miRNA_locus_ID	miRNA_locus_accession	miRNA_family	Organism	Chromosome	Start	End	Strand	Stem_loop_with_extended_20bp_seq	Stem_loop_with_extended_20bp_structure	Stem_loop_start	Stem_loop_end	Stem_loop_seq	Stem_loop_seq_structure	mature_miRNA	mature_start	mature_end	mature_seq	star_miRNA	star_start	star_end	star_seq	Confidence_level
Csi-MIR156a	PmiREN004753	MIR156	Citrus sinensis	Csi-scaffold00013	544049	544177	-	GTAAAAAGGGTAAGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTATTTTCTTGCATGCTTTGAGATCCTGCTTGAAGCGATGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCCCAACCCCCCCGCCCCCCAA	...............((.((((((((((((((((((((((.(((.(((......)))..((((((((......)))))))).))).))))))))))))).)))))))))))..................	544069	544157	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTATTTTCTTGCATGCTTTGAGATCCTGCTTGAAGCGATGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCACC	((((((((((((((((((((.(((.(((......)))..((((((((......)))))))).))).))))))))))))).)))))))..	Csi-miR156a	544138	544157	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Csi-miR156a*	544069	544089	GCTCACTCTCTATCTGTCACC		3
Csi-MIR156b	PmiREN004752	MIR156	Citrus sinensis	Csi-scaffold00025	1066349	1066471	-	AATTCTTGGAACATTGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCAGTTGTATAATTGTATACATGTTGCTTTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGCTTCCAGTACCGGAATCTGAC	.(((((.((.((...(((.(((((((((((((((((((((.(((((((((.((((((....))))))..))))))))).))))))))).))).))))))))).)))..)).))))))).....	1066369	1066451	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCAGTTGTATAATTGTATACATGTTGCTTTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGC	((((((((((((((((((((.(((((((((.((((((....))))))..))))))))).))))))))).))).))))))))..	Csi-miR156b	1066432	1066451	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Csi-miR156b*	1066369	1066389	CTCACTGCTCTTTCTGTCAGC		3
Csi-MIR157a	PmiREN004755	MIR157	Citrus sinensis	Csi-scaffold00445	44117	44243	+	GAGGGAAATGGGTGATGCTGGTGACAGAAGATAGAGAGCGCAGATGATGATATGCTCTAATGGAGTTTGTATATCACTCCTTTGTGCTCTCTGTGCTTCTGTCATCAGGCCAATTCAGTCCCTCCCC	((((((..(((((....(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.............)))))))).)).)))))))))))))).)))))))))))))....))))).))))))...	44137	44223	GTGACAGAAGATAGAGAGCGCAGATGATGATATGCTCTAATGGAGTTTGTATATCACTCCTTTGTGCTCTCTGTGCTTCTGTCATCA	((((((((((((((((((((((((.((((((((((.............)))))))).)).)))))))))))))).))))))))))..	Csi-miR157a	44137	44157	GTGACAGAAGATAGAGAGCGC	Csi-miR157a*	44203	44223	CTCTCTGTGCTTCTGTCATCA		3
Csi-MIR157b	PmiREN004756	MIR157	Citrus sinensis	Csi-scaffold06336	3203	3327	+	GCTAATTTTTTGAAATTTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACATAAATTAAAATGCCATTAATCAAATGCATTTTAAATCTTTGAGCTCTCTGTATTCCGTCATCAACGTGCATCATCATTTGGAC	.................(((.((((.(((.(((((((((.((....(((((((((.(((.....)))))))))))).....)).))))))))).))).)))).))).((.((........)).))	3223	3307	TTGACAGAAGATAGAGAGCACATAAATTAAAATGCCATTAATCAAATGCATTTTAAATCTTTGAGCTCTCTGTATTCCGTCATCA	.((((.(((.(((((((((.((....(((((((((.(((.....)))))))))))).....)).))))))))).))).))))...	Csi-miR157b	3223	3243	TTGACAGAAGATAGAGAGCAC	Csi-miR157b*	3287	3307	GCTCTCTGTATTCCGTCATCA		3
Csi-MIR157c	PmiREN004757	MIR157	Citrus sinensis	Csi-scaffold00008	66819	66941	-	CTAATTTTCTGAAATTTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCGCATAAATTAAAATGCCATTAAGCAAACGCATTTTAAATCTTTGTGCTCTCTGTATTCTGTCATCAACGTGCAGCTTCATTTGGC	........(((..((.(((.((((((((.((((((((((((....(((((((((............))))))))).....)))))))))))).)))))))).))).)).)))...........	66839	66921	TGACAGAAGATAGAGAGCGCATAAATTAAAATGCCATTAAGCAAACGCATTTTAAATCTTTGTGCTCTCTGTATTCTGTCATC	((((((((.((((((((((((....(((((((((............))))))))).....)))))))))))).))))))))..	Csi-miR157c	66902	66921	TGACAGAAGATAGAGAGCGC	Csi-miR157c*	66839	66859	TGCTCTCTGTATTCTGTCATC		3
Csi-MIR157d	PmiREN004758	MIR157	Citrus sinensis	Csi-scaffold00042	344554	344676	-	AGGCATTGTCGATGATGCTGTTGACGGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAAATGCGTGGAGCTTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATCATCTTCAGCCTCTCCCTTTAC	((((..((..(((((......(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.......))))).))).)).))))))))))))).)))))))))))))))..))))))..........	344574	344656	TTGACGGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAAATGCGTGGAGCTTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATTCTTCTGTCATCA	.(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.......))))).))).)).))))))))))))).))))))))))...	Csi-miR157d	344636	344656	TTGACGGAAGATAGAGAGCAC	Csi-miR157d*	344574	344594	CTCTCTATTCTTCTGTCATCA		3
Csi-MIR159	PmiREN004759	MIR159	Citrus sinensis	Csi-scaffold09175	570	695	-	ATGAGGCAAGGGTTTGGATTAGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACAGTAGAAAGAGGAGCATTTTGGTTATCCTATTGTGAATGTGTGAATGAAGCGGGAGATAATATTCATCCTTTCTTCTCTG	(.((((.((((((....((((.((.(((..((((((((.((..((((((((...((.((.((...)).)).))))))))))..)).))))))))..))).)).))))....)))))).)))))...	590	675	AGCTGCCGACTCATTCATTCAAACACAGTAGAAAGAGGAGCATTTTGGTTATCCTATTGTGAATGTGTGAATGAAGCGGGAGATAA	(.((.(((..((((((((.((..((((((((...((.((.((...)).)).))))))))))..)).))))))))..))).)).)..	Csi-miR159	655	675	AGCTGCCGACTCATTCATTCA	Csi-miR159*	590	610	TGTGAATGAAGCGGGAGATAA		3
Csi-MIR160a	PmiREN004760	MIR160	Citrus sinensis	Csi-scaffold00270	16337	16458	-	TCTATATATTTATAATTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGTCAATCGAAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTCCATGTATAATATATACC	..((((((((((((...((((((.(((((((.((((((((((((((.((((((.((((....))))))).))).)))))))))))))).))))))).))))))....)))).))))))))..	16357	16438	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGTCAATCGAAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATA	(((.(((((((.((((((((((((((.((((((.((((....))))))).))).)))))))))))))).))))))).)))..	Csi-miR160a	16418	16438	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Csi-miR160a*	16357	16377	GCGTATGAGGAGCCATGCATA		3
Csi-MIR160b	PmiREN004761	MIR160	Citrus sinensis	Csi-scaffold00008	2211676	2211798	-	AAGGTGAAATTAATGGGTTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCGCAAGCAGACGACAATCTGCCGGAGATTGGCCGTTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATACTATTCTTCCTTCCCTTTCT	((((.(((...(((((..(((((.(((((((.((((((((((.(((((.((.((((((.....))))))..))))))).)))))))))).))))))).)))))))))).....))).))))..	2211696	2211778	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCGCAAGCAGACGACAATCTGCCGGAGATTGGCCGTTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATA	(((.(((((((.((((((((((.(((((.((.((((((.....))))))..))))))).)))))))))).))))))).)))..	Csi-miR160b	2211758	2211778	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCG	Csi-miR160b*	2211696	2211716	GCGTACGAGGAGCCAAGCATA		3
Csi-MIR160c	PmiREN004762	MIR160	Citrus sinensis	Csi-scaffold00688	61165	61286	+	TTGACGATTGATATATAGTATGCCTGGCTCCCTGTATGCTTTTTGCAAAGCCCATCAGAAGATTGGTGGTCTTGGCGGATAGCGTGCGAGGAGCCATGCATGCTAAATTTAGTGTCAAAAGC	......(((((....((((((((.(((((((.((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).)))))))).))))))).))))))))...))))).........	61185	61266	TGCCTGGCTCCCTGTATGCTTTTTGCAAAGCCCATCAGAAGATTGGTGGTCTTGGCGGATAGCGTGCGAGGAGCCATGCATG	(((.(((((((.((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).)))))))).))))))).)))..	Csi-miR160c	61185	61205	TGCCTGGCTCCCTGTATGCTT	Csi-miR160c*	61246	61266	GCGTGCGAGGAGCCATGCATG		3
Csi-MIR162	PmiREN004763	MIR162	Citrus sinensis	Csi-scaffold00030	259389	259519	+	ATAGAGAGAGTGAAGTCACTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCACTTTGTGCAAATTTTGTTGTGAAAAATAACACAAAATACATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCACTCCAACTCTATTC	((((((.((((((.(.(.(((((.((((.((((.(((((((..((((((...(((((((.((........))))))))).))))))..))))))).)))).)))).))))).))))))))...))))))..	259409	259499	GGAGGCAGCGGTTCATCGATCACTTTGTGCAAATTTTGTTGTGAAAAATAACACAAAATACATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAG	(((.((((.((((.(((((((..((((((...(((((((.((........))))))))).))))))..))))))).)))).)))).)))..	Csi-miR162	259479	259499	TCGATAAACCTCTGCATCCAG	Csi-miR162*	259409	259429	GGAGGCAGCGGTTCATCGATC		3
Csi-MIR164a	PmiREN004764	MIR164	Citrus sinensis	Csi-scaffold00042	779207	779416	+	AAGGTGTGTGTAGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCAACCGCACATACATCTACTAACAAAAATTAATTAATCCACACATTTTGAAGAAACCAAATCAAGAAGCAGCAAGCTCTTTCTGTTGTTATAGCTCAGTCATGAGTTGAGTTATTTCTTCATGTGCCCTTCTTCCCCATCATGACCGCGGCACCTTGTGT	((((((((((.....((.(((((.((((.((((((((((......(((((((..........................................((((((..........))))))(((((((.........)))))))...(((((....))))))))))))......)))))))))).)))).))))).))..))).)))))))....	779227	779396	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCAACCGCACATACATCTACTAACAAAAATTAATTAATCCACACATTTTGAAGAAACCAAATCAAGAAGCAGCAAGCTCTTTCTGTTGTTATAGCTCAGTCATGAGTTGAGTTATTTCTTCATGTGCCCTTCTTCCCCATC	(((.((((.((((((((((......(((((((..........................................((((((..........))))))(((((((.........)))))))...(((((....))))))))))))......)))))))))).)))).)))..	Csi-miR164a	779227	779247	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Csi-miR164a*	779376	779396	CATGTGCCCTTCTTCCCCATC		3
Csi-MIR164b	PmiREN004765	MIR164	Citrus sinensis	Csi-scaffold00001	5038716	5038846	+	TTGGGTGAGTAGCTCCTTGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACACCACTTTGGCTCCTTTCGGTTTCAGAATTGCCACTAAATCCTTTGCACGCGCTCCCCTTCTCCAACATGGGTTCCTCACCTTTCCT	..(((((((.(((.((.((.((((((((..((((.((((((((........((((....(((.......)))..))))........)))))))).))))..)))))))).)).))))).))))))).....	5038736	5038826	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACACCACTTTGGCTCCTTTCGGTTTCAGAATTGCCACTAAATCCTTTGCACGCGCTCCCCTTCTCCAAC	((((((((..((((.((((((((........((((....(((.......)))..))))........)))))))).))))..))))))))..	Csi-miR164b	5038736	5038756	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Csi-miR164b*	5038806	5038826	CACGCGCTCCCCTTCTCCAAC		3
Csi-MIR164c	PmiREN004766	MIR164	Citrus sinensis	Csi-scaffold00366	56195	56310	+	AGAGGGAGAATGAGCCAAGCTGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCCATCAGTTGTGAGAATTTTTGGAGTGTTGCATATGCTCTAGCTCTCCAGCTAGGACTTTCCCCCTAAAAG	..((((.((..(((((.(((((((((.((((((((.((((....((((..((((.....))))..)))).....)))).)))))).))))))))))).)).))))).)))).....	56215	56290	TGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCCATCAGTTGTGAGAATTTTTGGAGTGTTGCATATGCTCTAGCTCTCCAGC	((((((.((((((((.((((....((((..((((.....))))..)))).....)))).)))))).))))))))..	Csi-miR164c	56215	56235	TGGAGAAGCAGGGCACATGCT	Csi-miR164c*	56270	56290	CATATGCTCTAGCTCTCCAGC		3
Csi-MIR166a	PmiREN004767	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00009	2033701	2033902	+	GGAAGCTATTTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGCCACTAACTAGATCTTTGATTTAATCTCAGTTGATCATATATTTGTTTCATTTTTCTTCCATAAAATTTAATTATATTGAGATACCCATCATTGATCTTAAGATAATTAAGTTAGTGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATAATTGCTTCTATCTG	((((((........(((.((((((((..((((((.((((.(.(((((((((((((..((((...((((((((((((..((.((((...................)))).)))))).))))))))....))))..)))))...........)))))))).).)))).))))))..)))))))).))).....)))))).....	2033721	2033882	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGCCACTAACTAGATCTTTGATTTAATCTCAGTTGATCATATATTTGTTTCATTTTTCTTCCATAAAATTTAATTATATTGAGATACCCATCATTGATCTTAAGATAATTAAGTTAGTGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((.(.(((((((((((((..((((...((((((((((((..((.((((...................)))).)))))).))))))))....))))..)))))...........)))))))).).)))).))))))..))))))..	Csi-miR166a	2033862	2033882	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Csi-miR166a*	2033721	2033741	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Csi-MIR166b	PmiREN004768	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00974	27437	27598	+	GAGAGGTTATGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGGTCATCTAGGTTTTCAAAATTTTCTCGGACTTTCTTTCTTGCTTTTATTTTTCCAGGAAAATTATGTTATTTGCCTATGTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTCAACCGACGGTTTCTCT	..........((((((((((((((..((((((.((((((.((((.(((((...((.((((((((.(((......................))).)))))))).))......))))).)))))))))).))))))..))))))))))))))............	27457	27578	AATGTTGTTTGGCTCGAGGGTCATCTAGGTTTTCAAAATTTTCTCGGACTTTCTTTCTTGCTTTTATTTTTCCAGGAAAATTATGTTATTTGCCTATGTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC	((((..((((((.((((((.((((.(((((...((.((((((((.(((......................))).)))))))).))......))))).)))))))))).))))))..))))..	Csi-miR166b	27558	27578	TCTCGGACCAGGCTTCATTCC	Csi-miR166b*	27457	27477	AATGTTGTTTGGCTCGAGGGT		3
Csi-MIR166c	PmiREN004769	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00022	261488	261616	+	TCATACATGAACGGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGTTCGAGATCACTCGTGGACGAATTAATTAATAACTTATTGTCTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCAGTTTAATTGCTC	.((....((((((((((.((((((((..((((((((((((((((.(((.((((((................))))))..))).))))))))))))))))..)))))))).)))))..)))))..))...	261508	261596	GGAATGTTGTCTGGTTCGAGATCACTCGTGGACGAATTAATTAATAACTTATTGTCTTTTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((((((((((((.(((.((((((................))))))..))).))))))))))))))))..))))))..	Csi-miR166c	261576	261596	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Csi-miR166c*	261508	261528	GGAATGTTGTCTGGTTCGAGA		3
Csi-MIR166d	PmiREN004770	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00444	93224	93375	-	GGGAAGCTGTTCTTTTGAGGGGACTGTTGTCTGGTTCAAGGCCATCAATTAATTATAACTTTGATTCAGGTGTGTGTGTGTATGTATATATATATATGTGTGTGTGTGTTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTTAATTACTGCTTCCATTAT	.((((((.((....(((((((((.((..(((((((((.(((.(((.((((((........))))))((.((((((((((((....)))))))))))).)).....))).))).)))))))))..)).)))))))))..)).)))))).....	93244	93355	GGACTGTTGTCTGGTTCAAGGCCATCAATTAATTATAACTTTGATTCAGGTGTGTGTGTGTATGTATATATATATATGTGTGTGTGTGTTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	(((.((..(((((((((.(((.(((.((((((........))))))((.((((((((((((....)))))))))))).)).....))).))).)))))))))..)).)))..	Csi-miR166d	93244	93264	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Csi-miR166d*	93335	93355	GGACTGTTGTCTGGTTCAAGG		3
Csi-MIR166e	PmiREN004771	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00001	3167617	3167794	+	GGGAGCTTTTTGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTGCTTGTTGATCCATTAATTTTACGTATTCTCTCATAGATCTAGCATCTGAATGGTGGATAACAATATACGGATTCAGCTTATTTGGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATATATTGCTTCCATGG	((((((....(((.(((.((((((((..((((((.((((.(((.((....((((((((...........((((..........(((((.(((....))).)))))......))))))).)))))......)).))).)))).))))))..)))))))).))).)))..))))))....	3167637	3167774	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTGCTTGTTGATCCATTAATTTTACGTATTCTCTCATAGATCTAGCATCTGAATGGTGGATAACAATATACGGATTCAGCTTATTTGGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((.(((.((....((((((((...........((((..........(((((.(((....))).)))))......))))))).)))))......)).))).)))).))))))..))))))..	Csi-miR166e	3167754	3167774	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Csi-miR166e*	3167637	3167657	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Csi-MIR166f	PmiREN004772	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00974	27293	27425	+	NNNNNNNNNNNNNNCTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGATGCATTAATAATAATTATAATTATATAATTATAATTATCATGAAAAAAGGGTATCGGACCAGGCTTCATTCCCTTCAGAATCAAATTCATTGTT	..............(((((((((.((..((((((.(((((((....((.((((((((((((....)))))))))))).)).........))))))).))))))..)).))))))))).....(((.....)))	27313	27405	GGACTGTTGTCTGGCTCGATGCATTAATAATAATTATAATTATATAATTATAATTATCATGAAAAAAGGGTATCGGACCAGGCTTCATTCCCT	(((.((..((((((.(((((((....((.((((((((((((....)))))))))))).)).........))))))).))))))..)).)))..	Csi-miR166f	27385	27405	TCGGACCAGGCTTCATTCCCT	Csi-miR166f*	27313	27333	GGACTGTTGTCTGGCTCGATG		3
Csi-MIR166g	PmiREN004773	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00361	86090	86208	-	TCTTTCTCTCATAGTTGAGGGGAATGCTGTCTGGTTCGAGACCTTTCATTTGAAGAATAGAAAATCATCTGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACAAGGTGTGTTTTACC	.............((((.((((((((..(((((((((((((.(.((((..(((...........)))..)))).).)))))))))))))..)))))))).))))...............	86110	86188	GGAATGCTGTCTGGTTCGAGACCTTTCATTTGAAGAATAGAAAATCATCTGAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..(((((((((((((.(.((((..(((...........)))..)))).).)))))))))))))..))))))..	Csi-miR166g	86110	86130	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Csi-miR166g*	86168	86188	GGAATGCTGTCTGGTTCGAGA		3
Csi-MIR166h	PmiREN004774	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00346	128975	129119	+	ATAATGTGTTGGAGTTGAGAGGAATGGCGGCTGGTTCAAAGCTTCAAAAGAAAGTTTCTTAAGAAATAAGAAACAAGTATGAATCTTTCTCTCTAAAGATAGCTTTGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAAATTAAACACCTATCT	.....(((((....(((((((((((((.(.(((((((((((((..........((((((((.....))))))))........((((((......))))))))))))))))))).).))))))))))))).....)))))......	128995	129099	GGAATGGCGGCTGGTTCAAAGCTTCAAAAGAAAGTTTCTTAAGAAATAAGAAACAAGTATGAATCTTTCTCTCTAAAGATAGCTTTGGACCAGGCTTCATTCCTC	(((((((.(.(((((((((((((..........((((((((.....))))))))........((((((......))))))))))))))))))).).)))))))..	Csi-miR166h	129079	129099	TTGGACCAGGCTTCATTCCTC	Csi-miR166h*	128995	129015	GGAATGGCGGCTGGTTCAAAG		3
Csi-MIR166i	PmiREN004775	MIR166	Citrus sinensis	Csi-scaffold00346	129215	129335	+	TGAGAGGGTTAGGTTTGAGAGGAATGTTGTCTGGTTCAAGATCATGGAGGAAGAATAAATATCGGAACCCTAAATGATTCTTGGACCAGGCTTCATTCCACTCAACCAACTCCTCTTTGCT	..((((((((.((((.(((.((((((..(((((((((((((((((..(((..................)))..)))).)))))))))))))..)))))).)))))))))).))))).....	129235	129315	GGAATGTTGTCTGGTTCAAGATCATGGAGGAAGAATAAATATCGGAACCCTAAATGATTCTTGGACCAGGCTTCATTCCAC	((((((..(((((((((((((((((..(((..................)))..)))).)))))))))))))..))))))..	Csi-miR166i	129295	129315	TTGGACCAGGCTTCATTCCAC	Csi-miR166i*	129235	129255	GGAATGTTGTCTGGTTCAAGA		3
Csi-MIR167a	PmiREN004776	MIR167	Citrus sinensis	Csi-scaffold00255	234213	234328	-	ATTCGTGCACTAGTAGTAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAACTTTCCTTGACCTCCATCTCTAGGGAAAGGCCAGATCATCTGGCAGTTTCACCTATTGATGGTAGCATGGCCA	...(((((((((.((((((.((((((((((((.((((((((..((((((((((........)).))))))))..)))))))))))))))))))).)))))).)))).)))))....	234233	234308	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAACTTTCCTTGACCTCCATCTCTAGGGAAAGGCCAGATCATCTGGCAGTTTCACC	((((((((((((.((((((((..((((((((((........)).))))))))..))))))))))))))))))))..	Csi-miR167a	234287	234308	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA	Csi-miR167a*	234233	234253	AGATCATCTGGCAGTTTCACC		3
Csi-MIR167b	PmiREN004777	MIR167	Citrus sinensis	Csi-scaffold00011	67753	67864	-	TATCGGGCACCACTATCAGATGAAGCTGCCAGCATGATCTTAACTTTCCTCCTTTGCTCGAGGAATGATACAGATCATGCGGCAGTTTCACCTGTTCGTTGGTTGCACGAAA	..(((.(((((((...(((.((((((((((.(((((((((((.(.((((((........)))))).).)).))))))))))))))))))).)))...).))).))).)))..	67773	67844	TGAAGCTGCCAGCATGATCTTAACTTTCCTCCTTTGCTCGAGGAATGATACAGATCATGCGGCAGTTTCACC	((((((((((.(((((((((((.(.((((((........)))))).).)).)))))))))))))))))))..	Csi-miR167b	67823	67844	TGAAGCTGCCAGCATGATCTTA	Csi-miR167b*	67773	67793	AGATCATGCGGCAGTTTCACC		3
Csi-MIR167c	PmiREN004779	MIR167	Citrus sinensis	Csi-scaffold00022	607617	607763	-	CAGTCTACAAGGGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTAGCGCATTTGGTTAGTGAAAGTAATAAATAAAGAAGCAAGTACGATACTAACCCTAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTACTTGCGGACCCA	..((((.(((((((((..(((((.(((((.(((((((((((.((((.......((((((((...(((.................)))..)))))))))))).)))))))))))..).)))).)))))..))))).)))).))))...	607637	607743	TGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTAGCGCATTTGGTTAGTGAAAGTAATAAATAAAGAAGCAAGTACGATACTAACCCTAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACT	(((.(((((.(((((((((((.((((.......((((((((...(((.................)))..)))))))))))).)))))))))))..).)))).)))..	Csi-miR167c	607723	607743	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Csi-miR167c*	607637	607657	TCATGCTCTGACAGCCTCACT		3
Csi-MIR167d	PmiREN004778	MIR167	Citrus sinensis	Csi-scaffold00022	604336	604444	-	TATCGTGAACCAGCAGCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTCCTTCACTGTCAAGGATAGATCGGATCATGTGGTAGCTTCACCTGTTGATCGGATCACGAATT	..((((((.((.(((((((.(((((((((((.((((((((...(((((((.......))))).))...))))))))))))))))))).)))))).).)).))))))...	604356	604424	TGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTCCTTCACTGTCAAGGATAGATCGGATCATGTGGTAGCTTCACC	(((((((((((.((((((((...(((((((.......))))).))...)))))))))))))))))))..	Csi-miR167d	604404	604424	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Csi-miR167d*	604356	604376	GGATCATGTGGTAGCTTCACC		3
Csi-MIR168	PmiREN004780	MIR168	Citrus sinensis	Csi-scaffold00494	62162	62343	+	TCAGTTACCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTAGTTTTTTTTTGAAATTTTTTGACAGCGAGGTGGCGTGTTGTAATTGGTCGTAACGTTTAAATTAATGATTGAAAAAATGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGAGGTGAGAG	....(((((..((((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((((.((..((((((((.............((((((.(....).))))))....((((((.............)))))))))))))))).)))))).))))).)))))))))).))))).)))))))).)))))...	62182	62323	TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTAGTTTTTTTTTGAAATTTTTTGACAGCGAGGTGGCGTGTTGTAATTGGTCGTAACGTTTAAATTAATGATTGAAAAAATGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT	(((.((((((((((.(((((.((((((.((..((((((((.............((((((.(....).))))))....((((((.............)))))))))))))))).)))))).))))).)))))))))).)))))	Csi-miR168	62182	62202	TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA	Csi-miR168*	62303	62323	CCCGCCTTGCATCAACTGAAT		3
Csi-MIR169a	PmiREN004795	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00050	124520	124628	-	GAAGGGACAGGTAGAGGATCTAGAGCCAAGAATGACTTGCCGACGGCATTGACCATAATATCATACGGCAGGCCATTCTTGTCTCAACTCCGCTCTCTATCTTCTCATC	((.((((.(((.((.(((....(((.((((((((.((((((((.((.((((....)))).)).).))))))).)))))))).)))...))).)).))).)))).)))).	124540	124608	TAGAGCCAAGAATGACTTGCCGACGGCATTGACCATAATATCATACGGCAGGCCATTCTTGTCTCAACT	..(((.((((((((.((((((((.((.((((....)))).)).).))))))).)))))))).)))...)	Csi-miR169a	124587	124610	TAGAGCCAAGAATGACTTGCCG	Csi-miR169a*	124540	124560	CAGGCCATTCTTGTCTCAACT		2
Csi-MIR169b	PmiREN004782	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00003	3592477	3592701	+	AGGTAAAGGTTCTCGTTTTGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGGAGCCCCTCAACGGTATTCTTACTTATTTATCATTTCTCAAAATATACGAGTTAATTAACATAAAATCAGATCACGAAGTAGAGTAGTGCTTACATTCTACTTCAAGAAAATGAAAGGACTGTAGTATCTTTGAGTGGTTTGCAGGCCATCTCCTTGGCTAGCAAGATGGCTCTTATCTCTCAC	............((((((((((((((((((.((...((((((((((.(((((.(((((...(((...(((.(((((((((.........)))........................((((((((((.((....))))))))))))....)))))).)))...)))))))).))))).))))).)))))..))))))))))).)))))))))..............	3592497	3592681	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGGAGCCCCTCAACGGTATTCTTACTTATTTATCATTTCTCAAAATATACGAGTTAATTAACATAAAATCAGATCACGAAGTAGAGTAGTGCTTACATTCTACTTCAAGAAAATGAAAGGACTGTAGTATCTTTGAGTGGTTTGCAGGCCATCTCCTTGGCTAGCA	((((((((((.((...((((((((((.(((((.(((((...(((...(((.(((((((((.........)))........................((((((((((.((....))))))))))))....)))))).)))...)))))))).))))).))))).)))))..))))))))))).)..	Csi-miR169b	3592497	3592517	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Csi-miR169b*	3592661	3592681	AGGCCATCTCCTTGGCTAGCA		3
Csi-MIR169c	PmiREN004783	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold04340	5879	6015	-	GAAGAGAGGAGAAATGTTTTTTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGCCATGCAAGAGGGTTTCGAGTAGCTATAGAAAAGCTCTACTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGCTGACAGCCTTTTCTTTTTCA	.((((((((((...((((.((((((((((((.((((.((((((((((.(((..(((((((....((....))...)))))))..))).))).)).)))))))))))))))))))))..))))..))))))))))...	5899	5995	TTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGCCATGCAAGAGGGTTTCGAGTAGCTATAGAAAAGCTCTACTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGC	(((((((((((.((((.((((((((((.(((..(((((((....((....))...)))))))..))).))).)).))))))))))))))))))))..	Csi-miR169c	5975	5995	TTAGCCAAGGATGACTTGCCT	Csi-miR169c*	5899	5918	GGCAGTCTCCTTGGCTAAGC		3
Csi-MIR169d	PmiREN004784	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00307	198717	198850	-	AAGATACGAGTAATGTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTTGTAATATAATTAGGTTTCAAGCTTTGAAGCCTTTTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGCTGACATCTTCTTCTCTTTCA	((((....((..(((((.((((((((((((.((((.((((((((((...((((.....(((((((((...)))))))))..)))).))))).)))))))))))))))))).))).)))))))))))........	198737	198830	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTTGTAATATAATTAGGTTTCAAGCTTTGAAGCCTTTTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGC	((((((((((.((((.((((((((((...((((.....(((((((((...)))))))))..)))).))))).)))))))))))))))))).)..	Csi-miR169d	198810	198830	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Csi-miR169d*	198737	198756	GGCAGTCTCCTTGGCTAAGC		3
Csi-MIR169e	PmiREN004785	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00307	187436	187574	-	AATATAATATCATTGTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCTTGATTGCAAGACGAGGGTTTCAAGTGGCTGGAAGCCTCTCTTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGTCACAGGCTCTTATCTTTCA	((.((((.....((((...(((((((((((.((((.(((((((((......((((((.((((.(((((......))))).))))))))))..)).)).))))))))))))))))))))...))))....))))..))..	187456	187554	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCTTGATTGCAAGACGAGGGTTTCAAGTGGCTGGAAGCCTCTCTTGTTTGGTTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAG	((((((((((.((((.(((((((((......((((((.((((.(((((......))))).))))))))))..)).)).)))))))))))))))))))..	Csi-miR169e	187534	187554	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Csi-miR169e*	187456	187475	AGGCAGTCTCCTTGGCTAAG		3
Csi-MIR169f	PmiREN004781	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00157	122784	122929	-	AAGATAGAAGTAATGTTTGATAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATATGAGTGAGACGTGGCTTCAGTCATTTACTTTTTGTGATGACAACATTAATTTGGTTCCGGGCAGTCACCTTGGCTAGGCTGACAAACTCCTCTCTTTC	((((.((.(((..((((...(((((((((.(((((.(((((..(((...((((.(....).))))..((((((.((.....))))))))..........)))...)))))))))))))))))))....)))).))).)).))))..	122804	122909	TAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATATGAGTGAGACGTGGCTTCAGTCATTTACTTTTTGTGATGACAACATTAATTTGGTTCCGGGCAGTCACCTTGGCTAGG	(((((((((.(((((.(((((..(((...((((.(....).))))..((((((.((.....))))))))..........)))...)))))))))))))))))))..	Csi-miR169f	122889	122909	TAGCCAAGGATGACTTGCCCG	Csi-miR169f*	122804	122824	CGGGCAGTCACCTTGGCTAGG		3
Csi-MIR169g	PmiREN004787	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00003	3151713	3151899	+	TGTGGAGATGAAATGATGCGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAAGCCCCTTTCCTAGAACCTAAGCATCATATTTTTAGATGGCTTCACAATTATGAGTCTTTTGACTTGGGGTTTGATTTTATAGCTTCACTTGTAGGGTTAATCGGCAAGTTGTCTTTGGCTACACCTCTGCCTCATGTTCA	..((((.((((......(.((((.((((((((((((((((((((((((((((.............(((((((.((....))))).)))).........(((((....)))))))))))))(((((((((......)))))))))...)))))))))))))))))))).)))).)....)))).))))	3151733	3151879	CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAAGCCCCTTTCCTAGAACCTAAGCATCATATTTTTAGATGGCTTCACAATTATGAGTCTTTTGACTTGGGGTTTGATTTTATAGCTTCACTTGTAGGGTTAATCGGCAAGTTGTCTTTGGCTACA	.((((((((((((((((((((((((((((.............(((((((.((....))))).)))).........(((((....)))))))))))))(((((((((......)))))))))...)))))))))))))))))))).))	Csi-miR169g	3151733	3151753	CAGCCAAGGATGACTTGCCGG	Csi-miR169g*	3151859	3151879	GGCAAGTTGTCTTTGGCTACA		3
Csi-MIR169h	PmiREN004788	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00992	15525	15664	-	AATATAATAGCATTGTTTGCTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGCCTTGATTGCAAGACGAGGGTTTCAAGTGGCTGGAAGCCTCTCTTGTTTGGTTGCCAGGCGGTCTCCTTGGCTAAGCTGACAGGCTCTTATCTTTCA	((.((((.(((.(((((.((((((((((((.((((.(((((.((.......((((((.((((.(((((......))))).))))))))))......)))))))))))))))))))).))).)))))))).))))..))..	15545	15644	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGCCTTGATTGCAAGACGAGGGTTTCAAGTGGCTGGAAGCCTCTCTTGTTTGGTTGCCAGGCGGTCTCCTTGGCTAAGC	((((((((((.((((.(((((.((.......((((((.((((.(((((......))))).))))))))))......)))))))))))))))))))).)..	Csi-miR169h	15624	15644	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Csi-miR169h*	15545	15565	AGGCGGTCTCCTTGGCTAAGC		3
Csi-MIR169i	PmiREN004796	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00307	198978	199133	-	TCTAGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGATTCTTCCAATTAAGCGGTTTCAGATTAATCATATTGATTAATTAGTTTTTTAAATGAAGCCATTGATGGGTTACCAGGCAGTCACCTTGGCTAACTTGACAGTCTCTTGTCTCTCATGCTAGGC	.(((((.((((((((((((.(((((.(((((.....((((.((((..((((((((((((((((...)))))))))...........))))))).))))))))....)))))))))))))))))))....(((((....)))))..))).)))))..	198988	199104	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGATTCTTCCAATTAAGCGGTTTCAGATTAATCATATTGATTAATTAGTTTTTTAAATGAAGCCATTGATGGGTTACCAGGCAGTCACCTTGGCTAAC	(((((((((.(((((.(((((.....((((.((((..((((((((((((((((...)))))))))...........))))))).))))))))....)))))))))))))))))))..	Csi-miR169i	199083	199106	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGA	Csi-miR169i*	198988	199008	CAGGCAGTCACCTTGGCTAAC		2
Csi-MIR169j	PmiREN004790	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00116	91873	92006	+	GAAGATAAGAGTAACGTTTGTTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTGTCAATATCATTAGGTTTCAAGCATGAAGCCTTTTGTTTGGTCGCCAGGGAGTCTCCTTGGCTAATCTGACAGCCTCTTTTCTTTCA	(((((.(((((....(((.((((((((((((.(((((.((((((((((.......((..((((((((....))))))))..))..)))))).)))))))))))))))))))))..)))...))))).)))))..	91893	91986	TTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTGTCAATATCATTAGGTTTCAAGCATGAAGCCTTTTGTTTGGTCGCCAGGGAGTCTCCTTGGCTAATC	(((((((((((.(((((.((((((((((.......((..((((((((....))))))))..))..)))))).))))))))))))))))))))..	Csi-miR169j	91893	91913	TTAGCCAAGGATGACTTGCCT	Csi-miR169j*	91967	91986	GGGAGTCTCCTTGGCTAATC		3
Csi-MIR169k	PmiREN004791	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00015	1332270	1332429	+	GGGAATGAGGGTATGTGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAACATTGGCTTGTTGATCACATCATTTTTGCTTCATTAGATATGACACTACTACATAAATGTGTTAACTAGTTCATCGGCAAGTCGTCTCTGGCTACAATACTGCCTCCTTCTCTCAT	(((((.((((....(((.((.(((((.(((((((((((((((((((......)))))...................(((((...((((((............)))))).)))))...)))))))))))))).))))).)).)))..)))).)))))....	1332290	1332409	CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAACATTGGCTTGTTGATCACATCATTTTTGCTTCATTAGATATGACACTACTACATAAATGTGTTAACTAGTTCATCGGCAAGTCGTCTCTGGCTACA	.(((((.(((((((((((((((((((......)))))...................(((((...((((((............)))))).)))))...)))))))))))))).)))))...	Csi-miR169k	1332290	1332310	CAGCCAAGGATGACTTGCCGG	Csi-miR169k*	1332389	1332409	GGCAAGTCGTCTCTGGCTACA		3
Csi-MIR169l	PmiREN004799	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00337	36333	36467	-	AGAAAAGAGTGCTAGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGATCTCTCCTAAGTGGTTTCAAAACGTTGAATATTTAAACCCTCGGGTGGGTACCAGGCAGTCTCCTTGGCTAACTTGACAGCCTCTCTTCTTTC	((((.((((.(((.(((.((((((((((((.((((.(((((..(((.(((.((.((((((((....)))).......)))))).))).)))...)))))))))))))))))).))).)))))))))).))).)))	36353	36447	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGATCTCTCCTAAGTGGTTTCAAAACGTTGAATATTTAAACCCTCGGGTGGGTACCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAC	((((((((((.((((.(((((..(((.(((.((.((((((((....)))).......)))))).))).)))...)))))))))))))))))).))	Csi-miR169l	36427	36449	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGAT	Csi-miR169l*	36353	36371	GGCAGTCTCCTTGGCTA		3
Csi-MIR169m	PmiREN004793	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00123	352975	353132	+	CGCAGATATATAGTAGCGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGAATGCTGTGTTTCCAGCTCTCCTTGGATATGTTCAGAAACATATATATTGTAATGAATGAATTGGTGCAAGTTGGCAAGTTGTCCTTGGCTACATGTTTCTTTCTGCTCCGTAT	.(((((.....((.((((((.(((((((((((((((((((((.((..((((......))))..)).....(((((((....)))))))...(((((.(.((....)).))))))))))))))))))))))))))).)))))).)).))))).......	352995	353112	CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGAATGCTGTGTTTCCAGCTCTCCTTGGATATGTTCAGAAACATATATATTGTAATGAATGAATTGGTGCAAGTTGGCAAGTTGTCCTTGGCTACA	.(((((((((((((((((((((.((..((((......))))..)).....(((((((....)))))))...(((((.(.((....)).)))))))))))))))))))))))))))...	Csi-miR169m	352995	353015	CAGCCAAGGATGACTTGCCGG	Csi-miR169m*	353092	353112	GGCAAGTTGTCCTTGGCTACA		3
Csi-MIR169n	PmiREN004797	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00025	227318	227396	+	GACGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGAGATGTTTGTACATTTTCAATTTCCCGGCAAGTTGCCCTTGGCTACATTGGCCT	.....((((((((.(((((((((((.((...(((........)))..))))))))))))).))))))))..........	227322	227389	CAGCCAAGGATGACTTGCCGGAGATGTTTGTACATTTTCAATTTCCCGGCAAGTTGCCCTTGGCTACA	.((((((((.(((((((((((.((...(((........)))..))))))))))))).))))))))...	Csi-miR169n	227322	227344	CAGCCAAGGATGACTTGCCGG	Csi-miR169n*	227369	227389	GGCAAGTTGCCCTTGGCTACA		3
Csi-MIR169o	PmiREN005093	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00025	227086	227210	+	AAGAGGTAGAGAGTGTGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGGCCGGAACTAGCAAAGGCAATTCAAGTGCCCTTATTTTCCGGCAAGTTTATCCTTGGCTACATTGGGCTCTCTTCCTCTCAT	.....................((((((((((((((((((((.((((.(((...((....))..)))..).)))........)))))))).)))))))))))).......................	227106	227190	CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGGCCGGAACTAGCAAAGGCAATTCAAGTGCCCTTATTTTCCGGCAAGTTTATCCTTGGCTACA	.((((((((((((((((((((.((((.(((...((....))..)))..).)))........)))))))).))))))))))))...	Csi-miR169o	227106	227126	CAGCCAAGGATGACTTGCCGG	Csi-miR169o*	227170	227190	GCAAGTTTATCCTTGGCTACA		3
Csi-MIR169p	PmiREN004794	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00992	37304	37534	-	AAAGCCCTTGTGTGGTAGCAGGCAGTCTCCTTTGACTAATTTGACAGACTCTTTTCTTTCATGCTAGCCTTCCTTTTCTTCAACAAGTCATAAGCAATTGGACAAGCAATGCTGCTTAATTAGAAGAATACTATGTCGTAAGATTAATCAAGATGGGAGGGTCTTACATGCAGATAACAGTATTGTTCGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGGCTTGCGATATTATTAAG	.......((((..(((.(((((((((((((((.(.(((....((((((((.((.(((..((((..(((((((((..((((.....((((.((((((((((......))))..))))))..........(((......))).))))....)))).))))))).))..)))).))).)).))).)))))...)))).))))).))).))))))).))).))))..........	37324	37514	GGCAGTCTCCTTTGACTAATTTGACAGACTCTTTTCTTTCATGCTAGCCTTCCTTTTCTTCAACAAGTCATAAGCAATTGGACAAGCAATGCTGCTTAATTAGAAGAATACTATGTCGTAAGATTAATCAAGATGGGAGGGTCTTACATGCAGATAACAGTATTGTTCGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTG	((((((((((((.(.(((....((((((((.((.(((..((((..(((((((((..((((.....((((.((((((((((......))))..))))))..........(((......))).))))....)))).))))))).))..)))).))).)).))).)))))...)))).))))).))).))))..	Csi-miR169p	37324	37344	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Csi-miR169p*	37494	37514	GGCAGTCTCCTTTGACTAATT		3
Csi-MIR169q	PmiREN004798	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00079	101118	101244	+	GTTTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTTGCTTCTAAAGAAAGGTCTCTCAAGTTTAACTTAGCTACATGTACAGCAAGAATCCTTGTGCAGGTTCTAGGGCAAGTCGTCTTGGGCTATCTTGACAGGC	(((.(((((((.((((((((((((((((...((.....((((..(((...(((..((..........))..))).)))..)))).....))...)))))))))))))))).)))))))..)))....	101125	101234	AGCCAAGGATGACTTGCCTTGCTTCTAAAGAAAGGTCTCTCAAGTTTAACTTAGCTACATGTACAGCAAGAATCCTTGTGCAGGTTCTAGGGCAAGTCGTCTTGGGCTAT	((((.((((((((((((((((...((.....((((..(((...(((..((..........))..))).)))..)))).....))...)))))))))))))))).))))))	Csi-miR169q	101125	101144	AGCCAAGGATGACTTGCC	Csi-miR169q*	101214	101234	GGGCAAGTCGTCTTGGGCTAT		2
Csi-MIR169r	PmiREN004786	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00533	104380	104560	+	TTGGCTTAGAAAGTATTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACGCTTCAAAGATATAGATATATAGCTTCCAATTAGTTTGTATTATTAATTTTCCAGAGAAGATTTATGGGAATTAAATTATATATATAATGGAGAAGTTGGCAAGCCGTTTTTGGCTACATGGTGCTTTCTACTCCTCAT	..((..((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((.(((((...(((((((((((.((((.......)))))))))).(((((((.(((...........))))))))))....)))))....)))))..))))))))).))))))))))).))))))))))))))..))....	104400	104540	CAGCCAAGGATGACTTGCCGACGCTTCAAAGATATAGATATATAGCTTCCAATTAGTTTGTATTATTAATTTTCCAGAGAAGATTTATGGGAATTAAATTATATATATAATGGAGAAGTTGGCAAGCCGTTTTTGGCTACA	.(((((((((((.(((((((((.(((((...(((((((((((.((((.......)))))))))).(((((((.(((...........))))))))))....)))))....)))))..))))))))).)))))))))))...	Csi-miR169r	104400	104419	CAGCCAAGGATGACTTGCCG	Csi-miR169r*	104520	104540	GGCAAGCCGTTTTTGGCTACA		3
Csi-MIR169s	PmiREN004789	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00708	60660	60802	+	AAGATGAAGAGCTTTGCTTTGCTAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCACCATTGAGGGTTTTCCAAATCAGAAGAATGAGAGCCCCTATGTGGGTTATGTTTGGCAAGTGTCCTAGGCTAATTGAGTGGCTCTTATCTTGCA	(((((((.(((((..((((...(((((.(((((.(((((((.((((...((((...((((((((....((....))..))))))))....))))...))))..)))))))))))).)))))...))))))))))))))))...	60680	60782	CTAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCACCATTGAGGGTTTTCCAAATCAGAAGAATGAGAGCCCCTATGTGGGTTATGTTTGGCAAGTGTCCTAGGCTAATT	.(((((.(((((.(((((((.((((...((((...((((((((....((....))..))))))))....))))...))))..)))))))))))).)))))...	Csi-miR169s	60680	60701	CTAGCCAAGGATGACTTGCCTA	Csi-miR169s*	60762	60782	GGCAAGTGTCCTAGGCTAATT		3
Csi-MIR169t	PmiREN004792	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00337	36051	36193	-	GAAGATAAGAATACTGTTTGGTAGCCAGGGATGACTTGCCTGCGGCTTCCAATATTGCTAGCTAGGTTTCACCATCATCAATTAAAGCTGCTGTAGACAGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGCTGACAGCCTCTTCTCTCTCA	..(((.((((...(((((...((((((((((.((((.(((((.((((..((....))..)))).(((...)))................((((....)))))))))))))))))))))))....)))))..)))).)))....	36071	36173	GTAGCCAGGGATGACTTGCCTGCGGCTTCCAATATTGCTAGCTAGGTTTCACCATCATCAATTAAAGCTGCTGTAGACAGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGC	.((((((((((.((((.(((((.((((..((....))..)))).(((...)))................((((....)))))))))))))))))))))))...	Csi-miR169t	36153	36173	GTAGCCAGGGATGACTTGCCT	Csi-miR169t*	36071	36090	GGCAGTCTCCTTGGCTAAGC		3
Csi-MIR169u	PmiREN005092	MIR169	Citrus sinensis	Csi-scaffold00116	90486	90645	+	AAAATGAGAGTCTAGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGAACTTTCCAATTAAGTGGTTTCAAAATCATGTTGATGATATAATTTTTCTAAAAGAAACCCTTTGATTGTTGGATACCAGGCAGTCTCCTCGGCTAACTTGACAGTCCCTTATCTCTCA	....................(((((.((((.((((.(((((....(((((((((((.((((((...(((((....)))))...............)))))).))))))))..)))...))))))))))))).))))).......................	90506	90625	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGAACTTTCCAATTAAGTGGTTTCAAAATCATGTTGATGATATAATTTTTCTAAAAGAAACCCTTTGATTGTTGGATACCAGGCAGTCTCCTCGGCTAACT	(((((.((((.((((.(((((....(((((((((((.((((((...(((((....)))))...............)))))).))))))))..)))...))))))))))))).)))))...	Csi-miR169u	90506	90527	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGA	Csi-miR169u*	90605	90625	AGGCAGTCTCCTCGGCTAACT		3
Csi-MIR170a	PmiREN004800	MIR170	Citrus sinensis	Csi-scaffold00121	256150	256273	-	GTTGTAAAATGAAATCATCAAGGTATTGGCGCGCCTCAATTTAAAGACGTGGTTAAATGGGCATGATTAGCCATGTATTTTCATTGAGCCGCGTCAATATCTCCTTAATTATTTTGTAACTCTC	((((((((((((........(((((((((((((.((((((..(((.((((((((((..........)))))))))).)))..)))))).)))))))))))))......))))))))))))....	256170	256253	AGGTATTGGCGCGCCTCAATTTAAAGACGTGGTTAAATGGGCATGATTAGCCATGTATTTTCATTGAGCCGCGTCAATATCTCC	(((((((((((((.((((((..(((.((((((((((..........)))))))))).)))..)))))).)))))))))))))..	Csi-miR170a	256233	256253	AGGTATTGGCGCGCCTCAATT	Csi-miR170a*	256170	256190	TTGAGCCGCGTCAATATCTCC		3
Csi-MIR170b	PmiREN004801	MIR170	Citrus sinensis	Csi-scaffold00066	476316	476454	-	GATTGGAGAAGTAGACATGGTGTGATATTGGTTCGGCTCATCTTAATTAATAGATTCATATTTCAGCCCTTAAGGTTCTTACATGTATATATCTAGACGAGCCGAATCAATATCACTCTTGTATGCTTCTTTCTTTTGA	.......((((((.(((.((.((((((((((((((((((.(((........((((..((((...((((.....)))).......))))..))))))).)))))))))))))))))).))))).))))))..........	476336	476434	TGTGATATTGGTTCGGCTCATCTTAATTAATAGATTCATATTTCAGCCCTTAAGGTTCTTACATGTATATATCTAGACGAGCCGAATCAATATCACTCT	.((((((((((((((((((.(((........((((..((((...((((.....)))).......))))..))))))).))))))))))))))))))...	Csi-miR170b	476336	476356	GAGCCGAATCAATATCACTCT	Csi-miR170b*	476413	476434	TGTGATATTGGTTCGGCTCATC		3
Csi-MIR171a	PmiREN004802	MIR171	Citrus sinensis	Csi-scaffold00121	134980	135101	-	AGGATGGATGGGTACTCACGGGATATTGGTGCGGTTCAATAAGAAAACGGTGCTCAATACTTTTTGAGCTCCGCTTTTTGATTGAGCCGCGCCAATATCACGTGCCACTCGCTCTCTAATTG	................((((.(((((((((((((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).))))))))))))))))))).))))..................	135000	135081	GGATATTGGTGCGGTTCAATAAGAAAACGGTGCTCAATACTTTTTGAGCTCCGCTTTTTGATTGAGCCGCGCCAATATCACG	.(((((((((((((((((((.(((((.(((.((((((......)))))).))).))))).)))))))))))))))))))...	Csi-miR171a	135000	135020	TTGAGCCGCGCCAATATCACG	Csi-miR171a*	135061	135081	GGATATTGGTGCGGTTCAATA		3
Csi-MIR171b	PmiREN004803	MIR171	Citrus sinensis	Csi-scaffold00013	503140	503265	-	AAGCAAGAAAAAAACGAAAGCGATATTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGGATTTACACATTGAAGTTGTAAAAGACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTAATTTATAAAAATGAATAT	.................(((.((((((((((.(((((((((.((.((((..(((((((......).))))))...)).)))).))))))))).)))))))))).))).((((((....))))))..	503160	503245	CGATATTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGGATTTACACATTGAAGTTGTAAAAGACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACT	.((((((((((.(((((((((.((.((((..(((((((......).))))))...)).)))).))))))))).))))))))))...	Csi-miR171b	503160	503180	TTGAGCCGCGCCAATATCACT	Csi-miR171b*	503225	503245	CGATATTGGTGAGGTTCAATC		3
Csi-MIR171c	PmiREN004804	MIR171	Citrus sinensis	Csi-scaffold00035	91768	91885	+	GTTGAAATTTAAAACGGAGATGTTGGAACGGCTCAATCAAATCAAATCTCCTATGAAATCAATTGGGTCCTTTAATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCCTCTCGTCTTCTTTCGCT	...............(((((((((((.(((((((((((((((.(((...((((..........))))...))).))))))))))))))).))))))))))).................	91788	91865	TGTTGGAACGGCTCAATCAAATCAAATCTCCTATGAAATCAATTGGGTCCTTTAATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	((((((.(((((((((((((((.(((...((((..........))))...))).))))))))))))))).))))))..	Csi-miR171c	91845	91865	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Csi-miR171c*	91788	91808	TGTTGGAACGGCTCAATCAAA		3
Csi-MIR171d	PmiREN004805	MIR171	Citrus sinensis	Csi-scaffold00002	4204354	4204472	-	TACTGAAATAGTCACTGCGATATTGGCCCGGTTCATTCAGAGCTTAAGCGTTTAAGCTGAATGCTTGCTGGTGGACTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTGCTTACTTCAAACAC	...((((.(((.(((((.(((((((((.(((((((.((((((((((((((((((...)))))))))).....)).)))))).))))))).))))))))).))))).))).)))).....	4204374	4204452	TATTGGCCCGGTTCATTCAGAGCTTAAGCGTTTAAGCTGAATGCTTGCTGGTGGACTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((.(((((((.((((((((((((((((((...)))))))))).....)).)))))).))))))).)))))))..	Csi-miR171d	4204374	4204394	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Csi-miR171d*	4204432	4204452	TATTGGCCCGGTTCATTCAGA		3
Csi-MIR171e	PmiREN004808	MIR171	Citrus sinensis	Csi-scaffold00007	1828567	1828684	-	ATTCCACAAAGCATACGAGATATTGGTGCGGTTCAATCTGAGAGCAGTGCTCAAAGTCTAAGAAGAGCCCTGTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTCACGTGCAATCAATTC	..........(((((((.((((((((((((((((((((....(((((.((((............)))).)))))....)))))))))))))))))))).)))...)))).........	1828587	1828664	TATTGGTGCGGTTCAATCTGAGAGCAGTGCTCAAAGTCTAAGAAGAGCCCTGTTATTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	((((((((((((((((((....(((((.((((............)))).)))))....))))))))))))))))))..	Csi-miR171e	1828587	1828607	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Csi-miR171e*	1828644	1828664	TATTGGTGCGGTTCAATCTGA		3
Csi-MIR171f	PmiREN004806	MIR171	Citrus sinensis	Csi-scaffold00017	1276172	1276308	+	ATATATGAAAGGGTAGCCGTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACAAACCGGTTTATTTGCTCTTATTAGAGCAAAGTTCCAGGTTTTTTGTTTTGGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCGTTTCTCTTTCATTTT	....(((((((((.(((.(.(((((((((.(((((((.(((((((((((((....((((((((....))))))))...)).))))).........)))))).))))))).))))))))).)))).)))))))))...	1276192	1276288	TATTGGCCTGGTTCACTCAGACAAACCGGTTTATTTGCTCTTATTAGAGCAAAGTTCCAGGTTTTTTGTTTTGGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((.(((((((.(((((((((((((....((((((((....))))))))...)).))))).........)))))).))))))).)))))))))	Csi-miR171f	1276268	1276288	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Csi-miR171f*	1276192	1276212	TATTGGCCTGGTTCACTCAGA		3
Csi-MIR171g	PmiREN004807	MIR171	Citrus sinensis	Csi-scaffold00038	645179	645293	-	GTGGTAGGAGTAAAGTTTGATGTTGGCATAGCTCAATCCGATCAAAATTCTCAGTGCAGCTGAGTCCTTTATTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACATTCATTCTCTCTATCAT	((((((((((...(((.((((((((((((.((((((((.((..(((...((((((...))))))...)))..)).)))))))).)))))))))))).)))....))).)))))))	645199	645273	TGTTGGCATAGCTCAATCCGATCAAAATTCTCAGTGCAGCTGAGTCCTTTATTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((((.((((((((.((..(((...((((((...))))))...)))..)).)))))))).)))))))))..	Csi-miR171g	645199	645219	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Csi-miR171g*	645253	645273	TGTTGGCATAGCTCAATCCGA		3
Csi-MIR172a	PmiREN004809	MIR172	Citrus sinensis	Csi-scaffold00017	562785	562929	-	AACAGTCGTTGCTCGCTGTAGCAGCGTCCTCAAGATTCACATCCAGTCTAAAGGCAAAAGCAGCAATTTTTCTTCATTTTTGCTTGCCTTGGTTTTTGTCAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAACGGCGATTAATGACTAGCTA	...((((((((.(((((((.((((((((.(((((((((.(((.(((....((((((..(((((.(((........))).))))))))))).....)))...))).))))))))).)))))))).))))))).)))))))).....	562805	562909	GCAGCGTCCTCAAGATTCACATCCAGTCTAAAGGCAAAAGCAGCAATTTTTCTTCATTTTTGCTTGCCTTGGTTTTTGTCAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAA	((((((((.(((((((((.(((.(((....((((((..(((((.(((........))).))))))))))).....)))...))).))))))))).))))))))..	Csi-miR172a	562805	562825	AGAATCTTGATGATGCTGCAA	Csi-miR172a*	562889	562909	GCAGCGTCCTCAAGATTCACA		3
Csi-MIR172b	PmiREN004810	MIR172	Citrus sinensis	Csi-scaffold00259	112631	112801	+	AACAGTCATCGTTTGCAGATGCAGCATCATCAAGATTCACATGTATATATATATATATATATATATATATAGATATAGATATATGCTAATGGTGGAAAGATGTTTATCTTTTTGCTTTATTGCCTTCATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCGATAAATGACTAATCA	...((((((...((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((((((((....)))))))))))).............((....(((((((((((....))))))))))).....))...)))).))))))))))))))))))))).))))...)))))).....	112651	112781	GCAGCATCATCAAGATTCACATGTATATATATATATATATATATATATATAGATATAGATATATGCTAATGGTGGAAAGATGTTTATCTTTTTGCTTTATTGCCTTCATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT	((((((((((((((((((.((((((((((((((((....)))))))))))).............((....(((((((((((....))))))))))).....))...)))).))))))))))))))))))..	Csi-miR172b	112761	112781	AGAATCTTGATGATGCTGCAT	Csi-miR172b*	112651	112671	GCAGCATCATCAAGATTCACA		3
Csi-MIR172c	PmiREN004811	MIR172	Citrus sinensis	Csi-scaffold00061	126124	126249	-	GACAGTCGCTGTTTGCGGGTGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATACACGGCAGTGATGTGATAATCTCTTGCGAAGCACTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAATAAGCGGCTTAAAA	...(((((((..((((.(((((((((((((((((((((.(((((.........((((.(((......)))..))))...))).)).))))))))))))))))))))).))))..))))))).....	126144	126229	GTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAATACACGGCAGTGATGTGATAATCTCTTGCGAAGCACTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT	((((((((((((((((((.(((((.........((((.(((......)))..))))...))).)).))))))))))))))))))..	Csi-miR172c	126144	126164	AGAATCTTGATGATGCTGCAT	Csi-miR172c*	126209	126229	GTAGCATCATCAAGATTCACA		3
Csi-MIR172d	PmiREN004812	MIR172	Citrus sinensis	Csi-scaffold00014	88718	88847	-	AAGTTCCTTCCAAATAATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAAATATTTGACTACGATTCATACCACTTTTGAATTTCAAATACACATGCAGCACAGATAGATGCTCATGATCGTTTGTTCAGATGA	................(((((.((((...((.((((((((..(....(((((((....((((((.........))))))))))))))..))))))))))...)))).)))))..((((((....))))))	88738	88827	GAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAAATATTTGACTACGATTCATACCACTTTTGAATTTCAAATACACATGCAGCACAGATAGATGCTC	(.((((...((.((((((((..(....(((((((....((((((.........))))))))))))))..))))))))))...)))).)..	Csi-miR172d	88808	88827	GAATCTTGATGATGCTGCAT	Csi-miR172d*	88738	88758	ATGCAGCACAGATAGATGCTC		3
Csi-MIR319a	PmiREN004819	MIR319	Citrus sinensis	Csi-scaffold00005	2404918	2405029	-	TGCGAAAATGGTAGAAATAGGGGTTCCTTGCGGCCCAAAACAGTTGGCTAACTCTGCTCTTCTCTCTATGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAATTCTTCTCTTTTCCTTCC	...(((((.((.((((.((((((((((((.(((.((((((((...(((.......)))..........)))))))).))).)))))))))))).)))).)).))))).....	2404938	2405009	GGGTTCCTTGCGGCCCAAAACAGTTGGCTAACTCTGCTCTTCTCTCTATGTTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT	(((((((((.(((.((((((((...(((.......)))..........)))))))).))).)))))))))..	Csi-miR319a	2404938	2404957	TTGGACTGAAGGGAGCTCCT	Csi-miR319a*	2404989	2405009	GGGTTCCTTGCGGCCCAAAAC		3
Csi-MIR319b	PmiREN004820	MIR319	Citrus sinensis	Csi-scaffold00009	1236387	1236593	-	GTTGATTTTGATTAAGCTGGGAGCTTTCTTCGGTCCACTTATGGGTGGCAATAGGATTTAATTAGCTGCTGACTCATTCATCCAAATACTGAGTAAAGGGTCGAAATGGATACCCAGTAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCATTGCTCGCTAATCTTATCC	..............(((((((((((((((((((((((..((((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((.((..(((((.((.....(((......))))).)))))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))).))))))..))))))))))))))))))))..)))..............	1236407	1236573	GAGCTTTCTTCGGTCCACTTATGGGTGGCAATAGGATTTAATTAGCTGCTGACTCATTCATCCAAATACTGAGTAAAGGGTCGAAATGGATACCCAGTAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC	(((((((((((((((((..((((((.(((..((((((((((((.(((.(((..((((((((.((..(((((.((.....(((......))))).)))))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))).))))))..)))))))))))))))))..	Csi-miR319b	1236407	1236426	TTGGACTGAAGGGAGCTCCC	Csi-miR319b*	1236553	1236573	GAGCTTTCTTCGGTCCACTTA		3
Csi-MIR390a	PmiREN004824	MIR390	Citrus sinensis	Csi-scaffold00042	571805	571943	+	AAAGTAAAGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGGTGCCATGAATATGGGAATGATCTAGGGTTTCATGATAAATAATGGGCACTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGCTTCTTCTTACTCTCTC	......((((((((.((((.((((((((((.(((((((((((...(((((............((((.........))))...........)))))))))))))))).)))))))))).)))).))))))))........	571825	571923	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGGTGCCATGAATATGGGAATGATCTAGGGTTTCATGATAAATAATGGGCACTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCA	((((((((((.(((((((((((...(((((............((((.........))))...........)))))))))))))))).))))))))))..	Csi-miR390a	571825	571845	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC	Csi-miR390a*	571903	571923	CGCTATCCATCCTGAGTTTCA		3
Csi-MIR390b	PmiREN004825	MIR390	Citrus sinensis	Csi-scaffold00026	1060687	1060825	+	TTGTCAAGTATGGAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGATAATATTCTTTTTTAATTAATTAATTAATTCCTTGATCAATTAGCGGCGCTGGCGCTATCTATCCTGAGTTTTCCGGATTCTTCTTGCTAG	...........((((((((((.(((((((((((.(((((((((((.((......))....((((((.(((((........))))).))))))......))))))))))).))))))))))).)))))))))).......	1060707	1060805	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGATAATATTCTTTTTTAATTAATTAATTAATTCCTTGATCAATTAGCGGCGCTGGCGCTATCTATCCTGAGTTTTC	((((((((((.(((((((((((.((......))....((((((.(((((........))))).))))))......))))))))))).))))))))))).	Csi-miR390b	1060707	1060727	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC	Csi-miR390b*	1060785	1060805	CGCTATCTATCCTGAGTTTTC		3
Csi-MIR391	PmiREN004826	MIR391	Citrus sinensis	Csi-scaffold00014	1373894	1374012	+	CAACATCAATATGTTTGCCATGCAGGTGAGATGATACCGTCACCGCTGCTCTCTTGTTTCCGACAGGGGCTTGGCTGCCGGAATCATTTCTCCCGCGTGAGAAACCTTTTGCTGTGTTT	..(((.(((...((((..(((((.((.((((((((.(((.(((((..(((((..((((...))))))))).))).)).))).)))))))).)).)))))..))))...))).)))....	1373914	1373992	TGCAGGTGAGATGATACCGTCACCGCTGCTCTCTTGTTTCCGACAGGGGCTTGGCTGCCGGAATCATTTCTCCCGCGTG	(((.((.((((((((.(((.(((((..(((((..((((...))))))))).))).)).))).)))))))).)).)))..	Csi-miR391	1373914	1373935	TGCAGGTGAGATGATACCGTCA	Csi-miR391*	1373972	1373992	CGGAATCATTTCTCCCGCGTG		3
Csi-MIR393a	PmiREN004827	MIR393	Citrus sinensis	Csi-scaffold00028	1051069	1051191	-	TTCTGCAACTAGAGGATAAATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGCCTTAATTATAATTCCCATACTTAATATTCATTAGGACGATGCTATCCCTCTGGATTCCTCCTTCGGTAGCTCATAT	....((.(((.(((((..((((((.((((((.((((((.((((((......((((.............)))).....)))))))))))).)))))).))))))..))))).))).))......	1051089	1051171	TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGCCTTAATTATAATTCCCATACTTAATATTCATTAGGACGATGCTATCCCTCTGGATT	((((.((((((.((((((.((((((......((((.............)))).....)))))))))))).)))))).))))..	Csi-miR393a	1051151	1051171	TCCAAAGGGATCGCATTGATC	Csi-miR393a*	1051089	1051109	ACGATGCTATCCCTCTGGATT		3
Csi-MIR393b	PmiREN004828	MIR393	Citrus sinensis	Csi-scaffold00171	277845	277998	+	TGATTAGTGCAGGTGGAGAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGATGATAACATTAAATTAATCACTCAAACGGGTTGATTTTATTATATATATGATTTCTTTCATTTTTAGATCATGCGATCCCTTCGGAATTCCCCATCTATGGCTCTAAAT	...((((.((((((((.(((((((.((((((((((((.(((((((((((((.....((((((((.(......))))))))))))))))....((((......))))...)))))))))))))))))).))))))).))))))...)).))))..	277865	277978	TTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGATGATAACATTAAATTAATCACTCAAACGGGTTGATTTTATTATATATATGATTTCTTTCATTTTTAGATCATGCGATCCCTTCGGAATT	((((.((((((((((((.(((((((((((((.....((((((((.(......))))))))))))))))....((((......))))...)))))))))))))))))).))))..	Csi-miR393b	277865	277885	TTCCAAAGGGATCGCATTGAT	Csi-miR393b*	277958	277978	TCATGCGATCCCTTCGGAATT		3
Csi-MIR393c	PmiREN004829	MIR393	Citrus sinensis	Csi-scaffold00021	1407962	1408084	+	GCTTCTGCAACTAGAGGATAAATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGCCTTAATTATAATTCTCATACTTAATGTTCATGAGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCCTCCTTCGGTAGCTCAT	((....)).....(((((...((((((((((((.((((.((((((..((.((((.(((.......))).)))).)).....)))))))))).)))))))))))))))))..............	1407982	1408064	TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGCCTTAATTATAATTCTCATACTTAATGTTCATGAGGATCATGCTATCCCTTTGGATT	(((((((((((.((((.((((((..((.((((.(((.......))).)))).)).....)))))))))).)))))))))))))	Csi-miR393c	1407982	1408002	TCCAAAGGGATCGCATTGATC	Csi-miR393c*	1408044	1408064	ATCATGCTATCCCTTTGGATT		3
Csi-MIR394a	PmiREN004830	MIR394	Citrus sinensis	Csi-scaffold00002	4264656	4264806	+	AGTGCTTCTTACAGAGTTTATTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTCCCCATCGATTGAATCTGAAAGCCTTTTTCTTTTCTTGTTTTTGTGCTTCTCTCTTTCATGCTCATGGAGGTGGGCATACTGCCAACTGAGCTCTGTTGGCTTCTCTT	((.(...((.((((((((((((((((...(((((((((((((....(((.((..((....(((((((...................).)))).))))..)))))...)))))))))))))...)))))).)))))))))).))...).)).	4264676	4264786	TTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTCCCCATCGATTGAATCTGAAAGCCTTTTTCTTTTCTTGTTTTTGTGCTTCTCTCTTTCATGCTCATGGAGGTGGGCATACTGCCAACT	((((((...(((((((((((((....(((.((..((....(((((((...................).)))).))))..)))))...)))))))))))))...))))))..	Csi-miR394a	4264676	4264695	TTGGCATTCTGTCCACCTCC	Csi-miR394a*	4264766	4264786	GAGGTGGGCATACTGCCAACT		3
Csi-MIR394b	PmiREN004831	MIR394	Citrus sinensis	Csi-scaffold00194	81542	81664	+	GGGGCCTTGTTGCAGAGTCATTTTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCCCACTTGAAATCTTAGATTTGGAGGTGGCTAGCATGCCTAACAGGCTCTGTGAATTTCTC	.........((((((((((.....(((((.(((.(((((((((........((((..............)))).........))))))))).))).))))).....)))))))))).......	81562	81644	TTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCCCACTTGAAATCTTAGATTTGGAGGTGGCTAGCATGCCTAAC	..(((((.(((.(((((((((........((((..............)))).........))))))))).))).)))))....	Csi-miR394b	81562	81581	TTGGCATTCTGTCCACCTCC	Csi-miR394b*	81624	81644	GAGGTGGCTAGCATGCCTAAC		3
Csi-MIR395a	PmiREN004832	MIR395	Citrus sinensis	Csi-scaffold11775	1625	1743	-	TCAGTCAGTTGTCTCCGGGAGTTCCTCCGATCACTTCATTGGGGCTATATGATCATTTAGAGAAAATTTGTCACCCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGGTGCCACCTGACATTAC	...(((((.((.(.((.(((((((((((((.(((((((.(((((.....((((.((((.....))))..))))))))).))))))).))))))))))))).)).).)).))))).....	1645	1723	GTTCCTCCGATCACTTCATTGGGGCTATATGATCATTTAGAGAAAATTTGTCACCCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	((((((((((.(((((((.(((((.....((((.((((.....))))..))))))))).))))))).))))))))))..	Csi-miR395a	1645	1665	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Csi-miR395a*	1703	1723	GTTCCTCCGATCACTTCATTG		3
Csi-MIR395b	PmiREN004833	MIR395	Citrus sinensis	Csi-scaffold00003	2769786	2769886	+	TGCATCAGGTTTCCCCTAGAGTTCCCCTGAACACTTCATTGGGGACTCCTTTTAACCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGAGTCATTTGATATTAC	...(((((((..(.((..((((((((((((((((((((.(((((...........))))).))))))))))))))))))))..)).)..))))))).....	2769806	2769866	GTTCCCCTGAACACTTCATTGGGGACTCCTTTTAACCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	((((((((((((((((((.(((((...........))))).))))))))))))))))))..	Csi-miR395b	2769846	2769866	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Csi-miR395b*	2769806	2769826	GTTCCCCTGAACACTTCATTG		3
Csi-MIR395c	PmiREN004834	MIR395	Citrus sinensis	Csi-scaffold00348	77137	77247	-	AGAGTCAGTTGGTTCCTGGAGTTCCTCCGAGCACTTCATTGGGGTCATTCAGAGAAAAGTCGTCACCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGTTGCCACCTGACATTAC	...(((((.((((..(((((((((((((((((((((((.((((((......((......))...)))))).)))))))))))))))))))))))..)))).))))).....	77157	77227	GTTCCTCCGAGCACTTCATTGGGGTCATTCAGAGAAAAGTCGTCACCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	((((((((((((((((((.((((((......((......))...)))))).))))))))))))))))))..	Csi-miR395c	77157	77177	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Csi-miR395c*	77207	77227	GTTCCTCCGAGCACTTCATTG		3
Csi-MIR395d	PmiREN004835	MIR395	Citrus sinensis	Csi-scaffold00003	2766880	2767003	-	ATCGTCATCTGTCCCCTGGAGTTCCCCTAACCACTTCACTAATCACTAGAGTGGGGATCTTTGCTACCGGGCCTCTACATATATTGAAGTGTTTGGAGGAACTCTGGGTGCCACTTGACAATTA	((.((((..((.(.(((((((((((.((((.(((((((........((((((.((...........)).)..))))).......))))))).)))).))))))))))).).))..)))).))..	2766900	2766983	GTTCCCCTAACCACTTCACTAATCACTAGAGTGGGGATCTTTGCTACCGGGCCTCTACATATATTGAAGTGTTTGGAGGAACTC	(((((.((((.(((((((........((((((.((...........)).)..))))).......))))))).)))).)))))..	Csi-miR395d	2766900	2766920	TTGAAGTGTTTGGAGGAACTC	Csi-miR395d*	2766963	2766983	GTTCCCCTAACCACTTCACTA		3
Csi-MIR395e	PmiREN004836	MIR395	Citrus sinensis	Csi-scaffold11395	1209	1320	-	AAAGTCAGTTGCCTCCTAGAGTTCCTCTAAACACTTCTTTGGGGTCATTTGGAGAAAATGCCGTTGCCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCGGGTGCCAACTGACATTAC	...((((((((.(.(((.(((((((((((((((((((..(((((.((..(((........))).)))))))..))))))))))))))))))).))).).)))))))).....	1229	1300	GTTCCTCTAAACACTTCTTTGGGGTCATTTGGAGAAAATGCCGTTGCCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((((((((((((..(((((.((..(((........))).)))))))..)))))))))))))))))..	Csi-miR395e	1229	1249	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Csi-miR395e*	1280	1300	GTTCCTCTAAACACTTCTTTG		3
Csi-MIR396a	PmiREN004845	MIR396	Citrus sinensis	Csi-scaffold00051	580166	580294	-	CGAAGGTCCTCTTTGTGATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGTCTTGAATTTTCCGATCGATACCGGTGCATGATTAATTCCCAACACAATTCAAGAAAGCTGTGGAAAACTACTAAGAGGATTTGGTCA	...((((((((((.(((...((((((((((((((((((.(((...(((((.((..((((....))))....))..))))).....))).))))))))))))))))))...))).)))))))))).....	580186	580274	TTCCACAGCTTTCTTGAACTGTCTTGAATTTTCCGATCGATACCGGTGCATGATTAATTCCCAACACAATTCAAGAAAGCTGTGGAAAA	((((((((((((((((((.(((...(((((.((..((((....))))....))..))))).....))).))))))))))))))))))..	Csi-miR396a	580254	580274	TTCCACAGCTTTCTTGAACTG	Csi-miR396a*	580186	580206	ATTCAAGAAAGCTGTGGAAAA		3
Csi-MIR396b	PmiREN004846	MIR396	Citrus sinensis	Csi-scaffold00013	468454	468581	+	TTATGATCCTCTTTGTATTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCATCTTTGCATGAGGCCACAGACTTGGCATGGCATTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAACAGGTTCAATAAA	...(((.(((.(((((((((((((((((((((.((((((((((.((....(((.....((((......))))...)))..)).)))))))))).))))))))))))))))))))).))).))).....	468474	468561	TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCATCTTTGCATGAGGCCACAGACTTGGCATGGCATTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG	((((((((((((.((((((((((.((....(((.....((((......))))...)))..)).)))))))))).))))))))))))..	Csi-miR396b	468474	468494	TTCCACAGCTTTCTTGAACTG	Csi-miR396b*	468541	468561	GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG		3
Csi-MIR396c	PmiREN004847	MIR396	Citrus sinensis	Csi-scaffold00266	193368	193551	+	TATGATGCAAGTTCCTGTCATGTTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTAATAATAGGCTACGATTTGATGTGGCTAGCTGCAGCTATTAGAAGTTCAAGAAATCTGTGGGAAGAAATGGCAAATAAGG	............((.((((((.(((((((((((.((((((((((((((......................................................(((....)))(((((........)))))((((....))))..)))))))))))))).))))))))))).)))))).....))	193388	193531	TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTAATAATAGGCTACGATTTGATGTGGCTAGCTGCAGCTATTAGAAGTTCAAGAAATCTGTGGGAAG	((((((((.((((((((((((((......................................................(((....)))(((((........)))))((((....))))..)))))))))))))).))))))))))	Csi-miR396c	193388	193408	TTCCACAGCTTTCTTGAACTT	Csi-miR396c*	193511	193531	GTTCAAGAAATCTGTGGGAAG		3
Csi-MIR396d	PmiREN004848	MIR396	Citrus sinensis	Csi-scaffold00011	399054	399200	-	AGCACCGTTTGCCCAGCCATGGCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTCCTTCTTCTTCTTCTCTAATTATAGGCTACTATTTGATGTGGCTAGCTGCAGCTATCAGAAGTTCAAGAAATCTGTGGGAAGAAATGGCAAATAAGGGCTTA	(((.(((((((((.........((((((.((((((((((((((.................(((....)))(((((........)))))((((....))))..)))))))))))))).))))))........)))))))..)))))..	399074	399180	GGCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTCCTTCTTCTTCTTCTCTAATTATAGGCTACTATTTGATGTGGCTAGCTGCAGCTATCAGAAGTTCAAGAAATCTGTGGGAAG	..((((((.((((((((((((((.................(((....)))(((((........)))))((((....))))..)))))))))))))).))))))....	Csi-miR396d	399160	399180	GGCCACAGCTTTCTTGAACTT	Csi-miR396d*	399074	399093	TTCAAGAAATCTGTGGGAAG		3
Csi-MIR396e	PmiREN004849	MIR396	Citrus sinensis	Csi-scaffold05298	4054	4203	-	TAAAGGTCTTTTGCATGCTTTTCCACGGCTTTCTTGAACTTAATTAGTACGGTTAATTTTTTTGTGCTATTAACAAGCAATTAATATGCAAATCTTTAATCAGTGCAAAGCTCAAGAATGCCGTGGGAAAACATGAAAGGTTTTTGTCGT	((((((.(((((.((((.(((((((((((.(((((((.(((.....((((((((((....((((((.((((((.......))))))))))))...)))))).)))).))).))))))).))))))))))).)))))))))))))))....	4074	4183	TTCCACGGCTTTCTTGAACTTAATTAGTACGGTTAATTTTTTTGTGCTATTAACAAGCAATTAATATGCAAATCTTTAATCAGTGCAAAGCTCAAGAATGCCGTGGGAAA	(((((((((.(((((((.(((.....((((((((((....((((((.((((((.......))))))))))))...)))))).)))).))).))))))).)))))))))..	Csi-miR396e	4163	4183	TTCCACGGCTTTCTTGAACTT	Csi-miR396e*	4074	4094	GCTCAAGAATGCCGTGGGAAA		3
Csi-MIR396f	PmiREN004850	MIR396	Citrus sinensis	Csi-scaffold00013	474037	474188	-	ATTAAGTCCTGGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCACTGTTTGCTGATTAATACACGGCTCTTGCTAGCTAGGCGCCGTATGTAGACACCGCGCGCCATGGGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAACATGGCACACCTTCAGGAT	.....((((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((..((.(((((.((.(((.(((((.((((.....)))).))))).))).))))..))).))..)))))).))))))))))))))))))).)))))).......))))))	474057	474168	TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCACTGTTTGCTGATTAATACACGGCTCTTGCTAGCTAGGCGCCGTATGTAGACACCGCGCGCCATGGGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA	(((((((((((((((((.((((((..((.(((((.((.(((.(((((.((((.....)))).))))).))).))))..))).))..)))))).)))))))))))))))))..	Csi-miR396f	474148	474168	TTCCACAGCTTTCTTGAACTT	Csi-miR396f*	474057	474077	GCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA		3
Csi-MIR396g	PmiREN004851	MIR396	Citrus sinensis	Csi-scaffold01298	10520	10669	+	AGCACCGTTTGCCCAGCCACGACCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTAATTATAGGCTACTATTTGATGTGGCTAGCTGCAGCTATCAGAAGTTCAAGAAATCTGTGGGAAGAAATGGCAAATAAGGGCTTA	(((.(((((((((.........((((((.((((((((((((((....................(((....)))(((((........)))))((((....))))..)))))))))))))).))))))........)))))))..)))))..	10540	10649	GACCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCTAATTATAGGCTACTATTTGATGTGGCTAGCTGCAGCTATCAGAAGTTCAAGAAATCTGTGGGAAG	..((((((.((((((((((((((....................(((....)))(((((........)))))((((....))))..)))))))))))))).))))))....	Csi-miR396g	10540	10560	GACCACAGCTTTCTTGAACTT	Csi-miR396g*	10630	10649	TTCAAGAAATCTGTGGGAAG		3
Csi-MIR396h	PmiREN004852	MIR396	Citrus sinensis	Csi-scaffold12086	55	192	-	AAATGGATCAGCTCTTATTTTTCCACGGCTTTCTTGAACGTAAAAGTGCTTCCGCCGGTTTGCATATACAATTAGGCTGTTCAAGCACCATTAATTACGTTCAAGAAGCTGTGGAAAAATACGCGTTGATTCAGTGCA	...(((((((((.(.((((((((((((((((.(((((((((((..(((((((.(((...(((......)))...))).)...))))))......))))))))))))))))))))))))))).).))))))))).....	75	172	TTCCACGGCTTTCTTGAACGTAAAAGTGCTTCCGCCGGTTTGCATATACAATTAGGCTGTTCAAGCACCATTAATTACGTTCAAGAAGCTGTGGAAAA	(((((((((((.(((((((((((..(((((((.(((...(((......)))...))).)...))))))......))))))))))))))))))))))..	Csi-miR396h	152	172	TTCCACGGCTTTCTTGAACGT	Csi-miR396h*	75	95	CGTTCAAGAAGCTGTGGAAAA		3
Csi-MIR397a	PmiREN004853	MIR397	Citrus sinensis	Csi-scaffold00010	1490201	1490335	+	TTCCCAGATTGAAAAAAACATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAATATTTGTCGGTGCTTTGCCAATATTTCTCTATACTAGCCAGGATTCTTTCACCAGCGCTGCACTCGATCATGTTTTTTAGCTCTGCTGGTTC	............(((((((((.((((((((((((((((.((((.....(((...(((.....................)))...)))...)))).)))))))))))))))).)))))))))..............	1490221	1490315	TCATTGAGTGCAGCGTTGATGAATATTTGTCGGTGCTTTGCCAATATTTCTCTATACTAGCCAGGATTCTTTCACCAGCGCTGCACTCGATCATG	(.((((((((((((((((.((((.....(((...(((.....................)))...)))...)))).)))))))))))))))).)..	Csi-miR397a	1490221	1490241	TCATTGAGTGCAGCGTTGATG	Csi-miR397a*	1490295	1490315	CCAGCGCTGCACTCGATCATG		3
Csi-MIR397b	PmiREN004854	MIR397	Citrus sinensis	Csi-scaffold00083	390534	390794	-	TAGTGTTATCGAACGGTATTTGTGGTGCACTAGCGTATGCTCTTGCAGCCATATAATAAGAGCCCACTGGCTGGTCGGCTTTCAGCAAAACGTCCGTAGTCTGGCCGGGGGCGATCACGACCACGTCGGTGACGTAGGGCTCGGTGTAGCATGCGTCAATGGCGACAACTGTAAAGTTGTGATTGGCAATCTTGAAGAAGAGCTGGTTATTGAGTGCAGCGTTGATGATACGTAGGAGATAGGTCTTCCC	..((((((((.((((((((((..((((.(((((((((((((...(((.((.........(((((((((((((((((((((...)))....(((((.(.((...)).).)))))....)))))).))))))......))))))))))))))))))((((((.(((((.........))))).))))))..((((....))))))))))))))))))))..))))))))))))...(((((....)))))..	390554	390774	ATCGAACGGTATTTGTGGTGCACTAGCGTATGCTCTTGCAGCCATATAATAAGAGCCCACTGGCTGGTCGGCTTTCAGCAAAACGTCCGTAGTCTGGCCGGGGGCGATCACGACCACGTCGGTGACGTAGGGCTCGGTGTAGCATGCGTCAATGGCGACAACTGTAAAGTTGTGATTGGCAATCTTGAAGAAGAGCTGGTTATTGAGTGCAGCGTTGATGA	(((.((((((((((..((((.(((((((((((((...(((.((.........(((((((((((((((((((((...)))....(((((.(.((...)).).)))))....)))))).))))))......))))))))))))))))))((((((.(((((.........))))).))))))..((((....))))))))))))))))))))..)))))))..	Csi-miR397b	390554	390573	ATTGAGTGCAGCGTTGATGA	Csi-miR397b*	390754	390774	ATCGAACGGTATTTGTGGTGC		3
Csi-MIR399a	PmiREN004860	MIR399	Citrus sinensis	Csi-scaffold00007	888959	889099	-	GCATGCAGTTGCATATTACAGGGCAACATCTCCATTGGCAGGCTGCATACTTATTACATCCATCTCATATATACGTATGTTCTTCAGTCAGTGTGCCTTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGGCAATTCCTCTGCATTTATTT	(((......)))))......((((((.((((((.((((((((..(((((((.(((..........(((((....)))))......))).)))))))..)))))))).)))))))))))).)))...))))...........	888979	889079	GGGCAACATCTCCATTGGCAGGCTGCATACTTATTACATCCATCTCATATATACGTATGTTCTTCAGTCAGTGTGCCTTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	((((((.((((((.((((((((..(((((((.(((..........(((((....)))))......))).)))))))..)))))))).)))))))))))).)	Csi-miR399a	888979	889001	TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	Csi-miR399a*	889059	889079	GGGCAACATCTCCATTGGCAG		3
Csi-MIR399b	PmiREN004855	MIR399	Citrus sinensis	Csi-scaffold00040	362917	363077	+	AAGCAGTAAGCGATTTAGTTGTAGGGCTTCTCTCCTTTGGCAGGTGATGGCCAAGGGCAAAGATCATATAATATATATTTATATGGTGCCTATTCTAATTATTGTTCTATTTTTTCAATGACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTATAACTGCTTCAGCTTTT	.......((((((..((((((((((((..((((((((((((((((.........(((((....((((((((.......)))))))))))))........(((((...........)))))))))))))))))))))..))))))))))))..)).))))..	362937	363057	GGGCTTCTCTCCTTTGGCAGGTGATGGCCAAGGGCAAAGATCATATAATATATATTTATATGGTGCCTATTCTAATTATTGTTCTATTTTTTCAATGACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTA	((((..((((((((((((((((.........(((((....((((((((.......)))))))))))))........(((((...........)))))))))))))))))))))..))))))	Csi-miR399b	363037	363057	TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTA	Csi-miR399b*	362937	362957	GGGCTTCTCTCCTTTGGCAGG		3
Csi-MIR399c	PmiREN004856	MIR399	Citrus sinensis	Csi-scaffold00007	877857	877990	+	AATGTGGTTGAGGAATAACAGTGCAGTCCTCCTTTGGCGTGCAGATTGCAAAGAGATAATGCATATTATTTCATTCATTTGCATCCTTCTGTTTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCACTCTCGCAGCTAG	..................(((.(((((.(((((((((((.(((((.((((((((((((((....)))))))).....))))))....))))).))))))))))).))))).)))....................	877877	877970	GTGCAGTCCTCCTTTGGCGTGCAGATTGCAAAGAGATAATGCATATTATTTCATTCATTTGCATCCTTCTGTTTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	(.(((((.(((((((((((.(((((.((((((((((((((....)))))))).....))))))....))))).))))))))))).))))).)..	Csi-miR399c	877950	877970	TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	Csi-miR399c*	877877	877897	GTGCAGTCCTCCTTTGGCGTG		3
Csi-MIR399d	PmiREN004857	MIR399	Citrus sinensis	Csi-scaffold00031	430917	431064	-	TCATAAGCAAAGCAGTTTTAGGGCACCTCTTACTTGGCATGCAATGGTGATTTATTGGTGCAATAATCAGCATTATATTGGTTAATTCGATATCAATCCCACTGATATGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTGACTGCTTCAGCTTAATAT	...(((((.((((((((.(((((((.(((((..((((((((((.(((.((((....(((((........)))))(((((((.....))))))).))))))).)).))))))))..))))).))))))).))))))))..)))))....	430937	431044	GGGCACCTCTTACTTGGCATGCAATGGTGATTTATTGGTGCAATAATCAGCATTATATTGGTTAATTCGATATCAATCCCACTGATATGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG	(((((.(((((..((((((((((.(((.((((....(((((........)))))(((((((.....))))))).))))))).)).))))))))..))))).)))))..	Csi-miR399d	430937	430957	TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG	Csi-miR399d*	431024	431044	GGGCACCTCTTACTTGGCATG		3
Csi-MIR399e	PmiREN004858	MIR399	Citrus sinensis	Csi-scaffold00007	876252	876362	-	AAGTGTTTAGATGCATTACTGGGCAATTCTCTATTGGCAGTTGGCTGCAGGGAGGAGCAACCTAGCTCACTGCCAAAGGAGATTTGCCCGGCAATTCATCTGTGCAATCAT	...(((.((((((.(((.((((((((.(((((.((((((((.((((..(((.........))))))).)))))))).))))).)))))))).))).)))))).))).....	876272	876342	GGGCAATTCTCTATTGGCAGTTGGCTGCAGGGAGGAGCAACCTAGCTCACTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	((((((.(((((.((((((((.((((..(((.........))))))).)))))))).))))).))))))..	Csi-miR399e	876272	876292	TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	Csi-miR399e*	876322	876342	GGGCAATTCTCTATTGGCAGT		3
Csi-MIR399f	PmiREN004859	MIR399	Citrus sinensis	Csi-scaffold00007	883254	883403	+	GCGGGTAGAGGAGAATTCCAGGGCAATTCTCCTTTGGCAGAAAATATTGCGCTTGTACGTACACGCACGGTGCAGTACTTGCACAGGTGCTATAATATATAATATTTGCCGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCAACTACTACCATAT	...(((((((..((((..((((((((((((((((((((.(.(((((((((((((((..((((..(((...))).))))....))))))))..........))))))).).))))))))))))))))))))..))))..)).)))))....	883274	883383	GGGCAATTCTCCTTTGGCAGAAAATATTGCGCTTGTACGTACACGCACGGTGCAGTACTTGCACAGGTGCTATAATATATAATATTTGCCGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	((((((((((((((((((.(.(((((((((((((((..((((..(((...))).))))....))))))))..........))))))).).))))))))))))))))))..	Csi-miR399f	883363	883383	CGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	Csi-miR399f*	883274	883294	GGGCAATTCTCCTTTGGCAGA		3
Csi-MIR403a	PmiREN004861	MIR403	Citrus sinensis	Csi-scaffold00001	4263502	4263648	+	TCAAGGAGAGGCATGTTTCGGGTTTGTGCGTGAATTTAATAAAATAACCGCTTCTTTTAATCTCGTTCCCCCATTTTTTGTTAGTAACAAATTTTTGCCGTCAGTGTTAGATTCACGCACAAACTCGTGATGTGTCTTTTCTTTTAC	...((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.....((.((.........................((((((...)))))).....)).))...))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).....	4263522	4263628	GGTTTGTGCGTGAATTTAATAAAATAACCGCTTCTTTTAATCTCGTTCCCCCATTTTTTGTTAGTAACAAATTTTTGCCGTCAGTGTTAGATTCACGCACAAACTCG	(((((((((((((((((((((.....((.((.........................((((((...)))))).....)).))...)))))))))))))))))))))..	Csi-miR403a	4263608	4263628	TTAGATTCACGCACAAACTCG	Csi-miR403a*	4263522	4263542	GGTTTGTGCGTGAATTTAATA		3
Csi-MIR403b	PmiREN004862	MIR403	Citrus sinensis	Csi-scaffold00016	1081358	1081479	-	GGCCGGGGGGGCACATCTCAAGTTTGTGCGTGAATCTAACCCCATCACAGCCGTCCGTTTTCCCGCTCTCATCTGATGGCGTTAGATTCACGCACAAACTCGCGATCTGTCCATCGACACAC	.....((.(((((.(((.(.((((((((((((((((((((.((((((.....(..((......))..).....)))))).)))))))))))))))))))).).))).))))).)).......	1081378	1081459	AGTTTGTGCGTGAATCTAACCCCATCACAGCCGTCCGTTTTCCCGCTCTCATCTGATGGCGTTAGATTCACGCACAAACTCG	((((((((((((((((((((.((((((.....(..((......))..).....)))))).))))))))))))))))))))..	Csi-miR403b	1081378	1081398	TTAGATTCACGCACAAACTCG	Csi-miR403b*	1081439	1081459	AGTTTGTGCGTGAATCTAACC		3
Csi-MIR408	PmiREN004863	MIR408	Citrus sinensis	Csi-scaffold00001	3896876	3896997	+	CAAGAAGCAAGAGACAAAAGACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAACCATTAACAGGTTCTCTGTTTTGGCTCCTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTCTGCCTTCCTCGTCTTTT	(.....)...............((((((.((((((.((((((..(((.(((..(((((.....))))).))).)))..)))))).)))))).))))))........................	3896896	3896977	ACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAACCATTAACAGGTTCTCTGTTTTGGCTCCTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT	..((((((.((((((.((((((..(((.(((..(((((.....))))).))).)))..)))))).)))))).))))))....	Csi-miR408	3896957	3896977	TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT	Csi-miR408*	3896896	3896916	ACGGGGAACAGGCAGAGCATG		3
Csi-MIR477a	PmiREN004864	MIR477	Citrus sinensis	Csi-scaffold00087	147997	148122	+	TAAAAATGGAGAAGCTTCCAACCTCCCTCGAAGGCTTCCAATATACCATGCTTCCTCAAATTGGCCTTGTAAGCATGGGAATGTTGGAAACCCTAGGGGGAGGTCGAAAGCTTATGACTCCATTTA	....(((((((((((((.(.(((((((((...((.(((((((((.((((((((((.......))......))))))))..))))))))).))...))))))))).).))))))....)))))))..	148017	148102	ACCTCCCTCGAAGGCTTCCAATATACCATGCTTCCTCAAATTGGCCTTGTAAGCATGGGAATGTTGGAAACCCTAGGGGGAGGTCG	(((((((((...((.(((((((((.((((((((((.......))......))))))))..))))))))).))...)))))))))..	Csi-miR477a	148017	148037	ACCTCCCTCGAAGGCTTCCAA	Csi-miR477a*	148082	148102	GGAAACCCTAGGGGGAGGTCG		3
Csi-MIR477b	PmiREN004865	MIR477	Citrus sinensis	Csi-scaffold00116	66086	66242	-	ATTAAGCAGTATCGTCGTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCAATCCATATACGTATTGAACTCTCTCTATATACATATGCTCAAATAATAATTAACGAGAGGAGGATTGACGCCGTAGCCCTCAGGTAGAGTGATCGACTCCCGTTTTATTTAA	.............((((.(((((((.(((..((((((...(.(((((((......((.....))((((((........(((......))).........)))))).))))))).)....)))))).))).))))))).))))...............	66106	66222	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCAATCCATATACGTATTGAACTCTCTCTATATACATATGCTCAAATAATAATTAACGAGAGGAGGATTGACGCCGTAGCCCTCAGGTAGAGTGA	(((((.(((..((((((...(.(((((((......((.....))((((((........(((......))).........)))))).))))))).)....)))))).))).)))))..	Csi-miR477b	66202	66222	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTC	Csi-miR477b*	66106	66126	CGTAGCCCTCAGGTAGAGTGA		3
Csi-MIR477c	PmiREN004866	MIR477	Citrus sinensis	Csi-scaffold00019	79006	79128	-	CCAAAGCAGTAGAGTCGTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCGCCACAATCCAAATCATGCTGAACAGGTGGGTGGGTTGATGCTGAAGTCCTTGGGGTTGAGTGATCGACGCCTGTTTTTTAACT	..(((((((....((((.((((((..((((((((((((((.(((((((((..((((.........)))).))))))).)).))))))))))))))..)))))).))))..)))))))......	79026	79108	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCGCCACAATCCAAATCATGCTGAACAGGTGGGTGGGTTGATGCTGAAGTCCTTGGGGTTGAGTGA	((((..((((((((((((((.(((((((((..((((.........)))).))))))).)).))))))))))))))..))))..	Csi-miR477c	79088	79108	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCGC	Csi-miR477c*	79026	79046	GAAGTCCTTGGGGTTGAGTGA		3
Csi-MIR477d	PmiREN004867	MIR477	Citrus sinensis	Csi-scaffold00009	1431102	1431230	+	CATTAAGGCATTGGTTGCTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGGCGTTAATTAATGACAATTATTAATGCTTGCAGCTGCCTGCCAGGCCTGAGGCCGTTGGGGAGAGTGGACAAAAGTTGTCTTCGTAAC	....((((((.(..(((.((((((((((.(((.((((((.(((....((((((((...)))))))).((.((((....)))).))))).)))))).))))))))))))).)))..).))))))......	1431122	1431210	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGGCGTTAATTAATGACAATTATTAATGCTTGCAGCTGCCTGCCAGGCCTGAGGCCGTTGGGGAGAGTGG	((((((((.(((.((((((.(((....((((((((...)))))))).((.((((....)))).))))).)))))).)))))))))))..	Csi-miR477d	1431122	1431142	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTG	Csi-miR477d*	1431190	1431210	TGAGGCCGTTGGGGAGAGTGG		3
Csi-MIR477e	PmiREN004868	MIR477	Citrus sinensis	Csi-scaffold00009	1431330	1431422	+	ATTGCTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGAACTGGCCTTGTTCACCTTCAATTAAAGGCCTAGACTGAGGTTCTTGGGGAGAGTAGATAATGTT	((((((.((((((((.((((((((((......((((((...............))))))......)))))))))))))))))))).))))...	1431337	1431414	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGAACTGGCCTTGTTCACCTTCAATTAAAGGCCTAGACTGAGGTTCTTGGGGAGAGTAG	((((((((.((((((((((......((((((...............))))))......))))))))))))))))))))	Csi-miR477e	1431337	1431360	ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGA	Csi-miR477e*	1431394	1431414	TGAGGTTCTTGGGGAGAGTAG		3
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Csi-MIR482f	PmiREN004874	MIR482	Citrus sinensis	Csi-scaffold00008	115885	115995	-	GGACTGGGGGAAGTCTTGGAGATGGGTGAGTTGGGAAAATAATAACTTTCTTCACGAAAGAAAGCAATTTTTTTCCCACACCTCCCATCCCTAAGATTTTCTTCAGTTCCT	(((((((((((((((((((.((((((.(.((((((((((.(((..(((((((.....)))))))..))).)))))))).))).)))))).)))))))))))))))))))..	115905	115975	GATGGGTGAGTTGGGAAAATAATAACTTTCTTCACGAAAGAAAGCAATTTTTTTCCCACACCTCCCATCCC	((((((.(.((((((((((.(((..(((((((.....)))))))..))).)))))))).))).))))))..	Csi-miR482f	115905	115925	TTTTCCCACACCTCCCATCCC	Csi-miR482f*	115954	115975	GATGGGTGAGTTGGGAAAATAA		3
Csi-MIR530a	PmiREN004877	MIR530	Citrus sinensis	Csi-scaffold00061	238804	238949	-	ACTGAGATGTCGCATTTTTCTGCATTTGCACCTGCACCTTGCTGTGCTGTTATCTGGGTTGACGAAGATCATCATGATGATCAGCTTCAAAACTCGAAAGCATGAAGGTGCAGCTGTATATGCAGGTGAATGCCATTTTAGCCATT	.((((((((..((((((.(((((((.((((.(((((((((...(((((......((((((((.(..((((((....))))))..).)))..)))))..))))).))))))))).)))).))))))).)))))))))))))).....	238824	238929	TGCATTTGCACCTGCACCTTGCTGTGCTGTTATCTGGGTTGACGAAGATCATCATGATGATCAGCTTCAAAACTCGAAAGCATGAAGGTGCAGCTGTATATGCAGG	(((((.((((.(((((((((...(((((......((((((((.(..((((((....))))))..).)))..)))))..))))).))))))))).)))).)))))..	Csi-miR530a	238909	238929	TGCATTTGCACCTGCACCTTG	Csi-miR530a*	238824	238844	AGGTGCAGCTGTATATGCAGG		3
Csi-MIR530b	PmiREN004878	MIR530	Citrus sinensis	Csi-scaffold00061	256181	256356	+	GCTAAGATGTATCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTGTTGCGTTATCTGGTTCTGGTTCGTAAAAGCCAAAGCACAAGAAGAGCCAATAGCCGTCGGCAGATATGGTGGCAGCATGGGGTTATATGCATCAAGGTGCAGTTGCAAGTGCAGATGAATGCCATTTTAGCTAGC	(((((((((...(.((((((((((((((((.((((((((((.(((((.((((.((..((((((......((....)).......))))))...((.((((.((....)).)))).)))).))))...))))).)))))))))).)))))))))))))))).).)))))))))....	256201	256336	TGCATTTGCACCTGCATCTTGTTGCGTTATCTGGTTCTGGTTCGTAAAAGCCAAAGCACAAGAAGAGCCAATAGCCGTCGGCAGATATGGTGGCAGCATGGGGTTATATGCATCAAGGTGCAGTTGCAAGTGCAGA	((((((((((.((((((((((.(((((.((((.((..((((((......((....)).......))))))...((.((((.((....)).)))).)))).))))...))))).)))))))))).))))))))))..	Csi-miR530b	256201	256221	TGCATTTGCACCTGCATCTTG	Csi-miR530b*	256316	256336	AGGTGCAGTTGCAAGTGCAGA		3
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Csi-MIR535b	PmiREN004880	MIR535	Citrus sinensis	Csi-scaffold04109	7116	7236	-	AGACTCAATACAAATTTGCTTGACAATGAGAGAGAGCACACCTGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCGTGCTCTCTACCATTGTCATAAAATTTGCTTAAAGCAGTTG	...........((((((...((((((((..(((((((((.(..((((((.....(((.....)))..))))...))..).)))))))))..))))))))..))))))..............	7136	7216	TGACAATGAGAGAGAGCACACCTGTCAGCATTCGTGCAAATGGCAAGGCTGTCTACTAGCGTGCTCTCTACCATTGTCATA	((((((((..(((((((((.(..((((((.....(((.....)))..))))...))..).)))))))))..))))))))..	Csi-miR535b	7196	7216	TGACAATGAGAGAGAGCACAC	Csi-miR535b*	7136	7156	GTGCTCTCTACCATTGTCATA		3
Csi-MIR827	PmiREN004881	MIR827	Citrus sinensis	Csi-scaffold00180	294553	294676	-	TTTTGGTGCAGCTTTGAATTTGCTTGTTGATTGTCATCTAATCATTTTCTTTTTCATCCGGGCATTTGAATGATTATATGGTTAGATGACCATCAACAAACATATTCATGGTATGGCATGCATT	....(((((((((.(((((.((.((((((((.(((((((((((((.......((((..........)))).......))))))))))))).)))))))).)).))))).)))......))))))	294573	294656	TGCTTGTTGATTGTCATCTAATCATTTTCTTTTTCATCCGGGCATTTGAATGATTATATGGTTAGATGACCATCAACAAACATA	((.((((((((.(((((((((((((.......((((..........)))).......))))))))))))).)))))))).))..	Csi-miR827	294573	294593	AGATGACCATCAACAAACATA	Csi-miR827*	294636	294656	TGCTTGTTGATTGTCATCTAA		3
Csi-MIR828	PmiREN004882	MIR828	Citrus sinensis	Csi-scaffold00066	131483	131650	-	TTATTCCTCTTTGTAATGTTTCTTGCTCAAATGAGTATTCCAAAAACAGCTGAATCTTGCACATATTTCATTTATAAGAAAACAAGATATTCTCATATTCCTCTTCATTGATGCTTCTGTTGGCTGAGATACTCATTTGAGCTAGAAGTATTATGAGTGGAAGAAATT	....(((.(((.(((((((((((.(((((((((((((((.......(((((((.....(((((.........(((.((((.........)))).)))...........)).))).....))))))).))))))))))))))).)))))))))))))).))).......	131503	131630	TCTTGCTCAAATGAGTATTCCAAAAACAGCTGAATCTTGCACATATTTCATTTATAAGAAAACAAGATATTCTCATATTCCTCTTCATTGATGCTTCTGTTGGCTGAGATACTCATTTGAGCTAGAAG	(((.(((((((((((((((.......(((((((.....(((((.........(((.((((.........)))).)))...........)).))).....))))))).))))))))))))))).)))..	Csi-miR828	131610	131630	TCTTGCTCAAATGAGTATTCC	Csi-miR828*	131503	131523	GATACTCATTTGAGCTAGAAG		3
Csi-MIR1446	PmiREN004751	MIR1446	Citrus sinensis	Csi-scaffold00087	149205	149330	+	TTTTGAGAGCTAACGTTCTCCGAACTCTCTCCCTCAACGGCTCCTCTTGGCTTTGCAAATCATTCCTTCTGATACAGAAGGCGCCGTTGAGGTAGGGCAGTTCGGAAAATATAGGCTCTTAGCTGT	......(((((...(((.((((((((((((.((((((((((.((....))..............(((((((...))))))).)))))))))).)))).)))))))).)))...)))))........	149225	149310	CGAACTCTCTCCCTCAACGGCTCCTCTTGGCTTTGCAAATCATTCCTTCTGATACAGAAGGCGCCGTTGAGGTAGGGCAGTTCGGA	((((((((((.((((((((((.((....))..............(((((((...))))))).)))))))))).)))).))))))..	Csi-miR1446	149225	149245	CGAACTCTCTCCCTCAACGGC	Csi-miR1446*	149290	149310	GTTGAGGTAGGGCAGTTCGGA		3
Csi-MIR2111	PmiREN004813	MIR2111	Citrus sinensis	Csi-scaffold00083	135152	135262	-	TCCATATTGGTGAGGATCGGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTGGATCAGCATGTACGTTTGTTGTATCTAGTCCTCAGGATGCGGATTACCTTATCCTTACTGACAATATAA	...((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((((((((((........))))).)))))).)))))))))))))))))))).))))))))...))))))..	135172	135242	GTAATCTGCATCCTGAGGTTTGGATCAGCATGTACGTTTGTTGTATCTAGTCCTCAGGATGCGGATTACCT	((((((((((((((((((.(((((((((((........))))).)))))).))))))))))))))))))..	Csi-miR2111	135172	135192	TCCTCAGGATGCGGATTACCT	Csi-miR2111*	135222	135242	GTAATCTGCATCCTGAGGTTT		3
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Csi-MIR2275b	PmiREN004815	MIR2275	Citrus sinensis	Csi-scaffold00055	67036	67159	-	TTCTTTATCAGTTGTATGTAAGAATTGGATGGAACTAAACAGATTAACTAGTAAATAGTAAGATCGAAATATTCTTTTTCTGTTTAGTTTCCTCCAATATTTTATCTCCAACTTCTAAACTATA	..............(((((((((((((((.(((((((((((((...((((.....))))((((.........))))..))))))))))))).)))))).))))))................)))	67056	67139	AGAATTGGATGGAACTAAACAGATTAACTAGTAAATAGTAAGATCGAAATATTCTTTTTCTGTTTAGTTTCCTCCAATATTTTA	(((((((((.(((((((((((((...((((.....))))((((.........))))..))))))))))))).)))))).)))..	Csi-miR2275b	67119	67139	AGAATTGGATGGAACTAAACA	Csi-miR2275b*	67056	67076	TTAGTTTCCTCCAATATTTTA		3
Csi-MIR2275c	PmiREN004816	MIR2275	Citrus sinensis	Csi-scaffold00027	281464	281576	-	TATTGTGAATGGTGTATGTAAGTATTGGAGGGAATTAATCCGATTAGTATTTTTTTCCATAATTGTTTCTGTTTAATTTCCTCCAATATCTTATGTCCCCCCTTTACTTGTAT	....(((((.((.(.(((((((((((((((((((((((.(((((((.............)))))).....).)))))))))))))))).))))))).).)).)))))......	281484	281556	AGTATTGGAGGGAATTAATCCGATTAGTATTTTTTTCCATAATTGTTTCTGTTTAATTTCCTCCAATATCTTA	((((((((((((((((((.(((((((.............)))))).....).)))))))))))))))).))..	Csi-miR2275c	281484	281505	TTTAATTTCCTCCAATATCTTA	Csi-miR2275c*	281536	281556	AGTATTGGAGGGAATTAATCC		3
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Csi-MIR2275e	PmiREN004818	MIR2275	Citrus sinensis	Csi-scaffold00666	64832	64982	-	AATAGTTGCAACTTAAGGTGAGAATTGGAGGAAACGAAATAGACTGAAGTTGTTCAATCATCGGTGGTTGCTATTTGATTTTAAGTTGTTCAATCATCGGTCATCTCTATTTGGTTTTCTCCAATATCTCATCTCCAGTTTTGACTCAGAT	...(((((.((((..((((((((((((((((((((.(((((((.((((....))))...(((((((((((..(((((....)))))....)))))))))))....))))))).)))))))))))).))))))))..)))).))))).....	64852	64962	AGAATTGGAGGAAACGAAATAGACTGAAGTTGTTCAATCATCGGTGGTTGCTATTTGATTTTAAGTTGTTCAATCATCGGTCATCTCTATTTGGTTTTCTCCAATATCTCA	(((((((((((((((.(((((((.((((....))))...(((((((((((..(((((....)))))....)))))))))))....))))))).)))))))))))).)))..	Csi-miR2275e	64852	64873	TTTGGTTTTCTCCAATATCTCA	Csi-miR2275e*	64942	64962	AGAATTGGAGGAAACGAAATA		3
Csi-MIR3627a	PmiREN004821	MIR3627	Citrus sinensis	Csi-scaffold00015	716394	716526	-	GAGGGGGGCTACAGGGATTCTTGTCGCCGGAGAGATAGCACCTACTACCTCTTAATTGCATTAACTAAGTTGTGCATAAATAACGCCGTAAGCGCCATCTCCCGGTGACAAGACTCCCTTCATCCTCTATATA	...(((((....(((((.((((((((((((.(((((.((.(.(((...........(((((.(((...))))))))...........))).).)).))))))))))))))))).)))))....))))).....	716414	716506	TTGTCGCCGGAGAGATAGCACCTACTACCTCTTAATTGCATTAACTAAGTTGTGCATAAATAACGCCGTAAGCGCCATCTCCCGGTGACAAGA	((((((((((.(((((.((.(.(((...........(((((.(((...))))))))...........))).).)).)))))))))))))))..	Csi-miR3627a	716486	716506	TTGTCGCCGGAGAGATAGCAC	Csi-miR3627a*	716414	716434	CGCCATCTCCCGGTGACAAGA		3
Csi-MIR3627b	PmiREN004822	MIR3627	Citrus sinensis	Csi-scaffold00015	720282	720398	+	TAAAAGAAGTTCAGGGACTCTTGTCGCAGGAGCGGTGGCACCTGCACCGGCCGCCGTGTGTATGTGGTGTCGCAAGTGCCAGCATCCTGTGACAAGAAGCCCTAAAACTTCTTCGCT	...((((((((.((((..(((((((((((((..(.((((((.(((....(((((.........)))))...))).)))))).).)))))))))))))..))))..))))))))....	720302	720378	TTGTCGCAGGAGCGGTGGCACCTGCACCGGCCGCCGTGTGTATGTGGTGTCGCAAGTGCCAGCATCCTGTGACAAGA	(((((((((((..(.((((((.(((....(((((.........)))))...))).)))))).).)))))))))))..	Csi-miR3627b	720302	720323	TTGTCGCAGGAGCGGTGGCACC	Csi-miR3627b*	720358	720378	TGCCAGCATCCTGTGACAAGA		3
Csi-MIR3627c	PmiREN004823	MIR3627	Citrus sinensis	Csi-scaffold00015	714687	714789	+	AGAAAGTTGGGGCACTTATATCGCAGGGGAGATGGGACCAACTGCAGCCGCTAGGTAGCAGCCGGTGCCATCCTCCTGCGATATGAGAACCCTCCAACTTACT	...(((((((((..(((((((((((((((.(((((.(((..((((.(((....))).))))..))).))))))))))))))))))))....)))))))))...	714707	714769	TCGCAGGGGAGATGGGACCAACTGCAGCCGCTAGGTAGCAGCCGGTGCCATCCTCCTGCGATA	(((((((((.(((((.(((..((((.(((....))).))))..))).))))))))))))))..	Csi-miR3627c	714707	714728	TCGCAGGGGAGATGGGACCAAC	Csi-miR3627c*	714749	714769	CGGTGCCATCCTCCTGCGATA		3
Csi-MIR3950	PmiREN004837	MIR3950	Citrus sinensis	Csi-scaffold00427	37641	37795	+	AAAACCCAATTTTTTCGGCAACATGATTTCTTAGTAGAAACCAAAATTTACTTTTTGTGCCAACAGGATTTATAATAAGAATTTATGCAAACGGATTTCTTTTAGAAGTCAAATTTTGACAAGATTGATCATCATCGTTGGTGGGAAACACCAAG	......(((((((.((((.((..((((((((....(((((((..........((((((....))))))..(((((.......))))).....)).)))))...))))))))..)))))).)))))))..........((((((.....)))))).	37651	37765	TTTTTCGGCAACATGATTTCTTAGTAGAAACCAAAATTTACTTTTTGTGCCAACAGGATTTATAATAAGAATTTATGCAAACGGATTTCTTTTAGAAGTCAAATTTTGACAAGAT	(((.((((.((..((((((((....(((((((..........((((((....))))))..(((((.......))))).....)).)))))...))))))))..)))))).)))))	Csi-miR3950	37651	37673	TTTTTCGGCAACATGATTTCT	Csi-miR3950*	37745	37765	GAAGTCAAATTTTGACAAGAT		2
Csi-MIR3951	PmiREN004838	MIR3951	Citrus sinensis	Csi-scaffold00152	150997	151146	+	CATAAGAGGAGTGCTTGGCATAGATAAAGATGAGAGAAAAATATGAGAGAAAGGACGAGAGAAATTTGTTCCCTCTCCACCCACCCACTCTCTCTTCTCTTTTCTTCTTTTTCTCTTATCGTTATCTGTGCTTAGCATTTTTCTTCGATA	...((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((...(((((((.(((.((((((..........................)))))).))).))))))).))))))))))))).))))))))))).)))))))))))).....	151017	151126	TAGATAAAGATGAGAGAAAAATATGAGAGAAAGGACGAGAGAAATTTGTTCCCTCTCCACCCACCCACTCTCTCTTCTCTTTTCTTCTTTTTCTCTTATCGTTATCTGTG	(((((((.(((((((((((((...(((((((.(((.((((((..........................)))))).))).))))))).))))))))))))).)))))))..	Csi-miR3951	151106	151126	TTTCTCTTATCGTTATCTGTG	Csi-miR3951*	151017	151037	TAGATAAAGATGAGAGAAAAA		3
Csi-MIR3952a	PmiREN004839	MIR3952	Citrus sinensis	Csi-scaffold11004	1711	1890	+	TTATGCATATTCTTTCATGTGCTGTAGATAGGCCCTTCAACCTCGGAAACCTCACCATGGACTGGGAGCGAAGGAAGTGGGATCTGATGGTTGGCATTGTAGGTGGCAAGCTGCAAAAGAAAGATGACGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCACTGGAATCCATTCATACTTCA	............(((((.(((((.((((.((((((((((((...((((((.(((((((...((........))...))))((((....))))....((((((.(....).))))))........))).))))))...)))))))))))).)))).))))))))))...............	1731	1870	GCTGTAGATAGGCCCTTCAACCTCGGAAACCTCACCATGGACTGGGAGCGAAGGAAGTGGGATCTGATGGTTGGCATTGTAGGTGGCAAGCTGCAAAAGAAAGATGACGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	(((.((((.((((((((((((...((((((.(((((((...((........))...))))((((....))))....((((((.(....).))))))........))).))))))...)))))))))))).)))).)))..	Csi-miR3952a	1850	1870	TGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	Csi-miR3952a*	1731	1751	GCTGTAGATAGGCCCTTCAAC		3
Csi-MIR3952b	PmiREN004841	MIR3952	Citrus sinensis	Csi-scaffold03620	2843	3022	-	TTATGCATATTCTTTCATGTGCTGTAGAAAGGCCCCTCAACCTCGGAAACCTCACCATGGACTGGGAACGAAGAAAGTGGGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGGCGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCACTGGAATCCATTCATAATTTA	.............(((..(((((.(((((((((((.(((((...((((((.(((((((...((........))...))))..((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).......))).))))))...))))).))))))))))).)))))..)))...............	2863	3002	GCTGTAGAAAGGCCCCTCAACCTCGGAAACCTCACCATGGACTGGGAACGAAGAAAGTGGGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGGCGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	(((.(((((((((((.(((((...((((((.(((((((...((........))...))))..((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).......))).))))))...))))).))))))))))).)))..	Csi-miR3952b	2863	2883	TGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	Csi-miR3952b*	2982	3002	GCTGTAGAAAGGCCCCTCAAC		3
Csi-MIR3952c	PmiREN004840	MIR3952	Citrus sinensis	Csi-scaffold00261	158727	158912	-	TTATGCATATTCTTTCATGTGCTGTAGAAAGTCCCTTCACCCTCGGAAACGTCACCATGGACTGGAACTGGGGGCGAAGAAAGTGAGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGGCGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCACTGGAATCCATTCATAATTAA	............(((((.(((((.(((((((.((((((((((((((...((((......))).)...)))))))..............((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).(((((......))))).....))))))).))))))).))))))))))...............	158747	158892	GCTGTAGAAAGTCCCTTCACCCTCGGAAACGTCACCATGGACTGGAACTGGGGGCGAAGAAAGTGAGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGGCGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	(((.(((((((.((((((((((((((...((((......))).)...)))))))..............((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).(((((......))))).....))))))).))))))).)))..	Csi-miR3952c	158747	158767	TGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	Csi-miR3952c*	158872	158892	GCTGTAGAAAGTCCCTTCACC		3
Csi-MIR3952d	PmiREN004842	MIR3952	Citrus sinensis	Csi-scaffold00742	5816	6001	-	TTATGCATATTCTTTCATGTGCTGTAGAAAGTCCCTTCACCCTCGGAAACGTCACCATGGACTGGAACTGGGAGCGAAGAAAGCGAGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCACTGGAATCCATTCATAATTAA	............(((((.(((((.(((((((.(((((((.(...(((((((((((((.(........))))..((.......))....((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).......))))))))))...).))))))).))))))).))))))))))...............	5836	5981	GCTGTAGAAAGTCCCTTCACCCTCGGAAACGTCACCATGGACTGGAACTGGGAGCGAAGAAAGCGAGATCTGATGGTTGGCATTGAAGGTGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAAGTTGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	(((.(((((((.(((((((.(...(((((((((((((.(........))))..((.......))....((((..(.(((.((((...)))).))).)..)))).......))))))))))...).))))))).))))))).)))..	Csi-miR3952d	5836	5856	TGAAGGGCCTTTCTAGAGCAC	Csi-miR3952d*	5961	5981	GCTGTAGAAAGTCCCTTCACC		3
Csi-MIR3953	PmiREN004843	MIR3953	Citrus sinensis	Csi-scaffold00646	3040	3140	+	TGGATAATCTGATGACTGCAGAGCCCAGACAGAGGCGTCATTCCGTGCATCATAGCCATCACCCCGTCGATTGAGTTCTGCAAGCCGTCGAGTTTCTGCCT	.(((...((.((((.(((((((((.(((.....((((.......(.((......))).......))))..))).))))))).)).))))))...)))....	3050	3130	GATGACTGCAGAGCCCAGACAGAGGCGTCATTCCGTGCATCATAGCCATCACCCCGTCGATTGAGTTCTGCAAGCCGTCGA	((((.(((((((((.(((.....((((.......(.((......))).......))))..))).))))))).)).))))))	Csi-miR3953	3110	3132	TTGAGTTCTGCAAGCCGTCGA	Csi-miR3953*	3050	3070	GATGACTGCAGAGCCCAGACA		3
Csi-MIR3954	PmiREN004844	MIR3954	Citrus sinensis	Csi-scaffold06001	2926	3081	+	AAATGATCGATTATATTTGTTTGGACAGAGAAATCACGGTCATGAGATGAGTTTTCTAATCTGTACTGTAATCTGTATACGGTGATGGTGAATATTGACGACGGATTCTCTTTCTACCGTGTTTCTCTGCCCAATCAGATATATTTGATCTTCATT	....((((((.((((((((.((((.((((((((.((((((...((((.(((..(((..(((..(((((((.......)))))))..))).............)))..))))))).)))))))))))))).)))).)))))))).))))))......	2946	3061	TTGGACAGAGAAATCACGGTCATGAGATGAGTTTTCTAATCTGTACTGTAATCTGTATACGGTGATGGTGAATATTGACGACGGATTCTCTTTCTACCGTGTTTCTCTGCCCAATC	((((.((((((((.((((((...((((.(((..(((..(((..(((((((.......)))))))..))).............)))..))))))).)))))))))))))).))))..	Csi-miR3954	2946	2967	TTGGACAGAGAAATCACGGTCA	Csi-miR3954*	3041	3061	ACCGTGTTTCTCTGCCCAATC		3
Csi-MIR5179	PmiREN004875	MIR5179	Citrus sinensis	Csi-scaffold09931	1053	1292	-	TAGAACAATTAAAACCAAAATCTTGCTCAAGACCGCGCAATTTGTTCATGAAAAACCGCATCTGGGTATTGGTTTGTCAGGTATTTCATCAGTATTTACAGAGAGGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATACAAGATTGGATAAAAATGGATAAGCCTATACCTTGATGCTGCTGCTCATGTATATAGGCTGCGTGGTCTTGCGCAAGATATTACTTGAGAAAAAATATGC	...................(((((((.((((((((((((.(((((.(((((..(.(.(((((.((((((.((((((((...(((((.(((.((((((......................................))))))..))).)))))......)))))))).)))))).))))).).)..)))))...))))).)))))))))))).))))))).....................	1073	1272	TCTTGCTCAAGACCGCGCAATTTGTTCATGAAAAACCGCATCTGGGTATTGGTTTGTCAGGTATTTCATCAGTATTTACAGAGAGGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATACAAGATTGGATAAAAATGGATAAGCCTATACCTTGATGCTGCTGCTCATGTATATAGGCTGCGTGGTCTTGCGCAAGATA	((((((.((((((((((((.(((((.(((((..(.(.(((((.((((((.((((((((...(((((.(((.((((((......................................))))))..))).)))))......)))))))).)))))).))))).).)..)))))...))))).)))))))))))).))))))..	Csi-miR5179	1252	1272	TCTTGCTCAAGACCGCGCAAT	Csi-miR5179*	1073	1093	TGCGTGGTCTTGCGCAAGATA		3
Csi-MIR5225	PmiREN004876	MIR5225	Citrus sinensis	Csi-scaffold00015	721964	722110	+	GAAAGAGATGTAAAGGGGCTTCTGTCGCAGGAGAGATGGTGCCTACCGCATAGCTCTTGCTTGCTGGTTTGTGCATTAATGTCATCACAGCAATATGTAATTAAGCATCATCTTTCCTGGACTGAAGCCCATCATTTTCTTTCAGTA	...............(((((((.(((.(((((((((((((((.((..(((((((....))((((((...((.(((....)))))...)))))))))))...)).)))))))))))))))))).))))))).................	721984	722090	TCTGTCGCAGGAGAGATGGTGCCTACCGCATAGCTCTTGCTTGCTGGTTTGTGCATTAATGTCATCACAGCAATATGTAATTAAGCATCATCTTTCCTGGACTGAAG	((.(((.(((((((((((((((.((..(((((((....))((((((...((.(((....)))))...)))))))))))...)).)))))))))))))))))).))..	Csi-miR5225	721984	722005	TCTGTCGCAGGAGAGATGGTGC	Csi-miR5225*	722070	722090	ATCATCTTTCCTGGACTGAAG		3
Csi-MIR9560	PmiREN004883	MIR9560	Citrus sinensis	Csi-scaffold00004	4113217	4113317	+	TTCAAGGTGTGATTCTGAATGCACAGGAGGTGGAACAAATATGAAATTTTCATTGAAATTCATATTTGCTCCACCACCTGTGGATTCAAATTCAGCCTTAG	..((((((.(((...(((((.((((((.((((((.((((((((((.(((.....))).)))))))))).)))))).)))))).)))))...)))))))).)	4113237	4113297	ACAGGAGGTGGAACAAATATGAAATTTTCATTGAAATTCATATTTGCTCCACCACCTGTGG	(((((.((((((.((((((((((.(((.....))).)))))))))).)))))).)))))).	Csi-miR9560	4113237	4113260	ACAGGAGGTGGAACAAATATGAAA	Csi-miR9560*	4113277	4113297	TATTTGCTCCACCACCTGTGG		3
Csi-MIR12106	PmiREN004746	MIR12106	Citrus sinensis	Csi-scaffold00010	938693	938816	+	TTTTGCAAAAGCTTAAGTCCTGTTTAGGACAGCTGCTGCCAAACCTACATTATAGGAGAGATTTTCTCCTAAAATACAGGTTTGGCGCAGCTGTCCTAAACGGGCCTATAGTCTAGCAACTCAG	.....................(((((((((((((((.(((((((((..(((.(((((((.....))))))).)))..)))))))))))))))))))))))).......................	938713	938796	TGTTTAGGACAGCTGCTGCCAAACCTACATTATAGGAGAGATTTTCTCCTAAAATACAGGTTTGGCGCAGCTGTCCTAAACGGG	.(((((((((((((((.(((((((((..(((.(((((((.....))))))).)))..))))))))))))))))))))))))...	Csi-miR12106	938713	938734	TGTTTAGGACAGCTGCTGCCAA	Csi-miR12106*	938776	938796	GGCGCAGCTGTCCTAAACGGG		3
Csi-MIR12107	PmiREN004747	MIR12107	Citrus sinensis	Csi-scaffold05694	2312	2452	-	TTATTTTGAGAGTGTTTTTACTGATGAGAGAGCGAATGATAAACCTTAATCTTTCTCAATTTATAAACAATTGGGAGACTCCAAAAAAAAATCAAATTTATCATTCGCGCTCTCATCATTATGAACGCCTTCAAATCCTGC	....((((((.((((((.((.(((((((((.((((((((((((........((((((((((.......))))))))))..................)))))))))))).))))))))).)).)))))).))))))......	2332	2432	CTGATGAGAGAGCGAATGATAAACCTTAATCTTTCTCAATTTATAAACAATTGGGAGACTCCAAAAAAAAATCAAATTTATCATTCGCGCTCTCATCATTA	.(((((((((.((((((((((((........((((((((((.......))))))))))..................)))))))))))).)))))))))...	Csi-miR12107	2412	2432	CTGATGAGAGAGCGAATGATA	Csi-miR12107*	2332	2352	TCATTCGCGCTCTCATCATTA		3
Csi-MIR12108	PmiREN004748	MIR12108	Citrus sinensis	Csi-scaffold00063	299338	299476	+	ATATATAAGGATTCTCATGCGCAGACGTTCGCACTTTTTAAAATGCAGATTTATGTTAGATCATGCTAATTAGCTCAAATTTAACATTTTTATATCTGCATTTTAAAACGTGCGGATGTCTGCACTAAAGAGTGATTAT	....((((..(((((...(.((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((((((...(((....)))....)))))))))......))))))))))))))).)))))))))))))).)...)))))..))))	299358	299456	GACGTTCGCACTTTTTAAAATGCAGATTTATGTTAGATCATGCTAATTAGCTCAAATTTAACATTTTTATATCTGCATTTTAAAACGTGCGGATGTCTG	(((((((((((.(((((((((((((((..(((((((((...(((....)))....)))))))))......))))))))))))))).)))))))))))))	Csi-miR12108	299433	299456	CATTTTAAAACGTGCGGATGTCTG	Csi-miR12108*	299358	299378	GACGTTCGCACTTTTTAAAAT		3
Csi-MIR12109	PmiREN004749	MIR12109	Citrus sinensis	Csi-scaffold07881	1274	1374	-	GAAATAGCTGATGTGTCTGCTGCTTGGTGCATAAAACTACAGAAACAATACATGCTTCTGCAGATTTGTGCATTAAGCTGCAGAAACAGTTGCAAATCTTA	(.....((...(((.(((((.((((((((((((((.((.(((((.((.....)).))))).)).)))))))))))))).))))).)))...)).....)))	1294	1354	TGCTTGGTGCATAAAACTACAGAAACAATACATGCTTCTGCAGATTTGTGCATTAAGCTGC	.((((((((((((((.((.(((((.((.....)).))))).)).)))))))))))))).))	Csi-miR12109	1294	1319	CTGCAGATTTGTGCATTAAGCTGC	Csi-miR12109*	1334	1354	TGCTTGGTGCATAAAACTACA		3
Csi-MIR12110	PmiREN004750	MIR12110	Citrus sinensis	Csi-scaffold00104	253375	253493	-	TAAATGGGAGATAGATAGTTCTGGGGAGTTGCACCCGGAGTAATTTCTTCAGCTTCTTTTTAGCGTTTTATATTTACCCCGGGTCACAGCTCCCTGGACCGATCTATCTCACATGCATA	...(((.(((((((((.(.((((((((((((.((((((.((((........(((.......))).........)))).))))))..)))))))))))).).))))))))).))).....	253395	253473	CTGGGGAGTTGCACCCGGAGTAATTTCTTCAGCTTCTTTTTAGCGTTTTATATTTACCCCGGGTCACAGCTCCCTGGAC	(((((((((((.((((((.((((........(((.......))).........)))).))))))..)))))))))))..	Csi-miR12110	253395	253416	CCCGGGTCACAGCTCCCTGGAC	Csi-miR12110*	253453	253473	CTGGGGAGTTGCACCCGGAGT		3
Csi-MIRN836	PmiREN004959	MIRN836	Citrus sinensis	Csi-scaffold00036	835878	835996	+	TTTTTAATTTTCTGTTATGTAGCTTGAGTCTTGCTGAAAGTACATGTTTAAAAGTTTGGATTTTATTTTTTCCAAGTACTTTCAGCAGCCTCCGGCGTCATAGCAGAGAGTGAAATTAT	......(((((((((((((..(((.(((.((.(((((((((((............(((((..........)))))))))))))))))).))).)))..)))))))))))))........	835898	835976	AGCTTGAGTCTTGCTGAAAGTACATGTTTAAAAGTTTGGATTTTATTTTTTCCAAGTACTTTCAGCAGCCTCCGGCGTC	.(((.(((.((.(((((((((((............(((((..........)))))))))))))))))).))).)))...	Csi-miRN836	835956	835976	CTTTCAGCAGCCTCCGGCGTC	Csi-miRN836*	835898	835918	AGCTTGAGTCTTGCTGAAAGT		3
Csi-MIRN848	PmiREN004938	MIRN848	Citrus sinensis	Csi-scaffold00032	473238	473362	-	TTAGGTGCAACTATGGCACCGTGCCACAGTTACATCTAGCCGTTGGATGCCAGTGGACCCCATCAATCTAACTGCATCCAACAGTTAGATGCAACTGTGGTACGGTGCCACAGTTGCACCGTAGC	(..(((((((((.((((((((((((((((((.((((((((.(((((((((.((((((.........))).)))))))))))).)))))))).)))))))))))))))))).)))))))))..)..	473258	473342	GTGCCACAGTTACATCTAGCCGTTGGATGCCAGTGGACCCCATCAATCTAACTGCATCCAACAGTTAGATGCAACTGTGGTACGG	(((((((((((.((((((((.(((((((((.((((((.........))).)))))))))))).)))))))).)))))))))))..	Csi-miRN848	473258	473278	TTAGATGCAACTGTGGTACGG	Csi-miRN848*	473322	473342	GTGCCACAGTTACATCTAGCC		3
Csi-MIRN850	PmiREN005099	MIRN850	Citrus sinensis	Csi-scaffold00001	2477060	2477268	+	CTGCAATTAGGGTTTTAATGGAGCTCTCTGAACTCCAAGTCTGAAAGGAGGTGATGGTAGGCCACGGCTGCTAGTCCATGAACACCCGTGGTTGCGCAGACTCAATACTGTGGCGCAGTCTAAGGGTTTGCATGAACTGGGAGACGAGGCTACCTTGATCTTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCATTCATGGACATCTCATTATT	....................(((((((((..(((((((..(((((((((......(((((.((.((.((.(((((.((((...((((.(((((((((..((........)).)))))).))).))))...)))).))))).)).)).)))))))....)))))))))..)))))))..)))))))))......................	2477080	2477248	GAGCTCTCTGAACTCCAAGTCTGAAAGGAGGTGATGGTAGGCCACGGCTGCTAGTCCATGAACACCCGTGGTTGCGCAGACTCAATACTGTGGCGCAGTCTAAGGGTTTGCATGAACTGGGAGACGAGGCTACCTTGATCTTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCA	(((((((((..(((((((..(((((((((......(((((.((.((.((.(((((.((((...((((.(((((((((..((........)).)))))).))).))))...)))).))))).)).)).)))))))....)))))))))..)))))))..)))))))))..	Csi-miRN850	2477080	2477099	GAGCTCTCTGAACTCCAAGT	Csi-miRN850*	2477228	2477248	ATTGGAGTGAAGGGAGCTCCA		3
Csi-MIRN853a	PmiREN004914	MIRN853	Citrus sinensis	Csi-scaffold11271	117	212	-	ATGTTAAGTTATATGCATGCAACTTACAATCCCCTCACATGAATAGTAAAATTTATGTGAGATGATTGTAAGTTACATGAATGTAACTTAGAAACG	....((((((((((.((((.(((((((((((..(((((((((((......)))))))))))..))))))))))).)))).))))))))))......	137	192	AACTTACAATCCCCTCACATGAATAGTAAAATTTATGTGAGATGATTGTAAGTTAC	(((((((((((..(((((((((((......)))))))))))..)))))))))))..	Csi-miRN853a	137	157	TGTGAGATGATTGTAAGTTAC	Csi-miRN853a*	172	192	AACTTACAATCCCCTCACATG		3
Csi-MIRN853b	PmiREN004953	MIRN853	Citrus sinensis	Csi-scaffold00002	754827	754941	+	ATGTTAAGTTACATGCATATACCTTACACTTTTTTTATATAAATAGTGAATGATGTGGGTTTATTTATTATTTACGTGAGAGGGTTGTAAGGTACATACATATAACTTGGAGGGA	...((((((((.(((.((.(((((((((.(((((((((.((((((((((((((.......)))))))))))))).))))))))).))))))))).)).))).)))))))).....	754847	754921	ACCTTACACTTTTTTTATATAAATAGTGAATGATGTGGGTTTATTTATTATTTACGTGAGAGGGTTGTAAGGTAC	((((((((.(((((((((.((((((((((((((.......)))))))))))))).))))))))).))))))))..	Csi-miRN853b	754901	754921	CGTGAGAGGGTTGTAAGGTAC	Csi-miRN853b*	754847	754867	ACCTTACACTTTTTTTATATA		3
Csi-MIRN853c	PmiREN005048	MIRN853	Citrus sinensis	Csi-scaffold00058	525463	525566	-	CCTCTAAGTTACATGCATGTACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTATCCATACACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTACATGCATGTAACTTAGCATTA	...((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((........))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))).....	525483	525546	ACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTATCCATACACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTAC	(((((((((.(((((((((((((((((........))))))))))))))))).)))))))))..	Csi-miRN853c	525483	525503	TGTGAGAGGAATGTAAGGTAC	Csi-miRN853c*	525526	525546	ACCTTACATCCCTCTCACATG		3
Csi-MIRN853d	PmiREN005057	MIRN853	Citrus sinensis	Csi-scaffold00894	50634	50739	-	CCTCTAAGTTACATGCATGTACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTGTATTCATACACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTACATGCATGTAACTTAGCATTA	....(((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))......	50654	50719	ACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTGTATTCATACACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTAC	(((((((((.((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))).)))))))))..	Csi-miRN853d	50654	50674	TGTGAGAGGAATGTAAGGTAC	Csi-miRN853d*	50699	50719	ACCTTACATCCCTCTCACATG		3
Csi-MIRN853e	PmiREN005101	MIRN853	Citrus sinensis	Csi-scaffold00021	955192	955306	+	ATGCTAAGTTACATGCATGTACCTTACACTCCTCTCACATGAATAGTGAATGATGTGGGTTCACTCACTATTCATGTGAGAGGATTGTAAGGTACAGGCATGTAACTTAGAGGAA	....................((((((((.((((((((((((((((((((.(((.......))).)))))))))))))))))))).))))))))......................	955212	955286	ACCTTACACTCCTCTCACATGAATAGTGAATGATGTGGGTTCACTCACTATTCATGTGAGAGGATTGTAAGGTAC	((((((((.((((((((((((((((((((.(((.......))).)))))))))))))))))))).))))))))..	Csi-miRN853e	955266	955286	TGTGAGAGGATTGTAAGGTAC	Csi-miRN853e*	955212	955232	ACCTTACACTCCTCTCACATG		3
Csi-MIRN855	PmiREN005028	MIRN855	Citrus sinensis	Csi-scaffold00330	77017	77141	+	GGGAATCCCATACTTTAATAAAGTAAGGGACAAGCTAAAAGACCAAAAAACATAGATTTCAATACAATGCAGTGGAGTTTGTGTTTTTCTGTCTTTTAGCTTGTTCCTTACTTTAAAGTAAGGGA	.....((((.((((((((...((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((...........))))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))).))))	77037	77121	AGGGACAAGCTAAAAGACCAAAAAACATAGATTTCAATACAATGCAGTGGAGTTTGTGTTTTTCTGTCTTTTAGCTTGTTCCTTA	((((((((((((((((((..((((((((((((((((...........))))))))))))))))..))))))))))))))))))))	Csi-miRN855	77037	77057	AGGGACAAGCTAAAAGACCAA	Csi-miRN855*	77101	77121	TGTCTTTTAGCTTGTTCCTTA		3
Csi-MIRN856	PmiREN004899	MIRN856	Citrus sinensis	Csi-scaffold00001	2999565	2999735	+	ACTCCTTTCATTGAAAAGCCTCTTGCTCAAATGAGTATTCCACAACCTCTGCTTGGAAAGAACAATTCTCACTGACGTTTCCCATTATTGGTTCTACCATTCTCCAGTGTTCCTTCACACATTGTAATGGGATACTCATTTAGGCAAGACGCTTTGCATGGGAGGACACTC	..(((((((((.(.(((((.(((((((.((((((((((((((.((((.......(((((...((........))...))))).......))))...........((((((........))))))...)))))))))))))).))))))).))))).)))))))))).....	2999585	2999715	TCTTGCTCAAATGAGTATTCCACAACCTCTGCTTGGAAAGAACAATTCTCACTGACGTTTCCCATTATTGGTTCTACCATTCTCCAGTGTTCCTTCACACATTGTAATGGGATACTCATTTAGGCAAGACG	(((((((.((((((((((((((.((((.......(((((...((........))...))))).......))))...........((((((........))))))...)))))))))))))).)))))))..	Csi-miRN856	2999695	2999715	GATACTCATTTAGGCAAGACG	Csi-miRN856*	2999585	2999605	TCTTGCTCAAATGAGTATTCC		3
Csi-MIRN859	PmiREN005058	MIRN859	Citrus sinensis	Csi-scaffold10399	1485	1582	-	GAATATGGGTTTGTGTGTCTGACCCTTTTGATGAGTACAGAATTGCGAAAGCAATCATTGAAGCTTTAGAAGGTTCTGCCACTAATTTAGTTGAACTA	..............(((.(.((.((((((((..(((.(((.(((((....)))))..)))..))))))))))).)).).))).....((((...))))	1505	1562	GACCCTTTTGATGAGTACAGAATTGCGAAAGCAATCATTGAAGCTTTAGAAGGTTCTG	((.((((((((..(((.(((.(((((....)))))..)))..))))))))))).))..	Csi-miRN859	1505	1525	TTGAAGCTTTAGAAGGTTCTG	Csi-miRN859*	1542	1562	GACCCTTTTGATGAGTACAGA		3
Csi-MIRN860	PmiREN005002	MIRN860	Citrus sinensis	Csi-scaffold00046	244476	244586	-	TAAAGAACCACTTTCACTCTTTTTGTTGCATGATGCTGATAATGAATGTAGGTCATTGATACTTTTCACTACCCGCATCATGCAACAAAAGAGTTGAAGTGGTTCGACGGA	....((((((((((.((((((((.((((((((((((.(.((.((((.(((.........)))..)))).)).).)))))))))))))))))))).))))))))))......	244496	244566	TTTTGTTGCATGATGCTGATAATGAATGTAGGTCATTGATACTTTTCACTACCCGCATCATGCAACAAAAG	(((.((((((((((((.(.((.((((.(((.........)))..)))).)).).)))))))))))))))..	Csi-miRN860	244545	244566	TTTTGTTGCATGATGCTGATAA	Csi-miRN860*	244496	244516	ACCCGCATCATGCAACAAAAG		3
Csi-MIRN861	PmiREN004990	MIRN861	Citrus sinensis	Csi-scaffold00008	1318056	1318225	-	AATATATGCTTTGAACATCCTGAGCTGTTTGGCTATTCTCGCTGTAAACTCTTGATATCCCAATTTGTATAATTTCTTATTTTTCACTACTTTAGTTGGAATTGGTGTTGGGGTATTAAGAGTTTACAATGAGATAGCCAACGGCTCATGTTGTTTTGAAGGCATATATA	.((((((((((((((((.(.(((((((((.((((((.((((.((((((((((((((((((((((.....(((((((.....................)))))))..)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).).)))))..))))))))))).	1318076	1318205	TGAGCTGTTTGGCTATTCTCGCTGTAAACTCTTGATATCCCAATTTGTATAATTTCTTATTTTTCACTACTTTAGTTGGAATTGGTGTTGGGGTATTAAGAGTTTACAATGAGATAGCCAACGGCTCATG	(((((((((.((((((.((((.((((((((((((((((((((((.....(((((((.....................)))))))..)))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))..	Csi-miRN861	1318184	1318205	TGAGCTGTTTGGCTATTCTCGC	Csi-miRN861*	1318076	1318096	TGAGATAGCCAACGGCTCATG		3
Csi-MIRN862	PmiREN004906	MIRN862	Citrus sinensis	Csi-scaffold00708	8735	8875	+	GAGATGAAGAGCTTTGCTTTGCTAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCATCATTAAGGGTTTTCAAAATCAAAAGAATGAGAATCCTTTTGTGGGTTATGTTTAGCAAGCATCCTGGGCTAATTGAGTGGCTCTTATCTTT	(((((((.(((((..((((...(((((.((((((.(((((..((((...((((.(((((((((((...((....)).)))))))))))..))))...))))...))))))))))).)))))...)))))))))))))))).	8755	8855	TAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCATCATTAAGGGTTTTCAAAATCAAAAGAATGAGAATCCTTTTGTGGGTTATGTTTAGCAAGCATCCTGGGCTAAT	(((((.((((((.(((((..((((...((((.(((((((((((...((....)).)))))))))))..))))...))))...))))))))))).)))))..	Csi-miRN862	8836	8855	AGCAAGCATCCTGGGCTAAT	Csi-miRN862*	8755	8775	TAGCCAAGGATGACTTGCCTA		3
Csi-MIRN863	PmiREN004889	MIRN863	Citrus sinensis	Csi-scaffold00124	407788	407984	-	TATGCCTATTCTTCCTTGTACTGTAGAAGGCTCCTGTGACCTCAAAGACGTCACCATGGAATGGAAGCATGCTGAAGGCTTATCCGATGGTTGGCATAGAAGGTGGCAAGTTACTTGTAATAGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAGGTCGCAGGAGCTTTCTACGGTTGGGGAAATTTTTCCATGCTG	...........(((((((.(((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((....((((.........)))).))).))))(((.(((.....))).)))((..(((((.....)))))..))..........)))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))..............	407808	407964	CTGTAGAAGGCTCCTGTGACCTCAAAGACGTCACCATGGAATGGAAGCATGCTGAAGGCTTATCCGATGGTTGGCATAGAAGGTGGCAAGTTACTTGTAATAGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAGGTCGCAGGAGCTTTCTACGGTT	((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((....((((.........)))).))).))))(((.(((.....))).)))((..(((((.....)))))..))..........)))))))))..))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN863	407808	407828	TCGCAGGAGCTTTCTACGGTT	Csi-miRN863*	407944	407964	CTGTAGAAGGCTCCTGTGACC		3
Csi-MIRN864a	PmiREN004912	MIRN864	Citrus sinensis	Csi-scaffold00124	390407	390496	+	CTTTTTCTTGCTCAAGGTCTTCTTCCACCAAAGCATTCATTTCCTCAAATAAGTTCAGATTCTGTGGCAATATGACAACGAAGGCCAGTA	...............(((((((((((((...((.(((.((((........))))...))).)))))).)).........)))))))....	390427	390476	TTCCACCAAAGCATTCATTTCCTCAAATAAGTTCAGATTCTGTGGCAATA	((((((...((.(((.((((........))))...))).)))))).))..	Csi-miRN864a	390427	390448	TTCCACCAAAGCATTCATTTCC	Csi-miRN864a*	390456	390476	AGTTCAGATTCTGTGGCAATA		3
Csi-MIRN864b	PmiREN004952	MIRN864	Citrus sinensis	Csi-scaffold00718	62258	62467	+	ACCACTCGAGTTCGAACAGAAAATGAATTGTTTGTTGGAATTTGATTGACACTGAAAGTAGTGATTAGTTTGGTTAGTTATCTGACAAGCCAATCAGACCATATTTGCAAAATTAGAGATTTTCTTCATCTCTCTTTCATGTTGGTCTTTTTCTTGCTCAAGGTCTTCTTCCACCAAAGCATTCATTTCCTCAAAGAACTTCAGATTCTG	.......((((((....((.((((((((..((((.(((((...((..(((.((...(((((.((((.(((((.((((....))))))))).))))((((((....((.(((...((((((.......)))))).)))))...)))))).....)))))..))))).))))))).))))..)))))))).))....)))))).........	62278	62447	AAATGAATTGTTTGTTGGAATTTGATTGACACTGAAAGTAGTGATTAGTTTGGTTAGTTATCTGACAAGCCAATCAGACCATATTTGCAAAATTAGAGATTTTCTTCATCTCTCTTTCATGTTGGTCTTTTTCTTGCTCAAGGTCTTCTTCCACCAAAGCATTCATTTCC	((((((((..((((.(((((...((..(((.((...(((((.((((.(((((.((((....))))))))).))))((((((....((.(((...((((((.......)))))).)))))...)))))).....)))))..))))).))))))).))))..))))))))..	Csi-miRN864b	62426	62447	TTCCACCAAAGCATTCATTTCC	Csi-miRN864b*	62278	62298	AAATGAATTGTTTGTTGGAAT		3
Csi-MIRN867	PmiREN005060	MIRN867	Citrus sinensis	Csi-scaffold00055	333838	334045	-	TGGAGAGGCTCCGAGTTGTTCAGAGGGGTAGTGATGTGCTGGAGGAGAGCAGGTTAGAGAGAGCGGGGCTAATTGACAAAGGTTTTCCATCTACTTCTGGTGGTGACTCATGTATGATTTTGGGAGTTGAAGGGTACCCTATTATTATCTATGTTACTAGGGTACCTCGCCATCACCATGTCTTTTATTAACCTTCGTTGTTTTCTAT	.....((((..(((((((...(((((.((.((((((.((.((((((((((..(((((....(((...)))..)))))....))))))).)))(((((((((.(((.(....)))).)))..))))))....((((((((((.((..........)).)))))))))).)))))))).)).)))))...))))..)))..)))).....	333858	334025	CAGAGGGGTAGTGATGTGCTGGAGGAGAGCAGGTTAGAGAGAGCGGGGCTAATTGACAAAGGTTTTCCATCTACTTCTGGTGGTGACTCATGTATGATTTTGGGAGTTGAAGGGTACCCTATTATTATCTATGTTACTAGGGTACCTCGCCATCACCATGTCTTTTAT	.(((((.((.((((((.((.((((((((((..(((((....(((...)))..)))))....))))))).)))(((((((((.(((.(....)))).)))..))))))....((((((((((.((..........)).)))))))))).)))))))).)).)))))...	Csi-miRN867	334005	334025	CAGAGGGGTAGTGATGTGCTG	Csi-miRN867*	333858	333878	CGCCATCACCATGTCTTTTAT		3
Csi-MIRN869	PmiREN004958	MIRN869	Citrus sinensis	Csi-scaffold00059	292014	292170	+	AATATTGAATGGCAGCATAGGAGGAGTGGGTCGCATATGAATCATGTAATCAAAGAAGTCAATTGATTTGTTGGGAGTGATGTTACCTGATTTACAGCTTTCTTCAAGTAATTTGTCAAGTGAGGTTCGGTCTTTGACAGCGCCGTATTCAATTTCG	...((((((((((.((....(((((.((((((.(((.((((((((....((((..(((((....))))).))))..)))))(((((.(((.............))).)))))...))).))).)))))).)))))....)))))))..)))))....	292034	292150	GAGGAGTGGGTCGCATATGAATCATGTAATCAAAGAAGTCAATTGATTTGTTGGGAGTGATGTTACCTGATTTACAGCTTTCTTCAAGTAATTTGTCAAGTGAGGTTCGGTCTTTGA	(((((.((((((.(((.((((((((....((((..(((((....))))).))))..)))))(((((.(((.............))).)))))...))).))).)))))).)))))..	Csi-miRN869	292129	292150	TCAAGTGAGGTTCGGTCTTTGA	Csi-miRN869*	292034	292054	GAGGAGTGGGTCGCATATGAA		3
Csi-MIRN870	PmiREN005024	MIRN870	Citrus sinensis	Csi-scaffold00144	71450	71605	-	TAAGATTTTTACATAAATTTTGAGTCATGGATCTAATGCAATTCAATGTTTGGTATCCAAAGTCAAAAGTTGTATTTACCGATGTCAATTCATCCTCCATCTCGACCATTCAATTGAATTAGATCAATGGCTTATAATTTGTGTCAAAATTTTAAG	.((((((((.(((((((((.((((((((.((((((((.(((((.(((((((((...))))).......((((........((((......))))........)))))))).))))).)))))))).)))))))).))))))))).))))))))...	71470	71585	TGAGTCATGGATCTAATGCAATTCAATGTTTGGTATCCAAAGTCAAAAGTTGTATTTACCGATGTCAATTCATCCTCCATCTCGACCATTCAATTGAATTAGATCAATGGCTTATA	((((((((.((((((((.(((((.(((((((((...))))).......((((........((((......))))........)))))))).))))).)))))))).))))))))..	Csi-miRN870	71470	71490	GAATTAGATCAATGGCTTATA	Csi-miRN870*	71565	71585	TGAGTCATGGATCTAATGCAA		3
Csi-MIRN871	PmiREN004951	MIRN871	Citrus sinensis	Csi-scaffold00415	141719	141838	+	ATTCATTTAGACTTTGGTTATCTAAAGATAGGTAGATTTAGTTAATAGGATTATAACAACATCTATAACCATGTTAGCTAGTTCTATCTATCTTTTGAAATTCCATGTTTACTTGAATTT	(((((..(((((..(((...((.(((((((((((((.((((((((((((.(((((........))))))).)))))))))).))))))))))))).))....))).)))))..)))))..	141739	141818	TCTAAAGATAGGTAGATTTAGTTAATAGGATTATAACAACATCTATAACCATGTTAGCTAGTTCTATCTATCTTTTGAAA	((.(((((((((((((.((((((((((((.(((((........))))))).)))))))))).))))))))))))).))..	Csi-miRN871	141739	141759	TCTAAAGATAGGTAGATTTAG	Csi-miRN871*	141798	141818	AGTTCTATCTATCTTTTGAAA		3
Csi-MIRN874	PmiREN004901	MIRN874	Citrus sinensis	Csi-scaffold00269	176155	176280	+	GGGTGTACGGCATGGGCGGCATTGGGAAGACGACACTGGTGAAAGAAGTTGCAAGAAAAGTGAAGGAAGATCGACAAGCTCTTTGATCAGGTGGATTTTTCAGAGGTTTCCCAGAATCCAAACATA	..((((..((..((((.(((.((((((((.(.((.(((((.(((((..(((...((..............))..)))..))))).))))))).).))))))))..))).))))....))..)))).	176175	176260	ATTGGGAAGACGACACTGGTGAAAGAAGTTGCAAGAAAAGTGAAGGAAGATCGACAAGCTCTTTGATCAGGTGGATTTTTCAGAGG	.((((((((.(.((.(((((.(((((..(((...((..............))..)))..))))).))))))).).))))))))...	Csi-miRN874	176175	176195	ATTGGGAAGACGACACTGGTG	Csi-miRN874*	176240	176260	ATCAGGTGGATTTTTCAGAGG		3
Csi-MIRN875a	PmiREN004890	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold00435	103405	103529	+	TACAGTGCAACTGTGGTACTATGCCACAGTTGCATCCAGCCGTTGGATCCACTTGGATGGGTAGGGTCCATTGAGAAACAATGGCTGAATGCAACTGTGGCACGGTACCACAGTTTTCCCCTATT	........((((((((((((.((((((((((((((.(((((((((..((((..(((((.......))))).)).))..))))))))).)))))))))))))).))))))))))))..........	103425	103509	ATGCCACAGTTGCATCCAGCCGTTGGATCCACTTGGATGGGTAGGGTCCATTGAGAAACAATGGCTGAATGCAACTGTGGCACGG	.((((((((((((((.(((((((((..((((..(((((.......))))).)).))..))))))))).))))))))))))))...	Csi-miRN875a	103489	103509	CTGAATGCAACTGTGGCACGG	Csi-miRN875a*	103425	103445	ATGCCACAGTTGCATCCAGCC		3
Csi-MIRN875b	PmiREN004894	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold04664	3923	4046	+	TGTGGTGCAACTGTGGTACCATATCACAGTTGCATCCAACCATTGAATGTCAGTGGACCCCAGCAATTCAAGTGCATCAACGGCTGAATGCAACTGTGGCACGGTACCACAGTTGCACCGTAGC	((((((((((((((((((((...((((((((((((.((.((.((((.(((...((((.........))))...))))))).)).)).))))))))))))...))))))))))))))))))))..	3943	4026	ATATCACAGTTGCATCCAACCATTGAATGTCAGTGGACCCCAGCAATTCAAGTGCATCAACGGCTGAATGCAACTGTGGCACGG	...((((((((((((.((.((.((((.(((...((((.........))))...))))))).)).)).)))))))))))).....	Csi-miRN875b	4006	4026	CTGAATGCAACTGTGGCACGG	Csi-miRN875b*	3943	3963	ATATCACAGTTGCATCCAACC		3
Csi-MIRN875c	PmiREN004950	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold00389	86404	86522	-	ATGTGGTGCAACTGTGGTACCGTGCCATAGTTGCATCCAGCCTCAGTGGACCCCATTAATCCAAGTGCATCCAACGGGTGGATGTAACTGTGGCACGGTACAACAGTTGCACTGTAGCC	....(((((((((((.(((((((((((((((((((((((.((....((((...((((......))))..))))..)).))))))))))))))))))))))).)))))))))))......	86424	86502	CGTGCCATAGTTGCATCCAGCCTCAGTGGACCCCATTAATCCAAGTGCATCCAACGGGTGGATGTAACTGTGGCACGGT	(((((((((((((((((((.((....((((...((((......))))..))))..)).)))))))))))))))))))..	Csi-miRN875c	86424	86444	TGGATGTAACTGTGGCACGGT	Csi-miRN875c*	86482	86502	CGTGCCATAGTTGCATCCAGC		3
Csi-MIRN875d	PmiREN004966	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold00337	108007	108131	+	TACGGTGCAACTGTGGTACCGTATCACAGTTGCATCCAGCCATTGAATGCACTTAGATTAATGAAATTCACTGACATCCAACGGCTGGAGACAACTGTGGTACGGTACCATAGTTGCACCACAGG	...(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((.(((.(((((....((((.....))))...)).))).))).)))))))..))))))))))))))))))))))))))))).....	108027	108111	GTATCACAGTTGCATCCAGCCATTGAATGCACTTAGATTAATGAAATTCACTGACATCCAACGGCTGGAGACAACTGTGGTACGG	((((((((((((..(((((((.(((.(((((....((((.....))))...)).))).))).)))))))..))))))))))))..	Csi-miRN875d	108091	108111	CTGGAGACAACTGTGGTACGG	Csi-miRN875d*	108027	108047	GTATCACAGTTGCATCCAGCC		3
Csi-MIRN875e	PmiREN005026	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold00235	155036	155149	+	TGTGATACAACTGTAATACCGTACCATAATTACATTCAGCCGTTGAATGTGTTAGTCCACTGACATCCAATGACTGGATGCAATTGTGGCACGGTACCACAGTTACACCGTAGC	........((((((..((((((.((((((((.(((((((.(((((...(((((((....))))))).))))).))))))).)))))))).))))))..))))))..........	155056	155129	GTACCATAATTACATTCAGCCGTTGAATGTGTTAGTCCACTGACATCCAATGACTGGATGCAATTGTGGCACGG	((.((((((((.(((((((.(((((...(((((((....))))))).))))).))))))).)))))))).))..	Csi-miRN875e	155109	155129	CTGGATGCAATTGTGGCACGG	Csi-miRN875e*	155056	155076	GTACCATAATTACATTCAGCC		3
Csi-MIRN875f	PmiREN005039	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold08287	799	921	+	ACGGTGCAACTGTGGTACCGTGCCACAGTTGCATCCAGTCGTTGGATCCACTTAAATGAGTAGGGTTCATTGAGATCCAACAGCTGAATGCAACTGTGGCACGTTAACACAGTTGCACAACAG	...(((((((((((.((.((((((((((((((((.((((.((((((((((.....(((((.....))))))).)))))))).)))).)))))))))))))))).)).))))))))))).....	819	901	TGCCACAGTTGCATCCAGTCGTTGGATCCACTTAAATGAGTAGGGTTCATTGAGATCCAACAGCTGAATGCAACTGTGGCACG	((((((((((((((.((((.((((((((((.....(((((.....))))))).)))))))).)))).))))))))))))))..	Csi-miRN875f	881	901	GCTGAATGCAACTGTGGCACG	Csi-miRN875f*	819	839	TGCCACAGTTGCATCCAGTCG		3
Csi-MIRN875g	PmiREN005049	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold00064	95847	95971	+	TGTGGTGCAACTGCGGTACCGTGCCACAGTTGCATCCAACCGTTGGATCTACTTAAATGAGTGGAGTTCATTGAGATTCAACGGCTGGATGCAACTGTGGTACGGTACCGCAGTTGCACCATAAC	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(...((((((.....)))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	95867	95951	GTGCCACAGTTGCATCCAACCGTTGGATCTACTTAAATGAGTGGAGTTCATTGAGATTCAACGGCTGGATGCAACTGTGGTACGG	((((((((((((((((((.(((((((((((.(...((((((.....)))))))))))))))))).))))))))))))))))))..	Csi-miRN875g	95931	95951	CTGGATGCAACTGTGGTACGG	Csi-miRN875g*	95867	95887	GTGCCACAGTTGCATCCAACC		3
Csi-MIRN875h	PmiREN005050	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold00087	327080	327204	-	TACGGTGCAATTGTGGTACCGTGCCACTGTTGCATCTAGCTGTTGGATGCACTTGAATGGCTAGGGTCTATGGACATTCAACGGCTGGATGCAACTGTGGTACGGTACCACAAGTTTTCCCTTAT	...........((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..(......(((....)))...)..))))))))))))))))))))).)))))))))))))))).............	327100	327184	GTGCCACTGTTGCATCTAGCTGTTGGATGCACTTGAATGGCTAGGGTCTATGGACATTCAACGGCTGGATGCAACTGTGGTACGG	(((((((.(((((((((((((((((((((..(......(((....)))...)..))))))))))))))))))))).)))))))..	Csi-miRN875h	327100	327120	CTGGATGCAACTGTGGTACGG	Csi-miRN875h*	327164	327184	GTGCCACTGTTGCATCTAGCT		3
Csi-MIRN875i	PmiREN005051	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold00158	268480	268620	+	TACGGTGCAACTGTGGTACCATGCCACAATTGCATCCAGCCGTTGGATCCATTTAAATGGGTGGGATTCATTAAAATCCAACAGCTGGATGGCTGGATGCCTGGATGCAACTGTGGTACGGTACCACAGTTGCACCACAAT	...(((((((((((((((((.(((((((.((((((((((.((((..((((((....)))))).(((((......)))))..(((((....))))))))).)))))))))).))))))).))))))))))))))))).....	268500	268600	ATGCCACAATTGCATCCAGCCGTTGGATCCATTTAAATGGGTGGGATTCATTAAAATCCAACAGCTGGATGGCTGGATGCCTGGATGCAACTGTGGTACGG	.(((((((.((((((((((.((((..((((((....)))))).(((((......)))))..(((((....))))))))).)))))))))).)))))))...	Csi-miRN875i	268580	268600	CTGGATGCAACTGTGGTACGG	Csi-miRN875i*	268500	268520	ATGCCACAATTGCATCCAGCC		3
Csi-MIRN875j	PmiREN005054	MIRN875	Citrus sinensis	Csi-scaffold00604	6984	7108	-	TGTGATGTAACTGTGGTACCGTGTCACAGTTGCATTCAACCGTTGGATGTTAATGAACCCCACCAATTTAAGCGCATCTAACGGCTGGATGCAACTGTGGTACGGTACCACAATTATACCGTAGC	...(.(((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((...((((.........))))...))))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))).).....	7004	7088	GTGTCACAGTTGCATTCAACCGTTGGATGTTAATGAACCCCACCAATTTAAGCGCATCTAACGGCTGGATGCAACTGTGGTACGG	((((((((((((((((((.(((((((((((...((((.........))))...))))))))))).))))))))))))))))))..	Csi-miRN875j	7004	7024	CTGGATGCAACTGTGGTACGG	Csi-miRN875j*	7068	7088	GTGTCACAGTTGCATTCAACC		3
Csi-MIRN876a	PmiREN004957	MIRN876	Citrus sinensis	Csi-scaffold00030	852767	852884	+	CCCTATGTTATATTGAATGTACCATACATAACCCACAAGAACCACATAAATTATGGGACCCATATAATTGTGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTACATTCAATGTAACACAGCAAA	..((.((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((...)))))...))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))).))....	852787	852864	ACCATACATAACCCACAAGAACCACATAAATTATGGGACCCATATAATTGTGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	(((((((((((((.(((((((((((((((..(((((...)))))...))))))))))))))).)))))))))))))..	Csi-miRN876a	852844	852864	CTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	Csi-miRN876a*	852787	852807	ACCATACATAACCCACAAGAA		3
Csi-MIRN876b	PmiREN004961	MIRN876	Citrus sinensis	Csi-scaffold00051	222655	222773	-	TGCTATGTTACATTGAATGTACCATACACAACTAACAAGAACCACACAATTATGTGGGTCCCACTAATTTATGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTACATTCAATGTAACATAGAGGC	..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.((((...)))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....	222675	222753	ACCATACACAACTAACAAGAACCACACAATTATGTGGGTCCCACTAATTTATGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	((((((((((((((((((((((((((.(((((.((((...)))))))))..))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN876b	222675	222695	CTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	Csi-miRN876b*	222733	222753	ACCATACACAACTAACAAGAA		3
Csi-MIRN876c	PmiREN004969	MIRN876	Citrus sinensis	Csi-scaffold00565	35912	36029	+	TGCTATGTTACATTGAATGTACCATACACAACTAACAAGAACCACACAATTATGTGGGTCCCACAATTTATGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTACATTCAATGTAACATAAAGGC	.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......(((((...))))).....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...)))	35932	36009	ACCATACACAACTAACAAGAACCACACAATTATGTGGGTCCCACAATTTATGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	((((((((((((((((((((((((((......(((((...))))).....))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN876c	35989	36009	CTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	Csi-miRN876c*	35932	35952	ACCATACACAACTAACAAGAA		3
Csi-MIRN876d	PmiREN004973	MIRN876	Citrus sinensis	Csi-scaffold00913	11370	11487	-	TGCTATGTTACATTGAATGTACCATACACAACTAACAAAAACCACACAATTATGTGGGTCCCACAATTTATGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTACATTCAATGTAACATAGAGGC	..((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((......(((((...))))).....))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))....	11390	11467	ACCATACACAACTAACAAAAACCACACAATTATGTGGGTCCCACAATTTATGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	((((((((((((((((((.(((((((......(((((...))))).....))))))).))))))))))))))))))..	Csi-miRN876d	11390	11410	CTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	Csi-miRN876d*	11447	11467	ACCATACACAACTAACAAAAA		3
Csi-MIRN876e	PmiREN004978	MIRN876	Citrus sinensis	Csi-scaffold08407	1689	1806	-	CCCTATGTTACATTGAATGTACCATACACAACCCACAAGAACTACACAAATTATGGGACCCATATAATTGTGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTACATTTAATGTAACATAGCAAA	..(((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((...)))))...))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))....	1709	1786	ACCATACACAACCCACAAGAACTACACAAATTATGGGACCCATATAATTGTGTGGTTCTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	(((((((((((((.(((((((((((((((..(((((...)))))...))))))))))))))).)))))))))))))..	Csi-miRN876e	1709	1729	CTTGTTGGTTGTGTATGGTAC	Csi-miRN876e*	1766	1786	ACCATACACAACCCACAAGAA		3
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Csi-MIRN879	PmiREN004897	MIRN879	Citrus sinensis	Csi-scaffold09523	450	585	-	TGCTGCGGAGACTTAACTTCTTCTAAACTCTCTCCCTCATGGGCATTTCTGTACTTTGTTAGAACCTGAGTTCAAAGAAGATGATAGGATAGCCCATGAGGGAAGAGCTTAGAAGGAGTTGGGTTCTCTCCGTCGA	....((((((((((((((((((((((.((((.((((((((((((..((((((.((((....((((....))))...))))...))))))..)))))))))))))))).)))))))))))))))...)))))))...	470	565	TTCTAAACTCTCTCCCTCATGGGCATTTCTGTACTTTGTTAGAACCTGAGTTCAAAGAAGATGATAGGATAGCCCATGAGGGAAGAGCTTAGAAGG	((((((.((((.((((((((((((..((((((.((((....((((....))))...))))...))))))..)))))))))))))))).))))))..	Csi-miRN879	470	489	TGAGGGAAGAGCTTAGAAGG	Csi-miRN879*	545	565	TTCTAAACTCTCTCCCTCATG		3
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Csi-MIRN885	PmiREN004884	MIRN885	Citrus sinensis	Csi-scaffold00006	1480517	1480642	-	TTGATAAAATATTTCTTAAATTGTTTATACTTTGTTTTTGCATCACCAAATGTTAAAGAGGTGTTTGCCAACTTTAATTTGTGCGAGAAGAGAGTTCATAGCGATTGTATGTTGGTGGGACAGACA	..................(((((((...(((((.(((((((((........(((((((.(((....)))..)))))))..))))))))).)))))....)))))))....................	1480537	1480622	TTGTTTATACTTTGTTTTTGCATCACCAAATGTTAAAGAGGTGTTTGCCAACTTTAATTTGTGCGAGAAGAGAGTTCATAGCGATT	(((((...(((((.(((((((((........(((((((.(((....)))..)))))))..))))))))).)))))....)))))..	Csi-miRN885	1480537	1480557	AGAAGAGAGTTCATAGCGATT	Csi-miRN885*	1480602	1480622	TTGTTTATACTTTGTTTTTGC		3
Csi-MIRN886	PmiREN004885	MIRN886	Citrus sinensis	Csi-scaffold00136	226242	226344	+	TTTGAGGTTGTTGAACTATGTCAATGGTTATGGCACTAAGATGGGCTTAAGTTGGGCAATCCTTTGTGCCATAGCCATTGACACAGTGATCTACAATCTCCTG	...((((((((.(((((.((((((((((((((((((.(((....(((((...)))))....))).)))))))))))))))))).)))..)).))))))))...	226262	226324	TCAATGGTTATGGCACTAAGATGGGCTTAAGTTGGGCAATCCTTTGTGCCATAGCCATTGACA	((((((((((((((((.(((....(((((...)))))....))).))))))))))))))))..	Csi-miRN886	226304	226324	TTTGTGCCATAGCCATTGACA	Csi-miRN886*	226262	226282	TCAATGGTTATGGCACTAAGA		3
Csi-MIRN887a	PmiREN004886	MIRN887	Citrus sinensis	Csi-scaffold00027	775669	775827	-	TCTTATATAAATTTATTTTGTACAAACTGACGTGGCATGATAAAATTGGTTGAATTAAATATCTCTTGGTCCACAGATTTATTTTTATTATTTTATATTTTCATTCAACCAATGAATTAATGCCAAATTAATTTGTACAAGATAAATTTGTACAAGAGT	((((.(((((((((((((((((((((.(((..((((((......(((((((((((.((((((....((((....(((......)))))))....))))))..)))))))))))......))))))..))).))))))))))))))))))))).))))..	775689	775807	TACAAACTGACGTGGCATGATAAAATTGGTTGAATTAAATATCTCTTGGTCCACAGATTTATTTTTATTATTTTATATTTTCATTCAACCAATGAATTAATGCCAAATTAATTTGTACA	((((((.(((..((((((......(((((((((((.((((((....((((....(((......)))))))....))))))..)))))))))))......))))))..))).))))))..	Csi-miRN887a	775787	775807	TACAAACTGACGTGGCATGAT	Csi-miRN887a*	775689	775709	AATGCCAAATTAATTTGTACA		3
Csi-MIRN887b	PmiREN004891	MIRN887	Citrus sinensis	Csi-scaffold00764	69594	69753	-	TCTTGTATAAACTTATTTTGTACAAACTGACGTGGCATGATAGGATTGGTTGAATTCAATATCACTTGGCCCACATGATTTGTTTTTATTATTTTATATTTTCATTCAACCAATGAATTAATACCACGTCAGTTTGTACAAAATAAATTTGTACAAGAGT	(((((((((((.(((((((((((((((((((((((.((......(((((((((((..(((((..........(((.....)))............)))))...)))))))))))......)).))))))))))))))))))))))).)))))))))))..	69614	69733	TACAAACTGACGTGGCATGATAGGATTGGTTGAATTCAATATCACTTGGCCCACATGATTTGTTTTTATTATTTTATATTTTCATTCAACCAATGAATTAATACCACGTCAGTTTGTACA	(((((((((((((((.((......(((((((((((..(((((..........(((.....)))............)))))...)))))))))))......)).)))))))))))))))..	Csi-miRN887b	69713	69733	TACAAACTGACGTGGCATGAT	Csi-miRN887b*	69614	69634	AATACCACGTCAGTTTGTACA		3
Csi-MIRN887c	PmiREN004898	MIRN887	Citrus sinensis	Csi-scaffold10326	774	933	-	GATATAGTCACTAACTCTTGTACAAACTGACGTGGCATGATAAAATTGGTTGAATTAAATATCTCTTGACCCACATGATTTATTTCTATTATTTTATATTTTCATACAACCAAATAATTACTACCACATCAGTTTGTACAAGAGTTTATGACTGTATCAT	((((((((((..((((((((((((((((((.((((..((((....((((((((((.(((((..((.((.....)).))..)))))..)))................)))))))...))))...)))).))))))))))))))))))..))))))))))..	794	913	TACAAACTGACGTGGCATGATAAAATTGGTTGAATTAAATATCTCTTGACCCACATGATTTATTTCTATTATTTTATATTTTCATACAACCAAATAATTACTACCACATCAGTTTGTACA	((((((((((.((((..((((....((((((((((.(((((..((.((.....)).))..)))))..)))................)))))))...))))...)))).))))))))))..	Csi-miRN887c	893	913	TACAAACTGACGTGGCATGAT	Csi-miRN887c*	794	814	ACTACCACATCAGTTTGTACA		3
Csi-MIRN887d	PmiREN004992	MIRN887	Citrus sinensis	Csi-scaffold00164	188119	188278	+	TTTTGTACAAATTTATTTTGTACAAACTGACGTGGCATGATTTCATTGGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAACAAATCATGTGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATAATGCTACATCAATTTGTACAAAATAAGTTTGTACAAGAAT	((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((......(((((((((((..((((((............(((.....)))..........)))))).)))))))))))......))))))).))).))))))))))))))))))))))))))..	188139	188258	TACAAACTGACGTGGCATGATTTCATTGGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAACAAATCATGTGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATAATGCTACATCAATTTGTACA	((((((.(((.(((((((......(((((((((((..((((((............(((.....)))..........)))))).)))))))))))......))))))).))).))))))..	Csi-miRN887d	188139	188159	TACAAACTGACGTGGCATGAT	Csi-miRN887d*	188238	188258	AATGCTACATCAATTTGTACA		3
Csi-MIRN888	PmiREN004887	MIRN888	Citrus sinensis	Csi-scaffold00088	292164	292312	-	AAAAGTGAAACCCGCAAGCCTTTGAACTCCTCGAAGCCTGCAAAAATGGAGCAAACCGAGGTTAGAGGTGGAGCTGGCGGTGGCTGACGATTTTTCCTCCATTTTTGCTGGCTTCGAGGAGTTCAAAGGCTCATGGGTTTTCCTTTTGT	(((((.((((((((..((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((.....(((((.(.((.......)).)..)))))....))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))..)))))))).)))))..	292184	292292	TTTGAACTCCTCGAAGCCTGCAAAAATGGAGCAAACCGAGGTTAGAGGTGGAGCTGGCGGTGGCTGACGATTTTTCCTCCATTTTTGCTGGCTTCGAGGAGTTCAAAGG	((((((((((((((((((.((((((((((((.(((.....(((((.(.((.......)).)..)))))....))).)))))))))))).))))))))))))))))))..	Csi-miRN888	292272	292292	TTTGAACTCCTCGAAGCCTGC	Csi-miRN888*	292184	292204	TGGCTTCGAGGAGTTCAAAGG		3
Csi-MIRN889	PmiREN004892	MIRN889	Citrus sinensis	Csi-scaffold02936	7869	8053	+	TAATACGCTCTTACAAAGTTTTGACCTCTCGAGCAAGCTGATCCTCGCGAGACTGACGGCTTTGGAGCTCACCCCTTAACTTGTCAACCTCTGACTGGGCGGCAACAAGGGAGTCGAGGTCCGGAAGGCAGTGGCTGAGGAGAAAAGATGCTTGCGGGGTCATAAAAGACATGTTAAATATATGT	.....................(((((((.((((((..((..((((((.(..((((.(...((((((.((((((((((...(((((..((.......))..))))).))))).)).))).))))))..)))))..)))))))....)).)))))).)))))))......((((((.....))))))	7889	8033	TTGACCTCTCGAGCAAGCTGATCCTCGCGAGACTGACGGCTTTGGAGCTCACCCCTTAACTTGTCAACCTCTGACTGGGCGGCAACAAGGGAGTCGAGGTCCGGAAGGCAGTGGCTGAGGAGAAAAGATGCTTGCGGGGTCATAA	.(((((((.((((((..((..((((((.(..((((.(...((((((.((((((((((...(((((..((.......))..))))).))))).)).))).))))))..)))))..)))))))....)).)))))).)))))))...	Csi-miRN889	7889	7909	TTGACCTCTCGAGCAAGCTGA	Csi-miRN889*	8013	8033	AAGATGCTTGCGGGGTCATAA		3
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Csi-MIRN891	PmiREN004895	MIRN891	Citrus sinensis	Csi-scaffold06275	1905	2128	-	CTACGCGTTACAGTGAATATGGGGGCTGATCAAGCGTATCAACTGAAAGAGTTGTCAAATGATGATTGTTTGTGTCTGCTCACTCAAATCTCCCTGGGGACTGGGGATTTCAACATTCATCCATCCTTGAAGGAAGTTGGAGAGAAGATAGTGATGAAGTGCAAAGGATTGCCTTTAGCTGCAAAAACTCTTGGCGGCCTTTTACGGGGCAAACATGACCCGAG	...(((......))).....((((((((.(((((.((..(((((.....))))).........((((....(((......)))...)))).((((((...))))))((((((.(((((.((((((((...))))...))))..)).....))).))))))(((((((....))))).)).......)).)))))))))))))..((((.((....)).))))..	1925	2108	GGGGGCTGATCAAGCGTATCAACTGAAAGAGTTGTCAAATGATGATTGTTTGTGTCTGCTCACTCAAATCTCCCTGGGGACTGGGGATTTCAACATTCATCCATCCTTGAAGGAAGTTGGAGAGAAGATAGTGATGAAGTGCAAAGGATTGCCTTTAGCTGCAAAAACTCTTGGCGGCCTTTTA	((((((((.(((((.((..(((((.....))))).........((((....(((......)))...)))).((((((...))))))((((((.(((((.((((((((...))))...))))..)).....))).))))))(((((((....))))).)).......)).)))))))))))))..	Csi-miRN891	1925	1945	AAAACTCTTGGCGGCCTTTTA	Csi-miRN891*	2088	2108	GGGGGCTGATCAAGCGTATCA		3
Csi-MIRN892	PmiREN004900	MIRN892	Citrus sinensis	Csi-scaffold00047	51637	51852	-	CTCATGTGCGGCCAAAAGTACGAGGCTTGGACTAGTGCGGTGGTGCGCTCGATTCCTGGGTGACAGCCCACTTGGAGTCGTGGCACTCCTTGATGACTTACTTCGGTAAATTTCCCCACCTTGGCACGAACAGCCGATCTCCCTTGGTGAGGATGATGCATTCATCTTCCCAAAATCGCCTTGTCTTGCCTTCGAGCACCTTTTCCAGCAAGTCAT	.................((.((((((..((((.((.((((((((((.(.((((((((((((....)))))...))))))).))))))..........((((....))))...........(((((.......)))))......((((.((((((((.....)))))))))))).))))))).)))).))).))).))...................	51657	51832	CGAGGCTTGGACTAGTGCGGTGGTGCGCTCGATTCCTGGGTGACAGCCCACTTGGAGTCGTGGCACTCCTTGATGACTTACTTCGGTAAATTTCCCCACCTTGGCACGAACAGCCGATCTCCCTTGGTGAGGATGATGCATTCATCTTCCCAAAATCGCCTTGTCTTGCCTTCGAG	((((((..((((.((.((((((((((.(.((((((((((((....)))))...))))))).))))))..........((((....))))...........(((((.......)))))......((((.((((((((.....)))))))))))).))))))).)))).))).)))..	Csi-miRN892	51811	51832	CGAGGCTTGGACTAGTGCGGTG	Csi-miRN892*	51657	51677	TCGCCTTGTCTTGCCTTCGAG		3
Csi-MIRN893a	PmiREN004902	MIRN893	Citrus sinensis	Csi-scaffold00718	62023	62226	+	TGGGTGAAATCCTTTGGGGAAGTGGATGCTTGGTGGAAGAAGATCTCTAACTAATCAAATTGGTCTTGTGGGCTTGTAAGTTTTAACTAACCAAATTAATCGCTACTTTCAATCTCGGTCAAATTTCGGTAAGGGCTTTTATATTTCTATTAACATACACCAATTTCAACAAGCAATGTACTATATCCCCAGAGTTTTGTCGGA	...........(((((((((((((.(((((((.(((((.((((((................))))))(((((..((((((......((.((((((((.((((.............))))..))))).))).))....))))))..))))).............))))).))))).)).))))...)))))))))..........	62043	62206	AGTGGATGCTTGGTGGAAGAAGATCTCTAACTAATCAAATTGGTCTTGTGGGCTTGTAAGTTTTAACTAACCAAATTAATCGCTACTTTCAATCTCGGTCAAATTTCGGTAAGGGCTTTTATATTTCTATTAACATACACCAATTTCAACAAGCAATGTACTAT	((((.(((((((.(((((.((((((................))))))(((((..((((((......((.((((((((.((((.............))))..))))).))).))....))))))..))))).............))))).))))).)).))))..	Csi-miRN893a	62043	62063	AGTGGATGCTTGGTGGAAGAA	Csi-miRN893a*	62186	62206	TTTCAACAAGCAATGTACTAT		3
Csi-MIRN893b	PmiREN004919	MIRN893	Citrus sinensis	Csi-scaffold00124	390056	390227	+	CTGCCTTGAAATCCTTTGGGGAAGTGGATGCTTGGTGGAAGAAGATCTCTAACCAATCAAATTTGATTAATCACTACTTTCAATCTCGGTCGGATTTCAACAAGAACTTTTTTATTTCTGTTTACATACACAATTTCAACAAGCAATGTACTATATCCCCAGAGTTTTGTCG	......(((((..(((((((((((((.(((((((.(((((...((..(((.((((((((....)))))...................))).)))..))((((.(((.........)))))))...........))))).))))).)).))))...)))))))))..)).)))	390076	390207	AGTGGATGCTTGGTGGAAGAAGATCTCTAACCAATCAAATTTGATTAATCACTACTTTCAATCTCGGTCGGATTTCAACAAGAACTTTTTTATTTCTGTTTACATACACAATTTCAACAAGCAATGTACTAT	((((.(((((((.(((((...((..(((.((((((((....)))))...................))).)))..))((((.(((.........)))))))...........))))).))))).)).))))..	Csi-miRN893b	390076	390096	AGTGGATGCTTGGTGGAAGAA	Csi-miRN893b*	390187	390207	TTTCAACAAGCAATGTACTAT		3
Csi-MIRN894a	PmiREN004904	MIRN894	Citrus sinensis	Csi-scaffold01198	33223	33355	-	TTACAGCCTTGATGGTGCCTCCGTGTTGCGTTACCTTGAGGCCTAGACACTTAGCCTCTTCTTCGGAGATGAAGTTGTGTGTTGCTCCGGTGTCAAGGAGCGCACGAACGGTTTGGCCATTGATGAGCACACT	.....(((((((((((....((((..((((((.((((((.(((..(((((.((((.((.(((....))).)).)))).))))).....))).))))))))))))...))))....)))))))).).)).....	33243	33335	CCGTGTTGCGTTACCTTGAGGCCTAGACACTTAGCCTCTTCTTCGGAGATGAAGTTGTGTGTTGCTCCGGTGTCAAGGAGCGCACGAACGGTT	((((..((((((.((((((.(((..(((((.((((.((.(((....))).)).)))).))))).....))).))))))))))))...))))..	Csi-miRN894a	33243	33263	TCAAGGAGCGCACGAACGGTT	Csi-miRN894a*	33315	33335	CCGTGTTGCGTTACCTTGAGG		3
Csi-MIRN894b	PmiREN004910	MIRN894	Citrus sinensis	Csi-scaffold08677	923	1055	+	TTACAGCCTTAATGGTGCCTCCGTGTTGCGTTACCTTGAGGCCTAGACATTTAGCCTCTTTTTCGGAGATAAAGTTGTGTGTTGCTCCGGTGTCAAGGAGCGCACGAACGGTTTGGCTATTGATGAGCACACT	........((((((((....((((..((((((.((((((.(((..(((((.((((((((.....)))).....)))).))))).....))).))))))))))))...))))....))))))))..........	943	1035	CCGTGTTGCGTTACCTTGAGGCCTAGACATTTAGCCTCTTTTTCGGAGATAAAGTTGTGTGTTGCTCCGGTGTCAAGGAGCGCACGAACGGTT	((((..((((((.((((((.(((..(((((.((((((((.....)))).....)))).))))).....))).))))))))))))...))))..	Csi-miRN894b	1015	1035	TCAAGGAGCGCACGAACGGTT	Csi-miRN894b*	943	963	CCGTGTTGCGTTACCTTGAGG		3
Csi-MIRN895	PmiREN004905	MIRN895	Citrus sinensis	Csi-scaffold01508	877	960	+	CTTCATTGAGCAATTGACTGAAGAGGAATGTTGGTTGTTGTTCTAGCAGTTAGCATTTTCCGGTCGCTCTTTCGAGGATTGTGA	(((((..((((....(((((..(((.((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))..).)))).......	897	940	AAGAGGAATGTTGGTTGTTGTTCTAGCAGTTAGCATTTTCCGGT	..(((.((((((((((((((...)))))))))))))))))....	Csi-miRN895	897	917	AAGAGGAATGTTGGTTGTTGT	Csi-miRN895*	920	940	TAGCAGTTAGCATTTTCCGGT		3
Csi-MIRN896a	PmiREN004907	MIRN896	Citrus sinensis	Csi-scaffold02015	142	371	-	GAAGATCTCCGTCCAAAAACGCCCAGTGAACCGAGGGTCTCGGTCGCTCATAATGCTCTTCAGAACTCCCCAAAGCTTCACAATGTGCTTGACGAATAGGCGGGCGGCCTCGTCCGCTTTGCAATCGACCGGTGCGGCAATGAATGTGGCGTACTTGCTGTATCGGTCGACAACGACCATGATGCTTCCGCAACCTTCGGACTTGGGCAGCGATGTAATGAAGTCCATAG	...(((....))).......(((((((...((((((((..(((..((((((.....................((((..........)))).......(((((((((....))))))))).....((((((((((((((((.(.(((...))).)))))))))))))))))........)))).))..)))..)))))))))).)))))......................	162	351	GCCCAGTGAACCGAGGGTCTCGGTCGCTCATAATGCTCTTCAGAACTCCCCAAAGCTTCACAATGTGCTTGACGAATAGGCGGGCGGCCTCGTCCGCTTTGCAATCGACCGGTGCGGCAATGAATGTGGCGTACTTGCTGTATCGGTCGACAACGACCATGATGCTTCCGCAACCTTCGGACTTGGGCAG	(((((((...((((((((..(((..((((((.....................((((..........)))).......(((((((((....))))))))).....((((((((((((((((.(.(((...))).)))))))))))))))))........)))).))..)))..)))))))))).)))))..	Csi-miRN896a	162	183	CGCAACCTTCGGACTTGGGCAG	Csi-miRN896a*	331	351	GCCCAGTGAACCGAGGGTCTC		3
Csi-MIRN896b	PmiREN005027	MIRN896	Citrus sinensis	Csi-scaffold00247	61373	61602	-	GAAGAGCTCCGTCCAAAAACGCCCAGTGAACCGAGGGTCTCGGTTGCTCACAATGCTCCTTGGAACTTCCCAAAGCTTCACAATGTGCTTGACGAATAGGCGGGCTGCCTCGTCCACTTTGCAATCGACTGGTGCGGCAATGAATGTGGCGTACTTGCTGTATCGGTCGACAACAACCATGATGCTTCCGCAACCTTCGGACTTGGGCAGCGATGTGATGAAGTCCATGG	...(.(((.((((((.....(((((((...((((((((..(((..(((((....(((..((((......)))))))....(((.(((...(((((...(((.....))))))))))).)))...((((((((((((((((.(.(((...))).))))))))))))))))).........))).))..)))..)))))))))).))))).....)).)))).))).)....	61393	61582	GCCCAGTGAACCGAGGGTCTCGGTTGCTCACAATGCTCCTTGGAACTTCCCAAAGCTTCACAATGTGCTTGACGAATAGGCGGGCTGCCTCGTCCACTTTGCAATCGACTGGTGCGGCAATGAATGTGGCGTACTTGCTGTATCGGTCGACAACAACCATGATGCTTCCGCAACCTTCGGACTTGGGCAG	(((((((...((((((((..(((..(((((....(((..((((......)))))))....(((.(((...(((((...(((.....))))))))))).)))...((((((((((((((((.(.(((...))).))))))))))))))))).........))).))..)))..)))))))))).)))))..	Csi-miRN896b	61393	61414	CGCAACCTTCGGACTTGGGCAG	Csi-miRN896b*	61562	61582	GCCCAGTGAACCGAGGGTCTC		3
Csi-MIRN896c	PmiREN005030	MIRN896	Citrus sinensis	Csi-scaffold00499	39152	39379	+	AAGAGCTCCGTCCAAAAATGCCCAGTGAACCGAGGGTCTCGGTCGCTCACAATGCTCTTTGGGACTCCCCAAAGCTTCACAATGTGCTTGATGAATAGGCGGGCTGCCTCATCCGCTTTGCAATCGACTAGTGCGGCGATGAATGTGGCATACTTGCTATAATGGTTGACAACGACCATGATGCTTCCGCAACCTTCGGACTTGGGCAACGATGTAATGAAGTCCATG	(...((..(((.......((((((((...((((((((..(((..((((........(((((((....))))))).((((...((((((((((....(((((((........)))))))....))))...))))))....))))(((((((....)))))))(((((((....))))))))).))..)))..)))))))))).)))))))))..))..)..........	39172	39359	CCCAGTGAACCGAGGGTCTCGGTCGCTCACAATGCTCTTTGGGACTCCCCAAAGCTTCACAATGTGCTTGATGAATAGGCGGGCTGCCTCATCCGCTTTGCAATCGACTAGTGCGGCGATGAATGTGGCATACTTGCTATAATGGTTGACAACGACCATGATGCTTCCGCAACCTTCGGACTTGGGCA	((((((...((((((((..(((..((((........(((((((....))))))).((((...((((((((((....(((((((........)))))))....))))...))))))....))))(((((((....)))))))(((((((....))))))))).))..)))..)))))))))).))))..	Csi-miRN896c	39338	39359	CCGCAACCTTCGGACTTGGGCA	Csi-miRN896c*	39172	39192	CCCAGTGAACCGAGGGTCTCG		3
Csi-MIRN896d	PmiREN005032	MIRN896	Citrus sinensis	Csi-scaffold00715	68993	69222	+	AAAGAGCTCCGTCCAAAAACGCCCAGTGAACCGAGGGTCTCGGTCGCTCACAATGCTCTTCGAAACTCCCCAAAGCTTCACAATATGTTTGACGAATAAGCGGGCTGCCTCATCCGCTTTGCAATCGATTGGTGCGGCAATGAATGTGGCATACTTGCTGTATCAGTCGACAACAACTATGATGCTATCGCAACCTTCGGACTTGGGCAGTGATGTGATGAAGTCCATGG	...(.(((.((((((...(((((((((...((((((((..((((.(((((........((((((((....................))))..)))).(((((((........))))))).....((((((((((((((((.(.(((...))).))))))))))))))))).........))).)).))))..)))))))))).))))).))..)).)))).))).)....	69013	69202	GCCCAGTGAACCGAGGGTCTCGGTCGCTCACAATGCTCTTCGAAACTCCCCAAAGCTTCACAATATGTTTGACGAATAAGCGGGCTGCCTCATCCGCTTTGCAATCGATTGGTGCGGCAATGAATGTGGCATACTTGCTGTATCAGTCGACAACAACTATGATGCTATCGCAACCTTCGGACTTGGGCAG	(((((((...((((((((..((((.(((((........((((((((....................))))..)))).(((((((........))))))).....((((((((((((((((.(.(((...))).))))))))))))))))).........))).)).))))..)))))))))).)))))..	Csi-miRN896d	69181	69202	CGCAACCTTCGGACTTGGGCAG	Csi-miRN896d*	69013	69033	GCCCAGTGAACCGAGGGTCTC		3
Csi-MIRN897	PmiREN004908	MIRN897	Citrus sinensis	Csi-scaffold02299	10962	11125	-	ACTTACGGTTCTTTATCGTAATCTTTCACATGAATGTCTCGCTAACCTTAGGTTTTTTATGCTTTTGCAGGTGTGACATGGGCTAAAGGATTATGCCCAGTTCAGGAGGTGGGGAGGGAGGTAGAGAGGTTTGTGGATAGGCTTCGAGGTGCACAGAGGGGTAG	...............(((...(((.((.(((((((.(((((((..((((.(((((((((.((((.((((....)).)).)))))))))))))...((((.((....)).))))))))..))).)))).))))))))).)))...))).................	10982	11105	ATCTTTCACATGAATGTCTCGCTAACCTTAGGTTTTTTATGCTTTTGCAGGTGTGACATGGGCTAAAGGATTATGCCCAGTTCAGGAGGTGGGGAGGGAGGTAGAGAGGTTTGTGGATAGGCTT	.(((.((.(((((((.(((((((..((((.(((((((((.((((.((((....)).)).)))))))))))))...((((.((....)).))))))))..))).)))).))))))))).)))...	Csi-miRN897	10982	11002	GAGAGGTTTGTGGATAGGCTT	Csi-miRN897*	11085	11105	ATCTTTCACATGAATGTCTCG		3
Csi-MIRN898	PmiREN004909	MIRN898	Citrus sinensis	Csi-scaffold03472	7232	7377	+	CTGGTATTTTCTTTCTCTCTTTTGTTTATTTCTTTGGGCGGCTGCCAAAACCATGTTTATTTCTTTGGGCCGGTGGTGGCCTAGCTAAAATCAAATTGGCTTTGACAGCCACCCAAAGAAATAACAAAAGAGAGAAAGAAAAAAAT	......((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((.((((.(((..((.((((..((((((((....))))))))...)))).))..))).)))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))))....	7252	7357	TGTTTATTTCTTTGGGCGGCTGCCAAAACCATGTTTATTTCTTTGGGCCGGTGGTGGCCTAGCTAAAATCAAATTGGCTTTGACAGCCACCCAAAGAAATAACAAA	((((.(((((((((((.(((((.((((.(((..((.((((..((((((((....))))))))...)))).))..))).)))).))))).)))))))))))))))))	Csi-miRN898	7252	7273	TGTTTATTTCTTTGGGCGGCTG	Csi-miRN898*	7337	7357	GCCACCCAAAGAAATAACAAA		3
Csi-MIRN899	PmiREN004913	MIRN899	Citrus sinensis	Csi-scaffold09396	673	904	-	GGTTATGATTGATCTATAATATGTATAAATACCTCTTCATGTATTCAATTTAAGCATAAAAAAAAGCAACAAAATCTATAAGTTGCAAAGAGTGAAAAATAAGAGTTGTGTTTGAGGAGTGTTCTTGAAGAAATAAATAGTATTTATTTTGAGTGTTTGAATATTTTTTTTTTATGCTTGAATTGAATACATTAGGGGGCATTTATACATATTATAAGTCAATCACAACCAT	((((.((((((((.((((((((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((..(((.....((((.....))))......))).))))))))..(((((((((.....(((((((((...)))))))))........)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))))))))).)))))))).))))..	693	884	ATGTATAAATACCTCTTCATGTATTCAATTTAAGCATAAAAAAAAGCAACAAAATCTATAAGTTGCAAAGAGTGAAAAATAAGAGTTGTGTTTGAGGAGTGTTCTTGAAGAAATAAATAGTATTTATTTTGAGTGTTTGAATATTTTTTTTTTATGCTTGAATTGAATACATTAGGGGGCATTTATACATAT	((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((..(((.....((((.....))))......))).))))))))..(((((((((.....(((((((((...)))))))))........)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).))))))))))..	Csi-miRN899	693	713	TTAGGGGGCATTTATACATAT	Csi-miRN899*	864	884	ATGTATAAATACCTCTTCATG		3
Csi-MIRN900a	PmiREN004917	MIRN900	Citrus sinensis	Csi-scaffold00001	5073938	5074113	-	TATTATATCAAGGACCTTGCTACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCAGCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTCCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGTTTTGTCCCAGAGTTTAATTG	...........((((...(((((((((((((((((((((((((((((((...((.((.....)).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))))...)))).............	5073958	5074093	TACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCAGCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTCCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGT	(((((((((((((((((((((((((((((...((.((.....)).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN900a	5073958	5073978	ATACAGAGTCTGTAACGTAGT	Csi-miRN900a*	5074073	5074093	TACGTTACAGATTCTGTATGT		3
Csi-MIRN900b	PmiREN004927	MIRN900	Citrus sinensis	Csi-scaffold00011	255388	255563	-	ATCTCTGTTTTGGACCTTGCTACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCGCGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTCCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGTTTTGTCCCTCTGTTTTATGT	...........((((...(((((((((((((((((((((((((((((((...((.(((...))).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))))...)))).............	255408	255543	TACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCGCGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTCCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGT	(((((((((((((((((((((((((((((...((.(((...))).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN900b	255408	255428	ATACAGAGTCTGTAACGTAGT	Csi-miRN900b*	255523	255543	TACGTTACAGATTCTGTATGT		3
Csi-MIRN900c	PmiREN004968	MIRN900	Citrus sinensis	Csi-scaffold00095	405526	405702	+	TTATACTTGACGGACCTTGCTACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTTCTATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGTTTTGTCCTATACTTGTATTC	..((((..(..((((...(((((((((((((((((((((((((((((((...((.(((...))).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).))))..)))))...))))))))))))))))))))))))))))))...))))....)..))))..	405546	405682	TACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTTCTATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGT	(((((((((((((((((((((((((((((...((.(((...))).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).))))..)))))...))))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN900c	405662	405682	ATACAGAGTCTGTAACGTAGT	Csi-miRN900c*	405546	405566	TACGTTACAGATTCTGTATGT		3
Csi-MIRN900d	PmiREN004993	MIRN900	Citrus sinensis	Csi-scaffold00184	55106	55281	-	CTATAAAGTAAGGACCTTGCTACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTTCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGTTTTGTCCATAAAGTAATTAT	...........((((...((((((((((((((((((((((((..(((((.((((((((((......))(((.(((.((..........)).))).)))((((((......)).))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))...)))).............	55126	55261	TACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTTCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGT	((((((((((((((((((((((..(((((.((((((((((......))(((.(((.((..........)).))).)))((((((......)).))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN900d	55126	55146	ATACAGAGTCTGTAACGTAGT	Csi-miRN900d*	55241	55261	TACGTTACAGATTCTGTATGT		3
Csi-MIRN900e	PmiREN004994	MIRN900	Citrus sinensis	Csi-scaffold00232	174214	174389	-	TATAAATTTAGGGACCTTGCTACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTCCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGTTTTGTCCTAAATTTAGTAGT	..((((((((((.((...(((((((((((((((((((((((((((((((...((.(((...))).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))))...)))))))))))).....	174234	174369	TACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTCCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGT	(((((((((((((((((((((((((((((...((.(((...))).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN900e	174234	174254	ATACAGAGTCTGTAACGTAGT	Csi-miRN900e*	174349	174369	TACGTTACAGATTCTGTATGT		3
Csi-MIRN900f	PmiREN004995	MIRN900	Citrus sinensis	Csi-scaffold00792	63186	63361	+	ATTATTTAGCCGGACCTTGCTACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTCCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGTTTTGTCCTATTTAGCCAAAC	...........((((...(((((((((((((((((((((((((((((((...((.(((...))).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))))...)))).............	63206	63341	TACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTCCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGT	(((((((((((((((((((((((((((((...((.(((...))).)).))))).............((((..(((((.((((((......)).)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN900f	63321	63341	ATACAGAGTCTGTAACGTAGT	Csi-miRN900f*	63206	63226	TACGTTACAGATTCTGTATGT		3
Csi-MIRN900g	PmiREN005100	MIRN900	Citrus sinensis	Csi-scaffold09379	2048	2223	+	ATATTAACAAGGGACCTTGCTACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTTCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGTTTTGTCCATTAACAAGATAT	....................((((((((((((((((((((((..(((((.((((((((((......))(((.(((.((..........)).))).)))((((((......)).))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))......................	2068	2203	TACGTTACAGATTCTGTATGTAACGCAGCAAATGAGGAGCATCCACGCGTTGCAGGAGAGAGGAAAAGTTGTTGGAACTTAGCTGATACAAGACTAATTTTCATTGAGCTGTTACATACAGAGTCTGTAACGTAGT	((((((((((((((((((((((..(((((.((((((((((......))(((.(((.((..........)).))).)))((((((......)).))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN900g	2183	2203	ATACAGAGTCTGTAACGTAGT	Csi-miRN900g*	2068	2088	TACGTTACAGATTCTGTATGT		3
Csi-MIRN901	PmiREN004923	MIRN901	Citrus sinensis	Csi-scaffold04295	5216	5455	-	GGGGGTATCCTACTGTTACTTATGGGACTGGAGTACCCCATTATCATTGCATTCTTCGTTTCGCTTCCCCGCTTTCCATTTCCTATTTTTTACTTTTACAGTACTTAGTACTTGTCCAACTAACATAACTTTTGTGCATTGGGTGCAATCATGGAATCGACGGGTGACGCTTTTGACGCCTTCTTCCAAGCGGTAGTGGGGTGCTTCCGGATCTCAGGATTCGACGGTACCCCCGAGAGG	((((((.....((((((.....(((((((((((((((((((((((.(((.......((((..((.(((((((.((((((..................(((((((...)))).)))((((...(((.......)))...))))........))))))..).)))).)).))....))))........)))..))))))))))))).))))).)))))......))))))))))))......	5236	5435	TATGGGACTGGAGTACCCCATTATCATTGCATTCTTCGTTTCGCTTCCCCGCTTTCCATTTCCTATTTTTTACTTTTACAGTACTTAGTACTTGTCCAACTAACATAACTTTTGTGCATTGGGTGCAATCATGGAATCGACGGGTGACGCTTTTGACGCCTTCTTCCAAGCGGTAGTGGGGTGCTTCCGGATCTCAGGAT	..(((((((((((((((((((((((.(((.......((((..((.(((((((.((((((..................(((((((...)))).)))((((...(((.......)))...))))........))))))..).)))).)).))....))))........)))..))))))))))))).))))).)))))....	Csi-miRN901	5236	5256	GGTGCTTCCGGATCTCAGGAT	Csi-miRN901*	5415	5435	TATGGGACTGGAGTACCCCAT		3
Csi-MIRN902	PmiREN004930	MIRN902	Citrus sinensis	Csi-scaffold01873	1681	1842	+	TGTTAGGAAATTGAGCTTCTTCCCAAGATCTCTCCAAGCAACCTGTCAAAGTAAATCTTATGTTGTGTGATTGGTATATTCTCCATTTAATTTTTCTTATTAATTTGTTACTTGACAAATTGCTTGGAGAGATACTGGGAAGAAGCTCAATTTCCTAACAGT	(((((((((((((((((((((((((..((((((((((((((..((((((.((((.....(((.....(((.(((........))).)))........))).......))))))))))..))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))..	1701	1822	TCCCAAGATCTCTCCAAGCAACCTGTCAAAGTAAATCTTATGTTGTGTGATTGGTATATTCTCCATTTAATTTTTCTTATTAATTTGTTACTTGACAAATTGCTTGGAGAGATACTGGGAAG	(((((..((((((((((((((..((((((.((((.....(((.....(((.(((........))).)))........))).......))))))))))..))))))))))))))..)))))..	Csi-miRN902	1701	1721	TCCCAAGATCTCTCCAAGCAA	Csi-miRN902*	1802	1822	GCTTGGAGAGATACTGGGAAG		3
Csi-MIRN903	PmiREN004933	MIRN903	Citrus sinensis	Csi-scaffold00647	7070	7194	-	TTTGCAGGATACGCTTTGATCTGCCTGGCTCCCTGGATGCCAAGTAAGAAGCTTGTCGACATGTGTCGATTTCTCATTAGTTGGCATCAGAGGAGCCATGCAGATGCACCAATGCCCGCCCTCCG	..................((((((.((((((((((.(((((((.(((..((...((((((....))))))..))..))).)))))))))).))))))).))))))....................	7090	7174	CTGCCTGGCTCCCTGGATGCCAAGTAAGAAGCTTGTCGACATGTGTCGATTTCTCATTAGTTGGCATCAGAGGAGCCATGCAGAT	((((.((((((((((.(((((((.(((..((...((((((....))))))..))..))).)))))))))).))))))).))))..	Csi-miRN903	7090	7110	CATCAGAGGAGCCATGCAGAT	Csi-miRN903*	7154	7174	CTGCCTGGCTCCCTGGATGCC		3
Csi-MIRN904	PmiREN004942	MIRN904	Citrus sinensis	Csi-scaffold00097	121050	121168	+	TAATGCTAAGTTACATGTATGTAACTTCCAATCCTCTCATATGAATAGTAAATATTATAGGCTCATTTACTATTCATGTGAGAAAGTTGTAAGTTACGTACATGTAATTTAGGAAAAAA	...(.((((((((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((((((...........)))))))))))))))))))..)))).)))))))))))))))))))))).).....	121070	121148	GTAACTTCCAATCCTCTCATATGAATAGTAAATATTATAGGCTCATTTACTATTCATGTGAGAAAGTTGTAAGTTACGT	(((((((.((((..(((((((((((((((((((...........)))))))))))))))))))..)))).)))))))..	Csi-miRN904	121128	121148	TGAGAAAGTTGTAAGTTACGT	Csi-miRN904*	121070	121090	GTAACTTCCAATCCTCTCATA		3
Csi-MIRN905	PmiREN004943	MIRN905	Citrus sinensis	Csi-scaffold00377	46347	46540	-	TATAAAGCAGGTTTAGGTGTTTTTACAGAAAGCGCTTTTATTTGAAAGCACTTCATGTCAGATACCTTATGGTAAAATGCTAATGTGAGATTATATAGGTGAGTATGAAGAGCACGCATATTTTGAAATGTTTTAGGATATGTGCTTTCAAGAAAGAGCGTTTTCTGTAAAAATACTTGCAACTGTTTTATAAA	((((((((((...((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((((.(...(((((((((((....(((....)))..)))))).))))).)))))))).....((((((((((((....))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))...))))))))))..	46367	46520	TTTTACAGAAAGCGCTTTTATTTGAAAGCACTTCATGTCAGATACCTTATGGTAAAATGCTAATGTGAGATTATATAGGTGAGTATGAAGAGCACGCATATTTTGAAATGTTTTAGGATATGTGCTTTCAAGAAAGAGCGTTTTCTGTAAAAAT	(((((((((((((((((((.(((((((((.(((((((.(...(((((((((((....(((....)))..)))))).))))).)))))))).....((((((((((((....))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))..	Csi-miRN905	46500	46520	TTTTACAGAAAGCGCTTTTAT	Csi-miRN905*	46367	46387	AAGAGCGTTTTCTGTAAAAAT		3
Csi-MIRN906	PmiREN004945	MIRN906	Citrus sinensis	Csi-scaffold00557	33142	33385	+	CAAGAAATAGCAAGGCAAGCTATAGAAGACAAGTTTTTTGACAAAGTTATTATTGCTGAGATAACACTCACACAAGACCAGAAACATAATTTTAAAAAAAATTACTTATGATTTAGGCTTGGAATATGATCATAATGTATTTGGAAGAGCTGGTCAGAGTGAAGAAACATTATGTTTATTTCGGTAGATTGTGGGTGATTCAGCAAAAAAATTTCTTTTATTTGCATTTTGGTTCAATTGATTC	..............((((...((((((((..((((((((..............(((((((....((((((((....(((..((((((((((((........((((((.(((((..(((((.((((((.........)))))).)...)))))))))))))))..))).))))))))).....)))....)))))))).))))))))))))))))))))))))))).....((.((....)).))	33162	33365	TATAGAAGACAAGTTTTTTGACAAAGTTATTATTGCTGAGATAACACTCACACAAGACCAGAAACATAATTTTAAAAAAAATTACTTATGATTTAGGCTTGGAATATGATCATAATGTATTTGGAAGAGCTGGTCAGAGTGAAGAAACATTATGTTTATTTCGGTAGATTGTGGGTGATTCAGCAAAAAAATTTCTTTTATTTG	.((((((((..((((((((..............(((((((....((((((((....(((..((((((((((((........((((((.(((((..(((((.((((((.........)))))).)...)))))))))))))))..))).))))))))).....)))....)))))))).)))))))))))))))))))))))...	Csi-miRN906	33162	33182	TATAGAAGACAAGTTTTTTGA	Csi-miRN906*	33345	33365	CAAAAAAATTTCTTTTATTTG		3
Csi-MIRN907	PmiREN004947	MIRN907	Citrus sinensis	Csi-scaffold06012	2220	2463	+	TCCGAGGTAGCTGAAGAGACTGACAAGATGAGTTTGAGCCAGCGCTATGGTCAGGCACTTAGGGTTACTCAAGAGATAAGCTATTAATGGGGTACCCCAGGTGTACCCTCCATTTTTTACTTGTTTACTCCTATTGCCATACATATATTTAATATGTCTTTTACGACCGGCAGGCATCCTTTCTCCTCAGCCACTGCCTTCCAGATCTCGACTCCCTTGTTGCCGCCCAATCGGAGGTTGACAA	((((((((.((..........((((((..(((((.(((..........((((.((((..((((((........(((((((..(..(((((((((((....).)))))..)))))..)..))))))))).)))).))))..((((((.....)))))).......))))(((((((..............)))..))))........)))))))).)))))))).)))...))))).........	2240	2443	TGACAAGATGAGTTTGAGCCAGCGCTATGGTCAGGCACTTAGGGTTACTCAAGAGATAAGCTATTAATGGGGTACCCCAGGTGTACCCTCCATTTTTTACTTGTTTACTCCTATTGCCATACATATATTTAATATGTCTTTTACGACCGGCAGGCATCCTTTCTCCTCAGCCACTGCCTTCCAGATCTCGACTCCCTTGTTGCC	.((((((..(((((.(((..........((((.((((..((((((........(((((((..(..(((((((((((....).)))))..)))))..)..))))))))).)))).))))..((((((.....)))))).......))))(((((((..............)))..))))........)))))))).))))))...	Csi-miRN907	2240	2260	TGACAAGATGAGTTTGAGCCA	Csi-miRN907*	2423	2443	GATCTCGACTCCCTTGTTGCC		3
Csi-MIRN908	PmiREN004948	MIRN908	Citrus sinensis	Csi-scaffold00110	203188	203330	-	TCCTTTGGAACTTACAGTATGCTGCTCAAGTCCAGGCCACAGCTGATGCCGATCAGAAATCAGATTCTACATCATAGTGGTATATTTGGGATTGAGGTGATGTGGCCTGAGCTTGTGCAGCATCGTGTTAGTTTCAAATATAG	...(((((((((.(((..(((((((.(((((.(((((((((....((..(((((.....((((((.((((......))))...)))))))))))..))..))))))))).))))).)))))))..))).))))))))).....	203208	203310	GCTGCTCAAGTCCAGGCCACAGCTGATGCCGATCAGAAATCAGATTCTACATCATAGTGGTATATTTGGGATTGAGGTGATGTGGCCTGAGCTTGTGCAGCAT	(((((.(((((.(((((((((....((..(((((.....((((((.((((......))))...)))))))))))..))..))))))))).))))).)))))..	Csi-miRN908	203208	203228	TGGCCTGAGCTTGTGCAGCAT	Csi-miRN908*	203290	203310	GCTGCTCAAGTCCAGGCCACA		3
Csi-MIRN909	PmiREN004949	MIRN909	Citrus sinensis	Csi-scaffold00047	555631	555718	-	TCAAGAAATACTTCCGGATAATCAGAATGGAAGTAGAGTATTAATAACACTCACTGACATTAGGATCATCATCTCATTTCAGTTCGAA	................(((.(((..((((..(((.((((.........)))))))..))))..))).)))..................	555651	555698	ATCAGAATGGAAGTAGAGTATTAATAACACTCACTGACATTAGGATCA	(((..((((..(((.((((.........)))))))..))))..)))..	Csi-miRN909	555678	555698	ATCAGAATGGAAGTAGAGTAT	Csi-miRN909*	555651	555671	CACTCACTGACATTAGGATCA		3
Csi-MIRN910a	PmiREN004954	MIRN910	Citrus sinensis	Csi-scaffold00008	1578178	1578332	-	CTACAAGAGGAAACCTGTGTTGCAACTGTAGTACCGTGCCACAGTTGTATCCAACCGTTGGATGTCAGTAGACCCCACCAATCTAAGCACATCCAACGGCTGGATGTAACTGTAGTACGGTACCACAGTTGTACCGTAACCTGATCCTACACTAC	..................(.(((((((((.(((((((((.(((((((((((((.(((((((((((...((((.........))))...))))))))))).))))))))))))).))))))))).))))))))).)....................	1578198	1578312	TGCAACTGTAGTACCGTGCCACAGTTGTATCCAACCGTTGGATGTCAGTAGACCCCACCAATCTAAGCACATCCAACGGCTGGATGTAACTGTAGTACGGTACCACAGTTGTACC	(((((((((.(((((((((.(((((((((((((.(((((((((((...((((.........))))...))))))))))).))))))))))))).))))))))).)))))))))..	Csi-miRN910a	1578292	1578312	TGCAACTGTAGTACCGTGCCA	Csi-miRN910a*	1578198	1578218	GTACGGTACCACAGTTGTACC		3
Csi-MIRN910b	PmiREN004955	MIRN910	Citrus sinensis	Csi-scaffold00008	649982	650145	-	AAACTAAGATAAAACTGTGGTGCAACTGTAGTACCGTGCCACAATTGCACCCAACTGTTAAATTTTCACTCATTCAAGTGGACCCTATTTATTTAAGTTGATCCAACGGCTGGTGCAACTATGGCACGGTACCACAGTTACATTGTAGCCTAACCCCGCAAACT	..............((((((((.((((((.(((((((((((...((((((((((((..(((((.((((((......))))))....)))))....)))))...........)))))))...))))))))))).)))))).))))))))................	650002	650125	TGCAACTGTAGTACCGTGCCACAATTGCACCCAACTGTTAAATTTTCACTCATTCAAGTGGACCCTATTTATTTAAGTTGATCCAACGGCTGGTGCAACTATGGCACGGTACCACAGTTACATT	((.((((((.(((((((((((...((((((((((((..(((((.((((((......))))))....)))))....)))))...........)))))))...))))))))))).)))))).))..	Csi-miRN910b	650105	650125	TGCAACTGTAGTACCGTGCCA	Csi-miRN910b*	650002	650022	GCACGGTACCACAGTTACATT		3
Csi-MIRN910c	PmiREN004964	MIRN910	Citrus sinensis	Csi-scaffold00116	157352	157505	-	AAAATAAGGGAAACTTGTGGTGCAACTGTAGTACCGTGCCACAGTTACATCCAGCCGTGGATGTCAGTGGATCCCACCAATCCAAATGCATCTAACGATTGGATGTAACTGTGTCACGGTATCACAATTGCACCGTAGTCTGATCCACAAAAAT	...(((((.....)))))(((((((.(((.((((((((.(((((((((((((((.(((((((((...(((((.......)))))...)))))).))).))))))))))))))).)))))))).))).)))))))....................	157372	157485	TGCAACTGTAGTACCGTGCCACAGTTACATCCAGCCGTGGATGTCAGTGGATCCCACCAATCCAAATGCATCTAACGATTGGATGTAACTGTGTCACGGTATCACAATTGCACC	(((((.(((.((((((((.(((((((((((((((.(((((((((...(((((.......)))))...)))))).))).))))))))))))))).)))))))).))).)))))..	Csi-miRN910c	157465	157485	TGCAACTGTAGTACCGTGCCA	Csi-miRN910c*	157372	157392	TCACGGTATCACAATTGCACC		3
Csi-MIRN910d	PmiREN004965	MIRN910	Citrus sinensis	Csi-scaffold00162	73046	73200	+	TTACGAGAGAAAACTTGTGGTGCAACTGTAGTACCGTGCCATAGTTGCATCCAGCCGTTGGATGCCAGTAGACCCCACCAATTCAAGTGCATCCAACGGTTAGATGCAACTGTGGCACGGTACCACAATTGTACCGTAGCCTGATCCCTATTACC	..(((((......)))))(((((((.(((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((((.(.(.((..........)).).)))))))))))))).))))))))))))))))))))).))).)))))))....................	73066	73180	TGCAACTGTAGTACCGTGCCATAGTTGCATCCAGCCGTTGGATGCCAGTAGACCCCACCAATTCAAGTGCATCCAACGGTTAGATGCAACTGTGGCACGGTACCACAATTGTACC	(((((.(((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((((.(.(.((..........)).).)))))))))))))).))))))))))))))))))))).))).)))))..	Csi-miRN910d	73066	73086	TGCAACTGTAGTACCGTGCCA	Csi-miRN910d*	73160	73180	GCACGGTACCACAATTGTACC		3
Csi-MIRN910e	PmiREN004970	MIRN910	Citrus sinensis	Csi-scaffold00603	23541	23695	-	ATAATAGGGGAAACCTGTGGTGCAACTGTAGTACCGTGCCATAGTTGCATCTAGCCATTGGATGCCAATGAACCCCGCCAATCTAAGTGCATCCAACGGTTGGATGCAACTGTGGCACGGTACCACAGTTGCACCGTAGCCTGATCCTTAATAAT	....((((((....(((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.(((((((((...((..........))...).)))))))).)))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))).....)))))).....	23561	23675	TGCAACTGTAGTACCGTGCCATAGTTGCATCTAGCCATTGGATGCCAATGAACCCCGCCAATCTAAGTGCATCCAACGGTTGGATGCAACTGTGGCACGGTACCACAGTTGCACC	(((((((((.((((((((((((((((((((((((((.(((((((((...((..........))...).)))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))))))..	Csi-miRN910e	23655	23675	TGCAACTGTAGTACCGTGCCA	Csi-miRN910e*	23561	23581	GCACGGTACCACAGTTGCACC		3
Csi-MIRN910f	PmiREN004980	MIRN910	Citrus sinensis	Csi-scaffold10806	746	899	+	TTTATCGGGTCCGGCTATGTTGCAACTGTAGTACCGTGCCAGGTTGCAACCAGCCATTGGATGAGGGATGCAACAGTGAATCCAAGTGAATCCAATAGTTAGTTGCAACTGTGACACGGTACCACAGTTACAACATAACCAAATTCCGATTTAT	(..((((((...((.(((((((.((((((.((((((((.(((((((((((.(((.(((((((...((((.((....)).))))......))))))).))).))))))))).)).)))))))).)))))).))))))).))....))))))..).	766	879	TGCAACTGTAGTACCGTGCCAGGTTGCAACCAGCCATTGGATGAGGGATGCAACAGTGAATCCAAGTGAATCCAATAGTTAGTTGCAACTGTGACACGGTACCACAGTTACAAC	((.((((((.((((((((.(((((((((((.(((.(((((((...((((.((....)).))))......))))))).))).))))))))).)).)))))))).)))))).))..	Csi-miRN910f	766	786	TGCAACTGTAGTACCGTGCCA	Csi-miRN910f*	859	879	ACACGGTACCACAGTTACAAC		3
Csi-MIRN911	PmiREN004956	MIRN911	Citrus sinensis	Csi-scaffold00008	620235	620466	+	GCTGTAAATCTAGAAGCCAACCGTTCTAGAAGTAGCCCATTTTGAATGTTAACATTTGTTGAAGAAGAAAGAAGAATTCGGCAGCAGTAATTTTGGAAAGAAGAAAAAGGAAGAAAGAAGAATGAAGAAGATGTTGCAGAAGTTGATCTTGACAAATGGTGGTTGGCACGCCAAAATGTTAGCATTCAAAATGGACTACTTCTAGAATGGTTGGCTTATAGATTTGCAGTAG	((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((...........((((..(((((.((((((....((((...............................))))..)))))).).))))..))))......(((((.......)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))).))))))))))))..	620255	620446	CCGTTCTAGAAGTAGCCCATTTTGAATGTTAACATTTGTTGAAGAAGAAAGAAGAATTCGGCAGCAGTAATTTTGGAAAGAAGAAAAAGGAAGAAAGAAGAATGAAGAAGATGTTGCAGAAGTTGATCTTGACAAATGGTGGTTGGCACGCCAAAATGTTAGCATTCAAAATGGACTACTTCTAGAATGGTT	(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((...........((((..(((((.((((((....((((...............................))))..)))))).).))))..))))......(((((.......)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))..	Csi-miRN911	620426	620446	TGGACTACTTCTAGAATGGTT	Csi-miRN911*	620255	620275	CCGTTCTAGAAGTAGCCCATT		3
Csi-MIRN912	PmiREN004960	MIRN912	Citrus sinensis	Csi-scaffold00050	472481	472649	-	TTTTGTGTTTAAAGACTTGTGTTTTATTTTAATTTTGTTTGAGTGGTGAATTTTTTACTGGTAGTAAGTCCCGTTTTAGGATAAGGATTTCCGCTTAAGGCTGTAAAACCATACATGTAGCCATTCCGACAAGACCATAGATAGACCATAAGTTCTTTATCCATGGATC	.((((((..((((((((((((.(((((((...(((((((.(((((((...........((((....((((........(((........)))......)))).....))))........))))))).)))))))....))))))).)))))).))))))..))))))..	472501	472629	GTTTTATTTTAATTTTGTTTGAGTGGTGAATTTTTTACTGGTAGTAAGTCCCGTTTTAGGATAAGGATTTCCGCTTAAGGCTGTAAAACCATACATGTAGCCATTCCGACAAGACCATAGATAGACCAT	(.(((((((...(((((((.(((((((...........((((....((((........(((........)))......)))).....))))........))))))).)))))))....))))))).)..	Csi-miRN912	472501	472521	ACAAGACCATAGATAGACCAT	Csi-miRN912*	472609	472629	GTTTTATTTTAATTTTGTTTG		3
Csi-MIRN913a	PmiREN004962	MIRN913	Citrus sinensis	Csi-scaffold00075	471008	471105	-	AGTTTAATATCTTTTATTTCTTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGAGTTGTTTTCTTCTTATCCAGGATTTCAGTGAGATCATAAGTATTCATTTTAAT	.............((((.((((.((((.(((((((((((..(((((.....)))))..))))))))))))))).))))..))))......((....))	471028	471085	TTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGAGTTGTTTTCTTCTTATCCAGGATTTCAGTGAGA	((.((((.(((((((((((..(((((.....)))))..))))))))))))))).))..	Csi-miRN913a	471064	471085	TTTCTGAAGATCTTGGATATTA	Csi-miRN913a*	471028	471048	TTATCCAGGATTTCAGTGAGA		3
Csi-MIRN913b	PmiREN004967	MIRN913	Citrus sinensis	Csi-scaffold00343	15187	15366	+	CAAATTTAATTTCTTTGATTTCTTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGGGTTGTTTTCTTTGTTTTCTTTGTACCCAAAATTTCAGTGAGATCATAAGAATTCTTTTTAACAATTGGAACTTTAGGAGTTTTTGCTTTGTTAGAATCCAAGGTTTTTAGAAGTTTATCAAGGTATTCCTTTT	.......(((..(((((((...((((((((((((((((((..........(..(((((((.((((.(((............))).)))).)).)))))..)..((((((((..(((((((...)))))))....))))))))))))))))))))))))))...))))))).)))......	15207	15346	TTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGGGTTGTTTTCTTTGTTTTCTTTGTACCCAAAATTTCAGTGAGATCATAAGAATTCTTTTTAACAATTGGAACTTTAGGAGTTTTTGCTTTGTTAGAATCCAAGGTTTTTAGAAGTT	((((((((((((((((((..........(..(((((((.((((.(((............))).)))).)).)))))..)..((((((((..(((((((...)))))))....))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN913b	15207	15228	TTTCTGAAGATCTTGGATATTA	Csi-miRN913b*	15326	15346	AATCCAAGGTTTTTAGAAGTT		3
Csi-MIRN913c	PmiREN004974	MIRN913	Citrus sinensis	Csi-scaffold02138	14272	14457	+	AGTTTGATATCTTTTATTTCTTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGAGTCGTTGTTTTCTTTGTTTTCTTTTTATCCAAAATTTCAGTAAGATCATATGTATTCTTTTTAATTATTGGGGCTTTAGAAATTTCTGTTTTATTTCCTACTTCTAAGGTTTTTAGAAGTTTGTCAAGGTATTCTCTTTAA	((...((((((((.......(((((((((((((((((...((((((................(((((.....(((((((((.....((((..........))))...)))).))))).....)))))............))))))..)))))))))))))))))......))))))))))......	14292	14437	TTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGAGTCGTTGTTTTCTTTGTTTTCTTTTTATCCAAAATTTCAGTAAGATCATATGTATTCTTTTTAATTATTGGGGCTTTAGAAATTTCTGTTTTATTTCCTACTTCTAAGGTTTTTAGAAGTT	(((((((((((((((((...((((((................(((((.....(((((((((.....((((..........))))...)))).))))).....)))))............))))))..)))))))))))))))))..	Csi-miRN913c	14292	14313	TTTCTGAAGATCTTGGATATTA	Csi-miRN913c*	14417	14437	CTTCTAAGGTTTTTAGAAGTT		3
Csi-MIRN913d	PmiREN004975	MIRN913	Citrus sinensis	Csi-scaffold02513	5202	5383	+	CAAGTTTAATATCTTTGATTTCTTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGGGTTGTTTTCTTTGTTTTCTTTGTACCCAAAATTTCAGTGAGATCATAAGAATTCTTCTTGACAATTGGAACTTTAGAAGTTTCTGTTTGAACTTTAGAATCCAGGGTTTTTAAAAGTTTATCAAGGTATTCTTTT	.....................((((.((((((((((((((.((((((...(..(((((((.((((.(((............))).)))).)).)))))..)(((..((((...(((((((...))))))))))).))))))))).)))))))))))))))))).......(((......)))	5222	5363	TTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGGGTTGTTTTCTTTGTTTTCTTTGTACCCAAAATTTCAGTGAGATCATAAGAATTCTTCTTGACAATTGGAACTTTAGAAGTTTCTGTTTGAACTTTAGAATCCAGGGTTTTTAAAAGT	(((.((((((((((((((.((((((...(..(((((((.((((.(((............))).)))).)).)))))..)(((..((((...(((((((...))))))))))).))))))))).)))))))))))))))))).	Csi-miRN913d	5222	5243	TTTCTGAAGATCTTGGATATTA	Csi-miRN913d*	5343	5363	GAATCCAGGGTTTTTAAAAGT		3
Csi-MIRN913e	PmiREN004976	MIRN913	Citrus sinensis	Csi-scaffold04877	2636	2742	-	AGTTTAATATCTCTTATTTCTTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGAATTGTTTTCTTTGTTTTCTTCTTATCTAGGATTTCAGTGAGATCATAAGTATTCCTTTTAAT	............(((((.((((.((((.(((((((((((..(((((..............)))))..))))))))))))))).))))..))))).............	2656	2722	TTTCTGAAGATCTTGGATATTAGGAATTGTTTTCTTTGTTTTCTTCTTATCTAGGATTTCAGTGAGA	((.((((.(((((((((((..(((((..............)))))..))))))))))))))).))..	Csi-miRN913e	2701	2722	TTTCTGAAGATCTTGGATATTA	Csi-miRN913e*	2656	2676	TTATCTAGGATTTCAGTGAGA		3
Csi-MIRN914	PmiREN004963	MIRN914	Citrus sinensis	Csi-scaffold00084	407522	407751	+	AATGAAAAAGTCATGATAAAATAATACTACACTTCCGAAGTTGTATCCCAACCTTGTCTATCTCATGCATGGTGACATTTATCCATTGGATGGTGTGAGGGATTAATATGTAATTTGACATCTTTTGAAATTGACACTACAGTAGATGAATGTCACTCAGTACGTAGGATTCAAATATTGGGATACTACTTGAGAAGTGTAGTATTATTTTATCTGACACATATGCATGG	.........((((.(((((((((((((((((((((..((((.(((((((((..((....((((.(((..((((((((((((((.((((..((((((.((...((((.((((......))))...))))..)).)))))))))).)))))))))))).))...))).))))...))..))))))))).))))..)))))))))))))))))))))))))............	407542	407731	ATAATACTACACTTCCGAAGTTGTATCCCAACCTTGTCTATCTCATGCATGGTGACATTTATCCATTGGATGGTGTGAGGGATTAATATGTAATTTGACATCTTTTGAAATTGACACTACAGTAGATGAATGTCACTCAGTACGTAGGATTCAAATATTGGGATACTACTTGAGAAGTGTAGTATTATTT	(((((((((((((((..((((.(((((((((..((....((((.(((..((((((((((((((.((((..((((((.((...((((.((((......))))...))))..)).)))))))))).)))))))))))).))...))).))))...))..))))))))).))))..)))))))))))))))..	Csi-miRN914	407711	407731	TTGAGAAGTGTAGTATTATTT	Csi-miRN914*	407542	407562	ATAATACTACACTTCCGAAGT		3
Csi-MIRN915	PmiREN004971	MIRN915	Citrus sinensis	Csi-scaffold00703	23987	24201	-	AGAGGAGAACGACTACATGGCTCATATGTTCTATATACTAGTGTTGTGGGTATGTTTATGTATGTTATGGTGTGCACAAGGCCTGACATATCTCAGTCTATGAGTATAGTTAATCGATACATGTATAATTTGGGAAAAAACTATTGGCTTGGAATGAAGTGGGTTCTCTGATATCTGTATAGGACAGTTGATGTTAGATTGTTGTTCAACAAAGA	......(((((((....(((((((..(((((((((((...(((((((((.(((((((((((((((((.(((.(.....).)))))))))))........))))))))).)))..)))))).......(((.((((.......(((.((((......)))).))))))).)))...)))))))))))..))).))))....)))))))........	24007	24181	CTCATATGTTCTATATACTAGTGTTGTGGGTATGTTTATGTATGTTATGGTGTGCACAAGGCCTGACATATCTCAGTCTATGAGTATAGTTAATCGATACATGTATAATTTGGGAAAAAACTATTGGCTTGGAATGAAGTGGGTTCTCTGATATCTGTATAGGACAGTTGATGTT	((((..(((((((((((...(((((((((.(((((((((((((((((.(((.(.....).)))))))))))........))))))))).)))..)))))).......(((.((((.......(((.((((......)))).))))))).)))...)))))))))))..))).)..	Csi-miRN915	24007	24028	TCTGTATAGGACAGTTGATGTT	Csi-miRN915*	24161	24181	CTCATATGTTCTATATACTAG		3
Csi-MIRN916	PmiREN004977	MIRN916	Citrus sinensis	Csi-scaffold07226	2422	2540	+	GGCACAAACAATAGAAAATTCCTGTGTTTTGTGACAGTCAGAGTGCCTTGCATATTGCAAGGAATCCAGCCTTTCATTCTAGGACAAAGCACATAGGAGTCCAGTATCACTTCGTTCGA	(((.......(((....(((((((((((((((.....(((((((((((((((...)))))))............)))))).)))))))))))..))))))....)))......)))...	2442	2520	CCTGTGTTTTGTGACAGTCAGAGTGCCTTGCATATTGCAAGGAATCCAGCCTTTCATTCTAGGACAAAGCACATAGGAG	((((((((((((.....(((((((((((((((...)))))))............)))))).)))))))))))..)))..	Csi-miRN916	2499	2520	TCTAGGACAAAGCACATAGGAG	Csi-miRN916*	2442	2462	CCTGTGTTTTGTGACAGTCAG		3
Csi-MIRN917a	PmiREN004981	MIRN917	Citrus sinensis	Csi-scaffold00001	1677568	1677741	-	GTGATACTCTTGTATAAATTTATTTTGTACAAACTGACGTAGCATTAATTCATTGATTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAATAAATTATGTGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATCATGTCACATTAGTTTGTATAAAATAAATTTATACAAGAATTTGTGAC	((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((......((((.((((((..((((((............(((...)))............)))))).)))))).))))......)))).)).))))))))))))))))))))))))))))))...))).))	1677588	1677721	TATTTTGTACAAACTGACGTAGCATTAATTCATTGATTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAATAAATTATGTGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATCATGTCACATTAGTTTGTATAAAATAAA	(((((((((((((((((.((.((((......((((.((((((..((((((............(((...)))............)))))).)))))).))))......)))).)).)))))))))))))))))..	Csi-miRN917a	1677701	1677721	TATTTTGTACAAACTGACGTA	Csi-miRN917a*	1677588	1677608	CATTAGTTTGTATAAAATAAA		3
Csi-MIRN917b	PmiREN004984	MIRN917	Citrus sinensis	Csi-scaffold00074	64801	64974	-	CACAAATTTTTGTATAAATTTATTTTGTACAAACTGACGTAGTATTAATTTATTGGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAAAAAATCATGTGGGCCAAGTAATATTTAATTCAACTAATTTTATCATACTACATCAATTTGTACAAAATAAATTTATACAAGAGTTTATGGC	((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((......(((((((((((..((((((.................................)))))).)))))))))))......))))))).))).)))))))))))))))))))))))))))))).))..	64821	64954	TATTTTGTACAAACTGACGTAGTATTAATTTATTGGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAAAAAATCATGTGGGCCAAGTAATATTTAATTCAACTAATTTTATCATACTACATCAATTTGTACAAAATAAA	(((((((((((((.(((.(((((((......(((((((((((..((((((.................................)))))).)))))))))))......))))))).))).)))))))))))))..	Csi-miRN917b	64934	64954	TATTTTGTACAAACTGACGTA	Csi-miRN917b*	64821	64841	CATCAATTTGTACAAAATAAA		3
Csi-MIRN917c	PmiREN004985	MIRN917	Citrus sinensis	Csi-scaffold00104	389736	389909	+	GCCACAAACTCTTGTACAAATTTATTTTGTACAAACTGACGTAGTATTAATTCATTAGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAAAAAATCATATGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATCATGACACATTAATTTATACAAAATAAATTTATACAAGAATTTGTG	..((((((.(((((((.((((((((((((((.(((.(((.((.((........(((.(((((((..(((((..................((((.((...)).))))))))).))))))).))).........)))).))).))).)))))))))))))).))))))).))))))	389756	389889	TATTTTGTACAAACTGACGTAGTATTAATTCATTAGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAAAAAATCATATGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATCATGACACATTAATTTATACAAAATAAA	(((((((((.(((.(((.((.((........(((.(((((((..(((((..................((((.((...)).))))))))).))))))).))).........)))).))).))).)))))))))))	Csi-miRN917c	389756	389776	TATTTTGTACAAACTGACGTA	Csi-miRN917c*	389869	389889	CATTAATTTATACAAAATAAA		3
Csi-MIRN917d	PmiREN004986	MIRN917	Citrus sinensis	Csi-scaffold00115	107842	108016	+	GCTATAAACTCTTGTACAAATTTATTTTGTACAAACTGACGTAGTATTAATTCATTGGTTGAATGAAAAATATAAAATAATAAAAAAAAATCATGTGGGGCAAGTGATATTTAATTTAACCAATCTTATCATACCACAACAGTTTGTACAAAATAAGTTTGTACAAGAGTTTGTA	..((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((.((((......(((((((((((...(((((..................((((.((...)).))))))))).)))))))))))......)))).))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))	107862	107996	TATTTTGTACAAACTGACGTAGTATTAATTCATTGGTTGAATGAAAAATATAAAATAATAAAAAAAAATCATGTGGGGCAAGTGATATTTAATTTAACCAATCTTATCATACCACAACAGTTTGTACAAAATAAG	((((((((((((((((..((.((((......(((((((((((...(((((..................((((.((...)).))))))))).)))))))))))......)))).))..))))))))))))))))))	Csi-miRN917d	107862	107882	TATTTTGTACAAACTGACGTA	Csi-miRN917d*	107976	107996	CAACAGTTTGTACAAAATAAG		3
Csi-MIRN917e	PmiREN004987	MIRN917	Citrus sinensis	Csi-scaffold00244	203420	203593	-	CACAAACTCTTGTACAAATTTATTTTGTACAAACTGACGTATCATTAATTCATTGGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAACAAATCATGTGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATTTTATCATGCCACATCAATTTGTACAAAATAAGTTTGTACAAGAGTTTGTGGC	(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((..(((......(((((((((((..((((((............(((.....)))..........)))))).)))))))))))......)))..)).))).)))))))))))))))))))))))))))))))))..	203440	203573	TATTTTGTACAAACTGACGTATCATTAATTCATTGGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAACAAATCATGTGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATTTTATCATGCCACATCAATTTGTACAAAATAAG	(((((((((((((.(((.((..(((......(((((((((((..((((((............(((.....)))..........)))))).)))))))))))......)))..)).))).)))))))))))))..	Csi-miRN917e	203553	203573	TATTTTGTACAAACTGACGTA	Csi-miRN917e*	203440	203460	CATCAATTTGTACAAAATAAG		3
Csi-MIRN917f	PmiREN004988	MIRN917	Citrus sinensis	Csi-scaffold00508	85847	86020	+	NNNNNNNNNNNNNNNACAAATTTATTTTGTACAAACTGACGTAACATTAATTTATTGGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAACAAATCATGTGGGTCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATCATGTTAGATCAGTTTGTACAAAATAAATTTGTACAAGAGTTTGTG	...............((((((((((((((((((((((((..((((((......(((((((((((..((((((...((.((....(((.....)))..)).))...)))))).)))))))))))......))))))..)))))))))))))))))))))))).............	85867	86000	TATTTTGTACAAACTGACGTAACATTAATTTATTGGTTGAATGAAAATATAAATTAATAAAAACAAATCATGTGGGTCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATCATGTTAGATCAGTTTGTACAAAATAAA	(((((((((((((((((..((((((......(((((((((((..((((((...((.((....(((.....)))..)).))...)))))).)))))))))))......))))))..)))))))))))))))))))	Csi-miRN917f	85867	85887	TATTTTGTACAAACTGACGTA	Csi-miRN917f*	85980	86000	GATCAGTTTGTACAAAATAAA		3
Csi-MIRN917g	PmiREN004989	MIRN917	Citrus sinensis	Csi-scaffold07076	1607	1781	-	TACAAACTCTTGTACAAACTTATTTTGTACAAACTGACGTAGCATTAATTCATTGGTTGAATGAAAATATAAAATAATAAAAATAAATCATGTGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATCATACCACATCAGTTTTGTATAAAATAAGTTTGTACAAGAGTTTGTGGC	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((...........(((((((((((..(((((..................((((.((...)).))))))))).)))))))))))...........)).)))).)))))))))))))))))))))))))))))))))..	1627	1761	TATTTTGTACAAACTGACGTAGCATTAATTCATTGGTTGAATGAAAATATAAAATAATAAAAATAAATCATGTGGGCCAAGTGATATTTAATTCAACCAATCTTATCATACCACATCAGTTTTGTATAAAATAAG	(((((((((((((((((.((...........(((((((((((..(((((..................((((.((...)).))))))))).)))))))))))...........)).)))).)))))))))))))..	Csi-miRN917g	1741	1761	TATTTTGTACAAACTGACGTA	Csi-miRN917g*	1627	1647	ATCAGTTTTGTATAAAATAAG		3
Csi-MIRN918	PmiREN004982	MIRN918	Citrus sinensis	Csi-scaffold00005	1349135	1349302	-	CAGTTTTGTGGACTTGGCTATGTTGCAACTGTAGTACCGTGCCACAATTGCAACCCATTAGATCCACTTGGATCCACTGTTGCAACCCTCATCCAAGTGGATCCAATGGCTGGTTGCAACTGTGGCACGGTACTACAGTTGCAACATAGCCGGACCCCAGTTTTGTTA	...............(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((.....((....))....))))))))))))).))))...)))))))).))))))))))))))))))))))))))))))).................	1349155	1349282	TGTTGCAACTGTAGTACCGTGCCACAATTGCAACCCATTAGATCCACTTGGATCCACTGTTGCAACCCTCATCCAAGTGGATCCAATGGCTGGTTGCAACTGTGGCACGGTACTACAGTTGCAACATA	((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((.....((....))....))))))))))))).))))...)))))))).))))))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN918	1349262	1349282	TGTTGCAACTGTAGTACCGTG	Csi-miRN918*	1349155	1349175	CGGTACTACAGTTGCAACATA		3
Csi-MIRN919	PmiREN004983	MIRN919	Citrus sinensis	Csi-scaffold00005	1973446	1973628	+	GTCGGCCCCCGGCGGAGTTATCGAATGGATAATGAACGTGTGATTAGTATTGCATCCATTTTCAACTTTTTGTTACATGTTTATAATAGAGGACTAGAGTGTAAAAAATCATAAATGTGGCAGATATTTATTTATTAGTGACCGTTCTGAATCGATGTCGAAAGAGTAGGATGGGATACGTTT	....................((((((.(((...(((((.((.(((((((.......((((((....(((((((((........)))))))))...)))))).........((((((((.....)))))))).))))))).)))))))...))).)).)))).............((.....))	1973466	1973608	TCGAATGGATAATGAACGTGTGATTAGTATTGCATCCATTTTCAACTTTTTGTTACATGTTTATAATAGAGGACTAGAGTGTAAAAAATCATAAATGTGGCAGATATTTATTTATTAGTGACCGTTCTGAATCGATGTCGAAA	((((((.(((...(((((.((.(((((((.......((((((....(((((((((........)))))))))...)))))).........((((((((.....)))))))).))))))).)))))))...))).)).))))..	Csi-miRN919	1973466	1973486	TCGAATGGATAATGAACGTGT	Csi-miRN919*	1973588	1973608	CGTTCTGAATCGATGTCGAAA		3
Csi-MIRN920	PmiREN004991	MIRN920	Citrus sinensis	Csi-scaffold00172	38623	38724	-	CATGAGCGATGGCCCATGTGGCCAGCTCTCATGAAGAGAGCTGTGCAGTGGGACCCAAAGCTTTCTTCATGAGAGCTGGCCACGTTGGCCATCACTCTCCAT	...(((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.(....).))....))))))))))))))))))))))))))).))))))).))).....	38643	38704	GCCAGCTCTCATGAAGAGAGCTGTGCAGTGGGACCCAAAGCTTTCTTCATGAGAGCTGGCCA	((((((((((((((((((((((((.(....).))....))))))))))))))))))))))..	Csi-miRN920	38643	38663	TTTCTTCATGAGAGCTGGCCA	Csi-miRN920*	38684	38704	GCCAGCTCTCATGAAGAGAGC		3
Csi-MIRN921	PmiREN004996	MIRN921	Citrus sinensis	Csi-scaffold01019	20409	20514	-	AGAGATCGTCATGTGTTGGGGAGTATTGGGTCCAAGACTTTTCAGATTGATGTTTTAAATGAAGAAGAAGCGTGGACTCTATTCAAGAAGATGACAGGTGACTGTG	.......(((((.(......(((((..(((((((.(.(((((((..((((....)))).)))....))))).))))))))))))....).)))))...........	20429	20494	GAGTATTGGGTCCAAGACTTTTCAGATTGATGTTTTAAATGAAGAAGAAGCGTGGACTCTATTCAA	(((((..(((((((.(.(((((((..((((....)))).)))....))))).))))))))))))..	Csi-miRN921	20429	20449	AGAAGCGTGGACTCTATTCAA	Csi-miRN921*	20474	20494	GAGTATTGGGTCCAAGACTTT		3
Csi-MIRN922	PmiREN004997	MIRN922	Citrus sinensis	Csi-scaffold01153	23064	23161	+	CAAAAATGAACCCAAAACCTTGAGAGCTAATGGAAGACCACTGGCATACTTTACTACGCTTTCAGCTAGCTCTACATATTCTTCGAAAGGCTTATGGG	..........((((.((((((((((((((.((((((.(...(((.........))).)))))))..))))))).))...........))).)).))))	23084	23141	TGAGAGCTAATGGAAGACCACTGGCATACTTTACTACGCTTTCAGCTAGCTCTACATA	(((((((((.((((((.(...(((.........))).)))))))..))))))).))..	Csi-miRN922	23084	23104	TGAGAGCTAATGGAAGACCAC	Csi-miRN922*	23121	23141	GCTTTCAGCTAGCTCTACATA		3
Csi-MIRN923	PmiREN004998	MIRN923	Citrus sinensis	Csi-scaffold03444	27	270	+	CCATATGCATCCCTTTCAATGTTCTTTCTCACCACCATTGTCTCCCCATTGCGGCTGACTTCTAAAAGCAGTTGTTCCAAACATGACATAATTGGAAGTAGGCTACGATGGAAAAAAGTTCTTCTTATAATCGATCATGTGATTGGTTCGGTCCAGGCTGCAGAATTCTAATAACAACGAGAGATAAACAGTTGTTGGTGGCGCATGAAGTGGATGAAGAGCATATTCTGAACCTTGATGTACT	.....((((((...(((((((((((...((((((((((((((.((((((((.((((.((((((((...(((((......))).))......)))))))).)))).))))))....(((.....)))..((((((((....))))))))((((....))))............((((((............)))))))).)))).)))..)))).))))))))))....))))....))))))..	47	250	GTTCTTTCTCACCACCATTGTCTCCCCATTGCGGCTGACTTCTAAAAGCAGTTGTTCCAAACATGACATAATTGGAAGTAGGCTACGATGGAAAAAAGTTCTTCTTATAATCGATCATGTGATTGGTTCGGTCCAGGCTGCAGAATTCTAATAACAACGAGAGATAAACAGTTGTTGGTGGCGCATGAAGTGGATGAAGAGCAT	(((((...((((((((((((((.((((((((.((((.((((((((...(((((......))).))......)))))))).)))).))))))....(((.....)))..((((((((....))))))))((((....))))............((((((............)))))))).)))).)))..)))).))))))))..	Csi-miRN923	230	250	CATGAAGTGGATGAAGAGCAT	Csi-miRN923*	47	67	GTTCTTTCTCACCACCATTGT		3
Csi-MIRN924	PmiREN004999	MIRN924	Citrus sinensis	Csi-scaffold03728	2155	2282	+	GCTATGGTGCAACGGTGATACGGTATCACCGTTGCATCCAGTCGTTGGATCCACGTGGATGAATGGATCTAGTGGGATCCAACGGCTGGGTGTGACGGTGATACCATATCACCGTTGCACCGTAACTT	.....(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((...(((((......)))))...))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))).......	2175	2262	CGGTATCACCGTTGCATCCAGTCGTTGGATCCACGTGGATGAATGGATCTAGTGGGATCCAACGGCTGGGTGTGACGGTGATACCATA	.(((((((((((((((((((((((((((((((...(((((......)))))...)))))))))))))))))))))))))))))))...	Csi-miRN924	2175	2195	CGGTATCACCGTTGCATCCAG	Csi-miRN924*	2242	2262	GGGTGTGACGGTGATACCATA		3
Csi-MIRN925	PmiREN005000	MIRN925	Citrus sinensis	Csi-scaffold05779	1847	1970	+	TAATGTGCAACTGTGGTATCGTACTACAGTTGCATCCAGCCGGTGGATCCACTTGGATGGTGGGGTCCATGAAGATCCAACGGCTTGTTGCAACTGTGGTACGGTACCACAGTTGCGCGACAGT	....((((((((((((((((((((((((((((((.(.(((((.((((((..(.(((((......))))).)..)))))).))))).).))))))))))))))))))))))))))))))......	1867	1950	GTACTACAGTTGCATCCAGCCGGTGGATCCACTTGGATGGTGGGGTCCATGAAGATCCAACGGCTTGTTGCAACTGTGGTACGG	((((((((((((((.(.(((((.((((((..(.(((((......))))).)..)))))).))))).).))))))))))))))..	Csi-miRN925	1930	1950	CTTGTTGCAACTGTGGTACGG	Csi-miRN925*	1867	1887	GTACTACAGTTGCATCCAGCC		3
Csi-MIRN926	PmiREN005001	MIRN926	Citrus sinensis	Csi-scaffold00039	188074	188307	-	CGCGAATTCTTGATGGTTTTGGAGGACAAGATGAAACGGTGTCGGAGTGCGGAGGATTTGTCGGCGGTGAAGGCGGAGTTGGAGGAAGTGAGAGTGAAGGTTTTGCAGAGACTTAAGCATATTGAAGAAGACGAATTCGTCACTTCTTTGCTCAATTGTTGATTCAATTTTGATGATGGACATTAATTAAATTAGGGTTTGATTTTGCTTCGATCAACTGATAGTTGATCAAGA	......(.((((((.....(.((((.((((((.((((..((((..(.(((.((.......)).))).)...))))((((..((((((((((((((....(((((.......................)))))..)))).))))))))))))))(((((......)))))((((((.....))))))..........)))).)))))))))).).(((((...))))))))))))	188094	188287	GGAGGACAAGATGAAACGGTGTCGGAGTGCGGAGGATTTGTCGGCGGTGAAGGCGGAGTTGGAGGAAGTGAGAGTGAAGGTTTTGCAGAGACTTAAGCATATTGAAGAAGACGAATTCGTCACTTCTTTGCTCAATTGTTGATTCAATTTTGATGATGGACATTAATTAAATTAGGGTTTGATTTTGCTTCGAT	.((((.((((((.((((..((((..(.(((.((.......)).))).)...))))((((..((((((((((((((....(((((.......................)))))..)))).))))))))))))))(((((......)))))((((((.....))))))..........)))).))))))))))...	Csi-miRN926	188267	188287	GGAGGACAAGATGAAACGGTG	Csi-miRN926*	188094	188114	AGGGTTTGATTTTGCTTCGAT		3
Csi-MIRN927	PmiREN005008	MIRN927	Citrus sinensis	Csi-scaffold00944	31988	32167	-	GTGAATGGATACTATTCATATGAGAGGATTGTAAGGTACATACATGCAACTTAGTATTAGCCTTCATAATTTGCTATTCATTTTTGAGGTTGACCTGATAGTCAATTCAAAATTTCGACTATTTTAAGTTTTAACCAATGCATATTTACAACCTCTCGAATAATATTAAAGAATCTTCCA	((((((((...))))))))..((((((.(((((((...(((..((((......))))((((...........)))).(((....)))((((((.(((((((((((........)).)))))))...))..)))))).)))....))))))))))))).......................	32008	32147	TGAGAGGATTGTAAGGTACATACATGCAACTTAGTATTAGCCTTCATAATTTGCTATTCATTTTTGAGGTTGACCTGATAGTCAATTCAAAATTTCGACTATTTTAAGTTTTAACCAATGCATATTTACAACCTCTCGAA	.((((((.(((((((...(((..((((......))))((((...........)))).(((....)))((((((.(((((((((((........)).)))))))...))..)))))).)))....)))))))))))))...	Csi-miRN927	32127	32147	TGAGAGGATTGTAAGGTACAT	Csi-miRN927*	32008	32028	GCATATTTACAACCTCTCGAA		3
Csi-MIRN928	PmiREN005009	MIRN928	Citrus sinensis	Csi-scaffold05422	2462	2549	+	ACACTTGCGACAAGCCCTCCAAGTACTTCGAGACAATGAGCTATTCCTCAAATTGGAGAAGTGCTCGTTTGCCCAACGAGAAGTGGAG	.....................((((((((....(((((((......))))..)))..)))))))).......................	2482	2529	AAGTACTTCGAGACAATGAGCTATTCCTCAAATTGGAGAAGTGCTCGT	.((((((((....(((((((......))))..)))..))))))))...	Csi-miRN928	2482	2501	AAGTACTTCGAGACAATGAG	Csi-miRN928*	2509	2529	TCAAATTGGAGAAGTGCTCGT		3
Csi-MIRN929	PmiREN005012	MIRN929	Citrus sinensis	Csi-scaffold00003	3020131	3020309	+	AGGCCAAGTAAGAAAATGGACGAATTGCCATGAACAGCGATCTCTTTATTGGGATGATTTTCTTTTACCAATAGTCTACAGTTGAAGAATTGGCGATGCAGGTGGCACATTGTACGTCAGAAAATCTCTATAGATAGATCGTGTTCATGGCATTTCTGCTACTATATTTAACGTATCTC	................(((..(((.(((((((((((.((((((.(((((..(((.((((((((.....((((........)))).......((((.(((((........))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).)))..)))...........(.....)	3020151	3020289	CGAATTGCCATGAACAGCGATCTCTTTATTGGGATGATTTTCTTTTACCAATAGTCTACAGTTGAAGAATTGGCGATGCAGGTGGCACATTGTACGTCAGAAAATCTCTATAGATAGATCGTGTTCATGGCATTTCTGC	.(((.(((((((((((.((((((.(((((..(((.((((((((.....((((........)))).......((((.(((((........))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).)))...	Csi-miRN929	3020151	3020172	CGAATTGCCATGAACAGCGATC	Csi-miRN929*	3020269	3020289	TCGTGTTCATGGCATTTCTGC		3
Csi-MIRN930	PmiREN005015	MIRN930	Citrus sinensis	Csi-scaffold02789	3069	3254	-	ACCTTCCTTGTACTCAACATTGCCGTCTCCTTGTATCTGCCCATTTCTTCATTTTCCTCGCGGCTTTGTCGAGGTAGGCTCGCGTGATGTCTGCTTCCTCATGCCATTCGCGGGCGAGCTTGTGTGCCGCGGGGCTTTTCCCTCCGTAAGTCGAGGCTATGGCATTGGGGGTCATGGGTTGGAATC	....................((((((..(((((.((.(((...............(((((((((.....((((.(..(((((((.((((...((........))))))))))))).).))))...)))))))))...........))).)))))))..))))))......................	3089	3234	TGCCGTCTCCTTGTATCTGCCCATTTCTTCATTTTCCTCGCGGCTTTGTCGAGGTAGGCTCGCGTGATGTCTGCTTCCTCATGCCATTCGCGGGCGAGCTTGTGTGCCGCGGGGCTTTTCCCTCCGTAAGTCGAGGCTATGGCATT	((((((..(((((.((.(((...............(((((((((.....((((.(..(((((((.((((...((........))))))))))))).).))))...)))))))))...........))).)))))))..))))))..	Csi-miRN930	3089	3110	CGTAAGTCGAGGCTATGGCATT	Csi-miRN930*	3214	3234	TGCCGTCTCCTTGTATCTGCC		3
Csi-MIRN931	PmiREN005016	MIRN931	Citrus sinensis	Csi-scaffold00005	2986152	2986282	-	GGTTACGGTGCAACTGTGGTACCGTGCCACAGTTACATCTAGTTGTTGGATGCACTTAGATTGATGGGGTCTACTGGCATCCAACGACTAAATGCAACTGTGGCACGGTACCACAGTTGCACCACATGCTT	......((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((((...((((((.....))))))...)))))))))))))).))).))))))))))))))))))))))))))))........	2986172	2986262	ACCGTGCCACAGTTACATCTAGTTGTTGGATGCACTTAGATTGATGGGGTCTACTGGCATCCAACGACTAAATGCAACTGTGGCACGGTAC	((((((((((((((.(((.((((((((((((((...((((((.....))))))...)))))))))))))).))).))))))))))))))..	Csi-miRN931	2986172	2986192	AATGCAACTGTGGCACGGTAC	Csi-miRN931*	2986242	2986262	ACCGTGCCACAGTTACATCTA		3
Csi-MIRN932	PmiREN005017	MIRN932	Citrus sinensis	Csi-scaffold00007	2110425	2110631	+	CTAAAATTTGATATCATTAGAATCCTTATTGTCGGGGCTACGTAATAGTATAATCATTACTAGCAAAAAGCTTCCATTCGCATTAAATTTATGATAAAAGTTTTGAAAGCTGAAATTTTGATCATGAACGAAAATTCCTCTGTCCAGGATAGTTGCACCATTGCGTAGCTTTGATAATAATGATTCTAGTGGCATTGAAATATAGTT	(((...((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((.((.((((.......(((.....)))....((((.......((((((((.(((((((((.....))))))))).))))))))))))...((((......))))..)))).)).))))))))))))))))))))).))))))))))).))))))...)))..	2110445	2110611	AATCCTTATTGTCGGGGCTACGTAATAGTATAATCATTACTAGCAAAAAGCTTCCATTCGCATTAAATTTATGATAAAAGTTTTGAAAGCTGAAATTTTGATCATGAACGAAAATTCCTCTGTCCAGGATAGTTGCACCATTGCGTAGCTTTGATAATAATGATTCT	((((.(((((((((((((((((((((.((.((((.......(((.....)))....((((.......((((((((.(((((((((.....))))))))).))))))))))))...((((......))))..)))).)).))))))))))))))))))))).))))..	Csi-miRN932	2110445	2110465	AATCCTTATTGTCGGGGCTAC	Csi-miRN932*	2110591	2110611	AGCTTTGATAATAATGATTCT		3
Csi-MIRN933	PmiREN005019	MIRN933	Citrus sinensis	Csi-scaffold00078	95728	95862	+	CAGGCTACGGTGCAATTATGGTACCATGCCACAGTTGCATCTAGTCGTTGGATGGACTTAGATTGGTGTGGTTCATTGACATCCAACGGCTGTATGCAACTGTGGCACAATACCACAGTTGCACCACAGGTTTCC	.((.((..(((((((((.(((((...((((((((((((((.(((((((((((((........((((((.....))))))))))))))))))).))))))))))))))...))))).)))))))))..)).))...	95748	95842	GTACCATGCCACAGTTGCATCTAGTCGTTGGATGGACTTAGATTGGTGTGGTTCATTGACATCCAACGGCTGTATGCAACTGTGGCACAATACCA	(((...((((((((((((((.(((((((((((((........((((((.....))))))))))))))))))).))))))))))))))...)))..	Csi-miRN933	95822	95842	TGCAACTGTGGCACAATACCA	Csi-miRN933*	95748	95768	GTACCATGCCACAGTTGCATC		3
Csi-MIRN934a	PmiREN005020	MIRN934	Citrus sinensis	Csi-scaffold00095	222875	222968	-	CACAAACGGATGGACAAACCGAGCGCATCAATAGCCTACTCGAGATGTATCTTAGGCATTATGTGAGCGCTCACCAGCGAGATTGAGCGAAGTT	(......)............((((((.(((((((((((...((......)).)))))..))).)))))))))......................	222895	222948	GAGCGCATCAATAGCCTACTCGAGATGTATCTTAGGCATTATGTGAGCGCTCAC	((((((.(((((((((((...((......)).)))))..))).)))))))))..	Csi-miRN934a	222895	222915	AGGCATTATGTGAGCGCTCAC	Csi-miRN934a*	222928	222948	GAGCGCATCAATAGCCTACTC		3
Csi-MIRN934b	PmiREN005029	MIRN934	Citrus sinensis	Csi-scaffold00386	120677	120770	+	TGCAAACGAATGGACAAACTGAGCGCATCAATAGCCTACTCGAGATGTATCTTAGGCATTATGTGAGCGCTCACCAGCGAGATTGGGCCAAGTT	...................(((((((.(((((((((((...((......)).)))))..))).)))))))))).....................	120697	120750	GAGCGCATCAATAGCCTACTCGAGATGTATCTTAGGCATTATGTGAGCGCTCAC	((((((.(((((((((((...((......)).)))))..))).)))))))))..	Csi-miRN934b	120730	120750	AGGCATTATGTGAGCGCTCAC	Csi-miRN934b*	120697	120717	GAGCGCATCAATAGCCTACTC		3
Csi-MIRN934c	PmiREN005034	MIRN934	Citrus sinensis	Csi-scaffold00988	39117	39210	-	CGCAAACGGATGGACAAACCGAGCGCATCAATAGCCTACTCGAGATGTATCTTAGGCATTATGTGAGCGCTCACCAGCGAGATTGGGTGAAGTT	((....))............((((((.(((((((((((...((......)).)))))..))).)))))))))......................	39137	39190	GAGCGCATCAATAGCCTACTCGAGATGTATCTTAGGCATTATGTGAGCGCTCAC	((((((.(((((((((((...((......)).)))))..))).)))))))))..	Csi-miRN934c	39137	39157	AGGCATTATGTGAGCGCTCAC	Csi-miRN934c*	39170	39190	GAGCGCATCAATAGCCTACTC		3
Csi-MIRN934d	PmiREN005038	MIRN934	Citrus sinensis	Csi-scaffold06651	526	619	-	CGCAAACGGATGGACAAACCGAGCGCATCAATAGCCTACTCGAGATGTATCTTAGGCATTATGTGAGCGCTCACCAGCGAGATTGGGCGAAGTT	((....))............((((((.(((((((((((...((......)).)))))..))).)))))))))......................	546	599	GAGCGCATCAATAGCCTACTCGAGATGTATCTTAGGCATTATGTGAGCGCTCAC	((((((.(((((((((((...((......)).)))))..))).)))))))))..	Csi-miRN934d	546	566	AGGCATTATGTGAGCGCTCAC	Csi-miRN934d*	579	599	GAGCGCATCAATAGCCTACTC		3
Csi-MIRN935a	PmiREN005021	MIRN935	Citrus sinensis	Csi-scaffold00103	240834	240956	+	ACGGTGCAATTGTGGTATCGTGCCATAGTTGCATCCAGCCGTTGGATGCACTCGAATAGATGGGGTTCATTAGCATCTAACGGCTGAATGCAACTGTGGCACAGTACCATAGTTGCACCACAG	..((((((((((((((((.(((((((((((((((.((((((((((((((....((((.......))))....)))))))))))))).))))))))))))))).))))))))))))))))....	240854	240936	TGCCATAGTTGCATCCAGCCGTTGGATGCACTCGAATAGATGGGGTTCATTAGCATCTAACGGCTGAATGCAACTGTGGCACA	((((((((((((((.((((((((((((((....((((.......))))....)))))))))))))).))))))))))))))..	Csi-miRN935a	240916	240936	GCTGAATGCAACTGTGGCACA	Csi-miRN935a*	240854	240874	TGCCATAGTTGCATCCAGCCG		3
Csi-MIRN935b	PmiREN005025	MIRN935	Citrus sinensis	Csi-scaffold00189	145860	145982	-	TTAGTGCAACTGTGGTACCGTGCCATAGTTGCATCCAACCGTTGGATGCCAGTGAACTCTACCAATCTAAGTGCATCAAATGGCTGAATGCAACTGTGGCACATTGACCTCACCAATCTAAAT	...((((.......)))).(((((((((((((((.((.(((((.((((((...((..........))...).))))).))))).)).))))))))))))))).....................	145880	145962	TGCCATAGTTGCATCCAACCGTTGGATGCCAGTGAACTCTACCAATCTAAGTGCATCAAATGGCTGAATGCAACTGTGGCACA	((((((((((((((.((.(((((.((((((...((..........))...).))))).))))).)).))))))))))))))..	Csi-miRN935b	145880	145900	GCTGAATGCAACTGTGGCACA	Csi-miRN935b*	145942	145962	TGCCATAGTTGCATCCAACCG		3
Csi-MIRN935c	PmiREN005035	MIRN935	Citrus sinensis	Csi-scaffold01199	33436	33558	+	GTGGTGCAACTGTGGTACCGTGCCACAGTTGCATCCAACTGTTGGATGCCAGTAGACTCTACTCATTTAAGTGCATTTAACGGCTGAATGCAACTGTGGCACAGTACCACAGTTACACTGTAG	((((((.(((((((((((.(((((((((((((((.((.(((((((((((((((((...))))).......).))))))))))).)).))))))))))))))).))))))))))).))))))..	33456	33538	TGCCACAGTTGCATCCAACTGTTGGATGCCAGTAGACTCTACTCATTTAAGTGCATTTAACGGCTGAATGCAACTGTGGCACA	((((((((((((((.((.(((((((((((((((((...))))).......).))))))))))).)).))))))))))))))..	Csi-miRN935c	33518	33538	GCTGAATGCAACTGTGGCACA	Csi-miRN935c*	33456	33476	TGCCACAGTTGCATCCAACTG		3
Csi-MIRN936	PmiREN005022	MIRN936	Citrus sinensis	Csi-scaffold01617	5747	5936	-	CAAGTTTACAGTAAAGATAGATAGATAAAGATTAATGACTGTAGTTTAATTATGCAAATACAATATACATATCTGTCATAAATTATTATGAAATGTGGTAAAAGTTTAATTATTTTAAATCATGATAAATATGAATAATTAAACTACAGTTGTTAATTCGTTGTCTACTTATTTTCGCTGTTAGCTTGGC	((((((.(((((.(((((((.(((((((.((((((((((((((((((((((((......................(((((..(((((((((.....(((((........))))).....))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))..))))))).))))))).))))).))))))..	5767	5916	ATAGATAAAGATTAATGACTGTAGTTTAATTATGCAAATACAATATACATATCTGTCATAAATTATTATGAAATGTGGTAAAAGTTTAATTATTTTAAATCATGATAAATATGAATAATTAAACTACAGTTGTTAATTCGTTGTCTACTT	.(((((((.((((((((((((((((((((((((......................(((((..(((((((((.....(((((........))))).....))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))..)))))))...	Csi-miRN936	5897	5916	ATAGATAAAGATTAATGACT	Csi-miRN936*	5767	5787	TTGTTAATTCGTTGTCTACTT		3
Csi-MIRN937	PmiREN005023	MIRN937	Citrus sinensis	Csi-scaffold00123	296961	297119	+	TTGTACAAATTATATTTTGTACTAACTGATGGGGCATTACATGATTGCTTGAATGAAAATATAAAATAATAAAAATAAATCATGTGGGCCAAGTGATGTCTTCATTTAACCATTCATGTGATGCCACATCAGTTTGTACAAAGTCATTTGGACAAAAGA	((((.(((((...(((((((((.((((((((.((((((((((((.((.(((((((((.....................(((((.((...)).)))))...))))))))).)).)))))))))))).)))))))).))))))))).))))).))))....	296981	297099	ACTAACTGATGGGGCATTACATGATTGCTTGAATGAAAATATAAAATAATAAAAATAAATCATGTGGGCCAAGTGATGTCTTCATTTAACCATTCATGTGATGCCACATCAGTTTGTAC	((.((((((((.((((((((((((.((.(((((((((.....................(((((.((...)).)))))...))))))))).)).)))))))))))).)))))))).))..	Csi-miRN937	296981	297001	ACTAACTGATGGGGCATTACA	Csi-miRN937*	297079	297099	TGATGCCACATCAGTTTGTAC		3
Csi-MIRN938	PmiREN005031	MIRN938	Citrus sinensis	Csi-scaffold00548	80293	80398	-	ATCAATACTTTGATGCCATGGGTGTGCGCGACGAGGCATCGAAAGTGGTCACAACACCCACTTATCTTCGAGGCGCTGCACAACTATGGTGGTGTCAGAAGCATGG	(((((....)))))(((((((((((((((..(((((.((...((((((.........)))))))))))))..)))).))))..)))))))................	80313	80378	GGTGTGCGCGACGAGGCATCGAAAGTGGTCACAACACCCACTTATCTTCGAGGCGCTGCACAACTA	(((((((((..(((((.((...((((((.........)))))))))))))..)))).))))..)..	Csi-miRN938	80313	80334	TCTTCGAGGCGCTGCACAACTA	Csi-miRN938*	80358	80378	GGTGTGCGCGACGAGGCATCG		3
Csi-MIRN939	PmiREN005036	MIRN939	Citrus sinensis	Csi-scaffold04700	2784	2960	-	CAAACTCGAGTGATGTGCGGCGCGCCACATTGATGTGCCAAAGCCCGACACCTACAATGGCACACGCACTGCCACAATCGTGGACAACTTCCTATTTGGGCTCGATCAATACTTTGATGCCATGGGTGTTCGAGATGAGGCATCGAAAGTGGGCACTGCACCCACCTATCTTAGAGG	.......(.(((..((((((.((.((((.(((((((..((...(.((((((((...(((((.........(((.(((....(((.....)))...))))))...(((((....))))))))))))))).))).).))..)))))))..)))))).)))))).))))...........	2804	2940	CGCGCCACATTGATGTGCCAAAGCCCGACACCTACAATGGCACACGCACTGCCACAATCGTGGACAACTTCCTATTTGGGCTCGATCAATACTTTGATGCCATGGGTGTTCGAGATGAGGCATCGAAAGTGGGCACT	.((.((((.(((((((..((...(.((((((((...(((((.........(((.(((....(((.....)))...))))))...(((((....))))))))))))))).))).).))..)))))))..))))))...	Csi-miRN939	2804	2825	TGAGGCATCGAAAGTGGGCACT	Csi-miRN939*	2920	2940	CGCGCCACATTGATGTGCCAA		3
Csi-MIRN940	PmiREN005037	MIRN940	Citrus sinensis	Csi-scaffold05047	1310	1458	+	CGACGGGAGCAAAGCATGTATGGTACCCACGGAGCGAGGCAAGTCCGAGGAGAAGACACTCTCCGCCATGCAATTCAAAAGGGCTTTCAAGAAGGACCCAAGCTTCTTGGTCTCCATCCGGGAACTAAACAAGGAAGGAAAGAGCAGAA	................(((.((((.(((..(((..(((((((((((..(((((......)))))................)))))).(((((((........))))))))))))..)))))).)))).)))..................	1330	1438	TGGTACCCACGGAGCGAGGCAAGTCCGAGGAGAAGACACTCTCCGCCATGCAATTCAAAAGGGCTTTCAAGAAGGACCCAAGCTTCTTGGTCTCCATCCGGGAACTAAA	((((.(((..(((..(((((((((((..(((((......)))))................)))))).(((((((........))))))))))))..)))))).))))..	Csi-miRN940	1330	1351	TGGTACCCACGGAGCGAGGCAA	Csi-miRN940*	1418	1438	GGTCTCCATCCGGGAACTAAA		3
Csi-MIRN941	PmiREN005040	MIRN941	Citrus sinensis	Csi-scaffold00008	132090	132200	-	AGAAGAGGGGAAATTTCGGGAATGGGTGCATGGGCAAGAGAAGGAGAAAAAGAAAATATAAACTTCCTTTCTTACCTATGCCACCCATTCCTTTGATTTCCTTCACTTCCT	.((((.(((((((((..(((((((((((((((((.((((((.((((.................)))))))))).)))))).)))))))))))..)))))))))..))))..	132110	132180	AATGGGTGCATGGGCAAGAGAAGGAGAAAAAGAAAATATAAACTTCCTTTCTTACCTATGCCACCCATTCC	((((((((((((((.((((((.((((.................)))))))))).)))))).))))))))..	Csi-miRN941	132160	132180	AATGGGTGCATGGGCAAGAGA	Csi-miRN941*	132110	132130	CTTACCTATGCCACCCATTCC		3
Csi-MIRN942	PmiREN005041	MIRN942	Citrus sinensis	Csi-scaffold00013	2086384	2086578	-	TGTATGCTCACCACCAATGCTTCTAAACTTTTCCTCAAAGACAACCCTTTGAGCTTAACCCGTTGAACTCTGGTCAGTGCCATAGCTAAAAGGGCGTTGTCAAAATGGGATCTAGCATGGCTAGTATGAAAAGTGTTAAGCTCAAAGTGTTGTCTTTGAGGAGGAGCTTAGAAGCATTGGTGAGACCGCTTGTGG	...........(((((((((((((((.((((((((((((((((((.(((((((((((((.(........(((((((.(((.....(((....(((...)))....)))......))))))))))........).))))))))))))).)))))))))))))))))).)))))))))))))))...((......))	2086404	2086558	TTCTAAACTTTTCCTCAAAGACAACCCTTTGAGCTTAACCCGTTGAACTCTGGTCAGTGCCATAGCTAAAAGGGCGTTGTCAAAATGGGATCTAGCATGGCTAGTATGAAAAGTGTTAAGCTCAAAGTGTTGTCTTTGAGGAGGAGCTTAGAAGC	((((((.((((((((((((((((((.(((((((((((((.(........(((((((.(((.....(((....(((...)))....)))......))))))))))........).))))))))))))).)))))))))))))))))).))))))..	Csi-miRN942	2086404	2086424	TTTGAGGAGGAGCTTAGAAGC	Csi-miRN942*	2086538	2086558	TTCTAAACTTTTCCTCAAAGA		3
Csi-MIRN943	PmiREN005042	MIRN943	Citrus sinensis	Csi-scaffold00015	695971	696085	+	CCCCTAAGTTACGTTTAACGTAGCTTACGCCACACACAGCAACAGTACCACATTGGTGGGACCCGCTACTGTTGCTGTGTGTAATGTAAGTTACGTTAAACATAATTTAACACTG	(...(((((((.(((((((((((((((((..((((((((((((((((((((....)))).......))))))))))))))))..))))))))))))))))).))))))).....)	695991	696065	TAGCTTACGCCACACACAGCAACAGTACCACATTGGTGGGACCCGCTACTGTTGCTGTGTGTAATGTAAGTTACG	(((((((((..((((((((((((((((((((....)))).......))))))))))))))))..)))))))))..	Csi-miRN943	695991	696011	TAGCTTACGCCACACACAGCA	Csi-miRN943*	696045	696065	CTGTGTGTAATGTAAGTTACG		3
Csi-MIRN944	PmiREN005052	MIRN944	Citrus sinensis	Csi-scaffold00163	271524	271617	+	GATAAATGGGCAGTCCATTCGCGCGCTACTAGACACGGGAGCGACACACAACTTCGTGTCCGTAGACGAGGCCAAGCGCTTAGGCCTCAAGGCC	....................((.((((((..((((((((.............)))))))).)))).))..))..........((((....))))	271544	271597	GCGCGCTACTAGACACGGGAGCGACACACAACTTCGTGTCCGTAGACGAGGCCA	((.((((((..((((((((.............)))))))).)))).))..))..	Csi-miRN944	271576	271597	TTCGTGTCCGTAGACGAGGCCA	Csi-miRN944*	271544	271564	GCGCGCTACTAGACACGGGAG		3
Csi-MIRN945	PmiREN005053	MIRN945	Citrus sinensis	Csi-scaffold00439	112597	112766	-	ACACCCTTTCTCTCAATTCACAAGTATTGAAGAAAGAACACTCAGGTTATTTGAATTCCTCAAGTAGGAATTGAACCTCACAAATAGTTACTGAAAGCTCTTAATTAATGCTTGTAAGAAGCTCACAATTGTTTTTCTTCGATACTTAAACAAATGGAACCATAAGCTAT	.....................((((((((((((((((.((.((((.((((((((((((((.....)))))))........)))))))...)))).((((((((...........)))).))))......)))))))))))))))))).......................	112617	112746	CAAGTATTGAAGAAAGAACACTCAGGTTATTTGAATTCCTCAAGTAGGAATTGAACCTCACAAATAGTTACTGAAAGCTCTTAATTAATGCTTGTAAGAAGCTCACAATTGTTTTTCTTCGATACTTAAA	.((((((((((((((((.((.((((.((((((((((((((.....)))))))........)))))))...)))).((((((((...........)))).))))......))))))))))))))))))...	Csi-miRN945	112726	112746	CAAGTATTGAAGAAAGAACAC	Csi-miRN945*	112617	112637	TGTTTTTCTTCGATACTTAAA		3
Csi-MIRN946	PmiREN005056	MIRN946	Citrus sinensis	Csi-scaffold00748	9681	9840	+	GCTACGTTGTCCGTCATTATCGTGAAGTGTGAGCCAAGCAAGTAATGTCACCACACTCTTAGACAATAGATGATGGCTGTCATCTCATTTTCTTGCACCGTGTAGCGGCGTTCCGTATTGTTTAGCTTTCGACTCTCGAACGTTATGGGGTGGCCTTCTT	...................(((.((..((.((((.((((((..((((((.(.((((....(((.((((((((((....))))))).))).)))......)))).).)))))).....)))))).)))).))..)).))).....................	9701	9820	CGTGAAGTGTGAGCCAAGCAAGTAATGTCACCACACTCTTAGACAATAGATGATGGCTGTCATCTCATTTTCTTGCACCGTGTAGCGGCGTTCCGTATTGTTTAGCTTTCGACTCTCGAA	((.((..((.((((.((((((..((((((.(.((((....(((.((((((((((....))))))).))).)))......)))).).)))))).....)))))).)))).))..)).))..	Csi-miRN946	9701	9722	CGTGAAGTGTGAGCCAAGCAAG	Csi-miRN946*	9800	9820	GTTTAGCTTTCGACTCTCGAA		3
Csi-MIRN947	PmiREN005063	MIRN947	Citrus sinensis	Csi-scaffold00948	7915	8017	-	CAGAAGCTTTCGAGGAGTTTAGGATTGCCAGAGCCATAGTTGAAGCTTTAGATGTTTCTTCTTCTGGTCTAGGCGAATTTCAATCTCTTCTTAAAACTATATC	...........((((((.((.(((((((((((.(((.((..(((((.......)))))..))..)))))).))).))))).)).)))))).............	7935	7997	AGGATTGCCAGAGCCATAGTTGAAGCTTTAGATGTTTCTTCTTCTGGTCTAGGCGAATTTCAA	.(((((((((((.(((.((..(((((.......)))))..))..)))))).))).)))))...	Csi-miRN947	7935	7955	TCTGGTCTAGGCGAATTTCAA	Csi-miRN947*	7977	7997	AGGATTGCCAGAGCCATAGTT		3
Csi-MIRN948	PmiREN005066	MIRN948	Citrus sinensis	Csi-scaffold00120	72699	72845	+	TGCAAAGAGGTAGAGAAGTCCCGCAGGGGCGACATGAGATCACATGCAACGCATTGCCTAATGCCTATACATGTGGTGTGGTGGGAGTGTTTGTGTTTATGTGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGTGGGATTTCTTCTACCATTTTTTTT	...((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((.((((((..((((..((((.((((.....))))))))..)).)).))))))..)))))).))))).))))))))))))))))))).)))))).)))))...	72719	72825	CCGCAGGGGCGACATGAGATCACATGCAACGCATTGCCTAATGCCTATACATGTGGTGTGGTGGGAGTGTTTGTGTTTATGTGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGTGGGA	(((((((((((((.(((((.((((((.((((((..((((..((((.((((.....))))))))..)).)).))))))..)))))).))))).)))))))))))))..	Csi-miRN948	72719	72739	CCGCAGGGGCGACATGAGATC	Csi-miRN948*	72805	72825	TCTCAGGTCGCCCCTGTGGGA		3
Csi-MIRN949	PmiREN005068	MIRN949	Citrus sinensis	Csi-scaffold02079	3486	3574	-	GTAGACTCTTGTTTGTTGCTTGTGGATGATAGTGGTGACAATTTTTCCATGCATGATGTTGTTCGCGATGTTGCTATTTCAATTGCATG	..............((.((((((((((((((.(.(((.((.........))))).))))))))))))).)).))...............	3506	3554	TGTGGATGATAGTGGTGACAATTTTTCCATGCATGATGTTGTTCGCGAT	(((((((((((.(.(((.((.........))))).))))))))))))..	Csi-miRN949	3506	3526	ATGCATGATGTTGTTCGCGAT	Csi-miRN949*	3534	3554	TGTGGATGATAGTGGTGACAA		3
Csi-MIRN950	PmiREN005069	MIRN950	Citrus sinensis	Csi-scaffold00079	83723	83876	+	ATGAAGAAAGAACCTTGTTTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTTGCTTTTAAAGAAAGGTCTCTCAACTTTAGCTTAGCTACATATTTAGCTAGTATCCTTGTGCAGGTTCCAAGGCAAGTCGTCTTTGGCTATTTTGACAGGCTCTTATTATTC	.......((((.(((.(((.((((((((((((((((((((((((..........((((.............(((.(((((......))))))))..))))..........))))))))))))))))))))))))..)))))).)))).......	83743	83856	ATAGCCAAGGATGACTTGCCTTGCTTTTAAAGAAAGGTCTCTCAACTTTAGCTTAGCTACATATTTAGCTAGTATCCTTGTGCAGGTTCCAAGGCAAGTCGTCTTTGGCTATTT	(((((((((((((((((((((((..........((((.............(((.(((((......))))))))..))))..........)))))))))))))))))))))))).	Csi-miRN950	83837	83856	CAAGTCGTCTTTGGCTATTT	Csi-miRN950*	83743	83763	ATAGCCAAGGATGACTTGCCT		3
Csi-MIRN951	PmiREN005070	MIRN951	Citrus sinensis	Csi-scaffold00089	503307	503503	-	GAACTCCTCCCAAGTTTGTTGGCAGCCATTTGCTAGTTTTGACTTATTTGTATATTTTCTCTCTCTGGCGGTAATAAGGGTTTTAATGTATCCGAGGGCTCGGTATTATGATGTCATTTACAGGTGGTGGGGTTGCGCTTTTTCATGCCTCAAAGTAGCTGGACAAATTGCAAACTACAAGCTTAGGTGGAAAGATT	....(((.((.((((((((.(...((.(((((((((((...(((((((((((.......((....((.((((.....((((........))))....)).)).))....)).......)))))))..((((((.............)))))))))))))))).))))).))...).)))))))).)).)))......	503327	503483	GGCAGCCATTTGCTAGTTTTGACTTATTTGTATATTTTCTCTCTCTGGCGGTAATAAGGGTTTTAATGTATCCGAGGGCTCGGTATTATGATGTCATTTACAGGTGGTGGGGTTGCGCTTTTTCATGCCTCAAAGTAGCTGGACAAATTGCAAACTA	(...((.(((((((((((...(((((((((((.......((....((.((((.....((((........))))....)).)).))....)).......)))))))..((((((.............)))))))))))))))).))))).))...)..	Csi-miRN951	503327	503347	AGCTGGACAAATTGCAAACTA	Csi-miRN951*	503463	503483	GGCAGCCATTTGCTAGTTTTG		3
Csi-MIRN952	PmiREN005071	MIRN952	Citrus sinensis	Csi-scaffold00133	98705	98823	+	TAGGCATTATGCCTACCTTTGATGCCTCATCTCGGACACCTATGTCATCAAAGTATTGTTTTAGTCTGAAGAGAAAATTGTCTATGATGGTGGCATTGTGTGCACCATCGTAGGTGTCG	((((((...)))))).....(((((((((((..(((((....(.((.(((.(.((......)).).))).)).)....)))))..))))).))))))....(((((......)))))..	98725	98803	GATGCCTCATCTCGGACACCTATGTCATCAAAGTATTGTTTTAGTCTGAAGAGAAAATTGTCTATGATGGTGGCATTGT	(((((((((((..(((((....(.((.(((.(.((......)).).))).)).)....)))))..))))).))))))..	Csi-miRN952	98725	98744	GATGCCTCATCTCGGACACC	Csi-miRN952*	98783	98803	TGTCTATGATGGTGGCATTGT		3
Csi-MIRN953	PmiREN005072	MIRN953	Citrus sinensis	Csi-scaffold00628	50811	51046	-	AATTCCTTGACACACCAAACAGTTTTGATTTTGTCATTTGGATAGTGGTGTCCAAGGACTTACAACTTGCAAAGATTCAAGAAGGTATTGCAAAAAAAATGGGTTTGTTTAACGAGTCATGGCAGAGTAAAGGCCTTGAAGAGAAAGCAAATAAAATATTCAAGATCTTGAGCAAGAAAAAGTTTGTGTTACTGTTGGATGACATATGGGAGCTGGTTGATTTAGCTCAAGTGGGG	......(((......))).(((((((.((..(((((((..((((((((....((.((((((....(((((.((((((...((..(((((.............((((((((......(((.(((.........))).))).....))))))))..)))))))..))))))..)))))...)))))).)))))))))).))))))).)).)))))))..........(((.....)))	50831	51026	AGTTTTGATTTTGTCATTTGGATAGTGGTGTCCAAGGACTTACAACTTGCAAAGATTCAAGAAGGTATTGCAAAAAAAATGGGTTTGTTTAACGAGTCATGGCAGAGTAAAGGCCTTGAAGAGAAAGCAAATAAAATATTCAAGATCTTGAGCAAGAAAAAGTTTGTGTTACTGTTGGATGACATATGGGAGCTGG	((((((.((..(((((((..((((((((....((.((((((....(((((.((((((...((..(((((.............((((((((......(((.(((.........))).))).....))))))))..)))))))..))))))..)))))...)))))).)))))))))).))))))).)).))))))..	Csi-miRN953	50831	50851	TGGATGACATATGGGAGCTGG	Csi-miRN953*	51006	51026	AGTTTTGATTTTGTCATTTGG		3
Csi-MIRN954	PmiREN005074	MIRN954	Citrus sinensis	Csi-scaffold00019	79185	79332	-	TATACAAAAGCAATCGTCGTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCGATCCATATATAACGTACATATGCTCAAATGAGTGGTGATGGATCGACGCTGAAGCCCTTAGGGCAGAGTGATCGACTCCGGCTTTCTCATTTTCCTTTTTC	......(((((....((((.(((((((((((.(((((((((.(.(((((((((..........(((..((((....)))).)))))))))))).)..))))))))))))).))))))).))))....)))))................	79205	79312	TCGTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCGATCCATATATAACGTACATATGCTCAAATGAGTGGTGATGGATCGACGCTGAAGCCCTTAGGGCAGAGTGATCGACT	(((.(((((((((((.(((((((((.(.(((((((((..........(((..((((....)))).)))))))))))).)..))))))))))))).))))))).)))..	Csi-miRN954	79205	79224	TTAGGGCAGAGTGATCGACT	Csi-miRN954*	79292	79312	TCGTTCACTCTCCCTCAAGGG		3
Csi-MIRN955a	PmiREN005094	MIRN955	Citrus sinensis	Csi-scaffold00009	1114018	1114131	+	TTGGGGCAGCTGCGCTGCCACCGCGCAGCTGCTTCCCAGGCCAATTCTAGGGGAATATTTCCCTAAAATTGGCATGGGGAGTAGCTGCGCGGTGGCAGCGCAGCTGCCCCAAAC	....................((((((((((((((((((.(((((((.(((((((....))))))).))))))).))))))))))))))))))......................	1114038	1114111	CCGCGCAGCTGCTTCCCAGGCCAATTCTAGGGGAATATTTCCCTAAAATTGGCATGGGGAGTAGCTGCGCGGTG	((((((((((((((((((.(((((((.(((((((....))))))).))))))).))))))))))))))))))..	Csi-miRN955a	1114091	1114111	ATGGGGAGTAGCTGCGCGGTG	Csi-miRN955a*	1114038	1114058	CCGCGCAGCTGCTTCCCAGGC		3
Csi-MIRN955b	PmiREN005103	MIRN955	Citrus sinensis	Csi-scaffold00003	1252089	1252203	+	TTGGAGCAATTGTGTTGTCACTGCGCAGCTGCTCCACATGCTATATTCGAGGGGAATATTTCCCTAAAATAGACATGGGGAGTAGCTGCGCGGTGGCAGCATAGCTACCCCAAAT	....................(((((((((((((((.((((((((.....((((((....))))))...)))).)))).)))))))))))))))......................	1252109	1252183	CTGCGCAGCTGCTCCACATGCTATATTCGAGGGGAATATTTCCCTAAAATAGACATGGGGAGTAGCTGCGCGGTG	(((((((((((((((.((((((((.....((((((....))))))...)))).)))).)))))))))))))))..	Csi-miRN955b	1252163	1252183	ATGGGGAGTAGCTGCGCGGTG	Csi-miRN955b*	1252109	1252129	CTGCGCAGCTGCTCCACATGC		3
Csi-MIRN956	PmiREN005095	MIRN956	Citrus sinensis	Csi-scaffold07555	2119	2337	+	TCCCTCCTCGTTTCTCCTCCTTTGGCGCATTTACAGTGGCGCTATTTTGCATACTCTGAGAAAAATTTATTTTTGGTTTTTGTTGTGTTTGTTTTTTGTTGGTTGATGTTTGCATTTGGTGGTTGATGTGTGGTGGATGGTGCTTGGTATGGACATGTTGCTGTTTGGGAAACTTGTGGCTTGCTGGATGTGTTGTTGGGGGCTTGTGGATATGTTGTT	.......................((((((((..((((((.((((((((.((.((...((.(((((((.......))))))).))((((((((.....(((.(((.((....(((((........)))))...)).))).).)).....))))))))......)).)).)))....))))))))))))))))))).........................	2139	2317	TTTGGCGCATTTACAGTGGCGCTATTTTGCATACTCTGAGAAAAATTTATTTTTGGTTTTTGTTGTGTTTGTTTTTTGTTGGTTGATGTTTGCATTTGGTGGTTGATGTGTGGTGGATGGTGCTTGGTATGGACATGTTGCTGTTTGGGAAACTTGTGGCTTGCTGGATGTGTTGTTGG	...((((((((..((((((.((((((((.((.((...((.(((((((.......))))))).))((((((((.....(((.(((.((....(((((........)))))...)).))).).)).....))))))))......)).)).)))....))))))))))))))))))).....	Csi-miRN956	2297	2317	GCTTGCTGGATGTGTTGTTGG	Csi-miRN956*	2139	2159	TTTGGCGCATTTACAGTGGCG		3
Csi-MIRN957	PmiREN005098	MIRN957	Citrus sinensis	Csi-scaffold00377	169778	169968	+	ACTTGTGTTGAGACTTGATTTATGGATGTAGATTATTCTAATGGATATACATTTATGTTATATTTATATGTTTAGCCATAAGTAATTGTTGATCTATGGCAAAGTGAATATGCACTACATTTATATGGATGAAATGAAGTATACTATTTTGGATTTGATTTGTCTCGTCGTAAGTTTCGAAACGGTATATT	........................(((((((((((.((((((((.(((((.(((((....((((((((((....((((((.((........)).))))))..((((......)))).....))))))))))..))))))))))))))..))))..)))))))...))))......................	169798	169948	TATGGATGTAGATTATTCTAATGGATATACATTTATGTTATATTTATATGTTTAGCCATAAGTAATTGTTGATCTATGGCAAAGTGAATATGCACTACATTTATATGGATGAAATGAAGTATACTATTTTGGATTTGATTTGTCTCGTCGT	....(((((((((((.((((((((.(((((.(((((....((((((((((....((((((.((........)).))))))..((((......)))).....))))))))))..))))))))))))))..))))..)))))))...))))..	Csi-miRN957	169927	169948	TGGATTTGATTTGTCTCGTCGT	Csi-miRN957*	169798	169818	TATGGATGTAGATTATTCTAA		3
Csi-MIRN4413	PmiREN005065	MIRN4413	Citrus sinensis	Csi-scaffold00007	2039139	2039388	-	TAAATGTGAGGGAGGGGGGTGTGTGTGTGGGTGTGGGTGTGTGTGTGTGATGACTGAAGCTAGTGAAGTAGTCCTGGGGGTGGATGGAAACAATCTCATTTGATTAAGGATACGCTTTGTTATGGATCCAAGATTTGATGGAGGACATTTGGGGCGATGCTCCTCTTATGTATATTTTTGTCTCAGTAATATGAGATTTTCTAATAAAGAAATGCCTATAACAGATACATCAAGCTCGTTACATGGTA	...((((((..(((...(((((((.(((...(((((((((.......(.(((((.(((((..((....(((((.(((((.((........)).)))))...)))))...))..)))))))))).).((((........))))..((((..(((((...)))))....))))........((((((......)))))).((((.....)))))))))))))))).)))))))...))).)))))).... .	2039159	2039368	GTGTGTGTGGGTGTGGGTGTGTGTGTGTGATGACTGAAGCTAGTGAAGTAGTCCTGGGGGTGGATGGAAACAATCTCATTTGATTAAGGATACGCTTTGTTATGGATCCAAGATTTGATGGAGGACATTTGGGGCGATGCTCCTCTTATGTATATTTTTGTCTCAGTAATATGAGATTTTCTAATAAAGAAATGCCTATAACAGATACAT	((((.(((...(((((((((.......(.(((((.(((((..((....(((((.(((((.((........)).)))))...)))))...))..)))))))))).).((((........))))..((((..(((((...)))))....))))........((((((......)))))).((((.....)))))))))))))))).))))..	Csi-miRN4413	2039348	2039368	GTGTGTGTGGGTGTGGGTGTG	Csi-miRN4413*	2039159	2039179	AAATGCCTATAACAGATACAT		3
Csi-MIRN4425	PmiREN004754	MIRN4425	Citrus sinensis	Csi-scaffold00034	800816	800939	-	GCAGTGAAAGGCTGACACTCAGCTGCTGACTCGTTGGTTCAAGAGCTCATCAATGGAAAATGTAGAATCATGATGTGTTTCTGATCCAACGAAGCAGGAGCTGCGTTTAGTCATGGCTGTCACG	(((((.(..((((((.((.(((((.(((..(((((((.(((.((((.(((((.((.............))))))).)))).))).)))))))..))).))))).)))))))).).)))))....	800836	800919	AGCTGCTGACTCGTTGGTTCAAGAGCTCATCAATGGAAAATGTAGAATCATGATGTGTTTCTGATCCAACGAAGCAGGAGCTGC	((((.(((..(((((((.(((.((((.(((((.((.............))))))).)))).))).)))))))..))).))))..	Csi-miRN4425	800899	800919	AGCTGCTGACTCGTTGGTTCA	Csi-miRN4425*	800836	800856	ATCCAACGAAGCAGGAGCTGC		3