miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Gar-MIR156a PmiREN007809 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 123713274 123713404 - GGGTTTTAGGGTAAGGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGGGTTCTTTCTTGCATGCTTGAGCCTTTCATGCTTGAAGCTCTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCATCCACTTCTCTCTCTCTCTCTC ..(....((((..(((((((((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((((...........)))))..))))))))).))))))))))))).)))))))))....)))))..))))....) 123713294 123713384 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGGGTTCTTTCTTGCATGCTTGAGCCTTTCATGCTTGAAGCTCTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCATC ((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((((...........)))))..))))))))).))))))))))))).))))))).. Gar-miR156a 123713365 123713384 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Gar-miR156a* 123713294 123713314 GCTCACTCTCTATCTGTCATC 3 Gar-MIR156b PmiREN007810 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 49371802 49371923 - CATTCATGGAACATAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACATGTATAAGCCTATACTTTTGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGCTTCCAGTGCCGGAATTTGAT ...............(((.(((((((((((((((((((((.((((((((...(((((....)))))...)))))))).)))))))).)))).))))))))).)))................. 49371822 49371903 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACATGTATAAGCCTATACTTTTGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGC ((((((((((((((((((((.((((((((...(((((....)))))...)))))))).)))))))).)))).)))))))).. Gar-miR156b 49371884 49371903 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Gar-miR156b* 49371822 49371842 CTCACTTCTCTTTCTGTCAGC 3 Gar-MIR156c PmiREN007811 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 48483274 48483398 - TTAGAGAGGAAGGAGAGGTCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCAGGCAGATTGTATGAAAGGCCATACCTTTGCCCGCCGTGTGCTCACTTCTCTTCTGTCAGCTTAACAATTCACTCTTTTCA ..................((((((((((((((((((((((((((.((((((..(((((......))))).)))))).).))))))))))).)))))))))))))....................) 48483294 48483378 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCAGGCAGATTGTATGAAAGGCCATACCTTTGCCCGCCGTGTGCTCACTTCTCTTCTGTCAGC ((((((((((((((((((((((((.((((((..(((((......))))).)))))).).))))))))))).)))))))))))).. Gar-miR156c 48483359 48483378 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Gar-miR156c* 48483294 48483314 GCTCACTTCTCTTCTGTCAGC 3 Gar-MIR156d PmiREN007812 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 33391182 33391303 + CTTCTTTGGGACATAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCACTTGTATAAGGCTATACTTCTGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGTTTCCAGTGCCGGAATTTGAT ...............(((((((((((((((((((((((((.((((((((...(((((....)))))...)))))))).)))))))).)))).)))))))))))))................. 33391202 33391283 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCACTTGTATAAGGCTATACTTCTGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGT ((((((((((((((((((((.((((((((...(((((....)))))...)))))))).)))))))).)))).)))))))).. Gar-miR156d 33391202 33391221 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Gar-miR156d* 33391263 33391283 CTCACTTCTCTTTCTGTCAGT 3 Gar-MIR156e PmiREN007813 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 34046051 34046180 + AGAGGTTTTTAGGGTAACGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGGGTGTTTTCTTGCATGCTTGGGCTTTCATGCTTGAAGCTTTGAGTGCTCACTCTCTATCTGTCATCCACTTCTCTCTCTCTTT ....(.....((((....(..((((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((((..........)))))..))))))))).))))))))))))).)))))))))..)....)))).....) 34046071 34046160 TGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGGGTGTTTTCTTGCATGCTTGGGCTTTCATGCTTGAAGCTTTGAGTGCTCACTCTCTATCTGTCATC ((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((((..........)))))..))))))))).))))))))))))).))))))))) Gar-miR156e 34046071 34046090 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Gar-miR156e* 34046140 34046160 GCTCACTCTCTATCTGTCATC 3 Gar-MIR156f PmiREN007814 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 268809 268931 + CTTCTTTGGGACAGAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGTATTTGTATAAAGCTTATACTAATGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCCGTCAGCTTCCAGTGCCGGGAGTTGAT ...................(((((.(((((((((((((((.((((((((((.((((((...)))))).)))))))))).)))))))).)))))))..)))))..................... 268829 268911 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGTATTTGTATAAAGCTTATACTAATGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCCGTCAGC ((((.(((((((((((((((.((((((((((.((((((...)))))).)))))))))).)))))))).)))))))..)))).. Gar-miR156f 268829 268848 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Gar-miR156f* 268891 268911 CTCACTTCTCTTTCCGTCAGC 3 Gar-MIR156g PmiREN007815 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 48610889 48611011 + CAATGAGAACAAAGAGAGATTGACAGAAGAGAGTGAGCACTCACAGGCAATTGTATGCAAAAGGCATACCTTTTCCGTGGTTGCTTACTTCTCTTCTGTCGGCTATTTTCTTCTTCATCATCA ..(((((((..(((((((.((((((((((((((((((((.((((.((.((..((((((.....))))))..)).)))))).))))))).)))))))))))))...))))))).))).)))).. 48610909 48610991 TGACAGAAGAGAGTGAGCACTCACAGGCAATTGTATGCAAAAGGCATACCTTTTCCGTGGTTGCTTACTTCTCTTCTGTCGGC (((((((((((((((((((.((((.((.((..((((((.....))))))..)).)))))).))))))).)))))))))))).. Gar-miR156g 48610909 48610928 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Gar-miR156g* 48610971 48610991 GCTTACTTCTCTTCTGTCGGC 3 Gar-MIR156h PmiREN007816 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 49021850 49021972 + CTTCTTTGGGACAGAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGTATTTGTATAAAGCTTATACTAATGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCCGTCAGCTTCCAGTGCCGGGAGTTGAT ...................(((((.(((((((((((((((.((((((((((.((((((...)))))).)))))))))).)))))))).)))))))..)))))..................... 49021870 49021952 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGTATTTGTATAAAGCTTATACTAATGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCCGTCAGC ((((.(((((((((((((((.((((((((((.((((((...)))))).)))))))))).)))))))).)))))))..)))).. Gar-miR156h 49021870 49021889 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Gar-miR156h* 49021932 49021952 CTCACTTCTCTTTCCGTCAGC 3 Gar-MIR156i PmiREN007817 MIR156 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 126569248 126569374 - TATATAGATATATATATATGTTGACAGAAGAGAGAGAGCACAAGCCAGGATCTGCAAAAAGAGTGTTTGCTTTTGTTGGAAGTGTGCTTTCTCTTCTTCTGTCACCATTTCTCTAACTCTATCATAT ((((((((.........(((.(((((((((((((((((((((..((((.(...(((((.......)))))...).))))...))))))))))).)))))))))).))).........))))).))). 126569268 126569354 TTGACAGAAGAGAGAGAGCACAAGCCAGGATCTGCAAAAAGAGTGTTTGCTTTTGTTGGAAGTGTGCTTTCTCTTCTTCTGTCACCA .(((((((((((((((((((((..((((.(...(((((.......)))))...).))))...))))))))))).))))))))))... Gar-miR156i 126569334 126569354 TTGACAGAAGAGAGAGAGCAC Gar-miR156i* 126569268 126569288 CTTTCTCTTCTTCTGTCACCA 3 Gar-MIR157a PmiREN007818 MIR157 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 84474402 84474525 - CTAAGAAAATGGTGATGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGCATGCATGTAGTCTTTGCATTTCACTCCTTTGTGCTCTTTATTTTCTGTCATCACACCTTTCATCCTCTTAATT .(((((..((((.(.(((.(.(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.........))))).))).)).))))))))))))))))))))))).)))).)..))))..)))))... 84474422 84474505 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGCATGCATGTAGTCTTTGCATTTCACTCCTTTGTGCTCTTTATTTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.........))))).))).)).)))))))))))))))))))))))... Gar-miR157a 84474485 84474505 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Gar-miR157a* 84474422 84474442 GCTCTTTATTTTCTGTCATCA 3 Gar-MIR157b PmiREN007819 MIR157 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 120168504 120168628 + GGAGGCACTGGTGATTGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTGTTGCATATGTGCATGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCATCACCTGTCATCATCACATT .........(((((....((.(((((((((((((((((((((((.(((((.(.(((((......))))).)))).)).)))))))))))))).))))))))).)))))))............... 120168524 120168608 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTGTTGCATATGTGCATGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.(((((.(.(((((......))))).)))).)).)))))))))))))).)))))))))... Gar-miR157b 120168524 120168544 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Gar-miR157b* 120168588 120168608 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Gar-MIR157c PmiREN007820 MIR157 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 97612086 97612210 - GGAGGCAGTGGTGAATGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTTTGCAAGTACTTAATGCATTCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCATCACCTTCAGCCCCTCTTAC ((.(((...(((((....((.(((((((((((((((((((((((.(((((..((((.........))))..))).)).)))))))))))))).))))))))).)))))))....)))))...... 97612106 97612190 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTTTGCAAGTACTTAATGCATTCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.(((((..((((.........))))..))).)).)))))))))))))).)))))))))... Gar-miR157c 97612170 97612190 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Gar-miR157c* 97612106 97612126 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Gar-MIR157d PmiREN007821 MIR157 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 68335500 68335634 + GAGGCAACAGGTGATTGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTGTGCAATTAGGAGTCTTGAAGCAATGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTCAAGCCACTCTTACCT ..(((...((((((.......(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.(((((...))))).....))))).))).)).)))))))))))))).)))))))))))))))....))).......... 68335520 68335614 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTGTGCAATTAGGAGTCTTGAAGCAATGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.(((((...))))).....))))).))).)).)))))))))))))).)))))))))... Gar-miR157d 68335520 68335540 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Gar-miR157d* 68335594 68335614 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Gar-MIR159 PmiREN007822 MIR159 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 62320918 62321123 - AGGTGGGGGGGTTAGGAATGGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGTTCTTGCTGGGTATATTGAGCTGCTTGGCTATGGATCCCACAGTCCTATCCCATGTTGGGAGGGATAGGCTTGCGGCTTCCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTAAAAGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTTCTCCTTTCTCACT .((((((((((..(((..(((((((((((..(((((((..((((.(((.((((((((....(((((.((.((.((((((..((.(((.((((((((.........)))))))).))).))..)))))).)).)).)))))...)))))....))).))).))))..)))))))..)))))))))))..)))..))))...)))))) 62320938 62321103 GAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGTTCTTGCTGGGTATATTGAGCTGCTTGGCTATGGATCCCACAGTCCTATCCCATGTTGGGAGGGATAGGCTTGCGGCTTCCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTAAAAGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((..(((((((..((((.(((.((((((((....(((((.((.((.((((((..((.(((.((((((((.........)))))))).))).))..)))))).)).)).)))))...)))))....))).))).))))..)))))))..))))))))).. Gar-miR159 62320938 62320958 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Gar-miR159* 62321083 62321103 GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG 3 Gar-MIR160a PmiREN007823 MIR160 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 115744689 115744823 - ATGAAACAATGGAAATGATCTGCCTGGCTCCCTGAATGCCAACTATGAATGGTGTCAAATAAGCGGTGTTGTGTTGTTGGCCCTTTCCTAGTTGGCATCAGAGGACTCAGGCAGGTCTATCCTTTTTATCATCTT ((((......(((...(((((((((((.(((((((.(((((((((.(((.((.(((((....(((....)))....))))))).))).))))))))))))).))).)))))))))))..)))......))))... 115744709 115744803 TGCCTGGCTCCCTGAATGCCAACTATGAATGGTGTCAAATAAGCGGTGTTGTGTTGTTGGCCCTTTCCTAGTTGGCATCAGAGGACTCAGGCAGG (((((((.(((((((.(((((((((.(((.((.(((((....(((....)))....))))))).))).))))))))))))).))).))))))).. Gar-miR160a 115744783 115744803 TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA Gar-miR160a* 115744709 115744729 GCATCAGAGGACTCAGGCAGG 3 Gar-MIR160b PmiREN007824 MIR160 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 91335295 91335415 - CCATGTATATATCATGTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATCCGCAGAACCTATCGAACAACGATGGCATCTGTGAATGGCGTATGAGGAGTCAAGCATATATTTCTACATATATATCTC ..((((((((.....((((((((.(((((((.((((((((((.((((((..((((((.....))))))..)))))).)))))))))).))))))).))))))))......))))))))... 91335315 91335395 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATCCGCAGAACCTATCGAACAACGATGGCATCTGTGAATGGCGTATGAGGAGTCAAGCATA (((.(((((((.((((((((((.((((((..((((((.....))))))..)))))).)))))))))).))))))).))).. Gar-miR160b 91335375 91335395 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Gar-miR160b* 91335315 91335335 GCGTATGAGGAGTCAAGCATA 3 Gar-MIR160c PmiREN007825 MIR160 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 107082611 107082731 + ATGACATCCATGTATGTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGCCCATTGAACTTCGATAGCCTCCGTGAATGGCGTATGAGGAGCCATGCATGTATTCTATGTATTTCATATT (((.....)))....((((((((.(((((((.((((((((((((((.(((.(.(((((...))))).).))).)))))))))))))).))))))).))))))))................. 107082631 107082711 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGCCCATTGAACTTCGATAGCCTCCGTGAATGGCGTATGAGGAGCCATGCATG (((.(((((((.((((((((((((((.(((.(.(((((...))))).).))).)))))))))))))).))))))).))).. Gar-miR160c 107082631 107082651 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Gar-miR160c* 107082691 107082711 GCGTATGAGGAGCCATGCATG 3 Gar-MIR160d PmiREN007826 MIR160 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 109732275 109732396 + AATTAAATGCATATTTTGCATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAAAGCTCATCAAGAGTCTGGTGGCCTTGGCGTATGGCGTGCGAGGAGCCATGCATGCATACTGATGTCTTAATCAG ................(((((((.(((((((.((((((((((.(((.(((.((((((......)))))).))).))).)))))))))).))))))).)))))))..(((((......))))) 109732295 109732376 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAAAGCTCATCAAGAGTCTGGTGGCCTTGGCGTATGGCGTGCGAGGAGCCATGCATG (((.(((((((.((((((((((.(((.(((.((((((......)))))).))).))).)))))))))).))))))).))).. Gar-miR160d 109732295 109732315 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Gar-miR160d* 109732356 109732376 GCGTGCGAGGAGCCATGCATG 3 Gar-MIR160e PmiREN007827 MIR160 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 21490005 21490129 + TGTGGATTGGTTGGTGAATCTGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCTAAGAAGCTTTGTCAAGCACGGTTGGCTGCCTTCTTACATGGCATGAGGGGAGTCATGCAGGTTTAACTGTTTCATATCTTC ............(((((((((((.(((((((((..(((((((.(((((((....(((((......)))))...))))))).)))))))..))))))))).)))))))).)))............. 21490025 21490109 TGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCTAAGAAGCTTTGTCAAGCACGGTTGGCTGCCTTCTTACATGGCATGAGGGGAGTCATGCAGG (((.(((((((((..(((((((.(((((((....(((((......)))))...))))))).)))))))..))))))))).))).. Gar-miR160e 21490025 21490045 TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA Gar-miR160e* 21490089 21490109 GCATGAGGGGAGTCATGCAGG 3 Gar-MIR160f PmiREN007828 MIR160 Gossypium arboreum Gar-NC_030675.1 94794098 94794218 - ATGGCACACATATATGTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAACCCATCGAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATATTCCATGTATGTATATAC .......((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((.((..(((((((...)))))))..)).)))))))))))))).))))))).)))))))...)))))))))...... 94794118 94794198 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAACCCATCGAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.((((((((((((((.((..(((((((...)))))))..)).)))))))))))))).))))))).))).. Gar-miR160f 94794178 94794198 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Gar-miR160f* 94794118 94794138 GCGTATGAGGAGCCAAGCATA 3 Gar-MIR160g PmiREN007829 MIR160 Gossypium arboreum Gar-NW_016624415.1 127169 127289 + CCATGTGTGTATAATGTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATCCGCAGAACCTATCGAACAACGATGGCATTTGTGAATGGCGTATGAGGAGTCAAGCATATATTTCTACATATATATATC ..(((((((((....((((((((.(((((((.((((((((((.((((((..((((((.....))))))..)))))).)))))))))).))))))).))))))))...)))))))))..... 127189 127269 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATCCGCAGAACCTATCGAACAACGATGGCATTTGTGAATGGCGTATGAGGAGTCAAGCATA (((.(((((((.((((((((((.((((((..((((((.....))))))..)))))).)))))))))).))))))).))).. Gar-miR160g 127189 127209 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Gar-miR160g* 127249 127269 GCGTATGAGGAGTCAAGCATA 3 Gar-MIR162 PmiREN007830 MIR162 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 40339397 40339525 - AAAAAAGGGGTAAAGACACTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAGAATTTTGTTGTGAGAATAACACAAATACATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCCTTAACTCTCTTTTATT (.(((((((((.(((.(.(((((.((((.((((.(((((((..(((.((...((((((((((....)))))).)))).)).)))..))))))).)))).)))).))))).).))).)).))))))).). 40339417 40339505 GGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAGAATTTTGTTGTGAGAATAACACAAATACATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAG (((.((((.((((.(((((((..(((.((...((((((((((....)))))).)))).)).)))..))))))).)))).)))).))).. Gar-miR162 40339417 40339437 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Gar-miR162* 40339485 40339505 GGAGGCAGCGGTTCATCGATC 3 Gar-MIR164a PmiREN007831 MIR164 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 45892265 45892371 + TGGGGGTGAGTATCTCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAGTTCCTATGTTTAAGTGAACTTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCACCGTGAGTTTCTCATTCTGATT (.((((((((...(((.((.((((((((..((((((((((((((((((.......)).)))).))))))))))))..)))))))).)).)))...)))))))).).. 45892285 45892351 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAGTTCCTATGTTTAAGTGAACTTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCACC ((((((((..((((((((((((((((((.......)).)))).))))))))))))..)))))))).. Gar-miR164a 45892285 45892305 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Gar-miR164a* 45892331 45892351 CACGTGCTCCCCTTCTCCACC 3 Gar-MIR164b PmiREN007832 MIR164 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 27183005 27183139 - GCGGGTGCGAAGCTCCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAGAAAGTGCTTGAATTGGTGCCACATATATCATATGTATATATATCACCTTCTGCACGTGCTCCCTTTCTCCAACATGGGTTCCACACCTATTAC ..(((((.(.(((.((.(((((((((((..((((((((((((((............((((....((((((.....))))))....))))))))))))))))))..))))))))))).))))).).)))))..... 27183025 27183119 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAGAAAGTGCTTGAATTGGTGCCACATATATCATATGTATATATATCACCTTCTGCACGTGCTCCCTTTCTCCAAC ((((((((..((((((((((((((............((((....((((((.....))))))....))))))))))))))))))..)))))))).. Gar-miR164b 27183099 27183119 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Gar-miR164b* 27183025 27183045 CACGTGCTCCCTTTCTCCAAC 3 Gar-MIR164c PmiREN007833 MIR164 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 112342297 112342426 + GAGGGGTGAGTAGGTCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAGTTGTACATTCTATGTAAGCTTTGGTACATGTCAAAAATGAAATTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCACCATGAGTTCCTCACCTTTTTG ((((((((((.((.((.((.((((((((..(((((((((((((((...((((.((((((........)))))).....)))).)))))))))))))))..)))))))).)).)).)).)))))))))).. 112342317 112342406 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAGTTGTACATTCTATGTAAGCTTTGGTACATGTCAAAAATGAAATTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCACC ((((((((..(((((((((((((((...((((.((((((........)))))).....)))).)))))))))))))))..)))))))).. Gar-miR164c 112342317 112342337 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Gar-miR164c* 112342386 112342406 CACGTGCTCCCCTTCTCCACC 3 Gar-MIR164d PmiREN007834 MIR164 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 48000509 48000647 - AAGGGGTGAATAGGTCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAAGAGTGCCTTAATCCCCATTTGGCTTCAATACATATATATGTATGTGCGTTGTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCAACTGGGGTTACTCACCCTATCT ....................((((((((..((((((((((((..(((.(((.............))))))..(((((((....))))))).....))))))))))))..))))))))..((((((.....))))))... 48000529 48000627 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAAGAGTGCCTTAATCCCCATTTGGCTTCAATACATATATATGTATGTGCGTTGTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCAAC ((((((((..((((((((((((..(((.(((.............))))))..(((((((....))))))).....))))))))))))..)))))))).. Gar-miR164d 48000607 48000627 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Gar-miR164d* 48000529 48000549 CACGTGCTCCCCTTCTCCAAC 3 Gar-MIR164e PmiREN007835 MIR164 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 64743438 64743552 - GGAGAGAGGGTAAGCCATGCTGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCTATTAGGCAAAAATAGTCTTTTATTTTGCATGTGCCTTGGCTCTCCATCTTGGAAAGTCTCTCTTTATT ..............(((.(.((((((..((((((((((((.(((..((..((((.......))))..)).)))))))))))))))..)))))).).)))((((.....))))... 64743458 64743532 TGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCTATTAGGCAAAAATAGTCTTTTATTTTGCATGTGCCTTGGCTCTCCATC ((((((..((((((((((((.(((..((..((((.......))))..)).)))))))))))))))..)))))).. Gar-miR164e 64743512 64743532 TGGAGAAGCAGGGCACATGCT Gar-miR164e* 64743458 64743478 CATGTGCCTTGGCTCTCCATC 3 Gar-MIR164f PmiREN007836 MIR164 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 112980689 112980865 + AAGGTGTGTGTCGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATGCCTTGTGGCACTGCCAATGCCTGTTAAGCGTTTAATTACTTTCTACCTATGGCTTCACTTAGGCTGCAGTGAGTTAGTTCTTCATGTGCCCCTCTTCCCCATCATGACCACTGCACCTTGTGT ...............((.(((((.((((..(((((((((....(((((((((((((....))))((((....(((((..((((......................))))....))))).)))))))))))))....)))))))))..)))).))))).))................. 112980709 112980845 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATGCCTTGTGGCACTGCCAATGCCTGTTAAGCGTTTAATTACTTTCTACCTATGGCTTCACTTAGGCTGCAGTGAGTTAGTTCTTCATGTGCCCCTCTTCCCCATC (((.((((..(((((((((....(((((((((((((....))))((((....(((((..((((......................))))....))))).)))))))))))))....)))))))))..)))).))).. Gar-miR164f 112980709 112980729 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Gar-miR164f* 112980825 112980845 CATGTGCCCCTCTTCCCCATC 3 Gar-MIR164g PmiREN007837 MIR164 Gossypium arboreum Gar-NC_030675.1 97237833 97237945 + GTAGATGAGTAGCTCCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAAGTGTAGTTTCTCCTTATCTTTCACTTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCACCATGGGTTTTTCGTCCTTACT (((((((((.(((.((.((.((((((((..(((((((((((((.(((.((...........))..))))))))))))))))..)))))))).)).))))).))))))..))). 97237853 97237925 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAAGTGTAGTTTCTCCTTATCTTTCACTTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCACC ((((((((..(((((((((((((.(((.((...........))..))))))))))))))))..)))))))).. Gar-miR164g 97237853 97237873 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Gar-miR164g* 97237905 97237925 CACGTGCTCCCCTTCTCCACC 3 Gar-MIR166a PmiREN007838 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 18940688 18940854 - GCGGAGTAACCAATTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTTGTTTTTAATCCATTTCTTGCATTACAATTCATTTATGGATCTGATTATTGCTGTAATGGATTGAGGCTGTACAAGGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCTAATGCTTGCTCCTATATG ..................((((((((..((((((.((((.(((.(((((((((((((((((....(((.(((((((((....))))).))..)).)))...))))))))))))....)))))))).)))).))))))..)))))))).................... 18940708 18940834 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTTGTTTTTAATCCATTTCTTGCATTACAATTCATTTATGGATCTGATTATTGCTGTAATGGATTGAGGCTGTACAAGGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((.(((.(((((((((((((((((....(((.(((((((((....))))).))..)).)))...))))))))))))....)))))))).)))).))))))..)))))).. Gar-miR166a 18940708 18940728 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166a* 18940814 18940834 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Gar-MIR166b PmiREN007839 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 60951789 60951924 - TGAAGCGAAAGGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATTTAGGGTTCGTCTAATATCTATATATGCATACATACATAGCCCTATATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCATCAACCAAACACTTCCCCT .((((.(....((((((((((((((..((((((.((((.(((((.(((((............((((.((((....)))).))))))))).))))).)))).))))))..))))))))))))))...).)))).... 60951809 60951904 GAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATTTAGGGTTCGTCTAATATCTATATATGCATACATACATAGCCCTATATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCC (((((..((((((.((((.(((((.(((((............((((.((((....)))).))))))))).))))).)))).))))))..))))).. Gar-miR166b 60951809 60951828 TCGGACCAGGCTTCATTCCC Gar-miR166b* 60951884 60951904 GAATGTTGTTTGGCTCGAGGT 3 Gar-MIR166c PmiREN007840 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 64019868 64019985 - TGTAACATGAACTGTTGCGGGGAATGTTGTCTGGTTCGAAGTCATTCATATGAAACTTAATTGTCTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTTGGTTTAATAGCTA .............((((.((((((((..((((((((((((((((((((...((..........))...))))))))))))))))))))..)))))))).))))............... 64019888 64019965 GGAATGTTGTCTGGTTCGAAGTCATTCATATGAAACTTAATTGTCTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((((((((((((((((...((..........))...))))))))))))))))))))..)))))).. Gar-miR166c 64019888 64019908 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166c* 64019945 64019965 GGAATGTTGTCTGGTTCGAAG 3 Gar-MIR166d PmiREN007841 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 2061345 2061466 + ATTACAGGAAATCGTTGCGGGGAATGTTGTCTGGTTCGAAGTCATTCATGTGAATGTTTTAAACGACCTTTGTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTTTTGGTATAATACC .............((((.((((((((..(((((((((((((((((((((..(((.(((......))).))))))))))))))))))))))))..)))))))).))))....((((...)))) 2061365 2061446 GGAATGTTGTCTGGTTCGAAGTCATTCATGTGAATGTTTTAAACGACCTTTGTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(((((((((((((((((((((..(((.(((......))).))))))))))))))))))))))))..)))))).. Gar-miR166d 2061426 2061446 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166d* 2061365 2061385 GGAATGTTGTCTGGTTCGAAG 3 Gar-MIR166e PmiREN007842 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 68633344 68633525 + AATGGAGTTACTCTTTGAGGGGAATGTTGTCTGACCCGAGGATGCTTCTATGAATCCATTTTTCCTTGCATTTGATGATTCTTCTTATGGATCTGATTGTTGTTGTAATGGAGTAAGGGATTGAGGTTTGTACCAGCGCCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCCAATTGCTGCTCCTAAAT ...(((((......(((.((((((((..(((((..((((((.((((..((((((((((...((((((((.......(((((.......)))))(.((((......)))).).)))))))).)).))))))))..)))))).))))..)))))..))))))))..))).....)))))..... 68633364 68633505 GGAATGTTGTCTGACCCGAGGATGCTTCTATGAATCCATTTTTCCTTGCATTTGATGATTCTTCTTATGGATCTGATTGTTGTTGTAATGGAGTAAGGGATTGAGGTTTGTACCAGCGCCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(((((..((((((.((((..((((((((((...((((((((.......(((((.......)))))(.((((......)))).).)))))))).)).))))))))..)))))).))))..)))))..)))))).. Gar-miR166e 68633485 68633505 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166e* 68633364 68633384 GGAATGTTGTCTGACCCGAGG 3 Gar-MIR166f PmiREN007843 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 100845904 100846072 - GGAAGCCATTTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGCCATCAACTAGATCTATGGATTTTTTTTTCATATATCAAAGTTTGAGAGATGATGATGATTTAATCATTAATCATAGGTTAATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTTGCTTCCAATT ..............(((.((((((((..((((((.((((.(.(((.((((.(((.((((((.......)))))).)))......(((..((((((.........))))))..)))..)))).))).).)))).))))))..)))))))).)))................ 100845924 100846052 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGCCATCAACTAGATCTATGGATTTTTTTTTCATATATCAAAGTTTGAGAGATGATGATGATTTAATCATTAATCATAGGTTAATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((.(.(((.((((.(((.((((((.......)))))).)))......(((..((((((.........))))))..)))..)))).))).).)))).))))))..)))))).. Gar-miR166f 100845924 100845944 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166f* 100846032 100846052 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Gar-MIR166g PmiREN007844 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 63439595 63439733 - GAAGAAAAGAGGGTGTATGGAATGAAGTTTGATCCAAGATCCAAGATCCATCAATCATCTTTCTTTTCTAAGTCATGAATTACGATGATATTAATGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTCACACCATGCTTTTCCATT ...((((((..(((((..(((((((((((((.(((.(((((((.(((......((((((......(((........)))....)))))))))..))))))).))).)))))))))))))..)))))...)))))).... 63439615 63439713 AATGAAGTTTGATCCAAGATCCAAGATCCATCAATCATCTTTCTTTTCTAAGTCATGAATTACGATGATATTAATGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC (((((((((((.(((.(((((((.(((......((((((......(((........)))....)))))))))..))))))).))).))))))))))).. Gar-miR166g 63439615 63439635 TCTCGGACCAGGCTTCATTCC Gar-miR166g* 63439693 63439713 AATGAAGTTTGATCCAAGATC 3 Gar-MIR166h PmiREN007845 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 9072964 9073090 + GAAATGGGTTGTCTTTGAGAGGAATGTTGGCTGGCTCGATGCGACAGCTTTGAGATTGTAAAGTGTGATCAAAGTAAAAGGTATCATCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAACATTTTCATTTTTAA ((((((((.(((..(((((.((((((..(.((((.((((((..((.(((((((...............))))))).....))..)))))).)))).)..)))))).))))))))..))))))))... 9072984 9073070 GGAATGTTGGCTGGCTCGATGCGACAGCTTTGAGATTGTAAAGTGTGATCAAAGTAAAAGGTATCATCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(.((((.((((((..((.(((((((...............))))))).....))..)))))).)))).)..)))))).. Gar-miR166h 9073050 9073070 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166h* 9072984 9073004 GGAATGTTGGCTGGCTCGATG 3 Gar-MIR166i PmiREN007846 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 9073117 9073306 + ATTATGTAAAAGGAGAAACGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATATAGGTTGATCTTTTATATATAATTTCCATGAAATTTTCTTGGATTTATTTAAATTTTCCGGGAAAGTTTCTGGATATGTGTATATATATAGCCCTATATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTCAGCCAAACACT ..............(....((((((((((((((..((((((.((((((((((((((((((......((((((((...((((.((((((((((((((.............))))))))))))))))))))))))))......))).))))))))))))))).))))))..))))))))))))))......) 9073137 9073286 GGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATATAGGTTGATCTTTTATATATAATTTCCATGAAATTTTCTTGGATTTATTTAAATTTTCCGGGAAAGTTTCTGGATATGTGTATATATATAGCCCTATATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCG ((((((..((((((.((((((((((((((((((......((((((((...((((.((((((((((((((.............))))))))))))))))))))))))))......))).))))))))))))))).))))))..)))))))) Gar-miR166i 9073266 9073286 TCGGACCAGGCTTCATTCCCG Gar-miR166i* 9073137 9073157 GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG 3 Gar-MIR166j PmiREN007847 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 45938988 45939169 + AGGGAGCATTCATTCTGAGGGGAATGTTGTCTGGACCGGGGACACTTGTGTTTCTAATCCATTTTCCCTGCAATATTGTTCTGGCCATGGGGATCTTTATATTGCTTATTTTTGTAATGGATTAAGGTTGTACTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATCATTGCTCCCATATG .(((((((.......((.((((((((..((((((.((((.((((((.(((..(((((((((((......(((((((...(((........))).....)))))))..........)))))))).)))...))).)))))).)))).))))))..)))))))).)).....)))))))..... 45939008 45939149 GGAATGTTGTCTGGACCGGGGACACTTGTGTTTCTAATCCATTTTCCCTGCAATATTGTTCTGGCCATGGGGATCTTTATATTGCTTATTTTTGTAATGGATTAAGGTTGTACTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((.((((((.(((..(((((((((((......(((((((...(((........))).....)))))))..........)))))))).)))...))).)))))).)))).))))))..)))))).. Gar-miR166j 45939129 45939149 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166j* 45939008 45939028 GGAATGTTGTCTGGACCGGGG 3 Gar-MIR166k PmiREN007848 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 34684226 34684350 - TATGTCTTCAACAGTTGAGGGGAATGCTGTCTGGTTCGAGACCATTCGTTCCGAAGGTCTTGGAAGACTCGGATTCGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCTAACTCCGAATATTATTAC ............(((((.((((((((..(((((((((((((.((((((.(((((..((((....)))))))))..)))))).)))))))))))))..)))))))).))))).............. 34684246 34684330 GGAATGCTGTCTGGTTCGAGACCATTCGTTCCGAAGGTCTTGGAAGACTCGGATTCGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(((((((((((((.((((((.(((((..((((....)))))))))..)))))).)))))))))))))..)))))).. Gar-miR166k 34684246 34684266 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166k* 34684310 34684330 GGAATGCTGTCTGGTTCGAGA 3 Gar-MIR166l PmiREN007849 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 107558849 107558985 + GAAGAAAAGAGGGTGTAAGGAATGAAGTTTGATCCAAGATCAATCCCTCCGTAATGGTCTTTTCATCATTTTATAACTTGATGGTTCATGGATGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTCACGCCATGCTTTTCCTAA ...........(((((.((((((((((((((.(((.(((((.((((..((((((((((......))))))..........)))).....)))).))))).))).)))))))))))))).)))))............. 107558869 107558965 AATGAAGTTTGATCCAAGATCAATCCCTCCGTAATGGTCTTTTCATCATTTTATAACTTGATGGTTCATGGATGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC (((((((((((.(((.(((((.((((..((((((((((......))))))..........)))).....)))).))))).))).))))))))))).. Gar-miR166l 107558945 107558965 TCTCGGACCAGGCTTCATTCC Gar-miR166l* 107558869 107558889 AATGAAGTTTGATCCAAGATC 3 Gar-MIR166m PmiREN007850 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030675.1 121861500 121861616 - GAAAATGGTAGATTTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAAGCTTAAACAAATACAGCTTTGGTTTTGGTTTAAGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAAAATTTATGCATGTAT ............((((((((((((((..(.((((.((((((((((((((((..((....))..))).))))))))))))).)))).)..)))))))))))))).............. 121861520 121861596 GGAATGTTGGCTGGCTCGAAGCTTAAACAAATACAGCTTTGGTTTTGGTTTAAGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCTC ((((((..(.((((.((((((((((((((((..((....))..))).))))))))))))).)))).)..)))))).. Gar-miR166m 121861520 121861540 TCGGACCAGGCTTCATTCCTC Gar-miR166m* 121861576 121861596 GGAATGTTGGCTGGCTCGAAG 3 Gar-MIR166n PmiREN007851 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 124681695 124681843 + AAGAAGAAAAGAGGGTGTATGGAATGAAGTTTGATCCAAGATCAATCTCTTCATAATGATTTCTAAAGTTTTTTTTTTGATAACGAGGGCGGAGTTCGTCCATGTAACTCGGACCAGGCTTCATTCCTCGCGTGCACCTTGCTTTTCCT .....((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((((............)))))).(((((......)))))...(((.(((((.....))))).))).....))).)))))))))))))....))))))))).)))))).. 124681715 124681823 GGAATGAAGTTTGATCCAAGATCAATCTCTTCATAATGATTTCTAAAGTTTTTTTTTTGATAACGAGGGCGGAGTTCGTCCATGTAACTCGGACCAGGCTTCATTCCTC (((((((((((((.(((.((((((............)))))).(((((......)))))...(((.(((((.....))))).))).....))).))))))))))))).. Gar-miR166n 124681803 124681823 TCGGACCAGGCTTCATTCCTC Gar-miR166n* 124681715 124681735 GGAATGAAGTTTGATCCAAGA 3 Gar-MIR166o PmiREN007852 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NW_016664617.1 205 368 - AAGGAGCTACTCTTTTGAGGGGAACGTTGTCTGGCCCGAGGACACCAGTTCCATTTCCATTTTGCCTCTACGGAAGCTGTTCGTCACTTGGTTGTTAAATGGTTTGAGCTTGTGCCAGTGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCCCAATTATTGCTCCCATATC ..(((((.......(((.((((((.(..((((((.((((.(((((((((((.....((((((.((..(((((((.....))))).....))..)).))))))...)))).)).....))))).)))).))))))..).)))))).))).....)))))...... 225 348 GGAACGTTGTCTGGCCCGAGGACACCAGTTCCATTTCCATTTTGCCTCTACGGAAGCTGTTCGTCACTTGGTTGTTAAATGGTTTGAGCTTGTGCCAGTGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCTC ((((.(..((((((.((((.(((((((((((.....((((((.((..(((((((.....))))).....))..)).))))))...)))).)).....))))).)))).))))))..).)))).. Gar-miR166o 225 245 TCGGACCAGGCTTCATTCCTC Gar-miR166o* 328 348 GGAACGTTGTCTGGCCCGAGG 3 Gar-MIR166p PmiREN008906 MIR166 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 23316812 23316933 + AACTGCGTGAACTGTTGCGGGGAATGCTGACTGGTTCGAGACCATTCATTCATATGGACCTTAAATGTGTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACTTGGTTTAATAGTTA ....................((((((..(.(((((((((((.((((((..(((((.........)))))...)))))).))))))))))).)..))))))...................... 23316832 23316913 GGAATGCTGACTGGTTCGAGACCATTCATTCATATGGACCTTAAATGTGTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..(.(((((((((((.((((((..(((((.........)))))...)))))).))))))))))).)..)))))).. Gar-miR166p 23316893 23316913 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Gar-miR166p* 23316832 23316852 GGAATGCTGACTGGTTCGAGA 3 Gar-MIR167a PmiREN007853 MIR167 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 127425792 127425915 - CATCACGCACCACTGATAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTATCCATCCCTCCTTTAGTTTATCTTTCAGGGAGAAAACTAGATCATATGGCAGCTTCATCTGTCCATGGTAGCATGAATA ..(((.((((((..(((((.(((((((((((..(((((((((...((..(((((.....((.....))...)))))))...))))))))).))))))))))).)))))..)))).)).)))... 127425812 127425895 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTATCCATCCCTCCTTTAGTTTATCTTTCAGGGAGAAAACTAGATCATATGGCAGCTTCATC (((((((((((..(((((((((...((..(((((.....((.....))...)))))))...))))))))).))))))))))).. Gar-miR167a 127425874 127425895 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAG Gar-miR167a* 127425812 127425832 AGATCATATGGCAGCTTCATC 3 Gar-MIR167b PmiREN007854 MIR167 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 64820690 64820814 - TAGCATGCACCACAGAGAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGTTAACCACCCCTCCATTTTTAAACCTTTCAGGGAGAGAGACTAGATCATGTGACAGCTTCATCTGTCCATGGCAGCATGATCA ...(((((.(((..((.((.((((((((...(((((((((((((......((((.................)))).....)))))))))))))..)))))))).)).))..)))..))))).... 64820710 64820794 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGTTAACCACCCCTCCATTTTTAAACCTTTCAGGGAGAGAGACTAGATCATGTGACAGCTTCATC ((((((((...(((((((((((((......((((.................)))).....)))))))))))))..)))))))).. Gar-miR167b 64820773 64820794 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAG Gar-miR167b* 64820710 64820730 AGATCATGTGACAGCTTCATC 3 Gar-MIR167c PmiREN007855 MIR167 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 140190207 140190317 - TACGTGCACCCACTGGCTGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTCCTTCTCTGTTTTAAGGATGGTTCAGATCATGTGGTAGCTTCACCTGCTGTTGGTATCACGACCA ..((((...(((.((((.(.(((((((((((.((((((((.(((((((((.........))))).)))).))))))))))))))))))).).)))).)))...)))).... 140190227 140190297 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTCCTTCTCTGTTTTAAGGATGGTTCAGATCATGTGGTAGCTTCACC (((((((((((.((((((((.(((((((((.........))))).)))).))))))))))))))))))).. Gar-miR167c 140190277 140190297 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Gar-miR167c* 140190227 140190247 AGATCATGTGGTAGCTTCACC 3 Gar-MIR167d PmiREN007856 MIR167 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 26791683 26791792 + GGCGTGAACCTACAAGCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTCCTTCTCTGTTGAGGGATAGATGGGATCATGTGGTAGCTTCACCTGTTGTTGGGATCACGAGCT ..(((((.((((..(((((.(((((((((((.((((((((...((((((((......)))))).))...))))))))))))))))))).)))))..)))).))))).... 26791703 26791772 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTCCTTCTCTGTTGAGGGATAGATGGGATCATGTGGTAGCTTCACC (((((((((((.((((((((...((((((((......)))))).))...))))))))))))))))))).. Gar-miR167d 26791703 26791723 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Gar-miR167d* 26791752 26791772 GGATCATGTGGTAGCTTCACC 3 Gar-MIR167e PmiREN007857 MIR167 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 25134530 25134658 + GAAGTCTGCAAGGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTCGGTTAGTAAGATGCGGATGCTATATTGCTAACCCTAGCTAGGTCATGCTGCGACAGCCTCACTCCTTCCTACTTGGGGCCCAA ...........(((((..(((((.(((((((((((((((((.((..(((((((((...((....))....)))))))))..)).)))))))))))).).)))).)))))..)))))............. 25134550 25134638 TGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTCGGTTAGTAAGATGCGGATGCTATATTGCTAACCCTAGCTAGGTCATGCTGCGACAGCCTCACT (((.(((((((((((((((((.((..(((((((((...((....))....)))))))))..)).)))))))))))).).)))).))).. Gar-miR167e 25134550 25134570 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Gar-miR167e* 25134618 25134638 TCATGCTGCGACAGCCTCACT 3 Gar-MIR167f PmiREN007858 MIR167 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 5363245 5363356 - TATGGTGCTCCATCATCAGATGAAGCTGCCAGCATGATCTTAATTTCCCTCTGTTTTATCGAGGAAAAATCAGATCATGTGGCAGTTTCACCTGTTGCTGCTTGCACCCCCC ...(((((..((.((.(((.(((((((((((.((((((((...(((.((((.........)))).)))...))))))))))))))))))).))).)).))...))))).... 5363265 5363336 TGAAGCTGCCAGCATGATCTTAATTTCCCTCTGTTTTATCGAGGAAAAATCAGATCATGTGGCAGTTTCACC (((((((((((.((((((((...(((.((((.........)))).)))...))))))))))))))))))).. Gar-miR167f 5363315 5363336 TGAAGCTGCCAGCATGATCTTA Gar-miR167f* 5363265 5363285 AGATCATGTGGCAGTTTCACC 3 Gar-MIR167g PmiREN007859 MIR167 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 105458291 105458402 - TTTGGTACTCCACCATCAGATGAAGCTGCCAGCATGATCTTAATTCCCCTTCTTTTTTTAATTGAGGGATCAAATCATGTGGCAGTTTCATCTGTTGCTACTAGCACAATAT ..((((.....)))).(((((((((((((((.((((((......(((((..............).))))....))))))))))))))))))))).((((...))))...... 105458311 105458382 TGAAGCTGCCAGCATGATCTTAATTCCCCTTCTTTTTTTAATTGAGGGATCAAATCATGTGGCAGTTTCATC (((((((((((.((((((......(((((..............).))))....))))))))))))))))).. Gar-miR167g 105458361 105458382 TGAAGCTGCCAGCATGATCTTA Gar-miR167g* 105458311 105458331 AAATCATGTGGCAGTTTCATC 3 Gar-MIR168 PmiREN007860 MIR168 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 85743182 85743351 - AGTTACCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTAGCTGTTCCTTAATATTGGATTGATTTTGATTTTGATTTAAGCCAGATGGCTGGGCGTGATTGGAGGAAGCGCGAATCGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCGGTGAAGGTT ..((((((.((((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((((.((..((((((.....((((((((........))))))))((((....))))...........))))))..)).)))))).))))).)))))))))).))))).))))))))))))))..... 85743202 85743331 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTAGCTGTTCCTTAATATTGGATTGATTTTGATTTTGATTTAAGCCAGATGGCTGGGCGTGATTGGAGGAAGCGCGAATCGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((.((((((.((..((((((.....((((((((........))))))))((((....))))...........))))))..)).)))))).))))).)))))))))).))).. Gar-miR168 85743311 85743331 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Gar-miR168* 85743202 85743222 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Gar-MIR169a PmiREN007861 MIR169 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 99210437 99210672 + AAAACCCTGGTTGGGTCCCAGGCAGTCACCTTGGCTAACTAGACAGGCTGTTTTCATTCATGCTAGGCCTCATCTTCCGCCCCATTGGATATACATCAAGTTAAAGCCAAGTAATGATGGAGAAACATGCATGCATAAGACTTAAGACTTACGGGGAAGAGTAGGTCTTCCATGAAGATAAAGAGTCTTGTTTGGTAGCCAAGAATGACTTGCCTGCAGCTCATGGGAACCCATGT ...((((.....))))..((((((((((.((((((((.(((((((((((.(((...((((((..((((((..((((((.((...((((....((.....)).....))))(((.(((((......))).))))).((((........)))).))))))))..))))))..))))))...))).)).)))))))))))))))))..)))).)))))).....(((((....))))). 99210457 99210652 GGCAGTCACCTTGGCTAACTAGACAGGCTGTTTTCATTCATGCTAGGCCTCATCTTCCGCCCCATTGGATATACATCAAGTTAAAGCCAAGTAATGATGGAGAAACATGCATGCATAAGACTTAAGACTTACGGGGAAGAGTAGGTCTTCCATGAAGATAAAGAGTCTTGTTTGGTAGCCAAGAATGACTTGCCTG ((((((((.((((((((.(((((((((((.(((...((((((..((((((..((((((.((...((((....((.....)).....))))(((.(((((......))).))))).((((........)))).))))))))..))))))..))))))...))).)).)))))))))))))))))..)))).)))).. Gar-miR169a 99210632 99210652 TAGCCAAGAATGACTTGCCTG Gar-miR169a* 99210457 99210477 GGCAGTCACCTTGGCTAACTA 3 Gar-MIR169b PmiREN007862 MIR169 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 54562030 54562167 - AAGATAAGAGTTGAGTTGGGTAGCCAAGAATGACTTGCCTGCTGCTCCTTTCAAAGAGGTTTCAAAAAACTTCTTTGAAAACCTTTTGTTGGCTACCAGGCAGTCATCTTGGCTAACTTGACAAGCTCTTTTCTTTCA ((((.(((((((..(((((((((((((((.(((((.(((((..(((..((((((((((((((....))))))))))))))..........)))...)))))))))))))))))).))))))).))))))).))))... 54562050 54562147 TAGCCAAGAATGACTTGCCTGCTGCTCCTTTCAAAGAGGTTTCAAAAAACTTCTTTGAAAACCTTTTGTTGGCTACCAGGCAGTCATCTTGGCTAACT (((((((((.(((((.(((((..(((..((((((((((((((....))))))))))))))..........)))...)))))))))))))))))).).. Gar-miR169b 54562127 54562147 TAGCCAAGAATGACTTGCCTG Gar-miR169b* 54562050 54562070 AGGCAGTCATCTTGGCTAACT 3 Gar-MIR169c PmiREN007863 MIR169 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 54561781 54561908 - AAGATAAGAACCTAGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCCCACGACAAGTTTCACTAAGGCTGGCCCTGTTTTTAGTTTGCAGGCAATCATCCTTGGTTAAGCTGACAGGTTCTTCTCTTTC ((((.((((((((.(((...(((((((((((((.(((((((((......(((((((((.....))))).....)))).......))))))))))))))))))))))....))))))))))).)))).. 54561801 54561888 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCCCACGACAAGTTTCACTAAGGCTGGCCCTGTTTTTAGTTTGCAGGCAATCATCCTTGGTTAAG (((((((((((((.(((((((((......(((((((((.....))))).....)))).......)))))))))))))))))))))).. Gar-miR169c 54561867 54561888 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGC Gar-miR169c* 54561801 54561821 AGGCAATCATCCTTGGTTAAG 3 Gar-MIR169d PmiREN007864 MIR169 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 57239895 57240091 + AGGTTATCTATCTATATGTGATACAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCACTTCCACTTAACATAAATCATGCTCTCTAAATAAGCAGCTAAAAGTTAGATCACAAAGCTAAAACCTATATATGTTGTCATCAATTAATTTATAATAAATGTTAATTGATCGGCAAGTCATCTGTGGCTATATCATTGTCTCATTTTCT ((((.....))))....((((((.(((((.(((((((((((((.............((((........((((.........)))).......))))(((.(((.................))).)))((((((((((...........))))))))))))))))))))))).))))).))))))............. 57239915 57240071 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCACTTCCACTTAACATAAATCATGCTCTCTAAATAAGCAGCTAAAAGTTAGATCACAAAGCTAAAACCTATATATGTTGTCATCAATTAATTTATAATAAATGTTAATTGATCGGCAAGTCATCTGTGGCTATA .(((((.(((((((((((((.............((((........((((.........)))).......))))(((.(((.................))).)))((((((((((...........))))))))))))))))))))))).))))).)) Gar-miR169d 57239915 57239935 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Gar-miR169d* 57240051 57240071 GGCAAGTCATCTGTGGCTATA 3 Gar-MIR169e PmiREN007865 MIR169 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 28987166 28987301 + AGATTAAAGAGCCTTGTAAGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTAAAACCCCCAAACAGGGTTTTGTTTGAAGTATCCATTTTAATGGGGCTTTTTAGGCAGTCTCCTTTGGCTATCCTCACTGGCTCTTATCTTTCAT ((((..(((((((..((.((((((((((((..((((.((((((((.(((((((..((((.((......)).))))..))...)))))..))))))))))))..))))))))).))).)).)))))))))))..... 28987186 28987281 GTAGCCAAGGATGACTTGCCTAAAACCCCCAAACAGGGTTTTGTTTGAAGTATCCATTTTAATGGGGCTTTTTAGGCAGTCTCCTTTGGCTATCCT ((((((((((..((((.((((((((.(((((((..((((.((......)).))))..))...)))))..))))))))))))..))))))))).).. Gar-miR169e 28987186 28987206 GTAGCCAAGGATGACTTGCCT Gar-miR169e* 28987260 28987281 GGCAGTCTCCTTTGGCTATCCT 3 Gar-MIR169f PmiREN007866 MIR169 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 106025495 106025696 + TTAAATGAGGTACAGTACTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGGCTAAGCTATCTCTTCCATATTATATTCTGTTATTATGTTCATTTTATTGCCAAAGATTTGAACAAGACTGTAATACATAAATGAAACAAAACCTTTGGAGGAGATAACATCGATCCGGCAAGTTGTCCTCGGCTACAATTCTGTCTCATTTTCACTT ..(((((((..((((...((.((((.(((((((((((((((.(((......((((((((((((((((((.(((.......((((((..((.........))..))))))))).)))))))....................)))))))))))...)))..))))))))))))))).)))).))...)))))))))))...... 106025515 106025676 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGGCTAAGCTATCTCTTCCATATTATATTCTGTTATTATGTTCATTTTATTGCCAAAGATTTGAACAAGACTGTAATACATAAATGAAACAAAACCTTTGGAGGAGATAACATCGATCCGGCAAGTTGTCCTCGGCTACA .((((.(((((((((((((((.(((......((((((((((((((((((.(((.......((((((..((.........))..))))))))).)))))))....................)))))))))))...)))..))))))))))))))).))))... Gar-miR169f 106025515 106025535 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Gar-miR169f* 106025656 106025676 GGCAAGTTGTCCTCGGCTACA 3 Gar-MIR169g PmiREN007867 MIR169 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 130308007 130308236 + GTGGGAATGAGGTAAAGTAGTGCAGCCAAGGATGATTTTCCGGCTAGGCTTTCTCTTCCACTTATCTGAGTTGTTTTTTGATACTCGTTAATTACTCAAAACTATTTATGTTAATGGTTTGAACTGTTCATGGGAATATGAAGTTAATTATTTAATACATAAATGAATCAAACCTTTGTTGGAGGAGATAATCGGCAAGTTGTCTTTGGCTACGTTTCTTTCTCATTCTC ....((((((((..(((.((((.(((((((((((((((.((((.((.....(((((((((......(((((.(((...(((...)))..))).)))))((((((((......)))))))).((((..(((((....)))))))))..(((((((.....))))))).............))))))))))).)))).))))))))))))))).)))).)))))))))..)) 130308027 130308216 AGCCAAGGATGATTTTCCGGCTAGGCTTTCTCTTCCACTTATCTGAGTTGTTTTTTGATACTCGTTAATTACTCAAAACTATTTATGTTAATGGTTTGAACTGTTCATGGGAATATGAAGTTAATTATTTAATACATAAATGAATCAAACCTTTGTTGGAGGAGATAATCGGCAAGTTGTCTTTGGCTAC (((((((((((((((.((((.((.....(((((((((......(((((.(((...(((...)))..))).)))))((((((((......)))))))).((((..(((((....)))))))))..(((((((.....))))))).............))))))))))).)))).))))))))))))))).) Gar-miR169g 130308027 130308047 AGCCAAGGATGATTTTCCGGC Gar-miR169g* 130308196 130308216 CGGCAAGTTGTCTTTGGCTAC 3 Gar-MIR169h PmiREN007868 MIR169 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 21701852 21702002 + TGAAAAGAGTCGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCATCTTTCAAAGAGGTTCAAAATCTTTGTATCAACCATGGAAAAGAAACCAGAAGCTCTTTGTGAGAGTGCCAGGCAGTCACCTTGGCTAATCTAACAGGTTCTTGTCACT .((.(((((.(.((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((.(((((((.(((....(((((..............))))).....))).))))))).)))).)).)))))))))))))))))).))).)))).)))))).))... 21701872 21701982 AGCCAAGGATGACTTGCCTGCATCTTTCAAAGAGGTTCAAAATCTTTGTATCAACCATGGAAAAGAAACCAGAAGCTCTTTGTGAGAGTGCCAGGCAGTCACCTTGGCTAA ((((((((.(((((.(((((((((((.(((((((.(((....(((((..............))))).....))).))))))).)))).)).)))))))))))))))))).. Gar-miR169h 21701872 21701892 AGCCAAGGATGACTTGCCTGC Gar-miR169h* 21701963 21701982 CAGGCAGTCACCTTGGCTAA 3 Gar-MIR170a PmiREN007869 MIR170 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 93468073 93468178 + GTGGGAGGAGTATACACGACGTGATATTGGTTCGGCTCATCTTATTGTGATTAAAAATTTCAAGGCGAGCCGAATCAATATCACTCATGTATGCTTTTTTATTATT ...(((((((((((((.((.((((((((((((((((((.((((...((........))...)))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))...... 93468093 93468158 GTGATATTGGTTCGGCTCATCTTATTGTGATTAAAAATTTCAAGGCGAGCCGAATCAATATCACTC ((((((((((((((((((.((((...((........))...)))).)))))))))))))))))).. Gar-miR170a 93468138 93468158 CGAGCCGAATCAATATCACTC Gar-miR170a* 93468093 93468113 GTGATATTGGTTCGGCTCATC 3 Gar-MIR170b PmiREN007870 MIR170 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 22639805 22639920 + ACTGGAGGAGTAGACATGGCGTGATATTGCTTCTGCTCATCTTCTTTCTCTGTAATCCCTCTGAAAGTTTCAAGGCGAGCCGAATCAATATCACTCTTGTATGCTTCTTTCTCATG ...(((((((((.(((.((.(((((((((.(((.((((.(((((((((..............)))))....)))).)))).))).))))))))))).))).)))))))))...... 22639825 22639900 GTGATATTGCTTCTGCTCATCTTCTTTCTCTGTAATCCCTCTGAAAGTTTCAAGGCGAGCCGAATCAATATCACTC (((((((((.(((.((((.(((((((((..............)))))....)))).)))).))).))))))))).. Gar-miR170b 22639880 22639900 CGAGCCGAATCAATATCACTC Gar-miR170b* 22639825 22639845 GTGATATTGCTTCTGCTCATC 3 Gar-MIR171a PmiREN007871 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 134874679 134874808 - ACATGAAATAGTGACTTTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACATGAAACATAAAAGACACTTTCTCTCTTTTTTATTATTATTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTGCTCTTTCATATATG .(((((((.(((.(((..(((((((((.(((((((.((((((..(((..((((((((...........)))))))).....)))..)))))).))))))).)))))))))..)))))).)))))....)) 134874699 134874788 TATTGGCCTGGTTCACTCAGACATGAAACATAAAAGACACTTTCTCTCTTTTTTATTATTATTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.((((((..(((..((((((((...........)))))))).....)))..)))))).))))))).))))))).. Gar-miR171a 134874699 134874719 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171a* 134874768 134874788 TATTGGCCTGGTTCACTCAGA 3 Gar-MIR171b PmiREN007872 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 114981372 114981488 + GAGATGACGATAAAACTGGGGATGTTGGAATGGCTCAATCAAATCAAATTTCCTTGAGTTTTATTGGGTCTTTTAATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACCAGCTTTCATATCTCC ((((((..((.....((((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((...........)))...))).))))))))))))))).)))))))).))))...)).)))))). 114981392 114981468 TGTTGGAATGGCTCAATCAAATCAAATTTCCTTGAGTTTTATTGGGTCTTTTAATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC ((((((.(((((((((((((((.(((...(((...........)))...))).))))))))))))))).)))))))) Gar-miR171b 114981448 114981468 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171b* 114981392 114981412 TGTTGGAATGGCTCAATCAAA 3 Gar-MIR171c PmiREN007873 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 77543537 77543678 + TCATGGAATAGTAACTGTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACATGAAACAAGGCGCAGTTTTTGATCTCTCAGAAGAGTTGAAGCATCAGTGGTTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAAGTACTGTTTCAAATCT ...((((((((((.((..(((((((((.(((((((.((((((..(((((...((...(((((....((((....))))..)))))....)).))))).)))))).))))))).)))))))))...))))))))))))..... 77543557 77543658 TATTGGCCTGGTTCACTCAGACATGAAACAAGGCGCAGTTTTTGATCTCTCAGAAGAGTTGAAGCATCAGTGGTTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.((((((..(((((...((...(((((....((((....))))..)))))....)).))))).)))))).))))))).))))))).. Gar-miR171c 77543638 77543658 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171c* 77543557 77543577 TATTGGCCTGGTTCACTCAGA 3 Gar-MIR171d PmiREN007874 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 123549614 123549729 + AAGTAAGAATGTTAACGAGATATTGGTGCGGTTCAATTTAAGAGCATCACTCTAAAGGTTAAGAGTTATGTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTAATAATTATACACCTT ..(((.((.(((((.((.((((((((((((((((((((....(((((.(((((........))))).)))))....)))))))))))))))))))).))))))).)).)))..... 123549634 123549709 TATTGGTGCGGTTCAATTTAAGAGCATCACTCTAAAGGTTAAGAGTTATGTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC ((((((((((((((((((....(((((.(((((........))))).)))))....)))))))))))))))))).. Gar-miR171d 123549689 123549709 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171d* 123549634 123549654 TATTGGTGCGGTTCAATTTAA 3 Gar-MIR171e PmiREN007875 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 74956431 74956565 - GATTTTGAGTGCGATCGAGATATTGGTGCGGTTCAATCAGATAGAACTTCACTCTTTAAAAAAAAAAAAGGAAACAATAGAGTTGTGTTTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGCACAGTAACTCATGGTT ........(((((.....(((((((((((((((((((((((((((((...(((((.......................)))))...))))))))))))))))))))))))))))).))))).............. 74956451 74956545 TATTGGTGCGGTTCAATCAGATAGAACTTCACTCTTTAAAAAAAAAAAAGGAAACAATAGAGTTGTGTTTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((((((((((((((((((((((...(((((.......................)))))...))))))))))))))))))))))))))).. Gar-miR171e 74956451 74956471 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171e* 74956525 74956545 TATTGGTGCGGTTCAATCAGA 3 Gar-MIR171f PmiREN007876 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 16355475 16355608 - GGTTGAAATAGTCACTGCGATGTTGGCTCGGTTCACTCAGACAATAATCAAGTTCTACGCTTTAGATATAACTCTGCGTAGCTTGCTGTGCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCCTAGTGCCGTTTCATTCTCT ((.((((((.(.(((((.(((((((((.(((((((.(((((..(((..((((..((((((...(((......))))))))))))).)))..))))).))))))).))))))))).)))))).)))))).))... 16355495 16355588 TGTTGGCTCGGTTCACTCAGACAATAATCAAGTTCTACGCTTTAGATATAACTCTGCGTAGCTTGCTGTGCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(((((((.(((((..(((..((((..((((((...(((......))))))))))))).)))..))))).))))))).))))))).. Gar-miR171f 16355495 16355515 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171f* 16355568 16355588 TGTTGGCTCGGTTCACTCAGA 3 Gar-MIR171g PmiREN007877 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030675.1 141958784 141958900 + TAAAATAGTTGAAAATTTGATGTTGGCACGGTTCAATCAGATCAAATCTCTCAGTGACTGGCTGAGTCCTTTAATCTGATTGAGCCGTGCCAATATCAGAGTTAGTCAGTTTATCAC ...............(((((((((((((((((((((((((((.(((...((((((.....))))))...))).)))))))))))))))))))))))))))................. 141958804 141958880 TGTTGGCACGGTTCAATCAGATCAAATCTCTCAGTGACTGGCTGAGTCCTTTAATCTGATTGAGCCGTGCCAATATC ((((((((((((((((((((((.(((...((((((.....))))))...))).)))))))))))))))))))))).. Gar-miR171g 141958860 141958880 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171g* 141958804 141958824 TGTTGGCACGGTTCAATCAGA 3 Gar-MIR171h PmiREN007878 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 49402525 49402638 + CAAAGGTGGTGTACGATGGATGTTGGCACGGATCAATCGGATCAAATCTCTCAGTGGACTGAGTCCTTTAATCTGATTGAGTCGTGCCAATATCAATCTCCCTCTCTCACACAT ....((.((.(...(((.(((((((((((((.((((((((((.(((...(((((....)))))...))).)))))))))).))))))))))))).))).))).))......... 49402545 49402618 TGTTGGCACGGATCAATCGGATCAAATCTCTCAGTGGACTGAGTCCTTTAATCTGATTGAGTCGTGCCAATATC (((((((((((.((((((((((.(((...(((((....)))))...))).)))))))))).))))))))))).. Gar-miR171h 49402598 49402618 TGATTGAGTCGTGCCAATATC Gar-miR171h* 49402545 49402565 TGTTGGCACGGATCAATCGGA 3 Gar-MIR171i PmiREN007879 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 66052348 66052466 + TTAGGAAGCAAAAATAAAAGCGATGTTGGTGCGGTTCAATCCGAAAACGAATTTACAATCGTAAAATACGATATCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTTCCGCAAGTCTCCAAATTT ................((((.((((((((((((((((((((.((...(((.(((((....))))).).))...)).)))))))))))))))))))).))))....((((......)))) 66052368 66052446 CGATGTTGGTGCGGTTCAATCCGAAAACGAATTTACAATCGTAAAATACGATATCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACT .((((((((((((((((((((.((...(((.(((((....))))).).))...)).))))))))))))))))))))... Gar-miR171i 66052426 66052446 TTGAGCCGCGCCAATATCACT Gar-miR171i* 66052368 66052388 CGATGTTGGTGCGGTTCAATC 3 Gar-MIR171j PmiREN007880 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 66053649 66053767 + TTAGGAAGCAAAAATAAAAGCGATGTTGGTGCGGTTCAATCCGAAAACGAATTTACAATCGTAAAATACGATATCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTTCCGCAAGTCTCCAAATTT ................((((.((((((((((((((((((((.((...(((.(((((....))))).).))...)).)))))))))))))))))))).))))....((((......)))) 66053669 66053747 CGATGTTGGTGCGGTTCAATCCGAAAACGAATTTACAATCGTAAAATACGATATCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACT .((((((((((((((((((((.((...(((.(((((....))))).).))...)).))))))))))))))))))))... Gar-miR171j 66053727 66053747 TTGAGCCGCGCCAATATCACT Gar-miR171j* 66053669 66053689 CGATGTTGGTGCGGTTCAATC 3 Gar-MIR171k PmiREN007881 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 69416445 69416573 + AGAAGCAAAAGAAAAGAAAGCGATGTTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGGATTTACGAATTGATTCAGTCGTAAAATACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTTCCACATCCCTTCTATTTT ......(((((((..(((((.((((((((((.(((((((((.((.((((..(((((((.(((...))))))))))...)).)))).))))))))).)))))))))).)))))........))))..))) 69416465 69416553 CGATGTTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGGATTTACGAATTGATTCAGTCGTAAAATACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACT .((((((((((.(((((((((.((.((((..(((((((.(((...))))))))))...)).)))).))))))))).))))))))))... Gar-miR171k 69416533 69416553 TTGAGCCGCGCCAATATCACT Gar-miR171k* 69416465 69416485 CGATGTTGGTGAGGTTCAATC 3 Gar-MIR171l PmiREN008907 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NW_016646323.1 44 156 + ATATTGAGTTGAAATTTTTATGTTGGCACGGTGTAGTCAGATCAAATCTCTAAATGGCTGAGTCGTTTAGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACCTTGACCCGCCATATCTG ....................((((((((((((.((((((((........(((((((((...))))))))))))))))).))))))))))))...................... 64 136 TGTTGGCACGGTGTAGTCAGATCAAATCTCTAAATGGCTGAGTCGTTTAGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC ((((((((((((.((((((((........(((((((((...))))))))))))))))).)))))))))))).. Gar-miR171l 116 136 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171l* 64 84 TGTTGGCACGGTGTAGTCAGA 3 Gar-MIR171m PmiREN008908 MIR171 Gossypium arboreum Gar-NW_016668660.1 150 262 + ATATTGAGTTGAAATTTTTATGTTGGTTCAGTTCAGTCAGATCAAATCTCTAAATGGCTGAGTTGTTTAGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACCTTGACCCGCCATATCTG ....................(((((((.(.((((((((((((.(((((((.........)))..)))).)))))))))))).).)))))))...................... 170 242 TGTTGGTTCAGTTCAGTCAGATCAAATCTCTAAATGGCTGAGTTGTTTAGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((.(.((((((((((((.(((((((.........)))..)))).)))))))))))).).))))))).. Gar-miR171m 222 242 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Gar-miR171m* 170 190 TGTTGGTTCAGTTCAGTCAGA 3 Gar-MIR172a PmiREN007882 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 81272206 81272331 + TACAGTCAGTGTTTGCAAATGCGGCATCGTCAAGATTCATAGAAAATTTTCCTAAGAGCCTGTTTGGATGCCTTGAAAGTTTTCTTGAATCTTGATGATGCTGCATCTGCAATTATATTGGCTAAC ...((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((.......((.....)).......)))))))))))))))))))))))))))))))).)))))..)))))))))... 81272226 81272311 GCGGCATCGTCAAGATTCATAGAAAATTTTCCTAAGAGCCTGTTTGGATGCCTTGAAAGTTTTCTTGAATCTTGATGATGCTGCAT (((((((((((((((((((.(((((((((((.......((.....)).......)))))))))))))))))))))))))))))).. Gar-miR172a 81272291 81272311 TGAATCTTGATGATGCTGCAT Gar-miR172a* 81272226 81272246 GCGGCATCGTCAAGATTCATA 3 Gar-MIR172b PmiREN007883 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 88840564 88840697 + ATCAGTCCGCGTTTGCAGGTGCGGCATCATCAAGATTCGCAAGCTTTGGTAAGGGCTTCTCTCTTCTTCCAAGTGTCCTTTCAAATGGAATCTTGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCGAACGTATGGGCTACT ...(((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((((((....)))))))........(((((..((......))..)))))...)))))))))))))))))))))).))))))))..)))))... 88840584 88840677 GCGGCATCATCAAGATTCGCAAGCTTTGGTAAGGGCTTCTCTCTTCTTCCAAGTGTCCTTTCAAATGGAATCTTGAATCTTGATGATGCTGCAT (((((((((((((((((((.(((((((....)))))))........(((((..((......))..)))))...))))))))))))))))))).. Gar-miR172b 88840657 88840677 TGAATCTTGATGATGCTGCAT Gar-miR172b* 88840584 88840604 GCGGCATCATCAAGATTCGCA 3 Gar-MIR172c PmiREN007884 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030675.1 33330341 33330467 - ATCAGTCGTTGTTTGCAAATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAACGTTGTATGTATGTATATATATATGTATAGTTTGGGTCTGAGAATCTTGATGATGCTGCATTGGCAATGAATGGTTATGGC ((((.((((((((....(((((((((((((((((((((.((.((....((((((((((((....)))))))))))).....)).)).))))))))))))))))))))))))))))).))))...... 33330361 33330447 GTAGCATCATCAAGATTCACATGCAACGTTGTATGTATGTATATATATATGTATAGTTTGGGTCTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.((.((....((((((((((((....)))))))))))).....)).)).)))))))))))))))))).. Gar-miR172c 33330361 33330381 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Gar-miR172c* 33330427 33330447 GTAGCATCATCAAGATTCACA 3 Gar-MIR172d PmiREN007885 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 49914872 49914998 - ATCAGTCATTTTTTGCTGATGCAGCATCTTCAAGATTCACATGCAAAGTATAGTACGGCCAGGCCATAGCTTTTGTTTGAAGCATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCCATTAATGACTCCACA ...(((((((..(.((((((((((((((.(((((((((.((((((((....(((..(((...)))...)))....)))...))))).))))))))).)))))))))))))).)..)))))))..... 49914892 49914978 GCAGCATCTTCAAGATTCACATGCAAAGTATAGTACGGCCAGGCCATAGCTTTTGTTTGAAGCATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((.(((((((((.((((((((....(((..(((...)))...)))....)))...))))).))))))))).)))))))).. Gar-miR172d 49914892 49914912 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Gar-miR172d* 49914958 49914978 GCAGCATCTTCAAGATTCACA 3 Gar-MIR172e PmiREN007886 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 88908152 88908322 + GACAGTCGTTGTTTGCAGGTGTAGCATCTTCAAGATTCACATGCAAATGCACGGTGGTGAATGGTGATTATAGTAACGTACTCCCCCTTTCTTCTCTTCCTAATTTCATTCCCAAAGTTCCTTGCAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAATTAACGACTA ...((((((((.((((.(((((((((((.(((((((((((.(((((....((..(((.((((((.(((((.((......................))...))))))))))))))..))...))))).))))..))))))).))))))))))).)))).....)))))))). 88908172 88908302 GTAGCATCTTCAAGATTCACATGCAAATGCACGGTGGTGAATGGTGATTATAGTAACGTACTCCCCCTTTCTTCTCTTCCTAATTTCATTCCCAAAGTTCCTTGCAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((.(((((((((((.(((((....((..(((.((((((.(((((.((......................))...))))))))))))))..))...))))).))))..))))))).)))))))).. Gar-miR172e 88908282 88908302 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Gar-miR172e* 88908172 88908192 GTAGCATCTTCAAGATTCACA 3 Gar-MIR172f PmiREN007887 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 79080447 79080562 + GACAGTCGTTGTTTGCAGGTGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATTATATTGCTAAAAGTTCTTTGAAACTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAACGACTACACA ...(((((((..((((.(((((((((((((((((((((....((((......))))....((((......))))..))))))))))))))))))))).))))..)))))))..... 79080467 79080542 GTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATTATATTGCTAAAAGTTCTTTGAAACTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((....((((......))))....((((......))))..)))))))))))))))))).. Gar-miR172f 79080522 79080542 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Gar-miR172f* 79080467 79080487 GTAGCATCATCAAGATTCACA 3 Gar-MIR172g PmiREN007888 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 112329027 112329209 - CTGGGTCAGTGTTTGCAGATGCGGCATTATCAAGATTCACAAACTTAGTAAAGGGTTTCATTGGAGAGCCAAAGGTTGTGGTTTAGTGGTACCCCTCCACAAAATCACCTCCTTTTACTTCAAAGTTTTCCTTTCAAATATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAAACATATTGGCTATA ........((((((((.(((((((((((((((((((((.((......(.((((((...(.((((((....(((((..(((((((.((((.......)))).)))))))..)))))..)))))).)...))))))).....)).))))))))))))))))))))).)))))))).......... 112329047 112329189 GCGGCATTATCAAGATTCACAAACTTAGTAAAGGGTTTCATTGGAGAGCCAAAGGTTGTGGTTTAGTGGTACCCCTCCACAAAATCACCTCCTTTTACTTCAAAGTTTTCCTTTCAAATATGGGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.((......(.((((((...(.((((((....(((((..(((((((.((((.......)))).)))))))..)))))..)))))).)...))))))).....)).)))))))))))))))))).. Gar-miR172g 112329047 112329067 GGAATCTTGATGATGCTGCAT Gar-miR172g* 112329169 112329189 GCGGCATTATCAAGATTCACA 3 Gar-MIR172h PmiREN007889 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 81862774 81862957 - AACAGTCGTTGTTTGCGGGAGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAACTGCACGGTGGCGATGATAATAATACTAACTCTTTTTCCTCTTTCTCCTTTCTTCCCTCCCTGTCCTAAATTTTATTGCCAAACATCTTTGAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAACGACTATTCA ...(((((((..((((.((.((((((((((((((((((.(((............(((((((((.......................................................))))))))).............))).)))))))))))))))))).)).))))..)))))))..... 81862794 81862937 GTAGCATCATCAAGATTCACATGCAACTGCACGGTGGCGATGATAATAATACTAACTCTTTTTCCTCTTTCTCCTTTCTTCCCTCCCTGTCCTAAATTTTATTGCCAAACATCTTTGAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.(((............(((((((((.......................................................))))))))).............))).)))))))))))))))))).. Gar-miR172h 81862794 81862814 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Gar-miR172h* 81862917 81862937 GTAGCATCATCAAGATTCACA 3 Gar-MIR172i PmiREN007890 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 80449800 80449943 + ACAACAGCCATTGTTTTCTGTTGGAGCATCATCAAGATTCACAAAAAGCATTTTAAGGTTTTTTTAATTGAATTGATCAATCAGCGCTTTATGAATATGTTTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAGTGGCAATAAATGGCTAAG .....(((((((..((.((((((.((((((((((((((((...((((((((..((((((.......(((((.....)))))....)))))).....))))))))..)))))))))))))))).)))))).))..)))))))... 80449820 80449923 GGAGCATCATCAAGATTCACAAAAAGCATTTTAAGGTTTTTTTAATTGAATTGATCAATCAGCGCTTTATGAATATGTTTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAG (.((((((((((((((((...((((((((..((((((.......(((((.....)))))....)))))).....))))))))..)))))))))))))))).))) Gar-miR172i 80449903 80449923 AGAATCTTGATGATGCTGCAG Gar-miR172i* 80449820 80449840 GGAGCATCATCAAGATTCACA 3 Gar-MIR172j PmiREN007891 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 74205402 74205573 - AACAGTCATTGTTTGCGGATGGAGCATCATCAAGATTCACGTATCATTCTTAGGGCAATCGAATATTAATGGTGAAGATCATCCTTTTTGCTTCACCATACATGTACCAATTAGTCCCTTGGATATATATGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATAAATGGCTAAATT ...(((((((..((((.(.((.((((((((((((((((.(((((...(((.((((((((...((((..(((((((((.............)))))))))..))))....))).).)))).)))...))))).)))))))))))))))).)).).))))..)))))))..... 74205422 74205553 GGAGCATCATCAAGATTCACGTATCATTCTTAGGGCAATCGAATATTAATGGTGAAGATCATCCTTTTTGCTTCACCATACATGTACCAATTAGTCCCTTGGATATATATGAGAATCTTGATGATGCTGCAG (.((((((((((((((((.(((((...(((.((((((((...((((..(((((((((.............)))))))))..))))....))).).)))).)))...))))).)))))))))))))))).).. Gar-miR172j 74205422 74205442 AGAATCTTGATGATGCTGCAG Gar-miR172j* 74205533 74205553 GGAGCATCATCAAGATTCACG 3 Gar-MIR172k PmiREN007892 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 80452593 80452725 + AACAGTCACTGTTTGCTGTTGGAGCATCATCAAGATTCACAATTTTAGGGTTCTTTTTTGATTGATTTGATCAATCAGCCTTTTTATGATTGAGAATCCTGATGATGCTGCAGTGGCAATAAGTGGCTAAATA ...(((((((..(((((((((.((((((((((.(((((.(((((..(((((.......((((((((...))))))))))))).....))))).))))).)))))))))).)))))))))..)))))))..... 80452613 80452705 GGAGCATCATCAAGATTCACAATTTTAGGGTTCTTTTTTGATTGATTTGATCAATCAGCCTTTTTATGATTGAGAATCCTGATGATGCTGCAG (.((((((((((.(((((.(((((..(((((.......((((((((...))))))))))))).....))))).))))).)))))))))).).. Gar-miR172k 80452685 80452705 AGAATCCTGATGATGCTGCAG Gar-miR172k* 80452613 80452633 GGAGCATCATCAAGATTCACA 3 Gar-MIR172l PmiREN007893 MIR172 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 80457153 80457293 + AACAGTCACTGTTTGCTGCTGCAGCATTATCAAGATTCACAAGAAGCATTTTAGGGTCTTTTTTGACTGATTGATCAATCAATAAGCCCTTTTATGATTGAGAATCCTGATGATGCTGCAGTGGCAATAAGTGGCTAAATA ...(((((((..((((((((((((((((((((.(((((.(((....(((...((((.(((..((((.(((....))).)))).)))))))...))).))).))))).))))))))))))))))))))..)))))))..... 80457173 80457273 GCAGCATTATCAAGATTCACAAGAAGCATTTTAGGGTCTTTTTTGACTGATTGATCAATCAATAAGCCCTTTTATGATTGAGAATCCTGATGATGCTGCAG ((((((((((((.(((((.(((....(((...((((.(((..((((.(((....))).)))).)))))))...))).))).))))).)))))))))))).. Gar-miR172l 80457253 80457273 AGAATCCTGATGATGCTGCAG Gar-miR172l* 80457173 80457193 GCAGCATTATCAAGATTCACA 3 Gar-MIR390a PmiREN007904 MIR390 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 70389450 70389587 + TCAGTATGGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGATGATCCATCTTTCAAGCTTTCATGCATGTATTTTATTTGATCCTCATATAGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATCGGTTCTTCTTGCTTGCTG ..((((.(((((((((.((.((((((((((.(((((((((.(((((.((((.......((.((......)).))..........)))).)).))).))))))))).)))))))))).)).)))))))))))))..... 70389470 70389567 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGATGATCCATCTTTCAAGCTTTCATGCATGTATTTTATTTGATCCTCATATAGCGCTATCCATCCTGAGTTTCA ((((((((((.(((((((((.(((((.((((.......((.((......)).))..........)))).)).))).))))))))).)))))))))).. Gar-miR390a 70389470 70389490 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Gar-miR390a* 70389547 70389567 CGCTATCCATCCTGAGTTTCA 3 Gar-MIR390b PmiREN007905 MIR390 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 78063493 78063608 - CAAGTATGGGATAACCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCCCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTATATATGGCGCTATCTATCCTGAGTTTCATGGGTTCTTCCTGCTATATA ..((((.((((.(((((((.((((((((((.(((((((.((((............................)))).))))))).)))))))))).))))))).))))))))..... 78063513 78063588 AAGCTCAGGAGGGATAGCCCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTATATATGGCGCTATCTATCCTGAGTTTCA ((((((((((.(((((((.((((............................)))).))))))).)))))))))).. Gar-miR390b 78063568 78063588 AAGCTCAGGAGGGATAGCCCC Gar-miR390b* 78063513 78063533 CGCTATCTATCCTGAGTTTCA 3 Gar-MIR390c PmiREN007906 MIR390 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 112850258 112850369 + TAAGTATAGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGATGATCTTCAGCCTGATCCTCATTAGCGCTATCTATCCTGAGTTACATGGCTTCTTCTTGCTCTTGC ..((((.(((((((.((((..(((((((((.(((((((((.(..((.((((........)))).))..).))))))))).)))))))))..)))).)))))))))))..... 112850278 112850349 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGATGATCTTCAGCCTGATCCTCATTAGCGCTATCTATCCTGAGTTACA .(((((((((.(((((((((.(..((.((((........)))).))..).))))))))).)))))))))... Gar-miR390c 112850278 112850298 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Gar-miR390c* 112850329 112850349 CGCTATCTATCCTGAGTTACA 3 Gar-MIR390d PmiREN007907 MIR390 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 89199957 89200082 - CGAGTATGGGAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTAAGCTATTTCTTTCTTTCTTTTTTGCAGAAATATCATCTGCGGCGCTATCTATCCTGAGTTTCATGGGTTCTTCCTGCTATATG ..((((.((((((((((((.((((((((((.((((((((((.(((......)))............(((((.......))))))))))))))).)))))))))).))))))))))))))))..... 89199977 89200062 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTAAGCTATTTCTTTCTTTCTTTTTTGCAGAAATATCATCTGCGGCGCTATCTATCCTGAGTTTCA ((((((((((.((((((((((.(((......)))............(((((.......))))))))))))))).)))))))))).. Gar-miR390d 89200042 89200062 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Gar-miR390d* 89199977 89199997 CGCTATCTATCCTGAGTTTCA 3 Gar-MIR393a PmiREN007908 MIR393 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 121101620 121101780 - TCCTAGTGCAGGTGGAGAGCTCCAAAGGGATCGCATTGATCTAATGTTGATGATGGGCTTCCTTGAAAACCTTAACGAATTAATTATTGATTTTTGTTGATTCAGTTCAGTACCCATTGGATCATGCGATCCCTTCGGAATTTTCCATCGCTAGCTCTAAA ..........(((((((((.(((.((((((((((((.(((((((((....(((.((..(((...)))..)).....((((((((...........))))))))...))).....))))))))))))))))))))).))).)))))))))............ 121101640 121101760 TCCAAAGGGATCGCATTGATCTAATGTTGATGATGGGCTTCCTTGAAAACCTTAACGAATTAATTATTGATTTTTGTTGATTCAGTTCAGTACCCATTGGATCATGCGATCCCTTCGGAAT (((.((((((((((((.(((((((((....(((.((..(((...)))..)).....((((((((...........))))))))...))).....))))))))))))))))))))).))).. Gar-miR393a 121101740 121101760 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Gar-miR393a* 121101640 121101660 ATCATGCGATCCCTTCGGAAT 3 Gar-MIR393b PmiREN007909 MIR393 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 96620659 96620815 - GCCAAGTACTTGAGAAGGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTTATTTTTTTTCAACCCTTTATTTTTTTTTCTTTTCAATTCCCCCCTCCCCCAAAACAAATTCACAATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCCTCCTTTGGTAGCTTCAAA ....((((((.(((.(((.((((((((((((.((((.(((((........................................................................))))))))).)))))))))))).))).))).))).)))..... 96620679 96620795 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTTATTTTTTTTCAACCCTTTATTTTTTTTTCTTTTCAATTCCCCCCTCCCCCAAAACAAATTCACAATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATT (((((((((((.((((.(((((........................................................................))))))))).))))))))))).. Gar-miR393b 96620775 96620795 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Gar-miR393b* 96620679 96620699 ATCATGCTATCCCTTTGGATT 3 Gar-MIR393c PmiREN007910 MIR393 Gossypium arboreum Gar-NC_030675.1 18659259 18659368 + AAGCTGGCAGCTAGAGGAGGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTTATTTTTCTTCATTCACAATTTTGGATCATGCTATCCCTTCGGATTTTTCCTTTGGTAGCTTCA (((((....(((((((((((.((((.(((((((.((((.(((((.........................))))))))).))))))).)))).)))))))))))))))).. 18659279 18659348 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTTATTTTTCTTCATTCACAATTTTGGATCATGCTATCCCTTCGGATT (((.(((((((.((((.(((((.........................))))))))).))))))).)))). Gar-miR393c 18659279 18659299 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Gar-miR393c* 18659328 18659348 ATCATGCTATCCCTTCGGATT 3 Gar-MIR393d PmiREN007911 MIR393 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 74402970 74403091 + ACCGCAGGTACTAGAGGAGGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTTATTTTTCTTTTTAAAAAAAATTTACCCTAATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCCTCCTTTGGTTGCTTCA .........((((((((((((((((((((((((.((((.(((((.....................................))))))))).))))))))))))))))))))))))....... 74402990 74403071 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTTATTTTTCTTTTTAAAAAAAATTTACCCTAATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATT (((((((((((.((((.(((((.....................................))))))))).))))))))))))) Gar-miR393d 74402990 74403010 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Gar-miR393d* 74403051 74403071 ATCATGCTATCCCTTTGGATT 3 Gar-MIR394a PmiREN007912 MIR394 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 32275012 32275150 + GGCTTTGTTGCAGAGCCAATTTGGCATTCTGTCCACCTCCATTGATGTACTTCTTCTTACCTACCCAACTTATAAAATGATTTGTCTTTGAAGTAATGGAGGCGGCCAGTATGTCAAATAGACTCTGTAAATTTCTCTC .......((((((((.(.(((((((((.(((.((.(((((((.....((((((....................................))))))))))))).)).))).))))))))).).))))))))......... 32275032 32275130 TTGGCATTCTGTCCACCTCCATTGATGTACTTCTTCTTACCTACCCAACTTATAAAATGATTTGTCTTTGAAGTAATGGAGGCGGCCAGTATGTCAAAT (((((((.(((.((.(((((((.....((((((....................................))))))))))))).)).))).))))))).. Gar-miR394a 32275032 32275051 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Gar-miR394a* 32275110 32275130 GAGGCGGCCAGTATGTCAAAT 3 Gar-MIR394b PmiREN007913 MIR394 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 41979978 41980087 - GGCGTAGTTGCAGAGCCAATTTGGCATTCTGTCCACCTCCACTAATACTTGTTACCTAGCTTGGAAATGGAGGTGGCCAGTATGTCAAACAGGCTCTGTAAATTTGTCAC ((((...((((((((((..((((((((.(((.(((((((((((((..((........)).))))...))))))))).))).))))))))..))))))))))...)))).. 41979998 41980067 TTGGCATTCTGTCCACCTCCACTAATACTTGTTACCTAGCTTGGAAATGGAGGTGGCCAGTATGTCAAAC (((((((.(((.(((((((((((((..((........)).))))...))))))))).))).))))))).. Gar-miR394b 41980048 41980067 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Gar-miR394b* 41979998 41980018 GAGGTGGCCAGTATGTCAAAC 3 Gar-MIR394c PmiREN007914 MIR394 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 39269315 39269415 - GGCGCAGTTGCAGAGCCAATTTGGCATTCTGTCCACCTCCACCAATAATTCTTGGTAGTGGAGGTGGCCAGTATGTCAAACAGGCAGTGTAAATTTGTCAC ......((((((..(((..((((((((.(((.(((((((((((((......)))))...)))))))).))).))))))))..)))..))))........)) 39269335 39269395 TTGGCATTCTGTCCACCTCCACCAATAATTCTTGGTAGTGGAGGTGGCCAGTATGTCAAAC (((((((.(((.(((((((((((((......)))))...)))))))).))).))))))).. Gar-miR394c 39269376 39269395 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Gar-miR394c* 39269335 39269355 GAGGTGGCCAGTATGTCAAAC 3 Gar-MIR394d PmiREN007915 MIR394 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 59511585 59511720 + AAAGGGCTTCTTACAGAGTTTATTGGCATTCTGTCCACCTCCAATCATGGAAACAAAAAAACCCTTTTCTTTTTGCTCTCTGATCTCATCTTTCATGGAGGTGGGCATACTGCCAACTGGGCTCTGTTGGCTTCTC ...(((...((.((((((((((((((((...((((((((((((((((.(((..((((((..........)))))).))).))))...........))))))))))))...)))))).)))))))))).))...))) 59511605 59511700 TTGGCATTCTGTCCACCTCCAATCATGGAAACAAAAAAACCCTTTTCTTTTTGCTCTCTGATCTCATCTTTCATGGAGGTGGGCATACTGCCAACT ((((((...((((((((((((((((.(((..((((((..........)))))).))).))))...........))))))))))))...)))))).) Gar-miR394d 59511605 59511624 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Gar-miR394d* 59511680 59511700 GAGGTGGGCATACTGCCAACT 3 Gar-MIR394e PmiREN007916 MIR394 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 16457019 16457143 + AGGGCTTCTTACAGAGTTTATTGGCATTCTGTCCACCTCCCCATCATGGAAAAAGTCCGTATTTTTCCCCTCTGGTTTTTCATGGAGGTGGGCATACTGCCAACTGGGCTCTGTTGGCTTCTCTT ((((...((.((((((((((((((((...((((((((((((((....(((((((.......)))))))....)))........)))))))))))...)))))).)))))))))).))...)))). 16457039 16457123 TTGGCATTCTGTCCACCTCCCCATCATGGAAAAAGTCCGTATTTTTCCCCTCTGGTTTTTCATGGAGGTGGGCATACTGCCAACT ((((((...((((((((((((((....(((((((.......)))))))....)))........)))))))))))...)))))).. Gar-miR394e 16457039 16457058 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Gar-miR394e* 16457103 16457123 GAGGTGGGCATACTGCCAACT 3 Gar-MIR395a PmiREN007917 MIR395 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 6566400 6566521 - AAAGTCAGCTGTTCCCTGGAGTTCCTCTGATCACTTCATTGGGGCTATTTTACGACACTTGACACAGGGAATTTGGCCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGTAGACAGTGGACACTGT .......((((((..(((((((((((((((.(((((((.((((((((..(..(..............)..)..)))))))).))))))).)))))))))))))))..))))))......... 6566420 6566501 GTTCCTCTGATCACTTCATTGGGGCTATTTTACGACACTTGACACAGGGAATTTGGCCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC ((((((((((.(((((((.((((((((..(..(..............)..)..)))))))).))))))).)))))))))).. Gar-miR395a 6566420 6566439 TGAAGTGTTTGGGGGAACTC Gar-miR395a* 6566481 6566501 GTTCCTCTGATCACTTCATTG 3 Gar-MIR395b PmiREN007918 MIR395 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 14690946 14691085 - AGAGTCAGCTGTCCTCTTGAGTTCCCCTGATCACTTCACTGGGGTTATGGGGTCTGCTCTTCTTAGAGCCTTGTTAAAGGGGAGGTCCCTGATGACCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGCTAGCACCTGACACTGA ...(((((.(((...((.((((((((((((.(((((((...(((((((.(((....((((((((.((......)).))))))))...))).)))))))..))))))).)))))))))))).))...))).)))))..... 14690966 14691065 GTTCCCCTGATCACTTCACTGGGGTTATGGGGTCTGCTCTTCTTAGAGCCTTGTTAAAGGGGAGGTCCCTGATGACCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC ((((((((((.(((((((...(((((((.(((....((((((((.((......)).))))))))...))).)))))))..))))))).)))))))))).. Gar-miR395b 14690966 14690985 TGAAGTGTTTGGGGGAACTC Gar-miR395b* 14691045 14691065 GTTCCCCTGATCACTTCACTG 3 Gar-MIR396a PmiREN007921 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 66170768 66170929 - AAATGGCCCTCTTGGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACTTCGTCATAGATCGTTGGTTGCCTGTTGTTGTTAATGGTGCATCCATGTGGGCGGTATACGGCTATTTTTTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACACACAGGGCCAAAAGC ...(((((((..(((((((.((((((((((((.(((((((((((..((......))....(((.(((((((((....)))))).))).))).((((.((.....)).)))).....))))))))))).)))))))))))).))))).)).)))))))..... 66170788 66170909 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACTTCGTCATAGATCGTTGGTTGCCTGTTGTTGTTAATGGTGCATCCATGTGGGCGGTATACGGCTATTTTTTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.(((((((((((..((......))....(((.(((((((((....)))))).))).))).((((.((.....)).)))).....))))))))))).)))))))))))).. Gar-miR396a 66170889 66170909 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Gar-miR396a* 66170788 66170808 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Gar-MIR396b PmiREN007922 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 48029056 48029216 + ACATGGCCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACTTCGTCTTACATTTTTCCTTGTTATTTTGTGTTGCTTATATAGGCGGTATGTGAGTATGTATGTATGTCGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACGGACAGGGTCAAAGAG ...(((((((.((((((((.((((((((((((.((((((((((((..((((.(((((.....................(((((((((.....)))))))))))))).).)))..)))))))))))).)))))))))))).)))))))).)))))))..... 48029076 48029196 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACTTCGTCTTACATTTTTCCTTGTTATTTTGTGTTGCTTATATAGGCGGTATGTGAGTATGTATGTATGTCGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((((..((((.(((((.....................(((((((((.....)))))))))))))).).)))..)))))))))))).)))))))))))).. Gar-miR396b 48029076 48029096 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Gar-miR396b* 48029176 48029196 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Gar-MIR396c PmiREN007923 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 48236009 48236146 + CTATGGTTCTCTTTGTGGTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTGTATCAAGAAAAAAAGCTAAAGCCTTTCACCATGCAACAGTACTGAAATCAAACACAGTTCAAAAAATCTGTGGAAAATTACTGAGAGGATCTTCTTC ....(((((((((.((((((((((((((.(((.(((((((((.............((....)).(((((...(((....))).)))))......))))))))).))).)))))))))))))).)))))))))...... 48236029 48236126 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGTATCAAGAAAAAAAGCTAAAGCCTTTCACCATGCAACAGTACTGAAATCAAACACAGTTCAAAAAATCTGTGGAAAA ((((((((.(((.(((((((((.............((....)).(((((...(((....))).)))))......))))))))).))).)))))))).. Gar-miR396c 48236029 48236049 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Gar-miR396c* 48236106 48236126 GTTCAAAAAATCTGTGGAAAA 3 Gar-MIR396d PmiREN007924 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 66150281 66150430 + CGGAGAAGTCCTGGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTGAGTACTAACTCCGTCCTAAGGGAGAAAGAAAAAAAAAAACCATTTGCTAGCACACCATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGATGGCAATTCAGG .........((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((.....((.(((.((((........)))).......................))).)).....))))).))))))))))))))))))).)))))).......)))) 66150301 66150410 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTGAGTACTAACTCCGTCCTAAGGGAGAAAGAAAAAAAAAAACCATTTGCTAGCACACCATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA (((((((((((((((((.(((((.....((.(((.((((........)))).......................))).)).....))))).))))))))))))))))))) Gar-miR396d 66150301 66150321 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Gar-miR396d* 66150390 66150410 GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA 3 Gar-MIR396e PmiREN007925 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 23713524 23713654 - GTATGGTCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACTACGTCTTAGATGATGCATGTGAGCGGTTTTAAGTATCAATTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAATAGGGTCAATGGA .......(((.((((((((.((((((((((((.(((((((((((......((((((...(((......)))..))))))......))))))))))).)))))))))))).)))))))).)))......... 23713544 23713634 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACTACGTCTTAGATGATGCATGTGAGCGGTTTTAAGTATCAATTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.(((((((((((......((((((...(((......)))..))))))......))))))))))).)))))))))))).. Gar-miR396e 23713614 23713634 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Gar-miR396e* 23713544 23713564 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Gar-MIR396f PmiREN007926 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 51341006 51341161 - ACGATAAGCCATTCGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAATTTCGTGTAATCAGATAACCTGTTCGTTGCTGTCGTTGACGGCGCTTCATACATACGAGTACATTGTTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAACAGGGCCAAAGTT ((((........))))....((((((((((((.((((((((((((...(((((..(((.....)))((((((((((((...)))))))..........)))))))))).)))))))))))).))))))))))))............(((....))) 51341026 51341141 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAATTTCGTGTAATCAGATAACCTGTTCGTTGCTGTCGTTGACGGCGCTTCATACATACGAGTACATTGTTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((((...(((((..(((.....)))((((((((((((...)))))))..........)))))))))).)))))))))))).)))))))))))).. Gar-miR396f 51341121 51341141 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Gar-miR396f* 51341026 51341046 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Gar-MIR396g PmiREN007927 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 108808738 108808897 + TGGGGTTTGGTTGCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTGGCTACTCTCTCTGGCTCTGCATGCCTTCTCTTCTCTATTCCTACTGGAAGCATTAATCCTCAGTCAGTGGATATGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAATCATGGACGCCCCATTTTTA ((((((...(((.((((.(((((((((((((((((((.(((..(((((..((..((......((((.............((((....))))))))....))..))..))))).....))).))))))))))))))))))).)))))))))))))...... 108808758 108808877 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTGGCTACTCTCTCTGGCTCTGCATGCCTTCTCTTCTCTATTCCTACTGGAAGCATTAATCCTCAGTCAGTGGATATGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA (((((((((((((((((.(((..(((((..((..((......((((.............((((....))))))))....))..))..))))).....))).))))))))))))))))).. Gar-miR396g 108808758 108808778 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Gar-miR396g* 108808857 108808877 GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA 3 Gar-MIR396h PmiREN007928 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 28419635 28419795 - ACATGGCCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACTTCGTCTTACATTTTTCCTTGTTATTTTGTGTTGCTTATATAGGCGGTATGTGAGTATGTATGTATGTCGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACGGACAGGGTCAAAGAG ...(((((((.((((((((.((((((((((((.((((((((((((..((((.(((((.....................(((((((((.....)))))))))))))).).)))..)))))))))))).)))))))))))).)))))))).)))))))..... 28419655 28419775 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACTTCGTCTTACATTTTTCCTTGTTATTTTGTGTTGCTTATATAGGCGGTATGTGAGTATGTATGTATGTCGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((((..((((.(((((.....................(((((((((.....)))))))))))))).).)))..)))))))))))).)))))))))))).. Gar-miR396h 28419755 28419775 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Gar-miR396h* 28419655 28419675 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Gar-MIR396i PmiREN007929 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 82147634 82147790 + ACATGGCTCTCTTCGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAATTTCATGTAATCAGATCATTCATTCATTCGTTGTCGTTGATGGTGCTGCATACATACGAGTACGTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAACAGGGTCAAAGTC ...(((((((.((.(((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((..(((((((((.((.((.....))..)).)))))).)))..)))))..)))......)))))))))))).)))))))))))).))))).)).)))))))..... 82147654 82147770 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAATTTCATGTAATCAGATCATTCATTCATTCGTTGTCGTTGATGGTGCTGCATACATACGAGTACGTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((((((((((((..(((((((((.((.((.....))..)).)))))).)))..)))))..)))......)))))))))))).)))))))))))).. Gar-miR396i 82147654 82147674 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Gar-miR396i* 82147750 82147770 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Gar-MIR396j PmiREN007930 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 23710053 23710200 + TAAAAGTTCTGGCCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTGTGTACTTGTTTGTATGTATGTATGAAGCTAACAAAGGTTTAGATAGAGGACACCATGGGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAAGATGGCAACGTCTCAGGAC .....(((((((((((..(((((((((((((((((((.(((((...((((.((((((((.((.(.(((.........))).).)).)))))).)).))))...))))).)))))))))))))))))))..))))).......)))))) 23710073 23710180 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTGTGTACTTGTTTGTATGTATGTATGAAGCTAACAAAGGTTTAGATAGAGGACACCATGGGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA (((((((((((((((((.(((((...((((.((((((((.((.(.(((.........))).).)).)))))).)).))))...))))).))))))))))))))))).. Gar-miR396j 23710073 23710093 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Gar-miR396j* 23710160 23710180 GCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA 3 Gar-MIR396k PmiREN007931 MIR396 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 82154861 82155020 - TTAAAGTTCTGATCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTGTTTTCCATCATAAAAGAATTAGCTAATAGCTAGATATACGTATATATATATGTGTATGTATATACCATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAACATGATAACAATTCAGGAC .....((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((........))))).....(((((...))))).(((((((((((((....))))))))))))).....))))).))))))))))))))))))).))))).......))))))) 82154881 82155000 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTGTTTTCCATCATAAAAGAATTAGCTAATAGCTAGATATACGTATATATATATGTGTATGTATATACCATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA (((((((((((((((((.((((((((((........))))).....(((((...))))).(((((((((((((....))))))))))))).....))))).))))))))))))))))).. Gar-miR396k 82154980 82155000 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Gar-miR396k* 82154881 82154901 GCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA 3 Gar-MIR397 PmiREN007932 MIR397 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 61381714 61381816 - CTCAGATTGAAGAAACATTGTTGAGTGCAGCGTTGATGAGCTTTTTTTCTGTTTTGATAAGTTCATCAACACTGCATTCAACGATGTTTCTTTTTGCTCTTTC ........((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((.........)).)))))))))))).)))))))))))))))))))))).......... 61381734 61381796 TTGAGTGCAGCGTTGATGAGCTTTTTTTCTGTTTTGATAAGTTCATCAACACTGCATTCAACG ((((((((((.((((((((((((.((.........)).)))))))))))).)))))))))).. Gar-miR397 61381776 61381796 TTGAGTGCAGCGTTGATGAGC Gar-miR397* 61381734 61381754 TCATCAACACTGCATTCAACG 3 Gar-MIR399a PmiREN007933 MIR399 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 26754703 26754841 - TAATGTGCAACTGGATTACAGGGCAAAGTCTCCATTGGCAGGCAGACAACCACTTTAAACGTGCATTTAAAGCTCATGCTTTGATGTAGTGTGCTCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGGCAATTCTTTTGCACTACAAT ....((((((..(((((.(.(((((((.(((((.((((((((.((.((..((((........(((((.(((((....)))))))))))))))))).)))))))).)))))))))))).).)))))..))))))...... 26754723 26754821 GGGCAAAGTCTCCATTGGCAGGCAGACAACCACTTTAAACGTGCATTTAAAGCTCATGCTTTGATGTAGTGTGCTCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG (((((((.(((((.((((((((.((.((..((((........(((((.(((((....)))))))))))))))))).)))))))).)))))))))))).. Gar-miR399a 26754723 26754743 TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG Gar-miR399a* 26754801 26754821 GGGCAAAGTCTCCATTGGCAG 3 Gar-MIR399b PmiREN007934 MIR399 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 47545687 47545799 - TAAGTCCTGAACTGGTTGCAGGGCTTCTCTGCATTGGCAGGTAGATGATAACTCCACATCATGTAGTTAACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTTTAACTGATTCAACTTAATAA (((((..((((.((((((.(((((..((((.(.((((((((((.(((((........))))).).....))))))))).).))))..))))).)))))).))))))))).... 47545707 47545779 GGGCTTCTCTGCATTGGCAGGTAGATGATAACTCCACATCATGTAGTTAACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTT ((((..((((.(.((((((((((.(((((........))))).).....))))))))).).))))..)))).. Gar-miR399b 47545707 47545727 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTT Gar-miR399b* 47545759 47545779 GGGCTTCTCTGCATTGGCAGG 3 Gar-MIR399c PmiREN007935 MIR399 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 52529044 52529159 - TGTGCAGTTGTGAAATAACAGTGCAGTCCTCCTTTGGCACAGAGAAGAACATGGCTTACTTAAAACTTCTGGCTTTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCACTCCTGCAGTTAC ..(((((..(((((....(((.(((((.(((((((((((.(((((((.....((....)).....)))))..)).))))))))))).))))).)))...)))))..)))))..... 52529064 52529139 GTGCAGTCCTCCTTTGGCACAGAGAAGAACATGGCTTACTTAAAACTTCTGGCTTTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG (.(((((.(((((((((((.(((((((.....((....)).....)))))..)).))))))))))).))))).).. Gar-miR399c 52529064 52529084 TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Gar-miR399c* 52529119 52529139 GTGCAGTCCTCCTTTGGCACA 3 Gar-MIR399d PmiREN007936 MIR399 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 52516118 52516265 + GTGCAATAGCAAATATTACAGGGCAATATCTCCATTGGCAGGCGGCCACTTACACAGGCATTCCTTGTCCAACTTCAAACTCAAATGCATTAATACAGTGTGCTCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGGCAATTCTTTTGCACTACAAG ((((((.((...........((((((.((((((.((((((((.(((((((.......(((((..(((........))).....)))))........)))).))).)))))))).)))))))))))).......)).))))))...... 52516138 52516245 GGGCAATATCTCCATTGGCAGGCGGCCACTTACACAGGCATTCCTTGTCCAACTTCAAACTCAAATGCATTAATACAGTGTGCTCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG ((((((.((((((.((((((((.(((((((.......(((((..(((........))).....)))))........)))).))).)))))))).)))))))))))).. Gar-miR399d 52516225 52516245 TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG Gar-miR399d* 52516138 52516158 GGGCAATATCTCCATTGGCAG 3 Gar-MIR399e PmiREN007937 MIR399 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 26767885 26768047 - TAAGGTGCAACTGCATTACAGGGCAATTTCTCCATTGGCAGAATGTCACTTTAAAGCTCATTCTATTTTTTTTTTTTGGTGAAATTTAACGCTCATTCTTTGATGTAGTGTAGTATGCACTCTGCCAAAGGAGATTTGTCCGGCTATTCTTTTGCACTACAAA ...(((((((..(.((....((((((..(((((.((((((((.(((.(((.((((..(((((...............)))))..))))(((((((((....)))).))))))))..))).)))))))).))))).))))))....)).)..)))))))..... 26767905 26768027 GGGCAATTTCTCCATTGGCAGAATGTCACTTTAAAGCTCATTCTATTTTTTTTTTTTGGTGAAATTTAACGCTCATTCTTTGATGTAGTGTAGTATGCACTCTGCCAAAGGAGATTTGTCCGG ((((((..(((((.((((((((.(((.(((.((((..(((((...............)))))..))))(((((((((....)))).))))))))..))).)))))))).))))).)))))).. Gar-miR399e 26767905 26767925 TGCCAAAGGAGATTTGTCCGG Gar-miR399e* 26768006 26768027 GGGCAATTTCTCCATTGGCAGA 3 Gar-MIR399f PmiREN007938 MIR399 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 14565532 14565658 + AGCTAAGTGAACTAGTTGTAGGGCTTCTCTCCTTTGGCAGGTTCATGGTCGTGGATGATAAATCTGGATCTAGTTCAACGAGAACCCGCCAAAGGAGAGTTGCCCTTTAACTGATTCTACTTAATTA ...((((((((.((((((.(((((..((((((((((((.(((((....(((((((((((........)))..)))).))))))))).))))))))))))..))))).)))))).))).))))).... 14565552 14565638 GGGCTTCTCTCCTTTGGCAGGTTCATGGTCGTGGATGATAAATCTGGATCTAGTTCAACGAGAACCCGCCAAAGGAGAGTTGCCCTT ((((..((((((((((((.(((((....(((((((((((........)))..)))).))))))))).))))))))))))..)))).. Gar-miR399f 14565618 14565638 CGCCAAAGGAGAGTTGCCCTT Gar-miR399f* 14565552 14565572 GGGCTTCTCTCCTTTGGCAGG 3 Gar-MIR399g PmiREN007939 MIR399 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 120726723 120726834 - TAATAAGCAAACCAGTCTTAGGGCACCTCTCACTTAGGCAGGTAATGGTGCATATATTTGTTCCCATGACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTGACTGCTTCAGCTTAGCAT ...(((((....(((((.(((((((.(((((.(((.(((((((.((((.(((......)))..)))).))))))).)))))))).))))))).))))).....))))).... 120726743 120726814 GGGCACCTCTCACTTAGGCAGGTAATGGTGCATATATTTGTTCCCATGACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG (((((.(((((.(((.(((((((.((((.(((......)))..)))).))))))).)))))))).))))).. Gar-miR399g 120726743 120726763 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG Gar-miR399g* 120726794 120726814 GGGCACCTCTCACTTAGGCAG 3 Gar-MIR399h PmiREN007940 MIR399 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 120724093 120724246 - GAATAAGCAAACCAGTCAAAGGGCGCCTCTTACTTGGCAGGTAAGTACAGTATTTTGTGCTGTAATTAAGTACATTCAAGGGCTGGTTTCCCAACACTTGGTTTTCACTGACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTGACTGATTCAGCTTAATAT ...(((((....((((((.((((((.(((((..(((((((((...((((((((...))))))))....(((....(((((.(.(((....))).).))))).....))).)))))))))..))))).)))))).)))))).....))))).... 120724113 120724226 GGGCGCCTCTTACTTGGCAGGTAAGTACAGTATTTTGTGCTGTAATTAAGTACATTCAAGGGCTGGTTTCCCAACACTTGGTTTTCACTGACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG (((((.(((((..(((((((((...((((((((...))))))))....(((....(((((.(.(((....))).).))))).....))).)))))))))..))))).))))).. Gar-miR399h 120724113 120724133 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG Gar-miR399h* 120724206 120724226 GGGCGCCTCTTACTTGGCAGG 3 Gar-MIR403a PmiREN007941 MIR403 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 135486713 135486841 + AAAAGAGGAGGCATATTTCAGGTTTGTGCATGAATCTAATAAAACCATAAGCTAGAAAAAGAAGATGGAAAGGTGGATTTGTTTCATGTTAGATTCACGCACAAACTCGTAATCTGTCTTTTCATTTCA ....(((((((((.(((.(.(((((((((.((((((((((....((((...((......))...))))....(((((.....))))))))))))))).))))))))).).))).)))))))))...... 135486733 135486821 GGTTTGTGCATGAATCTAATAAAACCATAAGCTAGAAAAAGAAGATGGAAAGGTGGATTTGTTTCATGTTAGATTCACGCACAAACTCG (((((((((.((((((((((....((((...((......))...))))....(((((.....))))))))))))))).))))))))).. Gar-miR403a 135486801 135486821 TTAGATTCACGCACAAACTCG Gar-miR403a* 135486733 135486753 GGTTTGTGCATGAATCTAATA 3 Gar-MIR403b PmiREN007942 MIR403 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 88733535 88733658 + AAAAGAAGAGCCATGTTTCGGGTTTTGTGCGTGAATCTAATAAAACTGTAATCCACACACAAAAAATGTGGATTTGTTTCATATTAGATTCACGCAGAAACTCGTAATCTGTCTTTTCACTAAT ....((((((.((.(((.((((((((.(((((((((((((((((((...((((((((.........)))))))).))))..))))))))))))))))))))))).))).)).))))))...... 88733555 88733638 GGTTTTGTGCGTGAATCTAATAAAACTGTAATCCACACACAAAAAATGTGGATTTGTTTCATATTAGATTCACGCAGAAACTCG ((((((.(((((((((((((((((((...((((((((.........)))))))).))))..))))))))))))))))))))).. Gar-miR403b 88733618 88733638 TTAGATTCACGCAGAAACTCG Gar-miR403b* 88733555 88733575 GGTTTTGTGCGTGAATCTAAT 3 Gar-MIR408 PmiREN007943 MIR408 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 136572649 136572768 + GATGGGAGAGACAGACAAAGACAGGGAACAGGCTGAGCATGGATGGATCTACCAACTGATTCTGTTGTTTCTCCGCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTGCCTCCTCCATTTTTTTC ((((((.(((.((((......(((((((.((((.(.((((((.((((.....((((.......))))....)))).)))))).).)))).)))))))..)))).))).))))))...... 136572669 136572748 ACAGGGAACAGGCTGAGCATGGATGGATCTACCAACTGATTCTGTTGTTTCTCCGCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT .(((((((.((((.(.((((((.((((.....((((.......))))....)))).)))))).).)))).)))))))... Gar-miR408 136572728 136572748 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT Gar-miR408* 136572669 136572689 ACAGGGAACAGGCTGAGCATG 3 Gar-MIR477 PmiREN007944 MIR477 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 10233559 10233687 - AATCAAGGAGTTTCTCATTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCCCCAACATGCCATGCATGTGGGCTTGATGCTTCAGATGGAAATGCTTGGTGAAGTCCTTAGGGGGAGTGGATGAGACATTGTCTTTCATG ....(((((((.(((((((((((((((((.(((((((((.(((((((.((((.(.((.((((.....)))))))))))..))).)))).)))))))))))))))))))))))))).))).))))..... 10233579 10233667 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCCCCAACATGCCATGCATGTGGGCTTGATGCTTCAGATGGAAATGCTTGGTGAAGTCCTTAGGGGGAGTGG (((((((((.(((((((((.(((((((.((((.(.((.((((.....)))))))))))..))).)))).)))))))))))))))))).. Gar-miR477 10233647 10233667 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCCC Gar-miR477* 10233579 10233599 TGAAGTCCTTAGGGGGAGTGG 3 Gar-MIR482 PmiREN007945 MIR482 Gossypium arboreum Gar-NC_030675.1 129382162 129382284 + GAGTTGCCGGGAGTTTTTGGAAGTGGGATGGGTGGAAAGATTTGTATTTTCTCTCTTGATTTTCTAAGAATGTAAAGCAAATCTTTCCTACTCCTCCCATTCCACTTATTTCCAGTTCTTCCT .((..((.((((((...(((((.(((((.((((((((((((((((.(((.(..(((((......)))))..).))))))))))))))).)))).))))))))))...)))))).)).....)) 129382182 129382264 AAGTGGGATGGGTGGAAAGATTTGTATTTTCTCTCTTGATTTTCTAAGAATGTAAAGCAAATCTTTCCTACTCCTCCCATTCC ((.(((((.((((((((((((((((.(((.(..(((((......)))))..).))))))))))))))).)))).))))))).. Gar-miR482 129382243 129382264 TCTTTCCTACTCCTCCCATTCC Gar-miR482* 129382182 129382202 AAGTGGGATGGGTGGAAAGAT 3 Gar-MIR530a PmiREN007946 MIR530 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 78877643 78877829 - GCTAAGATGTAGCCTTAATCTGCATTTGCACCTGCACCTTCTTGTTTTCTTCAGTTTGGTTCAGCTTCAGAAACTAAAGCATGACAGTCTCATGGCAGATCATGTGTTTATAGCGGTGAAGGAAGATATATTGGAGAGTACAAAGAAGGTGCAGATGTAATTGCAGGTGAATGCCACTTCTACCATG ....(((.((.((....(((((((.(((((.((((((((((((((.(((((((((...(((...(((((....(((..(((((((.(((....))).).)))))).....)))...)))))...)))..))))))))).)).)))))))))))).))))).)))))))....)).)).)))...... 78877663 78877809 TGCATTTGCACCTGCACCTTCTTGTTTTCTTCAGTTTGGTTCAGCTTCAGAAACTAAAGCATGACAGTCTCATGGCAGATCATGTGTTTATAGCGGTGAAGGAAGATATATTGGAGAGTACAAAGAAGGTGCAGATGTAATTGCAGG ((((.(((((.((((((((((((((.(((((((((...(((...(((((....(((..(((((((.(((....))).).)))))).....)))...)))))...)))..))))))))).)).)))))))))))).))))).)))).. Gar-miR530a 78877789 78877809 TGCATTTGCACCTGCACCTTC Gar-miR530a* 78877663 78877683 AGGTGCAGATGTAATTGCAGG 3 Gar-MIR530b PmiREN007947 MIR530 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 103253230 103253389 - GCTAAGATGTAGCTTTTGTCTGCATTTGCACCTGCACCTTATTGTTTGTTTCAGCTATGTCAGAAAAACAAAACACTGTTAAATATGTTTTGTGTGGTGTGGTTGGAGACCAAACAAAGAGGTGCAGATGCAGTTGCAGATGAATGCCATTTTAGCTATC (((((((((..((.((((((((((.(((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((.(....(((((((.(((...))))))))))).))))))))))))))..))))))).))))))))).))))).)))))))))).))))))))))).... 103253250 103253369 TGCATTTGCACCTGCACCTTATTGTTTGTTTCAGCTATGTCAGAAAAACAAAACACTGTTAAATATGTTTTGTGTGGTGTGGTTGGAGACCAAACAAAGAGGTGCAGATGCAGTTGCAGA ((((.(((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((.(....(((((((.(((...))))))))))).))))))))))))))..))))))).))))))))).))))).)))).. Gar-miR530b 103253349 103253369 TGCATTTGCACCTGCACCTTA Gar-miR530b* 103253250 103253270 AGGTGCAGATGCAGTTGCAGA 3 Gar-MIR530c PmiREN008910 MIR530 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 81930984 81931152 + GCTAAGATGTAGCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCACCTTCTTGTTTAATTCTCTGCTTCAGAAGCCAAATGTGTTTGTTTGTGATGTTGATGAAAATAGAATAGGACTAAAACAAAAAATAATAATAAGGTGCAGGTGCAGGCGCAGCTGAATGCCATTTTGGCCTTT ....................(((.(((((((((((((((((((((((..(((((.((.(((.((((.(((....))))))).))).)).)).)))....)))))))).....................))))))))))))))).)))...................... 81931004 81931132 TGCATTTGCACCTGCACCTTCTTGTTTAATTCTCTGCTTCAGAAGCCAAATGTGTTTGTTTGTGATGTTGATGAAAATAGAATAGGACTAAAACAAAAAATAATAATAAGGTGCAGGTGCAGGCGCAGC (((.(((((((((((((((((((((((..(((((.((.(((.((((.(((....))))))).))).)).)).)))....)))))))).....................))))))))))))))).))).. Gar-miR530c 81931004 81931024 TGCATTTGCACCTGCACCTTC Gar-miR530c* 81931112 81931132 AGGTGCAGGTGCAGGCGCAGC 3 Gar-MIR535a PmiREN007948 MIR535 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 12799477 12799596 - AGATATGATACATTATCAATTGACAACGAGAGAGAGCACGTTTGTAGCCATTCATACATGGTCATGGATGCATACAAGCGTGCTCTCTATCGTTGTCATGTGATTTGTACATGTCTCTCC (((((((.((((..((((..(((((((((.((((((((((((((((..(((((((........)))))))..)))))))))))))))).)))))))))..)))).))))))))))).... 12799497 12799576 TGACAACGAGAGAGAGCACGTTTGTAGCCATTCATACATGGTCATGGATGCATACAAGCGTGCTCTCTATCGTTGTCATG (((((((((.((((((((((((((((..(((((((........)))))))..)))))))))))))))).))))))))).. Gar-miR535a 12799556 12799576 TGACAACGAGAGAGAGCACGT Gar-miR535a* 12799497 12799517 GTGCTCTCTATCGTTGTCATG 3 Gar-MIR535b PmiREN007949 MIR535 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 52014380 52014499 - GATTGACACGCATTGTCAATTGACAATGAGAGAGAGCACGCTTGTTGCCATTCATGCAAGGGCATGGATGTATACAAGTGTGCTCTCTGTCGTTGTCATATGATTTGTTCAAAGCTGTCA ...(((((.((.((((((..(((((((((.(((((((((((((((...(((((((((....)))))))))...))))))))))))))).)))))))))..)))......))).))))))) 52014400 52014479 TGACAATGAGAGAGAGCACGCTTGTTGCCATTCATGCAAGGGCATGGATGTATACAAGTGTGCTCTCTGTCGTTGTCATA (((((((((.(((((((((((((((...(((((((((....)))))))))...))))))))))))))).))))))))).. Gar-miR535b 52014459 52014479 TGACAATGAGAGAGAGCACGC Gar-miR535b* 52014400 52014420 GTGCTCTCTGTCGTTGTCATA 3 Gar-MIR827 PmiREN007955 MIR827 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 14354433 14354593 + AAAATGCATTATTGAATGTGTTTGTTTATGGTCATCTAAGCCATTTTTCATCTCGCCAATTCTTTGTTCAAGCAGTTTTTGGATAATCGAACCGATAGAATACACCCGCAGAAATGATGTTTAGATGACCATCAACAAACAACTTCATCTTATTGCATCAA .............(((..((((((((.(((((((((((((((((((((..........((((((((((((((.....)))))))))..........)))))........)))))))..)))))))))))))).))))))))..)))............... 14354453 14354573 TTTGTTTATGGTCATCTAAGCCATTTTTCATCTCGCCAATTCTTTGTTCAAGCAGTTTTTGGATAATCGAACCGATAGAATACACCCGCAGAAATGATGTTTAGATGACCATCAACAAACA ((((((.(((((((((((((((((((((..........((((((((((((((.....)))))))))..........)))))........)))))))..)))))))))))))).)))))).. Gar-miR827 14354553 14354573 TTAGATGACCATCAACAAACA Gar-miR827* 14354453 14354473 TTTGTTTATGGTCATCTAAGC 3 Gar-MIR2111 PmiREN007894 MIR2111 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 77257235 77257343 + TTATACTGGTGAGGACCGGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTATATCAACATGTTTGTTTGTTGAATCTAGTCCTTGGGGTGCAGATTACCTCTTCCTCACTGCAATACAA ........(((((((..((((((((((((((((((((......((((((........)))))).......))))))))))))))))))))..))))))).......... 77257255 77257323 TAATCTGCATCCTGAGGTTTATATCAACATGTTTGTTTGTTGAATCTAGTCCTTGGGGTGCAGATTACC (((((((((((((((((......((((((........)))))).......))))))))))))))))).. Gar-miR2111 77257255 77257275 TAATCTGCATCCTGAGGTTTA Gar-miR2111* 77257303 77257323 GTCCTTGGGGTGCAGATTACC 3 Gar-MIR2118 PmiREN008909 MIR2118 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 92100542 92100658 + GGAAACTTGAGGAAGTCGTCGGCTGTGGTTGATTCGGCAAGAAAATATATCTTGTCTTTTTTATTTTTATTTTTCTTGCCGATTCCACCCATGCCTATTATTTCCTTTACTTTCTCT ....................(((((.(((.((.((((((((((((.........................)))))))))))).)).))))).)))...................... 92100562 92100638 GGCTGTGGTTGATTCGGCAAGAAAATATATCTTGTCTTTTTTATTTTTATTTTTCTTGCCGATTCCACCCATGCCTA (((((.(((.((.((((((((((((.........................)))))))))))).)).))))).))).. Gar-miR2118 92100617 92100638 TTGCCGATTCCACCCATGCCTA Gar-miR2118* 92100562 92100582 GGCTGTGGTTGATTCGGCAAG 3 Gar-MIR2947 PmiREN007895 MIR2947 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 107735297 107735388 - TGCTTTCATTAACAGCAAATTATACCGTGCCCATGACTGTAGCATCACTCGGCAGCTCTATGGGTGTATATTTGCCAGTTCAAGGAAGAGAA ...((((...(((.((((((.((((...((((((((((((...........)))).)).))))))))))))))))..)))....)))).... 107735317 107735368 TATACCGTGCCCATGACTGTAGCATCACTCGGCAGCTCTATGGGTGTATATT .((((...((((((((((((...........)))).)).))))))))))... Gar-miR2947 107735347 107735368 TATACCGTGCCCATGACTGTAG Gar-miR2947* 107735317 107735337 GCAGCTCTATGGGTGTATATT 3 Gar-MIR2948 PmiREN007896 MIR2948 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 100944852 100944965 - GTGCTGTTGGGGGTTGGAGGTGTGGGAGAGTTGGGCAAGAATTATGACCTTTGTTCAATCCAAAGGGGTAATTCTTACCAACCCCTCCCATACCCTTAATTTCCAACCGTTGCT ((((.((((((((((((.((((((((((.(((((..(((((((((..((((((.......)))))).))))))))).)))))..)))))))))).)))))))))))).).))). 100944872 100944945 TGTGGGAGAGTTGGGCAAGAATTATGACCTTTGTTCAATCCAAAGGGGTAATTCTTACCAACCCCTCCCATACC ((((((((.(((((..(((((((((..((((((.......)))))).))))))))).)))))..)))))))).. Gar-miR2948 100944924 100944945 TGTGGGAGAGTTGGGCAAGAAT Gar-miR2948* 100944872 100944892 CTTACCAACCCCTCCCATACC 3 Gar-MIR2949a PmiREN007897 MIR2949 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 67096624 67096745 + CTGTCTTAGTTTGTGTCTTGTCTTTTGAACTGGATTTGCTCACTTGAAATGTGTTTTTGAAGATTTACAAAAGTCAAGCCAGAAAATCCAGTTCAAAAGCCAAAACCGGGCTGAGATTTACG ..(((((((((((.((.(((.((((((((((((((((.((..(((((....(((............)))....)))))..)).)))))))))))))))).))).)))))))))))))..... 67096644 67096725 TCTTTTGAACTGGATTTGCTCACTTGAAATGTGTTTTTGAAGATTTACAAAAGTCAAGCCAGAAAATCCAGTTCAAAAGCCA .((((((((((((((((.((..(((((....(((............)))....)))))..)).))))))))))))))))... Gar-miR2949a 67096644 67096664 TCTTTTGAACTGGATTTGCTC Gar-miR2949a* 67096705 67096725 GAAAATCCAGTTCAAAAGCCA 3 Gar-MIR2949b PmiREN007898 MIR2949 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 67100568 67100689 + CTGTCTTAGTTTGCGTCTTGTCTTTTGAACTGGATTTGCTCACTTGAAATGTGTTTTTGAAGATTTACAAAAGTCAAGCCAGAAAATCCAGTTCAAAAGCCAAAAACGGGCTGAGATTTACG ..(((((((((((....(((.((((((((((((((((.((..(((((....(((............)))....)))))..)).)))))))))))))))).)))...)))))))))))..... 67100588 67100669 TCTTTTGAACTGGATTTGCTCACTTGAAATGTGTTTTTGAAGATTTACAAAAGTCAAGCCAGAAAATCCAGTTCAAAAGCCA .((((((((((((((((.((..(((((....(((............)))....)))))..)).))))))))))))))))... Gar-miR2949b 67100588 67100608 TCTTTTGAACTGGATTTGCTC Gar-miR2949b* 67100649 67100669 GAAAATCCAGTTCAAAAGCCA 3 Gar-MIR2950a PmiREN007899 MIR2950 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 18262437 18262551 - TGACATGGGTTTATGTTATATTCCATCTCTTGCACACTGGACTAGCCAGCTTTTTGTTGGCTTCAGCTTCAGGTTGGTGTGCAGGGGGTGGAATACATCATTGATATCATGGGAT (..((((((((.(((...(((((((((((((((((((..(((((((((((.....))))))).........)))).)))))))))))))))))))...))).))).)))))..). 18262457 18262531 TTCCATCTCTTGCACACTGGACTAGCCAGCTTTTTGTTGGCTTCAGCTTCAGGTTGGTGTGCAGGGGGTGGAATA (((((((((((((((((..(((((((((((.....))))))).........)))).))))))))))))))))).. Gar-miR2950a 18262511 18262531 TTCCATCTCTTGCACACTGGA Gar-miR2950a* 18262457 18262477 TGGTGTGCAGGGGGTGGAATA 3 Gar-MIR2950b PmiREN007900 MIR2950 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 49780250 49780350 - TGACATGGGTTTATGTTATATTCCATCTCTTGCACACTGGACAAGTGCTGGGCTTTAGGCTGGTGTGCAAGGGGTGGAATATATCATTGAATCATGATGTT .(((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((..((((.....))))....)))))))))))))))))))))))).)).))))))...))))) 49780270 49780330 TTCCATCTCTTGCACACTGGACAAGTGCTGGGCTTTAGGCTGGTGTGCAAGGGGTGGAATA ((((((((((((((((((((..((((.....))))....)))))))))))))))))))).. Gar-miR2950b 49780310 49780330 TTCCATCTCTTGCACACTGGA Gar-miR2950b* 49780270 49780290 TGGTGTGCAAGGGGTGGAATA 3 Gar-MIR3267 PmiREN007901 MIR3267 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 26464524 26464646 + ATCAAGGGTTCATGTGGGGTTCTGTCGCAGGGGAGATGGCTGGTCCATTCATGCCTATGCTATGCCATGCATGTATGCATCAACCATCTCATTGTGACAGAACTCCATCCAATCCTTACATTT ....((((((...(((((((((((((((((..(((((((.((((.(((.(((((....((...))...))))).))).)))).))))))).)))))))))))))))))..))))))....... 26464544 26464626 TCTGTCGCAGGGGAGATGGCTGGTCCATTCATGCCTATGCTATGCCATGCATGTATGCATCAACCATCTCATTGTGACAGAAC ((((((((((..(((((((.((((.(((.(((((....((...))...))))).))).)))).))))))).)))))))))).. Gar-miR3267 26464544 26464565 TCTGTCGCAGGGGAGATGGCTG Gar-miR3267* 26464606 26464626 ACCATCTCATTGTGACAGAAC 3 Gar-MIR3476 PmiREN007902 MIR3476 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 67000965 67001101 - AGTATTCCAGTATCTTGATTTGAACTGGGTTTGTTGGCTGCTGATTTGCTTTTTTGAAGCAGATATCAAATCTAGTTAATAAAAACACTTTTCAGGAGCCAACAAATACAGTTCCAACCAGGACTGGGCTGAGATTT (((...((((..(((((.((.((((((.(((((((((((.((((((((((((...)))))))))..........(((......)))......))).))))))))))).)))))).)).))))))))))))....... 67000985 67001081 TGAACTGGGTTTGTTGGCTGCTGATTTGCTTTTTTGAAGCAGATATCAAATCTAGTTAATAAAAACACTTTTCAGGAGCCAACAAATACAGTTCCAA .((((((.(((((((((((.((((((((((((...)))))))))..........(((......)))......))).))))))))))).))))))... Gar-miR3476 67001061 67001081 TGAACTGGGTTTGTTGGCTGC Gar-miR3476* 67000985 67001005 AGCCAACAAATACAGTTCCAA 3 Gar-MIR3627 PmiREN007903 MIR3627 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 99492239 99492368 - AAGAGGAGATTGGGGGAATCTTGTCGCAGGAGAGATGGCACTGAGGGTTTTATATATGCTTTGCTTTTCCTCCCCTTAGCTTAGCTTAGTGCCGTCGCCTTGTGACAAGATACCCTTCAATTTCTTTGTT ..((((((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((((((.............(((..(((............)))..)))))))))))))).)))))))))))))).))).)))))))))))... 99492259 99492348 TTGTCGCAGGAGAGATGGCACTGAGGGTTTTATATATGCTTTGCTTTTCCTCCCCTTAGCTTAGCTTAGTGCCGTCGCCTTGTGACAAGA ((((((((((.(.(((((((((((.............(((..(((............)))..)))))))))))))).))))))))))).. Gar-miR3627 99492327 99492348 TTGTCGCAGGAGAGATGGCACT Gar-miR3627* 99492259 99492279 TGCCGTCGCCTTGTGACAAGA 3 Gar-MIR3954a PmiREN007919 MIR3954 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 57492430 57492560 + TTCAGATCCGGTCCATTTGCTTGGACAGAGTAATCACGGTCGATTAAATACTCTTAATTCTGTTTAGCAAAACAGGTTTCGTTTAAATCAATCGTGTTACTCTGTCCAAACAGATGGTTTGGATCATCGAA ....(((((((.(((((((.(((((((((((((.((((((.((((....((.......(((((((....)))))))....))...)))).))))))))))))))))))).))))))).)))))))...... 57492450 57492540 TTGGACAGAGTAATCACGGTCGATTAAATACTCTTAATTCTGTTTAGCAAAACAGGTTTCGTTTAAATCAATCGTGTTACTCTGTCCAAAC (((((((((((((.((((((.((((....((.......(((((((....)))))))....))...)))).))))))))))))))))))).. Gar-miR3954a 57492450 57492471 TTGGACAGAGTAATCACGGTCG Gar-miR3954a* 57492520 57492540 ATCGTGTTACTCTGTCCAAAC 3 Gar-MIR3954b PmiREN007920 MIR3954 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 34695632 34695774 - TTCAGATCCAGTTCCTTTGTTTGGACAGAGTAATCACGGTCGATTTTCTCTTAATCTATGTTTGAATTATTCTCTCTTTTTTAAACAGATTTTGTTGAATCAACCGTGTTACTCTGTCTAATCAGATGTATTGGATCATCAAC ....((((((((.(.((((.(((((((((((((.((((((.(((((...(..(((((..(((((((.............))))))))))))..)..))))).))))))))))))))))))).)))).).))))))))...... 34695652 34695754 TTGGACAGAGTAATCACGGTCGATTTTCTCTTAATCTATGTTTGAATTATTCTCTCTTTTTTAAACAGATTTTGTTGAATCAACCGTGTTACTCTGTCTAATC (((((((((((((.((((((.(((((...(..(((((..(((((((.............))))))))))))..)..))))).))))))))))))))))))).. Gar-miR3954b 34695733 34695754 TTGGACAGAGTAATCACGGTCG Gar-miR3954b* 34695652 34695672 ACCGTGTTACTCTGTCTAATC 3 Gar-MIR7484a PmiREN007950 MIR7484 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 56963116 56963276 - ATTATTCTATTAAAGTTTTTATTTATTTCTATTGTTAAAAACTGATTCATATATGTCAGCATGATATATATGTGGCAAGTCTTGTGTAAATTTTTGGATATTTTATTAGTCATGCCACATTTTAATGGTAGAAATGGATGAAAATTTCAACTAAAATATCT ............((((((((((((((((((((((((((((........((((((((((...))))))))))((((((.(.((.(((.((((........))))))).)).).)))))).)))))))))))))))))))))))))))).............. 56963136 56963256 ATTTATTTCTATTGTTAAAAACTGATTCATATATGTCAGCATGATATATATGTGGCAAGTCTTGTGTAAATTTTTGGATATTTTATTAGTCATGCCACATTTTAATGGTAGAAATGGATGA ((((((((((((((((((((........((((((((((...))))))))))((((((.(.((.(((.((((........))))))).)).).)))))).)))))))))))))))))))).. Gar-miR7484a 56963136 56963156 TTTAATGGTAGAAATGGATGA Gar-miR7484a* 56963236 56963256 ATTTATTTCTATTGTTAAAAA 3 Gar-MIR7484b PmiREN008911 MIR7484 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 33580559 33580699 + GTCTTTCTATTGAAAATTTCATCCATCTCTATTGTTAAAAACTGGCTCATGTACGTTTGAAAGAGGTAACTGCCTGGTTATTTTTTCATCTATGTTGGTTTTTAATGGTAGAAATGGATGAAGATTTTAACAAAAGAAGAC ....................((((((.(((((((((((((((((((....(((.(..((((((((.(((((....))))))))))))).))))))))))))))))))))))).))))))...................... 33580579 33580679 ATCCATCTCTATTGTTAAAAACTGGCTCATGTACGTTTGAAAGAGGTAACTGCCTGGTTATTTTTTCATCTATGTTGGTTTTTAATGGTAGAAATGGATGA ((((((.(((((((((((((((((((....(((.(..((((((((.(((((....))))))))))))).))))))))))))))))))))))).)))))).. Gar-miR7484b 33580659 33580679 TTTAATGGTAGAAATGGATGA Gar-miR7484b* 33580579 33580599 ATCCATCTCTATTGTTAAAAA 3 Gar-MIR7505a PmiREN007951 MIR7505 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 14645602 14645732 + GCAATTTATAGTACTGTTATCTACAGCTTTAGAAATCATCCCTTTTTTAGATGTGTAAATATATAAATAAATTGAAGCACGTTGCTAGAAAGGGATGATTTCTAAAGCTCTAGAAAACGTTATTACAACGA ...................((((.(((((((((((((((((((((((..(((((((....................)))))))...))))))))))))))))))))))).))))...((((.....)))). 14645622 14645712 ACAGCTTTAGAAATCATCCCTTTTTTAGATGTGTAAATATATAAATAAATTGAAGCACGTTGCTAGAAAGGGATGATTTCTAAAGCTCTAG (.(((((((((((((((((((((((..(((((((....................)))))))...))))))))))))))))))))))).))) Gar-miR7505a 14645622 14645642 ACAGCTTTAGAAATCATCCCT Gar-miR7505a* 14645692 14645712 GGATGATTTCTAAAGCTCTAG 3 Gar-MIR7505b PmiREN007952 MIR7505 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 14645786 14645913 + GCAATATTGTTATCTACGGCTTCAGAGACCATCCCTTGCTTGCTAAATTAATGGAATCTGTAATCTACAGATTGACGCCCCTTGCAAGGAAGGAATGGTTTCTGAAGCTTTAGGTAACTTTATCACGA ........((((((((.(((((((((((((((.((((.(((((...........((((((((...))))))))..........))))).)))).))))))))))))))).)))))))).......... 14645806 14645893 TTCAGAGACCATCCCTTGCTTGCTAAATTAATGGAATCTGTAATCTACAGATTGACGCCCCTTGCAAGGAAGGAATGGTTTCTGAAGC ((((((((((((.((((.(((((...........((((((((...))))))))..........))))).)))).)))))))))))).. Gar-miR7505b 14645806 14645826 TTCAGAGACCATCCCTTGCTT Gar-miR7505b* 14645873 14645893 GGAAGGAATGGTTTCTGAAGC 3 Gar-MIR7505c PmiREN007953 MIR7505 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 14556062 14556183 + CGTCTATAATATTGTTATCTACAGCTTTAGAAATCATTCCTTCCTTGTTTAATGTACAGATACACACATATAACAAGGAATGGATGATTTCTAAAGCTTTAGATAGCTTTATCATGATGAGG ((((.((.(((..((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((..((((..........))))..))))))))).))))))))))))))))).))))))))..))).))))))... 14556082 14556163 ACAGCTTTAGAAATCATTCCTTCCTTGTTTAATGTACAGATACACACATATAACAAGGAATGGATGATTTCTAAAGCTTTAG (.(((((((((((((((((.(((((((((..((((..........))))..))))))))).))))))))))))))))).).. Gar-miR7505c 14556082 14556102 ACAGCTTTAGAAATCATTCCT Gar-miR7505c* 14556143 14556163 GGATGATTTCTAAAGCTTTAG 3 Gar-MIR7508 PmiREN007954 MIR7508 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 129969826 129969954 - CTCCATTGTTGGCAGGAAGCAAGAAAAGAAGTCGGGAGAAGAGTTTTCGATCGGTTCCCTTTAGCTTCTCAAAACTTATCTGAAATTCTTTCCCGGCTTCTTTTCTTGCTTTCTTTTTATTGTTCGTTT ..(((....))).((((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((.((((................)))).))).)))))))))))))))))))))))))))))))))............... 129969846 129969934 AAGAAAAGAAGTCGGGAGAAGAGTTTTCGATCGGTTCCCTTTAGCTTCTCAAAACTTATCTGAAATTCTTTCCCGGCTTCTTTTCTTGC (((((((((((((((((((.(((((((.(((.((((................)))).))).)))))))))))))))))))))))))).. Gar-miR7508 129969914 129969934 AAGAAAAGAAGTCGGGAGAAG Gar-miR7508* 129969846 129969866 TTTCCCGGCTTCTTTTCTTGC 3 Gar-MIR8633 PmiREN007956 MIR8633 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 57256343 57256550 + GAAAGTTTATGAAGGACAACTAAGTGAAGAAAGAGGTAGGTTTGAAGAAGAAGATGGTAAGCTGAGTTTAAGAGGAATGGTGAACTTAATTGAGATCATCTTCTCCTAGTTTTCGTCACATGAACCTTTCTTCATTTAGATCTTCAAATCCACCTTAGATCTTCAAACCAGCCTTTTCTTCACTTAGTTGTCCTTCCAAACATGAACC ....(((((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((((..(((.(((.....(((((((((((((((.((((((((.....((((......))))..)))))...........))).))))))..))))))..)))...))).)))...)))))))))).)))))))))))))))))))))))))).....))))).) 57256363 57256530 TAAGTGAAGAAAGAGGTAGGTTTGAAGAAGAAGATGGTAAGCTGAGTTTAAGAGGAATGGTGAACTTAATTGAGATCATCTTCTCCTAGTTTTCGTCACATGAACCTTTCTTCATTTAGATCTTCAAATCCACCTTAGATCTTCAAACCAGCCTTTTCTTCACTTAGT (((((((((((.(((((.((((((((((..(((.(((.....(((((((((((((((.((((((((.....((((......))))..)))))...........))).))))))..))))))..)))...))).)))...)))))))))).)))))))))))))))).. Gar-miR8633 57256363 57256384 TAAGTGAAGAAAGAGGTAGGTT Gar-miR8633* 57256510 57256530 CCAGCCTTTTCTTCACTTAGT 3 Gar-MIR8634a PmiREN007957 MIR8634 Gossypium arboreum Gar-NC_030669.1 8081298 8081478 + TAGATTGACGCTCGTATTTTACTTGGTATGGAGGATGGAAAAGAGTGAGGACGGAAAATTTGTTAATCAAATTATTAAAATTCATAATCACTTTTTAGTTTGTATTTTAACCATAAGATTGTGAAATTTTCATTTTCAATCTTTTATACCCTTCATATCAAGCAGAGTCTTAAAGGTTTTT ...............(((((.(((((((((((((.((.((((((.((((((..((((((((..(((((..((..(((((((..((((..(((....))))))))))))))..))..)))))..)))))))).)))))).)))))).)).))))))))))))).)))))............. 8081318 8081458 TTGGTATGGAGGATGGAAAAGAGTGAGGACGGAAAATTTGTTAATCAAATTATTAAAATTCATAATCACTTTTTAGTTTGTATTTTAACCATAAGATTGTGAAATTTTCATTTTCAATCTTTTATACCCTTCATATCAAGC ((((((((((((.((.((((((.((((((..((((((((..(((((..((..(((((((..((((..(((....))))))))))))))..))..)))))..)))))))).)))))).)))))).)).))))))))))))). Gar-miR8634a 8081318 8081338 TTGGTATGGAGGATGGAAAAG Gar-miR8634a* 8081438 8081458 TTTATACCCTTCATATCAAGC 3 Gar-MIR8634b PmiREN007958 MIR8634 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 40557298 40557462 + TTCAAAGTCCTTAAGGCTCTGCTTGGTATGGAGGATGGAAAAGAGTGAGGAATGGTTAAGCTACAAAGTAAGAAAATGGTTATGAATCTTAACCATTTGATTTAACAAATTTTCCATCCTCACTCTTTTTCATCCTTCATACCAAGCAAAGGCTAAGCTCTTGGA ....(((..((((.(.((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((..((..........((..(((((((((.......)))))))))..)).......))..))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))))..)))... 40557318 40557442 TTGGTATGGAGGATGGAAAAGAGTGAGGAATGGTTAAGCTACAAAGTAAGAAAATGGTTATGAATCTTAACCATTTGATTTAACAAATTTTCCATCCTCACTCTTTTTCATCCTTCATACCAAGC (((((((((((((((((((((((((((((.(((..((..........((..(((((((((.......)))))))))..)).......))..)))))))))))))))))))))))))))))))))) Gar-miR8634b 40557318 40557338 TTGGTATGGAGGATGGAAAAG Gar-miR8634b* 40557422 40557442 TTTTCATCCTTCATACCAAGC 3 Gar-MIR8634c PmiREN007959 MIR8634 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 63661819 63661983 + TTCAAAGTCCTTAAGGCTCTGCTTGGTATGGAGGATGGAAAAGAGTGAGGAATGGTTAAGCTACAAAGTAAGAAAATGGTTATGAATCTTAACCATTTGATTTAACAAATTTTCCATCCTCACTCTTTTTCATCCTTCATACCAAGCAAAGGCTAAGCTCTTGGA ....(((..((((.(.((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((..((..........((..(((((((((.......)))))))))..)).......))..))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))))..)))... 63661839 63661963 TTGGTATGGAGGATGGAAAAGAGTGAGGAATGGTTAAGCTACAAAGTAAGAAAATGGTTATGAATCTTAACCATTTGATTTAACAAATTTTCCATCCTCACTCTTTTTCATCCTTCATACCAAGC (((((((((((((((((((((((((((((.(((..((..........((..(((((((((.......)))))))))..)).......))..)))))))))))))))))))))))))))))))))) Gar-miR8634c 63661839 63661859 TTGGTATGGAGGATGGAAAAG Gar-miR8634c* 63661943 63661963 TTTTCATCCTTCATACCAAGC 3 Gar-MIR8634d PmiREN007960 MIR8634 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 13641935 13642100 + TGCAAGGGCTCTAAGGCTCTGCTTGGTATGGAGGATGGAAAAGAGTGATGATGGAAAATTTTTCAATCTAATGGTTAAGCTACAAAGTAAGAAAATGGTTATGAATCTTAACATTTGATTAACAAATTTTCCATCCTCCATACCAAGCCGAACCTAAGGGCTCTAA ....((((((((.(((.((.(((((((((((((((((((((((((.(((........))).)))((((.((..((((((.......((((........))))....))))))..))))))......)))))))))))))))))))))).)).))).)))))))).. 13641955 13642080 TTGGTATGGAGGATGGAAAAGAGTGATGATGGAAAATTTTTCAATCTAATGGTTAAGCTACAAAGTAAGAAAATGGTTATGAATCTTAACATTTGATTAACAAATTTTCCATCCTCCATACCAAGC (((((((((((((((((((((((.(((........))).)))((((.((..((((((.......((((........))))....))))))..))))))......)))))))))))))))))))))) Gar-miR8634d 13641955 13641975 TTGGTATGGAGGATGGAAAAG Gar-miR8634d* 13642060 13642080 TTTCCATCCTCCATACCAAGC 3 Gar-MIR8636 PmiREN007961 MIR8636 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 48392158 48392379 - TTGAAGTGTTGGCTGTCGACCGGACCCTCGAACAGTGGAGGTGTTTTGCTAAGTGGTAGGCCAAAAATGCTAAAAACATTAGGCGCTGCAGTCAAACTCTGTAAACCCCTTTGGGTTTTCCTTGGATTAGGGAGACAAAACACGGGTCTAAAACCGAGCATAGACACCCGGGCACAATACCTCCATTGTTTGAGGTTCCGATCAGCTGCTCAGTGGATGATA ......(((((((.((.((.((((.((((((((((((((((((((.((((..((((((((((...((((.......)))).))).)))).......(((.((..((((..((..((((((((......))))))))..))...)))).....)).)))......)))...)))).)))))))))))))))))))).)))).)).)).)))........)))) 48392178 48392359 CGGACCCTCGAACAGTGGAGGTGTTTTGCTAAGTGGTAGGCCAAAAATGCTAAAAACATTAGGCGCTGCAGTCAAACTCTGTAAACCCCTTTGGGTTTTCCTTGGATTAGGGAGACAAAACACGGGTCTAAAACCGAGCATAGACACCCGGGCACAATACCTCCATTGTTTGAGGTTCCGAT ((((.((((((((((((((((((((.((((..((((((((((...((((.......)))).))).)))).......(((.((..((((..((..((((((((......))))))))..))...)))).....)).)))......)))...)))).)))))))))))))))))))).)))).. Gar-miR8636 48392339 48392359 CGGACCCTCGAACAGTGGAGG Gar-miR8636* 48392178 48392198 TCCATTGTTTGAGGTTCCGAT 3 Gar-MIRN169 PmiREN007968 MIRN169 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 69350558 69350666 - TATGCCAGGTGCCCACTAGAGTTCCCTCCGGCACTTCAGTTTATTTGTCAAAACTTCTTTGCTGTTTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCGGTTGCCATCTGAGATGGT ..............(((.((((((((((.(((((((((((..((..(.((((.....))))).))..))))))))))).)))))))))).))).((((((...)))))) 69350578 69350646 GTTCCCTCCGGCACTTCAGTTTATTTGTCAAAACTTCTTTGCTGTTTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC ((((((((.(((((((((((..((..(.((((.....))))).))..))))))))))).)))))))).. Gar-miRN169 69350626 69350646 GTTCCCTCCGGCACTTCAGTT Gar-miRN169* 69350578 69350598 CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC 3 Gar-MIRN1373a PmiREN007962 MIRN1373 Gossypium arboreum Gar-NC_030664.1 79043605 79043746 + AACCAGTTCCGTCTTATATTTCTACTTTAACAATATTCTTATTTTCTTCTTTGCCCGTTGGGTTTCTGTATAATTACACTATTGTTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAATATAAGAAAATATTGTATAA ...((((....(((((((((((((((((((((((((((.((..((((.....((((...))))...((((....))))..((((....)))).))))..)).)))))))))))))))))))))))))))....))))..... 79043625 79043726 TCTACTTTAACAATATTCTTATTTTCTTCTTTGCCCGTTGGGTTTCTGTATAATTACACTATTGTTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAA ((((((((((((((((((.((..((((.....((((...))))...((((....))))..((((....)))).))))..)).)))))))))))))))))).. Gar-miRN1373a 79043706 79043726 TGAATATTGTTAAAGTAGAAA Gar-miRN1373a* 79043625 79043645 TCTACTTTAACAATATTCTTA 3 Gar-MIRN1373b PmiREN007963 MIRN1373 Gossypium arboreum Gar-NC_030672.1 48145585 48145726 - AACCAGTTCCGTCTTATATTTCTACTTTAACAATATTCATATTTTCTTCTTCGCCCATTGGGTTTCTGTATAATTACACTATTGTTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAATATAAGAAAATATTGTATAA ...((((....((((((((((((((((((((((((((((((..((((.....((((...))))...((((....))))..((((....)))).))))..))))))))))))))))))))))))))))))....))))..... 48145605 48145706 TCTACTTTAACAATATTCATATTTTCTTCTTCGCCCATTGGGTTTCTGTATAATTACACTATTGTTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAA (((((((((((((((((((((..((((.....((((...))))...((((....))))..((((....)))).))))..))))))))))))))))))))).. Gar-miRN1373b 48145605 48145625 TGAATATTGTTAAAGTAGAAA Gar-miRN1373b* 48145686 48145706 TCTACTTTAACAATATTCATA 3 Gar-MIRN1373c PmiREN007965 MIRN1373 Gossypium arboreum Gar-NW_016621643.1 172 313 + AACCAGTTCCGTCTTATATTTCTACTTCAACAATATTCATATTTTCTTCTTCGCCCATTGGGTTTCTGTATAATTACACTATTGCTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAATATAAGAAAATATTGTATAA ...((((....((((((((((((((((.(((((((((((((..((((..((.((.((.(((.....((((....))))))).))..)).))..))))..))))))))))))).))))))))))))))))....))))..... 192 293 TCTACTTCAACAATATTCATATTTTCTTCTTCGCCCATTGGGTTTCTGTATAATTACACTATTGCTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAA (((((((.(((((((((((((..((((..((.((.((.(((.....((((....))))))).))..)).))..))))..))))))))))))).))))))).. Gar-miRN1373c 273 293 TGAATATTGTTAAAGTAGAAA Gar-miRN1373c* 192 212 TCTACTTCAACAATATTCATA 3 Gar-MIRN1373d PmiREN007966 MIRN1373 Gossypium arboreum Gar-NW_016635472.1 50765 50906 - ATACAATATTTTCTTCTATTTCTACTTTAACAATATTCATAAGTTCTGATTGGCAACAATAGTGTAATTATACAGAAACCCAACAGGCGAAGAAGAAAATATGAATATTGTTAAAGTAGAAATATAAGACGGAACTGGTTGA ................(((((((((((((((((((((((((..((((..((.((........((((....))))............)).))..))))..))))))))))))))))))))))))).................. 50785 50886 TCTACTTTAACAATATTCATAAGTTCTGATTGGCAACAATAGTGTAATTATACAGAAACCCAACAGGCGAAGAAGAAAATATGAATATTGTTAAAGTAGAAA (((((((((((((((((((((..((((..((.((........((((....))))............)).))..))))..))))))))))))))))))))).. Gar-miRN1373d 50785 50805 TGAATATTGTTAAAGTAGAAA Gar-miRN1373d* 50866 50886 TCTACTTTAACAATATTCATA 3 Gar-MIRN1373e PmiREN007967 MIRN1373 Gossypium arboreum Gar-NW_016636232.1 19102 19243 - ATACAATATTTTCTTATATTTCTACTTTAACAATATTCATAAGTTCTGATTGGCAACAATAGTGTAATTATACAGAAACCCAACGGGCGAAGAAGAAAATATGAATATTGTTAAAGTAGAAATATAAGACGGAACTGGTTGA ...........((((((((((((((((((((((((((((((..((((..((.((.......((((....)))).....((....)))).))..))))..))))))))))))))))))))))))))))))............. 19122 19223 TCTACTTTAACAATATTCATAAGTTCTGATTGGCAACAATAGTGTAATTATACAGAAACCCAACGGGCGAAGAAGAAAATATGAATATTGTTAAAGTAGAAA (((((((((((((((((((((..((((..((.((.......((((....)))).....((....)))).))..))))..))))))))))))))))))))).. Gar-miRN1373e 19122 19142 TGAATATTGTTAAAGTAGAAA Gar-miRN1373e* 19203 19223 TCTACTTTAACAATATTCATA 3 Gar-MIRN1373f PmiREN007973 MIRN1373 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 70592617 70592758 + AACCAGTTCCGTCTTATATTTCTACTTCAACAATATTCATATTTTCTTCTTCGCCCATTGGGTTTCTGTATAATTACACTATTGCTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAATATAAGAAAATATTGTATAA ...((((....((((((((((((((((.(((((((((((((..((((..((.((.((.(((.....((((....))))))).))..)).))..))))..))))))))))))).))))))))))))))))....))))..... 70592637 70592738 TCTACTTCAACAATATTCATATTTTCTTCTTCGCCCATTGGGTTTCTGTATAATTACACTATTGCTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAA (((((((.(((((((((((((..((((..((.((.((.(((.....((((....))))))).))..)).))..))))..))))))))))))).))))))).. Gar-miRN1373f 70592718 70592738 TGAATATTGTTAAAGTAGAAA Gar-miRN1373f* 70592637 70592657 TCTACTTCAACAATATTCATA 3 Gar-MIRN1373g PmiREN007980 MIRN1373 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 105941626 105941768 - AACCAGTTCTGTCTTATATTTCTACTTTAACAATATTCAAATTTTCTTCTTCGCCTGTTGGGTTTCTGTATAAATTACACTATTGTTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAATATAAGAAAATATTGTATAA ...........((((((((((((((((((((((((((((.............((((...))))(((((........(((....))).......)))))....))))))))))))))))))))))))))))............. 105941646 105941748 TCTACTTTAACAATATTCAAATTTTCTTCTTCGCCTGTTGGGTTTCTGTATAAATTACACTATTGTTGCCAATCAGAACTTATGAATATTGTTAAAGTAGAAA (((((((((((((((((((.............((((...))))(((((........(((....))).......)))))....))))))))))))))))))).. Gar-miRN1373g 105941646 105941666 TGAATATTGTTAAAGTAGAAA Gar-miRN1373g* 105941728 105941748 TCTACTTTAACAATATTCAAA 3 Gar-MIRN1374 PmiREN007964 MIRN1374 Gossypium arboreum Gar-NC_030676.1 102753263 102753400 - AGGATTCTAGAAAGCTCGTGGGATGGGTGAGGGGGTAAGACAATGGACTGTTTCAGTCTTTTGGAAACAGAAATAAAGAAGAAGGCTGGTTTATGTCTTGCCTACTCCGCCCATGCCACTGGTTTCCTGGTGTTCCTC ((((..((((.(((((.((((.(((((((((.((((((((((.(((((.....(((((((((.................)))))))))))))))))))))))).)).))))))).)))).))))).))))...)))). 102753283 102753380 GGATGGGTGAGGGGGTAAGACAATGGACTGTTTCAGTCTTTTGGAAACAGAAATAAAGAAGAAGGCTGGTTTATGTCTTGCCTACTCCGCCCATGCCA (.(((((((((.((((((((((.(((((.....(((((((((.................)))))))))))))))))))))))).)).))))))).).. Gar-miRN1374 102753360 102753380 GGATGGGTGAGGGGGTAAGAC Gar-miRN1374* 102753283 102753303 TTGCCTACTCCGCCCATGCCA 3 Gar-MIRN1375 PmiREN007969 MIRN1375 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 69238165 69238406 - TTGGCAAATTAGTCTTTGTACATTAGATCAAAGGGCAAACTAGTCCTATTAAAAATTTCATCCATTTTTGCTGATAAAAACTGGTCTTTGTACATTAGCATGAGGTACATGTGGCATGCCACGAGTCATTATCTGATTATTTTATCAACCACTTTAGTTTTTAACATTACAAATGGATGAAATTTTAACAAAAAGGATCAATTCGCTTTTTAATCTAATGTATAGGTACTAATTTGCCCCTT ..(((((((((((.((((((((((((((.(((((((......(((((....((((((((((((((((.((.((.(((((((((((....(((.(((((.((((.(.((.(((((....))))).))).)))))))))))).......))).....)))))))).)).)).)))))))))))))))).......)))))......))))))).)))))))))))))).))))))))))).... 69238185 69238386 CATTAGATCAAAGGGCAAACTAGTCCTATTAAAAATTTCATCCATTTTTGCTGATAAAAACTGGTCTTTGTACATTAGCATGAGGTACATGTGGCATGCCACGAGTCATTATCTGATTATTTTATCAACCACTTTAGTTTTTAACATTACAAATGGATGAAATTTTAACAAAAAGGATCAATTCGCTTTTTAATCTAATGTA ((((((((.(((((((......(((((....((((((((((((((((.((.((.(((((((((((....(((.(((((.((((.(.((.(((((....))))).))).)))))))))))).......))).....)))))))).)).)).)))))))))))))))).......)))))......))))))).)))))))).. Gar-miRN1375 69238366 69238386 CATTAGATCAAAGGGCAAACT Gar-miRN1375* 69238185 69238205 TTCGCTTTTTAATCTAATGTA 3 Gar-MIRN1376 PmiREN007970 MIRN1376 Gossypium arboreum Gar-NC_030665.1 17114665 17114812 + AATGGAACATTTGGAAAATTTGCCAAATCAGGTAAGCGAAAGGTGTTTGCAGGCAGCAGAGTTTTGAGGGTAGTTTTCATCCTCTCATCACTCTACTCCCAGATTATTCGCTTCCCTAATTTGGACGATTTTACTTGCGCTCCTTCTT (..(((.(....((((((((..((((((.(((.(((((((....(((((..((.((.(((((..((((((...........))))))..))))).)))))))))..))))))).))).))))))..)))))).))...).)))...). 17114685 17114792 TGCCAAATCAGGTAAGCGAAAGGTGTTTGCAGGCAGCAGAGTTTTGAGGGTAGTTTTCATCCTCTCATCACTCTACTCCCAGATTATTCGCTTCCCTAATTTGGACGA ..((((((.(((.(((((((....(((((..((.((.(((((..((((((...........))))))..))))).)))))))))..))))))).))).)))))).... Gar-miRN1376 17114771 17114792 TTCGCTTCCCTAATTTGGACGA Gar-miRN1376* 17114685 17114705 TGCCAAATCAGGTAAGCGAAA 3 Gar-MIRN1377 PmiREN007971 MIRN1377 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 81760055 81760161 + TGTACATGCAACCCTTTTTCACTCTCTTCCAAAGGCTTTGAGCTGCTATATGAAACAATCATAGTTCAAAGTCTTGGGAGAGAGTGAAGAAAAGTTGTCATGATTTT ....((((((((..((((((((((((((((((.(((((((((((.....((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))..)))).))))..... 81760075 81760141 ACTCTCTTCCAAAGGCTTTGAGCTGCTATATGAAACAATCATAGTTCAAAGTCTTGGGAGAGAGTGA ((((((((((((.(((((((((((.....((((.....))))))))))))))))))))))))))).. Gar-miRN1377 81760075 81760096 ACTCTCTTCCAAAGGCTTTGAG Gar-miRN1377* 81760121 81760141 CAAAGTCTTGGGAGAGAGTGA 3 Gar-MIRN1378 PmiREN007972 MIRN1378 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 130021516 130021696 - GGATCTTCAACAGCTTGAGAGGGACGTCTGAAGTACAGAGTGATGAACGAACTTCCATTGATACCCGGTGAACTGTGGAATGAAGCAAGATCGTTTCCCGGTTTCTTTTTTTGCTTCCGTCGGTCAGATAGTTCGTCTCCTTTGTACTTTAGATGTCTCTCTCATGCTGTTTGAAGTTGTT .....(((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((.((.((((((....(((((...(((.((((((.(((((((.......))))))).))))))............)))...)))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))...... 130021536 130021676 GGGACGTCTGAAGTACAGAGTGATGAACGAACTTCCATTGATACCCGGTGAACTGTGGAATGAAGCAAGATCGTTTCCCGGTTTCTTTTTTTGCTTCCGTCGGTCAGATAGTTCGTCTCCTTTGTACTTTAGATGTCTCTC ((((((((((((((((((((.((.((.((((((....(((((...(((.((((((.(((((((.......))))))).))))))............)))...)))))..)))))))))))))))))))))))))))))).. Gar-miRN1378 130021536 130021556 TTTGTACTTTAGATGTCTCTC Gar-miRN1378* 130021656 130021676 GGGACGTCTGAAGTACAGAGT 3 Gar-MIRN1379 PmiREN007974 MIRN1379 Gossypium arboreum Gar-NC_030674.1 28569709 28569802 - GCACATAGATGAGGCAGTCGTGGATTTGTTCGATCGCGTTGGTAAGCAAAATACACCGGTACCAGCAATCCTAGCTGAGACATTTAGATCTTTG .......((((...(((.(..(((((.(((.(((((.((..(((.......))))))))).).))))))))..))))...)))).......... 28569729 28569782 TGGATTTGTTCGATCGCGTTGGTAAGCAAAATACACCGGTACCAGCAATCCTAG .(((((.(((.(((((.((..(((.......))))))))).).))))))))... Gar-miRN1379 28569761 28569782 TGGATTTGTTCGATCGCGTTGG Gar-miRN1379* 28569729 28569749 CACCGGTACCAGCAATCCTAG 3 Gar-MIRN1380 PmiREN007975 MIRN1380 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 10238545 10238680 - AATCAAGGCTTTTCTCGTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCCCCAACATGACATGCATGGTGCTAGCTTAATGCTGCCTGCATATGGAAATGCTTGGCGAAGTCCTTAGGGGGGGTGCATGAGACATTATTGTCTTGT ....(((((..(((((((.((((((((((.(((((((((.(((((((..((((((.(((...(((.....))))))))))..))...))).)))).))))))))))))))))))).))))))....)..))))).. 10238565 10238660 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCCCCAACATGACATGCATGGTGCTAGCTTAATGCTGCCTGCATATGGAAATGCTTGGCGAAGTCCTTAGGGGGGGTGC (((((((((.(((((((((.(((((((..((((((.(((...(((.....))))))))))..))...))).)))).)))))))))))))))))).. Gar-miRN1380 10238565 10238585 CGAAGTCCTTAGGGGGGGTGC Gar-miRN1380* 10238640 10238660 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCCC 3 Gar-MIRN1381 PmiREN007976 MIRN1381 Gossypium arboreum Gar-NC_030673.1 31317997 31318107 + TGGGATGGAAATCATTGCTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGAATTTGCCTGTGTTTAAGGGCTTAAACTGAAGCGCTGGAGGGTAGAGTGGATAATGTTCACCATTCTTTC .(((((((....(((((.((((((((((((.((.(((((.......((((........)))).......))))).)).))))).))))))).)))))....)))))))... 31318017 31318087 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGAATTTGCCTGTGTTTAAGGGCTTAAACTGAAGCGCTGGAGGGTAGAGTGG ((((((((((.((.(((((.......((((........)))).......))))).)).))))).))))).. Gar-miRN1381 31318066 31318087 GAAGCGCTGGAGGGTAGAGTGG Gar-miRN1381* 31318017 31318037 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTG 3 Gar-MIRN1382 PmiREN007977 MIRN1382 Gossypium arboreum Gar-NC_030666.1 22348262 22348429 - TGAATATTTGTATCAGAATATCGAGAATGACTATAGGTGACAGATGATAACATATTGAGATGTGAAGGCAGGGACCGGATAAATGAAAGTAATCCTGTCTTCACATTTCACTATGTTACCTATTTGTCGCCTATAATCAATTTCGATATTCTATTACAAGTATCCATC ((.(((((((((..((((((((((((.(((.(((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((.....................))))))))))))))))).)))))))..))))))))))))))).))).))))))))))))..))))))))).)).. 22348282 22348409 TCGAGAATGACTATAGGTGACAGATGATAACATATTGAGATGTGAAGGCAGGGACCGGATAAATGAAAGTAATCCTGTCTTCACATTTCACTATGTTACCTATTTGTCGCCTATAATCAATTTCGATA ((((((.(((.(((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((.....................))))))))))))))))).)))))))..))))))))))))))).))).)))))).. Gar-miRN1382 22348389 22348409 TCGAGAATGACTATAGGTGAC Gar-miRN1382* 22348282 22348302 CGCCTATAATCAATTTCGATA 3 Gar-MIRN1383 PmiREN007978 MIRN1383 Gossypium arboreum Gar-NC_030667.1 8449301 8449447 - AGGAAGGGATGGTAAAATACGGCTGCTAGTTCATGGATGCCCCTGGATGCGTACTTTAGCCAGCATTAAACATCGAAAGCCAGGCCGAGGATGCGCAAGCTAAGGGTTTGCATGAACTAGGAGACGTCATTACCTTGATTTTTTAGG (((....((.(((((...(((.((.((((((((((.(.((((.(((.((((((((((.(((.((.((........)).))..))).)))).))))))..))).)))).).)))))))))).)).)))..)))))))..)))...... 8449321 8449427 GGCTGCTAGTTCATGGATGCCCCTGGATGCGTACTTTAGCCAGCATTAAACATCGAAAGCCAGGCCGAGGATGCGCAAGCTAAGGGTTTGCATGAACTAGGAGACGT (.((.((((((((((.(.((((.(((.((((((((((.(((.((.((........)).))..))).)))).))))))..))).)))).).)))))))))).)).).. Gar-miRN1383 8449321 8449341 TTTGCATGAACTAGGAGACGT Gar-miRN1383* 8449407 8449427 GGCTGCTAGTTCATGGATGCC 3 Gar-MIRN1384 PmiREN007979 MIRN1384 Gossypium arboreum Gar-NC_030668.1 9909616 9909739 + ATGGAGGTTCGTTTGCATGCTTTTCCACGGCTTTCTTGAACTTCTTTTTCTCTCTTTGTGTTAGTAATGAATTAAAGAGGATGAAGGTCAAGAAAGTCATGGGAAAACATGAACGGATTTTGTT ......(((((((..((((.(((((((.(((((((((((...(((((.((.(((((((..(((....)))..))))))))).)))))))))))))))).))))))).)))))))))))...... 9909636 9909719 TTCCACGGCTTTCTTGAACTTCTTTTTCTCTCTTTGTGTTAGTAATGAATTAAAGAGGATGAAGGTCAAGAAAGTCATGGGAAA (((((.(((((((((((...(((((.((.(((((((..(((....)))..))))))))).)))))))))))))))).))))))) Gar-miRN1384 9909699 9909719 GGTCAAGAAAGTCATGGGAAA Gar-miRN1384* 9909636 9909656 TTCCACGGCTTTCTTGAACTT 3 Gar-MIRN1385 PmiREN007981 MIRN1385 Gossypium arboreum Gar-NC_030670.1 27769239 27769422 + TTGAGGGACCAATGAACACCCAAAGAGAACAATACTGGTATTGTGCTCACAACACTGGTTTGATACGACTCAAGGAACTGAGATGACATGAATAGCCCGCTGACTGACAAGGTACTCTAATTTCTCCGGGTTGTGAGCAGAAAACTATTATTATCCTCATTGGATGTCCACTAACCCCTCAAAG (((((((.....((.(((.((((.(((...((((.((((.((.((((((((((.((((.((((......))))((((...(((..((.....(((........))).....))..)))...)))))))))))))))))).)).)))).))))...))).)))).))).)).....))))))).. 27769259 27769402 CAAAGAGAACAATACTGGTATTGTGCTCACAACACTGGTTTGATACGACTCAAGGAACTGAGATGACATGAATAGCCCGCTGACTGACAAGGTACTCTAATTTCTCCGGGTTGTGAGCAGAAAACTATTATTATCCTCATTGGA (((.(((...((((.((((.((.((((((((((.((((.((((......))))((((...(((..((.....(((........))).....))..)))...)))))))))))))))))).)).)))).))))...))).))).. Gar-miRN1385 27769259 27769279 CAAAGAGAACAATACTGGTAT Gar-miRN1385* 27769382 27769402 ACTATTATTATCCTCATTGGA 3 Gar-MIRN1386a PmiREN007982 MIRN1386 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 73936280 73936406 - TATGCACTTTAATTGGCTTATGAATCTAGTTTCTCTCTTACTCCATTATTCATATTTTCCTTGTAAAAATATGTCTTCAAGAGAGTAAGGGAAAGACTAGATTCATAACCCAACATAAGTGATCAAC ....(((((...((((.(((((((((((((((.(((((((((((......((((((((.......)))))))).......).)))))))))).))))))))))))))).))))...)))))...... 73936300 73936386 TGAATCTAGTTTCTCTCTTACTCCATTATTCATATTTTCCTTGTAAAAATATGTCTTCAAGAGAGTAAGGGAAAGACTAGATTCATA ((((((((((((.(((((((((((......((((((((.......)))))))).......).)))))))))).)))))))))))).. Gar-miRN1386a 73936300 73936320 AAGGGAAAGACTAGATTCATA Gar-miRN1386a* 73936366 73936386 TGAATCTAGTTTCTCTCTTAC 3 Gar-MIRN1386b PmiREN007983 MIRN1386 Gossypium arboreum Gar-NC_030671.1 73922921 73923048 - AAATGAACTTTGATTGGCTTCTGAATCTAGTTTCTCTCTTGCTCCATTTTTCATATTTTCCTTGTGAAAATATGTCTTCAAGAGAGTAAGGGAGAGCTAGATTCATAACCCAGCAAAAGTCATCAACT ..((((..((((.((((.((.(((((((((((.((((((((((((......(((((((((.....))))))))).......).)))))))))))))))))))))).)).))))))))..))))..... 73922941 73923028 CTGAATCTAGTTTCTCTCTTGCTCCATTTTTCATATTTTCCTTGTGAAAATATGTCTTCAAGAGAGTAAGGGAGAGCTAGATTCATAA .(((((((((((.((((((((((((......(((((((((.....))))))))).......).))))))))))))))))))))))... Gar-miRN1386b 73922941 73922961 AAGGGAGAGCTAGATTCATAA Gar-miRN1386b* 73923008 73923028 CTGAATCTAGTTTCTCTCTTG 3