miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Bju-MIR156a PmiREN001479 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007187.1 2288890 2289027 - TGTTGATGGGGAAAAAGAAGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGGGGAATTGTATAAAATTAAGTTTGTTGTATATAGTTGCTTTTGCGTGCTCACTCTCTCTATGTCATAACTTCTCCTTCTTGGATCTTCAC ...............(((((((((((..(((((((((((((.((((((...(((((((((.(((.......))).))))))))).)))))).)))))))))))))...)))))..))))))................. 2288910 2289007 TTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGGGGAATTGTATAAAATTAAGTTTGTTGTATATAGTTGCTTTTGCGTGCTCACTCTCTCTATGTCATAACT ((((((..(((((((((((((.((((((...(((((((((.(((.......))).))))))))).)))))).)))))))))))))...)))))..).. Bju-miR156a 2288987 2289007 TTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156a* 2288910 2288930 CACTCTCTCTATGTCATAACT 3 Bju-MIR156b PmiREN001480 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007188.1 21527157 21527281 - ACAAAAGAAAAACATAGCAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAAGTAATCTGCATATACTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGATTCTAGTGCTGATCTCTTTGG ....................(((((((((((((((((((((.(((((((((..((((.....)))).))))))...))).))))))))).))).))))))))).........((((.....)))) 21527177 21527261 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAAGTAATCTGCATATACTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGAT (((((((((((((((((((((.(((((((((..((((.....)))).))))))...))).))))))))).))).))))))))).. 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Bju-miR156g 42320686 42320706 GTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156g* 42320766 42320786 CTTACTCTCTATCTGTCACCC 3 Bju-MIR156h PmiREN001486 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007200.1 9581411 9581535 - ACAAAAGAAAGACATAGCAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGTAATTTGCAGACACTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGACTCTAGTGCTGATCTCTTTGG ....................(((((((((((((((((((((.(((((((((..(((((...))))).))))))...))).))))))))).))).))))))))).........((((.....)))) 9581431 9581515 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGTAATTTGCAGACACTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGAC (((((((((((((((((((((.(((((((((..(((((...))))).))))))...))).))))))))).))).))))))))).. 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Bju-miR156j 73657095 73657115 GTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156j* 73657022 73657042 CTCACTATCTATCTGTCACCT 3 Bju-MIR156k PmiREN001489 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007202.1 73656416 73656549 - TGAGTGCTAAGGAATTGATGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATAGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGATCTCATGCTTGAAGTTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCGCCTTCTTTCTCTCTCTCTCC .(((.(..((((((..(.(((((((((((((((((((((((((((((....((((..(((....(((.....))))))..))))))))))))))))))))))).))))))))))).))))))..).)))..... 73656436 73656529 GTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATAGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGATCTCATGCTTGAAGTTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCG (((((((((((((((((((((((((((....((((..(((....(((.....))))))..))))))))))))))))))))))).)))))))).. Bju-miR156k 73656509 73656529 GTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156k* 73656436 73656456 CTCACTCTCTATCTGTCACCG 3 Bju-MIR156l PmiREN001490 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007202.1 4488769 4488893 - AGGCAAAACAAACACAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAAGTAATTTGCATATGCTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGATTCCGGTGTTGATCTCTTTGG ..........(((((.(((.(((((((((((((((((((((.(((((((((..((((.....)))).))))))...))).))))))))).))).))))))))).)))..)))))........... 4488789 4488873 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAAGTAATTTGCATATGCTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGAT (((((((((((((((((((((.(((((((((..((((.....)))).))))))...))).))))))))).))).))))))))).. 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Bju-miR156o 13889215 13889235 TTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156o* 13889280 13889300 TCACTGCTTTATCTGTCAGAT 3 Bju-MIR156p PmiREN001494 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007193.1 54167452 54167576 + GCAAAAGAAACACACAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAAGTAAATTGCATATGTTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGATTCCCGTGCTGATCTCTTTGG .....................((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((.....)))))))))))...))).))))))))).))).))))))))..........((((.....)))) 54167472 54167556 TTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAAGTAAATTGCATATGTTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGAT .((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((.....)))))))))))...))).))))))))).))).))))))))... 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Bju-miR156r 47158922 47158941 CGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156r* 47158854 47158874 GCTCACCCTCTTCTTGTCTCC 3 Bju-MIR156s PmiREN001497 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007194.1 16688213 16688354 - CCATCGAAGGTAAGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGCGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTCAAAATTAGGATTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACCCCTTCTCTCTCTTTTCTTTT .....(((((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((..((((........))))...)))))..))))))))))))))))))))))).))))))))).)))))..).))))...... 16688233 16688334 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGCGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTCAAAATTAGGATTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((..((((........))))...)))))..))))))))))))))))))))))).))))))).. 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Bju-miR156z 58449038 58449058 TTGACAGAAGAGAGCGAGCAC Bju-miR156z* 58448965 58448985 CATTCTCCTTCTGTCATAACT 3 Bju-MIR156aa PmiREN001505 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007202.1 56207904 56208044 - CCATCGAAGGTAAGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTAAAATTAGGGTTTTATGCTTGGAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACCCCTTCTCTCTCTCTTTTCTC .....((.((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((...(((((....)))))...)))))..))))))))))))))))))))))).))))))))).)))))..)).))....... 56207924 56208024 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATGCTTTTTTAAAATTAGGGTTTTATGCTTGGAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACC (((((((((((((((((((((((((((....(((..(((((...(((((....)))))...)))))..))))))))))))))))))))))).))))))).. Bju-miR156aa 56208004 56208024 TGACAGAAGAGAGTGAGCACA Bju-miR156aa* 56207924 56207944 GCTTACTCTCTCTCTGTCACC 3 Bju-MIR156ab PmiREN001506 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007185.1 13004533 13004656 - AGAAATGCAACAGAGAAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTCTCCATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACGGCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGACTTCTCGCTTTCTC (((((.((....(((((.((((((((((((((.((((((((.((((.(((..((((((....))))))..))).)))).))))))))..))).))))))))))).......)))))))))))). 13004553 13004636 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTCTCCATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACGGCTCTTTCTGTCAGTT ((((((((((((.((((((((.((((.(((..((((((....))))))..))).)))).))))))))..))).))))))))).. Bju-miR156ab 13004616 13004636 CTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156ab* 13004553 13004573 TCACGGCTCTTTCTGTCAGTT 3 Bju-MIR156ac PmiREN001507 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007185.1 11797264 11797387 - AGAAATGCAACAGAGAAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTCTCCATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACGGCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGACTTCTCGCTTTCTC ..................((((((((((((((.((((((((.((((.(((..((((((....))))))..))).)))).))))))))..))).)))))))))))((..(....)..))...... 11797284 11797367 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTCTCCATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACGGCTCTTTCTGTCAGTT ((((((((((((.((((((((.((((.(((..((((((....))))))..))).)))).))))))))..))).))))))))).. Bju-miR156ac 11797347 11797367 CTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156ac* 11797284 11797304 TCACGGCTCTTTCTGTCAGTT 3 Bju-MIR156ad PmiREN001508 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007185.1 11471619 11471745 + TTTAGAAAAACGCAAAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGGTTCCGGCACCGATTCTTTTTG ................((..(((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).))))))))..))......(((......))) 11471639 11471725 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGGT (((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).)))))))).. 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Bju-miR156af 3336525 3336545 TTGACAGAAGAAAGAGAGCAC Bju-miR156af* 3336592 3336612 CTCTCTTTACTTCTGCCACCA 3 Bju-MIR156ag PmiREN001511 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007187.1 39263461 39263584 + AGGAATTGCAGCAGAGAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTGTCCATAACTTTGCTTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGAGTTCTCGCTTTCAC ..................(((((((((((((((((((((((.((((((((..((((((....))))))..)))))))).))))))).))))).)))))))))))......((..........)) 39263481 39263564 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTGTCCATAACTTTGCTTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGTT (((((((((((((((((((((.((((((((..((((((....))))))..)))))))).))))))).))))).))))))))).. Bju-miR156ag 39263481 39263501 CTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156ag* 39263544 39263564 TCACCTCTCTTTCTGTCAGTT 3 Bju-MIR156ah PmiREN001512 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007187.1 42234460 42234593 - TGAGTGACAAGAAATTGATGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGGTTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTATCTATCTGTCACCTTGTTCTTTTCGCTTACATCT (((((((.(((((......((((((((((((.((((((((((((((((....(((..(((....((((...)))))))..))))))))))))))))))).))).)))))))))...))))).)))))))..... 42234480 42234573 GTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGGTTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTATCTATCTGTCACCT (((((((((((.((((((((((((((((....(((..(((....((((...)))))))..))))))))))))))))))).))).)))))))).. Bju-miR156ah 42234553 42234573 GTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156ah* 42234480 42234500 CTCACTATCTATCTGTCACCT 3 Bju-MIR156ai PmiREN001513 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007187.1 42233874 42234007 - TGAGTGCTAAGGAATTGATGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATAGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGATCTCATGCTTGAAGTTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCGCCTTCTTTCTCTCTCTCTCC .(((.(..((((((..(.(((((((((((((((((((((((((((((....((((..(((....(((.....))))))..))))))))))))))))))))))).))))))))))).))))))..).)))..... 42233894 42233987 GTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATAGTGGCTTTCTTGCATATTTGAAGATCTCATGCTTGAAGTTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCG (((((((((((((((((((((((((((....((((..(((....(((.....))))))..))))))))))))))))))))))).)))))))).. Bju-miR156ai 42233967 42233987 GTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156ai* 42233894 42233914 CTCACTCTCTATCTGTCACCG 3 Bju-MIR156aj PmiREN001514 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007187.1 39551498 39551624 - TTTAGAGAAACGCATAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGATTCCGGCTCCGATTCTTTTCG ................(((.(((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).)))))))).)))......(((......))) 39551518 39551604 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGAT (((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).)))))))).. Bju-miR156aj 39551584 39551604 CTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156aj* 39551518 39551538 TCACTGCTCTATCTGTCAGAT 3 Bju-MIR156ak PmiREN001515 MIR156 Brassica juncea Bju-CM007187.1 39537926 39538052 - TTTAGAGAAACGCATAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGATTCCGGCTCCGATTCTTTTCG ................(((.(((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).)))))))).)))......(((......))) 39537946 39538032 CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGAT (((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).)))))))).. Bju-miR156ak 39538012 39538032 CTGACAGAAGAGAGTGAGCAC Bju-miR156ak* 39537946 39537966 TCACTGCTCTATCTGTCAGAT 3 Bju-MIR157a PmiREN001516 MIR157 Brassica juncea Bju-CM007185.1 18857362 18857549 + AGGTTTGGGAGTGATGCAGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATACATATATATCATCACACCGCAAGTGGATATAAGGAAATTCAAGAAAGAGAGGAAAAAAGAGCCTGCATCTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCAATACCATTATTTATTCCTCT .............(.(.(((.(((((((((((((((((((((((.(((((.((.(((((.((.........((((((..(((.......)))))))))......(((........))).........)).))))).))...))))).))))))))))).))))))))))))............))))) 18857382 18857529 TTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATACATATATATCATCACACCGCAAGTGGATATAAGGAAATTCAAGAAAGAGAGGAAAAAAGAGCCTGCATCTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCAATA (((((((((((((((((((((.(((((.((.(((((.((.........((((((..(((.......)))))))))......(((........))).........)).))))).))...))))).))))))))))).)))))))))))) 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Bju-miR157b 6594459 6594479 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Bju-miR157b* 6594531 6594551 CTCTCTAGCCTTCTGTCATCA 3 Bju-MIR157c PmiREN001518 MIR157 Brassica juncea Bju-CM007187.1 27851494 27851689 - TTTGAGAGTGATGCTGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATATGTATGTATCATCACACCGCCTGTGGATGATTACAAAAATAAAACCAATTCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTCGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCATTATTTCTTCTTCTTT ..............((((.((.(((((((((((((((((((.(((((.((((((((.((.........(((((((((.(((.....)))))))).))))..............((......))..........)).))))))))...))))).))))))))))).)))))))))).))))................ 27851514 27851669 TTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATATGTATGTATCATCACACCGCCTGTGGATGATTACAAAAATAAAACCAATTCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTCGTGCTCTCTATACTTCTGTCACC (.(((((((((((((((((((.(((((.((((((((.((.........(((((((((.(((.....)))))))).))))..............((......))..........)).))))))))...))))).))))))))))).))))))))).. Bju-miR157c 27851649 27851669 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Bju-miR157c* 27851514 27851534 GCTCTCTATACTTCTGTCACC 3 Bju-MIR157d PmiREN001519 MIR157 Brassica juncea Bju-CM007191.1 24781711 24781843 + TTTGGTAGGCGTCGATAGTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATGCAATTTGGAGAAGCTTGTATGCATCGTACTCCTTTGTGCTCTCTAGTCTTCTGTCATCACTCGTTACTTGCCTTAACCC ...((((((((..(((((((.(((((((((((((((((((((((.((((.((((((....((.....))....)))))).)).)).)))))))))))).))))))))))).)))).)))...)))))..))). 24781731 24781823 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATGCAATTTGGAGAAGCTTGTATGCATCGTACTCCTTTGTGCTCTCTAGTCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.((((.((((((....((.....))....)))))).)).)).)))))))))))).)))))))))))... Bju-miR157d 24781731 24781751 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Bju-miR157d* 24781803 24781823 CTCTCTAGTCTTCTGTCATCA 3 Bju-MIR157e PmiREN001520 MIR157 Brassica juncea Bju-CM007195.1 22708236 22708439 - TTCGAGAGTGATGCTGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCTAGTACATATATATGTATCATCACACCCGCCTGTGGAAGATAAAAATGTAAAACAAATTCAAGAAAGAGAGAGAGAAAGACAAAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCATTTTGTTCTTCTTCTC .....(((.((.((((((.((.(((((((((((((((((((.(((((.(((((((..((...(((((...((((.((.(((......))))).))))...)))))........((......))..................))..)))))))...))))).))))))))))).)))))))))).))))....))...))..))) 22708256 22708419 TTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCTAGTACATATATATGTATCATCACACCCGCCTGTGGAAGATAAAAATGTAAAACAAATTCAAGAAAGAGAGAGAGAAAGACAAAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCACC (.(((((((((((((((((((.(((((.(((((((..((...(((((...((((.((.(((......))))).))))...)))))........((......))..................))..)))))))...))))).))))))))))).))))))))).. 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Bju-miR157f 5729589 5729609 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Bju-miR157f* 5729722 5729742 CTCTCTATACTTCTGTCAATA 3 Bju-MIR157g PmiREN001522 MIR157 Brassica juncea Bju-CM007201.1 17716667 17716799 + GTTGGTAGGCGTTGATAGTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATGCAATTTGGAGCAGCTTCTATGCATCCTACTCCTTTGTGCTCTCTAGTCTTCTGTCATCACCCGTTATTTGCCTTAACCC ...((.(((((.((((.(((.(((((((((((((((((((((((.((((.((((((...(((((....))))))))))).)).)).)))))))))))).))))))))))).)))..))))..)))))....)) 17716687 17716779 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAGATGCAATTTGGAGCAGCTTCTATGCATCCTACTCCTTTGTGCTCTCTAGTCTTCTGTCATCA .(((((((((((((((((((((((.((((.((((((...(((((....))))))))))).)).)).)))))))))))).)))))))))))... 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Bju-miR159b 10074067 10074087 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Bju-miR159b* 10074224 10074244 GAGCTCCTTAAAGTTCAAACG 3 Bju-MIR159c PmiREN001528 MIR159 Brassica juncea Bju-CM007194.1 4460181 4460396 - TTCTTGAGAACAAAGAAGTAGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCTATAATCCTAAAAGATAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTCTTTCACTTTATCT ............((((.((((((((((((.(((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..((((((((((.((((((..........))))))))))).)))))..).)))).)).)).))))))...)))))).....))))...)))))).))))))))).)))))))))))).)))).............. 4460201 4460376 GGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCTATAATCCTAAAAGATAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((.(((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..((((((((((.((((((..........))))))))))).)))))..).)))).)).)).))))))...)))))).....))))...)))))).))))))))).))))))))).. Bju-miR159c 4460201 4460221 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Bju-miR159c* 4460356 4460376 GGGCTCCTTATAGTTCAAACG 3 Bju-MIR159d PmiREN002676 MIR159 Brassica juncea Bju-LFQT01009470.1 92614 92831 + TTCCCGAGAACAAAAAAGTAGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGAATCCCATAAGCCCTAATCCTTATATATAAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTACATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTCTTTCACTTTATCT ....................(((((((((.(((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((((((..(((((((.........))))))).)))).)))))..).)))).)).)).))))))...))))))......))))...)))))).))))))))).)))))))))...................... 92634 92811 GGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGAATCCCATAAGCCCTAATCCTTATATATAAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTACATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((.(((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((((((..(((((((.........))))))).)))).)))))..).)))).)).)).))))))...))))))......))))...)))))).))))))))).))))))))).. Bju-miR159d 92791 92811 TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA Bju-miR159d* 92634 92654 GGGCTCCTTATAGTTCAAACG 3 Bju-MIR160a PmiREN001529 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007199.1 48180901 48181021 - GTTGATGTATATTATATATATGTCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGCTCATCGACCATCGAGGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTTTCATATACATATTTCTA ....((((((((.....((((((.(((((((.(((((((((..(((..((.((.((((...)))).)).))..)))..))))))))).))))))).))))))....))))))))....... 48180921 48181001 TGTCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGCTCATCGACCATCGAGGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.(((((((((..(((..((.((.((((...)))).)).))..)))..))))))))).))))))).))).. Bju-miR160a 48180981 48181001 TGTCTGGCTCCCTGTATGCCA Bju-miR160a* 48180921 48180941 GCGTATGAGGAGCCAAGCATA 3 Bju-MIR160b PmiREN001530 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007185.1 14533261 14533383 + ATATATTTGATACAAAGTCCTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAAACACCGATCTCATTATGAAATCGAACACTAGTGGCGTACAGAGCAGTCAAGCATGACCACAGCTATTCTTGATAT ................(((.(((.((((((.(((((((((((.(((......((((.(((...))).))))...))).))))))))))).).))))).))).))).................. 14533281 14533363 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAAACACCGATCTCATTATGAAATCGAACACTAGTGGCGTACAGAGCAGTCAAGCATG (((.((((((.(((((((((((.(((......((((.(((...))).))))...))).))))))))))).).))))).))).. Bju-miR160b 14533281 14533300 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160b* 14533343 14533363 CGTACAGAGCAGTCAAGCATG 3 Bju-MIR160c PmiREN001531 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007187.1 11760329 11760449 + GAAATATGATATATTTGTATATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGTTCATCGATCCTCGGCGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATAATCTCATCATATATATA ....((((.(((((.((....(((((.(((((((.(((((((((..(((..((.((.((((...)))).)).))..)))..))))))))).))))))).)))))....))..))))))))) 11760349 11760429 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGTTCATCGATCCTCGGCGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATA (((.(((((((.(((((((((..(((..((.((.((((...)))).)).))..)))..))))))))).))))))).))))) Bju-miR160c 11760349 11760368 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160c* 11760409 11760429 GCGTATGAGGAGCCAAGCATA 3 Bju-MIR160d PmiREN001532 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007189.1 3486265 3486385 - GTTGTTGTATAAGATGTGTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACTCTAAGCTCATCGACCATTGATGACCTCCGTGAATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTTTCATATACAATTACATA ((.((((((((.((...((((((.(((((((.((((((((((.(.(..((.(((((((...))))))).))..).).)))))))))).))))))).))))))..)).)))))))).))... 3486285 3486365 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACTCTAAGCTCATCGACCATTGATGACCTCCGTGAATGGCGTATGAGGAGCCATGCATA (((.(((((((.((((((((((.(.(..((.(((((((...))))))).))..).).)))))))))).))))))).))).. Bju-miR160d 3486346 3486365 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160d* 3486285 3486305 GCGTATGAGGAGCCATGCATA 3 Bju-MIR160e PmiREN001533 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007190.1 35136058 35136181 - ATACATACATACTTGTCTCATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAGATATTGATTTTGGTTGAAAAAATCAGCTGCCAGTGGCGTACAAGGAGTCAAGCATGACCTAGAACATATGGTAACT ..................(((((.(((((((.((((((((((..((((...((((((((.......))))))))))))..)))))))))).))))))).)))))(((..........))).... 35136078 35136161 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAGATATTGATTTTGGTTGAAAAAATCAGCTGCCAGTGGCGTACAAGGAGTCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((..((((...((((((((.......))))))))))))..)))))))))).))))))).))).. Bju-miR160e 35136142 35136161 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160e* 35136078 35136098 GCGTACAAGGAGTCAAGCATG 3 Bju-MIR160f PmiREN001534 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007193.1 50225926 50226048 + TGTGTGTGCTCTTATGGTCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTATATACCGATCTCGTTACGAAATCTATGGCTAGTGGCGTACAGAGTAGTCAAGCATGACCAAAGCTTTTCTTGGTGT ...............((((((((.((((((.(((((((((((.(((.((((..(((.((.....)).)))))))))).))))))))))).).))))).))))))))................. 50225946 50226028 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTATATACCGATCTCGTTACGAAATCTATGGCTAGTGGCGTACAGAGTAGTCAAGCATG (((.((((((.(((((((((((.(((.((((..(((.((.....)).)))))))))).))))))))))).).))))).))).. Bju-miR160f 50225946 50225965 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160f* 50226008 50226028 CGTACAGAGTAGTCAAGCATG 3 Bju-MIR160g PmiREN001535 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007193.1 23252211 23252332 - GATGTGTCATCATGCCTGATTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACGAGTGGGTATCGATTTTGTTGAAAAATTGGCTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATGACCAGAAGAAGCAAATGATA ....((((((..((((((..(((.(((((((.((((((((((.(((((...((((((((.....))))))))))))).)))))))))).))))))).)))....))).....))).)))))) 23252231 23252312 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACGAGTGGGTATCGATTTTGTTGAAAAATTGGCTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((.(((((...((((((((.....))))))))))))).)))))))))).))))))).))).. 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Bju-miR160i 13554427 13554446 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160i* 13554487 13554507 GCGTATGAGGAGCCAAGCATA 3 Bju-MIR160j PmiREN001538 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007198.1 3188739 3188859 - GTAGTTGTATAAGATGTGTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATCCTCTAAGCTCATCGACCATTGATGACCTCCGTGAATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTTTCATATACATTTACATA ((((.((((((.((...((((((.(((((((.((((((((((.(.(..((.(((((((...))))))).))..).).)))))))))).))))))).))))))..)).)))))).))))... 3188759 3188839 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATCCTCTAAGCTCATCGACCATTGATGACCTCCGTGAATGGCGTATGAGGAGCCATGCATA (((.(((((((.((((((((((.(.(..((.(((((((...))))))).))..).).)))))))))).))))))).))).. Bju-miR160j 3188820 3188839 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160j* 3188759 3188779 GCGTATGAGGAGCCATGCATA 3 Bju-MIR160k PmiREN001539 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007200.1 4581081 4581203 + CATATATTGATTTGCTGTCATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTGGATATCGATTTTGGCTGAAAAATTAGCTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATGACCAGAAGAAGCAGATGATA ..................(((((.(((((((.((((((((((.(((((.....((((((......))))))..))))).)))))))))).))))))).))))).................... 4581101 4581183 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTGGATATCGATTTTGGCTGAAAAATTAGCTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((.(((((.....((((((......))))))..))))).)))))))))).))))))).))).. 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Bju-miR160l 63533432 63533451 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160l* 63533496 63533516 GCGTACAAGGAGCCAAGCATG 3 Bju-MIR160m PmiREN001541 MIR160 Brassica juncea Bju-CM007202.1 71485640 71485762 + TGTGTGTGCTCTTGTAGTCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAAATACCGATCTCGTTACGAAATCTATGGCTAGTGGCGTACAGAGTAGTCAAGCATGACCAAAGCTTTTCTTGGTAT ...............((((((((.((((((.(((((((((((.(((..(((..(((.((.....)).)))))).))).))))))))))).).))))).)))))))....(((......))).) 71485660 71485742 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTAAATACCGATCTCGTTACGAAATCTATGGCTAGTGGCGTACAGAGTAGTCAAGCATG (((.((((((.(((((((((((.(((..(((..(((.((.....)).)))))).))).))))))))))).).))))).))).. Bju-miR160m 71485660 71485679 TGCCTGGCTCCCTGTATGCC Bju-miR160m* 71485722 71485742 CGTACAGAGTAGTCAAGCATG 3 Bju-MIR160n PmiREN001542 MIR160 Brassica juncea Bju-LFQT01009350.1 8456 8578 + CATATATTGATTTGCTGTCATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTGGATATCGATTTTGGCTGAAAAATTAGCTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATGACCAGAAGAAGCAGATGATA ..................(((((.(((((((.((((((((((.(((((.....((((((......))))))..))))).)))))))))).))))))).))))).................... 8476 8558 TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGTGGATATCGATTTTGGCTGAAAAATTAGCTGCTGGTGGCGTACGAGGAGCCAAGCATG (((.(((((((.((((((((((.(((((.....((((((......))))))..))))).)))))))))).))))))).))).. 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Bju-miR161 18940146 18940166 TCAATGCACTGAAAGTGACTA Bju-miR161* 18940057 18940077 GTCACTTTCAATGCGTTGATC 3 Bju-MIR162a PmiREN001544 MIR162 Brassica juncea Bju-CM007194.1 17070343 17070469 + GAGAAAAAGGAGTGAAAGATGCTGGAGGCAGCGGTTGATCGATCTCTTTGTGGGAATTTTTGAAAAACAAAATTAAAAGCATGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGGTCGCCTCTTCATCA ...............(((((((((((.((((.((((.((((((((.((((((.....(((((.....))))).......)))))).)))))))).)))).)))).)))))))......))))..... 17070363 17070449 GGAGGCAGCGGTTGATCGATCTCTTTGTGGGAATTTTTGAAAAACAAAATTAAAAGCATGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAG (((.((((.((((.((((((((.((((((.....(((((.....))))).......)))))).)))))))).)))).)))).))))) 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Bju-miR162d 43221016 43221036 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Bju-miR162d* 43221099 43221119 GGAGGCAGCGGTTCATCGATC 3 Bju-MIR162e PmiREN001548 MIR162 Brassica juncea Bju-CM007198.1 6829685 6829819 - TGATGAAAGTTGAAGTCGCTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCAATTCCTGTGAATAATGATGTTGGAAACAATTTACATGGGAAGCATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGCTTCTCCTTCCTGATTTG ......(((..((((.(((((((.((((.((((.(((((((.((((.(((.....((((.((((....)))).).))).....))).)))).))))))).)))).)))).)))))))))))..)))......... 6829705 6829799 GGAGGCAGCGGTTCATCGATCAATTCCTGTGAATAATGATGTTGGAAACAATTTACATGGGAAGCATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAG (((.((((.((((.(((((((.((((.(((.....((((.((((....)))).).))).....))).)))).))))))).)))).)))).))).. 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Bju-miR162f 72277439 72277459 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Bju-miR162f* 72277360 72277380 GGAGGCAGCGGTTCATCGATC 3 Bju-MIR162g PmiREN001550 MIR162 Brassica juncea Bju-LFQT01007049.1 2009 2152 + TAATCAGAAGAGTGAAAGTCGCTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGTGGATTTTTTTGTTTGTTTGTCATTGTTGGAAAGAGATTAAAAGCACGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGGTTGCCTCTTCGTCA ......((((((.(..((((((((((.((((.((((.((((((((.(((.(((.....((((.((((.(((.(((....)))))).)))).))))))).))).)))))))).)))).)))).)))))))))).))))))).... 2029 2132 GGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGTGGATTTTTTTGTTTGTTTGTCATTGTTGGAAAGAGATTAAAAGCACGAACAGATCGATAAACCTCTGCATCCAG (((.((((.((((.((((((((.(((.(((.....((((.((((.(((.(((....)))))).)))).))))))).))).)))))))).)))).)))).))))) Bju-miR162g 2112 2132 TCGATAAACCTCTGCATCCAG Bju-miR162g* 2029 2049 GGAGGCAGCGGTTCATCGATC 3 Bju-MIR164a PmiREN001551 MIR164 Brassica juncea Bju-CM007188.1 33072134 33072250 + GTAGGTGAGAACCTCCATGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAAAAAACATGAAATCTGTTTCATATGCTTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAACATGAGCTCCTCACCATTGGC ...((((((...(((.(((((((((.((..(((((((((((((.((..(((((.......)))))....)).)))))))))))))..)).))))))))))))...))))))...... 33072154 33072230 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAAAAAACATGAAATCTGTTTCATATGCTTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAAC (((((.((..(((((((((((((.((..(((((.......)))))....)).)))))))))))))..)).))))).. 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Bju-miR164b 33106172 33106192 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Bju-miR164b* 33106231 33106251 CACGTGCTCCCCTCCTCCAAC 3 Bju-MIR164c PmiREN001553 MIR164 Brassica juncea Bju-CM007189.1 164041 164157 - GCGGATGAGAACCTCCACGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACAAACACGAGATCTATCTCATGTAATTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAACATGAGCTCCTCACCATTGAC ..................(((((((.((..(((((((((((((.......(((.((((....)))).)))..)))))))))))))..)).))))))).................... 164061 164137 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACAAACACGAGATCTATCTCATGTAATTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAAC (((((.((..(((((((((((((.......(((.((((....)))).)))..)))))))))))))..)).))))).. 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Bju-miR164d 1393511 1393531 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Bju-miR164d* 1393641 1393661 CATGTGCCCATCTTCCCCATC 3 Bju-MIR164e PmiREN001555 MIR164 Brassica juncea Bju-CM007198.1 1529462 1529578 + GCGGGTGAGAACCTCCACGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACGAACACGAAATTTGTTTCATGTAATTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAACATGAACTCCTCACCATTGAC ...((((((......((.(((((((.((..(((((((((((((.((..(((((.......)))))..))...)))))))))))))..)).))))))).)).....))))))...... 1529482 1529558 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACGAACACGAAATTTGTTTCATGTAATTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAAC (((((.((..(((((((((((((.((..(((((.......)))))..))...)))))))))))))..)).))))).. 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Bju-miR164j 14872705 14872725 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCG Bju-miR164j* 14872801 14872821 CACGTGTTCTACTACTCCAAC 3 Bju-MIR164k PmiREN001561 MIR164 Brassica juncea Bju-CM007202.1 73412708 73412829 + AATGGGTGAGTAACACTTGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCGATCAAATGAGATCAATCAGTACATGTTGATCATATATTCGCACGTGTTCTACTACTCCAACACGTGTTTCTCTCCCCTCTC ...(((.(((.(((((.((.(((((.((.(((((((((((((....(((.((((((.((.....)))))))).)))..))))))))))))).)).))))).)).))))).))).)))..... 73412728 73412809 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCGATCAAATGAGATCAATCAGTACATGTTGATCATATATTCGCACGTGTTCTACTACTCCAAC (((((.((.(((((((((((((....(((.((((((.((.....)))))))).)))..))))))))))))).)).))))).. 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Bju-miR165j 3906717 3906737 TCGGACCAGGCTTCATCCCCC Bju-miR165j* 3906623 3906643 GGAATGTTGTCTGGACCGAGG 3 Bju-MIR166a PmiREN001572 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007188.1 32689394 32689560 + AAGGGGCTTTCTCTTTTGAGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAAGACTCTAGCTATTCATGTTAGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCACACCTCCATGTTTGAGATCTGATTAGGTTTTTAGGGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTGCTCCCTGCTTA .((((((........(((.((((((((..((((((.((((.((((((((..(((...((((((((((.((((((...))))))..(((......)))..))))))))))..)))..)))))))).)))).))))))..)))))))).))).....)).))))..... 32689414 32689540 GGGAATGTTGTTTGGCTCGAAGACTCTAGCTATTCATGTTAGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCACACCTCCATGTTTGAGATCTGATTAGGTTTTTAGGGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCC (((((((..((((((.((((.((((((((..(((...((((((((((.((((((...))))))..(((......)))..))))))))))..)))..)))))))).)))).))))))..))))))).. Bju-miR166a 32689519 32689540 TCGGACCAGGCTTCATTCCCCC Bju-miR166a* 32689414 32689434 GGGAATGTTGTTTGGCTCGAA 3 Bju-MIR166b PmiREN001573 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007188.1 15850854 15851007 - ATGAAGCTTTTTCTTATGAGGGGATTGTTGTCTGGCACGAGGCCCTTAACTCAGATCTACGATCGGTTATATAAATATATTATATGAACGATCAGTTAAGTGGTTGATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGTTACATCGCTTCGATCC ..(((((.........((((((((.((..((((((..(((.(.(.(((((.((.....(((((((.((((((((.....)))))))).))))).))....))))))).).).)))..))))))..)).))))))))........)))))..... 15850874 15850987 GGGATTGTTGTCTGGCACGAGGCCCTTAACTCAGATCTACGATCGGTTATATAAATATATTATATGAACGATCAGTTAAGTGGTTGATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCT ((((.((..((((((..(((.(.(.(((((.((.....(((((((.((((((((.....)))))))).))))).))....))))))).).).)))..))))))..)).)))).. Bju-miR166b 15850874 15850895 TCGGACCAGGCTTCATTCCCCT Bju-miR166b* 15850967 15850987 GGGATTGTTGTCTGGCACGAG 3 Bju-MIR166c PmiREN001574 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007189.1 615685 615838 - GAGGGATTTATCTTTTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTTATCCTAACTCAATCACGTTTATAAAATCTAGCTTTGATTTGATGATTGATTAGGGTTTTAGTGTCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTACTTCCTCTCA ((((((..((....(((.(((((.((..((((((.((((((((.((.(((((((.(((((((........(((((.......)))))..))))))))))))))...)).)))))))).))))))..)).))))).)))....))..))).))). 615705 615818 GGACTGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTTATCCTAACTCAATCACGTTTATAAAATCTAGCTTTGATTTGATGATTGATTAGGGTTTTAGTGTCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC (((.((..((((((.((((((((.((.(((((((.(((((((........(((((.......)))))..))))))))))))))...)).)))))))).))))))..)).))).. 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Bju-miR166d 32428425 32428446 TCGGACCAGGCTTCATTCCCCC Bju-miR166d* 32428367 32428387 GTGGATGATGCCTGGCTCGAG 3 Bju-MIR166e PmiREN001576 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007190.1 37321170 37321298 - CTGAGCGGGGAGGTTGATACGGTGGTGAAAGGTGTTTGACAAAAGGTAGCGAAACCCTTGGTAACTGTGCCTGGGAGAATATTTTAGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACTTACACGTTTTGCGTT ..(((((...(((((((...((.((((((.(.((((((((..((((((......(((..((((....)))).)))....)))))).)))))))..).))))))).)).)))))))...)))))...... 37321190 37321278 GGTGGTGAAAGGTGTTTGACAAAAGGTAGCGAAACCCTTGGTAACTGTGCCTGGGAGAATATTTTAGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCT ((.((((((.(.((((((((..((((((......(((..((((....)))).)))....)))))).)))))))..).))))))).)).. Bju-miR166e 37321190 37321211 TCGGACCAGGCTTCATTCCCCT Bju-miR166e* 37321258 37321278 GGTGGTGAAAGGTGTTTGACA 3 Bju-MIR166f PmiREN001577 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007193.1 52368295 52368447 + TAAAGGGATTTATCTTTTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTTATTCTAACTCAATCACGTTTTATAAAATCTACTTAATCTGATGATTGATTAGGGTTTTAGTGTCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTACTTCCTCT ....((((..((....(((.(((((.((..((((((.((((((((.((.(((((((.(((((((((..(((...........)))..)).))))))))))))))...)).)))))))).))))))..)).))))).)))....))..)))).. 52368315 52368427 GGACTGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTTATTCTAACTCAATCACGTTTTATAAAATCTACTTAATCTGATGATTGATTAGGGTTTTAGTGTCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC (((.((..((((((.((((((((.((.(((((((.(((((((((..(((...........)))..)).))))))))))))))...)).)))))))).))))))..)).))))) Bju-miR166f 52368406 52368427 TTCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bju-miR166f* 52368315 52368335 GGACTGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Bju-MIR166g PmiREN001578 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007194.1 16920133 16920249 - TGGTGCGGTTTAGGGTTGAGAGGACTGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAATGAAAGCTAAACCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACCTTTTTATCGCCATAT (((((......(((((((.(.(((.((..((((((.((((((((((..((..............))..)))).)))))).))))))..)).))).).))))))).....)))))... 16920153 16920229 AGGACTGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAATGAAAGCTAAACCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCC .(((.((..((((((.((((((((((..((..............))..)))).)))))).))))))..)).)))... Bju-miR166g 16920153 16920174 TCGGACCAGGCTTCATTCCCCC Bju-miR166g* 16920209 16920229 AGGACTGTTGTCTGGCTCGAG 3 Bju-MIR166h PmiREN001579 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007194.1 16918252 16918375 - TATGGTGTATAGGGTTGTGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGTAGGTTCATTAGATCACTTAGCACTAAATGATTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCACAACCATTACTATCACATT ....(((.(((((((((((.((((((..((((((.((((((((((..(((((((((....))..))))...)))..)))).)))))).))))))..)))))).)))))))....)))))))... 16918272 16918355 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGTAGGTTCATTAGATCACTTAGCACTAAATGATTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((((((((..(((((((((....))..))))...)))..)))).)))))).))))))..)))))).. Bju-miR166h 16918272 16918293 TTCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bju-miR166h* 16918335 16918355 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Bju-MIR166i PmiREN001580 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007198.1 605981 606151 + GAAGGGGTTTTCTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGGCTCTATCAACTCATGTTGGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCAAACCTCTATGTTTGAGATCTGATTAGGGTTTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTGCTCCCTGA ...(((((........(((.((((((((..((((((.((((.(((.((((((((((((..((..((((((((......))))))))....((((((......))))))))..))).))))))..))).))).)))).))))))..)))))))).))).....))))).... 606001 606131 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGGCTCTATCAACTCATGTTGGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCAAACCTCTATGTTTGAGATCTGATTAGGGTTTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((.(((.((((((((((((..((..((((((((......))))))))....((((((......))))))))..))).))))))..))).))).)))).))))))..)))))))) Bju-miR166i 606111 606131 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bju-miR166i* 606001 606021 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Bju-MIR166j PmiREN001581 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007198.1 1032323 1032493 + GAAGGGGTTTTCTCATTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGTCTCTATCTATTCAAGTTGGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCAAACCTCTATGTTAGAGATCAGATTAGGGTTTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTGCTCCCTGA ..((((((........(((.((((((((..((((((.((((.(((.(((.((((((((((((..((((((((......)))))))).)))).....(((((...)))))...))).)))))...))).))).)))).))))))..)))))))).))).....)).)))).. 1032343 1032473 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGTCTCTATCTATTCAAGTTGGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCAAACCTCTATGTTAGAGATCAGATTAGGGTTTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC ((((((..((((((.((((.(((.(((.((((((((((((..((((((((......)))))))).)))).....(((((...)))))...))).)))))...))).))).)))).))))))..)))))))) Bju-miR166j 1032453 1032473 TCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bju-miR166j* 1032343 1032363 GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Bju-MIR166k PmiREN001582 MIR166 Brassica juncea Bju-CM007199.1 35385693 35385848 + TCTGAAGCTTTTTATTTTGAGGGGACTGTTGTCTGGCACGAGGCCCTTAACTCAGATCTACGATCGGTTATATAATATATATATATGTGAACGATCAGTTAAGTGGTTGATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGTTACATCGCTTCGATT ...(((((........(((((((((.((..((((((..(((.(.(.(((((.((.....(((((((.(((((((.........))))))).))))).))....))))))).).).)))..))))))..)).))))))))).......))))).... 35385713 35385828 GGGACTGTTGTCTGGCACGAGGCCCTTAACTCAGATCTACGATCGGTTATATAATATATATATATGTGAACGATCAGTTAAGTGGTTGATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCT ((((.((..((((((..(((.(.(.(((((.((.....(((((((.(((((((.........))))))).))))).))....))))))).).).)))..))))))..)).)))))) 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Bju-miR166m 93507 93528 TTCGGACCAGGCTTCATTCCCC Bju-miR166m* 93416 93436 GGACTGTTGTCTGGCTCGAGG 3 Bju-MIR166n PmiREN001585 MIR166 Brassica juncea Bju-LFQT01002015.1 24215 24381 - AAGGGGCTTTCTCTTTTGAGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAAGACTCTAGCTATTCATGTTAGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCATAAGTCCATGTTTGACATCTGATTAGGGTTTTAGAGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTGCTCCCTGCTTA ...............(((.((((((((..((((((.((((.((((((((..((((..((((((((......))))))))..(((((...(((.......)))...))))).)))).)))))))).)))).))))))..)))))))).))).....((.....))... 24235 24361 GGGAATGTTGTTTGGCTCGAAGACTCTAGCTATTCATGTTAGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCATAAGTCCATGTTTGACATCTGATTAGGGTTTTAGAGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCC (((((((..((((((.((((.((((((((..((((..((((((((......))))))))..(((((...(((.......)))...))))).)))).)))))))).)))).))))))..))))))).. 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Bju-miR167g 21001880 21001900 TGAAGCTGCCAGCATGATCTT Bju-miR167g* 21001811 21001831 AGATCATGTGGCAGTTTCACC 3 Bju-MIR167h PmiREN001594 MIR167 Brassica juncea Bju-CM007194.1 12226283 12226423 + TATGGTGCACCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAGTTAACTTTATTTCTCCGTTGTTTATCCATGACAATGGAAAAGGGATAAGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACCCGTTGACTGTCGCATCCTTA ...(((((..(((((.(.(.(((((((((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((.......)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).).).)).)))..))))).... 12226303 12226403 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGTTAACTTTATTTCTCCGTTGTTTATCCATGACAATGGAAAAGGGATAAGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((.......)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).. Bju-miR167h 12226303 12226323 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bju-miR167h* 12226383 12226403 GATCATGTTCGTAGTTTCACC 3 Bju-MIR167i PmiREN001595 MIR167 Brassica juncea Bju-CM007195.1 13408979 13409121 + AACGGTGCACAGGTATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTAATTTCTCCGTTGATTTTATGACGATGGAAAAGAGATGAGTGTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCAATTGACTGTCGCACCCTTA ...(((((((((..(..((.(((((((((.((((((((((((((.((...((((.(((((((((((.((....)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).))..)..)))).))))).... 13408999 13409101 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTAATTTCTCCGTTGATTTTATGACGATGGAAAAGAGATGAGTGTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((.((...((((.(((((((((((.((....)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).. Bju-miR167i 13408999 13409019 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bju-miR167i* 13409081 13409101 GATCATGTTCGCAGTTTCACC 3 Bju-MIR167j PmiREN001596 MIR167 Brassica juncea Bju-CM007199.1 16392221 16392365 + ATGAGAAGTGTAGCCCCAGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTATATTTCTTTCTCCGTTGGCGATGGAAAAGACATGTGTGGATTAGATCATGTGTGGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCCGTTGACTGTCGC ................(((.((.(.(.(((((((((.((((((((((((((......((((.((((((...))))))))))(((((((..........))))))).)))))))))))))).))))))))).).).)).))).... 16392241 16392345 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTATATTTCTTTCTCCGTTGGCGATGGAAAAGACATGTGTGGATTAGATCATGTGTGGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((......((((.((((((...))))))))))(((((((..........))))))).)))))))))))))).))))))))).) Bju-miR167j 16392241 16392261 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bju-miR167j* 16392325 16392345 GATCATGTTCGCAGTTTCACC 3 Bju-MIR167k PmiREN001597 MIR167 Brassica juncea Bju-CM007201.1 32659304 32659440 + TATGGTGCATCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTGTTTCCATGACGATGGAAAAGGGATGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACCCGATGACTGTCGCACCCTTA ...(((((..(((((((.(.(((((((((.((((((((((((((.((.((((((.(((((((((.....))))))))).)))))).))...)))))))))))))).))))))))).).)))).)))..))))).... 32659324 32659420 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTGTTTCCATGACGATGGAAAAGGGATGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((.((.((((((.(((((((((.....))))))))).)))))).))...)))))))))))))).))))))))).. Bju-miR167k 32659324 32659344 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bju-miR167k* 32659400 32659420 GATCATGTTCGTAGTTTCACC 3 Bju-MIR167l PmiREN001598 MIR167 Brassica juncea Bju-CM007202.1 56911469 56911605 - TATGGTGCATCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTGTTTCCATGACGATGGAAAAGGGATGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACCCGATGACTGTCGCACCCTTA ...(((((..(((((((.(.(((((((((.((((((((((((((.((.((((((.(((((((((.....))))))))).)))))).))...)))))))))))))).))))))))).).)))).)))..))))).... 56911489 56911585 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTGTTTCCATGACGATGGAAAAGGGATGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((.((.((((((.(((((((((.....))))))))).)))))).))...)))))))))))))).))))))))).. Bju-miR167l 56911565 56911585 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bju-miR167l* 56911489 56911509 GATCATGTTCGTAGTTTCACC 3 Bju-MIR167m PmiREN001599 MIR167 Brassica juncea Bju-LFQT01001971.1 451037 451163 - AGAGGTGCACCAGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTTAACTTCTCTCTCTATATATGTATATAGATTTGAACAGGGACGATCAGATCATGTGGCAGTTTCACCCGTTGATGGCCGCATCAATA ..((((((....))))))..(((((((((((.((((((((...(.(((((.(((((((....))))))).......))))).)...)))))))))))))))))))...(((((((....))))))). 451057 451143 TGAAGCTGCCAGCATGATCTTAACTTCTCTCTCTATATATGTATATAGATTTGAACAGGGACGATCAGATCATGTGGCAGTTTCACC (((((((((((.((((((((...(.(((((.(((((((....))))))).......))))).)...))))))))))))))))))).. Bju-miR167m 451123 451143 TGAAGCTGCCAGCATGATCTT Bju-miR167m* 451057 451077 AGATCATGTGGCAGTTTCACC 3 Bju-MIR167n PmiREN001600 MIR167 Brassica juncea Bju-LFQT01007331.1 17573 17715 + AACGGTGCACAGGTATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTAATTTCTCCGTTGATTTTATGACGATGGAAAAGAGATGAGTGTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCAATTGACTGTCGCACCCTTA ...(((((((((..(..((.(((((((((.((((((((((((((.((...((((.(((((((((((.((....)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).))..)..)))).))))).... 17593 17695 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTAATTTCTCCGTTGATTTTATGACGATGGAAAAGAGATGAGTGTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((.((...((((.(((((((((((.((....)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).. Bju-miR167n 17593 17613 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bju-miR167n* 17675 17695 GATCATGTTCGCAGTTTCACC 3 Bju-MIR167o PmiREN001601 MIR167 Brassica juncea Bju-LFQT01007331.1 24487 24629 - AACGGTGCACAGGTATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTAATTTCTCCGTTGATTTTATGACGATGGAAAAGAGATGAGTGTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCAATTGACTGTCGCACCCTTA ...(((((((((..(..((.(((((((((.((((((((((((((.((...((((.(((((((((((.((....)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).))..)..)))).))))).... 24507 24609 TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTAATTTCTCCGTTGATTTTATGACGATGGAAAAGAGATGAGTGTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACC (((((((((.((((((((((((((.((...((((.(((((((((((.((....)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).. Bju-miR167o 24589 24609 TGAAGCTGCCAGCATGATCTA Bju-miR167o* 24507 24527 GATCATGTTCGCAGTTTCACC 3 Bju-MIR168a PmiREN001602 MIR168 Brassica juncea Bju-CM007189.1 27044405 27044544 - GGTCACCGTCTGGCTTGGATTCGCTTGGTGCAGGCCGGGAACCAATTGTCTAACACATCCACCAAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAAATGAATCGGAGTCCTGATGGTGAAAT ..((((((((.(((((.((((((.((((((((((.(((((.((((((.(....((((.(((.(((((...))))).)))..))))....).)))))).))))).)))))))))).)))))).))).)).))))))))... 27044425 27044524 TCGCTTGGTGCAGGCCGGGAACCAATTGTCTAACACATCCACCAAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAAATGAAT (((.((((((((((.(((((.((((((.(....((((.(((.(((((...))))).)))..))))....).)))))).))))).)))))))))).))).. Bju-miR168a 27044504 27044524 TCGCTTGGTGCAGGCCGGGAA Bju-miR168a* 27044425 27044445 CCCGCCTTGCATCAAATGAAT 3 Bju-MIR168b PmiREN001603 MIR168 Brassica juncea Bju-CM007192.1 5749348 5749487 - GGTCACCGTCTGGCTTGGATTCGCTTGGTGCAGGCCGGGAACCAATTGTCTAACACATCCACCAAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAATTGAATCGGAGTCCTGAAGGTGAAAT ..(((((.((.(((((.((((((.((((((((((.(((((.((((((.(....((((.(((.(((((...))))).)))..))))....).)))))).))))).)))))))))).)))))).))).)).)).)))))... 5749368 5749467 TCGCTTGGTGCAGGCCGGGAACCAATTGTCTAACACATCCACCAAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAATTGAAT (((.((((((((((.(((((.((((((.(....((((.(((.(((((...))))).)))..))))....).)))))).))))).)))))))))).))).. Bju-miR168b 5749447 5749467 TCGCTTGGTGCAGGCCGGGAA Bju-miR168b* 5749368 5749388 CCCGCCTTGCATCAATTGAAT 3 Bju-MIR168c PmiREN001604 MIR168 Brassica juncea Bju-CM007192.1 5732930 5733069 + GGTCACCGTCTGGCTTGGATTCGCTTGGTGCAGGCCGGGAACCAATTGTCTAACACATCCACCAAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAAATGAATCGGAGTCCTGATGGTGAAAT ..((((((((.(((((.((((((.((((((((((.(((((.((((((.(....((((.(((.(((((...))))).)))..))))....).)))))).))))).)))))))))).)))))).))).)).))))))))... 5732950 5733049 TCGCTTGGTGCAGGCCGGGAACCAATTGTCTAACACATCCACCAAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAAATGAAT (((.((((((((((.(((((.((((((.(....((((.(((.(((((...))))).)))..))))....).)))))).))))).)))))))))).))).. Bju-miR168c 5732950 5732970 TCGCTTGGTGCAGGCCGGGAA Bju-miR168c* 5733029 5733049 CCCGCCTTGCATCAAATGAAT 3 Bju-MIR168d PmiREN001605 MIR168 Brassica juncea Bju-LFQT01009452.1 8110 8249 + GGTCACCGTCTGGCTTGGATTCGCTTGGTGCAGGCCGGGAACCAATTGTCTAACACATCCACCAAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAAATGAATCGGAGTCCTGATGGTGAAAT ..((((((((.(((((.((((((.((((((((((.(((((.((((((.(....((((.(((.(((((...))))).)))..))))....).)))))).))))).)))))))))).)))))).))).)).))))))))... 8130 8229 TCGCTTGGTGCAGGCCGGGAACCAATTGTCTAACACATCCACCAAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAAATGAAT (((.((((((((((.(((((.((((((.(....((((.(((.(((((...))))).)))..))))....).)))))).))))).)))))))))).))).. Bju-miR168d 8130 8150 TCGCTTGGTGCAGGCCGGGAA Bju-miR168d* 8209 8229 CCCGCCTTGCATCAAATGAAT 3 Bju-MIR168e PmiREN001606 MIR168 Brassica juncea Bju-CM007185.1 12480176 12480315 + AGTCACCGCCGGGCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGACTAATTCGCTGACACAGCCACGTGGATTTTCCTTATTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCTCGATGGTGAAAG ..((((((.(((((((.((((((.((((((((((.(((((((((((((((.(((.(((((...(((...)))....)))))))).)))..))))))).))))).)))))))))).)))))).))))).)).))))))... 12480196 12480295 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGACTAATTCGCTGACACAGCCACGTGGATTTTCCTTATTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((((((((((((.(((.(((((...(((...)))....)))))))).)))..))))))).))))).)))))))))).))).. 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Bju-miR168j 53149383 53149403 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAC Bju-miR168j* 53149463 53149483 CCCGCCTTGCATCAACTGAAT 3 Bju-MIR168k PmiREN001612 MIR168 Brassica juncea Bju-CM007200.1 5166676 5166816 + GTTTATCGGCGGTCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTGACACCGCCACGTGGATTTTCACGGTTGGCTTGTGAGCAGGGATCGGATCCTGCCTTCCATCAACTGAATCGGAGCCCGAGGTGAAAATA .((((((..(((.(((.((((((.((((((.(((.(((((.((((((.(((.(((..(((((((((....)))))..)))).))).)))...)))))).))))))))..)))))).)))))).))).))).)))))).... 5166696 5166796 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTGACACCGCCACGTGGATTTTCACGGTTGGCTTGTGAGCAGGGATCGGATCCTGCCTTCCATCAACTGAAT (((.((((((.(((.(((((.((((((.(((.(((..(((((((((....)))))..)))).))).)))...)))))).))))))))..)))))).))).. Bju-miR168k 5166696 5166716 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA Bju-miR168k* 5166776 5166796 CCTGCCTTCCATCAACTGAAT 3 Bju-MIR168l PmiREN001613 MIR168 Brassica juncea Bju-CM007201.1 31925545 31925685 - AGTCACCGTCGGGCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGGTTGTTTGACACATCCACAAGAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCATGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCCTGATGGTAAAAT ....((((((((((((.((((((.((((((((((.(((((.((((((......((((.(((((((.......)))).)))..))))......)))))).))))).)))))))))).)))))).)))))).))))))..... 31925565 31925665 TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGGTTGTTTGACACATCCACAAGAGTTTTACTTGCTGGTTTGTGAGCATGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT (((.((((((((((.(((((.((((((......((((.(((((((.......)))).)))..))))......)))))).))))).)))))))))).))).. 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Bju-miR169z 2701977 2701997 CAGCCAAGGATGACTTGCCGA Bju-miR169z* 2701900 2701920 GGCAAGTTGTCCTTGGCTATA 3 Bju-MIR169aa PmiREN001642 MIR169 Brassica juncea Bju-CM007199.1 2694534 2694671 - TAAGTGACCAAAGTAGTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATTTAAAATATCTGATAAGTATTTTGTTTCGTATTTTAAAGAAAAAAAATCATGATCGGCAAGTTGTCCTTGGCTATACGTTTCTTTGTGTCGCGCAT ...((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((((((((((((..(((((.....)))))..))))))))...............)))))))))))))))))))))).)))))).))))).))))).... 2694554 2694651 CAGCCAAGGATGACTTGCCGATTTAAAATATCTGATAAGTATTTTGTTTCGTATTTTAAAGAAAAAAAATCATGATCGGCAAGTTGTCCTTGGCTATA .((((((((((((((((((((((((((((((..(((((.....)))))..))))))))...............))))))))))))))))))))))... Bju-miR169aa 2694631 2694651 CAGCCAAGGATGACTTGCCGA Bju-miR169aa* 2694554 2694574 GGCAAGTTGTCCTTGGCTATA 3 Bju-MIR169ab PmiREN001643 MIR169 Brassica juncea Bju-CM007200.1 914739 914925 + GCGAACAGAGTCATGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTTTTGTAGGGTTTTGGATTATTATGCTTCTAAAGAGTATAGTAATTCAAAATCTTGTTGAATCTTTGTGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATCTTGACATGCTTTTTTCATCC (.(((.((((.((((((.((((((((((((.((((.(((((.....(((.((((.((.((((((((.......((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))).)))...))))))))))))))))))).)).)))))))))).)))..). 914759 914905 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTTTTGTAGGGTTTTGGATTATTATGCTTCTAAAGAGTATAGTAATTCAAAATCTTGTTGAATCTTTGTGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATC ((((((((((.((((.(((((.....(((.((((.((.((((((((.......((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))).)))...))))))))))))))))))).. Bju-miR169ab 914759 914779 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Bju-miR169ab* 914885 914905 CAGGCAGTCTCCTTGGCTATC 3 Bju-MIR169ac PmiREN001644 MIR169 Brassica juncea Bju-CM007200.1 12709745 12709938 + GAAGAAGAGAGTTGATATCTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGCTTAGTTCTTCTCAATGTTTCAGTCTTATGTTTTTTTTTAAAAAAAAATTAATAGCTAGCATTCTGATACCACATGTTATAGAGCTGACTGAATCTTGAGGTTTATGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATCTTAATATGCTTTCTTTAT .....................(((((((((((.((((.(((((......((...((((((.(.(((((((....((((((((....))))))))....(((((((((..((....)).)))))....))))))))))).)))))))...))....))))))))))))))))))))...........(.....). 12709765 12709918 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGCTTAGTTCTTCTCAATGTTTCAGTCTTATGTTTTTTTTTAAAAAAAAATTAATAGCTAGCATTCTGATACCACATGTTATAGAGCTGACTGAATCTTGAGGTTTATGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATC ((((((((((.((((.(((((......((...((((((.(.(((((((....((((((((....))))))))....(((((((((..((....)).)))))....))))))))))).)))))))...))....)))))))))))))))))))). Bju-miR169ac 12709765 12709785 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Bju-miR169ac* 12709898 12709918 CAGGCAGTCTCCTTGGCTATC 3 Bju-MIR169ad PmiREN001645 MIR169 Brassica juncea Bju-CM007200.1 16225033 16225169 - ATCAAAGAGAAGTTGTGTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTCTCAACACCATATCAAAGACTATCGGTAGTCTCTGATGAGTTGGTTAGTCGTTAGGCAGTCTCCTCGGCTATTCAGACAATTCTCTTTCTCCT ...((((((((.((((.((((((((.((((.((((.(((((((.((...((.(.(((((.((((((....)))))).))))).).))...)).)).))))))))))))).))))).))).))))))))))))..... 16225053 16225149 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTCTCAACACCATATCAAAGACTATCGGTAGTCTCTGATGAGTTGGTTAGTCGTTAGGCAGTCTCCTCGGCTATT (((((.((((.((((.(((((((.((...((.(.(((((.((((((....)))))).))))).).))...)).)).))))))))))))).))))).. 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Bju-miR169ae 36422921 36422941 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Bju-miR169ae* 36422837 36422857 TAGGCAGTCTCCTCGGCTATT 3 Bju-MIR169af PmiREN001647 MIR169 Brassica juncea Bju-CM007201.1 27395256 27395401 + AAGAATGAGTAGTTGTGTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTCTTACACCATATCTATCAAAGACATTAATGATCGGTAGTCTTTGATGAATTGGTTAGTTGGTAGGCAGTCTCCTTGGCTATTCAGACAATTCTCTTTCTCCT (((((.(((.((((((.(((((((((((((.((((.((((((...(((.((((..((.(((((((((..............)))))))))))..)))))))...)))))))))))))))))))).))).))))))))).))))..) 27395276 27395381 TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTCTTACACCATATCTATCAAAGACATTAATGATCGGTAGTCTTTGATGAATTGGTTAGTTGGTAGGCAGTCTCCTTGGCTATT ((((((((((.((((.((((((...(((.((((..((.(((((((((..............)))))))))))..)))))))...)))))))))))))))))))).. 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Bju-miR169ag 68107690 68107710 TAGCCAAGGATGACTTGCCTG Bju-miR169ag* 68107560 68107580 CAGGCAGTCTCCTTGGCTATT 3 Bju-MIR169ah PmiREN001649 MIR169 Brassica juncea Bju-LFQT01000766.1 64993 65138 - GAAGTAATAGAGAGTGGAATTGAGCCAAGGATGACTTGCCGGTTTAAAAACAACCGGTTGGTGGCTATTAATTGGTCACATACTCAGTCCGTTGATTTGTGACTGGCAGGTTGACCTTGGCTCTGTTTCGCTCTCTATTTCTCCAT (.((.(((((((((((((((.(((((((((..((((((((((((..(((.((((.((((((((((((.....))))))).....))).)))))).)))..))))))))))))..))))))))).))))))))))))))).)).).. 65013 65118 TGAGCCAAGGATGACTTGCCGGTTTAAAAACAACCGGTTGGTGGCTATTAATTGGTCACATACTCAGTCCGTTGATTTGTGACTGGCAGGTTGACCTTGGCTCTGT .(((((((((..((((((((((((..(((.((((.((((((((((((.....))))))).....))).)))))).)))..))))))))))))..)))))))))... 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Bju-miR172v 649197 649217 AGAATCTTGATGATGCTGCAT Bju-miR172v* 649278 649298 GCAGCACCATTAAGATTCACA 3 Bju-MIR319a PmiREN001687 MIR319 Brassica juncea Bju-CM007191.1 16058216 16058424 - GATGGGTTGGTGGAGGAAGAGAGCTTTCTTTGGTCCACTCATGGAGTAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCACATACCAAATGAAAGAATATGTTCCCATATGGTAAATGAATAAATGATTCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTTTTCTTTGTTTTCCAATATTT (.((((......(((((((((((((((((((((((((..(((((((......(((((((((((((..((((.((.(((((.((.((..(((((.(((...(((....))).))).)))))..)).)).))))).)).))))...))))))))).))))..)))))))..)))))))))))))))).)))))))))....)))).).... 16058236 16058404 GAGCTTTCTTTGGTCCACTCATGGAGTAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCACATACCAAATGAAAGAATATGTTCCCATATGGTAAATGAATAAATGATTCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTT (((((((((((((((((..(((((((......(((((((((((((..((((.((.(((((.((.((..(((((.(((...(((....))).))).)))))..)).)).))))).)).))))...))))))))).))))..)))))))..)))))))))))))))).).. Bju-miR319a 16058236 16058256 TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT Bju-miR319a* 16058384 16058404 GAGCTTTCTTTGGTCCACTCA 3 Bju-MIR319b PmiREN001688 MIR319 Brassica juncea Bju-CM007198.1 23844007 23844216 + GATGATGGATTGGTGAAGGAAGAGAGCTTTCTTTGGTCCACTCATGGAGTAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCACATACCAAATGAAAGAATATGTTCGCATATGGTAAATGAATGAATGATTCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGATTGGACTGAAGGGAGCTCCTTTTCTTTGTTTTCCAATAT .........((((.(((.((((((((((((((((((((((.((((((((......(((((((((((((..((((.((.((((((((.((..(((((.(((...(((....))).))).)))))..)).)))))))).)).))))...))))))))).))))..)))))))).)))))))))))))))))....))))).))).))))... 23844027 23844196 AGAGCTTTCTTTGGTCCACTCATGGAGTAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCACATACCAAATGAAAGAATATGTTCGCATATGGTAAATGAATGAATGATTCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGATTGGACTGAAGGGAGCTCCTT ((((((((((((((((((.((((((((......(((((((((((((..((((.((.((((((((.((..(((((.(((...(((....))).))).)))))..)).)))))))).)).))))...))))))))).))))..)))))))).)))))))))))))))))... Bju-miR319b 23844176 23844196 TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT Bju-miR319b* 23844027 23844047 AGAGCTTTCTTTGGTCCACTC 3 Bju-MIR319c PmiREN001689 MIR319 Brassica juncea Bju-CM007188.1 10915631 10915840 - TGCTGGGTTGGTGGGGGAAGGGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATAGAATAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATATGTAGACATATGGTAAATGAATGAATGATGCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTTTTATTTTCCTGTATTT (((.(((..(((((((((((((((((((((((((((((..((((((.......(((((((((((((..((((.(..((((((((.((..(((((.(((..............))).)))))..)).))))))))..).))))...))))))))).))))...))))))..)))))))))))))))))))))))))))))..))))))... 10915651 10915820 GGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATAGAATAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATATGTAGACATATGGTAAATGAATGAATGATGCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT ((((((((((((((((((..((((((.......(((((((((((((..((((.(..((((((((.((..(((((.(((..............))).)))))..)).))))))))..).))))...))))))))).))))...))))))..)))))))))))))))))).. Bju-miR319c 10915651 10915671 TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT Bju-miR319c* 10915800 10915820 GGAGCTTTCTTCGGTCCACTC 3 Bju-MIR319d PmiREN001690 MIR319 Brassica juncea Bju-CM007187.1 26296270 26296478 - AGGAAATATAGATAGGTAGGGAGCTTCCTTTAGTCCATTCACAGATCATGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATCCATCCAAATACCGAGTCACGAAAATTTCAACTTAGACTCGTTAAATGAATGAATGATGCGGTAGACAAATTGGTTCATTGATTTTCTCTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCCTTTCATTGTTCTAAAAT ..........((.(((.((((((((((((((((((((.(((.(((..((.(.((((.((((((.(((.(((..((((.(((.((..((.((((((.................)))))).))..)).))).))))..))).)).).)))))).))))).))..))).))).))))))))))))))))))))))).))............. 26296290 26296458 GAGCTTCCTTTAGTCCATTCACAGATCATGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATCCATCCAAATACCGAGTCACGAAAATTTCAACTTAGACTCGTTAAATGAATGAATGATGCGGTAGACAAATTGGTTCATTGATTTTCTCTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((.(((.(((..((.(.((((.((((((.(((.(((..((((.(((.((..((.((((((.................)))))).))..)).))).))))..))).)).).)))))).))))).))..))).))).))))))))))))))))).. 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Bju-miR319e 10921941 10921960 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Bju-miR319e* 10922088 10922108 GAGCTTTCTTCGGTCCACTCA 3 Bju-MIR319f PmiREN001692 MIR319 Brassica juncea Bju-CM007192.1 18512764 18512970 + ATGTGGAATCGATAGATAGAGAGCTTCCTTGAGTCCATTCACAGGTTGTGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATACCGAGTTACCAAAATTCAAACTAACTCGATAAATGAATGTATGATGCGGTGGACAAATTGGGTCATTGATTCTCTCTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCTTCTTTTGGTAGCTCCCT .......(((((.(((.((.((((((((((.((((((.(((.(((..((.(.(((((((((((.(((.(((..((((.(((.((..((.(((((((.............))))))).))..)).))).))))..))).)).).)))))))))))).))..))).))).)))))).)))))))))).))..))).)))))........ 18512784 18512950 GAGCTTCCTTGAGTCCATTCACAGGTTGTGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATACCGAGTTACCAAAATTCAAACTAACTCGATAAATGAATGTATGATGCGGTGGACAAATTGGGTCATTGATTCTCTCTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCC ((((((((((.((((((.(((.(((..((.(.(((((((((((.(((.(((..((((.(((.((..((.(((((((.............))))))).))..)).))).))))..))).)).).)))))))))))).))..))).))).)))))).)))))))))).. Bju-miR319f 18512931 18512950 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Bju-miR319f* 18512784 18512804 GAGCTTCCTTGAGTCCATTCA 3 Bju-MIR319g PmiREN001693 MIR319 Brassica juncea Bju-LFQT01000334.1 8259 8467 - AGGAAATATAGATAGGTAGGGAGCTTCCTTTAGTCCATTCACAGATCATGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATCCATCCAAATACCGAGTCACGAAAATTTCAACTTAGACTCGTTAAATGAATGAATGATGCGGTAGACAAATTGGTTCATTGATTTTCTCTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCCTTTCATTGTTCTAAAAT ..........((.(((.((((((((((((((((((((.(((.(((..((.(.((((.((((((.(((.(((..((((.(((.((..((.((((((.................)))))).))..)).))).))))..))).)).).)))))).))))).))..))).))).))))))))))))))))))))))).))............. 8279 8447 GAGCTTCCTTTAGTCCATTCACAGATCATGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATCCATCCAAATACCGAGTCACGAAAATTTCAACTTAGACTCGTTAAATGAATGAATGATGCGGTAGACAAATTGGTTCATTGATTTTCTCTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((.(((.(((..((.(.((((.((((((.(((.(((..((((.(((.((..((.((((((.................)))))).))..)).))).))))..))).)).).)))))).))))).))..))).))).))))))))))))))))).. 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Bju-miR319i 16287568 16287587 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Bju-miR319i* 16287420 16287440 GAGCTTCCTTGAGTCCATTCA 3 Bju-MIR319j PmiREN002683 MIR319 Brassica juncea Bju-CM007187.1 35394251 35394459 + TAGGAATATAGATAGATAGGGAGCTTCCTTTAGTCCATTCACAGATCATGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATACCAAGTCACCAAAATTTCTACTTAGACTTGTTAAATGAATGAATGATGCGGTAGACAAATTGGATCATTGATTCTCTTTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCCTTTTACTATTCTAAGAT ....................(((((((((((((((((.(((.(((..((.(.(((((((((((.(((.(((..((((((((.((..((.((((((.................)))))).))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))..))).))).)))))))))))))))))...................... 35394271 35394439 GAGCTTCCTTTAGTCCATTCACAGATCATGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATACCAAGTCACCAAAATTTCTACTTAGACTTGTTAAATGAATGAATGATGCGGTAGACAAATTGGATCATTGATTCTCTTTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((.(((.(((..((.(.(((((((((((.(((.(((..((((((((.((..((.((((((.................)))))).))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))..))).))).))))))))))))))))).. Bju-miR319j 35394420 35394439 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Bju-miR319j* 35394271 35394291 GAGCTTCCTTTAGTCCATTCA 3 Bju-MIR319k PmiREN002684 MIR319 Brassica juncea Bju-CM007196.1 57285048 57285254 + GGAATATATATATCGAGGGAGAGCTTCCTTGAGTCCATTCACAGGTTGTGATATGATCCAATTGGTTTCCGACTCATCCATCCAAATACCGAGTCACTAAAATTTAAGCTAGACTCGTTAAATGAATGAATGATGCGTAGACAAATTGGATTATTGATTCTCTTCGGTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCTCTTCGTATTATAATTTT ....................((((((((((.((((((.(((((...))))).(((((((((((.((((.((..((((.(((.((..((.((((((.((........))...)))))).))..)).))).))))..)).)))).)))))))))))(((......)))..)))))).))))))))))...................... 57285068 57285234 GAGCTTCCTTGAGTCCATTCACAGGTTGTGATATGATCCAATTGGTTTCCGACTCATCCATCCAAATACCGAGTCACTAAAATTTAAGCTAGACTCGTTAAATGAATGAATGATGCGTAGACAAATTGGATTATTGATTCTCTTCGGTTGGACTGAAGGGAGCTCCC ((((((((((.((((((.(((((...))))).(((((((((((.((((.((..((((.(((.((..((.((((((.((........))...)))))).))..)).))).))))..)).)))).)))))))))))(((......)))..)))))).)))))))))).. Bju-miR319k 57285215 57285234 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Bju-miR319k* 57285068 57285088 GAGCTTCCTTGAGTCCATTCA 3 Bju-MIR319l PmiREN002685 MIR319 Brassica juncea Bju-CM007199.1 35620895 35621102 + GATGGGTTGGTGGGGGAAGGGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATAGAATAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATATGTAGACATATGGTAAATGAATGAATGATGCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTTTTATTTTTCCTGTAT ....................(((((((((((((((((..((((((.......(((((((((((((..((((.(..((((((((.((..(((((.(((..............))).)))))..)).))))))))..).))))...))))))))).))))...))))))..)))))))))))))))))...................... 35620915 35621082 GAGCTTTCTTCGGTCCACTCATAGAATAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATATGTAGACATATGGTAAATGAATGAATGATGCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((..((((((.......(((((((((((((..((((.(..((((((((.((..(((((.(((..............))).)))))..)).))))))))..).))))...))))))))).))))...))))))..))))))))))))))))).. 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Bju-miR390d 29879337 29879357 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC Bju-miR390d* 29879387 29879407 CGCTGTCCATCCTGAGTTTCA 3 Bju-MIR390e PmiREN001699 MIR390 Brassica juncea Bju-CM007196.1 27604516 27604628 - AAAGTAGAGAAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATCATAATCTCATTCACATCGATATTTTTGGCGCTGTCCATCCTGAGTTTCATTGGCTCTCCTTACTGCAGT ....................((((((((((.(((((((((((.....(((...........))).....))))))))))).))))))))))....((....)).......... 27604536 27604608 AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATCATAATCTCATTCACATCGATATTTTTGGCGCTGTCCATCCTGAGTTTCA ((((((((((.(((((((((((.....(((...........))).....))))))))))).)))))))))).. 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Bju-miR393b 16889942 16889962 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Bju-miR393b* 16890050 16890070 ATCATGCGATCTCTTCGGATT 3 Bju-MIR393c PmiREN001712 MIR393 Brassica juncea Bju-CM007197.1 66122908 66123068 + CTTCCAGCAACTAGAGAAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCAGATTAAGCTGAATTATTCAATATTTTCTTTTTCATCAATCGAGTAAGATGAAACAAGAAATTTGCTTCTTTTCTGGATCATGCGATCTCATTCGGATTCATCTCTTTGGTAGCTTC .....(((.((((((((..((((((((.((((((((((.((((((((..((((((((...))))....(((((((((((((..........))))))).))))))...))))....)))))))))))))))))).)).))))))...)))))))).))).. 66122928 66123048 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCAGATTAAGCTGAATTATTCAATATTTTCTTTTTCATCAATCGAGTAAGATGAAACAAGAAATTTGCTTCTTTTCTGGATCATGCGATCTCATTCGGATT (((((.((((((((((.((((((((..((((((((...))))....(((((((((((((..........))))))).))))))...))))....)))))))))))))))))).)).))))) Bju-miR393c 66122928 66122949 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Bju-miR393c* 66123028 66123048 TCATGCGATCTCATTCGGATT 3 Bju-MIR393d PmiREN001713 MIR393 Brassica juncea Bju-CM007197.1 73548704 73548875 + CTCATAGCAACTAGAGAAAGTATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGCTGAATTTATTCCCAATAATTGTTAAATTTTTCTCATTATAAAGATAGAAAAAAGTCCCAAAAATCTGCTTCGTTTTCAGGATCATGCGATCTATTTGGATTCATCCTTTGGTTGCTTCC .....(((((((((((.....(((((((.(((((((((.(((((((((.((((.((.(((...........(((.....(((((((.(((.....)))))))))).....)))))))).)))).)))...))))))))))))))).))))))).....)))))))))))... 73548724 73548855 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGCTGAATTTATTCCCAATAATTGTTAAATTTTTCTCATTATAAAGATAGAAAAAAGTCCCAAAAATCTGCTTCGTTTTCAGGATCATGCGATCTATTTGGATT ((((((.(((((((((.(((((((((.((((.((.(((...........(((.....(((((((.(((.....)))))))))).....)))))))).)))).)))...))))))))))))))).))))))). Bju-miR393d 73548724 73548745 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Bju-miR393d* 73548835 73548855 ATCATGCGATCTATTTGGATT 3 Bju-MIR393e PmiREN001714 MIR393 Brassica juncea Bju-CM007198.1 21839218 21839379 - CGCAGCAACTAGAGAAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAGTCAAGCTGAGTTATTATTTTTACTTTTTCTCGTCGAAAGATGGAAAACAATCCCAAAAATTTGCTTCGTTTTCTGGATCATGCGATCTCTTCGGATTCATCCTTTGGTAGCTTCCAC ...(((.(((((((...((((((.((((((((((((.(((((.((..((((.((((....((((((...(((((.((((....))))))))).......))))))..)))).)))).))))))))))))))))))).))))))...))))))).)))..... 21839238 21839359 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAGTCAAGCTGAGTTATTATTTTTACTTTTTCTCGTCGAAAGATGGAAAACAATCCCAAAAATTTGCTTCGTTTTCTGGATCATGCGATCTCTTCGGATT (((.((((((((((((.(((((.((..((((.((((....((((((...(((((.((((....))))))))).......))))))..)))).)))).))))))))))))))))))).))).. Bju-miR393e 21839339 21839359 TCCAAAGGGATCGCATTGATC Bju-miR393e* 21839238 21839258 ATCATGCGATCTCTTCGGATT 3 Bju-MIR393f PmiREN001715 MIR393 Brassica juncea Bju-CM007198.1 2812578 2812738 - CATAGCAACTAGAGGAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGGTGAATTATCCCTATTATTTTCTTGGTTATTGGCAAAAGAAGTACCAGAAAAAATATTGGTTAATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGAATTCATCCTTCGGTAGCTTCCTC ...(((.(((.(((((.((((.(((((((((.((((.(((((..........((((((.((.((((.((((((.(((..((........))..)))))))))))))..)).)))))).))))))))).))))))))).)))).))))).))).)))..... 2812598 2812718 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGGTGAATTATCCCTATTATTTTCTTGGTTATTGGCAAAAGAAGTACCAGAAAAAATATTGGTTAATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGAATT (.(((((((((.((((.(((((..........((((((.((.((((.((((((.(((..((........))..)))))))))))))..)).)))))).))))))))).))))))))).).. Bju-miR393f 2812697 2812718 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Bju-miR393f* 2812598 2812618 ATCATGCTATCCCTTTGAATT 3 Bju-MIR393g PmiREN001716 MIR393 Brassica juncea Bju-CM007199.1 48714371 48714527 + TTCATAGCAACTAGAGGAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGTAAGGTGAATTATCACAATGATTTTCTTAATTATTGGCAAAAGAAATCCCAAAAATTTGCTTGGCTTTGGATCATGCTATCCCTTTCGATTCATCCTTCGGTAGCTTCC .....(((.(((.(((((.(((((.((((((((.((((.(((((.((((.(((((((((....((((((((.....)))))))).................))))))))).)))).))))))))).)))))))).))))).))))).))).)))... 48714391 48714507 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAAGTAAGGTGAATTATCACAATGATTTTCTTAATTATTGGCAAAAGAAATCCCAAAAATTTGCTTGGCTTTGGATCATGCTATCCCTTTCGATT ((.((((((((.((((.(((((.((((.(((((((((....((((((((.....)))))))).................))))))))).)))).))))))))).)))))))).)))) Bju-miR393g 48714391 48714412 TCCAAAGGGATCGCATTGATCC Bju-miR393g* 48714487 48714507 ATCATGCTATCCCTTTCGATT 3 Bju-MIR393h PmiREN001717 MIR393 Brassica juncea Bju-CM007188.1 3629105 3629266 - CACAGCAACTAGAGAAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCAAATTAAGCTGAATTATTCCCCAATAGTTATTCTTTTTCTCAATCGAAAGATGAAAAGAAGACTTGCTTCATTTTCTGGATCATGCGATCTCATTGGATTCATTCTTTGGTAGCTTCCAT ...(((.(((((((((.((((((((.((((((((((.(((((((((.((((..(((((((....)))))))..(((((((.(((.((....))))).)))))))...)))).)))...)))))))))))))))).)))))))).))))))))).)))..... 3629125 3629246 TCCAAAGGGATCGCATTGATCCAAATTAAGCTGAATTATTCCCCAATAGTTATTCTTTTTCTCAATCGAAAGATGAAAAGAAGACTTGCTTCATTTTCTGGATCATGCGATCTCATTGGATT (((((.((((((((((.(((((((((.((((..(((((((....)))))))..(((((((.(((.((....))))).)))))))...)))).)))...)))))))))))))))).))))).. 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Bju-miR395d 16899479 16899499 CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC Bju-miR395d* 16899552 16899572 GTTCCCTTTAACGCTTCATTG 3 Bju-MIR395e PmiREN001734 MIR395 Brassica juncea Bju-CM007201.1 16908647 16908767 + AGCGTCAAATGTCCCCTTGAGTTCCCTGAAACGCTTCATTGTTCATTACGTAGATGTTTAGTAAATCAATCTAATGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTCTAGGTGGTATATTGACACCG (...).........(((.(((((((((.((((((((((.(((((((((.((.(((.........))).)).))))))))).)))))))))).))))))))).)))................ 16908667 16908747 GTTCCCTGAAACGCTTCATTGTTCATTACGTAGATGTTTAGTAAATCAATCTAATGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTC (((((((.((((((((((.(((((((((.((.(((.........))).)).))))))))).)))))))))).))))))).. 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Bju-miR395k 25965594 25965614 CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC Bju-miR395k* 25965509 25965529 GTTCCCTTTAACGCTTCATTG 3 Bju-MIR396a PmiREN001739 MIR396 Brassica juncea Bju-CM007192.1 7824015 7824166 - TGAAGATCCTGGTTATATTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTTTCATTTCCCTTATTTAGAGCCAAAATAACTAAAAATCTCTAACATTTAACACTAGAAAAAAAAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGACATTTCAGGGTTTT ......((((((((((.((((((((((((((((((((.((((.((((((...........((((((.................))))))............)))))).)))).)))))))))))))))))))).)))))....))))).... 7824035 7824146 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTTTCATTTCCCTTATTTAGAGCCAAAATAACTAAAAATCTCTAACATTTAACACTAGAAAAAAAAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA (((((((((((((((((.((((.((((((...........((((((.................))))))............)))))).)))).))))))))))))))))).. 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Bju-miR398d 2830637 2830657 TGTGTTCTCAGGTCACCCCTG Bju-miR398d* 2830563 2830583 GGGTCGACATGAGAACACATG 3 Bju-MIR398e PmiREN001750 MIR398 Brassica juncea Bju-CM007200.1 1376881 1377004 - ACAACAGGTGAAATCTCAAAAGAGTGTCATGAGAACACGGATCCTCTGGTTTCTTTAAGATTTCCACTGAAACCATTGAGTTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGAAGCTCCCCTGTTCCATC ...............(((((.(.(((.(.((((((((((((..((((((((((...............)))))))..))).)))))))))))).).))).).)))))(((......)))..... 1376901 1376984 AGAGTGTCATGAGAACACGGATCCTCTGGTTTCTTTAAGATTTCCACTGAAACCATTGAGTTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTT .(.(((.(.((((((((((((..((((((((((...............)))))))..))).)))))))))))).).))).)... Bju-miR398e 1376901 1376921 TGTGTTCTCAGGTCACCCCTT Bju-miR398e* 1376964 1376984 AGAGTGTCATGAGAACACGGA 3 Bju-MIR398f PmiREN001751 MIR398 Brassica juncea Bju-CM007202.1 57719485 57719619 + AAAGGTAGAGGATCTCGACAGGGTCGATATGAGAACACATGTGCAGTCAACGGCTGTAATGACACCACGTCATTATTGCATATCCATCTTTTCATGTGTTCTCAGGTCACCCCTGCTGAGCTCTTTCTCTACCCT ...(((((((((.((((.(((((..(((.((((((((((((...((......((.((((((((.....)))))))).))........))...)))))))))))).)))..))))).))))....))))))))).. 57719505 57719599 GGGTCGATATGAGAACACATGTGCAGTCAACGGCTGTAATGACACCACGTCATTATTGCATATCCATCTTTTCATGTGTTCTCAGGTCACCCCTG (((..(((.((((((((((((...((......((.((((((((.....)))))))).))........))...)))))))))))).)))..))).. 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Bju-miR827b 76691137 76691157 TTAGATGACCATCAACAAATA Bju-miR827b* 76691082 76691102 TTTGTTGATTGACATCTATGC 3 Bju-MIR845 PmiREN001775 MIR845 Brassica juncea Bju-CM007196.1 49959771 49959889 + ATCGCCTCGTTTTCATCACGTCGATTGGTGTCAAAGCCATGCTAATTAACTCTCTGTCAGTCAAAGAGGAATTTTGCACGGCTCTGATACCAGTTGATGCAATGGAAACATGGATTAAG ....((..((((((((..(((((((((((((((.((((.(((.((((..((((.((.....)).)))).))))..))).)))).)))))))))))))))..))))))))..))...... 49959791 49959869 TCGATTGGTGTCAAAGCCATGCTAATTAACTCTCTGTCAGTCAAAGAGGAATTTTGCACGGCTCTGATACCAGTTGATG (((((((((((((.((((.(((.((((..((((.((.....)).)))).))))..))).)))).))))))))))))).. 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Bju-miR860 73676810 73676830 TCACTAGATTGGACTATATAT Bju-miR860* 73676873 73676893 ATGTAGTCCAATCTATTGAAG 3 Bju-MIR1140 PmiREN001478 MIR1140 Brassica juncea Bju-CM007187.1 971176 971335 + TTCTCTCAATCTTTTATATGGCTCCGATTGGCTTTAGGCTGTTGTGGCTTTGACTTCTTTCTAAAGTCTTCAAAATTTAGTTTTTCACAATCACGTTAAATTTTTTTAAAAGTCACAGCCACAACAGCCTAAACCAATCGGAGCCATGGTGATGAGTTCT ....((((.((.....(((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((....(((((..........)))))...............(((((....))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))).... 971196 971315 CCGATTGGCTTTAGGCTGTTGTGGCTTTGACTTCTTTCTAAAGTCTTCAAAATTTAGTTTTTCACAATCACGTTAAATTTTTTTAAAAGTCACAGCCACAACAGCCTAAACCAATCGGAG ((((((((.(((((((((((((((((.((((((....(((((..........)))))...............(((((....))))))))))).))))))))))))))))))))))))))) 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Bju-miR6028 24419349 24419370 TGGAGAGTAAAGACATTCAGAT Bju-miR6028* 24419267 24419287 CTGAATGTCTTTCTCTTCATC 3 Bju-MIR6029 PmiREN001770 MIR6029 Brassica juncea Bju-CM007189.1 34463143 34463267 + AAAAGAGATACACAAGCCAAGCCTGAAGTAAACAATCCCAACAGATTACAAATCATTTGGCCTTGAATTTCATTTGTAATATGTTGGGGTTGTGATTTCAGGCTTGGCTTGTGTATCTTTTTTTA (((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((.(((((((((.((((......))))...))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).. 34463163 34463247 GCCTGAAGTAAACAATCCCAACAGATTACAAATCATTTGGCCTTGAATTTCATTTGTAATATGTTGGGGTTGTGATTTCAGGCTT (((((((((..((((((((((((.(((((((((.((((......))))...))))))))).)))))))))))).))))))))).. Bju-miR6029 34463227 34463247 TGGGGTTGTGATTTCAGGCTT Bju-miR6029* 34463163 34463183 GCCTGAAGTAAACAATCCCAA 3 Bju-MIR6030a PmiREN001771 MIR6030 Brassica juncea Bju-CM007190.1 11391460 11391597 + GATGGTTTCAGGGATTAAGTGTCTGTATGTGTGGGCTGAGTAGGCACATTCACAGCTTTTACTCAGATCTGGTTGTGAATGGAGGATTATACCTTCTCCACCCATACCATACAGACCCTTAATACTGAATCCAAAGCT .......((((..((((((.(((((((((((((((..(((.(((..(((((((((((.............)))))))))))..........))).)))..)))))).))))))))).)))))).)))).......... 11391480 11391577 GTCTGTATGTGTGGGCTGAGTAGGCACATTCACAGCTTTTACTCAGATCTGGTTGTGAATGGAGGATTATACCTTCTCCACCCATACCATACAGACCC (((((((((((((((..(((.(((..(((((((((((.............)))))))))))..........))).)))..)))))).))))))))).. Bju-miR6030a 11391556 11391577 TCCACCCATACCATACAGACCC Bju-miR6030a* 11391480 11391500 GTCTGTATGTGTGGGCTGAGT 3 Bju-MIR6030b PmiREN001772 MIR6030 Brassica juncea Bju-CM007197.1 28153069 28153239 - GATGGTTTCAGGGATTAAGTGTCTGTATGTATGGGTTGAGTAGGCACAATCACATCTTTTACTCTGATGGTCAAAAGTACAGATGATGGATTTTGTGATCTGGTTGCTGCTTTTGAGGATTTTGCCTTCTCCACCCATACCGTACAGACCCTTAATTCTGAATCCAAAGCT .............((((((.((((((((((((((((.(((.(((((.((((.((((.........)))).((((((((((((((.(((.....))).))))).....))))))))).)))).))))).))).))))))).))))))))).))))))............... 28153089 28153219 GTCTGTATGTATGGGTTGAGTAGGCACAATCACATCTTTTACTCTGATGGTCAAAAGTACAGATGATGGATTTTGTGATCTGGTTGCTGCTTTTGAGGATTTTGCCTTCTCCACCCATACCGTACAGACCC ((((((((((((((((.(((.(((((.((((.((((.........)))).((((((((((((((.(((.....))).))))).....))))))))).)))).))))).))).))))))).))))))))).. Bju-miR6030b 28153089 28153110 TCCACCCATACCGTACAGACCC Bju-miR6030b* 28153199 28153219 GTCTGTATGTATGGGTTGAGT 3 Bju-MIR9552a PmiREN001777 MIR9552 Brassica juncea Bju-CM007193.1 28741189 28741353 - ACGCTGTTGTTGTCAGTAGACTATCGGTCTACTCGGTCAGCGCTAGCTTCTTCCTCACCGGACAGGCTAAACTTCTGCAGCTTCTCCACTAGATTAGTCTGTCCGGTGATGAAGAAGCTAGCGCTGACCGAGTAGACCGATAGTCTGCTGACAACAACAGCCAAC .....((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.((..((.((...)).))..)).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....... 28741209 28741333 CTATCGGTCTACTCGGTCAGCGCTAGCTTCTTCCTCACCGGACAGGCTAAACTTCTGCAGCTTCTCCACTAGATTAGTCTGTCCGGTGATGAAGAAGCTAGCGCTGACCGAGTAGACCGATAGTC (((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.((..((.((...)).))..)).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).. Bju-miR9552a 28741209 28741229 TGACCGAGTAGACCGATAGTC Bju-miR9552a* 28741313 28741333 CTATCGGTCTACTCGGTCAGC 3 Bju-MIR9552b PmiREN001778 MIR9552 Brassica juncea Bju-LFQT01002446.1 170301 170465 - TGGCTGTTGTTGTCAGCAGACTATCGGTCTACTCGGTCAGCGCTAGCTTCTTCATCACCGGACAGACTAATCTAGTGGAGAAGCTGCAGAAGTTTAGCCTGTCCGGTGAGGAAGAAGCTAGCGCTGACCGAGTAGACCGATAGTCTACTGACAACAACAGCGTCA ..((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((.((..((.((...)).))..)).)))).))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).... 170321 170445 CTATCGGTCTACTCGGTCAGCGCTAGCTTCTTCATCACCGGACAGACTAATCTAGTGGAGAAGCTGCAGAAGTTTAGCCTGTCCGGTGAGGAAGAAGCTAGCGCTGACCGAGTAGACCGATAGTC (((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((.((..((.((...)).))..)).)))).))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).. Bju-miR9552b 170321 170341 TGACCGAGTAGACCGATAGTC Bju-miR9552b* 170425 170445 CTATCGGTCTACTCGGTCAGC 3 Bju-MIR9557 PmiREN001779 MIR9557 Brassica juncea Bju-CM007191.1 1218447 1218623 - GTCTTTACAGTTCACACTGATTTTGCGTTTCAACTCGGTCCTCATTTCTTTATAACGAAGTGGAGGAACAAAAAGATGTTTTCAGAAGAACATTGAAGAGGAAGAGAATGAAAGCTGCAAGTTAAAAGAAATGAGGGCTGAGTTGGAACACAAAATCTTTGAACTAAGAGACAAGAT ((((((..((((((....(((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((...((((...............(((((((.......)))))))...............))))..))))))))))))))))))))))))))))).)))))))..)))))).))))))..... 1218467 1218603 TTTTGCGTTTCAACTCGGTCCTCATTTCTTTATAACGAAGTGGAGGAACAAAAAGATGTTTTCAGAAGAACATTGAAGAGGAAGAGAATGAAAGCTGCAAGTTAAAAGAAATGAGGGCTGAGTTGGAACACAAAATC (((((.(((((((((((((((((((((((((.((((...((((...............(((((((.......)))))))...............))))..))))))))))))))))))))))))))))).))))).. 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Bju-miR9558 26468502 26468522 AGAGATGTCTGGCTTGCAACA Bju-miR9558* 26468415 26468435 GCAAGCCAGACATTTTCCTTT 3 Bju-MIRN251a PmiREN001781 MIRN251 Brassica juncea Bju-CM007186.1 7642552 7642796 + TCTTGCCGAGATCATCAACTCCGACAAAATGAAGGTCCATGGGGAATTGCACATCAACGCGAATCAGGTTACAATGCTGTAGCGTCACACACCTCACCATATTTGATGCGGCGTCTTTCTTGAAAGAGCTGGCACAGTAGATGGTGGGAAATGTCGCGACCCTCACGCATCGTAGTTTGATTCTTGGTGACGTGCTATTTCTTGTAGACTTACATCTTGTCGGAGTTTATGATCTCTGCGCGCAA ...(((.((((((((.(((((((((((.(((.(((((.(((((((((.((((.(((.((.((((((((((((.((((((.((.(((.((((.((((((((..(((.((((((.(((((....)))))))).))))))...))))))))...))).).))).)))).)))).)))))))))))).)).))).)))).))))))))).))))).))).))))))))))).)))))))).)))..... 7642572 7642776 CCGACAAAATGAAGGTCCATGGGGAATTGCACATCAACGCGAATCAGGTTACAATGCTGTAGCGTCACACACCTCACCATATTTGATGCGGCGTCTTTCTTGAAAGAGCTGGCACAGTAGATGGTGGGAAATGTCGCGACCCTCACGCATCGTAGTTTGATTCTTGGTGACGTGCTATTTCTTGTAGACTTACATCTTGTCGGAG (((((((.(((.(((((.(((((((((.((((.(((.((.((((((((((((.((((((.((.(((.((((.((((((((..(((.((((((.(((((....)))))))).))))))...))))))))...))).).))).)))).)))).)))))))))))).)).))).)))).))))))))).))))).))).))))))).. Bju-miRN251a 7642756 7642776 TAGACTTACATCTTGTCGGAG Bju-miRN251a* 7642572 7642592 CCGACAAAATGAAGGTCCATG 3 Bju-MIRN251b PmiREN001789 MIRN251 Brassica juncea Bju-CM007186.1 7653190 7653434 + TCTTGCCGAGATCATCAACTCCGACAAAATGAAGGTCCATGGGGAATTGCACATCAACGCGAATCAGGTTACAATGCTGTAGCGTCACACACCTCACCATATTTGATGCGGCGTCTTTCTTGAAAGAGCTGGCACAGTAGATGGTGGGAAATGTCGCGACCCTCACGCATCGTAGTTTGATTCTTGGTGACGTGCTATTTCTTGTAGACTTACATCTTGTCGGAGTTTATGATCTCTGCGCGCAA ...(((.((((((((.(((((((((((.(((.(((((.(((((((((.((((.(((.((.((((((((((((.((((((.((.(((.((((.((((((((..(((.((((((.(((((....)))))))).))))))...))))))))...))).).))).)))).)))).)))))))))))).)).))).)))).))))))))).))))).))).))))))))))).)))))))).)))..... 7653210 7653414 CCGACAAAATGAAGGTCCATGGGGAATTGCACATCAACGCGAATCAGGTTACAATGCTGTAGCGTCACACACCTCACCATATTTGATGCGGCGTCTTTCTTGAAAGAGCTGGCACAGTAGATGGTGGGAAATGTCGCGACCCTCACGCATCGTAGTTTGATTCTTGGTGACGTGCTATTTCTTGTAGACTTACATCTTGTCGGAG (((((((.(((.(((((.(((((((((.((((.(((.((.((((((((((((.((((((.((.(((.((((.((((((((..(((.((((((.(((((....)))))))).))))))...))))))))...))).).))).)))).)))).)))))))))))).)).))).)))).))))))))).))))).))).))))))).. Bju-miRN251b 7653394 7653414 TAGACTTACATCTTGTCGGAG Bju-miRN251b* 7653210 7653230 CCGACAAAATGAAGGTCCATG 3 Bju-MIRN252a PmiREN001782 MIRN252 Brassica juncea Bju-CM007200.1 10361892 10362077 - GTAAATGTATCCTTGTCTTCGCCTTCTTGAAATTCTAAATCGTCATAATGACTGAATATTGATCGTTCATTTTCGACAATCATATTATGGAGTATGATGAATGCTCTCGTAATATTTGATATTTTTCCTTTATCCCATAACCTAGATGGATTTTTGACAACGGCAAATCTTGCTTGCAAAACTCCG ....................(((((.((((((.((((....((((...)))).....((((.(((........))))))).((((((((((((((.....)))))).))))))))..((((.........))))............)))).)))))).)).)))...................... 10361912 10362057 GCCTTCTTGAAATTCTAAATCGTCATAATGACTGAATATTGATCGTTCATTTTCGACAATCATATTATGGAGTATGATGAATGCTCTCGTAATATTTGATATTTTTCCTTTATCCCATAACCTAGATGGATTTTTGACAACGGCAA (((((.((((((.((((....((((...)))).....((((.(((........))))))).((((((((((((((.....)))))).))))))))..((((.........))))............)))).)))))).)).))).. Bju-miRN252a 10361912 10361932 ATGGATTTTTGACAACGGCAA Bju-miRN252a* 10362037 10362057 GCCTTCTTGAAATTCTAAATC 3 Bju-MIRN252b PmiREN002689 MIRN252 Brassica juncea Bju-CM007200.1 13953230 13953446 + TGTACTGCCGAGATTCGAAGGCATGTTGACGGAAAATGTATCCACTTCTTCTCTTTCTTGAAACTCAAATTTGTTAAACTGAGTGAATGATGAGCGTTCATCTTCGACAATCATATTATGGAGTATGATACATGCTCTCATAATATTTCCTATTTTCTCTTTATCCCATAACTTAGATGGATTTTTGACAACGGCAAATCTTGCTTGCAGGACTCCG ....................((.(((((...((((((.((((......(((........)))(((((............)))))(((.(((((....)))))))).......(((((((((((((((...))))))).)))))))).............................)))).))))))..)))))))...................... 13953250 13953426 GCATGTTGACGGAAAATGTATCCACTTCTTCTCTTTCTTGAAACTCAAATTTGTTAAACTGAGTGAATGATGAGCGTTCATCTTCGACAATCATATTATGGAGTATGATACATGCTCTCATAATATTTCCTATTTTCTCTTTATCCCATAACTTAGATGGATTTTTGACAACGGCAA ((.(((((...((((((.((((......(((........)))(((((............)))))(((.(((((....)))))))).......(((((((((((((((...))))))).)))))))).............................)))).))))))..))))))).. Bju-miRN252b 13953406 13953426 ATGGATTTTTGACAACGGCAA Bju-miRN252b* 13953250 13953270 GCATGTTGACGGAAAATGTAT 3 Bju-MIRN253a PmiREN001783 MIRN253 Brassica juncea Bju-LFQT01008883.1 278684 278778 - ACGACGGCAAATCTAGCTTGCAGGACTCCAAAGGCACGCTCAACATCTTTTCGCACAGCTTCTTGGGTTTTAGCATATAATGAATGCTTCTGACT ..((.((((.........((((((((.((((((((..((.............))...)))).))))))))).))).........))))))..... 278704 278758 CAGGACTCCAAAGGCACGCTCAACATCTTTTCGCACAGCTTCTTGGGTTTTAGCA ((((((.((((((((..((.............))...)))).))))))))).).. Bju-miRN253a 278738 278758 CAGGACTCCAAAGGCACGCTC Bju-miRN253a* 278704 278724 ACAGCTTCTTGGGTTTTAGCA 3 Bju-MIRN253b PmiREN001825 MIRN253 Brassica juncea Bju-CM007195.1 11444598 11444692 + TAACGACGGCAAATCTAGCTTGCAGGACTCCAAAGGCACGCTCAACATCTTTTCGCACAGCTTCTTGGGTTTTAGCAAATAATGAATGCTTCTGA ...................(((((((((.((((((((..((.............))...)))).))))))))).))))................. 11444618 11444672 CAGGACTCCAAAGGCACGCTCAACATCTTTTCGCACAGCTTCTTGGGTTTTAGCA ((((((.((((((((..((.............))...)))).))))))))).))) Bju-miRN253b 11444618 11444638 CAGGACTCCAAAGGCACGCTC Bju-miRN253b* 11444652 11444672 ACAGCTTCTTGGGTTTTAGCA 3 Bju-MIRN254 PmiREN001784 MIRN254 Brassica juncea Bju-CM007185.1 38695977 38696128 + CTGAGTCGTTGTGGTGAGATAGTGGCGTATTCACTACAATCTAACCGGGGTTTGCGTAGGCGTCACAAATATCAGGCCGATTGTGTCTGTGTCGACTCTACTCGGAATGGTAGTAGTGATTATTGCCGCTATCCCACCAAATCGACTGCTGC ...(((((...(((((.((((((((((((.(((((((.(((...((((.......(((((.((((((.....((((((....).)))))))).))))))))))))...))).))))))).)).)))))))))).)))))...)))))..... 38695997 38696108 AGTGGCGTATTCACTACAATCTAACCGGGGTTTGCGTAGGCGTCACAAATATCAGGCCGATTGTGTCTGTGTCGACTCTACTCGGAATGGTAGTAGTGATTATTGCCGCTAT (((((((((.(((((((.(((...((((.......(((((.((((((.....((((((....).)))))))).))))))))))))...))).))))))).)).))))))).. 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Bju-miRN255 40230657 40230677 TGAAGGAATAGAGAGTGGAAT Bju-miRN255* 40230785 40230805 TTCGTTCTCTATTTCTCCATG 3 Bju-MIRN256a PmiREN001786 MIRN256 Brassica juncea Bju-CM007185.1 9049713 9049839 + AACAAGAAGAGGGTAGAAATATCTGCCGACTCATCCATCCAAACACTTCTGGTAAAAAGACAAGAGATTTTAAACCACAGTGGCTGTGTGAATGATGCGGGAGATGTTTTCATCTCTCTTTATCTGT ......(((((((..(((((((((.(((..((((.(((.((..((((..((((..((((........))))..)))).))))..)).))).))))..))).)))))))))...)))))))....... 9049733 9049819 ATCTGCCGACTCATCCATCCAAACACTTCTGGTAAAAAGACAAGAGATTTTAAACCACAGTGGCTGTGTGAATGATGCGGGAGATGT ((((.(((..((((.(((.((..((((..((((..((((........))))..)))).))))..)).))).))))..))).)))).. 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Bju-miRN261g 56871026 56871046 TAACAATTAGTTCGGGAATAA Bju-miRN261g* 56871155 56871175 ATTCCCGAACTTATTGTTTAC 3 Bju-MIRN261h PmiREN001812 MIRN261 Brassica juncea Bju-CM007202.1 12660416 12660605 + AGTATTGCTTGCGCAAATTTATTCCCGAACTTATTGTTTACTGTGCAAAATTGGCCACAAAATAGTCAACAGTTAAAGTCTAAATGGAAAGTTAACGATTTCCGTCTAATTTTTAACGGTTGAATATTTCAAACCCAATTTTGCGCAGTTAACAATTAGTTCGGGAATAATTATGCATAATTAATACTTG (((((((.(((.(((...(((((((((((((.((((((.(((((((((((((((.....(((((.(((((.(((((((.....(((((((........))))))).....))))))).))))).))))).....))))))))))))))).)))))).)))))))))))))...))).))).))))))).. 12660436 12660585 ATTCCCGAACTTATTGTTTACTGTGCAAAATTGGCCACAAAATAGTCAACAGTTAAAGTCTAAATGGAAAGTTAACGATTTCCGTCTAATTTTTAACGGTTGAATATTTCAAACCCAATTTTGCGCAGTTAACAATTAGTTCGGGAATAA (((((((((((.((((((.(((((((((((((((.....(((((.(((((.(((((((.....(((((((........))))))).....))))))).))))).))))).....))))))))))))))).)))))).))))))))))).. 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Bju-miRN261l 316108 316128 TAACAATTAGTTCGGGAATAA Bju-miRN261l* 315979 315999 ATTCCCGAACTTATTGTTTAC 3 Bju-MIRN261m PmiREN001819 MIRN261 Brassica juncea Bju-LFQT01004271.1 158018 158207 + AGTATTGCTTGCGCAAATTTATTCCTGAACTTATTGTTGACTGCGTAAAATTGGTCACGAAATAGTCAACCGTTAAAGTCTAAACGGAAAGTTAACGATTTATGTCCAATTTTTAACGGTCGAATATTTCAAACCCAATTTTGCGCAGTTAACAATTAGTTCGGGAATAATTCTGCGCAATTAATACTTG (((((((.(((((((...(((((((((((((.((((((((((((((((((((((....((((((.((.((((((((((.....(((..(((((...))))).))).....)))))))))).)).))))))....)))))))))))))))))))))).)))))))))))))...))))))).))))))).. 158038 158187 ATTCCTGAACTTATTGTTGACTGCGTAAAATTGGTCACGAAATAGTCAACCGTTAAAGTCTAAACGGAAAGTTAACGATTTATGTCCAATTTTTAACGGTCGAATATTTCAAACCCAATTTTGCGCAGTTAACAATTAGTTCGGGAATAA (((((((((((.((((((((((((((((((((((....((((((.((.((((((((((.....(((..(((((...))))).))).....)))))))))).)).))))))....)))))))))))))))))))))).))))))))))).. Bju-miRN261m 158167 158187 TAACAATTAGTTCGGGAATAA Bju-miRN261m* 158038 158058 ATTCCTGAACTTATTGTTGAC 3 Bju-MIRN261n PmiREN001822 MIRN261 Brassica juncea Bju-LFQT01008050.1 15260 15449 + AGTATTGCTTGCACAAATTTATTCCCGAACTTATTGTTTACTGTGCAAAATTGGCCAAGAAATAGTCAACAGTTAAAGTCTAAACGAAAGGTTAACGATTTCCATCTAATTTTTAACGGTTGAATATTTCAAACCCAATTTTGCGCAGTTAACAATTAGTTCGGGAATAATTATGCACAATTAATACTTG (((((((.(((..((...(((((((((((((.((((((.(((((((((((((((....((((((.(((((.(((((((.......((((.........))))........))))))).))))).))))))....))))))))))))))).)))))).)))))))))))))...))..))).))))))).. 15280 15429 ATTCCCGAACTTATTGTTTACTGTGCAAAATTGGCCAAGAAATAGTCAACAGTTAAAGTCTAAACGAAAGGTTAACGATTTCCATCTAATTTTTAACGGTTGAATATTTCAAACCCAATTTTGCGCAGTTAACAATTAGTTCGGGAATAA (((((((((((.((((((.(((((((((((((((....((((((.(((((.(((((((.......((((.........))))........))))))).))))).))))))....))))))))))))))).)))))).))))))))))).. 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Bju-miRN263 16841840 16841860 CTATTCCTCGTTGACTTGCAT Bju-miRN263* 16842033 16842053 GAAGGCCCACGAGGAATCGCA 3 Bju-MIRN264 PmiREN001804 MIRN264 Brassica juncea Bju-CM007197.1 67714744 67714862 + CTGCAGAGTTCCTCCCATTCCGTTCAATTTTCCTTTGCTTCACATTAGATCAGTCTCGTCAAGACTGATTCGATACGAAGCAAACGAGGATTGAACGGAACAAACCTCATCTTCTTGTC .................(((((((((((((((.((((((((..(((.(((((((((.....))))))))).)))..)))))))).)))))))))))))))................... 67714764 67714842 CGTTCAATTTTCCTTTGCTTCACATTAGATCAGTCTCGTCAAGACTGATTCGATACGAAGCAAACGAGGATTGAACGGA ((((((((((((.((((((((..(((.(((((((((.....))))))))).)))..)))))))).)))))))))))).. 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Bju-miRN269 44426328 44426348 TCGGTAGAAGAGTTGAGATGA Bju-miRN269* 44426257 44426277 TCTTGAACTCTTCTCCTGATC 3 Bju-MIRN270 PmiREN002688 MIRN270 Brassica juncea Bju-CM007199.1 12753840 12754017 + GGGATTTCCCGGGATGGTTGGAAGCATTGACTGTATGCATTGGGAGTGGAAGAATTGCCCCACCGCTTGGAAAGGAATGTATTCACGAGGAAACGCAAAACCAACAATTGTGTTGGAGGCCGTTGCTTCATATGACCTCTGGATATGGCATGCTTTTTTTGGAGCTCCAGGTACTATG ....................(((((((.(.((((((.((..((..((((((((((.(((((....((((..((........))..))))..(((((((.........))))))))).))).))).)))).)))..))..)).))))))))))))))...................... 12753860 12753997 GAAGCATTGACTGTATGCATTGGGAGTGGAAGAATTGCCCCACCGCTTGGAAAGGAATGTATTCACGAGGAAACGCAAAACCAACAATTGTGTTGGAGGCCGTTGCTTCATATGACCTCTGGATATGGCATGCTTTTT (((((((.(.((((((.((..((..((((((((((.(((((....((((..((........))..))))..(((((((.........))))))))).))).))).)))).)))..))..)).)))))))))))))).. Bju-miRN270 12753977 12753997 TCTGGATATGGCATGCTTTTT Bju-miRN270* 12753860 12753880 GAAGCATTGACTGTATGCATT 3 Bju-MIRN271 PmiREN002691 MIRN271 Brassica juncea Bju-CM007198.1 8760113 8760245 + GTACGAAAAGATGTCGAGCGTGCTTTTGGAGTCTTGCAAGCTCACTTTTCCATTGTTAAATGTCCATCAGTTTTTCGGGATAAAGTCAAAATTGGTAAGATTATGAGAGCATGTATCATATTCGATAATATGA ....................(((((((..((((((((......((((((((..((..((((........))))..))))).)))))........))))))))..)))))))...................... 8760133 8760225 TGCTTTTGGAGTCTTGCAAGCTCACTTTTCCATTGTTAAATGTCCATCAGTTTTTCGGGATAAAGTCAAAATTGGTAAGATTATGAGAGCATG (((((((..((((((((......((((((((..((..((((........))))..))))).)))))........))))))))..))))))).. Bju-miRN271 8760204 8760225 TTGGTAAGATTATGAGAGCATG Bju-miRN271* 8760133 8760153 TGCTTTTGGAGTCTTGCAAGC 3 Bju-MIRN272 PmiREN002692 MIRN272 Brassica juncea Bju-CM007192.1 11034233 11034370 + TTTCACGTTCTTCCTTTCGGAAGGAGGATTAGAAAATCCTATTGATTGCAGCTTTCTCCAGACCCCTGGGAAAAGCATGAAAAAAAGGCTTCAACCGGGTTATTCTATTCCACCTCTTAGAAAGAAAAGAACTTAAAT .....................(((.(((.((((((((((..((((..((.(((((.(((((....))))).)))))...........)).))))..))))).))))).))).)))....................... 11034253 11034350 AAGGAGGATTAGAAAATCCTATTGATTGCAGCTTTCTCCAGACCCCTGGGAAAAGCATGAAAAAAAGGCTTCAACCGGGTTATTCTATTCCACCTCTT .(((.(((.((((((((((..((((..((.(((((.(((((....))))).)))))...........)).))))..))))).))))).))).)))... Bju-miRN272 11034331 11034350 GTTATTCTATTCCACCTCTT Bju-miRN272* 11034253 11034273 AAGGAGGATTAGAAAATCCTA 3