miRNA_locus_ID	miRNA_locus_accession	miRNA_family	Organism	Chromosome	Start	End	Strand	Stem_loop_with_extended_20bp_seq	Stem_loop_with_extended_20bp_structure	Stem_loop_start	Stem_loop_end	Stem_loop_seq	Stem_loop_seq_structure	mature_miRNA	mature_start	mature_end	mature_seq	star_miRNA	star_start	star_end	star_seq	Confidence_level
Cre-MIR906	PmiREN024568	MIR906	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	2125448	2125571	+	GGTTGGTGGGCGTGATCAGCAGGGGGAAGCTTTATCGGAATTCGATGTGCAGGGCGTGTGGGCACATGCCCTGCACATCGATTTCCGATAAAGCTTCCCCCTGCTGATCACGCCCACCAACCGT	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((....)))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	2125469	2125552	AGGGGGAAGCTTTATCGGAATTCGATGTGCAGGGCGTGTGGGCACATGCCCTGCACATCGATTTCCGATAAAGCTTCCCCCTGC	((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((....)))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))	Cre-miR906	2125469	2125491	AGGGGGAAGCTTTATCGGAAT	Cre-miR906*	2125531	2125551	TCCGATAAAGCTTCCCCCTGC		3
Cre-MIR907	PmiREN024569	MIR907	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	4088532	4088732	+	CCAGCCCAGCGCTCGCACCGCTCGCAGAAGACATCGCTGGCACCGTGTTGGCCGCCATTTGAGCGCTTGGTCACATCGCTGGCACCCACGGCTGGCACCGTGGCCGCCACTTGACCAAGCGCTAAATATCGGCCAACNCGGTGCCAGCGATGTCTTCTGCGAGCGGTGCGAGCGCTGGGCTGG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((..((((.((((((((((((....(.((((..((((((......))))))..))))).))))))))))))))))..)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	4088553	4088713	TCGCACCGCTCGCAGAAGACATCGCTGGCACCGTGTTGGCCGCCATTTGAGCGCTTGGTCACATCGCTGGCACCCACGGCTGGCACCGTGGCCGCCACTTGACCAAGCGCTAAATATCGGCCAACNCGGTGCCAGCGATGTCTTCTGCGAGCGGTGCGAGC	(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((..((((.((((((((((((....(.((((..((((((......))))))..))))).))))))))))))))))..)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))	Cre-miR907	4088693	4088715	TCTTCTGCGAGCGGTGCGAGC	Cre-miR907*	4088552	4088572	TCGCACCGCTCGCAGAAGACA		3
Cre-MIR908	PmiREN024570	MIR908	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-scaffold_35	13785	13950	+	AATGTTGACAGACCACCCGCTCCCTTACTGACGCAGTTGACGCGTTTGATAGCAGGATCATAGTACGGGACCAGTTCCCCTACCAACTGGTCCCGTAACCACTATGATCCTGCTATCAAAGGCGTCAACTACGTCAATAAGGCAGCGGGTGGTCAATATACATTAT	(((((.....(((((((((((.(((((.(((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((........))))))))))))....)))))))))))))))))))).))))))))).))))).))))).))))))))))).....)))))))	13806	13931	TCCCTTACTGACGCAGTTGACGCGTTTGATAGCAGGATCATAGTACGGGACCAGTTCCCCTACCAACTGGTCCCGTAACCACTATGATCCTGCTATCAAAGGCGTCAACTACGTCAATAAGGCAGC	(.(((((.(((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((........))))))))))))....)))))))))))))))))))).))))))))).))))).))))).)))	Cre-miR908	13806	13828	TCCCTTACTGACGCAGTTGAC	Cre-miR908*	13910	13930	CAACTACGTCAATAAGGCAGC		3
Cre-MIR909	PmiREN024571	MIR909	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_16	3786002	3786221	+	GCTCCAGGGCCTTCTGCTGCTGATGGTGCAGATGCGGCTGGTGCTGGTCAAACCGGTGGTGGTGGTGCTGGTGCTGTTCGGGCTCCTGCTGCACCGGCAGTAGCGCCAGCAGCTGGAGCAGGTACAGGGCGGCCGCCAGCGGCAGCACCACCACCACCACCACCGGTTCGACCAGCACCAGCCGCACCTGCACCACCAGCAGCGGATAGAAGGCTCCGGA	(((((.((((((((((((((((.((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((.((.(((((.(((((...(((......))).))))).)))))........(((....)))..))))))))))).))))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))).)))))))....))))))))).)))	3786023	3786202	TGATGGTGCAGATGCGGCTGGTGCTGGTCAAACCGGTGGTGGTGGTGCTGGTGCTGTTCGGGCTCCTGCTGCACCGGCAGTAGCGCCAGCAGCTGGAGCAGGTACAGGGCGGCCGCCAGCGGCAGCACCACCACCACCACCACCGGTTCGACCAGCACCAGCCGCACCTGCACCACCAGC	((.((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((.((.(((((.(((((...(((......))).))))).)))))........(((....)))..))))))))))).))))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))).))))	Cre-miR909	3786023	3786045	TGATGGTGCAGATGCGGCTGG	Cre-miR909*	3786181	3786201	AGCCGCACCTGCACCACCAGC		3
Cre-MIR910	PmiREN003506	MIR910	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_14	3218765	3218888	-	CGGGGCCCGCAGGTAGCTGCCGTTGAGCCCGACGCTGCTGCCGCCGCGCCGGTGCTGCTGCGCGGCAGCACCTGACCGGCTGCAGCAGCGTCGGGCTCGACCGCAGCCACCTGCGGGTCCCGCA	((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((.((((..(.(((((((((....))))))))).)..)))).)))))))))))))))))))).))))).))))))))))))))..	3218785	3218868	CGTTGAGCCCGACGCTGCTGCCGCCGCGCCGGTGCTGCTGCGCGGCAGCACCTGACCGGCTGCAGCAGCGTCGGGCTCGACCGC	.((((((((((((((((((((.((((..(.(((((((((....))))))))).)..)))).))))))))))))))))))))...	Cre-miR910	3218785	3218805	AGCAGCGTCGGGCTCGACCGC	Cre-miR910*	3218848	3218868	CGTTGAGCCCGACGCTGCTGC		3
Cre-MIR912	PmiREN003507	MIR912	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_9	6365888	6366055	-	ACAGGATCCATTTTCTAGTGCCTGGCTGGGATCAATGCAAGATGATAGTTGGATCCTGGACGCCGAAGGCCATCATGCGGTGTCAACCGCATGACGGCCGTTGGCGTCCAGGATCTAGCTGTCGTCTTGGATTGATCCCAGCCAGGCGCTTGGAGATGGACCCACGGT	...((.(((((((((.((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((((((....))))))))).)))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).))))))))).)).....	6365908	6366035	CCTGGCTGGGATCAATGCAAGATGATAGTTGGATCCTGGACGCCGAAGGCCATCATGCGGTGTCAACCGCATGACGGCCGTTGGCGTCCAGGATCTAGCTGTCGTCTTGGATTGATCCCAGCCAGGCG	((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((((((....))))))))).)))).))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))..	Cre-miR912	6365908	6365928	TGGATTGATCCCAGCCAGGCG	Cre-miR912*	6366015	6366035	CCTGGCTGGGATCAATGCAAG		3
Cre-MIR913a	PmiREN003508	MIR913	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_5	1790662	1790832	+	CTCGCCACGTTTTGGGGGCTTGCACACTTGCGAGTCCGTGGCCGTGTTTCCAAGGATGTATACAAGCGAAGTCGAGACTTTGGTATTACATACTCCCACTTCGCTTTTATACATTCTTGGAGACACGGCCACGGACTCGCAGGTGTGCAAGCCCCCGAAACGTCGCCAGGG	((.((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((....((......))..)))..))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).))..	1790682	1790812	TGCACACTTGCGAGTCCGTGGCCGTGTTTCCAAGGATGTATACAAGCGAAGTCGAGACTTTGGTATTACATACTCCCACTTCGCTTTTATACATTCTTGGAGACACGGCCACGGACTCGCAGGTGTGCAAG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((....((......))..)))..))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miR913a	1790792	1790812	ACGGACTCGCAGGTGTGCAAG	Cre-miR913a*	1790682	1790702	TGCACACTTGCGAGTCCGTGG		3
Cre-MIR913b	PmiREN024572	MIR913	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_5	1790681	1790809	+	GCACACTTGCGAGTCCGTGGCCGTGTTTCCAAGGATGTATACAAGCGAAGTCGAGACTTTGGTATTACATACTCCCACTTCGCTTTTATACATTCTTGGAGACACGGCCACGGACTCGCAGGTGTGCAA	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((....((......))..)))..))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	1790702	1790790	CCGTGTTTCCAAGGATGTATACAAGCGAAGTCGAGACTTTGGTATTACATACTCCCACTTCGCTTTTATACATTCTTGGAGACACGGCC	(((((((((((((((((((((.(((((((((.(((....((......))..)))..))))))))).)))))))))))))))))))))))	Cre-miR913b	1790770	1790792	TACATTCTTGGAGACACGGCC	Cre-miR913b*	1790701	1790721	CCGTGTTTCCAAGGATGTATA		3
Cre-MIR914	PmiREN024573	MIR914	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	1588427	1588710	+	CTCCCCTCCACGGATTCCGGCGCGCCCGGGGGTTGGTAATGGGTGCTAATGCGTGTGGCAGCACGGCGTACATTTGCCAGTTGCATCTGGAATGCTCAGGGCTGGCCTGCTCTGCCCTAGCCTGGCCCTGCCCTTGCACAGGGCACCCCTGCTGCAGTCACTTGCTGCGGCTAAGCACGGCTGCAACCCGTGGGGGGCGCTGCCGATTGACGCGAATGCAAGAGATCGGAGGCCCGGCACCCATTACCAACCCCCGGGCGCGCCGGAATCCGTGGAGGGGAGGC	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((....)))).)))).......((((......))))..(((..(((((.((((.(((.......)))..))))..))))).))).((((...))))((((((((.....))))))))....(((((.......)))))..((((.((.((((((...((....))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	1588448	1588691	CGCGCCCGGGGGTTGGTAATGGGTGCTAATGCGTGTGGCAGCACGGCGTACATTTGCCAGTTGCATCTGGAATGCTCAGGGCTGGCCTGCTCTGCCCTAGCCTGGCCCTGCCCTTGCACAGGGCACCCCTGCTGCAGTCACTTGCTGCGGCTAAGCACGGCTGCAACCCGTGGGGGGCGCTGCCGATTGACGCGAATGCAAGAGATCGGAGGCCCGGCACCCATTACCAACCCCCGGGCGCGCC	(((((((((((((((((((((((((((.((((((((....)))).)))).......((((......))))..(((..(((((.((((.(((.......)))..))))..))))).))).((((...))))((((((((.....))))))))....(((((.......)))))..((((.((.((((((...((....))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	Cre-miR914	1588671	1588693	TTACCAACCCCCGGGCGCGCC	Cre-miR914*	1588447	1588467	CGCGCCCGGGGGTTGGTAATG		3
Cre-MIR917	PmiREN024574	MIR917	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	2882106	2882400	-	CGTGCGCTTCGATGTGCTGTAACACAGGTCGCGGCGTAGCTACTCTTAAGGCCTCAACCAAAGGGCCTTTGCGGCGTTTCACGGTTATGTTCGAAGTCGGTACTAACAATCTGAACCAAAGTCGGAGCCCAAGTCTGAACCAAAGTCGTTTGGTTCAGACTGTTAGTGCCGACTTTGGTTCAGACTGCTAGTGCCGACTTCGAACATAACCGTGAAACGCCGCAAAGGCCCTTTGGTTGAGGACTTAAGAGTAGCTACGCCGCGACCTGTGTTACAGCACATCGAAGCGCACGCC	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((.((...(((((((((((((....)))))))))))))....)).)))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	2882124	2882378	AACACAGGTCGCGGCGTAGCTACTCTTAAGGCCTCAACCAAAGGGCCTTTGCGGCGTTTCACGGTTATGTTCGAAGTCGGTACTAACAATCTGAACCAAAGTCGGAGCCCAAGTCTGAACCAAAGTCGTTTGGTTCAGACTGTTAGTGCCGACTTTGGTTCAGACTGCTAGTGCCGACTTCGAACATAACCGTGAAACGCCGCAAAGGCCCTTTGGTTGAGGACTTAAGAGTAGCTACGCCGCGACCTGTGTTAC	((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((.((...(((((((((((((....)))))))))))))....)).)))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))	Cre-miR917	2882358	2882380	AACACAGGTCGCGGCGTAGCT	Cre-miR917*	2882126	2882146	CTACGCCGCGACCTGTGTTAC		3
Cre-MIR918	PmiREN003509	MIR918	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_5	935313	935435	-	CGGTCAGCATCTCGATTGGCAAGACGTCCACTCCGGGTACGCGCCGCTCATGCGATGACGCCTTCATCGCGTGAGCGGCGTGTACCTGAAGCGGACATCTTGCCAAACGAAATGCTGACCGAG	((((((((((.(((.(((((((((.((((.((.(((((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))).)).)))).))))))))).))).))))))))))..	935333	935415	AAGACGTCCACTCCGGGTACGCGCCGCTCATGCGATGACGCCTTCATCGCGTGAGCGGCGTGTACCTGAAGCGGACATCTTGC	((((.((((.((.(((((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))).)).)))).))))..	Cre-miR918	935333	935353	TACCTGAAGCGGACATCTTGC	Cre-miR918*	935395	935415	AAGACGTCCACTCCGGGTACG		3
Cre-MIR919	PmiREN024575	MIR919	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_5	935312	935436	+	TCGGTCAGCATTTCGTTTGGCAAGATGTCCGCTTCAGGTACACGCCGCTCACGCGATGAAGGCGTCATCGCATGAGCGGCGCGTACCCGGAGTGGACGTCTTGCCAATCGAGATGCTGACCGAGA	(((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((.(((((((((.(((((((.....))))))).))))))))).))))).))))))))))))))))))).)))))))))))))))))	935333	935417	CAAGATGTCCGCTTCAGGTACACGCCGCTCACGCGATGAAGGCGTCATCGCATGAGCGGCGCGTACCCGGAGTGGACGTCTTGCC	(((((((((((((((.(((((.(((((((((.(((((((.....))))))).))))))))).))))).)))))))))))))))))	Cre-miR919	935397	935419	ACCCGGAGTGGACGTCTTGCC	Cre-miR919*	935332	935352	CAAGATGTCCGCTTCAGGTAC		3
Cre-MIR1144a	PmiREN024343	MIR1144	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	591825	592041	-	ACTGCTGGGGTGCAGCAGGCTTGGAACCGGGCACGCAGGAGGTGGGTTTTGTGGCGGCAGGNAGCAGGCAGCGCGGGGCTGCTGGTGGTGGTGGAGGAGGATGAAGTTCGCCATTCAAACAACCCTTTCTGCACCGGTCCTGTGCTGCCCGTTGCCTGCAGGAGCAAAACACACCCACTCCGTGTCCGGCTCCAAGATTGCTGAACCCCTGTCGCTG	.(.((.(((((.(((((..((((((.(((((((((.((..((((.(((((((..(.(((((.(((.((((((((((((((...((((.(((.(((((.(..((((........))))..)...)))))))))))))))))))))))))).))).))))).)..))))))).))))..)).))))))))).))))))..))))).))))).)).))))	591843	592019	TTGGAACCGGGCACGCAGGAGGTGGGTTTTGTGGCGGCAGGNAGCAGGCAGCGCGGGGCTGCTGGTGGTGGTGGAGGAGGATGAAGTTCGCCATTCAAACAACCCTTTCTGCACCGGTCCTGTGCTGCCCGTTGCCTGCAGGAGCAAAACACACCCACTCCGTGTCCGGCTCCAAGA	(((((.(((((((((.((..((((.(((((((..(.(((((.(((.((((((((((((((...((((.(((.(((((.(..((((........))))..)...)))))))))))))))))))))))))).))).))))).)..))))))).))))..)).))))))))).)))))).	Cre-miR1144a	591998	592021	TTGGAACCGGGCACGCAGGAGG	Cre-miR1144a*	591845	591865	ACTCCGTGTCCGGCTCCAAGA		3
Cre-MIR1144b	PmiREN003490	MIR1144	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	591753	592017	-	GGTGGGTAGTGTGGCGGCAGGCAGCAGGCAGCGCGGGGCTGCTGGTGGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGAGGACGGGCGCCCGTCCTCCTCCTCCTCCTCCAGCGGCCCCGCGCTGCCTGCTACCTCCACCACACTACCCACCCCCTGCGTGCCCGGTACCCCGCC	((((((((((((((.((.(((.((((((((((((((((((((((((...)....................................................................................................((((((((((....)))))))))).........))))))))))))))))))))))).))))).))))))))))))))...........(((....)))..	591773	591997	TGGGTAGTGTGGCGGCAGGCAGCAGGCAGCGCGGGGCTGCTGGTGGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGAGGACGGGCGCCCGTCCTCCTCCTCCTCCTCCAGCGGCCCCGCGCTGCCTGCTACCTCCACCACACTACCCACC	((((((((((((.((.(((.((((((((((((((((((((((((...)....................................................................................................((((((((((....)))))))))).........))))))))))))))))))))))).))))).))))))))))))..	Cre-miR1144b	591976	591997	TGGGTAGTGTGGCGGCAGGCAG	Cre-miR1144b*	591773	591793	ACCTCCACCACACTACCCACC		3
Cre-MIR1144c	PmiREN003491	MIR1144	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	457768	457980	+	ACTGCTGGAGTGCAGCAGGCTTGGCACCGGGCACGCAGGAGGTGGGTAGTGTTGCGGCAGGCAGCAGGCAGCGCGGGGCTGCTGCTGGTGGAGGAGGAGGACGGGCGCCTGTCCTCTTCCACCAACAGCACCAGCCCCGCGCTGCCTGCTACCTCCACCACACTACCCACCCCCTGCATGCCCGGTACCAAGCC	.((((((.....))))))((((((.((((((((.(((((.((((((((((((.(.((.(((.(((((((((((((((((((.(((((.(((.((((((((((((....)))))))))))).))).))))).))))))))))))))))))).))))).).)))))))))))).))))).)))))))).)))))).	457788	457960	TTGGCACCGGGCACGCAGGAGGTGGGTAGTGTTGCGGCAGGCAGCAGGCAGCGCGGGGCTGCTGCTGGTGGAGGAGGAGGACGGGCGCCTGTCCTCTTCCACCAACAGCACCAGCCCCGCGCTGCCTGCTACCTCCACCACACTACCCACCCCCTGCATGCCCGGTACCAAGC	((((.((((((((.(((((.((((((((((((.(.((.(((.(((((((((((((((((((.(((((.(((.((((((((((((....)))))))))))).))).))))).))))))))))))))))))).))))).).)))))))))))).))))).)))))))).))))..	Cre-miR1144c	457788	457809	TTGGCACCGGGCACGCAGGAGG	Cre-miR1144c*	457940	457960	CCTGCATGCCCGGTACCAAGC		3
Cre-MIR1145a	PmiREN003492	MIR1145	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	552475	552640	+	TCGCAATGCTGGTCAACGCCACCGAGAGGGTCAACAGCACCCAGGAGCACTGGGCGGACATCAAGCAGAAGACGTCCTGACGCTGGAGGCCGTCTTCTGCTTGATGTCCGCCCACAGCTGCTGATTGGCGTTGACCCTGTCGGTGGCCTTGACCAGCATCGCGGCA	((((.(((((((((((.((((((((.(((((((((..((..(((.(((..((((((((((((((((((((((((.(((........))).))))))))))))))))))))))))..))).)))..))..))))))))).)))))))).))))))))))).))))..	552495	552620	ACCGAGAGGGTCAACAGCACCCAGGAGCACTGGGCGGACATCAAGCAGAAGACGTCCTGACGCTGGAGGCCGTCTTCTGCTTGATGTCCGCCCACAGCTGCTGATTGGCGTTGACCCTGTCGGTGG	(((((.(((((((((..((..(((.(((..((((((((((((((((((((((((.(((........))).))))))))))))))))))))))))..))).)))..))..))))))))).)))))..	Cre-miR1145a	552600	552620	TGGCGTTGACCCTGTCGGTGG	Cre-miR1145a*	552495	552515	ACCGAGAGGGTCAACAGCACC		3
Cre-MIR1145b	PmiREN024344	MIR1145	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	552524	552689	+	TCGCAATGCTGGTCAACGCCACCGAGAGGGTCAACACCACCCAGCAGCTCTGGGCGGACATCAAGCAGAAGACGTCCTCCAGCGGGAGGCCGTCTTCTGCTTGATGTCCGCCCACAGCTGCTGATTGGCGTTGACCCTGTCGGTGGCCTTGACCAGCATCGCGGCA	((((.(((((((((((.((((((((.(((((((((.(((..((((((((.((((((((((((((((((((((((.(((((....))))).)))))))))))))))))))))))).))))))))..))).))))))))).)))))))).))))))))))).))))).	552545	552670	ACCGAGAGGGTCAACACCACCCAGCAGCTCTGGGCGGACATCAAGCAGAAGACGTCCTCCAGCGGGAGGCCGTCTTCTGCTTGATGTCCGCCCACAGCTGCTGATTGGCGTTGACCCTGTCGGTGG	(((((.(((((((((.(((..((((((((.((((((((((((((((((((((((.(((((....))))).)))))))))))))))))))))))).))))))))..))).))))))))).)))))))	Cre-miR1145b	552650	552672	TGGCGTTGACCCTGTCGGTGG	Cre-miR1145b*	552544	552564	ACCGAGAGGGTCAACACCACC		3
Cre-MIR1147	PmiREN003493	MIR1147	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	1448167	1448289	-	CCTCCGCTTCTGCCATAATTAGTGCCAGCGCGCTCTCGGCCAAGTCTGGCAGAAGCGGAGGAGCCGCCGCTGCCAGACTTGGCCGAGAACGCGCTGGCACTAATTGGGGCTGCACGGAAGCTG	..((((.....(((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((..((((.....))))..))))))))))))))))))).))))))))))))))))).)))....)))).....	1448187	1448269	AGTGCCAGCGCGCTCTCGGCCAAGTCTGGCAGAAGCGGAGGAGCCGCCGCTGCCAGACTTGGCCGAGAACGCGCTGGCACTAA	((((((((((((.(((((((((((((((((((..((((.....))))..))))))))))))))))))).))))))))))))..	Cre-miR1147	1448249	1448269	AGTGCCAGCGCGCTCTCGGCC	Cre-miR1147*	1448187	1448207	CCGAGAACGCGCTGGCACTAA		3
Cre-MIR1149	PmiREN003494	MIR1149	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	7190628	7190757	+	CCACGATCGACCGCCTCGGGCCCGCTATGTCGGACAACACCGACCCCCAGCCCGCCAACAAGGAGATGGCGTTGGCGGGCTGGGGTCGGTGTTGTCTGACATGGAGGGTCCCAGGCAGTCGGGGTAGTCT	((.....((((.((((.((((((.(((((((((((((((((((((((.(((((((((((...........)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).)))).)))))).......	7190648	7190737	CCCGCTATGTCGGACAACACCGACCCCCAGCCCGCCAACAAGGAGATGGCGTTGGCGGGCTGGGGTCGGTGTTGTCTGACATGGAGGGTC	(((.(((((((((((((((((((((((.(((((((((((...........)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))..	Cre-miR1149	7190717	7190737	TGTTGTCTGACATGGAGGGTC	Cre-miR1149*	7190648	7190668	CCCGCTATGTCGGACAACACC		3
Cre-MIR1150	PmiREN024345	MIR1150	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	2591509	2591808	-	CAATATCCCTCTTGGCGAGCTTCGCAAATAGAGTCGGCCCCAGTTTCCGCTGCAGCTGGGCTTCGTGCTTCCAGCTTCCTGCACGGCTCGCCGTCCGAGCGCCTTGCTTGCCGCCCGATACGCAGTTCGGATTCGTATACGCATATCGAACTCAATCCGAGTCGCGTATCATCGGGTGGCAAGGAAGGCGCTGGAAGCCTCTGACAGCGAGCCATGCAGGAAGCTGAAAGCCTGAAAGCCCACCTGCAGCGGCGACTGGGGCCGACCCTGTTTGCAAAGCTCGCCGAGAGGGACATTGAT	((((.(((((((((((((((((.((((((((.(((((((((((((.(((((((((.(((((((((.((((.((((((((((((.(((((((.((((.((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((((((....))).))).....)))))))).)))))...)))))))))))).)))))))).)........))).))))))).)))))))))))).)))).)).))))))).))))))))).))))))))))))).)))))))).))))))))))))))))).))))))	2591527	2591786	TTCGCAAATAGAGTCGGCCCCAGTTTCCGCTGCAGCTGGGCTTCGTGCTTCCAGCTTCCTGCACGGCTCGCCGTCCGAGCGCCTTGCTTGCCGCCCGATACGCAGTTCGGATTCGTATACGCATATCGAACTCAATCCGAGTCGCGTATCATCGGGTGGCAAGGAAGGCGCTGGAAGCCTCTGACAGCGAGCCATGCAGGAAGCTGAAAGCCTGAAAGCCCACCTGCAGCGGCGACTGGGGCCGACCCTGTTTGCAAAGC	((.((((((((.(((((((((((((.(((((((((.(((((((((.((((.((((((((((((.(((((((.((((.((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((((((....))).))).....)))))))).)))))...)))))))))))).)))))))).)........))).))))))).)))))))))))).)))).)).))))))).))))))))).))))))))))))).)))))))).))))	Cre-miR1150	2591766	2591788	TTCGCAAATAGAGTCGGCCCC	Cre-miR1150*	2591529	2591549	GGCCGACCCTGTTTGCAAAGC		3
Cre-MIR1151a	PmiREN003495	MIR1151	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	2371039	2371164	-	CCGCTCACCGGCCACGGCAGTCCGGGGCTCATAACCTGTTAACGCGCGCAGCCCGCAGGCAGTCCCTGCGGGCCGCGCGGTGCTAACGGGTTGTGGGACCCGGACTGACGCGGCTGGCATGTGACA	((((...(((....)))(((((((((.((((((((((((((.(((((((.(((((((((.....))))))))).)))).))).)))))))))))))).)))))))))..)))).............	2371059	2371144	TCCGGGGCTCATAACCTGTTAACGCGCGCAGCCCGCAGGCAGTCCCTGCGGGCCGCGCGGTGCTAACGGGTTGTGGGACCCGGACT	((((((.((((((((((((((.(((((((.(((((((((.....))))))))).)))).))).)))))))))))))).))))))..	Cre-miR1151a	2371124	2371144	TCCGGGGCTCATAACCTGTTA	Cre-miR1151a*	2371059	2371079	ACGGGTTGTGGGACCCGGACT		3
Cre-MIR1151b	PmiREN003496	MIR1151	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	2372804	2372929	-	TCTCTCACCGGCCGCGGCAGTCCGGGGCTCATAACCTGTTGACGCGCGCAGCCCGCGGGCAGTCCCTGCGGGCCGCGCGGCGCTAACGGGGTGTGGGACCCGGACTGACGCGGCCGGCATGTGGCA	((.(...(((((((((.(((((((((.(((((..(((((((.(((((((.(((((((((.....))))))))).)))).))).)))))))..))))).))))))))).)))))))))...).))..	2372824	2372909	TCCGGGGCTCATAACCTGTTGACGCGCGCAGCCCGCGGGCAGTCCCTGCGGGCCGCGCGGCGCTAACGGGGTGTGGGACCCGGACT	((((((.(((((..(((((((.(((((((.(((((((((.....))))))))).)))).))).)))))))..))))).))))))..	Cre-miR1151b	2372889	2372909	TCCGGGGCTCATAACCTGTTG	Cre-miR1151b*	2372824	2372844	ACGGGGTGTGGGACCCGGACT		3
Cre-MIR1152	PmiREN003497	MIR1152	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	7063774	7063903	-	GGGGTATTCACGGCACCGTCAAGACGGCGCACCTTCTTAACGTCCTTCGGTGCTTGCTTGCACACACTCAAGCAGGCACCGAAGGGCGTTAAGAAGGTGCGCTGTCTTGACGGTGCCGTGAATACCTTCA	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((........))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	7063794	7063883	AAGACGGCGCACCTTCTTAACGTCCTTCGGTGCTTGCTTGCACACACTCAAGCAGGCACCGAAGGGCGTTAAGAAGGTGCGCTGTCTTGA	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((........))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miR1152	7063794	7063814	TAAGAAGGTGCGCTGTCTTGA	Cre-miR1152*	7063863	7063883	AAGACGGCGCACCTTCTTAAC		3
Cre-MIR1153	PmiREN024346	MIR1153	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	3100621	3100748	+	TGGGCCATCGTATTACTATCAGTGCTGCTAGCAACTACAAGGCGGGCATGAAGGTCGATTTGATCCGATCGACCTTCATGACCGCCTTGTAATTGCCGGTAGCACTGATTGTAATGCGATGGCTCATT	((((((((((((((((.((((((((((((.((((.((((((((((.((((((((((((((......)))))))))))))).)))))))))).)))).)))))))))))).))))))))))))))))))	3100642	3100729	AGTGCTGCTAGCAACTACAAGGCGGGCATGAAGGTCGATTTGATCCGATCGACCTTCATGACCGCCTTGTAATTGCCGGTAGCACTGA	(((((((((.((((.((((((((((.((((((((((((((......)))))))))))))).)))))))))).)))).)))))))))))	Cre-miR1153	3100709	3100731	TGTAATTGCCGGTAGCACTGA	Cre-miR1153*	3100641	3100661	AGTGCTGCTAGCAACTACAAG		3
Cre-MIR1154	PmiREN003498	MIR1154	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	3694775	3694897	-	TGTAATGCGGGAAAATGGTAACTTAGTCATCCCAAGGCGTGTATCACCCATGTTACGGGCGACCTGTAACACGGGTGATACACGCCTTGTGACGACTAAGTTACCATTTTCCCTCGTTACAGG	.((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((.(((((((((...))))))))).))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))).))))))...	3694795	3694877	ACTTAGTCATCCCAAGGCGTGTATCACCCATGTTACGGGCGACCTGTAACACGGGTGATACACGCCTTGTGACGACTAAGTTA	((((((((.((.(((((((((((((((((.(((((((((...))))))))).))))))))))))))))).)).))))))))..	Cre-miR1154	3694857	3694877	ACTTAGTCATCCCAAGGCGTG	Cre-miR1154*	3694795	3694815	CGCCTTGTGACGACTAAGTTA		3
Cre-MIR1155	PmiREN003499	MIR1155	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	3820954	3821083	+	CTCCGACCAGTATTTGAGGCTCGTTCCTCAAGCAGGACTCAAAGAACCCGATCAGCTTGTCGAGCACGACAAGGTGATCGTGTTTTCTTAGTCCTGCACGAGGAAGGAGCCCCAGATGATGGACGGAGTC	(((((.(((.((((((.(((((.((((((..((((((((...(((((.((((((.(((((((....))))))).)))))).)))))...))))))))..)))))).))))).)))))).))).)))))..	3820974	3821063	TCGTTCCTCAAGCAGGACTCAAAGAACCCGATCAGCTTGTCGAGCACGACAAGGTGATCGTGTTTTCTTAGTCCTGCACGAGGAAGGAGC	((.((((((..((((((((...(((((.((((((.(((((((....))))))).)))))).)))))...))))))))..)))))).))..	Cre-miR1155	3821042	3821063	TAGTCCTGCACGAGGAAGGAGC	Cre-miR1155*	3820974	3820994	TCGTTCCTCAAGCAGGACTCA		3
Cre-MIR1156	PmiREN024347	MIR1156	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	5707704	5707822	+	CCGTGTGGCACAGGCTACCATGGTAGCCAGTCTGCGCACCTGCAGCCAGCAGCTGAATTCATCAGCTGTCGGCTGCAGGTGCGCAGACTGGCTACCTTCGAAGCCTGGGCCTCACGGCG	(((((.(((.((((((.(...((((((((((((((((((((((((((.((((((((.....)))))))).))))))))))))))))))))))))))...).)))))).))).)))))))	5707725	5707803	TGGTAGCCAGTCTGCGCACCTGCAGCCAGCAGCTGAATTCATCAGCTGTCGGCTGCAGGTGCGCAGACTGGCTACCTTC	.((((((((((((((((((((((((((.((((((((.....)))))))).))))))))))))))))))))))))))...	Cre-miR1156	5707784	5707805	TGCGCAGACTGGCTACCTTC	Cre-miR1156*	5707724	5707744	TGGTAGCCAGTCTGCGCACCT		3
Cre-MIR1157	PmiREN003500	MIR1157	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	6402208	6402329	-	AGTGTTCCAGCTGCAGTACACCTGGTCCCGCTATTTGAATCTCGCTGATCGGCACCATGGGGGTGGTGGTGATCAGCGCTATTCAGGTAGCGGGACCAGGTGTACTGCAGCCGGAACACTGC	((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((.((((((....)))))).)))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))..	6402228	6402309	CCTGGTCCCGCTATTTGAATCTCGCTGATCGGCACCATGGGGGTGGTGGTGATCAGCGCTATTCAGGTAGCGGGACCAGGTG	((((((((((((((((((((..(((((((((.((((((....)))))).)))))))))..))))))))))))))))))))..	Cre-miR1157	6402228	6402248	TTCAGGTAGCGGGACCAGGTG	Cre-miR1157*	6402289	6402309	CCTGGTCCCGCTATTTGAATC		3
Cre-MIR1158	PmiREN024348	MIR1158	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	6154051	6154250	+	GTGCTAGCTCCGCAAGCACCGCGTCCTCTATGTCCGTCATGTCGGACTCGGCGTCGGAGCCAGGGCCCTCGGCTCGAGCATCAGTCGTCCGCGCTGCTGCTGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGACATGACGGATATTGAGGACGCGGTGCTTGCGGAGCTAGCAGAG	.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.....(((......))).(((((...))))).((((.(((.((....))))).)))).....................................................))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))	6154072	6154231	GCGTCCTCTATGTCCGTCATGTCGGACTCGGCGTCGGAGCCAGGGCCCTCGGCTCGAGCATCAGTCGTCCGCGCTGCTGCTGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGACATGACGGATATTGAGGACGCGG	((((((((.(((((((((((((((.....(((......))).(((((...))))).((((.(((.((....))))).)))).....................................................))))))))))))))).))))))))))	Cre-miR1158	6154211	6154233	TGACGGATATTGAGGACGCGG	Cre-miR1158*	6154071	6154091	GCGTCCTCTATGTCCGTCATG		3
Cre-MIR1159	PmiREN024349	MIR1159	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_14	1191527	1191790	-	CGTCGACAATCGGGCACTGTGGCAAACTGCGACAATGCCAATGGAGACGGATGAGACCGTGTTATTCCAGCAGCCGCGACTCCTGGAATGGTCACGCGGCTGAGGCACCCTTGCTGGGTACCCCAGCCGATGCCGATGTTCCAGCCGCAGTCACGGCGGCAGCCACAGCACGGCCTCATCCGTCTCCATTGGCATTGTACACCGTCTGCCACAGTGCCCGATTGCCGCCG	((.((.((((((((((((((((((.((.(.(((((((((((((((((((((((((.(((((((......((.((((.(((((((((((((((....((((((.((.((((.....)))).)).))))))..)))...)))))))..).)))).)))).))......))))))).)))))))))))))))))))))))).).).)).)))))))))))))))))).)).))	1191545	1191768	GACAATCGGGCACTGTGGCAAACTGCGACAATGCCAATGGAGACGGATGAGACCGTGTTATTCCAGCAGCCGCGACTCCTGGAATGGTCACGCGGCTGAGGCACCCTTGCTGGGTACCCCAGCCGATGCCGATGTTCCAGCCGCAGTCACGGCGGCAGCCACAGCACGGCCTCATCCGTCTCCATTGGCATTGTACACCGTCTGCCACAGTGCCCGATTGCCGC	(.((((((((((((((((((.((.(.(((((((((((((((((((((((((.(((((((......((.((((.(((((((((((((((....((((((.((.((((.....)))).)).))))))..)))...)))))))..).)))).)))).))......))))))).)))))))))))))))))))))))).).).)).)))))))))))))))))).)).	Cre-miR1159	1191545	1191567	GCCACAGTGCCCGATTGCCGC	Cre-miR1159*	1191750	1191770	GACAATCGGGCACTGTGGCAA		3
Cre-MIR1160	PmiREN024350	MIR1160	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	5488765	5488925	-	CCAGAGCCTCACAGACCTCAAGAAGGTCGGGTTCACAAGCAAATGACGCCTGCTTAACCAGGTCGTTGCCGCCGGAAAAGTCGTCAGCAGCGTGGCAGCCTGCTTAGCAGGCGTCATTTGCTTGTGAACCCGACCTTCTTGAGGTCTGTGAGGCTCTGGAG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((.(.(((.....))).).)))))).....))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	5488783	5488903	AGAAGGTCGGGTTCACAAGCAAATGACGCCTGCTTAACCAGGTCGTTGCCGCCGGAAAAGTCGTCAGCAGCGTGGCAGCCTGCTTAGCAGGCGTCATTTGCTTGTGAACCCGACCTTCTTG	((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((.(.(((.....))).).)))))).....))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	Cre-miR1160	5488883	5488905	AGAAGGTCGGGTTCACAAGCA	Cre-miR1160*	5488785	5488805	CTTGTGAACCCGACCTTCTTG		3
Cre-MIR1162	PmiREN003501	MIR1162	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	3067347	3067475	+	CCTGACACCACTGCGGCCGCCGGCCTAAATTACTACAACACGCCGCGCCTGGACCCGAGGGAGGACCCCTCGGGACCCGGTACGTCGTGTTGTAGTAGTTTAGCCCTGCGGTCGCGGTGGGGTCAGGTC	((((((.(((((((((((((.((.((((((((((((((((((.((.(((.((.((((((((.....)))))))).)).))).)).)))))))))))))))))).)).))))))))))))).))))))..	3067367	3067455	CGGCCTAAATTACTACAACACGCCGCGCCTGGACCCGAGGGAGGACCCCTCGGGACCCGGTACGTCGTGTTGTAGTAGTTTAGCCCTGC	.((.((((((((((((((((((.((.(((.((.((((((((.....)))))))).)).))).)).)))))))))))))))))).))...	Cre-miR1162	3067434	3067455	TGTTGTAGTAGTTTAGCCCTGC	Cre-miR1162*	3067367	3067387	CGGCCTAAATTACTACAACAC		3
Cre-MIR1163	PmiREN003502	MIR1163	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	5030985	5031208	-	GGCCGACCTAAAGGGCATGCTGCGTGCCATGGCGCCCTTCATCGTGCGCGCATAGGGTCTTGACTGCCAGGTTGAAGTCGCACACGCGGAAGACCTTGCTGCCATCAGGCGCGATGTCGTACAGCAGGTTGGCGGGCTTCAGGTCAAAGTGCATGTAGCCGCGAGCGTTCAGGTGCTTTGATGAAGAGCGCCATGGCACGCAGCATGCCCTTCAGGTCGGCCTC	(((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((((((...(.((((((((((((.(((..(((((....)))...(((.((((.(((....))))))).)))..))..))).)))))))...))))).)...))))((((........))))....))))..)))))))).))))))))))))))))))))))))).)))))))))..	5031005	5031188	TGCGTGCCATGGCGCCCTTCATCGTGCGCGCATAGGGTCTTGACTGCCAGGTTGAAGTCGCACACGCGGAAGACCTTGCTGCCATCAGGCGCGATGTCGTACAGCAGGTTGGCGGGCTTCAGGTCAAAGTGCATGTAGCCGCGAGCGTTCAGGTGCTTTGATGAAGAGCGCCATGGCACGCAGC	(((((((((((((((.((((((((.((((((((...(.((((((((((((.(((..(((((....)))...(((.((((.(((....))))))).)))..))..))).)))))))...))))).)...))))((((........))))....))))..)))))))).)))))))))))))))..	Cre-miR1163	5031005	5031025	AAGAGCGCCATGGCACGCAGC	Cre-miR1163*	5031168	5031188	TGCGTGCCATGGCGCCCTTCA		3
Cre-MIR1165	PmiREN003503	MIR1165	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	1999966	2000090	-	CCTCGCACGGCGCTGCACTATACCGTACAAGCGGTCCGTCCTGCGCCCCATCCTGCGTTTGAAAACGCAGGATGGGGCGCAGGACGGACCGCTTGTACGGATATGGCGCGCGTGCCGCCGGAGCT	.............(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).)))...............	1999986	2000070	TACCGTACAAGCGGTCCGTCCTGCGCCCCATCCTGCGTTTGAAAACGCAGGATGGGGCGCAGGACGGACCGCTTGTACGGATATG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))..	Cre-miR1165	2000050	2000070	TACCGTACAAGCGGTCCGTCC	Cre-miR1165*	1999986	2000006	CGGACCGCTTGTACGGATATG		3
Cre-MIR1167	PmiREN024351	MIR1167	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	2235899	2236021	+	GAGCATCATGCATCGTTACACCCCCCACCGTGCACCTTCACGCTCATGCGCAGCACTGTGCATGCTTGGGGTGTGATGATTTGAAACTT	(((..(((...(((((((((((((....(((((((.....(((....))).......)))))))...))))))))))))).)))..)))	2235920	2236002	ATCATGCATCGTTACACCCCCCACCGTGCACCTTCACGCTCATGCGCAGCACTGTGCATGCTTGGGGTGTGATGATTTGAAAC	.(((...(((((((((((((....(((((((.....(((....))).......)))))))...))))))))))))).)))..)	Cre-miR1167	2235983	2236004	GGGGTGTGATGATTTGAAAC	Cre-miR1167*	2235919	2235939	ATCATGCATCGTTACACCCCC		2
Cre-MIR1168	PmiREN003504	MIR1168	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	1339172	1339333	-	TCCGCGGTGGCCTCCTCCTCAATCTTGGCCTTGCGCGCTTCGGGCTTGGCCTGGTCTACACAGCAGGCAGGGTTGGGAAGCTCCCTTACCCTGCCTGCTGTGTGGACAAGGCCAAGTCCGAAGCACGGAAGGCGAAGATTGAGGAGGAGCGTGCAGTGCGGG	((((((.(((((((((((((((((((.(((((.((.((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((...))))..)))))))))))))))))))).)))))))))))))))).)).))))).))))))))))))))).)).)).))))))	1339192	1339313	AATCTTGGCCTTGCGCGCTTCGGGCTTGGCCTGGTCTACACAGCAGGCAGGGTTGGGAAGCTCCCTTACCCTGCCTGCTGTGTGGACAAGGCCAAGTCCGAAGCACGGAAGGCGAAGATTGA	((((((.(((((.((.((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((...))))..)))))))))))))))))))).)))))))))))))))).)).))))).))))))..	Cre-miR1168	1339192	1339212	AGCACGGAAGGCGAAGATTGA	Cre-miR1168*	1339293	1339313	AATCTTGGCCTTGCGCGCTTC		3
Cre-MIR1172	PmiREN003505	MIR1172	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-scaffold_24	82165	82336	+	TAATTTGAAGCTGAGTACAGTAGGATCGGAGACGCAGTGAAGCCCCCTTGCTGCTGCGATTCTTTCCGACTTACAACGTGCTCGTGGCGAGCACATTGTAGGTGTAGAGGATTGCAGCAGCAACGGGGCTCCGCTGAGTGTCCGAATCTACTGGATGCTGGATTTGTCCAGG	.................(((((((.(((((.((.(((((.((((((.((((((((((((((((((.(.((((((((.(((((((...))))))).))))))))).)))))))))))))))))).)))))).))))).)).))))).)))))))....(((((....))))).	82185	82316	TAGGATCGGAGACGCAGTGAAGCCCCCTTGCTGCTGCGATTCTTTCCGACTTACAACGTGCTCGTGGCGAGCACATTGTAGGTGTAGAGGATTGCAGCAGCAACGGGGCTCCGCTGAGTGTCCGAATCTACT	((((.(((((.((.(((((.((((((.((((((((((((((((((.(.((((((((.(((((((...))))))).))))))))).)))))))))))))))))).)))))).))))).)).))))).))))..	Cre-miR1172	82185	82206	TAGGATCGGAGACGCAGTGAAG	Cre-miR1172*	82296	82316	CGCTGAGTGTCCGAATCTACT		3
Cre-MIR9897	PmiREN003510	MIR9897	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_10	3399873	3400000	-	GATAAGAAGGAGCCGTAAGGTACCGGGCGTGGGGAGGGCAGGGGCAGGGACGGGGATCAGGGGCAGCTGATCCCCGTCCCTGCCCCTGCCCTCCCCGCGCCCGGTACCTTACGGCTCCTTCTTATCGG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	3399893	3399980	TACCGGGCGTGGGGAGGGCAGGGGCAGGGACGGGGATCAGGGGCAGCTGATCCCCGTCCCTGCCCCTGCCCTCCCCGCGCCCGGTACC	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miR9897	3399959	3399980	TACCGGGCGTGGGGAGGGCAGG	Cre-miR9897*	3399893	3399913	GCCCTCCCCGCGCCCGGTACC		3
Cre-MIRN591	PmiREN003514	MIRN591	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	1442255	1442398	+	CCAGGGACTGTTTACCAACGTGCAGGGGGACTTAGTGGAGATCCTCCTGTCCGGCTAAAACCTCTCGCCCAGCTTGCGCTCCAGGTAGCCGGACAGGAGGATCTCCACTAAGTCCCCCTGCACGTTGGT	.............(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((..(((.......)))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	1442275	1442378	TGCAGGGGGACTTAGTGGAGATCCTCCTGTCCGGCTAAAACCTCTCGCCCAGCTTGCGCTCCAGGTAGCCGGACAGGAGGATCTCCACTAAGTCCCCCTGCACG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((..(((.......)))....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN591	1442275	1442295	TGCAGGGGGACTTAGTGGAGA	Cre-miRN591*	1442358	1442378	TCCACTAAGTCCCCCTGCACG		3
Cre-MIRN592	PmiREN003518	MIRN592	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	7190099	7190307	+	CCTACAACCGGAACTACGTGTTCGTGCCCAACACGTCCAGCCTCACCAACGACGTCGTTGATGACCCCATCCGCAGTCGCCAGTCGCCAGACATCGATGGGATGATGCCATCAACGTCCGGCGACTGCCGGTTGCGGATGGCGCCGTCGATGGCGTCGTCGGTGAGGCTGGTGGTGGTGGGCACGAACACGTAATTGCGGTTGTAGGTA	((((((((((.((.((((((((((((((((.(((..(((((((((((.(((((((((((((((.(.(((((((((((((.((((((((.(((...(((((.......)))))...))).)))))))).))))))))))))).).))))))))))))))).)))))))))))..))).)))))))))))))))).)).))))))))))..	7190119	7190287	TTCGTGCCCAACACGTCCAGCCTCACCAACGACGTCGTTGATGACCCCATCCGCAGTCGCCAGTCGCCAGACATCGATGGGATGATGCCATCAACGTCCGGCGACTGCCGGTTGCGGATGGCGCCGTCGATGGCGTCGTCGGTGAGGCTGGTGGTGGTGGGCACGAACA	((((((((((.(((..(((((((((((.(((((((((((((((.(.(((((((((((((.((((((((.(((...(((((.......)))))...))).)))))))).))))))))))))).).))))))))))))))).)))))))))))..))).))))))))))..	Cre-miRN592	7190119	7190139	TTCGTGCCCAACACGTCCAGC	Cre-miRN592*	7190267	7190287	TGGTGGTGGTGGGCACGAACA		3
Cre-MIRN593	PmiREN003519	MIRN593	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	671120	671241	-	CGGGCTCCGTGCCCTTGCTCTATGGACAATGGATGGCATACGTGCCCTTATGACACGGCCTGTGCGCCGCAAGCAACGGGCTCCGCATCCTTGCTTTATGGACAATTCACGGCAAACGTGCC	..................(((((((((((.(((((.....(((((......).))))((((((((.......)).))))))....)))))))).))))))))....................	671140	671221	TATGGACAATGGATGGCATACGTGCCCTTATGACACGGCCTGTGCGCCGCAAGCAACGGGCTCCGCATCCTTGCTTTATGGA	(((((((((.(((((.....(((((......).))))((((((((.......)).))))))....)))))))).))))))..	Cre-miRN593	671202	671221	TATGGACAATGGATGGCATA	Cre-miRN593*	671140	671160	TCCGCATCCTTGCTTTATGGA		3
Cre-MIRN594	PmiREN003523	MIRN594	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_14	1950116	1950326	+	CTCCACGTTCTCGCCGCGCAGGTACTGCAGGGGCATCTCGATGTCCATCGCCTCGTAGGCGCGGAGCTCATCAAGCGCCTGCGTCTTGTCCAGGCGCTTGATGAGCTCCGCGCCTACGAGGCGATGGACATCGAGATGCCCCTGCAGTACCTGCGCGGCGAGAACGCGGAGAAGGTGGCGGAGAATGTAACGCGGCGGGTACTTCCCGTTC	((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(......))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))........................((((.....))))...	1950136	1950306	TCCACGTTCTCGCCGCGCAGGTACTGCAGGGGCATCTCGATGTCCATCGCCTCGTAGGCGCGGAGCTCATCAAGCGCCTGCGTCTTGTCCAGGCGCTTGATGAGCTCCGCGCCTACGAGGCGATGGACATCGAGATGCCCCTGCAGTACCTGCGCGGCGAGAACGCGGAGA	(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(......))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))..	Cre-miRN594	1950286	1950306	TGCGCGGCGAGAACGCGGAGA	Cre-miRN594*	1950136	1950156	TCCACGTTCTCGCCGCGCAGG		3
Cre-MIRN595	PmiREN003524	MIRN595	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	1711416	1711663	-	CAACGCCCAGGCCGATGCCGAGGCCCAGGACAGCCAGCCCGTCACCGGTGCTAAGGTGTGGCATTCTGAATACGTAGTGGTACAGCACAAGCGCGTGAGCTGCGCGACGGATTGTTTTCAAGCCCGATTCCGTCGCGCAGCTTACGCGCTTGTGCTGTACCTGTTTCCACTACGTATTCAATATGCCTCACCTTAGTACCGGTGACGGGCTGGCTGTCCTGGGCCTCGGCATCGGCCTGGGCTTTGGC	(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..........))).))))))))))))))))))))))))))))))))).......))))))))))))..))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))..	1711436	1711643	AGGCCCAGGACAGCCAGCCCGTCACCGGTGCTAAGGTGTGGCATTCTGAATACGTAGTGGTACAGCACAAGCGCGTGAGCTGCGCGACGGATTGTTTTCAAGCCCGATTCCGTCGCGCAGCTTACGCGCTTGTGCTGTACCTGTTTCCACTACGTATTCAATATGCCTCACCTTAGTACCGGTGACGGGCTGGCTGTCCTGGGCCTCG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..........))).))))))))))))))))))))))))))))))))).......))))))))))))..))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN595	1711623	1711643	AGGCCCAGGACAGCCAGCCCG	Cre-miRN595*	1711436	1711456	GGCTGGCTGTCCTGGGCCTCG		3
Cre-MIRN596	PmiREN003525	MIRN596	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	814052	814256	+	CAGCCTGCGCCCGGACCCTGTTCCTCCATCCATGCCAGCAGTGCAGACTTGGTCTTCTGTGACCACATGTACTGGCCTGCGGCCTTGGCCCTGTTGATACCTGCGGCAGCATCAGAGCACACAGCCAGGCCAGTACATTGGTCACAGAAGACCAAGTCTGCACTGCTGGCATGGATGGAGGAACAGGGTCCGGGCGCAGGCTGAA	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((..(((..((((.(((.((...((...))...)).))).)).))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	814072	814236	TTCCTCCATCCATGCCAGCAGTGCAGACTTGGTCTTCTGTGACCACATGTACTGGCCTGCGGCCTTGGCCCTGTTGATACCTGCGGCAGCATCAGAGCACACAGCCAGGCCAGTACATTGGTCACAGAAGACCAAGTCTGCACTGCTGGCATGGATGGAGGAACA	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((..(((..((((.(((.((...((...))...)).))).)).))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN596	814072	814092	TTCCTCCATCCATGCCAGCAG	Cre-miRN596*	814216	814236	GCTGGCATGGATGGAGGAACA		3
Cre-MIRN597a	PmiREN003528	MIRN597	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	1036770	1036896	+	TTGTATACGGGGATTTGCAAAGTGATTGGCGTGTTTTTGGTGCGCGTTTCGGCCGGGGCTTGTGCACAATTCGGGTCACATCGCGCGCCGAGTCATCCGAAAACTTTGCACAAGCCCAAACTTTGCA	................(((((((..((((.(((..(((((((((((....((((.(((.(((....)))))).))))....))))))))))).)))))))..)))))))..................	1036790	1036876	AGTGATTGGCGTGTTTTTGGTGCGCGTTTCGGCCGGGGCTTGTGCACAATTCGGGTCACATCGCGCGCCGAGTCATCCGAAAACTTT	(((..((((.(((..(((((((((((....((((.(((.(((....)))))).))))....))))))))))).)))))))..)))..	Cre-miRN597a	1036790	1036810	AGTGATTGGCGTGTTTTTGGT	Cre-miRN597a*	1036856	1036876	GCCGAGTCATCCGAAAACTTT		3
Cre-MIRN597b	PmiREN003659	MIRN597	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	6583136	6583366	-	GAAAACCCAAATGCAATTGCCAAAGCCCATACCATTACCAGTGATCTAGCAACTCACATTGGCGTGTTGCATTAATGCAGACACACACGCGCCACTGGACGCTGACGTGCATCCTCTTGAAACTATGCGTGCAAGTTGCCAAGGCGTTGATGACGTTAACACCATGATTGATGACTACGGGGATTTGCAAAGTGATTGGCGTGTTTTTGGTGCGCGTTTCGGCCGGGGCTT	(....((.((((((...((((((((..(((.((((((((((((.(((((..........((((((((((((....)))).......))))))))))))))))))....((((............)))).((((((((.((..(((((((((...............))))))).))..)).))))))))..)))).))).))).)))))))).)))))).)).).......	6583156	6583346	CAAAGCCCATACCATTACCAGTGATCTAGCAACTCACATTGGCGTGTTGCATTAATGCAGACACACACGCGCCACTGGACGCTGACGTGCATCCTCTTGAAACTATGCGTGCAAGTTGCCAAGGCGTTGATGACGTTAACACCATGATTGATGACTACGGGGATTTGCAAAGTGATTGGCGTGTTTTTGGT	(((((..(((.((((((((((((.(((((..........((((((((((((....)))).......))))))))))))))))))....((((............)))).((((((((.((..(((((((((...............))))))).))..)).))))))))..)))).))).))).)))))..	Cre-miRN597b	6583156	6583176	AGTGATTGGCGTGTTTTTGGT	Cre-miRN597b*	6583326	6583346	CAAAGCCCATACCATTACCAG		3
Cre-MIRN597c	PmiREN003660	MIRN597	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	4437973	4438222	+	ACGGCGAACTGCAGCAACCAGGGCATGCCGACCCGTGCGACGCTAGTTGTGAAGGACCCGCGTATAACCCAAACCTACTTGTGGGCTTGAAGGACTGGCCTGATAGCAGCCGCGCCTCGTACCGAGCGTACAGGTTCACTTCATAATCTGCCATGGCTCAGTTGCGCGCGCACACCTTAGAGGTGGTGCACCTACGGGGATTTGCAAAGTGATTGGCGTGTTTTTGGTGCGCGTTTCGGCCGGGGCTTGT	.(((((((.(((.(((.((((((((((((((((..(((((.(((((((.(..(((.((((((.................)))))))))..).)))))))(((....)))..((((.....((.((((...((((((........)))))).....)))).)).))))((((.(((((...))))))))).((....))...)))))..).).)))))))).)))))))))))).))).))))........	4437993	4438202	CAGGGCATGCCGACCCGTGCGACGCTAGTTGTGAAGGACCCGCGTATAACCCAAACCTACTTGTGGGCTTGAAGGACTGGCCTGATAGCAGCCGCGCCTCGTACCGAGCGTACAGGTTCACTTCATAATCTGCCATGGCTCAGTTGCGCGCGCACACCTTAGAGGTGGTGCACCTACGGGGATTTGCAAAGTGATTGGCGTGTTTTTGGT	(((((((((((((((..(((((.(((((((.(..(((.((((((.................)))))))))..).)))))))(((....)))..((((.....((.((((...((((((........)))))).....)))).)).))))((((.(((((...))))))))).((....))...)))))..).).)))))))).)))))..	Cre-miRN597c	4438182	4438202	AGTGATTGGCGTGTTTTTGGT	Cre-miRN597c*	4437993	4438013	CAGGGCATGCCGACCCGTGCG		3
Cre-MIRN597d	PmiREN003661	MIRN597	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	3690281	3690371	+	GGGGCGTTTGCTTGTTGTACCGGGTCAGGTCTTGTTACGGGGATTTGCAAAGTGATTGGCGTGTTTTTGGTGCGCGTTTCGGCCGGGGCTT	((.((((...........((((((.((.(((..(((((..(......)...))))).))).))..)))))))))).)).............	3690301	3690351	CGGGTCAGGTCTTGTTACGGGGATTTGCAAAGTGATTGGCGTGTTTTTGGT	((((.((.(((..(((((..(......)...))))).))).))..))))..	Cre-miRN597d	3690331	3690351	AGTGATTGGCGTGTTTTTGGT	Cre-miRN597d*	3690301	3690321	CGGGTCAGGTCTTGTTACGGG		3
Cre-MIRN598	PmiREN003529	MIRN598	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	5450288	5450496	-	TTGCCGAAAGCTTCCGAACGTCTGACAATGAGCTCGGCATCCTGGGCGTCCTGATCCATTGCTAGCGGACGGCATTTTCAGTCCCAATCCGTCGCTATGAGCGTTGGCTGCCTTGTTGGAACGACCCCCCCCCCCCCCCCCGCCCGCCGCCGCGCGCCTCCTCACTGCCGACACGCTCGTATTCGGACGCGTGCCCTGGTACCCCACCC	.(((((...((...((..(((((((..((((((((((((....((((((.((((((((.((((((((.((((.(((.........)))))))))))...)))).))).......))))).))).)))..............((.(((....))).))........))))))...))))))..))))))))).))..)))))........	5450308	5450476	TCTGACAATGAGCTCGGCATCCTGGGCGTCCTGATCCATTGCTAGCGGACGGCATTTTCAGTCCCAATCCGTCGCTATGAGCGTTGGCTGCCTTGTTGGAACGACCCCCCCCCCCCCCCCCGCCCGCCGCCGCGCGCCTCCTCACTGCCGACACGCTCGTATTCGGACG	(((((..((((((((((((....((((((.((((((((.((((((((.((((.(((.........)))))))))))...)))).))).......))))).))).)))..............((.(((....))).))........))))))...))))))..)))))..	Cre-miRN598	5450457	5450476	TCTGACAATGAGCTCGGCAT	Cre-miRN598*	5450308	5450328	CGACACGCTCGTATTCGGACG		3
Cre-MIRN599	PmiREN003531	MIRN599	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	3724945	3725131	+	GCATAGGGATTCAGGTATGTTGTGTTGTTCCATGTGTCATCATGCATGCTTAACCCGTTTCTCTCTGGGCCGGAGACGGCATGCTTAACCCTCTCTGGGCCGGAGACCGTCTCCGGCCCAGAGAGGAACGAGTTAAGCATGCATGATGACACATGGAACAACACAACATACCTGAACTGGGTGCGAT	.........(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((..(.(....(((.....)))..).)..)))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...........	3724965	3725111	TGTGTTGTTCCATGTGTCATCATGCATGCTTAACCCGTTTCTCTCTGGGCCGGAGACGGCATGCTTAACCCTCTCTGGGCCGGAGACCGTCTCCGGCCCAGAGAGGAACGAGTTAAGCATGCATGATGACACATGGAACAACACAAC	((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((..(.(....(((.....)))..).)..)))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN599	3725091	3725111	TGACACATGGAACAACACAAC	Cre-miRN599*	3724965	3724985	TGTGTTGTTCCATGTGTCATC		3
Cre-MIRN600	PmiREN003540	MIRN600	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	93717	93976	+	TGGTGTTGCGGGGATCGTGTTTCGTCACGCGGCATGTGGGTGGGACTGCAAGGTTTCGTCTTCGACGCTCCAAATGCCCCTCTGAACGCTCCACCCAACAGAACACGTACTAGCACACATTAGCATGCACATACTCAAGCATTTGCAGAACGTTTAGCCTCTGGAAAGCGGCTTGTCGGTCACAAAGGCGTGCCGACCCCCCAGAGATGACAGGACACTTTTTTCGCCTAACTTTATCGCCGCGTGTCAA	.((((..(((((((..((((((.((((((.(...((((((((((...(((.((...((((...))))..))...)))............))))))).)))...).))).((((.((......((((((..........)))..))).....)))))).((((((.....((...(((((.(((......)))))))).))))))))..))).))))))..)))))))..........)))).........	93737	93956	CGGGGATCGTGTTTCGTCACGCGGCATGTGGGTGGGACTGCAAGGTTTCGTCTTCGACGCTCCAAATGCCCCTCTGAACGCTCCACCCAACAGAACACGTACTAGCACACATTAGCATGCACATACTCAAGCATTTGCAGAACGTTTAGCCTCTGGAAAGCGGCTTGTCGGTCACAAAGGCGTGCCGACCCCCCAGAGATGACAGGACACTTTTTTCGCC	((((((..((((((.((((((.(...((((((((((...(((.((...((((...))))..))...)))............))))))).)))...).))).((((.((......((((((..........)))..))).....)))))).((((((.....((...(((((.(((......)))))))).))))))))..))).))))))..))))))..	Cre-miRN600	93936	93956	TGACAGGACACTTTTTTCGCC	Cre-miRN600*	93737	93757	CGGGGATCGTGTTTCGTCACG		3
Cre-MIRN601a	PmiREN003541	MIRN601	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	1344164	1344254	+	CTGCTGCGGCCGCCGCGGTGTAAGCCTATGAAACTGCCCTCGGGACATCCGGTAGCTTTTGCAGTCTTACAAATGGT	..................((((((.((.((((((((((...((.....))))))).))))).)).))))))......	1344184	1344234	TAAGCCTATGAAACTGCCCTCGGGACATCCGGTAGCTTTTGCAGTCTTACA	((((.((.((((((((((...((.....))))))).))))).)).))))..	Cre-miRN601a	1344184	1344204	TAAGCCTATGAAACTGCCCTC	Cre-miRN601a*	1344214	1344234	GGTAGCTTTTGCAGTCTTACA		3
Cre-MIRN601b	PmiREN003786	MIRN601	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	1344464	1344552	+	AATCAAGTGGGGGAGGGTGTAAGCCTATGAAACTGCCCTCGGGACATCCGGTAGCTTTTGCAGTCTTACACGCGGCCGCCTGCTGTTGC	.....((((((((.(.(((((((.((.((((((((((...((.....))))))).))))).)).))))))).)..)).)))))).....	1344484	1344532	AAGCCTATGAAACTGCCCTCGGGACATCCGGTAGCTTTTGCAGTCTTAC	(((.((.((((((((((...((.....))))))).))))).)).)))..	Cre-miRN601b	1344484	1344504	AAGCCTATGAAACTGCCCTCG	Cre-miRN601b*	1344512	1344532	CGGTAGCTTTTGCAGTCTTAC		3
Cre-MIRN602	PmiREN003543	MIRN602	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_16	4148146	4148385	-	TGCTGCTCTCCACGCTGCTAGTGCTCGTTGCGCCGGCCGCCGGCGGCCTGCTGCTGCTGGCGGAGTAGCCCAGTACCGGCGCTGAGGCACCCGCCGCCGCCAGCAGCCCGCGTCCCACGACTTTGCTCGTCGATGGCGGCGAGAGCCCAGTCATCAACATTGGCAGCGCCACAGCCATGCCGTCGGCACAGGACCGCCAGTGGAACGCAATCGGGGACGGCGCGTCGCCAGCAGTGTCAG	(((((......((((.(((.((.(((((((((....((((.(((((((((..(((((((((((..((((((......)).)))).(((....))).)))))))))))..(((((....)))...))..((((((((((((....((.(.((((.......)))).).))....)))..))))))))).)))).))))).))))..))))).)))).)))))))))...))))).......	4148166	4148365	GTGCTCGTTGCGCCGGCCGCCGGCGGCCTGCTGCTGCTGGCGGAGTAGCCCAGTACCGGCGCTGAGGCACCCGCCGCCGCCAGCAGCCCGCGTCCCACGACTTTGCTCGTCGATGGCGGCGAGAGCCCAGTCATCAACATTGGCAGCGCCACAGCCATGCCGTCGGCACAGGACCGCCAGTGGAACGCAATCGGGGACGG	((.(((((((((....((((.(((((((((..(((((((((((..((((((......)).)))).(((....))).)))))))))))..(((((....)))...))..((((((((((((....((.(.((((.......)))).).))....)))..))))))))).)))).))))).))))..))))).)))).))..	Cre-miRN602	4148166	4148185	TGGAACGCAATCGGGGACGG	Cre-miRN602*	4148345	4148365	GTGCTCGTTGCGCCGGCCGCC		3
Cre-MIRN603	PmiREN003545	MIRN603	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_16	5457874	5458081	-	CGCAGCTCGGCCCCGCACCCTCGCCATCTGCCGAACCACCCCCCCAGCACCAAAACCTGTGAAACCGTCCCCCACCGCGAGAAACAGACTCCACTATTAATTAATATGTGATCTGGGTGGCGGTAAGGGACGGTTTCACAGGTTTTGGTGCTGGGGTGGGGGTGGGGGTGGTTCGGCAGATGGCGAGGGTGCGGGCTGGTGCGGGGCA	....((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((.(....((((...(((((((....)))).))).))))..).)))))..)))))))))))))))))))))))))))).........)))))))))))))))))))))))))))))))).....)).)))).	5457894	5458061	TCGCCATCTGCCGAACCACCCCCCCAGCACCAAAACCTGTGAAACCGTCCCCCACCGCGAGAAACAGACTCCACTATTAATTAATATGTGATCTGGGTGGCGGTAAGGGACGGTTTCACAGGTTTTGGTGCTGGGGTGGGGGTGGGGGTGGTTCGGCAGATGGCGAGG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((.(....((((...(((((((....)))).))).))))..).)))))..)))))))))))))))))))))))))))).........)))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN603	5457894	5457913	TGGTTCGGCAGATGGCGAGG	Cre-miRN603*	5458041	5458061	TCGCCATCTGCCGAACCACCC		3
Cre-MIRN604	PmiREN003549	MIRN604	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	7188648	7188738	+	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCGGCGTTGTTGGCCAGAGCGTACGTGTGGTGGACGGCGTGGTTGTACTCGCCGCCGCCGCCAGCGCC	.......................((.((((((((.((((.(.......).)))).)))))))).)).........................	7188668	7188718	NNCGCGGCGTTGTTGGCCAGAGCGTACGTGTGGTGGACGGCGTGGTTGTAC	...((.((((((((.((((.(.......).)))).)))))))).)).....	Cre-miRN604	7188698	7188718	TGGTGGACGGCGTGGTTGTAC	Cre-miRN604*	7188668	7188688	NNCGCGGCGTTGTTGGCCAGA		3
Cre-MIRN605	PmiREN003550	MIRN605	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_2	8604508	8604599	+	TAGGCACGCGCCCACAGCGTTGCAGCTGAAGTCGGTGGCCAGCCGCAAGGGGCGGGTGACATCGGCGGCACGCAGTCCGGGCTCAGTCGTAA	..(((....)))....((((.((.(((((.((((.(.(((..((....))))).).)))).))))).))))))...................	8604528	8604579	TGCAGCTGAAGTCGGTGGCCAGCCGCAAGGGGCGGGTGACATCGGCGGCACG	.((.(((((.((((.(.(((..((....))))).).)))).))))).))...	Cre-miRN605	8604528	8604548	TGCAGCTGAAGTCGGTGGCCA	Cre-miRN605*	8604559	8604579	GCGGGTGACATCGGCGGCACG		3
Cre-MIRN606a	PmiREN003552	MIRN606	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	5626495	5626608	-	AGCGTGCAGCTAACCGCACATGCTCAAGTCACGGCCGCAACCACACTGGCAGTGATCTGTACGCATGCAAGGTTGCGGACGAGACTTTAGCATGCGCGGTTAGCTGCACGCTTG	(((((((((((((((((.((((((.(((((.((.((((((((......((((((.......))).)))..)))))))).)).))))).)))))).)))))))))))))))))..	5626515	5626588	TGCTCAAGTCACGGCCGCAACCACACTGGCAGTGATCTGTACGCATGCAAGGTTGCGGACGAGACTTTAGCATG	((((.(((((.((.((((((((......((((((.......))).)))..)))))))).)).))))).))))..	Cre-miRN606a	5626515	5626535	TGCGGACGAGACTTTAGCATG	Cre-miRN606a*	5626568	5626588	TGCTCAAGTCACGGCCGCAAC		3
Cre-MIRN606b	PmiREN003553	MIRN606	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	5622093	5622206	-	AGCGTGCAGCTAACCGCACATGCTCAAGTCACGGCCGCAACCACACTGGCAGTGATCTGTACGCATGCAAGGTTGCGGACGAGACTTTAGCATGCGCGGTTAGCTGCACGCTTG	(((((((((((((((((.((((((.(((((.((.((((((((......((((((.......))).)))..)))))))).)).))))).)))))).)))))))))))))))))..	5622113	5622186	TGCTCAAGTCACGGCCGCAACCACACTGGCAGTGATCTGTACGCATGCAAGGTTGCGGACGAGACTTTAGCATG	((((.(((((.((.((((((((......((((((.......))).)))..)))))))).)).))))).))))..	Cre-miRN606b	5622113	5622133	TGCGGACGAGACTTTAGCATG	Cre-miRN606b*	5622166	5622186	TGCTCAAGTCACGGCCGCAAC		3
Cre-MIRN607	PmiREN003555	MIRN607	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_8	313441	313632	-	GACACCCCGCTGGCCTGCCTGCTCGTACGCCGCGTCCAGGAACGCCAGTACGACTGGCATGGAGGGCAGATCGTTTCCCGTATCCCGGCCGTTCATCGCAGCACTCTGAGGGGGAAACGATCTGCCCTCCATGCCAGTCGTACTGGCGTTCCTGGACGCGGCGTACGAGCAGGCAGGCCAGCGGGGTGTCGG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((...((.((.....)).)).....))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	313461	313612	GCTCGTACGCCGCGTCCAGGAACGCCAGTACGACTGGCATGGAGGGCAGATCGTTTCCCGTATCCCGGCCGTTCATCGCAGCACTCTGAGGGGGAAACGATCTGCCCTCCATGCCAGTCGTACTGGCGTTCCTGGACGCGGCGTACGAGCAG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((...((.((.....)).)).....))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN607	313461	313480	TGGACGCGGCGTACGAGCAG	Cre-miRN607*	313592	313612	GCTCGTACGCCGCGTCCAGGA		3
Cre-MIRN608a	PmiREN003557	MIRN608	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_10	4788570	4788654	-	GGTTGGTCTGCTTCAGGCGCTTGCGGCCGCCCCGGCGGATGCCCTCCAGCTGGGCGGCCGTCTCCTTGCCGCTGCCGAATAGGGT	......................((((((((((.((((((.....))).)))))))))))))........................	4788590	4788634	TTGCGGCCGCCCCGGCGGATGCCCTCCAGCTGGGCGGCCGTCTCC	..((((((((((.((((((.....))).)))))))))))))....	Cre-miRN608a	4788590	4788610	TCCAGCTGGGCGGCCGTCTCC	Cre-miRN608a*	4788614	4788634	TTGCGGCCGCCCCGGCGGATG		3
Cre-MIRN608b	PmiREN003657	MIRN608	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	781427	781507	-	CTCGTCCTGGCCGCTGCCGAACGCGGTCGCCTGCCGGCCCTCCAGCTGGGCGGCCGTCTCCTGGCCGCTGCCAAACTGGGC	.......((((.((.((((...((((((((((((.((....)).)).))))))))))....)))).)).))))........	781447	781487	ACGCGGTCGCCTGCCGGCCCTCCAGCTGGGCGGCCGTCTCC	..((((((((((((.((....)).)).))))))))))....	Cre-miRN608b	781447	781466	CCAGCTGGGCGGCCGTCTCC	Cre-miRN608b*	781467	781487	ACGCGGTCGCCTGCCGGCCCT		3
Cre-MIRN609	PmiREN003560	MIRN609	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	4818664	4818769	-	GGCCAGATCAGTCCAAGACGTTGCTGACTTAGCAGAGGATAGCGGGCTTGTGGCCGGGGGAGCTATCCTCTGCTAAGTCAGCAACATCTGANNNNNNNNNNNNNNN	((.(......).)).(((.((((((((((((((((((((((((...((((....))))...)))))))))))))))))))))))).))).................	4818684	4818749	TTGCTGACTTAGCAGAGGATAGCGGGCTTGTGGCCGGGGGAGCTATCCTCTGCTAAGTCAGCAACA	(((((((((((((((((((((((...((((....))))...)))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN609	4818729	4818749	TTGCTGACTTAGCAGAGGATA	Cre-miRN609*	4818684	4818704	TCCTCTGCTAAGTCAGCAACA		3
Cre-MIRN610a	PmiREN003570	MIRN610	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	864	990	-	CTAATGCTTTAGTAGATGGCTTGGAGCTGTGCTTGTCGACCCAAACCAGGAACTTTGGCCCTGTGCCGAAGCAAACCCCTATTTTCTCGACCTGAGCTCAGGCAAGATTACCCGCTGAACTTAAGCA	....(((((.(((((.(((((((...(((.(((((((((.........((..(((((((.....)))))))....)).........)))))..)))).))).)))).....)))))..))).)))))	884	970	TTGGAGCTGTGCTTGTCGACCCAAACCAGGAACTTTGGCCCTGTGCCGAAGCAAACCCCTATTTTCTCGACCTGAGCTCAGGCAAGA	(((...(((.(((((((((.........((..(((((((.....)))))))....)).........)))))..)))).))).)))..	Cre-miRN610a	884	905	CTCGACCTGAGCTCAGGCAAGA	Cre-miRN610a*	950	970	TTGGAGCTGTGCTTGTCGACC		3
Cre-MIRN610b	PmiREN003574	MIRN610	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_8	5030120	5030246	+	CTAATGCTTTAGTAGATGGCTTGGAGCTGTGCTTGTCGACCCAAACCAGGAACTTTGGCCCTGTGCCGAAGCAAACCCCTATTTTCTCGACCTGAGCTCAGGCAAGATTACCCGCTGAACTTAAGCA	....(((((.(((((.(((((((...(((.(((((((((.........((..(((((((.....)))))))....)).........)))))..)))).))).)))).....)))))..))).)))))	5030140	5030226	TTGGAGCTGTGCTTGTCGACCCAAACCAGGAACTTTGGCCCTGTGCCGAAGCAAACCCCTATTTTCTCGACCTGAGCTCAGGCAAGA	(((...(((.(((((((((.........((..(((((((.....)))))))....)).........)))))..)))).))).)))..	Cre-miRN610b	5030205	5030226	CTCGACCTGAGCTCAGGCAAGA	Cre-miRN610b*	5030140	5030160	TTGGAGCTGTGCTTGTCGACC		3
Cre-MIRN611	PmiREN003573	MIRN611	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_8	436409	436560	-	TGTGGCCACGCCCCTTCTGCTGGACTTCCTGCGGCACTTCGTCGTCTGCCACTTGGTGTCGCAGACCGCGCAGTGGAAGGCGGGGTGACGGGGTCCGTTCGGCAGACGACGAAGTGCCGCAGGAAGTCCAGCAGGCGGTACCGAAGGGGCGT	.......(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((.(((((..((((..........))))..)).))).).)))...)))))))))))))))))))))))))))))))))((.....))))))))))))	436429	436540	TGGACTTCCTGCGGCACTTCGTCGTCTGCCACTTGGTGTCGCAGACCGCGCAGTGGAAGGCGGGGTGACGGGGTCCGTTCGGCAGACGACGAAGTGCCGCAGGAAGTCCAGC	((((((((((((((((((((((((((((((...((((.(((((..((((..........))))..)).))).).)))...))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN611	436520	436540	TGGACTTCCTGCGGCACTTCG	Cre-miRN611*	436429	436449	AAGTGCCGCAGGAAGTCCAGC		3
Cre-MIRN612a	PmiREN003583	MIRN612	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	886032	886123	+	GCTTGCAAGTTATGGTCAGGTTGCGACATGTGGACGTGCGTTGCGGAACTAATGGACATGTGAATTGCGACATACGACATTGCGACATAAGG	..............(((..(((((((((((((..(((..(((....)))..)))..))))))..)))))))....)))....(........)	886052	886103	TTGCGACATGTGGACGTGCGTTGCGGAACTAATGGACATGTGAATTGCGACA	((((((((((((..(((..(((....)))..)))..))))))..))))))..	Cre-miRN612a	886084	886103	TGGACATGTGAATTGCGACA	Cre-miRN612a*	886052	886072	TTGCGACATGTGGACGTGCGT		3
Cre-MIRN612b	PmiREN003626	MIRN612	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	8965983	8966139	-	ACACAAGCGTTCGTTCGTTGTTACAAGGCGGTGTGCACGAGCAACGGGCACGGATTCCGTTGCAAGCCCGAGCTATAGCAGCTTGCAAGTTATTTGACATGGTCAGGTTGCGACATGTGGACATGTGAATTGCGACATACGACCTTGCGCCATACTG	..............((((((((.(((..((((((.(((.(((..(((((((((...)))).....))))).)))...((((((((((.(((....))).))..)))))))).....))).)))).))..))).)))).))))...............	8966003	8966119	TTACAAGGCGGTGTGCACGAGCAACGGGCACGGATTCCGTTGCAAGCCCGAGCTATAGCAGCTTGCAAGTTATTTGACATGGTCAGGTTGCGACATGTGGACATGTGAATTGCGACA	((.(((..((((((.(((.(((..(((((((((...)))).....))))).)))...((((((((((.(((....))).))..)))))))).....))).)))).))..))).))..	Cre-miRN612b	8966003	8966022	TGGACATGTGAATTGCGACA	Cre-miRN612b*	8966099	8966119	TTACAAGGCGGTGTGCACGAG		3
Cre-MIRN613	PmiREN003585	MIRN613	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	6169225	6169342	+	ACTTAGGGTCAGCTCTTGCGTAGGGCTATGGGGCAGTGCAGCAGCAGACAGCCTGCACGTGCAGCATAACTTGCTCTGTACTCGTTCCAGTCATTGCACAGGGATTCGGTCACGCCCG	...................((((((((..((((((((((((.(((((.....((((....))))......)))))))))))).))))))))).)))).........(((......)))	6169245	6169322	TAGGGCTATGGGGCAGTGCAGCAGCAGACAGCCTGCACGTGCAGCATAACTTGCTCTGTACTCGTTCCAGTCATTGCA	(((((((..((((((((((((.(((((.....((((....))))......)))))))))))).))))))))).)))..	Cre-miRN613	6169245	6169265	TAGGGCTATGGGGCAGTGCAG	Cre-miRN613*	6169302	6169322	GTACTCGTTCCAGTCATTGCA		3
Cre-MIRN614	PmiREN003594	MIRN614	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_15	1840192	1840415	+	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGCTCTGACAGCCGCGCTGCAGCACGTCCTCTTGCCGATATCCATTCCGACTTCTGCTGCGTTCGTCCCTGCATACAGGCTCCGCCACGCCTGCGGCCCCTACGTCCAGCACGCCACCCAGCAAGCCCACCGGGATGTCGCTTGCAGCTGCGCTCGAGAAGCGCATGCAGTCCACATCTCAGCGCTCTACCCG	.............(((((((((((((((((((.(((.((..((.((((((((((((((((((((((.((..((......))..))(((((.(..(((....((...(((((........)))))..))....))).)))))).........)))))......))))))).)).)))))).))))))))).))))))))))...)))))....))))........	1840212	1840395	TGTGTGTGTGTTGCTCTGACAGCCGCGCTGCAGCACGTCCTCTTGCCGATATCCATTCCGACTTCTGCTGCGTTCGTCCCTGCATACAGGCTCCGCCACGCCTGCGGCCCCTACGTCCAGCACGCCACCCAGCAAGCCCACCGGGATGTCGCTTGCAGCTGCGCTCGAGAAGCGCATGCAGTCC	.(((((((((((.(((.((..((.((((((((((((((((((((((.((..((......))..))(((((.(..(((....((...(((((........)))))..))....))).)))))).........)))))......))))))).)).)))))).))))))))).))))))))))...)	Cre-miRN614	1840376	1840395	TCGAGAAGCGCATGCAGTCC	Cre-miRN614*	1840212	1840232	TGTGTGTGTGTTGCTCTGACA		3
Cre-MIRN615	PmiREN003600	MIRN615	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_2	3113842	3113922	+	CTCCAGTAGGCCCACAGCTGCCTGCTGCGGCGTGCTGCTGGACCTCCGGCTCATCCACCACGGCCGCCGACGCCGCTGCCC	.((((((((((((.((((.....)))).)).)).))))))))..................((((.((....)).))))...	3113862	3113902	CCAGTAGGCCCACAGCTGCCTGCTGCGGCGTGCTGCTGGAC	(((((((((((.((((.....)))).)).)).)))))))..	Cre-miRN615	3113882	3113902	TGCTGCGGCGTGCTGCTGGAC	Cre-miRN615*	3113862	3113882	CCAGTAGGCCCACAGCTGCCT		3
Cre-MIRN616a	PmiREN003601	MIRN616	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	5535874	5536126	-	CGTGAGCAACTGGGTGGTCGAGGCGATTGGCGTCCGCAGGCTGTGCACTACCGAGCCCGACGAGGAATTTGAGGAGAGGAGGGAAGAGACAGAGACCGAGGAGGGAGGAGAGGAGATGGAGGCTTAGGGCGGGAAAGGGCGAGAGTGGAGTCAACGTTTGCGGCACCCTAGGGCCGCACTGGGGCGCGCGGCTTAAGTAGGGGCGGACCGACAGCTGTGGGTGCTTTGCACGGGGCGCCGCTGCACGT	(((((((.....((((.((...((((..(((((((((((.((((...((.((...(((..(..((..((((..................))))..))..)..))).)))).(.(((((..(((((...((........)).......)))))..))))).).((.((((((((((((.(......).)))))))...)))))))......)))))))))))))))))))...)).))))))).)))). .-86	5535894	5536106	AGGCGATTGGCGTCCGCAGGCTGTGCACTACCGAGCCCGACGAGGAATTTGAGGAGAGGAGGGAAGAGACAGAGACCGAGGAGGGAGGAGAGGAGATGGAGGCTTAGGGCGGGAAAGGGCGAGAGTGGAGTCAACGTTTGCGGCACCCTAGGGCCGCACTGGGGCGCGCGGCTTAAGTAGGGGCGGACCGACAGCTGTGGGTGCTTTGCACGG	..((((..(((((((((((.((((...((.((...(((..(..((..((((..................))))..))..)..))).)))).(.(((((..(((((...((........)).......)))))..))))).).((.((((((((((((.(......).)))))))...)))))))......)))))))))))))))))))....	Cre-miRN616a	5536086	5536106	AGGCGATTGGCGTCCGCAGGC	Cre-miRN616a*	5535894	5535914	AGCTGTGGGTGCTTTGCACGG		3
Cre-MIRN616b	PmiREN003605	MIRN616	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	5511036	5511288	-	CGTGAGCAACTGGGTGGTCGAGGCGATTGGCGTCCGCAGGCTGTGCACTACCGAGCCCGACGAGGAATTTGAGGAGAGGAGGGAAGAGACAGAGACCGAGGAGGGAGGAGAGGAGATGGAGGCTTAGGGCGGGAAAGGGCGAGAGTGGAGTCAACGTTTGCGGCACCCTAGGGCCGCACTGGGGCGCGCGGCTTAAGTAGGGGCGGACCGACAGCTGTGGGTGCTTTGCACGGGGCGCCGCTGCACGT	(((((((.....((((.((...((((..(((((((((((.((((...((.((...(((..(..((..((((..................))))..))..)..))).)))).(.(((((..(((((...((........)).......)))))..))))).).((.((((((((((((.(......).)))))))...)))))))......)))))))))))))))))))...)).))))))).)))). .-86	5511056	5511268	AGGCGATTGGCGTCCGCAGGCTGTGCACTACCGAGCCCGACGAGGAATTTGAGGAGAGGAGGGAAGAGACAGAGACCGAGGAGGGAGGAGAGGAGATGGAGGCTTAGGGCGGGAAAGGGCGAGAGTGGAGTCAACGTTTGCGGCACCCTAGGGCCGCACTGGGGCGCGCGGCTTAAGTAGGGGCGGACCGACAGCTGTGGGTGCTTTGCACGG	..((((..(((((((((((.((((...((.((...(((..(..((..((((..................))))..))..)..))).)))).(.(((((..(((((...((........)).......)))))..))))).).((.((((((((((((.(......).)))))))...)))))))......)))))))))))))))))))....	Cre-miRN616b	5511248	5511268	AGGCGATTGGCGTCCGCAGGC	Cre-miRN616b*	5511056	5511076	AGCTGTGGGTGCTTTGCACGG		3
Cre-MIRN617a	PmiREN003608	MIRN617	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	5511840	5512079	+	GACTGCGACCGGCGGTGCGCCGCTCTGCGCCGCCCCTCCGCCCGCCGGGCCCTCCTCCGCTGGCGCCATGGCGGCCAGCGGCTCTATGGCCAGCGCCACCTCGCTGCTAGAGTCCTCCTCTGGAATGTCCGCCAGCAGCCGGCGGGGTGATATGTCGCTAATACCGGCCGCGCCCAGGTCCGACGTCGTGCCCGCCCAATCAGGGTCGGCGAGCAGCGGCTGCGCCGCCATCGGTTGGGC	(((((.....((((((((((((((((.(((((.((((......((.((((.(((((((((((((((..((((((((((.((((((..(((.((((......)))))))))))....)).)))).....)))))))).)))))))))).)).((((((.....((((((...)))..))).)))))).).))))))......)))).))))))).)))))).))))))))..)))))....	5511860	5512059	CGCTCTGCGCCGCCCCTCCGCCCGCCGGGCCCTCCTCCGCTGGCGCCATGGCGGCCAGCGGCTCTATGGCCAGCGCCACCTCGCTGCTAGAGTCCTCCTCTGGAATGTCCGCCAGCAGCCGGCGGGGTGATATGTCGCTAATACCGGCCGCGCCCAGGTCCGACGTCGTGCCCGCCCAATCAGGGTCGGCGAGCAGCGGC	((((((.(((((.((((......((.((((.(((((((((((((((..((((((((((.((((((..(((.((((......)))))))))))....)).)))).....)))))))).)))))))))).)).((((((.....((((((...)))..))).)))))).).))))))......)))).))))))).))))..	Cre-miRN617a	5512039	5512059	TCAGGGTCGGCGAGCAGCGGC	Cre-miRN617a*	5511860	5511880	CGCTCTGCGCCGCCCCTCCGC		3
Cre-MIRN617b	PmiREN003610	MIRN617	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	5536678	5536917	+	GACTGCGACCGGCGGTGCGCCGCTCTGCGCCGCCCCTCCGCCCGCCGGGCCCTCCTCCGCTGGCGCCATGGCGGCCAGCGGCTCTATGGCCAGCGCCACCTCGCTGCTAGAGTCCTCCTCTGGAATGTCCGCCAGCAGCCGGCGGGGTGATATGTCGCTAATACCGGCCGCGCCCAGGTCCGACGTCGTGCCCGCCCAATCAGGGTCGGCGAGCAGCGGCTGCGCCGCCATCGGTTGGGC	(((((.....((((((((((((((((.(((((.((((......((.((((.(((((((((((((((..((((((((((.((((((..(((.((((......)))))))))))....)).)))).....)))))))).)))))))))).)).((((((.....((((((...)))..))).)))))).).))))))......)))).))))))).)))))).))))))))..)))))....	5536698	5536897	CGCTCTGCGCCGCCCCTCCGCCCGCCGGGCCCTCCTCCGCTGGCGCCATGGCGGCCAGCGGCTCTATGGCCAGCGCCACCTCGCTGCTAGAGTCCTCCTCTGGAATGTCCGCCAGCAGCCGGCGGGGTGATATGTCGCTAATACCGGCCGCGCCCAGGTCCGACGTCGTGCCCGCCCAATCAGGGTCGGCGAGCAGCGGC	((((((.(((((.((((......((.((((.(((((((((((((((..((((((((((.((((((..(((.((((......)))))))))))....)).)))).....)))))))).)))))))))).)).((((((.....((((((...)))..))).)))))).).))))))......)))).))))))).))))..	Cre-miRN617b	5536877	5536897	TCAGGGTCGGCGAGCAGCGGC	Cre-miRN617b*	5536698	5536718	CGCTCTGCGCCGCCCCTCCGC		3
Cre-MIRN618	PmiREN003614	MIRN618	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_2	9173282	9173410	-	CTGGAGGGCGCAAGCACGCAACGAGGGGATGACGAGCACGATGTGGGCCTGATACAGGCGGGCGACGAGGCTGTATCAGGCCCGCATCGTGCTCGTCATCCCCTCGTTGCGTGCTTGCGCCCTCCAGCC	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(.........).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	9173302	9173390	ACGAGGGGATGACGAGCACGATGTGGGCCTGATACAGGCGGGCGACGAGGCTGTATCAGGCCCGCATCGTGCTCGTCATCCCCTCGTTG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(.........).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN618	9173370	9173390	ACGAGGGGATGACGAGCACGA	Cre-miRN618*	9173302	9173322	GTGCTCGTCATCCCCTCGTTG		3
Cre-MIRN619	PmiREN003617	MIRN619	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_2	2294314	2294562	-	GGCGACAGCGGTGGCGGCGGCGGACAGGCGGCGGAGGGAACCGCGCGCAGCGCGGCGGCGAAGGCCAGACATCGGTGCGTCGTGCAATAAGCTCGTGTGGTTTTGCGCCCGTCGGCCCAGCTTGTCGATGGGCTGCACCACACGAGCTCGCACGACGCACCGATGTCTGGCCCGCGCTGCCAGTGGACGCCGCCGCGCTGCGCGCGGTTCCCTCCGCCGCCTGTCCGCCGCCGCCACCGCTGTCGCCA	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((((((((((((((((....((((((((((((...((((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).))))))))))))))))))))))((((.......)))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))). 	2294334	2294542	CGGACAGGCGGCGGAGGGAACCGCGCGCAGCGCGGCGGCGAAGGCCAGACATCGGTGCGTCGTGCAATAAGCTCGTGTGGTTTTGCGCCCGTCGGCCCAGCTTGTCGATGGGCTGCACCACACGAGCTCGCACGACGCACCGATGTCTGGCCCGCGCTGCCAGTGGACGCCGCCGCGCTGCGCGCGGTTCCCTCCGCCGCCTGTCCGCC	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((((((((((((((((....((((((((((((...((((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).))))))))))))))))))))))((((.......)))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN619	2294522	2294542	CGGACAGGCGGCGGAGGGAAC	Cre-miRN619*	2294334	2294354	TCCCTCCGCCGCCTGTCCGCC		3
Cre-MIRN620	PmiREN003622	MIRN620	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	2574489	2574590	+	CGGAGCCAGGCTCTTCGGCGTCGTCAGCGCCGGACGTCGGCCGCAGCCCTGAGAAGAAGTGGGTGGACGACTGGGCGAGATTCCGCAGGGCCACGGAGGCGT	(.(.....((((((.(((.(((.((.((.((((.((((.(((.((...((....))...))))).)))).))))))))))).))).)))))).).)......	2574509	2574570	TCGTCAGCGCCGGACGTCGGCCGCAGCCCTGAGAAGAAGTGGGTGGACGACTGGGCGAGATT	((.((.((.((((.((((.(((.((...((....))...))))).)))).))))))))))..	Cre-miRN620	2574509	2574529	TCGTCAGCGCCGGACGTCGGC	Cre-miRN620*	2574550	2574570	GGTGGACGACTGGGCGAGATT		3
Cre-MIRN621	PmiREN003624	MIRN621	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_2	6626342	6626461	+	GCAACTTGGCGATGGACATGCCAGTTCTGCCGTGTTTGGCTGATTGAGCTGATTGAGGTCTGAGACCAGGCTCAATCAGCCGAACACGGCAGAACTGACATTGTGACATGTCCATCGCCA	......((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......((((...)))).))))))))))))))))))))))))))))).......).))))))))))))))	6626362	6626441	CCAGTTCTGCCGTGTTTGGCTGATTGAGCTGATTGAGGTCTGAGACCAGGCTCAATCAGCCGAACACGGCAGAACTGACA	.(((((((((((((((((((((((((((((......((((...)))).)))))))))))))))))))))))))))))...	Cre-miRN621	6626422	6626441	CGAACACGGCAGAACTGACA	Cre-miRN621*	6626362	6626382	CCAGTTCTGCCGTGTTTGGCT		3
Cre-MIRN622	PmiREN003628	MIRN622	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	6441868	6442052	+	AGAAGAGTTTCAGGGCCGCGAAATGGAAGAGGCCGAAGTGGCGAGGTCTCTCTCAACAGGGGCACCCGCAGCAGAAGAGGCGCTGGTGTAGACCAATCAAGGTGAGGATTACTAGTTCTCAAGTGCTAGCTTGGTGTTTTGTGACTGGGGCCGGCTTCCCTTTCGGTTCTTGCGCACATCTTGGC	..................(((((.(((((.((((..(((.(((((..((((......))))(((((.((((((...((((.(((((((...(((......)))......)))))))))))...)))).))..)))))))))).)))..))))..))))).)))))....................	6441888	6442032	AAATGGAAGAGGCCGAAGTGGCGAGGTCTCTCTCAACAGGGGCACCCGCAGCAGAAGAGGCGCTGGTGTAGACCAATCAAGGTGAGGATTACTAGTTCTCAAGTGCTAGCTTGGTGTTTTGTGACTGGGGCCGGCTTCCCTTTCG	(((.(((((.((((..(((.(((((..((((......))))(((((.((((((...((((.(((((((...(((......)))......)))))))))))...)))).))..)))))))))).)))..))))..))))).)))..	Cre-miRN622	6441888	6441908	AAATGGAAGAGGCCGAAGTGG	Cre-miRN622*	6442012	6442032	CTGGGGCCGGCTTCCCTTTCG		3
Cre-MIRN623	PmiREN003630	MIRN623	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_5	3118927	3119045	-	ACGTGCCGCCAGGAGTGAGTACCGCGCGGCGACCTCTCGCAGTGCCGCAGCGCTTTGGTTTTCCGTGTGGGTGGAACTTGGGCAGGCGTTGTGAGGCATAAAGGCGGACCGGCCGCACT	.....................((.(((((((.(((((((.(((.((((..(((..(((....))).))).)))).))))))).)))))))))).)).......................	3118947	3119025	ACCGCGCGGCGACCTCTCGCAGTGCCGCAGCGCTTTGGTTTTCCGTGTGGGTGGAACTTGGGCAGGCGTTGTGAGGCAT	.((.(((((((.(((((((.(((.((((..(((..(((....))).))).)))).))))))).)))))))))).))...	Cre-miRN623	3118947	3118967	TGGGCAGGCGTTGTGAGGCAT	Cre-miRN623*	3119005	3119025	ACCGCGCGGCGACCTCTCGCA		3
Cre-MIRN624	PmiREN003633	MIRN624	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	6776066	6776232	-	CATGACCGACCCCGGTGTTGTGGGCGTGACCGTCCTCCTTCCCAAGTTCTTCGAGCTCTACCCGAACGTCGAGTTCAAGTACTGTACTTGAACTCGACGTTCGGGTAGAGCTCGAAGGTCTTGGGAAGGAGGACGGTCACGCCCACAACACCGGGGTCGGTCATGTT	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	6776086	6776212	TGGGCGTGACCGTCCTCCTTCCCAAGTTCTTCGAGCTCTACCCGAACGTCGAGTTCAAGTACTGTACTTGAACTCGACGTTCGGGTAGAGCTCGAAGGTCTTGGGAAGGAGGACGGTCACGCCCACA	((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN624	6776086	6776106	AGGAGGACGGTCACGCCCACA	Cre-miRN624*	6776192	6776212	TGGGCGTGACCGTCCTCCTTC		3
Cre-MIRN625	PmiREN003634	MIRN625	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_5	1887496	1887600	-	TAACAGTGCGTGTTGGCACGTGTTGGCACGAAGCACTGGAGACCTCGGTACTCTCTACCGGCCCCCAGGGCCATGCCATAACACGTGTTGACGTTGTAGGCTGCT	............((((((((((((((((....((.((((.(...((((((.....)))))).).)))).))..)))))..)))))))))))..............	1887516	1887580	TGTTGGCACGAAGCACTGGAGACCTCGGTACTCTCTACCGGCCCCCAGGGCCATGCCATAACACG	((((((((....((.((((.(...((((((.....)))))).).)))).))..)))))..)))..	Cre-miRN625	1887560	1887580	TGTTGGCACGAAGCACTGGAG	Cre-miRN625*	1887516	1887536	CCAGGGCCATGCCATAACACG		3
Cre-MIRN626a	PmiREN003637	MIRN626	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	5707765	5707962	+	CATCAGCTGTCGGCTGCAGGTGCGCAGACTGGCTACCTTCGAAGCCTGGGCCTCACGGCGGTGGACCCTCGCATGTCCGTGAAGGGGGCTCATGACCCTACCCAGTTTCAGCTGGAGCTTCAGGCACATCAGAGAGGTGCGTATACCCAAGGCCCCGTAGGTAGCGTGCCTGCGCTTTTGCAACCAGCAGCAGATTGC	.(((.(((((.((.((((((.((((((.(..(((((((.((..(((((((..((((((((((((....)))).)).)))))).((((........))))..(((((....)))))......(.((((.((...)).)))).)...))).))))..)).)))))))..).)))))).)))))).)).))))).)))...	5707785	5707942	TGCGCAGACTGGCTACCTTCGAAGCCTGGGCCTCACGGCGGTGGACCCTCGCATGTCCGTGAAGGGGGCTCATGACCCTACCCAGTTTCAGCTGGAGCTTCAGGCACATCAGAGAGGTGCGTATACCCAAGGCCCCGTAGGTAGCGTGCCTGCGCTTT	.((((((.(..(((((((.((..(((((((..((((((((((((....)))).)).)))))).((((........))))..(((((....)))))......(.((((.((...)).)))).)...))).))))..)).)))))))..).))))))...	Cre-miRN626a	5707785	5707804	TGCGCAGACTGGCTACCTTC	Cre-miRN626a*	5707922	5707942	TAGGTAGCGTGCCTGCGCTTT		3
Cre-MIRN626b	PmiREN003795	MIRN626	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	5708356	5708473	+	GCCGTGTGGCACAGGCTTCAATGGTAGCCAGTCTGCGCACCTGCAGCCGACAGCTGAGTTCAGCTGCTGGCTGCAGGTGCGCAGACTGGCTACCTTCGAAGCCTGGGCCTCACGGCGG	((((((.(((.((((((((...(((((((((((((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))))))))))))))...)))))))).))).))))))..	5708376	5708453	ATGGTAGCCAGTCTGCGCACCTGCAGCCGACAGCTGAGTTCAGCTGCTGGCTGCAGGTGCGCAGACTGGCTACCTTCG	..(((((((((((((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))))))))))))))....	Cre-miRN626b	5708433	5708453	TGCGCAGACTGGCTACCTTCG	Cre-miRN626b*	5708376	5708396	ATGGTAGCCAGTCTGCGCACC		3
Cre-MIRN627	PmiREN003638	MIRN627	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	5849006	5849184	-	GAGCTGGGAGCGAGCCAGAGCAGGGTCCGGTTCGGTGTTTGGGCCTGAGCCTGTTCGGTTAGTGGCAGTAGCAGGGAACGAAGGAGACAGAGACGGGCGGAGAACGCCGTTAGCGTGAGATAACACAGGGCCTGGGCCTAGGCAGTGGGGCGGACGGCATTGGACGGGCACGCACGCCT	(...((.(.((..(((((.((...(((((.((((.((((((((((((.((((((((.((((.......))))...))))............(((((.((.....)))))))...(((......))).)))).)))))))))))).)))).))))).)).)))).)..)).).)))....	5849026	5849164	CAGGGTCCGGTTCGGTGTTTGGGCCTGAGCCTGTTCGGTTAGTGGCAGTAGCAGGGAACGAAGGAGACAGAGACGGGCGGAGAACGCCGTTAGCGTGAGATAACACAGGGCCTGGGCCTAGGCAGTGGGGCGGACGGCA	(...(((((.((((.((((((((((((.((((((((.((((.......))))...))))............(((((.((.....)))))))...(((......))).)))).)))))))))))).)))).))))).)..	Cre-miRN627	5849026	5849046	TAGGCAGTGGGGCGGACGGCA	Cre-miRN627*	5849144	5849164	CAGGGTCCGGTTCGGTGTTTG		3
Cre-MIRN628	PmiREN003640	MIRN628	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_8	138910	139143	+	CCAATCAGGACGCACCACTGCCGCTAGAAAGACAGTTCACAGCATACAGTTGCCGCGGCGCGTTGTAAAGCTCACGCAATGGAGGGCAGTGACGGAGGCCAAGGCGCCGCGCCGGGAGGCGCCGGGCCGGCCCACTGTCACTGCCCTCCATTGCGTGAGCTTACCTTAAACGCGCAGCGGCACCTGCACACCATGGACTGTCTTGCTAGCGGCAGTGGTGCGTCCTGATTTTAA	..(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.......(((.((((((.(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((..(((.(.(((((....))))).).)))))))..))))))))))))))))))))))))))))))....))))))).)))))).))).......))))))))))).)))))))))))))))))))))))))....	138930	139123	CCGCTAGAAAGACAGTTCACAGCATACAGTTGCCGCGGCGCGTTGTAAAGCTCACGCAATGGAGGGCAGTGACGGAGGCCAAGGCGCCGCGCCGGGAGGCGCCGGGCCGGCCCACTGTCACTGCCCTCCATTGCGTGAGCTTACCTTAAACGCGCAGCGGCACCTGCACACCATGGACTGTCTTGCTAGCGGCA	(((((((.(((((((((((.......(((.((((((.(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((..(((.(.(((((....))))).).)))))))..))))))))))))))))))))))))))))))....))))))).)))))).))).......))))))))))).)))))))..	Cre-miRN628	139103	139123	TGGACTGTCTTGCTAGCGGCA	Cre-miRN628*	138930	138950	CCGCTAGAAAGACAGTTCACA		3
Cre-MIRN629	PmiREN003641	MIRN629	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_9	894606	894754	+	GGCGCGTGAGTTGCTGGGGCCGGACGCCAGCACTCAGGAGGTGGAGGCCAAGTCCCGGGAGCTGCACCTGTCGGCGCTGCGCTCGGCGCCATCGGCCAAGTACATACCCCTTGCGAGTGCGGTGCTGGGCCAGCAGGCCAGCAAGGACA	...........((((((..((((.((((.((((((..((((.((.((((..((.(((((.((.((.((....)).)).)).))))).))....)))).........))))))..)))))))))))))).))))))..............	894626	894734	CGGACGCCAGCACTCAGGAGGTGGAGGCCAAGTCCCGGGAGCTGCACCTGTCGGCGCTGCGCTCGGCGCCATCGGCCAAGTACATACCCCTTGCGAGTGCGGTGCTGGG	(((.((((.((((((..((((.((.((((..((.(((((.((.((.((....)).)).)).))))).))....)))).........))))))..)))))))))))))..	Cre-miRN629	894626	894646	CGGACGCCAGCACTCAGGAGG	Cre-miRN629*	894714	894734	CCTTGCGAGTGCGGTGCTGGG		3
Cre-MIRN630	PmiREN003644	MIRN630	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	2736414	2736617	-	CTACCGACCTGGAAACGCTTGTCCTCAACTGCCTTCTCTTTCTGCTGGTGCGCTTCCTAACACACGTGGCGTGTGGTGGGCCTTGAGGGGGGGCCGCGGATGGCCGTCCTGATGAGCAGGACGACCCGAGAGTCTTTTACTTTGTGGAAGCGCACACCCAAAAAGAGAAGGCAGTTGAGGACAAGCGTTCTCAGCCAGGTATGG	.((((...((((.((((((((((((((((((((((((((((.((...((((((((((...((((((...))))))((((.((((....)))).))))....((.(((((((.....))))))).))..(((((.....)))))..))))))))))...)).)))))))))))))))))))))))))))).))))...))))...	2736434	2736597	GTCCTCAACTGCCTTCTCTTTCTGCTGGTGCGCTTCCTAACACACGTGGCGTGTGGTGGGCCTTGAGGGGGGGCCGCGGATGGCCGTCCTGATGAGCAGGACGACCCGAGAGTCTTTTACTTTGTGGAAGCGCACACCCAAAAAGAGAAGGCAGTTGAGGACAA	(((((((((((((((((((((.((...((((((((((...((((((...))))))((((.((((....)))).))))....((.(((((((.....))))))).))..(((((.....)))))..))))))))))...)).)))))))))))))))))))))..	Cre-miRN630	2736434	2736454	AGAGAAGGCAGTTGAGGACAA	Cre-miRN630*	2736577	2736597	GTCCTCAACTGCCTTCTCTTT		3
Cre-MIRN631	PmiREN003647	MIRN631	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_16	6192809	6193054	+	ATCGCGCAGTGGACTAGTACAGGTCAGGGATAGTAGTCAGCTTCTACATGGCTCCGAGTGCACTCGGAGCCATGTAGAAGCTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACTCGGAGCCATGTAGAAGCTGACTACTATCCCTGACCTGTACTGCACTCGGAGCCATGTA	((.((.(((((...(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)...(((.((....)))))....................................................................................................)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)..)).))...	6192829	6193034	AGGTCAGGGATAGTAGTCAGCTTCTACATGGCTCCGAGTGCACTCGGAGCCATGTAGAAGCTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACTCGGAGCCATGTAGAAGCTGACTACTATCCCTGACCTGT	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)...(((.((....)))))....................................................................................................))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN631	6192829	6192849	AGGTCAGGGATAGTAGTCAGC	Cre-miRN631*	6193014	6193034	TGACTACTATCCCTGACCTGT		3
Cre-MIRN632	PmiREN003649	MIRN632	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	3167419	3167684	+	GTTTTATAGCCCCAATACCATGGAACGCTGCGGATGATGGCTGTTCCTGTTTGTATTTTAGATTGAGATGCAAGAGGGGCTCAGGGTTACGGTGCCTGCGTGGGACGCATGCACGCGGAGCAGAGTGCCAGCGTAGAAGCCGTGCACACATGTCGTGTAGCACTAGCAGGCACCGTAACTCTGAGCCCCTCTTGCATCTCAATCTAAAATACAAACAGGAACAGCCATCATCTGCAGCGTTCCATGG	.................((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((..((((.(......).))))..))))....)).((((((((.....)))).))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))	3167439	3167664	TGGAACGCTGCGGATGATGGCTGTTCCTGTTTGTATTTTAGATTGAGATGCAAGAGGGGCTCAGGGTTACGGTGCCTGCGTGGGACGCATGCACGCGGAGCAGAGTGCCAGCGTAGAAGCCGTGCACACATGTCGTGTAGCACTAGCAGGCACCGTAACTCTGAGCCCCTCTTGCATCTCAATCTAAAATACAAACAGGAACAGCCATCATCTGCAGCGTTCCATG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((..((((.(......).))))..))))....)).((((((((.....)))).))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN632	3167439	3167459	TGGAACGCTGCGGATGATGGC	Cre-miRN632*	3167644	3167664	CATCATCTGCAGCGTTCCATG		3
Cre-MIRN633	PmiREN003650	MIRN633	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	7188822	7188925	+	GGTCCACGTGGTCAGGGTAGTCAAGCAGGTAGGGTTGTCAGGGTGGCCTTGTTGGTGGCAGGGTTGACGACCGCCAGTGTGAGCTTCCCCATGGGTAG	......(((((...(((...(((.((.(((..(((((((((....(((........)))....)))))))))))).)).)))...))))))))..... .-100	7188842	7188905	TCAAGCAGGTAGGGTTGTCAGGGTGGCCTTGTTGGTGGCAGGGTTGACGACCGCCAGTGTGAGC	(((.((.(((..(((((((((....(((........)))....)))))))))))).)).)))..	Cre-miRN633	7188842	7188862	TCAAGCAGGTAGGGTTGTCAG	Cre-miRN633*	7188885	7188905	TTGACGACCGCCAGTGTGAGC		3
Cre-MIRN634	PmiREN003653	MIRN634	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_14	187933	188135	+	ACCCTGCCAACAGTCCAACACCCTTGTTCCGCACCTGCTGAGCAATACCTACAAAATACCAGCGAGTAGACAGCAGGGGGAGCAGCGACTCTGAACGGGGGCACGCCAACCCTCCTCGGCAGGCTCAATTGATGCTGCAGCTCTCACTTGGGAGTGTTCGCTTGCAGTTGGGGGACGATACCGGGCACACGAAAAGCTACGTC	.....((......((.....((((((((((.((.((((.(((((((((((............(((((.((.(((((((((....(((.((((.....))))..)))....))))))..((((..((....))..)))).))).))))))))).))))).)))))))).)).)))))))....))).....))........).)	187953	188115	CCCTTGTTCCGCACCTGCTGAGCAATACCTACAAAATACCAGCGAGTAGACAGCAGGGGGAGCAGCGACTCTGAACGGGGGCACGCCAACCCTCCTCGGCAGGCTCAATTGATGCTGCAGCTCTCACTTGGGAGTGTTCGCTTGCAGTTGGGGGACGATACCG	..((((((((.((.((((.(((((((((((............(((((.((.(((((((((....(((.((((.....))))..)))....))))))..((((..((....))..)))).))).))))))))).))))).)))))))).)).)))))))....)	Cre-miRN634	188095	188115	TGCAGTTGGGGGACGATACCG	Cre-miRN634*	187953	187973	CCCTTGTTCCGCACCTGCTGA		3
Cre-MIRN635a	PmiREN003656	MIRN635	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	4088527	4088737	-	GCTCCTGGCGCGACCAGCCCAGCGCTCGCACCGCTCGCAGAAGACATCGCTGGCACCGTGTTGGCCGATATTTAGCGCTTGGTCAAGTGGCGGCCACGGTGCCAGCCGTGGGTGCCAGCGATGTGACCAAGCGCTCAAATGGCGGCCAACACGGTGCCAGCGATGTCTTCTGCGAGCGGTGCGAGCGCTGGGCTGGGCTGGGACAACAATT	..(((((((....((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((..(((((.(((((((....))))))).)))))......)))))))))))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))........	4088547	4088717	AGCGCTCGCACCGCTCGCAGAAGACATCGCTGGCACCGTGTTGGCCGATATTTAGCGCTTGGTCAAGTGGCGGCCACGGTGCCAGCCGTGGGTGCCAGCGATGTGACCAAGCGCTCAAATGGCGGCCAACACGGTGCCAGCGATGTCTTCTGCGAGCGGTGCGAGCGCTGG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((..(((((.(((((((....))))))).)))))......)))))))))))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN635a	4088547	4088567	TGCGAGCGGTGCGAGCGCTGG	Cre-miRN635a*	4088697	4088717	AGCGCTCGCACCGCTCGCAGA		3
Cre-MIRN635b	PmiREN003667	MIRN635	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	4031310	4031519	-	GCTCCTGGCGCGACCAGCCCAGCGCTCGCACCGCTCGCAGAAGACATCGCTGGCACCGTGTTGGCCGCCATTTGAGCGCTTGGTCAAGTGGCGGCCAACACGGTCTCGCGATGTCTCGCAGTTGACCAAGCGCTCAAATGGCGGCCAACACGGTGCCAGCGATGTCTTCTGCGAGCGGTGCGAGCGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGGACAA	.............((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.(((...(((((......)).))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...............	4031330	4031499	AGCGCTCGCACCGCTCGCAGAAGACATCGCTGGCACCGTGTTGGCCGCCATTTGAGCGCTTGGTCAAGTGGCGGCCAACACGGTCTCGCGATGTCTCGCAGTTGACCAAGCGCTCAAATGGCGGCCAACACGGTGCCAGCGATGTCTTCTGCGAGCGGTGCGAGCGCTGG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.(((...(((((......)).))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN635b	4031330	4031350	TGCGAGCGGTGCGAGCGCTGG	Cre-miRN635b*	4031479	4031499	AGCGCTCGCACCGCTCGCAGA		3
Cre-MIRN636a	PmiREN003672	MIRN636	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	2205726	2205851	-	AGCACCGCGCCTGATCGCCAAGTTCAGTGCAGCCTGAGCGCCCTGCGCGGCCCCCTGAGGCTGAGCATTGCCGATCGCGGGCCCCTGCTCACCCTGGACGGCCTCGGCGACCACAGCAGCGCCAGC	.((...(((((((.(((((.((.((.((.(((..((((((((((((.(((((......))))).)))..((.....))))))....)))))..))).)))).)).)))))...)))..))))..))	2205746	2205831	AGTTCAGTGCAGCCTGAGCGCCCTGCGCGGCCCCCTGAGGCTGAGCATTGCCGATCGCGGGCCCCTGCTCACCCTGGACGGCCTCG	((.((.((.(((..((((((((((((.(((((......))))).)))..((.....))))))....)))))..))).)))).))..	Cre-miRN636a	2205746	2205766	TGCTCACCCTGGACGGCCTCG	Cre-miRN636a*	2205811	2205831	AGTTCAGTGCAGCCTGAGCGC		3
Cre-MIRN636b	PmiREN003685	MIRN636	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	791644	791769	-	AGCACCGCGCCTGATCGCCAAGTTCAGTGCAGCCTGAGCGCCCTGCGCGGCCCCCTGAGGCTGAGCATTGCCGATCGCGGGCCCCTGCTCACCCTGGACGGCCTCGGCGACCACAGCAGCGCCAGC	.((...(((((((.(((((.((.((.((.(((..((((((((((((.(((((......))))).)))..((.....))))))....)))))..))).)))).)).)))))...)))..))))..))	791664	791749	AGTTCAGTGCAGCCTGAGCGCCCTGCGCGGCCCCCTGAGGCTGAGCATTGCCGATCGCGGGCCCCTGCTCACCCTGGACGGCCTCG	((.((.((.(((..((((((((((((.(((((......))))).)))..((.....))))))....)))))..))).)))).))..	Cre-miRN636b	791664	791684	TGCTCACCCTGGACGGCCTCG	Cre-miRN636b*	791729	791749	AGTTCAGTGCAGCCTGAGCGC		3
Cre-MIRN636c	PmiREN003716	MIRN636	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-scaffold_21	122799	122924	+	AGCACCGCGCCTGATCGCCAAGTTCAGTGCAGCCTGAGCGCCCTGCGCGGCCCCCTGAGGCTGAGCATTGCCGATCGCGGGCCCCTGCTCACCCTGGACGGCCTCGGCGACCACAGCAGCGCCAGC	.((...(((((((.(((((.((.((.((.(((..((((((((((((.(((((......))))).)))..((.....))))))....)))))..))).)))).)).)))))...)))..))))..))	122819	122904	AGTTCAGTGCAGCCTGAGCGCCCTGCGCGGCCCCCTGAGGCTGAGCATTGCCGATCGCGGGCCCCTGCTCACCCTGGACGGCCTCG	((.((.((.(((..((((((((((((.(((((......))))).)))..((.....))))))....)))))..))).)))).))..	Cre-miRN636c	122884	122904	TGCTCACCCTGGACGGCCTCG	Cre-miRN636c*	122819	122839	AGTTCAGTGCAGCCTGAGCGC		3
Cre-MIRN637a	PmiREN003675	MIRN637	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	442713	442793	+	CTGCTCCGCAGTGGGCCGCTCCTGCGGATCCCACGCCACGCAGTCGAGCAGCAGCAGCTCCAGTGACAGGGGCAGGTAGGA	((((...((.(((((((((....))))..)))))))...))))......................................	442733	442773	GCTCCGCAGTGGGCCGCTCCTGCGGATCCCACGCCACGCAG	((...((.(((((((((....))))..)))))))...))..	Cre-miRN637a	442754	442773	GCGGATCCCACGCCACGCAG	Cre-miRN637a*	442733	442753	GCTCCGCAGTGGGCCGCTCCT		3
Cre-MIRN637b	PmiREN003676	MIRN637	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	448864	448944	+	CTGCTCCGCAGTGGGCCGCTCCTGCGGATCCCACGCCACGCAGTCGAGCAGCAGCAGCTCCAGCGACAGGGGCAGGTAGGA	((((...((.(((((((((....))))..)))))))...))))......................................	448884	448924	GCTCCGCAGTGGGCCGCTCCTGCGGATCCCACGCCACGCAG	((...((.(((((((((....))))..)))))))...))..	Cre-miRN637b	448905	448924	GCGGATCCCACGCCACGCAG	Cre-miRN637b*	448884	448904	GCTCCGCAGTGGGCCGCTCCT		3
Cre-MIRN638	PmiREN003682	MIRN638	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	413746	413945	+	CGCGGCCACGCAGCGCACGAACAGCGTCGTCTCCAGCAGTGCCGCCCGCTCCTAGACGATGAATAGGGCAACAGGACAGCCGCGACAGTGACGCCACATAAGTACGTCTACGCGCGGCTGGGCGTCAAGGGTCCCAGCACTATCCTGCAGAGCATGGACGACGTGCTGCAGTTCTTGCTGCCCTGCCGCACTCTGCTCAC	.(((((...((((((.((...(((((.((((((((((..((((((((((.((((.........))))))........(((((((.(.((((((..((....)).)))).)))))))))))))))...(((((.........))))))))..)).)))).)))))))))..))...))))))...)))))...........	413766	413925	CACGAACAGCGTCGTCTCCAGCAGTGCCGCCCGCTCCTAGACGATGAATAGGGCAACAGGACAGCCGCGACAGTGACGCCACATAAGTACGTCTACGCGCGGCTGGGCGTCAAGGGTCCCAGCACTATCCTGCAGAGCATGGACGACGTGCTGCAGTTCT	.((...(((((.((((((((((..((((((((((.((((.........))))))........(((((((.(.((((((..((....)).)))).)))))))))))))))...(((((.........))))))))..)).)))).)))))))))..))...	Cre-miRN638	413905	413925	TGGACGACGTGCTGCAGTTCT	Cre-miRN638*	413766	413786	CACGAACAGCGTCGTCTCCAG		3
Cre-MIRN639	PmiREN003684	MIRN639	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	4823195	4823444	-	GTGGCGCCAGATCAGCATGGAGTTCTGCGACGACTTCCTGCCCTTTGACCACCTCCCGGAGTGCCACATCGGCTGCCTGGTGCACGGCTTCTGGGCGCACCACTACTCATGGCAGTGCGCGGATGTCGTCGCACTGCCAGGAGTAGTGGTGCGCCCAGAAGCCGTGCACCAGGCAGCCGATGTGGCACTCCGGGAGGTGGTCAAAGGGCAGGAAGTCGTCGCAGAACTCCATGCTGATCTGGTGCCAC	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.....)).)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))) .	4823215	4823424	AGTTCTGCGACGACTTCCTGCCCTTTGACCACCTCCCGGAGTGCCACATCGGCTGCCTGGTGCACGGCTTCTGGGCGCACCACTACTCATGGCAGTGCGCGGATGTCGTCGCACTGCCAGGAGTAGTGGTGCGCCCAGAAGCCGTGCACCAGGCAGCCGATGTGGCACTCCGGGAGGTGGTCAAAGGGCAGGAAGTCGTCGCAGAACTCC	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.....)).)))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN639	4823215	4823235	AGGAAGTCGTCGCAGAACTCC	Cre-miRN639*	4823404	4823424	AGTTCTGCGACGACTTCCTGC		3
Cre-MIRN640	PmiREN003686	MIRN640	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_14	189577	189717	+	GAGTCCACCAAATGTGGTGCAGGCTGGGCGGGCGGCATTGCCTGGGCAGGGCGGTGGCTGGAGCCGCACACGCTCGCTCCCCACCCCCTGCCCCACGCTCGAATGATCCCACCCAGCCAGAGCACGGTGCATCCAATCCAC	.....................(((((((.(((...((((((..((((((((.(((((..(((((.((....))..))))))))))))))))))...))...))))..))).))))))).......................	189597	189697	AGGCTGGGCGGGCGGCATTGCCTGGGCAGGGCGGTGGCTGGAGCCGCACACGCTCGCTCCCCACCCCCTGCCCCACGCTCGAATGATCCCACCCAGCCAGA	.(((((((.(((...((((((..((((((((.(((((..(((((.((....))..))))))))))))))))))...))...))))..))).)))))))...	Cre-miRN640	189678	189697	AATGATCCCACCCAGCCAGA	Cre-miRN640*	189597	189617	AGGCTGGGCGGGCGGCATTGC		3
Cre-MIRN641	PmiREN003689	MIRN641	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-scaffold_21	36026	36264	+	GCGTGCGCACCCAATCCCCCCGACACCCCCGATGCACAGGAAACAACTTGGGGTACACACAGGGCTTTTCGGGAGGGAGAACGATCGTCAAACAGCGGAGCTTCAAACGGAGGGAAGCTAGGGGGTTGACGTGCAAACAGCGTAGACTGGCCACCATTTTCCCTCCCGAAAAGCCCTGTGTGTACCCCAAGTTGTTTCCTGTGCATCGGGGGTGTCGGGGGGATTGGGTGCGCACGCGA	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(..(((......))).((((((.........)))))).((.((((.((((.......)))).))))..))..).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	36046	36244	CGACACCCCCGATGCACAGGAAACAACTTGGGGTACACACAGGGCTTTTCGGGAGGGAGAACGATCGTCAAACAGCGGAGCTTCAAACGGAGGGAAGCTAGGGGGTTGACGTGCAAACAGCGTAGACTGGCCACCATTTTCCCTCCCGAAAAGCCCTGTGTGTACCCCAAGTTGTTTCCTGTGCATCGGGGGTGTCGGG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(..(((......))).((((((.........)))))).((.((((.((((.......)))).))))..))..).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN641	36225	36244	TGTGCATCGGGGGTGTCGGG	Cre-miRN641*	36046	36066	CGACACCCCCGATGCACAGGA		3
Cre-MIRN642	PmiREN003693	MIRN642	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	2549078	2549215	-	CGGCCGCAACCATCCTTGCCAGGAAAGATCCCGGCATCAAGGCGCGCGCGCGTGCACGCAAGAAAGGATCCCGGAGCAGCGTGCTCCGCGTGCACCTTGACGCTGGGATCTTTCCTGGCGAGGCCGCCTTGGACCCCG	(((((..........((((((((((((((((((((.((((((.(((((((.(.((((((......((...))......)))))).)))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))............	2549098	2549195	AGGAAAGATCCCGGCATCAAGGCGCGCGCGCGTGCACGCAAGAAAGGATCCCGGAGCAGCGTGCTCCGCGTGCACCTTGACGCTGGGATCTTTCCTGG	(((((((((((((((.((((((.(((((((.(.((((((......((...))......)))))).)))))))).)))))).)))))))))))))))..	Cre-miRN642	2549175	2549195	AGGAAAGATCCCGGCATCAAG	Cre-miRN642*	2549098	2549118	TGACGCTGGGATCTTTCCTGG		3
Cre-MIRN643	PmiREN003694	MIRN643	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	1972735	1972993	-	CATTATGTCTCCGCACTACTACAAATTCACCAGCCACGCAGAAGCATGCCTGCTATGACTGACACTGACAGCAAGGTGCCCGAACCCGCAACGGGCAGCGCTCCGCGACTCCCCCGTAGACCGGCACCACGCGCGTGGTGCTTGCTGCGGGGGAGTCGCGGAGCGCTGCGCGTTGCGGGCCCGGGCACCCTGCTGTCAGTCATAGCAGGCATGCTTCTGCGTGGCTGGTGAATTTGTAGTAGAGCGG	..........((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......(((.((((((((..(((((((((.(((((((((((((((((((((((((.(.((((((((....)))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))	1972755	1972973	ACAAATTCACCAGCCACGCAGAAGCATGCCTGCTATGACTGACACTGACAGCAAGGTGCCCGAACCCGCAACGGGCAGCGCTCCGCGACTCCCCCGTAGACCGGCACCACGCGCGTGGTGCTTGCTGCGGGGGAGTCGCGGAGCGCTGCGCGTTGCGGGCCCGGGCACCCTGCTGTCAGTCATAGCAGGCATGCTTCTGCGTGGCTGGTGAATTTGTAG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......(((.((((((((..(((((((((.(((((((((((((((((((((((((.(.((((((((....)))))))).)))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN643	1972953	1972973	ACAAATTCACCAGCCACGCAG	Cre-miRN643*	1972755	1972775	GCGTGGCTGGTGAATTTGTAG		3
Cre-MIRN644	PmiREN003719	MIRN644	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	2155672	2155808	+	TTAGGAGATTTTCGGCGATCTGACGAGGATGAAGGATACCCCGATCAAGTCTTCCTTTTTGCAGATGCGCAGAGCCGGTGACGAGGATTTGCCGGGGATGCCGCATTTTCAGTCACGCAGAGTTGTCAGGGGTGCAA	..............(((...(((((((((((..((...(((((..(((((((((((((((((......))))))..))....))))))))).)))))...)).))))))).)))))))...................	2155692	2155788	TGACGAGGATGAAGGATACCCCGATCAAGTCTTCCTTTTTGCAGATGCGCAGAGCCGGTGACGAGGATTTGCCGGGGATGCCGCATTTTCAGTCACG	(((((((((((..((...(((((..(((((((((((((((((......))))))..))....))))))))).)))))...)).))))))).))))..	Cre-miRN644	2155692	2155711	TGACGAGGATGAAGGATACC	Cre-miRN644*	2155768	2155788	GATGCCGCATTTTCAGTCACG		3
Cre-MIRN645a	PmiREN003722	MIRN645	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	3087179	3087270	-	GGACATTGTGTGCATGCATCCCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGGTGATGCTATCTATGGGTGTA	................((((((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))))))..................	3087199	3087250	CCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG	((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))..	Cre-miRN645a	3087231	3087250	CCCGCGGCGTTTGGAGGCAT	Cre-miRN645a*	3087199	3087219	CCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG		3
Cre-MIRN645b	PmiREN003767	MIRN645	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	1371466	1371557	+	GGACATTGTGTGCATGCATCCCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGGTGATGCTATCTATGGGTGTA	................((((((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))))))..................	1371486	1371537	CCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG	((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))..	Cre-miRN645b	1371486	1371505	CCCGCGGCGTTTGGAGGCAT	Cre-miRN645b*	1371517	1371537	CCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG		3
Cre-MIRN645c	PmiREN003797	MIRN645	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	2361697	2361788	+	GGACATTGTGTGCATGCATCCCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGGTGATGCTATCTATGGGTGTA	................((((((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))))))..................	2361717	2361768	CCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG	((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))..	Cre-miRN645c	2361717	2361736	CCCGCGGCGTTTGGAGGCAT	Cre-miRN645c*	2361748	2361768	CCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG		3
Cre-MIRN645d	PmiREN003806	MIRN645	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_2	3664606	3664697	+	GGACATTGTGTGCATGCATCCCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGGTGATGCTATCTATGGGTGTA	................((((((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))))))..................	3664626	3664677	CCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG	((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))..	Cre-miRN645d	3664626	3664645	CCCGCGGCGTTTGGAGGCAT	Cre-miRN645d*	3664657	3664677	CCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG		3
Cre-MIRN645e	PmiREN003809	MIRN645	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	4366406	4366497	-	GGACATTGTGTGCATGCATCCCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGGTGATGCTATCTATGGGTGTA	................((((((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))))))..................	4366426	4366477	CCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG	((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))..	Cre-miRN645e	4366458	4366477	CCCGCGGCGTTTGGAGGCAT	Cre-miRN645e*	4366426	4366446	CCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG		3
Cre-MIRN645f	PmiREN003813	MIRN645	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	4785794	4785885	-	GGACATTGTGTGCATGCATCCCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGGTGATGCTATCTATGGGTGTA	................((((((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))))))..................	4785814	4785865	CCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG	((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))..	Cre-miRN645f	4785846	4785865	CCCGCGGCGTTTGGAGGCAT	Cre-miRN645f*	4785814	4785834	CCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG		3
Cre-MIRN645g	PmiREN003815	MIRN645	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	4522208	4522299	+	GGACATTGTGTGCATGCATCCCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGGTGATGCTATCTATGGGTGTA	................((((((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))))))..................	4522228	4522279	CCCGCGGCGTTTGGAGGCATTCACGTGCGCGCCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG	((.(((((((..((((((............)))..))).))).)))).))..	Cre-miRN645g	4522228	4522247	CCCGCGGCGTTTGGAGGCAT	Cre-miRN645g*	4522259	4522279	CCTGTCCTGCGTCCGCCGGGG		3
Cre-MIRN646	PmiREN003723	MIRN646	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	3262655	3262801	-	CTTTGAGCAAACATAGGGCTTTTCGGAAGGGAGAACGGTGGTCAAACGGTGAAGCGCGCGCTGCGCGAAGCTAGGGGGGCGAGGACGCAAACAGCGTGGACTGGCCACCGTTCTCCCTTCCGAAAAGCCCTATGTTTGCTCAAAGTT	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((..((((.((((.(.(.......).).))))..).)))...)).)))....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	3262675	3262781	TTTCGGAAGGGAGAACGGTGGTCAAACGGTGAAGCGCGCGCTGCGCGAAGCTAGGGGGGCGAGGACGCAAACAGCGTGGACTGGCCACCGTTCTCCCTTCCGAAAAG	((((((((((((((((((((((((.(((.((..((((.((((.(.(.......).).))))..).)))...)).)))....))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN646	3262762	3262781	TTTCGGAAGGGAGAACGGTG	Cre-miRN646*	3262675	3262695	ACCGTTCTCCCTTCCGAAAAG		3
Cre-MIRN647	PmiREN003732	MIRN647	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	2540978	2541145	-	GGGCGTGCGGCTACTCGGCGCGCTCTTTGCCGACTTGCTGCGCAATCGCGTGGCGACCGCAGCCATGCCCGCCGCGGAGGTAGGTGCGCGGAGGACGGGCACGGCGGTGATTGCACTGGAATCGCGCAGCAAGTCGGCAAAGAGCGCGCCGAGTAGCCGCACGCCCAC	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((..(((.(((.(((.(((.(((((((((((.(......).)))))....)))))).))).))).))))))..))...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	2540998	2541125	CGCTCTTTGCCGACTTGCTGCGCAATCGCGTGGCGACCGCAGCCATGCCCGCCGCGGAGGTAGGTGCGCGGAGGACGGGCACGGCGGTGATTGCACTGGAATCGCGCAGCAAGTCGGCAAAGAGCGCG	(((((((((((((((((((((((..((..(((.(((.(((.(((.(((((((((((.(......).)))))....)))))).))).))).))))))..))...)))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN647	2540998	2541018	AGCAAGTCGGCAAAGAGCGCG	Cre-miRN647*	2541105	2541125	CGCTCTTTGCCGACTTGCTGC		3
Cre-MIRN648	PmiREN003734	MIRN648	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	1824666	1824789	-	CTGCATCCCACGTGCACGTCAGTACGAGGAGCGTCCTTGCGCTCCACAAGTCAGAGAAGGCCCCTTCTCTGACTTGTGGAGCGCAAGGACGCTCCTCGTACTGACGTGATTTCAGGTCTCTCAG	..............(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))................	1824686	1824769	AGTACGAGGAGCGTCCTTGCGCTCCACAAGTCAGAGAAGGCCCCTTCTCTGACTTGTGGAGCGCAAGGACGCTCCTCGTACTGA	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN648	1824686	1824706	CAAGGACGCTCCTCGTACTGA	Cre-miRN648*	1824749	1824769	AGTACGAGGAGCGTCCTTGCG		3
Cre-MIRN649	PmiREN003735	MIRN649	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	7383477	7383624	-	GCGTTGACGCTGACAAGCTGAAGATCGAGATCGACGGCATGGCCTTCTCCCTGGAGCGGGTGGTCTGGTGGAGCGCAAGCCGCGCATCAAGCTGATGTACGTGCAGGAGCTGGCGGTCAAGATGTTGAAGCTCGTGTAAGCCCGTGGG	(((....)))..((.((((.((.(((..(((((.((((...((...(((((((((.(....).))))).)))).))..((((.((((((...)))))).)).))....)))).)))))..))).))..)))).)).............	7383497	7383604	AAGATCGAGATCGACGGCATGGCCTTCTCCCTGGAGCGGGTGGTCTGGTGGAGCGCAAGCCGCGCATCAAGCTGATGTACGTGCAGGAGCTGGCGGTCAAGATGTTGA	((.(((..(((((.((((...((...(((((((((.(....).))))).)))).))..((((.((((((...)))))).)).))....)))).)))))..))).))..	Cre-miRN649	7383585	7383604	AAGATCGAGATCGACGGCAT	Cre-miRN649*	7383497	7383517	AGCTGGCGGTCAAGATGTTGA		3
Cre-MIRN650	PmiREN003736	MIRN650	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	6966926	6967152	-	GAGCATGAGAAGGACCGTGGTGGATTGGATGCACCGTGCTCTGGCTGGGTGGGATCATTCGAGCGTGGGGCAGGGGGTGGGGAGCGAGCGTGTGCGGCTCCAGCCACCGCCCTGCCCAGGCAATGCCGCCCGCCCAGCATGCACCACATTTGGTGGACTCTAGCCATACTGCACACACCCAGTGCTGTACGAAGCACTTCAGCCCCGCCCCAGCCCCGCCCGAA	(.((..(.(..((...((((.((.((((((((..(((((....((((((((((..((((...((.((((.(((((((((((((((..((....)).)))))..))))).))))))))).))))))...)))))))))).(.(((((....))))).).............((((.......)))).)))))..))).))))))))))).))..))..))).... .-	6966946	6967132	TGGATTGGATGCACCGTGCTCTGGCTGGGTGGGATCATTCGAGCGTGGGGCAGGGGGTGGGGAGCGAGCGTGTGCGGCTCCAGCCACCGCCCTGCCCAGGCAATGCCGCCCGCCCAGCATGCACCACATTTGGTGGACTCTAGCCATACTGCACACACCCAGTGCTGTACGAAGCACTTCAGCCCCG	.((.((((((((..(((((....((((((((((..((((...((.((((.(((((((((((((((..((....)).)))))..))))).))))))))).))))))...)))))))))).(.(((((....))))).).............((((.......)))).)))))..))).)))))))...	Cre-miRN650	6967112	6967132	TGGATTGGATGCACCGTGCTC	Cre-miRN650*	6966946	6966966	GTACGAAGCACTTCAGCCCCG		3
Cre-MIRN651	PmiREN003744	MIRN651	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	6573314	6573478	+	CTCGTGGGTGTGTGTAGGCTGTGTGTGCCTCTTCATGTATCACTTTGCGCCCGGTTAGCTTAGTTGGTAGAGCGCAAGGCTCTCAACCTTGTGGTCGTGGGTTCGCGCGTGCGCGGATGTCACAAGAACTGGAAGACGCACGCGTTTTGCGCATGCCAGGGGCCC	(((.(((.((((((((((.((((((((..(((((..((((((((..((.........))..)).)))).((.(((((((.......))))))).))(((((((((((....))))))).))))....))..))))))))))))).))))))))))))).)))...	6573334	6573458	GTGTGTGCCTCTTCATGTATCACTTTGCGCCCGGTTAGCTTAGTTGGTAGAGCGCAAGGCTCTCAACCTTGTGGTCGTGGGTTCGCGCGTGCGCGGATGTCACAAGAACTGGAAGACGCACGCGT	(((((((..(((((..((((((((..((.........))..)).)))).((.(((((((.......))))))).))(((((((((((....))))))).))))....))..))))))))))))..	Cre-miRN651	6573438	6573458	AGAACTGGAAGACGCACGCGT	Cre-miRN651*	6573334	6573354	GTGTGTGCCTCTTCATGTATC		3
Cre-MIRN652	PmiREN003755	MIRN652	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	3823022	3823237	-	CGCGTGGCGCGGCGGGTTTCCAGATGATGCCGCTGCGCATGCTCGAAACCATTGTCAAGGTGGTGATCGGCAGCGGCGGCTCCATTTGCGGCGTGGTGCGCGCCGTTACGCGCACGGCAAATCAGATGCTGGTGAGCGCCTTGCGTGCTCACCACCTTGACGATGGTTTGGAGTATGCGCAGCGGCATCATCTGGAAACCCGCCGCGACGGTGCCC	.......(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((((.((((.(((((((((....((.(((((((......))))))).))....)))))).....))))))))))).)).))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))..((...))	3823042	3823217	CAGATGATGCCGCTGCGCATGCTCGAAACCATTGTCAAGGTGGTGATCGGCAGCGGCGGCTCCATTTGCGGCGTGGTGCGCGCCGTTACGCGCACGGCAAATCAGATGCTGGTGAGCGCCTTGCGTGCTCACCACCTTGACGATGGTTTGGAGTATGCGCAGCGGCATCATCTGGA	((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((((.((((.(((((((((....((.(((((((......))))))).))....)))))).....))))))))))).)).))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN652	3823042	3823062	TGCGCAGCGGCATCATCTGGA	Cre-miRN652*	3823197	3823217	CAGATGATGCCGCTGCGCATG		3
Cre-MIRN653	PmiREN003765	MIRN653	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-scaffold_39	8027	8272	+	GCGTGCAAGGTGGTAAGCCCAATGCTGGACCTAGACGACTGAAAACCCGGTGCAGGCGAACTGACAGCGAGGGGGGGGAGGGGGGATAGAGGGGGACATGTCTACCAGCCTGCACGGCACGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	(((((((.........((.((((((.(.((.((.(((((.....((.((..(((.(((.((..(((...(.(.(.(.(.(.(.(.(((.(.(.(.((((...(((..((.((((((((((......)))).)))))).))..))).)))).).).).))).).).).).).).).)...)))..)).))).))).)).))....)).))).)).)).))))).)).)).........)))))))..	8047	8252	AATGCTGGACCTAGACGACTGAAAACCCGGTGCAGGCGAACTGACAGCGAGGGGGGGGAGGGGGGATAGAGGGGGACATGTCTACCAGCCTGCACGGCACGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	(((((.(.((.((.(((((.....((.((..(((.(((.((..(((...(.(.(.(.(.(.(.(.(((.(.(.(.((((...(((..((.((((((((((......)))).)))))).))..))).)))).).).).))).).).).).).).).)...)))..)).))).))).)).))....)).))).)).)).))))).)..	Cre-miRN653	8047	8067	AATGCTGGACCTAGACGACTG	Cre-miRN653*	8232	8252	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT		3
Cre-MIRN654	PmiREN003768	MIRN654	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	2127510	2127650	+	TGGCCGACTTCCAGACATGGTGCGAGCAACAGCCCTGGTACGGACACCAGCAGCACAGAATGCGAATGGGCGACGGTGGCGGGTGTCCGTTGTTGCTCGCACCAGGGCTGTTGCTCGCACCATGACCGGAAGTCGGCCAGC	((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((((((((((((((.((..(((....(((......)))...))))).)))))))))..........)))))))))))))))))))))))).).))))))))))))..	2127530	2127630	TGCGAGCAACAGCCCTGGTACGGACACCAGCAGCACAGAATGCGAATGGGCGACGGTGGCGGGTGTCCGTTGTTGCTCGCACCAGGGCTGTTGCTCGCACC	((((((((((((((((((((((((((((.((..(((....(((......)))...))))).)))))))))..........)))))))))))))))))))..	Cre-miRN654	2127530	2127549	TGCGAGCAACAGCCCTGGTA	Cre-miRN654*	2127610	2127630	ACCAGGGCTGTTGCTCGCACC		3
Cre-MIRN655	PmiREN003769	MIRN655	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_2	9129487	9129613	-	CACAGCTCCTGACGGCTAGACGGCTAGAGGGCGCAAGCACGCAAGGAGGGGATGACGAGCATCGTGCTCGTCATCCCCTCCTTGCGTGCTTGCGCCCTCTAGCCGTCTCGGTCATCAGGCGGCGGCT	........((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))).........	9129507	9129593	CGGCTAGAGGGCGCAAGCACGCAAGGAGGGGATGACGAGCATCGTGCTCGTCATCCCCTCCTTGCGTGCTTGCGCCCTCTAGCCGTC	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN655	9129572	9129593	CGGCTAGAGGGCGCAAGCACGC	Cre-miRN655*	9129507	9129527	TGCTTGCGCCCTCTAGCCGTC		3
Cre-MIRN656	PmiREN003770	MIRN656	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	6573880	6574001	-	TACGAAGTACACGCCATCATTCACATTCACCGCATGTCACCGCCGGAACCAACACGACACCTGTCGTGTTGGTTCCGGCGGTGACATGCGGTGAATGTGAATGATGGCGTGTACTTAACTTG	....((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))......	6573900	6573981	TCACATTCACCGCATGTCACCGCCGGAACCAACACGACACCTGTCGTGTTGGTTCCGGCGGTGACATGCGGTGAATGTGAAT	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN656	6573900	6573920	TGACATGCGGTGAATGTGAAT	Cre-miRN656*	6573961	6573981	TCACATTCACCGCATGTCACC		3
Cre-MIRN657	PmiREN003772	MIRN657	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_10	6199714	6199832	-	NNNNNNNNNNNNNNNNTATCATCTCGTCGTCGTCAGGCTTGTCCTCCACCGCGTCCTATTAGGACGCGGTGGAGGACAAGCCTGACGACGACGAGATGATAGATTGGTTATGCAATGGG	................(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).((((......))))...	6199734	6199812	ATCTCGTCGTCGTCAGGCTTGTCCTCCACCGCGTCCTATTAGGACGCGGTGGAGGACAAGCCTGACGACGACGAGATGA	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN657	6199734	6199754	AGCCTGACGACGACGAGATGA	Cre-miRN657*	6199792	6199812	ATCTCGTCGTCGTCAGGCTTG		3
Cre-MIRN658	PmiREN003774	MIRN658	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	2598570	2598749	-	ACAGCACAGTTATAAACATACACAGCCTGTTGGGTAGAACACGTTTCCAGAATCGTGAGAAATGGCGCTCAAATCGCAGCGGAACGGACTCCCAGGCCTGAGGCCATTTCTCACGGAACGGTCCCCTTCTTGAAACGTATTCTACCCAAGAGGCTGTGTATGTTTATAACTGTGCTGTGC	((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((.((((....((...(((......)))...)).))))))))))))))))))..........)))).))))))).)))))))))).))))))))))))))))))))))))))))..	2598590	2598729	CACAGCCTGTTGGGTAGAACACGTTTCCAGAATCGTGAGAAATGGCGCTCAAATCGCAGCGGAACGGACTCCCAGGCCTGAGGCCATTTCTCACGGAACGGTCCCCTTCTTGAAACGTATTCTACCCAAGAGGCTGTGTA	((((((((.((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((.((((....((...(((......)))...)).))))))))))))))))))..........)))).))))))).)))))))))).))))))))..	Cre-miRN658	2598590	2598610	TTCTACCCAAGAGGCTGTGTA	Cre-miRN658*	2598709	2598729	CACAGCCTGTTGGGTAGAACA		3
Cre-MIRN659	PmiREN003775	MIRN659	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	1518499	1518591	+	GACGGCGCCCTGGGGCAACTAGATGTGTCTCGATACCAAATGTAGTAGGACAGTCGGTAAAAGACACATCTATCGAGTTCAGGGCCCGACGTG	..(((.((((((((.....(((((((((((...((((...(((......)))...))))..))))))))))).....))))))))))).....	1518519	1518571	AGATGTGTCTCGATACCAAATGTAGTAGGACAGTCGGTAAAAGACACATCTAT	((((((((((...((((...(((......)))...))))..))))))))))..	Cre-miRN659	1518552	1518571	TCGGTAAAAGACACATCTAT	Cre-miRN659*	1518519	1518539	AGATGTGTCTCGATACCAAAT		3
Cre-MIRN660	PmiREN003779	MIRN660	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_16	4637317	4637544	-	CCATGGAAGAGAACATCAGAACTGTCACACGGCGCATGTAGGGGCGTCCTAGGGCATCTCCCCAGCCACCAGGAGGCCTCTGGACAGGCCCGAATCAGAAGCAGTCATTCGTATGACACCATTCGGGAAGCTTTCGGGTTCACATCGTCAGTCCTGTGAGCGCGACTTTGTCAGAAAATGAACCACTGCATGTCCGGCGCGGCGGAACGCTCTGAGCCCCAATCCAAA	...((((........(((((.(((((.(.(((.((((((((.(((.((((.((((.........))).).)))).)))((((.((((((((((((.....(..(((((....)))))..))))))))......(((.(((((((..........))))))).))).)))))))))..........)))))))))))..).))))).....))))).......))))..	4637337	4637524	ACTGTCACACGGCGCATGTAGGGGCGTCCTAGGGCATCTCCCCAGCCACCAGGAGGCCTCTGGACAGGCCCGAATCAGAAGCAGTCATTCGTATGACACCATTCGGGAAGCTTTCGGGTTCACATCGTCAGTCCTGTGAGCGCGACTTTGTCAGAAAATGAACCACTGCATGTCCGGCGCGGCGGAAC	.(((((.(.(((.((((((((.(((.((((.((((.........))).).)))).)))((((.((((((((((((.....(..(((((....)))))..))))))))......(((.(((((((..........))))))).))).)))))))))..........)))))))))))..).)))))...	Cre-miRN660	4637504	4637524	ACTGTCACACGGCGCATGTAG	Cre-miRN660*	4637337	4637357	GCATGTCCGGCGCGGCGGAAC		3
Cre-MIRN661	PmiREN003784	MIRN661	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-scaffold_19	32854	32993	-	GCGCACCGTATTGTGTCCGACCCAGTCCGTCCCCAACAGCCACGGTCCGCAGCCAGCTGCTTCGCACTTTGCAGAACTGCCGCGTGCGCGGAGCGGCATTGCATGGTGATAGACTGGGCGAGGTCGCACTTCAATGGCAC	.....((((..((((.((..(((((((.(((.(((.(((...((.(((((.((..((.((((((((...))).)))..)).))..))))))).))...)))..))).))).)))))))...)).)))).....))))...	32874	32973	CCCAGTCCGTCCCCAACAGCCACGGTCCGCAGCCAGCTGCTTCGCACTTTGCAGAACTGCCGCGTGCGCGGAGCGGCATTGCATGGTGATAGACTGGGCG	(((((((.(((.(((.(((...((.(((((.((..((.((((((((...))).)))..)).))..))))))).))...)))..))).))).)))))))..	Cre-miRN661	32874	32894	TGCATGGTGATAGACTGGGCG	Cre-miRN661*	32953	32973	CCCAGTCCGTCCCCAACAGCC		3
Cre-MIRN662	PmiREN003787	MIRN662	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_14	2430575	2430667	-	TGCCCAGGGCCTGCGCCACGTGCTGCCCAACTTGACGTAGGCGGCCCAAGAGGCCTGGTCCGGTGGCAGCTCGAGGGGACCTGCAGGGGGATA	(((((....((((((((.((.((((((..(((.(((.(((((..........)))))))).))))))))).))..))....))))))))).))	2430595	2430647	TGCTGCCCAACTTGACGTAGGCGGCCCAAGAGGCCTGGTCCGGTGGCAGCTCG	.((((((..(((.(((.(((((..........)))))))).)))))))))...	Cre-miRN662	2430628	2430647	TGCTGCCCAACTTGACGTAG	Cre-miRN662*	2430595	2430615	GCCTGGTCCGGTGGCAGCTCG		3
Cre-MIRN663	PmiREN003788	MIRN663	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_15	705860	706112	+	CTTACCGCGACGTCCTCTGCAGCCAAGCCGTTCTTGCGCTTGTCATTGGCCATTGTTCCTTATCCTTGGGATCTGAGCAGCTAGATGGTTACCGCAGCGAGTGTCTCAGCCTCTTAGTGCCTCAGTTAGGGTTTTCAGGCAGCGGGATCAGATCCCAAGGATAAGGAACAATGGCCAATGACAAGCGCAAGAACGGCTTGGCTGCAGAGGACGTCGCGGTAAGTTTGCGACGCAGGCGGTATTTAAGATG	.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((...(((..(((..((((((.((((.((...)).)).))))).)))..)))..)))...)))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((((...))))))............. .-	705880	706092	GCGACGTCCTCTGCAGCCAAGCCGTTCTTGCGCTTGTCATTGGCCATTGTTCCTTATCCTTGGGATCTGAGCAGCTAGATGGTTACCGCAGCGAGTGTCTCAGCCTCTTAGTGCCTCAGTTAGGGTTTTCAGGCAGCGGGATCAGATCCCAAGGATAAGGAACAATGGCCAATGACAAGCGCAAGAACGGCTTGGCTGCAGAGGACGTCGCGG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((...(((..(((..((((((.((((.((...)).)).))))).)))..)))..)))...)))....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN663	706072	706092	TGGCTGCAGAGGACGTCGCGG	Cre-miRN663*	705880	705900	GCGACGTCCTCTGCAGCCAAG		3
Cre-MIRN664	PmiREN003790	MIRN664	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_15	1583170	1583270	+	TATTTCCTTCCCATTCTGCTTCACCGGCATGCTTGGAACGCTCGTAGTATCCCTTAATGGGCATTCAAGCAGCTGGAGGACGCGCACCGGTGTTCTGCGCC	.......................(((((.((((((((..((((((...........)))))).)))))))))))))............(((((...)))))	1583190	1583250	TCACCGGCATGCTTGGAACGCTCGTAGTATCCCTTAATGGGCATTCAAGCAGCTGGAGGAC	...(((((.((((((((..((((((...........)))))).))))))))))))).....	Cre-miRN664	1583190	1583209	TCACCGGCATGCTTGGAACG	Cre-miRN664*	1583230	1583250	GCATTCAAGCAGCTGGAGGAC		3
Cre-MIRN665	PmiREN003791	MIRN665	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_16	150963	151191	+	AGTCAAAGGTGAACATGTCGAACCCGATGTCCTTCGCAACGTCGCGCACCTTGTCCCTCTACAATGTGTGCGCATAGCTGGCAGCGTCCAGCACCCGCCGTGCAGCCTCCCGATTTGCCTCTCAGGGAGGCTGCCAGCTTTGTGTGCTGGACGCTGGCAGCTATGCGTACACGACAAAGTGTGCGACGTTGCGATGGACATCGGGTTCGACATGTTTGCCTTTGACTTC	((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.(((((..........(((((((((((((((.((((((((((((((.((.(.((((((((((((........)).))))))))))).))...).))))))))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))..	150983	151171	AACCCGATGTCCTTCGCAACGTCGCGCACCTTGTCCCTCTACAATGTGTGCGCATAGCTGGCAGCGTCCAGCACCCGCCGTGCAGCCTCCCGATTTGCCTCTCAGGGAGGCTGCCAGCTTTGTGTGCTGGACGCTGGCAGCTATGCGTACACGACAAAGTGTGCGACGTTGCGATGGACATCGGGTTCG	((((((((((((.((((((((((((((((.(((((..........(((((((((((((((.((((((((((((((.((.(.((((((((((((........)).))))))))))).))...).))))))))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))))))..	Cre-miRN665	151151	151171	TTGCGATGGACATCGGGTTCG	Cre-miRN665*	150983	151003	AACCCGATGTCCTTCGCAACG		3
Cre-MIRN666	PmiREN003802	MIRN666	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_16	7435017	7435207	-	GCCAATCCAGTTAAGGACGGTGCACTCTCACTTCGCAGTTAAGCTCCCCTTTCCTGCCGCTAGACAGTCACAGCGTGCAGGTGCCACCGCGGTTTTGAAGCTCACGCAATGGAGGGCAGTAAAGGACGCCAAGGCGCCGGGAGCGGCCGCGGCGAGGACGCAGGAGGCGCCGGGCGGGCTCAGGTAGGGTT	.....(((......))).(((((.((((..((((((.((...((((((....(((((((((..........)))).)))))((((.(((((.............)))...))..)))).....((.(((....)))))))))))....)).)))))).....)))))))))....................	7435037	7435187	TGCACTCTCACTTCGCAGTTAAGCTCCCCTTTCCTGCCGCTAGACAGTCACAGCGTGCAGGTGCCACCGCGGTTTTGAAGCTCACGCAATGGAGGGCAGTAAAGGACGCCAAGGCGCCGGGAGCGGCCGCGGCGAGGACGCAGGAGGCGCC	(((.((((..((((((.((...((((((....(((((((((..........)))).)))))((((.(((((.............)))...))..)))).....((.(((....)))))))))))....)).)))))).....)))))))..	Cre-miRN666	7435037	7435056	GCGAGGACGCAGGAGGCGCC	Cre-miRN666*	7435167	7435187	TGCACTCTCACTTCGCAGTTA		3
Cre-MIRN667	PmiREN003803	MIRN667	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_17	4288625	4288800	+	TTCGCAGCCTTGAGCAAACATAGGGCTTTTCGGAAGGGAGAAGGGTGGACTCTGAGTCCACACTGTTTGCGTCCTCGCCCCCCTAGCTTCGGAGTTGCTTCGCGCAGCGCGCGCTTCACCGTTTGACCACCGTTCTCCCTTCCAAAAAGCCCTATGTTTGCTCAAAGTTGTTTGCT	...(((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((............(((....))).........)))))))).....(((((...)))))..(((.....)))))))).))))))))))).))))))))))))))))))))).))))).....	4288645	4288780	TAGGGCTTTTCGGAAGGGAGAAGGGTGGACTCTGAGTCCACACTGTTTGCGTCCTCGCCCCCCTAGCTTCGGAGTTGCTTCGCGCAGCGCGCGCTTCACCGTTTGACCACCGTTCTCCCTTCCAAAAAGCCCTATG	((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((............(((....))).........)))))))).....(((((...)))))..(((.....)))))))).))))))))))).))))))))))..	Cre-miRN667	4288645	4288665	TAGGGCTTTTCGGAAGGGAGA	Cre-miRN667*	4288760	4288780	TCCCTTCCAAAAAGCCCTATG		3
Cre-MIRN668	PmiREN003808	MIRN668	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	6908810	6909002	-	GGCCAGCTGTCGCACCGGCCTGGAGTGACAATACTGTAATTTAGCATTAGTATAGTTGATTGTTATGTTACGTGGTTATATGACAACCAAAGCCCACTGGCCCAGTGGGTTTGCTGTCCACTGGCTTAGTGGGCCGGATGGTGACGATGAGCTGCAGTTGTTGTGATTGCAATGGTGAGGCTGACGCATAGCT	.(.(((((....(((((...((.(((.((((((((((................((((.((((((((....(((((((.......)))))..(((((((((.((((((((.......)))))))).)))))))))))....)))))))).)))))))).)))))).))).)).))))).))))).)........	6908830	6908982	TGGAGTGACAATACTGTAATTTAGCATTAGTATAGTTGATTGTTATGTTACGTGGTTATATGACAACCAAAGCCCACTGGCCCAGTGGGTTTGCTGTCCACTGGCTTAGTGGGCCGGATGGTGACGATGAGCTGCAGTTGTTGTGATTGCAAT	((.(((.((((((((((................((((.((((((((....(((((((.......)))))..(((((((((.((((((((.......)))))))).)))))))))))....)))))))).)))))))).)))))).))).))..	Cre-miRN668	6908963	6908982	TGGAGTGACAATACTGTAAT	Cre-miRN668*	6908830	6908850	TGCAGTTGTTGTGATTGCAAT		3
Cre-MIRN669	PmiREN003817	MIRN669	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	2856072	2856203	+	CCTCTGTTACTTACTGCTGGCCTCTCGTACAGTCTCCATCCATCGTGCGCGCCCGTGTGTTTAGTTAACTTGGAGACGATGCGCACGATGGATGGAGACTGAACGAGAGGCCAGCAGTAAGTAACAGAGGCA	((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((..(((.(.(..((....)).).).))).)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))..	2856092	2856183	CCTCTCGTACAGTCTCCATCCATCGTGCGCGCCCGTGTGTTTAGTTAACTTGGAGACGATGCGCACGATGGATGGAGACTGAACGAGAGGCC	((((((((.((((((((((((((((((((((..(((.(.(..((....)).).).))).)))))))))))))))))))))).))))))))..	Cre-miRN669	2856164	2856183	TGGAGACTGAACGAGAGGCC	Cre-miRN669*	2856092	2856112	CCTCTCGTACAGTCTCCATCC		3
Cre-MIRN670	PmiREN003818	MIRN670	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	3014356	3014526	+	CGTGCGGGTCTGACTCGCGGGCAGGGCGGGACTGCCACAGCTGGGGATTATCGCGGGCAGGGCGGGACTGCCACAGTCGAAGATTCCTCAGCTGTGGCAGTCCCGCCCTGCCCGCGAGTCATTCCCCAGCTGTGGCAGTCCCGCCCTGCCCGCGAGTCCGATACGCATGTG	((((((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((((((.((.......)).))))))))))))))))))))))))))).....)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))).))))))..	3014376	3014506	GCAGGGCGGGACTGCCACAGCTGGGGATTATCGCGGGCAGGGCGGGACTGCCACAGTCGAAGATTCCTCAGCTGTGGCAGTCCCGCCCTGCCCGCGAGTCATTCCCCAGCTGTGGCAGTCCCGCCCTGCCC	(((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((((((.((.......)).))))))))))))))))))))))))))).....)))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN670	3014376	3014396	GCAGGGCGGGACTGCCACAGC	Cre-miRN670*	3014486	3014506	TGTGGCAGTCCCGCCCTGCCC		3
Cre-MIRN671	PmiREN003820	MIRN671	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_12	6166991	6167117	-	CCAAGGCTCGTCGCCCGAATGGCTACTGGCGTCCATTCAACACCTGTAAGCCTTACAGTTAATAAGGCTCCAAGGTTTACAGGTGTTGAACGGAAGCCAGTAGCCATTGGGGCGACGAGCCTTGGCT	((((((((((((((((.(((((((((((((.(((.(((((((((((((((((((..((((.....))))..))))))))))))))))))).))).))))))))))))).))))))))))))))))..	6167011	6167097	GGCTACTGGCGTCCATTCAACACCTGTAAGCCTTACAGTTAATAAGGCTCCAAGGTTTACAGGTGTTGAACGGAAGCCAGTAGCCAT	((((((((((.(((.(((((((((((((((((((..((((.....))))..))))))))))))))))))).))).))))))))))..	Cre-miRN671	6167011	6167031	TGAACGGAAGCCAGTAGCCAT	Cre-miRN671*	6167077	6167097	GGCTACTGGCGTCCATTCAAC		3
Cre-MIRN672	PmiREN003822	MIRN672	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	6448341	6448454	+	TCAGCATGGACCTGCAGACGCCGGCGTCGCGCGAGGGTGCGCCCACGATACCTAGGGTTGCCGCTGGCTGTGCACCGGTTCGGCGATGAGGGCAGCTGCGTGGCGGCACCCGAG	((......))..(((((..(((..((((((.((((((((((((((((..(((...)))...)).)))..)))))))..))))))))))..)))..)))))..............	6448361	6448434	CCGGCGTCGCGCGAGGGTGCGCCCACGATACCTAGGGTTGCCGCTGGCTGTGCACCGGTTCGGCGATGAGGGCA	((..((((((.((((((((((((((((..(((...)))...)).)))..)))))))..))))))))))..))..	Cre-miRN672	6448414	6448434	ACCGGTTCGGCGATGAGGGCA	Cre-miRN672*	6448361	6448381	CCGGCGTCGCGCGAGGGTGCG		3
Cre-MIRN673	PmiREN003823	MIRN673	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_13	2001073	2001199	+	CAAGCAGTCAGGTGGAAGCGCCGAGTAGGAGTGAGAGTCAGAGGGGTATATAAGCGGCTACGAGCAAGACGCTTACATACCCCACTGACTCTCACTCCTACTCGGCGCTTCTACCTGACTGCTTGCT	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((((.((.......)).)))))).))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	2001093	2001179	CCGAGTAGGAGTGAGAGTCAGAGGGGTATATAAGCGGCTACGAGCAAGACGCTTACATACCCCACTGACTCTCACTCCTACTCGGCG	(((((((((((((((((((((.(((((((.((((((.((.......)).)))))).))))))).)))))))))))))))))))))..	Cre-miRN673	2001093	2001113	CCGAGTAGGAGTGAGAGTCAG	Cre-miRN673*	2001159	2001179	GACTCTCACTCCTACTCGGCG		3
Cre-MIRN674a	PmiREN003829	MIRN674	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	1940453	1940552	-	GGGTGGGGTCGTGGCAGGGGTCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCCCCTGCCCCGCATGCAAAGGT	............(((((((((...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...)))))))))..............	1940473	1940532	TCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCC	(...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...)..	Cre-miRN674a	1940512	1940532	TCAAGGTGTGGATGCGGCATG	Cre-miRN674a*	1940473	1940493	TGCCCAGACCACGCTCCAGCC		3
Cre-MIRN674b	PmiREN003834	MIRN674	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	1573664	1573763	+	GGGTGGGGTCGTGGCAGGGGTCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCCCCTGCCCCGCATGCAAAGGT	(.(((.((....(((((((((...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...))))))))))).))).)......	1573684	1573743	TCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCC	(...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...)..	Cre-miRN674b	1573684	1573704	TCAAGGTGTGGATGCGGCATG	Cre-miRN674b*	1573723	1573743	TGCCCAGACCACGCTCCAGCC		3
Cre-MIRN674c	PmiREN003835	MIRN674	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	1574213	1574312	+	GGGTGGGGTCGTGGCAGGGGTCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCCCCTGCCCCGCATGCAAAGGT	(.(((.((....(((((((((...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...))))))))))).))).)......	1574233	1574292	TCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCC	(...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...)..	Cre-miRN674c	1574233	1574253	TCAAGGTGTGGATGCGGCATG	Cre-miRN674c*	1574272	1574292	TGCCCAGACCACGCTCCAGCC		3
Cre-MIRN674d	PmiREN003836	MIRN674	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	1577060	1577159	-	GGGTGGGGTCGTGGCAGGGGTCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCCCCTGTCCCGCATGCAAAGGT	............(((((((((...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...)))))))))..............	1577080	1577139	TCAAGGTGTGGATGCGGCATGGGTGGCTAACCCCGCCCATGCCCAGACCACGCTCCAGCC	(...(((((((.((.(((((((((((......)))))))))))))..)))))))...)..	Cre-miRN674d	1577119	1577139	TCAAGGTGTGGATGCGGCATG	Cre-miRN674d*	1577080	1577100	TGCCCAGACCACGCTCCAGCC		3
Cre-MIRN675	PmiREN003831	MIRN675	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	7184463	7184702	+	CTCCACCGTCCACCGTCCACCCTCCACCGTCCACTGTCCTCCGTCCACCCACCACCCTCGGCTGTCCATACCTGCTAAAGCTCTACCTAGCCCGCAGGCCAACGGCCTGCGCATCCCAGTGCTGATGGGATGGGGAGTTTTCATGAAGGTATGAACGATCCATGCCAACCCAGCGGCTGCTGGCGCCACGTTGTGGCGCGACACGTGGAGGTGCGTCGGCGCGGCGACGTAGGCCAGGCC	......((((..((((...((..(((((.(((((((((.....................((((((.(((((((...((((((((........((((((((...))))))))(((((((.......))))))).)))))))).....))))))).)))......)))....((((....))))(((((((...))))))))))).))))))))).)..)).)))).))))..(((...)))	7184483	7184682	CCTCCACCGTCCACTGTCCTCCGTCCACCCACCACCCTCGGCTGTCCATACCTGCTAAAGCTCTACCTAGCCCGCAGGCCAACGGCCTGCGCATCCCAGTGCTGATGGGATGGGGAGTTTTCATGAAGGTATGAACGATCCATGCCAACCCAGCGGCTGCTGGCGCCACGTTGTGGCGCGACACGTGGAGGTGCGTCGGC	(..(((((.(((((((((.....................((((((.(((((((...((((((((........((((((((...))))))))(((((((.......))))))).)))))))).....))))))).)))......)))....((((....))))(((((((...))))))))))).))))))))).)..)..	Cre-miRN675	7184663	7184682	ACACGTGGAGGTGCGTCGGC	Cre-miRN675*	7184483	7184503	CCTCCACCGTCCACTGTCCTC		3
Cre-MIRN676	PmiREN003838	MIRN676	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	6854046	6854247	-	GACCTGGTGGTTGGTCGGCGTTGGGCTGCTGGTGGTCGGCATCCTCATCAGGCTCCTGTACGCAACTGCGAAGCTCTTCCTCGCGACCGTCAGGTGCGCATCCTTCTGGTTCAGTTTAATGGAAGAGCTTCGCAGTTGCGTACAGGAGCATGATGAGGATGCCGACCACCAGCAGCCCAACGC	((((....)))).....(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..((((((....))).)))..((....))...........))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))	6854066	6854227	TTGGGCTGCTGGTGGTCGGCATCCTCATCAGGCTCCTGTACGCAACTGCGAAGCTCTTCCTCGCGACCGTCAGGTGCGCATCCTTCTGGTTCAGTTTAATGGAAGAGCTTCGCAGTTGCGTACAGGAGCATGATGAGGATGCCGACCACCAGCAGCCCAACG	((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..((((((....))).)))..((....))...........))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN676	6854207	6854227	TTGGGCTGCTGGTGGTCGGCA	Cre-miRN676*	6854066	6854086	CCGACCACCAGCAGCCCAACG		3
Cre-MIRN677	PmiREN003843	MIRN677	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_1	1695531	1695792	+	ATTCGGGTGAATAGCCGCGCGATTCAGGGAGCGACATCAGGGGACACGAAATATTCAAAGGGATTTTTCGCTTGCCTTTGAGCGCGAGTATCTGGTGGTACACAAGGAGGACGTCGGCCTTCAGCGTGGGCGTGACAGCTGCAGGGTCCACAGCGCCTCCGTGTTTCCATACAACATTAGCTCCGACAGGAAACTCAAAGGACCCGATAAAAGGTTGCGCGGCCATCGTGTTTTGGCTTCAAGTCAAGTG	.....((((....((((((((((((.(((.(((.(.(((((((.(((((((.((((....)))).)))))..)))))))))))))((((.....((((.((((..(((((.(((.((((((((((.((.......)))))).)))).))...))))))))))))..))))...........(((....))).))))......)))))......))))))))))))))....(((((((...)))))))..	1695551	1695772	GTGAATAGCCGCGCGATTCAGGGAGCGACATCAGGGGACACGAAATATTCAAAGGGATTTTTCGCTTGCCTTTGAGCGCGAGTATCTGGTGGTACACAAGGAGGACGTCGGCCTTCAGCGTGGGCGTGACAGCTGCAGGGTCCACAGCGCCTCCGTGTTTCCATACAACATTAGCTCCGACAGGAAACTCAAAGGACCCGATAAAAGGTTGCGCGGCCATCG	(((....((((((((((((.(((.(((.(.(((((((.(((((((.((((....)))).)))))..)))))))))))))((((.....((((.((((..(((((.(((.((((((((((.((.......)))))).)))).))...))))))))))))..))))...........(((....))).))))......)))))......)))))))))))))..	Cre-miRN677	1695753	1695772	AAAAGGTTGCGCGGCCATCG	Cre-miRN677*	1695551	1695571	GTGAATAGCCGCGCGATTCAG		3
Cre-MIRN678	PmiREN003846	MIRN678	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_7	5622229	5622349	-	CAGATCGACGGGACGTTATGAAGTCGTCGATGCGCCTCTGGTCTGAGCCTCTTGCTTGCAGCTGGGCCCGGCCCATTACCTGGGCGCTGACTGTGACTTCCTCCGTTGGCTCGGCGTTTGT	(((.((((((((.......((((((((((..((((((.(((.(((.((((...(((...))).)))).))).)))......))))))))))...)))))).)))))))))).)........	5622249	5622329	AAGTCGTCGATGCGCCTCTGGTCTGAGCCTCTTGCTTGCAGCTGGGCCCGGCCCATTACCTGGGCGCTGACTGTGACTTCC	(((((((((..((((((.(((.(((.((((...(((...))).)))).))).)))......))))))))))...)))))..	Cre-miRN678	5622249	5622269	TGGGCGCTGACTGTGACTTCC	Cre-miRN678*	5622309	5622329	AAGTCGTCGATGCGCCTCTGG		3
Cre-MIRN679	PmiREN003847	MIRN679	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_8	313745	313910	+	GGGGGTCCGGGTGGGGACGGTGTGGTTGGCGGCGTGGGAATGGGCGATACCGGAGGAGGCGGTGGGTGCAGCCACCCATGGAGGTCGGCGCCAGGTGGAGTCGCCGCGCATGGACCCAAGGCCTGCTGGAGCCGGCGGCGCGCGTGGAGGACCCGCTGGATTTAAT	.......(.((((((..(..((((((((.((((.(.((...((((....((......))(.(((((((....))))))).).((((.((((..((((....))))))))...))))....)))).)).).)))).)))).))))....)..)))))).).......	313765	313890	TGTGGTTGGCGGCGTGGGAATGGGCGATACCGGAGGAGGCGGTGGGTGCAGCCACCCATGGAGGTCGGCGCCAGGTGGAGTCGCCGCGCATGGACCCAAGGCCTGCTGGAGCCGGCGGCGCGCGTG	((((((((.((((.(.((...((((....((......))(.(((((((....))))))).).((((.((((..((((....))))))))...))))....)))).)).).)))).)))).))))..	Cre-miRN679	313765	313785	TGTGGTTGGCGGCGTGGGAAT	Cre-miRN679*	313870	313890	CTGGAGCCGGCGGCGCGCGTG		3
Cre-MIRN680	PmiREN003848	MIRN680	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_8	347808	347930	+	CTCTGCTGCGCAGAGTACCGAGGACGAAGAGCTTCTTGATTACGACGAGGACTTCGAGACCGTCTCGAAGTCCTCGTCGTAATCGAGGAGCTCTTCGTCCTCGGTACCGTTGCG	.(((((...)))))(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....... .-137.00	347828	347910	AGGACGAAGAGCTTCTTGATTACGACGAGGACTTCGAGACCGTCTCGAAGTCCTCGTCGTAATCGAGGAGCTCTTCGTCCTCG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Cre-miRN680	347828	347848	AGGACGAAGAGCTTCTTGATT	Cre-miRN680*	347890	347910	TCGAGGAGCTCTTCGTCCTCG		3
Cre-MIRN681	PmiREN003851	MIRN681	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	1371936	1372151	+	TGCCAACACGCACTGTTACCTTTCCTAGGCACACGGACGGCCACAGCTGCCCAGAAGCCACACACCTGAACAAGGATGCATGTGTTTCCCTGTAACGCCCCGGCGTCGTCTGCGTGGCTGGCGCACGCGGGACAATGCATGTGTGTTTCTGTCGTGGCCATTGGTGCACCTGATACGTTTGTGAGTCTGGTATCATGGCCCTTGCAACGCCAGTCG	........((.(((..........((((((.((((((((....(((.(((((((..((((((((...(((((.(.(((((((((((.......)))))((((.(((((((.((...)).)))).)))))))...)))))).).))))).))).)))))..)))).))).)))...)))))))).))))))......(((.........))))))))	1371956	1372131	TTTCCTAGGCACACGGACGGCCACAGCTGCCCAGAAGCCACACACCTGAACAAGGATGCATGTGTTTCCCTGTAACGCCCCGGCGTCGTCTGCGTGGCTGGCGCACGCGGGACAATGCATGTGTGTTTCTGTCGTGGCCATTGGTGCACCTGATACGTTTGTGAGTCTGGTATCAT	....((((((.((((((((....(((.(((((((..((((((((...(((((.(.(((((((((((.......)))))((((.(((((((.((...)).)))).)))))))...)))))).).))))).))).)))))..)))).))).)))...)))))))).))))))......	Cre-miRN681	1371956	1371976	TTTCCTAGGCACACGGACGGC	Cre-miRN681*	1372111	1372131	CGTTTGTGAGTCTGGTATCAT		3
Cre-MIRN682a	PmiREN003854	MIRN682	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_4	3981560	3981643	+	CGGTGGCGGCGCCGTGCAAAGCCGGCAGAATGACACGACAGCTGTCGCGCCATTCTGCCGGCATGGCATTTCGCCGGCAGCAGG	...((.(((((..((((...((((((((((((.(.((((....)))).).))))))))))))...))))..))))).)).....	3981580	3981623	GCCGGCAGAATGACACGACAGCTGTCGCGCCATTCTGCCGGCAT	((((((((((((.(.((((....)))).).))))))))))))..	Cre-miRN682a	3981580	3981599	GCCGGCAGAATGACACGACA	Cre-miRN682a*	3981603	3981623	GTCGCGCCATTCTGCCGGCAT		3
Cre-MIRN682b	PmiREN003856	MIRN682	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_6	8634797	8634880	+	CGGTGGCGGCGCCGTGCAAAGCCGGCAGAATGACACGACAGCTGTCGCGCCATTATGCCGGCATGGCATTTCGCCGGCAGCAGG	...((.(((((..((((...(((((((.((((.(.((((....)))).).)))).)))))))...))))..))))).)).....	8634817	8634860	GCCGGCAGAATGACACGACAGCTGTCGCGCCATTATGCCGGCAT	(((((((.((((.(.((((....)))).).)))).)))))))..	Cre-miRN682b	8634817	8634836	GCCGGCAGAATGACACGACA	Cre-miRN682b*	8634840	8634860	GTCGCGCCATTATGCCGGCAT		3
Cre-MIRN683	PmiREN003862	MIRN683	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_3	6440740	6440835	-	GCGTCGGGACGTGAACCGAGTTTCGGAAGCAATGACAGGTGTGTAGATTTGTGCGGTCCCTCATTCTTGTGAAAGTATAGTACTACGTCAAGTATA	..................(.(((((.(((.(((((..((..((((......))))..)).)))))))).))))).)....((.(((.....)))))	6440760	6440815	TTTCGGAAGCAATGACAGGTGTGTAGATTTGTGCGGTCCCTCATTCTTGTGAAAGT	(((((.(((.(((((..((..((((......))))..)).)))))))).)))))..	Cre-miRN683	6440795	6440815	TTTCGGAAGCAATGACAGGTG	Cre-miRN683*	6440760	6440780	GTCCCTCATTCTTGTGAAAGT		3
Cre-MIRN684	PmiREN003865	MIRN684	Chlamydomonas reinhardtii	Cre-chromosome_11	1369636	1369866	+	TTATGGACGCTTCGACTTGTTGCGTGCCCTGCTGCGTGCCCTGTCGCAATACGCCTTGAGTGTGCCGTGCACGGCAAGCCTGCGCCTCGCTATTGCTTCGTGTTGACAACGGAGCGGGCTTACGTGATCATGCGTCACCCTGTACGTCTTGAGGTCCGCACGCACATCATACTATCACGCGGCATCACCATTGTAGTTTGGCTGACGCACCCCAAGCCA	...............((((.((((((((..((((((((...((((((.........(((.(((((.((((..(((........)))........(((((((.......)))))))((((((.((.(((..((((......)))).))).)))))))))))))))))))).........))))))....)).))))))..)))..)))))...))))...	1369656	1369846	TGCGTGCCCTGCTGCGTGCCCTGTCGCAATACGCCTTGAGTGTGCCGTGCACGGCAAGCCTGCGCCTCGCTATTGCTTCGTGTTGACAACGGAGCGGGCTTACGTGATCATGCGTCACCCTGTACGTCTTGAGGTCCGCACGCACATCATACTATCACGCGGCATCACCATTGTAGTTTGGCTGACGCACC	((((((((..((((((((...((((((.........(((.(((((.((((..(((........)))........(((((((.......)))))))((((((.((.(((..((((......)))).))).)))))))))))))))))))).........))))))....)).))))))..)))..)))))..	Cre-miRN684	1369825	1369846	ATTGTAGTTTGGCTGACGCACC	Cre-miRN684*	1369656	1369676	TGCGTGCCCTGCTGCGTGCCC		3