miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Lja-MIR156a PmiREN010574 MIR156 Lotus japonicus Lja-BABK02036164.1 47955 48076 + TAGAGTAACGGTAAGGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGCTTTCTTGCAGTTTCATGCTTGAAGTTATATGTGCTCACCCTCTATCTGTCACCCCACCACCATCTCTTTTCTG ..................(((((((((((((.(((((((((.(((..((((.(..(((......)))..)))))))).))))))))).)))).))))))))).................... 47975 48056 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGCTTTCTTGCAGTTTCATGCTTGAAGTTATATGTGCTCACCCTCTATCTGTCACC (((((((((((.(((((((((.(((..((((.(..(((......)))..)))))))).))))))))).)))).))))))).. 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Lja-miR156b 23716 23735 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Lja-miR156b* 23653 23673 CTCACTGCTCTCTCTGTCACC 3 Lja-MIR156c PmiREN010576 MIR156 Lotus japonicus Lja-BABK02041698.1 46220 46344 + AATATAGTAGAGAGAGTAGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCTCGTAGTTATTGTATTAGGGCATACAGTTGCGGGTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGCTTCTCATTTTTCTCTCTCAC ......((.(((((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((...(((((((......))))))))))))))).)))))))).)))).)))))))))))..........))))))))) 46240 46324 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCTCGTAGTTATTGTATTAGGGCATACAGTTGCGGGTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGC ((((((((((((((((((((.((((((((...(((((((......))))))))))))))).)))))))).)))).)))))))).. 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Lja-miR157c 100635 100655 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Lja-miR157c* 100710 100730 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Lja-MIR159a PmiREN010581 MIR159 Lotus japonicus Lja-BABK02012296.1 1068 1275 + GGATTTTAAACCCAATTTGAGGCTCTCTGCGCTCCAATACTGAAAGGAAGTGATGGTAAACCCTAGCTGCTAGTTCATGGACACCTTTGGCTTCGCACAAATAAGCATATATGTGAAAGTCATGGGTATGCATGAATTTGGAGATGGGGGTTGCCTTGATCTTTTTGAATTGGAGTGAAGGGAGCTCCAAAATGAGGCTTCATGCTTA ((........))...((((.((((((((.(((((((((.(.(((((((......((((..(((((.((.(.((((((((.(.((((.((((((..((((.(((....))).)))).)))))).)))).).)))))))).).)).)))))..))))....)))))))).))))))))).)))))))).))))................. 1088 1255 GGCTCTCTGCGCTCCAATACTGAAAGGAAGTGATGGTAAACCCTAGCTGCTAGTTCATGGACACCTTTGGCTTCGCACAAATAAGCATATATGTGAAAGTCATGGGTATGCATGAATTTGGAGATGGGGGTTGCCTTGATCTTTTTGAATTGGAGTGAAGGGAGCTCC ((((((((.(((((((((.(.(((((((......((((..(((((.((.(.((((((((.(.((((.((((((..((((.(((....))).)))).)))))).)))).).)))))))).).)).)))))..))))....)))))))).))))))))).)))))))).. 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Lja-miR159b 4657 4676 ATTGGATTGAAGGGAGCTCC Lja-miR159b* 4835 4855 AGCTCCTTTCAATCCAATACG 3 Lja-MIR159c PmiREN010583 MIR159 Lotus japonicus Lja-BABK02027834.1 2622 2833 + TCAAGATGGGTTGTGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAATGAGGATTTTACTGGGTTGAATAGAGCTGCTTTGCTATGGATCCCATGGATCTACCCATCATAGGTGCTTTTGTGGTAGTTCCATGGCTTGCATATCTTAGGAGCTTTATGACCTTAATAGTTTCATCCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCTTATCAATCTTTCCAT ....((.((((((.((.((((((((((((..((((((((.((((((...((((((((..((((((((.((..(.((((.(..(((((((.(((((((.............)).))))).)))))))..).)))).)..)).)))))))))))))....)))...)))))).))))))))..)))))))))))).))....)))))).))... 2642 2813 GAGCTCCTTGAAGTCCAAATGAGGATTTTACTGGGTTGAATAGAGCTGCTTTGCTATGGATCCCATGGATCTACCCATCATAGGTGCTTTTGTGGTAGTTCCATGGCTTGCATATCTTAGGAGCTTTATGACCTTAATAGTTTCATCCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((..((((((((.((((((...((((((((..((((((((.((..(.((((.(..(((((((.(((((((.............)).))))).)))))))..).)))).)..)).)))))))))))))....)))...)))))).))))))))..))))))))).. Lja-miR159c 2793 2813 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Lja-miR159c* 2642 2662 GAGCTCCTTGAAGTCCAAATG 3 Lja-MIR160a PmiREN010584 MIR160 Lotus japonicus Lja-BABK02043080.1 17032 17153 - CATGCATACATATGTGTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGGAGAGCTCATCGAAACATCAATGATCTCTTTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCCATGTTTCATACATGGA .(((((((....)))))))((((.(((((((.((((((((((((((((((.((((.((....)).)))).)))))))))))))))))).))))))).))))..(((((((.....))))))) 17052 17133 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGGAGAGCTCATCGAAACATCAATGATCTCTTTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.((((((((((((((((((.((((.((....)).)))).)))))))))))))))))).))))))).))).. 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Lja-miR160b 3374 3394 TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA Lja-miR160b* 3435 3455 GCGTGAGGGGAGCCACGCAGG 3 Lja-MIR160c PmiREN010586 MIR160 Lotus japonicus Lja-BABK02042513.1 87765 87885 - GTTTATTAGCATACTTTGTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGTAGAGCACATCACCACGGTGATGGCCTAATGAATGGCGTACAAGGAGCCAAGCATGCTGTGTGTTGCTATTTAGCT ......((((((((...((((((.(((((((.((((((((((((((((.((.((((((....)))))))))).)))))))))))))).))))))).))))))...))).)))))....... 87785 87865 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGTAGAGCACATCACCACGGTGATGGCCTAATGAATGGCGTACAAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((((((((.((.((((((....)))))))))).)))))))))))))).))))))).))).. 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Lja-miR164a 398138 398157 ACGCTGGAGAAGCAGGGCAC Lja-miR164a* 398078 398098 TGCTCTGGCTCTCCAGCATGG 3 Lja-MIR164b PmiREN010589 MIR164 Lotus japonicus Lja-BABK02008715.1 1168 1284 + GATTGGTGAGTAGGTCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAATTTTCTCTCATCACAAGCTCAAACCTTGAATTTGCACGTGCTCCCCTTTTCCAACATGATTTTCCCACCATGTTC ...(((((.(.(((((.(((((((((((..((((((((((((..(((......................))).))))))))))))..))))))))))).))))).).)))))..... 1188 1264 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAATTTTCTCTCATCACAAGCTCAAACCTTGAATTTGCACGTGCTCCCCTTTTCCAAC ((((((((..((((((((((((..(((......................))).))))))))))))..)))))))).. 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Lja-miR164e 110692 110712 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Lja-miR164e* 110608 110628 CACGTGCTCCGTTTCTCCAAC 3 Lja-MIR164f PmiREN010593 MIR164 Lotus japonicus Lja-BABK02042965.1 9194 9305 + ACTGGGTGAGAAGCTCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATATGCCACTGAATCCTATCCTATGCTAATGCACGCGCTCCCCTTCTCCAACATGAGTTCCTTACCTTTCTC ...(((((((.(((((.(((((((((((..((((.(((((((..((....((......))....))..))))))).))))..))))))))))).))))).)))))))..... 9214 9285 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATATGCCACTGAATCCTATCCTATGCTAATGCACGCGCTCCCCTTCTCCAAC ((((((((..((((.(((((((..((....((......))....))..))))))).))))..)))))))).. 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Lja-miR166i 79833 79853 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Lja-miR166i* 79897 79917 GGAATGTCATCTGGATCGAGA 3 Lja-MIR167a PmiREN010604 MIR167 Lotus japonicus Lja-BABK02037266.1 218003 218141 + TGAGTTCACAAGGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGTTAGAGAAAGAGGTAGAGTGCTAATGAATTAACTGCTAACCCTGACTAGGTCATGCTGCGACAGCCTCACTCCTTCCTATTTGGGGACCCA ...........(((((..(((((.((((((((((((((((((....((((((((.......(((....))).........)).))))))....))))))))))))).).)))).)))))..)))))............. 218023 218121 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGTTAGAGAAAGAGGTAGAGTGCTAATGAATTAACTGCTAACCCTGACTAGGTCATGCTGCGACAGCCTCACT (((.((((((((((((((((((....((((((((.......(((....))).........)).))))))....))))))))))))).).)))).))).. 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Lja-miR171c 7113 7133 TGAGCCGAATCAATATCACTC Lja-miR171c* 7166 7186 GTGATGTTGATCTGGCTCATA 3 Lja-MIR171d PmiREN010628 MIR171 Lotus japonicus Lja-BABK02041643.1 720004 720129 + GATTTGGGAAGCAGAGAAAGCGATGTTGGTGAGGTTCAATCTGAAGACGGATTTACATGAAGAAGCAGTAAAATACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTTTCTTATTCATGAGCTCTG .............(((((((.((((((((((.((((((((((((.((((..(((((.((......)))))))...)).)))))))))))))).)))))))))).).)))))).............. 720024 720109 CGATGTTGGTGAGGTTCAATCTGAAGACGGATTTACATGAAGAAGCAGTAAAATACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACT .((((((((((.((((((((((((.((((..(((((.((......)))))))...)).)))))))))))))).))))))))))... Lja-miR171d 720089 720109 TTGAGCCGCGCCAATATCACT Lja-miR171d* 720024 720044 CGATGTTGGTGAGGTTCAATC 3 Lja-MIR171e PmiREN010629 MIR171 Lotus japonicus Lja-BABK02040473.1 21742 21861 - AGGGTAGAGGAGAAAAACGGGATATTGGTCCGGTTCAATAAGAAAGCAAAGCTCGAAACGTTTGGAGCTTTGTTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTTCATGAGACATTGTGCTC .(((((.((......((((.(((((((((.(((((((((.((((((((((((((.((....)).)))))))))))))).))))))))).))))))))).)))).........)).))))) 21762 21841 GATATTGGTCCGGTTCAATAAGAAAGCAAAGCTCGAAACGTTTGGAGCTTTGTTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCAC (((((((((.(((((((((.((((((((((((((.((....)).)))))))))))))).))))))))).))))))))).. Lja-miR171e 21762 21781 TTGAGCCGTGCCAATATCAC Lja-miR171e* 21821 21841 GATATTGGTCCGGTTCAATAA 3 Lja-MIR171f PmiREN010630 MIR171 Lotus japonicus Lja-BABK02040476.1 2367 2486 - AGGGTAGAGGAGAAAAACGGGATATTGGTCCGGTTCAATAAGAAAGCAAAGCTCGAAACGTTTGGAGCTTTGTTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTTCATGAGACATTGTGCTC .(((((.((......((((.(((((((((.(((((((((.((((((((((((((.((....)).)))))))))))))).))))))))).))))))))).)))).........)).))))) 2387 2466 GATATTGGTCCGGTTCAATAAGAAAGCAAAGCTCGAAACGTTTGGAGCTTTGTTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCAC (((((((((.(((((((((.((((((((((((((.((....)).)))))))))))))).))))))))).))))))))).. Lja-miR171f 2387 2406 TTGAGCCGTGCCAATATCAC Lja-miR171f* 2446 2466 GATATTGGTCCGGTTCAATAA 3 Lja-MIR171g PmiREN010631 MIR171 Lotus japonicus Lja-BABK02044255.1 782 901 + ACATAGTATTAAGGACCTGAGATATTGGTACGGTTCAATCAGAAGGCAGTGTTTTATGATCCTAAAGCTCTCTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACAGGTACAACATGTCTTCTTT ..............(((((.((((((((((((((((((((((((((.((.((((((......)))))).))))).))))))))))))))))))))))).)))))................ 802 881 GATATTGGTACGGTTCAATCAGAAGGCAGTGTTTTATGATCCTAAAGCTCTCTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCAC ((((((((((((((((((((((((((.((.((((((......)))))).))))).))))))))))))))))))))))).. Lja-miR171g 862 881 TTGAGCCGTGCCAATATCAC Lja-miR171g* 802 822 GATATTGGTACGGTTCAATCA 3 Lja-MIR171h PmiREN011003 MIR171 Lotus japonicus Lja-BABK02037026.1 120215 120332 + TTTTCCTATAACTGATTTGATGTTGGCTAGGCTCAATCAAATCAAAGTTCTTAAATAGAGATTTGAGTACTTTAGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCAGATTGACTATTATATGCTC ....................(((((((..((((((((((.((.(((((.(((((((....))))))).))))).)).))))))))))..)))))))...................... 120235 120312 TGTTGGCTAGGCTCAATCAAATCAAAGTTCTTAAATAGAGATTTGAGTACTTTAGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((..((((((((((.((.(((((.(((((((....))))))).))))).)).))))))))))..))))))).. Lja-miR171h 120292 120312 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Lja-miR171h* 120235 120255 TGTTGGCTAGGCTCAATCAAA 3 Lja-MIR171i PmiREN011004 MIR171 Lotus japonicus Lja-BABK02038442.1 2353 2482 + CTATGAAGTAGCTATTGCGATATTGGCTTGGTTCACTCAGACAAAACACATACACACAGAAAATGTGGATTATATATATGTTTTGGTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCACTGCTACTTCATGTTTT ....................(((((((.(((((((.((((((((((((.(((..((((.....)))).......))).)))))))..))))).))))))).)))))))...................... 2373 2462 TATTGGCTTGGTTCACTCAGACAAAACACATACACACAGAAAATGTGGATTATATATATGTTTTGGTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.((((((((((((.(((..((((.....)))).......))).)))))))..))))).))))))).))))))).. Lja-miR171i 2442 2462 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Lja-miR171i* 2373 2393 TATTGGCTTGGTTCACTCAGA 3 Lja-MIR172a PmiREN010632 MIR172 Lotus japonicus Lja-BABK02008315.1 13034 13183 + AGCAGTCGTTGTTTGCTGGTGGAGCATCATCAAGATTCACAAGCTTTAAGGGGTGGATTGTGTTTGGGGTGGTCCCTAATTGCTCCATATCAATTTGCTCTTTGATTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAGTAGCAATCACTGACTAATAC ...(((((.((.((((((.((.((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((....(((((((((.....)))))))))...))))))))))))))))))).)))))))))))))))).)).)))))).)).)))))..... 13054 13163 GGAGCATCATCAAGATTCACAAGCTTTAAGGGGTGGATTGTGTTTGGGGTGGTCCCTAATTGCTCCATATCAATTTGCTCTTTGATTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAG (.((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((....(((((((((.....)))))))))...))))))))))))))))))).)))))))))))))))).).. Lja-miR172a 13143 13163 AGAATCTTGATGATGCTGCAG Lja-miR172a* 13054 13074 GGAGCATCATCAAGATTCACA 3 Lja-MIR172b PmiREN010633 MIR172 Lotus japonicus Lja-BABK02005550.1 9374 9503 - GATGGTCGTTATTTGCAGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATGCAAATGCAATCTAAGGCCAAGCCATAGATCTTTTGAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCATGAACGGCTTTGAG .................(((((((((((((((((((((.(((.(((((((....)))(((((.(((...))).)))))..))))..))).)))))))))))))))))))))................... 9394 9483 GTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATGCAAATGCAATCTAAGGCCAAGCCATAGATCTTTTGAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.(((.(((((((....)))(((((.(((...))).)))))..))))..))).)))))))))))))))))).. Lja-miR172b 9394 9414 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Lja-miR172b* 9463 9483 GTAGCATCATCAAGATTCACA 3 Lja-MIR172c PmiREN010634 MIR172 Lotus japonicus Lja-BABK02043063.1 65913 66020 + CACAGTCGTTGTCTGCAGGTGCAGCACCATCAAGATTCACACACAAATTATAAGTGTTTTGGTGTTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATAAACGATTCAAGG ...(((((((...(((.(((((((((.(((((((((((((((.((((..........))))))))...))))))))))).))))))))).)))...)))))))..... 65933 66000 GCAGCACCATCAAGATTCACACACAAATTATAAGTGTTTTGGTGTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((.(((((((((((((((.((((..........))))))))...))))))))))).)))))).. Lja-miR172c 65980 66000 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Lja-miR172c* 65933 65952 GCAGCACCATCAAGATTCAC 3 Lja-MIR172d PmiREN010635 MIR172 Lotus japonicus Lja-BABK02011635.1 5936 6083 + AGCAGTCACTGTTTGCAGGTGGAGCATCATCAAGATTCACAAGCTTTAGGGGCTTTGTTTGATGAGTTGAGGTGGTCCCTTAATTTTCTAGCTAGCCTTTTGGTATGAGAATCTTGATGATGTTGCAGCAGCAATAAGTGACTAATAC ...(((((((..((((.(.((.((((((((((((((((.((.(((..(((((((..(((.((.(((((((((.....))))))))))).))).))))))).))).)).)))))))))))))))).)).).))))..)))))))..... 5956 6063 GGAGCATCATCAAGATTCACAAGCTTTAGGGGCTTTGTTTGATGAGTTGAGGTGGTCCCTTAATTTTCTAGCTAGCCTTTTGGTATGAGAATCTTGATGATGTTGCAG (.((((((((((((((((.((.(((..(((((((..(((.((.(((((((((.....))))))))))).))).))))))).))).)).)))))))))))))))).).. Lja-miR172d 6043 6063 AGAATCTTGATGATGTTGCAG Lja-miR172d* 5956 5976 GGAGCATCATCAAGATTCACA 3 Lja-MIR172e PmiREN010636 MIR172 Lotus japonicus Lja-BABK02039721.1 91839 92024 - TCCATTAATCTTTTGAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATTGGCCATAAACGACTTTAAAAATTAGAGTGCAGATGCTGTCCATGGTGCATATTTATTACACATGACAGGTGACTTTTTCTACTCTCTATTTGTTGTTGCCAGGTCGGTTTCATCTTCATTTTGTTTTCAATTTAGTTAGTAGTA ............((((((..(((((...(((((.((((..(((((....((((((......((.(((((.(.(((..(((((.((((((.........))).)))))))).........))).).))))).)))))))))))))..)))).)))))...)))))..)))))).............. 91859 92004 AGAATCTTGATGATGCTGCATTGGCCATAAACGACTTTAAAAATTAGAGTGCAGATGCTGTCCATGGTGCATATTTATTACACATGACAGGTGACTTTTTCTACTCTCTATTTGTTGTTGCCAGGTCGGTTTCATCTTCATTTTGT (((((...(((((.((((..(((((....((((((......((.(((((.(.(((..(((((.((((((.........))).)))))))).........))).).))))).)))))))))))))..)))).)))))...))))).. Lja-miR172e 91984 92004 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Lja-miR172e* 91859 91879 TCGGTTTCATCTTCATTTTGT 3 Lja-MIR172f PmiREN010637 MIR172 Lotus japonicus Lja-BABK02039976.1 27213 27398 + TCACAAGTCGGTATCTGCAGGTGCAGCATCATTAAGATTCACACAGCTTAGTTAGAGCTTCATGATTGGTTGAGCTAGCTTGTCTGCTTATCTGTGTATATAAAAGCTCTCTCTGTAAGTTTCATTGTATTTATATATAGAGAAATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAAATAGATGACTAA .....(((((.(((.(((.(((((((((((((((((((((((((((...(((..((((((((........)))...)))))....)))...))))))..........(((((.(((((((........)))))))...))))).....))))))))))))))))))))).))).)))..))))).. 27233 27378 GCAGCATCATTAAGATTCACACAGCTTAGTTAGAGCTTCATGATTGGTTGAGCTAGCTTGTCTGCTTATCTGTGTATATAAAAGCTCTCTCTGTAAGTTTCATTGTATTTATATATAGAGAAATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((((((((...(((..((((((((........)))...)))))....)))...))))))..........(((((.(((((((........)))))))...))))).....)))))))))))))))))))) Lja-miR172f 27358 27378 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Lja-miR172f* 27233 27253 GCAGCATCATTAAGATTCACA 3 Lja-MIR319a PmiREN010648 MIR319 Lotus japonicus Lja-BABK02001709.1 10296 10400 + AGTGAAAGTTGCAGAAATGGGAGCTCTTTGCAGCCCAAAACATCTAACTAGAACTTCATGTTGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAGTTCTTTACTTTCTCGGTG .(.((((((...((((.((((((((((((.(((.((((((((.(...............).)))))))).))).)))))))))))).))))..)))))).).... 10316 10380 GAGCTCTTTGCAGCCCAAAACATCTAACTAGAACTTCATGTTGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT (((((((((.(((.((((((((.(...............).)))))))).))).))))))))).. Lja-miR319a 10361 10380 TTGGACTGAAGGGAGCTCCT Lja-miR319a* 10316 10336 GAGCTCTTTGCAGCCCAAAAC 3 Lja-MIR319b PmiREN010649 MIR319 Lotus japonicus Lja-BABK02003220.1 5018 5226 - TCGGAATGAATGGTTTAAGAGAGCTTCCTTCAGTCCACTTATGGATGGGTAAGGGATTTGAATTAGCTGCTGACTCATTCATTCAAACACGATAGATCATAGAACAAGCGTTGCTATCGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGCTTATTTCATCCTTCTCTTGTCTCTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTAGTCTTCATACCATTT .......(((((((..(((.(((((((((((((((((..((.(((((((..((((((..((((.((((.(((..((((((((.((..((((((((..((..(......)..))))))))))..)).))))))))..))).)))).)))).))))))..))))))).))..))))))))))))))))).)))...........))))))) 5038 5206 GAGCTTCCTTCAGTCCACTTATGGATGGGTAAGGGATTTGAATTAGCTGCTGACTCATTCATTCAAACACGATAGATCATAGAACAAGCGTTGCTATCGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGCTTATTTCATCCTTCTCTTGTCTCTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((..((.(((((((..((((((..((((.((((.(((..((((((((.((..((((((((..((..(......)..))))))))))..)).))))))))..))).)))).)))).))))))..))))))).))..))))))))))))))))).. Lja-miR319b 5038 5057 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Lja-miR319b* 5186 5206 GAGCTTCCTTCAGTCCACTTA 3 Lja-MIR319c PmiREN010650 MIR319 Lotus japonicus Lja-BABK02030878.1 1764 1973 + CATTAGGAATTAGTTGAGGGGAGCTTCCTTCAGTCCACTCATGGATGGGTAAGGGGTTAGAATTAGCTGCTGACTCATTCATTCAAACACAATAGATCAGGCAACATGGTATGCTGTTGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGGTAAATTTCTTCCTATTCTTGTCTTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTATATTGTTTACAATAT ...............((((((((((((((((((((((..((.(((((((....(((..(((((((.((.(((..((((((((.((..((((((((((((.......))))...))))))))..)).))))))))..))).)).)))..)))).)))...))))))).))..)))))))))))))))))))))).((((((....)))))) 1784 1953 GAGCTTCCTTCAGTCCACTCATGGATGGGTAAGGGGTTAGAATTAGCTGCTGACTCATTCATTCAAACACAATAGATCAGGCAACATGGTATGCTGTTGTGAATGTGTGAATGATGCGGGAGGTAAATTTCTTCCTATTCTTGTCTTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((..((.(((((((....(((..(((((((.((.(((..((((((((.((..((((((((((((.......))))...))))))))..)).))))))))..))).)).)))..)))).)))...))))))).))..))))))))))))))))).. Lja-miR319c 1934 1953 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Lja-miR319c* 1784 1804 GAGCTTCCTTCAGTCCACTCA 3 Lja-MIR319d PmiREN010651 MIR319 Lotus japonicus Lja-BABK02032805.1 5978 6082 - TGTGGAAGTTGCAGAAATTGGAGTTCCTTGCAGCCCAAAACGCCGGGCAAGAATTCCCTGTTGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAGTTCTTCAATTCACTGTTT .......((((.((((...((((((((((.(((.((((((((.((((.........)))).)))))))).))).))))))))))...)))).))))......... 5998 6062 GAGTTCCTTGCAGCCCAAAACGCCGGGCAAGAATTCCCTGTTGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT (((((((((.(((.((((((((.((((.........)))).)))))))).))).))))))))).. 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Lja-miR399f 13469 13489 CGCCAAAGAAGATTTGCCCGG Lja-miR399f* 13552 13572 GGGCAATACTTCTTTGGCAGT 3 Lja-MIR399g PmiREN010688 MIR399 Lotus japonicus Lja-BABK02042017.1 31918 32049 - GTTGCAGGGTGTATATTACAGGGCGAGTTTCTCCATTGGCAAATAACGACTGTGATATGTGTCTCTCATACCAACATCACAGTGTGCAATTTGCCAAAGGAGATTTGCCCAGCAATTCTCTTGCAACAATAG (((((((((.(...(((.(.(((((((..(((((.(((((((((..((((((((((..((((.....))))....)))))))).))..))))))))).)))))))))))).).))).))))))))))..... 31938 32029 GGGCGAGTTTCTCCATTGGCAAATAACGACTGTGATATGTGTCTCTCATACCAACATCACAGTGTGCAATTTGCCAAAGGAGATTTGCCCAG (((((((..(((((.(((((((((..((((((((((..((((.....))))....)))))))).))..))))))))).)))))))))))).. Lja-miR399g 31938 31958 TGCCAAAGGAGATTTGCCCAG Lja-miR399g* 32009 32029 GGGCGAGTTTCTCCATTGGCA 3 Lja-MIR399h PmiREN010689 MIR399 Lotus japonicus Lja-BABK02042017.1 27983 28116 - AGAAAGCCATAAATAAAGTTCGGCAAGCTTCTCCATTGGCAGATAGCCACTGTGATATGCGTCTCTCTTAGACCAACATCACAGTGTGCAATTTGCCAAAGGAGATTTGCCCAGCGATTCTCCTGCAATGCTTG .................(((.((((((..(((((.(((((((((.(((((((((((.((.((((.....))))))..))))))))).)).))))))))).))))))))))).)))................... 28003 28096 CGGCAAGCTTCTCCATTGGCAGATAGCCACTGTGATATGCGTCTCTCTTAGACCAACATCACAGTGTGCAATTTGCCAAAGGAGATTTGCCCAG .((((((..(((((.(((((((((.(((((((((((.((.((((.....))))))..))))))))).)).))))))))).)))))))))))... Lja-miR399h 28003 28023 TGCCAAAGGAGATTTGCCCAG Lja-miR399h* 28076 28096 CGGCAAGCTTCTCCATTGGCA 3 Lja-MIR399i PmiREN010690 MIR399 Lotus japonicus Lja-BABK02008611.1 1518 1658 + CAATAAGCAAATCAGCAATAGGGCACCTCTCTATTGGCAGGTAAACAGTCAGTATTCTTGGAGCTTCCTCTAAAGCTTCGAAAAATCAATGTGAATGACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTGACTGCTATTGGCAGGTAA ...................((((((.((((((.(((((((((..(((..........(((((((((......)))))))))........))).....))))))))).)))))).))))))..................... 1538 1638 GGGCACCTCTCTATTGGCAGGTAAACAGTCAGTATTCTTGGAGCTTCCTCTAAAGCTTCGAAAAATCAATGTGAATGACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG (((((.((((((.(((((((((..(((..........(((((((((......)))))))))........))).....))))))))).)))))).))))).. Lja-miR399i 1618 1638 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG Lja-miR399i* 1538 1558 GGGCACCTCTCTATTGGCAGG 3 Lja-MIR399j PmiREN010691 MIR399 Lotus japonicus Lja-BABK02011481.1 4666 4805 - CAATAAGCAAATCAGCAATAGGGCACCTCTCTATTGGCAGGTAAATACTCAGTATTCTTGGAGCTGCCTCTAAAGCTTCAGAAGTCAGTGTGAGTAACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTGGCTGCTTTAGCTTAATCT .....((((((.((((.((((((((.((((((.(((((((((...(((((((..((((.((((((........))))))))))..)....))))))))))))))).)))))).)))))))).)))).))).)))...... 4686 4785 GGGCACCTCTCTATTGGCAGGTAAATACTCAGTATTCTTGGAGCTGCCTCTAAAGCTTCAGAAGTCAGTGTGAGTAACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG (((((.((((((.(((((((((...(((((((..((((.((((((........))))))))))..)....))))))))))))))).)))))).))))).. Lja-miR399j 4686 4706 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG Lja-miR399j* 4765 4785 GGGCACCTCTCTATTGGCAGG 3 Lja-MIR399k PmiREN011005 MIR399 Lotus japonicus Lja-BABK02000662.1 93508 93649 + TAATAAGCAAATCATTCATCGGGCATCTCTCTTTTGGCAGGTAATGGCGACCGGTTAATTGGTTTTTGTTTATCGCAAAACCAAAATAAATATCAGTGACTTGCCAAAGGTGAGCTGCCCTATGAGTGTTTAGCTTAGACAT ....................(((((.(((.((((((((((((..(((......(((..((((((((.((.....))))))))))))).....)))...)))))))))))).))).)))))...................... 93528 93629 GGGCATCTCTCTTTTGGCAGGTAATGGCGACCGGTTAATTGGTTTTTGTTTATCGCAAAACCAAAATAAATATCAGTGACTTGCCAAAGGTGAGCTGCCCTA (((((.(((.((((((((((((..(((......(((..((((((((.((.....))))))))))))).....)))...)))))))))))).))).))))).. Lja-miR399k 93609 93629 TGCCAAAGGTGAGCTGCCCTA Lja-miR399k* 93528 93548 GGGCATCTCTCTTTTGGCAGG 3 Lja-MIR408a PmiREN010692 MIR408 Lotus japonicus Lja-BABK02043959.1 61084 61222 + TGATGGAGAGACATGACAATGGCAGGGAAGAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACAAAATAAATTGAGAATGGGAGAAGTTTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTTTTCCCTGGCCACGTCTCAGTCTCCGTTT .((((((((.....(((..(((((((((((((((((.((((((.((((((((.(((((((.....((........))....))))))))))))))).)))))).))))))))))))).)))).)))....)))))))). 61104 61202 CAGGGAAGAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACAAAATAAATTGAGAATGGGAGAAGTTTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTTTTCCCTGGCC ((((((((((((((.((((((.((((((((.(((((((.....((........))....))))))))))))))).)))))).))))))))))))).))) Lja-miR408a 61182 61202 TGCACTGCCTTTTCCCTGGCC Lja-miR408a* 61104 61124 CAGGGAAGAGGCAGAGCATGG 3 Lja-MIR408b PmiREN010693 MIR408 Lotus japonicus Lja-BABK02014050.1 36 173 - ATGGAGAGACAAGACAATGGCAGGGAAGAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACAAAATAAATTGAGAATGGGAGATGTTTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCCACGTCTCAGTCTCCATTTC (((((((....((((..(((((((((((((((((.((((((.((((((((.(((((((.....((........))....))))))))))))))).)))))).))))))))))))).)))).))))...)))))))... 56 153 CAGGGAAGAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACAAAATAAATTGAGAATGGGAGATGTTTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGC ((((((((((((((.((((((.((((((((.(((((((.....((........))....))))))))))))))).)))))).))))))))))))).). Lja-miR408b 56 76 ATGCACTGCCTCTTCCCTGGC Lja-miR408b* 133 153 CAGGGAAGAGGCAGAGCATGG 3 Lja-MIR408c PmiREN010694 MIR408 Lotus japonicus Lja-BABK02039016.1 2558 2695 - ATGGAGAGACAAGACAATGGCAGGGAAGAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACAAAATAAATTGAGAATGGGAGATGTTTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCCACGTCTCAGTCTCTGTTTC (.(.((((((.((((..(((((((((((((((((.((((((.((((((((.(((((((.....((........))....))))))))))))))).)))))).))))))))))))).)))).))))..)))))).).). 2578 2675 CAGGGAAGAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACAAAATAAATTGAGAATGGGAGATGTTTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGC ((((((((((((((.((((((.((((((((.(((((((.....((........))....))))))))))))))).)))))).))))))))))))).). Lja-miR408c 2578 2598 ATGCACTGCCTCTTCCCTGGC Lja-miR408c* 2655 2675 CAGGGAAGAGGCAGAGCATGG 3 Lja-MIR477a PmiREN010696 MIR477 Lotus japonicus Lja-BABK02038636.1 201893 201998 + TATGGTAGCATTTATTGCTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGAAATCGCCTCCAAAGAAGCTAGTCTGAAGTTCTTAGGGAGAGTGGTTAATATTTGTTACGCCTTA ....((((((..(((((.(((((((((((.(((((((((.((....((.((....)).))...)).)))))))))))))))))))).)))))..))))))...... 201913 201978 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGAAATCGCCTCCAAAGAAGCTAGTCTGAAGTTCTTAGGGAGAGTGG (((((((((.(((((((((.((....((.((....)).))...)).)))))))))))))))))).. 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Lja-miR477b 201697 201718 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTAG Lja-miR477b* 201768 201788 AGAGGCTCTTGAGAAGAGTCA 3 Lja-MIR482 PmiREN010698 MIR482 Lotus japonicus Lja-BABK02036812.1 10183 10301 - TGAACCTGTTAGAAGTTGTGGGAATGGGTTGGTTGGAGAGACAACACTCAGAGACTCAACCTCTCTGTGTTGCTTTCTTTCCAATTCCGCCCATTCCTATAATTTCTAATGGCTACTCC .....((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((..((((.......))))..))))))...)))))))))))..))))))))))))))))))))))))....... 10203 10281 GGAATGGGTTGGTTGGAGAGACAACACTCAGAGACTCAACCTCTCTGTGTTGCTTTCTTTCCAATTCCGCCCATTCCTA (((((((((.(((((((((((((((((..((((.......))))..))))))...)))))))))))..))))))))).. 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Lja-miR1507b 235360 235381 TCTTCCATCCATACATCATCTA Lja-miR1507b* 235419 235439 GAGGTGTATGGCTGGAAAAAA 3 Lja-MIR1509 PmiREN010571 MIR1509 Lotus japonicus Lja-BABK02002135.1 11596 11705 + GCAATTGATCCTTTGCATTTTTTTAATCAAGGAAATCACATTTGAGAGAGAAGATATAATTCCCCTTCTCTAATGTGTTTCCTTGATTGAAGAGATTCACTGGATCATCA ......(((((..((.(((((((((((((((((((.((((((....(((((((...........)))))))))))))))))))))))))))))))).))..))))).... 11616 11685 TTAATCAAGGAAATCACATTTGAGAGAGAAGATATAATTCCCCTTCTCTAATGTGTTTCCTTGATTGAAG (((((((((((((.((((((....(((((((...........)))))))))))))))))))))))))))) 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Lja-miR1510b 2591 2611 TGTTGTTTTACCTATTCCTCC Lja-miR1510b* 2640 2660 GAGAATAGGTAAAACAACACT 3 Lja-MIR1511 PmiREN011002 MIR1511 Lotus japonicus Lja-BABK02038321.1 12908 13030 + TGGGCCAAGTGGTTCTATTCATGGTATCATAACCTGCTTCACTTAGTGGTCTTGTGTTCAAATACTGCTCAAGCACATGGTGAACCAGGCTCTGATACCATGAAGCGATTGGCTTCCTACTCT ....................(((((((((...((((.((((((..(((..((((.((.........)).))))..))))))))).))))...)))))))))...................... 12928 13010 ATGGTATCATAACCTGCTTCACTTAGTGGTCTTGTGTTCAAATACTGCTCAAGCACATGGTGAACCAGGCTCTGATACCATGA (((((((((...((((.((((((..(((..((((.((.........)).))))..))))))))).))))...))))))))).. 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Lja-miR2199b 8003 8022 GATACACTAGCACGGGTCAC Lja-miR2199b* 7983 8003 AATTTGTGCTGGGATTTTTTG 3 Lja-MIR2199c PmiREN010647 MIR2199 Lotus japonicus Lja-BABK02037651.1 1032 1111 - TATGCTTCTCTTTGTAATGGAATTTGTGCTGGGATTTTTTGATACACTAGCACGGGTCACCGTTGTTGGTCATGTTAAAA ((((((........((((((.(((((((((((((((....))).).)))))))))))..))))))..)).))))...... 1052 1091 AATTTGTGCTGGGATTTTTTGATACACTAGCACGGGTCAC .(((((((((((((((....))).).)))))))))))... Lja-miR2199c 1052 1071 GATACACTAGCACGGGTCAC Lja-miR2199c* 1071 1091 AATTTGTGCTGGGATTTTTTG 3 Lja-MIR4415 PmiREN010695 MIR4415 Lotus japonicus Lja-BABK02003900.1 12380 12493 + TCACCCTAGTTGCCTGAATCATGTTGTGTTGGGAATCAATGTCACATTGAGGAGTAAAAATCTGTTATTGCCATTGATTCTCATCACAACTTGGTCCAGTCTACCCGGGAACCC ...(((..((.(.(((.((((.((((((.((((((((((((.((.((...(((.......)))...)))).)))))))))))).)))))).)))).))).).))..)))..... 12400 12473 ATGTTGTGTTGGGAATCAATGTCACATTGAGGAGTAAAAATCTGTTATTGCCATTGATTCTCATCACAACTTGG (.((((((.((((((((((((.((.((...(((.......)))...)))).)))))))))))).)))))).).. Lja-miR4415 12453 12473 TTGATTCTCATCACAACTTGG Lja-miR4415* 12400 12420 ATGTTGTGTTGGGAATCAATG 3 Lja-MIR5287a PmiREN010699 MIR5287 Lotus japonicus Lja-BABK02033245.1 4826 4999 + ACAAAAGATATACACCCTCCGGTCATTATTATAAGCAAAAAACAACATTTTAAATTCATTGAATAAATGATGTATTTAGTCATTATTATAGACTAGATACATCATTTATTGAATGAATTTAAAAACTTATTTTTTTGCTTATAATAGTGACCGGATGACGTATATTAAATATGT ......(((((((..(.(((((((((((((((((((((((((.....(((((((((((((.((((((((((((((((((((.........)))))))))))))))))))).)))))))))))))......))))))))))))))))))))))))).)..))))))).....))) 4846 4979 GGTCATTATTATAAGCAAAAAACAACATTTTAAATTCATTGAATAAATGATGTATTTAGTCATTATTATAGACTAGATACATCATTTATTGAATGAATTTAAAAACTTATTTTTTTGCTTATAATAGTGACCGG ((((((((((((((((((((((.....(((((((((((((.((((((((((((((((((((.........)))))))))))))))))))).)))))))))))))......)))))))))))))))))))))))) Lja-miR5287a 4961 4981 TGCTTATAATAGTGACCGG Lja-miR5287a* 4846 4866 GGTCATTATTATAAGCAAAAA 3 Lja-MIR5287b PmiREN010700 MIR5287 Lotus japonicus Lja-BABK02041415.1 12076 12189 + AATATAAGGAAAAAATAATATTTTAGGTTCATTCAATAAATGCATGTATCTAGTCAATACTAGATACATGCATTTATTGAATGAACCTAAAATGTTATTTTTTGCTTATATTTG ((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))) 12096 12169 TTTTAGGTTCATTCAATAAATGCATGTATCTAGTCAATACTAGATACATGCATTTATTGAATGAACCTAAAATG ((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))) Lja-miR5287b 12096 12119 TTTTAGGTTCATTCAATAAATG Lja-miR5287b* 12149 12169 TTATTGAATGAACCTAAAATG 2 Lja-MIR7516 PmiREN010701 MIR7516 Lotus japonicus Lja-BABK02035618.1 9711 9835 + TTTGGTCGCGAGTAAAATTGTAGCGGGTGTCTTCGCCTCTGAACCTTTGCCTATTGTGCTGTTAACCATTCTCAGCCTGGCTTCAGAGACGTGACTCCCGCTACGCATTTGCTCGCCATCTCTGC ...(((.(((((((((..(((((((((.(((..((.(((((((.....(((......((((...........))))..)))))))))).)).))).)))))))))..))))))))).)))..... 9731 9815 TAGCGGGTGTCTTCGCCTCTGAACCTTTGCCTATTGTGCTGTTAACCATTCTCAGCCTGGCTTCAGAGACGTGACTCCCGCTACG (((((((.(((..((.(((((((.....(((......((((...........))))..)))))))))).)).))).))))))).. Lja-miR7516 9731 9752 TAGCGGGTGTCTTCGCCTCTGA Lja-miR7516* 9795 9815 AGAGACGTGACTCCCGCTACG 3 Lja-MIR7518 PmiREN011006 MIR7518 Lotus japonicus Lja-BABK02043168.1 21090 21215 + ATACGCGTAATGTTTTTTTCTGTCCTTCTTGTTGTTCAAAGTTTTCATTTTTTCTTTATATTAAGATAAAGAAATGTGATCACTTTGCGCACTGAGCAAGGACAGGGTAAACAATTATGCTATAGT ....................(((((((((((.(((.((((((..((((..(((((((((......))))))))).))))..)))))).))).)))).)))))))...................... 21110 21195 TGTCCTTCTTGTTGTTCAAAGTTTTCATTTTTTCTTTATATTAAGATAAAGAAATGTGATCACTTTGCGCACTGAGCAAGGACAGG (((((((((((.(((.((((((..((((..(((((((((......))))))))).))))..)))))).))).)))).))))))).. Lja-miR7518 21174 21195 TTGCGCACTGAGCAAGGACAGG Lja-miR7518* 21110 21130 TGTCCTTCTTGTTGTTCAAAG 3 Lja-MIR7522 PmiREN010704 MIR7522 Lotus japonicus Lja-BABK02035619.1 3730 3865 + ACAGGTTTTATGACTACCGCATGTTTAAGTGCGGCAGATGGTCAATTTTTTTTAATTCTCTCTGAATTCTCTCTGAATGTTTATAAATTCTTTGTTCTGTCCGCACTTTAATATGCGGCAGCACATATTTGCCTTT (.((((..((((.((.(((((((((.((((((((((((...............(((((.....)))))......((((........)))).....)))).)))))))).))))))))).))..))))...)))))) 3750 3845 ATGTTTAAGTGCGGCAGATGGTCAATTTTTTTTAATTCTCTCTGAATTCTCTCTGAATGTTTATAAATTCTTTGTTCTGTCCGCACTTTAATATGC (((((.((((((((((((...............(((((.....)))))......((((........)))).....)))).)))))))).))))))) Lja-miR7522 3826 3847 CTGTCCGCACTTTAATATGC Lja-miR7522* 3750 3770 ATGTTTAAGTGCGGCAGATGG 2 Lja-MIR7523a PmiREN010705 MIR7523 Lotus japonicus Lja-BABK02044108.1 6256 6429 + ACAGCTCCGCACCCATCATCACCACCGGGCTCGAGGATCAGCCTAACCTGAAGCTGCAAATCTCTGACATTGAGTGGTTTTTGGGCCTCGACAATGAGCCAGTCCAGGCCCAAGCCCAGATCCAGGCCCAGGCTGAGCCTCTGCCTGGTGGTGATGCTGAGTGGGAGAGCGATT ...(((((.(((.((.((((((((((((((..((((.(((((((..((((...(((.....(((.......))).(((..((((((((.(((.........))).))))))))))))))...))))...))))))).)))).)))))))))))))).)).))).).)))).... 6276 6409 ACCACCGGGCTCGAGGATCAGCCTAACCTGAAGCTGCAAATCTCTGACATTGAGTGGTTTTTGGGCCTCGACAATGAGCCAGTCCAGGCCCAAGCCCAGATCCAGGCCCAGGCTGAGCCTCTGCCTGGTGGTGA ((((((((((..((((.(((((((..((((...(((.....(((.......))).(((..((((((((.(((.........))).))))))))))))))...))))...))))))).)))).)))))))))).. Lja-miR7523a 6276 6297 ACCACCGGGCTCGAGGATCAGC Lja-miR7523a* 6389 6409 TGAGCCTCTGCCTGGTGGTGA 3 Lja-MIR7523b PmiREN010706 MIR7523 Lotus japonicus Lja-BABK02005032.1 16599 16772 + ACAGCTCCGCACCCATCATCACCACCGGGCTCGAGGATCAGCCTAACCTGAAGCTGCAAATCTCTGACATTGAGTGGTTTTTGGGCCTCGACAATGAGCCAGTCCAGGCCCAAGCCCAGATCCAGGCCCAGGCTGAGCCTCTGCCTGGTGGTGATGCTGAGTGGGAGAGCGATT ...(((((.(((.((.((((((((((((((..((((.(((((((..((((...(((.....(((.......))).(((..((((((((.(((.........))).))))))))))))))...))))...))))))).)))).)))))))))))))).)).))).).)))).... 16619 16752 ACCACCGGGCTCGAGGATCAGCCTAACCTGAAGCTGCAAATCTCTGACATTGAGTGGTTTTTGGGCCTCGACAATGAGCCAGTCCAGGCCCAAGCCCAGATCCAGGCCCAGGCTGAGCCTCTGCCTGGTGGTGA ((((((((((..((((.(((((((..((((...(((.....(((.......))).(((..((((((((.(((.........))).))))))))))))))...))))...))))))).)))).)))))))))).. Lja-miR7523b 16619 16640 ACCACCGGGCTCGAGGATCAGC Lja-miR7523b* 16732 16752 TGAGCCTCTGCCTGGTGGTGA 3 Lja-MIR7524 PmiREN010707 MIR7524 Lotus japonicus Lja-BABK02035392.1 41272 41346 + GACTCGGTCAAGGCACTGAGTCAATGAGTCACTGGTCGAACCAGTGAGTCATTGGGCGGATTGCTTGACTCGGTT ((((.(((((((.(((((..(((((((.((((((((...)))))))).))))))).)))..))))))))).)))) 41286 41335 ACTGAGTCAATGAGTCACTGGTCGAACCAGTGAGTCATTGGGCGGATTGC ((((..(((((((.((((((((...)))))))).))))))).)))..))) Lja-miR7524 41317 41337 GAGTCATTGGGCGGATTGC Lja-miR7524* 41286 41306 ACTGAGTCAATGAGTCACTGG 3 Lja-MIR7526a PmiREN010709 MIR7526 Lotus japonicus Lja-BABK02035559.1 248110 248230 - AAAATAGCTGTAACGTCCGCTATCAAGGTAGCTGTAACTTCCGCTATTAAGATAACAGTTACAGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACAGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACCGCTATCTTGA ((.(((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(.......).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).))))).)))) 248130 248210 TATCAAGGTAGCTGTAACTTCCGCTATTAAGATAACAGTTACAGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACAGCTATCTTGATAGC ((((((((((((((((((((((((((((((((((.(.......).)))))))))))))))))))))))))))))))))))) Lja-miR7526a 248192 248212 TATCAAGGTAGCTGTAACT Lja-miR7526a* 248130 248150 AGTTACAGCTATCTTGATAGC 3 Lja-MIR7526b PmiREN010716 MIR7526 Lotus japonicus Lja-BABK02042373.1 144045 144161 - AGATAGCTGTAACTTCCGCTATCAAGATAGCTGTAACTTCCGCTATCAAGATAGCTGTAACTGCTATCTTAATAGCGGAAGTTACAGCTACCTTGATAGCGGACGTTACAGCTATTT .((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((.......)))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))))))))). 144051 144157 CTGTAACTTCCGCTATCAAGATAGCTGTAACTTCCGCTATCAAGATAGCTGTAACTGCTATCTTAATAGCGGAAGTTACAGCTACCTTGATAGCGGACGTTACAGCT (((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((.......)))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))) Lja-miR7526b 144051 144072 TGATAGCGGACGTTACAGCT Lja-miR7526b* 144137 144157 CTGTAACTTCCGCTATCAAGA 3 Lja-MIR7526c PmiREN010710 MIR7526 Lotus japonicus Lja-BABK02038607.1 187844 187978 - AAAATAGCTGTAACATCCGCTATCAAGGTAGCTGTAACTTCCGCTATTTTTGTCTAATGCTCACGTTTGTTGTGTCCGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACCGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACAGCTATCAAGA ...(((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((.........((..((((.....))))..)).......))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))))))...)) 187864 187958 TATCAAGGTAGCTGTAACTTCCGCTATTTTTGTCTAATGCTCACGTTTGTTGTGTCCGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACCGCTATCTTGATAGC ((((((((((((.(((((((((((((((.........((..((((.....))))..)).......))))))))))))))).)))))))))))))) Lja-miR7526c 187940 187960 TATCAAGGTAGCTGTAACT Lja-miR7526c* 187864 187884 AGTTACCGCTATCTTGATAGC 3 Lja-MIR7526d PmiREN010711 MIR7526 Lotus japonicus Lja-BABK02041105.1 72811 72923 + ATAGCTGTAACGTCCGCTATCAAGGTAGCTGTAACTTCCGCTATTAAGATAGCAGTTACAGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACAGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACAGCTAT (((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.......))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))) 72828 72908 TATCAAGGTAGCTGTAACTTCCGCTATTAAGATAGCAGTTACAGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACAGCTATCTTGATAGC ((((((((((((((((((((((((((((((((((((.......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))) 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Lja-miR7526e 43330 43350 TATCAAGGTAGCTGTAACT Lja-miR7526e* 43268 43288 AGTTACAGCTATCTTGATAGC 3 Lja-MIR7526f PmiREN010713 MIR7526 Lotus japonicus Lja-BABK02042153.1 89608 89742 - AAAATAGCTGTAACGTCCGCTATCAAGGTAGCTGTAACTTCCGCTATTTTTGTCTAATGCTCACGTTTGTTGTGTCCGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACCGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACAGCTATCAAGA ...(((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((.........((..((((.....))))..)).......))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))))))...)) 89628 89722 TATCAAGGTAGCTGTAACTTCCGCTATTTTTGTCTAATGCTCACGTTTGTTGTGTCCGCTATCTTGATAGCGGAAGTTACCGCTATCTTGATAGC ((((((((((((.(((((((((((((((.........((..((((.....))))..)).......))))))))))))))).)))))))))))))) 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Lja-miR7533a 138112 138132 GAGGGGATGGAGAGAAGCTGG Lja-miR7533a* 138209 138229 TCTTCTTCTTCTCCCTCTCTA 3 Lja-MIR7533b PmiREN010719 MIR7533 Lotus japonicus Lja-BABK02006436.1 822 993 - TGGCTCAGATTTTGGATGGAGAGGGGATGGAGAGAAGCTGGATGGAGAGGATCCAAATCCAATTTCATCTTAGACATCATATTTAAAGGCTGATAAAGACACCGAATAGGATTTGATTTCCAGCAAACAAAAGGTTTTCTTCACACCACCATGATCAGTTTGATTAGCAAGA ....(((((((...(((.(.(..((..(((((((((.((((((((((.((((....))))..))))))))..................((((..((.((..((.....))..))..))..)))).......)).)))))))))..))..).).))))))))))......... 842 973 GAGGGGATGGAGAGAAGCTGGATGGAGAGGATCCAAATCCAATTTCATCTTAGACATCATATTTAAAGGCTGATAAAGACACCGAATAGGATTTGATTTCCAGCAAACAAAAGGTTTTCTTCACACCACCAT (..((..(((((((((.((((((((((.((((....))))..))))))))..................((((..((.((..((.....))..))..))..)))).......)).)))))))))..))..).. 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Lja-miR7533c 413 433 GAGGGGATGGAGAGAAGCTGG Lja-miR7533c* 604 624 AGCTTCTCTCCATCCTCTCTC 3 Lja-MIR7533d PmiREN010722 MIR7533 Lotus japonicus Lja-BABK02040467.1 10304 10555 - TGGATCCTCTCCATCCAGCTTCTCTCCATCCTCTCTCCATCCAAATCTGAGCCATTGATTTAGAAATTTAAAGGCTTGGATCAATTTAAGAAGAGAGAGAAAAAATGAATTGTATTTAAAGGCTTGAATCAATTTAAGAAGAGAGAGAAAACATGAACTAATCCTCACCTTTAAAATTCAAAATCAATGGCTCAGATTTTAGATGGAGAGGGGATGGAGAGAAGCTGGATGGAGAGGATCCAAATCCCAT (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((.((((((((...((((...((((.(...............(((((((.((((((....)))))))))))))...............).))))...))))...)))))))).))).)))))))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))........ . 10324 10535 AGCTTCTCTCCATCCTCTCTCCATCCAAATCTGAGCCATTGATTTAGAAATTTAAAGGCTTGGATCAATTTAAGAAGAGAGAGAAAAAATGAATTGTATTTAAAGGCTTGAATCAATTTAAGAAGAGAGAGAAAACATGAACTAATCCTCACCTTTAAAATTCAAAATCAATGGCTCAGATTTTAGATGGAGAGGGGATGGAGAGAAGCTGG (((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((.((((((((...((((...((((.(...............(((((((.((((((....)))))))))))))...............).))))...))))...)))))))).))).)))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))))).. Lja-miR7533d 10324 10344 GAGGGGATGGAGAGAAGCTGG Lja-miR7533d* 10515 10535 AGCTTCTCTCCATCCTCTCTC 3 Lja-MIR8175 PmiREN010725 MIR8175 Lotus japonicus Lja-BABK02034169.1 349 503 - AATGCTTTTGTATTGACGCAGTTCCCCGGCAACGGCGCCATTTTGTTGAAAGGTTTTTACCACAACTACTTTCAAATCCCTTTCAAGATTCAATTGTACTATAGTAAAGGGTTTTGTCGTATCCGCAGGGAATTGCTAATACAAATACCGTTTCT ......(((((((((..((((((((((((..(((((........((((...(((....))).)))).......(((.(((((((.((((......)).))...).)))))).))))))))..)))..)))))))))))))))))).......... 369 483 GTTCCCCGGCAACGGCGCCATTTTGTTGAAAGGTTTTTACCACAACTACTTTCAAATCCCTTTCAAGATTCAATTGTACTATAGTAAAGGGTTTTGTCGTATCCGCAGGGAATTG (((((((((..(((((........((((...(((....))).)))).......(((.(((((((.((((......)).))...).)))))).))))))))..)))..)))))).. 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Lja-miR11066 227742 227761 TTCAAGATGCTCTATGTTTG Lja-miR11066* 227721 227741 AAACATAGGGGATCTTGAATT 3 Lja-MIR11067 PmiREN010400 MIR11067 Lotus japonicus Lja-BABK02042301.1 30075 30226 - GGGTCAGCTCGACGGGTTGGCTAAATGAGCCGGGTTAGGTTGGTTAAATTCCAGTTCGAAAAGAACTTGGGTTAGTGCAACCCGACTCGTTGAACTCGCGGGTTAGACGGGCCAACCGCGGGTCAAGCGAGCCAACCCGTCGGGTTAGAGTT .(.(((((((((((((((((((...(((.(((((((.((((.(((.(((((((((((((..((...(((((((.....)))))))))..))))))).).))))).))).)))))))).))).)))....))))))))))))))))).)).). 30083 30219 TCGACGGGTTGGCTAAATGAGCCGGGTTAGGTTGGTTAAATTCCAGTTCGAAAAGAACTTGGGTTAGTGCAACCCGACTCGTTGAACTCGCGGGTTAGACGGGCCAACCGCGGGTCAAGCGAGCCAACCCGTCGGGT ((((((((((((((...(((.(((((((.((((.(((.(((((((((((((..((...(((((((.....)))))))))..))))))).).))))).))).)))))))).))).)))....)))))))))))))))) 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Lja-miR11097c 11306 11326 AAAACTTTACACCGTCGGT Lja-miR11097c* 11433 11453 CGACAATGTAAAGTTTTTTTA 3 Lja-MIR11097d PmiREN010472 MIR11097 Lotus japonicus Lja-BABK02026678.1 1 195 - AGAGTTTAATGGATATGCACTGACAGTGTAAAATAGTTTTACACAGACATCCAATTGAATTCCGCCAAATCAGAAAATATCTTATTCTTTTAATTAAAATTAAAGTCAAATGTAATTATCTCTCCTNATGTGGCATGCTTTGATTGGATGAATGTGTAAAACTATTTTACACTGTCAGTGCATTATCCATTAAAT ...((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((....((((....(((........((((.(((((((....)))))))...))))........))).......))))....))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))) 6 195 TTAATGGATATGCACTGACAGTGTAAAATAGTTTTACACAGACATCCAATTGAATTCCGCCAAATCAGAAAATATCTTATTCTTTTAATTAAAATTAAAGTCAAATGTAATTATCTCTCCTNATGTGGCATGCTTTGATTGGATGAATGTGTAAAACTATTTTACACTGTCAGTGCATTATCCATTAAAT ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((....((((....(((........((((.(((((((....)))))))...))))........))).......))))....))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))) 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Lja-miR11107b 75098 75121 TTAGTTCAGTGTATTATTTGGC Lja-miR11107b* 74961 74981 CAAATAATACACTGAACTAAC 3 Lja-MIR11108a PmiREN010495 MIR11108 Lotus japonicus Lja-BABK02024094.1 5292 5435 + ATGAGAAAATTTGGGTTAAATAACACATCATCCAATCACATTGAAGATAAGTGAGTTAGAATTTCTATATTTTATTTTTTAATTTATTTCCAACTCACTTATCTCCAATGTGATTGGATGATAGGTTATTTAACCCAAACTTTC ....((((.(((((((((((((((..(((((((((((((((((.(((((((((((((.(((.....(((..(((.....)))..)))))).))))))))))))).)))))))))))))))))..))))))))))))))).)))) 5312 5415 CACATCATCCAATCACATTGAAGATAAGTGAGTTAGAATTTCTATATTTTATTTTTTAATTTATTTCCAACTCACTTATCTCCAATGTGATTGGATGATAGGTT (..(((((((((((((((((.(((((((((((((.(((.....(((..(((.....)))..)))))).))))))))))))).)))))))))))))))))..))) Lja-miR11108a 5395 5415 AATGTGATTGGATGATAGGTT Lja-miR11108a* 5312 5332 CACATCATCCAATCACATTGA 3 Lja-MIR11108b PmiREN010496 MIR11108 Lotus japonicus Lja-BABK02042511.1 1042349 1042492 - ATGAAGTTTGGGTTAAATAATCCATCATCCAATCACATTGGAGATAAGTGAGTTGGAAATAAACTAATAAATAAAATATAGAAATTCCAACTCACTTATCTTCAATGTGATTGGATGATGAGTTGTTTAACCCAAACTTTGCTT ..(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((..........................)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).... 1042369 1042472 TCCATCATCCAATCACATTGGAGATAAGTGAGTTGGAAATAAACTAATAAATAAAATATAGAAATTCCAACTCACTTATCTTCAATGTGATTGGATGATGAGTT (.((((((((((((((((((((((((((((((((((((..........................)))))))))))))))))))))))))))))))))))).).. Lja-miR11108b 1042452 1042472 TCCATCATCCAATCACATTGG Lja-miR11108b* 1042369 1042389 AATGTGATTGGATGATGAGTT 3 Lja-MIR11108c PmiREN010497 MIR11108 Lotus japonicus Lja-BABK02044136.1 1493 1636 + TAATGAAGTTTGGGTTAAATAATCCATCATCCAATCACATTGGAGATAAGTGAGTTGGAAATAAACTAATAAATAAAATATAGAAATTCCAACTCACTTATCTTCAATGTGATTGGATGATGAGTTGTTTAACCCAAACTTTGC ....(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((..........................)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).. 1513 1616 TCCATCATCCAATCACATTGGAGATAAGTGAGTTGGAAATAAACTAATAAATAAAATATAGAAATTCCAACTCACTTATCTTCAATGTGATTGGATGATGAGTT (.((((((((((((((((((((((((((((((((((((..........................)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))) 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Lja-miR11108d 9248 9268 CCAATGTGATTGGATGATGGA Lja-miR11108d* 9169 9189 CATTATCCAATCACATTGAAG 3 Lja-MIR11108e PmiREN010502 MIR11108 Lotus japonicus Lja-BABK02037955.1 52317 52446 + TTTGAGTTAAATAACTCATTATCGAATCAAATTGGAGATAAGTGAGTTGAAACTAAATTAATAAATAAAATATTAAAATTTCAACTCACTTATCTCAAATGTGATTGGATGATGAATTATTTAACCCAAA .(((.(((((((((.((((((((.(((((.(((.((((((((((((((((((.....((((((.......))))))..)))))))))))))))))).))).))))).)))))))).))))))))).))). 52322 52443 GTTAAATAACTCATTATCGAATCAAATTGGAGATAAGTGAGTTGAAACTAAATTAATAAATAAAATATTAAAATTTCAACTCACTTATCTCAAATGTGATTGGATGATGAATTATTTAACCC (((((((((.((((((((.(((((.(((.((((((((((((((((((.....((((((.......))))))..)))))))))))))))))).))).))))).)))))))).))))))))).) 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Lja-miR11108f 41925 41950 ATTGGATGATGAGTTATTTAACCC Lja-miR11108f* 41828 41848 GTTAAATAACTCACTATCCAA 3 Lja-MIR11108g PmiREN010499 MIR11108 Lotus japonicus Lja-BABK02040838.1 23594 23715 - GTTAAATAACTCATCATTCAATCACATTTGAGATAAGTGAGTTGGAAATAAATTAATAAATAAAATATAGAAATTTCACCTCACTTATTTTCAATATGATTGGATGATGAGTTATTTAACCC ((((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((.(((((..........................))))).)))))))))))).))).)))))))))))))))))))))))).. 23594 23715 GTTAAATAACTCATCATTCAATCACATTTGAGATAAGTGAGTTGGAAATAAATTAATAAATAAAATATAGAAATTTCACCTCACTTATTTTCAATATGATTGGATGATGAGTTATTTAACCC ((((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((.(((((..........................))))).)))))))))))).))).)))))))))))))))))))))))).. Lja-miR11108g 23594 23619 ATTGGATGATGAGTTATTTAACCC Lja-miR11108g* 23695 23715 GTTAAATAACTCATCATTCAA 3 Lja-MIR11108h PmiREN010501 MIR11108 Lotus japonicus Lja-BABK02042005.1 49127 49248 + AAATAACTCATCATTCAATCACATTGGAGATAAGTGAGTTGGAGTTGAAAATAAATTAATAAATAAAATATAGAAATTTCAACTCACTTATCTTAAATGTGATTGGATTATGTGTTATTTAA (((((((.(((.(((((((((((((.((((((((((((((((((((............................)))))))))))))))))))).))))))))))))).))).))))))))) 49147 49228 ACATTGGAGATAAGTGAGTTGGAGTTGAAAATAAATTAATAAATAAAATATAGAAATTTCAACTCACTTATCTTAAATGTGA (((((.((((((((((((((((((((............................)))))))))))))))))))).))))))) 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Lja-miR11108i 94612 94635 TTGGATGATGGGTTATTTAACC Lja-miR11108i* 94697 94717 TTAAATAACCCATCATTCAAT 3 Lja-MIR11108j PmiREN010504 MIR11108 Lotus japonicus Lja-BABK02042200.1 339 484 - TGAGAAAGTTTGGGTTAAATAATTTATCATCTAATCACATTAAAGATAAGTGAGTTAGAAATAAATTAATAAATAAAATATAGAAATTTAAACTCACTTATCTTCAATGTCATTGGATGATGGGTTATTTAACCCAAACTTTTTCA (((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((.....((((((..((.........))..)))))))))))))))))))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))) 353 472 TTAAATAATTTATCATCTAATCACATTAAAGATAAGTGAGTTAGAAATAAATTAATAAATAAAATATAGAAATTTAAACTCACTTATCTTCAATGTCATTGGATGATGGGTTATTTAACC (((((((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((.....((((((..((.........))..)))))))))))))))))))).))))).))))))))))))))))))))))) 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Lja-miR11132 105848 105871 TTAGCAACTTTGAGTACTTTGA Lja-miR11132* 105888 105908 AGAGTGCCAAAGTTGCTAATG 2 Lja-MIR11133 PmiREN010535 MIR11133 Lotus japonicus Lja-BABK02037133.1 111351 111521 - TTACCAGAAGAGACTTTTGCTTCCTTAAGGCTAACAGCTTGGCCAACATCCTTGGCTTGATGAAAAGTGGCTAAAGCATCCACTAAGAAAGATTGAAGGTTGGTCATAGCAGCATCCTGGTGAGAATCAAGTTTTTGGCCAAGAAGGAAGACAAGCAACTCCTTGGCAGCA ...((((..(((...(((((((((((..((((((.(((((((((((.....)))))..((((....((((((((..((..(.........)..))....)))))))).....))))((....))...)))))).))))))...))))))).))))...))).))))..... 111371 111501 TTCCTTAAGGCTAACAGCTTGGCCAACATCCTTGGCTTGATGAAAAGTGGCTAAAGCATCCACTAAGAAAGATTGAAGGTTGGTCATAGCAGCATCCTGGTGAGAATCAAGTTTTTGGCCAAGAAGGAAGA ((((((..((((((.(((((((((((.....)))))..((((....((((((((..((..(.........)..))....)))))))).....))))((....))...)))))).))))))...)))))).. Lja-miR11133 111480 111501 TTCCTTAAGGCTAACAGCTTGG Lja-miR11133* 111371 111391 GTTTTTGGCCAAGAAGGAAGA 3 Lja-MIR11135a PmiREN010536 MIR11135 Lotus japonicus Lja-BABK02000364.1 14172 14252 + TGATAGTATAAGCTTAAACAATACATTATAGACTTATCAATTGTTTGGTGCTAACATTGTATTGTATAAGCTTATACATCA ((((.(((((((((((.((((((((...(((...((((((....)))))))))....)))))))).))))))))))))))) 14185 14242 TTAAACAATACATTATAGACTTATCAATTGTTTGGTGCTAACATTGTATTGTATAAGC (((.((((((((...(((...((((((....)))))))))....)))))))).))))) Lja-miR11135a 14223 14244 TAACATTGTATTGTATAAGC Lja-miR11135a* 14185 14205 TTAAACAATACATTATAGACT 2 Lja-MIR11135b PmiREN010537 MIR11135 Lotus japonicus Lja-BABK02041643.1 545494 545574 + TGATTGGATAAGCTTATACAATACATTATGTGCTTATCCATTGTTTTGTGCAAACATTGTATTGTATAAGCTTATCCATCA ((((.((((((((((((((((((((.....(((................))).....)))))))))))))))))))))))) 545500 545571 GATAAGCTTATACAATACATTATGTGCTTATCCATTGTTTTGTGCAAACATTGTATTGTATAAGCTTATCCA (((((((((((((((((((.....(((................))).....))))))))))))))))))))) Lja-miR11135b 545548 545573 CATTGTATTGTATAAGCTTATCCA Lja-miR11135b* 545500 545520 GATAAGCTTATACAATACATT 3 Lja-MIR11136a PmiREN010538 MIR11136 Lotus japonicus Lja-BABK02004719.1 503 625 + AGGACGTTGAATGAAAAATATATTTGGATCTTGAAAATTGTTGGGATTTTGAGGACGTTGGTTGGGAAATTGATTTGGATCTTGATAATTGTTGGGATTTTGATGACGTTGGTTGGGAAATTG ..((((((.............(((.(((((((((.((((((((((((((.......(((((((....)))))))..)))))))))))))).))))))))).)))))))))............. 523 605 TTTGGATCTTGAAAATTGTTGGGATTTTGAGGACGTTGGTTGGGAAATTGATTTGGATCTTGATAATTGTTGGGATTTTGATG ((.(((((((((.((((((((((((((.......(((((((....)))))))..)))))))))))))).))))))))).)))) 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Lja-miR11137a 15567 15588 TTTTTGGCATCATGATACTGTG Lja-miR11137a* 15426 15446 GGTACAATGATGCCAAAAATA 3 Lja-MIR11137b PmiREN010540 MIR11137 Lotus japonicus Lja-BABK02028694.1 1 184 + ATTTTTGGCATCATGATACTGTGTCTTCAGAGCCTTTTCAACTTGATTGCGTTGAGCGCTCTGCAATGGTACATTTAATCCGCAGTGCTCGACCTGATTATAGAGCGATCAACCTAATCAAGTCGAGAAGGTTCTTAAGACACGGTACAATGATGCCAAAAATAAACTGCATGGAAGAGAACTAATCTGCGAAAGTAATAATA ((((((((((((((..(((((((((((.(((((((((((.(((((((((.(((((.(((((((.((((((((............))))).......))).))))))).))))).))))))))).))))))))))).)))))))))))..))))))))))))))........................................ 2 164 TTTTTGGCATCATGATACTGTGTCTTCAGAGCCTTTTCAACTTGATTGCGTTGAGCGCTCTGCAATGGTACATTTAATCCGCAGTGCTCGACCTGATTATAGAGCGATCAACCTAATCAAGTCGAGAAGGTTCTTAAGACACGGTACAATGATGCCAAAAATA (((((((((((((..(((((((((((.(((((((((((.(((((((((.(((((.(((((((.((((((((............))))).......))).))))))).))))).))))))))).))))))))))).)))))))))))..))))))))))))).. 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Lja-miR11145b 30081 30105 GATAAGTGAGGGACCAAAAGAGC Lja-miR11145b* 29890 29910 TCTTTTGATCCCTCACTTATA 3 Lja-MIR11145c PmiREN010548 MIR11145 Lotus japonicus Lja-BABK02040459.1 67926 68149 + AATAGCTTTTTTGGTCCCTCACTTATCACGGTTTTGCACTTTTGATCCCTAATAAAAAAATTAGCACTTTTGGTCCTCCACATTGCTTATTTATTTGCAAAAATGATCCCTATTTAGACTAAAACTGCAAAAGTGTGTAAATGTGAGGGACTAATTTTGCTAATTTTTTTCTAAAGAGACCAAAAGAGCAAAATTGTGATAAGTGAGGGACCAAAAGAGCTATT (((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((.((...(((((((((((((...((((((((.((((((((.(((((..(((((.......((........)).......)))))))))).)).)))))).))))))))...)))))))))))))....)).)).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))) 67932 68145 TTTTTTGGTCCCTCACTTATCACGGTTTTGCACTTTTGATCCCTAATAAAAAAATTAGCACTTTTGGTCCTCCACATTGCTTATTTATTTGCAAAAATGATCCCTATTTAGACTAAAACTGCAAAAGTGTGTAAATGTGAGGGACTAATTTTGCTAATTTTTTTCTAAAGAGACCAAAAGAGCAAAATTGTGATAAGTGAGGGACCAAAAGAGC (((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((.((...(((((((((((((...((((((((.((((((((.(((((..(((((.......((........)).......)))))))))).)).)))))).))))))))...)))))))))))))....)).)).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))) Lja-miR11145c 68123 68147 GATAAGTGAGGGACCAAAAGAGC Lja-miR11145c* 67932 67952 TTTTTTGGTCCCTCACTTATC 3 Lja-MIR11145d PmiREN010545 MIR11145 Lotus japonicus Lja-BABK02031324.1 6158 6355 + GTCTCTCACTTGTCACGATTTTACACTTTTGGTCCCTCTAGGAAAAAAATAGCAAAATTAGTCCCTCACATTTACACACTTTTACCGTTTTAGTCCAAATAGGGATCATTTTCGCAAACAAATAAGCAATGTGGAGGACCAAAAGTGCTAATTTTTTTATTGGGGACCAAAAGTGCAAAATCGTGATAAGTGAGGGAT ((((((((((((((((((((((.((((((((((((((....(((((((.(((((......((((.(((((((.............((.....((((......))))......)).............))))))).))))......))))).)))))))...)))))))))))))).)))))))))))))))))))))) 6163 6352 TCACTTGTCACGATTTTACACTTTTGGTCCCTCTAGGAAAAAAATAGCAAAATTAGTCCCTCACATTTACACACTTTTACCGTTTTAGTCCAAATAGGGATCATTTTCGCAAACAAATAAGCAATGTGGAGGACCAAAAGTGCTAATTTTTTTATTGGGGACCAAAAGTGCAAAATCGTGATAAGTGAGG (((((((((((((((((.((((((((((((((....(((((((.(((((......((((.(((((((.............((.....((((......))))......)).............))))))).))))......))))).)))))))...)))))))))))))).))))))))))))))))))) Lja-miR11145d 6333 6354 CAAAATCGTGATAAGTGAGG Lja-miR11145d* 6163 6183 TCACTTGTCACGATTTTACAC 2 Lja-MIR11148 PmiREN010550 MIR11148 Lotus japonicus Lja-BABK02039686.1 39471 39610 + TGTGATTGAATGATTGTATAAAACTTATTTACACCGTCGGTACATAGAAATTAATTTCAATCATAATCACAATTGGGTTATGGATTAATTTCTATTCACTGACGGTGTAAATAAGTTTTACACAATTATTCAATCACAAC (((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((..(((((((((((((.....(((((((.......))))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))) 39491 39590 AAACTTATTTACACCGTCGGTACATAGAAATTAATTTCAATCATAATCACAATTGGGTTATGGATTAATTTCTATTCACTGACGGTGTAAATAAGTTTTA (((((((((((((((((((((..(((((((((((((.....(((((((.......))))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))) Lja-miR11148 39491 39512 AAACTTATTTACACCGTCGG Lja-miR11148* 39570 39590 TGACGGTGTAAATAAGTTTTA 2 Lja-MIR11149 PmiREN010552 MIR11149 Lotus japonicus Lja-BABK02039861.1 20905 21059 + ACACCGATAATGTAAATAAGTTTTACACCATCATTCAATCACATCTCTCCATTTTGTTAGCTCATAATTAATTTTAAATTTAATAATATCTAAAATAGAAAATGGAAGTTTGTGATTGAATGATGGTGTAAAACTTTTTACACCGTCGGTGCATA .(((((((..((((((.((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((.((((......(((((........))))).....)))....).))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))).... 20925 21039 TTTTACACCATCATTCAATCACATCTCTCCATTTTGTTAGCTCATAATTAATTTTAAATTTAATAATATCTAAAATAGAAAATGGAAGTTTGTGATTGAATGATGGTGTAAAACT (((((((((((((((((((((((.((.((((((((.((((......(((((........))))).....)))....).))))))))))..))))))))))))))))))))))))) 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Lja-miR11155c 82055 82076 GTAAGCGAGTTTGATTTTAG Lja-miR11155c* 82114 82134 TAAAATCAAACTTGCTTGCAT 2 Lja-MIR11155d PmiREN010556 MIR11155 Lotus japonicus Lja-BABK02038319.1 10377 10525 - CCCTGCGTTTGTAAGTGAGTTTGATTTTAGTTCCTCTAAGGCAAAATGATGTTTAGTGGCGGTCTTTCAGTAAACGTAAAAATGATCGCGACTATACGTTATTGTCCCTCAGAGGAATTAAAATCAAACTCGAATACAAATTCAGAGAC (.(((.(((((((..((((((((((((((((((((((.(((...((((((((.((((.((((((...................)))))).)))).))))))))...))).))))))))))))))))))))))..))))))).))).))) 10397 10505 TTGATTTTAGTTCCTCTAAGGCAAAATGATGTTTAGTGGCGGTCTTTCAGTAAACGTAAAAATGATCGCGACTATACGTTATTGTCCCTCAGAGGAATTAAAATCAAAC (((((((((((((((((.(((...((((((((.((((.((((((...................)))))).)))).))))))))...))).))))))))))))))))))) 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Lja-miR11173 23324 23345 AAATTCTATTGGTGGGATAA Lja-miR11173* 23410 23430 GATTCATCAATAAAATTATGT 2 Lja-MIR11174 PmiREN010565 MIR11174 Lotus japonicus Lja-BABK02000208.1 18726 18825 + CTTAGTGTGACTGTTATTGTTAGTTGTTCTGTTAATAAACAGCTGACATAGTTAGTTGTTTCTGTTAGAGTACAGCTGGCTCATTCTGTTATAGTTGTGA ((....(((((.(.....(((((((((.((.((((((((((((((((...))))))))))..)))))))).))))))))).....).))))))))))))) 18746 18805 TAGTTGTTCTGTTAATAAACAGCTGACATAGTTAGTTGTTTCTGTTAGAGTACAGCTGGC (((((((.((.((((((((((((((((...))))))))))..)))))))).))))))))) Lja-miR11174 18785 18807 TTCTGTTAGAGTACAGCTGGC Lja-miR11174* 18746 18766 TAGTTGTTCTGTTAATAAACA 2 Lja-MIR11176 PmiREN010566 MIR11176 Lotus japonicus Lja-BABK02035784.1 41806 41868 - GGTCGGCCCAGATAGGTCTCAAAGCTTTCATTGGAAGCTTTGAGATCTGCTGCGGCTAGGACC (((((((((((.(((((((((((((((((...)))))))))))))))))))).))))..)))) 41813 41861 CCAGATAGGTCTCAAAGCTTTCATTGGAAGCTTTGAGATCTGCTGCGGC ((((.(((((((((((((((((...)))))))))))))))))))).))) 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Lja-miR11179 89743 89764 AAGTTTAGGACCACGTTTGC Lja-miR11179* 89862 89882 ACACGTGGTCTCTAAACTTTA 2 Lja-MIRN34 PmiREN010894 MIRN34 Lotus japonicus Lja-BABK02023196.1 864 1089 - AGAATGGGTGACCTCCTTCGAAGTCCTCGTGTTGCATCCCTTTTTGCCATTTTTCGCAATTCCTTTTTTTTTAATTAATTAATTTAACGCATATTGTGTTTTAACCCGCATAACTTTCAGATGTGATCATACCTTCACTAATGCACCGGATCCCATCTGAACTCTGCAGTGAAGTGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCG ((...((((.((((........(((((.(((((((.(((((....(((((..(((((............................((((((...)))))).......(((.....((((((((.((((....................)))).))))))))...))).)))))))).))..))).))..))))))).))))))))).)))).))............ 884 1069 AAGTCCTCGTGTTGCATCCCTTTTTGCCATTTTTCGCAATTCCTTTTTTTTTAATTAATTAATTTAACGCATATTGTGTTTTAACCCGCATAACTTTCAGATGTGATCATACCTTCACTAATGCACCGGATCCCATCTGAACTCTGCAGTGAAGTGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGT ..(((((.(((((((.(((((....(((((..(((((............................((((((...)))))).......(((.....((((((((.((((....................)))).))))))))...))).)))))))).))..))).))..))))))).))))).... 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Lja-miRN776a 20826 20845 AATAGCTCGGCGCCAGGATG Lja-miRN776a* 20925 20945 TTCTGGTGTCCTAGGCGTAGA 3 Lja-MIRN776b PmiREN010747 MIRN776 Lotus japonicus Lja-BABK02044463.1 105140 105299 + TCTTCGTTCATGGTTCGATATTCTGGTGTCCTAGGCGTAGAGGAACCACACCAATCCATCCCGAACTTGGTGGTTAAACTCTACTGCGGTGACGATACTGTAGGGGAGGTCCTGCGGAAAAATAGCTCGGCGCCAGGATGATAAAAAGCTTACCACCTCT ..........((((....((((((((((((...(((((((((......((((((((......))..))))))......))))))..((....))...((((((((....)))))))).......))).))))))))))))...........))))..... 105160 105279 TTCTGGTGTCCTAGGCGTAGAGGAACCACACCAATCCATCCCGAACTTGGTGGTTAAACTCTACTGCGGTGACGATACTGTAGGGGAGGTCCTGCGGAAAAATAGCTCGGCGCCAGGATG ((((((((((...(((((((((......((((((((......))..))))))......))))))..((....))...((((((((....)))))))).......))).)))))))))).. Lja-miRN776b 105260 105279 AATAGCTCGGCGCCAGGATG Lja-miRN776b* 105160 105180 TTCTGGTGTCCTAGGCGTAGA 3 Lja-MIRN776c PmiREN010748 MIRN776 Lotus japonicus Lja-BABK02044463.1 127157 127316 - TCTTCGTTCATGGTTCGATATTCTGGTGTCCTAGGCGTAGAGGAACCACACCAATCCATCCCGAACTTGGTGGTTAAACTCTACTGCGGTGACGATACTGTAGGGGAGGTCCTGCGGAAAAATAGCTCGGCGCCAGGATGATAAAAAGCTTACCACCTCT ..........((((....((((((((((((...(((((((((......((((((((......))..))))))......))))))..((....))...((((((((....)))))))).......))).))))))))))))...........))))..... 127177 127296 TTCTGGTGTCCTAGGCGTAGAGGAACCACACCAATCCATCCCGAACTTGGTGGTTAAACTCTACTGCGGTGACGATACTGTAGGGGAGGTCCTGCGGAAAAATAGCTCGGCGCCAGGATG ((((((((((...(((((((((......((((((((......))..))))))......))))))..((....))...((((((((....)))))))).......))).)))))))))).. 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Lja-miRN1743b 3116 3135 TGAATCAAGTTAGTTACGGG Lja-miRN1743b* 3037 3057 CTTGACTACACTTTTCAAAGG 3 Lja-MIRN1744 PmiREN010727 MIRN1744 Lotus japonicus Lja-BABK02001951.1 11171 11292 - ATCGCAGTCGGTAATCCTGTATTCGTCGCAGTTAGGGTTCTTTGTCATCCTATGATCCTAAATTATGATAGGATTTCAGAGAATTCTAACTGCAACGAATACGAATAGACCGTATGCATTTG ...(((..((((.....(((((((((.(((((((((((((((((..(((((((.((........)).)))))))..))))))))))))))))).))))))))).....))))..)))..... 11191 11272 ATTCGTCGCAGTTAGGGTTCTTTGTCATCCTATGATCCTAAATTATGATAGGATTTCAGAGAATTCTAACTGCAACGAATAC ((((((.(((((((((((((((((..(((((((.((........)).)))))))..))))))))))))))))).)))))).. 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Lja-miRN1745b 159 178 TCTGATTGGTTGACGGTGTT Lja-miRN1745b* 190 210 CACTGTCTACACCGTCAATGC 3 Lja-MIRN1746 PmiREN010741 MIRN1746 Lotus japonicus Lja-BABK02012445.1 3723 3857 - ATAGAGAATGCTTTTAGTGACCCTCAAAGGCTTCCACTACTCTATGTTATAAGCGATTCAATTCATGTATGGATGAATATCCACAAACATGGAGGCGTGGGGGCTATTGGGGACCATTAAAGGCCATTCTGATGT (((.(((((((((((((((..((((((.(((((((((..(((((((((.......(((((.((((....))))))))).......)))))))))..))))))))).))))))..))))))))).))))))..))) 3743 3837 CCCTCAAAGGCTTCCACTACTCTATGTTATAAGCGATTCAATTCATGTATGGATGAATATCCACAAACATGGAGGCGTGGGGGCTATTGGGGACC .((((((.(((((((((..(((((((((.......(((((.((((....))))))))).......)))))))))..))))))))).))))))... 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Lja-miRN1751b 5629 5649 AAGGACTTATTTTGATACGGG Lja-miRN1751b* 5591 5611 CCTAGAGTATTTAAGCCTTTT 3 Lja-MIRN1751c PmiREN010937 MIRN1751 Lotus japonicus Lja-BABK02043911.1 80261 80522 - GAATCGGGAAAAAAATTTTCAAGGACTTATTTTGATACGGGGTACAATTTCAGGGACCTACAGAGTATTTAAGCCAATTTTTTACCCTTGAAGGTGACAGATATACTGCTGGGCATCTTTGTTGTAAATGTTGAGAAAATTTACTCTCATTAACAATTGGGATTAGTCATTATTGGGTTCCATTATTATCCAGTATTGAAGAATACTTTGTATTAACAATAGTTTGTGTAAATAGTCTTTGTAATTA .............((((..((((((((.((((..(((((((((.(........).)))((((((((((((..(((......(((((......)))))(((........))))))(((((.(((((.((((..(((........))).)))).))))).)))))...(((.((((((((.........)))))))).))).))))))))))))...........)))))))))))))))))).)))). 80281 80502 AAGGACTTATTTTGATACGGGGTACAATTTCAGGGACCTACAGAGTATTTAAGCCAATTTTTTACCCTTGAAGGTGACAGATATACTGCTGGGCATCTTTGTTGTAAATGTTGAGAAAATTTACTCTCATTAACAATTGGGATTAGTCATTATTGGGTTCCATTATTATCCAGTATTGAAGAATACTTTGTATTAACAATAGTTTGTGTAAATAGTCTTTGT (((((((.((((..(((((((((.(........).)))((((((((((((..(((......(((((......)))))(((........))))))(((((.(((((.((((..(((........))).)))).))))).)))))...(((.((((((((.........)))))))).))).))))))))))))...........))))))))))))))))).. 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Lja-miRN1769b 114751 114772 AAATCACGGTGCTAAAATGATC Lja-miRN1769b* 114686 114706 CATTTTGTCATCTTGATTTGG 3 Lja-MIRN1770 PmiREN010789 MIRN1770 Lotus japonicus Lja-BABK02036447.1 16333 16473 - AAAATAAAATAATTCTAAATCCCTAATAATTAGATCCTAACAATACTCTCTAAAAAGGAACCTTGTCCTAATGGTACTCCTATTTGGAGGCATGTATTGTTAGGATATAGTTATTAGGGATTTAGATTTATTTTATATTTA ...(((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((..........)))..)))).))))))))...))))))))))))).))))))))))))))))))).)))))))))..... 16353 16453 CCCTAATAATTAGATCCTAACAATACTCTCTAAAAAGGAACCTTGTCCTAATGGTACTCCTATTTGGAGGCATGTATTGTTAGGATATAGTTATTAGGGAT ((((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((..........)))..)))).))))))))...))))))))))))).)))))))))))).. Lja-miRN1770 16353 16374 TTAGGATATAGTTATTAGGGAT Lja-miRN1770* 16433 16453 CCCTAATAATTAGATCCTAAC 3 Lja-MIRN1771 PmiREN010791 MIRN1771 Lotus japonicus Lja-BABK02037487.1 107918 108021 + CGCTTGGGTTTTGTAAATTACCCTGCTTAACTCTGGGAAAATTAAGTAAGAAAAGCTTAATTTCGCCAGAGTTTGAGGAGGGTGATTTAGACAATTCAATTTGA ...(((((((.(.(((((((((((.(((((((((((..(((((((((.......)))))))))..)))))).))))).))))))))))).).)))))))..... 107938 108001 CCCTGCTTAACTCTGGGAAAATTAAGTAAGAAAAGCTTAATTTCGCCAGAGTTTGAGGAGGGTG ((((.(((((((((((..(((((((((.......)))))))))..)))))).))))).)))).. 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Lja-miRN1782 25505 25524 TTGCTCGGATCTTGCTTGGC Lja-miRN1782* 25555 25575 CTAGGTAGGATCCGAGCAACT 3 Lja-MIRN1783a PmiREN010812 MIRN1783 Lotus japonicus Lja-BABK02000956.1 20016 20270 - TTTCCAAATTGGTTCCACTCTTGGTGGGATTTCTTTGGACCTACAAAAGATATTTTTCCCCCCGAAGTACTGGAGGGATTCAAACTTTTTTCAAAAAATTGGAATAAAGATTTAAACAACTATCCGGTTAGTTTAAATTTTTATACAATCTTTTCGCTGTCTTGGATTTTTGCATGGCAGTACTTCATTAAAACAAAAAATATTCCTGAGCTCCACAAGCAAACCTCAATCAAATGGTGGAAAATCTT ...(((...)))(((((((.((((((((.((((((((((.((.((...((((((((((((.(((......))).))))..............((((.((((..((((((((((((((((((....)))).)))))))))))))).)))).)))).((((((.((.(....).)).))))))...............))))))))..)))).)))).))).))).))).)))))..)))))))...... .-58.0 20036 20250 TTGGTGGGATTTCTTTGGACCTACAAAAGATATTTTTCCCCCCGAAGTACTGGAGGGATTCAAACTTTTTTCAAAAAATTGGAATAAAGATTTAAACAACTATCCGGTTAGTTTAAATTTTTATACAATCTTTTCGCTGTCTTGGATTTTTGCATGGCAGTACTTCATTAAAACAAAAAATATTCCTGAGCTCCACAAGCAAACCTCAATCAAAT ((((((((.((((((((((.((.((...((((((((((((.(((......))).))))..............((((.((((..((((((((((((((((((....)))).)))))))))))))).)))).)))).((((((.((.(....).)).))))))...............))))))))..)))).)))).))).))).))).))))).. 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Lja-miRN1811 14997 15017 TGAGTTTAGTGCCCTTCTATC Lja-miRN1811* 15080 15100 TAGGAGGGCAATAGGCTTCAA 3 Lja-MIRN1812 PmiREN010896 MIRN1812 Lotus japonicus Lja-BABK02036825.1 11222 11350 + GAAGGGGAAAACCTTCAGTAACCCTCAGAGGCTTCCATAGCACCAAGTTGCGTCAAGTTATAAGTAAAATGACTAGAGACGTGGAGTTGTGGAAACCTTTTGGGGGGCCACTGAAGTTTTTAATCCTGT ..(.(((((((.(((((((..((((((((((.(((((((((.((.....(((((.((((((.......))))))...))))))).))))))))).)).))))))))...))))))).)))...)))).) 11242 11330 ACCCTCAGAGGCTTCCATAGCACCAAGTTGCGTCAAGTTATAAGTAAAATGACTAGAGACGTGGAGTTGTGGAAACCTTTTGGGGGGCC .((((((((((.(((((((((.((.....(((((.((((((.......))))))...))))))).))))))))).)).))))))))... 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Lja-miRN1818 26658 26679 TTTTTTTCCACACATCATCTAA Lja-miRN1818* 26720 26740 AGAGTTGTGTGGAAAGAAAGA 3 Lja-MIRN1819 PmiREN010915 MIRN1819 Lotus japonicus Lja-BABK02042782.1 139554 139683 - AGATTTGTGTATTTTATTTATCTTTCAGGCTGCTTGCGTTTGAAGATTAGTGGTGGTGGTTAGAAACTTCCCCCATCACAAATTTTTGAAATGCAGCTGCCTTTTAGATAAGTGTTTACATGAATCTCAC (((((((((((...(((((((((...((((.(((.(((((((((((((.(((((((.((..((...))..))))))))).))))))).))))))))).))))...)))))))))..)))))))))))... 139574 139663 TCTTTCAGGCTGCTTGCGTTTGAAGATTAGTGGTGGTGGTTAGAAACTTCCCCCATCACAAATTTTTGAAATGCAGCTGCCTTTTAGATA (((...((((.(((.(((((((((((((.(((((((.((..((...))..))))))))).))))))).))))))))).))))...))).. 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Lja-miRN1821a 5475 5494 GCTATGAGATCTGAGGGCTT Lja-miRN1821a* 5593 5613 TGCCCTCATAGCTTTTAGTTT 3 Lja-MIRN1821b PmiREN010949 MIRN1821 Lotus japonicus Lja-BABK02043142.1 48613 48791 - TCCTGTGTGATTTGTTCTAAGCTATGAGATCTGAGGGCTTTTTCTGGTTATTACCTCGTTTCAATGATTTTAATTGTGTTCTCGTTGAATCGTTTCAGTTCCCTATTTGCTGTTTTGTATTACTGAAATTTTCTTGCTTGCCCTCATAGCTTTTAGTTTTACTCCAGTATTGAAACAGG ..................((((((.(((...(((((((.......(((....))).((.((((((((..............)))))))).))(((((((........(((......)))..)))))))...........)))))))...))).))))))(((....))).......... 48633 48771 GCTATGAGATCTGAGGGCTTTTTCTGGTTATTACCTCGTTTCAATGATTTTAATTGTGTTCTCGTTGAATCGTTTCAGTTCCCTATTTGCTGTTTTGTATTACTGAAATTTTCTTGCTTGCCCTCATAGCTTTTAGTTT ((((.(((...(((((((.......(((....))).((.((((((((..............)))))))).))(((((((........(((......)))..)))))))...........)))))))...))).)))).. 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Lja-miRN1823 109 129 CATGAGGGGTAGAAACATCGG Lja-miRN1823* 265 285 GATGTTATTTACACTCATAAT 3 Lja-MIRN1824a PmiREN010942 MIRN1824 Lotus japonicus Lja-BABK02003012.1 16875 17105 + TTTGGATTTGTGTTTCTGAGAATTTCTCTGTCAAAAGGATTTTGTGTTCCATTATAGAATCTATTACAAAGGAAAAGGTTGATGCCTTGAACTTAAATGTAATAGAAGGAAAAGTCCAAGAATTGTTGCAAAGTAACAGATATTTGCTGATTTTAGATGATGTGTGGAAACAAAATCAAGAATTGAAGTTCGGATTAAGCCAAGACAAATGGAACAAGTTAAAATCTGTAT .................((((...)))).....(..(((((((((((((((((......((((((((((((...(((((....)))))...)))...))))))))).((...(((((......((((((...))))))((..(((...((((((.(((..(((......)))..))).)))))))))..)))))))...))......)))))))))...))))))))...) 16895 17085 GATTTTGTGTTCCATTATAGAATCTATTACAAAGGAAAAGGTTGATGCCTTGAACTTAAATGTAATAGAAGGAAAAGTCCAAGAATTGTTGCAAAGTAACAGATATTTGCTGATTTTAGATGATGTGTGGAAACAAAATCAAGAATTGAAGTTCGGATTAAGCCAAGACAAATGGAACAAGTTAAAATCTG ((((((((((((((((......((((((((((((...(((((....)))))...)))...))))))))).((...(((((......((((((...))))))((..(((...((((((.(((..(((......)))..))).)))))))))..)))))))...))......)))))))))...)))))))). Lja-miRN1824a 17064 17085 AAATGGAACAAGTTAAAATCTG Lja-miRN1824a* 16895 16915 GATTTTGTGTTCCATTATAGA 3 Lja-MIRN1824b PmiREN010966 MIRN1824 Lotus japonicus Lja-BABK02038712.1 3641 3871 + TTTGGATTTGTGTTTCTGAGAATTTCTCTGTCAAAAGGATTTTGTGTTCCATTATAGAATCTATTACAAAGGAAAAGGTTGATGCCTTGAACTTAAATGTAATAGAAGGAAAAGTCCAAGAATTGTTGCAAAGTAACAGATATTTGCTGATTTTAGATGATGTGTGGAAACAAAATCAAGAATTGAAGTTCGGATTAAGCCAAGACAAATGGAACAAGTTAAAATCTGTAT .................((((...)))).....(..(((((((((((((((((......((((((((((((...(((((....)))))...)))...))))))))).((...(((((......((((((...))))))((..(((...((((((.(((..(((......)))..))).)))))))))..)))))))...))......)))))))))...))))))))...) 3661 3851 GATTTTGTGTTCCATTATAGAATCTATTACAAAGGAAAAGGTTGATGCCTTGAACTTAAATGTAATAGAAGGAAAAGTCCAAGAATTGTTGCAAAGTAACAGATATTTGCTGATTTTAGATGATGTGTGGAAACAAAATCAAGAATTGAAGTTCGGATTAAGCCAAGACAAATGGAACAAGTTAAAATCTG ((((((((((((((((......((((((((((((...(((((....)))))...)))...))))))))).((...(((((......((((((...))))))((..(((...((((((.(((..(((......)))..))).)))))))))..)))))))...))......)))))))))...)))))))). Lja-miRN1824b 3830 3851 AAATGGAACAAGTTAAAATCTG Lja-miRN1824b* 3661 3681 GATTTTGTGTTCCATTATAGA 3 Lja-MIRN1825a PmiREN010953 MIRN1825 Lotus japonicus Lja-BABK02032739.1 2778 3029 - TATCATTTCATGTTGTTATCTTGTTCATATATCATATCGTATCATGACCACTGGGCCCGTTTGGTGGACAAGATAAACAGACATGATGAGATAGCAGTAATCATATCTTGTTGTAATTTGTTGTTTGTTGTGTCAGCAGGATAAGATAACATTATCATGTCTCTTATCGCATCATGTCTAAGGACCGTTTGGTGGTCAGAATAAGATATGATATGTGAACAGGATAGCAACAGGATATGACATGATATGT ((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.(((..((((((((((((..((((..((((((.(((((..(((((((((((.......((.(((.((((((((((..((............))..)))))))))).))).)).))))))))))).)))))......)))))).)))).))))))))))))..))).)))))))))))))))))))))))))))).....))).))))))... . 2798 3009 TATCTTGTTCATATATCATATCGTATCATGACCACTGGGCCCGTTTGGTGGACAAGATAAACAGACATGATGAGATAGCAGTAATCATATCTTGTTGTAATTTGTTGTTTGTTGTGTCAGCAGGATAAGATAACATTATCATGTCTCTTATCGCATCATGTCTAAGGACCGTTTGGTGGTCAGAATAAGATATGATATGTGAACAGGATAGC ((((((((((((((((((((((.(((..((((((((((((..((((..((((((.(((((..(((((((((((.......((.(((.((((((((((..((............))..)))))))))).))).)).))))))))))).)))))......)))))).)))).))))))))))))..))).)))))))))))))))))))))).. Lja-miRN1825a 2798 2819 TATGATATGTGAACAGGATAGC Lja-miRN1825a* 2989 3009 TATCTTGTTCATATATCATAT 3 Lja-MIRN1825b PmiREN010978 MIRN1825 Lotus japonicus Lja-BABK02041928.1 294 496 - GGGTGATGTTGAGGCACAGCTGAGTCCTGTTCTCACAAATCTTGATAAGAGATGGGTTTGTTTGAGATCCTATGTTGTCAATGCAGGTTTTTGTTTTTTTTCCATTTTGCTTCGATCTATAAATTAAAGAGCTTAGGGCACGTTTGGTAGTCAGGATAGGATATGATATGTGAACAGGATAGCAACATGATAGGATAAGAGCA ......(((....)))..(((..(((((((..(((((.((((((((((.(...((((((.....))))))..).))))))).......(((((((((....(((...(((((...(((.........))).....)))))....))).....)))))))))...))).))))))))))))))).................... 314 476 TGAGTCCTGTTCTCACAAATCTTGATAAGAGATGGGTTTGTTTGAGATCCTATGTTGTCAATGCAGGTTTTTGTTTTTTTTCCATTTTGCTTCGATCTATAAATTAAAGAGCTTAGGGCACGTTTGGTAGTCAGGATAGGATATGATATGTGAACAGGATAGC (..(((((((..(((((.((((((((((.(...((((((.....))))))..).))))))).......(((((((((....(((...(((((...(((.........))).....)))))....))).....)))))))))...))).))))))))))))).. Lja-miRN1825b 314 335 TATGATATGTGAACAGGATAGC Lja-miRN1825b* 456 476 TGAGTCCTGTTCTCACAAATC 3 Lja-MIRN1825c PmiREN011026 MIRN1825 Lotus japonicus Lja-BABK02038145.1 77160 77320 + TTTTGTGCCACAAAATATGTTAATTTTAAGTACACGTGAATGTCCATGAGCTGTTTCTGTCTTTTTACGTAAAACGTAGGATAACGATTACTTGGTGGTCAGGATAGGATATGATAGGATATGATATGTGAACAGGATAGCAACAGGATATGATAAGAGCA .............................((.((((((.((((((((.(.....((((((((((((((((...))))))))....((((((...)))))).))))))))..).)).))))))..)))))).))............................ 77180 77300 TAATTTTAAGTACACGTGAATGTCCATGAGCTGTTTCTGTCTTTTTACGTAAAACGTAGGATAACGATTACTTGGTGGTCAGGATAGGATATGATAGGATATGATATGTGAACAGGATAGC .........((.((((((.((((((((.(.....((((((((((((((((...))))))))....((((((...)))))).))))))))..).)).))))))..)))))).))........ Lja-miRN1825c 77279 77300 TATGATATGTGAACAGGATAGC Lja-miRN1825c* 77180 77200 TAATTTTAAGTACACGTGAAT 3 Lja-MIRN1826 PmiREN010955 MIRN1826 Lotus japonicus Lja-BABK02034925.1 11412 11608 + ATGTGTGTCTCACGTGACTTTCTTCAGAGAGATTGATGATTGGACAAGTCACATACTTCTCACGTGACTCTAAAATGCTTTAACGGTTGTGAAATTGCAAACCTTAATTAGACCTTATCACCTCTTTTAGAGTCACGTGAGAAGCATGTAACTTGTCCAGTCATCAAACTCTCTGAAGAAAGTCACGTGAGACACGC ..(((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((.((((((((((((((((((((....((((.((((((......)).)))))))).................)))))))))))))))))))).)))).))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))) 11432 11588 TTCAGAGAGATTGATGATTGGACAAGTCACATACTTCTCACGTGACTCTAAAATGCTTTAACGGTTGTGAAATTGCAAACCTTAATTAGACCTTATCACCTCTTTTAGAGTCACGTGAGAAGCATGTAACTTGTCCAGTCATCAAACTCTCTGAAGA (((((((((.(((((((((((((((((.((((.((((((((((((((((((((....((((.((((((......)).)))))))).................)))))))))))))))))))).)))).))))))))))))))))).))))))))))) Lja-miRN1826 11432 11453 TTCAGAGAGATTGATGATTGGA Lja-miRN1826* 11568 11588 AGTCATCAAACTCTCTGAAGA 3 Lja-MIRN1827 PmiREN010957 MIRN1827 Lotus japonicus Lja-BABK02035854.1 37514 37598 - AGCCGTGGAGTGTACTCGGTGTGATACACGATGGTTGGACTTGGAGGCTACGGTTGAGGCTTGAGAGGTGGTGTATTAGTGGCTG ((((.(.((((.((.(((.((((...)))).))).)).)))).).)))).................................... 37534 37578 CGTGGAGTGTACTCGGTGTGATACACGATGGTTGGACTTGGAGGC (.(.((((.((.(((.((((...)))).))).)).)))).).).. Lja-miRN1827 37534 37555 CACGATGGTTGGACTTGGAGGC Lja-miRN1827* 37558 37578 CGTGGAGTGTACTCGGTGTGA 3 Lja-MIRN1828 PmiREN010959 MIRN1828 Lotus japonicus Lja-BABK02044464.1 175932 176019 + TTACTAAATAGAAAGTTTTCTCGCTTGTTGGGGAAAGTCCAGTTTTTGGCCTTCTCTTGCAGGTGACGACGACGTCGAGTTGGCGGCG ..........((..(((.((((((((((.((((((.(.(((.....)))).)))))).)))))))).)).))).))............ 175952 175999 TCGCTTGTTGGGGAAAGTCCAGTTTTTGGCCTTCTCTTGCAGGTGACG ((((((((.((((((.(.(((.....)))).)))))).)))))))).. 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Lja-miRN1829 16331 16352 TTCTGGAGAGATTTGTATGAAG Lja-miRN1829* 16176 16196 TGATATAAATCTAGCCATGGT 3 Lja-MIRN1830a PmiREN010962 MIRN1830 Lotus japonicus Lja-BABK02038222.1 13908 14015 - GGTAGCTCAGGGATTTCAGCTGAATGATCAAGGACCTGAATGTAAGAATAGAAGAAATGTATTAGTTATGGGACCTTGATCATTCGGTTATGCGAGTTGCGGCAAACA .................((((((((((((((((.(((....((((.((((.(.....).))))..))))))).))))))))))))))))................... 13928 13995 TGAATGATCAAGGACCTGAATGTAAGAATAGAAGAAATGTATTAGTTATGGGACCTTGATCATTCGGT (((((((((((((.(((....((((.((((.(.....).))))..))))))).))))))))))))).. Lja-miRN1830a 13974 13995 TGAATGATCAAGGACCTGAATG Lja-miRN1830a* 13928 13948 ATGGGACCTTGATCATTCGGT 3 Lja-MIRN1830b PmiREN010963 MIRN1830 Lotus japonicus Lja-BABK02038225.1 6009 6116 - GGTAGCTCAGGGATTTCAGCTGAATGATCAAGGACCTGAATGTAAGAATAGAAGAAATGTATTAGTTATGGGACCTTGATCATTCGGTTATGCGAGTTGCGGCAAACA .................((((((((((((((((.(((....((((.((((.(.....).))))..))))))).))))))))))))))))................... 6029 6096 TGAATGATCAAGGACCTGAATGTAAGAATAGAAGAAATGTATTAGTTATGGGACCTTGATCATTCGGT (((((((((((((.(((....((((.((((.(.....).))))..))))))).))))))))))))).. Lja-miRN1830b 6075 6096 TGAATGATCAAGGACCTGAATG Lja-miRN1830b* 6029 6049 ATGGGACCTTGATCATTCGGT 3 Lja-MIRN1831 PmiREN011008 MIRN1831 Lotus japonicus Lja-BABK02014290.1 803 1013 + TAAACTCTCTATCCAAACTCTGATTTACAAAGTTCAGAGCAAACCTCAATTATTGTAATCTACTGTAGCAACAGTAAAACTTTTTACTGTAGCAAATAGTACCCGTCAAATAGTACCGACCACCGGAACTATTCAAAACAGTGCTCAAATTTTTTCTTTAAATAGGCTTCTTCTGAGCTTTGTTAGGCAGAGTTTGGATAGAGAGTTTAGA ....................((....(((((((((((((.((.(((....(((.(((...))).)))((.((((((((....)))))))).))....(((((......((((((.(((.....))).)))))).......)))))..................))).)).)))))))))))))....))...................... 823 993 TGATTTACAAAGTTCAGAGCAAACCTCAATTATTGTAATCTACTGTAGCAACAGTAAAACTTTTTACTGTAGCAAATAGTACCCGTCAAATAGTACCGACCACCGGAACTATTCAAAACAGTGCTCAAATTTTTTCTTTAAATAGGCTTCTTCTGAGCTTTGTTAGGCAGA ((....(((((((((((((.((.(((....(((.(((...))).)))((.((((((((....)))))))).))....(((((......((((((.(((.....))).)))))).......)))))..................))).)).)))))))))))))....)).. 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