miRNA_locus_ID	miRNA_locus_accession	miRNA_family	Organism	Chromosome	Start	End	Strand	Stem_loop_with_extended_20bp_seq	Stem_loop_with_extended_20bp_structure	Stem_loop_start	Stem_loop_end	Stem_loop_seq	Stem_loop_seq_structure	mature_miRNA	mature_start	mature_end	mature_seq	star_miRNA	star_start	star_end	star_seq	Confidence_level
Bdi-MIR156a	PmiREN001064	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	56655692	56655839	-	GCCTGTGTCGTCGGGCTGTCTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGTTGTGATCCGGGCCCCCGTCGTTGGTGGCAAACATCTTGTTGCCGTTGCTGTGCCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTCTCTGAGGAAGGTGTGATGGTAAATGGCT	(((....((((((.(((.(((..((((.(((((..((((((((.(((...(((((...((.((.(((((((((.....))))))))).)).)).))))).))).)))).)))).)).))))))).))).))).)))))).....))).	56655712	56655819	TGACAGAAGAGAGAGAGCACAGTTGTGATCCGGGCCCCCGTCGTTGGTGGCAAACATCTTGTTGCCGTTGCTGTGCCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTCTCTGAGGA	(..((((.(((((..((((((((.(((...(((((...((.((.(((((((((.....))))))))).)).)).))))).))).)))).)))).)).))))))).)..	Bdi-miR156a	56655800	56655819	TGACAGAAGAGAGAGAGCAC	Bdi-miR156a*	56655712	56655732	GTTGCTGCTGCTCTCTGAGGA		3
Bdi-MIR156b	PmiREN001060	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	39008650	39008834	-	AGGTGTGGCAAGGCTATGGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCCAGACTGCATCTATTCCTTCGGCGGCGGACACGGCCGGGCATGGCCGGCCATGGCATGGCATACACGAAAACGAATGATGCTGCTGCTGCTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCACCTCTCGCACACACGGCTAGCC	.................(((((((((((((((((((((((.(((((((.((.(.(((((.((((.((((...((...((.((((((......)))))).)).....)).....))))...))))))))).)))))))))).)))))))).))))).))))))))))...................	39008670	39008814	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCCAGACTGCATCTATTCCTTCGGCGGCGGACACGGCCGGGCATGGCCGGCCATGGCATGGCATACACGAAAACGAATGATGCTGCTGCTGCTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCACC	((((((((((((((((((((.(((((((.((.(.(((((.((((.((((...((...((.((((((......)))))).)).....)).....))))...))))))))).)))))))))).)))))))).))))).)))))))..	Bdi-miR156b	39008795	39008814	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Bdi-miR156b*	39008670	39008690	CTCACTTCTCTCTCTGTCACC		3
Bdi-MIR156c	PmiREN001061	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	4346580	4346702	-	TTGAGAGGGCCTCGAGAGATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGTCCGGCATATGTATGCCGTCGTCGCCGCGTGCTCACTCCTCTTTCTGTCAGCCTCTTTCTCTCCGGAGTTTA	.............(((((((((((((((((((((((((((.((((..((((..((((((....)))))).)))))))).))))))))).))).)))))))))......)))))).........	4346600	4346682	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGTCCGGCATATGTATGCCGTCGTCGCCGCGTGCTCACTCCTCTTTCTGTCAGC	((((((((((((((((((((.((((..((((..((((((....)))))).)))))))).))))))))).))).))))))))..	Bdi-miR156c	4346663	4346682	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Bdi-miR156c*	4346600	4346620	CTCACTCCTCTTTCTGTCAGC		3
Bdi-MIR156d	PmiREN001062	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	18347348	18347478	-	AGGGTCATGTGTGCGCGCGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGGCGGGACGGCACCCGGCGGATTGGTGCCGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTGTCTGTCACCTTTGCCCAGAAGGCCGCCTC	..............(((.((((((((((((((((((((((.(((((....(.(((((((((.........))))))))).)))))).))))))))).)))).)))))))))..)))...............	18347368	18347458	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGGCGGGACGGCACCCGGCGGATTGGTGCCGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTGTCTGTCACC	((((((((((((((((((((.(((((....(.(((((((((.........))))))))).)))))).))))))))).)))).)))))))..	Bdi-miR156d	18347439	18347458	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Bdi-miR156d*	18347368	18347388	CTCACTGCTCTGTCTGTCACC		3
Bdi-MIR156e	PmiREN001063	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	4036104	4036254	+	GGGAGTGATGAGATGGAGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGCCTTTCTTGCATGGTGAATCAGAGAGAGGGAGAAAGAGCGTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGCCATTACTTACATCTTTCTCT	(((((.((((((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((..((.....))..))))))))......((((......))))...))))))))))))))).))))).)))))))))).))).)).)))).))))).	4036124	4036234	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGCCTTTCTTGCATGGTGAATCAGAGAGAGGGAGAAAGAGCGTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGC	(((((((((((((((((((((((((((.((((((((..((.....))..))))))))......((((......))))...))))))))))))))).))))).)))))))..	Bdi-miR156e	4036124	4036143	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Bdi-miR156e*	4036214	4036234	CTCACTTCTCTCTCTGTCAGC		3
Bdi-MIR156f	PmiREN001059	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	4036341	4036450	+	TGAGTGGAAGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCATGGTGTTTCGTTTGCATCAAGGACATGCCAGGGAGCTATGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGCCAGCCACTGAT	(.(((((..((((((((((((((((((((((.((((((...((.((.((((.......)))).)).)))))))).))))))))).)))).)))))))))...))))).).	4036352	4036439	TGACAGAAGAGAGTGAGCACCCATGGTGTTTCGTTTGCATCAAGGACATGCCAGGGAGCTATGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGC	((((((((((((((((((((.((((((...((.((.((((.......)))).)).)))))))).))))))))).)))).)))))))))	Bdi-miR156f	4036352	4036373	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Bdi-miR156f*	4036419	4036439	CTCACTGCTCTATCTGTCAGC		3
Bdi-MIR156g	PmiREN001068	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	4036578	4036688	+	CTTTGGAGGTTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCGGTGGTTTCCTAGCATGCAGGAGCCATGCTGGGAGCTGCGCGTGCTCACCCTCTCTCTGTCAGCCGTTCACCATGC	...((((((((.((((((((((.((((((((.((((((....(((((((((((....).)))))))))))))))).)))))))).)))).)))))))))).))))......	4036589	4036676	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCGGTGGTTTCCTAGCATGCAGGAGCCATGCTGGGAGCTGCGCGTGCTCACCCTCTCTCTGTCAGC	.((((((((((.((((((((.((((((....(((((((((((....).)))))))))))))))).)))))))).)))).)))))))))	Bdi-miR156g	4036589	4036610	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Bdi-miR156g*	4036656	4036676	GCTCACCCTCTCTCTGTCAGC		3
Bdi-MIR156h	PmiREN001065	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	49734695	49734820	-	TGTATGGGCGGCTTGGGCGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGTCGTCACACGACGGCGCCGCCGTGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTTCCTGTCATCCACTAGCTCTCTCCGATTCC	..................((((((((((((((((((((((.(((((((((((...)))))(((((....))))).)))))).))))))))).))))).))))))))....................	49734715	49734800	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCCGGTCGTCACACGACGGCGCCGCCGTGTCGCGGCCGCGTGCTCACTGCTCTTCCTGTCATC	((((((((((((((((((((.(((((((((((...)))))(((((....))))).)))))).))))))))).))))).))))))..	Bdi-miR156h	49734781	49734800	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Bdi-miR156h*	49734715	49734735	CTCACTGCTCTTCCTGTCATC		3
Bdi-MIR156i	PmiREN001066	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	36068013	36068183	+	GATGGCGGTGTCAGAACGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCAGCCTGCATCTGGAGCTAAAGACGATGATGTGTCGATGCATGTGAAGAAGGGGAAAAGAGATAGGCGCAGCTGCTGTTGCGTGCTCACCCTCTCTCTGTCAGCTCTCCTCTCCCCCCTCGGGA	.................((((((((((((((.((((((((.((((((((((.(((.((((...((.....(..(.((((((....)))))).).....).....))...)))).))))))))))))).)))))))).)))).))))))))))......((((.....))))	36068033	36068163	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCAGCCTGCATCTGGAGCTAAAGACGATGATGTGTCGATGCATGTGAAGAAGGGGAAAAGAGATAGGCGCAGCTGCTGTTGCGTGCTCACCCTCTCTCTGTCAGC	(((((((((((.((((((((.((((((((((.(((.((((...((.....(..(.((((((....)))))).).....).....))...)))).))))))))))))).)))))))).)))).)))))))..	Bdi-miR156i	36068033	36068052	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Bdi-miR156i*	36068143	36068163	GCTCACCCTCTCTCTGTCAGC		3
Bdi-MIR156j	PmiREN001067	MIR156	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	38754411	38754551	-	GACCGGCCGGTTAAGGGTGATGACAGAAGAGAGAGAGCACAACCCAGCACCAGCGTGAAACACCGGCCGTCGGCCCGGTCGCTGAGGCAAGGGCCGTGTGCTCTCTGCTCTCTCTGTCATGGCCATCCCACGGACCACCCA	...............(((.((((((((((((((((((((((.(((.((..(((((......(((((((...)).))))))))))..))..)))...)))))))))).)))).)))))))).))).................	38754431	38754531	TGACAGAAGAGAGAGAGCACAACCCAGCACCAGCGTGAAACACCGGCCGTCGGCCCGGTCGCTGAGGCAAGGGCCGTGTGCTCTCTGCTCTCTCTGTCATG	(((((((((((((((((((((.(((.((..(((((......(((((((...)).))))))))))..))..)))...)))))))))).)))).)))))))..	Bdi-miR156j	38754512	38754531	TGACAGAAGAGAGAGAGCAC	Bdi-miR156j*	38754431	38754451	CTCTCTGCTCTCTCTGTCATG		3
Bdi-MIR159a	PmiREN001069	MIR159	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	5612607	5612819	+	AAGATATAGACAAGAAGAAGAGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGGGGAAGTGGTCGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTGTCTGGTGCATGCAGTGTGGTAATAGCCTGCGCACCTGCATCGGTTTGCATGACCCGGGAGATGAACCTGCCAGCGTCTTTCCCTCGTGCTTGGATTGAAGGGAGCTCTCTCTCCCCCCTCTCTCTCTC	...............((((((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((.(.((.((.((((.(((((.(.((((((..(((((..((((.((.......))))))))))).)))..))).).))))).)))).)).))).)).))))....))))))))).)).))))))))))))))))))).)))................	5612627	5612799	AGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGGGGAAGTGGTCGGATGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTGTCTGGTGCATGCAGTGTGGTAATAGCCTGCGCACCTGCATCGGTTTGCATGACCCGGGAGATGAACCTGCCAGCGTCTTTCCCTCGTGCTTGGATTGAAGGGAGCTCT	(((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((.(.((.((.((((.(((((.(.((((((..(((((..((((.((.......))))))))))).)))..))).).))))).)))).)).))).)).))))....))))))))).)).)))))))))))))))))..	Bdi-miR159a	5612780	5612799	CTTGGATTGAAGGGAGCTCT	Bdi-miR159a*	5612627	5612647	AGCTCCCTTCGATCCAATCCA		3
Bdi-MIR159b	PmiREN001070	MIR159	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	1097259	1097469	+	TTTGGTTTGGTTTTGAGGTGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAAGGTCTGTCAGAAGGGTGATACAGCTGCTTGTTCATGGTTCCCACTTATCCTATCTCCATTAGAAAGGAGGAGGTAGGCTTGTGGTTTGCATGACCGAGGAGCCGCATCCACCCCTTGCCGACCGCTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCTTGATCTTTCTAGCTA	..(((...((((..((.(((((((((((.(((.(((((.....((((.((.((..(((((((.(.(((.((((.(((((....((((....(((((((((...........)))))))))...))))....))))).)))).))).).)).))))))).)).)))).....))))).))).))))))))))).))..))))...)))....	1097279	1097449	GAGCTCCTATCATTCCAATGAAAGGTCTGTCAGAAGGGTGATACAGCTGCTTGTTCATGGTTCCCACTTATCCTATCTCCATTAGAAAGGAGGAGGTAGGCTTGTGGTTTGCATGACCGAGGAGCCGCATCCACCCCTTGCCGACCGCTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTG	((((((((.(((.(((((.....((((.((.((..(((((((.(.(((.((((.(((((....((((....(((((((((...........)))))))))...))))....))))).)))).))).).)).))))))).)).)))).....))))).))).))))))))..	Bdi-miR159b	1097429	1097449	TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG	Bdi-miR159b*	1097279	1097299	GAGCTCCTATCATTCCAATGA		3
Bdi-MIR159c	PmiREN001071	MIR159	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	302302	302459	-	CCTGCTGCTGCTGCTGTACATTTGGTTTGAAGGGGGCTCTGTTGGGTGGCTCGATGGCACCGTCAGAGACAGGCCCGTGCTCACCTGAACAGCGAAAGGTTCGCATATTTTGGAGCTGAGACCTCGATCGAACACATGCATATGCGGTGCACGGTGAC	((((.(((.((((((((.(((...((((((..((((((((((((((((((.((..(((.(.(((...))).)))))).)).))))).))))(((((...))))).............))).))))..))))))..))).))).))))))))))).)..	302322	302439	TTTGGTTTGAAGGGGGCTCTGTTGGGTGGCTCGATGGCACCGTCAGAGACAGGCCCGTGCTCACCTGAACAGCGAAAGGTTCGCATATTTTGGAGCTGAGACCTCGATCGAACACATG	(...((((((..((((((((((((((((((.((..(((.(.(((...))).)))))).)).))))).))))(((((...))))).............))).))))..))))))..)..	Bdi-miR159c	302419	302439	TTTGGTTTGAAGGGGGCTCTG	Bdi-miR159c*	302322	302342	GAGACCTCGATCGAACACATG		3
Bdi-MIR160a	PmiREN001072	MIR160	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	4542497	4542649	-	GTGAAAAAAAAAATGGGATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCGTAGCTGCCAACAACTCAGTTTGAGCTCCCCCGGCCCAAACGCAAACGTTGGCTCTACCGCGGATGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATGACCGTCTCTCCCCCTCCCTC	(.((........((((..(((((.(((((((.(((((((((.((((((((..((((((......(((((.(((.....))).)))))......)))))).))).))))).))))))))).))))))).))))).)))).........)))...	4542517	4542629	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCGTAGCTGCCAACAACTCAGTTTGAGCTCCCCCGGCCCAAACGCAAACGTTGGCTCTACCGCGGATGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATG	(((.(((((((.(((((((((.((((((((..((((((......(((((.(((.....))).)))))......)))))).))).))))).))))))))).))))))).)))..	Bdi-miR160a	4542609	4542629	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Bdi-miR160a*	4542517	4542537	GCGTGCGAGGAGCCAAGCATG		3
Bdi-MIR160b	PmiREN001073	MIR160	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	28108153	28108276	-	TTAATCGATCATCGGCTGCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCGATCCGTGCCGAGGTTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATGCATACATACAAGCTCCATGA	........((((.((((((((((.(((((((.((((((((((.((((((..((((((((...)).)))))).))).))).)))))))))).))))))).)))))).........))))..))))	28108173	28108256	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCGATCCGTGCCGAGGTTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATG	(((.(((((((.((((((((((.((((((..((((((((...)).)))))).))).))).)))))))))).))))))).)))..	Bdi-miR160b	28108236	28108256	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Bdi-miR160b*	28108173	28108193	GCGTGCAAGGAGCCAAGCATG		3
Bdi-MIR160c	PmiREN001074	MIR160	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	3425172	3425297	-	ATCTGATCAAGACTGTGCTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCAGCCCATGAATGTGGTTTGCCTGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATGCATTACGCATTATGATCAAT	(((((((.......((((.((((.(((((((.((((((((((.(((((((.(.((((((....)).)))).).)))).))).)))))))))).))))))).)))))))).....)))).)))....	3425192	3425277	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCAGCCCATGAATGTGGTTTGCCTGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGCATG	(((.(((((((.((((((((((.(((((((.(.((((((....)).)))).).)))).))).)))))))))).))))))).)))..	Bdi-miR160c	3425257	3425277	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Bdi-miR160c*	3425192	3425212	GCGTGCAAGGAGCCAAGCATG		3
Bdi-MIR160d	PmiREN001075	MIR160	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	12754473	12754602	+	GTGAAGCTTATGTTGGGATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATCTATAGCAACATTCCTTCCTGATGAGGTTGCCTAGGATGGATGGCGTGCACGGAGCCAAGCATATCCCCCTTGATCCCAACCGT	..............(((((((((.(((((((.(((((((((.((((((...(((((.(((.........))))))))...)))))).))))))))).))))))).)))))))))................	12754493	12754582	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATCTATAGCAACATTCCTTCCTGATGAGGTTGCCTAGGATGGATGGCGTGCACGGAGCCAAGCATA	(((.(((((((.(((((((((.((((((...(((((.(((.........))))))))...)))))).))))))))).))))))).)))..	Bdi-miR160d	12754493	12754513	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Bdi-miR160d*	12754562	12754582	GCGTGCACGGAGCCAAGCATA		3
Bdi-MIR160e	PmiREN001076	MIR160	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	41304792	41304914	+	AATGGGTGATGTTGCCTTCCTGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCTGAGAAGCACACCACCGTGCCTGGCGTGGCTCCTGGTTGGCATTGAGGGAGTCATGCAGGGTTGCAGGGTACGTCCTCGC	............(((..((((((.(((((((((.(((((((.(((.((..(((.(((.......))).)))..)).))).))))))).))))))))).))))))..)))......((....))	41304812	41304894	TGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCTGAGAAGCACACCACCGTGCCTGGCGTGGCTCCTGGTTGGCATTGAGGGAGTCATGCAGG	(((.(((((((((.(((((((.(((.((..(((.(((.......))).)))..)).))).))))))).))))))))).)))..	Bdi-miR160e	41304812	41304832	TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA	Bdi-miR160e*	41304874	41304894	GCATTGAGGGAGTCATGCAGG		3
Bdi-MIR160f	PmiREN001078	MIR160	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	19480653	19480783	-	CGGGGGCTGCGGGGTGGCGGATGTCAGTGTGCGGCCGTAGGCTGGACCGCGGGTGTTTGCTGTTGCGGAGATCCACCGAGGACGGAGACGGACCGAAGTGCGCATGCCTGGCTCCCTGTATGCCGCCCGCG	((((((((((((((.(.(((..((..((((((((((((...(((..(((.((((.(((((....))))).))))..)).)..)))..)))).))...))))))..))))).).))))))).))).))))..	19480659	19480776	CTGCGGGGTGGCGGATGTCAGTGTGCGGCCGTAGGCTGGACCGCGGGTGTTTGCTGTTGCGGAGATCCACCGAGGACGGAGACGGACCGAAGTGCGCATGCCTGGCTCCCTGTATGCC	((((((((.(.(((..((..((((((((((((...(((..(((.((((.(((((....))))).))))..)).)..)))..)))).))...))))))..))))).).))))))).)))	Bdi-miR160f	19480659	19480680	TGCCTGGCTCCCTGTATGCC	Bdi-miR160f*	19480756	19480776	CTGCGGGGTGGCGGATGTCAG		3
Bdi-MIR160g	PmiREN001077	MIR160	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	50454477	50454728	-	GAGACGGACCGAATTGCGCATGCCTGGCTCCCTGTATGCCTGCAGGAGGAGCACTACCGTCCGGGAAAGGGAAGAAGGACGGATGGTAGCTCTGGGTGTGGTGGTAATGGTGGTGTCCGTGTGCCACTAGGTTCAGGGGAAACGATGGGTTCAGGAGCTGCCCCTCGAAGGGGAACTCCGGGTACGCCGGGATCCGGGGCTTCTTGCGCGGCGGCGAGAAGGAGCTGGCGAGGTGGATGGCCGGCATG	....(((.(((...(.(((.((((.((((((((...((((((((((((((((.((((((((((................))))))))))((((((((.((((((((((((......)))).)))))))).))))))))((..(....)..))....))).(((((...)))))..((((((((.(....).))))))))))))))))).))))...))..))))))))))..))).)))))))..... .-1	50454497	50454708	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCTGCAGGAGGAGCACTACCGTCCGGGAAAGGGAAGAAGGACGGATGGTAGCTCTGGGTGTGGTGGTAATGGTGGTGTCCGTGTGCCACTAGGTTCAGGGGAAACGATGGGTTCAGGAGCTGCCCCTCGAAGGGGAACTCCGGGTACGCCGGGATCCGGGGCTTCTTGCGCGGCGGCGAGAAGGAGCTGGCGAG	((((.((((((((...((((((((((((((((.((((((((((................))))))))))((((((((.((((((((((((......)))).)))))))).))))))))((..(....)..))....))).(((((...)))))..((((((((.(....).))))))))))))))))).))))...))..))))))))))..	Bdi-miR160g	50454689	50454708	TGCCTGGCTCCCTGTATGCC	Bdi-miR160g*	50454497	50454517	CGGCGAGAAGGAGCTGGCGAG		3
Bdi-MIR162	PmiREN001079	MIR162	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	49353022	49353154	+	GCCTGGGCGCAGTGGTTTATCGATCCTTTCCCTGCCTTGTGCTACTGATCCTGGGCCGGGCGGCGATTGGATACTTTTTTTCTTCTTGTCACAGCTTATGCGGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCGGTT	..(((((.((((.((((((((((((..(((((.((((.((.(..........).)).))))(((((..(((.........)))..)))))...((....)))))))..)))))))))))).)))).)))))..	49353026	49353152	GGGCGCAGTGGTTTATCGATCCTTTCCCTGCCTTGTGCTACTGATCCTGGGCCGGGCGGCGATTGGATACTTTTTTTCTTCTTGTCACAGCTTATGCGGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCGG	(((.((((.((((((((((((..(((((.((((.((.(..........).)).))))(((((..(((.........)))..)))))...((....)))))))..)))))))))))).)))).)))))	Bdi-miR162	49353132	49353154	TCGATAAACCTCTGCATCCGG	Bdi-miR162*	49353026	49353046	GGGCGCAGTGGTTTATCGATC		2
Bdi-MIR164a	PmiREN001080	MIR164	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	19943468	19943636	-	ATGAGGCGAGGCGCGCGAGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTCGTTCCAGCTCGCCGCCGGTGTGCCGCGCCGCGGCCTGGGCGCGCGTGTCGCCCGAGCGGCCGGCCATGCGCGTGTGTGTGCATGCATGTGCCCTTCTTCTCCACCGCGCAAGCCTCGCCTGCGAA	...(((((((((..(((.((((((((((.(((((((((((..........(((.((((((((.(((.((((((((.......))).))))).)))))).))))).))).((((((......))))))))))))))))).)))))))))).)))..))))))))).....	19943488	19943616	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTCGTTCCAGCTCGCCGCCGGTGTGCCGCGCCGCGGCCTGGGCGCGCGTGTCGCCCGAGCGGCCGGCCATGCGCGTGTGTGTGCATGCATGTGCCCTTCTTCTCCACC	((((((((.(((((((((((..........(((.((((((((.(((.((((((((.......))).))))).)))))).))))).))).((((((......))))))))))))))))).))))))))..	Bdi-miR164a	19943596	19943616	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Bdi-miR164a*	19943488	19943508	CATGTGCCCTTCTTCTCCACC		3
Bdi-MIR164b	PmiREN001081	MIR164	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	14544989	14545176	+	CTCAGCGAGAAGGACCGCGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATGCATGCAACTAGAGCTTAGCTAGTGTCAATTCTTCCATCTCTTGTGCCTGGCCGGGATCGATCTTATATACCGAGCTTAATTTGGCACCTATTGGATGCTGCATGCATGTGTTCTTCTCCTCCATCACGGTCTTCATTTCTCTCGC	....(((((((((((((.(.(((((.((.((((((((((((((((.((((((((.......))))).........((((......(((((.((((((...............))).)))......)))))....))))))))))))))))))))))).)).))))).).)))))))......))))))	14545009	14545156	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATGCATGCAACTAGAGCTTAGCTAGTGTCAATTCTTCCATCTCTTGTGCCTGGCCGGGATCGATCTTATATACCGAGCTTAATTTGGCACCTATTGGATGCTGCATGCATGTGTTCTTCTCCTCCATC	(((((.((.((((((((((((((((.((((((((.......))))).........((((......(((((.((((((...............))).)))......)))))....))))))))))))))))))))))).)).)))))..	Bdi-miR164b	14545009	14545029	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Bdi-miR164b*	14545136	14545156	CATGTGTTCTTCTCCTCCATC		3
Bdi-MIR164c	PmiREN001082	MIR164	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	58864215	58864324	-	AGGGGGCGAGCAAACCTTGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCTTGACCGGTCGGCCGGAGCCGGGTTGCAGCATGTGCGCTCCTTCTCCAGCATGGCTTCTCGCCCCGTCGA	(.((((((((.((.((.(((((((((((.((.((((((((((((((...((((....))))))))).))))))))).)).))))))))))).)).)))))))))).)...	58864235	58864304	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCTTGACCGGTCGGCCGGAGCCGGGTTGCAGCATGTGCGCTCCTTCTCCAGC	((((((((.((.((((((((((((((...((((....))))))))).))))))))).)).))))))))..	Bdi-miR164c	58864284	58864304	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCT	Bdi-miR164c*	58864235	58864255	CATGTGCGCTCCTTCTCCAGC		3
Bdi-MIR164d	PmiREN001083	MIR164	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	26817640	26817773	-	TTTGGTGAGAATGCCCCTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAGATCGGAGCACGTTTCGTATGTGATGTACGTATGTGCATGGATCGCTGTGCACGCGCTCCCCTTCTCCACCATGGCCTTCTTACCACAGCT	..(((((((((.(((..((.((((((((..((((.((((((..((((.(.((((((..(((((.....))))).)))))).).))))....)))))).))))..)))))))).)).))).))))))))).....	26817660	26817753	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAGATCGGAGCACGTTTCGTATGTGATGTACGTATGTGCATGGATCGCTGTGCACGCGCTCCCCTTCTCCACC	((((((((..((((.((((((..((((.(.((((((..(((((.....))))).)))))).).))))....)))))).))))..))))))))..	Bdi-miR164d	26817733	26817753	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Bdi-miR164d*	26817660	26817680	CACGCGCTCCCCTTCTCCACC		3
Bdi-MIR166a	PmiREN001084	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	6568853	6568979	+	TCTTTTCATGGTTGTCGAGGGGAATGACGCCGGGTCTGAAAGAAAGAAGGGGGCACGCCGGGAATGACAGCGGTTCCCTAGCTCTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCATGACTCGACCATGGGCACC	....(((((((((((((.(((((((((.(((.(((((((((((....(((((((.(((.(.......).))))))))))...))))))))))).))).))))))))).))))..)))))))))....	6568873	6568959	GGAATGACGCCGGGTCTGAAAGAAAGAAGGGGGCACGCCGGGAATGACAGCGGTTCCCTAGCTCTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	(((((((.(((.(((((((((((....(((((((.(((.(.......).))))))))))...))))))))))).))).)))))))..	Bdi-miR166a	6568939	6568959	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Bdi-miR166a*	6568873	6568893	GGAATGACGCCGGGTCTGAAA		3
Bdi-MIR166b	PmiREN001085	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	30781286	30781507	-	GAGCCTTTTTCGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGGGGTTCTCTTTATTTCTATGCCTCTCTCTATCCCCCCCTCCTCAATCTCTCTAGCTTTGATTGGATCGAGAGAAGATCGATCGATCGATCCAAGAAGAGTTCTGAGAAGGGGGATGAAGAGAGTAGACGTATGTGTGTAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAAATACAAGGGCTCCCAT	((((((((.....((((.((((((((..((((((.((((((((..(..(((.((((...((((((.((((((((...........((((.((((((..(((((((((..((.......))..)))))))))..))))))..)))).)))))))).)))))))))).))).....)..)))))))).))))))..)))))))).))))...))))))))....	30781306	30781487	GGAATGTTGTCTGGCTCGGGGTTCTCTTTATTTCTATGCCTCTCTCTATCCCCCCCTCCTCAATCTCTCTAGCTTTGATTGGATCGAGAGAAGATCGATCGATCGATCCAAGAAGAGTTCTGAGAAGGGGGATGAAGAGAGTAGACGTATGTGTGTAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((((((..(..(((.((((...((((((.((((((((...........((((.((((((..(((((((((..((.......))..)))))))))..))))))..)))).)))))))).)))))))))).))).....)..)))))))).))))))..))))))..	Bdi-miR166b	30781306	30781326	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Bdi-miR166b*	30781467	30781487	GGAATGTTGTCTGGCTCGGGG		3
Bdi-MIR166c	PmiREN001086	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	32841387	32841537	+	AAGCTATTTTGCTTCTGGGTGGAATGTTGTCTGGTTCAAGGTCTTGCCATGTGATTTGAGGATGAACGGTTTGTGCATGCATAACTTTCATTTCTCTTGTTTGCGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGAGATAGCTTCAAACTC	((((((((.....((((((.((((((..(((((((((.(((((((((.....(((..(((((((((.(((((((....))).)))))))).)))))..))).))))))))).)))))))))..)))))).)))))))))))))).......	32841407	32841517	GGAATGTTGTCTGGTTCAAGGTCTTGCCATGTGATTTGAGGATGAACGGTTTGTGCATGCATAACTTTCATTTCTCTTGTTTGCGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..(((((((((.(((((((((.....(((..(((((((((.(((((((....))).)))))))).)))))..))).))))))))).)))))))))..))))))..	Bdi-miR166c	32841497	32841517	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Bdi-miR166c*	32841407	32841427	GGAATGTTGTCTGGTTCAAGG		3
Bdi-MIR166d	PmiREN001087	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	71651851	71651994	-	CATGTATGGCGCAGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGTTGGAGACCTAGCTAGCAGCTAGCACGGATCATCCATAGATCGATTCGACGCTGCATATGCGCGCGGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCTCAACTCGATCGA	............(((((.((((((((..((((((((.((((((..(((((...))))).(((((((((....))).)))))).(((.((....))))).)))))).))))))))..)))))))).)))))..............	71651871	71651974	GGAATGTTGTCTGGTTGGAGACCTAGCTAGCAGCTAGCACGGATCATCCATAGATCGATTCGACGCTGCATATGCGCGCGGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((((.((((((..(((((...))))).(((((((((....))).)))))).(((.((....))))).)))))).))))))))..))))))..	Bdi-miR166d	71651871	71651891	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Bdi-miR166d*	71651954	71651974	GGAATGTTGTCTGGTTGGAGA		3
Bdi-MIR166e	PmiREN001088	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	51198568	51198692	+	GGAGCTTTTTTACTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTGCTGAGATCGAGAGAACTTGAAATTCGATCTCTAGATTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAGTAAAGCTCCCGTGTG	(((((((...(((((.((((((((((..((((((.(((((((...(((((((((...........))))))))).......))))))).))))))..))))))))))))))))))))))......	51198588	51198672	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTGCTGAGATCGAGAGAACTTGAAATTCGATCTCTAGATTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.(((((((...(((((((((...........))))))))).......))))))).))))))..))))))..	Bdi-miR166e	51198652	51198672	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Bdi-miR166e*	51198588	51198608	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Bdi-MIR166f	PmiREN001089	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	6104124	6104246	-	GAGGGAAGCATGGTGTCTGGAATGGAGGCTGATCCAAGATCCTTGGTCCGAAATATTGTGTTTCTGTGTTTGTTGCCAAGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTCACACCGAGCTTCCGCTGC	.((((((((.((((((..(((((((((.(((.(((.(((((((((((...((((((.(.....).))))))...))))))))))).))).))).)))))))))..)))))).)))))).))..	6104144	6104226	AATGGAGGCTGATCCAAGATCCTTGGTCCGAAATATTGTGTTTCTGTGTTTGTTGCCAAGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC	(((((((.(((.(((.(((((((((((...((((((.(.....).))))))...))))))))))).))).))).)))))))..	Bdi-miR166f	6104144	6104164	TCTCGGACCAGGCTTCATTCC	Bdi-miR166f*	6104206	6104226	AATGGAGGCTGATCCAAGATC		3
Bdi-MIR166g	PmiREN001090	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	37525933	37526119	+	AGGTTGAAGTTAGGTTAAGGGGGTTGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCCACATACATCATGTACATGGAGGGCATGCATGCATGATATGCTGTTGTTGAGTGCCATTTGCTCGATCTTGTGTATATATGCAGTGTATGATGTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCGATCCCTTTAACCAGCATCTGCACAGT	((((....(((.((((((((((((((..(((((((((.(((((.((((((.(.((((....)))).)..((((((((((((((((((....(((((((.......)))))))...)))))).)))))).)))))))))))).))))).)))))))))..))))))))))))))))))))).......	37525953	37526099	GGGTTGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCCACATACATCATGTACATGGAGGGCATGCATGCATGATATGCTGTTGTTGAGTGCCATTTGCTCGATCTTGTGTATATATGCAGTGTATGATGTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCGATCCCT	((((((..(((((((((.(((((.((((((.(.((((....)))).)..((((((((((((((((((....(((((((.......)))))))...)))))).)))))).)))))))))))).))))).)))))))))..))))))..	Bdi-miR166g	37526079	37526099	TCGGACCAGGCTTCGATCCCT	Bdi-miR166g*	37525953	37525973	GGGTTGTTGTCTGGTTCAAGG		3
Bdi-MIR166h	PmiREN001091	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	57184716	57184873	+	ATGCCAGGATTAGGTTAAGGGGTTTGTTGTCTGGCTCGGGGCTCCCGGTCTTGATCGATGCGCGACTCCATCTCCCTTCACCGGGGAGACGTGCGTTGCGTACGTTGACCGGGGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCATGCGGCATTGATT	(((((.(.((..((((((((((.(((..((((((.((((((.((((((((.....((.((((((((.((.(((((((.....))))))).).).))))))))))..)))))))).)))))).))))))..))).)))))))))))).)))))).....	57184736	57184853	GGTTTGTTGTCTGGCTCGGGGCTCCCGGTCTTGATCGATGCGCGACTCCATCTCCCTTCACCGGGGAGACGTGCGTTGCGTACGTTGACCGGGGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCT	((.(((..((((((.((((((.((((((((.....((.((((((((.((.(((((((.....))))))).).).))))))))))..)))))))).)))))).))))))..))).))..	Bdi-miR166h	57184833	57184853	TCGGACCAGGCTTCAATCCCT	Bdi-miR166h*	57184736	57184756	GGTTTGTTGTCTGGCTCGGGG		3
Bdi-MIR166i	PmiREN001092	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	27180122	27180264	-	CTCTCCTCGTCTTGTTGAGGGGCATGTCGTGTGGCCCGAGACCGGTTCATGGCCGTCGATCGGTCGGCTAATGTCGCCGGCGGCGCGCGTCAGTGGATGGTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACGGCACGTGCGGACGC	...(((.(((.((((((.((((.(((..((.(((.(((((((((.(((((((((((((.((((.((((....)))))))))))))...)))).))))))))))))).))).))..))).)))).)))))).)))...)))...	27180142	27180244	GGCATGTCGTGTGGCCCGAGACCGGTTCATGGCCGTCGATCGGTCGGCTAATGTCGCCGGCGGCGCGCGTCAGTGGATGGTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((.(((..((.(((.(((((((((.(((((((((((((.((((.((((....)))))))))))))...)))).))))))))))))).))).))..))).))..	Bdi-miR166i	27180142	27180162	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Bdi-miR166i*	27180224	27180244	GGCATGTCGTGTGGCCCGAGA		3
Bdi-MIR166j	PmiREN001093	MIR166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	57184551	57184667	+	GTTGCCATGGTGGTTTGTGGGGACTGTTGGCTGGATCGAGGCCTCCTCGCCGGCTGGTATAGTTGGATTGGAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTTGTAAACCGATGCATCCATGG	....(((((((((((((((((((.((..(.((((.((((.((((((...(((((((...)))))))...)))))).)))).)))).)..)).)))))))))))))......))))))	57184571	57184647	GGACTGTTGGCTGGATCGAGGCCTCCTCGCCGGCTGGTATAGTTGGATTGGAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTT	(((.((..(.((((.((((.((((((...(((((((...)))))))...)))))).)))).)))).)..)).)))..	Bdi-miR166j	57184627	57184647	TCGGACCAGGCTTCATTCCTT	Bdi-miR166j*	57184571	57184591	GGACTGTTGGCTGGATCGAGG		3
Bdi-MIR167a	PmiREN001094	MIR167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	6342687	6342840	+	CCAGTGCCCAAGAGAAAGCGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTGACTTGTGGTGGCAAGTGCCACAGCAAATTCAGCAACGCCGTGGCTTCGGGGCCGGCAGTGTGGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACTCTTTCCCCTGTTGGGCACAC	...((((((((.((((((.((((((((((((((((((((((.((((.((((.(((((....))))).))))..))))..((((.((((((....)))).)).))))...)))))))))))).).))))))))).)))))...).))))))))..	6342707	6342820	TGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTGACTTGTGGTGGCAAGTGCCACAGCAAATTCAGCAACGCCGTGGCTTCGGGGCCGGCAGTGTGGTTAGATCATGCTGTGACAGTTTCACT	(((((((((((((((((((((.((((.((((.(((((....))))).))))..))))..((((.((((((....)))).)).))))...)))))))))))).).))))))))..	Bdi-miR167a	6342707	6342727	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Bdi-miR167a*	6342800	6342820	TCATGCTGTGACAGTTTCACT		3
Bdi-MIR167b	PmiREN001095	MIR167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	3768893	3769062	+	TTACTGCCCGAGGGAACGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCAGCGTGATCAAGCAAGATTCACACATACACGTGTGGTTTTTTTGAGCTATAGCTCGATTGATCTTGAGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACTTCTTCCCGCCGTTTGGGCAT	....((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((...((((((((...((((((((((((......)))))......((((((....))))))..))))))).))))))))...)))))))))))))..)))))).)))))).))))).....))))))).	3768913	3769042	TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCAGCGTGATCAAGCAAGATTCACACATACACGTGTGGTTTTTTTGAGCTATAGCTCGATTGATCTTGAGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACT	(((.(((((((((((((((((((...((((((((...((((((((((((......)))))......((((((....))))))..))))))).))))))))...)))))))))))))..)))))).)))..	Bdi-miR167b	3768913	3768933	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Bdi-miR167b*	3769022	3769042	TCATGCTGCGGCAGCCTCACT		3
Bdi-MIR167c	PmiREN001096	MIR167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	54262053	54262191	+	GTGGTGCATCTTCTAGGAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGACGAGAGTTCCTCGTCTGATAGCAATGTTTAATTCTCTTGTCATGACTAATGATCAGATCATGCTGTGCAGTTTCATCTGCTTGTGGATGCACAAGAT	...((((((((.(.((.((.(((((((((((((((((((((..(((((((...(((.((....)))))...)))))))..(((((.....))))))))))))))))).))))))))).)).)).).)))))))).....	54262073	54262171	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGACGAGAGTTCCTCGTCTGATAGCAATGTTTAATTCTCTTGTCATGACTAATGATCAGATCATGCTGTGCAGTTTCATC	(((((((((((((((((((((..(((((((...(((.((....)))))...)))))))..(((((.....))))))))))))))))).)))))))))..	Bdi-miR167c	54262073	54262094	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA	Bdi-miR167c*	54262151	54262171	ATCATGCTGTGCAGTTTCATC		3
Bdi-MIR167d	PmiREN001097	MIR167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	3643182	3643365	-	AATTTGATGGTGTGAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCACCGTCCAACGTAACCGAACACATGTCGATCGACTTCCGATTGCGCCGGTTATCTTGGTAGGAATATATATATATGAGCTTCCATTGCAAGGGTTCTTCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCATCACCACCGAAAGA	..((((.((((((((((((.(((((((((.((((((((((((...((..((((.(((((((.......((((((((.....)))))).))))))))).))))..)).............((((((.........)))))).))))))))))))))))))))).))))))).))))).))))...	3643202	3643345	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCACCGTCCAACGTAACCGAACACATGTCGATCGACTTCCGATTGCGCCGGTTATCTTGGTAGGAATATATATATATGAGCTTCCATTGCAAGGGTTCTTCAGATCATGTTGCAGCTTCACT	(((((((((.((((((((((((...((..((((.(((((((.......((((((((.....)))))).))))))))).))))..)).............((((((.........)))))).)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR167d	3643324	3643345	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA	Bdi-miR167d*	3643202	3643222	AGATCATGTTGCAGCTTCACT		3
Bdi-MIR167e	PmiREN001098	MIR167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	1640978	1641111	-	ATGTGCACCATACAAGCTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTGACCATATATCTAGATTGGCATGGATGGATATGTGATATGATCTGATCAGGTCATGCTGGAGTTTCATCTGCTGGTTGGGAGCACGATC	..((((.(((..((.((.(((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((............))))))))))....).)).))))))))))))))))))))))))).))))..)))..))))....	1640998	1641091	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTGACCATATATCTAGATTGGCATGGATGGATATGTGATATGATCTGATCAGGTCATGCTGGAGTTTCATC	(((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((............))))))))))....).)).)))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR167e	1641070	1641091	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA	Bdi-miR167e*	1640998	1641018	AGGTCATGCTGGAGTTTCATC		3
Bdi-MIR167f	PmiREN001099	MIR167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	1643267	1643390	-	GGGATGCTCATGTGAAAGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGATCCAATGTATGTCTCTACGTGTGGATCCTTGTTAGATCATGCCTGACAGCCTCATTTCTTCGCAAACGTTTGGGCA	....((((((((((((.((((((.((((.((((((((((((((...(((((((((((......))))).))))))...))))))))))).))).)))).)))))).))))))......))))))	1643287	1643370	TGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGATCCAATGTATGTCTCTACGTGTGGATCCTTGTTAGATCATGCCTGACAGCCTCATT	(((.((((.((((((((((((((...(((((((((((......))))).))))))...))))))))))).))).)))).)))..	Bdi-miR167f	1643350	1643370	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Bdi-miR167f*	1643287	1643307	ATCATGCCTGACAGCCTCATT		3
Bdi-MIR167g	PmiREN001100	MIR167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	71823255	71823427	-	GCTTGTGCGCCACAAGTAGATGAAGCTGCCAGCATGATCTGAACTCCACGCACCACATGTGTATCTTGGTGCTGTGTACTCGATCTTCAGATTGATTACATGCACGCATGAGAAACTGTGCAGGCGATCTGCAGATCATCTGGCAGCTTCATTTTCTCATGGCAGCACACCGG	.(((((((((((..((.(((((((((((((((.((((((((.......(((..((((.((...((.((((((.(((((.((((((....)))))).))))))))).)).))...))))))...))).....))))))))))))))))))))))).))..)))).)))))..))	71823275	71823407	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGAACTCCACGCACCACATGTGTATCTTGGTGCTGTGTACTCGATCTTCAGATTGATTACATGCACGCATGAGAAACTGTGCAGGCGATCTGCAGATCATCTGGCAGCTTCATT	((((((((((((.((((((((.......(((..((((.((...((.((((((.(((((.((((((....)))))).))))))))).)).))...))))))...))).....))))))))))))))))))))..	Bdi-miR167g	71823386	71823407	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGA	Bdi-miR167g*	71823275	71823295	AGATCATCTGGCAGCTTCATT		3
Bdi-MIR168	PmiREN001101	MIR168	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	1785692	1785800	-	CTGCCGCCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCTCCGCCCGCCCCCGCCGGGCCGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCGACTT	....((((((((.(((.((.(((((((((((((..(((((...(((((((((....).)))).)))))))))..))))))))))))).)).))).)))))..)))....	1785712	1785780	TCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCTCCGCCCGCCCCCGCCGGGCCGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAAT	(((((((((((((..(((((...(((((((((....).)))).)))))))))..)))))))))))))..	Bdi-miR168	1785760	1785780	TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC	Bdi-miR168*	1785712	1785732	CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT		3
Bdi-MIR169a	PmiREN001102	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	7712449	7712558	+	TAGGCTTGGGGACTATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGAAACGATGCACAATATGCATCGATCGGCGAGTTGTTCTTGGCTACATCTTAGCTCCTGCCCCTCAT	..(((..((((.(((.((((.((((((((((((((((((((((((.....((((.....)))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))).)))......	7712469	7712538	CAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGAAACGATGCACAATATGCATCGATCGGCGAGTTGTTCTTGGCTACA	.((((((((((((((((((((((((.....((((.....))))))))))))))))))))))))))))...	Bdi-miR169a	7712469	7712489	CAGCCAAGGATGACTTGCCGA	Bdi-miR169a*	7712518	7712538	GGCGAGTTGTTCTTGGCTACA		3
Bdi-MIR169b	PmiREN001103	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	27248033	27248180	-	ACGAGATAGAGAGTGGAATGTAGCCAAGGATGACTTGCCGGGTATGTGCATGTACGCTTCAGGGAATTATATGCATCCCTGGTCTGAATCCATGCTGATATTTCCCGGCAGGTTGTTCTTGGCTAACATCTTGCTCTCTTTCTCTCAC	..((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((((......(((((((..........)))))))........)))))..))))..))))))))))))))))))))).)))).))))))))).))))....	27248053	27248160	TAGCCAAGGATGACTTGCCGGGTATGTGCATGTACGCTTCAGGGAATTATATGCATCCCTGGTCTGAATCCATGCTGATATTTCCCGGCAGGTTGTTCTTGGCTAACA	((((((((((((((((((((((.(((((((((......(((((((..........)))))))........)))))..))))..))))))))))))))))))))).)..	Bdi-miR169b	27248141	27248160	TAGCCAAGGATGACTTGCCG	Bdi-miR169b*	27248053	27248073	GCAGGTTGTTCTTGGCTAACA		3
Bdi-MIR169c	PmiREN001104	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	23923380	23923508	-	AAGAGGCAGAGAAGGGGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTGTTGGGGGAATTGCAGCTTTGTTGAGCCTTGAGTTAGCCGGCAGGTTGTCCTTGGCTACACCTAGTTCTCTTCTTCTGGT	.(((((.((((((.(((.((.(((((((((((((((((((((((((........))))......((((....)))).........))))))))))))))))))))).)))))..)))))).)))))...	23923400	23923488	CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTGTTGGGGGAATTGCAGCTTTGTTGAGCCTTGAGTTAGCCGGCAGGTTGTCCTTGGCTACA	.(((((((((((((((((((((((((........))))......((((....)))).........)))))))))))))))))))))...	Bdi-miR169c	23923468	23923488	CAGCCAAGGATGACTTGCCGG	Bdi-miR169c*	23923400	23923420	GGCAGGTTGTCCTTGGCTACA		3
Bdi-MIR169d	PmiREN001105	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	26130537	26130703	+	AGAGCCTCCCTTGATTTTGGTAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCTTGCCCTCTGCTAACCAGCTAGCCATGCATGGTAACCAATGGACAAATTTCTTGTGGTTGGCGTGGTTAGTGTGGTTGCATGGGTGGGTCTTCTTGGCTAGCCAGAGCGGCTCTCATCCACCA	((((((.(.......(((((((((((((((.(((((((((((((..(((...((((((((((((((((((((((((...)).)))...........)))))))))).))))))))).))).)))))))))))))))))))))).))))))).)))))).........	26130557	26130683	TAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCTTGCCCTCTGCTAACCAGCTAGCCATGCATGGTAACCAATGGACAAATTTCTTGTGGTTGGCGTGGTTAGTGTGGTTGCATGGGTGGGTCTTCTTGGCTAGCC	((((((((((.(((((((((((((..(((...((((((((((((((((((((((((...)).)))...........)))))))))).))))))))).))).)))))))))))))))))))))).)..	Bdi-miR169d	26130557	26130577	TAGCCAAGAATGACTTGCCTA	Bdi-miR169d*	26130663	26130683	GGTGGGTCTTCTTGGCTAGCC		3
Bdi-MIR169e	PmiREN001106	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	43190651	43190792	+	GATAAGGGGTTTGGCCCTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGCATGTCCTCCCTTGATCGCTTGCATAATTTCATATATGCATGTGATCTCGATTTATCACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGGGTGCCTCTTATCCTCC	((((((((((...((((...((((((((((.((((.(((((((.(((...((....((((((.((((((........)))))).))))))..))..))))))))))))))))))))))))....))))))))))))))....	43190671	43190772	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGCATGTCCTCCCTTGATCGCTTGCATAATTTCATATATGCATGTGATCTCGATTTATCACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGC	((((((((((.((((.(((((((.(((...((....((((((.((((((........)))))).))))))..))..))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR169e	43190671	43190691	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Bdi-miR169e*	43190752	43190772	CAGGCAGTCTCCTTGGCTAGC		3
Bdi-MIR169f	PmiREN001114	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	11346706	11346835	-	GAGGACTAGAGCTGATTCGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTAAATGTGTCTATGTAATTCATCTGAGTTGGCATGGGACCGTTAATTTTAGGCATGTCTTCCTTGGCTATTCGGAGTGCCTCTTTGCTGCT	.((.((.((((....(((((((((((((((.(((.((((((((((.(((((((((((((....))))).)))).))))))).....))))))).))).)))))))))).)))))....))))..).).))	11346726	11346815	TAGCCAAGGATGACTTGCCTAAATGTGTCTATGTAATTCATCTGAGTTGGCATGGGACCGTTAATTTTAGGCATGTCTTCCTTGGCTATT	((((((((((.(((.((((((((((.(((((((((((((....))))).)))).))))))).....))))))).))).))))))))))..	Bdi-miR169f	11346795	11346815	TAGCCAAGGATGACTTGCCTA	Bdi-miR169f*	11346726	11346746	GGCATGTCTTCCTTGGCTATT		3
Bdi-MIR169g	PmiREN001108	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	43193635	43193769	+	AGCAAGGGGCTTATCTCTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCATACTTCAAGGCTTGGCAACATGATGCATGAGCCTTTGTTGTAGTCTCATAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGTGGCTCTTGCGGCTC	.(((((((.((...(((...((((((((((.((((.(((((((...(((..((((((((.(((......)))..))))).)))..)))....)))))))))))))))))))))....))).))))))))).....	43193655	43193749	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCATACTTCAAGGCTTGGCAACATGATGCATGAGCCTTTGTTGTAGTCTCATAGGCAGTCTCCTTGGCTAGC	((((((((((.((((.(((((((...(((..((((((((.(((......)))..))))).)))..)))....)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR169g	43193655	43193675	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Bdi-miR169g*	43193729	43193749	TAGGCAGTCTCCTTGGCTAGC		3
Bdi-MIR169h	PmiREN001109	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	11688170	11688311	-	CCAGAGCCTGCTTCCTCCGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTATATTTGCTCCTTCAGAAGTCCTGGTTAATTACATGCCAGGTTTCAGATGAGTTTGGCGATAGGCAGTCACCTTGGCTAGCCTGAGTGGCTCTTGCCTCTTA	(.((((((......(((.(((((((((((.(((((.((((((....((((..((.((((.((((((.........)))))))))).)).))))......))))))))))))))))))).))).))).)))))).).......	11688190	11688291	TAGCCAAGGATGACTTGCCTATATTTGCTCCTTCAGAAGTCCTGGTTAATTACATGCCAGGTTTCAGATGAGTTTGGCGATAGGCAGTCACCTTGGCTAGCC	(((((((((.(((((.((((((....((((..((.((((.((((((.........)))))))))).)).))))......))))))))))))))))))).)..	Bdi-miR169h	11688271	11688291	TAGCCAAGGATGACTTGCCTA	Bdi-miR169h*	11688190	11688210	AGGCAGTCACCTTGGCTAGCC		3
Bdi-MIR169i	PmiREN001107	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	44448686	44448797	+	AGCCAAGAATGGCTTGCCTATGCCCACGTTCTGTTTCATCACCACTGGGCTTAATCTTGGAGCCCTGGTGATGGATGAGATGTGATTGTATGGTCAAGCCATCTTGGCTAGA	((((((((.(((((((.((((((.(((((.((..((((((((((..((((((.......))))))))))))))))..)))))))...)))))).))))))))))))))).).	44448706	44448777	TGCCCACGTTCTGTTTCATCACCACTGGGCTTAATCTTGGAGCCCTGGTGATGGATGAGATGTGATTGTATG	(((.(((((.((..((((((((((..((((((.......))))))))))))))))..)))))))...)))))	Bdi-miR169i	44448756	44448779	ATGGATGAGATGTGATTGTATG	Bdi-miR169i*	44448706	44448726	TGCCCACGTTCTGTTTCATCA		3
Bdi-MIR169j	PmiREN001110	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	44453381	44453543	+	GATAAGGAGCCTACCTCTGTTAGCCAGGAATGGCTTGCCTACGCACACATTTTTCGGTTCATCACAGGGGCAAAACTAACTTGGAGATAGCCCCTAGTATGATGGACGGAGTGTGGCTGCATGGTCAAGCCTTCCTGACTAGGAGAGTGCTCCTCATCCCCCA	(((.((((((....((((.((((.((((((.((((((.(((.(((..(((..(((.(((((((((((((((..................)))))).))..))))))).))).)))..))).))).)))))))))))).)))).)))).)))))).))).....	44453401	44453523	TAGCCAGGAATGGCTTGCCTACGCACACATTTTTCGGTTCATCACAGGGGCAAAACTAACTTGGAGATAGCCCCTAGTATGATGGACGGAGTGTGGCTGCATGGTCAAGCCTTCCTGACTAGG	(((.((((((.((((((.(((.(((..(((..(((.(((((((((((((((..................)))))).))..))))))).))).)))..))).))).)))))))))))).)))..	Bdi-miR169j	44453401	44453421	TAGCCAGGAATGGCTTGCCTA	Bdi-miR169j*	44453502	44453523	TGGTCAAGCCTTCCTGACTAGG		3
Bdi-MIR169k	PmiREN001111	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	1172366	1172519	+	AAGTAGGAGGCCATCTTTGATAGCCAAGGATGATTTGCCTGTAAAACCGATTGTCGTCGCCTCTCGGTGCCGTTCCAGGCACTCGAAGGGAGGGCGGCAGCAACAGGTTCTATGGGCAAGTCAGCCTGGCTACCCGAGTACCTCTTACCCATAT	.(((((((((....(((.(.((((((.((.(((((((((((((.((((..((((.((((((((((((((((......))))))....)))).)))))).))))..)))).))))))))))))).)))))))).).)))..)))))))).....)	1172386	1172499	TAGCCAAGGATGATTTGCCTGTAAAACCGATTGTCGTCGCCTCTCGGTGCCGTTCCAGGCACTCGAAGGGAGGGCGGCAGCAACAGGTTCTATGGGCAAGTCAGCCTGGCTACC	((((((.((.(((((((((((((.((((..((((.((((((((((((((((......))))))....)))).)))))).))))..)))).))))))))))))).))))))))..	Bdi-miR169k	1172386	1172406	TAGCCAAGGATGATTTGCCTG	Bdi-miR169k*	1172478	1172499	TGGGCAAGTCAGCCTGGCTACC		3
Bdi-MIR169l	PmiREN001112	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	35650311	35650438	-	AGCTAGCTGCAGTGTACATGTAGCCAAGGATGAATTGCCGGCCGGCGTTTGTCGATGGTACTCAGCCGGAGATCGCGCGATTGAGCCGGCAAGTCATTTGTGGCTACGTCTTTGCCTCCTTTTCTCAT	.................(((((((((.((((((.((((((((((((((..(((..((((.....))))..))).))))...)).)))))))).)))))).)))))))))...................	35650331	35650418	TAGCCAAGGATGAATTGCCGGCCGGCGTTTGTCGATGGTACTCAGCCGGAGATCGCGCGATTGAGCCGGCAAGTCATTTGTGGCTACG	((((((.((((((.((((((((((((((..(((..((((.....))))..))).))))...)).)))))))).)))))).))))))..	Bdi-miR169l	35650399	35650418	TAGCCAAGGATGAATTGCCG	Bdi-miR169l*	35650331	35650351	GGCAAGTCATTTGTGGCTACG		3
Bdi-MIR169m	PmiREN001113	MIR169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	58393833	58393965	+	CACGACGACAGCTCTTCGTGTAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGGCCTGCATATATGTCTCCAAATTAACAAGCTTAACAAGCTAGGTCGGCAAGTTGTTTGCTTTGGCTACATGACTGCCTCATCCTCTCAT	...............((((((((((((((((((((((((((((((...(((....)))..)).........(((((...))))).))))))))))))))...)))))))))))))).................	58393853	58393945	TAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGGCCTGCATATATGTCTCCAAATTAACAAGCTTAACAAGCTAGGTCGGCAAGTTGTTTGCTTTGGCTACA	(((((((((((((((((((((((((...(((....)))..)).........(((((...))))).))))))))))))))...)))))))))..	Bdi-miR169m	58393853	58393872	TAGCCAAGGATGACTTGCCG	Bdi-miR169m*	58393925	58393945	AAGTTGTTTGCTTTGGCTACA		3
Bdi-MIR171a	PmiREN001119	MIR171	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	21823077	21823190	+	GGTCGAAGAAGACGACATGGCATGGTATTGTTTCGGCTCATGTCCTTCTCGAGCTGATGGTCGGATGAGATGTGAGCCGAACCAATATCACCCATGTATTCTTCCTTCAGACAA	.(((((((((((..((((((..((((((((.((((((((((((((.((.(((.(....).))))).).))))))))))))).)))))))).))))))..)))).)))).)))..	21823097	21823170	CATGGTATTGTTTCGGCTCATGTCCTTCTCGAGCTGATGGTCGGATGAGATGTGAGCCGAACCAATATCACCCA	..((((((((.((((((((((((((.((.(((.(....).))))).).))))))))))))).))))))))....	Bdi-miR171a	21823097	21823118	CATGGTATTGTTTCGGCTCATG	Bdi-miR171a*	21823150	21823170	GAGCCGAACCAATATCACCCA		3
Bdi-MIR171b	PmiREN001115	MIR171	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	6907420	6907560	+	TACTGGCTGGGAGAGTGCGATGTTGGCACGGTTCAATCAAATCGGGTGGTCTCTGCATGCACTGGCTTGCGAGCAAGCTGCGATGATGTTTCGCTCCATCTGATTGAGCCGTGCCAATATCGCAAGCTTCTTTGCCTAGCA	................(((((((((((((((((((((((.((.((((((......((((((...(((((....)))))))).))).....)))))).)).)))))))))))))))))))))))..(((.........))).	6907440	6907540	TGTTGGCACGGTTCAATCAAATCGGGTGGTCTCTGCATGCACTGGCTTGCGAGCAAGCTGCGATGATGTTTCGCTCCATCTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((((((((((((((.((.((((((......((((((...(((((....)))))))).))).....)))))).)).)))))))))))))))))))..	Bdi-miR171b	6907520	6907540	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Bdi-miR171b*	6907440	6907460	TGTTGGCACGGTTCAATCAAA		3
Bdi-MIR171c	PmiREN001116	MIR171	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	24869588	24869706	-	TTAATGTATTATAGACGCGGTATTGGTGCGGTTCAATCAGAAAGCTGGCGCTCCGGACGCAAAAGGGGTTCCTCTCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTTTTGCTTGACTCGTAT	............(((((.(((((((((((((((((((((((.((..((.(((((..........))))).)).)).))))))))))))))))))))))).)))))..............	24869608	24869686	TATTGGTGCGGTTCAATCAGAAAGCTGGCGCTCCGGACGCAAAAGGGGTTCCTCTCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((((((((((((((((.((..((.(((((..........))))).)).)).)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR171c	24869608	24869628	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Bdi-miR171c*	24869666	24869686	TATTGGTGCGGTTCAATCAGA		3
Bdi-MIR171d	PmiREN001117	MIR171	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	73000902	73001031	-	TGATGAAATGGCCACTATGATGTTGGCTCGACTCACTCAGACGACACCGGCCGGAGCGATGCGTGCGTGCTAGCTCGACGGCGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGTGCTCTTTCATGCATA	((((((((.(((.((((.(((((((((.((.((((.(((((.(((((..((((((((...((......))..))))..)))))))))))))).)))).)).))))))))).))))))).)))))).))..	73000922	73001011	TGTTGGCTCGACTCACTCAGACGACACCGGCCGGAGCGATGCGTGCGTGCTAGCTCGACGGCGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATC	(((((((.((.((((.(((((.(((((..((((((((...((......))..))))..)))))))))))))).)))).)).)))))))..	Bdi-miR171d	73000922	73000942	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Bdi-miR171d*	73000991	73001011	TGTTGGCTCGACTCACTCAGA		3
Bdi-MIR171e	PmiREN001118	MIR171	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	30950292	30950407	-	CCATGCAATGGAAGGAGCGATATTGGTGAGGTTCAATCCGATGCTAGATTTTACATCAGTGTTAAGATCTGTATCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCTCTTCTTCTAATGTCGAA	........(((((((((.((((((((((.(((((((((.(((((.((((((((((....)).))))))))))))).))))))))).))))))))))...)))))))))........	30950312	30950387	TATTGGTGAGGTTCAATCCGATGCTAGATTTTACATCAGTGTTAAGATCTGTATCTGATTGAGCCGTGCCAATATC	((((((((.(((((((((.(((((.((((((((((....)).))))))))))))).))))))))).))))))))..	Bdi-miR171e	30950312	30950332	TGATTGAGCCGTGCCAATATC	Bdi-miR171e*	30950367	30950387	TATTGGTGAGGTTCAATCCGA		3
Bdi-MIR172a	PmiREN001120	MIR172	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	55493943	55494071	-	CACAGTCGGCGCTTGCAGGTGCAGCACCACCAAGATTCACATCGGGTTCTCCAGTCGTAATTAATTAACGAGGAGTACAACCATGATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAACCGCTCGACTACTC	...((((((((.((((.(((((((((.((.((((((((.(((((((((((((..((((.........))))))))...)))).))))).)))))))).)).))))))))).)))).))).)))))....	55493963	55494051	GCAGCACCACCAAGATTCACATCGGGTTCTCCAGTCGTAATTAATTAACGAGGAGTACAACCATGATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT	((((((.((.((((((((.(((((((((((((..((((.........))))))))...)))).))))).)))))))).)).))))))..	Bdi-miR172a	55493963	55493983	AGAATCTTGATGATGCTGCAT	Bdi-miR172a*	55494031	55494051	GCAGCACCACCAAGATTCACA		3
Bdi-MIR172b	PmiREN001121	MIR172	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	58716489	58716722	-	ACCAGTCGGTGATTTCTGCTGTGGCATCATCAAGATTCACACAAATGCATGCTAGCTTCGTCTATGCCATCCTTTCTCATCTTTCGATCTCGATCTCGGCCCTAATTAAGTAATTATACCCAATTGTGGATCGGCCGGATTGGAGATCGATGGATGCGTGGAGAGGAGCTAGATTAGCTATAGCTTATGTGTGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGACATCAGTGACTAAAAC	...(((((.((((.((((.((((((((((((((((((((((((...((.((.(((((..(((((.((..(((((((((((((.((((((((((((.(((((.(((((....)))))...(((....)))...))))))))).)))))))).)))))...))))))))))))))).)))))))))...)))))..))))))))))))))))))).)))).)))).))))).....	58716509	58716702	GTGGCATCATCAAGATTCACACAAATGCATGCTAGCTTCGTCTATGCCATCCTTTCTCATCTTTCGATCTCGATCTCGGCCCTAATTAAGTAATTATACCCAATTGTGGATCGGCCGGATTGGAGATCGATGGATGCGTGGAGAGGAGCTAGATTAGCTATAGCTTATGTGTGGGAATCTTGATGATGCTGCAT	(((((((((((((((((((((((...((.((.(((((..(((((.((..(((((((((((((.((((((((((((.(((((.(((((....)))))...(((....)))...))))))))).)))))))).)))))...))))))))))))))).)))))))))...)))))..))))))))))))))))))..	Bdi-miR172b	58716509	58716529	GGAATCTTGATGATGCTGCAT	Bdi-miR172b*	58716682	58716702	GTGGCATCATCAAGATTCACA		3
Bdi-MIR319a	PmiREN001128	MIR319	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	31140436	31140689	+	AGGTATTCATTTGAGGGAGCTTTCTTCTGTCCACCCATGGGAGGTAGCGGGGATTGAACGAGCTGCCGACTCATTCACTCGAACACACAGTGGATAACTGGATATGCAGACTAATCCAAGGCATAATATCTACTAGTGTGGAATAATATCTACTGTGTGAATGAGCGAATGAAGCGGGAGATTGTTCTCTCTTTCCTCCTCCATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCACCTCTCATCACTTTCTCCCTC	...........((((((((((((((((.(((((..(((((.(((.((.(((((..((((((.((.(((..((((((.((((..(((((((((((((..(((((..........)))))..........(((((....)))))....)))))))))))))..)))).))))))..))).)).))))))..))))).))))))))))..))))).))))))))))))))))..................... .-1	31140456	31140669	GGGAGCTTTCTTCTGTCCACCCATGGGAGGTAGCGGGGATTGAACGAGCTGCCGACTCATTCACTCGAACACACAGTGGATAACTGGATATGCAGACTAATCCAAGGCATAATATCTACTAGTGTGGAATAATATCTACTGTGTGAATGAGCGAATGAAGCGGGAGATTGTTCTCTCTTTCCTCCTCCATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTC	(((((((((((((.(((((..(((((.(((.((.(((((..((((((.((.(((..((((((.((((..(((((((((((((..(((((..........)))))..........(((((....)))))....)))))))))))))..)))).))))))..))).)).))))))..))))).))))))))))..))))).)))))))))))))..	Bdi-miR319a	31140649	31140669	TGGACTGAAGGGAGCTCCCTC	Bdi-miR319a*	31140456	31140476	GGGAGCTTTCTTCTGTCCACC		3
Bdi-MIR319b	PmiREN001129	MIR319	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	45769618	45769827	-	GTGGCTCATGCATGTATAAGAGAGCTCTCTTCAGTCCACTCTCAGATGACTGTAGGGTTTTATTAGCTGCCGATTCATCCATTCACCTACCAAGAATCATGAGGGCGTATATGTCTTGGTAGCCGACTGGATGGCACGGGAGCTACAAAAAGCTTTTCGTTGTTTGTGGTTGGACTGAAGGGTGCTCCCTTGCTTACAATACTGCACAAA	............((((((((.((((.((((((((((((.((.((((((((...(((.((((..(((((.(((..(((((((.((..(((((((((..((((........)))))))))))))..)).)))))))..))).)))))..)))).)))...)))))))).)).)))))))))))).)))).))))..))))............	45769638	45769807	AGAGCTCTCTTCAGTCCACTCTCAGATGACTGTAGGGTTTTATTAGCTGCCGATTCATCCATTCACCTACCAAGAATCATGAGGGCGTATATGTCTTGGTAGCCGACTGGATGGCACGGGAGCTACAAAAAGCTTTTCGTTGTTTGTGGTTGGACTGAAGGGTGCTCCCT	.((((.((((((((((((.((.((((((((...(((.((((..(((((.(((..(((((((.((..(((((((((..((((........)))))))))))))..)).)))))))..))).)))))..)))).)))...)))))))).)).)))))))))))).))))...	Bdi-miR319b	45769638	45769658	TTGGACTGAAGGGTGCTCCCT	Bdi-miR319b*	45769787	45769807	AGAGCTCTCTTCAGTCCACTC		3
Bdi-MIR319c	PmiREN001130	MIR319	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	5602745	5602962	-	ATGGGAGTGATGGACGGAAGAGAGCGTCCTTCAGTCCACTCACGGGCGGTGCCAGGATCGAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCACATGCCGAGCAAAAGTTTAGCCCTTTGAGAAAGAGCTTTGCAGATGAGTGAATGAAGCGGGAGGTAAAGCTTTGATCTCGCGCCGCCGTTGCTTGGACTGAAGGGTGCTCCCTCCTCCTCCCTTAGCCACCTG	..(((((.((.(((.((....(((((((((((((((((..((..((((((((..(((((((((((.((.(((..((((((((.((..(((.((((.....(((((....))))).....)))).)))..)).))))))))..))).)).)))...)))))))).))))))))..))..)))))))))))))))))))))))))))))...........	5602765	5602942	AGAGCGTCCTTCAGTCCACTCACGGGCGGTGCCAGGATCGAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCACATGCCGAGCAAAAGTTTAGCCCTTTGAGAAAGAGCTTTGCAGATGAGTGAATGAAGCGGGAGGTAAAGCTTTGATCTCGCGCCGCCGTTGCTTGGACTGAAGGGTGCTCCCT	.(((((((((((((((((..((..((((((((..(((((((((((.((.(((..((((((((.((..(((.((((.....(((((....))))).....)))).)))..)).))))))))..))).)).)))...)))))))).))))))))..))..)))))))))))))))))...	Bdi-miR319c	5602765	5602785	TTGGACTGAAGGGTGCTCCCT	Bdi-miR319c*	5602922	5602942	AGAGCGTCCTTCAGTCCACTC		3
Bdi-MIR390	PmiREN001131	MIR390	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	2720633	2720821	+	TCGGTAAGGAACAATCCTTGAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTAGGTTCACTGCAACCAACAAGAGAACCGGCCATCGATATATACATATATATGTCCTCGATCGACCGATCGATCTCTTGCTGGTTCCGTCGATCTGTTCGTCCGAAGCGCTATCTATCCTGAGCTCCACGGTTCGTTCGTTCTTACCA	..((((((((((...((.((.(((((((((.(((((((((.((((((.((.(.(((((.(((((((..........((((((((....)))))))).((((((....))))))))))))).)))))).)).))))))(((....)))))))))))).))))))))).)).))...))))...)))))).	2720653	2720801	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTAGGTTCACTGCAACCAACAAGAGAACCGGCCATCGATATATACATATATATGTCCTCGATCGACCGATCGATCTCTTGCTGGTTCCGTCGATCTGTTCGTCCGAAGCGCTATCTATCCTGAGCTCCA	.(((((((((.(((((((((.((((((.((.(.(((((.(((((((..........((((((((....)))))))).((((((....))))))))))))).)))))).)).))))))(((....)))))))))))).)))))))))...	Bdi-miR390	2720653	2720673	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC	Bdi-miR390*	2720781	2720801	CGCTATCTATCCTGAGCTCCA		3
Bdi-MIR393a	PmiREN001132	MIR393	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	2007373	2007505	-	AACAATGTCTTGGGGAAGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTCGACTCCATTAATGGTGTTCGTCATCGTCTGCTGATTGTCGACGACGGATCATGCGATCCTTTTGGAGGCTTCCTCTAGCCATTACTAC	...((((.((.((((((((.((((((((((((((((.(((((..((((.(((....))).).)))...(((((.((.....)).))))).))))))))))))))))))))).)))))))).)).)))).....	2007393	2007485	TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTTCGACTCCATTAATGGTGTTCGTCATCGTCTGCTGATTGTCGACGACGGATCATGCGATCCTTTTGGAGG	((((((((((((((((.(((((..((((.(((....))).).)))...(((((.((.....)).))))).)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR393a	2007465	2007485	TCCAAAGGGATCGCATTGATC	Bdi-miR393a*	2007393	2007413	ATCATGCGATCCTTTTGGAGG		3
Bdi-MIR393b	PmiREN001133	MIR393	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	27796220	27796356	+	CAGGAAGCTAGTGGAGGACTCCAAAGGGATCGCATTGATCTCATCAGCTGCATCCAAGCATGAATCAACGGATGGATGGATCGATGCATATGCAAGATCAGTGCAATCCCTTTGGAATTCTCGACTCGCCTCTGCCT	...................(((((((((((.((((((((((...((..((((((....(((..(((....)))..)))....))))))..))..)))))))))).)))))))))))...........((....))..	27796240	27796336	CCAAAGGGATCGCATTGATCTCATCAGCTGCATCCAAGCATGAATCAACGGATGGATGGATCGATGCATATGCAAGATCAGTGCAATCCCTTTGGAA	((((((((((.((((((((((...((..((((((....(((..(((....)))..)))....))))))..))..)))))))))).))))))))))..	Bdi-miR393b	27796240	27796260	CCAAAGGGATCGCATTGATCT	Bdi-miR393b*	27796317	27796336	TCAGTGCAATCCCTTTGGAA		3
Bdi-MIR394	PmiREN001134	MIR394	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	52078173	52078307	-	GGGCGCTTACCGAGAGCTCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCTTGCGAGTCTCGCGGGAGATCTCATGATCTGTTGTTGAGCTTGCAGATAGCTTGGAGGTGGGCATACTGCCAATGGAGCTGTGTAGGCTTCCCTT	(((.((((((..(.((((((((((((...((((((((((((((((((.(((((((.(((((....))))).))).))))))))))).......)))))))))))...)))))).)))))).))))))).)))...	52078193	52078287	TTGGCATTCTGTCCACCTCCTTGCGAGTCTCGCGGGAGATCTCATGATCTGTTGTTGAGCTTGCAGATAGCTTGGAGGTGGGCATACTGCCAATG	((((((...((((((((((((((((((.(((((((.(((((....))))).))).))))))))))).......)))))))))))...))))))..	Bdi-miR394	52078268	52078287	TTGGCATTCTGTCCACCTCC	Bdi-miR394*	52078193	52078213	GAGGTGGGCATACTGCCAATG		3
Bdi-MIR395a	PmiREN001135	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	16422377	16422537	+	ATGGTTGGTTGTCAACTGGAGTTCTCCTCAAATCACTTCAGTAGCTAGCTAGCTAGCTTGTGCCTCATTGTTTCATTGCCGCTGTTTATAAGTGTGCATGGAGCTGGAGAGCCGTGCACAGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCGGGTGGCAACCAACAATAC	...(((((((((((.((((((((((((.((((.(((((((..((((((....))))))((((((((...(((((((.((((((.......)))).)))))))))....)))....))))).))))))))))))))))))))))).))))))))))).....	16422397	16422517	GTTCTCCTCAAATCACTTCAGTAGCTAGCTAGCTAGCTTGTGCCTCATTGTTTCATTGCCGCTGTTTATAAGTGTGCATGGAGCTGGAGAGCCGTGCACAGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.((((.(((((((..((((((....))))))((((((((...(((((((.((((((.......)))).)))))))))....)))....))))).))))))))))))))))))..	Bdi-miR395a	16422498	16422517	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395a*	16422397	16422417	GTTCTCCTCAAATCACTTCAG		3
Bdi-MIR395b	PmiREN001136	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	55639202	55639356	-	CCCAATTATGATGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTCACCAAGCTTACACAAATAAAAAGAGATACATCGGCCGATGGCAGATGACATTTGGTATTACCATGAGTTCCTGGCAAGCACTTCACGAGGCCCAATTCTAAGGACTA	............((((..(((((((((((((.((((((((.(((((..(((((((((.............)))...((((.(((...))).))))...))))))..))))).))))))))..))))))))))))).))))...............	55639222	55639336	TGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTCACCAAGCTTACACAAATAAAAAGAGATACATCGGCCGATGGCAGATGACATTTGGTATTACCATGAGTTCCTGGCAAGCACTTCACG	(((((((((((.((((((((.(((((..(((((((((.............)))...((((.(((...))).))))...))))))..))))).))))))))..)))))))))))..	Bdi-miR395b	55639317	55639336	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395b*	55639222	55639242	GTTCCTGGCAAGCACTTCACG		3
Bdi-MIR395c	PmiREN001137	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25617673	25617776	+	CACGTTTGGTAATACCATGAGTTCCCTGCAAGCACTTCATGAGGCCTAATTCTAAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTTACCAAGCTTTTA	...((((((((((((((.(((((((((.(((((((((((((.(((((........)))))..)))))))))))))))))))))).)))))))))))))).....	25617693	25617756	GTTCCCTGCAAGCACTTCATGAGGCCTAATTCTAAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.(((((((((((((.(((((........)))))..))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395c	25617737	25617756	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395c*	25617693	25617713	GTTCCCTGCAAGCACTTCATG		3
Bdi-MIR395d	PmiREN001138	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	14785755	14785879	-	ACGAACGGTTGGTTGTTTCCTGGGGTTCCCTCCAAACACTTCAGCAGGTCGGCTTTCCTATACTAGCTCACAGGCTGAAGGGTGAAGTGTTTGGGGAACTCTAGGTGACAACCGCCATTTTATCA	......(((.(((((((.((((((((((((..(((((((((((.(...(((((((................)))))))..).))))))))))))))))))))))).)))))))))).........	14785775	14785859	TGGGGTTCCCTCCAAACACTTCAGCAGGTCGGCTTTCCTATACTAGCTCACAGGCTGAAGGGTGAAGTGTTTGGGGAACTCTAGG	((((((((((..(((((((((((.(...(((((((................)))))))..).)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395d	14785775	14785795	AAGTGTTTGGGGAACTCTAGG	Bdi-miR395d*	14785839	14785859	TGGGGTTCCCTCCAAACACTT		3
Bdi-MIR395e	PmiREN001139	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25616858	25617015	+	TTGGTTGGTTGTCACCTGGAGTTCTCCTCAAATCACTTCAGTAGCTAGCTAGCTTGTGCCTCCTTGTTGCATTGCCACTGTTTTATAAGTGTGCTTGGGGCCAGAGAGCTGTGCACAGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTGGGTGGCAACCAGCATTTT	......(((((((((((((((((((((.((((.(((((((.(.(((((((..((.(.(((.((.....(((....((((........)))))))..))))))))..))))).))..).))))))))))))))))))))))))))))))))........	25616878	25616995	GTTCTCCTCAAATCACTTCAGTAGCTAGCTAGCTTGTGCCTCCTTGTTGCATTGCCACTGTTTTATAAGTGTGCTTGGGGCCAGAGAGCTGTGCACAGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.((((.(((((((.(.(((((((..((.(.(((.((.....(((....((((........)))))))..))))))))..))))).))..).))))))))))))))))))..	Bdi-miR395e	25616976	25616995	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395e*	25616878	25616898	GTTCTCCTCAAATCACTTCAG		3
Bdi-MIR395f	PmiREN001140	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25617089	25617192	+	TGAGTTTGGTGTCCCCGGGAGTTCCCTTCAAACACTTTACGAAGCATCTTTCTAAGACTATTTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTCGGTGTCACCAAGCATTTT	...((((((((.(.(((((((((((((.(((((((((((((((...((((...))))...)))))))))))))))))))))))))))).).)))))))).....	25617109	25617172	GTTCCCTTCAAACACTTTACGAAGCATCTTTCTAAGACTATTTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.(((((((((((((((...((((...))))...))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395f	25617153	25617172	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395f*	25617109	25617129	GTTCCCTTCAAACACTTTACG		3
Bdi-MIR395g	PmiREN001141	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25617382	25617486	+	AACGTTTGGTGTTACCAGGAGTTTCCTGCAAACACTTCACGAGTGCCTATTTTAATGGGTTGTTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGATGTCACCAAGCTTCTA	...((((((((.((.((((((((((((.((((((((((((((..((((((....))))))..)))))))))))))))))))))))))).)).)))))))).....	25617402	25617466	GTTTCCTGCAAACACTTCACGAGTGCCTATTTTAATGGGTTGTTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.((((((((((((((..((((((....))))))..)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395g	25617447	25617466	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395g*	25617402	25617422	GTTTCCTGCAAACACTTCACG		3
Bdi-MIR395h	PmiREN001142	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25617535	25617638	+	CACGTTTGGTATTACCATGAGTTCCCTGCAAGCACTTCACGAGGCCGTTTTCTGAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTCTCACCAAGCTTTTA	...(((((((...((((.(((((((((.(((((((((((((.((((.((....)).))))..)))))))))))))))))))))).))))...))))))).....	25617555	25617618	GTTCCCTGCAAGCACTTCACGAGGCCGTTTTCTGAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.(((((((((((((.((((.((....)).))))..))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395h	25617599	25617618	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395h*	25617555	25617575	GTTCCCTGCAAGCACTTCACG		3
Bdi-MIR395i	PmiREN001150	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	55639925	55640081	-	TTGGTTGGTTGTCACCTGGAGTTCTCCTCAAATCACTTCAGTAGCTAGCTAGCTTGTGACTCATTGTTACATTGTCACTGTTTTATAAGTGTGCTTGGGGCAGAGAGTTATGCATAGTGAAGTGTTTGGGGGAATTCTAGGTCACAATCAGCATTTT	...(((((((((.((((((((((((((.((((.(((((((.((((..........(((((((.((((..((....((((........))))....))..)))).))))))))).)).))))))))))))))))))))))))).))))))))).....	55639945	55640061	GTTCTCCTCAAATCACTTCAGTAGCTAGCTAGCTTGTGACTCATTGTTACATTGTCACTGTTTTATAAGTGTGCTTGGGGCAGAGAGTTATGCATAGTGAAGTGTTTGGGGGAATTC	(((((((.((((.(((((((.((((..........(((((((.((((..((....((((........))))....))..)))).))))))))).)).))))))))))))))))))..	Bdi-miR395i	55639945	55639965	GTGAAGTGTTTGGGGGAATTC	Bdi-miR395i*	55640040	55640061	GTTCTCCTCAAATCACTTCAGT		3
Bdi-MIR395j	PmiREN001144	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25617810	25617913	+	CATGTTTGGTATTCTCATGAGTTTCCCGCAAGCACTTCACGAGGCCGTTTTCTGAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTCTCACCAAGCTTTCA	...(((((((....(((.(((((((((.(((((((((((((.((((.((....)).))))..)))))))))))))))))))))).)))....))))))).....	25617830	25617893	GTTTCCCGCAAGCACTTCACGAGGCCGTTTTCTGAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.(((((((((((((.((((.((....)).))))..))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395j	25617874	25617893	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395j*	25617830	25617850	GTTTCCCGCAAGCACTTCACG		3
Bdi-MIR395k	PmiREN001145	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25617948	25618051	+	CACGTTTGGTACTACCATGAGTTCCCTGCAAGCACTTCATGAGGCCCAATTCTGAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTTACCAAGCTTTTA	...((((((((.(((((.(((((((((.(((((((((((((.(((((........)))))..)))))))))))))))))))))).))))).)))))))).....	25617968	25618031	GTTCCCTGCAAGCACTTCATGAGGCCCAATTCTGAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.(((((((((((((.(((((........)))))..))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395k	25618012	25618031	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395k*	25617968	25617988	GTTCCCTGCAAGCACTTCATG		3
Bdi-MIR395l	PmiREN001146	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25618225	25618328	+	CATGTTTGGTATTATCATGAGTTCCCTGCAAGCACTTCACGAGGCACTATCCCAAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTCACCAAGCTTTCA	...(((((((..(((((.(((((((((.(((((((((((((.(((.((......)).)))..)))))))))))))))))))))).)))))..))))))).....	25618245	25618308	GTTCCCTGCAAGCACTTCACGAGGCACTATCCCAAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.(((((((((((((.(((.((......)).)))..))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395l	25618289	25618308	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395l*	25618245	25618265	GTTCCCTGCAAGCACTTCACG		3
Bdi-MIR395m	PmiREN001147	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	55638875	55639121	-	CATGTTTGGTATTACCATGAGTTCCTTGCAAGTCACTTCACGAGGCACTATCCTAAGGGCTATTGTGAAATGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTTACCAAGCTTTCACAAACAAAAGAGATACATTGGCCAGCGACAGACCATTTTTGGTATTACCATGAGTTCCTTTGCAAGCATTTCACGTACGAGGCACTATCCCAAGGGCTATTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTCACCAAGATTTCA	....((((((..(((((.(((((((((.((((.(((((((((((((.((......(((.((..((((((((((((((((((((((.(((((.(((((((((((........))))........((((........).)))..))))))).))))).)))))))))..)))))))))))))....)).).))......)).))).))))))))))))))))))))))).)))))..))))))......	55638895	55639101	GTTCCTTGCAAGTCACTTCACGAGGCACTATCCTAAGGGCTATTGTGAAATGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTTACCAAGCTTTCACAAACAAAAGAGATACATTGGCCAGCGACAGACCATTTTTGGTATTACCATGAGTTCCTTTGCAAGCATTTCACGTACGAGGCACTATCCCAAGGGCTATTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.((((.(((((((((((((.((......(((.((..((((((((((((((((((((((.(((((.(((((((((((........))))........((((........).)))..))))))).))))).)))))))))..)))))))))))))....)).).))......)).))).)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395m	55638895	55638914	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395m*	55639081	55639101	GTTCCTTGCAAGTCACTTCAC		3
Bdi-MIR395n	PmiREN001148	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25618637	25618879	+	CATGTTTGGTATTACCATGAGTTCCTTGCAAAAACTTCACGAGGTCCAATTCTAAGTGCTCCCGTGAAGTGTTTGGGGGAAACTCTTGGTGTCACCAAGCTTTCGCGAACAAAAGGAGATACATTGGCCAACTGCAGACTATGTTTGGTATTACCATGAGTTCCCTGCAAGCACTTCACCATGCACTACCCCAAGGGCTATTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGTCACCAAGCTTTTA	...(((((((..(((((.(((((((((.((((.((((((((((((((.......(((((....((((((((((((.(((.(((((.(((((..(((((((..(((((........((......)).......))).))....)))))))..))))).))))).))).))))))))))))...))))).......))))).))))))))).))))))))))))).)))))..))))))).....	25618657	25618859	GTTCCTTGCAAAAACTTCACGAGGTCCAATTCTAAGTGCTCCCGTGAAGTGTTTGGGGGAAACTCTTGGTGTCACCAAGCTTTCGCGAACAAAAGGAGATACATTGGCCAACTGCAGACTATGTTTGGTATTACCATGAGTTCCCTGCAAGCACTTCACCATGCACTACCCCAAGGGCTATTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.((((.((((((((((((((.......(((((....((((((((((((.(((.(((((.(((((..(((((((..(((((........((......)).......))).))....)))))))..))))).))))).))).))))))))))))...))))).......))))).))))))))).)))))))))))..	Bdi-miR395n	25618840	25618859	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395n*	25618657	25618677	GTTCCTTGCAAAAACTTCACG		3
Bdi-MIR395o	PmiREN001149	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	55639452	55639555	-	CATGTTTGGTATTATCATGAATTCCCTACAAGCACTTCACAAGAAGCTATTCCTAGGGCTATTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGATGTCACCAAGCTTCCA	...(((((((..(((((.((.((((((.((((((((((((((..((((........)))).)))))))))))))))))))).)).)))))..))))))).....	55639472	55639535	ATTCCCTACAAGCACTTCACAAGAAGCTATTCCTAGGGCTATTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	.((((((.((((((((((((((..((((........)))).))))))))))))))))))))...	Bdi-miR395o	55639472	55639491	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395o*	55639515	55639535	ATTCCCTACAAGCACTTCACA		3
Bdi-MIR395p	PmiREN001143	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25618096	25618184	+	ATTGCCATGAGTTTCCTGCAAGCACTTCACGAGGCACTATCGATCCCAAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGAGGAACTCTTGGTGTCACC	...((((.(((((.(((.(((((((((((((.(((.((..........)).)))..))))))))))))).)))))))).))))......	25618106	25618173	GTTTCCTGCAAGCACTTCACGAGGCACTATCGATCCCAAGGGCTACTGTGAAGTGTTTGGAGGAACTC	(((.(((.(((((((((((((.(((.((..........)).)))..))))))))))))).))))))))	Bdi-miR395p	25618154	25618175	TGAAGTGTTTGGAGGAACTC	Bdi-miR395p*	25618106	25618126	GTTTCCTGCAAGCACTTCACG		2
Bdi-MIR395q	PmiREN001151	MIR395	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25618500	25618603	+	CATGTTTGGAATTATCATGAGTTCCTTGCAAGCACTTCATGAGGCACTATCCCAAGGGCTACTATGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGATATCACCAAGCTTTCA	...((((((...(((((.(((((((((.(((((((((((((.(((.((......)).)))..)))))))))))))))))))))).)))))...)))))).....	25618520	25618583	GTTCCTTGCAAGCACTTCATGAGGCACTATCCCAAGGGCTACTATGAAGTGTTTGGGGGAACTC	(((((((.(((((((((((((.(((.((......)).)))..))))))))))))))))))))..	Bdi-miR395q	25618564	25618583	TGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Bdi-miR395q*	25618520	25618540	GTTCCTTGCAAGCACTTCATG		3
Bdi-MIR396a	PmiREN001152	MIR396	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	59106924	59107107	-	TACAGGTTGCGGCCATGCTCTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGCGCCTAGCCTGCTAGCTGCTCAATTCGATCTGTCATCCTCGGTTCGATTCGATCTGAATTGCTTGTATATGATATGATGTGCCTTGTTGATGGTTCAAGAAAGTCCTTGGAAAACATGGCCGCCGCCTCTTTC	...((((.(((((((((...((((..((((((((((((((((.(((....(((.((((....)))).))).((((((((((.(((..(....)...)))..)))).))))))...((((((......))))))...))).))))))))))))))))..))))...))))))))).)))).....	59106944	59107087	TCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGCGCCTAGCCTGCTAGCTGCTCAATTCGATCTGTCATCCTCGGTTCGATTCGATCTGAATTGCTTGTATATGATATGATGTGCCTTGTTGATGGTTCAAGAAAGTCCTTGGAAA	((((..((((((((((((((((.(((....(((.((((....)))).))).((((((((((.(((..(....)...)))..)))).))))))...((((((......))))))...))).))))))))))))))))..))))..	Bdi-miR396a	59107067	59107087	TCCACAGGCTTTCTTGAACTG	Bdi-miR396a*	59106944	59106964	GTTCAAGAAAGTCCTTGGAAA		3
Bdi-MIR396b	PmiREN001153	MIR396	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	27294063	27294229	+	AGAGATGCGCGGGCATGCTTTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGGGGGTGTTCTCCTCTGAATTGTGTCGTGGAATTGCGGGCTTGTTCTTTATCCGTCGATCTCTCCGCCTGTTGATGGTTCAAGAAAGCCCATGGAAACCATGCCGCCATCTTGGTCT	.((((((.((((.((((.((((((..((((((((((((((((.(((..(((((((.((((......))))...((((((((...(((....)))......)))).)))).)))))))..))).))))))))))))))))..)))))).)))))))))))))).....	27294083	27294209	TCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGGGGGTGTTCTCCTCTGAATTGTGTCGTGGAATTGCGGGCTTGTTCTTTATCCGTCGATCTCTCCGCCTGTTGATGGTTCAAGAAAGCCCATGGAAA	((((..((((((((((((((((.(((..(((((((.((((......))))...((((((((...(((....)))......)))).)))).)))))))..))).))))))))))))))))..))))..	Bdi-miR396b	27294083	27294103	TCCACAGGCTTTCTTGAACTG	Bdi-miR396b*	27294189	27294209	GTTCAAGAAAGCCCATGGAAA		3
Bdi-MIR396c	PmiREN001154	MIR396	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	54725525	54725654	-	GCATGGCCCTCTCTGTGATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCTCGGATCTGCCTAATTAGATCACGGCTTGGGTTTGCACGAGAGGGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTTCAGAGAGAGGCCAATTG	(..((((((((((((.(((.((((((((((((.(((((((((((.((((((......))))))....((((........)))).))))))))))).)))))))))))).))).))))))).)))))..).	54725545	54725634	TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCTCGGATCTGCCTAATTAGATCACGGCTTGGGTTTGCACGAGAGGGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAA	((((((((((((.(((((((((((.((((((......))))))....((((........)))).))))))))))).))))))))))))..	Bdi-miR396c	54725614	54725634	TTCCACAGCTTTCTTGAACTG	Bdi-miR396c*	54725545	54725565	GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA		3
Bdi-MIR396d	PmiREN001155	MIR396	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	46839452	46839580	-	GCATGGCCCTCTTTGCTATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTGCAATGGATGCTACTTAGCTTATGCTTAACTGCAAGAGTGCTGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTGCAGAGAGAGACCAATTG	........((((((((.((.((((((((((((.((((((.((((((.....))))))......((((.(((......))).))))...)))))).)))))))))))).)).))))))))..........	46839472	46839560	TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTGCAATGGATGCTACTTAGCTTATGCTTAACTGCAAGAGTGCTGTTCAATAAAGCTGTGGGAAA	((((((((((((.((((((.((((((.....))))))......((((.(((......))).))))...)))))).))))))))))))..	Bdi-miR396d	46839540	46839560	TTCCACAGCTTTCTTGAACTG	Bdi-miR396d*	46839472	46839492	GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA		3
Bdi-MIR396e	PmiREN001156	MIR396	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	54720223	54720394	+	AGTTAGTCCATGCCATTCCTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCCTTCCCGGACTGCGGCCTGTAGCTCTCTCGCCCTCTTGATCTCCCGTCGATCTCCACTGGTAGCAGCTGGGAGAGCAGGGAAGAGGAGGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAGAAATGGCATAACCAGGACTT	....(((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((.(....)))....((((((((((((....((((.......))))......)).....)).)))))))).)))))).))))).))))))))))))))))))).)))))))).....))))).	54720243	54720374	TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCCTTCCCGGACTGCGGCCTGTAGCTCTCTCGCCCTCTTGATCTCCCGTCGATCTCCACTGGTAGCAGCTGGGAGAGCAGGGAAGAGGAGGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAG	(((((((((((((((((.(((((((((((((.(....)))....((((((((((((....((((.......))))......)).....)).)))))))).)))))).))))).)))))))))))))))))..	Bdi-miR396e	54720243	54720263	TTCCACAGCTTTCTTGAACTT	Bdi-miR396e*	54720354	54720374	GGTCAAGAAAGCTGTGGGAAG		3
Bdi-MIR397a	PmiREN001157	MIR397	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	3160035	3160153	-	AGAAGAGGCGCAAAGGCATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAACAGGGGCCAGGCGACCGGCGGCCGGTCCGGTTCGGTTCACCGGCGCTGCACACAGTGACGCCCTTGCATTCTCTGGCC	.........((((.(((.((((((.(((((((((((.(((((..(((((..(.((((((...)))))))))))).))))).))))))))))).)))))).))).))))...........	3160055	3160133	ATTGAGTGCAGCGTTGATGAACAGGGGCCAGGCGACCGGCGGCCGGTCCGGTTCGGTTCACCGGCGCTGCACACAGTGA	((((.(((((((((((.(((((..(((((..(.((((((...)))))))))))).))))).))))))))))).))))..	Bdi-miR397a	3160113	3160133	ATTGAGTGCAGCGTTGATGAA	Bdi-miR397a*	3160055	3160075	CACCGGCGCTGCACACAGTGA		3
Bdi-MIR397b	PmiREN001158	MIR397	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	3188192	3188312	-	AGAAGAGGCGCAGAGGCTTGATTGAGTGCAGCGTTGATGAACCCCTCTGCGCCCAGGCCGGCCATGGAACGCGGGGGGTTCTTCGACCCTGCACCCAATCACGCCTCTGCTTTCCTCTAGC	.........((((((((.((((((.((((((.(((((.(((((((.(((((.(((((....)).)))..)))))))))))).))))).)))))).)))))).))))))))...........	3188212	3188292	ATTGAGTGCAGCGTTGATGAACCCCTCTGCGCCCAGGCCGGCCATGGAACGCGGGGGGTTCTTCGACCCTGCACCCAATCA	((((.((((((.(((((.(((((((.(((((.(((((....)).)))..)))))))))))).))))).)))))).))))..	Bdi-miR397b	3188272	3188292	ATTGAGTGCAGCGTTGATGAA	Bdi-miR397b*	3188212	3188232	CTTCGACCCTGCACCCAATCA		3
Bdi-MIR398a	PmiREN001159	MIR398	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	35683355	35683476	-	CATGCGAGGAAGTTCCTGCAGGGTCGAATTGGGAACACATGAGATGGATGGTCCGCTGAGCTCTGAGCTCGAGCTCGGCCATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGTTGGGTCTTCCGTGCCATGG	...(((.(((((.(((.((((((.(((.(((((((((((((....(((...)))(((((((((.......)))))))))))))))))))))).))).)))))).))).))))).))).....	35683375	35683456	GGGTCGAATTGGGAACACATGAGATGGATGGTCCGCTGAGCTCTGAGCTCGAGCTCGGCCATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG	(((.(((.(((((((((((((....(((...)))(((((((((.......)))))))))))))))))))))).))).)))..	Bdi-miR398a	35683375	35683395	TGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG	Bdi-miR398a*	35683436	35683456	GGGTCGAATTGGGAACACATG		3
Bdi-MIR398b	PmiREN001160	MIR398	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	21961000	21961130	+	ATTGAGGGAAGCTGAACCCACAGGAGTGTCACTGAGAACACAGGTGCAGATGCCAATGCATGGTGAGTTTTCATTTTTGCATCGCAATTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGGGTTGCTTCCCTTGATTCCA	((((((((((((..((((((.(((.(((.(.((((((((((((.(((.(((((.((.....(((((....))))))).)))))))).))))))))))))).))).))).))))))))))))))))))....	21961020	21961110	CAGGAGTGTCACTGAGAACACAGGTGCAGATGCCAATGCATGGTGAGTTTTCATTTTTGCATCGCAATTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTG	.(((.(((.(.((((((((((((.(((.(((((.((.....(((((....))))))).)))))))).))))))))))))).))).)))...	Bdi-miR398b	21961090	21961110	TGTTCTCAGGTCACCCCTTTG	Bdi-miR398b*	21961020	21961041	CAGGAGTGTCACTGAGAACACA		3
Bdi-MIR399a	PmiREN001161	MIR399	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	4939200	4939332	+	ATTGTGGGCTCTGAATAACAGGGCAGTGCTCCCTCGGCAGAGTACACAACCAGATGCAGGGAAAGCAATGATCTGCAGCCCTGCTCTGGCTCTGCCGAAGGAGAGCTGCCCTGCCATTCAACAGCACAAGCGC	............((((..(((((((((.((((.(((((((((.......(((((.((((((...(((......)))..)))))))))))))))))))).)))).)))))))))..))))..............	4939220	4939312	GGGCAGTGCTCCCTCGGCAGAGTACACAACCAGATGCAGGGAAAGCAATGATCTGCAGCCCTGCTCTGGCTCTGCCGAAGGAGAGCTGCCCTG	(((((((.((((.(((((((((.......(((((.((((((...(((......)))..)))))))))))))))))))).)))).)))))))..	Bdi-miR399a	4939292	4939312	TGCCGAAGGAGAGCTGCCCTG	Bdi-miR399a*	4939220	4939240	GGGCAGTGCTCCCTCGGCAGA		3
Bdi-MIR399b	PmiREN001162	MIR399	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	7148303	7148442	+	AGATGAGGGTGAGAATTACAGTGCGGTTCTCCTCTGGCACGGAGGTCGAGGGTAGCCGGCGGCAATCCGGCCAGCGGCGAGGCTGCCAGTCCGTCCCCTTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCCATTCATAACCCTCCTGGG	....((((((..((((..(((.(((((((((((.(((((.((.((.((..(((((((.((.((..........)).))..)))))))....)).)))).))))).))))))))))).)))..))))...)))))).....	7148323	7148422	GTGCGGTTCTCCTCTGGCACGGAGGTCGAGGGTAGCCGGCGGCAATCCGGCCAGCGGCGAGGCTGCCAGTCCGTCCCCTTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	(.(((((((((((.(((((.((.((.((..(((((((.((.((..........)).))..)))))))....)).)))).))))).))))))))))).)..	Bdi-miR399b	7148402	7148422	TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	Bdi-miR399b*	7148323	7148343	GTGCGGTTCTCCTCTGGCACG		3
Bdi-MIR399c	PmiREN001163	MIR399	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	16746863	16747028	+	CACACAGCATGTGAATCCCAGGGCGCTTCTCCTTTGGCACGGTGGCATGTACCTGCAATGGAGTCAGCCAGGTGAGGATGCAGGTGAAGCTCCAGGCTTCCGTGGTGCAGCTCGCAAGCCGTGCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCGATTCCCCTAGCTGCTCTG	....((((....(((((.(((((((.(((((((((((((((.((((.(((..((((((((((...((((..(.(((.............)))).)))))))))..)))))...))).))))..))))))))))))))).))))))).))))).....)))).....	16746883	16747008	GGGCGCTTCTCCTTTGGCACGGTGGCATGTACCTGCAATGGAGTCAGCCAGGTGAGGATGCAGGTGAAGCTCCAGGCTTCCGTGGTGCAGCTCGCAAGCCGTGCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	(((((.(((((((((((((((.((((.(((..((((((((((...((((..(.(((.............)))).)))))))))..)))))...))).))))..))))))))))))))).)))))..	Bdi-miR399c	16746988	16747008	TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG	Bdi-miR399c*	16746883	16746903	GGGCGCTTCTCCTTTGGCACG		3
Bdi-MIR399d	PmiREN001164	MIR399	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	7145949	7146087	-	GCGTGTGAAGGTGCATTGCAGGGCAACTCCTCCGTTGGCAGAGGGACGACGGATGGATGTGGCCGGGGTTCTCCCTTGAATCCTTGGTCCTGTCCGTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGGCGATTCACCACCCACTTCGA	..(((.(..((((.(((((.((((((.((.(((.((((((((.(((((((.((.((((......((((....))))...)))))).)))..)))).)))))))).))))).)))))).))))).))))..)))).....	7145969	7146067	GGGCAACTCCTCCGTTGGCAGAGGGACGACGGATGGATGTGGCCGGGGTTCTCCCTTGAATCCTTGGTCCTGTCCGTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	((((((.((.(((.((((((((.(((((((.((.((((......((((....))))...)))))).)))..)))).)))))))).))))).))))))..	Bdi-miR399d	7145969	7145989	TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	Bdi-miR399d*	7146047	7146067	GGGCAACTCCTCCGTTGGCAG		3
Bdi-MIR408	PmiREN001165	MIR408	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	10459988	10460154	+	ATTGGAGAGAGGGGAGGAGACAGGGATGGAGCAGAGCATGGGATGGGGCTAACAGCAAAATTACGTTCGTTATTACTTCCACTATATGCTGTGAGAGCTGCTGCTGCTGTGTTGTTGCTCCCTCCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCCCCTGCATCACCCCCCCT	...........(((.((((.((((((.(((((((.(((.((((.(((((.(((((((......................(((........)))(((((....))).)).)))))))))))).)))).))).))).)))))))))).)))))))..............	10460008	10460134	CAGGGATGGAGCAGAGCATGGGATGGGGCTAACAGCAAAATTACGTTCGTTATTACTTCCACTATATGCTGTGAGAGCTGCTGCTGCTGTGTTGTTGCTCCCTCCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGC	((((((.(((((((.(((.((((.(((((.(((((((......................(((........)))(((((....))).)).)))))))))))).)))).))).))).))))))))))..	Bdi-miR408	10460114	10460134	CTGCACTGCCTCTTCCCTGGC	Bdi-miR408*	10460008	10460028	CAGGGATGGAGCAGAGCATGG		3
Bdi-MIR444a	PmiREN001167	MIR444	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	38636866	38636975	+	CACGCGTCCGACTAGAGGCAGCAACTCCATAACTTGCGGAAAGCTTGTTGGATGATGACCATGCCAATGATTTTACCGAAGTTATGCAGTTGCTGCCTCAAGCTTGCTGC	...(((..(((((.((((((((((((.((((((((.(((((((.((((((((((.....))).))))))))))).))))))))))).)))))))))))).)).))).)))	38636876	38636970	ACTAGAGGCAGCAACTCCATAACTTGCGGAAAGCTTGTTGGATGATGACCATGCCAATGATTTTACCGAAGTTATGCAGTTGCTGCCTCAAGCTT	(((.((((((((((((.((((((((.(((((((.((((((((((.....))).))))))))))).))))))))))).)))))))))))).)).))	Bdi-miR444a	38636950	38636972	TGCAGTTGCTGCCTCAAGCTT	Bdi-miR444a*	38636876	38636896	ACTAGAGGCAGCAACTCCATA		3
Bdi-MIR444b	PmiREN001166	MIR444	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	56458904	56459046	+	CATGAGGCGACAACTGCATTACTTGCTGGGAAGACGCAAGTATGACAGCGAAACATGCATTACTTGCGGGAAAGGCGCAAAACGAATAGAAGATCATCATACTTGTGGCTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGCTGCCTCAAGCT	(.(((((((.(((((((((.((((((.((((((.(((((((((((..((.......)).....(((((.......)))))................))))))))))).)))))).)))))).))))))))).))))))).)))	56458924	56459026	ACTTGCTGGGAAGACGCAAGTATGACAGCGAAACATGCATTACTTGCGGGAAAGGCGCAAAACGAATAGAAGATCATCATACTTGTGGCTTTCTTGCAAGTTG	((((((.((((((.(((((((((((..((.......)).....(((((.......)))))................))))))))))).)))))).)))))).)	Bdi-miR444b	56459006	56459028	TTGTGGCTTTCTTGCAAGTTG	Bdi-miR444b*	56458924	56458944	ACTTGCTGGGAAGACGCAAGT		3
Bdi-MIR444c	PmiREN001168	MIR444	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	48432447	48432550	-	GACAAACTTGAGGCAGCAACTGCATATCTTGCAAGAAAATTGGGTTTCAGAGCATACCGATGATTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGTTGTCTCAAGCTTGCTGC	(.(((.((((((((((((((((((((.((((((((((((((.(((..........)))...)))))))))))))).)))))))))))))))))))).))).)))	48432467	48432530	TGCATATCTTGCAAGAAAATTGGGTTTCAGAGCATACCGATGATTTTCTTGCAAGTTGTGCAGT	((((((.((((((((((((((.(((..........)))...)))))))))))))).))))))))	Bdi-miR444c	48432467	48432489	TTTTCTTGCAAGTTGTGCAGT	Bdi-miR444c*	48432510	48432530	TGCATATCTTGCAAGAAAATT		3
Bdi-MIR444d	PmiREN001169	MIR444	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	16067495	16067596	-	GGCAAGCTAGAGGCAGCAACTGCATAACGTGCAAGAAAATCGTTTCGGGCCATACCGATGATTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGTTGTCTCAAGCTTGCTGC	((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((..((((......))))))))))))))))).))))))))))))))))))).))))))))))	16067515	16067576	TGCATAACGTGCAAGAAAATCGTTTCGGGCCATACCGATGATTTTCTTGCAAGTTGTGCAGT	((((((((.(((((((((((((..((((......))))))))))))))))).))))))))))	Bdi-miR444d	16067515	16067537	TTTTCTTGCAAGTTGTGCAGT	Bdi-miR444d*	16067556	16067576	TGCATAACGTGCAAGAAAATC		3
Bdi-MIR482	PmiREN001170	MIR482	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	13997788	13997920	-	AAGAGGGCCTAAGAGCGGTGGGCATGGGAACATGATGGAAGGCGAAGCTCTTGGTTCCTCATCTAACATTGGAGGAGACCTTGGTTCGAGTTTTCCGATGCCTCCCATGCCTATTGTTCTTTGGTGCTCCTTC	..(((.(((.(((((((((((((((((((.(((..((((((((..(((.(..((((((((...........))))).)))..))))...)))))))))))..))))))))))))))))))).))).)))....	13997808	13997900	GGCATGGGAACATGATGGAAGGCGAAGCTCTTGGTTCCTCATCTAACATTGGAGGAGACCTTGGTTCGAGTTTTCCGATGCCTCCCATGCCTA	(((((((((.(((..((((((((..(((.(..((((((((...........))))).)))..))))...)))))))))))..)))))))))..	Bdi-miR482	13997808	13997829	TTTCCGATGCCTCCCATGCCTA	Bdi-miR482*	13997880	13997900	GGCATGGGAACATGATGGAAG		3
Bdi-MIR528	PmiREN001255	MIR528	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	73295140	73295266	-	GGGGGCTGGAGCAGCAGCGGTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGGATGATGGGGGGTTGTACTCTGCTTCTTCCCCTCTCGTTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCATTCCTGCTGCTACCGCCGTGCT	...(((.((((((((((.(((((((((((((.(((.(((((.((.((.((.((((((..(((...)))..)))))).)))).))))))).))).))))))))))))).)))))))).))))).....	73295160	73295246	TGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGGATGATGGGGGGTTGTACTCTGCTTCTTCCCCTCTCGTTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCATT	(((((((((((.(((.(((((.((.((.((.((((((..(((...)))..)))))).)))).))))))).))).)))))))))))..	Bdi-miR528	73295226	73295246	TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG	Bdi-miR528*	73295160	73295180	CCTGTGCCTGCCTCTTCCATT		3
Bdi-MIR529	PmiREN001258	MIR529	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	44657776	44657890	+	ATATCGTCAAGGTTAAAGGGAGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTAATTAAGCTCGATCGATCTGTCTTGTATCAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTCTCTTAGCTTCTTGATGCAAG	..........((((((.((((((((((((((.((((((((((.(((((((...........).)))).)).)))))))))).)))))))))))))).))))))............	44657796	44657870	AGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTAATTAAGCTCGATCGATCTGTCTTGTATCAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTC	(((((((((((.((((((((((.(((((((...........).)))).)).)))))))))).)))))))))))..	Bdi-miR529	44657796	44657816	AGAAGAGAGAGAGTACAGCCT	Bdi-miR529*	44657850	44657870	GCTGTACCCTCTCTCTTCTTC		3
Bdi-MIR530a	PmiREN001259	MIR530	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	17100249	17100413	-	GAAGAATGGTGTGATTTTTGCTGCATTTGCACCTGCACCTACATCGAAGGAACGATAGAAGCACTGCACCTATTTCATCAATTATCGTCATGCAGGCTTCTTGATCCTCCTCCTAAGCTGCTTAGGTGCAGTGGCAGATGCAGGTGTATCACAGGAATTTTCGGA	.........((((((.....((((((((((..(((((((((((.(..((((..(((((((((.(((((......................)))))))))))..)))....))))..).))..)))))))))..))))))))))....))))))............	17100269	17100393	CTGCATTTGCACCTGCACCTACATCGAAGGAACGATAGAAGCACTGCACCTATTTCATCAATTATCGTCATGCAGGCTTCTTGATCCTCCTCCTAAGCTGCTTAGGTGCAGTGGCAGATGCAGGT	((((((((((..(((((((((((.(..((((..(((((((((.(((((......................)))))))))))..)))....))))..).))..)))))))))..))))))))))..	Bdi-miR530a	17100373	17100393	CTGCATTTGCACCTGCACCTA	Bdi-miR530a*	17100269	17100289	GGTGCAGTGGCAGATGCAGGT		3
Bdi-MIR530b	PmiREN001260	MIR530	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	17100617	17100783	-	GATATGTGATAGTGATTGAGCTGCATTTGCACCTGCACCTACCAAGGAATGGTCTACATTCACCTTGCATATGATGCATGTAAGAGCAAGGATGTCCTTGACCCTCTCGCTCTTCCTAGGTGAGTAGGTGCAGTGGCAGATGCAGCTCAATCACAAGCACTCCAAGC	((...(((...(((((((((((((((((((..((((((((((....(((((.....)))))..(((((((.......)))))))..(((((....)))))......((((.((....))))))))))))))))..)))))))))))))))))))...))))).....	17100637	17100763	CTGCATTTGCACCTGCACCTACCAAGGAATGGTCTACATTCACCTTGCATATGATGCATGTAAGAGCAAGGATGTCCTTGACCCTCTCGCTCTTCCTAGGTGAGTAGGTGCAGTGGCAGATGCAGCT	((((((((((..((((((((((....(((((.....)))))..(((((((.......)))))))..(((((....)))))......((((.((....))))))))))))))))..))))))))))..	Bdi-miR530b	17100743	17100763	CTGCATTTGCACCTGCACCTA	Bdi-miR530b*	17100637	17100657	GGTGCAGTGGCAGATGCAGCT		3
Bdi-MIR531a	PmiREN001261	MIR531	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	9551233	9551332	+	ATTCATGGCGGCACGGTGGCGATGCTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGGTCTTAGCCCCGCACGCTCCTTCGTCGAGTTTGGCTACCGTCCCCGAACCACATC	......((.((.((((((((.(.(((((.(((((.(((((((.((((....)))).))))))).))))).))))).).))))))))))))..........	9551253	9551312	GATGCTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGGTCTTAGCCCCGCACGCTCCTTCGTCGAGTTTGGC	.(.(((((.(((((.(((((((.((((....)))).))))))).))))).))))).)...	Bdi-miR531a	9551253	9551276	GATGCTCGCCGGAGCAGCGTGCTG	Bdi-miR531a*	9551292	9551312	CGCTCCTTCGTCGAGTTTGGC		3
Bdi-MIR531b	PmiREN001262	MIR531	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	27050946	27051042	+	GCACGACGGCGCGGCGGCCGCTCTCGCCGGAGCAGCGTGCGTCGGGTTCAGCCCCGCGCGCTCCTCCGTCGAGCGTGGCAGCCGGCATCGTTTTTTT	..((((..((.((((.(((((.((((.(((((.((((((((..((((...)))))))))))).))))).)))).))))).)))))).))))......	27050966	27051022	CTCTCGCCGGAGCAGCGTGCGTCGGGTTCAGCCCCGCGCGCTCCTCCGTCGAGCGTG	(.((((.(((((.((((((((..((((...)))))))))))).))))).)))).)..	Bdi-miR531b	27050966	27050986	CTCTCGCCGGAGCAGCGTGCG	Bdi-miR531b*	27051002	27051022	CGCGCTCCTCCGTCGAGCGTG		3
Bdi-MIR536	PmiREN001263	MIR536	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	18852851	18852969	-	GAGAGATGGGTGGTGTGAGACGCACATAGCATGGCACACCCCGAGTTCCATCTCTACTTCTTTGAGATGCATGCCTCGTCGTGCCACGCTGTGTGCGTCCCACGCACCCTCTCTTTAAC	((((((.(((((.((((.((((((((((((.((((((....((((...((((((.........)))))).....))))..)))))).)))))))))))).)))))))))))))))....	18852871	18852949	CGCACATAGCATGGCACACCCCGAGTTCCATCTCTACTTCTTTGAGATGCATGCCTCGTCGTGCCACGCTGTGTGCGTC	((((((((((.((((((....((((...((((((.........)))))).....))))..)))))).))))))))))..	Bdi-miR536	18852871	18852891	TCGTGCCACGCTGTGTGCGTC	Bdi-miR536*	18852929	18852949	CGCACATAGCATGGCACACCC		3
Bdi-MIR827	PmiREN001301	MIR827	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	18181740	18181881	-	TCATGCAGCTCTGAACTTGTTTTGTTGGTTGTCATCTAACCATCGATCGGTCCGTGCTTCGGTGCTTGTGCCATGATTTTGCATCATCACACCGGCGATGGTTAGATGACCATCAGCAAACATGTTCGTGAGACATGCCGTG	....................(((((((((.(((((((((((((((.(((((..(((....(((((...............)))))..))))))))))))))))))))))).)))))))))......................	18181760	18181861	TTTGTTGGTTGTCATCTAACCATCGATCGGTCCGTGCTTCGGTGCTTGTGCCATGATTTTGCATCATCACACCGGCGATGGTTAGATGACCATCAGCAAACA	(((((((((.(((((((((((((((.(((((..(((....(((((...............)))))..))))))))))))))))))))))).)))))))))..	Bdi-miR827	18181760	18181780	TTAGATGACCATCAGCAAACA	Bdi-miR827*	18181841	18181861	TTTGTTGGTTGTCATCTAACC		3
Bdi-MIR845	PmiREN001302	MIR845	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	17834043	17834159	-	AAATCAATAATTGATTTTCTTGCTCTGATACCAATTGTTGGTATCAGTAACCTCTGATACCTAGATCGTCTGCACCAACAATTCGTATCAGAGCGAGAGAATCAATTTTTTGAAATC	...((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((..(((.....((((.....))))....))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))..))))....	17834063	17834139	TGCTCTGATACCAATTGTTGGTATCAGTAACCTCTGATACCTAGATCGTCTGCACCAACAATTCGTATCAGAGCGAG	(((((((((((.((((((((((..(((.....((((.....))))....))).)))))))))).)))))))))))..	Bdi-miR845	17834119	17834139	TGCTCTGATACCAATTGTTGG	Bdi-miR845*	17834063	17834083	AACAATTCGTATCAGAGCGAG		3
Bdi-MIR1432	PmiREN001058	MIR1432	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	18983508	18983654	+	GATTGGGATTGGGTCCTTTGTTCAGGAGAGATGACACCGACATCGATCTGATGGGTCGGCTCAGTTCAATTAGTTACTAGGCCATGTGTGTCCATCCGCTTGGAGTGGGTGTCATCTCCCCTGAACATAGGACGCACTATCCCTGTA	....(((((((.(((((.((((((((.(((((((((((.((.((((.(.((((((.(((((.(((..........))).))))......))))))).).)))).)).))))))))))).)))))))).))))).))..)))))....	18983528	18983634	TTCAGGAGAGATGACACCGACATCGATCTGATGGGTCGGCTCAGTTCAATTAGTTACTAGGCCATGTGTGTCCATCCGCTTGGAGTGGGTGTCATCTCCCCTGAACA	((((((.(((((((((((.((.((((.(.((((((.(((((.(((..........))).))))......))))))).).)))).)).))))))))))).))))))..	Bdi-miR1432	18983528	18983549	TTCAGGAGAGATGACACCGACA	Bdi-miR1432*	18983614	18983634	GGGTGTCATCTCCCCTGAACA		3
Bdi-MIR1848	PmiREN001122	MIR1848	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	43196777	43196867	+	TTGCGGCGCCCCCCTGACCCCCTTGCCGGCGCGCGCGTGCACCCGACGGTGCACGCGTCGCCGTCAAGAGGCTCAGCGGCGGTGCCCTTTG	....((((((((.((((.((.((((.(((((.(((((((((((....)))))))))))))))).)))).)).)))).)).)))))).....	43196797	43196847	CCTTGCCGGCGCGCGCGTGCACCCGACGGTGCACGCGTCGCCGTCAAGAGG	.((((.(((((.(((((((((((....)))))))))))))))).))))...	Bdi-miR1848	43196797	43196817	CCTTGCCGGCGCGCGCGTGCA	Bdi-miR1848*	43196827	43196847	GCACGCGTCGCCGTCAAGAGG		3
Bdi-MIR1878	PmiREN001123	MIR1878	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	37199896	37199993	+	TCACTATTGCAAACTTAGTCTGAACACTATAAAAAATGCTCATGTAAAAATATGCGCATCATAGATTTGTAGTGTTCAGATTGAGTTTACAGTAGTTG	..(((((((.(((((((((((((((((((((((..((((.(((((....))))).))))......))))))))))))))))))))))).)))))))..	37199908	37199983	ACTTAGTCTGAACACTATAAAAAATGCTCATGTAAAAATATGCGCATCATAGATTTGTAGTGTTCAGATTGAGTTT	(((((((((((((((((((((..((((.(((((....))))).))))......)))))))))))))))))))))))	Bdi-miR1878	37199960	37199985	ATTTGTAGTGTTCAGATTGAGTTT	Bdi-miR1878*	37199908	37199928	ACTTAGTCTGAACACTATAAA		3
Bdi-MIR2118a	PmiREN001124	MIR2118	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	13998344	13998562	-	CAAATATTCAGTTTGGTGTTTTCCTGATGCCTCCCATTCCTATGGTTCTTGAGCACTCCTTCCTCTTCCTTTTGGCCTGCGAAATGGCTTAACGAAGAAATTGTAGGTATTTGTGCATACTTTTAGACAATGTGAGGCAGGTCGGGAAGAGGAAGAGAAGAGGGCCTTAGAGCAGTGGGAGTGGGAACATGGAGGAAAGCCTGACTTGCTTTGTTTTCA	.........((((.(((..((((((.(((..((((((((((((.(((((...((.(((((((((((((((...(((((((...(((.......((((....((((.(....).))))..)))).......)))...)))))))))))))))))))....))).))...))))).)))))))))))).)))..))))))))).)))).............	13998364	13998542	TTCCTGATGCCTCCCATTCCTATGGTTCTTGAGCACTCCTTCCTCTTCCTTTTGGCCTGCGAAATGGCTTAACGAAGAAATTGTAGGTATTTGTGCATACTTTTAGACAATGTGAGGCAGGTCGGGAAGAGGAAGAGAAGAGGGCCTTAGAGCAGTGGGAGTGGGAACATGGAGGAAAG	(((((.(((..((((((((((((.(((((...((.(((((((((((((((...(((((((...(((.......((((....((((.(....).))))..)))).......)))...)))))))))))))))))))....))).))...))))).)))))))))))).)))..)))))..	Bdi-miR2118a	13998521	13998542	TTCCTGATGCCTCCCATTCCTA	Bdi-miR2118a*	13998364	13998384	GAGTGGGAACATGGAGGAAAG		3
Bdi-MIR2118b	PmiREN001125	MIR2118	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	13933869	13934002	-	CAGAGTGTCCAAGAGCAGTGCGAATGGGAACATCGAGAAAAGCATGAGTTCTCTAGATTTCCTCTCCCATAAGAGATGTCTAGTTCTGTACTTTTCTGATGCCTCCCATTCCTATTGTTCTTGAGTGCTCCTTC	..(((((.((((((((((((.((((((((.((((.(((((((....((....((((((.((.(((......))))).))))))..))...)))))))))))..)))))))).))))))))))).))))))....	13933889	13933982	CGAATGGGAACATCGAGAAAAGCATGAGTTCTCTAGATTTCCTCTCCCATAAGAGATGTCTAGTTCTGTACTTTTCTGATGCCTCCCATTCCTA	.((((((((.((((.(((((((....((....((((((.((.(((......))))).))))))..))...)))))))))))..))))))))...	Bdi-miR2118b	13933889	13933910	TTTCTGATGCCTCCCATTCCTA	Bdi-miR2118b*	13933962	13933982	CGAATGGGAACATCGAGAAAA		3
Bdi-MIR2275a	PmiREN001126	MIR2275	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	12534216	12534319	+	GAATTTGGCAGATGAATTTGAGTGTTGGATGGGACCAAATCTTACCGCAGGGTGATACAAGATTTGGTTTCCTCCAATGTCTCATGTTCATGTGTCAGATGCTG	(.((((((((.((((((.(((((((((((.((((((((((((((((....)))).....)))))))))))).))))))).)))).)))))).)))))))).)..	12534236	12534299	AGTGTTGGATGGGACCAAATCTTACCGCAGGGTGATACAAGATTTGGTTTCCTCCAATGTCTCA	(((((((((.((((((((((((((((....)))).....)))))))))))).))))))).))..	Bdi-miR2275a	12534278	12534299	TTTGGTTTCCTCCAATGTCTCA	Bdi-miR2275a*	12534236	12534256	AGTGTTGGATGGGACCAAATC		3
Bdi-MIR2275b	PmiREN001127	MIR2275	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	13962461	13962578	+	CTTGTCAGCAACTGAAAGTGAGAGTTGGAGGAAAACAAACTAGTTCTCCAGATGGACAATCATGGTCCTAGATAAGCTTGTTTTCCTCCAATATCTCACCTTCGCTCAATCGCCTGGC	............((((.(((((((((((((((((((((.((.(((..((((((.....))).))).....))).)).))))))))))))))).)))))).))))..............	13962481	13962558	AGAGTTGGAGGAAAACAAACTAGTTCTCCAGATGGACAATCATGGTCCTAGATAAGCTTGTTTTCCTCCAATATCTCA	((((((((((((((((((.((.(((..((((((.....))).))).....))).)).))))))))))))))).)))..	Bdi-miR2275b	13962537	13962558	CTTGTTTTCCTCCAATATCTCA	Bdi-miR2275b*	13962481	13962501	AGAGTTGGAGGAAAACAAACT		3
Bdi-MIR5067	PmiREN001173	MIR5067	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	20638228	20638297	+	CGATCCATATTATTTGCCGCTGATTTAGTGCAACTTTGTACTAAATCAGCGACAACTAATATGGATAGGA	(.((((((((((.(((.(((((((((((((((....))))))))))))))).))).)))))))))).)))	20638248	20638277	TGATTTAGTGCAACTTTGTACTAAATCAGC	((((((((((((....))))))))))))))	Bdi-miR5067	20638262	20638279	TTTGTACTAAATCAGC	Bdi-miR5067*	20638248	20638268	TGATTTAGTGCAACTTTGTAC		2
Bdi-MIR5070	PmiREN001174	MIR5070	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	34804928	34805035	+	TAGCCTTTGACACTGCTTAGTTCAACCAAATGAACTAAAATTTTAAAATGACACAACTTTTTGGAAAACTAGTTCATTTGTTTGAACTAAGTAGGGTCAGAGGGTACC	((.((((((((.(((((((((((((.(((((((((((...((((((((.(......).))))))))...))))))))))).))))))))))))).)))))))).))))	34804948	34805015	TTCAACCAAATGAACTAAAATTTTAAAATGACACAACTTTTTGGAAAACTAGTTCATTTGTTTGAACT	(((((.(((((((((((...((((((((.(......).))))))))...))))))))))).)))))))	Bdi-miR5070	34804992	34805017	AAAACTAGTTCATTTGTTTGAACT	Bdi-miR5070*	34804948	34804968	TTCAACCAAATGAACTAAAAT		3
Bdi-MIR5163a	PmiREN001175	MIR5163	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	11994548	11994668	-	TCTTTCTATTATTGAGCGTACCTAGCCTAAAATATTTAAAAATAATTGGAGCAACTAAAGTTGTTGTTGTTCAATTACTTTTAGGTATTTCAGGTTAGGTGGCTAACCAATGGTGGAAGTT	..(((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((.......)))))..)))))))).)))))))))))).)))))))))))))...))))))))))))..	11994568	11994648	CCTAGCCTAAAATATTTAAAAATAATTGGAGCAACTAAAGTTGTTGTTGTTCAATTACTTTTAGGTATTTCAGGTTAGGTG	((((((((.((((((((((((.(((((((((((((.......)))))..)))))))).)))))))))))).))))))))..	Bdi-miR5163a	11994568	11994588	TTAGGTATTTCAGGTTAGGTG	Bdi-miR5163a*	11994628	11994648	CCTAGCCTAAAATATTTAAAA		3
Bdi-MIR5163b	PmiREN001176	MIR5163	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	11995389	11995585	-	CTTTCAAACAATTGAGCATCCACCCAACTGAAATATTTAAAAATAATTGGAGCAACTAAAGCTATCAAGATTGGATCCAGTTATGATAGCTGCTATACGGAGGGGAGAGGAAAAGGGAGTCCAAAACACAAGGAAAGTGTTGTTTCAGTTATTTTTAGATATTTCAGGTTGTGTGGATAGCGAATTGGTGGAAGATG	((((((..(((((..((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((.(((((....))))).)))))))).................(((........)))................)))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))).)).))))).))))))...	11995409	11995565	CACCCAACTGAAATATTTAAAAATAATTGGAGCAACTAAAGCTATCAAGATTGGATCCAGTTATGATAGCTGCTATACGGAGGGGAGAGGAAAAGGGAGTCCAAAACACAAGGAAAGTGTTGTTTCAGTTATTTTTAGATATTTCAGGTTGTGTGGA	(((.((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((.(((((....))))).)))))))).................(((........)))................)))))))))))))))))))))))))))).)))).)))..	Bdi-miR5163b	11995409	11995430	TAGATATTTCAGGTTGTGTGGA	Bdi-miR5163b*	11995545	11995565	CACCCAACTGAAATATTTAAA		3
Bdi-MIR5164	PmiREN001177	MIR5164	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	22503939	22504056	-	CTCCGTCCCATAGTTAGTATCGCAACTTTGTCTAGATACGCATGTACCTACACACTAAAAAGCGTCTGGATACATGCGTATCTAGACAAAATTGTGACACTTAATATGGGACGGGGAG	((((((((((((...(((.((((((.((((((((((((((((((((.(((.((.((....)).)).))).)))))))))))))))))))).)))))).)))...))))))))..))))	22503959	22504036	CGCAACTTTGTCTAGATACGCATGTACCTACACACTAAAAAGCGTCTGGATACATGCGTATCTAGACAAAATTGTGAC	(((((.((((((((((((((((((((.(((.((.((....)).)).))).)))))))))))))))))))).)))))).	Bdi-miR5164	22504016	22504038	CGCAACTTTGTCTAGATACGC	Bdi-miR5164*	22503959	22503979	GTATCTAGACAAAATTGTGAC		2
Bdi-MIR5166	PmiREN001178	MIR5166	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	14491750	14492019	+	GCCCAGCGAGGTATGTTGGCTGCCCACCAGGGTTCGATCCAACAAGGTCGCATTCTATATAAATAATTTTCGTAAGGTGAGGCACCAAAATGCAATCCAATCACGCCTCTCCTACAAATATATATCTATAATTTTGTAAGGTGAGGCACCAGAATGCGACCCAATCACGCCTCTACTACAATATGTATATAATTTTCGTAAGGTGAGGCGCCAGAATGTGACCTTGTGGGATCGGACCCTGGTGTGCAGCCAGCATACCTCGCTGGGCTA	(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((((...................((((...)))).....(((.((.......(((((.((((((((..(((....)))..))))).))).)))))....)).)))..........((((((.(((....((((...........)))).)))))))))..))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))	14491770	14491999	TGCCCACCAGGGTTCGATCCAACAAGGTCGCATTCTATATAAATAATTTTCGTAAGGTGAGGCACCAAAATGCAATCCAATCACGCCTCTCCTACAAATATATATCTATAATTTTGTAAGGTGAGGCACCAGAATGCGACCCAATCACGCCTCTACTACAATATGTATATAATTTTCGTAAGGTGAGGCGCCAGAATGTGACCTTGTGGGATCGGACCCTGGTGTGCAGC	(((.((((((((((((((((.(((((((((((((((...................((((...)))).....(((.((.......(((((.((((((((..(((....)))..))))).))).)))))....)).)))..........((((((.(((....((((...........)))).)))))))))..))))))))))))))).)))))))))))))))).)))))	Bdi-miR5166	14491770	14491792	TGCCCACCAGGGTTCGATCCA	Bdi-miR5166*	14491979	14491999	GATCGGACCCTGGTGTGCAGC		2
Bdi-MIR5167a	PmiREN001179	MIR5167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	42056432	42056532	-	TATCTGCAACGCTCTTGCAAACCATTGACATGCCAGACCTTTTGAGTTCTTGCCGCTTTCCACTTTGGGTGTCATTGGTACTCTAGGTAAGGTAATTCAAT	....(((((.....))))).((((.((((((.(((((......((((.......)))).....))))))))))).))))......................	42056452	42056512	ACCATTGACATGCCAGACCTTTTGAGTTCTTGCCGCTTTCCACTTTGGGTGTCATTGGTAC	((((.((((((.(((((......((((.......)))).....))))))))))).))))..	Bdi-miR5167a	42056452	42056472	CACTTTGGGTGTCATTGGTAC	Bdi-miR5167a*	42056492	42056512	ACCATTGACATGCCAGACCTT		3
Bdi-MIR5167b	PmiREN001180	MIR5167	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	42059104	42059309	-	GTCATTCGTGCTCTAGTTAAGGTAATTTAACTAGAAGATAGAAATCTAGATTTTTTTATGTTACCTTCCACCATGGCGCGACAGAAAAGAACGACATTGGCATCGAGGCACATGTCGTTCGGGAATTAACTTCCAGGAAAGCAATATAAAGAATTTAGACTCCTAGCCTTCGAGTGTGAATTGCCTTAACGAGAGCACCAATGACA	((((((.(((((((.(((((((((((((((((.((((.(((...((((((((((((.(((((.(.((((....((......)).....(((((((((..((......))..)))))))))((((......)))).)))).).)))))))))))))))))...)))..)))).))).)))))))))))))).))))))).)))))).	42059117	42059297	TAGTTAAGGTAATTTAACTAGAAGATAGAAATCTAGATTTTTTTATGTTACCTTCCACCATGGCGCGACAGAAAAGAACGACATTGGCATCGAGGCACATGTCGTTCGGGAATTAACTTCCAGGAAAGCAATATAAAGAATTTAGACTCCTAGCCTTCGAGTGTGAATTGCCTTAACGAGA	(.(((((((((((((((((.((((.(((...((((((((((((.(((((.(.((((....((......)).....(((((((((..((......))..)))))))))((((......)))).)))).).)))))))))))))))))...)))..)))).))).)))))))))))))).)))	Bdi-miR5167b	42059117	42059139	GTGTGAATTGCCTTAACGAGA	Bdi-miR5167b*	42059277	42059297	TAGTTAAGGTAATTTAACTAG		2
Bdi-MIR5169a	PmiREN001181	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	42177616	42177797	-	TCTAGCTTTGTCTCTTGAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAACAGTATACTAATATCTAACAGTATCAAATAAGTATACTATGAAGATATATGCAATTGAGGATTTAATAAAACTAATTTAGAGTTGTAGATGTTGGTATATTTTTCTATAAACTTGGTCAAATTTAAAAAGTTTGAATTGGAAC	.........((.(((..((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((...((((((......).)))))............((((((..(((((..........)))))..))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))..............)))))	42177636	42177777	TTTGACCAAGTTTGTAGAACAGTATACTAATATCTAACAGTATCAAATAAGTATACTATGAAGATATATGCAATTGAGGATTTAATAAAACTAATTTAGAGTTGTAGATGTTGGTATATTTTTCTATAAACTTGGTCAAATT	(((((((((((((((((((.(((((((((((((((...((((((......).)))))............((((((..(((((..........)))))..))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))..	Bdi-miR5169a	42177757	42177777	TTTGACCAAGTTTGTAGAACA	Bdi-miR5169a*	42177636	42177656	TTCTATAAACTTGGTCAAATT		3
Bdi-MIR5169b	PmiREN001183	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	20678493	20678698	-	ATTGTTTGACCAAGTTTGTAGAACAATATCTCAACATCTACAACACTAAATTAGTTTTATTAGTGATATACTTATTTGATATTGTAGATATGAGTCAAAGTTTTGCTACAGACTAAGATTACTCCCTTCGTTCTAAAATATAAGGGTTCTAGCTTTGTCCCGAATCAAACTAGCTTATTATTGTTCGACCAAGTTTGTAGAACAAT	(((((((...((((((((..((((((((.......((((((((...(((((.(((..((((...)))).))).)))))...))))))))((((((...(((((.......(((.(((......(((((.((........)))))))......))).))).......))))).))))))))))))))...))))))))..)))))))	20678497	20678696	TTTGACCAAGTTTGTAGAACAATATCTCAACATCTACAACACTAAATTAGTTTTATTAGTGATATACTTATTTGATATTGTAGATATGAGTCAAAGTTTTGCTACAGACTAAGATTACTCCCTTCGTTCTAAAATATAAGGGTTCTAGCTTTGTCCCGAATCAAACTAGCTTATTATTGTTCGACCAAGTTTGTAGAACA	(((...((((((((..((((((((.......((((((((...(((((.(((..((((...)))).))).)))))...))))))))((((((...(((((.......(((.(((......(((((.((........)))))))......))).))).......))))).))))))))))))))...))))))))..)))))	Bdi-miR5169b	20678676	20678698	TTTGACCAAGTTTGTAGAACA	Bdi-miR5169b*	20678497	20678517	TTCGACCAAGTTTGTAGAACA		3
Bdi-MIR5169c	PmiREN001182	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	23234084	23234262	-	TAAGTCAAAACTTTTCAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAAATCTACTAAGATTTACAATATCAAATGAGTATACTATGAAAATATATACAATGACATATTTAATAAAACTAATTTGGAGTTCACGTGTTGGTAGCTTTTTCTATAAACCTGGTCAAACTTGAAGAAGTTTGACTTAGG	(((((((((..((((((((((((((((.(((((((((((((..(((((((.((....(((.((((((.(((....(((..((((((..........)))))).)))..))).)))))).)))...)).))))))).))))))))))))).))))))))))))))))..)))))))))..	23234104	23234242	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAAATCTACTAAGATTTACAATATCAAATGAGTATACTATGAAAATATATACAATGACATATTTAATAAAACTAATTTGGAGTTCACGTGTTGGTAGCTTTTTCTATAAACCTGGTCAAAC	(((((((.(((((((((((((..(((((((.((....(((.((((((.(((....(((..((((((..........)))))).)))..))).)))))).)))...)).))))))).))))))))))))).)))))))..	Bdi-miR5169c	23234222	23234242	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAA	Bdi-miR5169c*	23234104	23234124	TTTCTATAAACCTGGTCAAAC		3
Bdi-MIR5169d	PmiREN001184	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	19677004	19677199	+	TACTCGAAAGAGGACTGATTTTTCTATAAGCTGGTCCAACTTGAACTAGGCAGGGATCAGCCAGCCGGAGCTAAACAAGAAAGAAATTATATGTTGGTTCTTCTGAATTACTTCCTCCGTTCATAAATATAAGAAGTCCTATGTCAAACTTGAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAATCTACCAACATCTACAATCC	..(((....)))....((((((((((((((((((((.(((((((....(((((((......(((..((((((((.((..............)))))))))).)))....(((((..................)))))))).))))....))))))).)))).))))))))))))))))..................	19677024	19677179	TTTCTATAAGCTGGTCCAACTTGAACTAGGCAGGGATCAGCCAGCCGGAGCTAAACAAGAAAGAAATTATATGTTGGTTCTTCTGAATTACTTCCTCCGTTCATAAATATAAGAAGTCCTATGTCAAACTTGAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAA	((((((((((((((((.(((((((....(((((((......(((..((((((((.((..............)))))))))).)))....(((((..................)))))))).))))....))))))).)))).))))))))))))..	Bdi-miR5169d	19677159	19677179	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAA	Bdi-miR5169d*	19677024	19677044	TTTCTATAAGCTGGTCCAACT		3
Bdi-MIR5169e	PmiREN001185	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	50608903	50609080	-	GCTTTGTCGTGAGTCAAACTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAAATTACCGACATCTACAGCTCCAAACGAATTTTATTAAATCCGCCATGATATATCTTTTCATGGTATACTTATTTGATATTGTAGATGTTAGTATATTTTTTATCAACTTGGTCAAACTTTTTTTTTGACTTAGGACA	....((((.(((((((((.((((((((((((.((((((((...(((.(((((((((((..............((((((((..(((((((.........)))))))......))))))))))))))))))).)))..)))))))).)))))))))))).......))))))))).))))	50608923	50609060	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAAATTACCGACATCTACAGCTCCAAACGAATTTTATTAAATCCGCCATGATATATCTTTTCATGGTATACTTATTTGATATTGTAGATGTTAGTATATTTTTTATCAACTTGGTCAAAC	(((((((((((.((((((((...(((.(((((((((((..............((((((((..(((((((.........)))))))......))))))))))))))))))).)))..)))))))).)))))))))))..	Bdi-miR5169e	50609040	50609060	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAA	Bdi-miR5169e*	50608923	50608943	TTTTTATCAACTTGGTCAAAC		3
Bdi-MIR5169f	PmiREN001186	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	44530972	44531150	+	TAAGTCAAACTTCTTAAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAATCCACCAACATCTACAACTCTAAATTAGTTCTATTAAATCTGTCATGATATATATCTTCATAGTATACTAATTTGTTATTGTAGATATTAGTACTTTTTTCTATAAACTTGGTCAAACTTTAAGAAGATTGACTTAGG	((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((...((.((.((((((((...(((((((((.((((((.(((......))).)).......))))...)))))))))...)))))))).)).))...)))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))..	44530992	44531130	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAATCCACCAACATCTACAACTCTAAATTAGTTCTATTAAATCTGTCATGATATATATCTTCATAGTATACTAATTTGTTATTGTAGATATTAGTACTTTTTTCTATAAACTTGGTCAAAC	(((((((((((((((((((((...((.((.((((((((...(((((((((.((((((.(((......))).)).......))))...)))))))))...)))))))).)).))...)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5169f	44530992	44531012	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAA	Bdi-miR5169f*	44531110	44531130	TTTCTATAAACTTGGTCAAAC		3
Bdi-MIR5169g	PmiREN001187	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	5460756	5460935	+	TAAGTCCAACCTTATTAACTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAAATACCAACATATGTTACATCAAACAAACAAATGCAACACAAAAATATATTTGATAATAGTCTTAATAATACTATCTTAGTGTTGTATATATTGATGTTTCTTCTACAAAGTTGACAAAGTTTGATTTAGGGCAAACCCA	((((((..........(((((((..(((.(((((((((.(((((.(((....((((......)))).....(((((((((.((.(((((((.(((....)))..))))....))).)).)))))))))...))).))))).))))))))).))).))))))).))))))...........	5460776	5460915	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAAATACCAACATATGTTACATCAAACAAACAAATGCAACACAAAAATATATTTGATAATAGTCTTAATAATACTATCTTAGTGTTGTATATATTGATGTTTCTTCTACAAAGTTGACAAAG	(((..(((.(((((((((.(((((.(((....((((......)))).....(((((((((.((.(((((((.(((....)))..))))....))).)).)))))))))...))).))))).))))))))).))).)))..	Bdi-miR5169g	5460776	5460796	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAA	Bdi-miR5169g*	5460895	5460915	TCTTCTACAAAGTTGACAAAG		3
Bdi-MIR5169h	PmiREN001188	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	24450517	24450695	-	TAAGTCAAACTTCTTAAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAATATACCAACATCTATCACTCTAACTTAGTTTTATTAAATCTGTTATGATATATATCTTCGTAGTATACTTACTTGAGATTGTAGATATTAGTATATTTTCCTATAATCTTGGTCAAATTTGAAGAAGTTTGACTTTAG	.((((((((((((((.(((((((((((((.((((((.(((((((((.((.((((((..(((......(((..(((((.....(.((((...)))).)....))))).))).....)))...)))))).)).))))))))).)))))).))))))))))))).))))))))))))))...	24450537	24450675	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAATATACCAACATCTATCACTCTAACTTAGTTTTATTAAATCTGTTATGATATATATCTTCGTAGTATACTTACTTGAGATTGTAGATATTAGTATATTTTCCTATAATCTTGGTCAAAT	(((((((((.((((((.(((((((((.((.((((((..(((......(((..(((((.....(.((((...)))).)....))))).))).....)))...)))))).)).))))))))).)))))).)))))))))..	Bdi-miR5169h	24450655	24450675	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAA	Bdi-miR5169h*	24450537	24450557	TTCCTATAATCTTGGTCAAAT		3
Bdi-MIR5169i	PmiREN001189	MIR5169	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	3875615	3875829	-	CAAAGTCAAACTCTTAAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAATCTACCCACATCTACAACTCTAAGTTAGTTTTACTAAATTTGTCATGATATATAATTTCATGGTATACTTATTTGATACTCATGATATATATTTGTCCTGTAAACATGATAGAGTTAGTCAAACTTGGTATATTTTTCTATAAACTTGGTCAACTTTAAGAAGTTTGACGTAGG	(...(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((.........((((...))))(((((.(((((.((((((((((((((((...(((((((((.(......))))).))))))))))))............))))))))).))))).))))).)))).))))))))))))))))))))))))))))).))))))))...).	3875635	3875809	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAATCTACCCACATCTACAACTCTAAGTTAGTTTTACTAAATTTGTCATGATATATAATTTCATGGTATACTTATTTGATACTCATGATATATATTTGTCCTGTAAACATGATAGAGTTAGTCAAACTTGGTATATTTTTCTATAAACTTGGTCAAC	(.((((((((((((((((((((.((((.........((((...))))(((((.(((((.((((((((((((((((...(((((((((.(......))))).))))))))))))............))))))))).))))).))))).)))).)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5169i	3875789	3875809	TTGACCAAGTTTGTAGAAAAA	Bdi-miR5169i*	3875635	3875655	TTTTCTATAAACTTGGTCAAC		3
Bdi-MIR5170	PmiREN001190	MIR5170	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	57072308	57072621	-	ATTTTGGAAATCGAGACTTACGATCATTGAACTTGTCGAAACGTCCCACGTATGATCACCGACGCAGTGTCGCCTGTGCTAGGTTGCCAGCTCAGCACGTTTTTTGCAATTTGTCCCCTGAATAATCCCTTGCGGTGGGACATGCTGTCCACGTGCCCAGCCAATTAAGTCCCTCGTGGTATTATTCTTCAGGGGGCAAATTGCAAAATTCCGCTCTGAGTTAGCATAGGTGACGCACATACGGTAGAAATACAGTACAATATGTGGTATATTTCATCAAGTTGAGTGACCGTAAGTTTTGATTTTTAAAATAC	((((((((((((((((((((((.(((((.((((((..((((.((.((((((((..((((((.....(((((((((((((((........((((((..((..(((((((((((((((((((((((((.((..((((.(((((..((((..(....)..)))).......))))))))))).)))))...))))))))))))))))))))...))..))))))))))))))))))))).....)))).))...........)))))))).)).))))..)))))).))))).))))))))))))))))))))))))	57072328	57072601	CGATCATTGAACTTGTCGAAACGTCCCACGTATGATCACCGACGCAGTGTCGCCTGTGCTAGGTTGCCAGCTCAGCACGTTTTTTGCAATTTGTCCCCTGAATAATCCCTTGCGGTGGGACATGCTGTCCACGTGCCCAGCCAATTAAGTCCCTCGTGGTATTATTCTTCAGGGGGCAAATTGCAAAATTCCGCTCTGAGTTAGCATAGGTGACGCACATACGGTAGAAATACAGTACAATATGTGGTATATTTCATCAAGTTGAGTGACCGTA	((.(((((.((((((..((((.((.((((((((..((((((.....(((((((((((((((........((((((..((..(((((((((((((((((((((((((.((..((((.(((((..((((..(....)..)))).......))))))))))).)))))...))))))))))))))))))))...))..))))))))))))))))))))).....)))).))...........)))))))).)).))))..)))))).))))).))))	Bdi-miR5170	57072328	57072350	TCATCAAGTTGAGTGACCGTA	Bdi-miR5170*	57072581	57072601	CGATCATTGAACTTGTCGAAA		2
Bdi-MIR5171	PmiREN001191	MIR5171	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	11096141	11096284	-	ACATGGCGTTTTACTCCCTCCGTGACATATTAAGTGACGAAATATTACACATATCTAGAAGATTTTTGGTATAGATAGATACATCTATATTTGGACAGATTTGAGTCACTTAATATGGGACGGAAGAATTACAAAACAAGATGT	((((...(((((......(((((..(((((((((((((.((((....((...((((...))))...))((((((((......))))))))........))))..)))))))))))))..)))))........)))))...))))	11096161	11096264	CGTGACATATTAAGTGACGAAATATTACACATATCTAGAAGATTTTTGGTATAGATAGATACATCTATATTTGGACAGATTTGAGTCACTTAATATGGGACGGA	(((..(((((((((((((.((((....((...((((...))))...))((((((((......))))))))........))))..)))))))))))))..)))))	Bdi-miR5171	11096161	11096186	TTGAGTCACTTAATATGGGACGGA	Bdi-miR5171*	11096244	11096264	CGTGACATATTAAGTGACGAA		3
Bdi-MIR5172	PmiREN001192	MIR5172	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	44461475	44461592	+	CAGCCTCCTCGACTTCATCCTGATCTACTAGCTCCTCGGCAGAAAGAAATTCAAGTACATACTCTTACATTCATAGTGCTAAGAGGAATAAGATTAATGCAAAGACAACTGATACGCT	....................((((((..((..(((((((((....(((....(((........)))...)))....))))..))))).))))))))......................	44461495	44461572	TGATCTACTAGCTCCTCGGCAGAAAGAAATTCAAGTACATACTCTTACATTCATAGTGCTAAGAGGAATAAGATTAAT	((((((..((..(((((((((....(((....(((........)))...)))....))))..))))).))))))))..	Bdi-miR5172	44461495	44461515	TGATCTACTAGCTCCTCGGCA	Bdi-miR5172*	44461552	44461572	GCTAAGAGGAATAAGATTAAT		3
Bdi-MIR5173	PmiREN001193	MIR5173	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	22156325	22156485	-	GCTGTATAGGGCCGTATTCTTCTCGTATATGCGGATGTACCATATGGACCTGACTTCAAGCCATGGTTCGGTCGACTAGACGCATCAGGCCCGAGCCTTCTTAAATTTGGATTCATACGGTGCATCTGTATATACGAGAAGATACGGCCGTATATAGCCAG	((((((((.((((((((.(((((((((((((((((((((((.((((((.((((.((.(((....(((((((((..............)).)))))))..))).)).)))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))...	22156345	22156465	TCTCGTATATGCGGATGTACCATATGGACCTGACTTCAAGCCATGGTTCGGTCGACTAGACGCATCAGGCCCGAGCCTTCTTAAATTTGGATTCATACGGTGCATCTGTATATACGAGAAG	(((((((((((((((((((((.((((((.((((.((.(((....(((((((((..............)).)))))))..))).)).)))).)))))).)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5173	22156445	22156465	TCTCGTATATGCGGATGTACC	Bdi-miR5173*	22156345	22156365	TGCATCTGTATATACGAGAAG		3
Bdi-MIR5174a	PmiREN001200	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	45950059	45950178	-	TAAAATTCATAGATCTTACTTACTCCGTTCCATAAAGATTGGCGTGAATTTGAACTAGAGCTAGTTTAAATCCGTGCCAATCTTTATGAAACGGAGGGAGTACAACAGAGTCAGTCATGA	....((((...(((((((((..(((((((.((((((((((((((((.((((((((((....)))))))))).)))))))))))))))).)))))))..))))...(((((((.((((...	45950079	45950158	TACTCCGTTCCATAAAGATTGGCGTGAATTTGAACTAGAGCTAGTTTAAATCCGTGCCAATCTTTATGAAACGGAGGGAG	..(((((((.((((((((((((((((.((((((((((....)))))))))).)))))))))))))))).)))))))..))	Bdi-miR5174a	45950079	45950101	ATCTTTATGAAACGGAGGGAG	Bdi-miR5174a*	45950138	45950158	TACTCCGTTCCATAAAGATTG		2
Bdi-MIR5174b	PmiREN001194	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	7291510	7291627	-	CTGTGCTGGATGATTTACTCCCTCCGTTCCATAAAGATTGGCCTGACTTTGAACTAGCTATAGTTCAAAACCATGCCAATCTTTGTGGAACGGAGGGAGTATTTGTTAGGCCGTTGGA	....(((.(((((..(((((((((((((((((((((((((((.((..(((((((((....)))))))))..)).))))))))))))))))))))))))))).))))).))).......	7291530	7291607	CCTCCGTTCCATAAAGATTGGCCTGACTTTGAACTAGCTATAGTTCAAAACCATGCCAATCTTTGTGGAACGGAGGGA	((((((((((((((((((((((.((..(((((((((....)))))))))..)).))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5174b	7291530	7291550	AATCTTTGTGGAACGGAGGGA	Bdi-miR5174b*	7291587	7291607	CCTCCGTTCCATAAAGATTGG		3
Bdi-MIR5174c	PmiREN001195	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	19033183	19033300	+	TTCCCAGAAAGCAACTACTCCCTCCGTTCCATGAAGGCTGGCGTGACTTTGAACTAGCTATAGTTCAAAACCGTGCCAATCTTTGTGGAACGGAGGGAGTACATATGTATGCATTATC	..........(((((((((((((((((((((((((((.(((((((..(((((((((....)))))))))..))))))).)))))))))))))))))))))).....)).)))......	19033203	19033280	CCTCCGTTCCATGAAGGCTGGCGTGACTTTGAACTAGCTATAGTTCAAAACCGTGCCAATCTTTGTGGAACGGAGGGA	(((((((((((((((((.(((((((..(((((((((....)))))))))..))))))).)))))))))))))))))..	Bdi-miR5174c	19033260	19033280	AATCTTTGTGGAACGGAGGGA	Bdi-miR5174c*	19033203	19033223	CCTCCGTTCCATGAAGGCTGG		3
Bdi-MIR5174d	PmiREN001201	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	36155640	36155735	-	ACTGATTTCCCTCCGTTTCATAAAGATTGGCACGGATTTGAACTAAACCTAGTTTAAAGCCATGCCAATCTTTATGGAACGGAGAGAGTACTTGTG	((....(((.((((((((((((((((((((((.((.(((((((((....))))))))).)).)))))))))))))))))))))).))).....)).	36155660	36155715	TAAAGATTGGCACGGATTTGAACTAAACCTAGTTTAAAGCCATGCCAATCTTTATG	((((((((((((.((.(((((((((....))))))))).)).))))))))))))))	Bdi-miR5174d	36155695	36155717	TAAAGATTGGCACGGATTTGA	Bdi-miR5174d*	36155660	36155680	AAAGCCATGCCAATCTTTATG		3
Bdi-MIR5174e	PmiREN001196	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	11351705	11351822	+	ACAGGTATTACTTATTACTCCCTCCGTTCCATAAAGATTGGCATGATTTTGAACTAGCTATAGTTCAAAACCGTGCCAATCTTTGTGGAACGGAGGGAGTAGCAATTTTATTGACTTA	..............(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((....)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))................	11351725	11351802	CCTCCGTTCCATAAAGATTGGCATGATTTTGAACTAGCTATAGTTCAAAACCGTGCCAATCTTTGTGGAACGGAGGGA	(((((((((((((((((((((((((.((((((((((....)))))))))).)))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5174e	11351782	11351802	AATCTTTGTGGAACGGAGGGA	Bdi-miR5174e*	11351725	11351745	CCTCCGTTCCATAAAGATTGG		3
Bdi-MIR5174f	PmiREN001199	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	18614321	18614438	-	TCAAATGATAGTCACAATTCCCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCACGGTTGTGAACTACCTCTAATTCAAAGCCGTGCCAACCTTTACGAAACGGAGGGAGTACCAGTCAAACTGCAGCT	................((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((.((....)).)))).))))))))))))))))).))))))))))))))..((((...)))).....	18614341	18614418	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCACGGTTGTGAACTACCTCTAATTCAAAGCCGTGCCAACCTTTACGAAACGGAGGGA	((((((((((.(((((((((((((((((.((((.((....)).)))).))))))))))))))))).))))))))))..	Bdi-miR5174f	18614398	18614418	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGG	Bdi-miR5174f*	18614341	18614361	AACCTTTACGAAACGGAGGGA		3
Bdi-MIR5174g	PmiREN001197	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	24697131	24697248	+	ATTTGATAGATGATGTACTCCCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCATGGATTTGAACCAGAGCCAGTTCAGAGCCGTGCCAACCTTTATGGAATGGAGGAAGTAACTTATTTGAGAATCAA	...............((((.((((((((((((((((((((((((((.(((((((........))))))).)))))))))))))))))))))))))).))))......((((...))))	24697151	24697228	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCATGGATTTGAACCAGAGCCAGTTCAGAGCCGTGCCAACCTTTATGGAATGGAGGAA	((((((((((((((((((((((((((.(((((((........))))))).))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5174g	24697151	24697171	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGG	Bdi-miR5174g*	24697208	24697228	AACCTTTATGGAATGGAGGAA		3
Bdi-MIR5174h	PmiREN001198	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	37976583	37976671	+	TGGAATGTAAACTGGTACTCCCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCACGGCCAATCTTTATGGAACGGATGGAGTAATAAAAGAAAATTGATC	................(((((.((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))).)))))..................	37976603	37976651	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCACGGCCAATCTTTATGGAACGGATGGA	(.((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))).)..	Bdi-miR5174h	37976603	37976623	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGG	Bdi-miR5174h*	37976631	37976651	AATCTTTATGGAACGGATGGA		3
Bdi-MIR5174i	PmiREN001202	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	30728305	30728419	-	TGTAGTATGATTAGTGCTCACTCCGTTTCATAAAGGTTGGCACGGTTTTGAACTAGCTCAGTTCAAATCCGTGCCGATCTTTATGGAACGGATGAATAGTTAATAATAAAGATTG	.................(((.((((((((((((((((((((((((.((((((((.....)))))))).)))))))))))))))))))))))))))....................	30728325	30728399	CTCCGTTTCATAAAGGTTGGCACGGTTTTGAACTAGCTCAGTTCAAATCCGTGCCGATCTTTATGGAACGGATGA	.((((((((((((((((((((((((.((((((((.....)))))))).))))))))))))))))))))))))...	Bdi-miR5174i	30728379	30728399	CTCCGTTTCATAAAGGTTGGC	Bdi-miR5174i*	30728325	30728345	CGATCTTTATGGAACGGATGA		3
Bdi-MIR5174j	PmiREN001203	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	23051697	23051814	-	TGAGAAACAATATAGTACTCCCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCACGGATTTGAACTAGAGCTAGTTCAAAGCCACGCCAATCTTTATGGAACGGAGGGAGTAGTATAGTAAGATATTGG	..........((((.(((((((((((((((((((((((((((..((.(((((((((....))))))))).))..))))))))))))))))))))))))))).))))............	23051717	23051794	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCACGGATTTGAACTAGAGCTAGTTCAAAGCCACGCCAATCTTTATGGAACGGAGGGA	((((((((((((((((((((((..((.(((((((((....))))))))).))..))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5174j	23051774	23051794	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGG	Bdi-miR5174j*	23051717	23051737	AATCTTTATGGAACGGAGGGA		3
Bdi-MIR5174k	PmiREN001204	MIR5174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	47041784	47041901	+	AGGTGAGTTAACAGATACTCCCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCATGAATTTGAACTAAGTTTAGTTCAAAACCGTGTCAATTTTTATGGAACGGAGGAAGTAACAGTTAATGATGTTCA	...............((((.(((((((((((((((((((((((((..(((((((((....)))))))))..))))))))))))))))))))))))).)))).................	47041804	47041881	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGGCATGAATTTGAACTAAGTTTAGTTCAAAACCGTGTCAATTTTTATGGAACGGAGGAA	(((((((((((((((((((((((((..(((((((((....)))))))))..)))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5174k	47041804	47041824	CCTCCGTTTCATAAAGGTTGG	Bdi-miR5174k*	47041861	47041881	AATTTTTATGGAACGGAGGAA		3
Bdi-MIR5175a	PmiREN001214	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	15330562	15330679	+	ACCCATTACCATAAGTACTTCTTCTGTTCCTAAATTCTTACCGCTGTTTTAGTTCAAATTTGTACTAAAACAACGATAAGAATTTAGGAACGGAGGGAATACTTTCATAATTTATCTT	........)))))((((.((((((((((((((((((((((.((.(((((((((.((....)).))))))))).)).)))))))))))))))))))))).))))...............	15330582	15330659	CTTCTGTTCCTAAATTCTTACCGCTGTTTTAGTTCAAATTTGTACTAAAACAACGATAAGAATTTAGGAACGGAGGGA	((((((((((((((((((((.((.(((((((((.((....)).))))))))).)).))))))))))))))))))))))	Bdi-miR5175a	15330639	15330661	AAGAATTTAGGAACGGAGGGA	Bdi-miR5175a*	15330582	15330602	CTTCTGTTCCTAAATTCTTAC		3
Bdi-MIR5175b	PmiREN001222	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	19499425	19499524	+	CAGAACTACTTCCTCTGTTCCTAAATTCTTGTCATTGTTTTAGTTCAAATTTGTATTAAAGCCACGACAAGAATTTAGGAATGGAGGGAGTATGAGATAT	((....(((((((((((((((((((((((((((...((((((((.((....)).))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))).)))	19499445	19499504	CTAAATTCTTGTCATTGTTTTAGTTCAAATTTGTATTAAAGCCACGACAAGAATTTAGGA	(((((((((((((...((((((((.((....)).))))))))...)))))))))))))))	Bdi-miR5175b	19499489	19499506	CGACAAGAATTTAGGA	Bdi-miR5175b*	19499445	19499465	CTAAATTCTTGTCATTGTTTT		2
Bdi-MIR5175c	PmiREN001205	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	32150941	32151040	+	TTTTTTTTTGCGAAACAACAAAGAATTTAGGAACGGATGGAGTACTACTAAATTACTTTTTCGATCGACTAGGTTCCTTCTTTCGTAAATTTTCCTCCGG	......(((((((((.......((((((((((.((((.((((((.........)))))))))).))..))))))))....)))))))))...........	32150961	32151020	AAGAATTTAGGAACGGATGGAGTACTACTAAATTACTTTTTCGATCGACTAGGTTCCTTC	..((((((((((.((((.((((((.........)))))))))).))..))))))))....	Bdi-miR5175c	32150961	32150981	AAGAATTTAGGAACGGATGGA	Bdi-miR5175c*	32151000	32151020	TTCGATCGACTAGGTTCCTTC		3
Bdi-MIR5175d	PmiREN001206	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	63339580	63339697	+	CATTTTCTGTGAATATGCTCCCTCCGTTCCTAAATTCTTGTTGTTGTTTTAGTTCAAATTTGCACTATAACAACGAAAAGAATTTAGGAACGGATGGAGTATAACATAGTTAACGGAT	......(((((..((((((((.(((((((((((((((((.((((((((.((((.((....)).)))).)))))))).))))))))))))))))).)))))))).))))).........	63339600	63339677	CCTCCGTTCCTAAATTCTTGTTGTTGTTTTAGTTCAAATTTGCACTATAACAACGAAAAGAATTTAGGAACGGATGGA	(.(((((((((((((((((.((((((((.((((.((....)).)))).)))))))).))))))))))))))))).)..	Bdi-miR5175d	63339657	63339677	AAGAATTTAGGAACGGATGGA	Bdi-miR5175d*	63339600	63339620	CCTCCGTTCCTAAATTCTTGT		3
Bdi-MIR5175e	PmiREN001207	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	5914673	5914791	-	CTCTTACAATCGTAAGTACTCCCTCCGGTCCTAAATTCTTGTCATGGTTTTGTTCAAATTTGAACTAGAACTACGATACGAATTTAGGATCAGAAGGAGCAGTAACTTATAATACTATC	..................((((.((.((((((((((((.((((.((((((((((((....))))).))))))).)))).)))))))))))).)).))))....................	5914693	5914771	CCCTCCGGTCCTAAATTCTTGTCATGGTTTTGTTCAAATTTGAACTAGAACTACGATACGAATTTAGGATCAGAAGGAG	((.((.((((((((((((.((((.((((((((((((....))))).))))))).)))).)))))))))))).)).))..	Bdi-miR5175e	5914751	5914771	CCCTCCGGTCCTAAATTCTTG	Bdi-miR5175e*	5914693	5914713	CGAATTTAGGATCAGAAGGAG		3
Bdi-MIR5175f	PmiREN001208	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	2447152	2447242	-	CAAAAGTTCTTAGTAAATACCCCTCCGGTCCTAAATTCTTGTCTTGGTTTTAGTTCAAGGATCGGAGGGAGTAGTAAAGTCAAAATGCAGC	.................(((((((((((((((.....((............))....)))))))))))).)))..................	2447172	2447222	CCCTCCGGTCCTAAATTCTTGTCTTGGTTTTAGTTCAAGGATCGGAGGGAG	((((((((((((.....((............))....))))))))))))..	Bdi-miR5175f	2447202	2447222	CCCTCCGGTCCTAAATTCTTG	Bdi-miR5175f*	2447172	2447192	TAGTTCAAGGATCGGAGGGAG		3
Bdi-MIR5175g	PmiREN001209	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	46595742	46595861	+	ACTTCAACTTAAACGTTACTCCCTCCGGTCCTAAATTCTTGTCGTGATTTTAGTACAAATTTGAACTAAAACACAGACAACAATTTAGGATCAGAGTTACTAGAAGATTATGTGACCAAC	.(((((((......))).....(((.(((((((((((.((((((((.(((((((.((....)).)))))))))).))))).))))))))))).)))......))))..............	46595762	46595841	CCCTCCGGTCCTAAATTCTTGTCGTGATTTTAGTACAAATTTGAACTAAAACACAGACAACAATTTAGGATCAGAGTTAC	..(((.(((((((((((.((((((((.(((((((.((....)).)))))))))).))))).))))))))))).)))....	Bdi-miR5175g	46595762	46595782	CCCTCCGGTCCTAAATTCTTG	Bdi-miR5175g*	46595821	46595841	ACAATTTAGGATCAGAGTTAC		3
Bdi-MIR5175h	PmiREN001210	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	32631190	32631307	-	TTTGCCAGTAAAATCTACTCCCTCCGGTCCTAAATTCTTGTCATTGTTTTAGTTCAAATTTGTATTAAAACAACAACAACAATTTAGGATCGGAGGGAGTACAAAACTAAATAAGCAC	...............(((((((((((((((((((((.((((..((((((((((.((....)).))))))))))..)))).))))))))))))))))))))).................	32631210	32631287	CCTCCGGTCCTAAATTCTTGTCATTGTTTTAGTTCAAATTTGTATTAAAACAACAACAACAATTTAGGATCGGAGGGA	((((((((((((((((.((((..((((((((((.((....)).))))))))))..)))).))))))))))))))))..	Bdi-miR5175h	32631267	32631287	CCTCCGGTCCTAAATTCTTGT	Bdi-miR5175h*	32631210	32631230	AACAATTTAGGATCGGAGGGA		3
Bdi-MIR5175i	PmiREN001211	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	984457	984574	-	CTTAGAAAAATGTACTACTGTCTCTGATTCTAAATTTTTGTCACTGTTTTAATACAAATTTGAACTAAAACAGGGACAAGAATTTAGGAACGGATGGAGTAGAAATTTTAGTGTCACA	......(((((...(((((.(.((((.(((((((((((((((.((((((((...((....))...)))))))).))))))))))))))).)))).).)))))..))))).........	984477	984554	TCTCTGATTCTAAATTTTTGTCACTGTTTTAATACAAATTTGAACTAAAACAGGGACAAGAATTTAGGAACGGATGGA	(.((((.(((((((((((((((.((((((((...((....))...)))))))).))))))))))))))).)))).)..	Bdi-miR5175i	984477	984497	AAGAATTTAGGAACGGATGGA	Bdi-miR5175i*	984534	984554	TCTCTGATTCTAAATTTTTGT		3
Bdi-MIR5175j	PmiREN001212	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	65824189	65824306	+	CAGATTGTTAAGTACTACTCCCTCTGTTTCTAAGTACTTATCGTCATTTTAGTTCAAATTTGAACTAAGACCACAGCAAGAATTTAGGAATGGAGGGAGTATAAATTTGCGAATCCCA	................(((((((((((((((((((.(((...((..((((((((((....))))))))))..))...))).)))))))))))))))))))..................	65824209	65824286	CCTCTGTTTCTAAGTACTTATCGTCATTTTAGTTCAAATTTGAACTAAGACCACAGCAAGAATTTAGGAATGGAGGGA	(((((((((((((((.(((...((..((((((((((....))))))))))..))...))).)))))))))))))))..	Bdi-miR5175j	65824266	65824286	AAGAATTTAGGAATGGAGGGA	Bdi-miR5175j*	65824209	65824229	CCTCTGTTTCTAAGTACTTAT		3
Bdi-MIR5175k	PmiREN001213	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	55276223	55276321	-	AGATCCCGGGTTGAATATTCCCTCCGTTCCTAAATTCTTGTCATCGTAAAACTACGGCAAGAATTTAGGGACGGAGGGAGTACAATTTACTAGTAGCAG	...............((((((((((((((((((((((((((...((((....)))))))))))))))))))))))))))))).................	55276243	55276301	CCTCCGTTCCTAAATTCTTGTCATCGTAAAACTACGGCAAGAATTTAGGGACGGAGGGA	(((((((((((((((((((((...((((....)))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5175k	55276243	55276263	AAGAATTTAGGGACGGAGGGA	Bdi-miR5175k*	55276281	55276301	CCTCCGTTCCTAAATTCTTGT		3
Bdi-MIR5175l	PmiREN001215	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	11228517	11228634	+	ATATCTCAAATGAAGTATTCCCTCGGTTCCTAAATCCTTGTCGTGATTTTAGTTCAAATTTGTACTTAAACGGTAACAAGAATTTAGGGACGGAGGGAGTACCAAAATAAGCATGTGG	...((......)).((((((((((.((((((((((.((((((((......(((.((....)).)))...)))...))))).)))))))))).))))))))))................	11228537	11228614	CCTCGGTTCCTAAATCCTTGTCGTGATTTTAGTTCAAATTTGTACTTAAACGGTAACAAGAATTTAGGGACGGAGGGA	((((.((((((((((.((((((((......(((.((....)).)))...)))...))))).)))))))))).))))..	Bdi-miR5175l	11228594	11228614	AAGAATTTAGGGACGGAGGGA	Bdi-miR5175l*	11228537	11228557	CCTCGGTTCCTAAATCCTTGT		3
Bdi-MIR5175m	PmiREN001216	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	47816168	47816264	-	GTCTACCATTAATGCTACTCCCTCCGTTCCTAAATTCTTTGAAGTAAAATCACAACAAGAATTTAGGGACGGAGGGAATATATGTCAAACTCATTGG	..................((((((((((((((((((((((((.......)))....))))))))))))))))))))).......((((.....))))	47816188	47816244	CCTCCGTTCCTAAATTCTTTGAAGTAAAATCACAACAAGAATTTAGGGACGGAGGGA	((((((((((((((((((((((.......)))....)))))))))))))))))))..	Bdi-miR5175m	47816188	47816208	AAGAATTTAGGGACGGAGGGA	Bdi-miR5175m*	47816224	47816244	CCTCCGTTCCTAAATTCTTTG		3
Bdi-MIR5175n	PmiREN001217	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	21264918	21265035	+	TAAGAAACTAACGCATACTCCTGCTGTTCCTAAATTGTTGTTGTTTTAGTTCAAATTTGATGAACTAAAACCACAACAAGAATTTAGGGACGGAGGGAGTAGTTTGCATTATTCAGAA	............((.(((((((.(((((((((((((.((((((((((((((((.......)))))))))...))))))).))))))))))))).)))))))))...............	21264938	21265015	CTGCTGTTCCTAAATTGTTGTTGTTTTAGTTCAAATTTGATGAACTAAAACCACAACAAGAATTTAGGGACGGAGGGA	((.(((((((((((((.((((((((((((((((.......)))))))))...))))))).))))))))))))).))..	Bdi-miR5175n	21264995	21265015	AAGAATTTAGGGACGGAGGGA	Bdi-miR5175n*	21264938	21264958	CTGCTGTTCCTAAATTGTTGT		3
Bdi-MIR5175o	PmiREN001218	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	73051943	73052060	-	TTTTTTCTTCAAAGATACTCCCTCTGATCCTAAATTCTTGTCGTGGTTTTAGTACAAATTTGAACTAAAACCACGACAAGAATTTAGGAATGGAGGGAGTACTAAATTGCATCAGCAA	((........))...(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((....)).)))))))))))))))))))))))))).))))))))))).................	73051963	73052040	CCTCTGATCCTAAATTCTTGTCGTGGTTTTAGTACAAATTTGAACTAAAACCACGACAAGAATTTAGGAATGGAGGGA	((((((.((((((((((((((((((((((((((.((....)).)))))))))))))))))))))))))).))))))..	Bdi-miR5175o	73051963	73051983	AAGAATTTAGGAATGGAGGGA	Bdi-miR5175o*	73052020	73052040	CCTCTGATCCTAAATTCTTGT		3
Bdi-MIR5175p	PmiREN001219	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	45262522	45262679	-	ATTTGAACTAAAACCACGACAAGAATTTAGGAATGGAGGGAGTACTGGACTGTGTTCTACTTTTTTTGCAACAGTTTCTGTAATGCTGTCAAAAAAAAGTTGCTGTTTCTAATTATCTCTCATTTCTTTCCTTTTTGCTCTTGTGCATGTATGAAGTA	...................((((((...(((((..((((((..(.((((....((...(((((((((...(((((.........)))))..))))))))).))....)))).)..))))))..)))))...))))))..........((.......))	45262542	45262659	AAGAATTTAGGAATGGAGGGAGTACTGGACTGTGTTCTACTTTTTTTGCAACAGTTTCTGTAATGCTGTCAAAAAAAAGTTGCTGTTTCTAATTATCTCTCATTTCTTTCCTTTTTGC	(((((...(((((..((((((..(.((((....((...(((((((((...(((((.........)))))..))))))))).))....)))).)..))))))..)))))...)))))..	Bdi-miR5175p	45262639	45262659	AAGAATTTAGGAATGGAGGGA	Bdi-miR5175p*	45262542	45262562	TCTCATTTCTTTCCTTTTTGC		3
Bdi-MIR5175q	PmiREN001220	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	3835468	3835604	-	ATTTGAACTAAAACCGTGACAAGATTTTAGGAACGGAGGGAGTAACAGTTATGCGGTTTGGTTGACAAAGCTCATCAGTAACCTTTTTTATTTATATGAACTCCAGTTTTTACTTGTCTTCACCCAAAACAGGTTCT	.................((((((....(((((((((((...(((..(((.....((((((((.((......))))))..))))......)))..)))...)))).)))))))))))))...................	3835488	3835584	AAGATTTTAGGAACGGAGGGAGTAACAGTTATGCGGTTTGGTTGACAAAGCTCATCAGTAACCTTTTTTATTTATATGAACTCCAGTTTTTACTTGT	(((....(((((((((((...(((..(((.....((((((((.((......))))))..))))......)))..)))...)))).))))))))))..	Bdi-miR5175q	3835564	3835584	AAGATTTTAGGAACGGAGGGA	Bdi-miR5175q*	3835488	3835508	TGAACTCCAGTTTTTACTTGT		3
Bdi-MIR5175r	PmiREN001221	MIR5175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	52446748	52446839	-	GTATTTTTTAACATGTACTCCCTCCATTCAAATTTGAACTGAAACCATGACAAGAATTTAGGAATGGAGGGAGTAAATCATATTCTAAGACA	...............((((((((((((((((((((...(((....)).)....))))))..)))))))))))))).................	52446768	52446819	CCTCCATTCAAATTTGAACTGAAACCATGACAAGAATTTAGGAATGGAGGGA	(((((((((((((((...(((....)).)....))))))..)))))))))..	Bdi-miR5175r	52446768	52446788	AAGAATTTAGGAATGGAGGGA	Bdi-miR5175r*	52446799	52446819	CCTCCATTCAAATTTGAACTG		3
Bdi-MIR5176	PmiREN001223	MIR5176	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	28394465	28394585	-	TCACACGTTCTCTCATTTATTCTATGCCATGTCGTCACATATCCTACATGGCAATATTTACCAACATGCTATGTAGGATATGTGATGATGTGGCATAGAATGCGAGGAGAGAGAGCAAACT	......((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.............))))))))))))))))))))))))))))))))))))...)).)))))))).....	28394485	28394565	TCTATGCCATGTCGTCACATATCCTACATGGCAATATTTACCAACATGCTATGTAGGATATGTGATGATGTGGCATAGAAT	(((((((((((((((((((((((((((((((((.............)))))))))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5176	28394485	28394505	TGTGATGATGTGGCATAGAAT	Bdi-miR5176*	28394545	28394565	TCTATGCCATGTCGTCACATA		3
Bdi-MIR5177	PmiREN001224	MIR5177	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	9889733	9890070	+	TTGCACCCGAACTATGAAAACTGCCTGTTTTTCAACTCCATGTGGTTTTAAACAAGTGGGTTTGACTGACAACGATGCCGTGTATATGCTGTATCACTACCATAACACTGGCATGACATCAAACAGATCAGTCTCTTCACTGGATGCGCATGGTTCGGGTTAAAACCATGCTAAACTCTCACTACTCATCCTGTTCCTCATTGCCCCCTCTGTCCTCTCTCATTTCTGGTATGTTTGACGGTGGGCCAGAGATGTGGCAAACCACTATGTCAGACGAAACCATTTGTGAAACCATCTGAGGTTGTAAAACAGACAGTTCTGACAGTTAAGAGGTTGCA	((((((((.((((.(.(.(((((.(((((((.(((((.((.((((((((..((((((((..(((.((((((...(((((((((.((((..(((....))))))))))).)))))((((((.....)))..))).....((.(((((.((((((((........))))))))...............))))).))..(((...((((...(((((......(((.......)))...))))).))))..)))..((((....))))..)))))).)))..)))))))))))))))).)).))))).))))))).))))).).).))))..).)).))))	9889753	9890050	CTGCCTGTTTTTCAACTCCATGTGGTTTTAAACAAGTGGGTTTGACTGACAACGATGCCGTGTATATGCTGTATCACTACCATAACACTGGCATGACATCAAACAGATCAGTCTCTTCACTGGATGCGCATGGTTCGGGTTAAAACCATGCTAAACTCTCACTACTCATCCTGTTCCTCATTGCCCCCTCTGTCCTCTCTCATTTCTGGTATGTTTGACGGTGGGCCAGAGATGTGGCAAACCACTATGTCAGACGAAACCATTTGTGAAACCATCTGAGGTTGTAAAACAGACAGTT	(((.(((((((.(((((.((.((((((((..((((((((..(((.((((((...(((((((((.((((..(((....))))))))))).)))))((((((.....)))..))).....((.(((((.((((((((........))))))))...............))))).))..(((...((((...(((((......(((.......)))...))))).))))..)))..((((....))))..)))))).)))..)))))))))))))))).)).))))).))))))).)))))	Bdi-miR5177	9890029	9890052	TGAGGTTGTAAAACAGACAGTT	Bdi-miR5177*	9889753	9889773	CTGCCTGTTTTTCAACTCCAT		3
Bdi-MIR5178	PmiREN001225	MIR5178	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	8475487	8475680	-	TTTGATAGGAAATTTAACTGCTTGGGACCGCCGGTCAGAGCCATGTGGCAGACAAAATGTGACTATGATCCAACTCTGACCCATAGCACAATATATCGAACTTAGTCCTTGCCACTCGGGCCCATCGATCACGGTTTTTTTTTGCCATATGGCTCTGACCGGTGGGCCTGAGCGATTAGATTGCCTGTCAAATA	(((((((((.(((((((.((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((.(((((...((....))...)))))))))....(((((.....((((.........))))...)))))......)))).))))))))))))))))))))))))).)))))))).))))))).)))))))))..	8475507	8475660	CTTGGGACCGCCGGTCAGAGCCATGTGGCAGACAAAATGTGACTATGATCCAACTCTGACCCATAGCACAATATATCGAACTTAGTCCTTGCCACTCGGGCCCATCGATCACGGTTTTTTTTTGCCATATGGCTCTGACCGGTGGGCCTGAGCG	((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((.(((((...((....))...)))))))))....(((((.....((((.........))))...)))))......)))).))))))))))))))))))))))))).))))))..	Bdi-miR5178	8475507	8475527	TCTGACCGGTGGGCCTGAGCG	Bdi-miR5178*	8475640	8475660	CTTGGGACCGCCGGTCAGAGC		3
Bdi-MIR5179	PmiREN001226	MIR5179	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	9504482	9504712	-	TCATCCCTAGATCTCTCATGTTTTGCTCAAGACCGCGCAACAGTTCCATATGACACCGCATCGCTGTCCTTGCCTATCATATATCTCATGAAGTTCGACCAATGGATCTAAGGAAGAAGAAAAAGATTGCAAGCATGTGGATCATGTAAAGGATAGGTCTGAACGTCGATGCGCTGGTTATGGTCAGGCTGTGCGGTCTTGAGCAATAACGTTGAGACGGATCTCTTATTC	........(((((((((((((((((((((((((((((((.(....(((((...((.(((((((.(((.(..(((((((........(((((...((.((.....(((((..............)))))........)).))))))).....)))))))..).))).))))))).))..)))))....).))))))))))))))))).)))).)))))..))))).......	9504502	9504692	TTTTGCTCAAGACCGCGCAACAGTTCCATATGACACCGCATCGCTGTCCTTGCCTATCATATATCTCATGAAGTTCGACCAATGGATCTAAGGAAGAAGAAAAAGATTGCAAGCATGTGGATCATGTAAAGGATAGGTCTGAACGTCGATGCGCTGGTTATGGTCAGGCTGTGCGGTCTTGAGCAATAACG	(((((((((((((((((((.(....(((((...((.(((((((.(((.(..(((((((........(((((...((.((.....(((((..............)))))........)).))))))).....)))))))..).))).))))))).))..)))))....).))))))))))))))))).))..	Bdi-miR5179	9504672	9504692	TTTTGCTCAAGACCGCGCAAC	Bdi-miR5179*	9504502	9504522	GTGCGGTCTTGAGCAATAACG		3
Bdi-MIR5181a	PmiREN001227	MIR5181	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	48140333	48140503	+	TATGTTTTATGTACTCCTTCTGATCCATAATAAGTGTCAGGAATTTAGTACAAAGTTACTTTGTACTAAATCCCCGGCACTTATTATGGATCAGAGGGAGTAAGAAAATATTAACTTTGTACTAAATCCCCGGCACTTATTATGGATCGGAGGGAGTAAGAAAATATCTAA	.(((((((...(((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((.......((...(((((....((......))....).))))...)).......)))))))))))))))).)).)))))))))))))))))))))))))))..)))))))....	48140353	48140483	TGATCCATAATAAGTGTCAGGAATTTAGTACAAAGTTACTTTGTACTAAATCCCCGGCACTTATTATGGATCAGAGGGAGTAAGAAAATATTAACTTTGTACTAAATCCCCGGCACTTATTATGGATCGGA	((((((((((((((((((.((.((((((((((((((((.......((...(((((....((......))....).))))...)).......)))))))))))))))).)).))))))))))))))))))..	Bdi-miR5181a	48140353	48140373	TGATCCATAATAAGTGTCAGG	Bdi-miR5181a*	48140463	48140483	CGGCACTTATTATGGATCGGA		3
Bdi-MIR5181b	PmiREN001228	MIR5181	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	38960460	38960580	-	TTATTCCATTTTACTCCCTCCGATCCATAATAAGTGTCGGAGATTTAGTATGAAATTGTACAAACATTGTACTAAATCCCCGACACTTACTGTGGATCGGAGGGAGTAGTTGTAAGATGAG	((((......(((((((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((...(((....))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))..))))......	38960480	38960560	CGATCCATAATAAGTGTCGGAGATTTAGTATGAAATTGTACAAACATTGTACTAAATCCCCGACACTTACTGTGGATCGGA	(((((((((.((((((((((.((((((((((((...(((....))))))))))))))).)))))))))).)))))))))..	Bdi-miR5181b	38960480	38960500	CGACACTTACTGTGGATCGGA	Bdi-miR5181b*	38960540	38960560	CGATCCATAATAAGTGTCGGA		3
Bdi-MIR5181c	PmiREN001229	MIR5181	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	22821304	22821422	-	TCCTTGCAAAAACTATACTCCCTCCGGTCCACAATAAGTGTCTCGGATTTAGTACTAAGTTAGTACAAAATCTGAAACACTTCTTATGGATTGTAGGGAGTAGAATCTTGGATAACCTT	................(((((((.(((((((.((.((((((.((((((((.((((((...)))))).)))))))).)))))).)).))))))).)))))))..................	22821324	22821402	CCTCCGGTCCACAATAAGTGTCTCGGATTTAGTACTAAGTTAGTACAAAATCTGAAACACTTCTTATGGATTGTAGGGA	(((.(((((((.((.((((((.((((((((.((((((...)))))).)))))))).)))))).)).))))))).)))..	Bdi-miR5181c	22821324	22821344	ACTTCTTATGGATTGTAGGGA	Bdi-miR5181c*	22821382	22821402	CCTCCGGTCCACAATAAGTGT		3
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Bdi-MIR5181e	PmiREN001231	MIR5181	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	63937699	63937817	-	TCCAAGATTAGTACTCCCTCCGAACCATAATAAGTGTCTGACATTTAGCACAAATTTGTTAACTTCGTACTAAATCTCCGACACTTACTGTGGCTCGGAGGGAGTATGTGAAACGATAT	..........(((((((((((((.(((((.((((((((.((.((((((.((...............)).)))))).)).)))))))).))))).)))))))))))))............	63937719	63937797	CGAACCATAATAAGTGTCTGACATTTAGCACAAATTTGTTAACTTCGTACTAAATCTCCGACACTTACTGTGGCTCGGA	(((.(((((.((((((((.((.((((((.((...............)).)))))).)).)))))))).))))).)))..	Bdi-miR5181e	63937719	63937739	CGACACTTACTGTGGCTCGGA	Bdi-miR5181e*	63937777	63937797	CGAACCATAATAAGTGTCTGA		3
Bdi-MIR5181f	PmiREN001232	MIR5181	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	22809115	22809226	-	GGATGAATAATACTCTCCTCTGATCCATAATAAGTGTCAGGATTTTAGTACAAAGTTGTGTACTAACTCTCTGACACTTATTATGGATTGGAGGGAGTAGCATATTATGTCT	..........(((((.((((((((((((((((((((((((((..((((((((......)))))))).)).))))))))))))))))))))))))))))).............	22809135	22809206	TGATCCATAATAAGTGTCAGGATTTTAGTACAAAGTTGTGTACTAACTCTCTGACACTTATTATGGATTGGA	((((((((((((((((((((((..((((((((......)))))))).)).))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5181f	22809186	22809206	TGATCCATAATAAGTGTCAGG	Bdi-miR5181f*	22809135	22809155	TGACACTTATTATGGATTGGA		3
Bdi-MIR5181g	PmiREN001233	MIR5181	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	22756074	22756185	-	GGATGAATAATACTCCCCTCTGATCCATAATAAGTGTCAGGATTTTAGTACAAAGTTGTGTACTAACTCTCTGACACTTATAATGGATTGGAGGGAGTACCATATTATGTCT	......(((((((((((.((((((((((.(((((((((((((..((((((((......)))))))).)).))))))))))).))))))))))))))))).....))))....	22756094	22756165	TGATCCATAATAAGTGTCAGGATTTTAGTACAAAGTTGTGTACTAACTCTCTGACACTTATAATGGATTGGA	((((((((.(((((((((((((..((((((((......)))))))).)).))))))))))).))))))))..	Bdi-miR5181g	22756145	22756165	TGATCCATAATAAGTGTCAGG	Bdi-miR5181g*	22756094	22756114	TGACACTTATAATGGATTGGA		3
Bdi-MIR5182	PmiREN001234	MIR5182	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	50871508	50871680	-	TCCGGATTTATAAGGCACGTGTGTGTTCCAAGATCATCGATGTAACTAGCAAAATAATTCAAAAGTTCATTTGACTACAAATCTAATGATGTACTTTTTTGTGTAATATAATACATATTTTGTTGGTTAAATTGATGATCTTGGAACACGTGCATGCCTTATATATCCGTACC	(.(((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((....(((((((((((.((.......)).)))))...)))))).(((((......))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))).))))))))).))))).)..	50871528	50871660	GTGTGTTCCAAGATCATCGATGTAACTAGCAAAATAATTCAAAAGTTCATTTGACTACAAATCTAATGATGTACTTTTTTGTGTAATATAATACATATTTTGTTGGTTAAATTGATGATCTTGGAACACGTGC	(((((((((((((((((((((.((((((((((((((....(((((((((((.((.......)).)))))...)))))).(((((......))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5182	50871528	50871548	TGATGATCTTGGAACACGTGC	Bdi-miR5182*	50871640	50871660	GTGTGTTCCAAGATCATCGAT		3
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Bdi-MIR5185a	PmiREN001237	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	41494923	41495041	+	GGATCCCACGAAAGTCCCGTTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTCAAAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTCGCGGGATGCCG	(.(((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))).))))).).)	41494943	41495021	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTCAAAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185a	41495001	41495023	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185a*	41494943	41494963	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185b	PmiREN001238	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	6131689	6131807	+	TACTCACGCGAAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTCATAATTTGAATAAGAGGTTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTTGCGGGATCCCG	.((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((.((........)))))))))).)))))))))))).)))))))))))))))))))))))).))....)	6131709	6131787	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTCATAATTTGAATAAGAGGTTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.((((((((((((.((((((((.((........)))))))))).)))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185b	6131767	6131789	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185b*	6131709	6131729	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185c	PmiREN001239	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	47741014	47741123	+	ATCCCGCGAAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTTTATTCAAAATTTTGCTTAGAATTTGAATAAGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCAGGACTTTCGCAG	.....((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((.....))).))))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))..	47741032	47741110	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTTTATTCAAAATTTTGCTTAGAATTTGAATAAGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((.....))).))))))))))))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185c	47741090	47741112	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185c*	47741032	47741052	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185d	PmiREN001240	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	67052444	67052562	+	GGATGCTGCGAAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTTTATTCAAAATTTTCTTCAGAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTCGCGGGATCCCG	((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))).))))))	67052464	67052542	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTTTATTCAAAATTTTCTTCAGAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185d	67052522	67052544	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185d*	67052464	67052484	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185e	PmiREN001241	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	51099743	51099857	-	GGATCCCGTGAAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAAGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTCGCGGGAT	..((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((.((((....)))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))	51099763	51099841	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAAGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.((((((((((((.((((((((.((((....)))))))))))).)))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185e	51099763	51099785	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185e*	51099821	51099841	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185f	PmiREN001242	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	44718489	44718598	-	GATCCCGCGGAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCCAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAAGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCAGGACTTTCGCG	.....(((((((((((.((((((((((((.((((((((((((.(((((.(((((((....)))))))))))).)))))))))))).)))))))))))).)))))))))))	44718508	44718586	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCCAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAAGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.((((((((((((.(((((.(((((((....)))))))))))).)))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185f	44718508	44718530	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185f*	44718566	44718586	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185g	PmiREN001243	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	10738639	10738753	+	GGGATCCGCGAAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAAGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGATTTTCGCGGGAT	.....(((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((.((((....)))))))))))).)))))))))))).)))))))))))))))))))))))))...	10738659	10738737	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAAGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.((((((((((((.((((((((.((((....)))))))))))).)))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185g	10738717	10738739	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185g*	10738659	10738679	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185h	PmiREN001244	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	28160181	28160296	+	GGATCCCGCGAAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTCAGAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTCGCAGGATC	.(((((.(((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))).)))))	28160201	28160279	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTCAGAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185h	28160259	28160281	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185h*	28160201	28160221	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185i	PmiREN001245	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	35181127	35181227	+	AAAGTCCTGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTTAGAATTTGAATACGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTCGCG	((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((.(((.....))).)))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))....	35181137	35181215	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGCTTAGAATTTGAATACGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.((((((((((((.((((((((.(((.....))).)))))))).)))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185i	35181195	35181217	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185i*	35181137	35181157	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185j	PmiREN001246	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	9706121	9706221	-	GCAAGTCCTGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTCGC	(.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).)..	9706132	9706210	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185j	9706132	9706154	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185j*	9706190	9706210	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185k	PmiREN001247	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25031414	25031523	-	GATCCCGCAAAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGCAGGACTTTCGCG	.....(((.(((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))).)))	25031433	25031511	TTCTAGTTCATTTTTCAAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTGAATAGGAGATTTGAGAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((....))))))))))))))))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185k	25031433	25031455	TTTGAGAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185k*	25031491	25031511	TTCTAGTTCATTTTTCAAATC		3
Bdi-MIR5185l	PmiREN001236	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	16740246	16740364	-	GGATGCAAGCGGGGTCCCGCTTCTAGTTCAATTTCCAAATTTTCAGGTCAAGATTTGGCTTAAAATTTGACTAGAAGATTTGAAAATTGAACTAGAAGCGGGAGATATGTGGGATCCCG	.........(((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((.(((((......)))))))))).))))))))).))))))))))))))))...........)))))))))	16740266	16740344	TTCTAGTTCAATTTCCAAATTTTCAGGTCAAGATTTGGCTTAAAATTTGACTAGAAGATTTGAAAATTGAACTAGAAGC	((((((((((((((.(((((((((.(((((.(((((......)))))))))).))))))))).))))))))))))))..	Bdi-miR5185l	16740266	16740286	TTTGAAAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185l*	16740324	16740344	TTCTAGTTCAATTTCCAAATT		3
Bdi-MIR5185m	PmiREN001248	MIR5185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	23947055	23947161	+	CCCGCGAAAGTCCCGCTTCTAGTTCATTTTTCGAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTAAATAAGATTTGAAAATTGAACTAGAAGCGGGACTTTCGTGGG	((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((..((((..(((((((....))))))).))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))	23947071	23947147	TTCTAGTTCATTTTTCGAATCTTCTATTCAAAATTTTGTTCAGAATTTAAATAAGATTTGAAAATTGAACTAGAAGC	((((((((((.(((((((((((..((((..(((((((....))))))).))))))))))))))).))))))))))))	Bdi-miR5185m	23947127	23947149	TTTGAAAATTGAACTAGAAGC	Bdi-miR5185m*	23947071	23947091	TTCTAGTTCATTTTTCGAATC		2
Bdi-MIR5198	PmiREN001249	MIR5198	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	3140141	3140233	+	CCGAGCTCCCTCAATCTCTTTTCCGCTTTCTGCTTGGCTGGAAAGGAGTTGGGGTGGATAGCAGAGAGGGGAAAAGAGATTGAGGGAGCTCGG	((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((.((......)).)).))...))))))))).))))))))))))))))))))))))	3140147	3140229	TCCCTCAATCTCTTTTCCGCTTTCTGCTTGGCTGGAAAGGAGTTGGGGTGGATAGCAGAGAGGGGAAAAGAGATTGAGGGAGC	((((((((((((((((((.(((((((((((.((.((......)).)).))...))))))))).))))))))))))))))))))	Bdi-miR5198	3140147	3140168	TCCCTCAATCTCTTTTCCGC	Bdi-miR5198*	3140209	3140229	GGGAAAAGAGATTGAGGGAGC		2
Bdi-MIR5199	PmiREN001250	MIR5199	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	42939614	42939739	-	CGCTTAGAGATGGGCAAAGTGCTATCAATTGTTTGAACAAACTTTGCCCAGTCTACGACATTGACTCGAACCTGATTGCTGAGTTTGTTCATACGGTTGATAGCACTTAGCCCATCTCTAAACAGT	(..((((((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((.((.(((....(((.......)))...)))...)).))))))))))).)))))))))))))))).))))))))))))...).	42939634	42939719	GCTATCAATTGTTTGAACAAACTTTGCCCAGTCTACGACATTGACTCGAACCTGATTGCTGAGTTTGTTCATACGGTTGATAGCAC	((((((((((((.(((((((((((.((.(((....(((.......)))...)))...)).))))))))))).))))))))))))..	Bdi-miR5199	42939634	42939654	TGTTCATACGGTTGATAGCAC	Bdi-miR5199*	42939699	42939719	GCTATCAATTGTTTGAACAAA		3
Bdi-MIR5200a	PmiREN001251	MIR5200	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	47621684	47621803	+	AAAATCCTCAAAGCACTAGAGCCTTAGGGAATATCTACACTAGTAAGTTCTTTTCCTTTCTTCTGGACATGCTTAGCAGTGTAGATACTCCCTAAGGCTTCGGTCGTATTGGATTGTTGT	..(((((.....(.(((.((((((((((((.((((((((((..(((((.....(((........)))...)))))..)))))))))).)))))))))))).)))).....))))).....	47621704	47621783	GCCTTAGGGAATATCTACACTAGTAAGTTCTTTTCCTTTCTTCTGGACATGCTTAGCAGTGTAGATACTCCCTAAGGCTT	((((((((((.((((((((((..(((((.....(((........)))...)))))..)))))))))).))))))))))..	Bdi-miR5200a	47621763	47621783	TGTAGATACTCCCTAAGGCTT	Bdi-miR5200a*	47621704	47621724	GCCTTAGGGAATATCTACACT		3
Bdi-MIR5200b	PmiREN001252	MIR5200	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	47650886	47651006	+	AATCCTGAAGCACTAGTAAAGCCTTAGAGAGTATCTACACTGGTAGTATTCTTCTTTCTTGGTGGAAAAGTACTTGCCACTGTAGATACTCCCTAAGGCTTTAACAGGAGGTTTTGGGCCG	................(((((((((((.(((((((((((.((((((((((.((((........)))).))))).))))).))))))))))).)))))))))))..................	47650906	47650986	GCCTTAGAGAGTATCTACACTGGTAGTATTCTTCTTTCTTGGTGGAAAAGTACTTGCCACTGTAGATACTCCCTAAGGCTT	(((((((.(((((((((((.((((((((((.((((........)))).))))).))))).))))))))))).)))))))..	Bdi-miR5200b	47650966	47650986	TGTAGATACTCCCTAAGGCTT	Bdi-miR5200b*	47650906	47650926	GCCTTAGAGAGTATCTACACT		3
Bdi-MIR5201	PmiREN001253	MIR5201	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	42219854	42219975	-	TCATGTGCACCACTTCACTCTGATCATTTGCCCCGTCTTGTAGCACTGACACGTGGTCCATGCCCCACATGTCAGTGATACAGGGCGAGGCAAATGATCAAAGTGCGAAGTAAAGTGGGGCA	.....(((.((((((((((.((((((((((((.(((((((((.((((((((.((((........)))).)))))))).))))))))).)))))))))))).)))).......)))))).)))	42219874	42219955	TGATCATTTGCCCCGTCTTGTAGCACTGACACGTGGTCCATGCCCCACATGTCAGTGATACAGGGCGAGGCAAATGATCAAA	((((((((((((.(((((((((.((((((((.((((........)))).)))))))).))))))))).))))))))))))..	Bdi-miR5201	42219935	42219955	TGATCATTTGCCCCGTCTTGT	Bdi-miR5201*	42219874	42219894	AGGGCGAGGCAAATGATCAAA		3
Bdi-MIR5202	PmiREN001254	MIR5202	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	28991999	28992229	+	TTTGTGAGTTCAAACTTATGTTACGTGAGTTAAATCGTCGACCTAGGGATACGTGCAGGACCTACAAACCGAAACGGAGGGAGTAGACATCTTGTATTGCTCTCCAAATCCAAGGCTGTTTGTGAGAGAACGCACCATATGGATGTGTCGTGTGGAGTTAGGAAAATTTGAAGGTGATTATTTTCTATAGATGCAATAACTGAATGTAATTTGTGGGTGTGTAGGCAGCGA	.............(((((((((((((.(((((...((((..(((((..((((((((((((.((((...((........))..))))...)))))))...((((((((((........))))).))))).(((((((....)).))))))))))....))))).......((((((....))))))....))))...)))))..)))))))..)))))).............	28992019	28992209	TTACGTGAGTTAAATCGTCGACCTAGGGATACGTGCAGGACCTACAAACCGAAACGGAGGGAGTAGACATCTTGTATTGCTCTCCAAATCCAAGGCTGTTTGTGAGAGAACGCACCATATGGATGTGTCGTGTGGAGTTAGGAAAATTTGAAGGTGATTATTTTCTATAGATGCAATAACTGAATGTAATT	((((((.(((((...((((..(((((..((((((((((((.((((...((........))..))))...)))))))...((((((((((........))))).))))).(((((((....)).))))))))))....))))).......((((((....))))))....))))...)))))..))))))..	Bdi-miR5202	28992019	28992039	TTACGTGAGTTAAATCGTCGA	Bdi-miR5202*	28992189	28992209	ATGCAATAACTGAATGTAATT		3
Bdi-MIR5281a	PmiREN001256	MIR5281	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	11676642	11676754	+	AATCAGTGATATTTACTCCCTTCGTTCCTATTTATAAGACGTCTTGGCAAGTCAATTTGGCTTGCCAAAACGTCTTATAAATAGGAACGGAGGGAATACTTGGGCGTGATGCT	.....((((...))))((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((...))))))))))).))))))))))))))))))))))))))..................	11676662	11676734	TTCGTTCCTATTTATAAGACGTCTTGGCAAGTCAATTTGGCTTGCCAAAACGTCTTATAAATAGGAACGGAGG	((((((((((((((((((((((.(((((((((((...))))))))))).))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5281a	11676714	11676734	TCTTATAAATAGGAACGGAGG	Bdi-miR5281a*	11676662	11676682	TTCGTTCCTATTTATAAGACG		3
Bdi-MIR5281b	PmiREN001257	MIR5281	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	48498583	48498828	-	ACTACTCTCTTCCTTAGTTTTATAAGATGTTCTGGCTTTGTCATATACCAAGCTCTACAAACCTTGACCAAGATAATAGTAAATCGACCGACATCTACAACTTTATACCAAGCTTTATTAAATCTATTGCAATAGATATCTTATATTTATTTGAGAAGTTGCTGATATTAGTATAAACTTTGAGAGGTTTGACTTAATATAAAACTCAAAACTATAACATCTTATAAATAGGAACGGAGGTAGTAG	(((((.((((((((....(((((((((((((.(((.((((...((((..(((.....((((((((..(.(((...(((.(((((((..((((.(((.((............((..((.......))..))(((((((((...)))))))))))))).)))).)))).))).)))...))).).)))))))).)))..)))).....)))).))).))))))))))))).))))..)))))))))..	48498590	48498822	TCTTCCTTAGTTTTATAAGATGTTCTGGCTTTGTCATATACCAAGCTCTACAAACCTTGACCAAGATAATAGTAAATCGACCGACATCTACAACTTTATACCAAGCTTTATTAAATCTATTGCAATAGATATCTTATATTTATTTGAGAAGTTGCTGATATTAGTATAAACTTTGAGAGGTTTGACTTAATATAAAACTCAAAACTATAACATCTTATAAATAGGAACGGAGG	(((((((....(((((((((((((.(((.((((...((((..(((.....((((((((..(.(((...(((.(((((((..((((.(((.((............((..((.......))..))(((((((((...)))))))))))))).)))).)))).))).)))...))).).)))))))).)))..)))).....)))).))).))))))))))))).))))..)))))	Bdi-miR5281b	48498590	48498612	TCTTATAAATAGGAACGGAGG	Bdi-miR5281b*	48498802	48498822	TCTTCCTTAGTTTTATAAGAT		2
Bdi-MIR5568	PmiREN001264	MIR5568	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	42227633	42227745	-	GGTAATTATTTATTACTCCCTCTGTTCCTAATTGTAAGACGTTTTAGTAGGCTAATTTGACCTACCAAAACGTCTTACAATTAGGAACAGAGGGAGTACAAGAGAACTTTTTA	.............((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((......).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))...............	42227653	42227725	TCTGTTCCTAATTGTAAGACGTTTTAGTAGGCTAATTTGACCTACCAAAACGTCTTACAATTAGGAACAGAGG	(((((((((((((((((((((((((.((((((......).))))).)))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR5568	42227705	42227725	TCTGTTCCTAATTGTAAGACG	Bdi-miR5568*	42227653	42227673	TCTTACAATTAGGAACAGAGG		3
Bdi-MIR6197a	PmiREN001265	MIR6197	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	43994043	43994148	-	AGATGTACATTGCTACTACCTCTGTTCCTAAATGTAAGACGTTTTGGTAGAAGTCTACCAAAACGTCTTACATTTAGGAACAGAGGCCTACCAAAACGTCTTATAT	((((((...(((.((...((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))..)).))).)))))).....	43994063	43994128	TCTGTTCCTAAATGTAAGACGTTTTGGTAGAAGTCTACCAAAACGTCTTACATTTAGGAACAGAGG	((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR6197a	43994108	43994128	TCTGTTCCTAAATGTAAGACG	Bdi-miR6197a*	43994063	43994083	TCTTACATTTAGGAACAGAGG		3
Bdi-MIR6197b	PmiREN001266	MIR6197	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	41162167	41162268	+	ATCTTCTCACTACCGCTACCTCTGTTCCTAAATGTAAGACGTTTTGGTAGGCTAAAAAAAATCTTACATTTAGAAACAGAGGTAGTAGTTTTCTATTGTCAG	...........((.((((((((((((.((((((((((((..((((((....))))))....)))))))))))).)))))))))))).)).............	41162187	41162248	TCTGTTCCTAAATGTAAGACGTTTTGGTAGGCTAAAAAAAATCTTACATTTAGAAACAGAGG	((((((.((((((((((((..((((((....))))))....)))))))))))).))))))..	Bdi-miR6197b	41162187	41162207	TCTGTTCCTAAATGTAAGACG	Bdi-miR6197b*	41162228	41162248	TCTTACATTTAGAAACAGAGG		3
Bdi-MIR7710	PmiREN001267	MIR7710	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	45966087	45966230	+	ACTTTGAAAAATTATTCCGAGCACACCTAGCGACGCTGGTACCTACCATAACCTCTTCATCTAGCTAGGGTATAAAGAGTGACTAATGAAGATATGGTAGGTATCGACGATGCTAGATGTGCTCAGAATGATGTTTCAAAATTG	(.(((((((.(((((((.(((((((.((((((.((.((((((((((((((...(((((((.((((...............).)))))))))))))))))))))))).)).)))))).))))))).))))))).))))))).)))	45966107	45966210	GCACACCTAGCGACGCTGGTACCTACCATAACCTCTTCATCTAGCTAGGGTATAAAGAGTGACTAATGAAGATATGGTAGGTATCGACGATGCTAGATGTGCTC	(((((.((((((.((.((((((((((((((...(((((((.((((...............).)))))))))))))))))))))))).)).)))))).)))))))	Bdi-miR7710	45966190	45966212	TCGACGATGCTAGATGTGCTC	Bdi-miR7710*	45966107	45966127	GCACACCTAGCGACGCTGGTA		2
Bdi-MIR7715	PmiREN001268	MIR7715	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	36243363	36243509	+	TCGATAATGGACGGCATAGATCAAAGATGGGATTTCTGAACAGCCACTTAACTCTATGACGTGGGTAAAAGAAAGGGGTTATTGCAAAGTAGAGTTAAGTGGCTGTTAAGAAAACCCACCTTTGATGTATACCGTCCATTGTCGACC	((((((((((((((.(((.(((((((.((((.(((((.(((((((((((((((((((......(((((..........))))).....))))))))))))))))))).))))).)))).))))))).))).))))))))))))))..	36243383	36243489	TCAAAGATGGGATTTCTGAACAGCCACTTAACTCTATGACGTGGGTAAAAGAAAGGGGTTATTGCAAAGTAGAGTTAAGTGGCTGTTAAGAAAACCCACCTTTGATG	((((((.((((.(((((.(((((((((((((((((((......(((((..........))))).....))))))))))))))))))).))))).)))).))))))..	Bdi-miR7715	36243383	36243403	TCAAAGATGGGATTTCTGAAC	Bdi-miR7715*	36243469	36243489	TAAGAAAACCCACCTTTGATG		3
Bdi-MIR7719	PmiREN001269	MIR7719	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	40794568	40794724	-	GCAGATGGCAATTCAACATCTCCGCCATACATGTTTCTATCCCAATCATATTGCTGATCTTTGAAGCTTGGAGCCGGTATGTTGGACTAGACGAATTAAGTGCCATATGATTGTGATAGAAGCATATATGGCGAAGATCTTAAATTGACATATGCTA	(((.(((.(((((.((.((((.(((((((.(((((((((((.(((((((((.(((.........)))........((((((((.(......).)))...)))))))))))))).))))))))))).))))))).)))).)).))))).))).)))..	40794588	40794704	TCCGCCATACATGTTTCTATCCCAATCATATTGCTGATCTTTGAAGCTTGGAGCCGGTATGTTGGACTAGACGAATTAAGTGCCATATGATTGTGATAGAAGCATATATGGCGAAGA	(.(((((((.(((((((((((.(((((((((.(((.........)))........((((((((.(......).)))...)))))))))))))).))))))))))).))))))).)..	Bdi-miR7719	40794684	40794704	TCCGCCATACATGTTTCTATC	Bdi-miR7719*	40794588	40794608	TAGAAGCATATATGGCGAAGA		3
Bdi-MIR7721	PmiREN001270	MIR7721	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	34199841	34200032	-	ATAAGGCCAGCACGGGATTTTATAACGGACTTTGGCGAAACATTACTTGGTAATACGATGTTATTGCGACACAAAAGAGATATCGTTGTATTTATATTGGAAAACTCAATAAATAGTATAACATTTATATACCTACATTTTTTGTATAATTGTTCGTCAAAGTTTGGCATAGAATTCAATGCAGGTCTTATA	((((((((.(((..(((((((((..((((((((((((((.((.........(((((((((.((((.(.........).)))).)))))))))..((((((.....))))))....(((((.......))))).((((.....))))....))))))))))))))))..)))))))))..))).)))))))).	34199858	34200016	TTTTATAACGGACTTTGGCGAAACATTACTTGGTAATACGATGTTATTGCGACACAAAAGAGATATCGTTGTATTTATATTGGAAAACTCAATAAATAGTATAACATTTATATACCTACATTTTTTGTATAATTGTTCGTCAAAGTTTGGCATAGAATT	((((((..((((((((((((((.((.........(((((((((.((((.(.........).)))).)))))))))..((((((.....))))))....(((((.......))))).((((.....))))....))))))))))))))))..))))))))	Bdi-miR7721	34199996	34200018	TTTTATAACGGACTTTGGCGA	Bdi-miR7721*	34199858	34199878	GTCAAAGTTTGGCATAGAATT		2
Bdi-MIR7722	PmiREN001271	MIR7722	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	52449175	52449281	-	GTCTATTTTCCTCTCCTCCCGGTACCCTTCTTCCGGTTTCCATCCCGGTTGCCACCGACGCCGATAGACGCCGGAAGAAGGGTATCGGGATGAGAGGAAAATAGACT	(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((.(((...((((....))))...))).)).))))))))))))))))))))).))))))))))))))).	52449187	52449270	CTCCTCCCGGTACCCTTCTTCCGGTTTCCATCCCGGTTGCCACCGACGCCGATAGACGCCGGAAGAAGGGTATCGGGATGAGAG	(((.(((((((((((((((((((((.((.(((...((((....))))...))).)).))))))))))))))))))))).)))))	Bdi-miR7722	52449187	52449209	AGAAGGGTATCGGGATGAGAG	Bdi-miR7722*	52449250	52449270	CTCCTCCCGGTACCCTTCTTC		2
Bdi-MIR7723	PmiREN001272	MIR7723	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	55305183	55305417	-	AAAGTTCAATTTTGAAACAACTATCTTGGCCTTCTCTTCTGTCTGCTAGACCAACACATTGATCTCCTATTGGTAACCCCAACAATCCTTCATCTGTATATGCAATTATACGATAGCTAGTTTTTTGGTTATTTGCCTATATAATTGAAAGAATGTTGGGGCTGCCGATGAAATCAGTCTGTAGGTCCAGCCATCACACAAGAGGGCCAAGGTAGTTGTTTCACAGTTGCACCTT	...((.(((((.(((((((((((((((((((((((....((...(((.((((.(((.((((((.((..(((((((.((((((((.((.((((..((((((.(((.......(((((((((....)))))))))))).))))))..)))).)).)))))))).))))))))).)))))).))).)))).)))...))....))))))))))))))))))))))).))))).))...	55305195	55305407	TGAAACAACTATCTTGGCCTTCTCTTCTGTCTGCTAGACCAACACATTGATCTCCTATTGGTAACCCCAACAATCCTTCATCTGTATATGCAATTATACGATAGCTAGTTTTTTGGTTATTTGCCTATATAATTGAAAGAATGTTGGGGCTGCCGATGAAATCAGTCTGTAGGTCCAGCCATCACACAAGAGGGCCAAGGTAGTTGTTTCACA	(((((((((((((((((((((((....((...(((.((((.(((.((((((.((..(((((((.((((((((.((.((((..((((((.(((.......(((((((((....)))))))))))).))))))..)))).)).)))))))).))))))))).)))))).))).)))).)))...))....))))))))))))))))))))))).)	Bdi-miR7723	55305195	55305220	GAGGGCCAAGGTAGTTGTTTCACA	Bdi-miR7723*	55305387	55305407	TGAAACAACTATCTTGGCCTT		3
Bdi-MIR7725	PmiREN001273	MIR7725	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	9581264	9581408	+	ATCTTGGCGAACTAGGGAGATGGTTTTCGCTATGCTCCACCTCATATTTGACTGAAATAGAATTTTGTTCTTCCATGATGTAATTTAGTCAAATAAGAGGAGACGAGACATAGTGAAAACCATATTCCTAGCTCGCCATGGCAGG	.((.((((((.(((((((.((((((((((((((((((..((((.((((((((((((.((..(((.((......)).))).)).)))))))))))).))))....))).))))))))))))))).))))))).)))))).))....	9581274	9581397	ACTAGGGAGATGGTTTTCGCTATGCTCCACCTCATATTTGACTGAAATAGAATTTTGTTCTTCCATGATGTAATTTAGTCAAATAAGAGGAGACGAGACATAGTGAAAACCATATTCCTAGCTC	.(((((((.((((((((((((((((((..((((.((((((((((((.((..(((.((......)).))).)).)))))))))))).))))....))).))))))))))))))).))))))).))	Bdi-miR7725	9581274	9581296	ACTAGGGAGATGGTTTTCGCT	Bdi-miR7725*	9581377	9581397	TGAAAACCATATTCCTAGCTC		2
Bdi-MIR7726	PmiREN001274	MIR7726	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	60341321	60341471	-	AACGGTGGCATATTGACTGTAATTTTGATGACATGACGTACGGCGGCGGTCGTACCATCACTACCAACTCCAATTTAATATATTGGTGGTGATGGTACGGTCGTTGCGATACGTCACTTCACCGAAATTACAAATCTGCCACCGTTGTCCC	((((((((((.(((...((((((((((.(((..(((((((..(((((((((((((((((((((((((...............)))))))))))))))))))))))))..)))))))..))).))))))))))))).)))))))))).....	60341341	60341451	AATTTTGATGACATGACGTACGGCGGCGGTCGTACCATCACTACCAACTCCAATTTAATATATTGGTGGTGATGGTACGGTCGTTGCGATACGTCACTTCACCGAAATTAC	(((((((.(((..(((((((..(((((((((((((((((((((((((...............)))))))))))))))))))))))))..)))))))..))).)))))))))	Bdi-miR7726	60341428	60341453	AATTTTGATGACATGACGTACGGC	Bdi-miR7726*	60341341	60341361	ACGTCACTTCACCGAAATTAC		3
Bdi-MIR7728	PmiREN001275	MIR7728	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	9808896	9809000	+	CCCCTAGGCCTGCTCGGATTGAGTGTATTTTTAGTGGGGGGCTGGTACTTAGTTACCAACCCCCAACTAAAAATACACTCAATTCAAGCAGCTGGCCCTTAATTG	......((((((((.((((((((((((((((((((.(((((.(((((......))))).))))).)))))))))))))))))))).))))...))))........	9808906	9808987	TGCTCGGATTGAGTGTATTTTTAGTGGGGGGCTGGTACTTAGTTACCAACCCCCAACTAAAAATACACTCAATTCAAGCAGC	((((.((((((((((((((((((((.(((((.(((((......))))).))))).)))))))))))))))))))).))))..	Bdi-miR7728	9808906	9808928	TGCTCGGATTGAGTGTATTTT	Bdi-miR7728*	9808967	9808987	AATACACTCAATTCAAGCAGC		3
Bdi-MIR7729a	PmiREN001276	MIR7729	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	26534851	26534917	+	GTTTTCATAGGCCATGTAGAGCTAATTTTGTGGTGCAAAGTTGGAGCAATGGTGGTGGTTTGGAGGA	.((((((...(((((...(..((((((((((...))))))))))..)....)))))....)))))))	26534871	26534897	GCTAATTTTGTGGTGCAAAGTTGGAGC	.((((((((((...))))))))))..)	Bdi-miR7729a	26534874	26534899	AATTTTGTGGTGCAAAGTTGGAGC	Bdi-miR7729a*	26534871	26534891	GCTAATTTTGTGGTGCAAAGT		3
Bdi-MIR7729b	PmiREN001277	MIR7729	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	29643755	29643821	-	GTTTTCATAGGCCATGTAGAGCTAATTTTGTGGTGCAAAGTTGGAGCAATGGTGGTGGTTTGGAGGA	.((((((...(((((...(..((((((((((...))))))))))..)....)))))....)))))))	29643775	29643801	GCTAATTTTGTGGTGCAAAGTTGGAGC	.((((((((((...))))))))))..)	Bdi-miR7729b	29643775	29643800	AATTTTGTGGTGCAAAGTTGGAGC	Bdi-miR7729b*	29643781	29643801	GCTAATTTTGTGGTGCAAAGT		3
Bdi-MIR7730	PmiREN001278	MIR7730	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	49801031	49801313	-	AAGCAGAAGAGGCTTTTCGGTCCGGGAATTGATTACGGTCTAATACGATTGGTAGATCTGGAATTTTTTTAAAACCTAGAACGACCTATAGAAGGGGGCGGGAGTCGGAAGTGATGAGTCCACCACTACTATTTTACTAGCTTGTATGTTTTCTTTCTCCACTGATCCATTATACTCCCTACTTCCCATTTTATAGGTCGATCTAGGTTATATTTTTTACCCCGATTCACCTGTCTTATTAGTCTGTAATCAATTCCCTGATCAAAAAACCTCTCCGTCTTTC	(((..(.(((((.((((.((((.(((((((((((((((.((((((.(((.(((.((((.((........((.((((((((.(((((((((((((((((.((((((.(((((((..(((......(((((..............))).)).....)))..))))..))).....))))))...))))).)))))))))))).)))))))).))........)).)))).))).))).)))))).))))))))))))))).)))).)))).))))).)..)))))	49801051	49801293	TCCGGGAATTGATTACGGTCTAATACGATTGGTAGATCTGGAATTTTTTTAAAACCTAGAACGACCTATAGAAGGGGGCGGGAGTCGGAAGTGATGAGTCCACCACTACTATTTTACTAGCTTGTATGTTTTCTTTCTCCACTGATCCATTATACTCCCTACTTCCCATTTTATAGGTCGATCTAGGTTATATTTTTTACCCCGATTCACCTGTCTTATTAGTCTGTAATCAATTCCCTGATC	((.(((((((((((((((.((((((.(((.(((.((((.((........((.((((((((.(((((((((((((((((.((((((.(((((((..(((......(((((..............))).)).....)))..))))..))).....))))))...))))).)))))))))))).)))))))).))........)).)))).))).))).)))))).))))))))))))))).))))	Bdi-miR7730	49801273	49801295	TCCGGGAATTGATTACGGTCT	Bdi-miR7730*	49801051	49801071	TCTGTAATCAATTCCCTGATC		2
Bdi-MIR7732	PmiREN001279	MIR7732	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	6993937	6994060	+	TCCTGCGGGAACATGTCGGGTTCCTCCAAGATCTCGGAGACTCGGATTCGGGCGGCGGAATTTCCGGCTAGCCAGTCTCCAGAGATCGAGATCGTGGAGGAACCTGATAACTTCTACGCGTCGA	........(((..(((((((((((((((.((((((((...((((((..(.((((.((((...)))).)..))).)..))).))).)))))))).)))))))))))))))..)))..........	6993957	6994040	TTCCTCCAAGATCTCGGAGACTCGGATTCGGGCGGCGGAATTTCCGGCTAGCCAGTCTCCAGAGATCGAGATCGTGGAGGAACC	((((((((.((((((((...((((((..(.((((.((((...)))).)..))).)..))).))).)))))))).))))))))..	Bdi-miR7732	6993957	6993978	TTCCTCCAAGATCTCGGAGACT	Bdi-miR7732*	6994020	6994040	GATCGAGATCGTGGAGGAACC		3
Bdi-MIR7736	PmiREN001280	MIR7736	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	22263180	22263295	-	TATCTGGGATGTCACAAAAATCAACATCCAATGATAATGGACAAGTCATCCTTACTACCAAGGATGTGACAAGTCCATTATCGTTGGATGTTGATTCTCGTGACATATCTGATGGT	((((.((.(((((((...((((((((((((((((((((((((..(((((((((......)))))..))))..))))))))))))))))))))))))...))))))).)).))))))	22263200	22263275	TCAACATCCAATGATAATGGACAAGTCATCCTTACTACCAAGGATGTGACAAGTCCATTATCGTTGGATGTTGATT	((((((((((((((((((((((..(((((((((......)))))..))))..))))))))))))))))))))))))	Bdi-miR7736	22263255	22263277	TCAACATCCAATGATAATGGA	Bdi-miR7736*	22263200	22263220	CATTATCGTTGGATGTTGATT		3
Bdi-MIR7738a	PmiREN001281	MIR7738	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	47168047	47168147	-	GTCGAAGCCTTTGCCCATCCAGAGTCGTTTGTCAAGCTCGGACTGGTCTTTTTTGGCGCCGTGCTTGACAGACGACTCTGGCTGGGTTAAGGTTTTTTTTT	...((((((((.(((((.(((((((((((((((((((.(((.(..(((......))))))).))))))))))))))))))).))))).)))))))).....	47168067	47168127	AGAGTCGTTTGTCAAGCTCGGACTGGTCTTTTTTGGCGCCGTGCTTGACAGACGACTCTGG	(((((((((((((((((.(((.(..(((......))))))).)))))))))))))))))..	Bdi-miR7738a	47168067	47168087	GTGCTTGACAGACGACTCTGG	Bdi-miR7738a*	47168107	47168127	AGAGTCGTTTGTCAAGCTCGG		3
Bdi-MIR7738b	PmiREN001282	MIR7738	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	36883770	36883870	+	GTTGAATCCTTTCCCCATCCAGAGACGTTTGTCAAGCTCGGGCCAGTCTTGTTTGGCGTCGTGCTTGATTAACGACTCTGGCCGGGTTAAGGTTTTTCTGC	.......((((..(((..((((((.((((.(((((((.((((((((......))))).))).))))))).)))).))))))..)))..)))).........	36883790	36883850	AGAGACGTTTGTCAAGCTCGGGCCAGTCTTGTTTGGCGTCGTGCTTGATTAACGACTCTGG	((((.((((.(((((((.((((((((......))))).))).))))))).)))).))))..	Bdi-miR7738b	36883790	36883810	AGAGACGTTTGTCAAGCTCGG	Bdi-miR7738b*	36883830	36883850	GTGCTTGATTAACGACTCTGG		3
Bdi-MIR7738c	PmiREN001283	MIR7738	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	27296199	27296464	-	CCAGAGTCTTTGTCAAGCTCGGGCCGAACTTTTTTTAGCACTGTGTTTGACAGACTACTCTGGTCGGTTAACGCTTTTTTTTTTGAGAGGCGAACCACCGAGGGGGAACATGGCGGGAGGTGGCCAGCGGAGGTACAGGGCGCCTTCGAAGCCTTGCCCCGGCCATAGTCGTCGTTTGTTAAGTTCGGGCCGGACTTTTTTGACAGCGTGCTTGACAGACGACTCTGGGGGCGGCGGCCAGATAGCACCG	((((((((((((((((((((((.((((((((.....(((.((((.....))))....(((.(((.((((..((((((((.....))))))))))))))))))((.((..(((((.((.((((((...(((((((.......)))))))..)))..))))).)))))..)).)))))....)))))))).))))................)))))))))).)))))))).(((....)))...........	27296219	27296444	AGAGTCTTTGTCAAGCTCGGGCCGAACTTTTTTTAGCACTGTGTTTGACAGACTACTCTGGTCGGTTAACGCTTTTTTTTTTGAGAGGCGAACCACCGAGGGGGAACATGGCGGGAGGTGGCCAGCGGAGGTACAGGGCGCCTTCGAAGCCTTGCCCCGGCCATAGTCGTCGTTTGTTAAGTTCGGGCCGGACTTTTTTGACAGCGTGCTTGACAGACGACTCTGG	((((((((((((((((((((.((((((((.....(((.((((.....))))....(((.(((.((((..((((((((.....))))))))))))))))))((.((..(((((.((.((((((...(((((((.......)))))))..)))..))))).)))))..)).)))))....)))))))).))))................)))))))))).))))))..	Bdi-miR7738c	27296219	27296239	GTGCTTGACAGACGACTCTGG	Bdi-miR7738c*	27296424	27296444	AGAGTCTTTGTCAAGCTCGGG		3
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Bdi-MIR7744	PmiREN001286	MIR7744	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	65327176	65327465	-	ATCGTGCGCCTAAGGATGGCAAGATTTATCGATGGGTGTGGTGTTTACCTTGACTCCTCCAGAAAACGTCAAGGCGAGAAGAAACCATCTAGTTGGCACAAGTCAAGTCACGCGCTCGTGTGGTCAAACACCGAGTCATTCTAGGTCCTAACCAAACCAGCCGGTGTTTGACCACACAGGCGTCACTTTGACTCGTGCCAACTAGATGGTTTCTTTCCGCCTTGTCATTTCTGCATAAGATGGCCATCTTCACGCCCATCGACAACTTTTGCCATCCTTAGGAGCGCGAC	.((((((.((((((((((((((((.((.(((((((((((((.(....((....((....((((((..(.(((((((.((((((((((((((((((((((.((((((((.((((.((.((((((((((((((((.((.......(((....)))......)))))))))))))))))))))))).)).)))))).)))))))))))))))))))))).))))))).).))))))....))..))....).))))))))))))).)).)))))))))))))))).)))))).	65327188	65327455	AGGATGGCAAGATTTATCGATGGGTGTGGTGTTTACCTTGACTCCTCCAGAAAACGTCAAGGCGAGAAGAAACCATCTAGTTGGCACAAGTCAAGTCACGCGCTCGTGTGGTCAAACACCGAGTCATTCTAGGTCCTAACCAAACCAGCCGGTGTTTGACCACACAGGCGTCACTTTGACTCGTGCCAACTAGATGGTTTCTTTCCGCCTTGTCATTTCTGCATAAGATGGCCATCTTCACGCCCATCGACAACTTTTGCCATCCTTA	((((((((((((.((.(((((((((((((.(....((....((....((((((..(.(((((((.((((((((((((((((((((((.((((((((.((((.((.((((((((((((((((.((.......(((....)))......)))))))))))))))))))))))).)).)))))).)))))))))))))))))))))).))))))).).))))))....))..))....).))))))))))))).)).))))))))))))))	Bdi-miR7744	65327432	65327457	AGGATGGCAAGATTTATCGATGGG	Bdi-miR7744*	65327188	65327208	CGACAACTTTTGCCATCCTTA		3
Bdi-MIR7753	PmiREN001287	MIR7753	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	22224604	22224790	+	ATTTTCGTACCAAAATGCCCATGTCTTCTTCCTTGCTCATCTTCTTCCTCTGTGCCTGCAAAGTCTTCCACTGCTGCTAGCCCCTGCAAGCTCATCCTTCTCGCCTCTCATGCTGGCCATCTTCCTCTGTCACTGGATGGATCAAGGAGATGAGCAAGGGAGAAGACATGGGTATTTTGGTCAGAAA	..((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((.((.((((..(.((..((....))..)).)..)))).)).))........(((.........)))(((((............)))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))	22224624	22224774	ATGTCTTCTTCCTTGCTCATCTTCTTCCTCTGTGCCTGCAAAGTCTTCCACTGCTGCTAGCCCCTGCAAGCTCATCCTTCTCGCCTCTCATGCTGGCCATCTTCCTCTGTCACTGGATGGATCAAGGAGATGAGCAAGGGAGAAGACATGG	((((((((((((((((((((((((((..((((.((.((((..(.((..((....))..)).)..)))).)).))........(((.........)))(((((............)))))))..))))))))))))))))))))))))))))	Bdi-miR7753	22224754	22224776	TGAGCAAGGGAGAAGACATGG	Bdi-miR7753*	22224624	22224644	ATGTCTTCTTCCTTGCTCATC		2
Bdi-MIR7754	PmiREN001288	MIR7754	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	22815528	22815647	-	ATAAAAATATATACTCCATGTTCTCTCGGCTAAGGAACTGCTAATGGGATCGATCGAGACTGGGTCAAGGTTCATTAGCAGTTCCTCAGTTGAGAGAACATGAAGTACATATTCTTGTAT	((((.(((((.((((.(((((((((((((((.((((((((((((((((...((((.......))))....)))))))))))))))).))))))))))))))).)))).))))).))))..	22815548	22815627	TTCTCTCGGCTAAGGAACTGCTAATGGGATCGATCGAGACTGGGTCAAGGTTCATTAGCAGTTCCTCAGTTGAGAGAACA	(((((((((((.((((((((((((((((...((((.......))))....)))))))))))))))).)))))))))))..	Bdi-miR7754	22815607	22815627	TTCTCTCGGCTAAGGAACTGC	Bdi-miR7754*	22815548	22815568	AGTTCCTCAGTTGAGAGAACA		3
Bdi-MIR7755	PmiREN001289	MIR7755	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	22514047	22514265	-	AAATGATATAAGAACTAACAATTCCACACTGTAAATTGAATAGAATGTTTACTAGATTCGCCTTTTCATCTGTGCTAGCAACAGTTCCAGAACTAGAACCCTCTCAACAAAGGTTCTAGCTCAGGACAGTTTCTAGCCCAGATGAAAAGGTATATCATGTACGTAGCAAACATTATGTTCAATTTACGGTGTAGAATTGTTTGTTGTTATTTCAGTGTT	...(((.((((.(((.((((((((.(((((((((((((((((.(((((((.((((((..(((((((((((((.(((((.(((.((.((.((.((((((((...........)))))))).)).)))).))).))))).)))))))))))))..))).......))).))))))).))))))))))))))))).)))))))).))).)))).))).....	22514067	22514245	ATTCCACACTGTAAATTGAATAGAATGTTTACTAGATTCGCCTTTTCATCTGTGCTAGCAACAGTTCCAGAACTAGAACCCTCTCAACAAAGGTTCTAGCTCAGGACAGTTTCTAGCCCAGATGAAAAGGTATATCATGTACGTAGCAAACATTATGTTCAATTTACGGTGTAGAATTG	((((.(((((((((((((((((.(((((((.((((((..(((((((((((((.(((((.(((.((.((.((.((((((((...........)))))))).)).)))).))).))))).)))))))))))))..))).......))).))))))).))))))))))))))))).))))..	Bdi-miR7755	22514067	22514087	TCAATTTACGGTGTAGAATTG	Bdi-miR7755*	22514225	22514245	ATTCCACACTGTAAATTGAAT		3
Bdi-MIR7763	PmiREN001290	MIR7763	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	4510596	4510714	+	ATTGCTGCAACTTGGGCTGCAATCTTGATGTGCGGGGATAGATATTCCATCTTGAGAGGATTTTAACTGAGAATATCTATTCCCGTACGTCAAGATTGCAATCCTGATTGCATCCCTAT	.....(((((...(((.((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((...)))))).)).)))))))))))))))))))))))))))))).)))...))))).......	4510616	4510694	AATCTTGATGTGCGGGGATAGATATTCCATCTTGAGAGGATTTTAACTGAGAATATCTATTCCCGTACGTCAAGATTGC	(((((((((((((((((((((((((((((..((((((...)))))).)).)))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miR7763	4510674	4510694	ATTCCCGTACGTCAAGATTGC	Bdi-miR7763*	4510616	4510636	AATCTTGATGTGCGGGGATAG		3
Bdi-MIR7764	PmiREN001291	MIR7764	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	5134026	5134136	+	ATTTGCGGCCCATAACCTAGATCTGTATCAAAAGGCCCAAAGAAAATCTCCACATATATCTAATATCCTCGCCTTTTGAAATAGATCTTGGCGTTATGGGTTGCAAACCTG	.(((((((((((((((((((((((((.(((((((((..................................))))))))).))))))).))).)))))))))))))))....	5134036	5134125	CATAACCTAGATCTGTATCAAAAGGCCCAAAGAAAATCTCCACATATATCTAATATCCTCGCCTTTTGAAATAGATCTTGGCGTTATGGG	((((((((((((((((.(((((((((..................................))))))))).))))))).))).))))))))	Bdi-miR7764	5134104	5134127	AAATAGATCTTGGCGTTATGGG	Bdi-miR7764*	5134036	5134056	CATAACCTAGATCTGTATCAA		2
Bdi-MIR7768a	PmiREN001292	MIR7768	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	1455734	1455856	-	TCCATGGCCTCCGCTGCGCTCCCGGTCGAGGACGGCCCCGCCGCAGCGCTCCCCTTCGCGCTGGAACTACGCAGGCGGCGGCGGCGCCGTCCTCGACCGGGAGCGCCGCGGACATCCTTCCTT	.........(((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((((........))))).......((....))))))))).))))))))))))))))))))).)))))...........	1455754	1455836	CCCGGTCGAGGACGGCCCCGCCGCAGCGCTCCCCTTCGCGCTGGAACTACGCAGGCGGCGGCGGCGCCGTCCTCGACCGGGAG	((((((((((((((((.((((((((((((........))))).......((....))))))))).))))))))))))))))..	Bdi-miR7768a	1455816	1455836	CCCGGTCGAGGACGGCCCCGC	Bdi-miR7768a*	1455754	1455774	GGCGCCGTCCTCGACCGGGAG		3
Bdi-MIR7768b	PmiREN001293	MIR7768	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	21416118	21416249	-	TCCATGGCCTCCGCGGCGCTCCCGGTCGAGGACGGCCCCGCCGCAGCGCTCCCCTTCGCGCTAGAACTACGCACGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCGTCCTCGACCGGGAGCGCCGCGGACGTCCTTCCTT	.........(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((........))))).......(((.(((....))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))...........	21416138	21416229	CCCGGTCGAGGACGGCCCCGCCGCAGCGCTCCCCTTCGCGCTAGAACTACGCACGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCGTCCTCGACCGGGAG	((((((((((((((((.((((((((((((........))))).......(((.(((....))))))))))))).))))))))))))))))..	Bdi-miR7768b	21416209	21416229	CCCGGTCGAGGACGGCCCCGC	Bdi-miR7768b*	21416138	21416158	GGCGCCGTCCTCGACCGGGAG		3
Bdi-MIR7770	PmiREN001294	MIR7770	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	8001237	8001360	+	ACAGAGAACCTCTCCTTGAAAGCCTGTCTAGACAAGCTAGATAGTAGTCCAGAGGTTCTCGGTGCACAGCTCAACACTAACTATCTAGCTTGTCTAGACGGGCCTTCAAAGAGAGGTTCTCAGT	...(((((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((...(((...............)))...))).)))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))...	8001253	8001346	TGAAAGCCTGTCTAGACAAGCTAGATAGTAGTCCAGAGGTTCTCGGTGCACAGCTCAACACTAACTATCTAGCTTGTCTAGACGGGCCTTCAAA	((((.(((((((((((((((((((((((((((...(((...............)))...))).)))))))))))))))))))))))).))))).	Bdi-miR7770	8001253	8001275	TGAAAGCCTGTCTAGACAAGC	Bdi-miR7770*	8001326	8001346	TTGTCTAGACGGGCCTTCAAA		3
Bdi-MIR7773	PmiREN001295	MIR7773	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	65091888	65091992	-	ACAAGAACATGGACGGCATACGGGTCAACGAAGGAAAAATTCAGGCTCTTGAGTTGGCCTGAATTTTTCCTTCGGCTGACACGTACGCCATCCAAATCTTCATGG	..((((...((((.(((.((((.((((.(((((((((((((((((((........)))))))))))))))))))..)))).)))).))).))))..)))).....	65091908	65091972	CGGGTCAACGAAGGAAAAATTCAGGCTCTTGAGTTGGCCTGAATTTTTCCTTCGGCTGACACGTA	((.((((.(((((((((((((((((((........)))))))))))))))))))..)))).))..	Bdi-miR7773	65091908	65091929	TTTTTCCTTCGGCTGACACGTA	Bdi-miR7773*	65091952	65091972	CGGGTCAACGAAGGAAAAATT		3
Bdi-MIR7776	PmiREN001296	MIR7776	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	53868541	53868664	-	CTTGCCCTCTGATATCTTGGACATTCAACTCATTATTAATGAGGACAACAACAATGAAGTTAGAGTCGAAGTTATTGTCCTCGTTGATAATGGGTTGAATGCGCAAAGATATCAGAGGGCAACG	.((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((.(((..(((........)))..))).)))))))))))))))))))))))))))..).)))))))))))))))))..	53868561	53868644	ACATTCAACTCATTATTAATGAGGACAACAACAATGAAGTTAGAGTCGAAGTTATTGTCCTCGTTGATAATGGGTTGAATGCGC	.(((((((((((((((((((((((((((.(((..(((........)))..))).)))))))))))))))))))))))))))...	Bdi-miR7776	53868561	53868581	TTGATAATGGGTTGAATGCGC	Bdi-miR7776*	53868624	53868644	ACATTCAACTCATTATTAATG		3
Bdi-MIR7777	PmiREN001297	MIR7777	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	65774485	65774595	-	GGGTAGAACTACCTCTGACAAACACCATCGCAACTGCAGTATATCATGTTATTATTGTACCCATGATGTCCTGTTGTTGAGATGGTGTCTGTTGAAGGTTGTTCCACCCAA	((((.((((.((((.(((((.((((((((.((((.((((.((((((((.(((....)))..)))))))).)))).)))).)))))))).))))).)))).)))).))))))	65774505	65774575	AACACCATCGCAACTGCAGTATATCATGTTATTATTGTACCCATGATGTCCTGTTGTTGAGATGGTGTCTG	.((((((((.((((.((((.((((((((.(((....)))..)))))))).)))).)))).)))))))).))	Bdi-miR7777	65774505	65774530	GTCCTGTTGTTGAGATGGTGTCTG	Bdi-miR7777*	65774555	65774575	AACACCATCGCAACTGCAGTA		3
Bdi-MIR7782	PmiREN001298	MIR7782	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	30189522	30189660	+	CAATTCATCAAGTATATTACGCGGCATGGTATTAGAGCAAGTTGCCAAATCTGGCTGCCATGACAATTGGTGATGGTGATGGTATTGTTTTGGTGACCTGCTCTGATACCATGTTGTGAAATATTTTTAATGCATTGTG	((((.(((.(((.(((((.((((((((((((((((((((.(((((((((....((((((((.((.....)).)))))...))).....))))))))).)))))))))))))))))))).))))).))).))).))))..	30189542	30189640	GCGGCATGGTATTAGAGCAAGTTGCCAAATCTGGCTGCCATGACAATTGGTGATGGTGATGGTATTGTTTTGGTGACCTGCTCTGATACCATGTTGTGA	(((((((((((((((((((.(((((((((....((((((((.((.....)).)))))...))).....))))))))).)))))))))))))))))))..	Bdi-miR7782	30189617	30189640	ACCTGCTCTGATACCATGTTGTGA	Bdi-miR7782*	30189542	30189562	GCGGCATGGTATTAGAGCAAG		3
Bdi-MIR7783	PmiREN001299	MIR7783	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	14469721	14469921	-	CCCATCGTGAACTGCTGGTCGCGTCTACTTGGTATCCAAGCTTATGATATCTGTTATGCCTGATTCCGTTGGGTTATGTTCTTTGGTGGAGTTAAATGTCAGCAATGGCCAAATGCTTCCCTCCACTAGAAGGCGGTCATGTACAACAGAGATCATAAGCTCTGATACCATGTGGATGAGATTGACAATTCGTGATGAGTA	..(((((((((.((.(((((.(((((((.(((((((..((((((((((.((((((.(((.(((..(((((........((((.(((.(((((.....((((....)))).....)))))...)))..)))))))))))).))).)))))).))))))))))..))))))).))))))).))))).)).)))))))))....	14469741	14469901	GCGTCTACTTGGTATCCAAGCTTATGATATCTGTTATGCCTGATTCCGTTGGGTTATGTTCTTTGGTGGAGTTAAATGTCAGCAATGGCCAAATGCTTCCCTCCACTAGAAGGCGGTCATGTACAACAGAGATCATAAGCTCTGATACCATGTGGATGAGA	.(((((((.(((((((..((((((((((.((((((.(((.(((..(((((........((((.(((.(((((.....((((....)))).....)))))...)))..)))))))))))).))).)))))).))))))))))..))))))).)))))))...	Bdi-miR7783	14469741	14469764	AGCTCTGATACCATGTGGATGAGA	Bdi-miR7783*	14469881	14469901	GCGTCTACTTGGTATCCAAGC		3
Bdi-MIR7786	PmiREN001300	MIR7786	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	42101560	42101666	-	CTAACCAATGTGTCTGTGTCTGTGTCTATGTCTATGTCTGTGCACGCGTGTGTTAAACTGCAGAATTGCACAAACTGTGGAGTAGTCGGCAGAGGAATCACTGCGAA	.........(((....(.((((((.((((.(((((((.((((((....(.(((......))).)..)))))).)).))))))))).).))))).)...)))......	42101580	42101652	TGTGTCTATGTCTATGTCTGTGCACGCGTGTGTTAAACTGCAGAATTGCACAAACTGTGGAGTAGTCGGCAGA	((((.((((.(((((((.((((((....(.(((......))).)..)))))).)).))))))))).).)))))	Bdi-miR7786	42101580	42101605	ACAAACTGTGGAGTAGTCGGCAGA	Bdi-miR7786*	42101632	42101652	TGTGTCTATGTCTATGTCTGT		3
Bdi-MIR9480a	PmiREN001303	MIR9480	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	30898666	30898751	-	TTCCATTCCTTACAAGATAACATATACCACGTACATACTTAAGGGTATGTGAGGGTGGTAACTGAATGTGTGAGGGTGACACCCGT	......((((((((......((..((((((.((((((((....))))))))...))))))..))....))))))))..((....))	30898686	30898731	CATATACCACGTACATACTTAAGGGTATGTGAGGGTGGTAACTGAA	((..((((((.((((((((....))))))))...))))))..))..	Bdi-miR9480a	30898686	30898706	TATGTGAGGGTGGTAACTGAA	Bdi-miR9480a*	30898711	30898731	CATATACCACGTACATACTTA		3
Bdi-MIR9480b	PmiREN001304	MIR9480	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	22871062	22871190	-	TATGACAGTTTTGTTAAGGGTATGTGAGGGTGGTAACTGAATGTGTTTGGGTGCAATCCTCACACGACGGGTGTCACCCTCACACATTCGGGTACCACCCTAACATACCCTTAACAAGTTTCTGATCAA	..((((((.((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((..(((((..((((((....)).))))..)))))..)))))))))).))))))))).))))))))))))))))...))).))).	22871082	22871170	TATGTGAGGGTGGTAACTGAATGTGTTTGGGTGCAATCCTCACACGACGGGTGTCACCCTCACACATTCGGGTACCACCCTAACATACC	(((((.(((((((((.((((((((((..(((((..((((((....)).))))..)))))..)))))))))).))))))))).)))))..	Bdi-miR9480b	22871150	22871170	TATGTGAGGGTGGTAACTGAA	Bdi-miR9480b*	22871082	22871102	CGGGTACCACCCTAACATACC		3
Bdi-MIR9481a	PmiREN001305	MIR9481	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	4938490	4938636	-	AACGAATCTTCATGCAAATTCGGAGGTCAGGGATTCTACTGATTTAACTAAATTTCATCCGGCAAAGTGAAAAACTTGTACGTCGGATGTTTTTAGTGGGAAATCAGTCGGATTTCTCACCTTCGAATCTGCATCACGATTCGTGCA	.(((((((...(((((.((((((((((.((((((((.((((((((.((((((...((((((((.((((.....))))....))))))))..))))))...)))))))).)))))))).)))))))))).)))))...)))))))...	4938510	4938616	CGGAGGTCAGGGATTCTACTGATTTAACTAAATTTCATCCGGCAAAGTGAAAAACTTGTACGTCGGATGTTTTTAGTGGGAAATCAGTCGGATTTCTCACCTTCGAA	(((((((.((((((((.((((((((.((((((...((((((((.((((.....))))....))))))))..))))))...)))))))).)))))))).)))))))..	Bdi-miR9481a	4938510	4938533	TCAGTCGGATTTCTCACCTTCGAA	Bdi-miR9481a*	4938596	4938616	CGGAGGTCAGGGATTCTACTG		3
Bdi-MIR9481b	PmiREN001306	MIR9481	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	4937802	4937954	-	GAATCTTCATGCAGATACGGAGGTCAGGAATTCTACTGGTTTAACTAAATTTCATTCGACAAGACAAAGTAAAAAAACTCTTTCAATTATGTCGAATGTTTTTAGTGGAAAATCAGTCGGATTTCTCACCTTCAAATCTGCATCACGGTTTGG	(((((...((((((((..((((((.((((((((.((((((((.((((((...(((((((((.((.((((..........))))...)).)))))))))..))))))...)))))))).)))))))).))))))..))))))))...)))))..	4937822	4937934	AGGTCAGGAATTCTACTGGTTTAACTAAATTTCATTCGACAAGACAAAGTAAAAAAACTCTTTCAATTATGTCGAATGTTTTTAGTGGAAAATCAGTCGGATTTCTCACCTTC	((((.((((((((.((((((((.((((((...(((((((((.((.((((..........))))...)).)))))))))..))))))...)))))))).)))))))).))))..	Bdi-miR9481b	4937822	4937842	TCAGTCGGATTTCTCACCTTC	Bdi-miR9481b*	4937914	4937934	AGGTCAGGAATTCTACTGGTT		3
Bdi-MIR9482	PmiREN001307	MIR9482	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	18064296	18064440	-	CAACGGCACAGCTTTCTTGGATCCCTCTCTCCCTTGAAGGCTATTTTTTGGACAGGTTTTCATGTGCAGTTGTGCATCATTGTTTGCCTATGAACACAAGAGAGCCTTTGGGGAAGAAGGGAAACCAAGCAAGCCAGTGTCCATG	....(((((.((((.(((((.(((((.(((.(((((((((((.((((.((..(((((...((((((((....)))).)).))...)))..))..)).)))).))))))))))).))))))))..))))).))))..)))))....	18064316	18064420	ATCCCTCTCTCCCTTGAAGGCTATTTTTTGGACAGGTTTTCATGTGCAGTTGTGCATCATTGTTTGCCTATGAACACAAGAGAGCCTTTGGGGAAGAAGGGAAAC	.(((((.(((.(((((((((((.((((.((..(((((...((((((((....)))).)).))...)))..))..)).)))).))))))))))).))))))))...	Bdi-miR9482	18064316	18064336	CCTTTGGGGAAGAAGGGAAAC	Bdi-miR9482*	18064400	18064420	ATCCCTCTCTCCCTTGAAGGC		3
Bdi-MIR9483a	PmiREN001310	MIR9483	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	2815831	2816004	-	AATCTCGTAGGTGCTTCACAGGAAACAGTTCAATGTTTGCTGGAATGGAAAATATCGTTCATGTCTAAATGAGGCCTACAAAGCAAGCTAAGCTTTGGCTACGTTTGGAAGAGAATATATCTTTTCAATTCAAGTAAAAGTTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCCTGCAGATTTC	(((((.(((((.((((((.(((((((((((((((.((((((.(((((((((((((.((((...((((((((.((((...(((((.......))))))))).))))))))...)))))))).))))).)))).)))))).))))))))))))))).)))))).))))))))))..	2815842	2815994	TGCTTCACAGGAAACAGTTCAATGTTTGCTGGAATGGAAAATATCGTTCATGTCTAAATGAGGCCTACAAAGCAAGCTAAGCTTTGGCTACGTTTGGAAGAGAATATATCTTTTCAATTCAAGTAAAAGTTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCC	.((((((.(((((((((((((((.((((((.(((((((((((((.((((...((((((((.((((...(((((.......))))))))).))))))))...)))))))).))))).)))).)))))).))))))))))))))).)))))).))	Bdi-miR9483a	2815842	2815867	TTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCC	Bdi-miR9483a*	2815974	2815994	TGCTTCACAGGAAACAGTTCA		3
Bdi-MIR9483b	PmiREN001309	MIR9483	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	2815468	2815660	-	GGACACAAGAATCTTGTAGGTGCTTCACAGGTGGCAGTTCAATGTGTGCTTGAATGGAAAATATCGTTCAAGTCTAAACGAGGCCTACAAACCAAGCTAAGCTTCAGCCACGTTTGAAAGAGAACATATCTTTTCAATTCAAGTAGAAGTTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCCTGCAATTTTCATGTGTGTGG	....(((.(((..(((((((.((((((.(((.(((((((((((.(.((((((((((((((((((.((((...((.(((((.(((.........((((...))))..))).)))))))....)))))))).))))).))))))))).).))))))))))).))).)))))).)))))))..))).)))......	2815488	2815640	TGCTTCACAGGTGGCAGTTCAATGTGTGCTTGAATGGAAAATATCGTTCAAGTCTAAACGAGGCCTACAAACCAAGCTAAGCTTCAGCCACGTTTGAAAGAGAACATATCTTTTCAATTCAAGTAGAAGTTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCC	.((((((.(((.(((((((((((.(.((((((((((((((((((.((((...((.(((((.(((.........((((...))))..))).)))))))....)))))))).))))).))))))))).).))))))))))).))).))))))...	Bdi-miR9483b	2815488	2815511	TTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCC	Bdi-miR9483b*	2815620	2815640	TGCTTCACAGGTGGCAGTTCA		3
Bdi-MIR9483c	PmiREN001308	MIR9483	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	2816177	2816369	-	GGACACAAGAATCTCGTAGGTGCTTCACAGGAAGCAGTTCAATGTCTGCTGGAATGGAAAATATCGTTCAAGTCTAAACGAGGCCTACAAAGCAAGCTAAGCTTTGGCCACGTTTGGAAAGGAATATATCTTTCCAATTCAAGTAGAAGTTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCCTGCAGATTTCATGTGTGGTG	(.(((...((((((.(((((.((((((.(((((((((((((((.((((((.(((((((((((((.((((...((((((((.((((...(((((.......))))))))).))))))))...)))))))).))))).)))).)))))).))))))))))))))).)))))).)))))))))))..))).)....	2816197	2816349	TGCTTCACAGGAAGCAGTTCAATGTCTGCTGGAATGGAAAATATCGTTCAAGTCTAAACGAGGCCTACAAAGCAAGCTAAGCTTTGGCCACGTTTGGAAAGGAATATATCTTTCCAATTCAAGTAGAAGTTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCC	.((((((.(((((((((((((((.((((((.(((((((((((((.((((...((((((((.((((...(((((.......))))))))).))))))))...)))))))).))))).)))).)))))).))))))))))))))).))))))...	Bdi-miR9483c	2816197	2816220	TTGAACTGTTTCCTCTGAAGTTCC	Bdi-miR9483c*	2816329	2816349	TGCTTCACAGGAAGCAGTTCA		3
Bdi-MIR9484	PmiREN001311	MIR9484	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	42791641	42791805	-	TGGTGGTGGGCAGTGAATCCTAGTGCAGGGAGAAGTCGGTCTTGACAAGCATACCCACACTAAGTGATGGGGGTCGGAGAGACCCCAATGTGGGCAGACCCTGTCCTCAGCACGCTCATCAAGACTGGCTTCTACCTGGACTAGGACTCCCCTCCGAACCTTAGA	.................(((((((.((((.(((((((((((((((..(((.....(((.....)))...((((((.....))))))..((.((((((...)))))).))....)))..))))))))))))))).)))).)))))))...................	42791661	42791785	TAGTGCAGGGAGAAGTCGGTCTTGACAAGCATACCCACACTAAGTGATGGGGGTCGGAGAGACCCCAATGTGGGCAGACCCTGTCCTCAGCACGCTCATCAAGACTGGCTTCTACCTGGACTAGG	((((.((((.(((((((((((((((..(((.....(((.....)))...((((((.....))))))..((.((((((...)))))).))....)))..))))))))))))))).)))).))))..	Bdi-miR9484	42791765	42791785	TAGTGCAGGGAGAAGTCGGTC	Bdi-miR9484*	42791661	42791681	CTGGCTTCTACCTGGACTAGG		3
Bdi-MIR9485	PmiREN001312	MIR9485	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	9212130	9212320	+	AGTAGACATCAGGATCACACTTATGACGTGTAGGAGTTGCAACAATTTCAACGACCTTTTCAAACTTGAACTGCTGGTGACCAGGAATTATGTTGTGTGTCTTCAAGTGGTTCCTATTTTGGAAGTTTGAGAAGGTCGGTGAAACTGTTGCAACTCCTACACCTTATAAGTATGATCCAGATGTCTCGCTA	...(((((((.((((((.((((((((.(((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((.(((((.((......)).)).))).)).)))))))).........)))))))))))))))).))))).))))))))))))))))).)))))))).)))))).))))))).....	9212150	9212300	TTATGACGTGTAGGAGTTGCAACAATTTCAACGACCTTTTCAAACTTGAACTGCTGGTGACCAGGAATTATGTTGTGTGTCTTCAAGTGGTTCCTATTTTGGAAGTTTGAGAAGGTCGGTGAAACTGTTGCAACTCCTACACCTTATAAGT	((((((.(((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((.(((((.((......)).)).))).)).)))))))).........)))))))))))))))).))))).))))))))))))))))).))))))..	Bdi-miR9485	9212150	9212170	TTATGACGTGTAGGAGTTGCA	Bdi-miR9485*	9212280	9212300	CAACTCCTACACCTTATAAGT		3
Bdi-MIR9486a	PmiREN001314	MIR9486	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	7510346	7510458	-	TCAAAGGGGAAACCTCTAATCACTTCAAGGCATTTTATGAAGAAAAAACCCTGGATCCAGGGTTTTTTCTTTCATAAAATGCTTTCAAGGGATTAGAGGTTCCACCTTTCATA	..(((((((((.(((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))).))))))))))))))).))).))))))))))))).)))))....	7510356	7510447	AACCTCTAATCACTTCAAGGCATTTTATGAAGAAAAAACCCTGGATCCAGGGTTTTTTCTTTCATAAAATGCTTTCAAGGGATTAGAGGTTC	(.(((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))).))))))))))))))).))).))))))))))))	Bdi-miR9486a	7510356	7510381	ATGCTTTCAAGGGATTAGAGGTTC	Bdi-miR9486a*	7510427	7510447	AACCTCTAATCACTTCAAGGC		3
Bdi-MIR9486b	PmiREN001313	MIR9486	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	10729493	10729637	-	TAAAAGGATGAGATAAAAAGTGGAACCTCTGGCCACTTAAATGTATCTTAGGAAATAAAAACCTAAAGAATCCTACCTCAGGCGGGTTTTTCGTAAAATACTTTTAAGTGATTAGAGGTTCCAGTTTTCATCTAAGACTTTTATT	((((((..(.((((.((((.((((((((((((.((((((((.((((.(((.((((....(((((...((........))....))))))))).))).)))).)))))))).)))))))))))).)))).)))).)..))))))..	10729513	10729617	TGGAACCTCTGGCCACTTAAATGTATCTTAGGAAATAAAAACCTAAAGAATCCTACCTCAGGCGGGTTTTTCGTAAAATACTTTTAAGTGATTAGAGGTTCCAGT	((((((((((((.((((((((.((((.(((.((((....(((((...((........))....))))))))).))).)))).)))))))).))))))))))))..	Bdi-miR9486b	10729513	10729533	TAAGTGATTAGAGGTTCCAGT	Bdi-miR9486b*	10729597	10729617	TGGAACCTCTGGCCACTTAAA		3
Bdi-MIR9487	PmiREN001315	MIR9487	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	25447850	25448052	+	AGTACGAACTTCCTTCTGCCATTTTGCAATCGAACAAATCCTTAGTTACCTCATAACGTTCGGACCTTGTTGCTGATACAAAGCTTTGATAGCTTTGCTGTCTAGAATATTATCTTGGAGCTAAACACTTTGTTTCAGCAGTAAGCAAGGTTTGAACTAAGGCCTTGTTCGATTGCAAGATGACAGGTTAGTTCGGTAAGCCA	....((((((....((((.((((((((((((((((((..(((((((((.....))))(((((((((((((((((((.((((((....((((((...)))))).(((......)))((........)))))))).))))))....))))))))))))))))))..)))))))))))))))))).))))..))))))........	25447870	25448032	ATTTTGCAATCGAACAAATCCTTAGTTACCTCATAACGTTCGGACCTTGTTGCTGATACAAAGCTTTGATAGCTTTGCTGTCTAGAATATTATCTTGGAGCTAAACACTTTGTTTCAGCAGTAAGCAAGGTTTGAACTAAGGCCTTGTTCGATTGCAAGATGA	(((((((((((((((((..(((((((((.....))))(((((((((((((((((((.((((((....((((((...)))))).(((......)))((........)))))))).))))))....))))))))))))))))))..)))))))))))))))))..	Bdi-miR9487	25448012	25448032	CCTTGTTCGATTGCAAGATGA	Bdi-miR9487*	25447870	25447890	ATTTTGCAATCGAACAAATCC		3
Bdi-MIR9488	PmiREN001316	MIR9488	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	50199884	50200110	-	ATTACAAAAAACCACCACATTGAGGGCTAGGCTTTTATGTAACTACTGTTTGTGGTAATTGTTTTTCTAAAATCCTACCTGTTAATAGCACTGATTGCCCCGCAAAATATCACTACACGTCAGAATTGACATCAGTGCAACTTGAAACCGGATGTTTTTTGAAAAGAACTACCAAAACCAGTAGTTATGTAAAACCTATTCCTCAATGTTTGTTTTAATAATTTATG	.......(((((....((((((((((.((((.((((((((((((((((.((.(((((.((.(((((..(((((((......((((..(((((((((((...)))..............((((....))))))))))))...))))....))))..)))..))))).)).))))).)).)))))))))))))))))))).))))))))))..)))))...........	50199904	50200090	TGAGGGCTAGGCTTTTATGTAACTACTGTTTGTGGTAATTGTTTTTCTAAAATCCTACCTGTTAATAGCACTGATTGCCCCGCAAAATATCACTACACGTCAGAATTGACATCAGTGCAACTTGAAACCGGATGTTTTTTGAAAAGAACTACCAAAACCAGTAGTTATGTAAAACCTATTCCTCAAT	((((((.((((.((((((((((((((((.((.(((((.((.(((((..(((((((......((((..(((((((((((...)))..............((((....))))))))))))...))))....))))..)))..))))).)).))))).)).)))))))))))))))))))).))))))..	Bdi-miR9488	50200069	50200090	TGAGGGCTAGGCTTTTATGTAA	Bdi-miR9488*	50199904	50199924	ATGTAAAACCTATTCCTCAAT		3
Bdi-MIR9489	PmiREN001317	MIR9489	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	49284989	49285108	-	GTCTGGATTCTGGAACAGTTTCAGCTCCACGGACTTGGTGAAGCTGATTACTCATAGCTTCATATGAATGACTATCTCCACCAAATCTGTGGAGTTGGAGTGATCCCAAACACATCCTTG	((.(((......((.((.(((((((((((((((.((((((.((.((.(((.(((((......))))).))).)).)).)))))).))))))))))))))))).))))).)).........	49285009	49285088	TCAGCTCCACGGACTTGGTGAAGCTGATTACTCATAGCTTCATATGAATGACTATCTCCACCAAATCTGTGGAGTTGGAG	(((((((((((((.((((((.((.((.(((.(((((......))))).))).)).)).)))))).)))))))))))))..	Bdi-miR9489	49285068	49285088	TCAGCTCCACGGACTTGGTGA	Bdi-miR9489*	49285009	49285029	ACCAAATCTGTGGAGTTGGAG		3
Bdi-MIR9490	PmiREN001318	MIR9490	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	18752580	18752671	-	CTTAGTGCGAGGCCACACCCTAATGGTCGTGCGGGTGTCTTGTGAAAAGCCAAGGCCCACACGGCTAGAAGGGTGTGGCTTGGCGCTAAGCC	((((((((.((((((((((((..((((((((.((((..((((........)))))))).))))))))..)))))))))))).))))))))..	18752589	18752662	AGGCCACACCCTAATGGTCGTGCGGGTGTCTTGTGAAAAGCCAAGGCCCACACGGCTAGAAGGGTGTGGCTTGG	((((((((((((..((((((((.((((..((((........)))))))).))))))))..)))))))))))).)	Bdi-miR9490	18752639	18752664	AGGCCACACCCTAATGGTCGTGCG	Bdi-miR9490*	18752589	18752609	GGCTAGAAGGGTGTGGCTTGG		3
Bdi-MIR9491	PmiREN001319	MIR9491	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	14712900	14712997	+	TGCTTTGTATGGTATGTTACCTCTGATCAGTACTCCGTTGCTTATACAGTTAAAAGCAACGGAGTACCGATCAGAGGTAACATACAATAAAAAGCAAC	((((((.(((.(((((((((((((((((.((((((((((((((..........)))))))))))))).))))))))))))))))).))).))))))..	14712909	14712988	TGGTATGTTACCTCTGATCAGTACTCCGTTGCTTATACAGTTAAAAGCAACGGAGTACCGATCAGAGGTAACATACAATA	(.(((((((((((((((((.((((((((((((((..........)))))))))))))).))))))))))))))))).)))	Bdi-miR9491	14712909	14712931	TGGTATGTTACCTCTGATCAG	Bdi-miR9491*	14712968	14712988	GATCAGAGGTAACATACAATA		3
Bdi-MIR9492	PmiREN001320	MIR9492	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	25615243	25615333	-	GTTGTTCCTATCTACTCTGTCATGGTATCAGAGGCTTCACGCTCTCTGCGTTAGGGCTCTGATACCATGAAGGAGCGGAAAGAAATGTCTG	.......((.(((.((((.((((((((((((((.(((.((((.....)))).))).)))))))))))))).)))).))).)).........	25615251	25615325	TATCTACTCTGTCATGGTATCAGAGGCTTCACGCTCTCTGCGTTAGGGCTCTGATACCATGAAGGAGCGGAAAGA	(.(((.((((.((((((((((((((.(((.((((.....)))).))).)))))))))))))).)))).))).)).	Bdi-miR9492	25615305	25615327	TATCTACTCTGTCATGGTATC	Bdi-miR9492*	25615251	25615271	TACCATGAAGGAGCGGAAAGA		2
Bdi-MIR9494	PmiREN001321	MIR9494	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	2641905	2642076	+	ATCGAGGTCGGGGAAGAGGACGGAGGGAGAGGATGATGAAGCCGCAGCACGGGGCGCCCGCCGGCGGCGGCGGCGGCCACGGGCACGGGCGGAGGGCCCCGTTCCTGACCTCGTACGCGCTCACGCTCGCCTTCATCACCTTCGTCTCCGTCCTCTACTTCAAGGACTTCTC	...((((((((((.((((((((((((..((((.((((((((.((.(((...((((((((((((....)))))).((...((((.((((((.....).))))).)))).))......))))))..))))).))))))))))))..)))))))))))).))))...))))))..	2641925	2642056	CGGAGGGAGAGGATGATGAAGCCGCAGCACGGGGCGCCCGCCGGCGGCGGCGGCGGCCACGGGCACGGGCGGAGGGCCCCGTTCCTGACCTCGTACGCGCTCACGCTCGCCTTCATCACCTTCGTCTCCGTC	((((((..((((.((((((((.((.(((...((((((((((((....)))))).((...((((.((((((.....).))))).)))).))......))))))..))))).))))))))))))..))))))..	Bdi-miR9494	2642036	2642056	TTCATCACCTTCGTCTCCGTC	Bdi-miR9494*	2641925	2641945	CGGAGGGAGAGGATGATGAAG		3
Bdi-MIR9495	PmiREN001322	MIR9495	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	7692004	7692124	-	CAATCCAAAGTTTCTAGTTTTGAAAAATGCCTCTGGACGTGTCAATGTCTTGTAGGATCTGGACCCACGTATCATTCTCACATCCAGTGGCATTTTTCGAAATGCCAAACTTTGCAGTGGC	((...((((((((...(((((((((((((((.(((((.(((..((((...(((.((........)))))...))))..))).))))).)))))))))))))))...))))))))...))..	7692024	7692104	TGAAAAATGCCTCTGGACGTGTCAATGTCTTGTAGGATCTGGACCCACGTATCATTCTCACATCCAGTGGCATTTTTCGAA	(((((((((((.(((((.(((..((((...(((.((........)))))...))))..))).))))).)))))))))))..	Bdi-miR9495	7692084	7692104	TGAAAAATGCCTCTGGACGTG	Bdi-miR9495*	7692024	7692044	CATCCAGTGGCATTTTTCGAA		3
Bdi-MIR9496	PmiREN001323	MIR9496	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	1758903	1759003	-	TCCGAGCCGCCGCCTCTAGACTGGTTGGGCTTAGATGGGTCCTCAGCCGGCCCGGATGGACCCATCTAAACCAAGCCATTCGGAGCCGGTGCAGCTACGAC	.......(((((.((((.((.(((((.((.((((((((((((....(((...)))..)))))))))))).)).))))).)))))).)))))..........	1758923	1758983	CTGGTTGGGCTTAGATGGGTCCTCAGCCGGCCCGGATGGACCCATCTAAACCAAGCCATTC	.(((((.((.((((((((((((....(((...)))..)))))))))))).)).)))))...	Bdi-miR9496	1758962	1758983	CTGGTTGGGCTTAGATGGGTCC	Bdi-miR9496*	1758923	1758943	CCCATCTAAACCAAGCCATTC		3
Bdi-MIR9497	PmiREN001324	MIR9497	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	49096989	49097253	-	GTAGTTATTACTCCCTCCTTTTTCTGAATACATGGTGTATCATGTTTCTTAAGACATGGCTTGGACCAAGAATTACTTTATTTTATATGTGATGTAATATGATACGAAACCACAATTTTCAGTAAGTAGTTTTGAAGATGGATCTGGTGATGCAAATTTCATGTCATAAACCCACGTATTGACGAAGTAATTTTTGGTCAAAGCCTTGTCTTGACTAAATCTTATACACCCTGTATTGAGAAAAATAG	..................(((((((.((((((.(((((((...((((.((((((((.(((((.((((((((((((((((.((..(((((((..((..(((((((.((((.....((((((((.........))))))))(.(((....))).)...)))).))))))).)).))))))).)).)))))))))))))))).))))).))))))))..))))...))))))).)))))).)))))))...	49097009	49097233	TTTCTGAATACATGGTGTATCATGTTTCTTAAGACATGGCTTGGACCAAGAATTACTTTATTTTATATGTGATGTAATATGATACGAAACCACAATTTTCAGTAAGTAGTTTTGAAGATGGATCTGGTGATGCAAATTTCATGTCATAAACCCACGTATTGACGAAGTAATTTTTGGTCAAAGCCTTGTCTTGACTAAATCTTATACACCCTGTATTGAGAAAAA	(((((.((((((.(((((((...((((.((((((((.(((((.((((((((((((((((.((..(((((((..((..(((((((.((((.....((((((((.........))))))))(.(((....))).)...)))).))))))).)).))))))).)).)))))))))))))))).))))).))))))))..))))...))))))).)))))).)))))..	Bdi-miR9497	49097213	49097233	TTTCTGAATACATGGTGTATC	Bdi-miR9497*	49097009	49097029	TACACCCTGTATTGAGAAAAA		3
Bdi-MIR9498	PmiREN001325	MIR9498	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	38556554	38556611	+	TTGACCGTCAAGTGGTTGTTGAGAAGACGACTTTGCCCATAACCTTTTGTGGTCAATT	(((((((.((((.((((((.(.((((....))))..).)))))).)))))))))))..	38556556	38556609	GACCGTCAAGTGGTTGTTGAGAAGACGACTTTGCCCATAACCTTTTGTGGTCAA	(((((.((((.((((((.(.((((....))))..).)))))).)))))))))))	Bdi-miR9498	38556556	38556578	GACCGTCAAGTGGTTGTTGAG	Bdi-miR9498*	38556589	38556609	CCCATAACCTTTTGTGGTCAA		2
Bdi-MIR9499	PmiREN001326	MIR9499	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	17312532	17312640	-	GCCCGGCCCTGACGTCGTCTCCCTCGTCGACGCGGCAGCTCAGAAGGCGCGCGACGTGCCTGCGCGTGAGATGCCGTGTCGGCGGGGACGAGGACCGGGGGAGCGAGGA	.............(((.((((((.(((((((((((((.((((..(((((((...))))))).....)))).))))))))))))))))).)).)))..............	17312552	17312620	CCCTCGTCGACGCGGCAGCTCAGAAGGCGCGCGACGTGCCTGCGCGTGAGATGCCGTGTCGGCGGGGAC	(((.(((((((((((((.((((..(((((((...))))))).....)))).))))))))))))))))..	Bdi-miR9499	17312600	17312620	CCCTCGTCGACGCGGCAGCTC	Bdi-miR9499*	17312552	17312572	AGATGCCGTGTCGGCGGGGAC		3
Bdi-MIR9773a	PmiREN001327	MIR9773	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	35927591	35927848	-	ACTTTGAAAACACGAAATAGCTGATGAGCGAAGTTGTTGTTGAGAAATAGGAAAGTAGAATCAAACCCAGTCTTAGTCAAATATTTAATATATCTTCTTGTCCAAACAGAAAGAAAAGGAAAAAATTAAAGCTGAGCGGAAAATCCATACCTCTCTTATCGATTTAGAGCATATGGATCGATCTAGTTATAAGAATCAAATGTGTTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAAGGAATGAAAACAATTTTATCAT	..........(((((((((((..(.(((((((.......((((.........((.((((.((....((.(.((((((..(((.(((......((((.((((....)))).))))......))).)))...)))))))))...(((((((...((((.........))))..))))))).)))))).)).......)))).....))))))).)..))))))))))).....((((((....))))))... .-39.10	35927611	35927828	CACGAAATAGCTGATGAGCGAAGTTGTTGTTGAGAAATAGGAAAGTAGAATCAAACCCAGTCTTAGTCAAATATTTAATATATCTTCTTGTCCAAACAGAAAGAAAAGGAAAAAATTAAAGCTGAGCGGAAAATCCATACCTCTCTTATCGATTTAGAGCATATGGATCGATCTAGTTATAAGAATCAAATGTGTTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAA	(((((((((((..(.(((((((.......((((.........((.((((.((....((.(.((((((..(((.(((......((((.((((....)))).))))......))).)))...)))))))))...(((((((...((((.........))))..))))))).)))))).)).......)))).....))))))).)..)))))))))))..	Bdi-miR9773a	35927611	35927634	TTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAA	Bdi-miR9773a*	35927808	35927828	CACGAAATAGCTGATGAGCGA		3
Bdi-MIR9773b	PmiREN001328	MIR9773	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	11513533	11513790	+	ACTTTGAAAACACGAAATAGCTGATGAGCGAAGTTGTTGTTGAGAAATAGGAAAGTAGAATCAAACCCAGTCTTAGTCAAATATTTAATATATCTTCTTGTCCAAACAGAAAGAAAAGGAAAAAATTAAAGCTGAGCGGAAAATCCATACCTCTCTTATCGATTTAGAGCATATGGATCGATCTAGTTATAAGAATCAAATGTGTTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAAGGAATGAAAACAATTTTATCAT	..........(((((((((((..(.(((((((.......((((.........((.((((.((....((.(.((((((..(((.(((......((((.((((....)))).))))......))).)))...)))))))))...(((((((...((((.........))))..))))))).)))))).)).......)))).....))))))).)..))))))))))).....((((((....))))))... .-39.10	11513553	11513770	CACGAAATAGCTGATGAGCGAAGTTGTTGTTGAGAAATAGGAAAGTAGAATCAAACCCAGTCTTAGTCAAATATTTAATATATCTTCTTGTCCAAACAGAAAGAAAAGGAAAAAATTAAAGCTGAGCGGAAAATCCATACCTCTCTTATCGATTTAGAGCATATGGATCGATCTAGTTATAAGAATCAAATGTGTTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAA	(((((((((((..(.(((((((.......((((.........((.((((.((....((.(.((((((..(((.(((......((((.((((....)))).))))......))).)))...)))))))))...(((((((...((((.........))))..))))))).)))))).)).......)))).....))))))).)..)))))))))))..	Bdi-miR9773b	11513747	11513770	TTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAA	Bdi-miR9773b*	11513553	11513573	CACGAAATAGCTGATGAGCGA		3
Bdi-MIR9773c	PmiREN001329	MIR9773	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	25804359	25804616	-	ACTTTGAAAACACGAAATAGCTGATGAGCGAAGTTGTTGTTGAGAAATAGGAAAGTAGAATCAAACCCAGTCTTAGTCAAATATCTAATATATCTTCTTGTCCAAACAGAAAGAAAAGGAAAAAATTAAAGCTGAGCGGAAAATCCATACCTCTCTTATCGATTTAGAGCATATGGATCGATCTAGTTATAAGAATCAAATGTGTTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAAGGAATGAAAACAATTTTATCAT	..........(((((((((((..(.(((((((.......((((.........((.((((.((....((.(.((((((..(((..........((((.((((....)))).))))..........)))...)))))))))...(((((((...((((.........))))..))))))).)))))).)).......)))).....))))))).)..))))))))))).....((((((....))))))... .-38.60	25804379	25804596	CACGAAATAGCTGATGAGCGAAGTTGTTGTTGAGAAATAGGAAAGTAGAATCAAACCCAGTCTTAGTCAAATATCTAATATATCTTCTTGTCCAAACAGAAAGAAAAGGAAAAAATTAAAGCTGAGCGGAAAATCCATACCTCTCTTATCGATTTAGAGCATATGGATCGATCTAGTTATAAGAATCAAATGTGTTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAA	(((((((((((..(.(((((((.......((((.........((.((((.((....((.(.((((((..(((..........((((.((((....)))).))))..........)))...)))))))))...(((((((...((((.........))))..))))))).)))))).)).......)))).....))))))).)..)))))))))))..	Bdi-miR9773c	25804379	25804402	TTTGTTTTTATGTTATTTTGTGAA	Bdi-miR9773c*	25804576	25804596	CACGAAATAGCTGATGAGCGA		3
Bdi-MIRN34a	PmiREN001406	MIRN34	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	23341749	23341864	+	GGATGGGTGACCTCTTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATTCCTTTTTTTTTTGTTGCAGCTGTTCTAACTTTGTCATACGGAGTCCGACCGGGACGTTCTTGTACTTAAAACGACCGGA	(((.((....)))))...(((((((.((.((((.(((((..........((((.........))))..........))))).)))))))))).)))....................	23341769	23341844	AGTCCTCGTGTTGCATTCCTTTTTTTTTTGTTGCAGCTGTTCTAACTTTGTCATACGGAGTCCGACCGGGACGTTC	(((((.((.((((.(((((..........((((.........))))..........))))).)))))))))).)..	Bdi-miRN34a	23341769	23341788	AGTCCTCGTGTTGCATTCCT	Bdi-miRN34a*	23341824	23341844	CGGAGTCCGACCGGGACGTTC		3
Bdi-MIRN34b	PmiREN001407	MIRN34	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	23342086	23342178	+	GAAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATTGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATTCCTTTTTTTTTTGTTGCAGCTGT	....................(((.(((((((.((((((.....((....))..)))))).))))))).)))......................	23342106	23342158	GAGAGTAGTACTAGGATTGGTGACCTCCTGGGAAGTCCTCGTGTTGCATTCCT	(((.(((((((.((((((.....((....))..)))))).))))))).)))..	Bdi-miRN34b	23342139	23342158	AGTCCTCGTGTTGCATTCCT	Bdi-miRN34b*	23342106	23342126	GAGAGTAGTACTAGGATTGGT		3
Bdi-MIRN45a	PmiREN001353	MIRN45	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	3926535	3926788	-	TCATATTGACCTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGCTTGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATCTACC	.....((((((.(((((((.((((((..........((((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((...........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...)))))))))))).......)))))).))))..))).)).))))....(((((((...))))))). .-5	3926555	3926768	CTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGCTTGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGA	(.(((((((.((((((..........((((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((...........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...)))))))))))).......)))))).))))..))).)..	Bdi-miRN45a	3926555	3926574	GGCGGATGTAGCCAAGTGGA	Bdi-miRN45a*	3926748	3926768	CTTTTCTATTTTTGCCAATAA		3
Bdi-MIRN45b	PmiREN001375	MIRN45	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	35963562	35963813	+	CTTCATATTGACCTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATCCACC	.......((((((.(((((((.((((((.........(.(((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((.........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...))))))))))).)......)))))).))))..))).)).))))....(((((((...))))))). .	35963582	35963793	CTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGA	(.(((((((.((((((.........(.(((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((.........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...))))))))))).)......)))))).))))..))).)..	Bdi-miRN45b	35963774	35963793	GGCGGATGTAGCCAAGTGGA	Bdi-miRN45b*	35963582	35963602	CTTTTCTATTTTTGCCAATAA		3
Bdi-MIRN45c	PmiREN001388	MIRN45	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	69689587	69689840	-	TCGTATTGACCTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCAAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCTTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATCCACC	..((.((((((.(((((((.((((((.........(.((((((((.....(((.(((((((((((.(((((((((.......((((((...........))))))))))..(((((.......(((((.((......)).)))))........)))))....)).)))))))))))))).))).....)))))))).)......)))))).))))..))).)).)))).)).(((((((...))))))). .-5	69689607	69689820	CTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCAAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCTTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGA	(.(((((((.((((((.........(.((((((((.....(((.(((((((((((.(((((((((.......((((((...........))))))))))..(((((.......(((((.((......)).)))))........)))))....)).)))))))))))))).))).....)))))))).)......)))))).))))..))).)..	Bdi-miRN45c	69689607	69689626	GGCGGATGTAGCCAAGTGGA	Bdi-miRN45c*	69689800	69689820	CTTTTCTATTTTTGCCAATAA		3
Bdi-MIRN45d	PmiREN001396	MIRN45	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	16845753	16846005	+	TTCATATTGACCTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGTTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATCCACC	......((((((.(((((((.((((((.........(.(((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((..........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...))))))))))).)......)))))).))))..))).)).))))....(((((((...))))))). .-	16845773	16845985	CTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGTTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGA	(.(((((((.((((((.........(.(((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((..........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...))))))))))).)......)))))).))))..))).)..	Bdi-miRN45d	16845966	16845985	GGCGGATGTAGCCAAGTGGA	Bdi-miRN45d*	16845773	16845793	CTTTTCTATTTTTGCCAATAA		3
Bdi-MIRN45e	PmiREN001398	MIRN45	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	22571186	22571398	+	AATCCTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATCCACCATGCGCGGGTTCAATTCCCGTCGCTCGCCATCGCATTATTGCAAATGCAAAAAATGCAATTTTCCATATTCCTAGTTACGTATTTACTTACGGCGACGAAGAATAAAACTATCGCTATATTTTTTCCTTTTCCTAGTTCTTCTTCCA	........(((((((.((((((.(((((((((...((((.....(((.(((((((...)))))))...(((((((.......)))).)))..)))...(((((.((((....))))..))))).........(((((...(((.((((......))))..)))...)))))...)))).))))))))).)))))).))).)))).........	22571206	22571378	GGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATCCACCATGCGCGGGTTCAATTCCCGTCGCTCGCCATCGCATTATTGCAAATGCAAAAAATGCAATTTTCCATATTCCTAGTTACGTATTTACTTACGGCGACGAAGAATAAAACTATCGCTATATTTTTTCC	((.(((((((((...((((.....(((.(((((((...)))))))...(((((((.......)))).)))..)))...(((((.((((....))))..))))).........(((((...(((.((((......))))..)))...)))))...)))).))))))))).))..	Bdi-miRN45e	22571206	22571225	GGCGGATGTAGCCAAGTGGA	Bdi-miRN45e*	22571358	22571378	AACTATCGCTATATTTTTTCC		3
Bdi-MIRN45f	PmiREN001412	MIRN45	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	16119787	16120039	-	CTCCTTCATATTGACCTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATC	.(((......((((((.(((((((.((((((.........(.(((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((..........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...))))))))))).)......)))))).))))..))).)).))))......)))......... .-	16119807	16120019	CTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGA	(.(((((((.((((((.........(.(((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((..........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...))))))))))).)......)))))).))))..))).)..	Bdi-miRN45f	16119807	16119826	GGCGGATGTAGCCAAGTGGA	Bdi-miRN45f*	16119999	16120019	CTTTTCTATTTTTGCCAATAA		3
Bdi-MIRN45g	PmiREN001434	MIRN45	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	14611231	14611483	-	CTCCTTCATATTGACCTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATC	.(((......((((((.(((((((.((((((.........(.(((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((..........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...))))))))))).)......)))))).))))..))).)).))))......)))......... .-	14611251	14611463	CTTTTCTATTTTTGCCAATAAATGATGAGCTACAAAAGGATTCGTTTTTTTTCGTGTCACAGCTGATTACTCCTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGCGGCAATCTATGTCCAATATCTCGATCGAAGTATGGAGGTCAGAATAAATAGAATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAAATCCTGTAGCTGGATAAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGA	(.(((((((.((((((.........(.(((((((...((((((.(((((((((((.(((((((((.......((((((..........))))))))))..(((((.((((.(((.((....)).))))))).)).))).............)).)))))))))))))).))...))))))))))).)......)))))).))))..))).)..	Bdi-miRN45g	14611251	14611270	GGCGGATGTAGCCAAGTGGA	Bdi-miRN45g*	14611443	14611463	CTTTTCTATTTTTGCCAATAA		3
Bdi-MIRN172	PmiREN001332	MIRN172	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	13074179	13074388	+	AAAGGAAAACAGGTGAGGCCAGAGAAGCTGAGGCTGTATCTCCATCCAGTTATCTTGCACGAATAAGCGCCATCCTGATGCCTCTTATTCCTAATGTAGCCATAGCGGTAATCTTGTGTCGCACACATTAACTAAGAAGTTGTGTCTCCTCTAGGATAATAAGATGGTTGGTAACATCAAAGCTCTTGATACCTCTTATGCCTAATGTGG	..........((((((((...((((.(((..((.((((((.(((((..(((((((((((((((((((.(.(((....))).).)))))))........(((.....))).....(((((...)))))..((((....)))))))).......))))))))..)))))..))).)))))..)))))))....))))....)))).......	13074199	13074368	AGAGAAGCTGAGGCTGTATCTCCATCCAGTTATCTTGCACGAATAAGCGCCATCCTGATGCCTCTTATTCCTAATGTAGCCATAGCGGTAATCTTGTGTCGCACACATTAACTAAGAAGTTGTGTCTCCTCTAGGATAATAAGATGGTTGGTAACATCAAAGCTCTTGAT	.((((.(((..((.((((((.(((((..(((((((((((((((((((.(.(((....))).).)))))))........(((.....))).....(((((...)))))..((((....)))))))).......))))))))..)))))..))).)))))..)))))))...	Bdi-miRN172	13074199	13074219	AGAGAAGCTGAGGCTGTATCT	Bdi-miRN172*	13074348	13074368	GGTAACATCAAAGCTCTTGAT		3
Bdi-MIRN173	PmiREN001333	MIRN173	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	49791489	49791601	-	AAAAGTATATTTTTGGTCGTTCAATTGGCAGCAAAGTCTAGAAATGGACCTCGAACTCAAAGCCATGCATATACATTTGTTCCTCAATTGGCAAGACGGATACTTTTGATCCC	(((((((.....((.(((..((((((((.((((((((.((...((((...............))))...)).)).)))))).).)))))))...))).)))))))))......	49791509	49791581	TCAATTGGCAGCAAAGTCTAGAAATGGACCTCGAACTCAAAGCCATGCATATACATTTGTTCCTCAATTGGCA	((((((((.((((((((.((...((((...............))))...)).)).)))))).).)))))))..	Bdi-miRN173	49791561	49791581	TCAATTGGCAGCAAAGTCTAG	Bdi-miRN173*	49791509	49791529	ACATTTGTTCCTCAATTGGCA		3
Bdi-MIRN174a	PmiREN001334	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	45124672	45124850	-	TAAGTCAAAACTTCTTCAACTTTGACCGAGTTTATAGAAAAATCTACTAATATCTACAATATCAAATAAATACACCACGAGATGCAGACCATGACAGATTTAATAAAACTATTTAAAGTTATAGATGTTGGTTGATTTTTCTATAAACTTGGTCAAACTTTAAGAAGTTTGACTTAGGA	(((((((((.((((((.((.((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((...(((((..........((..((((.....)).))..)).........)))))...))).))))))))))).)))))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))...	45124692	45124830	TTTGACCGAGTTTATAGAAAAATCTACTAATATCTACAATATCAAATAAATACACCACGAGATGCAGACCATGACAGATTTAATAAAACTATTTAAAGTTATAGATGTTGGTTGATTTTTCTATAAACTTGGTCAAACT	((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((...(((((..........((..((((.....)).))..)).........)))))...))).))))))))))).))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN174a	45124810	45124830	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174a*	45124692	45124712	TTCTATAAACTTGGTCAAACT		3
Bdi-MIRN174b	PmiREN001335	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	30437846	30437965	-	CTTAAGTCAAACTTCTTAAGTTTGACCGAGTTTATAGAAAAATATACTAATGTCTACAACTATAGATGTTAGTACATTTTTCTATAAACTCTGTCAAACTTAAAGAATGACTTAGGACAA	(((((((((...((((((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((......)))))))))))).)))))))))))))))).))))))))).))))))))))))))....	30437866	30437945	TTTGACCGAGTTTATAGAAAAATATACTAATGTCTACAACTATAGATGTTAGTACATTTTTCTATAAACTCTGTCAAACT	((((((.((((((((((((((((.((((((((((((......)))))))))))).)))))))))))))))).))))))..	Bdi-miRN174b	30437925	30437945	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174b*	30437866	30437886	TTCTATAAACTCTGTCAAACT		3
Bdi-MIRN174c	PmiREN001338	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	43208231	43208428	+	CTGAGTCAAACATCTTAAAGTTTGACCGAGTTTATAGAAAAATCTACCAATATGTACTACTCCAAATTAGTTTTGTACTTCTGTTAAATCTGTAATGATATATCTTCATAATATACTTATTCTGTTATTTGATATTGTAAATAGGAGTAGTACATTTTTCTATAAATCTGGTCAAATTTAAAGCAAAGCTAGAACATC	.................(((((((((((.((((((((((((..........((((((((((((....(((.((((.((....)))))).)))..((((.......))))....(((....((........))....)))....)))))))))))))))))))))))).)))))))))))..(((...)))........	43208251	43208408	TTTGACCGAGTTTATAGAAAAATCTACCAATATGTACTACTCCAAATTAGTTTTGTACTTCTGTTAAATCTGTAATGATATATCTTCATAATATACTTATTCTGTTATTTGATATTGTAAATAGGAGTAGTACATTTTTCTATAAATCTGGTCAAATT	((((((((.((((((((((((..........((((((((((((....(((.((((.((....)))))).)))..((((.......))))....(((....((........))....)))....)))))))))))))))))))))))).))))))))..	Bdi-miRN174c	43208251	43208271	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174c*	43208388	43208408	TTCTATAAATCTGGTCAAATT		3
Bdi-MIRN174d	PmiREN001339	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	54574540	54574721	+	CTATGTCAAACTTGTTAAAGTTTGACCGAGTTTATAGAAAATTCCACCAACATCTACAACTTTAAATTAGTCTTATTAAATTTGTCATGGTATATATTTTCATAGTATACTTATTTTGATATTGTAAATATTAGTAAACTATTCTACAAACTTGGTCCAACTTTAAGATGTTTGACTTAGGA	(((.(((((((.(.((((((((.((((((((((.(((((............................((((.(((((((((((((((.((((((((((.....))))))..)))).))))).....))).)))))))))))))))).)))))))))).)))))))).).))))))).)))..	54574560	54574701	TTTGACCGAGTTTATAGAAAATTCCACCAACATCTACAACTTTAAATTAGTCTTATTAAATTTGTCATGGTATATATTTTCATAGTATACTTATTTTGATATTGTAAATATTAGTAAACTATTCTACAAACTTGGTCCAACT	((.((((((((((.(((((............................((((.(((((((((((((((.((((((((((.....))))))..)))).))))).....))).)))))))))))))))).)))))))))).))..	Bdi-miRN174d	54574560	54574580	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174d*	54574681	54574701	TTCTACAAACTTGGTCCAACT		3
Bdi-MIRN174e	PmiREN001340	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	39094844	39095023	+	AGGTTTGTTTTAAATCAATCTTTGACCGAGTTTATAGAAAAAAATCACAACACCAAACTAGTATCATTAAAAGTTTAAAACCATTATCAATAATATTTCATATTGTATTTGTCTGGTTCTTACGTGTGTTGGTAATTTTTTCTACAAATTTGGTCAAAGTTTAGTTAACAAAGTTTGACT	...................((((((((((((((.(((((((((....((((((((((((..((....))..)))))..(((((.((...(((((((...)))))))...))..))))).....).))))))....))))))))).))))))))))))))...((((((......))))))	39094864	39095003	TTTGACCGAGTTTATAGAAAAAAATCACAACACCAAACTAGTATCATTAAAAGTTTAAAACCATTATCAATAATATTTCATATTGTATTTGTCTGGTTCTTACGTGTGTTGGTAATTTTTTCTACAAATTTGGTCAAAGT	(((((((((((((.(((((((((....((((((((((((..((....))..)))))..(((((.((...(((((((...)))))))...))..))))).....).))))))....))))))))).)))))))))))))..	Bdi-miRN174e	39094864	39094884	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174e*	39094983	39095003	TTCTACAAATTTGGTCAAAGT		3
Bdi-MIRN174f	PmiREN001341	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	53633805	53633977	-	GCTTTGTCCTAAGTCAAATGTTTGACCGAGTTTATAGAAAAATATACTGACGCTACAATGTCTACTAAGTACACTGTGAATATATCATGATAGACCTAATAAAACTCATTTCGAGTTATAGATGGTAGATTTTTCTATAAACTTGGTCAAACTTGTAGAAGTTTGACTTCGGA	......(((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.....((((......))))...........((((.(........).))))(((...((.(((((.....))))).))...)))..))))))))))))))))))))))))........))))))))).)))	53633825	53633957	TTTGACCGAGTTTATAGAAAAATATACTGACGCTACAATGTCTACTAAGTACACTGTGAATATATCATGATAGACCTAATAAAACTCATTTCGAGTTATAGATGGTAGATTTTTCTATAAACTTGGTCAAACT	(((((((((((((((((((((((.....((((......))))...........((((.(........).))))(((...((.(((((.....))))).))...)))..)))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN174f	53633937	53633957	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174f*	53633825	53633845	TTCTATAAACTTGGTCAAACT		3
Bdi-MIRN174g	PmiREN001343	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	50764820	50764998	-	CTAAGTCAAACTTCTTAAATTTTGACCGAGTTTATAGAAAAATCTATTAACATCTGCAACTCTAAATTAGTTTAGTAAATCCATCATGATATATATCTTCATACTATACTTATTTGATATTGTAGATATTAGTAAATTTTCTGTAAACTTGGTCAAACTTTAAGAAGTTTAATTTAGGA	((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((((...((((((.((((((((...(((((.(((.(((((.........(((.........)))))))).))).)))))...)))))))).))))))..))))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))..	50764840	50764978	TTTGACCGAGTTTATAGAAAAATCTATTAACATCTGCAACTCTAAATTAGTTTAGTAAATCCATCATGATATATATCTTCATACTATACTTATTTGATATTGTAGATATTAGTAAATTTTCTGTAAACTTGGTCAAACT	(((((((((((((((((((((...((((((.((((((((...(((((.(((.(((((.........(((.........)))))))).))).)))))...)))))))).))))))..)))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN174g	50764958	50764978	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174g*	50764840	50764860	TTCTGTAAACTTGGTCAAACT		3
Bdi-MIRN174h	PmiREN001345	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	45801861	45802041	-	CTGAGTCAAACTTTCTCAACTTTGACCGAGTTTATAGAAAAAAGTACCAACATATGTAACACCAAATAAATGCAATATGAAAACATATTTGATAGTAGTCCTAATGATGCTAGTTTGGTGTTGTATATATTTGTGTTTTTCTTCTACAAATTTGGTAAAGTTGACCAACTTTGACTTGGGA	((((((((((.((..(((((((((.((((((((.(((((((((((((.((.((((((((((((((((....(((.(((....((.((((....))))))....))).)))..)))))))))))))))).)).)))))))).))))).)))))))))))))))))..)).))))))))))..	45801881	45802021	TTTGACCGAGTTTATAGAAAAAAGTACCAACATATGTAACACCAAATAAATGCAATATGAAAACATATTTGATAGTAGTCCTAATGATGCTAGTTTGGTGTTGTATATATTTGTGTTTTTCTTCTACAAATTTGGTAAAGT	((((.((((((((.(((((((((((((.((.((((((((((((((((....(((.(((....((.((((....))))))....))).)))..)))))))))))))))).)).)))))))).))))).))))))))))))..	Bdi-miRN174h	45802001	45802021	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174h*	45801881	45801901	CTTCTACAAATTTGGTAAAGT		3
Bdi-MIRN174i	PmiREN001347	MIRN174	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	7674546	7674741	+	ATAAGTTGAACTTCTTAAAGTTTGACCGAGTTTATAGAAAAATATACCAATATCTATAACTTTAAATTAGTTTTGTTAAATTCTTCATCATATATGTAATTATAATCTAAGCATGGATAGTATACTTATTTGATATTGTAGATATTAGTACATTTTCCTATAAACTCAGTCAAACTTCTTCAAGTTTGACTTAGGA	.((((((((((((....(((((((((.((((((((((.(((((.(((.(((((((((((..((((((.(((.(((((..((.(((.....((((......))))....))).)).)))))...))).))))))..))))))))))).))).))))).)))))))))).)))))))))....))))))))))))...	7674566	7674721	TTTGACCGAGTTTATAGAAAAATATACCAATATCTATAACTTTAAATTAGTTTTGTTAAATTCTTCATCATATATGTAATTATAATCTAAGCATGGATAGTATACTTATTTGATATTGTAGATATTAGTACATTTTCCTATAAACTCAGTCAAACT	((((((.((((((((((.(((((.(((.(((((((((((..((((((.(((.(((((..((.(((.....((((......))))....))).)).)))))...))).))))))..))))))))))).))).))))).)))))))))).))))))..	Bdi-miRN174i	7674566	7674586	TTTGACCGAGTTTATAGAAAA	Bdi-miRN174i*	7674701	7674721	TCCTATAAACTCAGTCAAACT		3
Bdi-MIRN175	PmiREN001336	MIRN175	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	23044683	23044826	+	TTCTCTAAAAATCAGACATGCCACTGGTCTTGGCCATTACAAGATCCATCTCTTGCCATTGGTTTTTATGCAGTAAAATAATGGGCGCAACACATGGATTTTGTAATGGCCAACACTAATGGCATGTTGATTTTCATCGAATGG	(((....((((((((.(((((((.((((.((((((((((((((((((((....((((....(((((........)))))....))))......)))))))))))))))))))).)))).)))))))))))))))....)))...	23044703	23044806	CCACTGGTCTTGGCCATTACAAGATCCATCTCTTGCCATTGGTTTTTATGCAGTAAAATAATGGGCGCAACACATGGATTTTGTAATGGCCAACACTAATGGCA	(((.((((.((((((((((((((((((((....((((....(((((........)))))....))))......)))))))))))))))))))).)))).)))..	Bdi-miRN175	23044786	23044806	TAATGGCCAACACTAATGGCA	Bdi-miRN175*	23044703	23044723	CCACTGGTCTTGGCCATTACA		3
Bdi-MIRN176	PmiREN001337	MIRN176	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	11496799	11496880	-	AATTAGATCTATCTCGCATTTTTGAGAACCCTTTGAGAAGGCGCTCAAGGGGTTCTCAAATAAAACGAAAAAGTAAAAACCT	.............(((....(((((((((((((((((......))))))))))))))))).....)))..............	11496819	11496860	TTTGAGAACCCTTTGAGAAGGCGCTCAAGGGGTTCTCAAATA	(((((((((((((((((......)))))))))))))))))..	Bdi-miRN176	11496819	11496838	GCTCAAGGGGTTCTCAAATA	Bdi-miRN176*	11496840	11496860	TTTGAGAACCCTTTGAGAAGG		3
Bdi-MIRN177a	PmiREN001342	MIRN177	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	377759	377880	+	GCCAATAAGATAGTACTCCCTCTGTCCTGTAATATAAGATGTTGTTACAACCAGTATAGGAGTTAATATGTTGTAACAACATCTTATATTCTGGGACGGAGGGAGTAGTACTTTTCTAGTTA	......(((.((.((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((........))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))).))))).........	377779	377860	TCTGTCCTGTAATATAAGATGTTGTTACAACCAGTATAGGAGTTAATATGTTGTAACAACATCTTATATTCTGGGACGGAGG	(((((((((.(((((((((((((((((((((..((((........))))))))))))))))))))))))).)))))))))..	Bdi-miRN177a	377779	377799	TCTGTCCTGTAATATAAGATG	Bdi-miRN177a*	377840	377860	TCTTATATTCTGGGACGGAGG		3
Bdi-MIRN177b	PmiREN001387	MIRN177	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	74872754	74872875	-	GCCAATAAGATAGTACTCCCTCTGTCCTGTAATATAAGATGTTGTTACAACCAGTATAGGAGTTAATATGTTGTAATAACATCTTATATTCTGGGACGGAGGGACTAGTACTTTTCTAGTTA	.......(((.((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((........))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))...)))))..))).....	74872774	74872855	TCTGTCCTGTAATATAAGATGTTGTTACAACCAGTATAGGAGTTAATATGTTGTAATAACATCTTATATTCTGGGACGGAGG	(((((((((.(((((((((((((((((((((..((((........))))))))))))))))))))))))).)))))))))..	Bdi-miRN177b	74872835	74872855	TCTGTCCTGTAATATAAGATG	Bdi-miRN177b*	74872774	74872794	TCTTATATTCTGGGACGGAGG		3
Bdi-MIRN178	PmiREN001344	MIRN178	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	12534368	12534471	+	AACCTGGGAAGCTGAATGTGAGATTTGGATGGAACCAAATCTTCAGCTGCATTGGCACAAGATTTGGTTTCCTCCAATATCTCACCTTCAACTGCCCCAGATGA	...(((((.((.((((.((((((((((((.(((((((((((((..(((.....)))..))))))))))))).))))).))))))).)))).))..)))))....	12534388	12534451	AGATTTGGATGGAACCAAATCTTCAGCTGCATTGGCACAAGATTTGGTTTCCTCCAATATCTCA	(((((((((.(((((((((((((..(((.....)))..))))))))))))).))))).))))..	Bdi-miRN178	12534388	12534408	AGATTTGGATGGAACCAAATC	Bdi-miRN178*	12534431	12534451	TTGGTTTCCTCCAATATCTCA		3
Bdi-MIRN179	PmiREN001346	MIRN179	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	3828076	3828265	-	TATAAGTTCATGAACTCGTGTTAGTGATACAGATTAGTCCAAAAACAGTTTGTCAAGGATAAAAGTTGACACGTGGCAGAAATCTAGTTACAAGCCGCCGTCCAGGATCATGCCACGTGTCAATTTTTAGACTTTCTAAACCGTTTTTGGACTAACCTGTATCAGTAAATCGAGTTTATGGACTTACGTG	(.((((((((((((((((..(((.((((((((.(((((((((((((.(((((..(((..(((((((((((((((((((...((((....((........))...))))..)))))))))))))))))))..)))..))))).))))))))))))).)))))))).)))..)))))))))))))))).)..	3828096	3828245	TTAGTGATACAGATTAGTCCAAAAACAGTTTGTCAAGGATAAAAGTTGACACGTGGCAGAAATCTAGTTACAAGCCGCCGTCCAGGATCATGCCACGTGTCAATTTTTAGACTTTCTAAACCGTTTTTGGACTAACCTGTATCAGTAAAT	(((.((((((((.(((((((((((((.(((((..(((..(((((((((((((((((((...((((....((........))...))))..)))))))))))))))))))..)))..))))).))))))))))))).)))))))).)))..	Bdi-miRN179	3828225	3828245	TTAGTGATACAGATTAGTCCA	Bdi-miRN179*	3828096	3828116	GACTAACCTGTATCAGTAAAT		3
Bdi-MIRN180	PmiREN001348	MIRN180	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	28310742	28310839	-	TAGATTATTTTTCCGCAAGTTGTCAGAAATGGATTGTTTGCATATTACACATGTGATCCTAGATGAGACTTTGACAATTTAATTTCATATGAATATAG	................(((((((((((...(..(((((((...(((((....)))))..)))))))..))))))))))))..................	28310762	28310819	TGTCAGAAATGGATTGTTTGCATATTACACATGTGATCCTAGATGAGACTTTGACAAT	(((((((...(..(((((((...(((((....)))))..)))))))..))))))))..	Bdi-miRN180	28310799	28310819	TGTCAGAAATGGATTGTTTGC	Bdi-miRN180*	28310762	28310782	CCTAGATGAGACTTTGACAAT		3
Bdi-MIRN181	PmiREN001349	MIRN181	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	23982867	23983130	+	TTCGATTCTCGCAACACCCCGATGTTTCTGTTCCTAGGTTTTGTTAGTTTTACGTTGCATTCAGTTTCGAACTAACCTGAAATATTCAGTTTCGGAGGCAGTATCAACAAACAAGACTCGCAAGCTTCAAAGCTGCTGTTGTTCTGGATTTTGATTCTGTTTGTGTACCTTTACATTGGTAAGAAATCTCGAAGATGCAGCATAATAATCATGCCTGCTATACTTAAATGAATGGAAATATAATACAG	(((((...))).)).......((((((((((((.(((((...(((((((...((..((.....))..)))))))))(((((((.....)))))))((((((.(((((.(..((.(((..(((.(((....))))))....))).))..).))))).))))))...((((........))))....((((...))))(((((((.......))).))))...)))))...)))))))))))).......	23982887	23983110	GATGTTTCTGTTCCTAGGTTTTGTTAGTTTTACGTTGCATTCAGTTTCGAACTAACCTGAAATATTCAGTTTCGGAGGCAGTATCAACAAACAAGACTCGCAAGCTTCAAAGCTGCTGTTGTTCTGGATTTTGATTCTGTTTGTGTACCTTTACATTGGTAAGAAATCTCGAAGATGCAGCATAATAATCATGCCTGCTATACTTAAATGAATGGAAATATAAT	.((((((((((((.(((((...(((((((...((..((.....))..)))))))))(((((((.....)))))))((((((.(((((.(..((.(((..(((.(((....))))))....))).))..).))))).))))))...((((........))))....((((...))))(((((((.......))).))))...)))))...))))))))))))...	Bdi-miRN181	23982887	23982907	GATGTTTCTGTTCCTAGGTTT	Bdi-miRN181*	23983090	23983110	TTAAATGAATGGAAATATAAT		3
Bdi-MIRN182	PmiREN001350	MIRN182	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	48936666	48936753	+	AGGAGGTATCAGGAATTGAACTCAAACTTTTCTGCCTTTTGCCATCTAAGCTAGAAACGATTTGAGGTGCGGTGTGGAGATCGACGGT	....................(((((((.((((((.(((.........))).)))))).).))))))....(.(((.(....).))).)	48936686	48936733	CTCAAACTTTTCTGCCTTTTGCCATCTAAGCTAGAAACGATTTGAGGT	(((((((.((((((.(((.........))).)))))).).))))))..	Bdi-miRN182	48936713	48936733	AAGCTAGAAACGATTTGAGGT	Bdi-miRN182*	48936686	48936706	CTCAAACTTTTCTGCCTTTTG		3
Bdi-MIRN183	PmiREN001351	MIRN183	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	57824582	57824737	-	CCAGGTCCACAACACATGCCAGCGTGGCCAAATTTCATCTGATTTTGGCCAATTGGATTAAAATGAACAAAACTACCAAGTTTACTGAGTCATTTGAACAGTTTTCAAGTTAATGGATGAAACTGAACATTGCTGCCAAGTTCATGGACCTGCGGT	.((((((((....((.((.(((((((..((..(((((((((..(((((..(((((.....((((((.(((((((....)))))..))..))))))...))))).)))))....))))))))).))..)).))))).)).))...))))))))....	57824602	57824717	AGCGTGGCCAAATTTCATCTGATTTTGGCCAATTGGATTAAAATGAACAAAACTACCAAGTTTACTGAGTCATTTGAACAGTTTTCAAGTTAATGGATGAAACTGAACATTGCTGC	((((((..((..(((((((((..(((((..(((((.....((((((.(((((((....)))))..))..))))))...))))).)))))....))))))))).))..)).))))..	Bdi-miRN183	57824602	57824622	GATGAAACTGAACATTGCTGC	Bdi-miRN183*	57824697	57824717	AGCGTGGCCAAATTTCATCTG		3
Bdi-MIRN184	PmiREN001352	MIRN184	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	56379128	56379248	-	CACAACGAAAGAAAATAGTGCGGTGAGTGCTACTCTGGCAGCTGTGCCCTTTGCTGTATCTCGGCTTATTGATCAGTTGAGAGCTTAGCAGCTAACCAGCGCGTGGAAGCTATGGGATTCT	.................(((((((.(((((((((((..((((((..(.....((((.....)))).....)..))))))))))..))))).)).))).))))...................	56379148	56379228	CGGTGAGTGCTACTCTGGCAGCTGTGCCCTTTGCTGTATCTCGGCTTATTGATCAGTTGAGAGCTTAGCAGCTAACCAGCG	((((.(((((((((((..((((((..(.....((((.....)))).....)..))))))))))..))))).)).))).)..	Bdi-miRN184	56379208	56379228	CGGTGAGTGCTACTCTGGCAG	Bdi-miRN184*	56379148	56379168	GAGCTTAGCAGCTAACCAGCG		3
Bdi-MIRN185	PmiREN001354	MIRN185	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	35278484	35278750	+	TACGCAACAGTTGCTAGTTTGTTCTGCCCGCTGATTTTTAATCCGTTTACAAAGTCCTCCGAGGACCGATATCCCGATTAGATGAATAAGCAAGAACACACCGGGGCTTTGTGGACATGGGAGGTGTCGGGATGCCAAAGCCTACCAACGAGAAACAACGAAGCATGGTGCTTCTATAGCTTGTTTGCTACTGGGGCGGCAAGCATGCATTTGGAAACTGTGACGTGCATTCTGTCCAAGGACAACCACG	((((..((((((.((((..(((..(((..((((....................(((((...)))))......(((.(.(((.(((((((((.((((..(((((..(((((((.....(((.((((...((....))...)))).)))..........))))))).))))).))))...)))))))))))).).)))))))..))).))).)))).))))))..)))).....((((....))))......	35278504	35278730	ACGCAACAGTTGCTAGTTTGTTCTGCCCGCTGATTTTTAATCCGTTTACAAAGTCCTCCGAGGACCGATATCCCGATTAGATGAATAAGCAAGAACACACCGGGGCTTTGTGGACATGGGAGGTGTCGGGATGCCAAAGCCTACCAACGAGAAACAACGAAGCATGGTGCTTCTATAGCTTGTTTGCTACTGGGGCGGCAAGCATGCATTTGGAAACTGTGACGTGC	(((..((((((.((((..(((..(((..((((....................(((((...)))))......(((.(.(((.(((((((((.((((..(((((..(((((((.....(((.((((...((....))...)))).)))..........))))))).))))).))))...)))))))))))).).)))))))..))).))).)))).))))))..)))..	Bdi-miRN185	35278710	35278730	CATTTGGAAACTGTGACGTGC	Bdi-miRN185*	35278504	35278524	ACGCAACAGTTGCTAGTTTGT		3
Bdi-MIRN186	PmiREN001355	MIRN186	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	51877664	51877868	+	TTCTGAAGAGATGTTAGATGTACGAACGAAGAGCGAGTAGATGTCGAATCACACCTGGTGATTCAGCTGCAACTTCCAAGATCTGTTACTATGAATAGGATGCAACAGGAGAATTTGGACAATGCATTCCAAACAATGATGCACATCTAGCATGTTTGCACTATATTTGTTGTTATGTTGGCCTGATCGAAACATGTAAGTCGGC	........(.(((((.(((...(.((((((.((((((((...((.(((((((.....))))))).))((((...((((((.((((((.(............).))))))....))))))...))))...((((((....(((.......))))))))).....)))))))).)).)))).)....)))..))))).)........	51877684	51877848	TACGAACGAAGAGCGAGTAGATGTCGAATCACACCTGGTGATTCAGCTGCAACTTCCAAGATCTGTTACTATGAATAGGATGCAACAGGAGAATTTGGACAATGCATTCCAAACAATGATGCACATCTAGCATGTTTGCACTATATTTGTTGTTATGTTGGCCTG	..(.((((((.((((((((...((.(((((((.....))))))).))((((...((((((.((((((.(............).))))))....))))))...))))...((((((....(((.......))))))))).....)))))))).)).)))).)....	Bdi-miRN186	51877828	51877848	ATTTGTTGTTATGTTGGCCTG	Bdi-miRN186*	51877684	51877704	TACGAACGAAGAGCGAGTAGA		3
Bdi-MIRN187	PmiREN001356	MIRN187	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	2063427	2063620	-	AAGATTGAGCTTTCCCAATTTGTCAAGCTGCATGTGGTTGATGCTTCAAAATGTAGAATTTTCAGATGTTCCTTATTCCATCTGTTGGAGGTTTAGTCCCTCCTGATCATACTCTGCGCAATCTTGTCTCTTGGAGATTTAAGTTGTTTCTGTTTCAATTACTGTTGCTGTAAATTTGTTCTATATATCCAGGC	................((((((.((.((.(((.((((((((.((........(((((.....((((((..........))))))..(((((.......))))).........)))))(((((...(((((...)))))....)))))....)).))))))))))).))))))))))..................	2063447	2063600	TGTCAAGCTGCATGTGGTTGATGCTTCAAAATGTAGAATTTTCAGATGTTCCTTATTCCATCTGTTGGAGGTTTAGTCCCTCCTGATCATACTCTGCGCAATCTTGTCTCTTGGAGATTTAAGTTGTTTCTGTTTCAATTACTGTTGCTGTAAA	((.((.((.(((.((((((((.((........(((((.....((((((..........))))))..(((((.......))))).........)))))(((((...(((((...)))))....)))))....)).))))))))))).))))))..	Bdi-miRN187	2063580	2063600	TGTCAAGCTGCATGTGGTTGA	Bdi-miRN187*	2063447	2063467	TTCAATTACTGTTGCTGTAAA		3
Bdi-MIRN188	PmiREN001357	MIRN188	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	1721232	1721460	-	AAACATATCAAGGCCATGCTCTGCTGGATTGTCTTGTTGCCGAGCAGAGTGCTTACAACCGGACGTGCAGGTGAAGATATGCAAACTAGAAATTGTAAGCACACACAATTGGATTCCCACTGCCCTCCAAGCCCAAACGTATACCCAAGAAAAACCAAGGAGCTTGAGATAACTAAGATATGCATGCAAGGAGAGATCGAACAGTAAAAGCAAGGACGGAGAATCTCTT	.............((.((((.(((((((((.((((.((((...(((..((((((((((.(.....((((.((....)).)))).....)...)))))))))).......(((....))).....(((.((((((........................)).)))))))............)))..)))).))))))))...)))))..)))).))..((((...)))).	1721252	1721440	CTGCTGGATTGTCTTGTTGCCGAGCAGAGTGCTTACAACCGGACGTGCAGGTGAAGATATGCAAACTAGAAATTGTAAGCACACACAATTGGATTCCCACTGCCCTCCAAGCCCAAACGTATACCCAAGAAAAACCAAGGAGCTTGAGATAACTAAGATATGCATGCAAGGAGAGATCGAACAGTAAAA	.(((((((((.((((.((((...(((..((((((((((.(.....((((.((....)).)))).....)...)))))))))).......(((....))).....(((.((((((........................)).)))))))............)))..)))).))))))))...)))))...	Bdi-miRN188	1721420	1721440	CTGCTGGATTGTCTTGTTGCC	Bdi-miRN188*	1721252	1721272	AGGAGAGATCGAACAGTAAAA		3
Bdi-MIRN189	PmiREN001358	MIRN189	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	13600634	13600888	+	AGACCACTGGTCCGGTTATCTTGATGAACTAATTTGCTTGATTTTTCTTGCAAATGTGGGAAGAGGATTGTTATTCGTAAGAATGGTGAGTTATCTTGCAAGTAAATATAGGTGGAGATTACAAACCAATATAAGCCCAACACATAACATGGTGATAGTTAGTTGAACTTCACTGCCAGCGACAGTGAGAATGTGTTAATAACTGTATTTTGTATCAGGACAAATTGTTACAGGATGGCTGTTTTTGA	.((((...))))(((((((((((...(((.(((((((((((((((((((((....))))))))).......(((((....)))))(((((....)))))..((..((((.(((...........))).))))..))....(((........)))(((((((.....(((((((((.......)))))))...)).....))))))).......)))))).))))))))).)))))))))))....... .-59.3	13600654	13600868	TTGATGAACTAATTTGCTTGATTTTTCTTGCAAATGTGGGAAGAGGATTGTTATTCGTAAGAATGGTGAGTTATCTTGCAAGTAAATATAGGTGGAGATTACAAACCAATATAAGCCCAACACATAACATGGTGATAGTTAGTTGAACTTCACTGCCAGCGACAGTGAGAATGTGTTAATAACTGTATTTTGTATCAGGACAAATTGTTACAGGA	(((...(((.(((((((((((((((((((((....))))))))).......(((((....)))))(((((....)))))..((..((((.(((...........))).))))..))....(((........)))(((((((.....(((((((((.......)))))))...)).....))))))).......)))))).))))))))).)))..	Bdi-miRN189	13600654	13600674	TTGATGAACTAATTTGCTTGA	Bdi-miRN189*	13600848	13600868	TCAGGACAAATTGTTACAGGA		3
Bdi-MIRN190	PmiREN001359	MIRN190	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	13934656	13934774	+	CTTGTCAGGCGCTGAAAGTGAGAGTTGGATGAAGACAAACTAGTTCAACAGATGGACAATTGTGGTCCGTTGATCAGCTTGTTTTCCTCCAATATCTCACCTTCGGTCGATCACCTGGC	...(((((((((((((.((((((((((((.((((((((.((.(.(((((....((((.......))))))))).))).)))))))).)))))).)))))).))))).))....))))))	13934676	13934754	AGAGTTGGATGAAGACAAACTAGTTCAACAGATGGACAATTGTGGTCCGTTGATCAGCTTGTTTTCCTCCAATATCTCA	(((((((((.((((((((.((.(.(((((....((((.......))))))))).))).)))))))).)))))).)))..	Bdi-miRN190	13934676	13934696	AGAGTTGGATGAAGACAAACT	Bdi-miRN190*	13934734	13934754	TTGTTTTCCTCCAATATCTCA		3
Bdi-MIRN191	PmiREN001360	MIRN191	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	13962601	13962701	+	TACATGCGCTGTTCAAAGCGAGGATTAGAAGGGACTGAATCATCTATTAGAAATGATGGTTCAGTTTCTTCTAATATCTCACCTTGAATGGTCCATCTGTG	...(((.(((((((((.(.(((((((((((((((((((((((((..........))))))))))))))))))))).)))).).))))))))).))).....	13962621	13962681	AGGATTAGAAGGGACTGAATCATCTATTAGAAATGATGGTTCAGTTTCTTCTAATATCTCA	((((((((((((((((((((((((..........))))))))))))))))))))).)))..	Bdi-miRN191	13962621	13962641	AGGATTAGAAGGGACTGAATC	Bdi-miRN191*	13962661	13962681	TCAGTTTCTTCTAATATCTCA		3
Bdi-MIRN192	PmiREN001361	MIRN192	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	35964896	35964988	+	AACATCCCTAGTTGCTAGCTAGACACGGTAGGCATCAGGAATCCGTGCATGCCGATGCCAATGGTCGATCCAGCTTCTTTCTAGTTACGTCCT	.......((((.....((((.(((((.((.((((((.((............)))))))).)).)).).)).)))).....)))).........	35964916	35964968	AGACACGGTAGGCATCAGGAATCCGTGCATGCCGATGCCAATGGTCGATCCAG	.(((((.((.((((((.((............)))))))).)).)).).))...	Bdi-miRN192	35964948	35964968	CGATGCCAATGGTCGATCCAG	Bdi-miRN192*	35964916	35964936	AGACACGGTAGGCATCAGGAA		3
Bdi-MIRN193	PmiREN001362	MIRN193	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	2651484	2651601	-	CTTGACTGCCATGTGAAGGTACAAATTGTTCCTTGATGCCTGTCTCATCTGGTTCTCTAACGACGAGATGATGTAGTTAGTGAGGAACATTGTTGTGCTTGGGCAAGTCTCAACTTCA	(((.((......)).)))..((((..((((((((..((.(((..((((((.(((.......))).))))))..))).))..))))))))...))))......................	2651504	2651581	ACAAATTGTTCCTTGATGCCTGTCTCATCTGGTTCTCTAACGACGAGATGATGTAGTTAGTGAGGAACATTGTTGTGC	((((..((((((((..((.(((..((((((.(((.......))).))))))..))).))..))))))))...))))..	Bdi-miRN193	2651504	2651524	TAGTGAGGAACATTGTTGTGC	Bdi-miRN193*	2651561	2651581	ACAAATTGTTCCTTGATGCCT		3
Bdi-MIRN194	PmiREN001363	MIRN194	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	5386571	5386690	+	CTTCTTGTTCTAGCCATGCCCGATATGTTGAGTTTCTGCCTCCGTCACTGGTCATACAAGATCAAGGCTTCAATTTCTGCGTAGGAACCAGCTTTGTGGGAGAGCATTTTCTATACAGTG	..................((((....((((.((((((((.........(((((......)))))..((..........))))))))))))))....))))...............(...)	5386591	5386670	CGATATGTTGAGTTTCTGCCTCCGTCACTGGTCATACAAGATCAAGGCTTCAATTTCTGCGTAGGAACCAGCTTTGTGGG	((....((((.((((((((.........(((((......)))))..((..........))))))))))))))....))..	Bdi-miRN194	5386591	5386611	CGATATGTTGAGTTTCTGCCT	Bdi-miRN194*	5386650	5386670	CGTAGGAACCAGCTTTGTGGG		3
Bdi-MIRN195a	PmiREN001364	MIRN195	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	1307457	1307566	+	AACTACTTAACTACTCCCTCCGTTCCTAAATTCTTGTCATGATTTTAGTTCAAATTTGAACTAAAACCACGACAAGAATTTAGGGACGGAGGGAGTATAATATAACTACA	...........(((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((((....)))))))))).)).))))))))))))))))))))))))))).............	1307477	1307546	CGTTCCTAAATTCTTGTCATGATTTTAGTTCAAATTTGAACTAAAACCACGACAAGAATTTAGGGACGGA	((((((((((((((((((.((.((((((((((....)))))))))).)).))))))))))))))))))..	Bdi-miRN195a	1307526	1307546	CGACAAGAATTTAGGGACGGA	Bdi-miRN195a*	1307477	1307497	CGTTCCTAAATTCTTGTCATG		3
Bdi-MIRN195b	PmiREN001394	MIRN195	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	48775491	48775600	-	TAAGTCTTAACTACTCCCTTCGTTCCTAAATTCTTGTTGTGGTTTTAGTTCAAATCTGTACTAAAACCACGACAAGAATTTAGGGACGGAGGGAGTAATAATCAGTGCCT	...........((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((....)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).............	48775511	48775580	CGTTCCTAAATTCTTGTTGTGGTTTTAGTTCAAATCTGTACTAAAACCACGACAAGAATTTAGGGACGGA	(((((((((((((((((((((((((((((.((....)).)))))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN195b	48775511	48775531	CGACAAGAATTTAGGGACGGA	Bdi-miRN195b*	48775560	48775580	CGTTCCTAAATTCTTGTTGTG		3
Bdi-MIRN195c	PmiREN001435	MIRN195	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	60377163	60377264	+	CCGTAGTCACTAATACTCTCTCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTGTTTTAGGTCAAACAACGACAAGAATTTAGGAACAGAGTAAGTAGTAATTTTTCTCATG	.............((((..(((.((((((((((((((((((((((((......)))))))))))))))))))))))).)))..))))...............	60377183	60377244	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTGTTTTAGGTCAAACAACGACAAGAATTTAGGAACAGAGT	((.((((((((((((((((((((((((......)))))))))))))))))))))))).))..	Bdi-miRN195c	60377183	60377203	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCG	Bdi-miRN195c*	60377224	60377244	ACAAGAATTTAGGAACAGAGT		3
Bdi-MIRN195d	PmiREN001440	MIRN195	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	13334234	13334347	+	TGGAACTAGTTAGTAGTCCCTCCGTTCTTAAATTCTTGTCGCTGTTTTAGTTCAAATTTGTACTAAAACAGCGACAAGAATTTAGGAACGAAGGTAGTACTTTGTAATAACTAG	.....((((((((((.(.(((.(((((((((((((((((((((((((((((.((....)).))))))))))))))))))))))))))))).))).).)))).......))))))	13334254	13334327	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCGCTGTTTTAGTTCAAATTTGTACTAAAACAGCGACAAGAATTTAGGAACGAAGG	(.(((((((((((((((((((((((((((((.((....)).))))))))))))))))))))))))))))).)..	Bdi-miRN195d	13334254	13334274	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCG	Bdi-miRN195d*	13334307	13334327	ACAAGAATTTAGGAACGAAGG		3
Bdi-MIRN195e	PmiREN001441	MIRN195	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	32913324	32913437	+	AGCATGAAAATTACACTCCCTCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTGTTTTAGTTCAAATTTATACTAAAACAGCGACACAAATTTAGGAACGGAGGTAGTAACTTTTACAACGTGG	....(((((.((((....((((((((((((((((..(((((((((((((((..........)))))))))))))))..))))))))))))))))..)))).)))))........	32913344	32913417	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTGTTTTAGTTCAAATTTATACTAAAACAGCGACACAAATTTAGGAACGGAGG	((((((((((((((..(((((((((((((((..........)))))))))))))))..))))))))))))))..	Bdi-miRN195e	32913344	32913364	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCG	Bdi-miRN195e*	32913397	32913417	ACACAAATTTAGGAACGGAGG		3
Bdi-MIRN195f	PmiREN001446	MIRN195	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	2063810	2063922	+	CGTACCTTATATATTGCTCCTCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTTTAGTTCCTCAATTTGAACTAACACCACGACAAGAATTTAAGTACGGAGTGAGTATTTACGATCGGTGCC	..............(((((((((((.((((((((((((((((.(((((((........)))))))....)))))))))))))))).)))))).)))))...............	2063830	2063902	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTTTAGTTCCTCAATTTGAACTAACACCACGACAAGAATTTAAGTACGGAGT	(((((.((((((((((((((((.(((((((........)))))))....)))))))))))))))).)))))..	Bdi-miRN195f	2063830	2063850	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCG	Bdi-miRN195f*	2063882	2063902	ACAAGAATTTAAGTACGGAGT		3
Bdi-MIRN195g	PmiREN001451	MIRN195	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	12974435	12974549	-	ACAGACATAGTTGTACTCCTTCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTTTTTAGTTCAAAATCTGCACTAAAACAGCGGACAAAAATTTAGGAACGGACGAAGTACACAAGGACAACATA	.......((((((((((.(.((((((((((((((.(((((((((((((((.((.....)).))))))).))).))))).)))))))))))))).).))))))........)).))	12974455	12974529	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTTTTTAGTTCAAAATCTGCACTAAAACAGCGGACAAAAATTTAGGAACGGACG	((((((((((((((.(((((((((((((((.((.....)).))))))).))).))))).))))))))))))))..	Bdi-miRN195g	12974509	12974529	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCG	Bdi-miRN195g*	12974455	12974475	ACAAAAATTTAGGAACGGACG		3
Bdi-MIRN195h	PmiREN001453	MIRN195	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	39305991	39306104	+	AACGCATGTCAGCTACTCCCTCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTGTTTTAGTACAAATTTGAACTAAAACAACGACAAGAATTTAGGAACAGAGAAGTAGCTCCTAATGGGTCCT	.((.(((...(((((((..(((.((((((((((((((((((((((((((((.((....)).)))))))))))))))))))))))))))).))).)))))))....))).))...	39306011	39306084	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCGTTGTTTTAGTACAAATTTGAACTAAAACAACGACAAGAATTTAGGAACAGAGA	((.((((((((((((((((((((((((((((.((....)).)))))))))))))))))))))))))))).))..	Bdi-miRN195h	39306011	39306031	TCCGTTCTTAAATTCTTGTCG	Bdi-miRN195h*	39306064	39306084	ACAAGAATTTAGGAACAGAGA		3
Bdi-MIRN196	PmiREN001365	MIRN196	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	1068680	1068781	+	TGCAATGTACTCCCTCCGTTTCTAAATACTTGTAGTGGTTCTAGGCCAACTTTGCACTAAAACCACGACAAGTATTTAGAAACAGAGGGAGTAATATGATCG	.......(((((((((.((((((((((((((((.((((((.(((((.......)).))).)))))).)))))))))))))))).))))))))).........	1068700	1068761	TCTAAATACTTGTAGTGGTTCTAGGCCAACTTTGCACTAAAACCACGACAAGTATTTAGAAA	(((((((((((((.((((((.(((((.......)).))).)))))).)))))))))))))..	Bdi-miRN196	1068700	1068720	TCTAAATACTTGTAGTGGTTC	Bdi-miRN196*	1068741	1068761	ACCACGACAAGTATTTAGAAA		3
Bdi-MIRN197	PmiREN001366	MIRN197	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	29013999	29014144	+	TGTGAAAAGTGGAACGTTTCCTTGAAGGGACTGATCCTCGTCCGCGCAATTACATTATTGATCTTGTTTACTTCCTGATGCCTCCTAATTCTATGTGTGGAAGCCGAAAGGAAATTCCTTCATGGTATTTCCAACAAGCTCCGATT	.((......(((((.....((.((((((((....(((((((((((((((((((((((..((...........)).))))).....))))....))))))))...)))..)))..)))))))).))...)))))....)).......	29014019	29014124	CTTGAAGGGACTGATCCTCGTCCGCGCAATTACATTATTGATCTTGTTTACTTCCTGATGCCTCCTAATTCTATGTGTGGAAGCCGAAAGGAAATTCCTTCATGGT	(.((((((((....(((((((((((((((((((((((..((...........)).))))).....))))....))))))))...)))..)))..)))))))).)..	Bdi-miRN197	29014019	29014039	CTTGAAGGGACTGATCCTCGT	Bdi-miRN197*	29014104	29014124	GAAAGGAAATTCCTTCATGGT		3
Bdi-MIRN198	PmiREN001367	MIRN198	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	13393280	13393365	-	CATCAGGAGTGTTCAGTGTGTTCAGTCAGATGGTTTGGCCTATCACGTGGATTATTTGATTCAACGCTCTGAAGCGCCAGCGGATG	...........(((((.(((((.((((((((((((..((.......)).)))))))))))).))))).))))).............	13393300	13393345	TTCAGTCAGATGGTTTGGCCTATCACGTGGATTATTTGATTCAACG	((.((((((((((((..((.......)).)))))))))))).))..	Bdi-miRN198	13393325	13393345	TTCAGTCAGATGGTTTGGCCT	Bdi-miRN198*	13393300	13393320	CGTGGATTATTTGATTCAACG		3
Bdi-MIRN199	PmiREN001368	MIRN199	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	18246077	18246190	+	AATTATTGCATTATACTCCCTCCGATCCAGAATAAGTGTCTCAGTTTTGAATTACGCCTAGTTCAAAACTGAGACACTTATTTTTGATCGGAGGAAGTACTTGATTATACTGAA	.............((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))).))))))))).))))...............	18246097	18246170	TCCGATCCAGAATAAGTGTCTCAGTTTTGAATTACGCCTAGTTCAAAACTGAGACACTTATTTTTGATCGGAGG	(((((((.((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))).)))))))..	Bdi-miRN199	18246150	18246170	ACACTTATTTTTGATCGGAGG	Bdi-miRN199*	18246097	18246117	TCCGATCCAGAATAAGTGTCT		3
Bdi-MIRN200	PmiREN001369	MIRN200	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	48934737	48934911	+	AATACGAGGCATCGGGGAAGCGCCATTGTCTTCGACCTGTCATGGTCGCGAGGGCTCCGACCTCAAGTCAGGTGACGGAGAGCCAGATTTTGGCTCGAGACACGATGTGACGAGGGCCGACGACGGGTTGCAATCGGGATGGAGGCAACGGCGGCGGCTGCAGAAATAGGTTGAG	.............(.((..(((((.(((((((((.((((....(.(((((..(((((((...(((.(((..(((.(...((((((.....))))))..).)))))).))))).)))))..)).))).)......)))).))))))))).))).))..)).)..............	48934757	48934891	CGCCATTGTCTTCGACCTGTCATGGTCGCGAGGGCTCCGACCTCAAGTCAGGTGACGGAGAGCCAGATTTTGGCTCGAGACACGATGTGACGAGGGCCGACGACGGGTTGCAATCGGGATGGAGGCAACGGCGGC	((((.(((((((((.((((....(.(((((..(((((((...(((.(((..(((.(...((((((.....))))))..).)))))).))))).)))))..)).))).)......)))).))))))))).))).).	Bdi-miRN200	48934871	48934891	CGGGATGGAGGCAACGGCGGC	Bdi-miRN200*	48934757	48934777	CGCCATTGTCTTCGACCTGTC		3
Bdi-MIRN201	PmiREN001370	MIRN201	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	373635	373742	+	TCGTATATGTCATAAAATTGCTCTGTATCTATGAGCACGGTGAAACTAAAACCCCATCCTGTATGGATCACGTCTCATAACCGAAGTAGTTTGGACATCTGACTCCCA	.......((((...(((((((((.((...((((((.(((.(((.............(((.....))))))))))))))))).).)))))))).))))...........	373655	373722	CTCTGTATCTATGAGCACGGTGAAACTAAAACCCCATCCTGTATGGATCACGTCTCATAACCGAAGTA	(((.((...((((((.(((.(((.............(((.....))))))))))))))))).).))..	Bdi-miRN201	373655	373675	CTCTGTATCTATGAGCACGGT	Bdi-miRN201*	373702	373722	TCACGTCTCATAACCGAAGTA		3
Bdi-MIRN202	PmiREN001371	MIRN202	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	35416172	35416283	-	ATACAACCTACTTCCGTGTATTGATTCAGATCAGTCGTTGTACTTCCACACATCTTCAAGTGGATAGAAGGAGGATTAAGATGCGGTCAACACGAAGATGAAGATTTGGAAG	..........((((.((((..(((((((..(.((((.((.(.(((((((..........))))).)).).)).)))).)..)).)))))))))))))...............	35416192	35416263	TTGATTCAGATCAGTCGTTGTACTTCCACACATCTTCAAGTGGATAGAAGGAGGATTAAGATGCGGTCAACA	.(((((((..(.((((.((.(.(((((((..........))))).)).).)).)))).)..)).)))))...	Bdi-miRN202	35416243	35416263	TTGATTCAGATCAGTCGTTGT	Bdi-miRN202*	35416192	35416212	AGGATTAAGATGCGGTCAACA		3
Bdi-MIRN203	PmiREN001372	MIRN203	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	34917381	34917608	-	GTTCATATATGCAACAGTCGCTAGCTTGTTCTGCCCGATGATTTTGATTTCGTTTATAAAGTCCTCTCATCCTCCATACTACATGAATCAGTAGGAACACCCTATAGCCTTGTGGCCATGGGAGGTATCGGGATGCAAATCCTACCATTGTGAAGTATCATAGTAAGGGACATGACTTTTGAGGCCTCGGGCTACAGATGAAGCGGTATCAACACTGCGCATCAAGAC	(((.....((((..((((.(((.((((..(((((((((.((........))((((..((((((.((((....(((.((((.........)))))))....(((((.(((....))).))))).(((...(((((....))))))))(((((((....)))))))..))))...))))))..)))).))))))...)))..)))))))......)))).))))...)))	34917401	34917588	CTAGCTTGTTCTGCCCGATGATTTTGATTTCGTTTATAAAGTCCTCTCATCCTCCATACTACATGAATCAGTAGGAACACCCTATAGCCTTGTGGCCATGGGAGGTATCGGGATGCAAATCCTACCATTGTGAAGTATCATAGTAAGGGACATGACTTTTGAGGCCTCGGGCTACAGATGAAGCGGTA	((.((((..(((((((((.((........))((((..((((((.((((....(((.((((.........)))))))....(((((.(((....))).))))).(((...(((((....))))))))(((((((....)))))))..))))...))))))..)))).))))))...)))..))))))..	Bdi-miRN203	34917401	34917421	CGGGCTACAGATGAAGCGGTA	Bdi-miRN203*	34917568	34917588	CTAGCTTGTTCTGCCCGATGA		3
Bdi-MIRN204	PmiREN001373	MIRN204	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	2066404	2066522	-	CAGAGGGAAATAGGGGAATTCAGAGGAAATGGCTGGAACAGAGGATCGCACAGCATCGCTGATTGGTCTTTTACCACGTCCCAGTCAGATTCCTTCTCAGGTGTGCTGGCTTGGTAGCA	......................((((((.(((((((.(((((((((((..((((...))))..))))))))).....)).)))))))..))))))................((....))	2066424	2066502	CAGAGGAAATGGCTGGAACAGAGGATCGCACAGCATCGCTGATTGGTCTTTTACCACGTCCCAGTCAGATTCCTTCTCA	..((((((.(((((((.(((((((((((..((((...))))..))))))))).....)).)))))))..))))))....	Bdi-miRN204	2066482	2066502	CAGAGGAAATGGCTGGAACAG	Bdi-miRN204*	2066424	2066444	TCCCAGTCAGATTCCTTCTCA		3
Bdi-MIRN205	PmiREN001374	MIRN205	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	574178	574278	-	GGGAGATTAAGAATAGATCGCTGGTCTGGTATGTAGGACGGGATGGGGAGGAGCACATCTGATGTTCATTGCAGATCAGCAGATCAGCAACCGAATAAAGA	...............(((((((((((((..(((.((.(..(((((.(......).)))))..).)))))..))))))))).))))................	574198	574258	CTGGTCTGGTATGTAGGACGGGATGGGGAGGAGCACATCTGATGTTCATTGCAGATCAGCA	((((((((..(((.((.(..(((((.(......).)))))..).)))))..))))))))..	Bdi-miRN205	574238	574258	CTGGTCTGGTATGTAGGACGG	Bdi-miRN205*	574198	574218	GATGTTCATTGCAGATCAGCA		3
Bdi-MIRN206	PmiREN001376	MIRN206	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	13282754	13282927	+	GTCTCGCAGCAAGGAAGATAGCTGGCTAGTTGCTCCGTGGGATTTGGAGTCTTCAGGAATATTTGCATTTCCATGCGCACCCTCGTTGTAAGGCGGAGCCAACCATGCGGCTTGCGCCGTGAAAATCAAACTTCCACGGATGATACTTCAGCGGACAACTGAATGCTTCTAAGA	(....(((...((.......(((((..(((..(((((((((((((((....((((((((.........)))).((((.((....)))))).(((((((((........))))).)))).))))..))))).))))))))).)..))))))))......))...)))..).....	13282774	13282907	GCTGGCTAGTTGCTCCGTGGGATTTGGAGTCTTCAGGAATATTTGCATTTCCATGCGCACCCTCGTTGTAAGGCGGAGCCAACCATGCGGCTTGCGCCGTGAAAATCAAACTTCCACGGATGATACTTCAGCGG	(((((..(((..(((((((((((((((....((((((((.........)))).((((.((....)))))).(((((((((........))))).)))).))))..))))).))))))))).)..))))))))..	Bdi-miRN206	13282887	13282907	CCACGGATGATACTTCAGCGG	Bdi-miRN206*	13282774	13282794	GCTGGCTAGTTGCTCCGTGGG		3
Bdi-MIRN207	PmiREN001377	MIRN207	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	14839508	14839705	+	ATCTTGCTCTAACAGTACAACAGAGATGAGATAAGTAGGACTTGGAGGGGTAGTCAGATAAGTTGTATCAATATGAGTGTAATTACTATGATCTCATTTGAAGTTAGCATCGTTCAACATGTCGGGGAACGTTAAAATACTTTTTTTTATTAATTCTCTCACTTGACTCATCTCATTCCACACTGTTGCTTTCAAACC	.........(((((((......((((((((.(((((.(((....((((.(((((......(.(((((....))))).)......)))))..))))....(((((......(((((..(.....)..))))).......))))).............))).))))).)))))))).......)))))))..........	14839528	14839685	CAGAGATGAGATAAGTAGGACTTGGAGGGGTAGTCAGATAAGTTGTATCAATATGAGTGTAATTACTATGATCTCATTTGAAGTTAGCATCGTTCAACATGTCGGGGAACGTTAAAATACTTTTTTTTATTAATTCTCTCACTTGACTCATCTCATTC	..((((((((.(((((.(((....((((.(((((......(.(((((....))))).)......)))))..))))....(((((......(((((..(.....)..))))).......))))).............))).))))).))))))))....	Bdi-miRN207	14839528	14839548	CAGAGATGAGATAAGTAGGAC	Bdi-miRN207*	14839665	14839685	CTCACTTGACTCATCTCATTC		3
Bdi-MIRN208	PmiREN001378	MIRN208	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	2601184	2601351	+	ACATGACGTTGTAAATAAGTGCTCAGTGTGACTCCTTTGTTCATCTACACCTTCATGGGGCAGCTGCAGGACCCAAATTAGATTACTAGGAACAGTTGGTTACCGACGTGAAATGATCCTATTGCAGGCAAAGGGTCACCTCGGACAAACGAGCAATTCATCTGCTGC	...................((((.((.(((((.(((((((.........(((....)))....((((((.......((((..((((..(((((.....))).))...))))..))))....)))))))))))))))))))).)).)).....................	2601204	2601331	GCTCAGTGTGACTCCTTTGTTCATCTACACCTTCATGGGGCAGCTGCAGGACCCAAATTAGATTACTAGGAACAGTTGGTTACCGACGTGAAATGATCCTATTGCAGGCAAAGGGTCACCTCGGACAA	(((.((.(((((.(((((((.........(((....)))....((((((.......((((..((((..(((((.....))).))...))))..))))....)))))))))))))))))))).)).)..	Bdi-miRN208	2601311	2601331	GCAAAGGGTCACCTCGGACAA	Bdi-miRN208*	2601204	2601224	GCTCAGTGTGACTCCTTTGTT		3
Bdi-MIRN209	PmiREN001379	MIRN209	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	45894517	45894628	-	CACCTATCGGGCCGTTTGCTCCCGGGCTGTAGCGAGTCGGTCCTGGCTCTCTGATCCGAAGGCCGAACTAGCTCGCTTTGGCAGCTCGTGTTGGCCACAATGACTGGCAGTT	.........(((((...((...(((((((((((((((.(((..(((((.((......)).))))).))).)))))))...)))))))).)))))))................	45894537	45894608	CCCGGGCTGTAGCGAGTCGGTCCTGGCTCTCTGATCCGAAGGCCGAACTAGCTCGCTTTGGCAGCTCGTGTT	..(((((((((((((((.(((..(((((.((......)).))))).))).)))))))...))))))))....	Bdi-miRN209	45894588	45894608	CCCGGGCTGTAGCGAGTCGGT	Bdi-miRN209*	45894537	45894557	CTCGCTTTGGCAGCTCGTGTT		3
Bdi-MIRN210	PmiREN001380	MIRN210	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	44807339	44807434	-	TCCTAAACAGTCTTCTAATCGACCAGCTGTGGGTTCAAATTTGAGGCAGTGTGCAAGTGGACACACGGATGGTCTGATGAGATGTTTGAAGACGGC	...((((((.((((...((((((((.(((((.(((((..((((..((...)).))))))))).))))).))))).)))))))))))))........	44807359	44807414	GACCAGCTGTGGGTTCAAATTTGAGGCAGTGTGCAAGTGGACACACGGATGGTCTG	(((((.(((((.(((((..((((..((...)).))))))))).))))).)))))..	Bdi-miRN210	44807359	44807379	AGTGGACACACGGATGGTCTG	Bdi-miRN210*	44807394	44807414	GACCAGCTGTGGGTTCAAATT		3
Bdi-MIRN211	PmiREN001381	MIRN211	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	43966916	43967180	-	ACTTCAATTGCCTGCCAGCTTCAGTAGAAGCCGAAGTTAGGAGCTATGGAGGAGGAAAGCAACAAGATAATAAGGGTCGTCAGTGATCGAGTTGTTAACTACACGGATCGATCGATTGGAAGTAAAGGAAGACGTTAAGTGCAGGCACTTGCATGCGCCTGAAGTTTTGATTCATACTTTTTCTAAGTTCTATTTACCGGTTTTGTATCGAGCGGCTGCTAGTTGGTACTTACATTACACAAGTTTACAG	...((((((((..(((.((((.....(((((((......((((((.(((((((((..........(((.......))).(((((((((((.((((.......)))).)))))).))))).........(((((.(((.(((((.((....)).))))).))).)))))........)))))))))))))))......))))))).....))))))).)).))))))........................	43966936	43967160	TCAATTGCCTGCCAGCTTCAGTAGAAGCCGAAGTTAGGAGCTATGGAGGAGGAAAGCAACAAGATAATAAGGGTCGTCAGTGATCGAGTTGTTAACTACACGGATCGATCGATTGGAAGTAAAGGAAGACGTTAAGTGCAGGCACTTGCATGCGCCTGAAGTTTTGATTCATACTTTTTCTAAGTTCTATTTACCGGTTTTGTATCGAGCGGCTGCTAGTTGGTA	((((((((..(((.((((.....(((((((......((((((.(((((((((..........(((.......))).(((((((((((.((((.......)))).)))))).))))).........(((((.(((.(((((.((....)).))))).))).)))))........)))))))))))))))......))))))).....))))))).)).))))))..	Bdi-miRN211	43966936	43966956	TCGAGCGGCTGCTAGTTGGTA	Bdi-miRN211*	43967140	43967160	TCAATTGCCTGCCAGCTTCAG		3
Bdi-MIRN212	PmiREN001382	MIRN212	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	4294254	4294494	+	CAGTCATTTGTTTTTTTGTTGAAGTGTTGGTAGCTGGCTATAACATGCATAGATCAAAGTTAGAATGTGAGAAAAGAAATTTGTGGGAACAGGAGACACCAGGAGTAGCGAACGAGCTTAAGTCTCCAGTGCTTCATTAGTAAAATCAAATAAGTAGTGAGATTCCGGTCGCCAGATCCCTGACCGCTGGAGACGAATCGCCAGATCAAGTTCGGCTTCAAAGGTATCAAGACAGCGGCGC	(.((....((((((..(((((((((.(((((..(((((.........((((..((.......)).)))).........((((.(((............))).))))(((......)))...((((((((((.(((((((.(...........).))))))).....((((....))))......)))))))))).....)))))))))).....)))))))...))..)))))))))....	4294274	4294474	GAAGTGTTGGTAGCTGGCTATAACATGCATAGATCAAAGTTAGAATGTGAGAAAAGAAATTTGTGGGAACAGGAGACACCAGGAGTAGCGAACGAGCTTAAGTCTCCAGTGCTTCATTAGTAAAATCAAATAAGTAGTGAGATTCCGGTCGCCAGATCCCTGACCGCTGGAGACGAATCGCCAGATCAAGTTCGGCTTCAA	(((((.(((((..(((((.........((((..((.......)).)))).........((((.(((............))).))))(((......)))...((((((((((.(((((((.(...........).))))))).....((((....))))......)))))))))).....)))))))))).....)))))..	Bdi-miRN212	4294454	4294474	CCAGATCAAGTTCGGCTTCAA	Bdi-miRN212*	4294274	4294294	GAAGTGTTGGTAGCTGGCTAT		3
Bdi-MIRN213	PmiREN001383	MIRN213	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	13208300	13208550	-	AAAGTCGAAAGCTCATGCTTGTCCACAGAGAGGAGGAGAGGCCAAAAGCGGATTAGAACGGTGGCCCTAAAAATAACCTGCAAAAAGTAAACAACTCTAGCCCTGTTAAAAATAATATCATTTCAACAATTCCAAATAACCCAACAGCAGACACTCTCGCCCATATCAGCCGGATGCAACTTATCTGGCCAATTTGTGAGTCGCTCGTTTTCTCGCATGTAGGAGGCATGAAGGCACGGCAGCCGCGACG	...((((.....(((((((..(((((((((((((.(((.(((.....(((((((..(((((.(((............((......))............)))))))).......................................(((((...))).))........((((((((.....)))))))).)))))))..))).))).)))))))...))).)))))))))).(((......))).)))). 	13208320	13208530	CTTGTCCACAGAGAGGAGGAGAGGCCAAAAGCGGATTAGAACGGTGGCCCTAAAAATAACCTGCAAAAAGTAAACAACTCTAGCCCTGTTAAAAATAATATCATTTCAACAATTCCAAATAACCCAACAGCAGACACTCTCGCCCATATCAGCCGGATGCAACTTATCTGGCCAATTTGTGAGTCGCTCGTTTTCTCGCATGTAGGAGGCA	((..(((((((((((((.(((.(((.....(((((((..(((((.(((............((......))............)))))))).......................................(((((...))).))........((((((((.....)))))))).)))))))..))).))).)))))))...))).)))))..	Bdi-miRN213	13208320	13208340	TTTTCTCGCATGTAGGAGGCA	Bdi-miRN213*	13208510	13208530	CTTGTCCACAGAGAGGAGGAG		3
Bdi-MIRN214a	PmiREN001385	MIRN214	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	48771784	48771982	+	TTTCGGCCCCATGTCCGGTCCGCCCCCTTCGCCGGTCCTCCTCCGTCGCCGGTCCGCCCCCGTTTCCGGTCAGCCCCCTTCGTCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCCGCCTCTGTCGTCGCCGGCCCTTTGTCCCCCGCAGTTGGACCGGCTACGGAGGAGGACCGGTGAAGGGGGCGGACTGGACATGGGGCCGGACCG	.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((..(((....)))...))......((.(((.......))).))...(((.((..(....)..)).)))...((((.....))))..)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))...	48771804	48771962	CGCCCCCTTCGCCGGTCCTCCTCCGTCGCCGGTCCGCCCCCGTTTCCGGTCAGCCCCCTTCGTCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCCGCCTCTGTCGTCGCCGGCCCTTTGTCCCCCGCAGTTGGACCGGCTACGGAGGAGGACCGGTGAAGGGGGCGGA	((((((((((((((((((((((((((.((((((((((..(((....)))...))......((.(((.......))).))...(((.((..(....)..)).)))...((((.....))))..)))))))).))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN214a	48771942	48771962	AGGACCGGTGAAGGGGGCGGA	Bdi-miRN214a*	48771804	48771824	CGCCCCCTTCGCCGGTCCTCC		3
Bdi-MIRN214b	PmiREN001392	MIRN214	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	31040516	31040714	+	GTTCGGCTCCATGTCCGGTCCGCCCCCTTCGCCAGTCCTCCTCCGTCGCCGGTCCGCCCCCGTTTCCGGTCAGCCCCTTTCGTCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCCGCCTCTGTCGTCGCCGGCCCTCGGCCCCCCGCAGCTGGACCGGCTACGGAGGAGGACCGGTGAAGGGGGCGGACCGGACATGGGGCCGGACCG	(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((..(((....)))...))......((.(((.......))).))...........((((....((((.....)))).....))))..)))))))).)))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))..	31040536	31040694	CGCCCCCTTCGCCAGTCCTCCTCCGTCGCCGGTCCGCCCCCGTTTCCGGTCAGCCCCTTTCGTCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCCGCCTCTGTCGTCGCCGGCCCTCGGCCCCCCGCAGCTGGACCGGCTACGGAGGAGGACCGGTGAAGGGGGCGGA	(((((((((((((.((((((((((((.((((((((((..(((....)))...))......((.(((.......))).))...........((((....((((.....)))).....))))..)))))))).)))))))))))).)))))))))))))..	Bdi-miRN214b	31040674	31040694	AGGACCGGTGAAGGGGGCGGA	Bdi-miRN214b*	31040536	31040556	CGCCCCCTTCGCCAGTCCTCC		3
Bdi-MIRN214c	PmiREN001393	MIRN214	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	50189116	50189314	+	GTTCGGCCCCATGTCTGGTCCGCCCCCTTCGCCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCCGCCCCCGTTTCCGGTCAGCCCCCTTCGTCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCCGCCTCTGTCGTCGCCGGCCCTCGGTCCCCCGCAGCTGGACCGGCTACGGAGGAGGACCGGTGAAGGGGGCGGACCGGACATGGGGCCGGACCG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((((..(((....)))...........((.(((.......))).)).(((...(((..((....))..)))...))).........)).)))).))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	50189136	50189294	CGCCCCCTTCGCCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCCGCCCCCGTTTCCGGTCAGCCCCCTTCGTCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCCGCCTCTGTCGTCGCCGGCCCTCGGTCCCCCGCAGCTGGACCGGCTACGGAGGAGGACCGGTGAAGGGGGCGGA	((((((((((((((((((((((((((.(((.((((((..(((....)))...........((.(((.......))).)).(((...(((..((....))..)))...))).........)).)))).))).))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN214c	50189274	50189294	AGGACCGGTGAAGGGGGCGGA	Bdi-miRN214c*	50189136	50189156	CGCCCCCTTCGCCGGTCCTCC		3
Bdi-MIRN214d	PmiREN001400	MIRN214	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	16665584	16665782	-	GTTCGGCCCCATGTCCGGTCCGCCCCCTTCGCCGGTCCTCCTCCGTCGCCGGTCCGCCTCCGTTTCCGGTCAGCCCCCTTCGTCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCTGCCTCTGTCGTCGCCGGCCCTTGGTCCCCCGCAGCTGGACCGGCTACGGAGGAGGACCGGTGAAGGGGGCGGACTGGACATGGGGCCGGACCG	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((.((...((((((.((......((.(((.......))).))..((.(.......).))..)).))))...)).....)).)).))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	16665604	16665762	CGCCCCCTTCGCCGGTCCTCCTCCGTCGCCGGTCCGCCTCCGTTTCCGGTCAGCCCCCTTCGTCGGTCCTCCTCCGTCGCCCGTCTGCCTCTGTCGTCGCCGGCCCTTGGTCCCCCGCAGCTGGACCGGCTACGGAGGAGGACCGGTGAAGGGGGCGGA	((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((.((...((((((.((......((.(((.......))).))..((.(.......).))..)).))))...)).....)).)).))))))))).))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN214d	16665604	16665624	AGGACCGGTGAAGGGGGCGGA	Bdi-miRN214d*	16665742	16665762	CGCCCCCTTCGCCGGTCCTCC		3
Bdi-MIRN215a	PmiREN001386	MIRN215	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	63126715	63126919	+	TTTCCGATAACCCGGGGCCACCAGTCAGATGCCATGTCATGTTCCCCAACACGTTTTCGACGCCTGTTTTCGATACCACGTCAGTTTCTACCCAACCCAAGACATCACCAGCTGTCACTAGAGCAAAGGCAGCTGACGTGGCATCGAAAACGGGTCGGGGAAGATGACGTGGCATCTGACTGGTGGCCCCGCATTGTCGGAAACA	((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((.((((((....((((...))))((((((((((((.(((((((((((.((...........((((........))))...........)).))))))))))).))))))))))))..)))))).))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))..	63126735	63126899	CCAGTCAGATGCCATGTCATGTTCCCCAACACGTTTTCGACGCCTGTTTTCGATACCACGTCAGTTTCTACCCAACCCAAGACATCACCAGCTGTCACTAGAGCAAAGGCAGCTGACGTGGCATCGAAAACGGGTCGGGGAAGATGACGTGGCATCTGACTGGTG	((((((((((((((((((((.((((((....((((...))))((((((((((((.(((((((((((.((...........((((........))))...........)).))))))))))).))))))))))))..)))))).))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN215a	63126879	63126899	TGACGTGGCATCTGACTGGTG	Bdi-miRN215a*	63126735	63126755	CCAGTCAGATGCCATGTCATG		3
Bdi-MIRN215b	PmiREN001402	MIRN215	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	13354819	13355036	+	TTTCTGACAATGCGGGGCCACCAATCAGATGCCACGTCATCTTCACCGACCCGTTTTCGATGCCCGTTTTTGACTCCACGCTAGCTGCCTTTGCTCTAGTGACAGCTGGTGATGTCTTGGGTCGGGTAGAAACTGACGTGGCATCGAAAGCGGACGTCGAAAACATGTTGGGGAAGATGACGTGGCATCTGACTGGTGCCCCCCCGGGTCATCGGAAA	(((((((..((.(((((.(((((.((((((((((((((((((((.(((((..((((((((((.((((((((((..(((((.(((((((((..((((....((((........))))..)))).))))))...))).)))))..)))))))))).))))))))))..))))).)))))))))))))))))))).)))))...))))).))..)))))))	13354839	13355016	CCAATCAGATGCCACGTCATCTTCACCGACCCGTTTTCGATGCCCGTTTTTGACTCCACGCTAGCTGCCTTTGCTCTAGTGACAGCTGGTGATGTCTTGGGTCGGGTAGAAACTGACGTGGCATCGAAAGCGGACGTCGAAAACATGTTGGGGAAGATGACGTGGCATCTGACTGGTG	(((.((((((((((((((((((((.(((((..((((((((((.((((((((((..(((((.(((((((((..((((....((((........))))..)))).))))))...))).)))))..)))))))))).))))))))))..))))).)))))))))))))))))))).)))..	Bdi-miRN215b	13354996	13355016	TGACGTGGCATCTGACTGGTG	Bdi-miRN215b*	13354839	13354859	CCAATCAGATGCCACGTCATC		3
Bdi-MIRN215c	PmiREN001415	MIRN215	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	64746624	64746840	-	TTTCTAACAACGCAGGGCCACCAATCAGATGCCACATCATCTTCCCCGACCCGTTTCCGATGTCTGTTTTTATGCCATGTCAGCTGCCTTTGCTCTAGTGACAGCTGGTGATGTCTTGGGTCGGGTAGAAACTGACGTTGTATCGAAAACGAGCGTCGAAAATGTGTTGGGGGAGATGACGTGGCATCTGACTGGTGGCCCTGGGTTATCGGAACTG	((((....(((.(((((((((((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((.((((((.(((((((((((.(((((((((((((..((((....((((........))))..)))).))))))...))))))).)))).))))))).)))))).))))).)))))))))))))).))))))))))).))))))))))).)))...))))...	64746644	64746820	CCAATCAGATGCCACATCATCTTCCCCGACCCGTTTCCGATGTCTGTTTTTATGCCATGTCAGCTGCCTTTGCTCTAGTGACAGCTGGTGATGTCTTGGGTCGGGTAGAAACTGACGTTGTATCGAAAACGAGCGTCGAAAATGTGTTGGGGGAGATGACGTGGCATCTGACTGGTG	(((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((.((((((.(((((((((((.(((((((((((((..((((....((((........))))..)))).))))))...))))))).)))).))))))).)))))).))))).)))))))))))))).))))))))))).)))..	Bdi-miRN215c	64746644	64746664	TGACGTGGCATCTGACTGGTG	Bdi-miRN215c*	64746800	64746820	CCAATCAGATGCCACATCATC		3
Bdi-MIRN215d	PmiREN001420	MIRN215	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	9332722	9332913	+	TTTCCGACAACGCGGGGCCACCAATCAGATGCCACGACATCTTCCCCGACCCTTTTTCGACGCCACGTCAGCTGCCTTTGCTCTAATGACAACTGGTGATGTCCTGGGTTAGGTAGAAACGGACGTGGCATCGAAAACGTGTTGGGGAAGATGACGTGGCATCTGACTGGTGGCCTCAGGTTATCGGAAACA	(((((((.(((..((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((.((((((((..((((((..((((....((((.(....).))))..)))).)))))).....)))))))).))))))).).))))))))))))).)))))))))))).))))))))))..))).)))))))..	9332742	9332893	CCAATCAGATGCCACGACATCTTCCCCGACCCTTTTTCGACGCCACGTCAGCTGCCTTTGCTCTAATGACAACTGGTGATGTCCTGGGTTAGGTAGAAACGGACGTGGCATCGAAAACGTGTTGGGGAAGATGACGTGGCATCTGACTGGTG	(((.((((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((.((((((((..((((((..((((....((((.(....).))))..)))).)))))).....)))))))).))))))).).))))))))))))).)))))))))))).)))..	Bdi-miRN215d	9332873	9332893	TGACGTGGCATCTGACTGGTG	Bdi-miRN215d*	9332742	9332762	CCAATCAGATGCCACGACATC		3
Bdi-MIRN216	PmiREN001389	MIRN216	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	12164090	12164222	+	GTTGAGAGAATTTCATATGTGCCACTTAAAATTTGCCCGGATGCCCAAATACCACTGAGAATTGGAAACAAGAATTTGGACATTTGGACATCCGGACAAACTTTGAGTGGCAAATATGGAATTCTCTCTGTTT	...(((((((((((((((.(((((((((((.((((.(((((((.((((((.(((..((...(((....)))...)))))..)))))).))))))).)))).))))))))))).))))))))))))))).....	12164110	12164202	GCCACTTAAAATTTGCCCGGATGCCCAAATACCACTGAGAATTGGAAACAAGAATTTGGACATTTGGACATCCGGACAAACTTTGAGTGGCAA	((((((((((.((((.(((((((.((((((.(((..((...(((....)))...)))))..)))))).))))))).)))).))))))))))..	Bdi-miRN216	12164182	12164202	CGGACAAACTTTGAGTGGCAA	Bdi-miRN216*	12164110	12164130	GCCACTTAAAATTTGCCCGGA		3
Bdi-MIRN217	PmiREN001390	MIRN217	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	51140012	51140134	-	CAGGGTCTCACTTATATCCCGCTTCTAAGTCAATCTCTAAATCCACGAGTCAAATTCAATGCTTATATTTGACTTGTGGATTTGGAGATTGACTTAGAAGCGGGATTAGGCGGATCCTGCTTG	(((((((.(.((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...........)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))....	51140032	51140114	GCTTCTAAGTCAATCTCTAAATCCACGAGTCAAATTCAATGCTTATATTTGACTTGTGGATTTGGAGATTGACTTAGAAGCGG	(((((((((((((((((((((((((((((((((((...........)))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN217	51140032	51140052	TGGAGATTGACTTAGAAGCGG	Bdi-miRN217*	51140094	51140114	GCTTCTAAGTCAATCTCTAAA		3
Bdi-MIRN218a	PmiREN001391	MIRN218	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	26955791	26956014	+	CAAGTTGACCGCCACGTTGGCTAACTGCAGGGTCGCTGGAAATTGCAAATAGGCCCAACCTTTCCATTTTACTCATCCAGAGGTCCTTTCCCCGATTCTTCCGACCATCCAGAGGTCCTTTCCCCGATTCTTCCAACCCCGCTTGAAATTGCAAAGTGGAAAGGTTGGGCCTATTTGCAATTTTCAGCAACTCGGCAGTTAGCCAACGTGGCAGTCAACTTGCC	(((((((((.((((((((((((((((((.((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((........(((((.(((((....(((((....))..))).))))).)))))...................((........)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))))))))))))))).)))))))))..	26955811	26955994	CTAACTGCAGGGTCGCTGGAAATTGCAAATAGGCCCAACCTTTCCATTTTACTCATCCAGAGGTCCTTTCCCCGATTCTTCCGACCATCCAGAGGTCCTTTCCCCGATTCTTCCAACCCCGCTTGAAATTGCAAAGTGGAAAGGTTGGGCCTATTTGCAATTTTCAGCAACTCGGCAGTTAGCC	((((((((.((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((........(((((.(((((....(((((....))..))).))))).)))))...................((........)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))))..	Bdi-miRN218a	26955974	26955994	TCAGCAACTCGGCAGTTAGCC	Bdi-miRN218a*	26955811	26955831	CTAACTGCAGGGTCGCTGGAA		3
Bdi-MIRN218b	PmiREN001395	MIRN218	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	46557143	46557334	+	CAAGTTGACTGCCACGTTGGCTAACTGCCGGGTCGCTAGAAATTGCAAATAGGCCCAGTCTTTCCATTTTACTCATCCCGAGGTCCTTTTCCCGATTCTCCCCACCCCGCTTGAAATTGCAAAATGGAAAGGTTAGGCCTATTTGCAATTTTCAGCAACTCGGCAGTTAGCCATCGTGGCAGTCAACTTGCC	((((((((((((((((.((((((((((((((((.(((.(((((((((((((((((.((((((((((((((.........((((((........)).))))........((........)))))))))))))))).))))))))))))))))).))).)))))))))))))))).))))))))))))))))..	46557163	46557314	CTAACTGCCGGGTCGCTAGAAATTGCAAATAGGCCCAGTCTTTCCATTTTACTCATCCCGAGGTCCTTTTCCCGATTCTCCCCACCCCGCTTGAAATTGCAAAATGGAAAGGTTAGGCCTATTTGCAATTTTCAGCAACTCGGCAGTTAGCC	(((((((((((((.(((.(((((((((((((((((.((((((((((((((.........((((((........)).))))........((........)))))))))))))))).))))))))))))))))).))).)))))))))))))..	Bdi-miRN218b	46557294	46557314	TCAGCAACTCGGCAGTTAGCC	Bdi-miRN218b*	46557163	46557183	CTAACTGCCGGGTCGCTAGAA		3
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Bdi-MIRN221b	PmiREN001464	MIRN221	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	35935092	35935356	-	GTATGAAAGCAATACTCTAACCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGGTA	((((.......))))....(((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))).	35935112	35935336	CCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGG	((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))	Bdi-miRN221b	35935112	35935131	AGGGCTATAGCTCAGTTCGG	Bdi-miRN221b*	35935316	35935336	CCACTGAGTTAAGTAGGCAAT		3
Bdi-MIRN221c	PmiREN001470	MIRN221	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	11506025	11506289	+	GTATGAAAGCAATACTCTAACCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGGTA	((((.......))))....(((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))).	11506045	11506269	CCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGG	((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))	Bdi-miRN221c	11506250	11506269	AGGGCTATAGCTCAGTTCGG	Bdi-miRN221c*	11506045	11506065	CCACTGAGTTAAGTAGGCAAT		3
Bdi-MIRN221d	PmiREN001472	MIRN221	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	28003543	28003807	+	GTATGAAAGCAATACTCTAACCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGGTA	((((.......))))....(((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))).	28003563	28003787	CCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGG	((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))	Bdi-miRN221d	28003768	28003787	AGGGCTATAGCTCAGTTCGG	Bdi-miRN221d*	28003563	28003583	CCACTGAGTTAAGTAGGCAAT		3
Bdi-MIRN221e	PmiREN001473	MIRN221	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	28036307	28036571	+	GTATGAAAGCAATACTCTAACCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGGTA	((((.......))))....(((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))).	28036327	28036551	CCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGG	((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))	Bdi-miRN221e	28036532	28036551	AGGGCTATAGCTCAGTTCGG	Bdi-miRN221e*	28036327	28036347	CCACTGAGTTAAGTAGGCAAT		3
Bdi-MIRN221f	PmiREN001475	MIRN221	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	7280666	7280930	+	CGCCGTATGCAATACTCTAACCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGGTA	....((((...))))....(((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))).	7280686	7280910	CCACTGAGTTAAGTAGGCAATTTATGATCACAAAGGAAGACCCATTACTTCGATCGATTATATATCGAATCCCTTTTCTAAGCAATAACGCTTCCTTATTGGTATGTTATATACTAAACAGATACATATTTAAAGAGATACCCTCTGGCATTAGAGAATATTCATCTTGACAATAAATTATCTATATGTTAAGATATCTCTGATAAGGGCTATAGCTCAGTTCGG	((((((((((..((((.(....(((((((...(((((((....(((.(((.(((((((.....)))))........)).))).)))....))))))).((((((((...))))))))...))).)))).....((((.....))))...((((((((......((((((((((((.......))).))))))))).))))))))...).))))))))))))..))	Bdi-miRN221f	7280891	7280910	AGGGCTATAGCTCAGTTCGG	Bdi-miRN221f*	7280686	7280706	CCACTGAGTTAAGTAGGCAAT		3
Bdi-MIRN222	PmiREN001404	MIRN222	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	2095479	2095636	-	AGGTGCAACATGGTGACTCTCAGGGTACCCTTTGATCCTCCTTAGTTAAAACAAATGAATTAGTTTTTCAAAAAATTGTGTCATTTTAAAACTTTATTTCATTTGGTTAAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACTCTGAGGGTCATAAACTTGCAGCTCT	((.(((((....((((((((((((((((((.((((((((((((((((.(..((((((((..((((((....(((((......)))))))))))....))))))))..).)))))))))))))))).))))))))))))))))))....))))).))..	2095499	2095616	CAGGGTACCCTTTGATCCTCCTTAGTTAAAACAAATGAATTAGTTTTTCAAAAAATTGTGTCATTTTAAAACTTTATTTCATTTGGTTAAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACTCTGAG	((((((((((.((((((((((((((((.(..((((((((..((((((....(((((......)))))))))))....))))))))..).)))))))))))))))).))))))))))..	Bdi-miRN222	2095499	2095519	AGGGTCAATGGGTACTCTGAG	Bdi-miRN222*	2095596	2095616	CAGGGTACCCTTTGATCCTCC		3
Bdi-MIRN223	PmiREN001405	MIRN223	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	41241532	41241645	-	CAAGTTTCAATATTACTCCCTCCGTCCCGAATTAACTGACGTGGATTTGTATAAGAATCTATAGAAATCTATGTCAGTTAATTCAGGATGGAGAGAGTACTTTTCAGAGTCTTT	.............(((((.((((((((.((((((((((((((((((((.((((......)))).)))))))))))))))))))).)))))))).)))))...............	41241552	41241625	TCCGTCCCGAATTAACTGACGTGGATTTGTATAAGAATCTATAGAAATCTATGTCAGTTAATTCAGGATGGAGA	(((((((.((((((((((((((((((((.((((......)))).)))))))))))))))))))).)))))))..	Bdi-miRN223	41241552	41241572	TCAGTTAATTCAGGATGGAGA	Bdi-miRN223*	41241605	41241625	TCCGTCCCGAATTAACTGACG		3
Bdi-MIRN224	PmiREN001408	MIRN224	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	19472699	19472815	-	TTTTAGTATATAAAACTCCCTCTGGTCCTAAATTCTTGCCGTTGTTTTAGTTCAACAAATTTTAACTAAATCAACGACAAGAATTTAGGATCGGAGGGTGTAGATTTTAAATATGAA	.................(((((((((((((((((((((.(((((.(((((((.((.....)).))))))).))))).))))))))))))))))))))).......((((....))))	19472719	19472795	TCTGGTCCTAAATTCTTGCCGTTGTTTTAGTTCAACAAATTTTAACTAAATCAACGACAAGAATTTAGGATCGGAGG	((((((((((((((((((.(((((.(((((((.((.....)).))))))).))))).))))))))))))))))))..	Bdi-miRN224	19472776	19472795	TCTGGTCCTAAATTCTTGCC	Bdi-miRN224*	19472719	19472739	ACAAGAATTTAGGATCGGAGG		3
Bdi-MIRN225	PmiREN001409	MIRN225	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	17165562	17165708	+	TACTTTAATTTTGCTACTCACTCCGATCCATATTACTTATCTCAACTTTACCCAAATATTGATGTATCTATGCCTAAAAAGTGTCTAGATACATGTAATATTTTGACAATTAATACGGATCGGAGGGAGTACTCTATGTTTATCTCT	...............((((.(((((((((.(((((.((...((((.........((((((((((((((((.((((....)).)).))))))))).))))))))))).)).))))).))))))))).)))).................	17165582	17165688	CTCCGATCCATATTACTTATCTCAACTTTACCCAAATATTGATGTATCTATGCCTAAAAAGTGTCTAGATACATGTAATATTTTGACAATTAATACGGATCGGAGGG	(((((((((.(((((.((...((((.........((((((((((((((((.((((....)).)).))))))))).))))))))))).)).))))).)))))))))..	Bdi-miRN225	17165582	17165602	CTCCGATCCATATTACTTATC	Bdi-miRN225*	17165668	17165688	CAATTAATACGGATCGGAGGG		3
Bdi-MIRN226	PmiREN001410	MIRN226	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	69958210	69958327	+	GCTAGATTAGTACTCCCTCTGATCCATAATAAGTGTCTCAGATTTTGTACTAACTTATACAAAGTTGTACTAAATCTCAGACACTTGTTATGGATCAGAGGGAGTACAAAAACTCAAC	.........(((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((.(((((.....))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))...........	69958230	69958307	GATCCATAATAAGTGTCTCAGATTTTGTACTAACTTATACAAAGTTGTACTAAATCTCAGACACTTGTTATGGATCAG	((((((((((((((((((.((((((.((((.(((((.....))))))))).)))))).))))))))))))))))))..	Bdi-miRN226	69958287	69958307	CAGACACTTGTTATGGATCAG	Bdi-miRN226*	69958230	69958250	GATCCATAATAAGTGTCTCAG		3
Bdi-MIRN227	PmiREN001411	MIRN227	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	28818577	28818667	-	TTGCGGCGCCCCCCTGGACCCCTTGCCGGCGCGCGCGGGCACCCAAAGGTGCGCGCGTCGCTGTCAAGGGGCTTAGTGGCGGCCGCCTCTT	.........((....)).(((((((.(((((.(((((.(((((....))))).)))))))))).)))))))....................	28818597	28818647	CCTTGCCGGCGCGCGCGGGCACCCAAAGGTGCGCGCGTCGCTGTCAAGGGG	(((((.(((((.(((((.(((((....))))).)))))))))).)))))..	Bdi-miRN227	28818597	28818616	CGCGCGTCGCTGTCAAGGGG	Bdi-miRN227*	28818627	28818647	CCTTGCCGGCGCGCGCGGGCA		3
Bdi-MIRN228	PmiREN001414	MIRN228	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	51037510	51037633	+	TACTCCGATCCAAAGTAATCGTCGCAGCTTTGTCTAGATACGCATGTACCTACACACTGAAATGCGTATAGATACATGTGTATCTAGACAAAGCTGTGACAAGTAATTTGGGTAGGAGGGAGTA	..((((.(((((((......((((((((((((((((((((((((((((.(((.((.(......).)).))).))))))))))))))))))))))))))))......))))))).))))......	51037530	51037613	CGTCGCAGCTTTGTCTAGATACGCATGTACCTACACACTGAAATGCGTATAGATACATGTGTATCTAGACAAAGCTGTGACAAG	.((((((((((((((((((((((((((((.(((.((.(......).)).))).))))))))))))))))))))))))))))...	Bdi-miRN228	51037593	51037613	TCTAGACAAAGCTGTGACAAG	Bdi-miRN228*	51037530	51037550	CGTCGCAGCTTTGTCTAGATA		3
Bdi-MIRN229	PmiREN001418	MIRN229	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	41650041	41650196	+	TAGCCAGTAAATCTCAATAAACAGATCAGATGAAAGGTGTAACCTCTCATCACTTATATATACTTCATGAAAAAAAAACACCAGGCGGAAAATATGCTTAAGTAATTAGAGGTTCCACCTTTCATCTGATCTGTTTATTTAAGATTTAATAGCTAG	((((...(((((((.((((((((((((((((((((((((.(((((((.((.((((((((((..(((....................)))..)))))..))))).)).))))))).))))))))))))))))))))))))..)))))))...)))).	41650061	41650176	ACAGATCAGATGAAAGGTGTAACCTCTCATCACTTATATATACTTCATGAAAAAAAAACACCAGGCGGAAAATATGCTTAAGTAATTAGAGGTTCCACCTTTCATCTGATCTGTTT	(((((((((((((((((((.(((((((.((.((((((((((..(((....................)))..)))))..))))).)).))))))).)))))))))))))))))))..	Bdi-miRN229	41650061	41650081	ACAGATCAGATGAAAGGTGTA	Bdi-miRN229*	41650156	41650176	CACCTTTCATCTGATCTGTTT		3
Bdi-MIRN230a	PmiREN001424	MIRN230	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	2413935	2414026	+	ATGGTGGCGCGGGGGCTGCGCTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGGACTCTGTCCCACGCGCTGCTTCGTCGAGCGTGGCGGCCGACGCCTCGACT	.....(((((((..((((((((((.((((((((((((.((((((...)))))))))))))))))).))))))))))..))).))))......	2413955	2414006	CTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGGACTCTGTCCCACGCGCTGCTTCGTCGAGCG	((((.((((((((((((.((((((...)))))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN230a	2413955	2413976	CTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGG	Bdi-miRN230a*	2413986	2414006	CACGCGCTGCTTCGTCGAGCG		3
Bdi-MIRN230b	PmiREN001425	MIRN230	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	44311715	44311806	-	ATGGTGGCGCGGGGGCTGCGCTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGGACTCTGTCCCGCGCGCTGCTTCGTCGAGCGTGGCGGCCGACGCCTCGACA	....((((((((..((((((((((.(((((((((((((.(((((...)))))))))))))))))).))))))))))..))).)))).....)	44311735	44311786	CTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGGACTCTGTCCCGCGCGCTGCTTCGTCGAGCG	((((.(((((((((((((.(((((...)))))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN230b	44311765	44311786	CTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGG	Bdi-miRN230b*	44311735	44311755	CGCGCGCTGCTTCGTCGAGCG		3
Bdi-MIRN230c	PmiREN001426	MIRN230	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	13430750	13430845	+	AAGGCGGCGCGCAGGCTGCGCTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGGACCCTATATATCCCGCGCGCTCCTTCGTCGAGTGTGGCCACCGACGCCGCACCT	...((((((((..(((((((((((.(((((.(((((((.((((.........))))))))))).))))).)))))))))))..)).))))))....	13430770	13430825	CTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGGACCCTATATATCCCGCGCGCTCCTTCGTCGAGTG	((((.(((((.(((((((.((((.........))))))))))).))))).))))..	Bdi-miRN230c	13430770	13430791	CTCGCCGGAGCAGCGTGCTGGG	Bdi-miRN230c*	13430805	13430825	CGCGCGCTCCTTCGTCGAGTG		3
Bdi-MIRN231	PmiREN001427	MIRN231	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	22251241	22251385	-	AAGTGCGATGTGCCGGTGTTTGCTTCTTCGGCAAATTGGTGATGACACCAATTATTGCATCCACGATTGTTTTTGGAGAAAGCTGTATGCAGTTGTTGTCATCACCAATTTGTCGGAGAAACAAACTCCGGTAAATCATACTTGC	(((((.(((.((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((.((((...(((((.((.....((((((...)))))))).))))))))).)))))))))))))))))))))))).))))).)))))).))).)))))..	22251261	22251365	TGCTTCTTCGGCAAATTGGTGATGACACCAATTATTGCATCCACGATTGTTTTTGGAGAAAGCTGTATGCAGTTGTTGTCATCACCAATTTGTCGGAGAAACAAA	((.((((((((((((((((((((((((.((((...(((((.((.....((((((...)))))))).))))))))).)))))))))))))))))))))))).))..	Bdi-miRN231	22251345	22251365	TGCTTCTTCGGCAAATTGGTG	Bdi-miRN231*	22251261	22251281	CCAATTTGTCGGAGAAACAAA		3
Bdi-MIRN232	PmiREN001429	MIRN232	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	37032284	37032374	+	CTGTCCCATTCTAAATTCTTATCGTCGTTTTAGTTTAAATTTGGCTCAAATTTGAACTAAAACGACGACAACAATTTAGGATAGGAAGGAG	((.(((.((((((((((.((.((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))).)).)))))))))).))).))..	37032304	37032354	ATCGTCGTTTTAGTTTAAATTTGGCTCAAATTTGAACTAAAACGACGACAA	.((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))...	Bdi-miRN232	37032334	37032354	TTTGAACTAAAACGACGACAA	Bdi-miRN232*	37032304	37032324	ATCGTCGTTTTAGTTTAAATT		3
Bdi-MIRN233	PmiREN001430	MIRN233	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	31075927	31076130	-	ACGTCAGTTTCAGCCAGGACCGCTGACATGGTAGTCGATTTTCTCAAGATCTTTTTGCAAAATCACCATGCCCGAGCCGCCCCACGAGAGGCAAGCGGCCGCGCCCAGACGGGGATCCTGGGGCCCTGAGAACCACGCCGTTGCAAAAAAAAATCCCTGAGAAAATCGAGTAGCAGTCCGCGGTTCTTGCCGAATCCAATGTGG	((....))........(((((((.(((.((.((.((((((((((((.(((.(((((((((..(((....((((.((...((((....(.(((..((....))))))....))))...)).))))..)))...........)))))))))...)))..)))))))))))).)).))))).)))))))..................	31075947	31076110	CGCTGACATGGTAGTCGATTTTCTCAAGATCTTTTTGCAAAATCACCATGCCCGAGCCGCCCCACGAGAGGCAAGCGGCCGCGCCCAGACGGGGATCCTGGGGCCCTGAGAACCACGCCGTTGCAAAAAAAAATCCCTGAGAAAATCGAGTAGCAGTCCGCGGT	(((.(((.((.((.((((((((((((.(((.(((((((((..(((....((((.((...((((....(.(((..((....))))))....))))...)).))))..)))...........)))))))))...)))..)))))))))))).)).))))).)))..	Bdi-miRN233	31075947	31075967	AATCGAGTAGCAGTCCGCGGT	Bdi-miRN233*	31076090	31076110	CGCTGACATGGTAGTCGATTT		3
Bdi-MIRN234a	PmiREN001431	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	28891801	28891946	+	CAAGTTTGTGACCCTCATGTACCCTTTGACCCTCCTTAATTTAACCAAATGAACTAAAATTTTAAAATGACACAACTTTTTGAAAAACTAGTTCATTTGTTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTGAGGGTCACCATGTTGC	.......((((((((((.((((((.(((((((((((((.(((((.(((((((((((...((((((((.(......).))))))))...))))))))))).))))).))))))))))))).))))))..))))))))))........	28891821	28891926	ACCCTTTGACCCTCCTTAATTTAACCAAATGAACTAAAATTTTAAAATGACACAACTTTTTGAAAAACTAGTTCATTTGTTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.(((((((((((((.(((((.(((((((((((...((((((((.(......).))))))))...))))))))))).))))).))))))))))))).))))..	Bdi-miRN234a	28891906	28891926	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234a*	28891821	28891841	ACCCTTTGACCCTCCTTAATT		3
Bdi-MIRN234b	PmiREN001432	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	32758834	32758979	+	AACTTGGTGACCCTTAGGGTACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTTATTTTAAAATTTTAGTTCATTTGGTTAAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTGAAGGTCAGAAACTTGC	.......(((((.(((((((((((.((((((((((((((((.(..((((((((((((..(((...(((((......))))).)))..))))))))))))..).)))))))))))))))).))))))))))).))))).........	32758854	32758959	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTTATTTTAAAATTTTAGTTCATTTGGTTAAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.((((((((((((((((.(..((((((((((((..(((...(((((......))))).)))..))))))))))))..).)))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN234b	32758939	32758959	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234b*	32758854	32758874	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTT		3
Bdi-MIRN234c	PmiREN001433	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	47979338	47979483	+	AACTTGGTGACCCGGAGGGTACCCTTTGACCCTCTGTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTATCATTTTAAAACTTTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCTTGAGGGTCACAAACTTGC	((.((.(((((((..(((((((((.((((((((((.(((((((..((((((((((((((((..((((.(......).))))))))))..))))))))))..))))))).)))))))))).)))))))))..))))))).)).))..	47979358	47979463	ACCCTTTGACCCTCTGTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTATCATTTTAAAACTTTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.((((((((((.(((((((..((((((((((((((((..((((.(......).))))))))))..))))))))))..))))))).)))))))))).))))..	Bdi-miRN234c	47979443	47979463	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234c*	47979358	47979378	ACCCTTTGACCCTCTGTAGTT		3
Bdi-MIRN234d	PmiREN001438	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	63182194	63182339	-	AACTTGGTGACCCTCAGGGTACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAACTTTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTGAGGGTCACAAACTTGC	((.((.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((..((((((((((((((((..((((.(......).))))))))))..))))))))))..)))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)).))..	63182214	63182319	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAACTTTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.((((((((((((((((((..((((((((((((((((..((((.(......).))))))))))..))))))))))..)))))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN234d	63182214	63182234	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234d*	63182299	63182319	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTT		3
Bdi-MIRN234e	PmiREN001439	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	45380838	45380983	-	AACTTGGTGACCCTTAGGGTACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAATTTTAGCTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTGAGGGTCACAAACTTGC	......((((((((((((((((((.((((((((((((((((((..(((((((.((((..(((.((((.(......).)))).)))..)))).)))))))..)))))))))))))))))).))))))))))))))))))........	45380858	45380963	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAATTTTAGCTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.((((((((((((((((((..(((((((.((((..(((.((((.(......).)))).)))..)))).)))))))..)))))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN234e	45380858	45380878	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234e*	45380943	45380963	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTT		3
Bdi-MIRN234f	PmiREN001443	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	45130086	45130231	-	AAGTTTGTGACCCTCAGGGTACCCATTGACCCTCCTTAGTTCAACCAAATGAACTAAAGTTTCAAAATGACACAACTTTTTGAAAAACTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTGAGGGTCACAAACTTGC	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((.(......).))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	45130106	45130211	ACCCATTGACCCTCCTTAGTTCAACCAAATGAACTAAAGTTTCAAAATGACACAACTTTTTGAAAAACTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((.(......).))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN234f	45130106	45130126	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234f*	45130191	45130211	ACCCATTGACCCTCCTTAGTT		3
Bdi-MIRN234g	PmiREN001454	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	47672651	47672796	+	AAGTTGGTGACCCTCAGGGTATCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAACCAAATGAACTAAAGTTTTAAAATGATACAACTTTTTGAAAAACTAGTTCATTTGTTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTGAGGGTCACCATGTTGC	((..((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((...((((((((.(......).))))))))...))))))))))).))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))..))..	47672671	47672776	ATCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAACCAAATGAACTAAAGTTTTAAAATGATACAACTTTTTGAAAAACTAGTTCATTTGTTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((...((((((((.(......).))))))))...))))))))))).))))))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN234g	47672756	47672776	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234g*	47672671	47672691	ATCCTTTGACCCTCCTTAGTT		3
Bdi-MIRN234h	PmiREN001457	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	7461899	7462044	-	AACATGGTGACCCTCAGGGTATCCTTTGATCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAACTTTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTGAGGGTCACAAAGTTGC	(((...((((((((((((((((((.((((((((((((((((((..((((((((((((((((..((((.(......).))))))))))..))))))))))..)))))))))))))))))).))))))))))))))))))...)))..	7461919	7462024	ATCCTTTGATCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAACTTTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.((((((((((((((((((..((((((((((((((((..((((.(......).))))))))))..))))))))))..)))))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN234h	7461919	7461939	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234h*	7462004	7462024	ATCCTTTGATCCTCCTTAGTT		3
Bdi-MIRN234i	PmiREN001458	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	17734189	17734334	+	AACTTGGTGACCCTCAGGGTACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATAAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAACTTTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTCAGGGTCACAAACTTGC	......((((((((.(((((((((.((((((((((((((((((..(((((.((((((((((..((((.(......).))))))))))..)))).)))))..)))))))))))))))))).))))))))).))))))))........	17734209	17734314	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATAAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAACTTTAGTTCATTTGGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.((((((((((((((((((..(((((.((((((((((..((((.(......).))))))))))..)))).)))))..)))))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN234i	17734294	17734314	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234i*	17734209	17734229	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTT		3
Bdi-MIRN234j	PmiREN001459	MIRN234	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	19112326	19112471	-	AACTTGGTGACCCTCAGGGTACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAACTTTAGTTCATTGTGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTACCCTGAGGGTCACAAACTTGC	((.((.((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((...((((((((((((((..((((.(......).))))))))))..))))))))...))))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)).))..	19112346	19112451	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTTCAAACAAATGAACTAGTTTTTCAAAAAGTTGTGTCATTTTAAAACTTTAGTTCATTGTGTTGAACTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	((((.(((((((((((((((((((...((((((((((((((..((((.(......).))))))))))..))))))))...))))))))))))))))))).))))..	Bdi-miRN234j	19112346	19112366	CTAAGGAGGGTCAATGGGTAC	Bdi-miRN234j*	19112431	19112451	ACCCTTTGACCCTCCTTAGTT		3
Bdi-MIRN235	PmiREN001436	MIRN235	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	63575571	63575776	+	CCACGTCGGCTTAGGCGAGGGCCGCACGCTGCTATTCGATTTTCTCAAGGGTTTTTTGTGCAACGACGTGGTTCTCAGGGCCTAGGATCCCCGTTTGGGCGCAGCTGCCTTGCCCCTCGCGGGGCGGCTCGGGCATGGCGATTTTGCAAAAAAATTCTGAGAAAATCGAGTAGCAGCCCGTGGTCCTGGCCGAAGCTGACGTGGCA	((((((((((((.(((.((((((((..((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((...(((.((.(((.(((((......((((((..(((.((((.....)))))))..)))))).)))))))).)).)))...))))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))))).))).))))))))))))..	63575591	63575756	GCCGCACGCTGCTATTCGATTTTCTCAAGGGTTTTTTGTGCAACGACGTGGTTCTCAGGGCCTAGGATCCCCGTTTGGGCGCAGCTGCCTTGCCCCTCGCGGGGCGGCTCGGGCATGGCGATTTTGCAAAAAAATTCTGAGAAAATCGAGTAGCAGCCCGTGGTCC	(((((..((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((...(((.((.(((.(((((......((((((..(((.((((.....)))))))..)))))).)))))))).)).)))...))))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))..	Bdi-miRN235	63575736	63575756	TCGAGTAGCAGCCCGTGGTCC	Bdi-miRN235*	63575591	63575611	GCCGCACGCTGCTATTCGATT		3
Bdi-MIRN236a	PmiREN001437	MIRN236	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	67169789	67169952	+	CCCTCGCCGCCACGCGTACGGTCGCGCATTAGCAAAGTCCATTATGTATTAAAAAGTTATACCATTAAAAACTTCTTTAAAATATGAATCTAGTGGTATAAGTTTTATAACTTACAATTTACATTTTGTTGGTGTAATTGATGGTTAAAGTTAGACCTCGAAAT	.................((.((((.(((((((((((((......(((((((((((.(((((((((((.....(((..........)))..))))))))))).)))).)))..))))......)))))))))))))...)))).))...................	67169809	67169932	GTCGCGCATTAGCAAAGTCCATTATGTATTAAAAAGTTATACCATTAAAAACTTCTTTAAAATATGAATCTAGTGGTATAAGTTTTATAACTTACAATTTACATTTTGTTGGTGTAATTGATGG	((((.(((((((((((((......(((((((((((.(((((((((((.....(((..........)))..))))))))))).)))).)))..))))......)))))))))))))...))))..	Bdi-miRN236a	67169912	67169932	TTTTGTTGGTGTAATTGATGG	Bdi-miRN236a*	67169809	67169829	GTCGCGCATTAGCAAAGTCCA		3
Bdi-MIRN236b	PmiREN001447	MIRN236	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	22333861	22334029	+	TTCGAGATTTTGTTTTGACCATCAATTAGACCAACAAAATGTGAATTATGTACTATAAAATTTATACCATTGGAAACTTCTTTCAGAAATGAATCTAGTGGTATAATTTTTATAACATATGATCCACATTTTGTTGGTGTAATTGATGGTGAAAGTTAGATCTTGAAAT	((((((((((..((((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((((..(((((((.(((((((((((((.......((((....))))))))))))))))).)))))))..))))))).)))))))))))))).))))))))))).))))..))))))))))..	22333881	22334009	ATCAATTAGACCAACAAAATGTGAATTATGTACTATAAAATTTATACCATTGGAAACTTCTTTCAGAAATGAATCTAGTGGTATAATTTTTATAACATATGATCCACATTTTGTTGGTGTAATTGATGG	((((((((.((((((((((((((.(((((((..(((((((.(((((((((((((.......((((....))))))))))))))))).)))))))..))))))).)))))))))))))).))))))))..	Bdi-miRN236b	22333989	22334009	TTTTGTTGGTGTAATTGATGG	Bdi-miRN236b*	22333881	22333901	ATCAATTAGACCAACAAAATG		3
Bdi-MIRN236c	PmiREN001449	MIRN236	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	53946429	53946597	+	TTCAGGATTTTGCGTTGACAATCAATTAGACCAACAAAATGTGAATTATGTATTATAAAAGTTATACCATTGGAAACTTCTTTCAAATACGAATCTAGTGGTATAAGTTTTATAACTTATAATTCAAATTTTGTTGGTGTAATTGATGGTCAAAGTTCGACCTCGAAAG	...(((.((..((.(((((.((((((((.(((((((((((.(((((((((..((((((((.(((((((((((((...(((..........)))))))))))))))).))))))))..))))))))).))))))))))).)))))))).))))).))..)))))......	53946449	53946577	ATCAATTAGACCAACAAAATGTGAATTATGTATTATAAAAGTTATACCATTGGAAACTTCTTTCAAATACGAATCTAGTGGTATAAGTTTTATAACTTATAATTCAAATTTTGTTGGTGTAATTGATGG	((((((((.(((((((((((.(((((((((..((((((((.(((((((((((((...(((..........)))))))))))))))).))))))))..))))))))).))))))))))).))))))))..	Bdi-miRN236c	53946557	53946577	TTTTGTTGGTGTAATTGATGG	Bdi-miRN236c*	53946449	53946469	ATCAATTAGACCAACAAAATG		3
Bdi-MIRN236d	PmiREN001452	MIRN236	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	19324991	19325168	+	TTCGAGATTTTGCTTTGACCATCAATTAGACCAACAAATAATGAATTATGTATTATAAAAATGACTCCCTCCTTCCCATTTCAAACGTCTTTCGGATATGAATCTAGTGGTATGATTTTTATAACATATAATTCCCATTTTGTTGGTGTAATTGATGGTGAAAGTTAAACCTCAAAAT	((.(((.(((.(((((.(((((((((((.(((((((((....(((((((((.((((((((((.(..((...((......((((...((((...)))).))))...)).))..).)))))))))).)))))))))....))))))))).))))))))))).))))).))).))).))..	19325011	19325148	ATCAATTAGACCAACAAATAATGAATTATGTATTATAAAAATGACTCCCTCCTTCCCATTTCAAACGTCTTTCGGATATGAATCTAGTGGTATGATTTTTATAACATATAATTCCCATTTTGTTGGTGTAATTGATGG	((((((((.(((((((((....(((((((((.((((((((((.(..((...((......((((...((((...)))).))))...)).))..).)))))))))).)))))))))....))))))))).))))))))..	Bdi-miRN236d	19325128	19325148	TTTTGTTGGTGTAATTGATGG	Bdi-miRN236d*	19325011	19325031	ATCAATTAGACCAACAAATAA		3
Bdi-MIRN237a	PmiREN001442	MIRN237	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	49782483	49782600	-	AATAAGTGTCTCAGATTTTGTACTCCCTCCGATCCATAAAAAGTGTTGTTCACTTAGTACAAAATGGGCGACACTTTTTATGGATTGAAGGGAGTACAAAGTTGTACTCAGGGCCGTA	................((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.((......)).))))))))))))))))))))))).))))))))))))..................	49782503	49782580	TACTCCCTCCGATCCATAAAAAGTGTTGTTCACTTAGTACAAAATGGGCGACACTTTTTATGGATTGAAGGGAGTACA	((((((((.(((((((((((((((((((((((.((......)).))))))))))))))))))))))).))))))))..	Bdi-miRN237a	49782503	49782523	TTATGGATTGAAGGGAGTACA	Bdi-miRN237a*	49782560	49782580	TACTCCCTCCGATCCATAAAA		3
Bdi-MIRN237b	PmiREN001450	MIRN237	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	41024355	41024472	-	TGTAAAAAAACGAAACTATGTACTTCCTTTGATTCATAAAAAATGTCGCCCATTTTGTACTAACTAGACGGCACTTTTTATGGATTGAAGGGAGTACAATGAATGTCGTCAAGTTCAA	.........((((.....((((((((((((((((((((((((.(((((....................))))).)))))))))))))))))))))))).......)))).........	41024375	41024452	TACTTCCTTTGATTCATAAAAAATGTCGCCCATTTTGTACTAACTAGACGGCACTTTTTATGGATTGAAGGGAGTACA	((((((((((((((((((((((.(((((....................))))).))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN237b	41024375	41024395	TTATGGATTGAAGGGAGTACA	Bdi-miRN237b*	41024432	41024452	TACTTCCTTTGATTCATAAAA		3
Bdi-MIRN238a	PmiREN001444	MIRN238	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	31244008	31244109	-	AAGTCCTAAGAGAATACTAGTATACGATCTGTTATATAAATAGGTAAATTTTCCTTTCCATTATGAATCGCGATTGTATGGCCAACCATTTTGGGTAGAACG	....(((((((.........((((((((((((((((.....(((........)))......)))))..)).)))))))))........))))))).......	31244028	31244089	TATACGATCTGTTATATAAATAGGTAAATTTTCCTTTCCATTATGAATCGCGATTGTATGGC	((((((((((((((((.....(((........)))......)))))..)).)))))))))..	Bdi-miRN238a	31244028	31244047	ATGAATCGCGATTGTATGGC	Bdi-miRN238a*	31244069	31244089	TATACGATCTGTTATATAAAT		3
Bdi-MIRN238b	PmiREN001455	MIRN238	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	16120073	16120177	-	CATGATTTAATTGATGGGATGGTATAGTTCGAATTTATAGATTAATGCAAAAATGTAAATGAATTATGAATCGCGATTGTATGGCCAACCATTGTGGGTAGAATG	................((.(.(((((((((((.(((((((.(((.((((....))))..))).)))))))))).)))))))).)))...................	16120093	16120157	GGTATAGTTCGAATTTATAGATTAATGCAAAAATGTAAATGAATTATGAATCGCGATTGTATGGC	.(((((((((((.(((((((.(((.((((....))))..))).)))))))))).))))))))...	Bdi-miRN238b	16120093	16120112	ATGAATCGCGATTGTATGGC	Bdi-miRN238b*	16120137	16120157	GGTATAGTTCGAATTTATAGA		3
Bdi-MIRN239	PmiREN001445	MIRN239	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	6143216	6143339	+	ACTCCGATCCATATTACTTGTCGCAGCTTTGTCTAGATACGCATGTATCTAGACGCGTTTCATTGGATAGGTACATACATGTGTATCTAGACAAAGCTGTGACAGGTAATATGGATCGGAAGAA	..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((........))..))))))))....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))....	6143236	6143319	TCGCAGCTTTGTCTAGATACGCATGTATCTAGACGCGTTTCATTGGATAGGTACATACATGTGTATCTAGACAAAGCTGTGACA	(((((((((((((((((((((((((((((((..((........))..))))))))....)))))))))))))))))))))))..	Bdi-miRN239	6143299	6143319	TATCTAGACAAAGCTGTGACA	Bdi-miRN239*	6143236	6143256	TCGCAGCTTTGTCTAGATACG		3
Bdi-MIRN240	PmiREN001448	MIRN240	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	30886361	30886451	+	TTTGGGGATTTTGCTGCAGATTTTGGGGAATTCCAGATGGATTTTAACCAGCCTGGTCATTTTGCAAAAAAAACAAAACCCTGAGAAAGTC	(((((((.(((((.......(((((.(((((.((((.(((.......)))..))))..))))).)))))....))))))))))))......	30886381	30886431	TTTTGGGGAATTCCAGATGGATTTTAACCAGCCTGGTCATTTTGCAAAAAA	(((((.(((((.((((.(((.......)))..))))..))))).)))))..	Bdi-miRN240	30886381	30886401	TTTTGGGGAATTCCAGATGGA	Bdi-miRN240*	30886411	30886431	GCCTGGTCATTTTGCAAAAAA		3
Bdi-MIRN241	PmiREN001456	MIRN241	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	6369028	6369266	-	TCGCCGCCGCCGCCGCAAGGGCCCATCTTCACGACCGACGGCGACGACGACCATGGAGCGCCGGCAACGCGGATAGACCGCAGAGCGCATCCTGCGGTCCATCCGCGTCGCCTGCCCCAACGCCCGGAACGCCAGCAGCATGCCGTACCACGAGAAGGCGGAGCACGACAAGACGTGCCCCGGCAATGGACGTGAGCCGTCGATCTTGGAGATGGGTCCTTGCGGCGGCGCCGGCAGCC	(.((((.((((((((((((((((((((((((.((.(((((((....(((.((((((.(.((.(((.((((((((.((((((((........)))))))).)))))))).))).))))).......((.(((.((......)).))).)).......(.(((.(((((......))))).))).).)))).)))..))))))).)).)))))))))))))))))))))))).)))).)..	6369048	6369246	GCCCATCTTCACGACCGACGGCGACGACGACCATGGAGCGCCGGCAACGCGGATAGACCGCAGAGCGCATCCTGCGGTCCATCCGCGTCGCCTGCCCCAACGCCCGGAACGCCAGCAGCATGCCGTACCACGAGAAGGCGGAGCACGACAAGACGTGCCCCGGCAATGGACGTGAGCCGTCGATCTTGGAGATGGGTCC	(((((((((((.((.(((((((....(((.((((((.(.((.(((.((((((((.((((((((........)))))))).)))))))).))).))))).......((.(((.((......)).))).)).......(.(((.(((((......))))).))).).)))).)))..))))))).)).)))))))))))..	Bdi-miRN241	6369048	6369068	GTCGATCTTGGAGATGGGTCC	Bdi-miRN241*	6369226	6369246	GCCCATCTTCACGACCGACGG		3
Bdi-MIRN242	PmiREN001460	MIRN242	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	18670833	18671020	-	TACTCCGGTAGTATTGGGAATCACAATCGATGCAAAGAAAATGAATGCATTTCCATACCATAATACACTTTCCAATGATACGTAAGCAAGGTATTTTGGGTCCTTTATAGGGAAGGCATATCATAGAGAATTAGAATTCTCATATATAATATTGGGTAGGTTGTGGTATTTCATTACTACAAACATGG	.......((((((.((((((((((((((.((.(((.....((((((((.(((((((((((.(((((.(((.(..(((...)))..).)))))))).)))......))).))))).)))).)))).((((((....))))))..........))).)).))))))))).))))).))))))........	18670853	18671000	TCACAATCGATGCAAAGAAAATGAATGCATTTCCATACCATAATACACTTTCCAATGATACGTAAGCAAGGTATTTTGGGTCCTTTATAGGGAAGGCATATCATAGAGAATTAGAATTCTCATATATAATATTGGGTAGGTTGTGGTA	((((((((.((.(((.....((((((((.(((((((((((.(((((.(((.(..(((...)))..).)))))))).)))......))).))))).)))).)))).((((((....))))))..........))).)).))))))))..	Bdi-miRN242	18670853	18670872	ATATTGGGTAGGTTGTGGTA	Bdi-miRN242*	18670980	18671000	TCACAATCGATGCAAAGAAAA		3
Bdi-MIRN243	PmiREN001461	MIRN243	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	14611714	14611795	-	GAAATACCCAATATCTTGTTCTACCAAGATATTGGGTATTTCTTTACTTTGCATCTTTTTTTTATTCTGAATCTTTCTATTC	((((((((((((((((((......))))))))))))))))))........................................	14611734	14611775	AAATACCCAATATCTTGTTCTACCAAGATATTGGGTATTTCT	(((((((((((((((((......)))))))))))))))))..	Bdi-miRN243	14611734	14611753	CCAAGATATTGGGTATTTCT	Bdi-miRN243*	14611755	14611775	AAATACCCAATATCTTGTTCT		3
Bdi-MIRN244	PmiREN001462	MIRN244	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	9353344	9353461	-	CACATCTCCCTAAGGTATAAAATGACTAATAAACCCCTGTATAGACTGGTACGATTCAATTCCACATTTTGTTCATTCGGGTTTGATTGTGTCATAGTTCTATAGTTGGAATTTAGTT	(............).......(((((((((((((((.((.(((((.(((............)))...))))).))...)))))).)))).))))).......................	9353364	9353441	AATGACTAATAAACCCCTGTATAGACTGGTACGATTCAATTCCACATTTTGTTCATTCGGGTTTGATTGTGTCATAGT	.(((((((((((((((.((.(((((.(((............)))...))))).))...)))))).)))).)))))...	Bdi-miRN244	9353364	9353383	GGGTTTGATTGTGTCATAGT	Bdi-miRN244*	9353421	9353441	AATGACTAATAAACCCCTGTA		3
Bdi-MIRN245	PmiREN001463	MIRN245	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	73701165	73701401	+	GATCGGAGAGAGAGAAGAGAAAGAGTAGCGTTGATACACCGTCGAATCTGGAATCGAATCGCGCCGTGACCACCCCATATCGGAATCGTCTCCGAGCATCGCATCGCATCCTCCCCCCCTTTTCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCCCAGCAGCACTCGCCTCTCGATTGCGTGATTCGTACGGTTTATCACCGCCTCTTTCTCTTCCGCTCTCTCTCGCCG	....((((((((.((((((((((((..(((.(((((.(((((((((((((.((((((...(((..(((...........(((((......)))))((........)).............................................................))).)))...)))))).)).)))))).))))).))))).)))))))))))))))..)))))))).....	73701185	73701381	AAGAGTAGCGTTGATACACCGTCGAATCTGGAATCGAATCGCGCCGTGACCACCCCATATCGGAATCGTCTCCGAGCATCGCATCGCATCCTCCCCCCCTTTTCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCCCAGCAGCACTCGCCTCTCGATTGCGTGATTCGTACGGTTTATCACCGCCTCTTTC	(((((..(((.(((((.(((((((((((((.((((((...(((..(((...........(((((......)))))((........)).............................................................))).)))...)))))).)).)))))).))))).))))).))))))))..	Bdi-miRN245	73701185	73701206	AAGAGTAGCGTTGATACACCGT	Bdi-miRN245*	73701361	73701381	CGGTTTATCACCGCCTCTTTC		3
Bdi-MIRN246	PmiREN001465	MIRN246	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	24838692	24838777	+	ACGTCCTCACCACTTCGTTCTTGGCGCGCTCCTTGTTGGCCACGTTCAGGAAGGACTGCATCATCTGGAACTCGCCGGTGATGAAC	......(((((.....((((((((.(((.(((((.((((......)))).))))).))).)))...))))).....))))).....	24838712	24838757	TTGGCGCGCTCCTTGTTGGCCACGTTCAGGAAGGACTGCATCATCT	.(((.(((.(((((.((((......)))).))))).))).)))...	Bdi-miRN246	24838737	24838757	TCAGGAAGGACTGCATCATCT	Bdi-miRN246*	24838712	24838732	TTGGCGCGCTCCTTGTTGGCC		3
Bdi-MIRN247a	PmiREN001466	MIRN247	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	35939724	35939810	+	TCTAATTGACTGCAATTAAACTCGGCTCAATCTTTTTTTTTAGAAAAAAAAAAGATTGAGCCGAATAAAAATGGATCATGATACGAT	.....................((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))..........(((.......)))	35939744	35939790	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTTAGAAAAAAAAAAGATTGAGCCGAATA	.((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))...	Bdi-miRN247a	35939771	35939790	AAAAAAGATTGAGCCGAATA	Bdi-miRN247a*	35939744	35939764	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTT		3
Bdi-MIRN247b	PmiREN001469	MIRN247	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd2	11501571	11501656	-	TCTAATTGACTGCAATTAAACTCGGCTCAATCTTTTTTTTTCTAAAAAAAAAGATTGAGCCGAATAAAAATGGATCATGATACGAT	.....................(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))..........(((.......)))	11501591	11501636	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTTCTAAAAAAAAAGATTGAGCCGAATA	.(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))...	Bdi-miRN247b	11501591	11501610	AAAAAAGATTGAGCCGAATA	Bdi-miRN247b*	11501616	11501636	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTT		3
Bdi-MIRN247c	PmiREN001471	MIRN247	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	7513204	7513289	-	TCTAATTGACTGCAATTAAACTCGGCTCAATCTTTTTTTTTAGAAAAAAAAAGATTGAGCCGAATAAAAATGGATCATGACACAGT	..((((((....))))))...(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).......................	7513224	7513269	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTTAGAAAAAAAAAGATTGAGCCGAATA	.(((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))...	Bdi-miRN247c	7513224	7513243	AAAAAAGATTGAGCCGAATA	Bdi-miRN247c*	7513249	7513269	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTT		3
Bdi-MIRN247d	PmiREN001474	MIRN247	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd3	4282897	4282981	+	TCTAATTGACTGCAATTAAACTCGGCTCAATCTTTTTTTTTCTAAAAAAAAGATTGAGCCGAATAAAAATGGATCGTTTTTCATT	.....................(((((((((((((((((((...))))))))))))))))))).......................	4282917	4282961	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTTCTAAAAAAAAGATTGAGCCGAATA	.(((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))...	Bdi-miRN247d	4282942	4282961	AAAAAAGATTGAGCCGAATA	Bdi-miRN247d*	4282917	4282937	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTT		3
Bdi-MIRN247e	PmiREN001476	MIRN247	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd5	13126900	13126984	-	TCTAATTGCCTGCAATTAAACTCGGCTCAATCTTTTTTTTCTAAAAAAAAAGATTGAGCCGAATAAAAATGGATCACGACACGAT	..((((((....))))))...(((((((((((((((((((...))))))))))))))))))).......................	13126920	13126964	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTCTAAAAAAAAAGATTGAGCCGAATA	.(((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))...	Bdi-miRN247e	13126920	13126939	AAAAAAGATTGAGCCGAATA	Bdi-miRN247e*	13126944	13126964	CTCGGCTCAATCTTTTTTTTC		3
Bdi-MIRN248	PmiREN001467	MIRN248	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd4	44507649	44507871	+	ATATACCTCTTGTTTATTAGTCTGAAGGGCTTGTCAATGTTCTTCAGTTAGCCCAAGGGTTGTTGACATTGAATCTTGGTCATATTTTTTGTTTGGGTGAAAGGACCTACCAAAATAAGTCACCGACCATATTGTGCAAGGGAACCAGGATTCAGTGTGCACAACCCCTTGGGCTAAGTGAACGTTGGCAAACCCTTCAGGCTAATAAATAAGAGGCACGTAT	((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((...(((.((((((((((((((((..(((((((((((((((....((((((((...(((.....(((.((......)).)))....))).......)))))))))))))))))))))))..)))).)))))))))))).))))))))))))).))))))))))))))))))))))))...))))	44507669	44507851	TCTGAAGGGCTTGTCAATGTTCTTCAGTTAGCCCAAGGGTTGTTGACATTGAATCTTGGTCATATTTTTTGTTTGGGTGAAAGGACCTACCAAAATAAGTCACCGACCATATTGTGCAAGGGAACCAGGATTCAGTGTGCACAACCCCTTGGGCTAAGTGAACGTTGGCAAACCCTTCAGGCT	(((((((((.((((((((((...(((.((((((((((((((((..(((((((((((((((....((((((((...(((.....(((.((......)).)))....))).......)))))))))))))))))))))))..)))).)))))))))))).))))))))))))).)))))))))..	Bdi-miRN248	44507669	44507689	TCTGAAGGGCTTGTCAATGTT	Bdi-miRN248*	44507831	44507851	CGTTGGCAAACCCTTCAGGCT		3
Bdi-MIRN249	PmiREN001468	MIRN249	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	35981808	35981895	+	AGATGAAAAAACCAAAAAAAGCTCTGCCCTTCCATCTCTTGGATAGATAGAGAGGGAGGGCAGAGGCCTTTGGTGTCCTTTTCAGTCA	((........((((((.....((((((((((((.(((((.........)))))))))))))))))...))))))...)).........	35981828	35981875	GCTCTGCCCTTCCATCTCTTGGATAGATAGAGAGGGAGGGCAGAGGCC	.((((((((((((.(((((.........)))))))))))))))))...	Bdi-miRN249	35981854	35981875	ATAGAGAGGGAGGGCAGAGGCC	Bdi-miRN249*	35981828	35981848	GCTCTGCCCTTCCATCTCTTG		3
Bdi-MIRN250	PmiREN001477	MIRN250	Brachypodium distachyon	Bdi-Bd1	24850782	24850900	-	AGGCCATGCCTAAATTATTATGCCCATAAGATTGTTGTATGTCGCAGGAATTTGAAAACCCAAAAAACTCCAGCGACATAAAACAGTCTTATGGGCATAATTAATAAGATATGCATGGC	..(((((((.((..((((((((((((((((((((((.((((((((.(((.(((...........))).))).)))))))).))))))))))))))))))....))))..)).)))))))	24850802	24850880	TGCCCATAAGATTGTTGTATGTCGCAGGAATTTGAAAACCCAAAAAACTCCAGCGACATAAAACAGTCTTATGGGCATA	((((((((((((((((.((((((((.(((.(((...........))).))).)))))))).))))))))))))))))..	Bdi-miRN250	24850802	24850822	TAAAACAGTCTTATGGGCATA	Bdi-miRN250*	24850860	24850880	TGCCCATAAGATTGTTGTATG		3