miRNA_locus_ID miRNA_locus_accession miRNA_family Organism Chromosome Start End Strand Stem_loop_with_extended_20bp_seq Stem_loop_with_extended_20bp_structure Stem_loop_start Stem_loop_end Stem_loop_seq Stem_loop_seq_structure mature_miRNA mature_start mature_end mature_seq star_miRNA star_start star_end star_seq Confidence_level Atr-MIR156a PmiREN000189 MIR156 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00020 1207427 1207517 - CGATGAGCCTCTGCCGTTTGTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGGTGGCGATGGGCTTCCACCTTCTGTGACAGAAGAGAGACGAGAGAATTT ................(((((.(((((((.(.(..(((.((........)).)))..).)))))))).)))))..(((..(....)..))) 1207447 1207497 TGACAGAAGAGAGAGAGCACAGGTGGCGATGGGCTTCCACCTTCTGTGACA (.(((((((.(.(..(((.((........)).)))..).)))))))).).. Atr-miR156a 1207478 1207497 TGACAGAAGAGAGAGAGCAC Atr-miR156a* 1207447 1207467 GGGCTTCCACCTTCTGTGACA 3 Atr-MIR156b PmiREN000190 MIR156 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00052 3292169 3292292 - GTATGATAGAGAAGAGGAGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACATATGGCCTTTCTTGCACCGAGTCGATGCTTGAAGTTATGCGTGCTTACTTTCTATCTGTCACTTCGCCACCAACACCACACAT ................((((((((((((((((((((((((.((((((..(((..(((.((...)).)))..))))))))).))))))))))))).))))))))))).................. 3292189 3292272 TGACAGAAGAGAGTGAGCACATATGGCCTTTCTTGCACCGAGTCGATGCTTGAAGTTATGCGTGCTTACTTTCTATCTGTCACT ((((((((((((((((((((.((((((..(((..(((.((...)).)))..))))))))).))))))))))))).))))))).. Atr-miR156b 3292253 3292272 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Atr-miR156b* 3292189 3292209 GCTTACTTTCTATCTGTCACT 3 Atr-MIR156c PmiREN000191 MIR156 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00065 3401555 3401676 - AAGGGGGTAGTGGGTTATGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGCCAATTGTATAACCGTATGCCGCTGTCTGTGCGTGCTCACTCCTCTTCTTGTCAGCTTTATCATTTCCCGCTATTG ..................((((((((((((((((((((((.(((((.((...(((((....)))))...)).))))).))))))))).)))))).))))))).................... 3401575 3401656 TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGCCAATTGTATAACCGTATGCCGCTGTCTGTGCGTGCTCACTCCTCTTCTTGTCAGC ((((((((((((((((((((.(((((.((...(((((....)))))...)).))))).))))))))).)))))).))))).. Atr-miR156c 3401637 3401656 TGACAGAAGAGAGTGAGCAC Atr-miR156c* 3401575 3401595 CTCACTCCTCTTCTTGTCAGC 3 Atr-MIR157a PmiREN000192 MIR157 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00044 4041321 4041446 + AGAGAGGGGGTCTGGTGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACATAAAGTAACGTGCAGTGGGCGTTTGCATTTTATTTTGTATGTGCTCTCTAGCCTTCTGTCATCACCTGCTCACCATTCCCACCC .....(((((..(((((.((.(((((((((.(((((((((((((((((((.((((((.......)))))).))))))..)))))))))))))..))))))))).))......)))))..))).)). 4041341 4041426 TTGACAGAAGATAGAGAGCACATAAAGTAACGTGCAGTGGGCGTTTGCATTTTATTTTGTATGTGCTCTCTAGCCTTCTGTCATCA .(((((((((.(((((((((((((((((((.((((((.......)))))).))))))..)))))))))))))..)))))))))... Atr-miR157a 4041341 4041361 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Atr-miR157a* 4041406 4041426 CTCTCTAGCCTTCTGTCATCA 3 Atr-MIR157b PmiREN000193 MIR157 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00061 4133450 4133577 + CTTGAAAGTAGAGTTGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAAAACCAACACAAGCAATAGGCTTTCATGCTTCTGGAGGATATGTGCTCTCTATACTTCTGCCACCATGCCCTTAGAAGCACTCTAT ...............(((((.((.((((((((((((((((((...((..((.(((((...........))))).))..))...)))))))))))).)))))).)).)).))).......(.......) 4133470 4133557 TTGACAGAAGATAGAGAGCACAAAACCAACACAAGCAATAGGCTTTCATGCTTCTGGAGGATATGTGCTCTCTATACTTCTGCCACCA .((.((((((((((((((((((...((..((.(((((...........))))).))..))...)))))))))))).)))))).))... Atr-miR157b 4133470 4133490 TTGACAGAAGATAGAGAGCAC Atr-miR157b* 4133537 4133557 CTCTCTATACTTCTGCCACCA 3 Atr-MIR159 PmiREN000194 MIR159 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00105 1236880 1237093 - TTTGTAGGGTTGTTGACATGGAGCTCCTTGAGGTCCAATCCAGGTTCTTACTTAGGTAAAAGCAGCTGCTAGTTCATGGATCCCACTGTGTTATTTCCAAATATAAGAGAATGGAGATATAATGGTGGTTTGCATGACCAAGGAGCTGCATTCTTGCCTTGTGAGATTCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTATGTGTTCTCCCCTTCCAAGC ((((.((((..(...((((((((((((((..(((((((.(.(((.((((((..((((((((((((((.((.(.(((((.(..(((((((..((((((((............))))))))..)))))))..).))))).).)).)))))).)).)))))).))))))..))).).)))))))..))))))))))))))...)..))))..)))). 1236900 1237073 GAGCTCCTTGAGGTCCAATCCAGGTTCTTACTTAGGTAAAAGCAGCTGCTAGTTCATGGATCCCACTGTGTTATTTCCAAATATAAGAGAATGGAGATATAATGGTGGTTTGCATGACCAAGGAGCTGCATTCTTGCCTTGTGAGATTCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA (((((((((..(((((((.(.(((.((((((..((((((((((((((.((.(.(((((.(..(((((((..((((((((............))))))))..)))))))..).))))).).)).)))))).)).)))))).))))))..))).).)))))))..))))))))).. 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Atr-miR164b 3521029 3521049 TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA Atr-miR164b* 3520986 3521006 CACGTGCTCCCCTTCTCCAAC 3 Atr-MIR165 PmiREN000199 MIR165 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00071 3736379 3736489 - GCTCGTGTGAGTGTTTTGGGGGGAAGGGTTGTCTGGATCGAGGCCGCAGTAGAGAGAGATGACTGTGGCTTCGGACCAGGCTTCGTCCCTCTCAAATTTCACACGTGCGAA ((.((((((((...((((((((((..((..((((((.(((((((((((((...........))))))))))))).)))))).)).)))).)))))).)))))))).))... 3736399 3736469 GGGAAGGGTTGTCTGGATCGAGGCCGCAGTAGAGAGAGATGACTGTGGCTTCGGACCAGGCTTCGTCCCTC ((((..((..((((((.(((((((((((((...........))))))))))))).)))))).)).)))).. 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Atr-miR171a 2643257 2643277 TGATTGAGCCGCGCCAATATC Atr-miR171a* 2643312 2643332 TGTTGGACCGGTTCAATCAGA 3 Atr-MIR171b PmiREN000215 MIR171 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00060 3430300 3430420 + AAGGGGACTCGGTTCGCGTGCGGTGTTGGCACGGTTCAATCTGACTGCTGCCCTGCTAGTTGTGCAGTATGGTGGTGCGATTGAGCCGTGCCAATATCACACTCAATCAGCCATCGAATCA .((....)).((((.(.(((.((((((((((((((((((((..((..(((..((((.......))))..)))..))..)))))))))))))))))))).))).)))))............. 3430320 3430400 CGGTGTTGGCACGGTTCAATCTGACTGCTGCCCTGCTAGTTGTGCAGTATGGTGGTGCGATTGAGCCGTGCCAATATCACA .((((((((((((((((((((..((..(((..((((.......))))..)))..))..))))))))))))))))))))... Atr-miR171b 3430380 3430400 TTGAGCCGTGCCAATATCACA Atr-miR171b* 3430320 3430340 CGGTGTTGGCACGGTTCAATC 3 Atr-MIR171c PmiREN000216 MIR171 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00088 670598 670720 - CATTGAAGGAGTTCTTGCGACATTGGCCCGGTTCGATCAGAGATGAAAATGCCAAGGAAAGAAATGGATGTTTGGTTTACTCTGATTGAGCCGCGCCAATATCAAAGAGCTTCTCAATCCTTT .(((((.(((((((((..((.((((((.((((((((((((((.(((....((((((.(.(....)...).))))))))))))))))))))))).)))))).)).))))))))))))))..... 670618 670700 CATTGGCCCGGTTCGATCAGAGATGAAAATGCCAAGGAAAGAAATGGATGTTTGGTTTACTCTGATTGAGCCGCGCCAATATC .((((((.((((((((((((((.(((....((((((.(.(....)...).))))))))))))))))))))))).))))))... Atr-miR171c 670618 670638 TGATTGAGCCGCGCCAATATC Atr-miR171c* 670680 670700 CATTGGCCCGGTTCGATCAGA 3 Atr-MIR171d PmiREN000217 MIR171 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00003 7402112 7402221 + GCGCATGATTTTGGGTACGGTGTTGGCACGGTTCAATTCAACCACTGCACTGCTACAAGCATGATAGTGTGATTGAGCCGTGCCAATATCATGCGCAACTAGTCATGGGG .(.((((((((((.(((.(((((((((((((((((((.((..(((((((.(((.....))))).)))))))))))))))))))))))))).))).)))..))))))).). 7402132 7402201 TGTTGGCACGGTTCAATTCAACCACTGCACTGCTACAAGCATGATAGTGTGATTGAGCCGTGCCAATATC (((((((((((((((((.((..(((((((.(((.....))))).)))))))))))))))))))))))).. Atr-miR171d 7402181 7402201 TGATTGAGCCGTGCCAATATC Atr-miR171d* 7402132 7402152 TGTTGGCACGGTTCAATTCAA 3 Atr-MIR171e PmiREN000218 MIR171 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00046 1289665 1289791 + AATTCAGGGGAGAGATGTAGCGATGTTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGCTTTTACGTCGGAAAAATCCGTAGAAACGATCTCAGGTTGAGCCGCGCCAATATCACTTCTCCCTCTTATAACTTCTC .....(((((.((((...((.((((((((((.(((((((((.((.((((.((((((...(((....))))))))).)).)))).))))))))).)))))))))).)))))))))))........... 1289685 1289771 CGATGTTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGCTTTTACGTCGGAAAAATCCGTAGAAACGATCTCAGGTTGAGCCGCGCCAATATCACT .((((((((((.(((((((((.((.((((.((((((...(((....))))))))).)).)))).))))))))).))))))))))... Atr-miR171e 1289751 1289771 TTGAGCCGCGCCAATATCACT Atr-miR171e* 1289685 1289705 CGATGTTGGTGAGGTTCAATC 3 Atr-MIR171f PmiREN000219 MIR171 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00013 1859857 1859977 + TTAACATGGAACTCGAATCGTGGTATTGGAACGGCTCAATCAGATGAGAAGTCCTTAGAAGAGCAGGTCTTATAATCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACGTTGCTTCGCTGCCTCATTAG ..............(...(((((((((((..((((((((((.(((...(((.(((.........))).)))...))).))))))))))..)))))))))))...)..........(....) 1859877 1859957 TGGTATTGGAACGGCTCAATCAGATGAGAAGTCCTTAGAAGAGCAGGTCTTATAATCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACG (((((((((..((((((((((.(((...(((.(((.........))).)))...))).))))))))))..))))))))).. Atr-miR171f 1859877 1859897 TGGTATTGGAACGGCTCAATC Atr-miR171f* 1859937 1859957 TTGAGCCGCGCCAATATCACG 3 Atr-MIR172 PmiREN000220 MIR172 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00012 6005575 6005740 + TCAGTCAGTGTTTGCTGGTGTAGCATCATCAAGATTCACATCTTGTAAGAGATCCCTTTGAATCGGTGGGATCACACTTCACTACATAAGATCACGATTTAGAGAGGGAAAGCTGACCATAAGATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAGTGACTTTGT ...........((((((((((((((((((((((((((.((((((((.((...(((((((((((((....((((................)))).)))))))..))))))...))....)))))))).))))))))))))))))))))))))))............. 6005595 6005720 TAGCATCATCAAGATTCACATCTTGTAAGAGATCCCTTTGAATCGGTGGGATCACACTTCACTACATAAGATCACGATTTAGAGAGGGAAAGCTGACCATAAGATGGGAATCTTGATGATGCTGCA (((((((((((((((((.((((((((.((...(((((((((((((....((((................)))).)))))))..))))))...))....)))))))).))))))))))))))))).. Atr-miR172 6005701 6005720 GGAATCTTGATGATGCTGCA Atr-miR172* 6005595 6005615 TAGCATCATCAAGATTCACAT 3 Atr-MIR319a PmiREN000223 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00077 2616695 2616910 + AAAATTGGGACTTGCGGAGGGAGCTCTCTTTAGTCCACCTATGGTTGGTGTCTAGGGGTCGAATTATCTGCCGACTCATTCATTCAAATAATTGGTAGAAAGGCCGTGATTTTTCTCTCTACTCTTTAAATTTGTGAATGATGCGGGAGATAAATTTCACCCTTGCCTCACCATTCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCTCTCTCTCTCATCTCTCA .....(((((.....((((((((((((((((((((((...(((((.(((....((((((.(((((((((.(((..((((((((.....(((..((((((.(((..........))).))))))..))).....))))))))..))).))))))..))))))))))))..)))))...)))))))))))))))))))))).....)))))....... 2616715 2616890 GAGCTCTCTTTAGTCCACCTATGGTTGGTGTCTAGGGGTCGAATTATCTGCCGACTCATTCATTCAAATAATTGGTAGAAAGGCCGTGATTTTTCTCTCTACTCTTTAAATTTGTGAATGATGCGGGAGATAAATTTCACCCTTGCCTCACCATTCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC (((((((((((((((((...(((((.(((....((((((.(((((((((.(((..((((((((.....(((..((((((.(((..........))).))))))..))).....))))))))..))).))))))..))))))))))))..)))))...))))))))))))))))).. Atr-miR319a 2616871 2616890 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Atr-miR319a* 2616715 2616735 GAGCTCTCTTTAGTCCACCTA 3 Atr-MIR319b PmiREN000224 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00081 2902535 2902658 + ATCGAAAATTGCAGAAATGGGGGCTCCTTTGAGGACAAAGAAAGCATTTCGGATCATCTTTTCTCTCAGTGAAGCAGCCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAATTCTTCTCTTTTCATCCC ...(((((..(.((((.(((((((((((((.((..(((((...((.(((((((........)))......))))..))....)))))..)).))))))))))))).)))).)..)))))..... 2902555 2902638 GGGCTCCTTTGAGGACAAAGAAAGCATTTCGGATCATCTTTTCTCTCAGTGAAGCAGCCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT ((((((((((.((..(((((...((.(((((((........)))......))))..))....)))))..)).)))))))))).. Atr-miR319b 2902618 2902638 TTTGGACTGAAGGGAGCTCCT Atr-miR319b* 2902555 2902575 GGGCTCCTTTGAGGACAAAGA 3 Atr-MIR319c PmiREN000225 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00105 1160443 1160654 + TTGTGGGGTTTGGGGGGAAGGAGCTCTCTTCAGTCCAGTCTAGGATGGCAGTTCGATCGAATGCTGCTGCCGGGTCCTTCTCTTATAATGCCTTTGATTTTTGTTTGAAAAGGAAACGAAGGCTTTGTGATAGAAGTACGCGGGAGCTGAATCTGGTTGACCCCTTCTTGCCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTCTTCTTTCTCCTCCTTCAA ............((((((.(((((((((((((((((((..(((((.((....(((((((.((...(((.(((.((.(((((.((((((.(((((((.(((((........))))).))))))).)))))).))))).)).))).)))...)).)))))))..)).)))))..))))))))))))))))))).)))))).............. 1160463 1160634 GAGCTCTCTTCAGTCCAGTCTAGGATGGCAGTTCGATCGAATGCTGCTGCCGGGTCCTTCTCTTATAATGCCTTTGATTTTTGTTTGAAAAGGAAACGAAGGCTTTGTGATAGAAGTACGCGGGAGCTGAATCTGGTTGACCCCTTCTTGCCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC ((((((((((((((((((..(((((.((....(((((((.((...(((.(((.((.(((((.((((((.(((((((.(((((........))))).))))))).)))))).))))).)).))).)))...)).)))))))..)).)))))..)))))))))))))))))).. Atr-miR319c 1160615 1160634 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Atr-miR319c* 1160463 1160483 GAGCTCTCTTCAGTCCAGTCT 3 Atr-MIR319d PmiREN000226 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00188 77611 77733 - AAGGAAAAATGCAAAAATGGGAGCTCCTTTGAGGACAAAGAAAGCACTTTGGATCGTCTTTTTGCTCATTGAAGAGTCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAATTCTTCTCTTTTTATCCT .................(((((((((((((.((..((((...........((((.(.((((((.......)))))).)))))))))..)).)))))))))))))................... 77631 77713 GAGCTCCTTTGAGGACAAAGAAAGCACTTTGGATCGTCTTTTTGCTCATTGAAGAGTCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT ((((((((((.((..((((...........((((.(.((((((.......)))))).)))))))))..)).)))))))))).. 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Atr-miR319e 805915 805934 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Atr-miR319e* 805767 805787 GAGCTCTCTTCAGTCCACTCA 3 Atr-MIR319f PmiREN000228 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00104 2492508 2492631 - TTGGAAAATTGAAAAAATGGGAGCCCTTTTGAGGACAAAGAAAGCATTTCGAATCGTCTTTTTGCTCATTGAAGCAGCCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCCAATTCTTCTCTTTTCTTCCC ..((((((..(((.((.(((((((((((((.((..(((((...((.((((((...((......))...))))))..))....)))))..)))))))).))))))).)).)))..)))))).... 2492528 2492611 GAGCCCTTTTGAGGACAAAGAAAGCATTTCGAATCGTCTTTTTGCTCATTGAAGCAGCCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCC ((((((((((.((..(((((...((.((((((...((......))...))))))..))....)))))..)))))))).)))).. Atr-miR319f 2492528 2492547 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Atr-miR319f* 2492591 2492611 GAGCCCTTTTGAGGACAAAGA 3 Atr-MIR319g PmiREN000229 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00188 232640 232762 + AAGGAAAATTGCATAAATGGGAGCTCTTTTGAGGACAAAGAAAGCACTTTGGATCGTCTTTTCGCTCATTGAAGAGTCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAATTTTTCTCTGTTCATCCT .................(((((((((((((.((..((((...........((((.(.(((((((.....))))))).)))))))))..)).)))))))))))))................... 232660 232742 GAGCTCTTTTGAGGACAAAGAAAGCACTTTGGATCGTCTTTTCGCTCATTGAAGAGTCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT ((((((((((.((..((((...........((((.(.(((((((.....))))))).)))))))))..)).)))))))))).. Atr-miR319g 232722 232742 TTTGGACTGAAGGGAGCTCCT Atr-miR319g* 232660 232680 GAGCTCTTTTGAGGACAAAGA 3 Atr-MIR319h PmiREN000230 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00188 92748 92870 - AAGGAAAAATGCAAAAATGGGAGCTCCTTTGAGGACAAAGAAAGCACTTTGGATCGTCTTTTTGCTCATTGAAGAGTCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCTAATTCTTCTCTTTTTATCCT .................(((((((((((((.((..((((...........((((.(.((((((.......)))))).)))))))))..)).)))))))))))))................... 92768 92850 GAGCTCCTTTGAGGACAAAGAAAGCACTTTGGATCGTCTTTTTGCTCATTGAAGAGTCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCT ((((((((((.((..((((...........((((.(.((((((.......)))))).)))))))))..)).)))))))))).. Atr-miR319h 92768 92788 TTTGGACTGAAGGGAGCTCCT Atr-miR319h* 92830 92850 GAGCTCCTTTGAGGACAAAGA 3 Atr-MIR319i PmiREN000231 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00188 440124 440247 - TTGGAAAATTGAAAAAATGGGGGCCCTTTTGAGGACAAAGAAAGCATTTCGAATCGTCTTTTTGCGCATTGAAGCAGCCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCCAATTCTTATCTTTTCTTCCC .................(((((((((((((.((..(((((...((.((((((..(((......)))..))))))..))....)))))..)))))))).)))))))................... 440144 440227 GGGCCCTTTTGAGGACAAAGAAAGCATTTCGAATCGTCTTTTTGCGCATTGAAGCAGCCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCC ((((((((((.((..(((((...((.((((((..(((......)))..))))))..))....)))))..)))))))).)))).. Atr-miR319i 440144 440163 TTGGACTGAAGGGAGCTCCC Atr-miR319i* 440207 440227 GGGCCCTTTTGAGGACAAAGA 3 Atr-MIR319j PmiREN000232 MIR319 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00701 6426 6549 - TTGGAAAATTGAAAAAATGGGAGCCCTTTTGAGGACAAAGAAAGCATTTCGAATCGTCTTTTTGCTCATTGAAGCAGCCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCCAATTCTTCTCTTTTCTTCCC ..((((((..(((.((.(((((((((((((.((..(((((...((.((((((...((......))...))))))..))....)))))..)))))))).))))))).)).)))..)))))).... 6446 6529 GAGCCCTTTTGAGGACAAAGAAAGCATTTCGAATCGTCTTTTTGCTCATTGAAGCAGCCATCCTTTGGACTGAAGGGAGCTCCC ((((((((((.((..(((((...((.((((((...((......))...))))))..))....)))))..)))))))).)))).. 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Atr-miR393b 3201601 3201621 TCATGCGATCCCTTTGGATAC Atr-miR393b* 3201490 3201510 ATCCAAAGGGATCGCATTGAT 3 Atr-MIR394 PmiREN000235 MIR394 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00001 3120995 3121123 + AGGGTTTCTTGCAGAGATTGTTGGCATTCTGTCCACCTCCTCCCTCTCTCTAAAAAATGAGAGTTTTTCGATTTTAATGCATCGTGAGGAGGTGGGCATCCTGCCAACCACACTCTGTGGGCTACTCTC (((((..((..(((((...(((((((...(((((((((((((...(((((........))))).....((((........)))).)))))))))))))...)))))))....)))))..))..))))). 3121015 3121103 TTGGCATTCTGTCCACCTCCTCCCTCTCTCTAAAAAATGAGAGTTTTTCGATTTTAATGCATCGTGAGGAGGTGGGCATCCTGCCAACC ((((((...(((((((((((((...(((((........))))).....((((........)))).)))))))))))))...)))))).. 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Atr-miR395b 807156 807176 CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC Atr-miR395b* 807017 807037 GTTCCCCCTACACTTCAGCGA 3 Atr-MIR396a PmiREN000251 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00013 1544511 1544646 + ATTTGATCTTTTCCATGCTCTCCACAGGCTTTCTTGAACATGCTGCTCAAACCCGTCTTCTGCCATGTTCTTGGAGAAGCAAAGTTGAGTGACAAGTTTAAGAATGCCTGGGGAAAACATGGAAATGAATTACAAG (((.(((((((((((((...(((.(((((.(((((((((.((.(((((((....(.(((((.(((......)))))))))....))))))).)).))))))))).))))).)))...))))))).........))) 1544531 1544626 TCCACAGGCTTTCTTGAACATGCTGCTCAAACCCGTCTTCTGCCATGTTCTTGGAGAAGCAAAGTTGAGTGACAAGTTTAAGAATGCCTGGGGAAA (((.(((((.(((((((((.((.(((((((....(.(((((.(((......)))))))))....))))))).)).))))))))).))))).))).. 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Atr-miR396b 2855224 2855244 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Atr-miR396b* 2855300 2855320 GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA 3 Atr-MIR396c PmiREN000240 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00046 1545684 1545791 + TTGGAAGTCCTGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTAGTCCTTGAATGGCATCTAGAAGTTCAAGGAAGTTGTGGGAAACCATGGCAATAAGGATTTTT ...((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.....((......)).....))))))))))))))))))))))))).))))))....)))).)))) 1545704 1545771 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTAGTCCTTGAATGGCATCTAGAAGTTCAAGGAAGTTGTGGGAAA (((((((((((((((((((((((.....((......)).....))))))))))))))))))))))).. Atr-miR396c 1545704 1545724 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Atr-miR396c* 1545751 1545771 GTTCAAGGAAGTTGTGGGAAA 3 Atr-MIR396d PmiREN000241 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00090 1850429 1850538 - CAACTGATGGCTTCATGCTTCTCCACGGCTTTCTTGAACTTAGTTTGAATAAGGTGAGCCTTCTTACAAGATCAAGAAAGCTGCGGAAAAACATAGATCCACTCAAAATT .....................(((.((((((((((((.(((.((..((...(((....)))))..))))).)))))))))))).)))....................... 1850449 1850518 CTCCACGGCTTTCTTGAACTTAGTTTGAATAAGGTGAGCCTTCTTACAAGATCAAGAAAGCTGCGGAAAA .(((.((((((((((((.(((.((..((...(((....)))))..))))).)))))))))))).)))... Atr-miR396d 1850498 1850518 CTCCACGGCTTTCTTGAACTT Atr-miR396d* 1850449 1850469 GATCAAGAAAGCTGCGGAAAA 3 Atr-MIR396e PmiREN000242 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold02939 2897 3036 + TCATGATCGTTTCCATATTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTGTTACTCAACAATGCATCTCCGAGAACCAACTCGAGGAGGGCCTGTCTGAATACCATGTTCAAGAAAGCCTGTGGAAAGCATGAAAACATCAAATCTTC ...((((.((((.(((..(((((((((((((((((((((.((.((.((((((..((.(((((..((......))..))))))).))).))).)).)).))))))))))).)))))))))).))).))))))))....... 2917 3016 TTCCACAGCTTTCTTGAACTTGTTACTCAACAATGCATCTCCGAGAACCAACTCGAGGAGGGCCTGTCTGAATACCATGTTCAAGAAAGCCTGTGGAAAG (((((((((((((((((((.((.((.((((((..((.(((((..((......))..))))))).))).))).)).)).))))))))))).)))))))).. Atr-miR396e 2917 2937 TTCCACAGCTTTCTTGAACTT Atr-miR396e* 2996 3016 TTCAAGAAAGCCTGTGGAAAG 3 Atr-MIR396f PmiREN000238 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00013 1778378 1778512 - GATTTGATGTGTTCATGCTTTCCACAGGGTTTCTTGAACATGCTGCTCGAACCCGTCTTCTTCCATGCTATGGAGAAGCAAAGTTGAGTAACAAGTTTAAGAATGCCTGCGGAAATCATAGAATGAATCATAACG .......((((((((((.(((((.((((..(((((((((.((.(((((((....(.(((((.((((...))))))))))....))))))).)).)))))))))..)))).))))).))).))))........))) 1778398 1778492 TCCACAGGGTTTCTTGAACATGCTGCTCGAACCCGTCTTCTTCCATGCTATGGAGAAGCAAAGTTGAGTAACAAGTTTAAGAATGCCTGCGGAAA (((.((((..(((((((((.((.(((((((....(.(((((.((((...))))))))))....))))))).)).)))))))))..)))).))).. Atr-miR396f 1778472 1778492 TCCACAGGGTTTCTTGAACAT Atr-miR396f* 1778398 1778418 GTTTAAGAATGCCTGCGGAAA 3 Atr-MIR396g PmiREN000243 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00013 1238077 1238213 - GGTTTGATGTTTTCATGCTTTTCACAGGCTTTCTTGAACATGGTATTCAGACGGCCCTCTTCGAGTTAGCTATCGGAGATGCAATGTTGAGTAACAGGTTCAAGAAATCTGTGGAGAAACATGGAAACAATCATGAC (...(((((((((((((.((((((((((.((((((((((.((.(((((((...((..(((((((........))))))).))....))))))).)).))))))))))))))))))))..))))))))).))))...) 1238097 1238193 TTCACAGGCTTTCTTGAACATGGTATTCAGACGGCCCTCTTCGAGTTAGCTATCGGAGATGCAATGTTGAGTAACAGGTTCAAGAAATCTGTGGAGA ((((((((.((((((((((.((.(((((((...((..(((((((........))))))).))....))))))).)).)))))))))))))))))).. Atr-miR396g 1238173 1238193 TTCACAGGCTTTCTTGAACAT Atr-miR396g* 1238097 1238117 GGTTCAAGAAATCTGTGGAGA 3 Atr-MIR396h PmiREN000244 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00013 112962 113099 + GATTTGATGTTTTCATGCTTTCCACAGGCTTTTTTGAACATGGTATTCAGACGAGCCATCTTCGAGTTAGTTCTTGGAGATGCAATGTTGAGTAACAAGTTCAATAAAGCTGTGGATAAACATGGAAACAATCATGAT .......((((((((((...(((((((.((((.((((((.((.(((((((....((.(((((((((......)))))))))))....))))))).)).)))))).)))))))))))....))))))))))........ 112982 113079 TCCACAGGCTTTTTTGAACATGGTATTCAGACGAGCCATCTTCGAGTTAGTTCTTGGAGATGCAATGTTGAGTAACAAGTTCAATAAAGCTGTGGATA (((((((.((((.((((((.((.(((((((....((.(((((((((......)))))))))))....))))))).)).)))))).))))))))))).. Atr-miR396h 112982 113002 TCCACAGGCTTTTTTGAACAT Atr-miR396h* 113059 113079 AGTTCAATAAAGCTGTGGATA 3 Atr-MIR396i PmiREN000245 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00244 76223 76364 + ATAATTAAAGTAAAACACTTTTCACAGGCTTTCTTGAACATGGTACATAGACAGGCCCACTTCGTCGAGGTTGGCTCTCGAAGATGTGATGCTGAGTAACAGGTTCAAGAAATCCGTGGAGAAACATGGAAACAATCGTAAT ...........(..((..(((((((.((.((((((((((.((.(((.(((.((....(((.((.((((((.....)))))).)).))).))))).))).)).)))))))))).)))))))))....((....))...))..) 76243 76344 TTCACAGGCTTTCTTGAACATGGTACATAGACAGGCCCACTTCGTCGAGGTTGGCTCTCGAAGATGTGATGCTGAGTAACAGGTTCAAGAAATCCGTGGAGA (((((.((.((((((((((.((.(((.(((.((....(((.((.((((((.....)))))).)).))).))))).))).)).)))))))))).))))))).. Atr-miR396i 76243 76263 TTCACAGGCTTTCTTGAACAT Atr-miR396i* 76324 76344 GGTTCAAGAAATCCGTGGAGA 3 Atr-MIR396j PmiREN000246 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00244 33730 33871 + GATTTGATGTTTTCATGCTTTTCACAGGCTTTCTTGAACATGGTACACAGACAGGCCCTCTTCGTCGAGGTTGGCTCTCGAAGATGTGATGCTGAGTAACAGGTTCAAGAAATCCGTGGAGAAACATAGAAACAATCATAAT ....((((((((..(((.(((((((.((.((((((((((.((.(((.(((.((...(.((((((..(((.....))).)))))).)...))))).))).)).)))))))))).)))))))))..)))..)))).)))).... 33750 33851 TTCACAGGCTTTCTTGAACATGGTACACAGACAGGCCCTCTTCGTCGAGGTTGGCTCTCGAAGATGTGATGCTGAGTAACAGGTTCAAGAAATCCGTGGAGA (((((.((.((((((((((.((.(((.(((.((...(.((((((..(((.....))).)))))).)...))))).))).)).)))))))))).))))))).. Atr-miR396j 33750 33770 TTCACAGGCTTTCTTGAACAT Atr-miR396j* 33831 33851 GGTTCAAGAAATCCGTGGAGA 3 Atr-MIR396k PmiREN000247 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00488 2988 3125 - GATTTGATGTTTTCATGCTTTCCATAGGCTTTCTTGAACATGGTATTCAGACGAGCCATCATCGAGTTAGTTCTCGGAGATGTAATGTTGAGTAACAGGTTCAATAAAGCTGTGGATAAACATGGAAACAATCATGAT .......((((((((((...(((((((.((((.((((((.((.(((((((.((...((((..((((......))))..))))...))))))))).)).)))))).)))))))))))....))))))))))........ 3008 3105 TCCATAGGCTTTCTTGAACATGGTATTCAGACGAGCCATCATCGAGTTAGTTCTCGGAGATGTAATGTTGAGTAACAGGTTCAATAAAGCTGTGGATA (((((((.((((.((((((.((.(((((((.((...((((..((((......))))..))))...))))))))).)).)))))).))))))))))).. Atr-miR396k 3085 3105 TCCATAGGCTTTCTTGAACAT Atr-miR396k* 3008 3028 GGTTCAATAAAGCTGTGGATA 3 Atr-MIR396l PmiREN000248 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold01070 2975 3112 + GATTTGATGTTTTCATGCTTTCTACAGGCTTTCTTGAACATGGTATTCAGACGAGCCATCTTCGAGTTAGTTCTCGGAGATGCACTGTTGAGTAACAAGTTCAATAAAGCTGTGGATAAACATGGAAACAATCATGAT .......((((((((((...(((((((.((((.((((((.((.(((((((....((.(((((((((......)))))))))))....))))))).)).)))))).)))))))))))....))))))))))........ 2995 3092 TCTACAGGCTTTCTTGAACATGGTATTCAGACGAGCCATCTTCGAGTTAGTTCTCGGAGATGCACTGTTGAGTAACAAGTTCAATAAAGCTGTGGATA (((((((.((((.((((((.((.(((((((....((.(((((((((......)))))))))))....))))))).)).)))))).))))))))))).. Atr-miR396l 2995 3015 TCTACAGGCTTTCTTGAACAT Atr-miR396l* 3072 3092 AGTTCAATAAAGCTGTGGATA 3 Atr-MIR396m PmiREN000249 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold03501 2676 2813 - GATTTGATGTTTTCATGCTTTTCACAGGCTTTCTTGAACATGGTATTCAGACGGTTCCTCTTCGAATTAGTTCTCGGAGATGCAATGTTGAGTAACAGGTTCAAGAAAGCTGTGGAGAAACATGGAAACGATTATTAC ........(((((((((.(((((((((.(((((((((((.((.(((((((...((...(((((((........))))))).))....))))))).)).))))))))))))))))))))..)))))))))......... 2696 2793 TTCACAGGCTTTCTTGAACATGGTATTCAGACGGTTCCTCTTCGAATTAGTTCTCGGAGATGCAATGTTGAGTAACAGGTTCAAGAAAGCTGTGGAGA (((((((.(((((((((((.((.(((((((...((...(((((((........))))))).))....))))))).)).)))))))))))))))))).. Atr-miR396m 2773 2793 TTCACAGGCTTTCTTGAACAT Atr-miR396m* 2696 2716 GGTTCAAGAAAGCTGTGGAGA 3 Atr-MIR396n PmiREN000250 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00021 4942932 4943057 + AATGATTGTCTGCATGTTTCTCCACAGCTTTCTTGAACTTGTTACTCAACATTGCCTCTATGAAGAGGGCCCGTCTGAATACCATGTTCAAGAAAGCCTGTGGAAAGCATGAAGACCTCAAATCTT ..(((..((((.(((((((.((((((((((((((((((.((.((.(((((....(((((....)))))....)).))).)).)).))))))))))).)))))))))))))).)))).)))...... 4942952 4943037 TCCACAGCTTTCTTGAACTTGTTACTCAACATTGCCTCTATGAAGAGGGCCCGTCTGAATACCATGTTCAAGAAAGCCTGTGGAAA ((((((((((((((((((.((.((.(((((....(((((....)))))....)).))).)).)).))))))))))).))))))).. Atr-miR396n 4942952 4942971 TCCACAGCTTTCTTGAACTT Atr-miR396n* 4943017 4943037 GTTCAAGAAAGCCTGTGGAAA 3 Atr-MIR396o PmiREN000252 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00046 1688246 1688396 + TGATGACTCTCTCTGTACTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCGCCTGAGTCGATAGAAAGAGAAATTTAGGGTTTCACAATTACCCCAAGATTTCTTGTATCAGATGACGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAAATGCATTGGGAGTCTCTGTG .............((((.(.((((((((((((.((((((((((.((((.((....))..(((((((((.((((.........))))..)))))))))...)))).)).)))))))).)))))))))))).).))))............... 1688266 1688376 TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCGCCTGAGTCGATAGAAAGAGAAATTTAGGGTTTCACAATTACCCCAAGATTTCTTGTATCAGATGACGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAA ((((((((((((.((((((((((.((((.((....))..(((((((((.((((.........))))..)))))))))...)))).)).)))))))).)))))))))))).. Atr-miR396o 1688266 1688286 TTCCACAGCTTTCTTGAACTG Atr-miR396o* 1688356 1688376 GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA 3 Atr-MIR396p PmiREN000253 MIR396 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00029 1065365 1065499 - GACTTGATCTCTTCATGCTCTTCCACGGCTTTCTTGAACATGGCGCTTAGACACCACTTCCACAGGGTCCTGTGAAAGCAAAGCTAAGTAACAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAAGATGAAAAGAATCATAGAA ..((((((((.(((((.((.(((((((((((((((((.(.((..((((((......(((.(((((....))))).))).....))))))..)).).)))))))))))))))))..))))))).)).)))).)).. 1065385 1065479 TTCCACGGCTTTCTTGAACATGGCGCTTAGACACCACTTCCACAGGGTCCTGTGAAAGCAAAGCTAAGTAACAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA (((((((((((((((((.(.((..((((((......(((.(((((....))))).))).....))))))..)).).))))))))))))))))).. Atr-miR396p 1065459 1065479 TTCCACGGCTTTCTTGAACAT Atr-miR396p* 1065385 1065405 GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA 3 Atr-MIR397a PmiREN000254 MIR397 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00016 5120362 5120463 - GGGGAGAAAAACCATACACATCCTTGAGTGCAGCGTTGATGAACCCAAAACCCTAATTTCAGCAGCGCTGTACTCAATGATGCCTTTGGTATTTCATGTAAT .....((((.((((....((((.(((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))))).))))....)))).))))....... 5120382 5120443 TCCTTGAGTGCAGCGTTGATGAACCCAAAACCCTAATTTCAGCAGCGCTGTACTCAATGATG ((.(((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))))).)).. Atr-miR397a 5120423 5120443 TCCTTGAGTGCAGCGTTGATG Atr-miR397a* 5120382 5120402 GCAGCGCTGTACTCAATGATG 3 Atr-MIR397b PmiREN000255 MIR397 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00072 1231142 1231264 + TATGAGGAAAACCAGAAACATCATTGAGTGCAGCGTTGGTGAACCCCAAAACCTAATTTTCATCTCTCTTGTTTGGGTTTCGGCAGCGCTGCACCCAATTATGCCTTTGGTATATCCTCCACG ...(((((..((((((..(((.((((.(((((((((((.((((.((((((.....................)))))).)))).))))))))))).)))).)))..))))))...))))).... 1231162 1231244 TCATTGAGTGCAGCGTTGGTGAACCCCAAAACCTAATTTTCATCTCTCTTGTTTGGGTTTCGGCAGCGCTGCACCCAATTATG (.((((.(((((((((((.((((.((((((.....................)))))).)))).))))))))))).)))).).. Atr-miR397b 1231162 1231182 TCATTGAGTGCAGCGTTGGTG Atr-miR397b* 1231224 1231244 GCAGCGCTGCACCCAATTATG 3 Atr-MIR398a PmiREN000256 MIR398 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00102 1169837 1169979 + AGAATGGGGAAGTCTCAACAGGAGCGATATGAGAACACACAATCATATGCATAAATATTGTGTATGTGTGTGTGCACGTGTGCATGTGCATGTGCGTGCTTGTGTGTTCCCAGGTCGCCCCTGCCGAGCCTGCCCATATCTAT ((((((((..((.(((..((((.(((((.((.(((((((((..((((((((((.....)))))))))).(..((((((((((....))))))))))..).))))))))).)).))))).))))..))).)).))))).))).. 1169857 1169959 GGAGCGATATGAGAACACACAATCATATGCATAAATATTGTGTATGTGTGTGTGCACGTGTGCATGTGCATGTGCGTGCTTGTGTGTTCCCAGGTCGCCCCTG ((.(((((.((.(((((((((..((((((((((.....)))))))))).(..((((((((((....))))))))))..).))))))))).)).))))).)).. Atr-miR398a 1169939 1169959 TGTGTTCCCAGGTCGCCCCTG Atr-miR398a* 1169857 1169877 GGAGCGATATGAGAACACACA 3 Atr-MIR398b PmiREN000257 MIR398 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00102 1185687 1185819 + TAGAATGTGAAGTCCCAACATTAGCGACATGGGAACACACAGGTATGCATACAATGATATGCATAAATATTGCATGTGTGTGTACGTGCTTGCGTGTTCCCAGGTCGCCCCTGCCGAGCCTGCCCATATATAT .......................(((((.(((((((((.((((((((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)))))))).))))))))).)))))......................... 1185707 1185799 TTAGCGACATGGGAACACACAGGTATGCATACAATGATATGCATAAATATTGCATGTGTGTGTACGTGCTTGCGTGTTCCCAGGTCGCCCCTG ...(((((.(((((((((.((((((((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)))))))).))))))))).)))))..... Atr-miR398b 1185779 1185799 CGTGTTCCCAGGTCGCCCCTG Atr-miR398b* 1185707 1185727 TTAGCGACATGGGAACACACA 3 Atr-MIR399 PmiREN000258 MIR399 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00069 2597392 2597519 + TAATGGGCAAACCAGTTTCAGGGCTTCTCTCCATTGGCAGACTTGCAAACAAAATAATTCAGACACTCACATTCTACCTGCATTGCCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTGTAACTGGCTTCTGTCCCAAC ...((((((((((((((.((((((..((((((.(((((((.(.((((...............................))))..).))))))).))))))..)))))).)))))).)).)).)))).. 2597412 2597499 GGGCTTCTCTCCATTGGCAGACTTGCAAACAAAATAATTCAGACACTCACATTCTACCTGCATTGCCTGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG ((((..((((((.(((((((.(.((((...............................))))..).))))))).))))))..)))).. Atr-miR399 2597479 2597499 TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG Atr-miR399* 2597412 2597432 GGGCTTCTCTCCATTGGCAGA 3 Atr-MIR408 PmiREN000259 MIR408 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00045 1152310 1152435 - AGAGAAGTGTTTGAGAGCAGGCAGGGATGAAGCTGAGCATGGGAGGGTCATGACCAAACTCATCTTGCTGCTCTTGTCCTTCTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTCCTTTATCTCTCTCTCTT (((((..((...((((((...((((((.((.((.(.(((((((((((.((.((.((............)).)).)).))))))))))).).)).)).))))))))))))...))..)))))..... 1152330 1152415 GCAGGGATGAAGCTGAGCATGGGAGGGTCATGACCAAACTCATCTTGCTGCTCTTGTCCTTCTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT .((((((.((.((.(.(((((((((((.((.((.((............)).)).)).))))))))))).).)).)).))))))... Atr-miR408 1152395 1152415 GCAGGGATGAAGCTGAGCATG Atr-miR408* 1152330 1152350 TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT 3 Atr-MIR477a PmiREN000260 MIR477 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00003 709706 709814 + TTTCAGGGCACCTAATCTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGGTCCTTACCATTCATGGTAAGAGGAATAGAGGCCTTAGGGGAGAGTGGATGCTAGGTGTTTTGGTTTC ..((((((((((((.(.((((((((((((..((((((((((.(((((((((....))))..))))).)))))))))).)))))))))))).).)))))))))))).... 709726 709794 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGGTCCTTACCATTCATGGTAAGAGGAATAGAGGCCTTAGGGGAGAGTGG (((((((((..((((((((((.(((((((((....))))..))))).)))))))))).))))))))).. Atr-miR477a 709774 709794 AGAGGCCTTAGGGGAGAGTGG Atr-miR477a* 709726 709746 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTG 3 Atr-MIR477b PmiREN000261 MIR477 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00003 741318 741423 + TTTCATGGCACCTCACCTTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGATCCTTGGCTTTCATAGGAGGATTAGAAGCCTTTGTGGAGAGTGGATGCAAGTTGCTTTGCCTTC .................((((((((((..((((((((((((((((((..((.....)))))))))))))))))))).))))))))))................... 741338 741403 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGATCCTTGGCTTTCATAGGAGGATTAGAAGCCTTTGTGGAGAGTGG (((((((..((((((((((((((((((..((.....)))))))))))))))))))).))))))).. Atr-miR477b 741338 741359 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTGA Atr-miR477b* 741383 741403 AGAAGCCTTTGTGGAGAGTGG 3 Atr-MIR477c PmiREN000262 MIR477 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00003 787275 787385 + TTTCAGGGCACCTAATCTTCACTCTCCCTCAATGGCTTCTCGTCCTTTACCTTTCATGGGAGGAGGAATCGAGGCCGTTGTGGGAGGGTGCATATTAGGTGTTTTGCCTTC .......(((((((((...(((((((((.((((((((((...(((((..(((.....)))..)))))...)))))))))).)))))))))...)))))))))......... 787295 787365 ACTCTCCCTCAATGGCTTCTCGTCCTTTACCTTTCATGGGAGGAGGAATCGAGGCCGTTGTGGGAGGGTGC ((((((((.((((((((((...(((((..(((.....)))..)))))...)))))))))).)))))))).. Atr-miR477c 787295 787315 ACTCTCCCTCAATGGCTTCTC Atr-miR477c* 787345 787365 GAGGCCGTTGTGGGAGGGTGC 3 Atr-MIR477d PmiREN000263 MIR477 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00003 739439 739547 - TTTCAGGTCACCTAATCCTCACTCTCCCTCAAGGGCTTCTAATCCTCACCTTTGAGAGGGGGAAGTATAGAAGCCTTTGGGGAGGGTGAATGCTAGGTGTTTTGCCTTC ....((((((((((....((((((((((.((((((((((((.(((((..(.....)..)))))....))))))))))))))))))))))....))))))....)))).. 739459 739527 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTAATCCTCACCTTTGAGAGGGGGAAGTATAGAAGCCTTTGGGGAGGGTGA ((((((((.((((((((((((.(((((..(.....)..)))))....)))))))))))))))))))).. Atr-miR477d 739506 739527 ACTCTCCCTCAAGGGCTTCTAA Atr-miR477d* 739459 739479 AGAAGCCTTTGGGGAGGGTGA 3 Atr-MIR535 PmiREN000264 MIR535 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00087 73178 73268 + CTTGCGTGACAACGAGAGAGAGCACGCTTGTGGCCATTCATGTGAGGTACATGCCTGTGCACATGCGTGCTCTTTCTCGTTGTCACCTAAG ((((.((((((((((((((((((((((.((((..((..((((((...))))))..))..)))).)))))))))))))))))))))).)))) 73184 73264 TGACAACGAGAGAGAGCACGCTTGTGGCCATTCATGTGAGGTACATGCCTGTGCACATGCGTGCTCTTTCTCGTTGTCACC (((((((((((((((((((((.((((..((..((((((...))))))..))..)))).)))))))))))))))))))))). 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Atr-miR828 8165714 8165735 TGATACTCATTTCAGCAAGCAA Atr-miR828* 8165636 8165656 TCTTGCTCAAATGAGTATTCC 3 Atr-MIR2111 PmiREN000221 MIR2111 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00165 819323 819463 + CTAACTGGCATGAGAGTGGATAATCTGTATCTTGAGGTTTGGGTTTAGCCCACAACTATACTTCATTATCAAGTGTCGGAGTCTAGTTAACCCAAAACCAGACCTCAGGATACAGGTTACCTCCTCTACAATGGTCAGTTT ....................((((((((((((((((((((((...........(((((.(((((((........)).))))).))))).........))))))))))))))))))))))...................... 819343 819443 TAATCTGTATCTTGAGGTTTGGGTTTAGCCCACAACTATACTTCATTATCAAGTGTCGGAGTCTAGTTAACCCAAAACCAGACCTCAGGATACAGGTTACC ((((((((((((((((((((((...........(((((.(((((((........)).))))).))))).........)))))))))))))))))))))).. Atr-miR2111 819343 819363 TAATCTGTATCTTGAGGTTTG Atr-miR2111* 819423 819443 GACCTCAGGATACAGGTTACC 3 Atr-MIR2950 PmiREN000222 MIR2950 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00059 4206320 4206421 - GAACATGGGTTTGTGGTTTATTCCATCTCTTGCACACTGGACCAGTGCTTCAGCAACTGGTTGGTGTGCAGGGGGTGGAATATGGCACCCATCCATGCAGTC ((.(((((((..(((.(.(((((((((((((((((((..(.(((((((....)).))))))..))))))))))))))))))).).)))..)))))))...)) 4206340 4206401 TTCCATCTCTTGCACACTGGACCAGTGCTTCAGCAACTGGTTGGTGTGCAGGGGGTGGAATA (((((((((((((((((..(.(((((((....)).))))))..))))))))))))))))).. 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Atr-miR8578 3264775 3264795 TTTATGAGTGATCTTTGCAAT Atr-miR8578* 3264838 3264858 TGCGAATGTCACTCATTAAGA 3 Atr-MIR8580 PmiREN000289 MIR8580 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00003 1980855 1981013 - AATGAGGTTGCGATATTCTTCACCATCCATTTTACTTGGACTGTGTAGGTTTGAATCGTTTTTTAAGACCGTTTCAATGGATGTCACGTCTTTTAAGATAGTGTTCAATCTACACTGTCTAAATAGAATGGATGGTGTAGGTGACTGCAACCTTATTTC ((((((((((((....(((.((((((((((((((.((((((.(((((((((.((((.(((((..(((((.((..((.....))..)))))))..)))))...))))))))))))).)))))).)))))))))))))).)))....)))))))))))))) 1980875 1980993 CACCATCCATTTTACTTGGACTGTGTAGGTTTGAATCGTTTTTTAAGACCGTTTCAATGGATGTCACGTCTTTTAAGATAGTGTTCAATCTACACTGTCTAAATAGAATGGATGGTGTA ((((((((((((((.((((((.(((((((((.((((.(((((..(((((.((..((.....))..)))))))..)))))...))))))))))))).)))))).)))))))))))))).) 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Atr-miR8603 1378478 1378498 TTGAGCTTGTGGTTCGACATG Atr-miR8603* 1378369 1378389 TGCCGAATCACATGCTCAAAG 3 Atr-MIR8612 PmiREN000302 MIR8612 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold03445 287 502 - AAAATACTACCAAATAATTGTGACCACGCGATGAAATTTGGACATGAGAGTAGACAAAATTACTATTCATTTTTACCTCGTTGGGAAGACTTTTCCATCCATATATATATATATATTCTTCTTAACGCTTATTGGCAAAAATGAATAGTGATTTTGTCTACCCTCATTACTGTCCAAATTTCATCGTGCGGTCACGTTTGTCTGTTAGTGTTTTAT (((((((((.((.((((.(((((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((...........((((((....)))))))))))))))))......)).))))))))))))))))))))))))).))))....)))))))))))))))))).))))))).)))).)).))))))))))) 307 482 TGACCACGCGATGAAATTTGGACATGAGAGTAGACAAAATTACTATTCATTTTTACCTCGTTGGGAAGACTTTTCCATCCATATATATATATATATTCTTCTTAACGCTTATTGGCAAAAATGAATAGTGATTTTGTCTACCCTCATTACTGTCCAAATTTCATCGTGCGGTCACG (((((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((.(((((((((((...........((((((....)))))))))))))))))......)).))))))))))))))))))))))))).))))....)))))))))))))))))).))))))) 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Atr-miR8613 3483024 3483049 CATCAAATTGGATGACTTGGGATG Atr-miR8613* 3482892 3482912 CCTCAAGATATCCAATTTGAC 3 Atr-MIR8615 PmiREN000304 MIR8615 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00069 1966183 1966343 - TACAACGAATGGCGTTTGTGCGTAGAATCATACCTGCAAAGACAAAACCTCTGGGAGGTATTAGCGCCGTGGGACAATACCTTTGCAAGGACAAGACCTCTTGGAGGTAGAAACATGACCTTGTAGGTATGATTCCACGCACGAACGCCATTCGTTTTGAC ...((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.(.((..(((((..((((((.......((.((.((........)).)).)).....))))))..))))).......)).).))))))))))))))).))))))))))))))))))))..... 1966203 1966323 CGTAGAATCATACCTGCAAAGACAAAACCTCTGGGAGGTATTAGCGCCGTGGGACAATACCTTTGCAAGGACAAGACCTCTTGGAGGTAGAAACATGACCTTGTAGGTATGATTCCACGCA (((.(((((((((((((((.(.((..(((((..((((((.......((.((.((........)).)).)).....))))))..))))).......)).).))))))))))))))).))).. Atr-miR8615 1966203 1966223 TTGTAGGTATGATTCCACGCA Atr-miR8615* 1966303 1966323 CGTAGAATCATACCTGCAAAG 3 Atr-MIR8616 PmiREN000305 MIR8616 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00049 1238509 1238812 + TTCATAGTCGGTGTTGGAAATTGATTTTAGAGCCATCATGGAGATTTTCGATGCCCAAAATGCTCTCTGAATGAGGATTCGAGATGAGGCTTTACTTTGATTTCTTAGAGGCCCGGGCCTTATAAAATCGAAAGTGCAATCCGAATGAGGATTCGAGATAAGGCTTTATTTTGATTTCATAGAGGCCCAGGCCTTATAAAACATAAAGTAGAGATTCACCTCAAAGCCTTATCTGAAAAACACTTCAGGCATAAGAAATCTTTTTGATGGCTTTAAAATCTATTTCCATCATCGATTATAAAAT ((.((((((((((.(((((((.((((((((((((((((.(((((((((..(((((...(((.(((.......))).)))..((((((((((((((((((........((((((.(((((((((.(((((((((..((.((((((((....))))).)))...))....))))))))).)).))))))).))))))........)))))))(((......))).)))))))))))(((......))).)))))..))))))))).)))))))))))))))).))))))).)))))))))).)))) 1238529 1238792 TTGATTTTAGAGCCATCATGGAGATTTTCGATGCCCAAAATGCTCTCTGAATGAGGATTCGAGATGAGGCTTTACTTTGATTTCTTAGAGGCCCGGGCCTTATAAAATCGAAAGTGCAATCCGAATGAGGATTCGAGATAAGGCTTTATTTTGATTTCATAGAGGCCCAGGCCTTATAAAACATAAAGTAGAGATTCACCTCAAAGCCTTATCTGAAAAACACTTCAGGCATAAGAAATCTTTTTGATGGCTTTAAAATCTATT (.((((((((((((((((.(((((((((..(((((...(((.(((.......))).)))..((((((((((((((((((........((((((.(((((((((.(((((((((..((.((((((((....))))).)))...))....))))))))).)).))))))).))))))........)))))))(((......))).)))))))))))(((......))).)))))..))))))))).)))))))))))))))).))) 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Atr-miRN22 5920653 5920673 TTTTGCTCAAGATCGCGCAGT Atr-miRN22* 5920838 5920858 CGCGTGATCTTGTGCAGAATA 3 Atr-MIRN23a PmiREN000308 MIRN23 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00014 5935402 5935613 - ATTTGAAGACCCAAATAAATTTTGTTCAAGATAGTGCAACTTATTCATGGGTAGCCTCTCGTAGTGTCTGCACATCGTCTGAAGATTTAGGAAGCTTGATGAATGGGGAGAGGGAAGGCCATGGCTTATTTCCCGATGTGTTGATGCTTCGATTTACTGCTTATGAATAGGCCGCACCCTCTTGATCAAAATACTTTTGGATCTCTTAAATC (((((((((.(((((...((((((.((((((..((((..(((((((((((((((....(((.((((((.(((((((.(((((....)))))..............((((((....((((....)))).))))))))))))).)))))).)))....)))))))))))))))..))))..)))))).))))))...))))).))).)))))). 5935422 5935593 TTTGTTCAAGATAGTGCAACTTATTCATGGGTAGCCTCTCGTAGTGTCTGCACATCGTCTGAAGATTTAGGAAGCTTGATGAATGGGGAGAGGGAAGGCCATGGCTTATTTCCCGATGTGTTGATGCTTCGATTTACTGCTTATGAATAGGCCGCACCCTCTTGATCAAAAT ((((.((((((..((((..(((((((((((((((....(((.((((((.(((((((.(((((....)))))..............((((((....((((....)))).))))))))))))).)))))).)))....)))))))))))))))..))))..)))))).)))).. 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Atr-miRN23b 562695 562715 TTTGTTCAAGATAGTGCAACT Atr-miRN23b* 562846 562866 CCGCACTCTCTTGATCAAAAT 3 Atr-MIRN24 PmiREN000309 MIRN24 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00028 3373375 3373545 + GGACATTGACAAATTGCCACACTGACAAATTGCCACATGCCCAAAGTGTAAATGTCGACTGTGGTCATGCTACCGTTTCACCCTTCATAGAGGATCGTACTCTCCGAACTTATCGCTTGGATGGGATGGCCATGTGGCAGTCTGACAGATACCATCTCTTTAACAATAATA .....................(((.((.(((((((((((.(((.............(((.((((.....)))).)))...(((((((.((((.......)))).(((.....)))..)))).))).))).))))))))))).)).)))....................... 3373395 3373525 ACTGACAAATTGCCACATGCCCAAAGTGTAAATGTCGACTGTGGTCATGCTACCGTTTCACCCTTCATAGAGGATCGTACTCTCCGAACTTATCGCTTGGATGGGATGGCCATGTGGCAGTCTGACAGATA .(((.((.(((((((((((.(((.............(((.((((.....)))).)))...(((((((.((((.......)))).(((.....)))..)))).))).))).))))))))))).)).)))... 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Atr-miRN48 8604485 8604505 TTGGATGGTGTAGATTTGGCA Atr-miRN48* 8604553 8604573 TCAAATTTACACTATCCAATT 3 Atr-MIRN49 PmiREN000349 MIRN49 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00016 155156 155251 - ATCTTGATAAAGAGATAGTCTGGTAGAAAGATTCATATAGTTCTTTCTACCGTACTATCTAGTTCTTTCTACCGTACTATCTTCGCTATCCATATC .....((((..((((((((.(((((((((((.....(((((.(........).))))).....))))))))))).)))))).))..))))...... 155176 155231 TGGTAGAAAGATTCATATAGTTCTTTCTACCGTACTATCTAGTTCTTTCTACCGTA (((((((((((.....(((((.(........).))))).....))))))))))).. 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Atr-miRN57 3536891 3536911 TCTTTAAACAGGATTTGGCTC Atr-miRN57* 3536761 3536781 GCCATATCCCCTTTGAGTAAG 3 Atr-MIRN58 PmiREN000368 MIRN58 Amborella trichopoda Atr-AmTr_v1.0_scaffold00068 239997 240111 + TTGGACCGTATAAGTAGAAATGCGGTCCAGCCCGCATAAAACAATTTTTCTTGAAGTAATAGACAACAATTGTTTCAAGCGGGCTGGACTGCATTTCTATAATATGTCATCCATG .((((.(((((..((((((((((((((((((((((...((((((((..(((.........)))....))))))))...)))))))))))))))))))))).)))))...)))).. 240017 240091 TGCGGTCCAGCCCGCATAAAACAATTTTTCTTGAAGTAATAGACAACAATTGTTTCAAGCGGGCTGGACTGCATT (((((((((((((((...((((((((..(((.........)))....))))))))...))))))))))))))).. 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