))).))))))).)))..).)))))))))))).)))))).))))...................... 2290812 2290936 CCCCCACAACGCCCCACAGCACATCCCCGCCATGTATTGTGAACATCTCCGGATAATGACATCATCATTTCTGGGAGATATTCTTAATACACGGCTTGAATGTGCTGTGGGACGTTGTAGGGGAC ((((.((((((.((((((((((((.(..(((.(((((((.(((.(((((((((.(((((.....)))))))).)))))).))).))))))).)))..).)))))))))))).)))))).)))).. Nnu-miRN2016b 2290812 2290832 CTGTGGGACGTTGTAGGGGAC Nnu-miRN2016b* 2290916 2290936 CCCCCACAACGCCCCACAGCA 3 Nnu-MIRN2016c PmiREN012382 MIRN2016 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729125.1 2665455 2665631 - AGAAATGAGACCAAATCAGCCCCCTACAACGTTCCACAGCACATCCCCGTCTTGTATTGAAAACATCTCCCAATGATAATTCTAGAAATGATGATGTCATCATCAAAAAATGTTCCCAATACATGACAAGGACGTGCTGTGGGACGTTGTAGGGGACAATCTTGTGGGGGCTGATTT (((..(((.......)))..((((((((((((((((((((((.(((..(((.(((((((..(((((........((....))......(((((((...)))))))....)))))..))))))).)))..))).))))))))))))))))))))))....)))............... 2665475 2665611 CCCCTACAACGTTCCACAGCACATCCCCGTCTTGTATTGAAAACATCTCCCAATGATAATTCTAGAAATGATGATGTCATCATCAAAAAATGTTCCCAATACATGACAAGGACGTGCTGTGGGACGTTGTAGGGGAC ((((((((((((((((((((((.(((..(((.(((((((..(((((........((....))......(((((((...)))))))....)))))..))))))).)))..))).)))))))))))))))))))))).. Nnu-miRN2016c 2665475 2665495 CTGTGGGACGTTGTAGGGGAC Nnu-miRN2016c* 2665591 2665611 CCCCTACAACGTTCCACAGCA 3 Nnu-MIRN2016d PmiREN012399 MIRN2016 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729084.1 8727745 8727914 + AATCAGCCCCCACAAGATTGCCCCTCACAAACGTCCCATAGCACATCCGTGTTGTGTATTAGAAACATCTCCGATAATGATATCATCATTTCTGACATTATCATGTTTTTAATACACTGCAGGAATATGCTGTGGGACGTTGTAGGGGACAATCTTGTGAGTGCTGATTT ....................(((((.((((.((((((((((((..(((.(((.(((((((((((((((....(((((((...(((.......))))))))))))))))))))))))).))))))...)))))))))))))))))))))...................... 8727765 8727894 CCCCTCACAAACGTCCCATAGCACATCCGTGTTGTGTATTAGAAACATCTCCGATAATGATATCATCATTTCTGACATTATCATGTTTTTAATACACTGCAGGAATATGCTGTGGGACGTTGTAGGGGAC (((((.((((.((((((((((((..(((.(((.(((((((((((((((....(((((((...(((.......))))))))))))))))))))))))).))))))...))))))))))))))))))))).. Nnu-miRN2016d 8727874 8727894 CTGTGGGACGTTGTAGGGGAC Nnu-miRN2016d* 8727765 8727785 CCCCTCACAAACGTCCCATAG 3 Nnu-MIRN2017a PmiREN012374 MIRN2017 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729091.1 2728463 2728572 + TTTGTTGGGTTAGGACTGGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTAGAAACTCAATTTCATAGATCACAATCTAATCCTCTGGATGCAGGTTACCTCTTCCTCACTAACAATTAA .(((((((...((((..(((((((((((((((.((((.(((((......................))))).)))).)))))))))))))))..))))..))))))).... 2728483 2728552 TAATCTGCATCCTGAGGTTTAGAAACTCAATTTCATAGATCACAATCTAATCCTCTGGATGCAGGTTACC ((((((((((((.((((.(((((......................))))).)))).)))))))))))).. Nnu-miRN2017a 2728532 2728552 ATCCTCTGGATGCAGGTTACC Nnu-miRN2017a* 2728483 2728503 TAATCTGCATCCTGAGGTTTA 3 Nnu-MIRN2017b PmiREN012377 MIRN2017 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729104.1 2238573 2238684 - CCCGTTGAGTTAGGAGTGGATAATCTGCATCCTGAGGTTTAGGTTTAGAAAGCCATGAGCATGACAATCTAATCCTCTGGATGCAGGTTACCTCTTCCTCACCAACACTAAT ...((((.((.(((((.((.((((((((((((.((((.(((((((......((.....)).....))))))).)))).))))))))))))))..))))).))))))...... 2238593 2238664 TAATCTGCATCCTGAGGTTTAGGTTTAGAAAGCCATGAGCATGACAATCTAATCCTCTGGATGCAGGTTACC ((((((((((((.((((.(((((((......((.....)).....))))))).)))).)))))))))))).. 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Nnu-miRN2020 1055302 1055322 CGGTGTGCAGAGGATGGAACA Nnu-miRN2020* 1055261 1055281 TTCCATCTCTTGCACACTGGA 3 Nnu-MIRN2021 PmiREN012380 MIRN2021 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729115.1 2559557 2559674 - CATCCCACACATTCTCTATAGCCCATCTCTCTGTGCATTGGGAACATCTTCCCATGACGAGTATGGGAGATGTTCCCAATGCACAGGGGGATGGGCTGTGGGGTGTATGTGGGGCGCA (.(((((((.((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).))))))).).. 2559577 2559654 GCCCATCTCTCTGTGCATTGGGAACATCTTCCCATGACGAGTATGGGAGATGTTCCCAATGCACAGGGGGATGGGCTG (((((((((((((((((((((((((((((.((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))))))).. 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Nnu-miRN2022 4401542 4401562 CGATACTCATCTGAGCAAGCA Nnu-miRN2022* 4401638 4401658 CTTGCTCAAATGAGTATTCCA 3 Nnu-MIRN2023 PmiREN012384 MIRN2023 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729152.1 1453738 1453846 - TTCGATTCTCTCAACGCCCCGCTTGCCTTGAACCTGTTGAAAAAACTCTTACACAAGAAAGTATCCTCCAATTGGTTCACGGCAAGCATTTTTTTCACACATGAACAAC ....................(((((((.((((((.((((.....((((((....))))..))......)))).)))))).)))))))......((((....)))).... 1453758 1453826 GCTTGCCTTGAACCTGTTGAAAAAACTCTTACACAAGAAAGTATCCTCCAATTGGTTCACGGCAAGCAT (((((((.((((((.((((.....((((((....))))..))......)))).)))))).))))))).. Nnu-miRN2023 1453758 1453778 CAATTGGTTCACGGCAAGCAT Nnu-miRN2023* 1453806 1453826 GCTTGCCTTGAACCTGTTGAA 3 Nnu-MIRN2024 PmiREN012385 MIRN2024 Nelumbo nucifera Nnu-NW_010729162.1 1098083 1098181 - CATTACAGAGCTGTTCCTCACCACTCTGTTTCGTATGAAGTTGTTCCTCACCACTCTCCATACGAAAGGCAGAGCCAAGGGAAATTGATAGAGTATGTT .............(((((.....((((((((((((((.(((.((.....)).)))...))))))))..))))))....)))))...((((.....)))) 1098103 1098161 CCACTCTGTTTCGTATGAAGTTGTTCCTCACCACTCTCCATACGAAAGGCAGAGCCAAG ...((((((((((((((.(((.((.....)).)))...))))))))..))))))..... 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