miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Cit-MIR156a PmiREN004520 MIR156 Citrus maxima Cit-CM007751.1 13417646 13417772 + GAGGGAAATGGGTGATGCTGGTGACAGAAGATAGAGAGCGCAGATGATGATATGCTCTAATGGAGTTTGTATATCACTCCTTTGTGCTCTCTGTGCTTCTGTCATCAGGCCACTTCAGTCCCTCCCC ((((((...(((((...(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.............)))))))).)).)))))))))))))).)))))))))))))..)))))...))))))... 13417666 13417752 GTGACAGAAGATAGAGAGCGCAGATGATGATATGCTCTAATGGAGTTTGTATATCACTCCTTTGTGCTCTCTGTGCTTCTGTCATCA ((((((((((((((((((((((((.((((((((((.............)))))))).)).)))))))))))))).)))))))))).. 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Cit-miR166i 36368733 36368753 TTGGACCAGGCTTCTTTCCTC Cit-miR166i* 36368889 36368909 GGAATGTTGTCTGGCTCAAGG 3 Cit-MIR166j PmiREN004544 MIR166 Citrus maxima Cit-CM007749.1 36162302 36162422 + TGAGAGGGTTAGGTTTGAGAGGAATGTTGTCTGGTTCAAGATCATGGAGGAAGAATAAATATCTGAACCCTAAATGATTCTTGGACCAGGCTTCATTCCACTCAACCAACTCCTCTTTGCT .(((((((((.((((.(((.((((((..(((((((((((((((((..(((..................)))..)))).)))))))))))))..)))))).)))))))))).)))))).... 36162322 36162402 GGAATGTTGTCTGGTTCAAGATCATGGAGGAAGAATAAATATCTGAACCCTAAATGATTCTTGGACCAGGCTTCATTCCAC ((((((..(((((((((((((((((..(((..................)))..)))).)))))))))))))..)))))).. 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Cit-miR166l 36307975 36307995 TTGGACCAGGCTTCCTTCCTC Cit-miR166l* 36307893 36307913 GGAATGGCGGCTGGTTCAAGG 3 Cit-MIR166m PmiREN005076 MIR166 Citrus maxima Cit-CM007752.1 19599931 19600072 + GAAGCTGTTCTTTTGAGGGGACTGTTGTCTGGTTCAAGGCCATCAATTAATTATAACTTTGATTCAGGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATATATATATGTTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTTAATTACTGCTTCCATT ......................((..(((((((((.(((((...((((((........))))))..)))(((((((((((((....)))))))))))))...)).)))))))))..))........................ 19599951 19600052 ACTGTTGTCTGGTTCAAGGCCATCAATTAATTATAACTTTGATTCAGGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATATATATATGTTCTCGGACCAGGCTTCATTCC ..((..(((((((((.(((((...((((((........))))))..)))(((((((((((((....)))))))))))))...)).)))))))))..)).... 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Cit-miR169b 6523881 6523900 AGGCAGTCTCCTTGGCTAAC Cit-miR169b* 6523979 6523999 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG 3 Cit-MIR169c PmiREN004554 MIR169 Citrus maxima Cit-CM007748.1 31271976 31272161 - GAGATGAAGAGCTAGTTTTCTAGCCAAGGATGACTTGCCTATATCAACCATTTTTGGGGTTTTGGAAGTGAATGCATGTATGCATACACACACACACAAGTGGGTTTCTACTTAACTAGCTAAGATCCCTTTTGTGGTATATGCTTGGGCAAGCATCCTTGCTAAACTGACCAGCTCTTATCTTTC (((((((.(((((.(((...((((.(((((((.(((((((((((..(((((....((((((((((..(((.(((((....))))).)))........((((((....))))))......))))))))))....)))))..)))..)))))))))))))))))))....))).)))))))))))).. 31271996 31272141 TAGCCAAGGATGACTTGCCTATATCAACCATTTTTGGGGTTTTGGAAGTGAATGCATGTATGCATACACACACACACAAGTGGGTTTCTACTTAACTAGCTAAGATCCCTTTTGTGGTATATGCTTGGGCAAGCATCCTTGCTAAA ((((.(((((((.(((((((((((..(((((....((((((((((..(((.(((((....))))).)))........((((((....))))))......))))))))))....)))))..)))..))))))))))))))))))).. Cit-miR169c 31272121 31272141 TAGCCAAGGATGACTTGCCTA Cit-miR169c* 31271996 31272016 TGGGCAAGCATCCTTGCTAAA 3 Cit-MIR169d PmiREN004555 MIR169 Citrus maxima Cit-CM007749.1 8995940 8996093 - ATTAAATGAGTCTTGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTAATCTCTTGCGAGTGGCTTCAAAATGTCGATTAGTTAAATTCAATTATCTCATTAAGACCCTTGATGGGTGTTAGGCAGTTATCTTGGCTAACTTGACAGACTCTTTTCTCTCA .......((((((.(((.((((((((((.((((((.(((((((.(((..((((.(((((...((((..(((.((((......))))))).))))))).))))))..))).)))))))))))))))))))).))).))))))))).......... 8995960 8996073 TAGCCAAGGATGACTTGCCTAATCTCTTGCGAGTGGCTTCAAAATGTCGATTAGTTAAATTCAATTATCTCATTAAGACCCTTGATGGGTGTTAGGCAGTTATCTTGGCTAACT ((((((((.((((((.(((((((.(((..((((.(((((...((((..(((.((((......))))))).))))))).))))))..))).)))))))))))))))))))).).. 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Cit-miR169f 12601716 12601736 TAGCCAAGGATGACTTGCCTA Cit-miR169f* 12601796 12601816 TGGCAAGTGTCCTAGGCTAAT 3 Cit-MIR169g PmiREN004558 MIR169 Citrus maxima Cit-CM007749.1 9020013 9020153 - AAGATAAGAATACTGTTTGGTAGCCAGGGATGACTTGCCTGCGGCTTCCAATATTGCTAGCTAGGTTTCACCATCATCAATTAAAGCTGCTGTAGACTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAGCTGACAGCCTCTTCTCTCTC .(((.((((...(((((...((((((((((.((((.((((((((((..((.....((.((((......................)))))))).)).))).)))))))))))))))))))....)))))..)))).)))... 9020033 9020133 TAGCCAGGGATGACTTGCCTGCGGCTTCCAATATTGCTAGCTAGGTTTCACCATCATCAATTAAAGCTGCTGTAGACTGCCAGGCAGTCTCCTTGGCTAAG ((((((((((.((((.((((((((((..((.....((.((((......................)))))))).)).))).))))))))))))))))))).. 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Cit-miR169n 39494803 39494822 CAGCCAAGGATGACTTGCCG Cit-miR169n* 39494690 39494710 GGCAAGTCGTTTTTGGCTACA 3 Cit-MIR169o PmiREN004566 MIR169 Citrus maxima Cit-CM007753.1 22702514 22702673 - GGGAATGAGGGTATGTGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAACATTGGCGTGTTGATCACATCATTTTTGCTTCATTAGATATGACACTACTACATAAATGTGTTAACTAGTTCATCGGCAAGTCGTCTCTGGCTACAATACTGCCTCCTTCTCTCAT (((((.((((....(((.((.(((((.(((((((((((((((((...(((.(((.....))).)))...))))...(((((...((((((............)))))).)))))....))))))))))))).))))).)).)))..)))).))))).... 22702534 22702653 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAACATTGGCGTGTTGATCACATCATTTTTGCTTCATTAGATATGACACTACTACATAAATGTGTTAACTAGTTCATCGGCAAGTCGTCTCTGGCTACA .(((((.(((((((((((((((((...(((.(((.....))).)))...))))...(((((...((((((............)))))).)))))....))))))))))))).)))))... Cit-miR169o 22702633 22702653 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Cit-miR169o* 22702534 22702554 GGCAAGTCGTCTCTGGCTACA 3 Cit-MIR169p PmiREN004567 MIR169 Citrus maxima Cit-CM007754.1 16267524 16267710 - GGAGATGAAATGATGCGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAAGCCCCTTTCCTAGAACCTAAGCATCATATTTTTAGATGGCTTCACAATTATGAGTCTTTTGACTTGGGGTTTGATTTTATAGCTTCACTGGTAGGGTTAATCGGCAAGTTGTCTTTGGCTACACCTCTGCCTCATGTTCACAT (((.((((......(.((((.((((((((((((((((((((((((((((.............(((((((.((....))))).)))).........(((((....)))))))))))))......((((((........)))))).)))))))))))))))))))).)))).)....)))).))).... 16267544 16267690 CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAAGCCCCTTTCCTAGAACCTAAGCATCATATTTTTAGATGGCTTCACAATTATGAGTCTTTTGACTTGGGGTTTGATTTTATAGCTTCACTGGTAGGGTTAATCGGCAAGTTGTCTTTGGCTACA .((((((((((((((((((((((((((((.............(((((((.((....))))).)))).........(((((....)))))))))))))......((((((........)))))).))))))))))))))))))))... 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Cit-miR393b 924954 924975 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Cit-miR393b* 925016 925036 ATCATGCTATCCCTTTGGATT 3 Cit-MIR393c PmiREN004604 MIR393 Citrus maxima Cit-CM007756.1 37686102 37686257 - TGATTAGTGCAGGTGGAGAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGATGATAACATTAAATTAATCACTCAAACGGGTTGATTTTATTATATATATATGATTTCTTTCATTTTTAGATCATGCGATCCCTTCGGAATTCCCCATCTATGGCTCTAAAT ...((((.((((((((.(((((((.((((((((((((.(((((((((((((.....((((((((.(......))))))))))))))))......((((......))))...)))))))))))))))))).))))))).))))))...)).)))).. 37686122 37686237 TTCCAAAGGGATCGCATTGATCTGATGATAACATTAAATTAATCACTCAAACGGGTTGATTTTATTATATATATATGATTTCTTTCATTTTTAGATCATGCGATCCCTTCGGAATT ((((.((((((((((((.(((((((((((((.....((((((((.(......))))))))))))))))......((((......))))...)))))))))))))))))).)))).. Cit-miR393c 37686216 37686237 TTCCAAAGGGATCGCATTGATC Cit-miR393c* 37686122 37686142 TCATGCGATCCCTTCGGAATT 3 Cit-MIR394a PmiREN004605 MIR394 Citrus maxima Cit-CM007750.1 10273933 10274055 + AGGGGCCTTGTTGCAGAGTCATTTTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCCCACTTGAAATCTTAGATTTGGAGGTGGCTAGCATGCCTAACAGGCTCTGTGAATTTCT ..........((((((((((.....(((((.(((.(((((((((........((((..............)))).........))))))))).))).))))).....))))))))))...... 10273953 10274035 TTGGCATTCTGTCCACCTCCGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCCCACTTGAAATCTTAGATTTGGAGGTGGCTAGCATGCCTAAC ..(((((.(((.(((((((((........((((..............)))).........))))))))).))).))))).... 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Cit-miR395d 16636200 16636220 CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC Cit-miR395d* 16636240 16636260 GTTCCCCTGAACACTTCATTG 3 Cit-MIR396a PmiREN004618 MIR396 Citrus maxima Cit-CM007748.1 413659 413796 - AAATGGATCAGCTCTTATTTTTCCACGGCTTTCTTGAACGTAAAAGTGCTTCCGCCGGTTTGCATATATAATTAAGCAGTTCAAGCACCATTAATTACGTTCAAGAAGCTGTGGAAAAATAAGCGTTGATTCAGTGCA ....((((((((.((((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....((.((((.((......)).)))).))))))))......))))))))))))))))))))))))))))).))))))))...... 413679 413776 TTCCACGGCTTTCTTGAACGTAAAAGTGCTTCCGCCGGTTTGCATATATAATTAAGCAGTTCAAGCACCATTAATTACGTTCAAGAAGCTGTGGAAAA (((((((((((.(((((((((((..((((((.....((.((((.((......)).)))).))))))))......)))))))))))))))))))))).. 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Cit-miR396c 21653258 21653278 TTCCACGGCTTTCTTGAACTT Cit-miR396c* 21653347 21653367 GCTCAAGAATGCCGTGGGAAA 3 Cit-MIR396d PmiREN004621 MIR396 Citrus maxima Cit-CM007751.1 2176648 2176776 + CGAAGGTCCTCTTTGTGATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGTCTTGGATTTTCCGATCGATACCGGTGCATGATTAATTCCCAACACAATTCAAGAAAGCTGTGGAAAACTACTAAGAGGATTTGATCA (((..((((((((.(((...((((((((((((((((((.(((.(((((((.((..((((....))))....))..)))..)))).))).))))))))))))))))))...))).))))))))))).... 2176668 2176756 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGTCTTGGATTTTCCGATCGATACCGGTGCATGATTAATTCCCAACACAATTCAAGAAAGCTGTGGAAAA ((((((((((((((((((.(((.(((((((.((..((((....))))....))..)))..)))).))).)))))))))))))))))).. 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Cit-miR399c 47210487 47210507 TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Cit-miR399c* 47210560 47210580 GTGCAGTCCTCCTTTGGCGTG 3 Cit-MIR399d PmiREN004630 MIR399 Citrus maxima Cit-CM007752.1 7048916 7049078 - CAGTAAGCGATTTAGTTGTAGGGCTTCTCTCCTTTGGCAGGTGATGGCCAAGGGCAAAGATCATATAATATATTTATATATATGGTGCCTATTCTAATTATTGTTCTATTTTTTCAATGACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTATAACTGCCTCAGCTTTTAAA ....((((((..((((((((((((..((((((((((((((((.........(((((....((((((((((....))).))))))))))))........(((((...........)))))))))))))))))))))..))))))))))))..)).))))..... 7048936 7049058 GGGCTTCTCTCCTTTGGCAGGTGATGGCCAAGGGCAAAGATCATATAATATATTTATATATATGGTGCCTATTCTAATTATTGTTCTATTTTTTCAATGACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTA ((((..((((((((((((((((.........(((((....((((((((((....))).))))))))))))........(((((...........)))))))))))))))))))))..)))).. 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Cit-miR399e 47205054 47205074 CGCCAAAGGAGAATTGCCCTG Cit-miR399e* 47205143 47205163 GGGCAATTCTCCTTTGGCAGA 3 Cit-MIR403a PmiREN004632 MIR403 Citrus maxima Cit-CM007752.1 45046398 45046544 - TCAAGGAGAGGCATGTTTCGGGTTTGTGCGTGAATTTAATAAAATAACCGCTTCTTTTAATCTCGTTCCCCCATTTTTTGTTAGTAACAAATTTTTGCCGTCAGTGTTAGATTCACGCACAAACTCGTGATGTGTCTTTTCTTTTAC ...((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.....((.((.........................((((((...)))))).....)).))...))))))))))))))))))))))).))))))))))))))..... 45046418 45046524 GGTTTGTGCGTGAATTTAATAAAATAACCGCTTCTTTTAATCTCGTTCCCCCATTTTTTGTTAGTAACAAATTTTTGCCGTCAGTGTTAGATTCACGCACAAACTCG (((((((((((((((((((((.....((.((.........................((((((...)))))).....)).))...))))))))))))))))))))).. Cit-miR403a 45046418 45046438 TTAGATTCACGCACAAACTCG Cit-miR403a* 45046504 45046524 GGTTTGTGCGTGAATTTAATA 3 Cit-MIR403b PmiREN004633 MIR403 Citrus maxima Cit-CM007756.1 1597319 1597440 + GGCCGGGGGGGCACATCTCAAGTTTGTGCGTGAATCTAACCCCATCACAGCCGTCCGTTTTCCCGCTCTCATCTGATGGCGTTAGATTCACGCACAAACTCGCGATCTGTCCATCGACACAC .....((.(((((.(((.(.((((((((((((((((((((.((((((.....(..((......))..).....)))))).)))))))))))))))))))).).))).))))).))....... 1597339 1597420 AGTTTGTGCGTGAATCTAACCCCATCACAGCCGTCCGTTTTCCCGCTCTCATCTGATGGCGTTAGATTCACGCACAAACTCG ((((((((((((((((((((.((((((.....(..((......))..).....)))))).)))))))))))))))))))).. Cit-miR403b 1597400 1597420 TTAGATTCACGCACAAACTCG Cit-miR403b* 1597339 1597359 AGTTTGTGCGTGAATCTAACC 3 Cit-MIR408 PmiREN004634 MIR408 Citrus maxima Cit-CM007752.1 45385502 45385623 - CAAGAAGCAAGAGACAAAAGACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAACCATTAACAGGTCCTCTGTTTTGGCTCCTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTCTGCCTTCCTCGTCTTTT .....................(((((((.((((((.((((((..(((.(((..(((((.....))))).))).)))..)))))).)))))).)))))))....................... 45385522 45385603 ACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAACCATTAACAGGTCCTCTGTTTTGGCTCCTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT .(((((((.((((((.((((((..(((.(((..(((((.....))))).))).)))..)))))).)))))).)))))))... Cit-miR408 45385522 45385542 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT Cit-miR408* 45385583 45385603 ACGGGGAACAGGCAGAGCATG 3 Cit-MIR477a PmiREN004636 MIR477 Citrus maxima Cit-CM007749.1 6546088 6546232 + AATACATATGCTCAAATAATACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCAATCCATATATTAAACTCTACATACATATGCTCAAATAATAATGAGAGGAGGATTGAGGCCGAAGCCCTCAGGTAGAGTGATCGACTCCTGTTTTATTTAA ...................((((((.(((..((((((((.(((((((((..........((((.(((...(((......)))...)))))))..)))))))))..)))))))).))).))))))...(((....)))........ 6546108 6546212 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTCTTCAATCCATATATTAAACTCTACATACATATGCTCAAATAATAATGAGAGGAGGATTGAGGCCGAAGCCCTCAGGTAGAGTGA (((((.(((..((((((((.(((((((((..........((((.(((...(((......)))...)))))))..)))))))))..)))))))).))).))))).. 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Cit-miR477b 21127801 21127822 TGAAGCCCTTAGGGCAGAGTGA Cit-miR477b* 21127727 21127747 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTC 3 Cit-MIR477c PmiREN004638 MIR477 Citrus maxima Cit-CM007752.1 1905944 1906070 + TTAAGGCATTGGTTGCTCACACTCCCTCAAGGGCTTCTGGCGTTAATTAATGACAATTATTAATGCTTGCAGCTGCCTGCCAGGCCTGAGGCCGTTGGGGAGAGTGGACAAAAGTTGTCTTCGTAAC ..((((((.(..(((.((.(((((((((((.((((((.(((....((((((((...)))))))).((.((((....)))).))))).)))))).)))))).))))))))))..).))))))...... 1905964 1906050 ACTCCCTCAAGGGCTTCTGGCGTTAATTAATGACAATTATTAATGCTTGCAGCTGCCTGCCAGGCCTGAGGCCGTTGGGGAGAGTGG ((((((((((.((((((.(((....((((((((...)))))))).((.((((....)))).))))).)))))).)))))).)))).. 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Cit-miRN831 25122165 25122185 CTTGTTGATTGTCATCTAATC Cit-miRN831* 25122106 25122126 TTAGATGACCATCAACAAACA 3 Cit-MIRN835 PmiREN004655 MIRN835 Citrus maxima Cit-CM007754.1 2106712 2106840 - ATGTGTGCCGCACTCCGACACCGTTTCATCTTGTCCTCCAGAACCATCACAATGAAGCCGATGTGTGCCGCGGATTCTTGATGGCTCTGGAAGACAAGATCAAACGGTGCCGGAGTGCGGAGGATTTGT ((((.(.((((((((((.((((((((.((((((((.((((((.((((((....(((.(((.((.....))))).))).)))))).)))))).)))))))).)))))))).)))))))))).).))..)) 2106732 2106820 CCGTTTCATCTTGTCCTCCAGAACCATCACAATGAAGCCGATGTGTGCCGCGGATTCTTGATGGCTCTGGAAGACAAGATCAAACGGTG ((((((.((((((((.((((((.((((((....(((.(((.((.....))))).))).)))))).)))))).)))))))).)))))).. Cit-miRN835 2106800 2106820 CCGTTTCATCTTGTCCTCCAG Cit-miRN835* 2106732 2106752 GGAAGACAAGATCAAACGGTG 3 Cit-MIRN836 PmiREN005085 MIRN836 Citrus maxima Cit-CM007753.1 14155388 14155506 + TTTTTAATTTTCTGTTATGTAGCTTGAGTCTTGCTGAAAGTACATGTTTAAAAGTTTGGATTTTATTTTTTCCAAGTACTTTCAGCAGCCTCCGGCGTCATAGCAGAGAGTGAAATTAT .....................(((.(((.((.(((((((((((............(((((..........)))))))))))))))))).))).)))....................... 14155408 14155486 AGCTTGAGTCTTGCTGAAAGTACATGTTTAAAAGTTTGGATTTTATTTTTTCCAAGTACTTTCAGCAGCCTCCGGCGTC .(((.(((.((.(((((((((((............(((((..........)))))))))))))))))).))).)))... Cit-miRN836 14155466 14155486 CTTTCAGCAGCCTCCGGCGTC Cit-miRN836* 14155408 14155428 AGCTTGAGTCTTGCTGAAAGT 3 Cit-MIRN837 PmiREN004666 MIRN837 Citrus maxima Cit-CM007748.1 15668097 15668363 - TACCCAAATCACACAATCAAAGTTGGTTGGACTCTCGAGAAATTTATTGTTGATATGGGTCAATAGTGTAGTTTTACCAACACCGCCCATACCATATAGGCCAATGATTCCCGCTGATTCTTCTGCAAGACATCTCCAGACTTGTTCAAGTTGTGATTGCAAGCCTACTACTGTTCGCTCGGTAGGTCTTTCATCTGCTACAGGCTCTGGAGCTCTCTCAGGCACCACCTCGGCAGCCACCGCCTCAA ....................((.((((.((.((.((((((((((((((((((((....)))))))))).)))))..........(((.(((...))).)))....((.((.....)).)).((((..(((...((((((((((((...(((.((((..(...(((((((...........))))))))..))))..)))))))).))))))).)))..))))......))))).)))))))).))... 15668117 15668343 AGTTGGTTGGACTCTCGAGAAATTTATTGTTGATATGGGTCAATAGTGTAGTTTTACCAACACCGCCCATACCATATAGGCCAATGATTCCCGCTGATTCTTCTGCAAGACATCTCCAGACTTGTTCAAGTTGTGATTGCAAGCCTACTACTGTTCGCTCGGTAGGTCTTTCATCTGCTACAGGCTCTGGAGCTCTCTCAGGCACCACCTCGGCAGCCACCGCCTCA ((.((((.((.((.((((((((((((((((((((....)))))))))).)))))..........(((.(((...))).)))....((.((.....)).)).((((..(((...((((((((((((...(((.((((..(...(((((((...........))))))))..))))..)))))))).))))))).)))..))))......))))).)))))))).)).. Cit-miRN837 15668323 15668343 AGTTGGTTGGACTCTCGAGAA Cit-miRN837* 15668117 15668137 ACCTCGGCAGCCACCGCCTCA 3 Cit-MIRN845 PmiREN004659 MIRN845 Citrus maxima Cit-CM007754.1 13387588 13387711 + TTTGAGAGCTAATGTTCTCCGAACTCTCTCCCTCAACGGCTCCTCTTGGCTTTGCAAATCATTCCTTCTGATACAGAAGGCGCCGTTGAGGTAGGGCAGTTCGGAAAATATAGGCTCTTAGCTG ..((((((((.(((((.((((((((((((.((((((((((.((....))..............(((((((...))))))).)))))))))).)))).)))))))).))))).)))))))).... 13387608 13387691 GAACTCTCTCCCTCAACGGCTCCTCTTGGCTTTGCAAATCATTCCTTCTGATACAGAAGGCGCCGTTGAGGTAGGGCAGTTCGG (((((((((.((((((((((.((....))..............(((((((...))))))).)))))))))).)))).))))).. Cit-miRN845 13387670 13387691 CCGTTGAGGTAGGGCAGTTCGG Cit-miRN845* 13387608 13387628 GAACTCTCTCCCTCAACGGCT 3 Cit-MIRN846a PmiREN004660 MIRN846 Citrus maxima Cit-CM007756.1 17475094 17475179 - GTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCCGGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGAC (((((...((.(((((((((.(((..((((((..((((((....))))))..))))))..))).))).)))))).))))))).... 17475114 17475159 CGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCCGGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGC .(((..((((((..((((((....))))))..))))))..)))... Cit-miRN846a 17475140 17475159 CGCGGACTGCTCGAGCTGCC Cit-miRN846a* 17475114 17475134 GCGGCGAGAGCGGGTCGCCGC 3 Cit-MIRN846b PmiREN004661 MIRN846 Citrus maxima Cit-CM007756.1 17393272 17393357 - GTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGCGGCGAGAGCGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGACGGACTGGG ((((.(..(((((((((...((((((((((((..(((((....)))))..)))))))..))))).))))).))))..))))).... 17393292 17393337 CGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGCGGCGAGAGCGGTCGCCGCGTG ((((((((((((..(((((....)))))..)))))))..))))).. Cit-miRN846b 17393318 17393337 CGCGGACTGCTCGAGCTGCC Cit-miRN846b* 17393292 17393312 GGCGAGAGCGGTCGCCGCGTG 3 Cit-MIRN846c PmiREN004665 MIRN846 Citrus maxima Cit-MKYQ01001368.1 1117480 1117563 - GTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGACGGACT ((((.(..((((((((((((.(((..((((((..(((((....)))))..))))))..))).))).))))).))))..))))). 1117500 1117543 CGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGC .(((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))... Cit-miRN846c 1117524 1117543 CGCGGACTGCTCGAGCTGCC Cit-miRN846c* 1117500 1117520 GCGGCGAGAGCGGGTCGCCGC 3 Cit-MIRN846d PmiREN004726 MIRN846 Citrus maxima Cit-CM007753.1 16299273 16299358 + CAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGTGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGACGGA .....(((..((((((((((((.(((..((((((..(((((......)))))..))))))..))).))).))))).))))..))). 16299293 16299338 CGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGTGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGC .(((..((((((..(((((......)))))..))))))..))).)) Cit-miRN846d 16299293 16299312 CGCGGACTGCTCGAGCTGCC Cit-miRN846d* 16299318 16299338 GCGGCGAGAGCGGGTCGCCGC 3 Cit-MIRN847 PmiREN004664 MIRN847 Citrus maxima Cit-MKYQ01001368.1 132573 132659 + AGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGACGGACT (((((.(..(((((((((...((((((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))).)).))))).))))..)))))) 132593 132639 GGGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGT (((((..((((((..(((((....)))))..))))))..)))).)). Cit-miRN847 132593 132613 GGGCGGACTGCTCGAGCTGCC Cit-miRN847* 132619 132639 GGCGAGAGCGGGTCGCCGCGT 3 Cit-MIRN848a PmiREN004668 MIRN848 Citrus maxima Cit-CM007748.1 5783560 5783686 - CTTAGGTGCAACTGAGGCACCGTGCCACAGTTGCATCTAGTCGTTGGATGTTAGTGAACCCCACCATTTCAATTGCATTTAATGATTAGATGCAACTGTAGTACGGTATCATAATTATACCGTAGCC (((((......)))))..(((((((.(((((((((((((((((((((((((...((((.........))))...))))))))))))))))))))))))).))))))).................... 5783580 5783666 CGTGCCACAGTTGCATCTAGTCGTTGGATGTTAGTGAACCCCACCATTTCAATTGCATTTAATGATTAGATGCAACTGTAGTACGGT (((((.(((((((((((((((((((((((((...((((.........))))...))))))))))))))))))))))))).))))).. Cit-miRN848a 5783580 5783600 TAGATGCAACTGTAGTACGGT Cit-miRN848a* 5783646 5783666 CGTGCCACAGTTGCATCTAGT 3 Cit-MIRN848b PmiREN005083 MIRN848 Citrus maxima Cit-CM007749.1 48842452 48842578 + CTTAGGTGCAACTGTGGTACCGTGCCACAGTTGCATCCAGCCGTTGGATGCCTGTAGACCCCACCAATCCAAGTGCATTCAACGGCTAGATGCAACTGTAGTACGGTACCACAGTTGCACCGTAGCC ....................(((((.(((((((((((.(((((((((((((((..................)).))))))))))))).))))))))))).)))))...................... 48842472 48842558 CGTGCCACAGTTGCATCCAGCCGTTGGATGCCTGTAGACCCCACCAATCCAAGTGCATTCAACGGCTAGATGCAACTGTAGTACGGT (((((.(((((((((((.(((((((((((((((..................)).))))))))))))).))))))))))).))))).. Cit-miRN848b 48842538 48842558 TAGATGCAACTGTAGTACGGT Cit-miRN848b* 48842472 48842492 CGTGCCACAGTTGCATCCAGC 3 Cit-MIRN849 PmiREN004672 MIRN849 Citrus maxima Cit-CM007752.1 49319454 49319630 - ATTTTAGGATTTAATTATTTTAGAACCTTTTAATTAATAAAACCACTCTTTTGTAATCATGGACGCTCTAATGCAAACAACTCTACAAGATTGATTTTGATAGATAATTCCAAAGAGAATTATAAAAGAAGGGTTTTATTAATCAAAAAGCTCTAAAACAATTAAAATCGTAAAATT ((((((.(((((((((.(((((((.(.((((.((((((((((((..((((((((((((.((((.((......)).......(((((((((....))))).))))....))))....).)))))))))))..)))))))))))).)))).).))))))).)))).))))).)))))). 49319474 49319610 TAGAACCTTTTAATTAATAAAACCACTCTTTTGTAATCATGGACGCTCTAATGCAAACAACTCTACAAGATTGATTTTGATAGATAATTCCAAAGAGAATTATAAAAGAAGGGTTTTATTAATCAAAAAGCTCTAAA ((((.(.((((.((((((((((((..((((((((((((.((((.((......)).......(((((((((....))))).))))....))))....).)))))))))))..)))))))))))).)))).).)))).. Cit-miRN849 49319590 49319610 TAGAACCTTTTAATTAATAAA Cit-miRN849* 49319474 49319494 TATTAATCAAAAAGCTCTAAA 3 Cit-MIRN850 PmiREN004673 MIRN850 Citrus maxima Cit-CM007752.1 46801673 46801881 - CTGCAATTAGGGTTTTAATGGAGCTCTCTGAACTCCAAGTCTGAAAGGAGGTGATGGTAGGCCACGGCTGCTAGTCCATGAACACCCGTGGTTGCGCAGACTCAATACTGTGGCGCAGTCTAAGGGTTTGCATGAACTGGGAGACGAGACTACCTTGATCTTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCATTCATGTACATCTCATTATT ................(((((((((((((..(((((((..(((((((((......(((((....((.((.(((((.((((...((((.(((((((((..((........)).)))))).))).))))...)))).))))).)).))...)))))....)))))))))..)))))))..))))))))))))).................. 46801693 46801861 GAGCTCTCTGAACTCCAAGTCTGAAAGGAGGTGATGGTAGGCCACGGCTGCTAGTCCATGAACACCCGTGGTTGCGCAGACTCAATACTGTGGCGCAGTCTAAGGGTTTGCATGAACTGGGAGACGAGACTACCTTGATCTTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCA (((((((((..(((((((..(((((((((......(((((....((.((.(((((.((((...((((.(((((((((..((........)).)))))).))).))))...)))).))))).)).))...)))))....)))))))))..)))))))..))))))))).. Cit-miRN850 46801841 46801861 GAGCTCTCTGAACTCCAAGTC Cit-miRN850* 46801693 46801713 ATTGGAGTGAAGGGAGCTCCA 3 Cit-MIRN851 PmiREN004678 MIRN851 Citrus maxima Cit-CM007751.1 1549093 1549215 + GCGTTTGGGGCAGCAGCGCTGCCGCAGCGCAGCTGCTCCCCACCCTATATTCTATGGAATATTTCCCTAGAATAAAAGGTGGGGAGCAACTGGGCTGTGGCAGCATAGCTGCCCCAAACGCAT ((((((((((((((...(((((((((((.(((.(((((((((((...(((((((.((((...)))).)))))))...))))))))))).))).)))))))))))...)))))))))))))).. 1549113 1549195 GCCGCAGCGCAGCTGCTCCCCACCCTATATTCTATGGAATATTTCCCTAGAATAAAAGGTGGGGAGCAACTGGGCTGTGGCAG ((((((((.(((.(((((((((((...(((((((.((((...)))).)))))))...))))))))))).))).)))))))).. Cit-miRN851 1549175 1549195 GGAGCAACTGGGCTGTGGCAG Cit-miRN851* 1549113 1549133 GCCGCAGCGCAGCTGCTCCCC 3 Cit-MIRN852 PmiREN004679 MIRN852 Citrus maxima Cit-CM007754.1 22144447 22144702 + AAATCAATAATAAATTTGTTGATAATCCAACAGATTTTGATTCTGTGATTTGGGTTGTGGTGTCCAAAGACCCGCAGCTTGAAAAAATTCAAGAGACTATCTGGAAAGAGATAGGTCTATATAATGATTCATGGAAGAGCAAAAGTCTCGAAGAGAAAGCTCAGGACATCTTCGAGACTTTAAGCAAGAAGAAGTTTGCTTTGTTGTTGGATGATCTATGGGAGCGGGTTGATTTAAAGAAGGTAGGTGT ((((((((......(((((.(((.(((((((((.......((((((((((((((((((((.(((....)))))))))))))))..........(((((((((......))))).))))..........)))))))).....(((((((((((((..............)))))))))))))(((((((......)))))))..))))))))).))).))))).....))))))))............... .-71. 22144467 22144682 AAATTTGTTGATAATCCAACAGATTTTGATTCTGTGATTTGGGTTGTGGTGTCCAAAGACCCGCAGCTTGAAAAAATTCAAGAGACTATCTGGAAAGAGATAGGTCTATATAATGATTCATGGAAGAGCAAAAGTCTCGAAGAGAAAGCTCAGGACATCTTCGAGACTTTAAGCAAGAAGAAGTTTGCTTTGTTGTTGGATGATCTATGGGAGCGG ...(((((.(((.(((((((((.......((((((((((((((((((((.(((....)))))))))))))))..........(((((((((......))))).))))..........)))))))).....(((((((((((((..............)))))))))))))(((((((......)))))))..))))))))).))).)))))..... Cit-miRN852 22144662 22144682 TTGGATGATCTATGGGAGCGG Cit-miRN852* 22144467 22144487 AAATTTGTTGATAATCCAACA 3 Cit-MIRN853a PmiREN004681 MIRN853 Citrus maxima Cit-CM007748.1 401810 401924 - ATGTTAAATTATATGCATGTACCTTATAACCCTCTCACATGAATAGTGAGTAGTGTGGGTTCACTCACTATTTATGTGAGAGGATTGTAAGGTACATGCATATAACTTAAAGGGA ........(((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.(........)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))).......... 401830 401904 ACCTTATAACCCTCTCACATGAATAGTGAGTAGTGTGGGTTCACTCACTATTTATGTGAGAGGATTGTAAGGTAC (((((((((.(((((((((((((((((((((.(........)))))))))))))))))))))).))))))))).. 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Cit-miRN853b 49073965 49073985 TGTGAGAGGAATGTAAGGTAC Cit-miRN853b* 49074008 49074028 ACCTTACATCCCTCTCACATA 3 Cit-MIRN853c PmiREN004684 MIRN853 Citrus maxima Cit-CM007751.1 10736335 10736467 - TAGTGTATAGATACTATTTATGTGAGAGGAATGTAAGGTACATGCATGTAACTTAGAGGGATCCTTATTATATATGTGTATGAAAATTAACACTTTTTTATTCCCCAAACAATCTTGATCAATCTCAGACGTG ((((((....))))))....(((..(.((((((.(((((.((((((((((.....((((...))))......)))))))))).........)))))..)))))).)..)))...................... 10736355 10736447 TGTGAGAGGAATGTAAGGTACATGCATGTAACTTAGAGGGATCCTTATTATATATGTGTATGAAAATTAACACTTTTTTATTCCCCAAACAAT (((..(.((((((.(((((.((((((((((.....((((...))))......)))))))))).........)))))..)))))).)..))).. Cit-miRN853c 10736427 10736447 TGTGAGAGGAATGTAAGGTAC Cit-miRN853c* 10736355 10736375 CTTTTTTATTCCCCAAACAAT 3 Cit-MIRN853d PmiREN004687 MIRN853 Citrus maxima Cit-CM007753.1 11442067 11442170 - CCTCTAAGTTACATGCATGTACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTATCCATACACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTACATGCATGTAACTTAGCATTA ...((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((........))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))..... 11442087 11442150 ACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTATCCATACACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTAC (((((((((.(((((((((((((((((........))))))))))))))))).))))))))).. Cit-miRN853d 11442087 11442107 TGTGAGAGGAATGTAAGGTAC Cit-miRN853d* 11442130 11442150 ACCTTACATCCCTCTCACATG 3 Cit-MIRN853e PmiREN004690 MIRN853 Citrus maxima Cit-CM007756.1 7762025 7762128 - CCTCTAAGTTACATGCATGTACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTATCCATACACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTACATGCATGTAACTTAGCATTA ...((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((........))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))..... 7762045 7762108 ACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTATCCATACACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTAC (((((((((.(((((((((((((((((........))))))))))))))))).))))))))).. Cit-miRN853e 7762045 7762065 TGTGAGAGGAATGTAAGGTAC Cit-miRN853e* 7762088 7762108 ACCTTACATCCCTCTCACATG 3 Cit-MIRN853f PmiREN005084 MIRN853 Citrus maxima Cit-CM007755.1 17716744 17716847 + ATGCTAAGTTACATGCATGTACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTATATGGATACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTACATGCATGTAACTTAGAGGGA ....................(((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))))))))...................... 17716764 17716827 ACCTTACATCCCTCTCACATGAATAGTATATGGATACTATTCATGTGAGAGGAATGTAAGGTAC (((((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).))))))))).. Cit-miRN853f 17716807 17716827 TGTGAGAGGAATGTAAGGTAC Cit-miRN853f* 17716764 17716784 ACCTTACATCCCTCTCACATG 3 Cit-MIRN854 PmiREN004683 MIRN854 Citrus maxima Cit-CM007750.1 1701632 1701755 + TTCTTGTCATAGATGACGTGTGGGACGGAGATTACATTAAATGGCAACCATTCTACCATTGTTTGAAGAATGGTCTTCATGAAAGTAAAATTTTAGTTACCACACGTAAGGAGTCAGTGGCGGA .....(((((.(((.(((((((((((.((((((..(((..((((..((((((((..((.....)).))))))))..))))...)))..)))))).))).)))))))).....))).)))))... 1701652 1701735 TGGGACGGAGATTACATTAAATGGCAACCATTCTACCATTGTTTGAAGAATGGTCTTCATGAAAGTAAAATTTTAGTTACCACA ((((((.((((((..(((..((((..((((((((..((.....)).))))))))..))))...)))..)))))).))).))).. 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Cit-miRN855 31935960 31935980 AGGGACAAGCTAAAAGACCAA Cit-miRN855* 31936024 31936044 TGTCTTTTAGCTTGTTCCTTA 3 Cit-MIRN856 PmiREN004686 MIRN856 Citrus maxima Cit-CM007752.1 46292164 46292334 - ACTCCTTTCATTGAAAAGCCTCTTGCTCAAATGAGTATTCCACAACCTCTGCTTGGAAAGAACAATTCTCACTGAGGTTTCCCATTATTGGTTCTACCATTCTCCAGTGTTCCTTCACACATTGTAATGGGATACTCATTTAGGCAAGACGCTTTGCATGGGAGGACACTC ..(((((((((.(.(((((.(((((((.((((((((((((((.((((((.....((((.......))))....)))))).........((((...)))).....((((((........))))))...)))))))))))))).))))))).))))).))))))))))..... 46292184 46292314 TCTTGCTCAAATGAGTATTCCACAACCTCTGCTTGGAAAGAACAATTCTCACTGAGGTTTCCCATTATTGGTTCTACCATTCTCCAGTGTTCCTTCACACATTGTAATGGGATACTCATTTAGGCAAGACG (((((((.((((((((((((((.((((((.....((((.......))))....)))))).........((((...)))).....((((((........))))))...)))))))))))))).))))))).. 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Cit-miRN857 32783532 32783552 TAAGAGTGTAATGAGCGGCAG Cit-miRN857* 32783374 32783394 CCCCTAGTAACATTTTAGATC 3 Cit-MIRN858 PmiREN004691 MIRN858 Citrus maxima Cit-CM007748.1 12614037 12614139 + TTTGAGGTTGTTGAACTATGTCAATGGTTATGGCACTAAGATGGGCTTAAGTTGGGCAATCCTTTGTGCCATAGCCATTGACACAGTGATCTACAATCTCCTG ...((((((((.(((((.((((((((((((((((((.(((....(((((...)))))....))).)))))))))))))))))).)))..)).))))))))... 12614057 12614119 TCAATGGTTATGGCACTAAGATGGGCTTAAGTTGGGCAATCCTTTGTGCCATAGCCATTGACA ((((((((((((((((.(((....(((((...)))))....))).)))))))))))))))).. Cit-miRN858 12614057 12614077 TCAATGGTTATGGCACTAAGA Cit-miRN858* 12614099 12614119 TTTGTGCCATAGCCATTGACA 3 Cit-MIRN859a PmiREN004695 MIRN859 Citrus maxima Cit-CM007748.1 31141989 31142086 + GAATATGGGTTTGTGTGTCTGACCCTTTTGATGAGTACAGAATTGCGAAAGCAATCATTGAAGCTTTAGAAGGTTCTGCCACTAATTTAGGTGAACTA ..............(((.(.((.((((((((..(((.(((.(((((....)))))..)))..))))))))))).)).).)))................ 31142009 31142066 GACCCTTTTGATGAGTACAGAATTGCGAAAGCAATCATTGAAGCTTTAGAAGGTTCTG ((.((((((((..(((.(((.(((((....)))))..)))..))))))))))).)).. Cit-miRN859a 31142046 31142066 TTGAAGCTTTAGAAGGTTCTG Cit-miRN859a* 31142009 31142029 GACCCTTTTGATGAGTACAGA 3 Cit-MIRN859b PmiREN004696 MIRN859 Citrus maxima Cit-CM007748.1 31094148 31094245 - GAATATGGGTTTGTGTGTCTGACCCTTTTGATGAGTACAGAATTGCGAAAGCAATCATTGAAGCTTTAGAAGGTTCTGCCACTAATTTAGTTGAACTA ..............(((.(.((.((((((((..(((.(((.(((((....)))))..)))..))))))))))).)).).))).....((((...)))) 31094168 31094225 GACCCTTTTGATGAGTACAGAATTGCGAAAGCAATCATTGAAGCTTTAGAAGGTTCTG ((.((((((((..(((.(((.(((((....)))))..)))..))))))))))).)).. Cit-miRN859b 31094168 31094188 TTGAAGCTTTAGAAGGTTCTG Cit-miRN859b* 31094205 31094225 GACCCTTTTGATGAGTACAGA 3 Cit-MIRN859c PmiREN004704 MIRN859 Citrus maxima Cit-CM007748.1 31369433 31369530 + GAATGTGGGTGTGTGTATCAGACCCTTTTGATGAGTTTCGGGTTGCAAGAGCTATCATTGAAGCTTTAGAAGGTTCTGCCTCTAATTTAGGGGAACTG ..................((((.((((((((..((((((((((.((....)).)))..))))))))))))))).))))((((((...))))))..... 31369453 31369510 GACCCTTTTGATGAGTTTCGGGTTGCAAGAGCTATCATTGAAGCTTTAGAAGGTTCTG ((.((((((((..((((((((((.((....)).)))..))))))))))))))).)).. Cit-miRN859c 31369490 31369510 TTGAAGCTTTAGAAGGTTCTG Cit-miRN859c* 31369453 31369473 GACCCTTTTGATGAGTTTCGG 3 Cit-MIRN860 PmiREN004697 MIRN860 Citrus maxima Cit-CM007749.1 25834721 25834831 + TAAAGAACCACTTTCACTCTTTTTGTTGCATGATGCTGATAATGAATGTAGGTCGTTGATACTTTTCACTACCCGCATCATGCAACAAAAGAGTTGAAGTGGTTCGACGGA ....((((((((((.((((((((.((((((((((((.(.((.((((.(((.........)))..)))).)).).)))))))))))))))))))).))))))))))...... 25834741 25834811 TTTTGTTGCATGATGCTGATAATGAATGTAGGTCGTTGATACTTTTCACTACCCGCATCATGCAACAAAAG (((.((((((((((((.(.((.((((.(((.........)))..)))).)).).))))))))))))))).. Cit-miRN860 25834741 25834762 TTTTGTTGCATGATGCTGATAA Cit-miRN860* 25834791 25834811 ACCCGCATCATGCAACAAAAG 3 Cit-MIRN861 PmiREN004699 MIRN861 Citrus maxima Cit-CM007749.1 51681031 51681200 + TGAATATATGCTTTGAACATCCTGAGCTGTTTGGCTATTCTCGCTGTAAACTCTTGATATCCCAATTTGTATAATTTCTTATTTTTCACAACTTTAGTTGGAATTGGTGTTGGGGTATTAAGAGTTTACAATGAGATAGCCAACGGCTCATGTTGTTTTGAAGGCATATA ....(((((((((((((((.(.(((((((((.((((((.((((.((((((((((((((((((((((.....(((((((.....................)))))))..)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).).)))))..)))))))))) 51681051 51681180 TGAGCTGTTTGGCTATTCTCGCTGTAAACTCTTGATATCCCAATTTGTATAATTTCTTATTTTTCACAACTTTAGTTGGAATTGGTGTTGGGGTATTAAGAGTTTACAATGAGATAGCCAACGGCTCATG (((((((((.((((((.((((.((((((((((((((((((((((.....(((((((.....................)))))))..)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).) Cit-miRN861 51681051 51681072 TGAGCTGTTTGGCTATTCTCGC Cit-miRN861* 51681160 51681180 TGAGATAGCCAACGGCTCATG 3 Cit-MIRN862 PmiREN004700 MIRN862 Citrus maxima Cit-CM007754.1 12549035 12549175 + GAGATGAAGAGCTTTGCTTTGCTAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCATCATTAAGGGTTTTCAAAATCAAAAGAATGAGAATCCTTTTGTGGGTTATGTTTAGCAAGCATCCTGGGCTAATTGAGTGGCTCTTATCTTT (((((((.(((((..((((...(((((.((((((.(((((..((((...((((.(((((((((((...((....)).)))))))))))..))))...))))...))))))))))).)))))...)))))))))))))))). 12549055 12549155 TAGCCAAGGATGACTTGCCTACGTCCATCATTAAGGGTTTTCAAAATCAAAAGAATGAGAATCCTTTTGTGGGTTATGTTTAGCAAGCATCCTGGGCTAAT (((((.((((((.(((((..((((...((((.(((((((((((...((....)).)))))))))))..))))...))))...))))))))))).))))).. Cit-miRN862 12549136 12549155 AGCAAGCATCCTGGGCTAAT Cit-miRN862* 12549055 12549075 TAGCCAAGGATGACTTGCCTA 3 Cit-MIRN863 PmiREN004701 MIRN863 Citrus maxima Cit-CM007755.1 10122499 10122695 + TATGCCTATTCTTCCTTGTACTGTAGAAGGCTCCTGTGACCTCAAAGACGTCACCATGGAATGGAAGCATGCTGAAGGCTTATCCGATGGTTGGCATAGAAGGTGGCAAGTTACTTGTAATAGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAGGTCGCAGGAGCTTTCTACGGTTGGGGAAATTTTTCCATGCTG ...........(((((((.(((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((....((((.........)))).))).))))(((.(((.....))).)))((..(((((.....)))))..))..........)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))).............. 10122519 10122675 CTGTAGAAGGCTCCTGTGACCTCAAAGACGTCACCATGGAATGGAAGCATGCTGAAGGCTTATCCGATGGTTGGCATAGAAGGTGGCAAGTTACTTGTAATAGGCAAGCTGCAGAAGAAAGATGACGTTTTCAAGGTCGCAGGAGCTTTCTACGGTT ((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((....((((.........)))).))).))))(((.(((.....))).)))((..(((((.....)))))..))..........)))))))))..)))))))))))))))))))))).. Cit-miRN863 10122655 10122675 TCGCAGGAGCTTTCTACGGTT Cit-miRN863* 10122519 10122539 CTGTAGAAGGCTCCTGTGACC 3 Cit-MIRN864 PmiREN004702 MIRN864 Citrus maxima Cit-CM007755.1 10067434 10067643 - ACCACTCGAGTTCGAACAGAAAATGAATTGTTTGTTGGAATTTGATTGACACTGAAAGTAGTGATTAGTTTGGTTAGTTATCTGACAAGCCAATCAGACCATATTTGCAAAATTAGAGATTTTCTTCATCTCTCTTTCATGTTGGTCTTGTTCTTGCTCAAGGTCTTCTTCCACCAAAGCATTCATTTCCTCAAAGAACTTCAGATTCTG .......((((((....((.((((((((..((((.(((((...((..(((.((...(((((.((((.(((((.((((....))))))))).))))((((((....((.(((...((((((.......)))))).)))))...)))))).....)))))..))))).))))))).))))..)))))))).))....))))))......... 10067454 10067623 AAATGAATTGTTTGTTGGAATTTGATTGACACTGAAAGTAGTGATTAGTTTGGTTAGTTATCTGACAAGCCAATCAGACCATATTTGCAAAATTAGAGATTTTCTTCATCTCTCTTTCATGTTGGTCTTGTTCTTGCTCAAGGTCTTCTTCCACCAAAGCATTCATTTCC ((((((((..((((.(((((...((..(((.((...(((((.((((.(((((.((((....))))))))).))))((((((....((.(((...((((((.......)))))).)))))...)))))).....)))))..))))).))))))).))))..)))))))).. Cit-miRN864 10067454 10067475 TTCCACCAAAGCATTCATTTCC Cit-miRN864* 10067603 10067623 AAATGAATTGTTTGTTGGAAT 3 Cit-MIRN865 PmiREN004705 MIRN865 Citrus maxima Cit-CM007749.1 4773664 4773804 - AAAGAGGTAGAGAAGTCCCGCAGGGGCGACATGAGATCACATGCAACGCATTCGCCTATACATTTGGTGTGGTGGGAGTGTTTGTGTTTATGTGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGTGGGATTTCTTCTACCATTTTTTTTTTT ((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((((((((.((((((.(((((((.....)))))).).))))))))))......))))).))))).))))))))))))))))))).)))))).)))))...... 4773684 4773784 CCGCAGGGGCGACATGAGATCACATGCAACGCATTCGCCTATACATTTGGTGTGGTGGGAGTGTTTGTGTTTATGTGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGTGGGA (((((((((((((.(((((.(((((((((.((((((.(((((((.....)))))).).))))))))))......))))).))))).))))))))))))).. Cit-miRN865 4773684 4773704 TCTCAGGTCGCCCCTGTGGGA Cit-miRN865* 4773764 4773784 CCGCAGGGGCGACATGAGATC 3 Cit-MIRN866a PmiREN004706 MIRN866 Citrus maxima Cit-CM007752.1 37014410 37014506 - AACATACAGGACCCGTGAGGAAGCGACGTGCAGTTGGGGCTAATAGGGTTGACAGTCCTCCTGCGGGTTCTCCTTCCCACATTTTCATTAGCGAGGG ..............(((.(((((.(((.(((((..((((((............)))))).))))).)))...))))))))................. 37014430 37014486 AAGCGACGTGCAGTTGGGGCTAATAGGGTTGACAGTCCTCCTGCGGGTTCTCCTTCC (((.(((.(((((..((((((............)))))).))))).)))...))).. Cit-miRN866a 37014466 37014486 AAGCGACGTGCAGTTGGGGCT Cit-miRN866a* 37014430 37014450 CCTCCTGCGGGTTCTCCTTCC 3 Cit-MIRN866b PmiREN004708 MIRN866 Citrus maxima Cit-CM007752.1 5441497 5441617 - GTGTTGTTAGGGACTTGTGGCCTGGTCGGTATGTTGTTGGGGGAAAGTAGATGGGTAAGAAACATACGGGACCAGTGAGGAAGCGACGTGCAGTTGGGGCTAGTAGGGTTGACAACTCCTA ..((((((((...((..((((((.(...((((((((((..((....(((..((.........)))))....))........))))))))))...).))))))..))..))))))))..... 5441517 5441597 CCTGGTCGGTATGTTGTTGGGGGAAAGTAGATGGGTAAGAAACATACGGGACCAGTGAGGAAGCGACGTGCAGTTGGGGCT (((.(...((((((((((..((....(((..((.........)))))....))........))))))))))...).))).. Cit-miRN866b 5441517 5441537 AAGCGACGTGCAGTTGGGGCT Cit-miRN866b* 5441577 5441597 CCTGGTCGGTATGTTGTTGGG 3 Cit-MIRN867a PmiREN004710 MIRN867 Citrus maxima Cit-CM007756.1 12792677 12792884 + TAGAGAGGCTCCGAGTTGTTCAGAGGGGTAGTGATGTGCTGGAGGAGAGCAGGTTAGAGAGAGCGGGGCTAATTGACAAAGGTTTTCCATCTACTTTTGGTGGTGACTCATGTATGATTTTGGGAGTTGAGGGGTACCCTATTATTATCTATGTGACTAGGGTACCTCGCCATCACCATGTCTTTTATTAACCTTCGTTGTTTTCTAT (((((((.(..(((((((...(((((.((.((((((.((....(((((((..(((((....(((...)))..)))))....)))))))..(((((...))))).(((((..............)))))..(((((((((((((((.......)))).))))))))))))))))))).)).)))))...))))..)))..)))))))). 12792697 12792864 CAGAGGGGTAGTGATGTGCTGGAGGAGAGCAGGTTAGAGAGAGCGGGGCTAATTGACAAAGGTTTTCCATCTACTTTTGGTGGTGACTCATGTATGATTTTGGGAGTTGAGGGGTACCCTATTATTATCTATGTGACTAGGGTACCTCGCCATCACCATGTCTTTTAT .(((((.((.((((((.((....(((((((..(((((....(((...)))..)))))....)))))))..(((((...))))).(((((..............)))))..(((((((((((((((.......)))).))))))))))))))))))).)).)))))... Cit-miRN867a 12792697 12792717 CAGAGGGGTAGTGATGTGCTG Cit-miRN867a* 12792844 12792864 CGCCATCACCATGTCTTTTAT 3 Cit-MIRN867b PmiREN004711 MIRN867 Citrus maxima Cit-CM007756.1 12924266 12924488 + TGGACAGGCTTCGAGGTGCACAGAGGGGTAGTGATGTGCTGGAGGAGAGCCGATTATGGAGAGCGGGGCTGATTGACCGAAGTCCTACACCTGCTCCTGGGGGTGACTCATGTATGATTTGGGTGTCGGGGGTATCCTATTATTACTTATGGGACTGGGGTACCCCATTATCATTGCATTCTTCGTTTCGCTTCCCCTCTTTCCTTTTCCCATTTTTTACTTT .....................(((((((.(((((...((.((((((.(.(((((((((.((((.((((((..........)))))).(((((.(....).))))).))).).))))).)))).).)).(((((((((((((((.....))))...)))))))))))..............)))))).))))).)))))))....................... 12924286 12924468 CAGAGGGGTAGTGATGTGCTGGAGGAGAGCCGATTATGGAGAGCGGGGCTGATTGACCGAAGTCCTACACCTGCTCCTGGGGGTGACTCATGTATGATTTGGGTGTCGGGGGTATCCTATTATTACTTATGGGACTGGGGTACCCCATTATCATTGCATTCTTCGTTTCGCTTCCCCTCTTTC .(((((((.(((((...((.((((((.(.(((((((((.((((.((((((..........)))))).(((((.(....).))))).))).).))))).)))).).)).(((((((((((((((.....))))...)))))))))))..............)))))).))))).)))))))... 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Cit-miRN868a 30340402 30340422 TACGTGAACGTAACTTGCGCC Cit-miRN868a* 30340305 30340325 CGTAAGTTACGTTCATGTAAC 3 Cit-MIRN868b PmiREN004715 MIRN868 Citrus maxima Cit-CM007750.1 15572434 15572570 + TATATAGGCTGGCGCTAAGTTACGTGAACGTAACTTGCGCCCCTCTCACAACTACAGTATCCGGCTCCACCAAGAGTACTGTAACTGTGAGAGGGCCATAAGTTACGTTCACGTAACTTAGACCCTCCCTATTATAT ((((((((..((..(((((((((((((((((((((((.(.((((((((((..((((((.....((((......))))))))))..)))))))))).).)))))))))))))))))))))))..))..)))).)))). 15572454 15572550 TACGTGAACGTAACTTGCGCCCCTCTCACAACTACAGTATCCGGCTCCACCAAGAGTACTGTAACTGTGAGAGGGCCATAAGTTACGTTCACGTAAC (((((((((((((((((.(.((((((((((..((((((.....((((......))))))))))..)))))))))).).))))))))))))))))).. Cit-miRN868b 15572454 15572474 TACGTGAACGTAACTTGCGCC Cit-miRN868b* 15572530 15572550 CATAAGTTACGTTCACGTAAC 3 Cit-MIRN869 PmiREN004713 MIRN869 Citrus maxima Cit-CM007748.1 5255894 5256050 - AATATTGAATGGCAGCATAGGAGGAGTGGGTCGCATATGAATCATGTAATCAAAGAAGTCAATTGATTTGTTGGGAGTGATGTTACCTGATTTACAGCTTTCTTCAAGTAATTTGTCAAGTGAGGTTCGGTCTTTGACAGCGCCGTATTCAATTTCG ...((((((((((.((....(((((.((((((.(((.((((((((....((((..(((((....))))).))))..)))))(((((.(((.............))).)))))...))).))).)))))).)))))....)))))))..))))).... 5255914 5256030 GAGGAGTGGGTCGCATATGAATCATGTAATCAAAGAAGTCAATTGATTTGTTGGGAGTGATGTTACCTGATTTACAGCTTTCTTCAAGTAATTTGTCAAGTGAGGTTCGGTCTTTGA (((((.((((((.(((.((((((((....((((..(((((....))))).))))..)))))(((((.(((.............))).)))))...))).))).)))))).))))).. Cit-miRN869 5255914 5255935 TCAAGTGAGGTTCGGTCTTTGA Cit-miRN869* 5256010 5256030 GAGGAGTGGGTCGCATATGAA 3 Cit-MIRN870 PmiREN004716 MIRN870 Citrus maxima Cit-CM007750.1 21034036 21034191 - TAAGATTTTTACATAAATTTTGAGTCATGGATCTAATGCAATTCAATGTTTGGTATCCAAAGTCAAAAGTTGTATTTATCGATGTCAATTCATCCTCCATCTCGATCATTCAATTGAATTAGATCAATGGCTTATAATTTGTGTCAAAATTTTAAG .((((((((.(((((((((.((((((((.((((((((.(((((.(((((((((...))))).......((((........((((......))))........)))))))).))))).)))))))).)))))))).))))))))).))))))))... 21034056 21034171 TGAGTCATGGATCTAATGCAATTCAATGTTTGGTATCCAAAGTCAAAAGTTGTATTTATCGATGTCAATTCATCCTCCATCTCGATCATTCAATTGAATTAGATCAATGGCTTATA ((((((((.((((((((.(((((.(((((((((...))))).......((((........((((......))))........)))))))).))))).)))))))).)))))))).. Cit-miRN870 21034056 21034076 GAATTAGATCAATGGCTTATA Cit-miRN870* 21034151 21034171 TGAGTCATGGATCTAATGCAA 3 Cit-MIRN871 PmiREN004718 MIRN871 Citrus maxima Cit-CM007754.1 13843860 13843979 - ATTCATTTAGACTTTGGTTATCTAAAGATAGGTAGATTTAGTTAATAGGATTATAACAACATCTATAACCATGTTAGCTAGTTCTATCTATCTTTTGAAATTCCATGTTTACTTGAATTT (((((..(((((..(((...((.(((((((((((((.((((((((((((.(((((........))))))).)))))))))).))))))))))))).))....))).)))))..))))).. 13843880 13843959 TCTAAAGATAGGTAGATTTAGTTAATAGGATTATAACAACATCTATAACCATGTTAGCTAGTTCTATCTATCTTTTGAAA ((.(((((((((((((.((((((((((((.(((((........))))))).)))))))))).))))))))))))).)).. Cit-miRN871 13843939 13843959 TCTAAAGATAGGTAGATTTAG Cit-miRN871* 13843880 13843900 AGTTCTATCTATCTTTTGAAA 3 Cit-MIRN872a PmiREN004719 MIRN872 Citrus maxima Cit-CM007754.1 6309746 6309909 - CATATGGGGTCAGACTACAGTGCAACTGTGGTACCGTGCTACAGTTGCACCAGCTGTTGGATCTACTCAAATGAGTGGAGTCCACTTGAATAAGTGGGAATCCAACGGTTGGGTACAACTGTGGCACGGTACCACAGTTGCACCACAGATTTATCCATCATATA ...................((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((....))))))..(((((((....))))))).)))))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))....(((......)))..... 6309766 6309889 TGCAACTGTGGTACCGTGCTACAGTTGCACCAGCTGTTGGATCTACTCAAATGAGTGGAGTCCACTTGAATAAGTGGGAATCCAACGGTTGGGTACAACTGTGGCACGGTACCACAGTTGCACC (((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((....))))))..(((((((....))))))).)))))))))))))...))))))))))))))))))))))))))).. 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Cit-miRN872b 20215330 20215350 TGCAACTGTGGTACCGTGCTA Cit-miRN872b* 20215424 20215444 GCACGGTACCACAGTTGCACC 3 Cit-MIRN873 PmiREN004721 MIRN873 Citrus maxima Cit-CM007756.1 12215497 12215760 - CTATAAGATTGGACTATGTTGAAAATGTGATCGGATATAAGTTGCTACCACCCTTTACTTGAAATGGTGAGAGACTCAAGTTCACTCTTTGATCCCTTGGTCTTTAAAGATGGCTTTTTGTTGATGATGGTGGGTGCCAAGGTCTACATATGTCAAATTGAGGCAAACCTTGTGACTGAAGTTTGCTTTATTCCTATGTTATCAGGTTCCTCCATGGAACGCCTTATTGTGGTTTCGTATTCTCTAA (.........).........(((.(((.(((((.(.(((((..((...((((.(((.....))).))))((((((.((((.(((.....)))...)))))))))).....((((....(((.(((..((((....))))..))).)))...))))...((((((((((.((......)).))))))))))...............(((((.....))))))))))))).))))).))).)))..... 12215517 12215740 GAAAATGTGATCGGATATAAGTTGCTACCACCCTTTACTTGAAATGGTGAGAGACTCAAGTTCACTCTTTGATCCCTTGGTCTTTAAAGATGGCTTTTTGTTGATGATGGTGGGTGCCAAGGTCTACATATGTCAAATTGAGGCAAACCTTGTGACTGAAGTTTGCTTTATTCCTATGTTATCAGGTTCCTCCATGGAACGCCTTATTGTGGTTTCGTATTCTC (((.(((.(((((.(.(((((..((...((((.(((.....))).))))((((((.((((.(((.....)))...)))))))))).....((((....(((.(((..((((....))))..))).)))...))))...((((((((((.((......)).))))))))))...............(((((.....))))))))))))).))))).))).))).. 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Cit-miRN874 43853758 43853778 ATTGGGAAGACGACACTGGTG Cit-miRN874* 43853697 43853717 ATCAGGTGGTTTTTTCAGAGG 3 Cit-MIRN875a PmiREN004724 MIRN875 Citrus maxima Cit-CM007750.1 6108279 6108403 - TGTGGTGCAATTGTAGTACCGTGTCAAAGTTGCATCCAGCCGTTGGATACCAGTGGACCCCACCAATTCAAGTGCATCCAACGGCTGGATGCAACTGTGGTACGGTACCACAGTTGCACCGTGGC ...(((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((((...)))).........)).))))))))))))))))))))).))))))))))).)))))))))))..... 6108299 6108383 GTGTCAAAGTTGCATCCAGCCGTTGGATACCAGTGGACCCCACCAATTCAAGTGCATCCAACGGCTGGATGCAACTGTGGTACGG ((((((.(((((((((((((((((((((..((((((...)))).........)).))))))))))))))))))))).)))))).. 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Cit-miRN875f 15913379 15913399 CTGGATGCAACTGTGGTACGG Cit-miRN875f* 15913315 15913335 GTGTCACAGTTGCATCCAGCC 3 Cit-MIRN875g PmiREN005091 MIRN875 Citrus maxima Cit-CM007752.1 4805643 4805775 + TTCGGTGCAACTGTGGTACCGTGCCACAATTGCATCCAGCCGTTGGATCCATTTAAATGAGTGGGATTCATTAAAATCCAACAGCTGGATGCCTGGATGCAACTGTGGTACGGTACCACAGTTGCACCACAAT ....................((((((((.((((((((((.(..(((((((((((....)))).))))))).....(((((.....)))))).)))))))))).))))))))...................... 4805663 4805755 GTGCCACAATTGCATCCAGCCGTTGGATCCATTTAAATGAGTGGGATTCATTAAAATCCAACAGCTGGATGCCTGGATGCAACTGTGGTACGG ((((((((.((((((((((.(..(((((((((((....)))).))))))).....(((((.....)))))).)))))))))).)))))))).. 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