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Aly-MIR156a	PmiREN000405	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	3693798	3693921	-	CAAGAGAAACGCAAAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCAATTTGCATATCATTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGATTCCGGTGCTGATCTCTTTG	...................(((((((((((((((((((((.(((((((((..((((......)))).))))))...))).))))))))).))).)))))))))..........(((.....)))	3693818	3693901	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCAATTTGCATATCATTGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTTTCTGTCAGA	((((((((((((((((((((.(((((((((..((((......)))).))))))...))).))))))))).))).))))))))..	Aly-miR156a	3693882	3693901	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Aly-miR156a*	3693818	3693838	CTCACTGCTCTTTCTGTCAGA		3
Aly-MIR156b	PmiREN000406	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	4534112	4534233	-	GAAAATGCAACAGAGAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCTCTGTTATGTGTCTATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGTTGCTTATCTCTTGTTTTATC	((.((.((((.(((...(((((((((((((((((((((((.((((.((...((((((....))))))...)).)))).))))))).))))).))))))))))).....))).)))).)).))	4534132	4534213	TGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCTCTGTTATGTGTCTATAACTTTGCGTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGT	((((((((((((((((((((.((((.((...((((((....))))))...)).)))).))))))).))))).))))))))..	Aly-miR156b	4534194	4534213	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Aly-miR156b*	4534132	4534152	CTCACCTCTCTTTCTGTCAGT		3
Aly-MIR156c	PmiREN000407	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	4138765	4138889	+	TAAGAGAAACGCATAGAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGATTTCGGCTCCGATTCGGTTC	...................(((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).))))))))......(..(((...)))..)	4138785	4138869	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCACTTTGCATGTTCGATGCATTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTCTATCTGTCAGA	((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))..)))))...))).))))))))).)))).)))))))..	Aly-miR156c	4138785	4138804	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Aly-miR156c*	4138849	4138869	CTCACTGCTCTATCTGTCAGA		3
Aly-MIR156d	PmiREN000408	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	4353129	4353256	-	GTTGATGGGGGAAAAGAAGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGGGAAGTTGTATAGAATTTTTGTATATGGTTGCTTTTGCGTGCTCACTCTCTTTCTGTCATAACTTCTCCTTTCATGAATCT	..............((((((((((((((((((((((((((.((((((.((...((((((((...))))))))...)).)))))).)))))))))))).))))))))..))))))..............	4353149	4353236	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGGGAAGTTGTATAGAATTTTTGTATATGGTTGCTTTTGCGTGCTCACTCTCTTTCTGTCATA	((((((((((((((((((((.((((((.((...((((((((...))))))))...)).)))))).)))))))))))).))))))))..	Aly-miR156d	4353217	4353236	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Aly-miR156d*	4353149	4353169	GCTCACTCTCTTTCTGTCATA		3
Aly-MIR156e	PmiREN000409	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	4871354	4871493	+	GTGTGAAAGGTAAGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGTTTCTTGCATGCTTTTTTTTAATTAGGGCTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACCCCTTCTCTCTCTCTTTTCAA	...(((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((..(((((((((.........)))))...))))..))))))))))))))))))))))).)))))))))...)).))))..))))))).	4871374	4871473	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGTTTCTTGCATGCTTTTTTTTAATTAGGGCTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTTACTCTCTCTCTGTCACC	(((((((((((((((((((((((((((...(((..(((((((((.........)))))...))))..))))))))))))))))))))))).)))))))..	Aly-miR156e	4871374	4871393	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Aly-miR156e*	4871453	4871473	GCTTACTCTCTCTCTGTCACC		3
Aly-MIR156f	PmiREN000410	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	11884619	11884750	+	GATTGATGAGTAATTGATGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATATTTGATGGTTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACCCCCTTCTCTCTCTCTATATA	..................(((((((((((((((((((((((((((((....(((..(((....(((.....))))))..))))))))))))))))))))))).)))))))))....................	11884639	11884730	TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGGCTTTCTTGCATATTTGATGGTTTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTCTCTATCTGTCACC	(((((((((((((((((((((((((((....(((..(((....(((.....))))))..))))))))))))))))))))))).)))))))..	Aly-miR156f	11884639	11884658	TGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Aly-miR156f*	11884710	11884730	GCTCACTCTCTATCTGTCACC		3
Aly-MIR156g	PmiREN000411	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	21084424	21084549	+	ATGAATAACAATAAGGAAGGCGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGCTCCTTTTTCTAGCATGCTCATGCTCGAAAGCTCTGCGTGCTTACTCTCTTCTTGTCTCCTCCTGCTTTCTCTCTTTCTC	.............((((.((.(((((((((((((((((((.((.((((.....(((.(((((....))))).))))))).)).))))))))))))))).)))).))))))................	21084444	21084529	CGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGCTCCTTTTTCTAGCATGCTCATGCTCGAAAGCTCTGCGTGCTTACTCTCTTCTTGTCTCC	.(((((((((((((((((((.((.((((.....(((.(((((....))))).))))))).)).))))))))))))))).))))...	Aly-miR156g	21084444	21084463	CGACAGAAGAGAGTGAGCAC	Aly-miR156g*	21084509	21084529	GCTTACTCTCTTCTTGTCTCC		3
Aly-MIR156h	PmiREN000412	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	17184354	17184481	-	GAGAAGAAGATAAAGAAATGTTGACAGAAGAAAGAGAGCACAACCTGGGATTAGCAAAAAGATAGTTTTGCCCTTGTCGGGAGTGTGCTCTCTTTCCTTCTGCCACCATCATCGTGCATAGCGCCATG	.................(((.((.((((((((((((((((((.(((((.(...((((((......))))))...).)))))..)))))))))))).)))))).)).)))...................	17184374	17184461	TTGACAGAAGAAAGAGAGCACAACCTGGGATTAGCAAAAAGATAGTTTTGCCCTTGTCGGGAGTGTGCTCTCTTTCCTTCTGCCACCA	.((.((((((((((((((((((.(((((.(...((((((......))))))...).)))))..)))))))))))).)))))).))...	Aly-miR156h	17184441	17184461	TTGACAGAAGAAAGAGAGCAC	Aly-miR156h*	17184374	17184394	CTCTCTTTCCTTCTGCCACCA		3
Aly-MIR156i	PmiREN000413	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	28321832	28321917	-	TTCTAAGAGAGAAATTTAGATGACAGAAGAGAGAGAGCAGACAGCTTCTCTATCTAATCTGTGGTCGCTTGAATGATGAGTTTGGC	..................(((.((((((((.(((((((.....)).))))).)))..))))).)))....................	28321852	28321897	TGACAGAAGAGAGAGAGCAGACAGCTTCTCTATCTAATCTGTGGTC	(.((((((((.(((((((.....)).))))).)))..))))).)..	Aly-miR156i	28321878	28321897	TGACAGAAGAGAGAGAGCAG	Aly-miR156i*	28321852	28321872	TTCTCTATCTAATCTGTGGTC		3
Aly-MIR156j	PmiREN000414	MIR156	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	20611079	20611184	-	TCCTGTGGTTGATGTGGATTTGACAGAAGAGAGAGGGCACAATTTGAGTCGCCAATTCCCTTGTAGCTCTCTAGTTTAGTGTCCATAATCTCTGGAGATGAGAAGC	.....................((((..(((.(((((((((((...((((.....))))..)))).)))))))..)))..))))..................(...)	20611099	20611164	TGACAGAAGAGAGAGGGCACAATTTGAGTCGCCAATTCCCTTGTAGCTCTCTAGTTTAGTGTCCAT	.((((..(((.(((((((((((...((((.....))))..)))).)))))))..)))..))))...	Aly-miR156j	20611145	20611164	TGACAGAAGAGAGAGGGCAC	Aly-miR156j*	20611099	20611119	GCTCTCTAGTTTAGTGTCCAT		3
Aly-MIR157a	PmiREN000415	MIR157	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	11818138	11818270	-	TTTGAGAGGCATTGAGAGTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATAAGATACAATTCGGAGCAGTTTCTTTGCATCTTACTCCTTTGTGCTCTCTAGCCTTCTGTCATCACCTTTTATTTGCTTTATCCT	.....((((((.((((((((.(((((((((.(((((((((((((.((((((((.(((...((((....))))))).)))))).)).)))))))))))))..))))))))).)).))))))..)))))).....	11818158	11818250	TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATAAGATACAATTCGGAGCAGTTTCTTTGCATCTTACTCCTTTGTGCTCTCTAGCCTTCTGTCATCA	.(((((((((.(((((((((((((.((((((((.(((...((((....))))))).)))))).)).)))))))))))))..)))))))))...	Aly-miR157a	11818230	11818250	TTGACAGAAGATAGAGAGCAC	Aly-miR157a*	11818158	11818178	CTCTCTAGCCTTCTGTCATCA		3
Aly-MIR157b	PmiREN000416	MIR157	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	11845990	11846122	+	TTTGGGAGGCATTGATAGTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGAGAAGATACAATTCTTCGCAGCTTCTTTGCATCTTACTCCTTTGTGCTCTCTAAGCTTCTGTCATCACCCGTTATTTTGCGGTCGCC	....((.(((.......(((.(((((((((.(((((((((((((.((((((((.(((...............))).))))).))).)))))))))))))..))))))))).))).(((......)))))).))	11846010	11846102	TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGAGAAGATACAATTCTTCGCAGCTTCTTTGCATCTTACTCCTTTGTGCTCTCTAAGCTTCTGTCATCA	.(((((((((.(((((((((((((.((((((((.(((...............))).))))).))).)))))))))))))..)))))))))...	Aly-miR157b	11846010	11846030	TTGACAGAAGATAGAGAGCAC	Aly-miR157b*	11846082	11846102	CTCTCTAAGCTTCTGTCATCA		3
Aly-MIR157c	PmiREN000417	MIR157	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	7799883	7800109	-	TTTGAGAGTGATGCTGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGCACATACATATATCATCACACCCCATGTGGATGATAAAATATGTATAACAAATTCAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGATGTAGAGGGAGAGGGAGAGAAAGAGACTGCATCTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCTTTATTTCTTCTTCTCT	...............(((.((.(((((((((((((((((((....................((((((((((((((.(((.....))))))))))...)))))))...................((((((((((((((((...........................))).)))))).)))))))))))))))))).)))))))))).))).................	7799903	7800089	TTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGCACATACATATATCATCACACCCCATGTGGATGATAAAATATGTATAACAAATTCAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGATGTAGAGGGAGAGGGAGAGAAAGAGACTGCATCTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCACC	(.(((((((((((((((((((....................((((((((((((((.(((.....))))))))))...)))))))...................((((((((((((((((...........................))).)))))).)))))))))))))))))).)))))))))..	Aly-miR157c	7800069	7800089	TTGACAGAAGATAGAGAGCAC	Aly-miR157c*	7799903	7799923	GCTCTCTATACTTCTGTCACC		3
Aly-MIR157d	PmiREN000418	MIR157	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	24813797	24814014	-	GGAGGGTGATAGTGTGGTTGCTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGATATGCAAAACACACACATATATGTGCTTCTAATTGTATTTCATACTTAACATCAATGTTGATGTGAATCGTGAAAAAAAAAAAAGAGAGAAGAGCTAGAGGAGCATCTGCATCTCTATTCCTATGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTTTTTTCTCTATTTCTC	...(((.(((((...(((.(.((((((((((((((((((((..((((....((((((......((((....)))).......))))))(((((.....((((((....)))))).....))))).........(((((..((((((.....))).)))...)))))..))))..))))))))))).))))))))).)))).........))))).)))	24813817	24813994	CTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGATATGCAAAACACACACATATATGTGCTTCTAATTGTATTTCATACTTAACATCAATGTTGATGTGAATCGTGAAAAAAAAAAAAGAGAGAAGAGCTAGAGGAGCATCTGCATCTCTATTCCTATGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCA	.((((((((((((((((((((..((((....((((((......((((....)))).......))))))(((((.....((((((....)))))).....))))).........(((((..((((((.....))).)))...)))))..))))..))))))))))).)))))))))...	Aly-miR157d	24813974	24813994	CTGACAGAAGATAGAGAGCAC	Aly-miR157d*	24813817	24813837	CTCTCTATGCTTCTGTCATCA		3
Aly-MIR158a	PmiREN000419	MIR158	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	4310350	4310452	-	AACACGTCATCTCTGTGCTTCTTTGTCTACAATTTTGGAAAAAGTGGTGACGCCATTGCTCTTTCCCAAATGTAGACAAAGCAATACCGTGATGACGTCTGTT	(((((((((((.(.(((...(((((((((((.(((.(((((.(((((((....))))))).))))).))))))))))))))...))).).))))))))..)))	4310370	4310432	CTTTGTCTACAATTTTGGAAAAAGTGGTGACGCCATTGCTCTTTCCCAAATGTAGACAAAGCA	(((((((((((.(((.(((((.(((((((....))))))).))))).))))))))))))))..	Aly-miR158a	4310370	4310389	TCCCAAATGTAGACAAAGCA	Aly-miR158a*	4310412	4310432	CTTTGTCTACAATTTTGGAAA		3
Aly-MIR158b	PmiREN000420	MIR158	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	29396582	29396685	+	AACTCGTCATCTCTGTGCCTCTTTGTCTACAATTTTGGAAAAAGTAGTGTCGCCATTGTTTTTTTCCCAAATGTAGACAAAGCGATACCGTGATGACGTTATAG	(((..((((((.(.(((.(.(((((((((((.(((.((((((((.((((....))))..)))))))).)))))))))))))).).))).).)))))))))....	29396602	29396665	CTTTGTCTACAATTTTGGAAAAAGTAGTGTCGCCATTGTTTTTTTCCCAAATGTAGACAAAGCG	(((((((((((.(((.((((((((.((((....))))..)))))))).))))))))))))))..	Aly-miR158b	29396645	29396665	TTCCCAAATGTAGACAAAGCG	Aly-miR158b*	29396602	29396622	CTTTGTCTACAATTTTGGAAA		3
Aly-MIR159a	PmiREN000421	MIR159	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	15958622	15958842	-	GAAAAAAAAAGATGGAAGTAGAGCTCCTTGAAGTTCAAACGAGAGTTGAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAATCCTTATAAAGAAAAAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTCTTTCACCTTCTCT	(((....(((((.(((.((((((((((((..((((((((.((((((.(((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((((((..(((((((............))))))).)))).)))))..).)))).)).)).))))))...)))))))......))))..)))))).))))))))..)))))))))))).))))))))....)))...	15958642	15958822	GAGCTCCTTGAAGTTCAAACGAGAGTTGAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAATCCTTATAAAGAAAAAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA	(((((((((..((((((((.((((((.(((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((((((..(((((((............))))))).)))).)))))..).)))).)).)).))))))...)))))))......))))..)))))).))))))))..)))))))))..	Aly-miR159a	15958642	15958662	TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA	Aly-miR159a*	15958802	15958822	GAGCTCCTTGAAGTTCAAACG		3
Aly-MIR159b	PmiREN000422	MIR159	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	7594088	7594300	+	CAAAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGCTCCTTGAAGTTCAATGGAGGGTTTAGCAGGGTAAAGTAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAACCTTATCAAATTCAAAATAAGGATTTTTTATGGATTCCATATCTCAGGAGCTTTCACTTACCCCTTTAATGGCTTCACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTTCATCTCTACCTCCATATACC	....(((.(.(((.((.((((((((((((..(((((((.(((((((..(((((((..((((((((((.((.((.((((((..(((((((((((((..........))))))....)))))))..)))))).)).)).)))))).))))..))))......)))..))))))).)))))))..)))))))))))).))))).).))).......	7594108	7594280	GAGCTCCTTGAAGTTCAATGGAGGGTTTAGCAGGGTAAAGTAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAACCTTATCAAATTCAAAATAAGGATTTTTTATGGATTCCATATCTCAGGAGCTTTCACTTACCCCTTTAATGGCTTCACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTT	(((((((((..(((((((.(((((((..(((((((..((((((((((.((.((.((((((..(((((((((((((..........))))))....)))))))..)))))).)).)).)))))).))))..))))......)))..))))))).)))))))..)))))))))..	Aly-miR159b	7594260	7594280	TTTGGATTGAAGGGAGCTCTT	Aly-miR159b*	7594108	7594128	GAGCTCCTTGAAGTTCAATGG		3
Aly-MIR159c	PmiREN000423	MIR159	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	16128668	16128850	-	ATCTATAGAAAGATATCAAAGAAACATTCAAATCAAAAACATTAGAAAACGTAACGTTTTTCAAAATAGAAAATCATGGAAATAATATCTGCCTTTTTATTTTCTTCCTCAAGAAACTGAGAGACAGAATCAACGCAAGATCTTTGGTTTGAAGGGGGCTCTATGAATTGATAAAATCTTCCT	......((.(((((((((((((..(.(((((((((((.......(((((((...)))))))...........(((.((.........((((.(((((...((((((....))))))..))))).)))).......)).))).)))))))))))...)..))).....))))))...)))).))	16128688	16128830	GAAACATTCAAATCAAAAACATTAGAAAACGTAACGTTTTTCAAAATAGAAAATCATGGAAATAATATCTGCCTTTTTATTTTCTTCCTCAAGAAACTGAGAGACAGAATCAACGCAAGATCTTTGGTTTGAAGGGGGCTCTA	((..(.(((((((((((.......(((((((...)))))))...........(((.((.........((((.(((((...((((((....))))))..))))).)))).......)).))).)))))))))))...)..))..	Aly-miR159c	16128688	16128708	TTTGGTTTGAAGGGGGCTCTA	Aly-miR159c*	16128810	16128830	GAAACATTCAAATCAAAAACA		3
Aly-MIR160a	PmiREN000425	MIR160	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	18997262	18997382	+	GTATATGTATTATATATGTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATATGCTGAGCTCATCGAGTATCGATGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATCCTCATACATATATATACA	((((((((((.......((((((.(((((((.((((((((((..((.(((.(((((((...))))))).))).))..)))))))))).))))))).))))))....)))))))))).....	18997282	18997362	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCATATGCTGAGCTCATCGAGTATCGATGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATA	(((.(((((((.((((((((((..((.(((.(((((((...))))))).))).))..)))))))))).))))))).)))..	Aly-miR160a	18997282	18997302	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Aly-miR160a*	18997342	18997362	GCGTATGAGGAGCCATGCATA		3
Aly-MIR160b	PmiREN000426	MIR160	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	11280818	11280940	-	TATATATAGATTTAAGGTCGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGAAAACATCGATTTAGTTACAAAATCGATCACTAGTGGCGTACAGAGTAGTCAAGCATGACCAAAGCTTTCTTGATATA	...............((((((((.((((((.(((((((((((.((.....((((((((.......))))))))..)).))))))))))).).))))).)))))))).................	11280838	11280920	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAAGAAAACATCGATTTAGTTACAAAATCGATCACTAGTGGCGTACAGAGTAGTCAAGCATG	(((.((((((.(((((((((((.((.....((((((((.......))))))))..)).))))))))))).).))))).)))..	Aly-miR160b	11280900	11280920	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Aly-miR160b*	11280838	11280858	CGTACAGAGTAGTCAAGCATG		3
Aly-MIR160c	PmiREN000427	MIR160	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	677270	677391	+	ATAATAGTTTGTCGTCGTTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACGAGTGGATACCGATTTTGTTATAAAATCGGCTGCCGGTGGCGTACAAGGAGCCAAGCATGACCATAAGCATATGATAACT	................(((((((.(((((((.((((((((((..((((...(((((((((...)))))))))))))..)))))))))).))))))).)))))))............(....)	677290	677371	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCACGAGTGGATACCGATTTTGTTATAAAATCGGCTGCCGGTGGCGTACAAGGAGCCAAGCATG	(((.(((((((.((((((((((..((((...(((((((((...)))))))))))))..)))))))))).))))))).)))..	Aly-miR160c	677290	677310	TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA	Aly-miR160c*	677351	677371	GCGTACAAGGAGCCAAGCATG		3
Aly-MIR161	PmiREN000428	MIR161	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	24491101	24491242	+	TATTGTGTCGATCAATGCATTGAAAGTGACTACATCGGGGTTTTGTTTTTTTGTTGCTCCCACGATCGAATCGATATGAGGAAGATGAAAAATTAATCAACCCCGGTTTAGTCACTTTCACTGCATTAATCAATGCATTTGT	...(((((.(((.((((((.((((((((((((.((((((((((((.(((((((((..(((((..((((...)))).)).))).))))))))).)))..))))))))).)))))))))))).)))))).))).))))).....	24491121	24491222	TGAAAGTGACTACATCGGGGTTTTGTTTTTTTGTTGCTCCCACGATCGAATCGATATGAGGAAGATGAAAAATTAATCAACCCCGGTTTAGTCACTTTCACT	((((((((((((.((((((((((((.(((((((((..(((((..((((...)))).)).))).))))))))).)))..))))))))).))))))))))))..	Aly-miR161	24491121	24491141	TGAAAGTGACTACATCGGGGT	Aly-miR161*	24491202	24491222	CCCGGTTTAGTCACTTTCACT		3
Aly-MIR162a	PmiREN000429	MIR162	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	3221205	3221331	-	GAAAAAGAGTGAGAGTCGCTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGGGAACGAATATATAAATATTGAAAAAGCATGAATAGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGTTTGCCTCTTTATCTTTG	.................((((((.((((.((((.((((((((.(((.((......(((((....))))).......)).))).)))))))).)))).)))).))))))...................	3221225	3221311	GGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGGGAACGAATATATAAATATTGAAAAAGCATGAATAGATCGATAAACCTCTGCATCCAG	(((.((((.((((.((((((((.(((.((......(((((....))))).......)).))).)))))))).)))).)))).)))..	Aly-miR162a	3221225	3221245	TCGATAAACCTCTGCATCCAG	Aly-miR162a*	3221291	3221311	GGAGGCAGCGGTTCATCGATC		3
Aly-MIR162b	PmiREN000430	MIR162	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	9808812	9808933	-	GGATTTAGAGTGAAGTCGCTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCAATTCCTGTGAATATTTTTGTTTTCAAAAGCATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTTACTCTTCCTCATCTG	(((...(((((((.(.(((((((.((((.((((.(((((((.((((.(((......(((((....)))))))).)))).))))))).)))).)))).)))))))))))))))))).......	9808832	9808913	GGAGGCAGCGGTTCATCGATCAATTCCTGTGAATATTTTTGTTTTCAAAAGCATGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAG	(((.((((.((((.(((((((.((((.(((......(((((....)))))))).)))).))))))).)))).)))).)))..	Aly-miR162b	9808832	9808852	TCGATAAACCTCTGCATCCAG	Aly-miR162b*	9808893	9808913	GGAGGCAGCGGTTCATCGATC		3
Aly-MIR164a	PmiREN000431	MIR164	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	23120157	23120273	+	GCGGGTGAGAATCTCCATGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACAAACACGAAATCCGTCTCATGTGTTTTGCACGTACTCCCCTTCTCCAACATGAGCTCCTGACCCATTGA	..((((.((...(((.((((((((((((..(((.(((((((((.((......(((.....)))......)).))))))))).)))..)))))))))))))))...)).)))).....	23120177	23120253	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACAAACACGAAATCCGTCTCATGTGTTTTGCACGTACTCCCCTTCTCCAAC	((((((((..(((.(((((((((.((......(((.....)))......)).))))))))).)))..))))))))..	Aly-miR164a	23120177	23120197	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Aly-miR164a*	23120233	23120253	CACGTACTCCCCTTCTCCAAC		3
Aly-MIR164b	PmiREN000432	MIR164	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	111763	111961	-	ATGGTGTGTGCTGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAGCTCATCTCGTATGCATATATATATACATCCTCACCACAAATGCGTGTATATGTGCGGAGATATAGATATATATGTGTGTGGAGTGTGATGATATAAATGAGTTAGTTCTTCATGTGCCCATCTTCACCATCATGACCACTCCACCTTGGTG	..((((.(.(.((..((.(((((.((((..(((((((((....(((((((((((((.(((((((((((((((.....(((..((((.(((....))).))))..)))......)))))))))))))))))).............))))))))))....)))))))))..)))).))))).))..))).)))))......	111783	111941	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAGCTCATCTCGTATGCATATATATATACATCCTCACCACAAATGCGTGTATATGTGCGGAGATATAGATATATATGTGTGTGGAGTGTGATGATATAAATGAGTTAGTTCTTCATGTGCCCATCTTCACCATC	(((.((((..(((((((((....(((((((((((((.(((((((((((((((.....(((..((((.(((....))).))))..)))......)))))))))))))))))).............))))))))))....)))))))))..)))).)))..	Aly-miR164b	111921	111941	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA	Aly-miR164b*	111783	111803	CATGTGCCCATCTTCACCATC		3
Aly-MIR164c	PmiREN000433	MIR164	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	12607206	12607329	-	AATGGGTGAGTAACACTTGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCGAACACAAATGAGATCGATCGGTACATGATGATCATATTTTCGCACGTGTTCTACTCCTCCAACACGTGTCTCTCCCCCTCCCC	...(((.(((..((((.((.(((((.((.((((((((((((((....((((.((((.((((.....)))))))).)))))))))))))))))).)).))))).)).))))..))).))).....	12607226	12607309	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCGAACACAAATGAGATCGATCGGTACATGATGATCATATTTTCGCACGTGTTCTACTCCTCCAAC	(((((.((.((((((((((((((....((((.((((.((((.....)))))))).)))))))))))))))))).)).)))))..	Aly-miR164c	12607289	12607309	TGGAGAAGCAGGGCACGTGCG	Aly-miR164c*	12607226	12607246	CACGTGTTCTACTCCTCCAAC		3
Aly-MIR165a	PmiREN000434	MIR165	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	449084	449219	+	TTAAGCTATTTCAGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGATCGAGGATATTATACATATATACATGTGTATGTTGATACATGTGATCATAGAGAGTATCCTCGGACCAGGCTTCATCCCCCCCAACATGTTATTGCCTCTG	....((.((..((((((.((((.(((..((((((.(((((((((((.........(((((((((......))))))))).........))))))))))).))))))..))).)))).)))).))..)).)).....	449104	449199	GGAATGTTGTCTGGATCGAGGATATTATACATATATACATGTGTATGTTGATACATGTGATCATAGAGAGTATCCTCGGACCAGGCTTCATCCCCC	((.(((..((((((.(((((((((((.........(((((((((......))))))))).........))))))))))).))))))..))).))..	Aly-miR165a	449179	449199	TCGGACCAGGCTTCATCCCCC	Aly-miR165a*	449104	449124	GGAATGTTGTCTGGATCGAGG		3
Aly-MIR165b	PmiREN000435	MIR165	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	24606423	24606600	+	AGAGGCCATTTCCGTTGTGGGGAATGTTGTTTGGATCGAGGATATCATAAAGGCATACACATGCATTTATATGTTATGATGCATTATATGATTGTGTAATGTACTTATGTACATATATATAGATGGTAATGGTATCGTCGGACCAGGCTTCATCCCCCTCAACATGTTAAGTGCCTTC	.............((((.((((.(((..((((((.((((.((((((((.......(((.(((..((.((((((((((((((((((((((....)))))))))).))))).))))))).))..)))))))))))))).)))).))))))..))).)))).))))...............	24606443	24606580	GGAATGTTGTTTGGATCGAGGATATCATAAAGGCATACACATGCATTTATATGTTATGATGCATTATATGATTGTGTAATGTACTTATGTACATATATATAGATGGTAATGGTATCGTCGGACCAGGCTTCATCCCCC	((.(((..((((((.((((.((((((((.......(((.(((..((.((((((((((((((((((((((....)))))))))).))))).))))))).))..)))))))))))))).)))).))))))..))).))..	Aly-miR165b	24606560	24606580	TCGGACCAGGCTTCATCCCCC	Aly-miR165b*	24606443	24606463	GGAATGTTGTTTGGATCGAGG		3
Aly-MIR166a	PmiREN000436	MIR166	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	22684208	22684381	+	AGGGGTTTTCTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGGCTCGCTCTATTCATGTTGGATCTTTTTCGATCTAATAATCGAATTGAACCTCCAGATTTCAGATCTGACTAGGGTTTTAGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGTTGCTCCCGATTT	.(((((.....(..(((.((((((((..((((((.((((.(((.((((...(((((((((.(((((((((......)))))))))...))).........((((((...))))))..)))))).)))).))).)))).))))))..)))))))).)))..)..)))))......	22684228	22684361	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGGCTCGCTCTATTCATGTTGGATCTTTTTCGATCTAATAATCGAATTGAACCTCCAGATTTCAGATCTGACTAGGGTTTTAGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((.(((.((((...(((((((((.(((((((((......)))))))))...))).........((((((...))))))..)))))).)))).))).)))).))))))..))))))..	Aly-miR166a	22684341	22684361	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Aly-miR166a*	22684228	22684248	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Aly-MIR166b	PmiREN000437	MIR166	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	20552771	20552919	+	GAGGGATTTTTCTTTTGAGGGGACTGTTGTCTGGCTCGAGGTCTCTTATTCTAATACAATCTCATTTCAATAGTCTCAGATCTGATGATTGATTAGGGTTTTAGCATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATTACTCCCTCTCA	((((((........(((.(((((.((..((((((.(((((((((...((((((((.((((((((..((..........))..))).)))))))))))))...)).))))))).))))))..)).))))).))).......))))))...	20552791	20552899	GGACTGTTGTCTGGCTCGAGGTCTCTTATTCTAATACAATCTCATTTCAATAGTCTCAGATCTGATGATTGATTAGGGTTTTAGCATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	(((.((..((((((.(((((((((...((((((((.((((((((..((..........))..))).)))))))))))))...)).))))))).))))))..)).)))..	Aly-miR166b	20552879	20552899	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Aly-miR166b*	20552791	20552811	GGACTGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Aly-MIR166c	PmiREN000438	MIR166	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	3626977	3627123	+	GGTGCGATTTAGGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGGAGAGGATATCACTCCAATTAATTTGGAAGAACGAATTAAGAAACCCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCTAACCGACTTATCACTTTT	......(.....(((((.(.((((((..((((((.((((((((((..(((...(((......)))..((((((((......)))))))).....)))..)))).)))))).))))))..)))))).).))))).............)	3626997	3627103	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGGAGAGGATATCACTCCAATTAATTTGGAAGAACGAATTAAGAAACCCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((((((((..(((...(((......)))..((((((((......)))))))).....)))..)))).)))))).))))))..))))))..	Aly-miR166c	3627083	3627103	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Aly-miR166c*	3626997	3627017	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Aly-MIR166d	PmiREN000439	MIR166	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	3632166	3632304	+	CCTTTGGTTTAGGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAAGATCATTAGATTGATTCATCTTAAAGAATGAAAACCCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACCGACATATCACATTC	....((((....(((((.(.((((((..((((((.((((((((((..((....(((((((((......)))).....))))).....))..)))).)))))).))))))..)))))).).))))).....)))).....	3632186	3632284	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAAGATCATTAGATTGATTCATCTTAAAGAATGAAAACCCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((((((((..((....(((((((((......)))).....))))).....))..)))).)))))).))))))..))))))..	Aly-miR166d	3632264	3632284	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Aly-miR166d*	3632186	3632206	GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG		3
Aly-MIR166e	PmiREN000440	MIR166	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	21195594	21195766	+	TGAAGCTTTTTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCACGAGGCCCTTAACTTAGATCTATATTTGATTTTATGTCTCTTCTTTATTTATTAGTCTATATATACATGAATGATCGATTTTAACGGTTAATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAATTATATCGCTTCTTCG	.(((((........((((((((((((..((((((..(((.(.(.((((((...........((((((((((((...........................))))))..)))))).......)))))).).).)))..))))))..)))))))))))).......)))))....	21195614	21195746	GGAATGTTGTCTGGCACGAGGCCCTTAACTTAGATCTATATTTGATTTTATGTCTCTTCTTTATTTATTAGTCTATATATACATGAATGATCGATTTTAACGGTTAATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((..(((.(.(.((((((...........((((((((((((...........................))))))..)))))).......)))))).).).)))..))))))..))))))..	Aly-miR166e	21195726	21195746	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Aly-miR166e*	21195614	21195634	GGAATGTTGTCTGGCACGAGG		3
Aly-MIR166f	PmiREN000441	MIR166	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_484	5707	5835	-	TTTTGAGCCAAAAGTTCAGGTGAATGATGCCTGGCTCGAGACCATTCCATCTCATGATCATGATGATGATATAATGATGATGATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACTTACACGTTTTGTTC	...........(((((.(((.((((((.((((((.((((.(.(((..((((((((.(((((....)))))...)))).))))))).).)))).)))))).)))))).))).))))).............	5727	5815	TGAATGATGCCTGGCTCGAGACCATTCCATCTCATGATCATGATGATGATATAATGATGATGATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	.((((((.((((((.((((.(.(((..((((((((.(((((....)))))...)))).))))))).).)))).)))))).))))))...	Aly-miR166f	5727	5747	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Aly-miR166f*	5795	5815	TGAATGATGCCTGGCTCGAGA		3
Aly-MIR166g	PmiREN000442	MIR166	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	21095447	21095574	+	GAAGCGATTTAGGGTTTAGAGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATGGAGAGTAATTCGTTACCAAAACACAAAACTCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACCTATTTTATCGCATT	...(((((...(((((.((.((((((..((((((.((((((((((..(((((.....(((.....))).....)))))..)))).)))))).))))))..)))))).)).))))).....)))))...	21095467	21095554	GGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATGGAGAGTAATTCGTTACCAAAACACAAAACTCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	((((((..((((((.((((((((((..(((((.....(((.....))).....)))))..)))).)))))).))))))..))))))..	Aly-miR166g	21095534	21095554	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Aly-miR166g*	21095467	21095487	GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG		3
Aly-MIR166h	PmiREN000443	MIR166	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	4172042	4172170	-	TTTTGAGCCAAAAGTTCAGGTGAATGATGCCTGGCTCGAGACCATTCCATCTCATGATCATGATGATGATATAATGATGATGATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACTTACACGTTTTGTTC	...........(((((.(((.((((((.((((((.((((.(.(((..((((((((.(((((....)))))...)))).))))))).).)))).)))))).)))))).))).))))).............	4172062	4172150	TGAATGATGCCTGGCTCGAGACCATTCCATCTCATGATCATGATGATGATATAATGATGATGATGATGTCGGACCAGGCTTCATTCCCC	.((((((.((((((.((((.(.(((..((((((((.(((((....)))))...)))).))))))).).)))).)))))).))))))...	Aly-miR166h	4172062	4172082	TCGGACCAGGCTTCATTCCCC	Aly-miR166h*	4172130	4172150	TGAATGATGCCTGGCTCGAGA		3
Aly-MIR167a	PmiREN000444	MIR167	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	10278868	10279012	+	TATGGTGCACCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAGCTTTCTTTATATCTGTTGTTGTGTTTCATAACGATGGTTAAGAGATGAGTCTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCCGTTGACTGTCGCACCCTTA	...(((((..(((((.(.(.(((((((((.((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((...))))))))))).))))))).))).)).)))))))))))))).))))))))).).).)).)))..)))))....	10278888	10278992	TGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAGCTTTCTTTATATCTGTTGTTGTGTTTCATAACGATGGTTAAGAGATGAGTCTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACC	(((((((((.((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((...))))))))))).))))))).))).)).)))))))))))))).)))))))))..	Aly-miR167a	10278888	10278908	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Aly-miR167a*	10278972	10278992	GATCATGTTCGCAGTTTCACC		3
Aly-MIR167b	PmiREN000445	MIR167	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	21158390	21158522	+	CAAGTCCACAAGGGAACAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTAAGAGATGAATGTGTAAACATATTGCTTAAACCCAAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTGGTTTAGGACCAT	...((((((..(((((..(((((.(((((.(((((((((((.(((.(((((((.(((..((((....))))))).))).)))).))).)))))))))))..).)))).)))))..))))).))...))))...	21158410	21158502	TGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTAAGAGATGAATGTGTAAACATATTGCTTAAACCCAAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACT	(((.(((((.(((((((((((.(((.(((((((.(((..((((....))))))).))).)))).))).)))))))))))..).)))).)))..	Aly-miR167b	21158410	21158430	TGAAGCTGCCAGCATGATCTA	Aly-miR167b*	21158482	21158502	TCATGCTCTGACAGCCTCACT		3
Aly-MIR167c	PmiREN000446	MIR167	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	1657178	1657357	-	TACCATGTACCAGTAGCAGTTAAGCTGCCAGCATGATCTTGTCTTCCTCTCTTAAGTTTCATATATAATCAAGTTAATATAAAGATTTTGTACAATTCTTGTTCTTATTATATGATCATAGCTTAGAGAGAGAGAGACTAGGTCATGCTGGTAGTTTCACCTGCTAATGATTGTAGCATG	...(((((..(((((((((..((((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((.((((....((((((...)))))).....))))...))).)))))))....))))).))))))).))))).))))))))))))))))))...)))))....))))..)))))	1657198	1657337	TAAGCTGCCAGCATGATCTTGTCTTCCTCTCTTAAGTTTCATATATAATCAAGTTAATATAAAGATTTTGTACAATTCTTGTTCTTATTATATGATCATAGCTTAGAGAGAGAGAGACTAGGTCATGCTGGTAGTTTCAC	.((((((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((.((((....((((((...)))))).....))))...))).)))))))....))))).))))))).))))).))))))))))))))))))...	Aly-miR167c	1657316	1657337	TAAGCTGCCAGCATGATCTTGT	Aly-miR167c*	1657198	1657218	AGGTCATGCTGGTAGTTTCAC		3
Aly-MIR167d	PmiREN000447	MIR167	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	16567755	16567840	-	TGTACGATTTACATGGATCTATATCTATGCTGGTTTTTAGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAATTGCTACATACGACATA	((((.....)))).........(((.((((((((((((((...))))))..)))))))))))........................	16567775	16567820	ATATCTATGCTGGTTTTTAGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGG	..(((.((((((((((((((...))))))..)))))))))))....	Aly-miR167d	16567775	16567796	TGAAGCTGCCAGCATGATCTGG	Aly-miR167d*	16567800	16567820	ATATCTATGCTGGTTTTTAGA		3
Aly-MIR168a	PmiREN000448	MIR168	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	10245612	10245757	-	TCTCACCGTCGGGCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCAATTCGGCTGACACAGCCTCGTGACTTTAAAACCTTTATTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGATCCCCGAGGTGTAAGA	...((((.(((((.((.((((((.((((((((((.(((((.((((((((((((...)))))...((.(((..(((((......)))))..))))).))))))).))))).)))))))))).)))))).))..))))))))).....	10245632	10245737	TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCAATTCGGCTGACACAGCCTCGTGACTTTAAAACCTTTATTGGTTTGTGAGCAGGGATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAAT	(((.((((((((((.(((((.((((((((((((...)))))...((.(((..(((((......)))))..))))).))))))).))))).)))))))))).)))..	Aly-miR168a	10245717	10245737	TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA	Aly-miR168a*	10245632	10245652	CCCGCCTTGCATCAACTGAAT		3
Aly-MIR168b	PmiREN000449	MIR168	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	2067209	2067339	+	AGTTACCGGCGGTCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTAGCTGACAATTACACGTGTGTTGTCATGGTTGGTTTGTGAGATCCCGTCTTGTATCAACTGAATCGGAGTCCGAGGTGAAAAAA	..(((((..(((.(((.((((((.((((((((((.(((((((.((((((((((((((.((....))))))))..)))))))).))....))))).)))))))))).)))))).))).))).))))).....	2067229	2067319	TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTAGCTGACAATTACACGTGTGTTGTCATGGTTGGTTTGTGAGATCCCGTCTTGTATCAACTGAAT	(((.((((((((((.(((((((.((((((((((((((.((....))))))))..)))))))).))....))))).)))))))))).)))..	Aly-miR168b	2067229	2067249	TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA	Aly-miR168b*	2067299	2067319	CCCGTCTTGTATCAACTGAAT		3
Aly-MIR169a	PmiREN000450	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	5439439	5439688	-	TATGTGACGAAAGTAGTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATTTAAATGATCTTTCTTTATACTCTATTAAGACATTTTAAGTTTCAAATTTCTTTGGTTCTTCAAGGATTAAGGAAGAAAGTAGGCTATATATGTAGATATATATATTATGCTGTATTAAATATATGTACAAGATAAGACCAAAAAAGAAAAAGTAACAATCATGATCGGCAAGTTGTCCTTGGCTACACGTTACTTTGTGTCGCGC	...(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((...(((((.(((((((....(((....))).......(.((((....((((((((((((...)))))))))))))))).).((((.(((.((((.((((((((((......))))...)))))).))))..))))).))...)))))))........))))))))))))))))))))))))))).))))))))))).)))))).. .	5439459	5439668	CAGCCAAGGATGACTTGCCGATTTAAATGATCTTTCTTTATACTCTATTAAGACATTTTAAGTTTCAAATTTCTTTGGTTCTTCAAGGATTAAGGAAGAAAGTAGGCTATATATGTAGATATATATATTATGCTGTATTAAATATATGTACAAGATAAGACCAAAAAAGAAAAAGTAACAATCATGATCGGCAAGTTGTCCTTGGCTACA	.((((((((((((((((((((((...(((((.(((((((....(((....))).......(.((((....((((((((((((...)))))))))))))))).).((((.(((.((((.((((((((((......))))...)))))).))))..))))).))...)))))))........)))))))))))))))))))))))))))...	Aly-miR169a	5439648	5439668	CAGCCAAGGATGACTTGCCGA	Aly-miR169a*	5439459	5439479	GGCAAGTTGTCCTTGGCTACA		3
Aly-MIR169b	PmiREN000461	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	3151693	3151882	-	GCGAAAAGAGTCATGTTTAGTAGCCAAAGATGACTTGCCTGATCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTGAATTCCATGGGTTTTGGATTATTATGCATTTTAAAAGCATAATAGTTCGAAAATCATGTTGAATCTTGCGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCTTTGGCTATCTTGACATGCTTTTTTCATTC	..((((((((.((((((.((((((((((((.((((.((((((....(((.((((.((.(((((((.........(((((.((((((((((((((((.........)))))))))))))))).)))))))))))).)).)))).)))..)))))))))))))))))))).)).))))))))))))))....	3151713	3151862	TAGCCAAAGATGACTTGCCTGATCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTGAATTCCATGGGTTTTGGATTATTATGCATTTTAAAAGCATAATAGTTCGAAAATCATGTTGAATCTTGCGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCTTTGGCTATC	((((((((((.((((.((((((....(((.((((.((.(((((((.........(((((.((((((((((((((((.........)))))))))))))))).)))))))))))).)).)))).)))..))))))))))))))))))))..	Aly-miR169b	3151841	3151862	TAGCCAAAGATGACTTGCCTGA	Aly-miR169b*	3151713	3151733	CAGGCAGTCTCTTTGGCTATC		3
Aly-MIR169c	PmiREN000452	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	23073377	23073625	+	GGAAAAAGGCCATTGTTGTTCAGCCAAGGATGACTTGCCGGTAGCTTTGTATATTTACTCTATATTCGGTTTATATTATGGAGATTATGCTTTATATATATATATACATAGTTTTAATTGATTTTTTTTCGTACGTACGTAATCTAATACGAAAAAGTATTTACTTATTTATATGTGTGTTGGTGAGATGTGTAAACAAAGCAAGCCCGGCAAGTCATCTCTGGCTATGCAACTGCCTCTTCCTCTC	((((..((((....(((((..(((((.((((((((((((((..(((((((.......(((((((............))))))).((((((.((.(((....(((((((((....(((..(((.((((((((((..............)))))))))).)))...)))....)))))))))..))).)).)))))))))))))....)))))))))))))).)))))..))))).)))).)))).... .	23073397	23073605	CAGCCAAGGATGACTTGCCGGTAGCTTTGTATATTTACTCTATATTCGGTTTATATTATGGAGATTATGCTTTATATATATATATACATAGTTTTAATTGATTTTTTTTCGTACGTACGTAATCTAATACGAAAAAGTATTTACTTATTTATATGTGTGTTGGTGAGATGTGTAAACAAAGCAAGCCCGGCAAGTCATCTCTGGCTATG	.(((((.((((((((((((((..(((((((.......(((((((............))))))).((((((.((.(((....(((((((((....(((..(((.((((((((((..............)))))))))).)))...)))....)))))))))..))).)).)))))))))))))....)))))))))))))).)))))...	Aly-miR169c	23073397	23073417	CAGCCAAGGATGACTTGCCGG	Aly-miR169c*	23073585	23073605	GGCAAGTCATCTCTGGCTATG		3
Aly-MIR169d	PmiREN000453	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	28725960	28726078	-	GAAAAAATAGAGAATGAGATTGAGCCAAGGATGACTTGCCGATTTTTATCAACAAATCTTAACTGATTATGGTGCCCGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGTTTCCTTCTCTTCTTTTCGAT	(((((...((((((.(((((.(((((((((..(((((((((.....(((((...((((......)))).)))))..)))))))))..))))))))).))))).))))))..)))))...	28725980	28726058	TGAGCCAAGGATGACTTGCCGATTTTTATCAACAAATCTTAACTGATTATGGTGCCCGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGT	.(((((((((..(((((((((.....(((((...((((......)))).)))))..)))))))))..)))))))))...	Aly-miR169d	28726038	28726058	TGAGCCAAGGATGACTTGCCG	Aly-miR169d*	28725980	28726000	GCAAGTTGACCTTGGCTCTGT		3
Aly-MIR169e	PmiREN000454	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	28728992	28729109	+	GAAAAAATAGAGAATGAGATTGAGCCAAGGATGACTTGCCGAATTTATTAACAAATCTCAAATGATTATGGTGCCCGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGTTTCCTTCTCTTCTTTTCGAT	(((((...((((((.(((((.(((((((((..(((((((((....(((((...((((......)))).)))))..)))))))))..))))))))).))))).))))))..)))))...	28729012	28729089	TGAGCCAAGGATGACTTGCCGAATTTATTAACAAATCTCAAATGATTATGGTGCCCGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGT	.(((((((((..(((((((((....(((((...((((......)))).)))))..)))))))))..)))))))))...	Aly-miR169e	28729012	28729032	TGAGCCAAGGATGACTTGCCG	Aly-miR169e*	28729069	28729089	GCAAGTTGACCTTGGCTCTGT		3
Aly-MIR169f	PmiREN000455	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	6024155	6024301	-	GAAGGAATAAAGAATGGAATTGAGCCAAGGATGACTTGCCGGTTTAAACACAACCGGATTATGACCATTGATTTGGTCTCATTCACAATCTGTTGATTCGTGTCTGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGCTTCGTTCTCTATTCTTCCAT	(.(((((((.((((((((...(((((((((..((((((((((........((((.(((((..(((((......)))))........)))))))))........))))))))))..)))))))))...)))))))).))))))).)..	6024175	6024281	TGAGCCAAGGATGACTTGCCGGTTTAAACACAACCGGATTATGACCATTGATTTGGTCTCATTCACAATCTGTTGATTCGTGTCTGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGC	.(((((((((..((((((((((........((((.(((((..(((((......)))))........)))))))))........))))))))))..)))))))))...	Aly-miR169f	6024261	6024281	TGAGCCAAGGATGACTTGCCG	Aly-miR169f*	6024175	6024195	GCAAGTTGACCTTGGCTCTGC		3
Aly-MIR169g	PmiREN000456	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	9193033	9193153	+	GGAAGAGTAGAGAATGAGGTTGAGCCAAGGATGACTTGCCGGGTTTTTTACCAATGAATCTTAACTGATTTTGGTGTCCGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGTTTCCTTCTCTTCTTTTCGAT	.((((((.((((((.((((..(((((((((..(((((((((((.....(((((..(((((......)))))))))))))))))))))..)))))))))..)))).)))))).))))))...	9193053	9193133	TGAGCCAAGGATGACTTGCCGGGTTTTTTACCAATGAATCTTAACTGATTTTGGTGTCCGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGT	.(((((((((..(((((((((((.....(((((..(((((......)))))))))))))))))))))..)))))))))...	Aly-miR169g	9193053	9193073	TGAGCCAAGGATGACTTGCCG	Aly-miR169g*	9193113	9193133	GCAAGTTGACCTTGGCTCTGT		3
Aly-MIR169h	PmiREN000451	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	8198500	8198645	-	AAGAATGAGAACTTGTGTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTTTTAACAATACAATATCAAAGACTACTCGATCGATCGATAGTCTTAGAGTTGGTTAGTCGTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATTCAAACAATTCTTGTTCTCCT	(((((((((((.((((.(((((((((((((.((((.(((((((..(((((....((((.((.(((((((.((((....))))))))))).))))))))))).)).))))))))))))))))))).))).))))))))))))))..)	8198520	8198625	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTTTTAACAATACAATATCAAAGACTACTCGATCGATCGATAGTCTTAGAGTTGGTTAGTCGTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATT	((((((((((.((((.(((((((..(((((....((((.((.(((((((.((((....))))))))))).))))))))))).)).))))))))))))))))))).)	Aly-miR169h	8198605	8198627	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Aly-miR169h*	8198520	8198540	CAGGCAGTCTCCTTGGCTATT		2
Aly-MIR169i	PmiREN000457	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	3130593	3130764	-	AGTAGGAGAATCATATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGATTCCTTTGCGTAAAATGGTTAGTGTCATGTTTGACAAAGTGACTATCAATTACATCAAGCGATGACCATTTTGCTTATAAAAAAGATGTCAGGCAGTCTCCTTGGATATCCTTATATGTTCTTCTCTTTC	((.(((((((.(((((..((...(((((((.((((.(((((((..((((..(((((((((((...(((..((((((.....(((...)))......)))))))))))))))))))).......))))..))))))))))))))))))....))..))))))))))))..)).	3130613	3130744	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGATTCCTTTGCGTAAAATGGTTAGTGTCATGTTTGACAAAGTGACTATCAATTACATCAAGCGATGACCATTTTGCTTATAAAAAAGATGTCAGGCAGTCTCCTTGGATATC	...(((((((.((((.(((((((..((((..(((((((((((...(((..((((((.....(((...)))......)))))))))))))))))))).......))))..)))))))))))))))))).....	Aly-miR169i	3130724	3130744	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Aly-miR169i*	3130613	3130633	CAGGCAGTCTCCTTGGATATC		3
Aly-MIR169j	PmiREN000458	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	3130948	3131137	-	GCGAAAAGAGTCATGTTTAATAGCCAAGGATGACTTGCCTGATCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTGAAGTTCATGCGTTTTGGATTATTATGCATCTAAAAGGTATAATAATTCGAAAATCATGTTGAATCATGCGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATCTTGACATGCTTTTTTCATCC	(.((((((((.((((((..(((((((((((.((((.((((((....(((.((((.((((((((((.........((((..((((((((((((((((.........))))))))))))))))..)))))))))))))).)))).)))..)))))))))))))))))))))...))))))))))))))..).	3130968	3131117	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGATCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTGAAGTTCATGCGTTTTGGATTATTATGCATCTAAAAGGTATAATAATTCGAAAATCATGTTGAATCATGCGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATC	((((((((((.((((.((((((....(((.((((.((((((((((.........((((..((((((((((((((((.........))))))))))))))))..)))))))))))))).)))).)))..))))))))))))))))))))..	Aly-miR169j	3131097	3131117	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Aly-miR169j*	3130968	3130988	CAGGCAGTCTCCTTGGCTATC		3
Aly-MIR169k	PmiREN000459	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	3143764	3143928	-	AATAAGAGAACCACATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTTTCTTTGAACAAAATGGTTGGTGTCATGTTTGATGTGACTACAAGTTATATCAAGAATGACATTTTGCTTATAAAAAGACATCAGGCAGTCTCCTTGGCTATCCTTATATGTTCTTCTTTCTC	(..((((((((.......((((((((((((.((((.(((((..(((((.........(((.((((((((.((((((((((((...)))))))))))).))))))))..))).....)))))...))))))))))))))))))))).......)))).))))..).	3143784	3143908	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTTTCTTTGAACAAAATGGTTGGTGTCATGTTTGATGTGACTACAAGTTATATCAAGAATGACATTTTGCTTATAAAAAGACATCAGGCAGTCTCCTTGGCTATC	((((((((((.((((.(((((..(((((.........(((.((((((((.((((((((((((...)))))))))))).))))))))..))).....)))))...)))))))))))))))))))..	Aly-miR169k	3143888	3143908	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Aly-miR169k*	3143784	3143804	CAGGCAGTCTCCTTGGCTATC		3
Aly-MIR169l	PmiREN000460	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	3149092	3149281	-	GCGAAAAGAGTCATGTTTAATAGCCAAGGATGACTTGCCTGATCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTGAATTTCATGGGTTTTGGATTATTATGCATCTAAAAGGTGTAATAATTCGAAAATCAAGTTGAATCTTGCGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATCTTGACATACTCTTTTCATCC	(.(((((((((.(((((..(((((((((((.((((.((((((....(((.((((.((.((((((((((((.((((.........(((((((..(((((((...)))))))))))))))))).)))))))))))).)).)))).)))..)))))))))))))))))))))...))))))))))))))..).	3149112	3149261	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGATCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTGAATTTCATGGGTTTTGGATTATTATGCATCTAAAAGGTGTAATAATTCGAAAATCAAGTTGAATCTTGCGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATC	((((((((((.((((.((((((....(((.((((.((.((((((((((((.((((.........(((((((..(((((((...)))))))))))))))))).)))))))))))).)).)))).)))..))))))))))))))))))))..	Aly-miR169l	3149241	3149261	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Aly-miR169l*	3149112	3149132	CAGGCAGTCTCCTTGGCTATC		3
Aly-MIR169m	PmiREN000462	MIR169	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	3151377	3151545	-	AATAGGAGAATCATATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTTTCTTTGAGTAAAATGGTTATTGTCATGTTTGACAAGTGACTATAAGTTATATCAAGTAACGACCATTTTACTCATCAAAAGACATGAGGCAGTCTTCTTGGCTATCCTTATATGTTCTTCTGTCTC	((((((((((.(((((..((((((((((((.((((.((((...((((((((((((((((((.((((((....))))))((((((...))))))..........))))))))))))))....))))....)))))))))))))))))).))..)))))))))))))).))	3151397	3151525	TAGCCAAGGATGACTTGCCTGTTTCTTTGAGTAAAATGGTTATTGTCATGTTTGACAAGTGACTATAAGTTATATCAAGTAACGACCATTTTACTCATCAAAAGACATGAGGCAGTCTTCTTGGCTATC	((((((((((.((((.((((...((((((((((((((((((.((((((....))))))((((((...))))))..........))))))))))))))....))))....)))))))))))))))))).)	Aly-miR169m	3151505	3151527	TAGCCAAGGATGACTTGCCTG	Aly-miR169m*	3151397	3151417	GAGGCAGTCTTCTTGGCTATC		2
Aly-MIR170	PmiREN000463	MIR170	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	22899757	22899857	+	GTCCGAGAGAGTCCCTCTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGATTCTCCTAACTAACTCATCTGATTGAGCCGTGTCAATATCTCAGTCCTCTCTCGTCGCTT	((.((((((((...((..(((((((((.(((((((.((((((...............)))))).))))))).)))))))))..))..))))))))..))..	22899777	22899837	TATTGGCCTGGTTCACTCAGATTCTCCTAACTAACTCATCTGATTGAGCCGTGTCAATATC	(((((((.(((((((.((((((...............)))))).))))))).)))))))..	Aly-miR170	22899817	22899837	TGATTGAGCCGTGTCAATATC	Aly-miR170*	22899777	22899797	TATTGGCCTGGTTCACTCAGA		3
Aly-MIR171a	PmiREN000464	MIR171	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	15611102	15611233	+	GCACGAGAGAGTCCCTTTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGATCTTCCCTGACCACACTCACGTCGTACATATGCATTCTCTCTAGATTATCTGATTGAGCCGCGCCAATATCTCAGTACTCTCTCGTCTCTA	(.((((((((((..((..(((((((((.(((((((.((((((..((...(((.........)))(((....)))..........))..)))))).))))))).)))))))))..)).)))))))))))....	15611122	15611213	TATTGGCCTGGTTCACTCAGATCTTCCCTGACCACACTCACGTCGTACATATGCATTCTCTCTAGATTATCTGATTGAGCCGCGCCAATATC	(((((((.(((((((.((((((..((...(((.........)))(((....)))..........))..)))))).))))))).)))))))..	Aly-miR171a	15611193	15611213	TGATTGAGCCGCGCCAATATC	Aly-miR171a*	15611122	15611142	TATTGGCCTGGTTCACTCAGA		3
Aly-MIR171b	PmiREN000465	MIR171	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	4720130	4720253	-	ATTTTATGTAAGGTAACGCGAGATATTAGTGCGGTTCAATCAAATAGTCGTCCTCTTAACTCATGGAGATCGGTGTTGTTCGATTGAGCCGTGCCAATATCACGCGGTAAACCAAAATGGCAAA	................((((.((((((.(((((((((((((.((((((((..((((........))))..)))..))))).))))))))))))).)))))).)))).....(((...)))....	4720150	4720233	AGATATTAGTGCGGTTCAATCAAATAGTCGTCCTCTTAACTCATGGAGATCGGTGTTGTTCGATTGAGCCGTGCCAATATCACG	.((((((.(((((((((((((.((((((((..((((........))))..)))..))))).))))))))))))).))))))...	Aly-miR171b	4720150	4720170	TTGAGCCGTGCCAATATCACG	Aly-miR171b*	4720213	4720233	AGATATTAGTGCGGTTCAATC		3
Aly-MIR171c	PmiREN000466	MIR171	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1951186	1951308	+	ATTATCGGACATCGAATACGAGATATTGGTGCGGTTCAATCAGAAAACTGTACTCTTTTGTTTTAAAGATCGGTTTGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTGTTTAAATAGTTTAAAGAT	.............(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((...(((((......))))).)))))).))))))))))))))))))))))).)))))))...............	1951206	1951288	AGATATTGGTGCGGTTCAATCAGAAAACTGTACTCTTTTGTTTTAAAGATCGGTTTGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACG	.(((((((((((((((((((((((((((((...(((((......))))).)))))).)))))))))))))))))))))))...	Aly-miR171c	1951268	1951288	TTGAGCCGTGCCAATATCACG	Aly-miR171c*	1951206	1951226	AGATATTGGTGCGGTTCAATC		3
Aly-MIR172a	PmiREN000467	MIR172	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	12144112	12144245	+	CACGGTCGCTGTTTGCTGCTGTGGCATCATCAAGATTCACATCTGTTGATGGACGGTGGTGATTCGCTCTCCCCAAAGTTCTCTATGAAAATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATCAACGGCTATTCT	...(((((.((.((((((.(((((((((((((((((((.(((.(((.((.((((..(((.((.......)).)))..)))))).)))...))).))))))))))))))))))).)))))).)).))))).....	12144132	12144225	GTGGCATCATCAAGATTCACATCTGTTGATGGACGGTGGTGATTCGCTCTCCCCAAAGTTCTCTATGAAAATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT	((((((((((((((((((.(((.(((.((.((((..(((.((.......)).)))..)))))).)))...))).))))))))))))))))))..	Aly-miR172a	12144205	12144225	AGAATCTTGATGATGCTGCAT	Aly-miR172a*	12144132	12144152	GTGGCATCATCAAGATTCACA		3
Aly-MIR172b	PmiREN000468	MIR172	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	1397243	1397369	-	ATCTGTCGTTGTTTGTAGGTGCAGCACCATCAAGATTCACATGAAAATTGATAAATCTCCTAAATTAGGGTTTTGATATGTATATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAACAATCGACGGCTACAAA	....(((((((.((((.(((((((((.(((((((((((.((((.....((.((((.(.((((...))))).)))).))....)))).))))))))))).))))))))).)))).)))))))......	1397263	1397349	GCAGCACCATCAAGATTCACATGAAAATTGATAAATCTCCTAAATTAGGGTTTTGATATGTATATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT	((((((.(((((((((((.((((.....((.((((.(.((((...))))).)))).))....)))).))))))))))).))))))..	Aly-miR172b	1397263	1397283	AGAATCTTGATGATGCTGCAT	Aly-miR172b*	1397329	1397349	GCAGCACCATCAAGATTCACA		3
Aly-MIR172c	PmiREN000469	MIR172	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	4586842	4586980	-	CCAGCTACTGTTCGCTGTTGGAGCATCATCAAGATTCACAAATCATCAAGTATTCGTGTAAATGAACCCATTTATAATTATATTGTTGATGTATGTATGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCTGCAATCAGTGGCTTACA	..((((((((...((.((((.(((((((((((((((((((...((((((((((...((((((((....))))))))...))))..))))))..)))....)))))))))))))))).)))).))...))))))))....	4586862	4586960	GAGCATCATCAAGATTCACAAATCATCAAGTATTCGTGTAAATGAACCCATTTATAATTATATTGTTGATGTATGTATGAGAATCTTGATGATGCTGCA	.(((((((((((((((((((...((((((((((...((((((((....))))))))...))))..))))))..)))....))))))))))))))))...	Aly-miR172c	4586862	4586881	AGAATCTTGATGATGCTGCA	Aly-miR172c*	4586940	4586960	GAGCATCATCAAGATTCACAA		3
Aly-MIR172d	PmiREN000470	MIR172	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	17548823	17548951	+	GCAGTCATTGTTTGCTATTGCAACATCTTCAAGATTCAGAAATCAGATTCTTTTATGGGTTTTCTTTTGAGCCTATATTATTTGGTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATTAAATGGCTTAT	..(((((((..(((((.(((((.((((.(((((((((..(((((((((.....(((((((((......)))))))))..)))))))))..))))))))).)))).))))).)))))...)))))))...	17548843	17548931	CAACATCTTCAAGATTCAGAAATCAGATTCTTTTATGGGTTTTCTTTTGAGCCTATATTATTTGGTTTGAGAATCTTGATGATGCTGCA	((.((((.(((((((((..(((((((((.....(((((((((......)))))))))..)))))))))..))))))))).)))).))..	Aly-miR172d	17548912	17548931	AGAATCTTGATGATGCTGCA	Aly-miR172d*	17548843	17548863	CAACATCTTCAAGATTCAGAA		3
Aly-MIR172e	PmiREN000471	MIR172	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	19150529	19150670	+	ACCAGCCAGTAGTCGCAGATGCAGCACCATTAAGATTCACAAGAGATGTGGTTCCCTTTGTTTTTGCCTCTCGATCCGAAGAAAAGGGTTCCTTTCGAGTGGGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAAATACATGGCTACTC	...((((((((...((.(((((((((.(((((((((((.((...((...((..((((((.((((((..........))))))))))))..))..))...)).))))))))))).))))))))).))...))).)))))....	19150549	19150650	GCAGCACCATTAAGATTCACAAGAGATGTGGTTCCCTTTGTTTTTGCCTCTCGATCCGAAGAAAAGGGTTCCTTTCGAGTGGGAATCTTGATGATGCTGCAT	((((((.(((((((((((.((...((...((..((((((.((((((..........))))))))))))..))..))...)).))))))))))).))))))..	Aly-miR172e	19150630	19150650	GGAATCTTGATGATGCTGCAT	Aly-miR172e*	19150549	19150569	GCAGCACCATTAAGATTCACA		3
Aly-MIR172f	PmiREN000472	MIR172	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1064	3075	3213	-	CCAGCTACTGTTCGCTGTTGGAGCATCATCAAGATTCACAAATCATCAAGTATTCGTGTAAATGAACCCATTTATAATTATATTGTTGATGTATGTATGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCTGCAATCAGTGGCTTACA	..((((((((...((.((((.(((((((((((((((((((...((((((((((...((((((((....))))))))...))))..))))))..)))....)))))))))))))))).)))).))...))))))))....	3095	3193	GAGCATCATCAAGATTCACAAATCATCAAGTATTCGTGTAAATGAACCCATTTATAATTATATTGTTGATGTATGTATGAGAATCTTGATGATGCTGCA	.(((((((((((((((((((...((((((((((...((((((((....))))))))...))))..))))))..)))....))))))))))))))))...	Aly-miR172f	3095	3114	AGAATCTTGATGATGCTGCA	Aly-miR172f*	3173	3193	GAGCATCATCAAGATTCACAA		3
Aly-MIR173a	PmiREN000473	MIR173	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_135	3728	3842	-	TGTGTTGGTGACTAAGTACTTTCGCTTGCAGAGAGAAATCACAGTGGTCAAAAGTTAAAGTCTCTTTCCTCTGTGATTCTCTGTGCAAGTGGAAGAGCTTGCTCCCCAAACTTAT	.((.((((.((.(((((.((((((((((((.((((((.((((((.((...((((.........)))))).)))))))))))).)))))))))))).))))).)).))))))....	3748	3822	TTCGCTTGCAGAGAGAAATCACAGTGGTCAAAAGTTAAAGTCTCTTTCCTCTGTGATTCTCTGTGCAAGTGGAAG	((((((((((.((((((.((((((.((...((((.........)))))).)))))))))))).))))))))))..	Aly-miR173a	3801	3822	TTCGCTTGCAGAGAGAAATCAC	Aly-miR173a*	3748	3768	GATTCTCTGTGCAAGTGGAAG		3
Aly-MIR173b	PmiREN000474	MIR173	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	10517128	10517242	+	TGTGTTGGTGACTAAGTACTTTCGCTTGCAGAGAGAAATCACAGTGGTCAAAAGTTAAAGTCTCTTTCCTCTGTGATTCTCTGTGCAAGTGGAAGAGCTTGCTCCCCAAACTTAT	.((.((((.((.(((((.((((((((((((.((((((.((((((.((...((((.........)))))).)))))))))))).)))))))))))).))))).)).))))))....	10517148	10517222	TTCGCTTGCAGAGAGAAATCACAGTGGTCAAAAGTTAAAGTCTCTTTCCTCTGTGATTCTCTGTGCAAGTGGAAG	((((((((((.((((((.((((((.((...((((.........)))))).)))))))))))).))))))))))..	Aly-miR173b	10517148	10517169	TTCGCTTGCAGAGAGAAATCAC	Aly-miR173b*	10517202	10517222	GATTCTCTGTGCAAGTGGAAG		3
Aly-MIR319a	PmiREN000480	MIR319	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	7941292	7941501	-	GTAGGAATATATATGTAGAGAGAGCTTCCTTGAGTCCATTCACAGGTCGTGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATACCGAGTCGCCAAAATTCGAACTAGACTCGTTAAATGAATGAATGATGCGGTAGACAAATTGGATCATTGATTCTCTTTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCTCTCTTCTGTATTCCAATT	...((((((((...(.(((((((((((((((.((((((.(((.(((..((.(.(((((((((((.(((.(((..((((((((.((..((.((((((................)))))).))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))..))).))).)))))).))))))))))..))))))...))))))))....	7941312	7941481	AGAGCTTCCTTGAGTCCATTCACAGGTCGTGATATGATCCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATACCGAGTCGCCAAAATTCGAACTAGACTCGTTAAATGAATGAATGATGCGGTAGACAAATTGGATCATTGATTCTCTTTGATTGGACTGAAGGGAGCTCCCT	(((((((((((.((((((.(((.(((..((.(.(((((((((((.(((.(((..((((((((.((..((.((((((................)))))).))..)).))))))))..))).)).).)))))))))))).))..))).))).)))))).))))))))))..)	Aly-miR319a	7941312	7941332	TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT	Aly-miR319a*	7941461	7941481	AGAGCTTCCTTGAGTCCATTC		3
Aly-MIR319b	PmiREN000481	MIR319	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	21388808	21389017	+	TGTTGAGTTGGTGAAGGAAGAGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATGGAGTAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAACATGTTCTCATATGGTAAATGAATGAATGATGCGAGAGACAAATTGAGTCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTATTTTTATTTTTTCTCGGTC	.((((((..((((((((.((.(((((((((((((((((..(((((((......(((((((((((((..((((((..((((((((.((..(((((.((((..(((....))))))).)))))..)).))))))))..))))))...))))))))).))))..)))))))..))))))))))))))))).)).))))))))....))))).)	21388828	21388997	AGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATGGAGTAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAACATGTTCTCATATGGTAAATGAATGAATGATGCGAGAGACAAATTGAGTCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT	.(((((((((((((((((..(((((((......(((((((((((((..((((((..((((((((.((..(((((.((((..(((....))))))).)))))..)).))))))))..))))))...))))))))).))))..)))))))..)))))))))))))))))...	Aly-miR319b	21388977	21388997	TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT	Aly-miR319b*	21388828	21388848	AGAGCTTTCTTCGGTCCACTC		3
Aly-MIR390a	PmiREN000498	MIR390	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	18611042	18611154	+	CAAGTAGAGAAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGATGATCTTATTTCATATCGATTTTTTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATTGGCTCTTCTTACTACAAT	.(.((((((((((.((.((.((((((((((.(((((((((((....((((............))))...))))))))))).)))))))))).)).)).))))))..))))..)	18611062	18611134	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGATGATCTTATTTCATATCGATTTTTTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCA	((((((((((.(((((((((((....((((............))))...))))))))))).))))))))))..	Aly-miR390a	18611062	18611082	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC	Aly-miR390a*	18611114	18611134	CGCTATCCATCCTGAGTTTCA		3
Aly-MIR390b	PmiREN000499	MIR390	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	18617958	18618091	+	ATAGTAGAAAAATAGCTATAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGAATCACCAATACTGTAGGTTTTGTATATACATGCATGTAGATCTGTTGGCGCTATCCATCCTGAGTTCCATAGCTTCTTCTTGCTTATAT	..(((((((....((((((..(((((((((.(((((((((((...(((.....(((((((.((.........)).)))).))))))....))))))))))).)))))))))..))))))..))).)))).....	18617978	18618071	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGAATCACCAATACTGTAGGTTTTGTATATACATGCATGTAGATCTGTTGGCGCTATCCATCCTGAGTTCCA	.(((((((((.(((((((((((...(((.....(((((((.((.........)).)))).))))))....))))))))))).)))))))))...	Aly-miR390b	18617978	18617998	AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC	Aly-miR390b*	18618051	18618071	CGCTATCCATCCTGAGTTCCA		3
Aly-MIR391	PmiREN000500	MIR391	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	19524565	19524676	+	AACTGCAAACAAAGATTTGCTTCGCAGGAGAGATAGCGCCACCACCTCTTCTAAGAAGTTAACCAGTGGTGACGGTATCTCTCCTACGTAGCAATCCTTATATATGCATCTA	...((((....(((..(((((.((.((((((((((.((.((((((..((((...)))).......)))))).)).)))))))))).)).)))))..))).....))))....	19524585	19524656	TTCGCAGGAGAGATAGCGCCACCACCTCTTCTAAGAAGTTAACCAGTGGTGACGGTATCTCTCCTACGTAGC	(.((.((((((((((.((.((((((..((((...)))).......)))))).)).)))))))))).)).)..	Aly-miR391	19524585	19524605	TTCGCAGGAGAGATAGCGCCA	Aly-miR391*	19524636	19524656	ACGGTATCTCTCCTACGTAGC		3
Aly-MIR393a	PmiREN000501	MIR393	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	19396116	19396270	+	CATAGCAACTAGAGGAAGGATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATAAAGGTGAATTACCCCAATCTTTTCTTAATAATTAGCAAACAAATCAAAAAAATTTGCTTGGTTTTGGATCATGCTATCTCTTTGGATTCATCCTTCGGTAGCTTCCTC	...(((.(((.(((((.((((((((((((((.((((.(((((......(((((((((..........(((((........)).)))...........)))))))))......))))))))).)))))))))))))).))))).))).))).....	19396136	19396250	TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATAAAGGTGAATTACCCCAATCTTTTCTTAATAATTAGCAAACAAATCAAAAAAATTTGCTTGGTTTTGGATCATGCTATCTCTTTGGATT	(((((((((((.((((.(((((......(((((((((..........(((((........)).)))...........)))))))))......))))))))).)))))))))))..	Aly-miR393a	19396136	19396157	TCCAAAGGGATCGCATTGATCC	Aly-miR393a*	19396230	19396250	ATCATGCTATCTCTTTGGATT		3
Aly-MIR393b	PmiREN000502	MIR393	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	17660783	17660959	+	CACAGCAACTAGAGAAAGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGCTGATTTATTCCCCAATATTTTATTTTCCTCATTCGAAAGTTGGAGAAAAAAAAAAAAAATTCTAAACATTTGCTTTCTTTTCCGGATCATGCGATCTCTTTGGATTCATTCTTTGGTAGCTTCCAC	...(((.(((((((((.(.(((((((((((((((((.(((((.....((((((.((((..........((((.((((((.............)))))).))))..........))))))...))))........)))))))))))))))))))))).).))))))))).))).....	17660803	17660939	TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATTAAGCTGATTTATTCCCCAATATTTTATTTTCCTCATTCGAAAGTTGGAGAAAAAAAAAAAAAATTCTAAACATTTGCTTTCTTTTCCGGATCATGCGATCTCTTTGGATT	((((((((((((((((.(((((.....((((((.((((..........((((.((((((.............)))))).))))..........))))))...))))........)))))))))))))))))))))..	Aly-miR393b	17660803	17660823	TCCAAAGGGATCGCATTGATC	Aly-miR393b*	17660919	17660939	ATCATGCGATCTCTTTGGATT		3
Aly-MIR394a	PmiREN000503	MIR394	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	8699220	8699343	+	AGAGTTTCTTACAGACATCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCTCCTGTACATGTGTGTATATATATGTGTTTTGTGTGGAAGAAGGAGGTGGGTATACTGCCAATAGAGATCTGTTAGGGTTTCTT	((((.((((.(((((..(((((((((...((((((((((((.((..(((((((((....)))))))))..........)).))))))))))))...)))))).)))..))))).)))).)))).	8699240	8699323	TTGGCATTCTGTCCACCTCCTCCTGTACATGTGTGTATATATATGTGTTTTGTGTGGAAGAAGGAGGTGGGTATACTGCCAATA	((((((...((((((((((((.((..(((((((((....)))))))))..........)).))))))))))))...))))))..	Aly-miR394a	8699240	8699259	TTGGCATTCTGTCCACCTCC	Aly-miR394a*	8699303	8699323	GAGGTGGGTATACTGCCAATA		3
Aly-MIR394b	PmiREN000504	MIR394	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	17011862	17011982	+	AGAGTCTCTTACAGAGATCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCTCTCTCTATATGTATATGTATGAGCGCTGTCTTGTGAGGGGAGGTGGACATATTGCCAACAGAGATCTGTTAGGGTTTCTT	((((.((((.(((((..(((((((((...((((((((((((((((((((((....))))).)))(((......)))))))))))))))))...)))))).)))..))))).)))).)))).	17011882	17011962	TTGGCATTCTGTCCACCTCCTCTCTCTATATGTATATGTATGAGCGCTGTCTTGTGAGGGGAGGTGGACATATTGCCAACA	((((((...((((((((((((((((((((((....))))).)))(((......)))))))))))))))))...))))))..	Aly-miR394b	17011882	17011901	TTGGCATTCTGTCCACCTCC	Aly-miR394b*	17011942	17011962	GAGGTGGACATATTGCCAACA		3
Aly-MIR395a	PmiREN000511	MIR395	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	14006209	14006343	+	GTCAACTGTCCCCTTGAGTTCCCTTAAACGCTTCATTGTTCATACTTTGTGAGTTTGTGTTCTAAGATCTATCGACCGATAAATCAATCTGATGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTCTAGGTGACATCTTGGC	(((((.((((.(((.((((((((((((((((((((.(((((((.(....(((..(((.(((............))))))....)))....)))))))).)))))))))))))))))))).))).))))..)))))	14006226	14006327	GTTCCCTTAAACGCTTCATTGTTCATACTTTGTGAGTTTGTGTTCTAAGATCTATCGACCGATAAATCAATCTGATGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTC	((((((((((((((((((.(((((((.(....(((..(((.(((............))))))....)))....)))))))).))))))))))))))))))))	Aly-miR395a	14006307	14006329	CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC	Aly-miR395a*	14006226	14006246	GTTCCCTTAAACGCTTCATTG		2
Aly-MIR395b	PmiREN000506	MIR395	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	10964915	10965032	-	AAAGCCAAATGTCCCCATGAGTTCCCTTTAACGCTTCATTGTTAAATACTCAAAGCCACATTGGTTTGTATATAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTCTTGGTGCCATTTTGGCGTTG	...((((((((.(.(((.((((((((((.(((((((((.(((((.((((...((((((...)))))))))).))))).))))))))).)))))))))).))).).)).))))))....	10964935	10965012	GTTCCCTTTAACGCTTCATTGTTAAATACTCAAAGCCACATTGGTTTGTATATAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTC	((((((((.(((((((((.(((((.((((...((((((...)))))))))).))))).))))))))).))))))))..	Aly-miR395b	10964935	10964955	CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC	Aly-miR395b*	10964992	10965012	GTTCCCTTTAACGCTTCATTG		3
Aly-MIR395c	PmiREN000505	MIR395	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	10968032	10968168	-	AAAGTCAAATGTCTTCATGAGTTCCCTTTAACGCTTCATTGTTAATATTCAAACTACATTTATTTCCATAAATGTTTGATCGATTTGTATATAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTTTTGGTGTCATTCTGGCGTAG	...((((((((.(.(((.((((((((((.(((((((((.(((((((((((((...((((((((....)))))))))))).......)))).))))).))))))))).)))))))))).))).).)))).))))))))	10968052	10968148	GTTCCCTTTAACGCTTCATTGTTAATATTCAAACTACATTTATTTCCATAAATGTTTGATCGATTTGTATATAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTT	((((((((.(((((((((.(((((((((((((...((((((((....)))))))))))).......)))).))))).))))))))).))))))))))	Aly-miR395c	10968052	10968074	CTGAAGTGTTTGGGGGGACTT	Aly-miR395c*	10968128	10968148	GTTCCCTTTAACGCTTCATTG		2
Aly-MIR395d	PmiREN000509	MIR395	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	13997975	13998092	-	TCGACTAGATGTCCTCTAGAGTTCTCCCGAACACTTCATTGGAAATTTGTTATTCGGTAAACTACCAATTAATTCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCGGATGTCATTTGGTGATGT	((.((((((((.(.(((.((((((((((((((((((((.((((.....((((...((((...))))...)))))))).)))))))))))))))))))).))).).))))))))))...	13997995	13998072	GTTCTCCCGAACACTTCATTGGAAATTTGTTATTCGGTAAACTACCAATTAATTCCACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	((((((((((((((((((.((((.....((((...((((...))))...)))))))).))))))))))))))))))))	Aly-miR395d	13997995	13998017	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Aly-miR395d*	13998052	13998072	GTTCTCCCGAACACTTCATTG		2
Aly-MIR395e	PmiREN000507	MIR395	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	14000948	14001060	-	TTGGTCGGATGTTTCCTAGAGTTCCTCTGAGCACTTCATTGGAGATACCATCTTTTATCAAATGGTTTTCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCCGGACTCATTCGATATTTT	...((((((((..(((..((((((((((((((((((((.((((((.(((((..........))))))))))).))))))))))))))))))))..)))..)))))))).....	14000968	14001040	GTTCCTCTGAGCACTTCATTGGAGATACCATCTTTTATCAAATGGTTTTCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	((((((((((((((((((.((((((.(((((..........))))))))))).))))))))))))))))))..	Aly-miR395e	14000968	14000988	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Aly-miR395e*	14001020	14001040	GTTCCTCTGAGCACTTCATTG		3
Aly-MIR395f	PmiREN000510	MIR395	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	14002867	14002993	+	GTCAAATGTCTCCTTGAGTTCCCTTAAACGCTTTATTGTTCACACTTTGTTGTCTAAGATCAATCGATCGATTCAATCAATCTGACGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTCTAGGTGACATATGGC	((((.(((((.(((.((((((((((((((((((((.(((((.((..((((((.....((((....))))....))).)))..))..))))).)))))))))))))))))))).))).))))).))))	14002884	14002978	GTTCCCTTAAACGCTTTATTGTTCACACTTTGTTGTCTAAGATCAATCGATCGATTCAATCAATCTGACGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTC	((((((((((((((((((.(((((.((..((((((.....((((....))))....))).)))..))..))))).))))))))))))))))))))	Aly-miR395f	14002958	14002980	CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC	Aly-miR395f*	14002884	14002904	GTTCCCTTAAACGCTTTATTG		2
Aly-MIR395g	PmiREN000508	MIR395	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	14005411	14005523	-	TTGGTCGGATGTTCCCTAGAGTTCCTCTGAGCACTTCATTGGAGATACCATTGTCTATGAAATAGTATTCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGACTCATTCGATAATTT	...((((((((...((..((((((((((((((((((((.(((((.(((.(((........))).)))))))).))))))))))))))))))))..))...)))))))).....	14005431	14005503	GTTCCTCTGAGCACTTCATTGGAGATACCATTGTCTATGAAATAGTATTCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	((((((((((((((((((.(((((.(((.(((........))).)))))))).))))))))))))))))))..	Aly-miR395g	14005431	14005451	CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC	Aly-miR395g*	14005483	14005503	GTTCCTCTGAGCACTTCATTG		3
Aly-MIR396a	PmiREN000512	MIR396	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	17432894	17433063	-	ACGTGACCCTCTCTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAAAACTTCTTCAGATTTGTTTTTTTTATATATATGTCTTACGCATAAAATAGTGTTTTTGTTCACATCTCTGCTCGATTGATTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACGGACAGAGTCAAAGAA	...........((((((((.((((((((((((.((((((((((((.(.((..((((..(((.......((((.(((((.....))))).....))))........)))..))))...))..).)))))))))))).)))))))))))).)))))))).............	17432914	17433043	TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAAAACTTCTTCAGATTTGTTTTTTTTATATATATGTCTTACGCATAAAATAGTGTTTTTGTTCACATCTCTGCTCGATTGATTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAG	((((((((((((.((((((((((((.(.((..((((..(((.......((((.(((((.....))))).....))))........)))..))))...))..).)))))))))))).))))))))))))..	Aly-miR396a	17433023	17433043	TTCCACAGCTTTCTTGAACTG	Aly-miR396a*	17432914	17432934	GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG		3
Aly-MIR396b	PmiREN000513	MIR396	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	18203546	18203709	+	AGAAGATCCTGGTCATATTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTTTCATTTCCATTGTTTTTTTTTTTCTAAACCAAAAAAAAAGATCTCTAAAATTTAGCATTTTGGAAACAAAGAAGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGACAATTCAGGGTTTT	.....(((((((((((.((((((((((((((((((((.(((.((((((..((((((.(((((((((((((........)))))))))).............)))...))))))..))))))))).)))))))))))))))))))).)))))....))))))...	18203566	18203689	TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTTTCATTTCCATTGTTTTTTTTTTTCTAAACCAAAAAAAAAGATCTCTAAAATTTAGCATTTTGGAAACAAAGAAGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA	(((((((((((((((((.(((.((((((..((((((.(((((((((((((........)))))))))).............)))...))))))..))))))))).)))))))))))))))))..	Aly-miR396b	18203566	18203586	TTCCACAGCTTTCTTGAACTT	Aly-miR396b*	18203669	18203689	GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA		3
Aly-MIR397a	PmiREN000514	MIR397	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	22804022	22804147	+	TCCTGGATTTGAATGAACATCATTGAGTGCAGCGTTGATGTAATTTCCTTTTTTTTTCATTGTTGAATGGAATTAAAAGAATTTACACCGGCGTTGCGCTCAATTATGTTTTTCTTATTTTCAGGA	(((((((..(((..((((((.((((((((((((((((.(((((.(((.((((..(((((((....)))))))..))))))).))))).)))))))))))))))).))))))...)))..)))))))	22804041	22804129	TCATTGAGTGCAGCGTTGATGTAATTTCCTTTTTTTTTCATTGTTGAATGGAATTAAAAGAATTTACACCGGCGTTGCGCTCAATTATG	(.((((((((((((((((.(((((.(((.((((..(((((((....)))))))..))))))).))))).)))))))))))))))).)))	Aly-miR397a	22804041	22804063	TCATTGAGTGCAGCGTTGATG	Aly-miR397a*	22804109	22804129	CCGGCGTTGCGCTCAATTATG		2
Aly-MIR397b	PmiREN000515	MIR397	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	14978334	14978464	-	CCTGGGTTTGAATAAACATCATTGAGTGCAGCGTTGATGTAAGTTTACTTATTTTATTCCATTGTTGAATGAATTAAAATGATACAGAATACATCAGCGTTGCATTCAATTATGTTTTTCTAATTTTCAGG	((((((...(((.((((((.(((((((((((((((((((((.......((((((((...((((....))))...)))))))).......))))))))))))))))))))).))))))))).....))))))	14978352	14978447	TCATTGAGTGCAGCGTTGATGTAAGTTTACTTATTTTATTCCATTGTTGAATGAATTAAAATGATACAGAATACATCAGCGTTGCATTCAATTATG	(.(((((((((((((((((((((.......((((((((...((((....))))...)))))))).......))))))))))))))))))))).)))	Aly-miR397b	14978427	14978449	TCATTGAGTGCAGCGTTGATG	Aly-miR397b*	14978352	14978372	TCAGCGTTGCATTCAATTATG		2
Aly-MIR398a	PmiREN000516	MIR398	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	1852492	1852613	+	ACAGGAGGTGAAATCTCAAAGGAGTGTCATGAGAACACAGATCCTATGGTTTCTTTACATTTTCATTGAAACCATTGAGTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGAATCTCCCCTGTTCCTTT	(((((.((.((....(((((((.(((.(.(((((((((((((.(.((((((((..............)))))))).).))))))))))))).).))).))))))).)).)))))))......	1852512	1852593	GGAGTGTCATGAGAACACAGATCCTATGGTTTCTTTACATTTTCATTGAAACCATTGAGTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTT	((.(((.(.(((((((((((((.(.((((((((..............)))))))).).))))))))))))).).))).))..	Aly-miR398a	1852573	1852593	TGTGTTCTCAGGTCACCCCTT	Aly-miR398a*	1852512	1852532	GGAGTGTCATGAGAACACAGA		3
Aly-MIR398b	PmiREN000517	MIR398	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	5876508	5876628	+	GAAGGTAGTGGATCTCGACAGGGTTGATATGAGGACACATGTGTAATCAACGGCTGTAATGACGCCACGTCATTGTTACATGTGTTCTCAGGTCACCCCTGCTGAGCTCTTTCTCTACCGA	...(((((.(((.((((.(((((.((((.((((((((((((((.............((((((((...)))))))).)))))))))))))).)))).))))).)))).)))....)))))..	5876528	5876608	GGGTTGATATGAGGACACATGTGTAATCAACGGCTGTAATGACGCCACGTCATTGTTACATGTGTTCTCAGGTCACCCCTG	(((.((((.((((((((((((((.............((((((((...)))))))).)))))))))))))).)))).)))..	Aly-miR398b	5876588	5876608	TGTGTTCTCAGGTCACCCCTG	Aly-miR398b*	5876528	5876548	GGGTTGATATGAGGACACATG		3
Aly-MIR399a	PmiREN000520	MIR399	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	12890916	12891053	+	AAAGGTGGAAATGTATTACAGGGTAAGATCTCTATTGGCAGGAAACCATTACTTAGATCTTTGCATCTCTTTATGCATTGCTTTTAAGTGAGTTCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGGTAATTCTTCTGCACCAATAT	...((((.(...(.(((((.(((((.(((((((.((((((((.(((..(((((((((.(..(((((......)))))..)..)))))))))))).)))))))).)))))))))))).))))).)...).))))....)	12890936	12891033	GGGTAAGATCTCTATTGGCAGGAAACCATTACTTAGATCTTTGCATCTCTTTATGCATTGCTTTTAAGTGAGTTCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	(((((.(((((((.((((((((.(((..(((((((((.(..(((((......)))))..)..)))))))))))).)))))))).)))))))))))).)	Aly-miR399a	12891013	12891035	TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	Aly-miR399a*	12890936	12890956	GGGTAAGATCTCTATTGGCAG		2
Aly-MIR399b	PmiREN000518	MIR399	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1307900	1308044	+	ATGTAAGCTCACAAGTTTTAGGGCGCCTCTCCATTGGCAGGTCCTTTATTTCCAAATATACACATACATATATGAATATAGAAAATTTCGATTTATATATGACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGAAACTGGTTCAGCTTAATTA	....(((((.((.((((((((((((.((((((.((((((((((........................((((((((((...(((...))).)))))))))))))))))))).)))))).)))))))))))).))..))))).....	1307920	1308024	GGGCGCCTCTCCATTGGCAGGTCCTTTATTTCCAAATATACACATACATATATGAATATAGAAAATTTCGATTTATATATGACCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG	(((((.((((((.((((((((((........................((((((((((...(((...))).)))))))))))))))))))).)))))).)))))..	Aly-miR399b	1308004	1308024	TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG	Aly-miR399b*	1307920	1307940	GGGCGCCTCTCCATTGGCAGG		3
Aly-MIR399c	PmiREN000519	MIR399	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	20345017	20345148	+	CTATAAGCGGAGCAGTAATAGGGCATCTTTCTATTGGCAGGAGACTCGGCTATTTGTATCTTTTGTGTTCTTGGCTATTGGCTATGTCACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTCACTACTTCCGCTTAAACA	...(((((((((.(((.((((((((.((((((.((((((((.(((..(((((...((................))...)))))..))).)))))))).)))))).)))))))).))).).))))))))....	20345037	20345128	GGGCATCTTTCTATTGGCAGGAGACTCGGCTATTTGTATCTTTTGTGTTCTTGGCTATTGGCTATGTCACTTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG	(((((.((((((.((((((((.(((..(((((...((................))...)))))..))).)))))))).)))))).)))))..	Aly-miR399c	20345108	20345128	TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG	Aly-miR399c*	20345037	20345057	GGGCATCTTTCTATTGGCAGG		3
Aly-MIR399d	PmiREN000521	MIR399	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	12884715	12884820	+	ATTACAGGGCAAGATCTCTATTGGCAGGAAACCATTACTTGACCTTTGCATCTCTTTATGCATTGCTTTGTAGTGAGTTCTTGCCAAAGGAGATTTGCCCGGTAAT	(((((.(((((.(((((((.((((((((((..((((((..((.(..(((((......)))))..).)).))))))..)))))))))).)))))))))))).)))))	12884721	12884816	GGGCAAGATCTCTATTGGCAGGAAACCATTACTTGACCTTTGCATCTCTTTATGCATTGCTTTGTAGTGAGTTCTTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	(((((.(((((((.((((((((((..((((((..((.(..(((((......)))))..).)).))))))..)))))))))).)))))))))))).)	Aly-miR399d	12884796	12884818	TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG	Aly-miR399d*	12884721	12884741	GGGCAAGATCTCTATTGGCAG		2
Aly-MIR402	PmiREN000522	MIR402	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	17541863	17542056	+	TTTTTATTTCACCATGATCCTTGGCCTATTGAACCTCTGTTTTAACTGCTTTTGAAAAGTTTTCCTTTTTAGAAATCTTCTTGTCTCTTTCTCCAACAACATCCCGTTAGTTCTTGGAAGAAATTAAGACTGACTTCCAAAAACCCTTTTAAAACAGAGTTCCGTAGACCACGGATTGCAAAAGAGACTATGCC	...............(((((.(((.((((.((((.((((((((((....((((((((((.....))))))))))........((((.(((((((((.(((.........))).)))).)))))...))))..................)))))))))))))).)))).))).))))).................	17541883	17542036	TTGGCCTATTGAACCTCTGTTTTAACTGCTTTTGAAAAGTTTTCCTTTTTAGAAATCTTCTTGTCTCTTTCTCCAACAACATCCCGTTAGTTCTTGGAAGAAATTAAGACTGACTTCCAAAAACCCTTTTAAAACAGAGTTCCGTAGACCACGG	.(((.((((.((((.((((((((((....((((((((((.....))))))))))........((((.(((((((((.(((.........))).)))).)))))...))))..................)))))))))))))).)))).)))...	Aly-miR402	17541883	17541904	TTGGCCTATTGAACCTCTGTTT	Aly-miR402*	17542016	17542036	ACAGAGTTCCGTAGACCACGG		3
Aly-MIR403a	PmiREN000523	MIR403	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	22991764	22991898	+	ATTAGAAGAGTCGTATTACATGTTTTGTGCGTGACTCTAATTTAACAGGCTTATGTTTGAGATTTTTTTGACAAATCCGGATTTTGCTGTTGGATTAGATTCACGCACAAACTCGTAATCTGTCTTTTCGATTTT	....((((((.((.(((((..((((.((((((((.(((((((((((((.(....(((((.(((((.......))))))))))...)))))))))))))).))))))))))))..))))).)).))))))......	22991784	22991878	TGTTTTGTGCGTGACTCTAATTTAACAGGCTTATGTTTGAGATTTTTTTGACAAATCCGGATTTTGCTGTTGGATTAGATTCACGCACAAACTCG	.((((.((((((((.(((((((((((((.(....(((((.(((((.......))))))))))...)))))))))))))).))))))))))))...	Aly-miR403a	22991858	22991878	TTAGATTCACGCACAAACTCG	Aly-miR403a*	22991784	22991805	TGTTTTGTGCGTGACTCTAATT		3
Aly-MIR403b	PmiREN000524	MIR403	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_302	4995	5129	+	ATTAGAAGAGTCGTATTACATGTTTTGTGCGTGACTCTAATTTAACAGGCTTATGTTTGAGATTTTTTTGACAAATCCGGATTTTGCTGTTGGATTAGATTCACGCACAAACTCGTAATCTGTCTTTTCGATTTT	....((((((.((.(((((..((((.((((((((.(((((((((((((.(....(((((.(((((.......))))))))))...)))))))))))))).))))))))))))..))))).)).))))))......	5015	5109	TGTTTTGTGCGTGACTCTAATTTAACAGGCTTATGTTTGAGATTTTTTTGACAAATCCGGATTTTGCTGTTGGATTAGATTCACGCACAAACTCG	.((((.((((((((.(((((((((((((.(....(((((.(((((.......))))))))))...)))))))))))))).))))))))))))...	Aly-miR403b	5089	5109	TTAGATTCACGCACAAACTCG	Aly-miR403b*	5015	5036	TGTTTTGTGCGTGACTCTAATT		3
Aly-MIR408	PmiREN000525	MIR408	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	22869881	22870007	+	GTGGTAATGATAGAGAGAGACAGGGAACAAGCAGAGCATGGATTGAGTTTACTAAAACATTAAACGACTCTGTTTTGTCTCTACCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCCCTCTTTTCTCTCTCTCT	...........((((((((((((((((...((((.((((((...(((...((.((((((...........)))))))))))...)))))).))))...)))))))...........)))))))))..	22869901	22869987	CAGGGAACAAGCAGAGCATGGATTGAGTTTACTAAAACATTAAACGACTCTGTTTTGTCTCTACCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGC	(((((((...((((.((((((...(((...((.((((((...........)))))))))))...)))))).))))...)))))))..	Aly-miR408	22869967	22869987	ATGCACTGCCTCTTCCCTGGC	Aly-miR408*	22869901	22869921	CAGGGAACAAGCAGAGCATGG		3
Aly-MIR773	PmiREN000543	MIR773	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	17336081	17336230	-	TTAACGGGTGAAGGAGGCAATATCTTTGAACAAACAGTTGATTTTAGAATTCCAACAACTAAAGGTGTGGAGAACATACAGTACCTTTAGTCGATGTACTTCTGCAATCAATTGTTCATTCAAGGATATTGTATCCTTCAACTTTTGAGC	((((.((.(((((((.((((((((((((((..(((((((((((.(((((...((.(.((((((((((((.........)).)))))))))).).))...))))).)))))))))))..)))))))))))))).))))))).)).))))))	17336101	17336210	TATCTTTGAACAAACAGTTGATTTTAGAATTCCAACAACTAAAGGTGTGGAGAACATACAGTACCTTTAGTCGATGTACTTCTGCAATCAATTGTTCATTCAAGGATATT	((((((((((..(((((((((((.(((((...((.(.((((((((((((.........)).)))))))))).).))...))))).)))))))))))..))))))))))))	Aly-miR773	17336190	17336212	TATCTTTGAACAAACAGTTGA	Aly-miR773*	17336101	17336121	AATTGTTCATTCAAGGATATT		2
Aly-MIR774	PmiREN000544	MIR774	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	3372430	3372559	-	TGTTCATTTGGATTCATATTCGAGACGAAGATATGGGTGACTAATACTTAAGATTTTGGTCAATTTAAATTACCAATCTAATTATTTGTTACCCATATCTCCATCTCCAATTTAATCTCTTAAAAGTCGT	.....................((((.(.(((((((((((((.((((.(((.(((..((((.(((....))))))))))))).)))).))))))))))))).).)))).......................	3372450	3372539	CGAGACGAAGATATGGGTGACTAATACTTAAGATTTTGGTCAATTTAAATTACCAATCTAATTATTTGTTACCCATATCTCCATCTCCAA	.((((.(.(((((((((((((.((((.(((.(((..((((.(((....))))))))))))).)))).))))))))))))).).))))...	Aly-miR774	3372519	3372539	CGAGACGAAGATATGGGTGAC	Aly-miR774*	3372450	3372470	TACCCATATCTCCATCTCCAA		3
Aly-MIR822	PmiREN000546	MIR822	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	1060682	1060763	-	GTATAAGTCGATATATGGGGATGTAACGCATGTTGTTTTCTGCGAGGAGCATTTGTACATGTTTCATGTAGCATGAAATCAC	...........((((((((((((((.((.(((((.(((.....))).))))).))))))).)))))))))............	1060702	1060743	ATGTAACGCATGTTGTTTTCTGCGAGGAGCATTTGTACATGT	(((((.((.(((((.(((.....))).))))).)))))))..	Aly-miR822	1060723	1060743	ATGTAACGCATGTTGTTTTCT	Aly-miR822*	1060702	1060722	GCGAGGAGCATTTGTACATGT		3
Aly-MIR823	PmiREN000547	MIR823	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	5608913	5609117	-	TACGTTTTCCAATCACGAATCTTGTATGATCACTAACCATTGGAAGTAAAAGAGTATATATGACTTCGAACGGTTTGCAATACGGAGGCTCATAGCAACCCTTTCTTCTTGCTAATATTGCAACTTGCAAGCCGTTCAAATTAAAATAGTCATCATTTAGTTCTAGGTTGGTGATCATATAGGATTGGTAACAGTGAAACATATC	((.(((((......((.(((((((((((((((((((((..(((((.((((.((.......(((((..(((((((((((((...((..(((...)))..))........((((.......)))).)))))))))))))..........))))))).)))).)))))))))))))))))))))))))).))......))))).))..	5608933	5609097	CTTGTATGATCACTAACCATTGGAAGTAAAAGAGTATATATGACTTCGAACGGTTTGCAATACGGAGGCTCATAGCAACCCTTTCTTCTTGCTAATATTGCAACTTGCAAGCCGTTCAAATTAAAATAGTCATCATTTAGTTCTAGGTTGGTGATCATATAGGAT	((((((((((((((((((..(((((.((((.((.......(((((..(((((((((((((...((..(((...)))..))........((((.......)))).)))))))))))))..........))))))).)))).)))))))))))))))))))))))..	Aly-miR823	5608933	5608954	TAGGTTGGTGATCATATAGGAT	Aly-miR823*	5609077	5609097	CTTGTATGATCACTAACCATT		3
Aly-MIR825	PmiREN000548	MIR825	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	6095665	6095792	+	GATTGATTCCATCAACTCGTTCAAGCACCAGCTCGAAGAAGCGTAGCTAATTTATCTTAGAAAATCATGGATTTGAAAAAGCTACGCTTCTCGAGAAGGTGCATGAACAAGTTGATGCATATTTTGAT	..........(((((((.(((((.(((((..(((((.(((((((((((..(((((((...........))))..)))..))))))))))))))))..))))).))))).)))))))............	6095685	6095772	TCAAGCACCAGCTCGAAGAAGCGTAGCTAATTTATCTTAGAAAATCATGGATTTGAAAAAGCTACGCTTCTCGAGAAGGTGCATGAAC	(((.(((((..(((((.(((((((((((..(((((((...........))))..)))..))))))))))))))))..))))).)))..	Aly-miR825	6095752	6095772	TTCTCGAGAAGGTGCATGAAC	Aly-miR825*	6095685	6095705	TCAAGCACCAGCTCGAAGAAG		3
Aly-MIR827	PmiREN000549	MIR827	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	19566586	19566704	-	TCTTGCAACCCTTGAATGTGTTTGTTGATTGACATCTATACATATCGATAATCCTATCGTGTTGATAGATCGATTGGTTTAGATGACCATCAACAAACGCTTTCGTGGTTTTGCATCGC	...(((((.((.((((.((((((((((((.(.((((((.((..((((((....(((((.....)))))))))))..)).)))))).).)))))))))))).)))).))..)))))....	19566606	19566684	TTTGTTGATTGACATCTATACATATCGATAATCCTATCGTGTTGATAGATCGATTGGTTTAGATGACCATCAACAAACG	(((((((((.(.((((((.((..((((((....(((((.....)))))))))))..)).)))))).).)))))))))..	Aly-miR827	19566606	19566626	TTAGATGACCATCAACAAACG	Aly-miR827*	19566664	19566684	TTTGTTGATTGACATCTATAC		3
Aly-MIR828	PmiREN000550	MIR828	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	6065292	6065431	-	TCCTTCCACTTTCTAATGTTTCTTGCTTAAATGAGTATTCCATGTAAAAAATGAGTCACTCACTCATATGGGTGGGTTGGGTTGGTTTTCTCTTCATGAGATGCTCATTTGAGCAAGCAATGTCTGTGAGTGGAACTATT	...((((((((.(..(((((.((((((((((((((((((.((((...(((((.((((((((((((....))))))))..)))).))))).....)))).)))))))))))))))))).)))))..).)))))))).....	6065312	6065411	TCTTGCTTAAATGAGTATTCCATGTAAAAAATGAGTCACTCACTCATATGGGTGGGTTGGGTTGGTTTTCTCTTCATGAGATGCTCATTTGAGCAAGCAA	.((((((((((((((((((.((((...(((((.((((((((((((....))))))))..)))).))))).....)))).))))))))))))))))))...	Aly-miR828	6065390	6065411	TCTTGCTTAAATGAGTATTCCA	Aly-miR828*	6065312	6065332	GATGCTCATTTGAGCAAGCAA		3
Aly-MIR831	PmiREN000551	MIR831	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	2376185	2376359	+	CAAGAATGTATAGTCTTAGAGTCTCAAGAAGAGGTACAAGGAGATGAGAAGTGAATCACTGAAACAAGTGGTTCTGGTTTGTGGATCAGTATGGTTTACCCAAAACACGTGTTTGGTGCTTCACTTCTAAACTCCTCGTACTCTTCTTGGGATTCTATGACTTACACTTGTTGAT	((((..((((.((((.(((((((((((((((((.(((.(((((...(((((((((.((((.(((((.(((....(((...((((((((...)))))))))))...))).))))))))).)))))))))...))))).)))))))))))))))))))).))))))))))))).)..	2376205	2376339	GTCTCAAGAAGAGGTACAAGGAGATGAGAAGTGAATCACTGAAACAAGTGGTTCTGGTTTGTGGATCAGTATGGTTTACCCAAAACACGTGTTTGGTGCTTCACTTCTAAACTCCTCGTACTCTTCTTGGGATTC	(((((((((((((.(((.(((((...(((((((((.((((.(((((.(((....(((...((((((((...)))))))))))...))).))))))))).)))))))))...))))).))))))))))))))))))	Aly-miR831	2376320	2376341	TCGTACTCTTCTTGGGATTC	Aly-miR831*	2376205	2376225	GTCTCAAGAAGAGGTACAAGG		2
Aly-MIR838	PmiREN000552	MIR838	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	513692	513831	-	TCAATCCACCTCCGGTGTTGTGCAAGAATGAGAAGCAAAGCCTGTCTATGTATTGTGAGATATCTACTTCTATGACTAGGATATATGTACAAGACCGGCTTTTCTTCTTCTTCTTGCACAACCTGAGGTAATTGGGGCTA	(((((..(((((.((.((((((((((((.((((((.((((((.((((.(((((......((((((.............))))))..))))))))).)))))).)))))).))))))))))))))))))).))))).....	513712	513811	TGCAAGAATGAGAAGCAAAGCCTGTCTATGTATTGTGAGATATCTACTTCTATGACTAGGATATATGTACAAGACCGGCTTTTCTTCTTCTTCTTGCACA	((((((((.((((((.((((((.((((.(((((......((((((.............))))))..))))))))).)))))).)))))).))))))))..	Aly-miR838	513712	513732	TTTTCTTCTTCTTCTTGCACA	Aly-miR838*	513791	513811	TGCAAGAATGAGAAGCAAAGC		3
Aly-MIR840	PmiREN000553	MIR840	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	995551	995717	-	TTACATCCGCAGTGTGGAAGACACTAAAGGACCTAAACTAACAAAGAGAAACAGCTCATTGTGCGGGGTATTACACTCTTAATGTCTGAATGCGATAATCCGCACGATGATCTCTTTATCTTTGTTTGTTTAGGTCCCTTAGTTTCTTCTATACCGCGAATGAAATC	((.(((.(((.((((((((((.(((((.((((((((((.((((((((.(((.((.((((((((((((.((((.((.((.........)).)).)))).)))))))))))).)).))).)))))))).)))))))))).))))).)))))))))).))).)))))...	995571	995697	ACACTAAAGGACCTAAACTAACAAAGAGAAACAGCTCATTGTGCGGGGTATTACACTCTTAATGTCTGAATGCGATAATCCGCACGATGATCTCTTTATCTTTGTTTGTTTAGGTCCCTTAGTTTCT	(.(((((.((((((((((.((((((((.(((.((.((((((((((((.((((.((.((.........)).)).)))).)))))))))))).)).))).)))))))).)))))))))).))))).)..	Aly-miR840	995571	995592	TTGTTTAGGTCCCTTAGTTTCT	Aly-miR840*	995677	995697	ACACTAAAGGACCTAAACTAA		3
Aly-MIR842	PmiREN000554	MIR842	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	2587548	2587677	-	AAGAGAGACCACAAGCGGGATGATGGATCCGACCATGATGGTGTTGCAGAAACTTATGTACGAGGTAGTTATCCAGGGGTCGAAACACCATCATGGTCAGATCCGTCATCCCACTTATGTTTTTTTAGGT	.((((((((...(((.(((((((((((((.(((((((((((((((...((..(((....((......)).....)))..))..))))))))))))))).))))))))))))).)))..))))))))....	2587568	2587657	TGATGGATCCGACCATGATGGTGTTGCAGAAACTTATGTACGAGGTAGTTATCCAGGGGTCGAAACACCATCATGGTCAGATCCGTCATC	(((((((((.(((((((((((((((...((..(((....((......)).....)))..))..))))))))))))))).)))))))))..	Aly-miR842	2587637	2587657	TGATGGATCCGACCATGATGG	Aly-miR842*	2587568	2587588	ATCATGGTCAGATCCGTCATC		3
Aly-MIR844	PmiREN000555	MIR844	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	1803625	1803758	-	AATCTTTTAGATTGAAGAAAAGAAGGACTAGTAAGATGGCTTATAAGCTGGATTTTGAGAGTGAGTGAGCTCTTCTACGCATTGGCTTATAAGCCATCTTACTAGTCTTTCTTTTCTTCAATGTGGGGATCATA	(.(((((.(.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.....((((((......)))))).......))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))....	1803645	1803738	AGAAGGACTAGTAAGATGGCTTATAAGCTGGATTTTGAGAGTGAGTGAGCTCTTCTACGCATTGGCTTATAAGCCATCTTACTAGTCTTTCTTT	(((((((((((((((((((((((((((((((.....((((((......)))))).......)))))))))))))))))))))))))))))))..	Aly-miR844	1803718	1803738	AGAAGGACTAGTAAGATGGCT	Aly-miR844*	1803645	1803665	CCATCTTACTAGTCTTTCTTT		3
Aly-MIR845a	PmiREN000556	MIR845	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	8114932	8115030	+	ATCGCTCGGTTTCCATCACGTCGATTGGTGTCAGAGCCACGCCTATGAAAAATTTGCGCGGCTCTGATACCAGTTGATGCAATGGAAACATCGATATTG	........((((((((..((((((((((((((((((((.(((..((.....))..))).))))))))))))))))))))..))))))))..........	8114952	8115010	TCGATTGGTGTCAGAGCCACGCCTATGAAAAATTTGCGCGGCTCTGATACCAGTTGATG	((((((((((((((((((.(((..((.....))..))).))))))))))))))))))..	Aly-miR845a	8114990	8115010	CGGCTCTGATACCAGTTGATG	Aly-miR845a*	8114952	8114972	TCGATTGGTGTCAGAGCCACG		3
Aly-MIR845b	PmiREN000557	MIR845	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	8118263	8118366	+	ATCACTAGGTTTCCATCACATCAATTGGTATCAGAGCAACGCATGATGTATAATAACTAAGCGTCGCTCTGATACCAAATGATGCAATGTAAACATGGATATTG	((......((((.(((..(((((.(((((((((((((.((((..................)))).))))))))))))).)))))..))).))))))........	8118283	8118346	TCAATTGGTATCAGAGCAACGCATGATGTATAATAACTAAGCGTCGCTCTGATACCAAATGATG	(((.(((((((((((((.((((..................)))).))))))))))))).)))..	Aly-miR845b	8118326	8118346	TCGCTCTGATACCAAATGATG	Aly-miR845b*	8118283	8118303	TCAATTGGTATCAGAGCAACG		3
Aly-MIR846	PmiREN000558	MIR846	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	2587065	2587369	-	GATGCCACGTCCGGTTTCATTCAGGGACTTCAATTCAGAACCAACTTCATGGTTTTTGAACTAATTGGATATGATAAATGGTACCAAGTTTTCACTTGCATTCAAGGGACATATATCATTGGGTTTTTACTTTTATGGATATATGACTATGACATACACGATTAGAAGCTAAAGGTTGCGGGAGGCAAGCAGTGGGATAATGATCTGCAAGTGGAACTTCTTACTTTTATCATATCCCATCAGCTCGAAAGTCTTGATGTTAGTTTTGAATTGAAGTGCTTGAATTAGACCAGATGAATAGTCAG	(((....((((.(((((.(((((((.(((((((((((((((.(((.(((.(((((((((.((.((.((((((((((((.((((..((((((.((((((((.(((.((..((((((((..((((........))))..)))))))).)).))).......(((((....(((..(.((((.....)))).)..))).....)))))))))))))))))))..)))))))))))))))).)).)).))))))))).))).))).))))))))))))))).))))))).))))).))))....)))).	2587085	2587349	TCAGGGACTTCAATTCAGAACCAACTTCATGGTTTTTGAACTAATTGGATATGATAAATGGTACCAAGTTTTCACTTGCATTCAAGGGACATATATCATTGGGTTTTTACTTTTATGGATATATGACTATGACATACACGATTAGAAGCTAAAGGTTGCGGGAGGCAAGCAGTGGGATAATGATCTGCAAGTGGAACTTCTTACTTTTATCATATCCCATCAGCTCGAAAGTCTTGATGTTAGTTTTGAATTGAAGTGCTTGAAT	(((((.(((((((((((((((.(((.(((.(((((((((.((.((.((((((((((((.((((..((((((.((((((((.(((.((..((((((((..((((........))))..)))))))).)).))).......(((((....(((..(.((((.....)))).)..))).....)))))))))))))))))))..)))))))))))))))).)).)).))))))))).))).))).))))))))))))))).)))))))	Aly-miR846	2587085	2587107	TTTGAATTGAAGTGCTTGAAT	Aly-miR846*	2587329	2587349	TCAGGGACTTCAATTCAGAAC		3
Aly-MIR847	PmiREN000559	MIR847	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	2578996	2579166	+	AAGAGAATAAAAGTCTCACATCTTGATGAAGAGGAATGGAAAGCCGAGACCCAAATCAAAACAGAGGCGTCCCCCAATTAAAATTGGTAAGTGATATCTATGTCTTGGTTTCGATCTTGATCTCGGTCTTTCACTCCTCTTCTTCATGATGTAAGAATTTGTTATTCAACA	..((((.......))))(((((.(((.((((((((.(((((.(((((((..((((((.((((.(((((((...(((((....)))))............))))))).)))).))).))).))))))).))))).)))))))).))).)))))...................	2579016	2579146	TCTTGATGAAGAGGAATGGAAAGCCGAGACCCAAATCAAAACAGAGGCGTCCCCCAATTAAAATTGGTAAGTGATATCTATGTCTTGGTTTCGATCTTGATCTCGGTCTTTCACTCCTCTTCTTCATGATG	((.(((.((((((((.(((((.(((((((..((((((.((((.(((((((...(((((....)))))............))))))).)))).))).))).))))))).))))).)))))))).))).))..	Aly-miR847	2579016	2579036	TCTTGATGAAGAGGAATGGAA	Aly-miR847*	2579126	2579146	TCACTCCTCTTCTTCATGATG		3
Aly-MIR856	PmiREN000560	MIR856	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	15243233	15243370	+	GATTATGGCGGTTGAGGGTTTCTTCGTAGAGGTTGATCGATCCTTAATGTCCTGTGGAATTTAAGTTTCCGAAACTGTTTATGAGGACATACAAGATCGTTCAGTGTCCAAGAAGAAGCCTGAGCCGCTATAATCATC	(((((((((((((..((((((((((...((.(((((.(((((....(((((((...((((...(((((...)))))))))...)))))))....))))).))))).))...)))))))))).))))))))))))).))	15243253	15243350	TCTTCGTAGAGGTTGATCGATCCTTAATGTCCTGTGGAATTTAAGTTTCCGAAACTGTTTATGAGGACATACAAGATCGTTCAGTGTCCAAGAAGAAG	(((((...((.(((((.(((((....(((((((...((((...(((((...)))))))))...)))))))....))))).))))).))...)))))))	Aly-miR856	15243253	15243275	TCTTCGTAGAGGTTGATCGAT	Aly-miR856*	15243330	15243350	CGTTCAGTGTCCAAGAAGAAG		2
Aly-MIR859	PmiREN000561	MIR859	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	3372654	3372784	-	TATAGATAGATGTCGAAATCTCTCCGTTGTAAAATCAAACATGAGTATGAATTTAACCATGAAGGGATATTTTTGATTCGTATACTCATGTTTGATTTTACAATAGATAGATATCGACGCCTATCTCTTGT	((.((((((.((((((.((((.((.((((((((((((((((((((((((((((((.((......)).)).....)))))..))))))))))))))))))))))).)).)))).)))))).))))))..)))	3372674	3372764	TCTCCGTTGTAAAATCAAACATGAGTATGAATTTAACCATGAAGGGATATTTTTGATTCGTATACTCATGTTTGATTTTACAATAGATAGA	(.((.((((((((((((((((((((((((((((((.((......)).)).....)))))..))))))))))))))))))))))).)).)))	Aly-miR859	3372744	3372766	TCTCCGTTGTAAAATCAAACA	Aly-miR859*	3372674	3372694	TTTGATTTTACAATAGATAGA		2
Aly-MIR868	PmiREN000562	MIR868	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	8091608	8091730	+	ACTGACCAGCTCTCGTATTTCATGTCATAATAATAGTCACACTAGGGTGATATAACGAGGAGAGAGTTATATCATCCTAGCGCGATTGTTTTTATGACATGAAATACGTTTTAGAACTTAAAA	(.((...((.((((((((((((((((((((.(((((((.(.(((((((((((((((.........))))))))))))))).).))))))).)))))))))))))))))....))).)).....	8091628	8091710	CATGTCATAATAATAGTCACACTAGGGTGATATAACGAGGAGAGAGTTATATCATCCTAGCGCGATTGTTTTTATGACATGAA	((((((((((.(((((((.(.(((((((((((((((.........))))))))))))))).).))))))).))))))))))))	Aly-miR868	8091690	8091712	CGATTGTTTTTATGACATGAA	Aly-miR868*	8091628	8091648	CATGTCATAATAATAGTCACA		2
Aly-MIR1887	PmiREN000475	MIR1887	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	9352610	9352672	-	TTGTTCACTTAGATTGTTCTTAGTATGAGTTGTTCTCGTACTAAGTAGAGTCTAAGAGAACAA	.(((((.((((((((.(.(((((((((((.....))))))))))).).)))))))).))))).	9352615	9352669	CACTTAGATTGTTCTTAGTATGAGTTGTTCTCGTACTAAGTAGAGTCTAAGAGAA	(.((((((((.(.(((((((((((.....))))))))))).).)))))))).)))	Aly-miR1887	9352615	9352640	CGTACTAAGTAGAGTCTAAGAGAA	Aly-miR1887*	9352649	9352669	CACTTAGATTGTTCTTAGTAT		3
Aly-MIR2111a	PmiREN000476	MIR2111	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	3692006	3692149	+	GAGTATTGGTGAGGATCGGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTAAAGCTTAATTTAAGCAGAAAATTTGTATACGCATATACGTATGTGTGTTGGTATAGCTTTTAGTCCTCGGGATGCGGATTACCTCTTCCTTACTTACAATACG	..(((((((((((((..((((((((((((((((((((...((((((........(((((...)))))(((((((((....)))))))))......))))))....))))))))))))))))))))..)))))))...)))))).	3692026	3692129	TAATCTGCATCCTGAGGTTTAAAGCTTAATTTAAGCAGAAAATTTGTATACGCATATACGTATGTGTGTTGGTATAGCTTTTAGTCCTCGGGATGCGGATTACC	(((((((((((((((((...((((((........(((((...)))))(((((((((....)))))))))......))))))....)))))))))))))))))..	Aly-miR2111a	3692109	3692129	GTCCTCGGGATGCGGATTACC	Aly-miR2111a*	3692026	3692046	TAATCTGCATCCTGAGGTTTA		3
Aly-MIR2111b	PmiREN000478	MIR2111	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	474781	474903	+	GTACTTGGTGATGAACGGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTAAAACTTTATAAGCATTTACGTATGTGACTATATAGTTTTTTTAATCCTCGGGATACAGATTACCTCTTCCTTACTCGAAGTAC	(((((((((((.(((.((((((((((.(((((((((.((((((((.((((..(((........)))..)))).)))...))))).))))))))).)))))))))).))).)))))..))))))	474800	474884	TAATCTGCATCCTGAGGTTTAAAACTTTATAAGCATTTACGTATGTGACTATATAGTTTTTTTAATCCTCGGGATACAGATTACC	(((((((.(((((((((.((((((((.((((..(((........)))..)))).)))...))))).))))))))).)))))))))	Aly-miR2111b	474800	474822	TAATCTGCATCCTGAGGTTTA	Aly-miR2111b*	474864	474884	ATCCTCGGGATACAGATTACC		2
Aly-MIR2111c	PmiREN000477	MIR2111	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_70	2629	2772	-	GAGTATTGGTGAGGATCGGGTAATCTGCATCCTGAGGTTTAAAGCTTAATTTAAGCAGAAAATTTGTATACGCATATACGTATGTGTGTTGGTATAGCTTTTAGTCCTCGGGATGCGGATTACCTCTTCCTTACTTACAATACG	..(((((((((((((..((((((((((((((((((((...((((((........(((((...)))))(((((((((....)))))))))......))))))....))))))))))))))))))))..)))))))...)))))).	2649	2752	TAATCTGCATCCTGAGGTTTAAAGCTTAATTTAAGCAGAAAATTTGTATACGCATATACGTATGTGTGTTGGTATAGCTTTTAGTCCTCGGGATGCGGATTACC	(((((((((((((((((...((((((........(((((...)))))(((((((((....)))))))))......))))))....)))))))))))))))))..	Aly-miR2111c	2649	2669	GTCCTCGGGATGCGGATTACC	Aly-miR2111c*	2732	2752	TAATCTGCATCCTGAGGTTTA		3
Aly-MIR2112	PmiREN000479	MIR2112	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	240436	240587	+	ATGATGCGCAAATGCGGATATCAATGTAAATCAGGACAACAAACCAATAGAGGTGCTCAGCAAAAACAACAAAATGCGAAAAGGGTTTATCAGAAACATTATTTGAAACATTGGGGTCATGATATACCTTTATATCCGCATTTGCGCATCAT	(((((((((((((((((((((.((.(((.((((.(((..((((((......)))((...))..........((((.(.....).)))).(((((.......)))))....)))..))).)))).))).)).)))))))))))))))))))))	240442	240583	CGCAAATGCGGATATCAATGTAAATCAGGACAACAAACCAATAGAGGTGCTCAGCAAAAACAACAAAATGCGAAAAGGGTTTATCAGAAACATTATTTGAAACATTGGGGTCATGATATACCTTTATATCCGCATTTGCGCA	(((((((((((((((.((.(((.((((.(((..((((((......)))((...))..........((((.(.....).)))).(((((.......)))))....)))..))).)))).))).)).)))))))))))))))))	Aly-miR2112	240563	240585	CTTTATATCCGCATTTGCGCA	Aly-miR2112*	240442	240462	CGCAAATGCGGATATCAATGT		2
Aly-MIR3433	PmiREN000482	MIR3433	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	18060457	18060597	+	GACTTAAACTGCGGTTACGTGGTCATTTGAGAACTGTGATGAGTATACAATGGTTTTTATGCTCACGACAATTTTCAAAGCATCTCTATGTTTATGCTCATCACAGTTCTTGATTACCCACTAAACCGATGTTTAAAAAAC	...((((((..(((((..((((....(((((((((((((((((((((..((((.....(((((...((......))..)))))..))))...)))))))))))))))))))))....))))..)))))..)))))).....	18060477	18060577	GGTCATTTGAGAACTGTGATGAGTATACAATGGTTTTTATGCTCACGACAATTTTCAAAGCATCTCTATGTTTATGCTCATCACAGTTCTTGATTACCCAC	((....(((((((((((((((((((((..((((.....(((((...((......))..)))))..))))...)))))))))))))))))))))....))..	Aly-miR3433	18060477	18060497	GGTCATTTGAGAACTGTGATG	Aly-miR3433*	18060557	18060577	TCACAGTTCTTGATTACCCAC		3
Aly-MIR3434	PmiREN000483	MIR3434	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	9536248	9536474	-	GTGGTAAATTTTAGCACTCGGCTGATTCTCTGATTTTGAACAGGGCTTCCTTAAGTCAGATCATTGGTCTCTCTCTCAAGTAACTTAGGGTTTGAAAAACAGCTTCTCCAGTCAGCATCTTACCCTGCTCCTCAACACTCAGCAAATCCACAAATAGAAACGAGTCGTTGCTTCGGAAAGCCTTGTTCAAAATCAGAGAATCAACCAAGTGATAAAATTTACCACCA	(((((((((((((.((((.((.((((((((((((((((((((((((((((...((..(((((...)))))..))...........((((((..((......(((.....))).....))..)))))).....((((((((.....................)))).))))....)).)))))))))))))))))))))))))).)).)))).)))))))))))))..	9536268	9536454	GCTGATTCTCTGATTTTGAACAGGGCTTCCTTAAGTCAGATCATTGGTCTCTCTCTCAAGTAACTTAGGGTTTGAAAAACAGCTTCTCCAGTCAGCATCTTACCCTGCTCCTCAACACTCAGCAAATCCACAAATAGAAACGAGTCGTTGCTTCGGAAAGCCTTGTTCAAAATCAGAGAATCAACCA	(.((((((((((((((((((((((((((((...((..(((((...)))))..))...........((((((..((......(((.....))).....))..)))))).....((((((((.....................)))).))))....)).)))))))))))))))))))))))))).)..	Aly-miR3434	9536268	9536288	TCAAAATCAGAGAATCAACCA	Aly-miR3434*	9536434	9536454	GCTGATTCTCTGATTTTGAAC		3
Aly-MIR3435	PmiREN000484	MIR3435	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	920952	921133	-	TTGACTTGGACTGCTGATTTTGGCATAATTCTGTCAATTCCCTCATAGATGTAATGTAAGTTGGTTTGGAGTTCAGTAAAGAAGCAGTGACACTAAATGACGGTTGGAATGCCAGAGATAGTCTAGTTACATGTTTGAAGGAATTGACAGTATTATGCCAGACGGCATTTCAAGTTGAAGAG	((((((((((.(((((..(((((((((((.(((((((((((.(((.(.(((((((.........(((((.((((...........(((...)))............)))).))))).........))))))).).))).))))))))))).)))))))))))))))).))))))))))....	920972	921113	TGGCATAATTCTGTCAATTCCCTCATAGATGTAATGTAAGTTGGTTTGGAGTTCAGTAAAGAAGCAGTGACACTAAATGACGGTTGGAATGCCAGAGATAGTCTAGTTACATGTTTGAAGGAATTGACAGTATTATGCCAGA	(((((((((.(((((((((((.(((.(.(((((((.........(((((.((((...........(((...)))............)))).))))).........))))))).).))).))))))))))).)))))))))..	Aly-miR3435	920972	920992	AATTGACAGTATTATGCCAGA	Aly-miR3435*	921093	921113	TGGCATAATTCTGTCAATTCC		3
Aly-MIR3436	PmiREN000485	MIR3436	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	23816599	23816735	-	GTCAAAATTATGTTTTCAAGCGAGCAAAAATCATTGTTGATTTTGAAAAAGGTTTTAAGGTTACCGGTTCTGTTTGTTTGTTATCCTTTTAAGATCAACAACGATTTTTGGGTCGTTTAAAAGTATAATTTTTTGTG	...(((((((((((((.((((((.((((((((.((((((((((((((..(((...((((...((.......))...))))....))))))))))))))))).))))))))..)))))).))))))))))))).....	23816619	23816715	CGAGCAAAAATCATTGTTGATTTTGAAAAAGGTTTTAAGGTTACCGGTTCTGTTTGTTTGTTATCCTTTTAAGATCAACAACGATTTTTGGGTCGTT	(((.((((((((.((((((((((((((..(((...((((...((.......))...))))....))))))))))))))))).))))))))..)))..	Aly-miR3436	23816695	23816715	CGAGCAAAAATCATTGTTGAT	Aly-miR3436*	23816619	23816639	AACAACGATTTTTGGGTCGTT		3
Aly-MIR3437	PmiREN000486	MIR3437	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	20829828	20829996	-	GTAGCATAATATTGCCTGACAAAAAACAAGGATCCACGGATTTAGGAATGGGAACGTTCTCTGTGTCCCAGAGCACATTCTGCAAAACAAGTGTGCTTTGGGACACCGAGAAGGTTCCCATTCCAAAATCGGTGGATCTTGTTTTTTGTCAGGCAATATTATGCGTTCC	...(((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((((((((.((.....))))))))))))))))))).))))).))))))))))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).....	20829848	20829976	AAAAAACAAGGATCCACGGATTTAGGAATGGGAACGTTCTCTGTGTCCCAGAGCACATTCTGCAAAACAAGTGTGCTTTGGGACACCGAGAAGGTTCCCATTCCAAAATCGGTGGATCTTGTTTTTTGT	((((((((((.((((((.(((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((((((((.((.....))))))))))))))))))).))))).))))))))))).))))).))))))))))))))))..	Aly-miR3437	20829956	20829976	AAAAAACAAGGATCCACGGAT	Aly-miR3437*	20829848	20829868	TCGGTGGATCTTGTTTTTTGT		3
Aly-MIR3438	PmiREN000487	MIR3438	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	4344687	4344816	-	TCACAAGTTATCGTTTATGCTCCATAGCTTCATCTCTGACCCAAGATCTTGTTTATGCATAATTTTTTATTTTACAACAAAATCATGAGTCAAGGATTAAGCTATGAAGCTTAAACATAACTTGTATTTG	..(((((((((.(((((.(((.((((((((.((((.((((.((.(((.(((((.....((((....)))).....))))).))).)).)))).)))).)))))))).))).)))))))))))))).....	4344707	4344796	TCCATAGCTTCATCTCTGACCCAAGATCTTGTTTATGCATAATTTTTTATTTTACAACAAAATCATGAGTCAAGGATTAAGCTATGAAGC	(.((((((((.((((.((((.((.(((.(((((.....((((....)))).....))))).))).)).)))).)))).)))))))).)..	Aly-miR3438	4344707	4344727	TCAAGGATTAAGCTATGAAGC	Aly-miR3438*	4344776	4344796	TCCATAGCTTCATCTCTGACC		3
Aly-MIR3439	PmiREN000488	MIR3439	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	17970276	17970572	+	CGTAAACCGATGTTTTAATTTTGGGGTTTCGAAATCAAGAGGTCGACCAAACCGATGATATGTCATCTTAAAGCTAAGAGACTATTAATAGTGTCTTAAAAACACTAAATCCTCGTTTGTATATCCATTGGCTCGCATACGGCAAAATCATACACAATAACCTGCGTGCTTCTATTGAGACTCTGAATAATCATGTTCTTTGTCAGATGTGCCCACTAAAACAATTAAGTGTGATGGTGTTGATTTGGTCGACCTTCTGATTTTCGAAGTCCCAAAATCTAAACTCATGTTTATGTT	(((((((.((.((((..((((((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((((.(((.(((((....))))))))))))).((((((.......))))))...........(((((((....(((.((((...((..................)))))).)))((....))(((...(((((....)))))...))).))))))).(((((..(((......)))..)))))))).))))))))))))).))).)))))))))))))))))..))))))..)))))))))	17970296	17970552	TTGGGGTTTCGAAATCAAGAGGTCGACCAAACCGATGATATGTCATCTTAAAGCTAAGAGACTATTAATAGTGTCTTAAAAACACTAAATCCTCGTTTGTATATCCATTGGCTCGCATACGGCAAAATCATACACAATAACCTGCGTGCTTCTATTGAGACTCTGAATAATCATGTTCTTTGTCAGATGTGCCCACTAAAACAATTAAGTGTGATGGTGTTGATTTGGTCGACCTTCTGATTTTCGAAGTCCCAAAA	(((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((((.(((.(((((....))))))))))))).((((((.......))))))...........(((((((....(((.((((...((..................)))))).)))((....))(((...(((((....)))))...))).))))))).(((((..(((......)))..)))))))).))))))))))))).))).))))))))))))))))	Aly-miR3439	17970531	17970554	TCTGATTTTCGAAGTCCCAAAA	Aly-miR3439*	17970296	17970316	TTGGGGTTTCGAAATCAAGAG		3
Aly-MIR3440a	PmiREN000489	MIR3440	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	7758272	7758398	+	TGCGGCATTTTCCACAAGTGTGGTTTCCCTGGCCAATCCACTTGTAATGTGTATTTTGTAAATAACGCAAAATGTGCATTAGAAGTGGATTGGTCAAGAGAACCGCACTTGTGCAAAATACCGCAGT	(((((.(((((.((((((((((((((.(.((((((((((((((.(((((((((((((((.......))))))))))))))).)))))))))))))).).)))))))))))))).))))).)))))..	7758292	7758378	TGGTTTCCCTGGCCAATCCACTTGTAATGTGTATTTTGTAAATAACGCAAAATGTGCATTAGAAGTGGATTGGTCAAGAGAACCGCA	((((((.(.((((((((((((((.(((((((((((((((.......))))))))))))))).)))))))))))))).).))))))..	Aly-miR3440a	7758357	7758378	TGGATTGGTCAAGAGAACCGCA	Aly-miR3440a*	7758292	7758312	TGGTTTCCCTGGCCAATCCAC		3
Aly-MIR3440b	PmiREN000490	MIR3440	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_814	3267	3393	+	TGCGGCATTTTCCACAAGTGTGGTTTCCCTGGCCAATCCACTTGTAATGTGTATTTTGTAAATAACGCAAAATGTGCATTAGAAGTGGATTGGTCAAGAGAACCGCACTTGTGCAAAATACCGCAGT	(((((.(((((.((((((((((((((.(.((((((((((((((.(((((((((((((((.......))))))))))))))).)))))))))))))).).)))))))))))))).))))).)))))..	3287	3373	TGGTTTCCCTGGCCAATCCACTTGTAATGTGTATTTTGTAAATAACGCAAAATGTGCATTAGAAGTGGATTGGTCAAGAGAACCGCA	((((((.(.((((((((((((((.(((((((((((((((.......))))))))))))))).)))))))))))))).).))))))..	Aly-miR3440b	3352	3373	TGGATTGGTCAAGAGAACCGCA	Aly-miR3440b*	3287	3307	TGGTTTCCCTGGCCAATCCAC		3
Aly-MIR3442	PmiREN000491	MIR3442	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	19148709	19148872	-	TTTACATTTTTATACTAAACACCATGTTTAGACTCTGAATTTTTTCCATATAATTTTATTTTAAAAGGCAAAGACTTTTTTCCTAAATCGGTCTCAAGGACTTATTTATTATATGGAAAAAAATTCAGAGTCTAAACATGGTGTTTAGTATAAAAATGTAAAAT	((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...........(((.((((....)))))))((((.(((((...))))).))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	19148729	19148852	ACCATGTTTAGACTCTGAATTTTTTCCATATAATTTTATTTTAAAAGGCAAAGACTTTTTTCCTAAATCGGTCTCAAGGACTTATTTATTATATGGAAAAAAATTCAGAGTCTAAACATGGTGT	((((((((((((((((((((((((((((((((((...........(((.((((....)))))))((((.(((((...))))).))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..	Aly-miR3442	19148729	19148749	TTCAGAGTCTAAACATGGTGT	Aly-miR3442*	19148832	19148852	ACCATGTTTAGACTCTGAATT		3
Aly-MIR3443	PmiREN000492	MIR3443	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	2671739	2671861	+	GGCTAATCAGCAAAACTAAATTCTAATCCCGCCATGCACCGAAAAAATTCTAGACTGAAATAATACAGTCTGTGGTTTTCCGGTGCCTTGTGAGATTAGAGTTTTATCTTGTGAATTTGCTTA	(((.(((..((((....(((((((((((.(((...((((((..((((((.(((((((........))))))).)))))).))))))...))).)))))))))))....))))..))).)))..	2671759	2671841	TTCTAATCCCGCCATGCACCGAAAAAATTCTAGACTGAAATAATACAGTCTGTGGTTTTCCGGTGCCTTGTGAGATTAGAGTT	((((((((.(((...((((((..((((((.(((((((........))))))).)))))).))))))...))).))))))))..	Aly-miR3443	2671759	2671779	TTCTAATCCCGCCATGCACCG	Aly-miR3443*	2671821	2671841	GTGCCTTGTGAGATTAGAGTT		3
Aly-MIR3444	PmiREN000493	MIR3444	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	18879831	18879950	+	TCCTTTGTAATCTCTTTATATTGGGAGCTCGATGAGATCGACCCTAACCGAGCCTAGATATCGAGATTTGGTTCGGGTCAATCTCATCAATCTCCCAATACTTTACAACATATATACAAC	....((((((........(((((((((...((((((((.(((((.(((((((.((........)).))))))).))))).))))))))...)))))))))..))))))............	18879851	18879930	TTGGGAGCTCGATGAGATCGACCCTAACCGAGCCTAGATATCGAGATTTGGTTCGGGTCAATCTCATCAATCTCCCAATA	(((((((...((((((((.(((((.(((((((.((........)).))))))).))))).))))))))...)))))))..	Aly-miR3444	18879851	18879871	TTGGGAGCTCGATGAGATCGA	Aly-miR3444*	18879910	18879930	AATCTCATCAATCTCCCAATA		3
Aly-MIR3446	PmiREN000494	MIR3446	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	16331950	16332117	-	AACTCACTCCATCGTGAATACTCGGAAGCTAGACGTGTGGCAGGGAAAATGAGTTAAGGGAAACCGTGATTAGTATGACATCGCCAACCGGCAGCATTCACAAAGATCTTAAACTCCTTTCCCCTGCCACTCTTTTAGCTTCCGAATCTTTTTCGATGGGTGAGTTCC	(((((((.((((((.(((...((((((((((((.(.(((((((((.(((.(((((((((......((((.....(((.(...(((....))).)))))))).....)))).))))).))).))))))))).).))))))))))))....))).)))))))))))))..	16331970	16332097	CTCGGAAGCTAGACGTGTGGCAGGGAAAATGAGTTAAGGGAAACCGTGATTAGTATGACATCGCCAACCGGCAGCATTCACAAAGATCTTAAACTCCTTTCCCCTGCCACTCTTTTAGCTTCCGAATC	.((((((((((((.(.(((((((((.(((.(((((((((......((((.....(((.(...(((....))).)))))))).....)))).))))).))).))))))))).).))))))))))))...	Aly-miR3446	16332074	16332097	CTCGGAAGCTAGACGTGTGGCAGG	Aly-miR3446*	16331970	16331990	CACTCTTTTAGCTTCCGAATC		3
Aly-MIR3447	PmiREN000495	MIR3447	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	12946994	12947125	-	ATTTTGTTCAGAGACTGATTCGTGACGAACATAATCAAACGATGAAACCATTTTAAGCTCATCGAGAGATTTCCTTAAAATTGTCTCGTTGTTTGAGTGTGTTTGTTATGAATAAGACTCTGAACCACTCTA	.....((((((((.((.((((((((((((((((.(((((((((((.((.((((((((...(((....)))...)))))))).)).))))))))))).)))))))))))))))).)).)))))))).......	12947014	12947105	CGTGACGAACATAATCAAACGATGAAACCATTTTAAGCTCATCGAGAGATTTCCTTAAAATTGTCTCGTTGTTTGAGTGTGTTTGTTATGAA	(((((((((((((.(((((((((((.((.((((((((...(((....)))...)))))))).)).))))))))))).)))))))))))))..	Aly-miR3447	12947014	12947034	TTTGAGTGTGTTTGTTATGAA	Aly-miR3447*	12947085	12947105	CGTGACGAACATAATCAAACG		3
Aly-MIR3448	PmiREN000496	MIR3448	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	4173301	4173429	-	TCATCCATGAGACTTATTGACCAGGAAAACATCTTCAGACACGAGCTTGTCAGTCAATTCCCAGACTTGACTTGACACAAACTCATGTCTGAGGATTTTTTTTGTGGTCAATAAATTTTCGATTCCTCA	(((....)))...((((((((((.(((((.(((((((((((.(((..((((((((((.((...)).))))).)))))....))).)))))))))))..))))).))))))))))...............	4173321	4173409	CCAGGAAAACATCTTCAGACACGAGCTTGTCAGTCAATTCCCAGACTTGACTTGACACAAACTCATGTCTGAGGATTTTTTTTGTGGTC	(((.(((((.(((((((((((.(((..((((((((((.((...)).))))).)))))....))).)))))))))))..))))).)))..	Aly-miR3448	4173321	4173342	TCTGAGGATTTTTTTTGTGGTC	Aly-miR3448*	4173389	4173409	CCAGGAAAACATCTTCAGACA		3
Aly-MIR3449	PmiREN000497	MIR3449	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	708076	708215	+	TAGTTTTCATTCTGAGATCCAATATCTAGATTGCTTTCGGTCTGTCTGATTGTCAGATTAATAATATGTTTGGTCAAAGTTTCAACCAATCAGACAGATAGAAAGCAATCTGGATATTGGATCTCAGAATGAAAATGACC	..((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((...((((((........))))))...........))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))....	708096	708195	AATATCTAGATTGCTTTCGGTCTGTCTGATTGTCAGATTAATAATATGTTTGGTCAAAGTTTCAACCAATCAGACAGATAGAAAGCAATCTGGATATTGG	((((((((((((((((((.(((((((((((((...((((((........))))))...........))))))))))))).))))))))))))))))))))	Aly-miR3449	708096	708118	AATATCTAGATTGCTTTCGGT	Aly-miR3449*	708175	708195	AGAAAGCAATCTGGATATTGG		2
Aly-MIR4221	PmiREN000526	MIR4221	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	13687003	13687148	-	TAGTATACCAGTTAACAGTTTTCCTGCTTTTGAATTCTTGCACTAGCTTCCATTGATAGATAATGGTTACATTTTGGTGCTGCAACTCTTGTGGTAGCTAGTACAAGAGTTCAAAAGTAGTGAAGATGTTATTTGGATACCATATA	..((((.((((.(((((.((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.(((((..((((....))))......)))....))..)))).))))))).))))))))))))))))).)))))))))).))))))))......	13687023	13687128	TTCCTGCTTTTGAATTCTTGCACTAGCTTCCATTGATAGATAATGGTTACATTTTGGTGCTGCAACTCTTGTGGTAGCTAGTACAAGAGTTCAAAAGTAGTGAAGA	((((((((((((((((((((.(((((((.((((.(((((..((((....))))......)))....))..)))).))))))).))))))))))))))))).)))..	Aly-miR4221	13687023	13687044	AAGAGTTCAAAAGTAGTGAAGA	Aly-miR4221*	13687108	13687128	TTCCTGCTTTTGAATTCTTGC		3
Aly-MIR4222	PmiREN000527	MIR4222	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	12382831	12382996	-	ACCATCCCTATGTTGAAAGCGGTAACAATCTCGATGAAAGAGAGGATGTAGACGCTCAACTGATATAGGAAGCAATTGTTTTGATTATTGCATCCTTCACCTTGTTGAGCATCTATACCCACTCTTTCATTCGAAATTGTTACCGCCCTCAGCCTTTGGATATTTC	...((((....(((((..(((((((((((.((((((((((((.((.((((((.(((((((......((((.(((((..........))))).)))).......))))))).)))))).)).)))))))).)))).)))))))))))..)))))....)))).....	12382851	12382976	GGTAACAATCTCGATGAAAGAGAGGATGTAGACGCTCAACTGATATAGGAAGCAATTGTTTTGATTATTGCATCCTTCACCTTGTTGAGCATCTATACCCACTCTTTCATTCGAAATTGTTACCGC	(((((((((.((((((((((((.((.((((((.(((((((......((((.(((((..........))))).)))).......))))))).)))))).)).)))))))).)))).)))))))))..	Aly-miR4222	12382851	12382872	TTTCATTCGAAATTGTTACCGC	Aly-miR4222*	12382956	12382976	GGTAACAATCTCGATGAAAGA		3
Aly-MIR4223	PmiREN000528	MIR4223	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	24251060	24251204	-	GCTTCTTGCTTTGCTTGACTATGGAATTTGATAAATAAACACAAAATATTAAACGCAGCCGTTTTCTGGTGGGCCAAAGTTTCCCTTTTTCGTTTAATTTTTGTGTTATTTATCAAATTCCATTGTCAAGCAAAAAAGACAACCT	...((((..((((((((((.((((((((((((((((((.(((((((.((((((((..((((.....))))(((.........))).....))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))).))))......	24251080	24251184	ATGGAATTTGATAAATAAACACAAAATATTAAACGCAGCCGTTTTCTGGTGGGCCAAAGTTTCCCTTTTTCGTTTAATTTTTGTGTTATTTATCAAATTCCATTG	((((((((((((((((((.(((((((.((((((((..((((.....))))(((.........))).....))))))))))))))))))))))))))))))))).)	Aly-miR4223	24251163	24251186	ATGGAATTTGATAAATAAACAC	Aly-miR4223*	24251080	24251100	GTTATTTATCAAATTCCATTG		2
Aly-MIR4224	PmiREN000529	MIR4224	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	24611232	24611351	+	TTTTCGGGACAGAGATGAGAAAGACTCAGCTATTTGTTGAAAATGAAATATCTGTGAAGCGAAAAACCTTTTTTTTTATTCAACAAACAACTGAGCTTCCTCATCTCTGTCACAATAAGA	(((...(((((((((((((.(((.(((((...(((((((((...((((.....((..........))....))))...)))))))))...)))))))).)))))))))))).)...))))	24611252	24611331	AAGACTCAGCTATTTGTTGAAAATGAAATATCTGTGAAGCGAAAAACCTTTTTTTTTATTCAACAAACAACTGAGCTTCC	(((.(((((...(((((((((...((((.....((..........))....))))...)))))))))...)))))))).)	Aly-miR4224	24611311	24611333	TCAACAAACAACTGAGCTTCC	Aly-miR4224*	24611252	24611272	AAGACTCAGCTATTTGTTGAA		2
Aly-MIR4225	PmiREN000530	MIR4225	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	25490071	25490220	+	ACCAAATCATGTTTATTTTAGAATCGATGGTTAAACAACACATTTTGACGACAAATTTTGGCGACTATCAGTTATATTTTCGAGTTATGATTTTTGTCACTCAAATGTGTTCTTTAATTCATCGATTCCTAAATAAACAAGATTTGACCA	..((((((.(((((((((..(((((((((((((((.(((((((((((((((.(((((.((((.....................)))).)))))))))))...))))))))).))))).))))))))))..))))))))).))))))....	25490090	25490201	AGAATCGATGGTTAAACAACACATTTTGACGACAAATTTTGGCGACTATCAGTTATATTTTCGAGTTATGATTTTTGTCACTCAAATGTGTTCTTTAATTCATCGATTCCTA	.(((((((((((((((.(((((((((((((((.(((((.((((.....................)))).)))))))))))...))))))))).))))).))))))))))..)	Aly-miR4225	25490090	25490112	AGAATCGATGGTTAAACAACA	Aly-miR4225*	25490181	25490201	TCTTTAATTCATCGATTCCTA		2
Aly-MIR4228	PmiREN000531	MIR4228	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	17393793	17393951	+	CGGCGTGTTGTTTTAACCTAAAAGCCTTGAACGCTGTCGTTTCGCCGTCGACAACAATCACACGCGCACACTTCCACCATTATCATCTATCCACCACACAGGTTCGTCGGATGCGAAACGGTGGTGTTCAGGGCTTTTTTAAGGTTGCTGGATTTTATT	(((((..........((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((..............................................))).)))))..))))))))))))))))))))))))))...))))))))).........	17393813	17393931	AAAGCCTTGAACGCTGTCGTTTCGCCGTCGACAACAATCACACGCGCACACTTCCACCATTATCATCTATCCACCACACAGGTTCGTCGGATGCGAAACGGTGGTGTTCAGGGCTTTTT	(((((((((((((((((((((((((..((((((((..............................................))).)))))..)))))))))))))))))))))))))).	Aly-miR4228	17393813	17393835	AAAGCCTTGAACGCTGTCGTT	Aly-miR4228*	17393911	17393931	CGGTGGTGTTCAGGGCTTTTT		2
Aly-MIR4229	PmiREN000532	MIR4229	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	6816117	6816259	-	ACATAAATCGTCCTAAAACCTTGGCAGGGAGGTCCTCCACACACAATATTTACAAGGACGTTTTGCACGTTGCATTCTTTGAAATTGATGTGAATATTGTGTGTGGAGACATCTTTGTCAAGGTGTTAGATGATTTATATTAA	..((((((((((.(((.(((((((((((((.(((.(((((((((((((((((((..(((((.....))))).................)))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))))))))).....	6816137	6816239	TTGGCAGGGAGGTCCTCCACACACAATATTTACAAGGACGTTTTGCACGTTGCATTCTTTGAAATTGATGTGAATATTGTGTGTGGAGACATCTTTGTCAAGG	((((((((((.(((.(((((((((((((((((((..(((((.....))))).................)))))))))))))))))))))).))))))))))..	Aly-miR4229	6816218	6816239	TTGGCAGGGAGGTCCTCCACAC	Aly-miR4229*	6816137	6816157	GTGGAGACATCTTTGTCAAGG		3
Aly-MIR4235	PmiREN000533	MIR4235	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	17278057	17278195	+	GTAGTATGTGTGATTTCTGGGTTGTATTGTTTTCAGTTCCTGTTCTGTAAGTGAATATGACCAATACTTGTTGGTTACACTCAAGCTGTACAGAACAGGAACTGAAAACACTACAACCCCTAGATCTTGGTACTTTTTA	..(((((....(((((..((((((((.(((((((((((((((((((((((((((...((((((((....))))))))...))..))).)))))))))))))))))))))).))))))))..)))))...))))).....	17278077	17278175	GTTGTATTGTTTTCAGTTCCTGTTCTGTAAGTGAATATGACCAATACTTGTTGGTTACACTCAAGCTGTACAGAACAGGAACTGAAAACACTACAACCC	((((((.(((((((((((((((((((((((((((...((((((((....))))))))...))..))).)))))))))))))))))))))).))))))))	Aly-miR4235	17278077	17278099	GTTGTATTGTTTTCAGTTCCT	Aly-miR4235*	17278155	17278175	GAACTGAAAACACTACAACCC		2
Aly-MIR4236	PmiREN000534	MIR4236	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	6972054	6972202	-	ATAAAATCGCAAATCTGTTAGGAGGGAAACAAATTAATGTCTTATAGGACGCAAGGGCACCAATACTCTTAAGCTATTGTGGTGACTGCTATCCAAGGTCTTATAAGGCATTAATTTGTTCCCCTCCTAATGCATGTGGAATTCTAATC	.......((((....(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.(..((((((((((....)).)))..))))).))))........))))))))))))))))))))))).)))))))))))..))))...........	6972074	6972182	GGAGGGAAACAAATTAATGTCTTATAGGACGCAAGGGCACCAATACTCTTAAGCTATTGTGGTGACTGCTATCCAAGGTCTTATAAGGCATTAATTTGTTCCCCTCCTA	((((((.((((((((((((((((((((((((((.(..((((((((((....)).)))..))))).))))........))))))))))))))))))))))).))))))))	Aly-miR4236	6972074	6972096	CATTAATTTGTTCCCCTCCTA	Aly-miR4236*	6972162	6972182	GGAGGGAAACAAATTAATGTC		2
Aly-MIR4238	PmiREN000536	MIR4238	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	4417749	4417870	+	TTTCAAGAGTGATTTGGTTTGGGGTTTTAATTTGCAAAAATTTGAAGTCAATGTGTGCTATTCGCATAAAGACTTCAATTTTTTTGCAAATTAAAACCCCAAACCAGTAATTCCTAATCATG	......((((...(((((((((((((((((((((((((((.((((((((..((((((.....))))))..))))))))..)))))))))))))))))))))))))))..)))).........	4417767	4417852	TTGGGGTTTTAATTTGCAAAAATTTGAAGTCAATGTGTGCTATTCGCATAAAGACTTCAATTTTTTTGCAAATTAAAACCCCAAAC	((((((((((((((((((((((.((((((((..((((((.....))))))..))))))))..))))))))))))))))))))))))	Aly-miR4238	4417767	4417790	TTGGGGTTTTAATTTGCAAAAA	Aly-miR4238*	4417832	4417852	TTGCAAATTAAAACCCCAAAC		2
Aly-MIR4239	PmiREN000537	MIR4239	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	9366490	9366611	-	TCTTGTTTGCACACTTTGTTTCCGTTATTTCCGCATGCTCCTTAGAAATTTTTGTGCATCGATATAAAATCCTTTCATAGGAGCATACGCAAACAATGGAAACAAGGAATGCAAATAAAACT	..(((((((((..(((((((((((((.(((.((.((((((((..((((.(((((((......)))))))...))))..)))))))).)).))).)))))))))))))..)))))))))....	9366510	9366591	TCCGTTATTTCCGCATGCTCCTTAGAAATTTTTGTGCATCGATATAAAATCCTTTCATAGGAGCATACGCAAACAATGGAAA	((((((.(((.((.((((((((..((((.(((((((......)))))))...))))..)))))))).)).))).))))))))	Aly-miR4239	9366571	9366593	TCCGTTATTTCCGCATGCTCC	Aly-miR4239*	9366510	9366530	AGCATACGCAAACAATGGAAA		3
Aly-MIR4240	PmiREN000538	MIR4240	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	10082347	10082550	+	TTTTCGTAGCCGTGAAGTTAATGGCTAGAGTGACTAGACCCGTAACATTGCTATGAAATCATTTGAACTGAAATTTGTTGATCTGCGGTTTATTTTCAAGAGATCAAAACGAAGATAAGTGGTGGCACAAGTTTACTTTAGCGAATTTATCGCTATGTTATCGGGTCTAGCACTCTATCCACTGATTTCACGACCACGAGCCTC	..(((((.(.((((((((((.(((.(((((((.(((((((((((((((.((.(((((.((..(((((...((((((((.(..((((.((((((((((.............)))))))))).)))))))))))))..))))).)).))))).)).)))))).)))))))))))))))).))).)))))))))).).)))))....	10082367	10082530	ATGGCTAGAGTGACTAGACCCGTAACATTGCTATGAAATCATTTGAACTGAAATTTGTTGATCTGCGGTTTATTTTCAAGAGATCAAAACGAAGATAAGTGGTGGCACAAGTTTACTTTAGCGAATTTATCGCTATGTTATCGGGTCTAGCACTCTATCCACTG	.(((.(((((((.(((((((((((((((.((.(((((.((..(((((...((((((((.(..((((.((((((((((.............)))))))))).)))))))))))))..))))).)).))))).)).)))))).)))))))))))))))).)))...	Aly-miR4240	10082367	10082388	ATGGCTAGAGTGACTAGACCCG	Aly-miR4240*	10082510	10082530	GGTCTAGCACTCTATCCACTG		3
Aly-MIR4241	PmiREN000539	MIR4241	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	14829014	14829198	+	GAACGAACTAAACCTCATTCGATGTAAGAAATCCCAAAAAGGACAGGGTTCATAAACATTCGCTCTATGGCCCATGATAATGTTGAGTCTGCTACGTGACTTACATTTTTGTCGGGCAGATCACGCCAATACACACCTGGTCTCTTTGGGATTTTCTTACAGCGAATGAGGTTTAGTTCCATCTC	((..(((((((((((((((((.((((((((((((((((..((((.((((..............(((...((((((((.(((((.(((((........)))))))))).)))).)))))))..............)))).)))).))))))).))))))))).)))))))))))))))))..))..	14829026	14829186	CCTCATTCGATGTAAGAAATCCCAAAAAGGACAGGGTTCATAAACATTCGCTCTATGGCCCATGATAATGTTGAGTCTGCTACGTGACTTACATTTTTGTCGGGCAGATCACGCCAATACACACCTGGTCTCTTTGGGATTTTCTTACAGCGAATGAGGTT	(((((((((.((((((((((((((((..((((.((((..............(((...((((((((.(((((.(((((........)))))))))).)))).)))))))..............)))).)))).))))))).))))))))).)))))))))))	Aly-miR4241	14829165	14829188	TTTTCTTACAGCGAATGAGGTT	Aly-miR4241*	14829026	14829046	CCTCATTCGATGTAAGAAATC		2
Aly-MIR4242	PmiREN000540	MIR4242	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	19830932	19831027	+	TGTGTTACAGAAACTCTAGAAAAGTTAACTATGGCATTCCCTAGTTCTTGGAATTGGAAGCAATGCAGGACTTTTCTGTGCCGTTTGTCGTGGAAA	................((((((((((...(((.((.((((..(((((...))))))))))).)))...))))))))))..................	19830952	19831007	AAAGTTAACTATGGCATTCCCTAGTTCTTGGAATTGGAAGCAATGCAGGACTTTTC	((((((...(((.((.((((..(((((...))))))))))).)))...))))))..	Aly-miR4242	19830952	19830972	AAAGTTAACTATGGCATTCCC	Aly-miR4242*	19830987	19831007	GGAAGCAATGCAGGACTTTTC		3
Aly-MIR4243	PmiREN000541	MIR4243	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	11472000	11472178	+	TTAAGAACCATGATTACAGTTGAAATTATAGATTTCGTACATGACAACAATTTGCTCTAGTCTCACTCTCAAGATTTTGTGGTTGTTGTTGCAGTATTCGAGAGAATACATGTCAAATATGAGAGCATGCATGTCATGTACGAAATCTACAATTTAAACTCTAATTAATGGATGGTTCT	...(((((((((((((.((((.(((((.((((((((((((((((((......((((((....((((............)))).((((...(((((((((....)))))).)))..))))..))))))....)))))))))))))))))).))))).)))).))))).....))))))))	11472020	11472158	TGAAATTATAGATTTCGTACATGACAACAATTTGCTCTAGTCTCACTCTCAAGATTTTGTGGTTGTTGTTGCAGTATTCGAGAGAATACATGTCAAATATGAGAGCATGCATGTCATGTACGAAATCTACAATTTAAAC	(.(((((.((((((((((((((((((......((((((....((((............)))).((((...(((((((((....)))))).)))..))))..))))))....)))))))))))))))))).))))).)))	Aly-miR4243	11472020	11472042	TGAAATTATAGATTTCGTACA	Aly-miR4243*	11472138	11472158	TACGAAATCTACAATTTAAAC		2
Aly-MIR4249	PmiREN000542	MIR4249	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	2250562	2250714	-	TACACATTTCTTGTTCAGGTTGAATTTGAGAAGTTGAGGTAGGTTTACCAACTCTTGAATTTCTCACACTCTCGATCAAGTTTCTCTTATCGAGTTTGGTTTCTCAAACCCACCTCAAATTCTCCAATTCCACCAGAACCTTAAAAATCTTTA	............((((.(((.(((((.(((((.(((((((.((((((((((....(((.....)))....((((((.(((.....))))))))).))))).....))))).))))))).))))).))))).))).))))..............	2250582	2250694	TGAATTTGAGAAGTTGAGGTAGGTTTACCAACTCTTGAATTTCTCACACTCTCGATCAAGTTTCTCTTATCGAGTTTGGTTTCTCAAACCCACCTCAAATTCTCCAATTCCAC	.(((((.(((((.(((((((.((((((((((....(((.....)))....((((((.(((.....))))))))).))))).....))))).))))))).))))).)))))...	Aly-miR4249	2250674	2250694	TGAATTTGAGAAGTTGAGGTA	Aly-miR4249*	2250582	2250602	CCTCAAATTCTCCAATTCCAC		3
Aly-MIRN45	PmiREN000622	MIRN45	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	2678624	2678832	-	AAAAAAAGGATCAATAAAGCTACGTAGGCTCTACTTGCCTAATGCATCAAAGCATCCGATATAAAAGATTGCGCCTTTAACGGCATGTCGATAGTTATCTGTTCCATATTGTTAAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGTGCTTTAGCGTAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGATTAAGGCAGTGGATTGTGAA	...................((((...((((.((.((((((.((((...((((((((............((((((.(((((.((((((....(((..(((((...(((........)))...))))))))...))).)))..))))).)))))))))))))).))))..)))))).)).))))..)))).....................	2678644	2678812	TACGTAGGCTCTACTTGCCTAATGCATCAAAGCATCCGATATAAAAGATTGCGCCTTTAACGGCATGTCGATAGTTATCTGTTCCATATTGTTAAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGTGCTTTAGCGTAGGGGCGGATGTAGCCAAGTGGA	(((...((((.((.((((((.((((...((((((((............((((((.(((((.((((((....(((..(((((...(((........)))...))))))))...))).)))..))))).)))))))))))))).))))..)))))).)).))))..)))..	Aly-miRN45	2678644	2678663	GGCGGATGTAGCCAAGTGGA	Aly-miRN45*	2678792	2678812	TACGTAGGCTCTACTTGCCTA		3
Aly-MIRN83	PmiREN000564	MIRN83	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1396548	1396654	-	CGATGCTCTTTGCAAGTACAAACATGTGGATGATGCCCTCAACCTGTTCAACGAAATGGAGAAGAAAGGAATTAGACCTGATGTTGTTACCTACAGCTCCCTCATAA	...(((.....))).(((..(((((..((.((((..(((.....(.((((......)))).)....))).))))..))..)))))..))).................	1396568	1396634	AACATGTGGATGATGCCCTCAACCTGTTCAACGAAATGGAGAAGAAAGGAATTAGACCTGATGTTGT	(((((..((.((((..(((.....(.((((......)))).)....))).))))..))..)))))..	Aly-miRN83	1396568	1396588	AGGAATTAGACCTGATGTTGT	Aly-miRN83*	1396614	1396634	AACATGTGGATGATGCCCTCA		3
Aly-MIRN84a	PmiREN000565	MIRN84	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	12931172	12931280	+	NNNNNNATTAAATCTCGCTGGAACAGTTTCCGACGAAATTTCCGACAAATTATTAAATTTCGTCGGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTACATTAATTTCTCGCGGATCTC	...........(((.(((.((((((((((((((((((((((((((((((((....))))).)))))))))))))))))))))))...........)))).))))))...	12931192	12931260	GAACAGTTTCCGACGAAATTTCCGACAAATTATTAAATTTCGTCGGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	...((((((((((((((((((((((((((((....))))).))))))))))))))))))))))).....	Aly-miRN84a	12931240	12931260	ATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	Aly-miRN84a*	12931192	12931212	GAACAGTTTCCGACGAAATTT		3
Aly-MIRN84b	PmiREN000575	MIRN84	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	6144183	6144365	+	GATCCGCGAGAAATTAATGTAACCAATTTCCGACAAAATTTCCGACGAAATTTAATAATTTGTCGGAAATTTCGTCGGAAACTGTTACAGCGAGATCTAATTTCCGACGAATTTTCCGACAGATTTTTAAATTTCGTCAGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTACATTAATTCTATTGCCGTTTA	...........(((((((((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((.(((((((((((((.(((((((((((...................))))))))))).))))))))))))).)))))))))))).))))))).))))))))))))))))))))))).............	6144203	6144345	AACCAATTTCCGACAAAATTTCCGACGAAATTTAATAATTTGTCGGAAATTTCGTCGGAAACTGTTACAGCGAGATCTAATTTCCGACGAATTTTCCGACAGATTTTTAAATTTCGTCAGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	((((((((((((((.(((((((.((((((((((((.(((((((((((((.(((((((((((...................))))))))))).))))))))))))).)))))))))))).))))))).))))))))))))))..	Aly-miRN84b	6144325	6144345	ATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	Aly-miRN84b*	6144203	6144223	AACCAATTTCCGACAAAATTT		3
Aly-MIRN84c	PmiREN000582	MIRN84	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	3225545	3225728	+	AGCGCTAGAGAAATTAATGTATCCAATTTCCGACGAAATTTCCGACGAAATTTACAAAATTTATCGGAAAATTCGTCGGAAATTAAATCTCCCGGTAACATTTTCCGACAAATATTCCGACAAATTTTTAAATTTCGTCGGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTACATTAACTTCTTTGGCGCCCG	.(((((((((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((((.(((.((((((((....(((....))).....)))))))).))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).)))))))))))...	3225565	3225708	ATCCAATTTCCGACGAAATTTCCGACGAAATTTACAAAATTTATCGGAAAATTCGTCGGAAATTAAATCTCCCGGTAACATTTTCCGACAAATATTCCGACAAATTTTTAAATTTCGTCGGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	(.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((((.(((.((((((((....(((....))).....)))))))).))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)..	Aly-miRN84c	3225688	3225708	ATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	Aly-miRN84c*	3225565	3225585	ATCCAATTTCCGACGAAATTT		3
Aly-MIRN84d	PmiREN000596	MIRN84	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	28174360	28174542	+	GATTCGCGAGAAATTAATGTAACCAATTCCGACGAAATTTCCGACGAAATTTACAAAATTTGTCGCAAAATTCGTCGGAAACTAAATCTCCCGGTAACATTTTCCGACAAATTTTCCGACAAATTTTTAAATTTCGTCGGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTACATTAACTTCTTTGACGCCCG	(..(((.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((((.((((((((....(((....))).....)))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))).))))))))..)...	28174380	28174522	AACCAATTCCGACGAAATTTCCGACGAAATTTACAAAATTTGTCGCAAAATTCGTCGGAAACTAAATCTCCCGGTAACATTTTCCGACAAATTTTCCGACAAATTTTTAAATTTCGTCGGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((((.((((((((....(((....))).....)))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))..	Aly-miRN84d	28174502	28174522	ATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	Aly-miRN84d*	28174380	28174400	AACCAATTCCGACGAAATTTC		3
Aly-MIRN84e	PmiREN000629	MIRN84	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	18167648	18167756	+	AGAAATACTGTTCCCGGGAGATTTAATTTCCGACGAATTTTCCGATAAATTTTTAAAATTCGTCGGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTACATTAATTTCTCGCGAATCTC	.........((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((.(((((...))))).)))))))).))))))))))))))........))))))))).))))...	18167668	18167736	ATTTAATTTCCGACGAATTTTCCGATAAATTTTTAAAATTCGTCGGAAATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	...((((((((((((((.((((((((.(((((...))))).)))))))).)))))))))))))).....	Aly-miRN84e	18167716	18167736	ATTTCGTCGGAAATTGGTTAC	Aly-miRN84e*	18167668	18167688	ATTTAATTTCCGACGAATTTT		3
Aly-MIRN85a	PmiREN000566	MIRN85	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	21706613	21706832	+	TCAAAACCTAAACTAATGTAAATGAGTCGATTTCAACACGACGTGAAACAATGTTAGTTCGGAAGTTAACAGTTCTCAAAGTTATTTGATTTTATTTTCAAGGTTTGATGAATGTTGTAGAGAGAGAATTACCCAAGGTTGAATAACCGTTAATTTCCGAACTAACACCGTTCCGCGTCGTGTTGAAATCGGCTCATTTGCATTAGTTCAGGTTTCGATT	((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((..(((((((((((((((((((.(((.((((.......(((((((.(((((((.((((...)))).))).))))..))))))).......))))..))).)))))))))))))))))))..))).))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).))..	21706633	21706812	AATGAGTCGATTTCAACACGACGTGAAACAATGTTAGTTCGGAAGTTAACAGTTCTCAAAGTTATTTGATTTTATTTTCAAGGTTTGATGAATGTTGTAGAGAGAGAATTACCCAAGGTTGAATAACCGTTAATTTCCGAACTAACACCGTTCCGCGTCGTGTTGAAATCGGCTCATTTG	(((((((((((((((((((((((((.(((..(((((((((((((((((((.(((.((((.......(((((((.(((((((.((((...)))).))).))))..))))))).......))))..))).)))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))))))))))))..	Aly-miRN85a	21706633	21706653	AATGAGTCGATTTCAACACGA	Aly-miRN85a*	21706792	21706812	GTGTTGAAATCGGCTCATTTG		3
Aly-MIRN85b	PmiREN000576	MIRN85	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	1591444	1591663	+	TCAAAACTTAAACAAATGTAAATGAGTCGATTTCAACACGACGTGAAACAATGTTAGTTCGGAAGTTAACAGTTCTCAAAGTTATTTGATTTTATTTTCAAAGTTTGATGAATGTTGTAGAGAGAGAATTACCCAAGGTTGAGTAACCGTTAACTTCCGAACTAACACCGTTCTGCGTCGTGTTGAAATCGGCTCATTTGCATTAGTTCAGGTTTCGATT	((.((((((.(((.(((((((((((((((((((((((((((((((.(((..(((((((((((((((((((.((((((((.......(((((((.(((((((.((((...)))).))).))))..))))))).......))))).))).)))))))))))))))))))..))).))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))))).))..	1591464	1591643	AATGAGTCGATTTCAACACGACGTGAAACAATGTTAGTTCGGAAGTTAACAGTTCTCAAAGTTATTTGATTTTATTTTCAAAGTTTGATGAATGTTGTAGAGAGAGAATTACCCAAGGTTGAGTAACCGTTAACTTCCGAACTAACACCGTTCTGCGTCGTGTTGAAATCGGCTCATTTG	(((((((((((((((((((((((((.(((..(((((((((((((((((((.((((((((.......(((((((.(((((((.((((...)))).))).))))..))))))).......))))).))).)))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))))))))))))..	Aly-miRN85b	1591464	1591484	AATGAGTCGATTTCAACACGA	Aly-miRN85b*	1591623	1591643	GTGTTGAAATCGGCTCATTTG		3
Aly-MIRN86a	PmiREN000567	MIRN86	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	14093244	14093438	-	CGAATGTAAATGAGCCGATTTCAACACGACGCGAAACAATGTTAGTTCAGAAGTTAACAGTTCTCCAGGTTATTTGATTTTATTTTCAAGGTTTGATGAATGTTGTAGAGAGAAAATTATCCAAGGTTGAGCAACCGTTAACTTTCGAACTACACCGTTTCGCGTCGTGTTGAAATCGGCTCATTTGCATTAGTT	(.(((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((.(((((.(((((((((.((((((.........(((((((.(((((((.((((...)))).))).))))..))))))).........))).))).))))))))).))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))).)..	14093264	14093418	TCAACACGACGCGAAACAATGTTAGTTCAGAAGTTAACAGTTCTCCAGGTTATTTGATTTTATTTTCAAGGTTTGATGAATGTTGTAGAGAGAAAATTATCCAAGGTTGAGCAACCGTTAACTTTCGAACTACACCGTTTCGCGTCGTGTTGAAA	(((((((((((((((((..(((.(((((.(((((((((.((((((.........(((((((.(((((((.((((...)))).))).))))..))))))).........))).))).))))))))).))))))))..)))))))))))))))))..	Aly-miRN86a	14093264	14093284	CCGTTTCGCGTCGTGTTGAAA	Aly-miRN86a*	14093398	14093418	TCAACACGACGCGAAACAATG		3
Aly-MIRN86b	PmiREN000578	MIRN86	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	24513513	24513709	-	CTAATGCAAATAAGCCGATTTCAACACGACGTGAAACGGTGTTAGTTCGAAAGCTAACAATTTTCAAGGTTATTTGATTTTATTTTCAGGGTTTGCTGATCAATGATGTAGGGAGAATTACCCAAGGTTGAGTAATTTTTAAATTTCGAACTAACACCGTTTCGCGTCGTGTTGAAATCGGCTCATTTGCATTAGTT	(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((((((.((((..((((((..(((.((((....))))..))).)))))).)))).))).....))))).)))).)))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))..	24513533	24513689	TCAACACGACGTGAAACGGTGTTAGTTCGAAAGCTAACAATTTTCAAGGTTATTTGATTTTATTTTCAGGGTTTGCTGATCAATGATGTAGGGAGAATTACCCAAGGTTGAGTAATTTTTAAATTTCGAACTAACACCGTTTCGCGTCGTGTTGAAA	((((((((((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((((((.((((..((((((..(((.((((....))))..))).)))))).)))).))).....))))).)))).)))..))))))))))))))))))))))))))))))))..	Aly-miRN86b	24513533	24513553	CCGTTTCGCGTCGTGTTGAAA	Aly-miRN86b*	24513669	24513689	TCAACACGACGTGAAACGGTG		3
Aly-MIRN86c	PmiREN000618	MIRN86	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	3693637	3693832	+	CTAATGTAAATGAGCCGATTTCAACACAACGCGAAACAGTGTTAGTTCGGAAGTTTACGGTTCTCAAGGTTATTTGATTTTATTTTCAGGGTTTGCTGAATACTGTAGAGAGAGAATTACCCAAGGTTGAGCAACCGTTAACTTCTAAACTAACACCGTTTCGCGTCGTGTTGAAATCGGCTCATTTGCATTAGTT	(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((((((.(((((((.((((((((((((((.((((..((((...(((((......))))).......))))..)))).))).....))))).)))))).))))))).))))))))).))))))))).)))))))))))))))))))))))))))..	3693657	3693812	TCAACACAACGCGAAACAGTGTTAGTTCGGAAGTTTACGGTTCTCAAGGTTATTTGATTTTATTTTCAGGGTTTGCTGAATACTGTAGAGAGAGAATTACCCAAGGTTGAGCAACCGTTAACTTCTAAACTAACACCGTTTCGCGTCGTGTTGAAA	(((((((.(((((((((.(((((((((.(((((((.((((((((((((((.((((..((((...(((((......))))).......))))..)))).))).....))))).)))))).))))))).))))))))).))))))))).)))))))..	Aly-miRN86c	3693792	3693812	CCGTTTCGCGTCGTGTTGAAA	Aly-miRN86c*	3693657	3693677	TCAACACAACGCGAAACAGTG		3
Aly-MIRN87a	PmiREN000568	MIRN87	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	5724110	5724289	-	GAAATTACAACTCACGTGGAAGGGGGTCGTTCAAATGGGTTCGTCCTCAAAATGATTCAAAAGGGAAGGAACACCAAGAAAATTCCACCCAGAAGAGTGAGAATGTGTGTTATAGATGTGGATCTAAGGGACATTGGGCCCGTACGTGTCGAACTCCTCCACATCTTTGTAAGTTGTACA	.....(((((((.(((((((.((((.(((..((.(((((((((((((......((((((...........((((.......(((((((.(....).))).))))))))..........))))))...)))))...))))))))...)).))).)))))))))......)).)))))))..	5724130	5724269	AGGGGGTCGTTCAAATGGGTTCGTCCTCAAAATGATTCAAAAGGGAAGGAACACCAAGAAAATTCCACCCAGAAGAGTGAGAATGTGTGTTATAGATGTGGATCTAAGGGACATTGGGCCCGTACGTGTCGAACTCCTCC	.((((.(((..((.(((((((((((((......((((((...........((((.......(((((((.(....).))).))))))))..........))))))...)))))...))))))))...)).))).))))...	Aly-miRN87a	5724248	5724269	AGGGGGTCGTTCAAATGGGTTC	Aly-miRN87a*	5724130	5724150	CCGTACGTGTCGAACTCCTCC		3
Aly-MIRN87b	PmiREN000569	MIRN87	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_573	1619	1796	-	GAAATTACAACTCACGTGGAAGGGGGTCGTTCAAATGGGTTCGTCCTCAAAATGATTCAAAAGGGAAGGACACCAAGAAATTCCACCCAGAAGAGTGAGAATGTGTGTTATAGATGTGGATCTAAGGGACATTGGGCCCGTACGTGTCGAACTCCTCCACATCTTTTTAAGTTGTACA	.....(((((((...(((((.((((.(((..((.(((((((((((((......((((((.......((.((((......(((((((.(....).))).)))))))).)).......))))))...)))))...))))))))...)).))).))))))))).........)))))))..	1639	1776	AGGGGGTCGTTCAAATGGGTTCGTCCTCAAAATGATTCAAAAGGGAAGGACACCAAGAAATTCCACCCAGAAGAGTGAGAATGTGTGTTATAGATGTGGATCTAAGGGACATTGGGCCCGTACGTGTCGAACTCCTCC	.((((.(((..((.(((((((((((((......((((((.......((.((((......(((((((.(....).))).)))))))).)).......))))))...)))))...))))))))...)).))).))))...	Aly-miRN87b	1755	1776	AGGGGGTCGTTCAAATGGGTTC	Aly-miRN87b*	1639	1659	CCGTACGTGTCGAACTCCTCC		3
Aly-MIRN87c	PmiREN000583	MIRN87	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	4252915	4253094	+	GAAATTACAACTCACGTGGAAGGGGGTCGTTCAAATGGGTTCGTCCTCAAAATGATTCAAAAGGGAAGGAACACCAAGAAAATTCTACCCAGAAGAGTGAGAATGTGTGTTATAGATGTGGATCTAAGGGGCATTGGGCCCGTACGTGTCGAACTCCTCCACATCTTTGTAAGCTGTACA	...............(((((.((((.(((..((.(((((((((.((((.....((((((..........(((((((.....(((((.......))))).....)).))))).......))))))...))))...)))))))))...)).))).))))))))).....((((.....))))	4252935	4253074	AGGGGGTCGTTCAAATGGGTTCGTCCTCAAAATGATTCAAAAGGGAAGGAACACCAAGAAAATTCTACCCAGAAGAGTGAGAATGTGTGTTATAGATGTGGATCTAAGGGGCATTGGGCCCGTACGTGTCGAACTCCTCC	.((((.(((..((.(((((((((.((((.....((((((..........(((((((.....(((((.......))))).....)).))))).......))))))...))))...)))))))))...)).))).))))...	Aly-miRN87c	4252935	4252956	AGGGGGTCGTTCAAATGGGTTC	Aly-miRN87c*	4253054	4253074	CCGTACGTGTCGAACTCCTCC		3
Aly-MIRN88	PmiREN000570	MIRN88	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	6352117	6352377	+	ATCTTCACCATGTTCATACCATACATAATAATTCGCCATAAACCCCCTATTAAGCAAATGACTCGAAATTGTGGTAGCTTTCATGCGTTTAGAATTTTGACAGACTACACAAGGACAATAAAACCGACCTTTTCCGTCTTCAACGTGAGAGCTCGCAAAATCGATGAACTGTTCCACACCCGCCAAATACTCCCCCGGAACATGACTAGTGTATGGATCGATTCGGTTGTACATCCATTCGCGTGATGGA	......(((..(((.((.((((((((....................................((((..(((((..((((((((((...........((((.((((.....((((.............))))....)))))))))))))))))))))))..)))).....((((((.....................))))))......)))))))))).)))..)))......((((((.....))))))	6352137	6352357	CCATGTTCATACCATACATAATAATTCGCCATAAACCCCCTATTAAGCAAATGACTCGAAATTGTGGTAGCTTTCATGCGTTTAGAATTTTGACAGACTACACAAGGACAATAAAACCGACCTTTTCCGTCTTCAACGTGAGAGCTCGCAAAATCGATGAACTGTTCCACACCCGCCAAATACTCCCCCGGAACATGACTAGTGTATGGATCGATTCGGTT	((..(((.((.((((((((....................................((((..(((((..((((((((((...........((((.((((.....((((.............))))....)))))))))))))))))))))))..)))).....((((((.....................))))))......)))))))))).)))..))..	Aly-miRN88	6352337	6352357	AGTGTATGGATCGATTCGGTT	Aly-miRN88*	6352137	6352157	CCATGTTCATACCATACATAA		3
Aly-MIRN89	PmiREN000571	MIRN89	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	2215438	2215589	+	TCCTTCTCGAAGGAGAGATCAAAACTAGCCGTGGGAAATTGCTTTCGGGAAAGAATTGTATTGTCATGTTGATGACGAGAAATACGTCGTGGCAATTCTTTCCCGAAAGCAATTTCCCATGGCTAGTTTTGATCTCTCCTTCGAGAAGGAGT	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((....)))))))((......))...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	2215458	2215569	AAAACTAGCCGTGGGAAATTGCTTTCGGGAAAGAATTGTATTGTCATGTTGATGACGAGAAATACGTCGTGGCAATTCTTTCCCGAAAGCAATTTCCCATGGCTAGTTTTGA	(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((....)))))))((......))...)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	Aly-miRN89	2215549	2215569	ATTTCCCATGGCTAGTTTTGA	Aly-miRN89*	2215458	2215478	AAAACTAGCCGTGGGAAATTG		3
Aly-MIRN90	PmiREN000572	MIRN90	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	3100573	3100658	+	CGCCGAACTCTTGTAGTTCGTCTGGTCTGCGATGGCACTCTAAGTGCTACGTGTGACAAGTTCGATGCTTGAGTAAGGCATTGAGA	.(((..((((..(((..(((.((.(((((((.(((((((...))))))))))).))).))..))))))..))))..))).......	3100593	3100638	GTCTGGTCTGCGATGGCACTCTAAGTGCTACGTGTGACAAGTTCGA	(.((.(((((((.(((((((...))))))))))).))).))..)..	Aly-miRN90	3100617	3100638	GTGCTACGTGTGACAAGTTCGA	Aly-miRN90*	3100593	3100613	GTCTGGTCTGCGATGGCACTC		3
Aly-MIRN91	PmiREN000573	MIRN91	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_681	3407	3654	-	AGACATGCTTTTTGAACACCGAGGTAGGTAGTGATTTTATGAAGAGATCTGCAGCATTGTCACATGATCGGACCTATTTGACTTCAATGTCTTTATTCTTCTCAAGTTCTTGGGTGTATGAAAAGAATTTCGGAGGGATATGTTTGGTTCTATTACTTTTGATATATCCTTCCTTCGTTTGGGCAACACATGCAGCATTATCTTCATATAGGATGGTTGGCTCTTTGTTGTGTTGGATTATTGATCTC	(((((......((.((((((((((.((.((((.((((((((((((((((((((...(((((.((....((((.......(((......)))............((((((((...........)))))))).(((((((((((((.(((......)))...)))))))))))))))))..)))))))....))))).))).))))))))..)))).)))).)))))))..))))).))....)).))).	3427	3634	GAGGTAGGTAGTGATTTTATGAAGAGATCTGCAGCATTGTCACATGATCGGACCTATTTGACTTCAATGTCTTTATTCTTCTCAAGTTCTTGGGTGTATGAAAAGAATTTCGGAGGGATATGTTTGGTTCTATTACTTTTGATATATCCTTCCTTCGTTTGGGCAACACATGCAGCATTATCTTCATATAGGATGGTTGGCTCTTTGT	((((.((.((((.((((((((((((((((((((...(((((.((....((((.......(((......)))............((((((((...........)))))))).(((((((((((((.(((......)))...)))))))))))))))))..)))))))....))))).))).))))))))..)))).)))).))))))..	Aly-miRN91	3427	3448	TATAGGATGGTTGGCTCTTTGT	Aly-miRN91*	3614	3634	GAGGTAGGTAGTGATTTTATG		3
Aly-MIRN92	PmiREN000574	MIRN92	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	5622383	5622592	-	GATACCAATACAAGCGGCTTATCCATTATAGCAAATTTATCAAGTCTTAGTATAAGCTTGATGTTAAGTTATCCATCAATCCTCCTAAATGTGCTAAGTGTAAGTTCACTCGGCACATTTAGGAGGATTAATGCACAATTTCAACATTAAGCTTAAACTTAGATCTGATAAATTTGCTATAAATGGATAACTCATTTGTATTGGTAATTT	..((((((((((((.((.((((((((((((((((((((((((.((((.(((.((((((((((((((((((...(((.((((((((((((((((((.((((......)))).)))))))))))))))))).)))...))))).))))))))))))).))).)))).))))))))))))))).))))))))).)).))))))))))))....	5622403	5622572	ATCCATTATAGCAAATTTATCAAGTCTTAGTATAAGCTTGATGTTAAGTTATCCATCAATCCTCCTAAATGTGCTAAGTGTAAGTTCACTCGGCACATTTAGGAGGATTAATGCACAATTTCAACATTAAGCTTAAACTTAGATCTGATAAATTTGCTATAAATGGATAA	((((((((((((((((((((((.((((.(((.((((((((((((((((((...(((.((((((((((((((((((.((((......)))).)))))))))))))))))).)))...))))).))))))))))))).))).)))).))))))))))))))).)))))))..	Aly-miRN92	5622403	5622424	TAAATTTGCTATAAATGGATAA	Aly-miRN92*	5622552	5622572	ATCCATTATAGCAAATTTATC		3
Aly-MIRN93	PmiREN000577	MIRN93	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	14078996	14079102	+	TTTCGATGGATATGGTGAAGAACAGTGTCTTGAATGAGGAAACTAGAAGGCAGTCAAATGCTAGTTCCTCAAGATCAGATGTGTTAGTCACTGAGTCAAGGGGGAGG	........(((.((((((..((((..((((.((.(((((((.((....((((......)))))))))))))...)))))).))))..)))))).)))..........	14079016	14079082	AACAGTGTCTTGAATGAGGAAACTAGAAGGCAGTCAAATGCTAGTTCCTCAAGATCAGATGTGTTAG	((((..((((.((.(((((((.((....((((......)))))))))))))...)))))).))))..	Aly-miRN93	14079016	14079036	AACAGTGTCTTGAATGAGGAA	Aly-miRN93*	14079062	14079082	CCTCAAGATCAGATGTGTTAG		3
Aly-MIRN94	PmiREN000579	MIRN94	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	12013121	12013234	-	CTATTTGGGATATCAATACGTGTCCCCCTGCGAATCGTACTACTATGCTCACTAATATAGTTGAAAACATTAATTTCGTTCTAGGGGAGATATATGCGAGATTTTTCGAGCGCC	...................(((((((((((.(((.((.......(((.((((((...))).)))...)))......))))))))))).)))))..((..((....))..))...	12013141	12013214	TGTCCCCCTGCGAATCGTACTACTATGCTCACTAATATAGTTGAAAACATTAATTTCGTTCTAGGGGAGATATA	((((((((((.(((.((.......(((.((((((...))).)))...)))......))))))))))).))))..	Aly-miRN94	12013193	12013214	TGTCCCCCTGCGAATCGTACTA	Aly-miRN94*	12013141	12013161	TTTCGTTCTAGGGGAGATATA		3
Aly-MIRN95	PmiREN000580	MIRN95	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	12012761	12012864	-	ATTCTGATCACTCAAGAGGTTTTTGACATCTCCACATATGATTCTCGTAGTATCCGAGACACGGTATGTTGGGCGCTCGAAAATCTCGCATGTATCTCCCCTA	...............(((((((((((...(((.((((((...(((((.......)))))....)))))).)))...)))))))))))................ 	12012781	12012844	TTTTGACATCTCCACATATGATTCTCGTAGTATCCGAGACACGGTATGTTGGGCGCTCGAAAAT	((((((...(((.((((((...(((((.......)))))....)))))).)))...))))))..	Aly-miRN95	12012823	12012844	TTTTGACATCTCCACATATGAT	Aly-miRN95*	12012781	12012801	GTATGTTGGGCGCTCGAAAAT		3
Aly-MIRN96	PmiREN000581	MIRN96	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_88	12326	12536	-	AACAGTTCCGTTCTGACCAAAAGCGATTGGCTGTAAATCTTTCTTTTTGACGGGATCATAGAACTCTTGCTCTTCAATTTGGATAGTGAATTGAGTAAAGAGCTTCTTTTGAAAAGACGAACTTGGCTTTTCAAACTTTATCTCCGTGGTTCCGTCGCTTCTAGAGTGAAAGCTTACGTCAGATGACTGAATCGGTGCTTGAGATGCTTGA	...............(((...((((.(((((.((((..((((((((((((((((((((((((((((((....(((((((((.....)))))))))..))))).))))(((((((((.(.......))))))))))..........)))))))))))).....)))).))))).))))))))).)).)).....)))...............	12346	12516	AAGCGATTGGCTGTAAATCTTTCTTTTTGACGGGATCATAGAACTCTTGCTCTTCAATTTGGATAGTGAATTGAGTAAAGAGCTTCTTTTGAAAAGACGAACTTGGCTTTTCAAACTTTATCTCCGTGGTTCCGTCGCTTCTAGAGTGAAAGCTTACGTCAGATGACTGAA	.((((.(((((.((((..((((((((((((((((((((((((((((((....(((((((((.....)))))))))..))))).))))(((((((((.(.......))))))))))..........)))))))))))).....)))).))))).))))))))).)).))...	Aly-miRN96	12346	12367	AAGCTTACGTCAGATGACTGAA	Aly-miRN96*	12496	12516	AAGCGATTGGCTGTAAATCTT		3
Aly-MIRN97	PmiREN000585	MIRN97	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	6126256	6126354	+	TATGACTTACGGTTCTCATGCAATGGCCTCTATCTTATTGATAATGAAATAAGTTGTTAAAGGTCTGTAGGTTGCTGCATGTCAGTTTTGAGAGAAATT	................((((((.(((((((.(((((..(((((((.......))))))))))))..).)))))).))))))..((((((....))))))	6126276	6126334	CAATGGCCTCTATCTTATTGATAATGAAATAAGTTGTTAAAGGTCTGTAGGTTGCTGCA	((.(((((((.(((((..(((((((.......))))))))))))..).)))))).))..	Aly-miRN97	6126313	6126334	TAAAGGTCTGTAGGTTGCTGCA	Aly-miRN97*	6126276	6126296	CAATGGCCTCTATCTTATTGA		3
Aly-MIRN98	PmiREN000586	MIRN98	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	4230788	4230984	+	AGTTGCCTGAGTGATAGTAAGATCTTCGTACTCTTCATTCTCTGGGGACGAATCCAAGATCTCTGAGTTAAACCGGGGAAAAGAGGGATCGGAAGGGGTCTCGTCGTCAGAGGACGATGGAGGATCGAAGGTTGTTGTTGAATAGAAACGACGGAGGAGGAGAGGCGGCGAGATCTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNN	................(((((((((((((.((((((.((((((((.(((((((((..(((((((...................))))))).....)))).))))).))))))))((((.....))))....((((((((.......))))))))..))))))..)))..))))))))))..................	4230808	4230964	GATCTTCGTACTCTTCATTCTCTGGGGACGAATCCAAGATCTCTGAGTTAAACCGGGGAAAAGAGGGATCGGAAGGGGTCTCGTCGTCAGAGGACGATGGAGGATCGAAGGTTGTTGTTGAATAGAAACGACGGAGGAGGAGAGGCGGCGAGATCTT	(((((((((.((((((.((((((((.(((((((((..(((((((...................))))))).....)))).))))).))))))))((((.....))))....((((((((.......))))))))..))))))..)))..))))))..	Aly-miRN98	4230943	4230964	GGAGGAGAGGCGGCGAGATCTT	Aly-miRN98*	4230808	4230828	GATCTTCGTACTCTTCATTCT		3
Aly-MIRN99	PmiREN000587	MIRN99	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	4193942	4194140	-	ATTCTTATTTCCACAAATTGCCTATATCCTTTTGAAAAGTTTTAAATATTTTGACTAAATATAAAACTTTGGTAACCGTCCATTTAATTCCCAATAATACACTTTGGTCATTTTTTTGTCGGATACACTATGGTCTATGGTTGCTGAAATAATTAAAACTTTTCAAAAGGATATAGGCAATTATTTCCAATAATTCGAA	(........).....((((((((((((((((((((((((((((((.((((((..................(((((((((((((.....((((((.((...((....))....)).)))..)))......))))...))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).................	4193962	4194120	CCTATATCCTTTTGAAAAGTTTTAAATATTTTGACTAAATATAAAACTTTGGTAACCGTCCATTTAATTCCCAATAATACACTTTGGTCATTTTTTTGTCGGATACACTATGGTCTATGGTTGCTGAAATAATTAAAACTTTTCAAAAGGATATAGGCA	(((((((((((((((((((((((((.((((((..................(((((((((((((.....((((((.((...((....))....)).)))..)))......))))...))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..	Aly-miRN99	4193962	4193982	CTTTTCAAAAGGATATAGGCA	Aly-miRN99*	4194100	4194120	CCTATATCCTTTTGAAAAGTT		3
Aly-MIRN100	PmiREN000588	MIRN100	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1159298	1159398	+	GCCTTGCACATCCCATCAATCATTATAGTATATGTGAATATTTTGAGTTTCATTTCACTCTTTTGCATATACTCGAATACCACCACTGCCTTCTCTAGGTT	.....................(((..((((((((((((.....((((......))))....))))))))))))..))).........((((.....)))).	1159318	1159378	CATTATAGTATATGTGAATATTTTGAGTTTCATTTCACTCTTTTGCATATACTCGAATACC	.(((..((((((((((((.....((((......))))....))))))))))))..)))...	Aly-miRN100	1159358	1159378	TTTTGCATATACTCGAATACC	Aly-miRN100*	1159318	1159338	CATTATAGTATATGTGAATAT		3
Aly-MIRN101	PmiREN000589	MIRN101	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1205947	1206068	+	TTTCTCCACAACAAAGCTTCCGAAGCTGTGGCGCTAGTTGATCGGATGGCTGTGAAAGGCTGTCAACCAAATCTGGTTACATATGGTGCTGTAGTAAATGGATTATGTAAGAGAGGTGATAT	(.((((....(((.....((((..((((((((((((..((....(((((((......)))))))(((((....))))).))..))))))))))))...))))...)))....)))).)....	1205967	1206048	CGAAGCTGTGGCGCTAGTTGATCGGATGGCTGTGAAAGGCTGTCAACCAAATCTGGTTACATATGGTGCTGTAGTAAATGGA	((..((((((((((((..((....(((((((......)))))))(((((....))))).))..))))))))))))...))..	Aly-miRN101	1206028	1206048	TATGGTGCTGTAGTAAATGGA	Aly-miRN101*	1205967	1205987	CGAAGCTGTGGCGCTAGTTGA		3
Aly-MIRN102a	PmiREN000590	MIRN102	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1206572	1206682	+	GATTTTGCAAGTCTAAGAAGGTAGAAGATGGTATGGAACTCTTCTGGGAGATGTCTCAAAGAGGATTGGTTCGAGACACAATCGTTTACACTACTCTCATCCAAGGGTTTT	(((((...)))))..((.(((((((.((((((.(.((((((((((..(((....)))..))))))...)))).).)).).))).))))).)).))................	1206592	1206662	GTAGAAGATGGTATGGAACTCTTCTGGGAGATGTCTCAAAGAGGATTGGTTCGAGACACAATCGTTTACAC	(((((.((((((.(.((((((((((..(((....)))..))))))...)))).).)).).))).)))))..	Aly-miRN102a	1206592	1206612	GTAGAAGATGGTATGGAACTC	Aly-miRN102a*	1206642	1206662	TCGAGACACAATCGTTTACAC		3
Aly-MIRN102b	PmiREN000592	MIRN102	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1217364	1217469	+	AGGACTGTTTCCCAAATGTAGTGACTTATACTACTCTTATAAATGGATTTTGCAAGTCTAAGAAGGTAGAAGATGGTATGGAACTCTTCCGGGAGATGTGTCAAAG	......(((((((....(.(((...((((((((((.((((...(((((((...))))))).....)))).)).)))))))).))))....))))))).........	1217384	1217449	GTGACTTATACTACTCTTATAAATGGATTTTGCAAGTCTAAGAAGGTAGAAGATGGTATGGAACTC	((...((((((((((.((((...(((((((...))))))).....)))).)).)))))))).))..	Aly-miRN102b	1217429	1217449	GTAGAAGATGGTATGGAACTC	Aly-miRN102b*	1217384	1217404	GTGACTTATACTACTCTTATA		3
Aly-MIRN103	PmiREN000591	MIRN103	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1217059	1217141	+	ACCAGATGTTTTTACCTATAACTCCCTCCTAAGCTGCCTTTGTAATTACGGAAGATGGAGTGATGCCTCTCGACTGCTGAGCG	....................((((((((((((..(((....))).))).)).))..)))))......................	1217079	1217121	ACTCCCTCCTAAGCTGCCTTTGTAATTACGGAAGATGGAGTGA	((((((((((((..(((....))).))).)).))..)))))..	Aly-miRN103	1217101	1217121	TAATTACGGAAGATGGAGTGA	Aly-miRN103*	1217079	1217099	ACTCCCTCCTAAGCTGCCTTT		3
Aly-MIRN104	PmiREN000593	MIRN104	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	6819180	6819328	-	TTTCTGAGCCTTTTGTAACCTTCTTTTGCACACGCCTTGGATTTTCTTTTGGCTTTTTTCATGTTGTTCATTTGAACTTTAGCCTTTTCATCTTACCTAAAGAAAATCGAAGGCGTTTGTAGAAGAAGGTTTCAAGAAAAAGTTATACA	..........(((((.((((((((((((((.(((((((.((((((((((.((((...((((...........))))....))))..............)))))))))).))))))).)))))))))))))).)))))............	6819200	6819308	TTCTTTTGCACACGCCTTGGATTTTCTTTTGGCTTTTTTCATGTTGTTCATTTGAACTTTAGCCTTTTCATCTTACCTAAAGAAAATCGAAGGCGTTTGTAGAAGAAGG	((((((((((.(((((((.((((((((((.((((...((((...........))))....))))..............)))))))))).))))))).))))))))))..	Aly-miRN104	6819200	6819220	GAAGGCGTTTGTAGAAGAAGG	Aly-miRN104*	6819288	6819308	TTCTTTTGCACACGCCTTGGA		3
Aly-MIRN105	PmiREN000595	MIRN105	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_446	7077	7172	+	TGAAATGTTGACAAACCCGGAGCTCGACGAATGGAAAAAATTACCTTTGGCTCTTTTAGTTCTGATCGACGGCGTGGTTATGTGCAACAACAGAGA	.....((((((((((((....((.((.(((.(((((((((...((...))...))))..))))).))).))))..)))).))).))))).......	7097	7152	AGCTCGACGAATGGAAAAAATTACCTTTGGCTCTTTTAGTTCTGATCGACGGCGTG	.((.((.(((.(((((((((...((...))...))))..))))).))).))))...	Aly-miRN105	7131	7152	TTTAGTTCTGATCGACGGCGTG	Aly-miRN105*	7097	7117	AGCTCGACGAATGGAAAAAAT		3
Aly-MIRN106	PmiREN000597	MIRN106	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	660356	660547	-	GTTTTAATATTGTTTTTATGTTTTTGTTTTCACTTTTCGGGGTTATCTGACCAGAAGGATAGAGCATTGCTCCTGTTTCGATATGTTTTTCTTTTTGTCTTAAGCTTTTGATGAAGTTATGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAACTCCAACTTTGCAGATGATGTGAGCTGAGCATGAGAATGATAAACATGCAG	.......((((((((((((((((..((((.(((.((((((((((....(..(((((((((((((((..((.........((((............))))...((((((....))))))..))..)))))))))))))))..)...))))))).))).).)).)))).)))))))))))))))).........	660376	660527	TTTTTGTTTTCACTTTTCGGGGTTATCTGACCAGAAGGATAGAGCATTGCTCCTGTTTCGATATGTTTTTCTTTTTGTCTTAAGCTTTTGATGAAGTTATGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAACTCCAACTTTGCAGATGATGTGAGCTGAGCA	(((..((((.(((.((((((((((....(..(((((((((((((((..((.........((((............))))...((((((....))))))..))..)))))))))))))))..)...))))))).))).).)).)))).)))..	Aly-miRN106	660376	660396	GCAGATGATGTGAGCTGAGCA	Aly-miRN106*	660507	660527	TTTTTGTTTTCACTTTTCGGG		3
Aly-MIRN107	PmiREN000598	MIRN107	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	18222754	18223026	+	GGAGCCATCAGACCATTTTATTAAAAAGTATGGAGTCACCATCTTCTGGGACTTTGAAAATTTAACGGTCGACAGAAATGCCGAAGATCTATCTCAACTTAAAGGTAATATCGAAGTTGCCTTGAAAACACTAGATCATCGCTTCTTCATCCATGGCAAGCCAAAGGGGTTTGGCAAATTTAAAGGAGCGAATTGGAGAGAAGTCATAGAACTGCAGAATACTGATGCGTTCGATTTGCAAAATGTGGAC	.((((((((((...(((((.........(((((..((.(((..(((((.((((((((....)))).))))..)))))........((((((..........((((((((......))))))))........)))))).(((((((((......((.((((((.....)))))).))......)))))))))..))).))....))))).......))))).)))))).))))..((((((...)))))).	18222774	18223006	GAGCCATCAGACCATTTTATTAAAAAGTATGGAGTCACCATCTTCTGGGACTTTGAAAATTTAACGGTCGACAGAAATGCCGAAGATCTATCTCAACTTAAAGGTAATATCGAAGTTGCCTTGAAAACACTAGATCATCGCTTCTTCATCCATGGCAAGCCAAAGGGGTTTGGCAAATTTAAAGGAGCGAATTGGAGAGAAGTCATAGAACTGCAGAATACTGATGCGTTCGA	((((((((((...(((((.........(((((..((.(((..(((((.((((((((....)))).))))..)))))........((((((..........((((((((......))))))))........)))))).(((((((((......((.((((((.....)))))).))......)))))))))..))).))....))))).......))))).)))))).))))..	Aly-miRN107	18222986	18223006	GCAGAATACTGATGCGTTCGA	Aly-miRN107*	18222774	18222794	GAGCCATCAGACCATTTTATT		3
Aly-MIRN108	PmiREN000599	MIRN108	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	19241114	19241223	-	TGGTAGAAATGGGATATACATCTATGTTTCAGCCTTATCCACGTCAAAAAAGCTATAGCTCTTGTTGATCGGATGGTAGAAACATAGGTTATTAATCCTATATAGGTATT	........((((((((((.(((((((((((.(((..((((..(((((...(((....)))....))))).))))))).))))))))))))))..))))))).........	19241134	19241203	TCTATGTTTCAGCCTTATCCACGTCAAAAAAGCTATAGCTCTTGTTGATCGGATGGTAGAAACATAGGTT	((((((((((.(((..((((..(((((...(((....)))....))))).))))))).))))))))))..	Aly-miRN108	19241134	19241154	CGGATGGTAGAAACATAGGTT	Aly-miRN108*	19241183	19241203	TCTATGTTTCAGCCTTATCCA		3
Aly-MIRN109	PmiREN000600	MIRN109	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	19236521	19236666	-	GGGAATGGTCTTTGTGGTAATGGATGAACTAGAAAAGGCATTGGACATATTCCAGGATATGCAAAAGAAATCAATGCATATTGTGTTGCATGTGCTCTACTAAATGTGATTTTCTAGTCATCTAAAAAATAGTTGC	....................(((((((.((((((((.(((((((((((((..((.((((((((...........)))))))).))....))))).))))....))))..)))))))))))))))............	19236541	19236646	TGGATGAACTAGAAAAGGCATTGGACATATTCCAGGATATGCAAAAGAAATCAATGCATATTGTGTTGCATGTGCTCTACTAAATGTGATTTTCTAGTCATCTAAA	(((((((.((((((((.(((((((((((((..((.((((((((...........)))))))).))....))))).))))....))))..)))))))))))))))..	Aly-miRN109	19236626	19236646	TGGATGAACTAGAAAAGGCAT	Aly-miRN109*	19236541	19236561	GTGATTTTCTAGTCATCTAAA		3
Aly-MIRN110	PmiREN000601	MIRN110	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	2747599	2747850	+	GAATGGAGGGCACAGGTGACTCTCTTGATCTTCAAAACCCACGCCTAGAATACAACGAAAATGATAATGAATGAATCACCGTTATTCGCTAATTTCGCATTCACGTCGTCCTCCTTCAAAAACGTTTATATCGTTGGCGTGAATTCGGAATTGGCGGATGACGGTGATTCATTCATTATCCTTTTCGTTGTATTCAAGGCGTGGGTTTTGAAGATCAAGAGAGTCTACTTGTGCCCTGGGTTTGTCCACC	......((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.............(((.......))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))((......))... .	2747619	2747830	TGACTCTCTTGATCTTCAAAACCCACGCCTAGAATACAACGAAAATGATAATGAATGAATCACCGTTATTCGCTAATTTCGCATTCACGTCGTCCTCCTTCAAAAACGTTTATATCGTTGGCGTGAATTCGGAATTGGCGGATGACGGTGATTCATTCATTATCCTTTTCGTTGTATTCAAGGCGTGGGTTTTGAAGATCAAGAGAGTCTAC	((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.............(((.......))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).).	Aly-miRN110	2747810	2747830	TTGAAGATCAAGAGAGTCTAC	Aly-miRN110*	2747619	2747639	TGACTCTCTTGATCTTCAAAA		3
Aly-MIRN111	PmiREN000602	MIRN111	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	13133053	13133195	+	CGGAGATTATGATGACACTTTCGGGTTGTTTGGTTGGCATGATGCAATTGTTCCAATTCGAGTTTTGAATCATCAAGAACTGAGTTTAATACTATTTCATCAAGTCATCCATATTACCTAAAAATGTCCTCTACTTTTCAAAA	..((((....((.((((.(((.((((.((.(((.((((.(((((.(((.((...((((((..((((((....))))))..))))))....)).))).))))).)))).))).)).)))).))).)))).))....))))....	13133073	13133175	TCGGGTTGTTTGGTTGGCATGATGCAATTGTTCCAATTCGAGTTTTGAATCATCAAGAACTGAGTTTAATACTATTTCATCAAGTCATCCATATTACCTAAAA	(.((((.((.(((.((((.(((((.(((.((...((((((..((((((....))))))..))))))....)).))).))))).)))).))).)).)))).)..	Aly-miRN111	13133073	13133094	TCGGGTTGTTTGGTTGGCATGA	Aly-miRN111*	13133155	13133175	AGTCATCCATATTACCTAAAA		3
Aly-MIRN112	PmiREN000603	MIRN112	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_5	16404377	16404476	-	TCAATTAAGGGACTGTGGTCTTTGTTTGCGACCCATACGTAATCTTTTGTGAGAGACTACGTGTGGGTGGCAAACAAAGACGACAATCCCTATTCCAGTT	.......(((((.(((.((((((((((((.(((((((((((.(((((....))))).))))))))))).)))))))))))).))).))))).........	16404397	16404456	TTTGTTTGCGACCCATACGTAATCTTTTGTGAGAGACTACGTGTGGGTGGCAAACAAAGA	(((((((((.(((((((((((.(((((....))))).))))))))))).)))))))))..	Aly-miRN112	16404397	16404417	CGTGTGGGTGGCAAACAAAGA	Aly-miRN112*	16404436	16404456	TTTGTTTGCGACCCATACGTA		3
Aly-MIRN113	PmiREN000604	MIRN113	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_6	12714347	12714510	+	GACAAATGTAAGATATTTGGAGTTGATGTGGGTGATTGGTATGTGGTGCTGAACAATTGGATCCATGGCTATATGGATTATTTACCGTAATAAAGTGTAATCTGTAATGTTTAACATCACATACACATCATCAACATCAACTCCAAATCTTTTGTTTGTCCTTT	((((((((.(((((..(((((((((((((.((((((..((((((((((.((((((....((((((((....))))))))..(((((........).)))).......)))))).))))))))))..)))))).)))))))))))))))))).))))))))....	12714367	12714490	AGTTGATGTGGGTGATTGGTATGTGGTGCTGAACAATTGGATCCATGGCTATATGGATTATTTACCGTAATAAAGTGTAATCTGTAATGTTTAACATCACATACACATCATCAACATCAACTCC	(((((((((.((((((..((((((((((.((((((....((((((((....))))))))..(((((........).)))).......)))))).))))))))))..)))))).)))))))))..	Aly-miRN113	12714367	12714387	AGTTGATGTGGGTGATTGGTA	Aly-miRN113*	12714470	12714490	CACATCATCAACATCAACTCC		3
Aly-MIRN114	PmiREN000605	MIRN114	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_735	374	487	-	TCACTCTATAGCGACATCTTGGTTTCTGTGAGCTGTTGGCTAGGTTTAGTATTACTATTAAACCAGTTCTGGTTTTGGCTTATTTAGGATACAAATAAACCGGTTAAATGCAAT	..................(((..((((((((((((..((((((((((((((....))))))))).....))))).))))))))..))))..)))....................	394	467	GGTTTCTGTGAGCTGTTGGCTAGGTTTAGTATTACTATTAAACCAGTTCTGGTTTTGGCTTATTTAGGATACAA	(..((((((((((((..((((((((((((((....))))))))).....))))).))))))))..))))..)..	Aly-miRN114	446	467	GGTTTCTGTGAGCTGTTGGCTA	Aly-miRN114*	394	414	TTTGGCTTATTTAGGATACAA		3
Aly-MIRN115	PmiREN000606	MIRN115	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	11988813	11988968	+	TCAACACGACGCGAAACAATGTTAGTTCGGAAGTTAACGGTTCTCAAAGTTATTTGATTTTATTTTCAGAGTTTGCTGAATGCTGTAGGGAGAGAATTACCCAAGGTTGAGCAACTTTTAACTTTCGAATTAACACTGTTTCGCGTCGTGTTGAAA	((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.(((((((((.......(((((((.((((((.(((.........))).).)))))))))))).......))))).)))).)))))))))))))))))).))))))))))))))))))..	11988833	11988948	GTTAGTTCGGAAGTTAACGGTTCTCAAAGTTATTTGATTTTATTTTCAGAGTTTGCTGAATGCTGTAGGGAGAGAATTACCCAAGGTTGAGCAACTTTTAACTTTCGAATTAACAC	(((((((((((((((((.(((((((((.......(((((((.((((((.(((.........))).).)))))))))))).......))))).)))).)))))))))))))))))..	Aly-miRN115	11988833	11988854	GTTAGTTCGGAAGTTAACGGTT	Aly-miRN115*	11988928	11988948	TTTTAACTTTCGAATTAACAC		3
Aly-MIRN116	PmiREN000607	MIRN116	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	31019018	31019118	+	CCCATACAGAGGTTGGGAGTTTTGATCTCATGATTAATGGTCTTGCAATTAATTGCAGGCGTTTAATTAAAGATTCAGCCAAACCATTTTGTGTATGAACA	..((((((.(((.(((.....(((((((..(((((((..((((.((((....))))))))..))))))).))).)))).....))).))).))))))....	31019038	31019098	TTTGATCTCATGATTAATGGTCTTGCAATTAATTGCAGGCGTTTAATTAAAGATTCAGCCA	.(((((((..(((((((..((((.((((....))))))))..))))))).))).))))...	Aly-miRN116	31019038	31019059	TTTGATCTCATGATTAATGGTC	Aly-miRN116*	31019078	31019098	GTTTAATTAAAGATTCAGCCA		3
Aly-MIRN117	PmiREN000608	MIRN117	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	19881593	19881802	+	GTGACTTGTTTGTTGTGATGTGTAGGTTGGATTTTTGATGGATCCAATAATTGAATCCGTGAGATGGTTGTGTTATTGGATGATTGTCAACACATAATTCATGAAAACAAACCAAACCAATGACAATCATCCAATAATACAACCATCTCACGGAGTCAATTGTTGGATCCATCAAAATTCAACCTACACATCACAACAAACAAGTTACAT	(((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((...............................)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..	19881613	19881782	TGTAGGTTGGATTTTTGATGGATCCAATAATTGAATCCGTGAGATGGTTGTGTTATTGGATGATTGTCAACACATAATTCATGAAAACAAACCAAACCAATGACAATCATCCAATAATACAACCATCTCACGGAGTCAATTGTTGGATCCATCAAAATTCAACCTACACA	(((((((((((((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((...............................)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))..	Aly-miRN117	19881613	19881634	TGTAGGTTGGATTTTTGATGGA	Aly-miRN117*	19881762	19881782	CATCAAAATTCAACCTACACA		3
Aly-MIRN118a	PmiREN000610	MIRN118	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	15441423	15441603	-	GATAAGGATATATTTAAACGTTGATTTTATTTAGCTCAAACAATATTAACATATATTTAAACATAAGAACAACAAGCACTAGTGGTCCAGTGGTATAGTAACCTGCCAGTGACCCGGGTTCGATACCCGACTGGTGCAATTGAGCTGTGATGAAATTGGCTTCAGCGTTGGTTGGGTCCTT	((((......)))).....((((((((((((((((((((..(((((......)))))..................((((((((((((.(.(((((........))))).)))))(((((.....)))))))))))))..)))))))).))))))))))))..((((....)))).......	15441443	15441583	TTGATTTTATTTAGCTCAAACAATATTAACATATATTTAAACATAAGAACAACAAGCACTAGTGGTCCAGTGGTATAGTAACCTGCCAGTGACCCGGGTTCGATACCCGACTGGTGCAATTGAGCTGTGATGAAATTGGCT	(((((((((((((((((((..(((((......)))))..................((((((((((((.(.(((((........))))).)))))(((((.....)))))))))))))..)))))))).)))))))))))..	Aly-miRN118a	15441443	15441463	TGAGCTGTGATGAAATTGGCT	Aly-miRN118a*	15441563	15441583	TTGATTTTATTTAGCTCAAAC		3
Aly-MIRN118b	PmiREN000611	MIRN118	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_1	2485175	2485418	-	TTCGATTCCCGGCTGGTGCATGAGCTGTGATGAAATTGGCTTCAGCGTTGGTTGGGTCCTTTGCATTCTTCTGATTTCTCAGATGTAATCGCCACACTCCTGAGCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTAATTCCTTGCATTTTAGTTTTGATTCGGTTTAAATCGAAAAAACGGAACAAAACGAAGATACACCACTTCCATATTCATTAGAGCTCTCAACCATACAAACTCTATTAAT	..........(..((((....(((((.(((((((..(((....(((...((.(((((...(((((....(((((....))))))))))..))).))..))...)))...................................((.(((((.((((((.(((.((((.........)))).))))))))).))))).))......)))..))))))).)))))...))))..).............	2485195	2485398	TGAGCTGTGATGAAATTGGCTTCAGCGTTGGTTGGGTCCTTTGCATTCTTCTGATTTCTCAGATGTAATCGCCACACTCCTGAGCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTAATTCCTTGCATTTTAGTTTTGATTCGGTTTAAATCGAAAAAACGGAACAAAACGAAGATACACCACTTCCATATTCATTAGAGCTCTCA	.(((((.(((((((..(((....(((...((.(((((...(((((....(((((....))))))))))..))).))..))...)))...................................((.(((((.((((((.(((.((((.........)))).))))))))).))))).))......)))..))))))).)))))...	Aly-miRN118b	2485378	2485398	TGAGCTGTGATGAAATTGGCT	Aly-miRN118b*	2485195	2485215	CCATATTCATTAGAGCTCTCA		3
Aly-MIRN118c	PmiREN000626	MIRN118	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_8	3060905	3061096	-	ACAAAACTGATGACCCACAGTTGATTTTATTTGGCTTTTAGACAATATTAACATATATTTAAAGAAACTAACAAAAAAGCACCAATGGTCTAGTGGTAGAATAGTACTCTGGCACTCCCCAGACCCGGGTACGATGCCCGATTGGTGCAATTGAGCTGTGATGAAATTGGCTTCAGCGTTGGTTGGGTCCTT	((..((((((((......(((((((((((((.(((((......(((((......)))))...................(((((((((((((((((.((((.......)))).))))....)))))((((((...))))))))))))))....)))))..)))))))))))))....))))))))..))....	3060925	3061076	TTGATTTTATTTGGCTTTTAGACAATATTAACATATATTTAAAGAAACTAACAAAAAAGCACCAATGGTCTAGTGGTAGAATAGTACTCTGGCACTCCCCAGACCCGGGTACGATGCCCGATTGGTGCAATTGAGCTGTGATGAAATTGGCT	(((((((((((.(((((......(((((......)))))...................(((((((((((((((((.((((.......)))).))))....)))))((((((...))))))))))))))....)))))..)))))))))))..	Aly-miRN118c	3060925	3060945	TGAGCTGTGATGAAATTGGCT	Aly-miRN118c*	3061056	3061076	TTGATTTTATTTGGCTTTTAG		3
Aly-MIRN119a	PmiREN000612	MIRN119	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1205701	1205955	-	GTGGAGAAAAAGCCCATGAATCAAAGTTGTAAATGTGACGGTATTAGGTTGATATCCCATTTCGACCATTTGATCAACCAAAGCTACAGCCTCGGATATCCTCTTACCATGACAGTACCCATTGAGAAGAGAAGAAAGCGTGACAATACTTGGCTCATAGCCGAGTTTCATCATCTTTCCAAGAACAGCTAAAGCAAGAGAGAGCTGAGACCGTCGGCAAAAACAGTTTATGAGAATATTGTAAGTAT	((((.(......)))))...((((((((((...(((((((((....((((((.........)))))).((((......)))).((.(((((((.......(((((..((((........)).))..)))))..(((((.((((....((((((((...))))))))....)))))))))........((....))....))).)))))))))))).)))...))))))).)))............... .-56.8	1205721	1205935	TCAAAGTTGTAAATGTGACGGTATTAGGTTGATATCCCATTTCGACCATTTGATCAACCAAAGCTACAGCCTCGGATATCCTCTTACCATGACAGTACCCATTGAGAAGAGAAGAAAGCGTGACAATACTTGGCTCATAGCCGAGTTTCATCATCTTTCCAAGAACAGCTAAAGCAAGAGAGAGCTGAGACCGTCGGCAAAAACAGTTTATGAGA	((((((((((...(((((((((....((((((.........)))))).((((......)))).((.(((((((.......(((((..((((........)).))..)))))..(((((.((((....((((((((...))))))))....)))))))))........((....))....))).)))))))))))).)))...))))))).)))..	Aly-miRN119a	1205915	1205935	TCAAAGTTGTAAATGTGACGG	Aly-miRN119a*	1205721	1205741	CGGCAAAAACAGTTTATGAGA		3
Aly-MIRN119b	PmiREN000614	MIRN119	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	5038962	5039056	+	GTGGAGAAAAAGACCATGAATCAAAGTTGTAAATGTGACGGTATTAGGTTGATATCCCATTTCGACCATTTGATCAAACAAAGCTACAGCATCGG	((((.........))))..((((((((((.(((((.(..(((((((...)))))))))))))))))..)))))).....................	5038982	5039036	TCAAAGTTGTAAATGTGACGGTATTAGGTTGATATCCCATTTCGACCATTTGATC	(((((((((.(((((.(..(((((((...)))))))))))))))))..)))))..	Aly-miRN119b	5038982	5039002	TCAAAGTTGTAAATGTGACGG	Aly-miRN119b*	5039016	5039036	TCCCATTTCGACCATTTGATC		3
Aly-MIRN119c	PmiREN000617	MIRN119	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	1394003	1394097	+	GTGGAGTAAAAGACCATGAATCAAAGTTGTAAATGTGACGGTATTAGGTTGATACCCCAGTACGACCATTTGATCAACCAAAGCTACAGCCTCGG	((((.........))))..((((((((((((..((.(..(((((((...)))))))))).))))))..)))))).....................	1394023	1394077	TCAAAGTTGTAAATGTGACGGTATTAGGTTGATACCCCAGTACGACCATTTGATC	(((((((((((..((.(..(((((((...)))))))))).))))))..)))))..	Aly-miRN119c	1394023	1394043	TCAAAGTTGTAAATGTGACGG	Aly-miRN119c*	1394057	1394077	CCCCAGTACGACCATTTGATC		3
Aly-MIRN120	PmiREN000613	MIRN120	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	3839525	3839651	+	CTCGTCGAGAGACTGAAAAGAGGGGGAATATGAAGGCTGTAAACTCTGAAACGTATCATATCGCTGCGGTGACTCTTCTGTTTCTCTAGCACTGCTGTTTCCTCTTTTTCTTTTTCTTGTGCCAGGA	(....(((((((..((((.(((((((((((.(.((((((........((((((.......((((....))))......))))))..)))).)).))))))))))))))))..))))))).)......	3839545	3839631	AGGGGGAATATGAAGGCTGTAAACTCTGAAACGTATCATATCGCTGCGGTGACTCTTCTGTTTCTCTAGCACTGCTGTTTCCTCTTT	((((((((((.(.((((((........((((((.......((((....))))......))))))..)))).)).)))))))))))..	Aly-miRN120	3839545	3839566	AGGGGGAATATGAAGGCTGTAA	Aly-miRN120*	3839611	3839631	TAGCACTGCTGTTTCCTCTTT		3
Aly-MIRN121	PmiREN000615	MIRN121	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	12657734	12657952	+	ACCTTTACTCCATCTCCAATGCCCAACTCTATAATTTCCCCTATTTTAAAGGAACTCTATTTTAGAATAGATTTATAGAGTAATCCATTGTCTCTCTCCTCTATTTTAGATTAAACTCTATTTTAGAGGGATACATTGAAGCAAAATCTCCTCTAAAATATAATTCCTCTAAAATAGAGGAAATTATAGAGTTGGGCATTGGAGATGCTCTTAAGGCTC	.((((.....(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((.(((((...(((((((((..((((((..((((..(.....)..)))).(((((((...((((......))))...))))))).............))))))..)))))))))...))))).)))))))).))))))))))))))))))))))))))))).....))))...	12657754	12657932	GCCCAACTCTATAATTTCCCCTATTTTAAAGGAACTCTATTTTAGAATAGATTTATAGAGTAATCCATTGTCTCTCTCCTCTATTTTAGATTAAACTCTATTTTAGAGGGATACATTGAAGCAAAATCTCCTCTAAAATATAATTCCTCTAAAATAGAGGAAATTATAGAGTTGGGCAT	(((((((((((((((((((.((((((((.(((((...(((((((((..((((((..((((..(.....)..)))).(((((((...((((......))))...))))))).............))))))..)))))))))...))))).)))))))).)))))))))))))))))))..	Aly-miRN121	12657912	12657932	GGAAATTATAGAGTTGGGCAT	Aly-miRN121*	12657754	12657774	GCCCAACTCTATAATTTCCCC		3
Aly-MIRN122	PmiREN000619	MIRN122	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_3	13712407	13712561	+	ATCAACATGATGAGGTGAGTTTTCTTTGTTTTACAGTGTTTAGGAACATATTTCCTGAACTTGTTATATTTGTTGCAGAGAGATAATGTTGACAATGGAGTGAATGAAAATGATAGAGCTGATGAACAAGAAGACAATGCTTAGCATGAGGTGAG	..(..((((.((((....((((((((.((((..(((((((((((((.....)))))))))((((((...(((((.......)))))...))))))......................))))..))))))))))))....)))).))))..)....	13712427	13712541	TTTCTTTGTTTTACAGTGTTTAGGAACATATTTCCTGAACTTGTTATATTTGTTGCAGAGAGATAATGTTGACAATGGAGTGAATGAAAATGATAGAGCTGATGAACAAGAAGAC	((((((.((((..(((((((((((((.....)))))))))((((((...(((((.......)))))...))))))......................))))..))))))))))..	Aly-miRN122	13712521	13712541	AGAGCTGATGAACAAGAAGAC	Aly-miRN122*	13712427	13712447	TTTCTTTGTTTTACAGTGTTT		3
Aly-MIRN123a	PmiREN000620	MIRN123	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	18166631	18166757	+	AAAAAGAAGAGGGTAGAAATATCTGCCGACTCATCCATCCAAACACTCGTGGTAGAGAAACGATCAATTTTAAACCGCAGTGACTGTATGAATGATGCGGGAGATATTTTTGATCCTTCTTTATCTG	...((((((.((.(((((((((((.(((..((((.(((.((..((((.(((((..((((........))))..)))))))))..)).))).))))..))).))))))))))).))))))))......	18166651	18166737	ATCTGCCGACTCATCCATCCAAACACTCGTGGTAGAGAAACGATCAATTTTAAACCGCAGTGACTGTATGAATGATGCGGGAGATAT	((((.(((..((((.(((.((..((((.(((((..((((........))))..)))))))))..)).))).))))..))).))))..	Aly-miRN123a	18166717	18166737	TATGAATGATGCGGGAGATAT	Aly-miRN123a*	18166651	18166671	ATCTGCCGACTCATCCATCCA		3
Aly-MIRN123b	PmiREN000621	MIRN123	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_4	19899206	19899332	+	AAAAAGAAGAGGGTAGAAATATCTGCCGACTCATCCATCCAAACACTCGTGGTAGAGAAACGATCAATTTTAAACCGCAGTGACTGTATGAATGATGCGGGAGATATTTTTGATCCTTCTTTATCTG	...((((((.((.(((((((((((.(((..((((.(((.((..((((.(((((..((((........))))..)))))))))..)).))).))))..))).))))))))))).))))))))......	19899226	19899312	ATCTGCCGACTCATCCATCCAAACACTCGTGGTAGAGAAACGATCAATTTTAAACCGCAGTGACTGTATGAATGATGCGGGAGATAT	((((.(((..((((.(((.((..((((.(((((..((((........))))..)))))))))..)).))).))))..))).))))..	Aly-miRN123b	19899292	19899312	TATGAATGATGCGGGAGATAT	Aly-miRN123b*	19899226	19899246	ATCTGCCGACTCATCCATCCA		3
Aly-MIRN124	PmiREN000623	MIRN124	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_7	15100019	15100197	+	CAGCGGTGGTTTTCAATTTTTCGAGGCAACCGAGAAGCTGGGTATCTGCGATTCTGGAATCGTAAAAATGGATCGGACCATGTTGATGGTCGATGGCAAGGTGATCAGAGCCTTAGATTCGGCAGACTCAATATACCCAGCTTATTAGTTGCCTCGGAAAATCGAAAACCATTGCTGGA	((((((((((((((.(((((((((((((((.((.(((((((((((....((.(((((((((..........((((.(((((....)))))))))...(((((.......))))).)))))..)))).))...))))))))))).)).))))))))))))))).))))))))))))))..	15100039	15100177	TCGAGGCAACCGAGAAGCTGGGTATCTGCGATTCTGGAATCGTAAAAATGGATCGGACCATGTTGATGGTCGATGGCAAGGTGATCAGAGCCTTAGATTCGGCAGACTCAATATACCCAGCTTATTAGTTGCCTCGGAA	((((((((((.((.(((((((((((....((.(((((((((..........((((.(((((....)))))))))...(((((.......))))).)))))..)))).))...))))))))))).)).))))))))))..	Aly-miRN124	15100039	15100059	TCGAGGCAACCGAGAAGCTGG	Aly-miRN124*	15100157	15100177	AGCTTATTAGTTGCCTCGGAA		3
Aly-MIRN125a	PmiREN000624	MIRN125	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_88	3640	3829	+	TGGAGCAATGTGATGACAGTTTACTCCATAGTTCGTCAGGATGGTAGATTGATATGAAAAGATCTTTGTGCGTAGTAGCTCATGAAGCTTGTTTCTGCTGATGAGTTGATGAACATCTTTGGGTACGTCTGCTTCAAAGTCATAGTAGCTCTTCTTGGATTCGGAGGAACTGGCCATCAT	.........((((((.((((((.((((..((((((..((((.(.((...((((.((((.((((....((((.(((((((((((..(((........))).))))))))..........))).))))))))..))))..))))...)).)))))..)))))).))))))))))..))))))	3660	3809	TTACTCCATAGTTCGTCAGGATGGTAGATTGATATGAAAAGATCTTTGTGCGTAGTAGCTCATGAAGCTTGTTTCTGCTGATGAGTTGATGAACATCTTTGGGTACGTCTGCTTCAAAGTCATAGTAGCTCTTCTTGGATTCGGAGGAAC	((.((((..((((((..((((.(.((...((((.((((.((((....((((.(((((((((((..(((........))).))))))))..........))).))))))))..))))..))))...)).)))))..)))))).))))))..	Aly-miRN125a	3660	3681	TTACTCCATAGTTCGTCAGGAT	Aly-miRN125a*	3789	3809	TCTTCTTGGATTCGGAGGAAC		3
Aly-MIRN125b	PmiREN000625	MIRN125	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_88	9236	9425	-	TGGAGCAATGTGATGACAGTTTACTCCATAGTTCGTCAGGATGGTAGATTGATATGAAAAGATCTTTGTGCGTAGTAGCTCATGAAGCTTGTTTCTGCTGATGAGTTGATGAACATCTTTGGGTACGTCTGCTTCAAAGTCATAGTAGCTCTTCTTGGATTCGGAGGAACTGGCCATCAT	.........((((((.((((((.((((..((((((..((((.(.((...((((.((((.((((....((((.(((((((((((..(((........))).))))))))..........))).))))))))..))))..))))...)).)))))..)))))).))))))))))..))))))	9256	9405	TTACTCCATAGTTCGTCAGGATGGTAGATTGATATGAAAAGATCTTTGTGCGTAGTAGCTCATGAAGCTTGTTTCTGCTGATGAGTTGATGAACATCTTTGGGTACGTCTGCTTCAAAGTCATAGTAGCTCTTCTTGGATTCGGAGGAAC	((.((((..((((((..((((.(.((...((((.((((.((((....((((.(((((((((((..(((........))).))))))))..........))).))))))))..))))..))))...)).)))))..)))))).))))))..	Aly-miRN125b	9384	9405	TTACTCCATAGTTCGTCAGGAT	Aly-miRN125b*	9256	9276	TCTTCTTGGATTCGGAGGAAC		3
Aly-MIRN126	PmiREN000628	MIRN126	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	701065	701274	+	ATCACTTATACCTCAATGATCGATGGATTTTGCAAACTGAATCGTCTAGATGATGCAAAGCGTATGTTTGATTCGATAGCTAGCAAGGGCTGCTCTCCGGACGTAGTTACTTGTAGTACCCTAATTAATGGCTATTGTAAGGCTAAAAGGGTTGACGATGGAATGGAGATTTTCTGCGAGATGCATCGAAGAGGAATAGTTGCTACTACA	..........((((.....((((((.((((((((....(((((.((((...((..((((.......))))..))....((((.((((((((((((....)).)))))).))))))))..((........))(((((((..((((.....)))).)))))))..)))))))))..)))))))).)))))).)))).........(.....)	701085	701254	CGATGGATTTTGCAAACTGAATCGTCTAGATGATGCAAAGCGTATGTTTGATTCGATAGCTAGCAAGGGCTGCTCTCCGGACGTAGTTACTTGTAGTACCCTAATTAATGGCTATTGTAAGGCTAAAAGGGTTGACGATGGAATGGAGATTTTCTGCGAGATGCATCGAA	(((((.((((((((....(((((.((((...((..((((.......))))..))....((((.((((((((((((....)).)))))).))))))))..((........))(((((((..((((.....)))).)))))))..)))))))))..)))))))).)))))..	Aly-miRN126	701085	701105	CGATGGATTTTGCAAACTGAA	Aly-miRN126*	701234	701254	TTTTCTGCGAGATGCATCGAA		3
Aly-MIRN127	PmiREN000630	MIRN127	Arabidopsis lyrata	Aly-scaffold_2	12500875	12500997	-	TCTCTGTAATAACGTCGTTTTGCAAAACTGCAATGGTCCTGAGCCGATAAGCCTCTAATGAAATTATAGACTCATCGGCTCAGGACCATTGCGGTTGTGCAAAACGGTGTTATTGCCGAGAAG	((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.((.((.((((...)))).)).)).))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))).))))..	12500895	12500977	TGCAAAACTGCAATGGTCCTGAGCCGATAAGCCTCTAATGAAATTATAGACTCATCGGCTCAGGACCATTGCGGTTGTGCAAA	((((.(((((((((((((((((((((((.((.((.((((...)))).)).)).))))))))))))))))))))))).))))..	Aly-miRN127	12500956	12500977	TGCAAAACTGCAATGGTCCTGA	Aly-miRN127*	12500895	12500915	GGACCATTGCGGTTGTGCAAA		3