miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Mes-MIR156a PmiREN011033 MIR156 Manihot esculenta Mes-Chromosome02 5385436 5385560 + AGGAGGCAGTGGTGATGTTGTTGACAGAAGATAGAGGGCACAGATGATGATGAAATGCATAAAGTATGCATCTCAATCCTTTGCGCTCTCTACTCTTCTGCCATCACCTTTTCAGCCCCTCTCTT (((.(((...(((((((.....(.(((((((((((((((.((((.(((..(((.(((((((...))))))).)))))).)))).)))))))).)))))))))))))))......))))))..... 5385456 5385540 TTGACAGAAGATAGAGGGCACAGATGATGATGAAATGCATAAAGTATGCATCTCAATCCTTTGCGCTCTCTACTCTTCTGCCATC ..(.(((((((((((((((.((((.(((..(((.(((((((...))))))).)))))).)))).)))))))).)))))))).... 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Mes-miR164d 23671674 23671694 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Mes-miR164d* 23671793 23671813 CATGTGCCCATCTTCCCCATC 3 Mes-MIR164e PmiREN011061 MIR164 Manihot esculenta Mes-Chromosome11 1447282 1447395 - GTGAAGGGGTTTAGCCATGCTGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCTATCAGCATTATAATCTGAGAATTTCGCATGTGCCCTGATTCTCCAGCTTGGATTCATCTCTTACAAG ..............(((.(((((((((.((((((((((((.((((...((((.((....))))))..)))).)))))))))))).))))))))).)))................ 1447302 1447375 TGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCTATCAGCATTATAATCTGAGAATTTCGCATGTGCCCTGATTCTCCAGC (((((((.((((((((((((.((((...((((.((....))))))..)))).)))))))))))).))))))).. 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Mes-miR169c 8413657 8413677 CAGCCAAGGATGACTTGCCGA Mes-miR169c* 8413715 8413735 GGCAAGTTGTCCTTGGCTACA 3 Mes-MIR169d PmiREN011087 MIR169 Manihot esculenta Mes-Chromosome01 21710525 21710671 + TGGAGGAGCTCATGCGGCGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTAGCTCTTGTAGCATGCTTATACTTTGCCATTAACTAAGGATGATGTGTCTGGCCAGTAGATGATCGGCAAGTCATCTCTGGCTACTCAACTGCCTCCTCCTTTCA .(((((((.....((((...(((((.(((((((((((((((((.......)))).......((((..((((...((..........))...)))).))))......))))))))))))).)))))......)))))))))))..... 21710545 21710651 AGCCAAGGATGACTTGCCGGCTAGCTCTTGTAGCATGCTTATACTTTGCCATTAACTAAGGATGATGTGTCTGGCCAGTAGATGATCGGCAAGTCATCTCTGGCTAC (((((.(((((((((((((((((.......)))).......((((..((((...((..........))...)))).))))......))))))))))))).))))).. Mes-miR169d 21710545 21710564 AGCCAAGGATGACTTGCCGG Mes-miR169d* 21710631 21710651 CGGCAAGTCATCTCTGGCTAC 3 Mes-MIR169e PmiREN011088 MIR169 Manihot esculenta Mes-Chromosome02 3694344 3694481 + ACGAGGAGGTCATGTGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTAGCTCTAGTATACTAGTAAGCTTATATTTTTCCATTTAACTGGCAACTAGATGGTCGGCAAGTCATCTCTGGCTACCCAACTTTCTCCTCCTTTCA (.(((((((.....(((.(.(((((.(((((((((((((((((..((((((...(((((.....................)))))..))))))))))))))))))))))).))))).))))....))))))).).... 3694364 3694461 AGCCAAGGATGACTTGCCGGCTAGCTCTAGTATACTAGTAAGCTTATATTTTTCCATTTAACTGGCAACTAGATGGTCGGCAAGTCATCTCTGGCTAC (((((.(((((((((((((((((..((((((...(((((.....................)))))..))))))))))))))))))))))).))))).. Mes-miR169e 3694364 3694383 AGCCAAGGATGACTTGCCGG Mes-miR169e* 3694441 3694461 CGGCAAGTCATCTCTGGCTAC 3 Mes-MIR169f PmiREN011089 MIR169 Manihot esculenta Mes-Chromosome03 249532 249632 + AGAGGTAGAGAGTGTAATTCAGCCAAGGATGACTTGCCGGAAACACTGCGCATCTTTGCCGGCAAGTTGTAGCTTGGCTATGTTGTACTCTTTTCTTCTCA .((((.((((((((((((..(((((((.((((((((((((..................))))))))))))..)))))))..)))))))))))).))))... 249552 249612 AGCCAAGGATGACTTGCCGGAAACACTGCGCATCTTTGCCGGCAAGTTGTAGCTTGGCTAT (((((((.((((((((((((..................))))))))))))..))))))).. 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Mes-miR171a 26130726 26130746 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Mes-miR171a* 26130640 26130660 TATTGGCCTGGTTCACTCAGA 3 Mes-MIR171b PmiREN011111 MIR171 Manihot esculenta Mes-Chromosome02 8278088 8278226 + ATGTGAAATAGCGATTGTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACGTGGAAAACCTACCCTTTTCTCGGCTTTATTTTGCTTGGACGATGTTGTCTTGCTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCAGTGCTCTTTCATTTCTC ..((((((.(((.((((.(((((((((.(((((((.(((((((.(((((........))))).))..........((..(((((....))))).))))))).))))))).))))))))).))))))).))))))..... 8278108 8278206 TATTGGCCTGGTTCACTCAGACGTGGAAAACCTACCCTTTTCTCGGCTTTATTTTGCTTGGACGATGTTGTCTTGCTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.(((((((.(((((........))))).))..........((..(((((....))))).))))))).))))))).))))))).. Mes-miR171b 8278186 8278206 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Mes-miR171b* 8278108 8278128 TATTGGCCTGGTTCACTCAGA 3 Mes-MIR171c PmiREN011112 MIR171 Manihot esculenta Mes-Chromosome05 20190854 20190973 + GCTTGAAAGTGCCATTGTGATGTTGGCTCGGTTCACTCAGACAAATTACTATGTTTTACTACAAGCATGTTATGGTCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTGCTCTTTCAATACTG ..(((((((.((.((((.(((((((((.(((((((.((((((.....((.((((((......))))))))....)))..))).))))))).))))))))).)))))).)))))))..... 20190874 20190953 TGTTGGCTCGGTTCACTCAGACAAATTACTATGTTTTACTACAAGCATGTTATGGTCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.((((((.....((.((((((......))))))))....)))..))).))))))).))))))).. 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Mes-miR171l 10054514 10054534 TTGAGCCGCGCCAATATCACT Mes-miR171l* 10054580 10054600 CGATGTTGGTGAGGTTCAATC 3 Mes-MIR172a PmiREN011122 MIR172 Manihot esculenta Mes-Chromosome04 1921942 1922104 + GACAGTCGTTGTTTGCGGGTGTAGCACCATCAAGATTCACATGCAAATGCACGGTGGTGATTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCCATCAACCAAAGTTCTTTGAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAACGACTTTACA ...(((((((..((((.(((((((((.(((((((((((.(((.((((.(.((..(((((((.....................................))).))))..)).)))))...))).))))))))))).))))))))).))))..)))))))..... 1921962 1922084 GTAGCACCATCAAGATTCACATGCAAATGCACGGTGGTGATTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCCATCAACCAAAGTTCTTTGAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((.(((((((((((.(((.((((.(.((..(((((((.....................................))).))))..)).)))))...))).))))))))))).)))))).. 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