miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Gma-MIR156a PmiREN006718 MIR156 Glycine max Gma-Gm17 6149960 6150084 - CACACCAGATTGAGAGAGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCTAGTGGTATTTGTATGAGGGCATACAATTGCGGGTGCGTGCTCACTTCTCTATCTGTCAGCTTCCCATTCTTTTTTACTTT .......((..(((((((((((((((((((((((((((((..((.(.(.(((.(((((((....))))))).))).).))))))))))).))))).))))))))))))....)))).......)) 6149980 6150064 TGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCTAGTGGTATTTGTATGAGGGCATACAATTGCGGGTGCGTGCTCACTTCTCTATCTGTCAGC ((((((((((((((((((((..((.(.(.(((.(((((((....))))))).))).).))))))))))).))))).))))))).. 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Gma-miR157g 37843837 37843857 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Gma-miR157g* 37843757 37843777 CTCTCTAGGCTTCTGTCATCC 3 Gma-MIR157h PmiREN006746 MIR157 Glycine max Gma-Gm16 6487189 6487312 + CATGCATAAGATAGAGCCTGCTGACAGAAGATAGAGAGCATAGCTGAACATACCCAACAGGGCTTTGTGTATGAGCAGTTGTTCTCTCTTTTCTTCTATCAACATATCAGTTCCTGGCCGGTTG .........((((.....((.(((.((((((.((((((.(((((((..(((((.(((.......))).)))))..))))))).))))))..)))))).))).))))))................ 6487209 6487292 CTGACAGAAGATAGAGAGCATAGCTGAACATACCCAACAGGGCTTTGTGTATGAGCAGTTGTTCTCTCTTTTCTTCTATCAACA .(((.((((((.((((((.(((((((..(((((.(((.......))).)))))..))))))).))))))..)))))).)))... 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Gma-miR159a 37672565 37672585 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Gma-miR159a* 37672413 37672433 GAGCTCCTTGAAGTCCAATTG 3 Gma-MIR159b PmiREN006749 MIR159 Glycine max Gma-Gm07 5386097 5386300 - TGGGTATCAAACCCAACTTGGAGTTCCCTGCACTCCAAGTCTGAAAGGATATGATGGTAAACCTCTACTGCTAGTTCATGGATACCTCTGACTTCTTAACAACATGCGTTCGAAGTCAAGGGTTTGCATGCCCTGGGAGATGAGTTTACCTTGATCTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCAGAGGGTATTCTCAAGCCCTG (((((.....)))))...(((((((((((.((((((((..((.(((((((.....(((((((.((..((.((((..((((.(.((((.(((((((..(((.......))).))))))).)))).).))))..)))).))..)))))))))...)))))))))..)))))))).))))))))))).................... 5386117 5386280 GAGTTCCCTGCACTCCAAGTCTGAAAGGATATGATGGTAAACCTCTACTGCTAGTTCATGGATACCTCTGACTTCTTAACAACATGCGTTCGAAGTCAAGGGTTTGCATGCCCTGGGAGATGAGTTTACCTTGATCTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCA (((((((((.((((((((..((.(((((((.....(((((((.((..((.((((..((((.(.((((.(((((((..(((.......))).))))))).)))).).))))..)))).))..)))))))))...)))))))))..)))))))).))))))))).. 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Gma-miR164c 5292028 5292048 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Gma-miR164c* 5291903 5291923 CATGTGCCCCCCTTCCCCATC 3 Gma-MIR164d PmiREN006772 MIR164 Glycine max Gma-Gm10 38093049 38093156 + TATTGGTGGTTAACTCCTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAACTCACTTCTAGTTAATCTGATTTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCAACACGATTTTCCTACCTCATTC ....(((((..((.((.(((((((((((..((((((((((((.(((.............)))..))))))))))))..))))))))))).)).))..)))))...... 38093069 38093136 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAACTCACTTCTAGTTAATCTGATTTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCAAC ((((((((..((((((((((((.(((.............)))..))))))))))))..)))))))).. 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Gma-miR164f 45537777 45537797 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Gma-miR164f* 45537844 45537864 CACGTGCTCTCCTTTTCCAGC 3 Gma-MIR164g PmiREN006775 MIR164 Glycine max Gma-Gm03 46896210 46896326 + ATGGTTGAGAAGCTCCTTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAGTCTCTTGGCTCTCAAATGCCACTGAACCCTTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCAACACGGGTTTCTCCCCTTATTT ..((..(((((((.((.(((((((((((..(((((((((((((..((.((((........))))..))....)))))))))))))..))))))))))).))))))))).))...... 46896230 46896306 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAGTCTCTTGGCTCTCAAATGCCACTGAACCCTTTGCACGTGCTCCCCTTCTCCAAC ((((((((..(((((((((((((..((.((((........))))..))....)))))))))))))..)))))))).. 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Gma-miR408b 44626702 44626722 ATGCACTGCCTCTTCCCTGGC Gma-miR408b* 44626798 44626818 TGGGAACAGGCAGGGCACGAA 3 Gma-MIR408c PmiREN007000 MIR408 Glycine max Gma-Gm10 36556991 36557142 - AGTTAGAGACAGGACAAAGCAGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACACAATATTGTCAAGAAAGTGAGAAAGTGAGAGGAGAAATCTGTTGTGGTTCTGCTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTTTGTCTCTATTTCTAATTC (((((((((.((((((((((.((((((.((((((.((((((.((((((((.(((((.....((.((..................)).))......))))))))))))).)))))).)))))).)))))).)))))))).)).))))))))). 36557011 36557122 AGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACACAATATTGTCAAGAAAGTGAGAAAGTGAGAGGAGAAATCTGTTGTGGTTCTGCTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGC .((((((.((((((.((((((.((((((((.(((((.....((.((..................)).))......))))))))))))).)))))).)))))).))))))... 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Gma-miR482d 48569642 48569663 TCTTCCCTACACCTCCCATACC Gma-miR482d* 48569688 48569708 TATGGGGGGATTGGGAAGGAA 3 Gma-MIR530a PmiREN007085 MIR530 Glycine max Gma-Gm12 33689543 33689717 + GCCGATATGTTGCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCACTTTAATTACTTGGTTTCTCTGTGACATAAATAAATATAAATATGTCAGGTAAGAGAAATATATTATATATAATATGGGAATAGAGGTACCGAGAACGAGGTGCAGGTGCATCTGCAGGTGAATGTCATATTGGATTAT .((((((((..((.((((((((((..((((((((((((((..((.((((((.(((((((..((((..((.((((((((((.((........)).)))).)))))).)).))))...))))))).)))))))).))))))))))))))..)))))))))).))))))))))..... 33689563 33689697 TGCATTTGCACCTGCACTTTAATTACTTGGTTTCTCTGTGACATAAATAAATATAAATATGTCAGGTAAGAGAAATATATTATATATAATATGGGAATAGAGGTACCGAGAACGAGGTGCAGGTGCATCTGCAGG ((((..((((((((((((((..((.((((((.(((((((..((((..((.((((((((((.((........)).)))).)))))).)).))))...))))))).)))))))).))))))))))))))..)))).. 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Gma-miR1523 12253368 12253388 TATGGGATAAATGTGAGCTCA Gma-miR1523* 12253305 12253325 AGCTCACATTTATTTCAAAAT 3 Gma-MIR1527 PmiREN006716 MIR1527 Glycine max Gma-Gm07 39681063 39681303 + CTCACAAGCCGGTTTTGTAAGGTTGAGTTAGACCTCAAATTTCAACATGGTATCAGAGCCATTGAACCACATGCTATCAGGTTTCCGCTATCGGGCCACCCCCCATTTATGTCTACGAACCAAACCTAATAGTGCTGATCGTGAGGGGGTGTGTTAAGAGTCCCACATCGGATAGGACATGGTCTGACAATATATTTATAAAGTTGAGGCCTAACTCAACCTTACAAAACCGGCTTGTGAG (((((((((((((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((((......))))))))((((..(.(((((.(((....(((....((((((((((...((((((((((...............)))..)).)))))))))))).)))...))).....))).))))).)..))))....................)))))).))))))))))))))))))))))))))))))) 39681073 39681295 GGTTTTGTAAGGTTGAGTTAGACCTCAAATTTCAACATGGTATCAGAGCCATTGAACCACATGCTATCAGGTTTCCGCTATCGGGCCACCCCCCATTTATGTCTACGAACCAAACCTAATAGTGCTGATCGTGAGGGGGTGTGTTAAGAGTCCCACATCGGATAGGACATGGTCTGACAATATATTTATAAAGTTGAGGCCTAACTCAACCTTACAAAACCGG (((((((((((((((((((((.((((((...(((..(((((......))))))))((((..(.(((((.(((....(((....((((((((((...((((((((((...............)))..)).)))))))))))).)))...))).....))).))))).)..))))....................)))))).))))))))))))))))))))))) 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Gma-miR2111e 16377852 16377871 TAATCTGCATCCTGAGGTTT Gma-miR2111e* 16377802 16377822 ATCCTTGGGATGTAGATTACC 3 Gma-MIR2111f PmiREN006884 MIR2111 Glycine max Gma-Gm07 16402339 16402443 - AGCTGTTGAGTGGGAAAAGCTAATCTGCATCCTGAGGTTTAGAGCAATGTTTTTGTTGCATCTAGTCCTTGGGATGCAGATTATCTCTTCCTTAACGACAATGCA .(((((((...(((((.((.(((((((((((((((((.(((((((((((....)))))).))))).))))))))))))))))).)).)))))...)))))..)). 16402359 16402423 TAATCTGCATCCTGAGGTTTAGAGCAATGTTTTTGTTGCATCTAGTCCTTGGGATGCAGATTATC (((((((((((((((((.(((((((((((....)))))).))))).))))))))))))))))).. 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Gma-miR2118b 48574033 48574054 TTGCCGATTCCACCCATTCCTA Gma-miR2118b* 48574099 48574119 GGAGATGGGAGGGTCGGTAAA 3 Gma-MIR2119a PmiREN006887 MIR2119 Glycine max Gma-Gm01 7195489 7195618 - CATTTTTTATACTTTAATTTCCTCTATACCTCACTTTTATTGGAGAAAAAAGAGAATAGAAAATAGTGGATTTCTCTTCTTTTTTTCAATCAAAGGGAGTTGTAGGGGAAAAGTTTAGAAAATGGCGTGT (((((((((.(((((....(((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((...............))))))).))))))))))).)))))))).)))))))))))))).)))))))))...... 7195509 7195598 CCTCTATACCTCACTTTTATTGGAGAAAAAAGAGAATAGAAAATAGTGGATTTCTCTTCTTTTTTTCAATCAAAGGGAGTTGTAGGGGAA ((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((...............))))))).))))))))))).)))))))).)))))))).. 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Gma-miR4351 45091914 45091934 TTGGGATTCAGTTGGAGTTGG Gma-miR4351* 45092016 45092036 AACTCTAACTGAATACCAATT 3 Gma-MIR4352 PmiREN007011 MIR4352 Glycine max Gma-Gm14 14128764 14128933 + GATTTTTTCAGAAACCGTCTTAGAATGTTTACAATCTAAGACGATTCTTCAAAGAACTGTCTAAGAGTGTTTGTTTTTTTAAAAAATTAAAATAAATTTAGAATTCTAAGATGATTTTTCCAAAAATCGTTTTAAAATGTAGACATTCTAAGACGGTTTTTCAAAAAATC ((((((((.((((((((((((((((((((((((...((((((((((.((..(((((.(((((.((((((((((((((...........))))))))).....))))).))))).)))))..)).))))))))))...)))))))))))))))))))))))).)))))))) 14128780 14128919 GTCTTAGAATGTTTACAATCTAAGACGATTCTTCAAAGAACTGTCTAAGAGTGTTTGTTTTTTTAAAAAATTAAAATAAATTTAGAATTCTAAGATGATTTTTCCAAAAATCGTTTTAAAATGTAGACATTCTAAGACGG (((((((((((((((((...((((((((((.((..(((((.(((((.((((((((((((((...........))))))))).....))))).))))).)))))..)).))))))))))...))))))))))))))))))) Gma-miR4352 14128896 14128921 TAAAATGTAGACATTCTAAGACGG Gma-miR4352* 14128780 14128800 GTCTTAGAATGTTTACAATCT 3 Gma-MIR4354 PmiREN007012 MIR4354 Glycine max Gma-Gm09 39346879 39347028 + TTGGTCGAGTTAGACCGCTCCAATCGGGATCCGGTGACCTAACCGGTCGAGTTTGACCAAGTCATCTCGAGTCTATTACGTGACCGATCTAATAGTATAATCGATCTGATTAGGTCACCAGATCCCAATTGGATCGGTCCAACCGGCCGA (((((((.(((.(((((.((((((.((((((.((((((((((.((((((((..((((...)))).)))))(((........)))((((...........))))..))).)))))))))).)))))).)))))).))))).)))))))))) 39346893 39347017 CCGCTCCAATCGGGATCCGGTGACCTAACCGGTCGAGTTTGACCAAGTCATCTCGAGTCTATTACGTGACCGATCTAATAGTATAATCGATCTGATTAGGTCACCAGATCCCAATTGGATCGGTC (((.((((((.((((((.((((((((((.((((((((..((((...)))).)))))(((........)))((((...........))))..))).)))))))))).)))))).)))))).))))) 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Gma-miR4363 19536526 19536547 CGATTACCAGAAGGCTTATTAG Gma-miR4363* 19536439 19536459 AGGATAGGCTCTGGTAATCGA 3 Gma-MIR4364a PmiREN007018 MIR4364 Glycine max Gma-Gm13 13706433 13706543 + AACTGCGGAAGAACCTTCTTCCGTGCCATCTTGCGGAAGAACTTCTTCCCCAGGAAGCCACGGAAGATGGTTCTTCCGCGAGATCGCACGGAAGAAGGTTCTTCCGCTGTT (((.((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((...((...))..)))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))).))) 13706446 13706532 CCTTCTTCCGTGCCATCTTGCGGAAGAACTTCTTCCCCAGGAAGCCACGGAAGATGGTTCTTCCGCGAGATCGCACGGAAGAAGGTT (((((((((((((.((((((((((((((((((((((...((...))..)))))).)))))))))))))))).))))))))))))))) 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Gma-miR4366b 13479270 13479291 TACTTAGTAGAGATTTGTTGGT Gma-miR4366b* 13479329 13479349 CAACAAATCTTTAAGAAGTAG 3 Gma-MIR4374a PmiREN007023 MIR4374 Glycine max Gma-Gm01 41170542 41170715 - CACGACCGTCTTAGAAAGCCAGGCTTCAAAGACGTTGTTGACATCACGAACGTCTTAGAAAGTCAGGCTTCTAAGACAGTGCTGACGTCGACAACGTCTTAGAAAGCCAACCTTCAAAGACAGCCGTGACGTCAACACCGTCTTTGAAGCCTGGTTTTCTAAGACGGTCGTGAT ((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((...(((((.(((.((..((((((((((((..((.((....)).))..))))))).))))).)).))).)))))...))))).))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).. 41170562 41170695 AGGCTTCAAAGACGTTGTTGACATCACGAACGTCTTAGAAAGTCAGGCTTCTAAGACAGTGCTGACGTCGACAACGTCTTAGAAAGCCAACCTTCAAAGACAGCCGTGACGTCAACACCGTCTTTGAAGCCTGG ((((((((((((((.(((((((.(((((...(((((.(((.((..((((((((((((..((.((....)).))..))))))).))))).)).))).)))))...))))).))))))).)))))))))))))).. 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Gma-miR4374b 41096868 41096888 CAACACCGTCTTTGAAGCCTG Gma-miR4374b* 41096669 41096689 ACTTTCAAAGACGGTACTGAC 3 Gma-MIR4375 PmiREN007025 MIR4375 Glycine max Gma-Gm09 36277144 36277211 - TACCACTAGTGGTCGCGCCTGGCAGGCCAACACTACTAGTCACGCCTGGCAGGGCACCACTAGTGGTT .((((((((((((.((.((((.(((((....(((...)))...))))).)))))))))))))))))). 36277147 36277210 CACTAGTGGTCGCGCCTGGCAGGCCAACACTACTAGTCACGCCTGGCAGGGCACCACTAGTGGT ((((((((((.((.((((.(((((....(((...)))...))))).)))))))))))))))))) 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Gma-miR4387c 25186950 25186970 TGTTAGTGATAAGGCGTGATG Gma-miR4387c* 25186889 25186909 TCACGCCTAATCACTGACGCA 3 Gma-MIR4388 PmiREN007037 MIR4388 Glycine max Gma-Gm10 45933240 45933399 - GACACTGTCAATTTGGTCTTTAAGATTTAAAAAATGTCAAAATGATCCTCGACTTTACATTCCGTTTGTCACGGTGTTAGGAGACTACTAACGGCAGGGACTAACGTGCCAAGGATCATTTTGATATTTTTTAAATCTTAGGGACCAAATTGACAGCGCC ..(.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((............((((.....)))).(((((.......)))))((((.(......).)))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).).. 45933245 45933396 TGTCAATTTGGTCTTTAAGATTTAAAAAATGTCAAAATGATCCTCGACTTTACATTCCGTTTGTCACGGTGTTAGGAGACTACTAACGGCAGGGACTAACGTGCCAAGGATCATTTTGATATTTTTTAAATCTTAGGGACCAAATTGACAGC ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((............((((.....)))).(((((.......)))))((((.(......).)))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))). Gma-miR4388 45933245 45933268 TCTTAGGGACCAAATTGACAGC Gma-miR4388* 45933376 45933396 TGTCAATTTGGTCTTTAAGAT 2 Gma-MIR4392a PmiREN007038 MIR4392 Glycine max Gma-Gm09 46771221 46771358 + GACAAGGTGGGTTACACTTCCGAGTCATATTTTCGCATAGAAAAGCCACCGAACAGGAACTTGTTACATACCAAGGATCGATCGGAAGTTTTTTTCTCTGCGAAAATGTGATTTCGGAACTGTTCCTGAGCTCTCTTT ........(((..(((.((((((((((((((((((((.((((((((..((((...((..((((........))))..))..))))..))..)))))).))))))))))))).))))))).))).)))........... 46771241 46771338 CGAGTCATATTTTCGCATAGAAAAGCCACCGAACAGGAACTTGTTACATACCAAGGATCGATCGGAAGTTTTTTTCTCTGCGAAAATGTGATTTCGGA (((((((((((((((((.((((((((..((((...((..((((........))))..))..))))..))..)))))).))))))))))))).)))).. Gma-miR4392a 46771317 46771338 TCTGCGAAAATGTGATTTCGGA Gma-miR4392a* 46771241 46771261 CGAGTCATATTTTCGCATAGA 3 Gma-MIR4392b PmiREN007039 MIR4392 Glycine max Gma-Gm20 156621 156760 - ATCAAGATGGGTTACACTTCCGAGTCACATTTTCACATAGAAAAGCCACCGAACAGGAACTTGTTATATAATACCAGCTCGCTTTGGAAGTCTTTTTCTCTGCGAAAATGTGATTTCGGAACTGTACCTGAGCTTTCTTT ........((((.(((.(((((((((((((((((.((.((((((((..(((((...((.((.((........)).)).))..)))))..))..)))))).)).)))))))))).))))))).)))))))........... 156641 156740 CGAGTCACATTTTCACATAGAAAAGCCACCGAACAGGAACTTGTTATATAATACCAGCTCGCTTTGGAAGTCTTTTTCTCTGCGAAAATGTGATTTCGGA ((((((((((((((.((.((((((((..(((((...((.((.((........)).)).))..)))))..))..)))))).)).)))))))))).)))).. Gma-miR4392b 156641 156662 TCTGCGAAAATGTGATTTCGGA Gma-miR4392b* 156720 156740 CGAGTCACATTTTCACATAGA 3 Gma-MIR4393 PmiREN007040 MIR4393 Glycine max Gma-Gm10 1370786 1370921 - CTGACTTCTCTGCTGTCCCTTTCCCAGCTGTCCCTTGAAAATCACACAGTTTTAAAATTGAATCACAAAATTAAATATTAACACAACTACATGGACGACACAGGGACAGTTGAGAAAAGGACGGCAGAAAAGCCAA .((.(((.((((((((((.((((.(((((((((((((....(((...((((((((.(((.(((......))).))).))))...))))...)))....)).))))))))))).)))).)))))))))).))).)). 1370802 1370907 CCCTTTCCCAGCTGTCCCTTGAAAATCACACAGTTTTAAAATTGAATCACAAAATTAAATATTAACACAACTACATGGACGACACAGGGACAGTTGAGAAAAGGAC ((.((((.(((((((((((((....(((...((((((((.(((.(((......))).))).))))...))))...)))....)).))))))))))).)))).)))) 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Gma-miR4399 25185933 25185954 TTAACGAAAAAGGACTAACGAC Gma-miR4399* 25185827 25185847 CGTTAGTCTCTTTCTGTTAAG 3 Gma-MIR4400 PmiREN007042 MIR4400 Glycine max Gma-Gm20 1764848 1765004 + CGGAAGACTCTTCTTTCGGAAAAATTCTGGAAGACGTCACTCCGAAAAACTCCTAGAAGAACCTTCTTCCGGAAGAAGAAGGTGGGCCTCCCGAAGAACTCCAGAATACGTTCTGCAAGGACGTGTCCCGGAATTTTTTCGAAAGAAGGGTCTTCTG ((((((((((((((((((((((((((((((.(.(((((.((...................(((((((((.....)))))))))(((...)))..(((((..........)))))...))))))).).)))))))))))))))))))))))))))))) 1764862 1764992 TTCGGAAAAATTCTGGAAGACGTCACTCCGAAAAACTCCTAGAAGAACCTTCTTCCGGAAGAAGAAGGTGGGCCTCCCGAAGAACTCCAGAATACGTTCTGCAAGGACGTGTCCCGGAATTTTTTCGAAAG ((((((((((((((((.(.(((((.((...................(((((((((.....)))))))))(((...)))..(((((..........)))))...))))))).).)))))))))))))))))) 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Gma-miR4406 39315571 39315596 GAGAACCGGTGTAGAATGATAATC Gma-miR4406* 39315638 39315658 GCATTCTACATCGGTCGTCTC 3 Gma-MIR4407 PmiREN007047 MIR4407 Glycine max Gma-Gm20 46020233 46020370 + CAAAGTTGTCTGGGTTGAGGTAAAGTGTTGCTTCGTCTAAGTAATTAATGTTGCCTTCATTCAATTCAATTTGAGTTACGCTACGTGCATTACACTCAGAGGAAGCAGCACTTGTACCTCAACTAATTAACTTAACTC ..((((((....((((((((((((((((((((((.(((..(((((..((((.((....((((((......))))))...)).))))..)))))....))).)))))))))))).))))))))))...))))))..... 46020253 46020350 TAAAGTGTTGCTTCGTCTAAGTAATTAATGTTGCCTTCATTCAATTCAATTTGAGTTACGCTACGTGCATTACACTCAGAGGAAGCAGCACTTGTACC ((((((((((((((.(((..(((((..((((.((....((((((......))))))...)).))))..)))))....))).)))))))))))).)).. Gma-miR4407 46020329 46020350 CAGAGGAAGCAGCACTTGTACC Gma-miR4407* 46020253 46020273 TAAAGTGTTGCTTCGTCTAAG 3 Gma-MIR4411 PmiREN007048 MIR4411 Glycine max Gma-Gm01 12555873 12555964 + TGTTTTGGTATATCGTTAGACGACGATTAATTAGTTGTAGTAATCATGAATTATTGTAACTAATTTGTCGGTACCTCTTAATAATGTAATTT ....................((((((...(((((((((((((((.....)))))))))))))))))))))...................... 12555893 12555944 CGACGATTAATTAGTTGTAGTAATCATGAATTATTGTAACTAATTTGTCGGT ((((((...(((((((((((((((.....))))))))))))))))))))).. Gma-miR4411 12555923 12555944 TTATTGTAACTAATTTGTCGGT Gma-miR4411* 12555893 12555913 CGACGATTAATTAGTTGTAGT 3 Gma-MIR4412 PmiREN007049 MIR4412 Glycine max Gma-Gm04 28578961 28579084 - CTGTGTCGGGCCAGCAAAACTGTTGCGGGTATCTTTGCCTCTGAAGGAAAGTTGTGCCTATTATTATGGCTTATTGCTTTAGTGGCGTAGATCCCCACAACAGTTATGCTTGCACTGCCTTTTG ......(((((.((((.((((((((.(((.((((.((((.((((((.(((((((((........)))))))..)).)))))).)))).)))).))).)))))))).)))).)).)))....... 28578981 28579064 TGTTGCGGGTATCTTTGCCTCTGAAGGAAAGTTGTGCCTATTATTATGGCTTATTGCTTTAGTGGCGTAGATCCCCACAACAGT (((((.(((.((((.((((.((((((.(((((((((........)))))))..)).)))))).)))).)))).))).))))).. Gma-miR4412 28579044 28579064 TGTTGCGGGTATCTTTGCCTC Gma-miR4412* 28578981 28579001 GGCGTAGATCCCCACAACAGT 3 Gma-MIR4413a PmiREN007050 MIR4413 Glycine max Gma-Gm19 1788509 1788626 - CGATTTGCACAAATCATTAATAAGAGAATTGTAAGTCACTGTATCATGCATCTAATCAACAGTTCCTAATTAATACAGTGACTTACAATTCTCTTATTGATGAGGATGCTCAAAGAAA ......(((....(((((((((((((((((((((((((((((((............................)))))))))))))))))))))))))))))))...)))......... 1788529 1788606 TAAGAGAATTGTAAGTCACTGTATCATGCATCTAATCAACAGTTCCTAATTAATACAGTGACTTACAATTCTCTTATT ((((((((((((((((((((((((............................)))))))))))))))))))))))).. Gma-miR4413a 1788586 1788606 TAAGAGAATTGTAAGTCACTG Gma-miR4413a* 1788529 1788549 GTGACTTACAATTCTCTTATT 3 Gma-MIR4413b PmiREN007051 MIR4413 Glycine max Gma-Gm13 5170446 5170543 + TCTGTTAGCATCCTCATCAATAAGAGAATTGTAAGTCACTTGATTAGGAAATTTTACGGAGACTTACAATTCCGTATTGATGATTTATGCAAATAGAG ((((((.((((..(((((((((.(.((((((((((((.(((((..........))).)).))))))))))))).)))))))))...)))).)))))). 5170466 5170523 TAAGAGAATTGTAAGTCACTTGATTAGGAAATTTTACGGAGACTTACAATTCCGTATT ((.(.((((((((((((.(((((..........))).)).))))))))))))).)).. 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Gma-miR4414 35663100 35663120 ATCCAACGATGCGGGAGCTGC Gma-miR4414* 35663012 35663032 AGCTGCTGACTCGTTGGCTCG 3 Gma-MIR4415a PmiREN007053 MIR4415 Glycine max Gma-Gm18 60474185 60474384 + ATCCCCTAGTTGGCTGCAGCAAGTTGTGATGAGAATCAATGGCAAGCAGTGACACCAAGAAAAAAAAATCCCATTATAAACATTTTTTCCCCTCAATCTTCTTCTCATAGTATATCATTAGGCTAACTGGTGTTGAAGGATATAAATCCACAACTGCCATTGATTCTCATCACAACATGGTCCAGTCTACCCGGGAACCC ...(((..((.(((((.(.((.((((((((((((((((((((((......(((((((.(((((((.................)))))))..................((((.((....)).))))..)))))))...((((....)))).....)))))))))))))))))))))).)).).))))).))..)))..... 60474205 60474364 AAGTTGTGATGAGAATCAATGGCAAGCAGTGACACCAAGAAAAAAAAATCCCATTATAAACATTTTTTCCCCTCAATCTTCTTCTCATAGTATATCATTAGGCTAACTGGTGTTGAAGGATATAAATCCACAACTGCCATTGATTCTCATCACAACATGG (.((((((((((((((((((((((......(((((((.(((((((.................)))))))..................((((.((....)).))))..)))))))...((((....)))).....)))))))))))))))))))))).).. Gma-miR4415a 60474344 60474364 TTGATTCTCATCACAACATGG Gma-miR4415a* 60474205 60474225 AAGTTGTGATGAGAATCAATG 3 Gma-MIR4415b PmiREN007054 MIR4415 Glycine max Gma-Gm08 23142756 23142935 + ATCCCCGAGTTGGCTGCATCAAGTTGTGATGGGAATCAATGGCAGCAATCACGCCAAGAAAATGAAATCCCATTATCTTCTCACAGTATATCATTAATTAGGCTAACTGGTGTTGACGGATATAAATCCATTACTGCCATTGATTCTCATCACAACATGGTCCAGTCTACTCGGGAACCC ...(((((((.(((((.((((.(((((((((((((((((((((((...(((((((((((.((((......)))).)))......(((.((........)).)))...))))).))).((((....))))....))))))))))))))))))))))).)))).))))).)))))))..... 23142776 23142915 AAGTTGTGATGGGAATCAATGGCAGCAATCACGCCAAGAAAATGAAATCCCATTATCTTCTCACAGTATATCATTAATTAGGCTAACTGGTGTTGACGGATATAAATCCATTACTGCCATTGATTCTCATCACAACATGG (.(((((((((((((((((((((((...(((((((((((.((((......)))).)))......(((.((........)).)))...))))).))).((((....))))....))))))))))))))))))))))).).. Gma-miR4415b 23142895 23142915 TTGATTCTCATCACAACATGG Gma-miR4415b* 23142776 23142796 AAGTTGTGATGGGAATCAATG 3 Gma-MIR4416a PmiREN007055 MIR4416 Glycine max Gma-Gm19 40699070 40699221 - TCCTATGGTCATCTTTGATCTGGGTGAGAGAAACGCGTATCGATGGATTGGGTTCAGTTCTGGTCTCACACGGTTTGTTCTAACAATTTGTACTGACTGTGTTTTGATCGATACGGGTCGCTCTCACCTAGGCCAGAGTTGCCCAAACTTTG .....(((.((.(((((.((((((((((((..((.(((((((((((((((((......)))))))).((((((((.((.(.........).)).))))))))....))))))))).))..)))))))))))).))))).)).)))....... 40699090 40699201 TGGGTGAGAGAAACGCGTATCGATGGATTGGGTTCAGTTCTGGTCTCACACGGTTTGTTCTAACAATTTGTACTGACTGTGTTTTGATCGATACGGGTCGCTCTCACCTAGG ((((((((((..((.(((((((((((((((((......)))))))).((((((((.((.(.........).)).))))))))....))))))))).))..)))))))))).. Gma-miR4416a 40699090 40699110 TACGGGTCGCTCTCACCTAGG Gma-miR4416a* 40699181 40699201 TGGGTGAGAGAAACGCGTATC 3 Gma-MIR4416b PmiREN007056 MIR4416 Glycine max Gma-Gm02 30498945 30499130 - TTTCTGTGGTCACTTCTGCTCTGGGTGAGAGAAACACGTATTGAAGAAGGTTCATGGCTTAGACAATAAGTTGCTACTTTGCTGAACTCACCATTTTATGTGAAGAAGTGGCTATGCTAATTGTTTGATTCTGTACACGTACGATACGGGTCGCTCTCACCTGGAGTAGGGCTGCCCAAAGCTTTG ......(((.((.((((((((((((((((((..((.(((((((......((.((.((.(((((((((.(((.((((((((.......((((........)))).))))))))...))).))))))))).)))).)).....))))))).))..)))))))))))))))))).)).)))........ 30498965 30499110 CTGGGTGAGAGAAACACGTATTGAAGAAGGTTCATGGCTTAGACAATAAGTTGCTACTTTGCTGAACTCACCATTTTATGTGAAGAAGTGGCTATGCTAATTGTTTGATTCTGTACACGTACGATACGGGTCGCTCTCACCTGGAG (((((((((((..((.(((((((......((.((.((.(((((((((.(((.((((((((.......((((........)))).))))))))...))).))))))))).)))).)).....))))))).))..))))))))))).. 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Gma-miR4997b 17996402 17996423 TCGCGGCAGAAGAAATCCTGAT Gma-miR4997b* 17996358 17996378 CAGGAGTTTTCTGTTGAGGCT 3 Gma-MIR4997c PmiREN007066 MIR4997 Glycine max Gma-Gm18 43436088 43436193 + TATTAGGTGTTGATTTGCGTCACGAGTTTTCTGCTGAGGCTGAGCAATTAGAAGCGGGGAGACATCGCGGCAGAAGAAATCCTGATCGTCAAGCGCGAAGATGGGA .................(((((.((.((((((((((.((((..((........))..)).....)).))))))))))..)).))).)).................. 43436108 43436173 CACGAGTTTTCTGCTGAGGCTGAGCAATTAGAAGCGGGGAGACATCGCGGCAGAAGAAATCCTGAT ((.((.((((((((((.((((..((........))..)).....)).))))))))))..)).)).. 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Gma-miR9736a 45355378 45355398 TGAAAGACAAACAAAGGTGGG Gma-miR9736a* 45355293 45355313 CACCTTTGTTTATCTTTCATC 3 Gma-MIR9736b PmiREN007156 MIR9736 Glycine max Gma-Gm15 45232633 45232892 + AACGTCCCCACCTTTCTTTGTCTTTCATCACTCATTGTCCACAATCATGTTTATCTTTGACCCTTCTGATGACACTCAAAATCTCACCATCTACTCATTATTATCTCACACTCTCTAAGAACTAGGAAGTTCAATTAATGGTGAGATTTTGCGTGTCACCAAGCCAGAAATGAACGTGATTGAGGACAAGTTGAGGATAGTGAGGGATGAAAGACAAACAAAGGTGGGAATGTTAACTTTGACAAGAAAA (((((.(((((((((.(((((((((((((.((((((((((.(((((((((((((.((((...((..((.((((((.((((((((((((((.........................((((((((....)))))..))))))))))))))))).)))))).)))).)))).))))))))))))).)))))...........))))).))))))))))))).))))))))).)))))................ 45232653 45232872 CACCTTTCTTTGTCTTTCATCACTCATTGTCCACAATCATGTTTATCTTTGACCCTTCTGATGACACTCAAAATCTCACCATCTACTCATTATTATCTCACACTCTCTAAGAACTAGGAAGTTCAATTAATGGTGAGATTTTGCGTGTCACCAAGCCAGAAATGAACGTGATTGAGGACAAGTTGAGGATAGTGAGGGATGAAAGACAAACAAAGGTGGG (((((((.(((((((((((((.((((((((((.(((((((((((((.((((...((..((.((((((.((((((((((((((.........................((((((((....)))))..))))))))))))))))).)))))).)))).)))).))))))))))))).)))))...........))))).))))))))))))).))))))).. 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Gma-miR10424g 15535317 15535337 TTTTCTAATTTATCAGGGACT Gma-miR10424g* 15535209 15535229 TCCTTAATAAATTAAGAAATT 3 Gma-MIR10424h PmiREN006666 MIR10424 Glycine max Gma-Gm16 7410796 7410966 - TCATTGACACTTATTTTTAGTCTAGAATAAATTAGTAAATTTTGTGTTTGCTTCATGATAAATATTTTCCATTTGTTATTAATACAGACTAAAACAAAATTTACTAACGTATTAGAAAGGAAACATAAAATTTTCTAATTTATCAGGGACTAAAATAGAATATCAAGGATA ..............(((((((((...(((((((((.(((((((((((((.(((..(((((...........((((((.(((........)))))))))...........)))))..))).))))))))))))).)))))))))...)))))))))................ 7410816 7410946 TCTAGAATAAATTAGTAAATTTTGTGTTTGCTTCATGATAAATATTTTCCATTTGTTATTAATACAGACTAAAACAAAATTTACTAACGTATTAGAAAGGAAACATAAAATTTTCTAATTTATCAGGGACT (((...(((((((((.(((((((((((((.(((..(((((...........((((((.(((........)))))))))...........)))))..))).))))))))))))).)))))))))...))).. 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Gma-miRN1350b 46227810 46227831 TGGAACCGACGAGCAAGGACGA Gma-miRN1350b* 46227871 46227891 GGCTTTGTTTTCTGAAATCCA 3 Gma-MIRN1351 PmiREN007677 MIRN1351 Glycine max Gma-Gm11 15108340 15108442 - TATTGGAAAGATGAAGTAGCTTATTTTGTAGCAGCTGATGGGAAAGTTTTCAAAACTGACTTAGTAAGTCATGCTCAATAGGCATCAAGTTTTTCCCTGATTG ....((((((((...((.((((((..((.(((((((..((((..(((((...)))))..))))...)))..))))))))))))))...))))))))....... 15108360 15108422 TTATTTTGTAGCAGCTGATGGGAAAGTTTTCAAAACTGACTTAGTAAGTCATGCTCAATAGGC ((((..((.(((((((..((((..(((((...)))))..))))...)))..)))))))))).. 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Gma-miRN1361a 12056994 12057014 ATGGAGATGAATTGTGAAGCT Gma-miRN1361a* 12056954 12056974 TTTTACAAAATTATTTTTCAT 3 Gma-MIRN1361b PmiREN007769 MIRN1361 Glycine max Gma-Gm19 11400404 11400646 + TCTGTAGGAGGATTATGAAGATGGAGATGAATTGTGAAGCTGGATTTATGTGCGCACAAGTCTCACGTACAGTGCACGTACAGTGCATCAAACGGGTGGTTCATGCACAGGAACCAATACCCAGGCTGCAAACAAAAAACAAATTATGCTGGCTATGAAAATTTTGAAAATGAAGATTATCTTATTTGTAATTTCAGTCTTTAGGCTTCCATTATTTCAGTTCAGTTCAATATACATACCTAT ...(((((.(.....(((((((.(((((((..((.((((((((((...((((((...........))))))((((((.....)))))).....(((((((((........)))))...)))).(((((((................))).))))..........(((((....((((......))))....)))))))))...))))))))))))))).)))...)))).....)...))))) 11400424 11400626 ATGGAGATGAATTGTGAAGCTGGATTTATGTGCGCACAAGTCTCACGTACAGTGCACGTACAGTGCATCAAACGGGTGGTTCATGCACAGGAACCAATACCCAGGCTGCAAACAAAAAACAAATTATGCTGGCTATGAAAATTTTGAAAATGAAGATTATCTTATTTGTAATTTCAGTCTTTAGGCTTCCATTATTTCAGTTC ((.(((((((..((.((((((((((...((((((...........))))))((((((.....)))))).....(((((((((........)))))...)))).(((((((................))).))))..........(((((....((((......))))....)))))))))...))))))))))))))).)).. 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