miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Esa-MIR156a PmiREN005583 MIR156 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_2 10225690 10225818 + GGAGAAGAAGATGAAAAATGTTGACAGAAGAAAGAGAGCACAACCCGGGATTAGCAAAAAAGATAGTTTTGCTCTTGTCGGGAGTGTGCTCTCTTTACTTCTGCCACCATCATCGCACATATGTATACA .................(((.((.((((((((((((((((((.(((((.(..(((((((.......)))))))..).)))))..)))))))))))).)))))).)).)))................... 10225710 10225798 TTGACAGAAGAAAGAGAGCACAACCCGGGATTAGCAAAAAAGATAGTTTTGCTCTTGTCGGGAGTGTGCTCTCTTTACTTCTGCCACCA .((.((((((((((((((((((.(((((.(..(((((((.......)))))))..).)))))..)))))))))))).)))))).))... 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Esa-miR172b 8433325 8433345 GAATCTTAATGATACTGCATC Esa-miR172b* 8433242 8433262 TGCAGCATCATCAAGATTCCC 3 Esa-MIR319a PmiREN005636 MIR319 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_10 10950425 10950647 + AATATAAGATAGATTTAGAAGGAGATTCTTTCAGTCCAGTCATGGATAGAAAATGAAGAGTGTAGAAATATCTGCCGACTCATCCACTCAAACACTCGTGGTGAAAAAACAACCATAAATTTTAAACCGCAGTGACTGTGTGAATGATGCGGGAGATATTTTTCATCCCTCTTTATCTGTGTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTTCTTTCTCTACATTTATTTTG ....((((((((((..((((((((.((((((((((((((.((((((((((....((.(.(((.((((((((((.(((..((((.(((.((..((((.(((((..((((...........))))..)))))))))..)).))).))))..))).))))))))))))).).)))))))))))).)))))))))))))).))))))))........)))))))))) 10950445 10950627 GGAGATTCTTTCAGTCCAGTCATGGATAGAAAATGAAGAGTGTAGAAATATCTGCCGACTCATCCACTCAAACACTCGTGGTGAAAAAACAACCATAAATTTTAAACCGCAGTGACTGTGTGAATGATGCGGGAGATATTTTTCATCCCTCTTTATCTGTGTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTT ((((.((((((((((((((.((((((((((....((.(.(((.((((((((((.(((..((((.(((.((..((((.(((((..((((...........))))..)))))))))..)).))).))))..))).))))))))))))).).)))))))))))).)))))))))))))).)))).. 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Esa-miR398b 4759634 4759654 TGTGTTCTCAGGTCACCCCTG Esa-miR398b* 4759561 4759581 GGGTAGACATGAGAACACATG 3 Esa-MIR399a PmiREN005659 MIR399 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_6 2179554 2179694 - CAATAAGCAGAGCAGTAATAGGGCATCTTTCTATTGGCAGGCGAGACTGCAATTTTGCTCATTTTGTGTTTTGTTGTGTTTGGCTATTTGCTCTGTCACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTCACTGCTTCCGCTTAAATA ...(((((.(((((((.((((((((.((((((.((((((((.((.(..((((....((((((.............)))...)))...))))..).)).)))))))).)))))).)))))))).)))))))..))))).... 2179574 2179674 GGGCATCTTTCTATTGGCAGGCGAGACTGCAATTTTGCTCATTTTGTGTTTTGTTGTGTTTGGCTATTTGCTCTGTCACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG (((((.((((((.((((((((.((.(..((((....((((((.............)))...)))...))))..).)).)))))))).)))))).))))).. 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Esa-miR845 7177184 7177204 CGGCTCTGATACCAATTGATG Esa-miR845* 7177145 7177165 TCGATTGGTGTCAGAGCCACG 3 Esa-MIR3435 PmiREN005639 MIR3435 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_13 8764683 8764854 + TAACTCGAACTGCCGATTTTTGGCATAATTCTGTCAATTCCCTCATAGATGTAATGTAAAGTTGGTTCGGTGATCAATAAAGAAGAAGGATGTGTGTTGTTTTGGAAATGCTCAAGTTACATGTTTGAAGGAATTGACAAAGTTATGCCAGAAGGCATTTCGAGTCGAAGAG (.(((((((.((((...(((((((((((((.((((((((((.(((.(.(((((((....(((...(((((....(((((....(......)...)))))..)))))...)))...))))))).).))).)))))))))).))))))))))))))))).))))))).)..... 8764703 8764834 TGGCATAATTCTGTCAATTCCCTCATAGATGTAATGTAAAGTTGGTTCGGTGATCAATAAAGAAGAAGGATGTGTGTTGTTTTGGAAATGCTCAAGTTACATGTTTGAAGGAATTGACAAAGTTATGCCAGA ((((((((((.((((((((((.(((.(.(((((((....(((...(((((....(((((....(......)...)))))..)))))...)))...))))))).).))).)))))))))).)))))))))).. 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Esa-miR5654 2382151 2382171 ATAAATCCCATGCATCTTCCA Esa-miR5654* 2382094 2382114 GAAGATGCTTGGGATTTATTT 3 Esa-MIR5718 PmiREN005664 MIR5718 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_11 3440943 3441198 - TACTGTTATTCTTGTTCTTGGTTGGTTCTGAACAACTTAGTGATGCTTTGTAATGGAGGCATAATGATATGTCAGCAGACTAGAACAAGCCGTTGATATGCCTCTTGATAGCCATGTTTTCTGTGTTACTCAACAGGCATATCAACGGTTCCTTCTAATCTCCTGAGATATCGTTGTGCCTCCATTACAGAGCAGCACTAAGCTGTTCAGAACCAAACCCAGAACAAGAGCAGTTGAACACAGATCTGAT .(((((...(((((((((.(((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((.(((.(((((..((((((((((((((((.((((((((((.......)).)))).)))).))))))))))))))))..))))).))).)))).))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))))))))).)))).))))))))))))))................ .-145 3440963 3441178 TGTTCTTGGTTGGTTCTGAACAACTTAGTGATGCTTTGTAATGGAGGCATAATGATATGTCAGCAGACTAGAACAAGCCGTTGATATGCCTCTTGATAGCCATGTTTTCTGTGTTACTCAACAGGCATATCAACGGTTCCTTCTAATCTCCTGAGATATCGTTGTGCCTCCATTACAGAGCAGCACTAAGCTGTTCAGAACCAAACCCAGAACAAG ((((((.(((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((.(((.(((((..((((((((((((((((.((((((((((.......)).)))).)))).))))))))))))))))..))))).))).)))).))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))))))))).)))).)))))).. 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Esa-miRN1019 6151446 6151466 TAGTGAAATTGGAAAGTTGCC Esa-miRN1019* 6151518 6151538 CAGCTTTCCTGATTCCACTTC 3 Esa-MIRN1020 PmiREN005670 MIRN1020 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_35 24538 24647 + GACTCCGATTTCTATCTCTATGTAAACGGACAATCACGACTAGGTGTAAAGCCTTCAGAGCGTATTAGGTTGGTGACTCCGTTTTTCAAAGATGTGAATGTCTCTGATGG ................(((.((.(((((((...((((((((((((.....)))).............)))).)))).)))))))..)).))).................. 24558 24627 TGTAAACGGACAATCACGACTAGGTGTAAAGCCTTCAGAGCGTATTAGGTTGGTGACTCCGTTTTTCAAA ((.(((((((...((((((((((((.....)))).............)))).)))).)))))))..)).. Esa-miRN1020 24558 24578 TGTAAACGGACAATCACGACT Esa-miRN1020* 24607 24627 TTGGTGACTCCGTTTTTCAAA 3 Esa-MIRN1021a PmiREN005671 MIRN1021 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_3 7777546 7777711 - CTGAAGAACCTTGGCCACAGTCTTGAATGCTCCCATGTGACCCCCAAAAGCTGAACCATGACATTCTTGCAACACAGGTTGCATCTCCTCCTCAGCAAGACACCTTCTATACAGCTGATCTTTGTTCAGGACATACAAGTAAGGCTCATCCCAATGGTATCTTTGG ((((((((((((((....(((((((.(((.(((..((.(((.......(((((...........((((((.....(((........))).....))))))...........))))).......))))))))))).))....)))))....)))).))).))))))) 7777566 7777691 TCTTGAATGCTCCCATGTGACCCCCAAAAGCTGAACCATGACATTCTTGCAACACAGGTTGCATCTCCTCCTCAGCAAGACACCTTCTATACAGCTGATCTTTGTTCAGGACATACAAGTAAGGCT (((((.(((.(((..((.(((.......(((((...........((((((.....(((........))).....))))))...........))))).......))))))))))).))....))).. 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Esa-miRN1021b 10831023 10831043 TCAGGACATACAAGTAAGGCT Esa-miRN1021b* 10830918 10830938 TCTTGAATGCTCCCATGTGAC 3 Esa-MIRN1021c PmiREN005695 MIRN1021 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_18 2414643 2414808 - CTGAAGAACCTTGGCCACAGTCTTGAATGCTCCCATGTGACCCCCAAAAGCTGAACCATGACACTCTTGCAACACAGGTTGCATCTCCTCCTCAGCAAGACACCTTCTATACAGCTGATCTTTGTTCAGGACATACAAGTAAGGCTCATCCCAATGGTATCTTTGG ((((((((((((((....(((((((.(((.(((..((.(((.......(((((...........((((((.....(((........))).....))))))...........))))).......))))))))))).))....)))))....)))).))).))))))) 2414663 2414788 TCTTGAATGCTCCCATGTGACCCCCAAAAGCTGAACCATGACACTCTTGCAACACAGGTTGCATCTCCTCCTCAGCAAGACACCTTCTATACAGCTGATCTTTGTTCAGGACATACAAGTAAGGCT (((((.(((.(((..((.(((.......(((((...........((((((.....(((........))).....))))))...........))))).......))))))))))).))....))).. 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Esa-miRN1023 2382384 2382404 CGAAGTGACTTATAATACTCT Esa-miRN1023* 2382433 2382453 AGTATTATAAGTCACTACATT 3 Esa-MIRN1024a PmiREN005675 MIRN1024 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_10 4454477 4454583 + GAAATTTACTTTTGAAGCTTTACCTTGTATTATATCATCAAAAACGGGTGAGCGATCAGAACATATATTGATATCGTTTAAGGTACCTGGAGGTCCGAAAAATGTGT (........)..........(((((((.((.((((((...........(((....)))..........)))))).)).)))))))...................... 4454497 4454563 TACCTTGTATTATATCATCAAAAACGGGTGAGCGATCAGAACATATATTGATATCGTTTAAGGTACC (((((((.((.((((((...........(((....)))..........)))))).)).))))))).. 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Esa-miRN1031 9328544 9328564 TGAAATATTCACATGCTTTCG Esa-miRN1031* 9328626 9328646 AAAGCATGTGAGTACTTCGTA 3 Esa-MIRN1032 PmiREN005685 MIRN1032 Eutrema salsugineum Esa-scaffold_10 10247169 10247281 + TCTATAGTTACTGTCTTGCCTCCGAGGCTGTTCACGAAGATCTGCATCTAGAAACAAAAAGATGATGCAAATCTTCGTCAAGAGCATTGGTGGCAAGACACTAACTTTCGACA ((...(((((.(((((((((.((((.(((.((.((((((((.((((((...............)))))).)))))))).)).))).)))).))))))))).)))))...)).. 10247189 10247261 TCCGAGGCTGTTCACGAAGATCTGCATCTAGAAACAAAAAGATGATGCAAATCTTCGTCAAGAGCATTGGTGG .((((.(((.((.((((((((.((((((...............)))))).)))))))).)).))).))))... 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