miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Cmo-MIR156a PmiREN005352 MIR156 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268519.1 2294162 2294287 - AGACCAGAAGGGTAAGAGAGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCTGCAGCCAAATGTATGAAGAGCATACCTCTGCGGGTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGCTTCCCCAGTATTTTCCCTTC ......((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((((((......(((((.....)))))..)))).)))).)))))))).)))).)))))))).)))........)))))))))) 2294182 2294267 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCTGCAGCCAAATGTATGAAGAGCATACCTCTGCGGGTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGC ((((((((((((((((((((.((((((((......(((((.....)))))..)))).)))).)))))))).)))).)))))))).. Cmo-miR156a 2294248 2294267 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Cmo-miR156a* 2294182 2294202 CTCACTTCTCTTTCTGTCAGC 3 Cmo-MIR156b PmiREN005353 MIR156 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268521.1 5153055 5153177 + GGTGTTTGTAGAATCGAAGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCTTTTGGTATAACAATATGCCATTGCTCTTGCGTGCTCACTTCTCTGTCTGTCAGCTTCCATCGCCAATTCCTTCT ((((..((.......(((((((((((((((((((((((((.(((.(((...(((((((....)))))))..))).))).)))))))).))))).)))))))))))))).)))).......... 5153075 5153157 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCTTTTGGTATAACAATATGCCATTGCTCTTGCGTGCTCACTTCTCTGTCTGTCAGC ((((((((((((((((((((.(((.(((...(((((((....)))))))..))).))).)))))))).))))).))))))).. Cmo-miR156b 5153075 5153094 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Cmo-miR156b* 5153137 5153157 CTCACTTCTCTGTCTGTCAGC 3 Cmo-MIR156c PmiREN005354 MIR156 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268521.1 5513420 5513547 - AATTTAGGGTAAGGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACATAAGGCACTTTCTTGCATGCTAGGGTTCATGCTTGAAGCTTTCTGTGCTTACTCTCTATCTGTCACCCCACCGTTTCTCTCTCTTCT ..................(((((((((((((((((((((((.(((((...(((..(((((........)))))..)))))))).)))))))))))))).))))))))).................... 5513440 5513527 TGACAGAAGAGAGTGAGCACATAAGGCACTTTCTTGCATGCTAGGGTTCATGCTTGAAGCTTTCTGTGCTTACTCTCTATCTGTCACC (((((((((((((((((((((.(((((...(((..(((((........)))))..)))))))).)))))))))))))).))))))).. Cmo-miR156c 5513508 5513527 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Cmo-miR156c* 5513440 5513460 GCTTACTCTCTATCTGTCACC 3 Cmo-MIR156d PmiREN005355 MIR156 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268522.1 1129092 1129221 + AAGATGAGAGAATTGAAAGAGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACTCCGAGCAATTGTATGAAAAAAATTCATACCTTTACTAGTGTGTGTTCATGTCTCTTTCCGTCAGCCTTCACTTCCCATTCTCT ......(((((((((((.(.((((((.((((((((((((((((((((...((.((..(((((((.....)))))))..)).))))))))))))))).)))))))..)))))))))))......))))))) 1129112 1129201 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACACTCCGAGCAATTGTATGAAAAAAATTCATACCTTTACTAGTGTGTGTTCATGTCTCTTTCCGTCAGC ((((.((((((((((((((((((((...((.((..(((((((.....)))))))..)).))))))))))))))).)))))))..)))))) 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Cmo-miR156e 1808277 1808296 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Cmo-miR156e* 1808214 1808234 CTCACTTCTCTTTCTGTCAGC 3 Cmo-MIR156f PmiREN005357 MIR156 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268524.1 1442766 1442893 - TAAGATGGAGGAGGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACATAAGGTACTTTCTTGCATCTTAGGGTTCATGCTTGAAGCTTTCTGTGCTTACTCTCTATCTGTCACCCCACCATGTCCCCTCTCTCT ..(((.(((((.(((((.(((((((((((((((((((((((.(((((...(((..((((..........))))..)))))))).)))))))))))))).)))))))))))......)))))))).))) 1442786 1442873 TGACAGAAGAGAGTGAGCACATAAGGTACTTTCTTGCATCTTAGGGTTCATGCTTGAAGCTTTCTGTGCTTACTCTCTATCTGTCACC (((((((((((((((((((((.(((((...(((..((((..........))))..)))))))).)))))))))))))).))))))).. 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Cmo-miR156g 1138215 1138234 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Cmo-miR156g* 1138284 1138304 CTCATTTCTCTTTCTGTCAGG 3 Cmo-MIR156h PmiREN005359 MIR156 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268532.1 1966246 1966369 + TGTGGCTTGGTCTTGGAATTTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGAGGCACTTGGTATAAAGTGTATGCTAAGGCTTTTGCGTGCTCACTACTCTCTCTGTCAGATTCGAACGATGGATCGAAAT .............(.(((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((.....)))))))))))))))).))))))))).)))).)))))))))))).)............... 1966266 1966349 TGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGAGGCACTTGGTATAAAGTGTATGCTAAGGCTTTTGCGTGCTCACTACTCTCTCTGTCAGA ((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((.....)))))))))))))))).))))))))).)))).))))))).. Cmo-miR156h 1966266 1966285 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Cmo-miR156h* 1966329 1966349 CTCACTACTCTCTCTGTCAGA 3 Cmo-MIR156i PmiREN005360 MIR156 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268543.1 1601597 1601720 - CGTCCCTGGGACTTGGAATTTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGAGGCACTTGGTATAAAGTGTATACTAATGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGATTCGATAGATGGATCGGGCT .((((...)))).(.(((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((((((.....)))))))))))))))).)))))))).))))).)))))))))))).)............... 1601617 1601700 TGACAGAAGAGAGTGAGCACCCAGAGGCACTTGGTATAAAGTGTATACTAATGCTTTTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGA ((((((((((((((((((((.((((((((.((((((((.....)))))))))))))))).)))))))).))))).))))))).. 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Cmo-miR157a 7431958 7431977 TGACAGAAGATAGAGAGCAC Cmo-miR157a* 7432028 7432048 GCTCTCTATGCTTCTGTCATC 3 Cmo-MIR157b PmiREN005362 MIR157 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268519.1 1433112 1433234 + AGCATTTAGGTGATATGGTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCAAATTTCTGTATCTCACTCCATTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCCTCTTCACCCTCCTTTAA ........(((((...((((.(((((((((((((((((((((((((.(((.(((((......))))).)))...)))))))))))))))).))))))))).))))....)))))......... 1433132 1433214 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCAAATTTCTGTATCTCACTCCATTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((((.(((.(((((......))))).)))...)))))))))))))))).)))))))))... Cmo-miR157b 1433132 1433152 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Cmo-miR157b* 1433194 1433214 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Cmo-MIR157c PmiREN005363 MIR157 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268523.1 361754 361876 - AAGGGGAGAAGGTAAAAATGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAAGTGCATATCCCTTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTACACTTCTGTCATCACCTTCTCATCCCCTTTCCTT (((((((((((((......(.(((((((((.(((((((((((((.(((((.(((((.......))))).))).)).)))))))))))))..))))))))).)))))))...)))))))..... 361774 361856 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAAGTGCATATCCCTTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTACACTTCTGTCATCA .(((((((((.(((((((((((((.(((((.(((((.......))))).))).)).)))))))))))))..)))))))))... Cmo-miR157c 361836 361856 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Cmo-miR157c* 361774 361794 CTCTCTACACTTCTGTCATCA 3 Cmo-MIR157d PmiREN005364 MIR157 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268530.1 2124110 2124251 + AATGGTGATCATGTTGTTGCTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGGGGAGATGCAAATGCAAATCATCATAAACAAGATCAAAGGCATCTCTTTCCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATCACCTTTAATTCAGCCCTCCA ((.(((((............(((((((((((((((((((((((.((((((((((...((...(((...........)))))...))))))))..))))))))))))))).))))))))))))))).)).............. 2124130 2124231 TGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGGGGAGATGCAAATGCAAATCATCATAAACAAGATCAAAGGCATCTCTTTCCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATC (((((((((((((((((((((((.((((((((((...((...(((...........)))))...))))))))..))))))))))))))).)))))))))).. Cmo-miR157d 2124130 2124149 TGACAGAAGATAGAGAGCAC Cmo-miR157d* 2124211 2124231 GCTCTCTATTCTTCTGTCATC 3 Cmo-MIR157e PmiREN005365 MIR157 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268536.1 3751160 3751291 + TGGTGTGATGTGTTTTTTGGTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGGGGGGATGCAAATTCAACCTAACAACAACGCATCTCTTTCCTTTGTGCTCTCTGTTCTTCTGTCATCACCTTTCATTCACCCCTCCA .((.((((.(((.....((((((((((((((((((((((((((.((((((((((....................))))))))..))))))))))))))).))))))))))))).....))))))).)).... 3751180 3751271 TGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGGGGGGATGCAAATTCAACCTAACAACAACGCATCTCTTTCCTTTGTGCTCTCTGTTCTTCTGTCATC (((((((((((((((((((((((.((((((((((....................))))))))..))))))))))))))).)))))))))).. Cmo-miR157e 3751180 3751199 TGACAGAAGATAGAGAGCAC Cmo-miR157e* 3751251 3751271 GCTCTCTGTTCTTCTGTCATC 3 Cmo-MIR157f PmiREN005366 MIR157 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268548.1 1511283 1511440 + GGAACATATAGGTGATATGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCAATTTCCTTTGTTTTTGATAGACATTTTACGAATCACTACTGTGCATCTCACTCCATTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTCTTTGTCCACCTTC (((.((...((((((........(((((((((((((((((((((((((.(((.(((((.........((((.(((........))).))))........))))).)))...)))))))))))))))).)))))))))))))))....)))))...... 1511303 1511420 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCAATTTCCTTTGTTTTTGATAGACATTTTACGAATCACTACTGTGCATCTCACTCCATTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((((.(((.(((((.........((((.(((........))).))))........))))).)))...)))))))))))))))).)))))))))))) Cmo-miR157f 1511303 1511323 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Cmo-miR157f* 1511400 1511420 CTCTCTATGCTTCTGTCATCA 3 Cmo-MIR159a PmiREN005367 MIR159 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268552.1 1305985 1306206 - TGGGATTAGGGTTACAAGCAGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGGTTGTGCTTGGTTGATCGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCTCAGCCCCTATCGCTATCTCATCAATCATATCTAAAGCTGATGGGCCTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGATTCATCAACTGTTTTTGTTGAATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATATTCTCTCTAATCATCT ...((((((((........((((((((((..(((((((..(((((((..((..(((((((.(((((.(((((.((((.(..((.(((.(((.((((((....................))).)))))).))).))..).)))).))))).)).))))))))))......))..)))))))..)))))))..)))))))))).........)))))))).... 1306005 1306186 GAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGGTTGTGCTTGGTTGATCGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCTCAGCCCCTATCGCTATCTCATCAATCATATCTAAAGCTGATGGGCCTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGATTCATCAACTGTTTTTGTTGAATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((..(((((((..(((((((..((..(((((((.(((((.(((((.((((.(..((.(((.(((.((((((....................))).)))))).))).))..).)))).))))).)).))))))))))......))..)))))))..)))))))..))))))))).. Cmo-miR159a 1306005 1306025 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Cmo-miR159a* 1306166 1306186 GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG 3 Cmo-MIR159b PmiREN005368 MIR159 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268553.1 402323 402535 + GAGGGGAGAGGCGGCGATGGAGCTCCCTTTGATTCAAAGAGAGGGGGGGAAGAAGGTGAAAGGAAGTGCTGCGAGTTCATGGATGCCTGTGGGGTGCCGCGGTAGCGCTTAGGCGCCGCACCTTCCAAAGGTTTGCATGCGCCCGGAGCTGTTCTTACCTTCTCCTTTCCTTTATTGGATTGAAGGGAGCTCCTCTTATGTTCTTTCTTTATC ..(((((((((((..((.(((((((((((((((((((..(((((((((((.(((((((...((((..(((.((.((.((((.(.(((((((.(((((((((....)))...)))))).))).......)))).).)))).)).)).)))..)))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))...)).)))))))))... 402343 402515 AGCTCCCTTTGATTCAAAGAGAGGGGGGGAAGAAGGTGAAAGGAAGTGCTGCGAGTTCATGGATGCCTGTGGGGTGCCGCGGTAGCGCTTAGGCGCCGCACCTTCCAAAGGTTTGCATGCGCCCGGAGCTGTTCTTACCTTCTCCTTTCCTTTATTGGATTGAAGGGAGCTCC (((((((((((((((((..(((((((((((.(((((((...((((..(((.((.((.((((.(.(((((((.(((((((((....)))...)))))).))).......)))).).)))).)).)).)))..)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).. Cmo-miR159b 402496 402515 ATTGGATTGAAGGGAGCTCC Cmo-miR159b* 402343 402363 AGCTCCCTTTGATTCAAAGAG 3 Cmo-MIR160a PmiREN005369 MIR160 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268518.1 5491295 5491419 - ATGCTTTCATGTATCAAATCTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGTAGAGCGCTCACCGTCTTACCCGATGACCTCCGTAGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCCGTCTAGATCGGGATTC ((((......))))......(((.(((((((.(((((((((((((..(((.(.(((.((.......)).)))))))..))))))))))))).))))))).)))...................... 5491315 5491399 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGTAGAGCGCTCACCGTCTTACCCGATGACCTCCGTAGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.(((((((((((((..(((.(.(((.((.......)).)))))))..))))))))))))).))))))).))).. 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Cmo-miR160d 1476180 1476200 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Cmo-miR160d* 1476117 1476137 GCGTATGAGGAGCCATGCATA 3 Cmo-MIR162a PmiREN005373 MIR162 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268519.1 1280107 1280233 + GAATGGGAGGTGGAGTCAGTGGAAGCAGCGGTTCATCGACCTCTTCTTGGGATTTGTAATGAATCGAACGCAAAAACACGAACCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCTCTCTCGCTCTCTAT ...................((((.((((.((((.(((((((..(((.((...(((((............)))))..)).)))..))))))).)))).)))).))))..................... 1280127 1280213 GGAAGCAGCGGTTCATCGACCTCTTCTTGGGATTTGTAATGAATCGAACGCAAAAACACGAACCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAG (((.((((.((((.(((((((..(((.((...(((((............)))))..)).)))..))))))).)))).)))).))).. 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Cmo-miR162b 1245355 1245375 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Cmo-miR162b* 1245288 1245308 GGAGGCAGCGGTTCATCGACC 3 Cmo-MIR164a PmiREN005375 MIR164 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268517.1 10196936 10197069 + AAGGTGCGTGCCGATCAGGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTTACTCAGTTGGTAACTCCACGGCGGCGGCGCCGCTGAGTGGGTTGTTCATGTGCCCGTCTTCCCCATCGTGACCACTGCAAACCTTAG ((((((((((..(.(((.(((((.((((..(((((((((.((.((((((((((.(((.....)))(((((....))))))))))))))).)).)))))))))..)))).))))).))))))).))..))))).. 10196956 10197049 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTTACTCAGTTGGTAACTCCACGGCGGCGGCGCCGCTGAGTGGGTTGTTCATGTGCCCGTCTTCCCCATC (((.((((..(((((((((.((.((((((((((.(((.....)))(((((....))))))))))))))).)).)))))))))..)))).))).. 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Cmo-miR164b 6891069 6891089 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Cmo-miR164b* 6891021 6891041 CACGTGCTCCCTTTCTCCAAC 3 Cmo-MIR164c PmiREN005377 MIR164 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268520.1 7058892 7059022 + AAGGTGCGTGCCGATCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTTACTCATGTAGCGACGCGACGTGGGTGCCGCTGAGTGCGTTGTTCATGTGCCCGTCTTCTCCATCGTGACCACTGCAACCTTTGC .....((((((.(.(((.((((((((((..(((((((((.((.((.((((((.(((.(.(((...))).).)))...)))))).)).)).)))))))))..)))))))))).)))...).))).....))) 7058912 7059002 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTTACTCATGTAGCGACGCGACGTGGGTGCCGCTGAGTGCGTTGTTCATGTGCCCGTCTTCTCCATC ((((((((..(((((((((.((.((.((((((.(((.(.(((...))).).)))...)))))).)).)).)))))))))..)))))))).. 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Cmo-miR167d 15665 15684 TGAAGCTGCCAGCATGATCT Cmo-miR167d* 15594 15614 AGATCATATGGCAGTTTCACC 3 Cmo-MIR167e PmiREN005401 MIR167 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268539.1 2827396 2827521 + TGTCGTGCGCTTACAACAGTTCAAGCTGCCAGCATGATCTAACCTTAATCTCTCCTAATTTTCGATTCTCCTGAGGTTTAAGATTAGATCATATGGCAGTTTCACCTGTTGCTGGCTCCACGAAGA ..(((((.(((..((((((...(((((((((..(((((((((.(((((((((....................)))).))))).))))))))).)))))))))...))))))..)))..)))))... 2827416 2827501 TCAAGCTGCCAGCATGATCTAACCTTAATCTCTCCTAATTTTCGATTCTCCTGAGGTTTAAGATTAGATCATATGGCAGTTTCACC ..(((((((((..(((((((((.(((((((((....................)))).))))).))))))))).))))))))).... Cmo-miR167e 2827416 2827437 TCAAGCTGCCAGCATGATCTAA Cmo-miR167e* 2827481 2827501 AGATCATATGGCAGTTTCACC 3 Cmo-MIR167f PmiREN005402 MIR167 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268540.1 1927830 1928002 - TGTGTTCGCGAGGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTACCTTTGGTCGGCAGGCAACGCGTTAAAGAGAAAAGTGAGAAGATAAAGAGATTGGAAATGAGTTTTGCCTCAATTGCCAACCCTAGTTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTGCTTTCGAACTTT ...(((((.(((((((..(((((.(((((.(((((((((((.((..(((.(((((((((.((........................................)).))))).....)))).)))..)).)))))))))))..).)))).)))))..))))..))).)))))... 1927850 1927982 TGAAGCTGCCAGCATGATCTACCTTTGGTCGGCAGGCAACGCGTTAAAGAGAAAAGTGAGAAGATAAAGAGATTGGAAATGAGTTTTGCCTCAATTGCCAACCCTAGTTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACT (((.(((((.(((((((((((.((..(((.(((((((((.((........................................)).))))).....)))).)))..)).)))))))))))..).)))).))).. Cmo-miR167f 1927962 1927982 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Cmo-miR167f* 1927850 1927872 GGTCATGCTCTGACAGCCTCACT 3 Cmo-MIR167g PmiREN005403 MIR167 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268540.1 1922282 1922409 - CGCCGTGCGCCACTAGCTGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAATCCGAATCCTCCCCGGCGCCGCCTCCAGCGCTCCATCGGAATCGGATCATTATGGTAGCTTCACCTGCTCCTGGTACCACGATTA ...((((.((((..(((.(.(((((((((((..(((((((((.(((((.........(((((........)))))...))))).)))))))))..))))))))))).).)))..))))..)))).... 1922302 1922389 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAATCCGAATCCTCCCCGGCGCCGCCTCCAGCGCTCCATCGGAATCGGATCATTATGGTAGCTTCACC (((((((((((..(((((((((.(((((.........(((((........)))))...))))).)))))))))..))))))))))).. Cmo-miR167g 1922368 1922389 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Cmo-miR167g* 1922302 1922322 GATCATTATGGTAGCTTCACC 3 Cmo-MIR167h PmiREN005404 MIR167 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268559.1 99404 99527 - CATGTGTTGGTTTGAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGGGACGGGTAAATTTATGATCAAAAAGTTGGTTCCTTCCATCAGATCATCTTGCAGCTTCAATCACTCAATCTCCAACAACAC ..((((((((.(((((.((((((((((((.((.((((((((((((.(((..(((((.........)))))...))).))).))))))))))).)))))))))))).)))))...))))).))). 99424 99507 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGGGGACGGGTAAATTTATGATCAAAAAGTTGGTTCCTTCCATCAGATCATCTTGCAGCTTCAAT (((((((((.((.((((((((((((.(((..(((((.........)))))...))).))).))))))))))).))))))))).. 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Cmo-miR167i 1608231 1608252 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA Cmo-miR167i* 1608132 1608152 AGGTCATCTTGCAGCTTCAAT 3 Cmo-MIR167j PmiREN005406 MIR167 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268576.1 963884 964003 + TGTCGTGCGCTTATATCAGTTCAAGCTGCCAGCATGATCTAACCTTAATCTCTGCTAATTATGTTCGAGATTCAAGATCAGATCATATGGCAGCTTCACCTGTTCTTGGCTGCACGAAGA (.(((((((((.....(((...(((((((((..(((((((...(((((((((.((.......))..)))))).)))...))))))).)))))))))...))).....))).))))))..) 963904 963983 TCAAGCTGCCAGCATGATCTAACCTTAATCTCTGCTAATTATGTTCGAGATTCAAGATCAGATCATATGGCAGCTTCACC ..(((((((((..(((((((...(((((((((.((.......))..)))))).)))...))))))).))))))))).... Cmo-miR167j 963904 963925 TCAAGCTGCCAGCATGATCTAA Cmo-miR167j* 963963 963983 AGATCATATGGCAGCTTCACC 3 Cmo-MIR168a PmiREN005407 MIR168 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268521.1 3254679 3254839 + AGTCATCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGTTTCGCTTCTTGATCTTGTTGTTCATGTTCTTGAGTTTCCTCTGCTGTTAGGGGGGAAAATTTGGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCCGAGACCGCGATGAAGATT ..((((((.(((((((..(((((.((((((((((.(((((.(((.((((((((..((.(.((.....)).).))..)).((((((((........)))))))).....)))))).))).))))).)))))))))).)))))..)))))))))))))..... 3254699 3254819 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGTTTCGCTTCTTGATCTTGTTGTTCATGTTCTTGAGTTTCCTCTGCTGTTAGGGGGGAAAATTTGGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((.(((.((((((((..((.(.((.....)).).))..)).((((((((........)))))))).....)))))).))).))))).)))))))))).))).. Cmo-miR168a 3254699 3254719 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Cmo-miR168a* 3254799 3254819 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Cmo-MIR168b PmiREN005408 MIR168 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268524.1 3584883 3585035 + GGTCATCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGCTTCGCTTCTTGATTTTGTGCTCTTAAATTTCCTCTGCTGTAAGAGGAAATAATCGCGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCCGAGACCGCGATGAAGATT ........((((((((..(((((.((((((((((.(((((.(((.(((((....(((((............(((((((((......)))))))))))))).))))).))).))))).)))))))))).)))))..)))))))).......... 3584903 3585015 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGCTTCGCTTCTTGATTTTGTGCTCTTAAATTTCCTCTGCTGTAAGAGGAAATAATCGCGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((.(((.(((((....(((((............(((((((((......)))))))))))))).))))).))).))))).)))))))))).))).. Cmo-miR168b 3584903 3584923 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Cmo-miR168b* 3584995 3585015 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Cmo-MIR168c PmiREN005409 MIR168 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268525.1 3165815 3166047 - TAACACCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGCTTCGCTCTGGTGTGCGTTTGCCGACGGCCGGCATCTCCTCATCTTCTTTTTCTGTTTTTCTCTGCTTCTATTTCTTTTACTTTTTGCTTCATTTCTCTTGCCGCCGTGTGGTTAAGCTTGTTCGGGAAATGTTTGGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAAACCGTGGTGAAGATT ...(((((.((((.(((.(((((.((((((((((.(((((.(((.(((((((......((((((.((((((((.((((.................................................................)))))))))((......)).....))).))))))..))))))).))).))))).)))))))))).))))).))).)))))))))...... 3165835 3166027 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGCTTCGCTCTGGTGTGCGTTTGCCGACGGCCGGCATCTCCTCATCTTCTTTTTCTGTTTTTCTCTGCTTCTATTTCTTTTACTTTTTGCTTCATTTCTCTTGCCGCCGTGTGGTTAAGCTTGTTCGGGAAATGTTTGGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((.(((.(((((((......((((((.((((((((.((((.................................................................)))))))))((......)).....))).))))))..))))))).))).))))).)))))))))).))).. Cmo-miR168c 3166007 3166027 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Cmo-miR168c* 3165835 3165855 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Cmo-MIR169a PmiREN005410 MIR169 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268522.1 3396506 3396634 + AAAAGAAAGAGAGGACTACTAAGCCAAGGATGAATTGCCGGCGATGATAGACTTTGGTTAATGCAGGCTTCTTATTAGTTTGTGGCCGGCAATTCTATTCTTGGCTAAGTGTGGCTTTCTTTCTCTCAT ...((((((((((...((((.(((((((((((((((((((((.......(((....)))...(((((((.......))))))).))))))))))).)))))))))).))))...))))))))))..... 3396526 3396614 AAGCCAAGGATGAATTGCCGGCGATGATAGACTTTGGTTAATGCAGGCTTCTTATTAGTTTGTGGCCGGCAATTCTATTCTTGGCTAAG .(((((((((((((((((((((.......(((....)))...(((((((.......))))))).))))))))))).))))))))))... Cmo-miR169a 3396526 3396546 AAGCCAAGGATGAATTGCCGG Cmo-miR169a* 3396594 3396614 GCAATTCTATTCTTGGCTAAG 3 Cmo-MIR169b PmiREN005411 MIR169 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268534.1 189925 190066 + GAATGGAGAGTCATGTACTGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCAGCCTGCAACTTCATGAAGGGATCTGTAAAAAGCTGCCCCCTGCAATGGCATACTCATGCAGGCAGTCTCTTTGGCTATCGAGACCGGCTCTTATTTCCC (((..(((((((..((.(((((((((((((.((((.((((((((((((((..........(((..(.((.....)).)..)))))))..))).......))))))))))))))))))))))..)))).)))))))..))).. 189945 190046 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCAGCCTGCAACTTCATGAAGGGATCTGTAAAAAGCTGCCCCCTGCAATGGCATACTCATGCAGGCAGTCTCTTTGGCTATC ((((((((((.((((.((((((((((((((..........(((..(.((.....)).)..)))))))..))).......))))))))))))))))))))).. 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Cmo-miR169c 1893408 1893428 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Cmo-miR169c* 1893339 1893359 CAGGCAGTCTCCTTGGCTAAT 3 Cmo-MIR169d PmiREN005413 MIR169 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268537.1 897101 897243 - AGATGTGAAAGTTTGTTTAGTGAGCCAAAGATGACTTGCCTATCGTGAAAGCATATAACGAAGGGTTTCTCGTCCAAGAAACTCTTAGTTATACATTTTATAGGCAGTTGTCTTTGGCTAATTTGATAGACTTCTATCTTTCA ........(((((((((.(((.((((((((((((((.((((((...((((...((((((.((((((((((......)))))))))).))))))..)))))))))))))))))))))))).))).))))))))).......... 897121 897223 TGAGCCAAAGATGACTTGCCTATCGTGAAAGCATATAACGAAGGGTTTCTCGTCCAAGAAACTCTTAGTTATACATTTTATAGGCAGTTGTCTTTGGCTAATT (.((((((((((((((.((((((...((((...((((((.((((((((((......)))))))))).))))))..)))))))))))))))))))))))).).. Cmo-miR169d 897203 897223 TGAGCCAAAGATGACTTGCCT Cmo-miR169d* 897121 897141 GGCAGTTGTCTTTGGCTAATT 3 Cmo-MIR169e PmiREN005414 MIR169 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268537.1 896846 896982 - AAGATAAGAGCGTTGTGTGATAGCCAAAAATGACTTGCCTGCAATAGCTCGTATGAAACTTTCTCGGTTGCTTTGATCAACCCTAGTTTCCAATGCTGGCGGGTCATTGAGGCTAACTTACGAGTTCTTTTCTTTCA ((((.((((((.(((((.(.(((((...(((((((((((.(((...........((((((.....(((((.......)))))..))))))...))).)))))))))))..))))).).))))))))))).))))... 896866 896962 TAGCCAAAAATGACTTGCCTGCAATAGCTCGTATGAAACTTTCTCGGTTGCTTTGATCAACCCTAGTTTCCAATGCTGGCGGGTCATTGAGGCTAAC (((((...(((((((((((.(((...........((((((.....(((((.......)))))..))))))...))).)))))))))))..))))).. Cmo-miR169e 896941 896962 TAGCCAAAAATGACTTGCCTGC Cmo-miR169e* 896866 896886 TGGCGGGTCATTGAGGCTAAC 3 Cmo-MIR169f PmiREN005415 MIR169 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268602.1 358577 358727 - GAATGAAGAGGGCGGTGTTGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCATACAACACTCAACAAAATAACACACACACTGGTGGTGTGAGGTGTATGGTGTGTGGTGTGGTTTGTGCAGGCAGTCTCCTTGGCTAATATCTCACCCTCTTATCTCTC ((...(((((((.((.((..((((((((((.((((.(((((((((..(((((..(((..(((.(((.((((((...))))))..))))))..)))..)))))....)))))))))))))))))))))))..)).)).)))))))...)).. 358597 358707 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCATACAACACTCAACAAAATAACACACACACTGGTGGTGTGAGGTGTATGGTGTGTGGTGTGGTTTGTGCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAT ((((((((((.((((.(((((((((..(((((..(((..(((.(((.((((((...))))))..))))))..)))..)))))....))))))))))))))))))))))).. Cmo-miR169f 358687 358707 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Cmo-miR169f* 358597 358617 CAGGCAGTCTCCTTGGCTAAT 3 Cmo-MIR171a PmiREN005416 MIR171 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268519.1 2575670 2575788 - GTGCGAGACTCGGAAAGCGATATTGGTGAGGTTCAATCGGAAGACGAATTTTACCAAACTTGTGTAAAGTACGATCTCTGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTTTTTATATTTCCAGGA ..............(((.((((((((((.((((((((((((.((((.(((((((((....)).))))))).)).)))))))))))))).)))))))))).)))................ 2575690 2575768 TATTGGTGAGGTTCAATCGGAAGACGAATTTTACCAAACTTGTGTAAAGTACGATCTCTGATTGAGCCGCGCCAATATC ((((((((.((((((((((((.((((.(((((((((....)).))))))).)).)))))))))))))).)))))))).. 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Cmo-miR171b 2102352 2102372 TGATTGAGCCGCGCCAATATC Cmo-miR171b* 2102261 2102281 TATTGGCCCGGTTCACTCAGA 3 Cmo-MIR171c PmiREN005418 MIR171 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268541.1 155715 155831 - ATACGAAAATCCGAAAGCGATGTTGGTGAGGTTCAATCTGAAGACGAATTTCACAAGGACTGTGAAGTACGATCTCTGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTTTGTATCATGTTGCTC (((.((.....((((((.((((((((((.(((((((((.((.((((.((((((((.....)))))))).)).)))).))))))))).)))))))))).))))))..)).)))..... 155735 155811 TGTTGGTGAGGTTCAATCTGAAGACGAATTTCACAAGGACTGTGAAGTACGATCTCTGATTGAGCCGCGCCAATATC ((((((((.(((((((((.((.((((.((((((((.....)))))))).)).)))).))))))))).)))))))).. Cmo-miR171c 155735 155755 TGATTGAGCCGCGCCAATATC Cmo-miR171c* 155791 155811 TGTTGGTGAGGTTCAATCTGA 3 Cmo-MIR171d PmiREN005419 MIR171 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268543.1 1470291 1470448 - GCTTGAAATAGCCGGTCTGATATTGACCCGGTTCACTCAGATCAGTACCTGTTTACCAGCTGCACGACATGCACTAGTTATTCGTGCATGTCGTGGGTTTTAAAGCTTAGCTGAATCTGATTGAGCCGCGCCAATATCTCAGTGCTATTTCATATATG ...((((((((((.....(((((((.(.(((((((.((((((((((....((((...((((.((((((((((((.........))))))))))))))))...))))...)))).)))))).))))))).).)))))))...).)))))))))...... 1470311 1470428 TATTGACCCGGTTCACTCAGATCAGTACCTGTTTACCAGCTGCACGACATGCACTAGTTATTCGTGCATGTCGTGGGTTTTAAAGCTTAGCTGAATCTGATTGAGCCGCGCCAATATC (((((.(.(((((((.((((((((((....((((...((((.((((((((((((.........))))))))))))))))...))))...)))).)))))).))))))).).))))).. Cmo-miR171d 1470311 1470331 TGATTGAGCCGCGCCAATATC Cmo-miR171d* 1470408 1470428 TATTGACCCGGTTCACTCAGA 3 Cmo-MIR172a PmiREN005420 MIR172 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268518.1 5360736 5360851 + CGCAGCCATAATTTGCTGGTGCGGCATCATCAAGATTCACAATAAGATTCTTGTTTACTCGAGATTATTTGATTGAGAATCTTGATGATGCTGCATTAGCAATCATTGAATGGCTA ...(((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((((((......)))))..)))).)))).))))))))))))))))))))))))))..)))..)))))). 5360756 5360831 GCGGCATCATCAAGATTCACAATAAGATTCTTGTTTACTCGAGATTATTTGATTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.((((.(((((((((......)))))..)))).)))).)))))))))))))))))).. 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Cmo-miR172b 5886004 5886024 AGAATCTTGATGATGCTGCAG Cmo-miR172b* 5885929 5885949 GCTGCATCTTCAAGATTCACA 3 Cmo-MIR172c PmiREN005422 MIR172 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268518.1 5889035 5889146 + CACAGCCACTGCTTGCAGCTGCAGTATCATTAAGATTCACAAGCTGCCCCCTTTTGGGTGCCATGGATATGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCCGCAATCAATGGCTTACAC ...(((((.((.((((.(((((((((((((((((((((.((.(((((.(((....))).))...)).).)).))))))))))))))))))))).)))).)).)))))..... 5889055 5889126 GCAGTATCATTAAGATTCACAAGCTGCCCCCTTTTGGGTGCCATGGATATGAGAATCTTGATGATGCTGCAG ((((((((((((((((((.((.(((((.(((....))).))...)).).)).)))))))))))))))))).. 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Cmo-miR172d 2440766 2440786 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Cmo-miR172d* 2440702 2440722 GCGGCATCATCAAGATTCACA 3 Cmo-MIR172e PmiREN005424 MIR172 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268523.1 2204717 2204842 - CACAGCCATAATTTGCTTGTGCGGCATCATCAAGATTCACAATGATTTTTGAGAGTTCATGTTTTTTTTGAAGCTTGTTTGGTTGAGAATCTTGATGATGCTGCATTAGCAATAGCTTCAATGGCT .............((((.((((((((((((((((((((.((((.(....((((..((((.........)))).))))..).)))).)))))))))))))))))))).))))..((((.....)))) 2204737 2204822 GCGGCATCATCAAGATTCACAATGATTTTTGAGAGTTCATGTTTTTTTTGAAGCTTGTTTGGTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.((((.(....((((..((((.........)))).))))..).)))).)))))))))))))))))).. Cmo-miR172e 2204737 2204757 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Cmo-miR172e* 2204802 2204822 GCGGCATCATCAAGATTCACA 3 Cmo-MIR172f PmiREN005425 MIR172 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268523.1 1796470 1796568 - CTCAGCCATTGTTGGCTGTTGCTGCATCATGAAGATTCACAGTCTCTTCCCAGGTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCCATTAATGGCTTCTTC ...((((((((.((((((((((.(((((((.(((((((.(((..(((....))).))).))))))).))))))).)))))))))).))))))))..... 1796490 1796548 GCTGCATCATGAAGATTCACAGTCTCTTCCCAGGTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAG ((.(((((((.(((((((.(((..(((....))).))).))))))).))))))).)).. Cmo-miR172f 1796490 1796510 AGAATCTTGATGATGCTGCAG Cmo-miR172f* 1796528 1796548 GCTGCATCATGAAGATTCACA 3 Cmo-MIR172g PmiREN005426 MIR172 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268526.1 3226775 3226899 + TACAGTTGTTGGTCGCTGGTGTGGCATTATCAAGATTCACACTCATATGGGTTTCGGAGCTTCCCGAGTTCTTTGCTGCAGCTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATCAACCACTTTGTT .......((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((.(((.(((((......))))).))).)).)).)).)).)))))))))))))))))))))))).))))))......... 3226795 3226879 GTGGCATTATCAAGATTCACACTCATATGGGTTTCGGAGCTTCCCGAGTTCTTTGCTGCAGCTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.((((((((.(((.(((((......))))).))).)).)).)).)).)))))))))))))))))).. Cmo-miR172g 3226859 3226879 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Cmo-miR172g* 3226795 3226815 GTGGCATTATCAAGATTCACA 3 Cmo-MIR172h PmiREN005427 MIR172 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268530.1 2681317 2681438 + GGCAGTGGTTGTTTGCAGGCGTGGCATCTTCAAGATTCACATGCAAAAAGCTCTCTTTCAGGGAGGGCATAGCATAGCTTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATCAAACCACTATGT ...((((((((.((((.((.((((((((.(((((((((.((.((.....((((((((...))))))))........)).)).))))))))).)))))))).)).)))).).))))))).... 2681337 2681418 GTGGCATCTTCAAGATTCACATGCAAAAAGCTCTCTTTCAGGGAGGGCATAGCATAGCTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((.(((((((((.((.((.....((((((((...))))))))........)).)).))))))))).)))))))).. 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Cmo-miR172i 3048385 3048405 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Cmo-miR172i* 3048330 3048350 GTAGCATTATCAAGATTCACA 3 Cmo-MIR172j PmiREN005429 MIR172 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268547.1 1974932 1975032 - GGCAGGCGTTATTTGCAGGAGTAGCATCTTCAAGATTCACAAGCTGAATAATTCAACCTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATAAAACGACTATAT ....((((((..((((.((.((((((((.(((((((((.((.(.((((...)))).).)).))))))))).)))))))).)).))))...)))).)).... 1974952 1975012 GTAGCATCTTCAAGATTCACAAGCTGAATAATTCAACCTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((.(((((((((.((.(.((((...)))).).)).))))))))).)))))))).. Cmo-miR172j 1974952 1974972 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Cmo-miR172j* 1974992 1975012 GTAGCATCTTCAAGATTCACA 3 Cmo-MIR172k PmiREN005483 MIR172 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268529.1 498721 498864 + AGCAGCCATTATTTGTTGGCGCAGCACCATCAAGATTCACAAGGCTTCCCATCTTTAAATTTCTCTCTTCATTGAAGAAAGAAGAACAAAGGCTTCTCCTTTGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGTCAATTACATGGCTTATA ....................((((((.(((((((((((.(((((.......(((((...(((((.(((((...))))).)))))...)))))......))))).))))))))))).))))))...................... 498741 498844 GCAGCACCATCAAGATTCACAAGGCTTCCCATCTTTAAATTTCTCTCTTCATTGAAGAAAGAAGAACAAAGGCTTCTCCTTTGGGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((.(((((((((((.(((((.......(((((...(((((.(((((...))))).)))))...)))))......))))).))))))))))).)))))).. Cmo-miR172k 498824 498844 GGAATCTTGATGATGCTGCAT Cmo-miR172k* 498741 498761 GCAGCACCATCAAGATTCACA 3 Cmo-MIR319a PmiREN005432 MIR319 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268537.1 2007302 2007518 - TACTAAGACTTTGAGAAGAGGGAGCTCTCTTCAGTCCAGTCCAAGGCAGCTTCTCGGTTGCTACTTAGCTGCTGACTCGTTGGCTCAATAACTCATCAACTGAAATAAATGTTTGGACAATGATGTGTTTCTGAACCAACGATGCAGGAGCCAAGTTCAGCCATGGCTGTCACGTCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCGCCATCCACTACCTTTGTT (...)............((((((((((((((((((((((.....(((((((....(((((..((((.(((.(((..(((((((.(((..(((.(((((..(.((((....)))).)....))))).)))..))).)))))))..))).))).)))).)))))..))))))).....))))))))))))))))))))))................... 2007322 2007498 GGAGCTCTCTTCAGTCCAGTCCAAGGCAGCTTCTCGGTTGCTACTTAGCTGCTGACTCGTTGGCTCAATAACTCATCAACTGAAATAAATGTTTGGACAATGATGTGTTTCTGAACCAACGATGCAGGAGCCAAGTTCAGCCATGGCTGTCACGTCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT (((((((((((((((((((.....(((((((....(((((..((((.(((.(((..(((((((.(((..(((.(((((..(.((((....)))).)....))))).)))..))).)))))))..))).))).)))).)))))..))))))).....))))))))))))))))))).. Cmo-miR319a 2007322 2007342 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Cmo-miR319a* 2007478 2007498 GGAGCTCTCTTCAGTCCAGTC 3 Cmo-MIR319b PmiREN005433 MIR319 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268538.1 3107170 3107378 + ATAATTTTGTGAGGGTTAAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGCCGTAGGGTTTAATTAGCTGCCGACTCATTCGTTCAAATACTGAGTCAATCAATCGGCTGTCGATTCAGTAAACGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTCCTTTTAACCCTTCTTTC ..........((((((((((((((((((((((((((((...(((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((((...(((((((((...((......))..)))))))))...))))))))))..))).)).).)))))))))))).))).)))))...))))))))))))))))).......)))))))))))..... 3107190 3107358 AGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGCCGTAGGGTTTAATTAGCTGCCGACTCATTCGTTCAAATACTGAGTCAATCAATCGGCTGTCGATTCAGTAAACGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT .(((((((((((((((((...(((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((((...(((((((((...((......))..)))))))))...))))))))))..))).)).).)))))))))))).))).)))))...)))))))))))))))))... Cmo-miR319b 3107338 3107358 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Cmo-miR319b* 3107190 3107210 AGAGCTTTCTTCAGTCCACTC 3 Cmo-MIR319c PmiREN005434 MIR319 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268566.1 1224742 1224951 + GATATTTTGTGAGGGTTAAGAGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGCGGTAGGGTTTAATTAGCTGCCGACTCATTCGTTCTAATACTGAGTCAAAAACCCGAGTCTCCGATTCAGTAAACGAATGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTATACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTCCTTTTACCCTTTTGATT ........(((((((..(((.(((((((((((((((((...(((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((((...(((((((((....((....))....)))))))))...))))))))))..))).)).).)))))))))))).))).)))))...))))))))))))))))).)))..))))))).......... 1224762 1224931 AGAGCTTTCTTCAGTCCACTCATGGGTGGCGGTAGGGTTTAATTAGCTGCCGACTCATTCGTTCTAATACTGAGTCAAAAACCCGAGTCTCCGATTCAGTAAACGAATGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTATACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT .(((((((((((((((((...(((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((((...(((((((((....((....))....)))))))))...))))))))))..))).)).).)))))))))))).))).)))))...)))))))))))))))))... Cmo-miR319c 1224911 1224931 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Cmo-miR319c* 1224762 1224782 AGAGCTTTCTTCAGTCCACTC 3 Cmo-MIR319d PmiREN005435 MIR319 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268580.1 270021 270220 - AAACTTTAGGCGTAAAAGAGGGAGCTTTCTTTAGTCCACTAATGGGAGGCGGTGAGATTCAATTAGCTGCTGACTCATTCATCCAAATATTGAGTTCAAAATGGCTCATTAAATGAGTGAATGACGCAGGAGACAGATTGAATCTTAAACCTTCCTTTCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTAATCTTCCCTTCTCCATTC .................(((((((((((((((((((((..((.((((((...((((((((((((.(((.(((..((((((((.((..((.((((((......)))))).))..)).))))))))..))).)).).))))))))))))..)))))).))..)))))))))))))))))))))................... 270041 270200 GGAGCTTTCTTTAGTCCACTAATGGGAGGCGGTGAGATTCAATTAGCTGCTGACTCATTCATCCAAATATTGAGTTCAAAATGGCTCATTAAATGAGTGAATGACGCAGGAGACAGATTGAATCTTAAACCTTCCTTTCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT ((((((((((((((((((..((.((((((...((((((((((((.(((.(((..((((((((.((..((.((((((......)))))).))..)).))))))))..))).)).).))))))))))))..)))))).))..)))))))))))))))))).. Cmo-miR319d 270041 270061 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Cmo-miR319d* 270180 270200 GGAGCTTTCTTTAGTCCACTA 3 Cmo-MIR390a PmiREN005436 MIR390 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268520.1 6992462 6992599 + AAGCGAAGAAGAATCCTCTGAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATCAATGGCGGTTCCGTTTCTGATGAACTGCCGAACCGGTGATTCCTCCGCTGCGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCACCGGTTCTCCTTGCTCTGCT ..................((((((((((((.((((((((((......((((((((.(((...)))))))))))....(((((.......))))).)))))))))).)))))))))))).................... 6992482 6992579 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATCAATGGCGGTTCCGTTTCTGATGAACTGCCGAACCGGTGATTCCTCCGCTGCGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCA ((((((((((.((((((((((......((((((((.(((...)))))))))))....(((((.......))))).)))))))))).)))))))))).. Cmo-miR390a 6992482 6992502 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Cmo-miR390a* 6992559 6992579 CGCTATCCATCCTGAGTTTCA 3 Cmo-MIR390b PmiREN005437 MIR390 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268526.1 4118440 4118569 + GTAGCACGGGAGAATCCGTCAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCGTCGAATAAAACACCACCGGAATGTTCATTTCCGCCGCCGCTTGCCGGCGCTATCTATCCTGAGTTTCATGGCTTCTTCTTGCTTTTTA ..((((.(((((((.((((.((((((((((.(((((((((((.(((.............((((.......))))((....))))).))))))))))).)))))))))).)))).)))))))))))..... 4118460 4118549 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCGTCGAATAAAACACCACCGGAATGTTCATTTCCGCCGCCGCTTGCCGGCGCTATCTATCCTGAGTTTCA ((((((((((.(((((((((((.(((.............((((.......))))((....))))).))))))))))).)))))))))).. Cmo-miR390b 4118460 4118480 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Cmo-miR390b* 4118529 4118549 CGCTATCTATCCTGAGTTTCA 3 Cmo-MIR390c PmiREN005438 MIR390 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268529.1 808218 808330 + CTAGCACCGGAGAATCTGTCAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCCCTCCAATAATCTCTCAAACTCGGGTTCCGGCGCTATCTATCCTGGGTTTCATGGCTTCTTCTTGCTTTTTT ..((((..((((((.((((.((((((((((.((((((((((...((..................))....)))))))))).)))))))))).)))).)))))).))))..... 808238 808310 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCCCTCCAATAATCTCTCAAACTCGGGTTCCGGCGCTATCTATCCTGGGTTTCA ((((((((((.((((((((((...((..................))....)))))))))).)))))))))).. Cmo-miR390c 808238 808258 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Cmo-miR390c* 808290 808310 CGCTATCTATCCTGGGTTTCA 3 Cmo-MIR390d PmiREN005439 MIR390 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268530.1 3770182 3770312 - TTAGTATGGGAGACTCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGTTCGTTGATTATGAGTATCAATAATATCACTGCACCTTTCAATGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATAGCTTCTTCTTACTCGCTC ..((((.((((((..((((.((((((((((.(((((((((((((((.((.(((((((........)))..)))).)).))).....)))))))))))).)))))))))).))))..))))))))))..... 3770202 3770292 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGTTCGTTGATTATGAGTATCAATAATATCACTGCACCTTTCAATGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCA ((((((((((.(((((((((((((((.((.(((((((........)))..)))).)).))).....)))))))))))).)))))))))).. Cmo-miR390d 3770272 3770292 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Cmo-miR390d* 3770202 3770222 CGCTATCCATCCTGAGTTTCA 3 Cmo-MIR390e PmiREN005440 MIR390 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268531.1 3660805 3660945 + ATTGCACGGAAGAGTCCGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCGTGTCGATCGATCGACGTTGTTGCATTAGCTCCCCCGACATCGTCGTATTCTTTTCGGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCCCGGCTTCTTCTTGCTTTTTT ...(((.(((((((.(((..((((((((((.((((((((((....(((..((((((((.(((((............))))).))))).)))....))))))))))))).))))))))))..))).))))))))))...... 3660825 3660925 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCGTGTCGATCGATCGACGTTGTTGCATTAGCTCCCCCGACATCGTCGTATTCTTTTCGGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCC ((((((((((.((((((((((....(((..((((((((.(((((............))))).))))).)))....))))))))))))).)))))))))).. Cmo-miR390e 3660825 3660845 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Cmo-miR390e* 3660905 3660925 CGCTATCCATCCTGAGTTTCC 3 Cmo-MIR390f PmiREN005441 MIR390 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268588.1 727088 727213 + AACGCACGGAAGAGTCCGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCGTTGTTGCATCACCGCCTTACCACGCCGTCCCATTCTCTTCCGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGCTTCTTCTTGCTCCATT ...(((.(((((((.((((.((((((((((.(((((((((((..........((.((........)).))............))))))))))).)))))))))).)))).))))))))))...... 727108 727193 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCGTTGTTGCATCACCGCCTTACCACGCCGTCCCATTCTCTTCCGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCA ((((((((((.(((((((((((..........((.((........)).))............))))))))))).)))))))))).. 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Cmo-miR393b 605090 605111 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Cmo-miR393b* 605140 605160 ATCATGCCATCTCTTTGGATT 3 Cmo-MIR393c PmiREN005444 MIR393 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268527.1 5104910 5105060 - CTTGGTGCCGGTGGAGAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCAATGTTCGTCTCGTCTTGGCTCGTTTCGCCCCATTGACGAGGTCGAAGTTGATTCCGGATTGTTCATTGGATCATGCGATCTCTTAGGAATCTTCCATCGGTAGCTCTAA ...(.(((((((((((.(((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((..((...))..)))..))))))).)))).................))))))))))))))))))))).))))).))))))))))).)..... 5104930 5105040 CCAAAGGGATCGCATTGATCCAATGTTCGTCTCGTCTTGGCTCGTTTCGCCCCATTGACGAGGTCGAAGTTGATTCCGGATTGTTCATTGGATCATGCGATCTCTTAGGAA ((.((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((..((...))..)))..))))))).)))).................))))))))))))))))))))).)).. Cmo-miR393c 5105020 5105040 CCAAAGGGATCGCATTGATCC Cmo-miR393c* 5104930 5104950 GATCATGCGATCTCTTAGGAA 3 Cmo-MIR393d PmiREN005445 MIR393 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268537.1 317832 317955 - GTGTGGAACTACAGGAAGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCCAACTTATCTATATCCTTCAATTTCTTCTACGTAATTTTGGATCATGCTATCCCTTCGGATGCCTCCTTTAGCTACTAATCC ........(((.((((.((((((.(((((((.((((.(((((.((.((((.......................)))).)).))))))))).))))))).)))))).)))).))).......... 317852 317935 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCCAACTTATCTATATCCTTCAATTTCTTCTACGTAATTTTGGATCATGCTATCCCTTCGGATG (((.(((((((.((((.(((((.((.((((.......................)))).)).))))))))).))))))).))).. Cmo-miR393d 317914 317935 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Cmo-miR393d* 317852 317872 ATCATGCTATCCCTTCGGATG 3 Cmo-MIR393e PmiREN005446 MIR393 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268550.1 609907 610041 + CCTTAGGGCTGGTGGAGAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCAATATGTTTGTCACGCTCACGATGTTGGAGTCGATTCTCGATTGTTTATTGGATCGTGCGATCCCTTAGGAACCATCCATCAATAGCTCTAAT ..((((((((((((((..(((((.((((((((((((.(((((((((.....(((.......((((......))))......)))....))))))))))))))))))))).)))))..))))))...)))))))). 609927 610021 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCAATATGTTTGTCACGCTCACGATGTTGGAGTCGATTCTCGATTGTTTATTGGATCGTGCGATCCCTTAGGAAC (((.((((((((((((.(((((((((.....(((.......((((......))))......)))....))))))))))))))))))))).))).. Cmo-miR393e 609927 609948 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Cmo-miR393e* 610001 610021 ATCGTGCGATCCCTTAGGAAC 3 Cmo-MIR393f PmiREN005484 MIR393 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268525.1 916111 916255 + CTCTGCAACTAGAGGAAGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCCAACTTATATATATATATATATACACATATATACTTACAGCTTCTTCTACATATAATTTTGGATCATGCTATCCCTTCGGATTCCTCCTTTAGGTAGTTCCTT ....................(((.(((((((.((((.(((((.((.((((((.(((((((((......)))))))..............)).)))))).)).))))))))).))))))).)))...................... 916131 916235 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCCAACTTATATATATATATATATACACATATATACTTACAGCTTCTTCTACATATAATTTTGGATCATGCTATCCCTTCGGATT (((.(((((((.((((.(((((.((.((((((.(((((((((......)))))))..............)).)))))).)).))))))))).))))))).))).. 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Cmo-miR394a 6661864 6661883 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Cmo-miR394a* 6661945 6661965 GAGGTGGGCATACTGCCAACT 3 Cmo-MIR394b PmiREN005448 MIR394 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268524.1 274849 274984 - GGGCTTCCCCGCAGAGTTCATTGGCATTCTGTCCACCTCCTTTCCCGGCTTCACCGAGTGTTTACTGTTTGGTTGGGGTTTTATATGATGTTGGGGAGGTGGGCATGCTGCCAATTCAGCTCTGTCGGATTCTCTT (((..(((..((((((((.(((((((...(((((((((((((((((((((......(((....)))....))))))))..............)))))))))))))...)))))))..)))))))).)))..))).. 274869 274964 TTGGCATTCTGTCCACCTCCTTTCCCGGCTTCACCGAGTGTTTACTGTTTGGTTGGGGTTTTATATGATGTTGGGGAGGTGGGCATGCTGCCAATT ((((((...(((((((((((((((((((((......(((....)))....))))))))..............)))))))))))))...)))))).. Cmo-miR394b 274945 274964 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Cmo-miR394b* 274869 274889 GAGGTGGGCATGCTGCCAATT 3 Cmo-MIR394c PmiREN005449 MIR394 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268532.1 2084898 2085020 - AGGGTTTCCAACAGAATTTATTGGCATTCTGTCCACCTCCTTCTCCATCGAAACATCCAAAAACACTTTCTTCTTTCATTTGGAGGTGGGCATACTGCCAACTGAGCTCTGTTTGGCTCCTCT ((((...((((((((.((((((((((...(((((((((((.........................................)))))))))))...)))))).)))).)))).))))...)))) 2084918 2085000 TTGGCATTCTGTCCACCTCCTTCTCCATCGAAACATCCAAAAACACTTTCTTCTTTCATTTGGAGGTGGGCATACTGCCAACT ((((((...(((((((((((.........................................)))))))))))...)))))).. Cmo-miR394c 2084981 2085000 TTGGCATTCTGTCCACCTCC Cmo-miR394c* 2084918 2084938 GAGGTGGGCATACTGCCAACT 3 Cmo-MIR394d PmiREN005450 MIR394 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268543.1 1485752 1485933 + AAAGGGTTTCCAACAGAATTTATTGGCATTCTGTCCACCTCAAATACCCAAAACAAGGTTTATCAACAAAAACCTTAAAAATCACGAAAGCCCTTTGCTTTTTGTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTGGTTTGTTCTTTCAACTTGGAGGTGGGCATACTGCCAATTGAGCTCTGTTTGGCTCCT ..((((...((((((((.((((((((((...((((((((((..........((((((.(....(((((..(((..(((....(((((((((.....)).)))))))..))).))).)))))...).))))))...........))))))))))...)))))).)))).)))).)))).)))) 1485772 1485913 TTGGCATTCTGTCCACCTCAAATACCCAAAACAAGGTTTATCAACAAAAACCTTAAAAATCACGAAAGCCCTTTGCTTTTTGTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTGGTTTGTTCTTTCAACTTGGAGGTGGGCATACTGCCAATT ((((((...((((((((((..........((((((.(....(((((..(((..(((....(((((((((.....)).)))))))..))).))).)))))...).))))))...........))))))))))...)))))).) Cmo-miR394d 1485772 1485791 TTGGCATTCTGTCCACCTCA Cmo-miR394d* 1485893 1485913 GAGGTGGGCATACTGCCAATT 3 Cmo-MIR395a PmiREN005451 MIR395 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268527.1 4696630 4696742 - AAGGTCATTTGCTTCCTAGAGTTTCCCTGAATGACTTCATTTAGGCCGAGTTTTAACTAACGTTTTCCTACAATGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTCAACTGACGAACA ...............(.(((((((((((((((.((((((((((((....(((......))).....)))).))))))))))))))))))))))).)................. 4696650 4696722 GTTTCCCTGAATGACTTCATTTAGGCCGAGTTTTAACTAACGTTTTCCTACAATGAAGTGTTTGGGGGAACTC ((((((((((((.((((((((((((....(((......))).....)))).)))))))))))))))))))).. Cmo-miR395a 4696650 4696669 TGAAGTGTTTGGGGGAACTC Cmo-miR395a* 4696702 4696722 GTTTCCCTGAATGACTTCATT 3 Cmo-MIR395b PmiREN005452 MIR395 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268528.1 3675860 3675971 - TCGATCAGGCGTCTCCTAGAGTTCCCTTCCAAGCACTTCAGATGAACATGCCAAGAAATCCAAATCTTTTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGGTGTGACTTGATCTCAA ..(((((((((.(.((((((((((((..(((((((((((((.((((.......(((........)))))))))))))))))))))))))))))))).))).))))))).... 3675880 3675951 GTTCCCTTCCAAGCACTTCAGATGAACATGCCAAGAAATCCAAATCTTTTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC ((((((..(((((((((((((.((((.......(((........)))))))))))))))))))))))))).. Cmo-miR395b 3675880 3675899 TGAAGTGTTTGGGGGAACTC Cmo-miR395b* 3675931 3675951 GTTCCCTTCCAAGCACTTCAG 3 Cmo-MIR396a PmiREN005453 MIR396 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268519.1 2562451 2562603 + TCCCATGGCTCTGTTCGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTTCTTGAGCCCGATTCGCTCCTCTCTCTCTCTTAAAATCGCGCTATTGTTCATCATTTTCTTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACACACAGGGCCAACC .....(((((((((..(((((.((((((((((((.((((((((((......(((...((((.(((.....................)))..))))....)))........)))))))))).)))))))))))).)))))..)))))))))... 2562471 2562583 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTTCTTGAGCCCGATTCGCTCCTCTCTCTCTCTTAAAATCGCGCTATTGTTCATCATTTTCTTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((......(((...((((.(((.....................)))..))))....)))........)))))))))).)))))))))))).) Cmo-miR396a 2562471 2562491 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Cmo-miR396a* 2562563 2562583 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Cmo-MIR396b PmiREN005454 MIR396 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268519.1 2565927 2566053 - GGGAGGACCTGGCCATGTTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCTCTTTATTTTCTTCTAATTCTGAAGATTTTAATCGATTTTGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGACATCATGGCATTTCAGGCTTCT ...........((((((...(((((((((((((((((.((((.((.(((...(((((.......)))))...)))..))....)))).)))))))))))))))))...))))))............. 2565947 2566033 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCTCTTTATTTTCTTCTAATTCTGAAGATTTTAATCGATTTTGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGACA (((((((((((((((((.((((.((.(((...(((((.......)))))...)))..))....)))).))))))))))))))))).. Cmo-miR396b 2566013 2566033 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Cmo-miR396b* 2565947 2565967 GCTCAAGAAAGCTGTGGGACA 3 Cmo-MIR396c PmiREN005455 MIR396 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268522.1 860262 860382 + AGTTCAGGTCGAAGCCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTCTCTCAATCATTTGCATGCAAATCTCTGTTAGAAAGTTGAAGAAAGCTGTGGGAGAAGATGGCATTTTTAGGCC ......((((((((((((..(((((((((((((((((.((((((((.....((...(((((....)))))...))..)))))))).)))))))))))))))))..))))).)))...)))) 860282 860362 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTCTCTCAATCATTTGCATGCAAATCTCTGTTAGAAAGTTGAAGAAAGCTGTGGGAGA (((((((((((((((.((((((((.....((...(((((....)))))...))..)))))))).))))))))))))))))) Cmo-miR396c 860282 860302 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Cmo-miR396c* 860342 860362 GTTGAAGAAAGCTGTGGGAGA 3 Cmo-MIR396d PmiREN005456 MIR396 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268528.1 905471 905613 + GCTAGAGGTCCTAGCCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTCCTCTTTTTTCATTCATCTTCTCAATCATTTCTATGCAAAGTAAAAACCCTTTGGAAGTTCATGAAAGCTGTGGGAGAACATGGCATTTCTAGGCC .........((((((((((.(((((((((((((((.(((((((((......(((((.(.(((((................))).)).).)))))......))))))))).))))))))))))))).)))))).....)))).. 905491 905593 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTCCTCTTTTTTCATTCATCTTCTCAATCATTTCTATGCAAAGTAAAAACCCTTTGGAAGTTCATGAAAGCTGTGGGAGA (((((((((((((.(((((((((......(((((.(.(((((................))).)).).)))))......))))))))).))))))))))))))) Cmo-miR396d 905491 905511 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Cmo-miR396d* 905573 905593 GTTCATGAAAGCTGTGGGAGA 3 Cmo-MIR396e PmiREN005457 MIR396 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268528.1 909269 909414 - TCTTGGTCCTCTTTGTATTCTTCCACGGCTTTCTTGAACTGCATCATCATGTTCTTCACAAAAAGGCTACTTTCTTCTTGGATTTCTTCCATTTCAATGGCTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAATAAAAGGATCAACC ..((((((((..(((((((.((((((((((((.((((((((((((((..............((((....)))).....((((.....)))).....)))).)))))))))).)))))))))))).)))))))....)))))))).. 909289 909394 TTCCACGGCTTTCTTGAACTGCATCATCATGTTCTTCACAAAAAGGCTACTTTCTTCTTGGATTTCTTCCATTTCAATGGCTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((((((..............((((....)))).....((((.....)))).....)))).)))))))))).)))))))))))).. Cmo-miR396e 909374 909394 TTCCACGGCTTTCTTGAACTG Cmo-miR396e* 909289 909309 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Cmo-MIR396f PmiREN005458 MIR396 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268541.1 143812 143957 + AGAAATGGCTCTGTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTTCCTGAGCCAAATTCGATCCTCTCTCTCTCGAAGCGTTCTTCGTTCATTAACTTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGACAAGGTCAACG .....(((((.((((((((((.((((((((((((.((((((((((......(((((....(((((...........))))).........)))))........)))))))))).)))))))))))).)))))))))).)))))... 143832 143937 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTTCCTGAGCCAAATTCGATCCTCTCTCTCTCGAAGCGTTCTTCGTTCATTAACTTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG ((((((((((((.((((((((((......(((((....(((((...........))))).........)))))........)))))))))).)))))))))))).) Cmo-miR396f 143832 143852 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Cmo-miR396f* 143917 143937 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG 3 Cmo-MIR408 PmiREN005459 MIR408 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268527.1 932257 932398 - GGGGGATTGGGAGAACGGCAGCGGGGAACAGACAGCGCATGGATGGAGTCCTCAACAAAACAAAACCTTTGCCTTCCTCTCTTTGTTGGGCCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTGCCTTCATATTCTCATCTCCA ............(((.((((((((((((.((.(((.((((((.(((((.((.(((((((......................))))))))).))))).)))))).))).)).)))))).)))))))))............... 932277 932378 GCGGGGAACAGACAGCGCATGGATGGAGTCCTCAACAAAACAAAACCTTTGCCTTCCTCTCTTTGTTGGGCCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTG ((((((((.((.(((.((((((.(((((.((.(((((((......................))))))))).))))).)))))).))).)).)))))).)).. Cmo-miR408 932277 932298 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCTG Cmo-miR408* 932358 932378 GCGGGGAACAGACAGCGCATG 3 Cmo-MIR530 PmiREN005460 MIR530 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268538.1 3018857 3018980 - CCAAATTGTTAGCCTTCTCCTGCATTTGCACCTACACCTTCAGCTTTGTTTCTTCTTTTCTCTTCAAATGCACAAGGCCACTGAGGTGCAGGTGCTTCTGCAAGTGAATGCCATCTTGGCTCTC ((((..((...((.(((.(.((((...((((((.((((((..(((((((......................)))))))....)))))).))))))...)))).).))).))))..))))..... 3018877 3018960 TGCATTTGCACCTACACCTTCAGCTTTGTTTCTTCTTTTCTCTTCAAATGCACAAGGCCACTGAGGTGCAGGTGCTTCTGCAAG ((((...((((((.((((((..(((((((......................)))))))....)))))).))))))...)))).. Cmo-miR530 3018940 3018960 TGCATTTGCACCTACACCTTC Cmo-miR530* 3018877 3018897 AGGTGCAGGTGCTTCTGCAAG 3 Cmo-MIR2111a PmiREN005430 MIR2111 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268520.1 6696831 6696981 - TTTATTGGGTAAGGATCAGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTAGATCAGAGTAATCAAATTTATAATAATAATAAATTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGGTCTCCTTTTCTAGGCCTCGGGTTGCAGATTACCTCTTCCCTTCCAACAATGCT ....(((((...(((..((((((((((((.(((((((((((((...((....))((((((((.......))))))))................(((((...)))))))))))))))))).))))))))))))..)))..)))))....... 6696851 6696961 TAATCTGCATCCTGAGGTTTAGATCAGAGTAATCAAATTTATAATAATAATAAATTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGGTCTCCTTTTCTAGGCCTCGGGTTGCAGATTACC (((((((((.(((((((((((((...((....))((((((((.......))))))))................(((((...)))))))))))))))))).))))))))).. Cmo-miR2111a 6696942 6696961 TAATCTGCATCCTGAGGTTT Cmo-miR2111a* 6696851 6696871 GGCCTCGGGTTGCAGATTACC 3 Cmo-MIR2111b PmiREN005431 MIR2111 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268531.1 3245538 3245663 - ATGATTGAGTTAGGATCTGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTAGGGAGTTCAATATGTTACTTATCCTCTCATGATGTGCTTCGCTGGTCCTTGGGATGCAGATTATCTCTTCCTGATTGACAATATA ...((((((((((((...(((((((((((((((((((.(((((((((.((.((((.............)))).)).))))).)))).)))))))))))))))))))...))))))))..))))... 3245558 3245643 TAATCTGCATCCTGAGGTTTAGGGAGTTCAATATGTTACTTATCCTCTCATGATGTGCTTCGCTGGTCCTTGGGATGCAGATTATC (((((((((((((((((.(((((((((.((.((((.............)))).)).))))).)))).))))))))))))))))).. Cmo-miR2111b 3245624 3245643 TAATCTGCATCCTGAGGTTT Cmo-miR2111b* 3245558 3245578 GTCCTTGGGATGCAGATTATC 3 Cmo-MIR6300a PmiREN005461 MIR6300 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268528.1 3860869 3861030 - GTACAGAAATTTAACAAATCGGTCGTTGTAGTATAGTGGTAAGTATTCCCGCCTGTCACGCGGGTGACCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGTTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTGACATTTATGCTCAAAACGGTCCGTTTAATAGATTAAGTGCAACT ((((...((((((..(((.((((((((..(((((((((...........((((.(((((....)))))(((((.......)))))....)))).................((.....)))).)))))))...))))).))))))..))))))..)))).... 3860889 3861010 GGTCGTTGTAGTATAGTGGTAAGTATTCCCGCCTGTCACGCGGGTGACCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGTTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTGACATTTATGCTCAAAACGGTCCGT (((((((..(((((((((...........((((.(((((....)))))(((((.......)))))....)))).................((.....)))).)))))))...))))).)).. Cmo-miR6300a 3860991 3861010 GGTCGTTGTAGTATAGTGGT Cmo-miR6300a* 3860889 3860909 TTTATGCTCAAAACGGTCCGT 3 Cmo-MIR6300b PmiREN005462 MIR6300 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268551.1 1174264 1174473 - GTTGCATATGCTAGAGGCATGGTCGTTGTAGTATAGTGGTGAGTATTCCCGCCTATCATGCAGGTGACCCGGGTTCGATCCCTGACTGAATCGTCTCGTAAAATCGTTACGGTATAGTGGTGAGTATTCTCACATTATCTATGTTAGTAGATATTGTCCGCTTTATTCCATTACAGTTACACGTAACCGTCAGCCTCACAATTTTAAAAC ...((....))..(((((((((((((.((((..((((((.((((((((((((...(((..((((.((..((....)).))))))..)))(((((..((......))..)))))...)))).))))))))..(((.(((((((....))))))).)))..........))))))...)))))))..)))))..)))))............. 1174284 1174453 GGTCGTTGTAGTATAGTGGTGAGTATTCCCGCCTATCATGCAGGTGACCCGGGTTCGATCCCTGACTGAATCGTCTCGTAAAATCGTTACGGTATAGTGGTGAGTATTCTCACATTATCTATGTTAGTAGATATTGTCCGCTTTATTCCATTACAGTTACACGTAACCGT ((((((.((((..((((((.((((((((((((...(((..((((.((..((....)).))))))..)))(((((..((......))..)))))...)))).))))))))..(((.(((((((....))))))).)))..........))))))...)))))))..))).. Cmo-miR6300b 1174434 1174453 GGTCGTTGTAGTATAGTGGT Cmo-miR6300b* 1174284 1174304 ATTACAGTTACACGTAACCGT 3 Cmo-MIR6300c PmiREN005463 MIR6300 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268590.1 497078 497202 + TTAGAAAACCTAAATCAACAGGTCGTTGTAGTATAGTGGTAAGTATTTTTGTGGTGTAGGCGACACATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCAATGGTAGGTTAGTGGCCTACTATGGTGG ......((((((..........((((((.(((((((.((((...((((..(((((((.(....))))))))..))))...))))))))..)))..)))))))))))).................. 497098 497182 GGTCGTTGTAGTATAGTGGTAAGTATTTTTGTGGTGTAGGCGACACATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCAATGGTAGG ..((((((.(((((((.((((...((((..(((((((.(....))))))))..))))...))))))))..)))..)))))).... Cmo-miR6300c 497098 497117 GGTCGTTGTAGTATAGTGGT Cmo-miR6300c* 497162 497182 CTATCAACTTTCAATGGTAGG 3 Cmo-MIRN45 PmiREN005469 MIRN45 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268613.1 131161 131397 + TTCACAGCCTAACCTCGGTTCTTTGAAGCTTTGCCAGGAAGCGGCCGACTTGTTGAAGCTTTGCTTCCCCTAATTCCAAAACACAAGACAAGAATAGACTTGCAACTCCGTATAGGAAAAAGCTTCTCTTTGATAGCGGTCATAGGGTGTAAGGATCTGATCGTATCTCGAGACTGAAACACCTGTGCAGGGGTAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAA (((((((((...(((.(((((((((..((((((((.((((((((..(.(((....)))).))))))))....................((((......))))..((((((((((((........((((...((((.((((((...(((......)))))))))))))..))))........))))))).)))))...)))))).))...)))).))))).)))....)).))))))) 131181 131377 CTTTGAAGCTTTGCCAGGAAGCGGCCGACTTGTTGAAGCTTTGCTTCCCCTAATTCCAAAACACAAGACAAGAATAGACTTGCAACTCCGTATAGGAAAAAGCTTCTCTTTGATAGCGGTCATAGGGTGTAAGGATCTGATCGTATCTCGAGACTGAAACACCTGTGCAGGGGTAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGA (((((..((((((((.((((((((..(.(((....)))).))))))))....................((((......))))..((((((((((((........((((...((((.((((((...(((......)))))))))))))..))))........))))))).)))))...)))))).))...)))).).. Cmo-miRN45 131358 131377 GGCGGATGTAGCCAAGTGGA Cmo-miRN45* 131181 131201 CTTTGAAGCTTTGCCAGGAAG 3 Cmo-MIRN964 PmiREN005466 MIRN964 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268547.1 1901317 1901438 - TCAAGTTTGGTGCCTTCATCTGCATTTGCACCTGCACCTTAACCTCTCTCTCTCTTTTAAACCTTCTTCAGAGAAGGTGTAAGGTGCTGGTGCATTTGCAGCTGAATGCCATCTTGGAAACC (((((..((((...((((.(((((..((((((.((((((((((((.(((((..................))))))))).)))))))).))))))..))))).)))).)))).)))))..... 1901337 1901418 TGCATTTGCACCTGCACCTTAACCTCTCTCTCTCTTTTAAACCTTCTTCAGAGAAGGTGTAAGGTGCTGGTGCATTTGCAGC ((((..((((((.((((((((((((.(((((..................))))))))).)))))))).))))))..)))).. Cmo-miRN964 1901337 1901357 AGGTGCTGGTGCATTTGCAGC Cmo-miRN964* 1901398 1901418 TGCATTTGCACCTGCACCTTA 3 Cmo-MIRN972 PmiREN005485 MIRN972 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268529.1 4550104 4550225 + TGGTGGAGTTTTTTTGAACGAGATGTTGGTTCGGTTCAATAAGAAAGCAGTGCTCTGTTTAACTTGTGTTCTTCTTTTTTATTGAGCCGTGCCAATATCACGTGTCGTATTTTTTGCTTATA .....................(((((((((.((((((((((((((((.((.((.(..........).)).)).)))))))))))))))).)))))))))....................... 4550124 4550205 AGATGTTGGTTCGGTTCAATAAGAAAGCAGTGCTCTGTTTAACTTGTGTTCTTCTTTTTTATTGAGCCGTGCCAATATCACG .(((((((((.((((((((((((((((.((.((.(..........).)).)).)))))))))))))))).)))))))))... Cmo-miRN972 4550124 4550143 AGATGTTGGTTCGGTTCAAT Cmo-miRN972* 4550185 4550205 TTGAGCCGTGCCAATATCACG 3 Cmo-MIRN973 PmiREN005473 MIRN973 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268530.1 1767610 1767732 + TGGTCAAAAGAATGGTAACTAGCTTCCCTTTGTTGACTGTGGGTAAAAAGGTGCCTCTAAGGATGAGACTCCATTTAGTTACCGTCAGCAAAGTGGAAGCTAGTGCTTCAAATTTACCGTTGA .........((..((((.(((((((((((((((((((.((((.((((..((.(.(((.......))).).)).)))).)))).)))))))))).))))))))))))))).............. 1767630 1767712 AGCTTCCCTTTGTTGACTGTGGGTAAAAAGGTGCCTCTAAGGATGAGACTCCATTTAGTTACCGTCAGCAAAGTGGAAGCTAG (((((((((((((((((.((((.((((..((.(.(((.......))).).)).)))).)))).)))))))))).))))))).. Cmo-miRN973 1767691 1767712 CCGTCAGCAAAGTGGAAGCTAG Cmo-miRN973* 1767630 1767650 AGCTTCCCTTTGTTGACTGTG 3 Cmo-MIRN980 PmiREN005468 MIRN980 Cucurbita moschata Cmo-NW_019268563.1 1483913 1484038 + TTCCATGGCTTTGTGGTATATTCCATCTCTTGCACACTGGACCACCGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGCCAGCCCTAGGAAGATGGCTGGTGTGCATTAGATGGAATACGCCATTCAACCATGTGCTT ...(((((....(((((.((((((((((..((((((((((.(((...((.((..(((((((....)))).)))..)).)).)))))))))))))..)))))))))).)))))....)))))..... 1483933 1484018 TTCCATCTCTTGCACACTGGACCACCGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGCCAGCCCTAGGAAGATGGCTGGTGTGCATTAGATGGAATA ((((((((..((((((((((.(((...((.((..(((((((....)))).)))..)).)).)))))))))))))..)))))))).. 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