miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Bra-MIR156a PmiREN002382 MIR156 Brassica rapa Bra-A02 2009598 2009739 + ATATTGAAGGTAAGGGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTCAATTAGGGTTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTCTGTCACCCCTTCTCTCTCTCTCTCTTG .....((.((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((((((........))))...)))))..)))))))))))))))))))))))...))))))))).)))))..)).))....... 2009618 2009719 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTCAATTAGGGTTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((((((........))))...)))))..)))))))))))))))))))))))...))))))).. 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Bra-miR169f 4684690 4684710 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Bra-miR169f* 4684567 4684587 CAGGCAGTCTCCTTGGCTATC 3 Bra-MIR169g PmiREN002453 MIR169 Brassica rapa Bra-A09 1476069 1476241 - AATAGGAGAATCATATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTACTTCTTTGAGAATTAAGATGGTCATGGTATCATGTTTGAAAGATGAATTTATATAGGTTATCTCAACTAATGATCTTGCTTATAAAGATATTAGGCAGTCTCCTTGGCTGCCCTTATATGTTCTTCTCTCTC (..(((((((.(((((..((((((((((((.((((.(((((..((((((..((.((((((.((..((((.(((....))).((((((.((.....)).))))))..)))))).)))))).)).))))))...)))))))))))))))))))))...))))))))))))...). 1476089 1476221 TAGCCAAGGATGACTTGCCTACTTCTTTGAGAATTAAGATGGTCATGGTATCATGTTTGAAAGATGAATTTATATAGGTTATCTCAACTAATGATCTTGCTTATAAAGATATTAGGCAGTCTCCTTGGCTGCC ((((((((((.((((.(((((..((((((..((.((((((.((..((((.(((....))).((((((.((.....)).))))))..)))))).)))))).)).))))))...))))))))))))))))))).. 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Bra-miR169l 24007367 24007387 CAGCCAAGGATGACTTGCCGA Bra-miR169l* 24007444 24007464 GGCAAGTTGTCCTTGGCTATA 3 Bra-MIR169m PmiREN002459 MIR169 Brassica rapa Bra-A06 25527117 25527308 + GCGAAAAGAGTCGTGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCTTGTTCACCTCCACGATTCAACTTTATACGTTGAAGGGTTTTGGATTATTGTGCATTCAACATGTATAATAATTTGAAATCATGTTGAATCTTTGTGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCGATTTTGACATACTTTTTTCATCC (.(((((((((.(((((.(((.((((((((.((((.(((((..((((...((((.((.((((((((..............((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))..))))))))..)).))))))))...))))))))))))))))).)))..))))))))))))))..). 25527137 25527288 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCTTGTTCACCTCCACGATTCAACTTTATACGTTGAAGGGTTTTGGATTATTGTGCATTCAACATGTATAATAATTTGAAATCATGTTGAATCTTTGTGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCGATT (.((((((((.((((.(((((..((((...((((.((.((((((((..............((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))..))))))))..)).))))))))...))))))))))))))))).).. 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Bra-miR390d 5295022 5295042 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Bra-miR390d* 5294959 5294979 CGCTATCCATCCTGAGTTCTA 3 Bra-MIR390e PmiREN002506 MIR390 Brassica rapa Bra-A03 9608347 9608461 + AAAGTACAGAAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATCATCATCATCTCATTCAAATTGATATTTTGGCGCTGTCCATCCTGAGTTTCATTGGCTCTTCTTACTACAAT ..((((.((((((.((.((.((((((((((.(((((((((((..((.((((............))))))..))))))))))).)))))))))).)).)).))))))))))..... 9608367 9608441 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATCATCATCATCTCATTCAAATTGATATTTTGGCGCTGTCCATCCTGAGTTTCA ((((((((((.(((((((((((..((.((((............))))))..))))))))))).)))))))))).. 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Bra-miR398b 15810217 15810237 TGTGTTCTCAGGTCACCCCTG Bra-miR398b* 15810291 15810311 GGGTCGATATGAGAACACATG 3 Bra-MIR398c PmiREN002534 MIR398 Brassica rapa Bra-A02 26353634 26353758 + ACAACAGGTGAGATCTCAAAGGAGTGTCATGAGAACACGGATCCTCTTGTTTCTTTAAGATTTCCACTGAAACCAATTGAGTTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGAATCTCCCCCGTTCCATT ((....((.(((((.(((((((.(((.(.((((((((((((..(((..(((((...............))))).....))).)))))))))))).).))).))))))))))))))..))...... 26353654 26353738 GGAGTGTCATGAGAACACGGATCCTCTTGTTTCTTTAAGATTTCCACTGAAACCAATTGAGTTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTT ((.(((.(.((((((((((((..(((..(((((...............))))).....))).)))))))))))).).))).)).. 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Bra-miR5717 22452899 22452919 GTTTGGATTGTTTGCCTTGGC Bra-miR5717* 22452847 22452867 CAAGGCAAACAATCCAAACTG 3 Bra-MIR5718 PmiREN002557 MIR5718 Brassica rapa Bra-A09 5605075 5605308 + GATTTATGTTTTGTTGATCTTGTTCTGGTTTGGTTTTGAACAGCTTAGTGTTGCTCTGTAATGGATGCATAACCAGTAGATATGTCAGGATATTAAAAGGAACCGTTATTTTGCCTCGTGATAGCGATGTTCCTTCGAATCTTCTGACATATCTACTGCTTATGCCACCATTACAGAACAGCAACAAGCTGTTCAGAACCAAACACAGAACAAGAACAACGGAACATAAAATCT ..((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((.((((((((((..((((((.(((((((((((((((((.(((..((((((((((((((.........)))))))..)))))))..))).))))))))))))))))).))))))..)))))))))).)))))..))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))))).... 5605095 5605288 TGTTCTGGTTTGGTTTTGAACAGCTTAGTGTTGCTCTGTAATGGATGCATAACCAGTAGATATGTCAGGATATTAAAAGGAACCGTTATTTTGCCTCGTGATAGCGATGTTCCTTCGAATCTTCTGACATATCTACTGCTTATGCCACCATTACAGAACAGCAACAAGCTGTTCAGAACCAAACACAGAACAAG ((((((((((((((((((((((((((..(((((.((((((((((..((((((.(((((((((((((((((.(((..((((((((((((((.........)))))))..)))))))..))).))))))))))))))))).))))))..)))))))))).)))))..))))))))))))))))))).))))))).. 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Bra-miR5723 27302427 27302447 AATGTGCTGCAATATCTCTGC Bra-miR5723* 27302332 27302352 AGAGATATTGCAGCACATTTC 3 Bra-MIR5724 PmiREN002560 MIR5724 Brassica rapa Bra-A08 15044699 15044874 + TGCAAAAATATAGAGACAGTAACCGCCGGTTTGATAATAGCCTTTACGGTGAAATGGATGAACATATCCTTGCATAACCATAAACGGTGAGACGGCAAGAACCACAAGAGCAAGCTCCCAATTCGCCGTAAACGCTATTATAAAACCGGCGGTTAGAGTCGTTATATTTTTTGCAC (((((((((((((.(((..(((((((((((((.((((((((.(((((((((((.(((...........(((((...(((......)))......)))))........(((....)))))).))))))))))).)))))))).)))))))))))))..))).))))).)))))))). 15044719 15044854 AACCGCCGGTTTGATAATAGCCTTTACGGTGAAATGGATGAACATATCCTTGCATAACCATAAACGGTGAGACGGCAAGAACCACAAGAGCAAGCTCCCAATTCGCCGTAAACGCTATTATAAAACCGGCGGTTAG ((((((((((((.((((((((.(((((((((((.(((...........(((((...(((......)))......)))))........(((....)))))).))))))))))).)))))))).)))))))))))).. 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Bra-miR6032 7202873 7202895 TCTGCTGGTCGTTCCATGTTA Bra-miR6032* 7202929 7202949 ACATGGAGCATCAACAGATCT 2 Bra-MIR6034 PmiREN002565 MIR6034 Brassica rapa Bra-A03 14512061 14512181 + ACTCTCAAGCATATCAACCCCGAAGCTATACACGTCTGATTTGTCCGACATTGTATTAGAAATATACAATGTTGGAGACATCTGATGTATATAGCTTTGGGGTTGATATGCTTGAGAGTAT ((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((.(.(((((((((((((.......))))))))))))).).))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))).. 14512081 14512161 CGAAGCTATACACGTCTGATTTGTCCGACATTGTATTAGAAATATACAATGTTGGAGACATCTGATGTATATAGCTTTGGG ((((((((((.(((((.(((.(.(((((((((((((.......))))))))))))).).))).))))).)))))))))).. Bra-miR6034 14512141 14512161 TCTGATGTATATAGCTTTGGG Bra-miR6034* 14512081 14512101 CGAAGCTATACACGTCTGATT 3 Bra-MIR9552a PmiREN002571 MIR9552 Brassica rapa Bra-A09 17721883 17722047 + TGTTGTTGTCAGCAGACTATCGGTCTACTCGGTCAGCGCTAGCTTCTTCATCACCGGACAGACTAATCTAGTGGAGAAGCTGCAGAAGTTTAGCCTGTCCGGTGAGGAAGAAGCTAGCGCTGACCAAGTAGACCGATAGTCTACTGACAACAACAGCGTCAGCCA ((((((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((.((((.((..((.((...)).))..)).)))).))))))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))))))((....)).. 17721899 17722023 CTATCGGTCTACTCGGTCAGCGCTAGCTTCTTCATCACCGGACAGACTAATCTAGTGGAGAAGCTGCAGAAGTTTAGCCTGTCCGGTGAGGAAGAAGCTAGCGCTGACCAAGTAGACCGATAGTC (((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((.((((.((..((.((...)).))..)).)))).))))))))))).))))))))))))))))))).))))))))))))))) Bra-miR9552a 17721899 17721921 CTATCGGTCTACTCGGTCAGC Bra-miR9552a* 17722003 17722023 TGACCAAGTAGACCGATAGTC 2 Bra-MIR9552b PmiREN002572 MIR9552 Brassica rapa Bra-A09 17721898 17722020 - TATCGGTCTACTTGGTCAGCGCTAGCTTCTTCCTCACCGGACAGGCTAAACTTCTGCAGCTTCTCCACTAGATTAGTCTGTCCGGTGATGAAGAAGCTAGCGCTGACCGAGTAGACCGATAGT ((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.((..((.((...)).))..)).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))) 17721918 17722000 GCTAGCTTCTTCCTCACCGGACAGGCTAAACTTCTGCAGCTTCTCCACTAGATTAGTCTGTCCGGTGATGAAGAAGCTAGCGC ((((((((((((.((((((((((((((((.((..((.((...)).))..)).)))))))))))))))).)))))))))))))) Bra-miR9552b 17721918 17721940 CGGTGATGAAGAAGCTAGCGC Bra-miR9552b* 17721980 17722000 GCTAGCTTCTTCCTCACCGGA 3 Bra-MIR9554 PmiREN002573 MIR9554 Brassica rapa Bra-A06 23317922 23318094 - AACAAACGTTTTACTTCCAGGAATGATACTTGGATATGATCTTGGAATAGAGTATATGATCCTTAAGTTTCTCTTTTGGCCTCATAGAAGAATGTGCCAAAACTTAAGAATCGGATGTACTCCATTCCATGATTATATCCAAGTATCATTCCTAGAAGTAAATGTATGTTAGG ((((.((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((.(((((((((......((((..(((......))).))))))))))))).)))..)))))))).)))))).))))))))))))))))))))))).))))))))))).))))... 23317942 23318074 GAATGATACTTGGATATGATCTTGGAATAGAGTATATGATCCTTAAGTTTCTCTTTTGGCCTCATAGAAGAATGTGCCAAAACTTAAGAATCGGATGTACTCCATTCCATGATTATATCCAAGTATCATTCCT (((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((.(((((((((......((((..(((......))).))))))))))))).)))..)))))))).)))))).))))))))))))))))))))).. Bra-miR9554 23317942 23317962 TTATATCCAAGTATCATTCCT Bra-miR9554* 23318054 23318074 GAATGATACTTGGATATGATC 3 Bra-MIR9555a PmiREN002575 MIR9555 Brassica rapa Bra-A07 14886862 14886983 + TATGCGTATGTAATTATGGGATTCTAAGCTTTACGGGAAACCCAACCGAAAGTTCCTTAAATAAGAAATTTTCGATTGCGTTTCCCGTAAAGCTTAGAACCCCGCAATTACCAATTACATAC (((((((((((((((.((((.((((((((((((((((((((.(((.((((((((.(((....))).)))))))).))).)))))))))))))))))))).))))........)))))))))) 14886882 14886963 ATTCTAAGCTTTACGGGAAACCCAACCGAAAGTTCCTTAAATAAGAAATTTTCGATTGCGTTTCCCGTAAAGCTTAGAACCC .((((((((((((((((((((.(((.((((((((.(((....))).)))))))).))).)))))))))))))))))))).)) Bra-miR9555a 14886943 14886965 TTCCCGTAAAGCTTAGAACCC Bra-miR9555a* 14886882 14886902 ATTCTAAGCTTTACGGGAAAC 2 Bra-MIR9555b PmiREN002574 MIR9555 Brassica rapa Bra-A01 12130767 12130883 - ATATATTATATATGTATATGTAATTGCGGGGTTCTAAGCTTTACGGTAAGAAACTTTCGGTTGGGTTTCCCATAAAGTTTAGAAACTTGCAATTATATACGCATATATAATATATAT ((((..(((((((((.((((((((((((((..(((((((((((.((...(((((((......))))))))).)))))))))))..)))))))))))))).))))))))))))))))) 12130787 12130863 TAATTGCGGGGTTCTAAGCTTTACGGTAAGAAACTTTCGGTTGGGTTTCCCATAAAGTTTAGAAACTTGCAATTATA ((((((((((..(((((((((((.((...(((((((......))))))))).)))))))))))..)))))))))))) Bra-miR9555b 12130844 12130865 TAATTGCGGGGTTCTAAGCT Bra-miR9555b* 12130787 12130807 GTTTAGAAACTTGCAATTATA 2 Bra-MIR9556 PmiREN002576 MIR9556 Brassica rapa Bra-A07 23964734 23964859 - GTAAATCAATCAAATTGATTGTCAATTGGTGATAGTAGTTCTTAAGCGTTATAGTGGATTTCTATCTCACGGTTGCTTGAGTTATTCTACTTTCACCAATTGGCCTTTTTTAATTAATTAAAGATA ...(((((((...)))))))((((((((((((.(((((..((((((((.....((((((....))).)))...)))))))).....))))).))))))))))))..(((((((....))))))).. 23964754 23964839 GTCAATTGGTGATAGTAGTTCTTAAGCGTTATAGTGGATTTCTATCTCACGGTTGCTTGAGTTATTCTACTTTCACCAATTGGCCT ((((((((((((.(((((..((((((((.....((((((....))).)))...)))))))).....))))).)))))))))))).. Bra-miR9556 23964754 23964774 TCTACTTTCACCAATTGGCCT Bra-miR9556* 23964819 23964839 GTCAATTGGTGATAGTAGTTC 3 Bra-MIR9557 PmiREN002577 MIR9557 Brassica rapa Bra-A07 913368 913542 - TCTTTGCAGTTCACACTGATTTTGCGTTTCAACTCTGTCCTCATTTCTTTATAACGAAGTGGAGGAACAAAAAGATGTTTTCAGAAGAACATTGAAGAGGAAGAGAATGAAAGCTGCAAGTTAAAAGAATTGAGGGCTGAGTTGGAACACAAAATCTTTGAACTAAGAGACAAGA (((((..((((((....(((((((.((((((((((.(((((((.((((((.((((...((((...............(((((((.......)))))))...............))))..)))))))))).))))))).)))))))))).)))))))..)))))).)))))..... 913388 913522 TTTGCGTTTCAACTCTGTCCTCATTTCTTTATAACGAAGTGGAGGAACAAAAAGATGTTTTCAGAAGAACATTGAAGAGGAAGAGAATGAAAGCTGCAAGTTAAAAGAATTGAGGGCTGAGTTGGAACACAAAAT ((((.((((((((((.(((((((.((((((.((((...((((...............(((((((.......)))))))...............))))..)))))))))).))))))).)))))))))).)))).. Bra-miR9557 913502 913522 TTTGCGTTTCAACTCTGTCCT Bra-miR9557* 913388 913408 GGCTGAGTTGGAACACAAAAT 3 Bra-MIR9558 PmiREN002578 MIR9558 Brassica rapa Bra-A03 17449383 17449529 - CAATGCAAACACTGTGGCAAAGAGATGTCTGGCTTGCAACATCTGAATGTCACTTGGGTGGTGTAGGTTCAGATGTGAACATGGTCGCATCTACTGTTAGAGATGTTGCAAGCCAGACATTTCCTTTCCCACAGTGTTCACAGTCCT .......((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.....)))).).))))((((((((......))))))))........)))))))))))))))))))))).)))).))))))))))......... 17449403 17449509 AGAGATGTCTGGCTTGCAACATCTGAATGTCACTTGGGTGGTGTAGGTTCAGATGTGAACATGGTCGCATCTACTGTTAGAGATGTTGCAAGCCAGACATTTCCTTT ((((((((((((((((((((((((((((.(((((.....)))).).))))((((((((......))))))))........)))))))))))))))))))))).)).. Bra-miR9558 17449489 17449509 AGAGATGTCTGGCTTGCAACA Bra-miR9558* 17449403 17449423 TGCAAGCCAGACATTTCCTTT 3 Bra-MIR9560a PmiREN002579 MIR9560 Brassica rapa Bra-A09 2541488 2541602 + TGAAGATTAAGTGTGTATTGACAGGTGGTGGAACAAATATGAGTTTGTATAGTAGTCGAACAAAATGAAACTCATATTAGTTCTACCTCCTGTTGAAGCCCACATTAATCTGAAT ...((((((((((.((.((((((((.((((((((.(((((((((((.....((......))......))))))))))).)))))))).)))))))).)).))).))))))).... 2541508 2541582 ACAGGTGGTGGAACAAATATGAGTTTGTATAGTAGTCGAACAAAATGAAACTCATATTAGTTCTACCTCCTGTTG (((((.((((((((.(((((((((((.....((......))......))))))))))).)))))))).))))).. 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Bra-miR9560b 23124270 23124293 ACAGGTGGTGGAACAAATATGAGT Bra-miR9560b* 23124326 23124346 TATTAGTTCTACCTCCTGCTG 3 Bra-MIR9561 PmiREN002581 MIR9561 Brassica rapa Bra-A03 14595622 14595711 - TGAGTCTCTCACCAGTCTTTCACTAATTGTATTAATATTCGATTAATTAAATATTAATATAATTGGTGAGAGACTCTGAAAGACTCACCA (((((((.(((..((((((((((((((((((((((((((.((....)).)))))))))))))))))))))))))).))).))))))))). 14595642 14595691 CACTAATTGTATTAATATTCGATTAATTAAATATTAATATAATTGGTGAG (((((((((((((((((((.((....)).))))))))))))))))))))) Bra-miR9561 14595642 14595664 AATATTAATATAATTGGTGAG Bra-miR9561* 14595671 14595691 CACTAATTGTATTAATATTCG 3 Bra-MIR9563 PmiREN002582 MIR9563 Brassica rapa Bra-A01 27780736 27780883 - AAGATTAATGGGAAGTTCTTAGCGGAATATAAGAACCCGTCTCTTAATTTTTAACTAAAAAAATTAAGAACCGGATTCTTAACTTTTTTTTAGTTAAAAGTTAAGAGACAAGTTATTATATTTCTTAAGTGCCTCCTCTTAAGAGCAC (((.((((.((((.((.(((((.(((((((((.(((..((((((((((((((((((((((((((((((((.....)))))))..)))))))))))))))))))))))))..))).)))))))))))))).)).)))).)))).....) 27780756 27780863 AGCGGAATATAAGAACCCGTCTCTTAATTTTTAACTAAAAAAATTAAGAACCGGATTCTTAACTTTTTTTTAGTTAAAAGTTAAGAGACAAGTTATTATATTTCTTAA ((.(((((((((.(((..((((((((((((((((((((((((((((((((.....)))))))..)))))))))))))))))))))))))..))).))))))))))))) Bra-miR9563 27780840 27780865 AGCGGAATATAAGAACCCGTCTCT Bra-miR9563* 27780756 27780776 ACAAGTTATTATATTTCTTAA 3 Bra-MIRN252 PmiREN002628 MIRN252 Brassica rapa Bra-A02 12634525 12634611 + CTCTTTATCCCAAAAAAGTGCTGGATTTTTGACAATGGCAAATCGAGCTTGCAAGACTCCAAAAGCACGCTCGACATCTTTTCGGAC .................((((((((.(((((.((..(((.......)))))))))).)))...)))))................... 12634545 12634591 CTGGATTTTTGACAATGGCAAATCGAGCTTGCAAGACTCCAAAAGCA (((((.(((((.((..(((.......)))))))))).)))...)).. 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Bra-miRN323 7226750 7226769 TTGAAACTTTGATCTAGATC Bra-miRN323* 7226827 7226847 CACTAGATAAAAGCTTTAATG 3 Bra-MIRN324a PmiREN002594 MIRN324 Brassica rapa Bra-A05 14110139 14110227 - CTTGTTTTGCATTTAAGAATTAGATTTAAATTCATTAATCTTTGTATAGATTTGTAGTTTACATGGCCTAATCTTTCATGCCATATATT ........((((..((((.((((((.((((((.((.(((((......))))).)))))))).))...))))))))..))))........ 14110159 14110207 TAGATTTAAATTCATTAATCTTTGTATAGATTTGTAGTTTACATGGCCT .((((.((((((.((.(((((......))))).)))))))).))...)) Bra-miRN324a 14110159 14110180 AGATTTGTAGTTTACATGGCCT Bra-miRN324a* 14110187 14110207 TAGATTTAAATTCATTAATCT 3 Bra-MIRN324b PmiREN002645 MIRN324 Brassica rapa Bra-A07 3502435 3502523 + CTTGTTTTGCATTTAAGAATTAGATTTAAATTCATTAATCTTTGTATAGATTTGTAGTTTACATGGCCTAGTCTTGCATGCCATATTAT ........((((.(((((.((((((.((((((.((.(((((......))))).)))))))).))...))))))))).))))........ 3502455 3502503 TAGATTTAAATTCATTAATCTTTGTATAGATTTGTAGTTTACATGGCCT .((((.((((((.((.(((((......))))).)))))))).))...)) 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Bra-miRN325 117534 117554 AACTGTAGTTGTTCCTGGCAC Bra-miRN325* 117721 117741 GCCGGGAACAACTACTGTTTG 3 Bra-MIRN326 PmiREN002596 MIRN326 Brassica rapa Bra-Scaffold9832 42319 42437 + AAGTATTTGTGGGGTCCATAATTTTTGTGGAACCCCATAGGCAAAGGTTCCAAAAATCTCATATTAAGAACCTTTGCCTATAGGATTCCACAAAAATTGTGGACCCCATCCCACAAATA ...(((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((((.................)))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))).....))))))) 42339 42417 ATTTTTGTGGAACCCCATAGGCAAAGGTTCCAAAAATCTCATATTAAGAACCTTTGCCTATAGGATTCCACAAAAATTG ((((((((((((.((.((((((((((((((.................)))))))))))))).)).)))))))))))).. Bra-miRN326 42397 42417 TATAGGATTCCACAAAAATTG Bra-miRN326* 42339 42359 ATTTTTGTGGAACCCCATAGG 3 Bra-MIRN327 PmiREN002597 MIRN327 Brassica rapa Bra-A05 22647705 22647862 - TTTATCCGGACGACATCCATGTAAGTCTTCCGGTAGACAACTTACAAGGAAGTCTTCCAGGATTTATTCCGAGATTCTACTCAAACGTTGGTTACTACAAAAGACTTCTGTGTAAGTCGTCTGCCGGAAGACTTACATGTAAGTCATCCGGATAAAAT ((((((((((.(((...(((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((...(((.....)))(((......))).(((....))).......))))))))).))))))).)))))))))))))))))))))...))).)))))))))).. 22647725 22647842 GTAAGTCTTCCGGTAGACAACTTACAAGGAAGTCTTCCAGGATTTATTCCGAGATTCTACTCAAACGTTGGTTACTACAAAAGACTTCTGTGTAAGTCGTCTGCCGGAAGACTTACAT ((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((...(((.....)))(((......))).(((....))).......))))))))).))))))).)))))))))))))))))).. Bra-miRN327 22647822 22647842 GTAAGTCTTCCGGTAGACAAC Bra-miRN327* 22647725 22647745 CGTCTGCCGGAAGACTTACAT 3 Bra-MIRN328 PmiREN002598 MIRN328 Brassica rapa Bra-A05 20269023 20269190 - GTATATGTCGTCTAATGGAATGTCAACTGATGGTGAGAGAGAGGTTCATGATTCTTGATATGGTGAAGTGTCTAAATAGGTCTTTGGACTGAAGATTAACTCTGTAAAGGGAGTTATGAGCCAACCTTACTTATTGTCGGTTGACTTTTTAAATTACTCTAACAAGTT .....................((((((((((((((((.(((.((((((((((((((..(((((.(....((((.....((((....))))..))))...).)))))..))))))))))))))...))).))))))))))))))))....................... 20269043 20269170 TGTCAACTGATGGTGAGAGAGAGGTTCATGATTCTTGATATGGTGAAGTGTCTAAATAGGTCTTTGGACTGAAGATTAACTCTGTAAAGGGAGTTATGAGCCAACCTTACTTATTGTCGGTTGACTTT .((((((((((((((((.(((.((((((((((((((..(((((.(....((((.....((((....))))..))))...).)))))..))))))))))))))...))).))))))))))))))))... Bra-miRN328 20269043 20269064 TTACTTATTGTCGGTTGACTTT Bra-miRN328* 20269150 20269170 TGTCAACTGATGGTGAGAGAG 3 Bra-MIRN329 PmiREN002599 MIRN329 Brassica rapa Bra-A08 10709641 10709835 - TCCTCTTTTTTTTTTTACTATTGTTCTTCAATATGTACTTGAAAAGGAAAATAGGTTCCCTTCCATATATATGCATTCTAAGTCTACCTTATTTCCATTCCTTTGTGCATTTTCTTGGTCACAGTATTTGTGAGACAACTATTTTGTTTTTTCAAGTACATTTTGAAGAAGAATAGTAAAAAAAGAGGATGATAA (((((((((((....(((((((.((((((((.((((((((((((((((((((((........(((.....((((((............................)))))).....)))(((((.....))))).....))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))))))))))))))...... 10709661 10709815 TTGTTCTTCAATATGTACTTGAAAAGGAAAATAGGTTCCCTTCCATATATATGCATTCTAAGTCTACCTTATTTCCATTCCTTTGTGCATTTTCTTGGTCACAGTATTTGTGAGACAACTATTTTGTTTTTTCAAGTACATTTTGAAGAAGAATA ((.((((((((.((((((((((((((((((((((........(((.....((((((............................)))))).....)))(((((.....))))).....))))))).))))))))))))))).)))))))).)).. Bra-miRN329 10709795 10709815 TTGTTCTTCAATATGTACTTG Bra-miRN329* 10709661 10709681 AGTACATTTTGAAGAAGAATA 3 Bra-MIRN330 PmiREN002600 MIRN330 Brassica rapa Bra-A08 8641126 8641240 - ATATTGTGTGCAATGTCAAGGCTACTTGTTTTGAGAGTCAACCACTTTAAAAGATCATGTATTTTGAACCTTTTGACTCACTTGAATAAAAGCCTTCCCTTTACTCAACCAAATG .................((((((..((((((...(((((((....(((((((.........)))))))....)))))))....)))))).))))))................... 8641146 8641220 GCTACTTGTTTTGAGAGTCAACCACTTTAAAAGATCATGTATTTTGAACCTTTTGACTCACTTGAATAAAAGCCT (((..((((((...(((((((....(((((((.........)))))))....)))))))....)))))).))).. Bra-miRN330 8641146 8641167 TGACTCACTTGAATAAAAGCCT Bra-miRN330* 8641200 8641220 GCTACTTGTTTTGAGAGTCAA 3 Bra-MIRN331 PmiREN002601 MIRN331 Brassica rapa Bra-A10 18954607 18954829 + GTAACGACCCCGCTGCTGTGGGCCTCCTACGTCCGTTTACTCAGCCTGTGGGCCTCACTTCGTGAGAGGGTCAGTGTGTTAATTTTCCAAAGGCTCGAAAGTCGTGTTTACTGTATGACTTTCGAGACTTCGGAAAATTAATGCACTGCACCACCCGTCGCCGAAATGGGCCCACGGGCGAGTGAACGGACATGGGAGGCCCATTAGCTGCTGTGGGTGATTG .(((..(((((((.(((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((.((.(((((((..(((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((.......))))))))))))).))).)))))))))))))))))....)))).))).)))).))))))))))))))))))))))))).))))))))))).)))).)).).))))..))) 18954627 18954809 GGCCTCCTACGTCCGTTTACTCAGCCTGTGGGCCTCACTTCGTGAGAGGGTCAGTGTGTTAATTTTCCAAAGGCTCGAAAGTCGTGTTTACTGTATGACTTTCGAGACTTCGGAAAATTAATGCACTGCACCACCCGTCGCCGAAATGGGCCCACGGGCGAGTGAACGGACATGGGAGGCCCA (((((((((.((((((((((((.(((((((((((.((.(((((((..(((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((((.......))))))))))))).))).)))))))))))))))))....)))).))).)))).))))))))))))))))))))))))).))))))))).. Bra-miRN331 18954789 18954809 TGAACGGACATGGGAGGCCCA Bra-miRN331* 18954627 18954647 GGCCTCCTACGTCCGTTTACT 3 Bra-MIRN332 PmiREN002602 MIRN332 Brassica rapa Bra-A08 14912288 14912486 + NNNNNNNNNNNNNNTCTAAGCCATGAAACAGCACGCAATATGGAGTACATGCTTGGCTACCACGCAGTGATAGTGCGTGCGGCTTCATCAGAAGTCCGCTCGATAATCTCCGAAACCGAGTCAAAATCTATCTCGTGGTAGCCAAGCATGTACTCCATATTGCGTGCTGTTTCATGGCTTAGATGGCCACTGCTTGCTG ..............((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((..((.((((((((....)))).)))).)).....(((.......))).......))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...(..(.....)..) 14912308 14912466 CCATGAAACAGCACGCAATATGGAGTACATGCTTGGCTACCACGCAGTGATAGTGCGTGCGGCTTCATCAGAAGTCCGCTCGATAATCTCCGAAACCGAGTCAAAATCTATCTCGTGGTAGCCAAGCATGTACTCCATATTGCGTGCTGTTTCATGGCT ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((..((.((((((((....)))).)))).)).....(((.......))).......))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. Bra-miRN332 14912445 14912466 TATTGCGTGCTGTTTCATGGCT Bra-miRN332* 14912308 14912328 CCATGAAACAGCACGCAATAT 3 Bra-MIRN333a PmiREN002603 MIRN333 Brassica rapa Bra-A02 17575105 17575244 + ATATATTATATATGCGTATATATTTGCGGGCTAAGGACTTTACGGAAACCCAAACCGATGGTTCCTTAATTAAGGAACTTTCGGTTTGGGTTTCCGTAAAATCCTTAGCCCGCAAATATATACGCATATATAATATATAC (((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((((....)))))))).)))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. 17575125 17575224 TATTTGCGGGCTAAGGACTTTACGGAAACCCAAACCGATGGTTCCTTAATTAAGGAACTTTCGGTTTGGGTTTCCGTAAAATCCTTAGCCCGCAAATATA (((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((((....)))))))).)))))))))))))))))))).))))))))))))))))).. Bra-miRN333a 17575125 17575145 TATTTGCGGGCTAAGGACTTT Bra-miRN333a* 17575204 17575224 AATCCTTAGCCCGCAAATATA 3 Bra-MIRN333b PmiREN002604 MIRN333 Brassica rapa Bra-A03 17706882 17707021 + ATGTATATATTATATATACGTATATATTTGCGGGCTAAGGACTTTACGGAAACCCAAACCAAAAGTTCCTTAATTAAGAAACTTTCGGTTTGGGTTTCCGTAAAGTCCTTAGCCCACAAATATATACGCATATATAATAT ......(((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((....))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))) 17706902 17707001 TATTTGCGGGCTAAGGACTTTACGGAAACCCAAACCAAAAGTTCCTTAATTAAGAAACTTTCGGTTTGGGTTTCCGTAAAGTCCTTAGCCCACAAATATA ((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((....))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))) Bra-miRN333b 17706902 17706922 TATTTGCGGGCTAAGGACTTT Bra-miRN333b* 17706981 17707001 AGTCCTTAGCCCACAAATATA 3 Bra-MIRN333c PmiREN002607 MIRN333 Brassica rapa Bra-A09 33534803 33534942 - ATATATTATATATGCGTATATATTTGCGGGCTAAGGACTTTACGGAAACCCAAACCGATAGTTCCTTAATTAAGGAACTTTTGGTTTGGGTTTCCGTAAAGTCCTTAGCCCGCAAATATATACGCATATATAATATATAC ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((....)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. 33534823 33534922 TATTTGCGGGCTAAGGACTTTACGGAAACCCAAACCGATAGTTCCTTAATTAAGGAACTTTTGGTTTGGGTTTCCGTAAAGTCCTTAGCCCGCAAATATA ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((....)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. Bra-miRN333c 33534902 33534922 TATTTGCGGGCTAAGGACTTT Bra-miRN333c* 33534823 33534843 AGTCCTTAGCCCGCAAATATA 3 Bra-MIRN334 PmiREN002606 MIRN334 Brassica rapa Bra-A08 19249112 19249232 + AACTGTTCTAGAGTTTCTCAGAAAAGTTGGAAGGTTGTAAGAAAATTTTTCAAATTAAATTTAATTTGAGATATTTTCTTACAAATCCTCCAACTTTTCTTAGAAACTATCGACCAATAAG ...........(((((((.((((((((((((.((((((((((((((.((((((((((....)))))))))).))))))))))))..)))))))))))))).)))))))............. 19249132 19249212 GAAAAGTTGGAAGGTTGTAAGAAAATTTTTCAAATTAAATTTAATTTGAGATATTTTCTTACAAATCCTCCAACTTTTCTT (((((((((((.((((((((((((((.((((((((((....)))))))))).))))))))))))..))))))))))))).. Bra-miRN334 19249191 19249212 TACAAATCCTCCAACTTTTCTT Bra-miRN334* 19249132 19249152 GAAAAGTTGGAAGGTTGTAAG 3 Bra-MIRN335 PmiREN002608 MIRN335 Brassica rapa Bra-A01 8210196 8210343 + GAGGGCAACCATGTACAAAGCTGAAGCTAACTATGTGAAGTATGGTAATCCCATAATTAGCTTATATTTTGGTATTGGCTAAGACTAGAATCTAATATATGCCTGACTTCACATAATCAGCTCCAGCTATGTACATGGTTCCCATTCT (((((.(((((((((((.(((((.((((...((((((((((..((((.........((((((.((((....)))).)))))).................))))..))))))))))...)))).))))).))))))))))))))..)). 8210216 8210323 CTGAAGCTAACTATGTGAAGTATGGTAATCCCATAATTAGCTTATATTTTGGTATTGGCTAAGACTAGAATCTAATATATGCCTGACTTCACATAATCAGCTCCAGCT (((.((((...((((((((((..((((.........((((((.((((....)))).)))))).................))))..))))))))))...)))).))).. Bra-miRN335 8210216 8210236 CTGAAGCTAACTATGTGAAGT Bra-miRN335* 8210303 8210323 TTCACATAATCAGCTCCAGCT 3 Bra-MIRN336 PmiREN002609 MIRN336 Brassica rapa Bra-A02 17704213 17704442 + ACGACGCATGAGGGAGAGAGGTCGACGGCTAGGGTTTTCGGCCTCCGGGAATTCTCTGCAGAGCTTCGCTTCAGATTTGTGATGAGACAAAAGAAGGGGGCTGCAGCTTCTTTTATAGGATGGAAGGAAGGAACCCTAGGTTTTTGACAAAGGGGCCGTAGAGAAGTCCATTTCTTTATAAAACTTTTTGGGCCAGGAACCGGGCCGTTACAATTCTCCCCCACTTGAAT ........((.(((((((..((.(((((((..((((((.(((((...(((.((((((((..((((((.((((...(((((......))))).))))))))))....((((((((........))))))))(..((((..(((...)))..))))..))))))))).)))....................))))).)))))).)))))))))..))))))).))....... 17704233 17704422 CGACGGCTAGGGTTTTCGGCCTCCGGGAATTCTCTGCAGAGCTTCGCTTCAGATTTGTGATGAGACAAAAGAAGGGGGCTGCAGCTTCTTTTATAGGATGGAAGGAAGGAACCCTAGGTTTTTGACAAAGGGGCCGTAGAGAAGTCCATTTCTTTATAAAACTTTTTGGGCCAGGAACCGGGCCGTTACA .(((((((..((((((.(((((...(((.((((((((..((((((.((((...(((((......))))).))))))))))....((((((((........))))))))(..((((..(((...)))..))))..))))))))).)))....................))))).)))))).))))))))). 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Bra-miRN366 26729011 26729031 TTCGTTCTCTATTTCTCCATG Bra-miRN366* 26728883 26728903 TGAAGGGATAGAGAGTGGAAT 3 Bra-MIRN367 PmiREN002651 MIRN367 Brassica rapa Bra-A02 10545494 10545756 + AGATCATCAACTCCGACAAAATGAAGGTCCATGGCGAATTGCACATCAACGAGAATCAGGTTACAATGCTGGAGCATCGCACACCTCACCATATTTGATGCGGCGTCTTTCTTGAAAGAGCTGGCACAGTAGATGGTGGGAAATGCCGCGACCCTCACGCATCGTAGTTTGATTCTTGGTGACGTGCTATTTCTTGTAGACTTACATCTTGTCGGAGTTTATGATCTCGGCGCGCAAACGAGTTACGGGA (((((((.(((((((((((.(((.(((((.((((.((((.((((.(((.(((((((((((((((.((((..(((..((((.((.((((((((..(((.((((((.(((((....)))))))).))))))...))))))))...))..))))..)))..)))).))))))))))))))).))).)))).)))).)))).))))).))).))))))))))).)))))))((..((........))..))... 10545514 10545736 TCATCAACTCCGACAAAATGAAGGTCCATGGCGAATTGCACATCAACGAGAATCAGGTTACAATGCTGGAGCATCGCACACCTCACCATATTTGATGCGGCGTCTTTCTTGAAAGAGCTGGCACAGTAGATGGTGGGAAATGCCGCGACCCTCACGCATCGTAGTTTGATTCTTGGTGACGTGCTATTTCTTGTAGACTTACATCTTGTCGGAGTTTATGATC ((((.(((((((((((.(((.(((((.((((.((((.((((.(((.(((((((((((((((.((((..(((..((((.((.((((((((..(((.((((((.(((((....)))))))).))))))...))))))))...))..))))..)))..)))).))))))))))))))).))).)))).)))).)))).))))).))).))))))))))).)))).. 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Bra-miRN368c 6788344 6788365 TTGAGGGTTTATTTCACTGGAT Bra-miRN368c* 6788416 6788436 TATGTGAAATAAACCCTCAAC 3 Bra-MIRN368d PmiREN002661 MIRN368 Brassica rapa Bra-A09 4540242 4540374 - AAAAACTCTCAACTAAAAATTTTGTGAAATAAACCCTCAACTTTAGTTCCGTTAACATATGTTACCCTGACATATTTTAATGTTTTATAAGTTGAGGGTTTATTTCACTGGATTTTTAGTTGAGGTTTTTTTT ((((((.(((((((((((((((.((((((((((((((((((((......((((((.((((((((...)))))))).))))))......)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))... 4540262 4540354 TTTGTGAAATAAACCCTCAACTTTAGTTCCGTTAACATATGTTACCCTGACATATTTTAATGTTTTATAAGTTGAGGGTTTATTTCACTGGAT ((.((((((((((((((((((((......((((((.((((((((...)))))))).))))))......)))))))))))))))))))).)).. Bra-miRN368d 4540262 4540283 TTGAGGGTTTATTTCACTGGAT Bra-miRN368d* 4540334 4540354 TTTGTGAAATAAACCCTCAAC 3 Bra-MIRN368e PmiREN002662 MIRN368 Brassica rapa Bra-A10 9885937 9886095 - AAAAACCCTCAACTAAAAATCTTGTGAAATAAACCCTCAACTTTAGTTCCGTTAACATATGTTACCCTCCGTTTAAAAAACCGTGACGGAGGGTGACATATGTTAACGGTTTATAAGTTGAGGGTTTATTTCACTGGATTTTTAGTTGAAGGTTTTTTT (((((((.((((((((((((((.((((((((((((((((((((.....(((((((((((((((((((((((((...........))))))))))))))))))))))))).....)))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))).. 9885957 9886075 CTTGTGAAATAAACCCTCAACTTTAGTTCCGTTAACATATGTTACCCTCCGTTTAAAAAACCGTGACGGAGGGTGACATATGTTAACGGTTTATAAGTTGAGGGTTTATTTCACTGGAT ((.((((((((((((((((((((.....(((((((((((((((((((((((((...........))))))))))))))))))))))))).....)))))))))))))))))))).)).. Bra-miRN368e 9885957 9885978 TTGAGGGTTTATTTCACTGGAT Bra-miRN368e* 9886055 9886075 CTTGTGAAATAAACCCTCAAC 3 Bra-MIRN369 PmiREN002653 MIRN369 Brassica rapa Bra-A04 391904 392032 + TCTTCTTAAGAATCTTTCTGTCATTAGGTTTGGATTTTGGTCATTGTTGGGAAAGGTTCTTGAACAATGAACTAAATCCAACAATGAACGAAATCCAAATCTAATTACAAAAAGATTGGTGGTGTAATC ..........(((((((.(((.(((((((((((((((((.(((((((((((...(((((.........)))))...))))))))))).))))))))))))))))).))).)))))))............ 391924 392012 TCATTAGGTTTGGATTTTGGTCATTGTTGGGAAAGGTTCTTGAACAATGAACTAAATCCAACAATGAACGAAATCCAAATCTAATTACA (.(((((((((((((((((.(((((((((((...(((((.........)))))...))))))))))).))))))))))))))))).).. 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Bra-miRN370 18090805 18090825 ATATGACATGCGTTTTTCGGA Bra-miRN370* 18090655 18090675 CGAAACGAGCAACTTTTATCC 3 Bra-MIRN371 PmiREN002656 MIRN371 Brassica rapa Bra-A05 6347131 6347375 - GATAGAAGAAAATTTTGTTGCAGAGGTGCTCATGTATGGTTTCTCTGTCGATAAGCGAATGAGCATCGTCGGGCATGTTTGAGGAGAAGTCGTAGTAACTTTTTGTGGAAGAACTCTCCGTTATTTGTATTTCTTTTACTGAACTTCTACTAAGCATATCTGCGAGAGTGTTTCTTGAGCCCTTTAAATAGACGGATTCGAAATCGTACTTTGAGAACCATTCGCTCCAGCGTAATAATTGCTGA (((((((.....)))))))((((.(((.((((.(((((((((((((((((((..((......))...)))((((((((((.((.((((((..((((((......(((.((((((.....))).))).))).....)))))).)))))).)))))))).....(((((.....))))).))))........))))))...))))))))))..)))).))).)).))..(((((.......))))). 6347151 6347355 CAGAGGTGCTCATGTATGGTTTCTCTGTCGATAAGCGAATGAGCATCGTCGGGCATGTTTGAGGAGAAGTCGTAGTAACTTTTTGTGGAAGAACTCTCCGTTATTTGTATTTCTTTTACTGAACTTCTACTAAGCATATCTGCGAGAGTGTTTCTTGAGCCCTTTAAATAGACGGATTCGAAATCGTACTTTGAGAACCATTCGC (((.(((.((((.(((((((((((((((((((..((......))...)))((((((((((.((.((((((..((((((......(((.((((((.....))).))).))).....)))))).)))))).)))))))).....(((((.....))))).))))........))))))...))))))))))..)))).))).)).). 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Bra-miRN377b 27941821 27941841 TGGATATGATGAAATGGCATA Bra-miRN377b* 27941752 27941772 TGCCATGTCTTCTGATCCTAT 3 Bra-MIRN378 PmiREN002671 MIRN378 Brassica rapa Bra-A08 6496571 6496739 - TCCTAACAAATAGTATACGATGCAGATCAGATTGTGCCAAATCTAAAAATTACTTAAGCACACACATATGTTAATACCATGGCTGATTATGAATTGACATATGTGTGTTCTTAAGTAATTTTTAGATTTGGCACAATCTGATCTGCATCGTATACTATTTGTTAACGTA ...(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((..((((......)))).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..... 6496591 6496719 TGCAGATCAGATTGTGCCAAATCTAAAAATTACTTAAGCACACACATATGTTAATACCATGGCTGATTATGAATTGACATATGTGTGTTCTTAAGTAATTTTTAGATTTGGCACAATCTGATCTGCATC ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((..((((......)))).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. Bra-miRN378 6496591 6496611 TGGCACAATCTGATCTGCATC Bra-miRN378* 6496699 6496719 TGCAGATCAGATTGTGCCAAA 3 Bra-MIRN379 PmiREN002673 MIRN379 Brassica rapa Bra-A09 1188355 1188577 + CTTCAACGTTAAGCCTTGGCATCTTCTGACTCAACTGCTTGCAAGCACCAAAACTCACAAAGCAAGAAGACATCCAAAGGGATCGCATGGTTTCAAGTTTCGCAGCGTTCTCGAGCAGCGCGGTGTCTCCAAACGGGCAGTCTCTTATCTCTAGCTTCTTTAAACTCTGACATCCCGACAGCAAGTGGTGTAGCATTAGATCACTGTCTCCAGCGAATGCTAT (......)............((((..((.((..(((((((((..((...............))((((((.......(((((((.((.(.((((..((...(((.(((((.......))))).))).))..)))).))).)))))))........))))))....................)))))))))..))))..))))..........(((....))).. 1188375 1188557 ATCTTCTGACTCAACTGCTTGCAAGCACCAAAACTCACAAAGCAAGAAGACATCCAAAGGGATCGCATGGTTTCAAGTTTCGCAGCGTTCTCGAGCAGCGCGGTGTCTCCAAACGGGCAGTCTCTTATCTCTAGCTTCTTTAAACTCTGACATCCCGACAGCAAGTGGTGTAGCATTAGATCA ((((..((.((..(((((((((..((...............))((((((.......(((((((.((.(.((((..((...(((.(((((.......))))).))).))..)))).))).)))))))........))))))....................)))))))))..))))..)))).. Bra-miRN379 1188375 1188395 ATCTTCTGACTCAACTGCTTG Bra-miRN379* 1188537 1188557 AAGTGGTGTAGCATTAGATCA 3 Bra-MIRN380 PmiREN002735 MIRN380 Brassica rapa Bra-Scaffold82087 2269 2390 + GTCATCAAGAGCTTTTGGACCGGAACATCTGACTATTTGACGAGAATTGAATTCACCACCGCATGTCAAGATGCTCCTGGCGTCCTTAGCTCGGATTTTGGCCAACCGCGTGGGTAACACAT ....................(.(((.(((((((((...((((.((((...)))).(((..((((......))))...)))))))..))).))))))))).)..................... 2289 2370 CGGAACATCTGACTATTTGACGAGAATTGAATTCACCACCGCATGTCAAGATGCTCCTGGCGTCCTTAGCTCGGATTTTGGC (.(((.(((((((((...((((.((((...)))).(((..((((......))))...)))))))..))).))))))))).). Bra-miRN380 2349 2370 CGTCCTTAGCTCGGATTTTGGC Bra-miRN380* 2289 2309 CGGAACATCTGACTATTTGAC 3 Bra-MIRN381 PmiREN002736 MIRN381 Brassica rapa Bra-A06 15500376 15500490 + AACAATTGTCTCTGGAAAGATGCTCGATTCGTGCCACACAAGTCATATAAGCCGAGAACCTATCGTGGACTTGAAATCGGTACGAATCAGGTAGAAATCGCAACAGGAAAATCGA ....................((((.((((((((((...((((((........(((.......)))..)))))).....)))))))))).))))...................... 15500396 15500470 TGCTCGATTCGTGCCACACAAGTCATATAAGCCGAGAACCTATCGTGGACTTGAAATCGGTACGAATCAGGTAGA ((((.((((((((((...((((((........(((.......)))..)))))).....)))))))))).)))).. Bra-miRN381 15500450 15500470 AATCGGTACGAATCAGGTAGA Bra-miRN381* 15500396 15500416 TGCTCGATTCGTGCCACACAA 3