miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Bni-MIR156a PmiREN002189 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004492.1 31054673 31054811 + ATATTGAAGGTAAGGGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTAACTAGGGTTTCGTGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTATCTGTCACCCCTTCTCTCTCTCTCTCTTG .....((.((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((((((.......)))))...))))..))))))))))))))))))))))).))))))))).)))))..)).))....... 31054693 31054791 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTAACTAGGGTTTCGTGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTATCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((((((.......)))))...))))..))))))))))))))))))))))).))))))).. Bni-miR156a 31054693 31054712 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156a* 31054771 31054791 GCTTACTCTCTATCTGTCACC 3 Bni-MIR156b PmiREN002190 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004492.1 40980065 40980186 + GAAATGCAACAGAGAAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTCTCCATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACGGCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGACTTCTCGCTTTCT ((((.((....(((((.((((((((((((((.((((((((.((((.(((..((((((....))))))..))).)))).))))))))..))).))))))))))).......))))))))))). 40980085 40980166 TGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTCTCCATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACGGCTCTTTCTGTCAGT (((((((((((.((((((((.((((.(((..((((((....))))))..))).)))).))))))))..))).)))))))).. Bni-miR156b 40980085 40980104 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156b* 40980146 40980166 CTCACGGCTCTTTCTGTCAGT 3 Bni-MIR156c PmiREN002191 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004492.1 41285273 41285397 - TAAGAGAAACGCAAAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGGTTCCGGCACCGATTCTTTTT ...............((..(((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).))))))))..)).......((......)) 41285293 41285377 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGG ((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).))))))).. Bni-miR156c 41285358 41285377 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156c* 41285293 41285313 CTCACTGCTCTATCTGTCAGG 3 Bni-MIR156d PmiREN002192 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004493.1 42524119 42524252 + TGTTGATGATGGGGAAAAAGAAGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGGGAAATTGTATAAAATTAAATTTGTTGTATATGGTTGCTTTTGCGTGCTCACTCTCATTATGTCATAACTTCTCCTTCATGAT ........((.(.(((..(((((((((((...((((((((((((.((((((.((...(((((((((......)).)))))))...)).)))))).))))))))))))....)))))..))))))..))).).)) 42524139 42524232 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGGGAAATTGTATAAAATTAAATTTGTTGTATATGGTTGCTTTTGCGTGCTCACTCTCATTATGTCATA (((((...((((((((((((.((((((.((...(((((((((......)).)))))))...)).)))))).))))))))))))....))))).. Bni-miR156d 42524139 42524158 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156d* 42524212 42524232 GCTCACTCTCATTATGTCATA 3 Bni-MIR156e PmiREN002193 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004493.1 42320240 42320378 - GTATGGAAGGTAAGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTATGTAATTAGGGTTTTATGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCT ....(((.((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((((((......))))....)))))..))))))))))))))))))))))).))))))))).)))))..)).)))...... 42320260 42320358 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTATGTAATTAGGGTTTTATGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((((((......))))....)))))..))))))))))))))))))))))).))))))).. Bni-miR156e 42320339 42320358 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156e* 42320260 42320280 GCTTACTCTCTCTCTGTCACC 3 Bni-MIR156f PmiREN002194 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004495.1 25813478 25813600 - CAAAAGAAAGACATAGCAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGTAATTTGCAGACACTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGACTCTAGTGCTGATCTCTTTG ..........((.(((...(((((((((((((((((((((.(((((((((..(((((...))))).))))))...))).))))))))).))).)))))))))...)))))..(((.....))) 25813498 25813580 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGTAATTTGCAGACACTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGA ((((((((((((((((((((.(((((((((..(((((...))))).))))))...))).))))))))).))).)))))))).. Bni-miR156f 25813561 25813580 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156f* 25813498 25813518 CTCACTGCTCTTTCTGTCAGA 3 Bni-MIR156g PmiREN002195 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004497.1 38013324 38013447 - TTAGAGAAGTACAAAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGGGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGATTCCTGCGCCGATTCTTATC ...............(((.(((((((((((((((((((((.((((((((..(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).)))))))).))).......(((....))) 38013344 38013427 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGGGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGA ((((((((((((((((((((.((((((((..(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).))))))).. Bni-miR156g 38013408 38013427 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156g* 38013344 38013364 CTCACTGCTCTATCTGTCAGA 3 Bni-MIR156h PmiREN002196 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004497.1 6095768 6095895 + AAGTATAATACAAAAAGGAAGGCGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGCTCCCTTTTTTCTAGCATGCTCATGCTCGAAAGCTCTGCGTGCTCACCCTCTTCTTGTCTCCTTCTCTCTTTACATATAT ................((((((.((((((((((.((((((((.((.((((.......(((.(((((....))))).))))))).)).)))))))).)))))).)))).)))))).............. 6095788 6095875 CGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGCTCCCTTTTTTCTAGCATGCTCATGCTCGAAAGCTCTGCGTGCTCACCCTCTTCTTGTCTCC .((((((((((.((((((((.((.((((.......(((.(((((....))))).))))))).)).)))))))).)))))).)))).)) Bni-miR156h 6095788 6095807 CGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156h* 6095855 6095875 GCTCACCCTCTTCTTGTCTCC 3 Bni-MIR156i PmiREN002197 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004497.1 37780968 37781089 + AATGCAACAGAGAAAAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACTTGCAAGCACTGTTATGTGTCCATAACTCTTCGTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGACTTCTCGCTTTCT ..........(((((..(((((((((((((((((((((((.((((......((((((....))))))......)))).))))))).))))).)))))))))))((..(....)..))))))) 37780988 37781069 TGACAGAAGAGAGTGAGCACTTGCAAGCACTGTTATGTGTCCATAACTCTTCGTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGT ((((((((((((((((((((.((((......((((((....))))))......)))).))))))).))))).)))))))).. Bni-miR156i 37780988 37781007 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156i* 37781049 37781069 CTCACCTCTCTTTCTGTCAGT 3 Bni-MIR156j PmiREN002198 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004498.1 27213116 27213256 - CCATCGAAGGTAAGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTAAAATTAGGGTTTTATGCTTGGAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACCCCTTCTCTCTCTCTTTTCTC .....((.((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((...(((((....)))))...)))))..))))))))))))))))))))))).))))))))).)))))..)).))....... 27213136 27213236 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTAAAATTAGGGTTTTATGCTTGGAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((...(((((....)))))...)))))..))))))))))))))))))))))).))))))).. Bni-miR156j 27213217 27213236 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156j* 27213136 27213156 GCTTACTCTCTCTCTGTCACC 3 Bni-MIR156k PmiREN002199 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004498.1 19151309 19151437 - TGAAGAAAGATGAGAAAATGTTGACAGAAGAAAGAGAGCACAAGCCGGGATTAGCAAATAAGAAAGTTTTGCCCTTGTCGGGAGTGTGCTCTCTTTACTTCTGTCACCATCATCATTCTGATGTATGTG ...((((.(((((.....((.(((((((((((((((((((((..((((.(...(((((.........)))))...).))))...)))))))))))).))))))))).))))))).)))).......... 19151329 19151417 TTGACAGAAGAAAGAGAGCACAAGCCGGGATTAGCAAATAAGAAAGTTTTGCCCTTGTCGGGAGTGTGCTCTCTTTACTTCTGTCACCA .(((((((((((((((((((((..((((.(...(((((.........)))))...).))))...)))))))))))).)))))))))... Bni-miR156k 19151397 19151417 TTGACAGAAGAAAGAGAGCAC Bni-miR156k* 19151329 19151349 CTCTCTTTACTTCTGTCACCA 3 Bni-MIR156l PmiREN002200 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004498.1 27712945 27713078 + TATGTTGATGGGGGAAAAGAAGTTGACAGAAGAGAGCGAGCACACAAAGGGAGAATTGTATAAAATCAATTTGTATATAACTACTTTTGCGTGCTCATTCTCCTTCTGTCATAACTTCTCCTTCATGAATCTTG ...(((.((((((((...((((((((((((((((((.((((((.((((((.((...((((((((.....))))))))...)).)))))).)))))).)))).)))))))))..))))))))))))).))).... 27712965 27713058 TTGACAGAAGAGAGCGAGCACACAAAGGGAGAATTGTATAAAATCAATTTGTATATAACTACTTTTGCGTGCTCATTCTCCTTCTGTCATAACT ((((((((((((((.((((((.((((((.((...((((((((.....))))))))...)).)))))).)))))).)))).)))))))))..))) Bni-miR156l 27712965 27712985 TTGACAGAAGAGAGCGAGCAC Bni-miR156l* 27713038 27713058 CATTCTCCTTCTGTCATAACT 3 Bni-MIR156m PmiREN002201 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004498.1 42565212 42565343 + GAGTGACAAGAAATTGATGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGGTTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTATCTATCTGTCACCTTGTTCTTTTCGCTCACATC ((((((.(((((......((((((((((((.((((((((((((((((....(((..(((....((((...)))))))..))))))))))))))))))).))).)))))))))...))))).))))))..... 42565232 42565323 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGGTTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTATCTATCTGTCACC ((((((((((.((((((((((((((((....(((..(((....((((...)))))))..))))))))))))))))))).))).))))))).. Bni-miR156m 42565232 42565251 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156m* 42565303 42565323 GCTCACTATCTATCTGTCACC 3 Bni-MIR156n PmiREN002202 MIR156 Brassica nigra Bni-CM004498.1 42565791 42565922 + GAGTGCTGAGGAATTGATGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATAGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGATCTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCGCCTTCTTTCTCTCTCTCTC (((.(..((((((..(.((((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((....(((.....))))))..))))))))))))))))))))))).)))))))))).)...)))))).).))).. 42565811 42565902 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATAGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGATCTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((....(((..(((....(((.....))))))..))))))))))))))))))))))).))))))).. Bni-miR156n 42565811 42565830 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156n* 42565882 42565902 GCTCACTCTCTATCTGTCACC 3 Bni-MIR156o PmiREN002203 MIR156 Brassica nigra Bni-LFLV01000199.1 647049 647173 + TTAGAGAAACGCAAAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGATTCCGGCTCCGATTCTTTTC ...................(((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).))))))))...........((......)) 647069 647153 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGA ((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).))))))).. Bni-miR156o 647069 647088 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156o* 647133 647153 CTCACTGCTCTATCTGTCAGA 3 Bni-MIR156p PmiREN002204 MIR156 Brassica nigra Bni-LFLV01000199.1 877817 877938 - GGAATTGCAGCAGAGAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTGTCCATAACTTTGCTTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGAGTTCTCGCCTTCA .................(((((((((((((((((((((((.((((((((..((((((....))))))..)))))))).))))))).))))).))))))))))).......(..........) 877837 877918 TGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTGTCCATAACTTTGCTTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGT ((((((((((((((((((((.((((((((..((((((....))))))..)))))))).))))))).))))).)))))))).. Bni-miR156p 877899 877918 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156p* 877837 877857 CTCACCTCTCTTTCTGTCAGT 3 Bni-MIR156q PmiREN002205 MIR156 Brassica nigra Bni-LFLV01001128.1 216438 216565 + GACAAGTGTTGTTGGGACTGAGCTGACAGAAGAGAGAGAGCACAAGTAGAGCGTGGCACCGCCGCCTCTTGCAAGTCCCAAATATAAGAAGCTTCCATCGTTTGTTTAGGTTCATCTTTGAAACTCAC .....(((..(((((((.((((((((((((.((..((.(((((..((((((.(((((...)))))))).)))..))..............)))))..)).))))))..))))))))))...))).))) 216458 216545 TGACAGAAGAGAGAGAGCACAAGTAGAGCGTGGCACCGCCGCCTCTTGCAAGTCCCAAATATAAGAAGCTTCCATCGTTTGTTTAGGT (((((((.((..((.(((((..((((((.(((((...)))))))).)))..))..............)))))..)).))))))..))) 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Bni-miR156r 128260 128279 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bni-miR156r* 128197 128217 CTCACTGCTCTTTCTGTCAGA 3 Bni-MIR157a PmiREN002207 MIR157 Brassica nigra Bni-CM004491.1 25757933 25758129 + TAGGTTTGAGAGTGATGCAGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGATATGCAAGTATATACATATATATATATCATCACACCGCATGTGGAAATAAAAATTCAAGAAAGAGAGGGATAGAGAGAAAAGGAGCCTGCATCTTTACTCTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCAATACCATTATTTATTCCTC ...........(.((((..(((.((((((((((((((((((((((....(((((((((...(((((....))))).))))))))).(((.....)))................((((((((((((..((.(........)))..)))))).))))))))))))))))).))))))))))))))..)))).......) 25757953 25758109 TTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGATATGCAAGTATATACATATATATATATCATCACACCGCATGTGGAAATAAAAATTCAAGAAAGAGAGGGATAGAGAGAAAAGGAGCCTGCATCTTTACTCTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCAATA (((((((((((((((((((((....(((((((((...(((((....))))).))))))))).(((.....)))................((((((((((((..((.(........)))..)))))).))))))))))))))))).)))))))))))) Bni-miR157a 25757953 25757973 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Bni-miR157a* 25758089 25758109 CTCTCTATACTTCTGTCAATA 3 Bni-MIR157b PmiREN002208 MIR157 Brassica nigra Bni-CM004491.1 10351825 10352032 + TAGGTTCGAGAGTGATGCTGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCTAGTACATATATATGTGTCATCACACCCGCCTGTGGACGATAAAAATGTAAAACAAATTCAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAGACAAAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCATTTTGTTCTTCT .............((.((((((.((.(((((((((((((((((((.(((((.(((((((..((...(((((...((((.((.(((......))))).))))...)))))........((......))......................))..)))))))...))))).))))))))))).)))))))))).))))....))...)). 10351845 10352012 TTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCTAGTACATATATATGTGTCATCACACCCGCCTGTGGACGATAAAAATGTAAAACAAATTCAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAGACAAAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCACC (.(((((((((((((((((((.(((((.(((((((..((...(((((...((((.((.(((......))))).))))...)))))........((......))......................))..)))))))...))))).))))))))))).)))))))))). Bni-miR157b 10351845 10351865 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Bni-miR157b* 10351992 10352012 GCTCTCTATACTTCTGTCACC 3 Bni-MIR157c PmiREN002209 MIR157 Brassica nigra Bni-CM004492.1 2259229 2259361 + TTTGAGAGGCATTGATAGTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATACAATCCGGAACAGTTTCTTTGCATCTTACTCCTTTGTGCTCTCTAGCCTTCTGTCATCACTTTGTATTTGCTTAATCTT ...((.(((((.....((((.(((((((((.(((((((((((((.((((((((.(((...((((....))))))).)))))).)).)))))))))))))..))))))))).)))).......)))))..)).. 2259249 2259341 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATACAATCCGGAACAGTTTCTTTGCATCTTACTCCTTTGTGCTCTCTAGCCTTCTGTCATCA .(((((((((.(((((((((((((.((((((((.(((...((((....))))))).)))))).)).)))))))))))))..)))))))))... Bni-miR157c 2259249 2259269 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Bni-miR157c* 2259321 2259341 CTCTCTAGCCTTCTGTCATCA 3 Bni-MIR157d PmiREN002210 MIR157 Brassica nigra Bni-CM004497.1 18831702 18831834 - GTTGGTAGGCGTTGATAGTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATGCAATTTGGAGCAGCTTCTATGCATCCTACTCCTTTGTGCTCTCTAGTCTTCTGTCATCACCCGTTATTTGCCTTAACCC ...((.(((((.((((.(((.(((((((((((((((((((((((.((((.((((((...(((((....))))))))))).)).)).)))))))))))).))))))))))).)))..))))..)))))....)) 18831722 18831814 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATGCAATTTGGAGCAGCTTCTATGCATCCTACTCCTTTGTGCTCTCTAGTCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.((((.((((((...(((((....))))))))))).)).)).)))))))))))).)))))))))))... Bni-miR157d 18831794 18831814 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Bni-miR157d* 18831722 18831742 CTCTCTAGTCTTCTGTCATCA 3 Bni-MIR158 PmiREN002211 MIR158 Brassica nigra Bni-LFLV01001999.1 24147 24252 + AACACGTTATCTCTGTTCTTCTTTGTTTACGTTTCGGAAAAAAAAGGTGATGTTCTGTCACACTTTTTCCAAATGTAGACAAAGCAAAACTGTGATGACGTCAGAG ...((((((((.(.(((...((((((((((((((.(((((((....(((((.....)))))..)))))))))))))))))))))...))).).))))))))..... 24167 24232 CTTTGTTTACGTTTCGGAAAAAAAAGGTGATGTTCTGTCACACTTTTTCCAAATGTAGACAAAGCA ((((((((((((((.(((((((....(((((.....)))))..))))))))))))))))))))).. Bni-miR158 24212 24232 TTTCCAAATGTAGACAAAGCA Bni-miR158* 24167 24187 CTTTGTTTACGTTTCGGAAAA 3 Bni-MIR159a PmiREN002212 MIR159 Brassica nigra Bni-CM004492.1 3703514 3703732 - ACAACAAAAAGGCAGAAGTAGAGCTCCTTAAAGTTCAAACGAGAGTTTAACAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGTCCTAATCCTTATACAGAGAAGAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTTAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTCTTTCAATTTATCT .......(((((.(((.((((((((((((..((((((((.((((((((((.(((((((...((((((.(((((.((((.(..(((((...((.(((((((..........))))))).))...)))))..).)))).))))).))))))...)))))))))))........)))))).))))))))..)))))))))))).)))))))).......... 3703534 3703712 GAGCTCCTTAAAGTTCAAACGAGAGTTTAACAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGTCCTAATCCTTATACAGAGAAGAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTTAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((..((((((((.((((((((((.(((((((...((((((.(((((.((((.(..(((((...((.(((((((..........))))))).))...)))))..).)))).))))).))))))...)))))))))))........)))))).))))))))..))))))))).. Bni-miR159a 3703534 3703554 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Bni-miR159a* 3703692 3703712 GAGCTCCTTAAAGTTCAAACG 3 Bni-MIR159b PmiREN002213 MIR159 Brassica nigra Bni-CM004497.1 24754160 24754245 + CTTTATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTCTTTCCCTTTATCTACAGTAATGAATTCAGTGTTGATTT ...............((..((.(((((.((((((((.............))))))))))))).))....))............... 24754180 24754225 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTCTTTCCCTTTATCTACAGT (.(((((.((((((((.............))))))))))))).).. Bni-miR159b 24754180 24754200 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Bni-miR159b* 24754205 24754225 TTCTTTCCCTTTATCTACAGT 3 Bni-MIR159c PmiREN002719 MIR159 Brassica nigra Bni-CM004497.1 13754904 13755125 + AAAAAAAAAAGATTGAAGTAGAGCTCCTTTAAGTTCAAACGAGAGTTTAGTAGGGTAAAGAAAAGCAGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAATCCTTATAGAGAGAGAAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTTAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTCTTTCACTTAATCC ....................((((((((((.((((((((.((((((..((((((((((...(((((..(((((.((((.(..(((((((((..(((((((.............))))))).)))).)))))..).)))).)))))..)))))...)))))))......)))...)))))).)))))))).))))))))))...................... 13754924 13755105 GAGCTCCTTTAAGTTCAAACGAGAGTTTAGTAGGGTAAAGAAAAGCAGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAATCCTTATAGAGAGAGAAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTTAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA ((((((((((.((((((((.((((((..((((((((((...(((((..(((((.((((.(..(((((((((..(((((((.............))))))).)))).)))))..).)))).)))))..)))))...)))))))......)))...)))))).)))))))).)))))))))).. Bni-miR159c 13755085 13755105 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Bni-miR159c* 13754924 13754944 GAGCTCCTTTAAGTTCAAACG 3 Bni-MIR160a PmiREN002214 MIR160 Brassica nigra Bni-CM004492.1 35053112 35053234 + ATATATTTGATACAAAGTCCTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAAACACCGATCTCATTATGAAATCGAACACTAGTGGCGTACAGAGCAGTCAAGCATGACCACAGCTATTCTTGATAT ................(((.(((.((((((.(((((((((((.(((......((((.(((...))).))))...))).))))))))))).).))))).))).))).................. 35053132 35053214 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAAACACCGATCTCATTATGAAATCGAACACTAGTGGCGTACAGAGCAGTCAAGCATG (((.((((((.(((((((((((.(((......((((.(((...))).))))...))).))))))))))).).))))).))).. Bni-miR160a 35053132 35053152 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Bni-miR160a* 35053194 35053214 CGTACAGAGCAGTCAAGCATG 3 Bni-MIR160b PmiREN002215 MIR160 Brassica nigra Bni-CM004493.1 31124703 31124823 - TGATGTATTATATATGTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGTTCATCGACCATCGGCGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCTCATCATATACAAATTT ........((((((((.((((((.(((((((.(((((((((..(((..((.((.((((...)))).)).))..)))..))))))))).))))))).))))))...))).)))))....... 31124723 31124803 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGTTCATCGACCATCGGCGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.(((((((((..(((..((.((.((((...)))).)).))..)))..))))))))).))))))).))).. Bni-miR160b 31124783 31124803 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Bni-miR160b* 31124723 31124743 GCGTATGAGGAGCCAAGCATA 3 Bni-MIR160c PmiREN002216 MIR160 Brassica nigra Bni-CM004494.1 4368261 4368381 - GTTGTTGTATAAGATGTGTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACTCTAAGCTCATCGACCATTGATGACCTCCGTGAATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTTTCATATACATTTACATA ((...((((((.((...((((((.(((((((.((((((((((.(.(..((.(((((((...))))))).))..).).)))))))))).))))))).))))))..)).))))))...))... 4368281 4368361 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACTCTAAGCTCATCGACCATTGATGACCTCCGTGAATGGCGTATGAGGAGCCATGCATA (((.(((((((.((((((((((.(.(..((.(((((((...))))))).))..).).)))))))))).))))))).))).. Bni-miR160c 4368341 4368361 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Bni-miR160c* 4368281 4368301 GCGTATGAGGAGCCATGCATA 3 Bni-MIR160d PmiREN002217 MIR160 Brassica nigra Bni-CM004495.1 34682718 34682838 + TATGTTGATGTATATTATATATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGCTCATCGACCATCGAGGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTTTCATATACATATTT .......((((((((.....((((((.(((((((.(((((((((..(((..((.((.((((...)))).)).))..)))..))))))))).))))))).))))))....)))))))).... 34682738 34682818 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGCTCATCGACCATCGAGGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.(((((((((..(((..((.((.((((...)))).)).))..)))..))))))))).))))))).))))) Bni-miR160d 34682738 34682758 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Bni-miR160d* 34682798 34682818 GCGTATGAGGAGCCAAGCATA 3 Bni-MIR160e PmiREN002218 MIR160 Brassica nigra Bni-CM004496.1 25960025 25960147 - CATATATTGATTTGCTGTCATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTGGATATCGATTTTGGCTGAAAAATTAGCTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATGACCAGAAGAAGCAGATGATA ..................(((((.(((((((.((((((((((.(((((.....((((((......))))))..))))).)))))))))).))))))).))))).................... 25960045 25960127 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTGGATATCGATTTTGGCTGAAAAATTAGCTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((.(((((.....((((((......))))))..))))).)))))))))).))))))).))).. Bni-miR160e 25960107 25960127 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Bni-miR160e* 25960045 25960065 GCGTACGAGGAGCCAAGCATG 3 Bni-MIR160f PmiREN002219 MIR160 Brassica nigra Bni-CM004498.1 39813237 39813359 - TGTGTGTGCTCTTGTAGTCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAAATACCGATCTCGTTACGAAATCTATGGCTAGTGGCGTACAGAGTAGTCAAGCATGACCAAAGCTTTTCTTGGTAT .......(((.(((..(((((((.((((((.(((((((((((.(((..(((..(((.((.....)).)))))).))).))))))))))).).))))).)))))))))))))............ 39813257 39813339 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAAATACCGATCTCGTTACGAAATCTATGGCTAGTGGCGTACAGAGTAGTCAAGCATG (((.((((((.(((((((((((.(((..(((..(((.((.....)).)))))).))).))))))))))).).))))).))).. Bni-miR160f 39813319 39813339 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Bni-miR160f* 39813257 39813277 CGTACAGAGTAGTCAAGCATG 3 Bni-MIR160g PmiREN002220 MIR160 Brassica nigra Bni-CM004498.1 34711016 34711140 - TGCATACGCACTTGTCTTCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTGGATATTGATTTTTGGTTGAAAAAATCGGCTGCTGGTGGCGTACAAGGAGCCAAGCATGACCTAGAACAGATGGTAATT ....(((.((.((((((((((((.(((((((.((((((((((.(((((...(((((((((......)))))))))))))).)))))))))).))))))).))))))...)).)))).)))))... 34711036 34711120 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTGGATATTGATTTTTGGTTGAAAAAATCGGCTGCTGGTGGCGTACAAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((.(((((...(((((((((......)))))))))))))).)))))))))).))))))).))).. Bni-miR160g 34711100 34711120 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA Bni-miR160g* 34711036 34711056 GCGTACAAGGAGCCAAGCATG 3 Bni-MIR162a PmiREN002221 MIR162 Brassica nigra Bni-CM004492.1 29930785 29931023 - AGATTAAAAGCACGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGGTTGCCTCTTCGTCAGTCAATCACTTTTGAATCCTTATTAGGTTTCTGAGAACTAAGTTATTGTGTAAACGATTTGATACTGAGGGAAAACAGAGTCAAGTCAAGAGTTTTTTTTTTTTTGAAACTCAAAAAAAACAAATGATCTTTGAGTTCATAGGAGCAGAGATACATTGAACACTGTTTCTGGTAATATAGT ..((((..(.((.((((((.(((((....((((((.(((((.(((((.((.......)).))))).))...(((.(((....))).)))...(((((((((((((.(((....((((((((.(((........))).))))))))..(((((((.........))))))).......)))))))).)))..)))))...)))))))))....)))))...)))))).)).)....)))) 29930805 29931003 TCGATAAACCTCTGCATCCAGCGGTTGCCTCTTCGTCAGTCAATCACTTTTGAATCCTTATTAGGTTTCTGAGAACTAAGTTATTGTGTAAACGATTTGATACTGAGGGAAAACAGAGTCAAGTCAAGAGTTTTTTTTTTTTTGAAACTCAAAAAAAACAAATGATCTTTGAGTTCATAGGAGCAGAGATACATTGAAC (((((....((((((.(((((.(((((.((.......)).))))).))...(((.(((....))).)))...(((((((((((((.(((....((((((((.(((........))).))))))))..(((((((.........))))))).......)))))))).)))..)))))...)))))))))....))))).. Bni-miR162a 29930983 29931003 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Bni-miR162a* 29930805 29930825 AGGAGCAGAGATACATTGAAC 3 Bni-MIR162b PmiREN002222 MIR162 Brassica nigra Bni-CM004498.1 28504317 28504430 + AAACAAGAGTGACAGTTGCTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAGAATTTTTAAAAGCATGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGGTACTCTTCGTCAATCAT ....(((((((....((((((((.((((.((((.((((((((.(((.((..............)).))).)))))))).)))).)))).))))))))))))))).......... 28504337 28504410 GGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAGAATTTTTAAAAGCATGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAG (((.((((.((((.((((((((.(((.((..............)).))).)))))))).)))).)))).))).. Bni-miR162b 28504390 28504410 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Bni-miR162b* 28504337 28504357 GGAGGCAGCGGTTCATCGATC 3 Bni-MIR162c PmiREN002223 MIR162 Brassica nigra Bni-CM004498.1 41596031 41596170 - TGATGAAAGTTGAAGTCGCTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCAATTCCTGTGAATATAATGATGTTGTTGGAAACAATTTACATGGAAAGCATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGCTTCTCCTTCCTGATTTT ...........((((.(((((((.((((.((((.(((((((.((((.(((.......((((.((((((...)))))).).))).....))).)))).))))))).)))).)))).))))))))))).............. 41596051 41596150 GGAGGCAGCGGTTCATCGATCAATTCCTGTGAATATAATGATGTTGTTGGAAACAATTTACATGGAAAGCATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAG (((.((((.((((.(((((((.((((.(((.......((((.((((((...)))))).).))).....))).)))).))))))).)))).)))).))).. Bni-miR162c 41596051 41596071 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Bni-miR162c* 41596130 41596150 GGAGGCAGCGGTTCATCGATC 3 Bni-MIR164a PmiREN002224 MIR164 Brassica nigra Bni-CM004491.1 18297134 18297261 + GTAATGGGTGGGTAACACTTGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCGAGCAAAAGAGATCGATCTATATATATATATGTTGATCATATTTTCGCACGTGTTCTACTACTCCAACACGTGTCTCTCTCCCCTC .....(((.(((..((((.((.(((((.((.((((((((((((((.......(((((((.((((....)))).))))))).....)))))))))))))).)).))))).)).))))..))).)))... 18297154 18297241 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCGAGCAAAAGAGATCGATCTATATATATATATGTTGATCATATTTTCGCACGTGTTCTACTACTCCAAC (((((.((.((((((((((((((.......(((((((.((((....)))).))))))).....)))))))))))))).)).))))).) Bni-miR164a 18297154 18297174 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCG Bni-miR164a* 18297221 18297241 CACGTGTTCTACTACTCCAAC 3 Bni-MIR164b PmiREN002225 MIR164 Brassica nigra Bni-CM004492.1 27784115 27784305 - AGAAGGTGTGCTGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATCCCTTAGCCCACATATATACACAGTAACACACTCTCCCCAAATGCATGTATATGAGAGAGATGTGTGTGGAGTGTGATGATACTTGAGTTAGTTCTTCATGTGCCCATCTTCCCCATCATGACCATTTCACTTTGATG ..((((((...((..((.(((((.((((..(((((((((....(((((((((.........((((((((((.............(((((..((.(((....))).)).)))))))))))))))(((((....))))))))))))))....)))))))))..)))).))))).))..))...)))))).... 27784135 27784285 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATCCCTTAGCCCACATATATACACAGTAACACACTCTCCCCAAATGCATGTATATGAGAGAGATGTGTGTGGAGTGTGATGATACTTGAGTTAGTTCTTCATGTGCCCATCTTCCCCATC (((.((((..(((((((((....(((((((((.........((((((((((.............(((((..((.(((....))).)).)))))))))))))))(((((....))))))))))))))....)))))))))..)))).))).. Bni-miR164b 27784265 27784285 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Bni-miR164b* 27784135 27784155 CATGTGCCCATCTTCCCCATC 3 Bni-MIR164c PmiREN002226 MIR164 Brassica nigra Bni-CM004493.1 567800 567919 + CGGGGTGAGAACCTCCATGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAACCAACAATCACGAAATATGTTTCATGAGCTTTTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAACATGAGCTCCTCACCATTGGC ...((((((...(((.(((((((((.((..((((((((((((((.......(((.((((....)))).)))...))))))))))))))..)).))))))))))))...))))))...... 567820 567899 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAACCAACAATCACGAAATATGTTTCATGAGCTTTTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAAC (((((.((..((((((((((((((.......(((.((((....)))).)))...))))))))))))))..)).))))).. Bni-miR164c 567820 567840 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Bni-miR164c* 567879 567899 CACGTGCTCCCCTCCTCCAAC 3 Bni-MIR164d PmiREN002227 MIR164 Brassica nigra Bni-CM004494.1 17653328 17653444 - GCGGGTGAGAACCTCCACGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACGAACACGAAATTTGTTTCATGTAATTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAACATGAGCTCCTCACCATTGAC ...((((((...(((...(((((((.((..(((((((((((((.((..(((((.......)))))..))...)))))))))))))..)).)))))))..)))...))))))...... 17653348 17653424 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACGAACACGAAATTTGTTTCATGTAATTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAAC (((((.((..(((((((((((((.((..(((((.......)))))..))...)))))))))))))..)).))))).. Bni-miR164d 17653404 17653424 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Bni-miR164d* 17653348 17653368 CACGTGCTCCCCTCCTCCAAC 3 Bni-MIR164e PmiREN002228 MIR164 Brassica nigra Bni-CM004496.1 31500591 31500745 - AATGGGTGAGTAACACTTGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCGAATAAATGAGATCGAATCAGTATATGTTTTGGTAATTTACAAAAAAAAAGTATATGTTTTGATAATATTTTCGCACGTGTTCTACTACTCCAACACGTGTATGTCTCCCCCTCA ...(((.(((((((((.((.(((((.((.((((((((((((((..((((..((((((.((((((...(((((........))))).....)))).)).))))))..)))))))))))))))))).)).))))).)).)))).)).)))))).... 31500611 31500725 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCGAATAAATGAGATCGAATCAGTATATGTTTTGGTAATTTACAAAAAAAAAGTATATGTTTTGATAATATTTTCGCACGTGTTCTACTACTCCAAC (((((.((.((((((((((((((..((((..((((((.((((((...(((((........))))).....)))).)).))))))..)))))))))))))))))).)).))))).. Bni-miR164e 31500705 31500725 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCG Bni-miR164e* 31500611 31500631 CACGTGTTCTACTACTCCAAC 3 Bni-MIR164f PmiREN002229 MIR164 Brassica nigra Bni-CM004498.1 42800576 42800697 - AATGGGTGAGTAACACTCGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCGATCAAATGAGATCAATCAGTACATGTTGATCATATATTCGCACGTGTTCTACTACTCCAACACGTGTTTCTCTCCCCTCTC ...(((.(((.(((((..(.(((((.((.(((((((((((((....(((.((((((.((.....)))))))).)))..))))))))))))).)).))))).)..))))).))).)))..... 42800596 42800677 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCGATCAAATGAGATCAATCAGTACATGTTGATCATATATTCGCACGTGTTCTACTACTCCAAC (((((.((.(((((((((((((....(((.((((((.((.....)))))))).)))..))))))))))))).)).))))).. Bni-miR164f 42800657 42800677 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCG Bni-miR164f* 42800596 42800616 CACGTGTTCTACTACTCCAAC 3 Bni-MIR165a PmiREN002230 MIR165 Brassica nigra Bni-CM004494.1 7673322 7673449 + GAAGCGATTTAGGGTTTAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGGAGAGTAATAATTTAACCCAACCCAACACTCTAAATGACTCTCGGACCAGGCTTCATCCCCCTCAACCTATTCATCGCAATT ...(((((...(((((.((.((.(((..((((((.((((((((((..(((((.....................)))))..))))).))))).))))))..))).)).)).)))))....))))).... 7673342 7673429 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGGAGAGTAATAATTTAACCCAACCCAACACTCTAAATGACTCTCGGACCAGGCTTCATCCCCC ((.(((..((((((.((((((((((..(((((.....................)))))..))))).))))).))))))..))).)).. 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Bni-miR165b 9860485 9860505 TCGGACCAGGCTTCATCCCCC Bni-miR165b* 9860386 9860406 GGAATGTTGTCTGGACCGAGG 3 Bni-MIR165c PmiREN002721 MIR165 Brassica nigra Bni-CM004497.1 24005892 24006045 + TGAAGCTATTTCAGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGATCGAGGATATTATATATACACAGATACGTATATATGTTGATACAAGTGATTTTGATCATATATGTATATAGACTATTCTCGGACCAGGCTTCATCCCCCCTAACATGTTATTGCCTCTG ....................((.(((..((((((.(((((((((...((((((((............(((((.(((.((((....))))))))))))))))))))...))))))))).))))))..))).))...................... 24005912 24006025 GGAATGTTGTCTGGATCGAGGATATTATATATACACAGATACGTATATATGTTGATACAAGTGATTTTGATCATATATGTATATAGACTATTCTCGGACCAGGCTTCATCCCCC ((.(((..((((((.(((((((((...((((((((............(((((.(((.((((....))))))))))))))))))))...))))))))).))))))..))).)).. Bni-miR165c 24006005 24006025 TCGGACCAGGCTTCATCCCCC Bni-miR165c* 24005912 24005932 GGAATGTTGTCTGGATCGAGG 3 Bni-MIR166a PmiREN002231 MIR166 Brassica nigra Bni-CM004494.1 11824560 11824730 - AGGGGTTTTCTCATTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGTCTCTATCTATTCAAGTTGGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCAAACCTCTATGTTAGAGATCAGATTAGGGTTTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTGCTCCCTGACT ((((((........(((.((((((((..((((((.((((.(((.(((.((((((((((((..((((((((......)))))))).)))).....(((((...)))))...))).)))))...))).))).)))).))))))..)))))))).))).....)).)))).... 11824580 11824710 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGTCTCTATCTATTCAAGTTGGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCAAACCTCTATGTTAGAGATCAGATTAGGGTTTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((.(((.(((.((((((((((((..((((((((......)))))))).)))).....(((((...)))))...))).)))))...))).))).)))).))))))..)))))).. Bni-miR166a 11824580 11824600 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bni-miR166a* 11824690 11824710 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Bni-MIR166b PmiREN002232 MIR166 Brassica nigra Bni-CM004494.1 11729697 11729861 - AGGGGCTTTCTCTTTTGAGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAAGACTCTAGCTATTCATGTTAGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCATACGTCCGTGTTTGAGATCTGATTAGGGTTTTAGAGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTGCTCCCTGCTT ((((.....))))..((.((((((((..((((((.((((.((((((((..((((..((((((((((.((((((...))))))..((((....))))..))))))))))..)))).)))))))).)))).))))))..)))))))).))................. 11729717 11729841 GGAATGTTGTTTGGCTCGAAGACTCTAGCTATTCATGTTAGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCATACGTCCGTGTTTGAGATCTGATTAGGGTTTTAGAGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((.((((((((..((((..((((((((((.((((((...))))))..((((....))))..))))))))))..)))).)))))))).)))).))))))..)))))).. 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Bni-miR166c 13687726 13687746 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bni-miR166c* 13687833 13687853 GGACTGTTGTCTGGCACGAGG 3 Bni-MIR166d PmiREN002234 MIR166 Brassica nigra Bni-CM004498.1 28335357 28335471 - GGTGCGGTTCAGGGTTGAGAGGACTGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAATGAAAGCTAAACCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACCATTTTATCGCCTTA ((.(((((....(((((.(.(((.((..((((((.((((((((((..((..............))..)))).)))))).))))))..)).))).).))))).....))))))).. 28335377 28335451 GGACTGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAATGAAAGCTAAACCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC (((.((..((((((.((((((((((..((..............))..)))).)))))).))))))..)).))).. Bni-miR166d 28335377 28335397 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bni-miR166d* 28335431 28335451 GGACTGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Bni-MIR166e PmiREN002235 MIR166 Brassica nigra Bni-LFLV01001230.1 420532 420649 - CTCTGAGACAACAGTTCAGGTGGATGATGCCTGGCTCGAGACCATTCCATCTCATGCTCTTGATGATGATGATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCGAACTTGCACGTTTTGCAT ............(((((.((.((((((.((((((.((((.(.((((.(((((((......))).))))..)))).).)))).)))))).)))))).)).))))).............. 420552 420629 TGGATGATGCCTGGCTCGAGACCATTCCATCTCATGCTCTTGATGATGATGATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC .((((((.((((((.((((.(.((((.(((((((......))).))))..)))).).)))).)))))).))))))... Bni-miR166e 420552 420572 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bni-miR166e* 420609 420629 TGGATGATGCCTGGCTCGAGA 3 Bni-MIR166f PmiREN002722 MIR166 Brassica nigra Bni-CM004493.1 197731 197883 + GAGGGATTTATCTTTTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTTATCCTAACTCAATCTCGTTTCATAAAATCTGCTTGATTTGATGATTGATTAGGGTTTTAGTGTCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTACTTCCTCTCA ....................(((.((..((((((.((((((((.((.(((((((.(((((((((..(((...........)))..))).)))))))))))))...)).)))))))).))))))..)).)))...................... 197751 197863 GGACTGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTTATCCTAACTCAATCTCGTTTCATAAAATCTGCTTGATTTGATGATTGATTAGGGTTTTAGTGTCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC (((.((..((((((.((((((((.((.(((((((.(((((((((..(((...........)))..))).)))))))))))))...)).)))))))).))))))..)).))).. Bni-miR166f 197843 197863 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bni-miR166f* 197751 197771 GGACTGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Bni-MIR166g PmiREN002723 MIR166 Brassica nigra Bni-CM004498.1 33286540 33286669 + CTCTGAGCCAAAAGTTCAGGTGGATGATGCTTGGCTCGAGACCATTCAATATGATCATTGGCATGATGATGATGATAATGATGATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACTTACACGTATTACGT .....................((((((.((((((.((((.(.((((((.(((.(((((((......))))))).))).)))..))).).)))).)))))).))))))....................... 33286560 33286649 TGGATGATGCTTGGCTCGAGACCATTCAATATGATCATTGGCATGATGATGATGATAATGATGATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC .((((((.((((((.((((.(.((((((.(((.(((((((......))))))).))).)))..))).).)))).)))))).))))))... Bni-miR166g 33286629 33286649 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bni-miR166g* 33286560 33286580 TGGATGATGCTTGGCTCGAGA 3 Bni-MIR167a PmiREN002236 MIR167 Brassica nigra Bni-CM004491.1 24078566 24078708 - AACGGTGCACAGGTATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTAATTTCTCCGTTGATTTTATGACGATGGAAAAGAGATGAGTGTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCAATTGACTGTCGCACCCTTA ...(((((((((..(..((.(((((((((.((((((((((((((.((...((((.(((((((((((.((....)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).))..)..)))).))))).... 24078586 24078688 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTAATTTCTCCGTTGATTTTATGACGATGGAAAAGAGATGAGTGTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((.((...((((.(((((((((((.((....)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).. Bni-miR167a 24078668 24078688 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bni-miR167a* 24078586 24078606 GATCATGTTCGCAGTTTCACC 3 Bni-MIR167b PmiREN002237 MIR167 Brassica nigra Bni-CM004494.1 29223203 29223334 - CAAATCCACAAGGGAACAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTGAGAGATGAATGTGGAAACATATTGCTTCAACCCAAGCTAGGTCATGTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTGGTCTAGGACTAT ....(((((..(((((..(((((.((((.((((((((((((.(((.(((((((.....((((((....))))))..))))))).))).))))))))).))).)))).)))))..))))).))...))).... 29223223 29223314 TGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTGAGAGATGAATGTGGAAACATATTGCTTCAACCCAAGCTAGGTCATGTCTGACAGCCTCACT (((.((((.((((((((((((.(((.(((((((.....((((((....))))))..))))))).))).))))))))).))).)))).))).. Bni-miR167b 29223294 29223314 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bni-miR167b* 29223223 29223243 GTCATGTCTGACAGCCTCACT 3 Bni-MIR167c PmiREN002238 MIR167 Brassica nigra Bni-CM004495.1 11011005 11011133 + TGTATGGCGCCCAGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTATATTTCTTTCTCCGTTGGCGATGGAAAAGACATGTGTGGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCCGTTGACTGTCGCGCCCT .....(((((.(((.((.(.(.(((((((((.((((((((((((((((((.(((((.((((((...))))))))))).))))...)))))))))))))).))))))))).).).)).)))..))))).. 11011025 11011113 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTATATTTCTTTCTCCGTTGGCGATGGAAAAGACATGTGTGGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((((((.(((((.((((((...))))))))))).))))...)))))))))))))).))))))))).) Bni-miR167c 11011025 11011045 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bni-miR167c* 11011093 11011113 GATCATGTTCGCAGTTTCACC 3 Bni-MIR167d PmiREN002239 MIR167 Brassica nigra Bni-CM004495.1 730645 730824 - TCCCATGCACCAGTAGCAGTTAAGCTGCCAGCATGATCTTGTCTTCCTCTCTTAAGATTCAGCTATAATCAAGCTACGAAAGTATATAATTTTTCTTATTCTTATGAGATTATATGATGATAGCTGAGAGAGAGAGACTAGGTCATGCTGGTAGTTTCACCTGCTATTGACTAGCATGAA ...(((((..(((((((((..((((((((((((((((((.((((..(((((((.....((((((((.((((...(((....))).........((((((....)))))).....)))).))))))))))))))))))).))))))))))))))))))...)))))))))....))))).. 730665 730804 TAAGCTGCCAGCATGATCTTGTCTTCCTCTCTTAAGATTCAGCTATAATCAAGCTACGAAAGTATATAATTTTTCTTATTCTTATGAGATTATATGATGATAGCTGAGAGAGAGAGACTAGGTCATGCTGGTAGTTTCAC .((((((((((((((((((.((((..(((((((.....((((((((.((((...(((....))).........((((((....)))))).....)))).))))))))))))))))))).))))))))))))))))))... Bni-miR167d 730783 730804 TAAGCTGCCAGCATGATCTTGT Bni-miR167d* 730665 730685 AGGTCATGCTGGTAGTTTCAC 3 Bni-MIR167e PmiREN002240 MIR167 Brassica nigra Bni-CM004496.1 24495240 24495364 - AGAGGTGCACCAGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTTAACTTCTCTCTCTATATATATATAGATTTGAACAGGGAAGATCAGATCATGTGGCAGTTTCACCCGTTGATGGCCGCATCAATA ..((((((....))))))..(((((((((((.((((((((...(((((((.((((((....)))))).......)))))))...)))))))))))))))))))...................... 24495260 24495344 TGAAGCTGCCAGCATGATCTTAACTTCTCTCTCTATATATATATAGATTTGAACAGGGAAGATCAGATCATGTGGCAGTTTCACC (((((((((((.((((((((...(((((((.((((((....)))))).......)))))))...))))))))))))))))))).. Bni-miR167e 24495324 24495344 TGAAGCTGCCAGCATGATCTT Bni-miR167e* 24495260 24495280 AGATCATGTGGCAGTTTCACC 3 Bni-MIR167f PmiREN002241 MIR167 Brassica nigra Bni-CM004497.1 31627304 31627440 - TATGGTGCATCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTGTTTCCATGACGATGGAAAAGGGATGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACCCGATGACTGTCGCACCCTTA ...(((((..(((((((.(.(((((((((.((((((((((((((.((.((((((.(((((((((.....))))))))).)))))).))...)))))))))))))).))))))))).).)))).)))..))))).... 31627324 31627420 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTGTTTCCATGACGATGGAAAAGGGATGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((.((.((((((.(((((((((.....))))))))).)))))).))...)))))))))))))).))))))))).. Bni-miR167f 31627400 31627420 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bni-miR167f* 31627324 31627344 GATCATGTTCGTAGTTTCACC 3 Bni-MIR168a PmiREN002242 MIR168 Brassica nigra Bni-CM004492.1 36036181 36036321 + GTCACCGCCGGGGATCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGACTGATTCGCTGACACAGCCACGTGGCTTTTCCCTTATTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCTCCGATGGTGAAAG .((((((.(((((.((.((((((.((((((((((.(((((((((((((((.(((.(((((...((......))....)))))))).)))..))))))).))))).)))))))))).)))))).)).))))).))))))... 36036201 36036301 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGACTGATTCGCTGACACAGCCACGTGGCTTTTCCCTTATTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((((((((((((.(((.(((((...((......))....)))))))).)))..))))))).))))).)))))))))).))).. Bni-miR168a 36036201 36036221 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAC Bni-miR168a* 36036281 36036301 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Bni-MIR168b PmiREN002243 MIR168 Brassica nigra Bni-CM004496.1 25374140 25374280 - GTTTATCGGCGGTCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTGACACCGCCACGTGGATTTTCACGGTTGGCTTGTGAGCAGGGATCGGATCCTGCCTTCCATCAACTGAATCGGAGCCCGAGGTGAAAATA .((((((..(((.(((.((((((.((((((.(((.(((((.((((((.(((.(((..(((((((((....)))))..)))).))).)))...)))))).))))))))..)))))).)))))).))).))).)))))).... 25374160 25374260 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTGACACCGCCACGTGGATTTTCACGGTTGGCTTGTGAGCAGGGATCGGATCCTGCCTTCCATCAACTGAAT (((.((((((.(((.(((((.((((((.(((.(((..(((((((((....)))))..)))).))).)))...)))))).))))))))..)))))).))).. Bni-miR168b 25374240 25374260 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Bni-miR168b* 25374160 25374180 CCTGCCTTCCATCAACTGAAT 3 Bni-MIR168c PmiREN002244 MIR168 Brassica nigra Bni-CM004497.1 32304248 32304388 + AGTCACCGTCGGGCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGGTTGTTTGACACATCCACAAGAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCCTGATGGTGAAAT ..((((((((((((((.((((((.((((((((((.(((((.((((((.((...((((.(((((((.......)))).)))..))))...)).)))))).))))).)))))))))).)))))).)))))).))))))))... 32304268 32304368 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGGTTGTTTGACACATCCACAAGAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((.((((((.((...((((.(((((((.......)))).)))..))))...)).)))))).))))).)))))))))).))).. Bni-miR168c 32304268 32304288 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Bni-miR168c* 32304348 32304368 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Bni-MIR168d PmiREN002245 MIR168 Brassica nigra Bni-CM004498.1 39276012 39276154 - AATCACCGTCGGGTTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGACTGATTGGCTGACACAACCAGAGGTGCTTTTTCCTTAATTTGTCTGTGAGCAGGGATTGGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCTCCAATGGTGAAAT ..(((((((.((((((.((((((.((((((((((.(((((((((((.(((.((((((...((((........))))...))))..)).)))...)))))).))))).)))))))))).)))))).)))).)).)))))))... 39276032 39276134 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGACTGATTGGCTGACACAACCAGAGGTGCTTTTTCCTTAATTTGTCTGTGAGCAGGGATTGGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((((((((.(((.((((((...((((........))))...))))..)).)))...)))))).))))).)))))))))).))).. Bni-miR168d 39276114 39276134 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAC Bni-miR168d* 39276032 39276052 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Bni-MIR168e PmiREN002246 MIR168 Brassica nigra Bni-CM004498.1 34103694 34103834 - ATGTTACGGCGGCTTCTGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTGACACCGCCACGTGGGATTTCATGGTTGGCTTGTGAGCAGGGATCGGATCCCGCCTTGTATCAAGTGAATCCGAGTCCGACGTGAAAGAA ...(((((.(((.(((.(((((((((((((((((.(((((.((((((.(((.(((..(((((((((....)))))..)))).))).)))...)))))).))))).))))))))))))))))).))).))).)))))..... 34103714 34103814 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTGACACCGCCACGTGGGATTTCATGGTTGGCTTGTGAGCAGGGATCGGATCCCGCCTTGTATCAAGTGAAT ((((((((((((((.(((((.((((((.(((.(((..(((((((((....)))))..)))).))).)))...)))))).))))).)))))))))))))).. Bni-miR168e 34103794 34103814 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Bni-miR168e* 34103714 34103734 CCCGCCTTGTATCAAGTGAAT 3 Bni-MIR169a PmiREN002247 MIR169 Brassica nigra Bni-CM004491.1 27198443 27198588 + GAAGTAATAGAGAGTGGAATTGAGCCAAGGATGACTTGCCGGTTTAAAAACAACCGGTTGGTGGCTATTAATTGGTCACATACTCAGTCCGTTGATTTGTGACTGGCAGGTTGACCTTGGCTCTGTTTCGTTCTCTATTTCTCCAT (.((.(((((((((((((((.(((((((((..((((((((((((..(((.((((.((((((((((((.....))))))).....))).)))))).)))..))))))))))))..))))))))).))))))))))))))).)).).. 27198463 27198568 TGAGCCAAGGATGACTTGCCGGTTTAAAAACAACCGGTTGGTGGCTATTAATTGGTCACATACTCAGTCCGTTGATTTGTGACTGGCAGGTTGACCTTGGCTCTGT .(((((((((..((((((((((((..(((.((((.((((((((((((.....))))))).....))).)))))).)))..))))))))))))..)))))))))... 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Bni-miR169i 30984814 30984834 CAGCCAAGGATGACTTGCCGG Bni-miR169i* 30984882 30984902 GCAAGTTGTCCTTCGGCTACA 3 Bni-MIR169j PmiREN002256 MIR169 Brassica nigra Bni-CM004496.1 10039383 10039501 - GGAAAAATAGAAAATGATATTGAGCCAAAGATGACTTGCCGATTTTACCAACGAAACTAAAACTGATATTGGCTACCGGCAAGTCGACTTTGGCTCTGTTTCCTTCTCTTCTTTTCGAT .(((((..(((.((.((.((.(((((((((.((((((((((......((((.................))))....)))))))))).))))))))).)).)).)).)))..)))))... 10039403 10039481 TGAGCCAAAGATGACTTGCCGATTTTACCAACGAAACTAAAACTGATATTGGCTACCGGCAAGTCGACTTTGGCTCTGT .(((((((((.((((((((((......((((.................))))....)))))))))).)))))))))... 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Bni-miR171e 31299792 31299811 TTGAGCCGTGCCAATATCAC Bni-miR171e* 31299731 31299751 GATATTGGTGCGGTTCAATCA 3 Bni-MIR172a PmiREN002265 MIR172 Brassica nigra Bni-CM004492.1 28971524 28971744 - AGGGCTTTGATATGTATATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAACAACCGACGGCTACACAATACGTAAAGCTGCAGAAAAGATACTAAATGGAGTCTGGATCTTCGGTAAGAAACTCAAGAAACTAAATTTCTCTCTTGATTACCTTTATGAATCTTTTTCTGTGTATGAACATGATTTACAGCTTTATTAATGTTATTATATATGTGCATAACCTATAC (((....((.(((((((((((.(((.(((((((.((((.((((........(((((..((.....))..)))))((((((((((.(((((.((((((.(((((((.(((.....))).)))).............))).)))).)))))).).))).)))))))(((....)))))))...)))).))))))).))).)))))))))))))...))).... 28971544 28971724 AGAATCTTGATGATGCTGCATCAACAACCGACGGCTACACAATACGTAAAGCTGCAGAAAAGATACTAAATGGAGTCTGGATCTTCGGTAAGAAACTCAAGAAACTAAATTTCTCTCTTGATTACCTTTATGAATCTTTTTCTGTGTATGAACATGATTTACAGCTTTATTAATGTTATTA (.(((.(((((((.((((.((((........(((((..((.....))..)))))((((((((((.(((((.((((((.(((((((.(((.....))).)))).............))).)))).)))))).).))).)))))))(((....)))))))...)))).))))))).))).).. 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Bni-miR172b 22621783 22621803 GGAATCTTGATGATGCTGCAT Bni-miR172b* 22621866 22621886 GCAGCATCATTAAGATTCACA 3 Bni-MIR172c PmiREN002267 MIR172 Brassica nigra Bni-CM004493.1 2062866 2063012 - AGCCTGTCTTTTTTGGTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATTAAATGGCTTCTTATATGATATAATCTTCAAACGATTAATTTGCCAGAAATCTTGACCAACATATCATTAGATCCGTCAAATATGAAGACCTGTGGTGA .((..((((((....(((((((.((((.(((((((.((....(((((.....((((.((......))..(((((.......)))))....))))......))).))..))))))))))))).).))))))..))))))..))..... 2062886 2062992 AGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATTAAATGGCTTCTTATATGATATAATCTTCAAACGATTAATTTGCCAGAAATCTTGACCAACATATCATTAGATCCGTCA ((.((((.(((((((.((....(((((.....((((.((......))..(((((.......)))))....))))......))).))..))))))))))))).).).. 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Bni-miR172d 38157377 38157397 GGAATCTTGATGATGCTGCAT Bni-miR172d* 38157294 38157314 GCAGCATCATTAAGATTCACA 3 Bni-MIR172e PmiREN002269 MIR172 Brassica nigra Bni-CM004494.1 386452 386590 - CACGGTCGTTGTTTGCTGCTGTGGCATCATCAAGATTCACATCCGATTGATGGACGGCGGTGGTGGTTCACTCTACCCAAAGTTCTCTTCTGAAAATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGTAATCAACGGCTATCCT ...((((((((.((((((.(((((((((((((((((((.((((.((..((.((((...(((((.(.....).)))))....)))))).)).))...)).))))))))))))))))))).)))))).))))))))..... 386472 386570 GTGGCATCATCAAGATTCACATCCGATTGATGGACGGCGGTGGTGGTTCACTCTACCCAAAGTTCTCTTCTGAAAATGGGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.((((.((..((.((((...(((((.(.....).)))))....)))))).)).))...)).)))))))))))))))))).. Bni-miR172e 386472 386492 GGAATCTTGATGATGCTGCAT Bni-miR172e* 386550 386570 GTGGCATCATCAAGATTCACA 3 Bni-MIR172f PmiREN002270 MIR172 Brassica nigra Bni-CM004494.1 31044882 31045012 - GCCAGTCAGTTTTTGCTATTGCATCATCTTCAAGATTCAGAAATCATATTCTTTGATGGATTCTCCTCTGACCCCATCTTCTTTGGTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATTAATGGCTTTCTT ...(((((....(((((.(((((.((((.(((((((((..((((((........(((((..((......))..))))).....))))))..))))))))).)))).))))).)))))....)))))..... 31044902 31044992 GCATCATCTTCAAGATTCAGAAATCATATTCTTTGATGGATTCTCCTCTGACCCCATCTTCTTTGGTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAG (((.((((.(((((((((..((((((........(((((..((......))..))))).....))))))..))))))))).)))).))).. Bni-miR172f 31044902 31044922 AGAATCTTGATGATGCTGCAG Bni-miR172f* 31044972 31044992 GCATCATCTTCAAGATTCAGA 3 Bni-MIR172g PmiREN002271 MIR172 Brassica nigra Bni-CM004498.1 21407632 21407746 + AACAGCCAGTAGTTGCAGATGCAGCATCATTAAGATTCACACGAGATGTGGTTTCCTTGGGCTCGTTTCGACTGGGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCATATACATGGCTACTC ...((((((((..(((.(((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((....))))))))))))..)).))))))))))))))))))))).)))..))).))))).... 21407652 21407726 GCAGCATCATTAAGATTCACACGAGATGTGGTTTCCTTGGGCTCGTTTCGACTGGGAATCTTGATGATGCTGCAT ((((((((((((((((((.(((((((((.(((((....))))))))))))..)).)))))))))))))))))).. 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Bni-miR390d 34434359 34434379 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Bni-miR390d* 34434409 34434429 CGCTGTCCATCCTGAGTTTCA 3 Bni-MIR390e PmiREN002277 MIR390 Brassica nigra Bni-CM004495.1 31772030 31772157 - GTGGTAGAGAAGTAGCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGACCACCATTACTATATTTATATGTGTTTTTGTATATGTAGTGGCGCTATCCATCCTGAGTTCCATGGCTTCTTCTTGCTTATTG ......((((((.((((((..(((((((((.((((((((((............(((((((.((((........)))).))))))))))))))))).)))))))))..)))))).))))))........ 31772050 31772137 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGACCACCATTACTATATTTATATGTGTTTTTGTATATGTAGTGGCGCTATCCATCCTGAGTTCCA .(((((((((.((((((((((............(((((((.((((........)))).))))))))))))))))).)))))))))... Bni-miR390e 31772117 31772137 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Bni-miR390e* 31772050 31772070 CGCTATCCATCCTGAGTTCCA 3 Bni-MIR391a PmiREN002278 MIR391 Brassica nigra Bni-CM004493.1 38576902 38577016 + AACTGCAAACAAAGATTTGCTTCGCAGGAGAGATAGCGCCATCACCTCTTCTAAGAGTTTAAAAGATAGTGATGACGGTATCTCTCCTACGTAGCAATCCTTAGATGTGCATCAA ...((((....(((..(((((.((.((((((((((.((.((((((.((((.(((....))).))))..)))))).)).)))))))))).)).)))))..))).....)))).... 38576922 38576996 TTCGCAGGAGAGATAGCGCCATCACCTCTTCTAAGAGTTTAAAAGATAGTGATGACGGTATCTCTCCTACGTAGC (.((.((((((((((.((.((((((.((((.(((....))).))))..)))))).)).)))))))))).)).).. 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Bni-miR391b 21965211 21965231 TTCGCAGGAGAGATAGCGCCA Bni-miR391b* 21965263 21965283 ACGGTATCTCTCCTACGTAGC 3 Bni-MIR393a PmiREN002280 MIR393 Brassica nigra Bni-CM004493.1 1923129 1923299 - CATAGCAACTAGAGAAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGCTGAATTTATTCCCAATAATTGTTAAATTTTCTCATTATAAAGATAGAAAAAAGTCCCAAAAATCTGCTTAATTTTCAGGATCATGCGATCTCTTTGGCTTCATCCTTTGGTTGCTTCCAT ...(((((((((((...(((.(((((((((((((((.((((((((((((((.((..(((((...)))))........((((((.(((.....)))))))))............)).))))))))...))))))))))))))))))))).)))...)))))))))))..... 1923149 1923279 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGCTGAATTTATTCCCAATAATTGTTAAATTTTCTCATTATAAAGATAGAAAAAAGTCCCAAAAATCTGCTTAATTTTCAGGATCATGCGATCTCTTTGGCTT .(((((((((((((((.((((((((((((((.((..(((((...)))))........((((((.(((.....)))))))))............)).))))))))...)))))))))))))))))))))... 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Bni-miR393b 30974192 30974213 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Bni-miR393b* 30974093 30974113 ATCATGCGATCTCATTGGATT 3 Bni-MIR393c PmiREN002282 MIR393 Brassica nigra Bni-CM004494.1 26159777 26159938 - CGCAGCAACTAGAGAAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAGTCAAGCTGAGTTATTATTTTTACTTTTTCTCGTCGAAAGATGGAAAACAATCCCAAAAATTTGCTTCGTTTTCTGGATCATGCGATCTCTTCGGATTCATCCTTTGGTAGCTTCCAC ...(((.(((((((...((((((.((((((((((((.(((((.((..((((.((((....((((((...(((((.((((....))))))))).......))))))..)))).)))).))))))))))))))))))).))))))...))))))).)))..... 26159797 26159918 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAGTCAAGCTGAGTTATTATTTTTACTTTTTCTCGTCGAAAGATGGAAAACAATCCCAAAAATTTGCTTCGTTTTCTGGATCATGCGATCTCTTCGGATT (((.((((((((((((.(((((.((..((((.((((....((((((...(((((.((((....))))))))).......))))))..)))).)))).))))))))))))))))))).))).. Bni-miR393c 26159898 26159918 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Bni-miR393c* 26159797 26159817 ATCATGCGATCTCTTCGGATT 3 Bni-MIR393d PmiREN002283 MIR393 Brassica nigra Bni-CM004494.1 4016716 4016876 - CACAGCAACTAGAGGAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGGTGAATTATCCCTATTATTTTCTTGGTTATTGGCAAAAGAAGTACCAGAAAAAATATTGGTTAATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGAATTCATCCTTCGGTAGCTTCCCT ...(((.(((.(((((.((((.(((((((((.((((.(((((..........((((((.((.((((.((((((.(((..((........))..)))))))))))))..)).)))))).))))))))).))))))))).)))).))))).))).)))..... 4016736 4016856 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGGTGAATTATCCCTATTATTTTCTTGGTTATTGGCAAAAGAAGTACCAGAAAAAATATTGGTTAATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGAATT (.(((((((((.((((.(((((..........((((((.((.((((.((((((.(((..((........))..)))))))))))))..)).)))))).))))))))).))))))))).).. Bni-miR393d 4016835 4016856 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Bni-miR393d* 4016736 4016756 ATCATGCTATCCCTTTGAATT 3 Bni-MIR393e PmiREN002284 MIR393 Brassica nigra Bni-CM004495.1 35042030 35042186 + TTCATAGCAACTAGAGGAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGTAAGGTGAATTATCACAATGATTTTCTTAATTATTGGCAAAAGAAATCCCAAAAATTTGCTTGGTTTTGGATCATGCTATCCCTTTCGATTCATCCTTCGGTAGCTTCC .....(((.(((.(((((.(((((.((((((((.((((.(((((.(((..(((((((((....((((((((.....)))))))).................)))))))))..))).))))))))).)))))))).))))).))))).))).)))... 35042050 35042166 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGTAAGGTGAATTATCACAATGATTTTCTTAATTATTGGCAAAAGAAATCCCAAAAATTTGCTTGGTTTTGGATCATGCTATCCCTTTCGATT ((.((((((((.((((.(((((.(((..(((((((((....((((((((.....)))))))).................)))))))))..))).))))))))).)))))))).)))) Bni-miR393e 35042050 35042071 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Bni-miR393e* 35042146 35042166 ATCATGCTATCCCTTTCGATT 3 Bni-MIR394a PmiREN002285 MIR394 Brassica nigra Bni-CM004497.1 29329314 29329442 - AAGAGTTTCTTACAGATTTCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCTTCTATGTACATAAATGTATGTAAATGTGCTGTGTGTGAAAGAAGGAGGTGGTCATACTGCCAGTAGACATGTGTTAGGGTTACTTAG ...........(((.((.(((((((((...((.((((((((((((...((((((...((((......))))..))))))..)))))))))))).))...)))))).))).)).)))............. 29329334 29329422 TTTGGCATTCTGTCCACCTCCTTCTATGTACATAAATGTATGTAAATGTGCTGTGTGTGAAAGAAGGAGGTGGTCATACTGCCAGTAGA (((((((...((.((((((((((((...((((((...((((......))))..))))))..)))))))))))).))...)))))).).. Bni-miR394a 29329402 29329422 TTTGGCATTCTGTCCACCTCC Bni-miR394a* 29329334 29329354 GGTGGTCATACTGCCAGTAGA 3 Bni-MIR394b PmiREN002286 MIR394 Brassica nigra Bni-CM004497.1 28298129 28298258 - AAGAGTTTCTTACAGATTTCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCTTCTATGTATCAAAAGTGTATGTCTATGCGTGGTGTGTGAAAAAGGGAGGTGGGCATACTGCCAATAGATATCTGTTAGGGTTTCTTCG (((((.((((.((((((.(((((((((...(((((((((((((((((((((((........))...))))))))..........)))))))))))))...)))))).))).)))))).)))).))))).. 28298149 28298238 TTTGGCATTCTGTCCACCTCCTTCTATGTATCAAAAGTGTATGTCTATGCGTGGTGTGTGAAAAAGGGAGGTGGGCATACTGCCAATAGA (((((((...(((((((((((((((((((((((........))...))))))))..........)))))))))))))...)))))).).. 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Bni-miR394c 11679766 11679786 TTTGGCATTCTGTCCACCTCC Bni-miR394c* 11679694 11679714 GGTGGGCATACTGCCAATAGA 3 Bni-MIR394d PmiREN002288 MIR394 Brassica nigra Bni-LFLV01002130.1 130123 130252 + AAAAGAGTTTCTTACAGAGATCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCCCTTTCTATATATATGTTTATTATCTTCGTCGTGTTTTGTGAGGGGGAGGTGGGCATACTGCCAACAGAGATCTGTTAGGGTTTCTT .............(((((..(((((((((...((((((((((((((((......(((((..............))))).....))))))))))))))))...)))))).)))..)))))........... 130143 130232 TTTGGCATTCTGTCCACCTCCCCTTTCTATATATATGTTTATTATCTTCGTCGTGTTTTGTGAGGGGGAGGTGGGCATACTGCCAACAGA (((((((...((((((((((((((((......(((((..............))))).....))))))))))))))))...)))))).))) Bni-miR394d 130143 130163 TTTGGCATTCTGTCCACCTCC Bni-miR394d* 130212 130232 GGTGGGCATACTGCCAACAGA 3 Bni-MIR395a PmiREN002289 MIR395 Brassica nigra Bni-CM004492.1 9030334 9030451 + TTGGTCGGATGTTTCCTAGAGTTCCTCTGAGCACTTCATTGGATATAACATTTTCTATCAAAACGAAATGTATTCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGACTCATTCGATACTTT ....(((((((..(((..((((((((((((((((((((.((((....(((((((..........)))))))..)))).))))))))))))))))))))..)))..)))))))...... 9030354 9030431 GTTCCTCTGAGCACTTCATTGGATATAACATTTTCTATCAAAACGAAATGTATTCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC ((((((((((((((((((.((((....(((((((..........)))))))..)))).)))))))))))))))))).. Bni-miR395a 9030411 9030431 CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC Bni-miR395a* 9030354 9030374 GTTCCTCTGAGCACTTCATTG 3 Bni-MIR395b PmiREN002290 MIR395 Brassica nigra Bni-CM004492.1 9043257 9043444 + TTTGCTATCAAAATGTATTCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGACTCATCCGGTATTTTCTGTTAGGTGGCTCAGTTTGGTTTAGACTAAATCCGATCCACGGCATAAACAAGCAGAATCACGGCTTTAGGTTGCAGGTTTTTGTTTTGTCAAGCTAATTTTTCGGGAAACATTTTTGAATATA .........(((((((.((((...(((((((((((.(((((.((((((((...(((.....(((((((..((((.((.(((((((....)))))))..)).))))..........)))))))...))).....)))).)))).....))))).))))))..)))))...)))))))))))........ 9043277 9043424 CTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGACTCATCCGGTATTTTCTGTTAGGTGGCTCAGTTTGGTTTAGACTAAATCCGATCCACGGCATAAACAAGCAGAATCACGGCTTTAGGTTGCAGGTTTTTGTTTTGTCAAGCTAATTTTTCGG ..(((((((((((.(((((.((((((((...(((.....(((((((..((((.((.(((((((....)))))))..)).))))..........)))))))...))).....)))).)))).....))))).))))))..)))))...) 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Bni-miR395f 16484475 16484495 CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC Bni-miR395f* 16484410 16484430 GTTTTTCCAACGATTCAGGTG 3 Bni-MIR395g PmiREN002295 MIR395 Brassica nigra Bni-CM004497.1 16479704 16479837 - ACAGTCAAATGTCCTCTTGAGTTCCCTTTAACGCTTCATTGTTTGTTCATACTTGGTTGTCTAATACCCACCGATATATCAATCTAATGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTCTAGGTGGCATATTGGCGCCG ..................((((((((((.(((((((((.((((((((.....(((((((((...........)))).)))))...)))))))).))))))))).)))))))))).................... 16479724 16479817 GTTCCCTTTAACGCTTCATTGTTTGTTCATACTTGGTTGTCTAATACCCACCGATATATCAATCTAATGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTC ((((((((.(((((((((.((((((((.....(((((((((...........)))).)))))...)))))))).))))))))).)))))))).. 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Bni-miR395k 16480853 16480873 CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC Bni-miR395k* 16480796 16480816 GTTCCTCTGAGCACTTCATTG 3 Bni-MIR396a PmiREN002299 MIR396 Brassica nigra Bni-CM004494.1 16581054 16581228 - ACATGACTCTCTCTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACCTTCTTCAGATTAGTTTTTTTTTCCTCGTATATCTACTGTCATAGCAGATATGCGTTAATTTAAATTGCATCTGTTCGATTGATTTGCGGTTCAATTAAGCTGTGGGAAGATACAGACAAAGTCAAAGAT ...(((((...((((((((.(((((((((((..((((((((((((..((..(((((((((((.........(((((((((.(((...))).))))))))).......)))))).)))))...))..)..)))))))))))..))))))))))).))))))))...)))))..... 16581074 16581208 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAACCTTCTTCAGATTAGTTTTTTTTTCCTCGTATATCTACTGTCATAGCAGATATGCGTTAATTTAAATTGCATCTGTTCGATTGATTTGCGGTTCAATTAAGCTGTGGGAAG (((((((((((..((((((((((((..((..(((((((((((.........(((((((((.(((...))).))))))))).......)))))).)))))...))..)..)))))))))))..))))))))))).. Bni-miR396a 16581188 16581208 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Bni-miR396a* 16581074 16581094 GTTCAATTAAGCTGTGGGAAG 3 Bni-MIR396b PmiREN002300 MIR396 Brassica nigra Bni-LFLV01002366.1 196939 197106 + AACATGAAGATCCTGGTTATATTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTTTCATTTCCCTTCTTTTAAAGATGTAATAACTAATTTTTTTTTTAACATTTAACACTCTAGAACACAAAAAAAAAAAAAAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGACAATTCAGGG ..........((((((((((.((((((((((((((((((((.((((.(((((..(((...((((.....((((((....................))))))........))))....)))..))))).)))).)))))))))))))))))))).)))))....))))) 196959 197086 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTTTCATTTCCCTTCTTTTAAAGATGTAATAACTAATTTTTTTTTTAACATTTAACACTCTAGAACACAAAAAAAAAAAAAAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA (((((((((((((((((.((((.(((((..(((...((((.....((((((....................))))))........))))....)))..))))).)))).))))))))))))))))))) Bni-miR396b 196959 196979 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Bni-miR396b* 197066 197086 GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA 3 Bni-MIR397 PmiREN002301 MIR397 Brassica nigra Bni-CM004493.1 21584319 21584446 - TAACTGGGATTGGATGAACATCATTGAGTGCAGCGTTGATGTATCTTCCTTTTTCTTCAATTGTTGAATGGGAAAAAACAATTTACACCAGCGTTGCGCTCAATCATGTTTTTCTAATTATCAGGAAC ...(((((((((((.((((((.((((((((((((((((.((((..((..(((((((((((...))))...)))))))..))..)))).)))))))))))))))).)))))).))))))).)))).... 21584339 21584426 TCATTGAGTGCAGCGTTGATGTATCTTCCTTTTTCTTCAATTGTTGAATGGGAAAAAACAATTTACACCAGCGTTGCGCTCAATCATG (.((((((((((((((((.((((..((..(((((((((((...))))...)))))))..))..)))).)))))))))))))))).).. Bni-miR397 21584406 21584426 TCATTGAGTGCAGCGTTGATG Bni-miR397* 21584339 21584359 CCAGCGTTGCGCTCAATCATG 3 Bni-MIR398 PmiREN002302 MIR398 Brassica nigra Bni-CM004498.1 26404741 26404875 - AAAGGTAGAGGATCTCGACAGGGTCGATATGAGAACACATGTGCAGTCAACGGCTGTAATGACACCACGTCATTATTGCATATCCGTCTTTTCATGTGTTCTCAGGTCACCCCTGCTGAGCTCTTTCTCTACCCT ...(((((((((.((((.(((((..(((.((((((((((((...((.(....((.((((((((.....)))))))).))......).))...)))))))))))).)))..))))).))))....))))))))).. 26404761 26404855 GGGTCGATATGAGAACACATGTGCAGTCAACGGCTGTAATGACACCACGTCATTATTGCATATCCGTCTTTTCATGTGTTCTCAGGTCACCCCTG (((..(((.((((((((((((...((.(....((.((((((((.....)))))))).))......).))...)))))))))))).)))..))).. Bni-miR398 26404761 26404781 TGTGTTCTCAGGTCACCCCTG Bni-miR398* 26404835 26404855 GGGTCGATATGAGAACACATG 3 Bni-MIR400a PmiREN002303 MIR400 Brassica nigra Bni-CM004494.1 12887036 12887155 + GAAGTTGCTGAATATTGTTTTATGAGAGTATTATAAGTCACTAGGTTTGGTAATCAACTCTTGCTTTTCCAAACGAAGTGACTTATAAAACTCTCATGGATTGATTTTTCAACTCTTGAA ((.((((..(((.((((.(((((((((((.((((((((((((..((((((....(((...))).....))))))..)))))))))))).))))))))))).)))).)))))))))..... 12887056 12887135 TATGAGAGTATTATAAGTCACTAGGTTTGGTAATCAACTCTTGCTTTTCCAAACGAAGTGACTTATAAAACTCTCATGGA (((((((((.((((((((((((..((((((....(((...))).....))))))..)))))))))))).))))))))).. Bni-miR400a 12887056 12887076 TATGAGAGTATTATAAGTCAC Bni-miR400a* 12887115 12887135 GACTTATAAAACTCTCATGGA 3 Bni-MIR400b PmiREN002304 MIR400 Brassica nigra Bni-CM004497.1 22964198 22964318 + CTACTCTCTCTCTCTCTTGTTTTATGAGAGTATTATAAGTCACTACGTTTGGTAATCAACTGTTGCTTTCCGAAACGAAGTGACTTATAATAAATCTCATGAATGGATCTTGCGAGAGAGT .....................((((((((.((((((((((((((.(((((((.((.(((...))).)).)).))))).))))))))))))))..))))))))................... 22964218 22964298 TATGAGAGTATTATAAGTCACTACGTTTGGTAATCAACTGTTGCTTTCCGAAACGAAGTGACTTATAATAAATCTCATGAA (((((((.((((((((((((((.(((((((.((.(((...))).)).)).))))).))))))))))))))..)))))))). Bni-miR400b 22964218 22964238 TATGAGAGTATTATAAGTCAC Bni-miR400b* 22964278 22964298 ACTTATAATAAATCTCATGAA 3 Bni-MIR400c PmiREN002305 MIR400 Brassica nigra Bni-LFLV01001323.1 134109 134229 + GAAGTTGCTGAATATTGTTTTATGAGAGTATTATAAGTCACTGCATTTGGTAATCAAGATGTTGCTTTCCCAAACGAAGTGACTTATAATGACCTCATGAATCGATGTTTGCAAAGTCTTA .........((((((((.((((((((..((((((((((((((.(.(((((.((.(((....)))..)).))))).).))))))))))))))..)))))))).))))))))........... 134129 134209 TATGAGAGTATTATAAGTCACTGCATTTGGTAATCAAGATGTTGCTTTCCCAAACGAAGTGACTTATAATGACCTCATGAA ((((((..((((((((((((((.(.(((((.((.(((....)))..)).))))).).))))))))))))))..)))))).. Bni-miR400c 134129 134149 TATGAGAGTATTATAAGTCAC Bni-miR400c* 134189 134209 GACTTATAATGACCTCATGAA 3 Bni-MIR403 PmiREN002306 MIR403 Brassica nigra Bni-CM004494.1 17770937 17771055 - AGAAGAAGAGTCATATTACATGTTTTGTGCGTGAATCTAATTCATAAGCTCATGTAGTAATCCTAACATGTTGTTGGATTAGATTCACGCACAAACTCGTAATCTGTCTTTTCAAATAT ....((((((.((.(((((..((((.((((((((((((((((((..(((..((((((.....)).)))))))..))))))))))))))))))))))..))))).)).))))))...... 17770957 17771035 TGTTTTGTGCGTGAATCTAATTCATAAGCTCATGTAGTAATCCTAACATGTTGTTGGATTAGATTCACGCACAAACTCG .((((.((((((((((((((((((..(((..((((((.....)).)))))))..))))))))))))))))))))))... Bni-miR403 17770957 17770977 TTAGATTCACGCACAAACTCG Bni-miR403* 17771015 17771035 TGTTTTGTGCGTGAATCTAAT 3 Bni-MIR408 PmiREN002307 MIR408 Brassica nigra Bni-CM004494.1 17876028 17876158 - AAAGTGGTAAACAGAGAGAGACGGGGAACAAGCAGAGCATGGATTGAGTATTTACCAAAACATCAGATGACTATGTTTGGTCTCTTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCCCTCTTTCTCTCCCTTCTC .(((.((.....((((.(((.(((((((...((((.((((((...(((.....((((((.(((.((....))))))))))))))...)))))).))))...))))))).))).))))......)))))... 17876048 17876138 ACGGGGAACAAGCAGAGCATGGATTGAGTATTTACCAAAACATCAGATGACTATGTTTGGTCTCTTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT .(((((((...((((.((((((...(((.....((((((.(((.((....))))))))))))))...)))))).))))...)))))))... Bni-miR408 17876048 17876068 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT Bni-miR408* 17876118 17876138 ACGGGGAACAAGCAGAGCATG 3 Bni-MIR827 PmiREN002314 MIR827 Brassica nigra Bni-CM004495.1 38545621 38545736 - TTTTGCAACCCTTGAATGTGTTTGTTGATTGACATCTATGCATATTGATCATCCTCGTTTTGATGATCGATTCGTTTAGATGACCATCAACAAATACTTTCATGGTTTTGCATCGC ...(((((.((.((((.((((((((((((.(.((((((.((..((((((((((........))))))))))..)).)))))).).)))))))))))).)))).))..))))).... 38545641 38545716 TTTGTTGATTGACATCTATGCATATTGATCATCCTCGTTTTGATGATCGATTCGTTTAGATGACCATCAACAAATA (((((((((.(.((((((.((..((((((((((........))))))))))..)).)))))).).))))))))).. Bni-miR827 38545641 38545661 TTAGATGACCATCAACAAATA Bni-miR827* 38545696 38545716 TTTGTTGATTGACATCTATGC 3 Bni-MIR5654a PmiREN002308 MIR5654 Brassica nigra Bni-CM004497.1 22964419 22964535 - TTACAAGAGGAGACTACAAAATAAATCCCAAGCATCATCCATTTTACAAGCCTTCGTGTTCAAAACTAATAAGGTGGATGATGCTTGGGATTTATCTTGTTATTACCTTTACAAAAG ...............((((.((((((((((((((((((((((((((..((...............))..)))))))))))))))))))))))))).))))................. 22964439 22964515 ATAAATCCCAAGCATCATCCATTTTACAAGCCTTCGTGTTCAAAACTAATAAGGTGGATGATGCTTGGGATTTATCT ((((((((((((((((((((((((((..((...............))..)))))))))))))))))))))))))).. Bni-miR5654a 22964495 22964515 ATAAATCCCAAGCATCATCCA Bni-miR5654a* 22964439 22964459 GATGATGCTTGGGATTTATCT 3 Bni-MIR5654b PmiREN002309 MIR5654 Brassica nigra Bni-LFLV01001323.1 134323 134442 + TTGACTGGGTAAAAGGCGAGATAAATCCCAAGCATCATCCACCTTATCAGCTTTGACATGAATAAAAGCGTATAAAATGGATGATGTTTGGGATTTATCTGTCTGTAGTCTTCTTGTCCA .............((((.(((((((((((((((((((((((..((((..(((((..........)))))..))))..)))))))))))))))))))))))))))................ 134343 134422 ATAAATCCCAAGCATCATCCACCTTATCAGCTTTGACATGAATAAAAGCGTATAAAATGGATGATGTTTGGGATTTATCT (((((((((((((((((((((..((((..(((((..........)))))..))))..))))))))))))))))))))).. Bni-miR5654b 134343 134363 ATAAATCCCAAGCATCATCCA Bni-miR5654b* 134402 134422 GATGATGTTTGGGATTTATCT 3 Bni-MIR5718 PmiREN002310 MIR5718 Brassica nigra Bni-CM004496.1 18789036 18789270 + ATTTATGTTTTGTTGATCTTGTTCTGGGTTTGGTTTTGAACAGCTTAGTGTTGCTCTGTAATGGATGCATAACCAGTAGATATGTCAGGAGATTAGAAGGAACCGTTATTTCTGCCTCGGTGATAGCTATGTTCCTTCAAATCTTCTGACATGTCTACTGCTTATGCCACCATTACAGAACAGCACGAAGCTGTTCAGAACCAAACCCAGAACAAGAACAACGGAAACAACTAGC .....((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((((((..((((((.(((((((((((((((((((((.((((((((.((((((.(((...))).))))))...)))))))).))))))))))))))))))))).))))))..)))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))...... 18789056 18789250 GTTCTGGGTTTGGTTTTGAACAGCTTAGTGTTGCTCTGTAATGGATGCATAACCAGTAGATATGTCAGGAGATTAGAAGGAACCGTTATTTCTGCCTCGGTGATAGCTATGTTCCTTCAAATCTTCTGACATGTCTACTGCTTATGCCACCATTACAGAACAGCACGAAGCTGTTCAGAACCAAACCCAGAACAA ((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((((((..((((((.(((((((((((((((((((((.((((((((.((((((.(((...))).))))))...)))))))).))))))))))))))))))))).))))))..)))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))).. Bni-miR5718 18789230 18789250 TCAGAACCAAACCCAGAACAA Bni-miR5718* 18789056 18789076 GTTCTGGGTTTGGTTTTGAAC 3 Bni-MIR6028 PmiREN002311 MIR6028 Brassica nigra Bni-CM004497.1 22435152 22435295 - GACAAGCACGGTTGGGATGATGGAGAGTAAAGACATTCAGATCTGCAAATCCTATTGCCCTTTTACACTTAAAAAAATGGATAGTGCGTATAAGTTTGTTGACCTGAATGTCTTTCTCTTCATCAAAACAGCCTCTTGTACTTG ((((((...(((((...((((((((((.((((((((((((.((.((((((.....(((.((....((.((....)).))...)).))).....)))))).)).))))))))))))))))))))))...))))).))))).)... 22435172 22435275 TGGAGAGTAAAGACATTCAGATCTGCAAATCCTATTGCCCTTTTACACTTAAAAAAATGGATAGTGCGTATAAGTTTGTTGACCTGAATGTCTTTCTCTTCATC (((((((.((((((((((((.((.((((((.....(((.((....((.((....)).))...)).))).....)))))).)).))))))))))))))))))).. Bni-miR6028 22435254 22435275 TGGAGAGTAAAGACATTCAGAT Bni-miR6028* 22435172 22435192 CTGAATGTCTTTCTCTTCATC 3 Bni-MIR6030a PmiREN002312 MIR6030 Brassica nigra Bni-CM004493.1 16965731 16965914 - GATGGTTTCAAGGATTAAGTGTCTGTATGTATGGGCTGAGCAGGCACAATCGCATCTTTTACTCTGATGATCAAAAGTACAGATGATGGATTTGAGATCTGGTCGAGTCTTTTGAAAAATGTGAATTGAGGATTTTACCTTCTCCACCCATACCATACAGACCCTAAATCCTGAATCCAAAGCT ..(((.((((.(((((.((.(((((((((((((((..(((.((((.(((((((((.((((((((.(((((((..((((.((.....)).))))..))))..))))))).....)))).))))).))))..)......))).)))..)))))).))))))))).)).))))))))).)))..... 16965751 16965894 GTCTGTATGTATGGGCTGAGCAGGCACAATCGCATCTTTTACTCTGATGATCAAAAGTACAGATGATGGATTTGAGATCTGGTCGAGTCTTTTGAAAAATGTGAATTGAGGATTTTACCTTCTCCACCCATACCATACAGACCC (((((((((((((((..(((.((((.(((((((((.((((((((.(((((((..((((.((.....)).))))..))))..))))))).....)))).))))).))))..)......))).)))..)))))).))))))))).. Bni-miR6030a 16965751 16965772 TCCACCCATACCATACAGACCC Bni-miR6030a* 16965874 16965894 GTCTGTATGTATGGGCTGAGC 3 Bni-MIR6030b PmiREN002313 MIR6030 Brassica nigra Bni-CM004493.1 16943626 16943796 - GATGGTTTCAGGGATTAAGTGTCTGTATGTATGGGTTGAGTAGGCACAATCACATCTTTTACTCTGATGGTCAAAAGTACAGATGATGGATTTTGTGATCTGGTTGCTGCTTTTGAGGATTTTGCCTTCTCCACCCATACCGTACAGACCCTTAATCCTGAATCCAAAGCT ..(((.((((((.((((((.((((((((((((((((.(((.(((((.((((.((((.........)))).((((((((((((((.(((.....))).))))).....))))))))).)))).))))).))).))))))).))))))))).)))))))))))).)))..... 16943646 16943776 GTCTGTATGTATGGGTTGAGTAGGCACAATCACATCTTTTACTCTGATGGTCAAAAGTACAGATGATGGATTTTGTGATCTGGTTGCTGCTTTTGAGGATTTTGCCTTCTCCACCCATACCGTACAGACCC ((((((((((((((((.(((.(((((.((((.((((.........)))).((((((((((((((.(((.....))).))))).....))))))))).)))).))))).))).))))))).))))))))).. Bni-miR6030b 16943646 16943667 TCCACCCATACCGTACAGACCC Bni-miR6030b* 16943756 16943776 GTCTGTATGTATGGGTTGAGT 3 Bni-MIRN299 PmiREN002315 MIRN299 Brassica nigra Bni-CM004497.1 24054739 24054860 - GTCTCAGTTCACCTCTGGTGTTGTGCAAGACTGAGAAGGAAAGCATGTCTATGTATATCCTTTGTATATAAGACATGCTTTTCTTCTTCTTGTTGCACAACCTGAGGTAATTGGGGCTATCA (((((((((.(((((.((.(((((((((.(..(((((((((((((((((((((((((.....))))))).))))))))))))))))))..).)))))))))))))))))))))))))..... 24054759 24054840 TTGTGCAAGACTGAGAAGGAAAGCATGTCTATGTATATCCTTTGTATATAAGACATGCTTTTCTTCTTCTTGTTGCACAACC ((((((((.(..(((((((((((((((((((((((((.....))))))).))))))))))))))))))..).)))))))).. Bni-miRN299 24054820 24054840 TTGTGCAAGACTGAGAAGGAA Bni-miRN299* 24054759 24054779 TCTTCTTCTTGTTGCACAACC 3 Bni-MIRN300 PmiREN002316 MIRN300 Brassica nigra Bni-CM004498.1 44142354 44142547 + TTTAAAAGTTTTTTTGATCTTGTGTTGTGATGATAATCTGACTCCATGACCAAAACAACAAGATTTACCATTATCCCCAAGTTGAAAGACAAAAAAGGTACTTGTCATGCTTGATGATGTGGTTTAGAAACTTGTTGATTTGATCTTTGGAATGGATTATCATCACAACACTAGATCTAAAAAAATTAGAAGCA ((....((((((((((((((.(((((((((((((((((((..((((.((.((((.(((((((.((((((((.(((..(((((.....(((((.........)))))..)))))..))))))))...))).))))))).)))).))..)))).))))))))))))))))))).))))).)))))))))))..... 44142374 44142527 TGTGTTGTGATGATAATCTGACTCCATGACCAAAACAACAAGATTTACCATTATCCCCAAGTTGAAAGACAAAAAAGGTACTTGTCATGCTTGATGATGTGGTTTAGAAACTTGTTGATTTGATCTTTGGAATGGATTATCATCACAACACTAG .(((((((((((((((((((..((((.((.((((.(((((((.((((((((.(((..(((((.....(((((.........)))))..)))))..))))))))...))).))))))).)))).))..)))).)))))))))))))))))))... Bni-miRN300 44142374 44142394 TGTGTTGTGATGATAATCTGA Bni-miRN300* 44142507 44142527 GGATTATCATCACAACACTAG 3